2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
3BF1A 2E88A 3F9MA 4FWNA 1ATRA 1J6ZA 5JMVA 1BU6O 1XC3A 3D2EB 1GLBG 2J4RA 3M1FA 5AQNA 5AQYA 3HBTA 3RSEA 1NMDA 2FSKA 2W40A 4FWRA 4BRDA 2A3ZA 1HKBA 4BC2A 4H5TA 3D2FA 3ZETA 1G99A 4I6MA 4B1UB 4FPBA 4JAXA 1RDWX 1JCEA 2P9NB 2Q97A 1KXPA 4QS9A 5LJVA 2E2OA 4FOIA 4JHDA 5E84A 4BRGA 5ADXA 1E4GT 2NLXA 1WOQA 1C0FA 4BRLA 1JCFA 2HF3A 2E1ZA 3WXIA 1Y64A 2ZGZA 3GOIA 4ISGA 4BR7A 4IXCA 4BRCA 4MLEA 5AZJA 4BVOA 4M7YA 3WEEA 5AR0A 5FPEA 3O08A 3VETA 1QQMA 3UB5A 3ZETB 4BG9A 3FZKA 2P9KB 2QWLA 4MO4A 3CJBA 2V7YA 4CZGA 4A2AA 4BGBA 4FO0A 3G25A 3MN7A 3O8MA 4K42A 2ZF5O 4IWVA 2A5XA 3FLCO 4ISEA 5LY3A 1KAYA 3LDNA 4FWSA 3VF6A 3IDHA 5ELZA 2I7PA 3A5NC 1HPMA 5BPNA 5AQUA 4XH5A 3TU5A 3MN9A 4WQ4A 2FXUA 4H0PA 4A61A 3W3DA 4QS8A 5AQZA 5KQ8A 5AQOA 4CZFA 1TYQB 2IVNA 3R8EA 1TUUA 4FWMA 3FR0A 1X3NA 1T44A 3AY9A 3C7NB 3AARA 3ULEB 3DJCA 5TKYA 4DHYA 1Q18A 3GBTA 1X3MA 3DXKA 1K8KA 1S22A 1IJJA 2QWRA 1JCGA 2A40A 3CJ1A 4BROA 3MN6A 1YXQA 5FPMA 5E26A 3KHYA 4A62A 5ADXH 4MLHA 1ATNA 4K25A 4EHTA 3VGMA 3LDQA 4BRNA 3VEOA 1QHAA 2VCPA 4WQ4C 4CZHA 1E4FT 2P9SA 3O80A 1NLVA 2GWJA 3DXKB 4H0YB 4BVPA 2AA4A 1K8KB 3M6GA 4AM7A 4CZMA 3SLCA 2KHOA 3O1BA 2YJFA 1GLCG 2AP1A 4EHUA 4C23A 3P4IA 4H5RA 1YUWA 3CJCA 4IZ9A 4BRFA 1QZ5A 1BA0A 3TPQA 5KPTA 3DXMA 5LJWA 1CZAN 3QMLA 2E1YA 2E2NA 3GE1A 4CZLA 4B1XB 2YHXA 4KBOA 5BR9A 4JN4A 4FL9A 4BRMA 4GNIA 4BC3A 4IJAA 5CE3A 3SMSA 1X9JA 2P9SB 4BRIA 3LDOA 3GL1A 3UKRB 3CERA 3DAWA 1NGCA 3VEXA 2FF6A 3ENOA 2QXLA 4DB3A 1GLJO 3H3OB 5AQQA 3L6QA 2NZTA 3I33A 3R6MA 3FZLA 4YDUA 1KAZA 4BR5A 1MDUB 1GLFO 3L4IA 3EL2A 3HTVA 4H0XB 3IUCA 5B8HA 2P9UA 1BDGA 4PKGA 3ZEUB 2A42A 4O8KA 1DGKN 1HJOA 1ZC6A 5BN9A 2PAVA 2W41A 3DWLA 5JLFA 2VYPA 5I9EB 4K41A 3LDLA 3EZWA 3B8AX 2WUSA 3QFUA 3BP8A 2Q1NA 3RSEB 1MWMA 3ATVA 3CIPA 3QBWA 2P9UB 4J8FA 3VGLA 4Z94A 1XQSC 4BG8A 1BWFO 3CJAA 3IMXA 2ZWHA 3D2FB 3BUZB 4YDUC 1GLAG 4I6MB 1T6DA 1NGGA 3AAQA 4WYBA 2VWBA 2BUPA 3A5OC 1GLEG 4BR2A 4JHDB 3CJ9A 4IO8A 1MWKA 4RCHA 4GY2B 5JICA 3ENHA 1OKJA 4FPAA 3U4LA 3UE5A 4CJ7A 5AZJB 3WEEB 4LC9B 5AQFA 2ASMA 3H45C 3VESA 3VENA 3EO3A 4CZJA 2YHWA 2QWMA 3CI5A 4EAHD 3O4WA 1SQKA 3H6EA 3R9PA 4QS7A 5F2RA 3IFRA 5EOYA 4NB4A 4BQZA 4IJNA 5AQLA 4DCHA 2GUPA 4EIAA 3O5BA 3WUHA 4B1WB 5AQSA 1NGEA 3WQTA 2E8AA 3KVGA 4BRKA 4MO5A 1LCUA 4DQ8A 5EXWA 3FZFA 2YHYA 3GDQA 4WQ5A 3S41A 3HZ6A 3OHRA 1QQOA 3H1QA 2QWNA 2IVPA 2BTFA 3FFKB 5AFUA 1HLUA 4BR0A 4FSVA 4RWTA 5AQIA 2I7NA 2A41A 3D7EO 5KPZA 3EKUA 4HTLA 3UKUA 2D0OA 4H0OA 3ATUA 4L3QA 4CBWA 4PKHA 4ISFA 3WXKA 4AM6A 2CGLA 3ZX0A 2A6AA 3QBXA 2YJEA 4BGAA 2OANA 3LM2A 5EX5A 2HMPA 1P8ZA 3MDQA 4BQLA 4FOEA 4O5FA 4H5VA 2Q0RA 2Q2RA 1TUYA 3U8XA 1LOTB 3VEYA 4BC5A 1NGJA 3MMVA 4B9QA 4WQ5C 4CD1A 4CBUA 5FPDA 4XH1A 3UKUB 3CHWA 4H03B 4BRHA 1WUAA 2GELA 3VEZA 3VERA 1IG8A 2GTDA 2QW9A 3D2EA 4BC4A 4H0VB 3JS6A 1MA9B 3H46O 3WT0A 2CGKA 3CQXA 3DXMB 1DEJA 3MN5A 4FWOA 2CGJA 5KQDA 1NWKA 4RTFD 1ZBSA 1QQNA 3A8YA 5AQGA 3M3ZA 2EWSA 3GG4A 2CH5A 3VGKA 2QWOA 3LM9A 1HX1A 2E2QA 2V52B 3U9ZA 1R59O 2P9NA 1U2VA 4JNEA 4BR4A 4H0TB 1XUPO 5EY4A 4HWIA 4E1JA 2V7ZA 1NGAA 3U9DA 2QM1A 2CH6A 4CZKA 5AFUH 4FWQA 4H5WA 1NGIA 2P9PA 1H1VA 3HM8A 5AQTA 3QICA 3O1WA 2E2PA 3LDPA 4FWLA 3BEXA 4K43A 3QDKA 2ASPA 1U6ZA 2P9KA 3EKSA 1T6CA 1U2VB 5F1XA 2E20A 4NO7A 1EQYA 5BREA 1S3XA 3H3NO 5BRDA 4A2BA 3W0LA 5BRHA 5AQXA 2UYTA 1V4TA 2IVOA 1RGIA 3A5LC 4B1ZA 4EFHA 2DPNA 1BA1A 4XEIA 2FSNA 2YI1A 2P9PB 4BRQA 4CBXA 1NM1A 3C0BA 2QWPA 3CETA 4BRPA 3A0IX 3MK6A 2Q36A 5AQJA 3VPZA 3H1VX 4XH4A 5AQHA 1HKGA 5KPRA 5FPNA 2V51B 2D0PA 3AAPA 3FZHA 1D4XA 4CZIA 3VEWA 2FSJA 4BR9A 1TYQA 4PL7A 2GWKA 4PL8A 2F9TA 4M7XA 5AQRA 1YAGA 1BG3A 3C7NA 3ULEA 2FLOA 2F9WA 1YVNA 2YCHA 3KZBA 2P9IA 4Y0WA 1ATSA 3EN9A 2ASOA 3SMPA 1NBWA 3J8AA 3VOVA 5AQWA 3ZX3A 5JLHA 2PBDA 4B1YB 3VF4A 5AZIA 1V4SA 2IIRA 2H3GX 4PKIA 5BPLA 1NGBA 2D1KA 3HI0A 2QWQA 1SZ2A 2ZGYA 2D4WA 2FF3B 5AQVA 2NRHA 3FE1A 3SJHA 2HOEA 4JD2A 3VEVA 3ID8A 1HKCA 3LL3A 2P9IB 4FWPA 3FGUA 4H5NA 3WQUA 1Z05A 4CI6A 4FWKA 1C0GA 3CJ7A 2Q0UA 5AZIB 1NGFA 2ITMA 3ZX2A 5AQKA 1NGDA 3WXLA 3VF2A 1ZXOA 1BOTO 3WXJA 1GLLO 3MCPA 4JD2B 3HSCA 5EVZA 5AQPA 3SK3A 2GEMA 2P9LA 1HUXA 2HF4A 3UKRA 3O6WA 5BN8A 1ESVA 1GLDG 3FZMA 4CZEA 1BO5O 3L0QA 4F9OA 4BREA 3QFPA 1BUPA 4M63C 2Q31A 5BRFA 1QZ6A 3A5MC 1RFQA 3QB0A 4BRAA 5AQMA 5F0XA 1SAZA 3ZEUA 1KAXA 5BPMA 3I8BA 3CQYA 2P9LB 1Z6RA 1NGHA 3JXUA 3BF3A 4CD3A 1DKGD 4B1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E88A 1EWQA 2JWKA 3MECA 1ATRA 2O8EA 3OYKA 3VA3A 3OVNA 3RSEA 3KKSA 5HLFA 3QIOA 4BRDA 2A3ZA 4CFDA 4CW7B 1BISA 5HOOA 4ID5A 4I6MA 4B1UB 4CECA 2P9NB 1JCEA 1YTAA 2F7TA 4FOIA 4LF9K 4JHDA 5E84A 4AHCA 4BACA 1J9AA 2NLXA 3VQ4A 3P31A 4KHNA 1A5VA 2ZQBA 2BH1A 2E1ZA 3L4QA 3J7ZO 4FJ7A 1Y64A 4QAGA 4BR7A 3KLGA 4FJKA 4E72A 4BRCA 2HMIA 5AZJA 2OZSA 3NF8A 1WAJA 3KLIA 5FPEA 3ZETB 1QQMA 4O44A 2PYLA 1N32K 4WFBL 4FLVA 3RMCA 2VG7A 3SJJA 3U3GA 4JK7A 4K42A 2ZF5O 4IWVA 4JI4K 1S5JA 1WBDA 3DLEA 5C2FA 4AHUA 1W9HA 3AVFA 5C12A 5M1NA 3ZSVA 3VF6A 3ZT3A 1DTQA 4YOWA 1CZBA 4IG3A 2GV9A 4DSJA 4WQ4A 2FXUA 1C1CA 4C8KA 4YNQA 4NCGA 3W3DA 3QO9A 3VQ6A 1L3TA 2HW3A 3NFAA 3SI6A 2IGIA 2YNHA 3AY9A 3C7NB 3AARA 1WN7A 4CJSA 3GBTA 1Q9XA 1WB9A 2FC0A 3DXKA 1XMOK 2QWRA 3S3MA 1JCGA 3OYNA 4I2PA 2P5OA 1A5WA 4CHNA 3SYZA 5ADXH 1L3UA 4K25A 3VGMA 3LDQA 1RT1A 1Y97A 1N8RO 4CFBA 3EE8A 1NLVA 2GWJA 4BDPA 4BVPA 3SQ1A 4GVMA 1K8KB 4O4GA 4CZMA 3SLCA 1K73O 4JRQA 2YJFA 2E5LK 4EHUA 4C23A 3LP2A 3TARA 5J1EA 1N34K 3LZJA 3GE1A 3CCRN 4B1XB 2NRZA 3NVMA 4BRMA 4GNIA 4BC3A 3LZIA 4DV7K 1U4BA 3V4IA 1IBLK 4HCCA 3DAWA 3R3LA 5GINA 4FXDA 3K9KA 2R7YA 3SZ2A 4X64K 2D0AA 3I33A 3AVCA 2XY8A 3CCJN 1SKRA 4DTJA 3ENBA 3ZT0A 4DV2K 4KFBA 2KFZA 1BDGA 4CJ3A 1QVGM 2GX9A 4DSIA 3H08A 1BL3A 2PAVA 1KCFA 3K2PA 2VYPA 2W6LA 3NMUA 1QSSA 2JLEA 2HSTA 3HPOA 1W97L 4LSNA 2WUSA 3RTVA 2O8EB 3RSEB 4J2AA 3QBWA 1JL2A 4LF7K 4PWDA 2Y1JA 1D8YA 4CGFA 1OH7A 2ZWHA 3I56N 5GAGP 1NKBA 4YDUC 4I6MB 1T6DA 3HPGA 4OKKA 2BUPA 1TK5A 3B6PA 4JHDB 3KK1A 5C24A 4FM1A 3P83D 4GY2B 4JKGA 2ZJRL 2ETJA 2HBMA 1KVCA 4CJ7A 5AZJB 2ASMA 5HRPA 4CK2A 3H45C 4CJVA 1XHXA 4EAHD 2D5RA 3E9PA 1SQKA 3THYB 3KK7A 3AA5X 1FK9A 3MX2A 1RCHA 4IDHA 4DCHA 4IJNA 5AQLA 4TSXA 2W42A 4K8ZA 5AQSA 3WQTA 4CGHA 3KVGA 2YNGA 4DQ8A 1N6QA 3GDQA 3NF6A 3SAGA 4C8OA 2DFFA 2IVPA 3FFKB 4EZ6A 4CIEA 5MLCQ 3MEEA 4KHPK 1EP4A 2O8CB 4W5OA 1MU2A 3HP6A 3V1QA 2BE2A 3UKUA 4DTMA 4J2EA 3L2QA 1JJ2M 3JAMO 1KVBA 3ATUA 2F8TA 4AM6A 3QBXA 5EX5A 2QKKA 2DY4A 4H5VA 2Q0RA 2O8BB 4CJKA 3VEYA 3MMVA 3C6TA 5JVGL 4DSEA 3CHWA 1WSEA 4H03B 4E89A 3VQ9A 3S9HA 2W6KA 3MXMA 1VSMA 2HNZA 3CQ8A 4B08A 3OYHA 1RDAA 1YT3A 3JS6A 3H46O 1S72N 4IO9L 4FWOA 1B9FA 1TL3A 2EWSA 3VGKA 1QVFM 1C0MA 4H8KA 3DYAA 3LP3A 1K6YA 3P5JA 2DFEA 3HPHA 4DSFA 1U2VA 3JSMA 4BR4A 1XUPO 1GOAA 1VSKA 4F3OA 4HWIA 2V7ZA 3KD5E 3U9DA 3HYFA 3TABA 3AVIA 3MAQA 4CZKA 4HUEA 4WF9L 1RTDA 1RILA 1Q82O 3HM8A 4X66K 2E2PA 2UXDK 1IKVA 3ZYYX 1ZBIA 3AA2A 4K43A 3NCIA 1NK8A 3D6RA 1U6ZA 4NO7A 4CJ5A 1TV6A 1EQYA 5GAEP 4B9MA 1DTTA 5BRDA 3CYGA 5BRHA 1V4TA 3HP9A 3EYZA 4FJMA 3A5LC 4G1QA 4B1ZA 2DPNA 2YI1A 1HQEA 2C1GA 3C0BA 1JLAA 2QWPA 4DQSA 5AQJA 2Q36A 3H1VX 1SL0A 4GKKK 3CG7A 5FPNA 3TTFA 1D4XA 4OPAA 2FSJA 4BR9A 1RT3A 1YHQN 1VQ7N 3OYBA 3KLFA 1YAGA 4B3TK 3ULEA 3UIQA 1T8EA 3CXCM 2GUIA 4FJ8A 1L5UA 4JI6K 1ATSA 1SKSA 3ZX3A 3PIPL 3AO3A 2IC3A 1SL1A 4JKEA 5FDLA 4M3XA 3K0SA 1V4SA 1D9FA 3M8SA 1T05A 3QEWA 3C94A 1ZBHA 2D1KA 1BIUA 2QWQA 4OLAA 2D4WA 3NE6A 2FF3B 4N47A 1RT5A 2NRHA 3FE1A 1FJGK 2P9IB 4FLYA 2XY7A 5D3GA 2Q0UA 2KQ2A 3VF2A 1KRPA 4NLCA 1ZXOA 4ELUA 3OJSA 3NH1A 4JD2B 1S1UA 3HSCA 3ZSWA 4FVUA 3SCXA 5AQPA 3SK3A 2GEMA 2P9LA 1EX4A 3BGRA 3TSPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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