2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
b'AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
1K8KB 3CJCA 3WXKA 2UYTA 3L6QA 5KPRA 2FSJA 3A8YA 2QM1A 3GBTA 4JNEA 3EKSA 2ITMA 5JMVA 4FWLA 1Q18A 1Z6RA 4Y0WA 3EN9A 5KQDA 2YHYA 2QWRA 4A2AA 1U2VA 3SLCA 1QQOA 4KBOA 3ZETA 5AQGA 3D2EA 2YI1A 4H0YB 2A40A 4B1XB 4CZLA 5FPMA 1HKBA 5AQJA 1Y64A 4WQ4C 5AFUA 4BVOA 4BG8A 3FE1A 4FWMA 1NGJA 4BRMA 4YDUA 2IVPA 2ZF5O 4BR9A 4CBXA 4JHDB 1RFQA 1BA0A 1T6DA 4QS9A 3KZBA 4FPBA 1NLVA 4IZ9A 4Z94A 2FF3B 2P9UA 2IIRA 2HF3A 3WEEB 1Z05A 3QB0A 3ZEUB 5FPDA 3CI5A 1GLCG 2V51B 1QQMA 1ZC6A 1BU6O 3F9MA 5JICA 2E1YA 3CJ1A 3VETA 1ZBSA 5AQRA 2P9PA 3VF6A 4FO0A 3AY9A 4FWPA 2HMPA 3VERA 4GNIA 2QWOA 2FXUA 3EO3A 3O08A 5EY4A 5BPNA 3O80A 1NGCA 2CGKA 4PL7A 2EWSA 5AQFA 5BREA 5KQ8A 3IUCA 2VYPA 2GWJA 4K25A 4IJAA 1GLBG 3ZETB 2P9NB 3D2EB 4CZEA 3O5BA 2NLXA 1NGEA 3LDOA 3EZWA 4MLHA 4WQ5C 2D4WA 3O6WA 1D4XA 3HSCA 3M6GA 4CZFA 4BR2A 5AQLA 3CETA 4M63C 4CZHA 1C0GA 1KAXA 1LOTB 1KAYA 2AA4A 4H5VA 4XH1A 2E2PA 3VEXA 4AM7A 3CERA 4FWQA 3FLCO 2NZTA 1NBWA 1XQSC 4RCHA 5ADXA 1BO5O 3BF1A 1WUAA 1KXPA 2GELA 3U8XA 3P4IA 2P9PB 4DQ8A 2NRHA 5BPLA 3ATUA 2P9IB 1X3NA 3FZKA 3WXLA 2CGJA 1ATSA 3L0QA 1RDWX 2QXLA 4PKGA 3A5LC 2Q0UA 3W0LA 4F9OA 5AZJB 1HJOA 1C0FA 1JCEA 3U9ZA 1BUPA 4M7YA 3BP8A 1NGDA 1V4SA 4BRDA 4I6MA 5I9EB 3GL1A 3OHRA 2ASOA 2FSKA 3FZHA 3S41A 2AP1A 5EVZA 4MLEA 5LJVA 1T6CA 4CZJA 3DXMA 4A2BA 3U4LA 5AQWA 3JS6A 3MN6A 4BR5A 5AR0A 1TUYA 2ZGZA 3VGLA 5JLHA 3VGMA 2A5XA 2KHOA 2D0PA 2GWKA 3MCPA 4IO8A 3TPQA 3MDQA 3ZX3A 4CBWA 4BRCA 2ZGYA 4CD1A 2YJFA 4RTFD 3VEVA 2W40A 4FPAA 2P9SB 3UKRA 5BR9A 5KPTA 3TU5A 3D2FA 4JAXA 4PKIA 1X9JA 3VESA 2P9NA 3H3OB 4FWKA 1EQYA 4BRKA 2YJEA 3DWLA 3LM9A 4HWIA 4K41A 4EHUA 3A0IX 3VF4A 4H0PA 4I6MB 4QS7A 3WUHA 3ENOA 3RSEA 5E26A 4BGAA 4BRHA 3HM8A 4RWTA 3IDHA 1KAZA 3H45C 4ISEA 4BG9A 3C0BA 3KHYA 3H3NO 3DXMB 5FPNA 4B1VA 4EAHD 3R8EA 5AQYA 3GOIA 2CH5A 3WXIA 4BQLA 2I7PA 2Q1NA 4CZMA 4BVPA 4FOIA 5AQZA 1DGKN 3ID8A 4WQ4A 3GE1A 2VCPA 2V7YA 3VEYA 1JCFA 3QICA 2P9IA 3O1BA 3CHWA 1NGGA 4EHTA 2V7ZA 3UKRB 5AZJA 2E88A 1ESVA 4L3QA 2YHWA 4BGBA 4B1UB 2CH6A 2PAVA 3D2FB 4IJNA 5AFUH 1QQNA 4K42A 5AQPA 1DKGD 3QFPA 3AAQA 5AQIA 3H46O 1DEJA 5BPMA 5AQQA 2A6AA 3ZX2A 1OKJA 4QS8A 4BC2A 2E2NA 3DAWA 3HTVA 3FZMA 3AAPA 3D7EO 1NGIA 5AQNA 3A5OC 3DXKA 3QDKA 2I7NA 1E4FT 2HOEA 1MWKA 5ELZA 3UB5A 5BRFA 1LCUA 2CGLA 3RSEB 3VGKA 3MN5A 4BC5A 4BR7A 2A42A 2W41A 3VEWA 2A3ZA 3R9PA 3VF2A 2E1ZA 1YUWA 3MN9A 3BEXA 3HI0A 4K43A 2YCHA 3JXUA 1HLUA 4A61A 2P9SA 2GUPA 4WQ5A 4CZIA 3HBTA 1HX1A 1QHAA 5BRDA 1TUUA 3ENHA 3VEZA 3A5MC 3KVGA 2Q97A 4CJ7A 2E2OA 3J8AA 4FWOA 1HKGA 4XEIA 5AQHA 3HZ6A 2E2QA 3QFUA 4NB4A 1YXQA 4E1JA 4EIAA 1BG3A 3FFKB 1NM1A 4EFHA 4BROA 1YVNA 4H5TA 3CJ9A 4M7XA 3QBXA 2Q0RA 4A62A 1JCGA 3SK3A 4ISGA 3SMPA 5AQKA 4DHYA 2Q31A 2FF6A 3DXKB 1XUPO 2GTDA 3CJBA 1XC3A 1QZ5A 3G25A 1V4TA 3I33A 1RGIA 5ADXH 3CQYA 3WXJA 4XH4A 4B9QA 4BC4A 4H5RA 4H5WA 2E8AA 3L4IA 4JN4A 3A5NC 5EXWA 2GEMA 5F0XA 1S22A 5AQMA 4FWRA 4IXCA 4BC3A 3VPZA 3EKUA 4BR4A 1SAZA 1NGAA 2ZWHA 4MO4A 4JD2B 1U6ZA 5E84A 1MA9B 4H0VB 1TYQB 1ATRA 2V52B 4CZGA 4DB3A 4CI6A 3AARA 3LL3A 1NMDA 3VEOA 1NGHA 4YDUC 3LDNA 3MMVA 2FSNA 4B1ZA 4CBUA 5AZIA 5CE3A 1GLDG 1R59O 3CJ7A 2QW9A 1ZXOA 3H1VX 3EL2A 2OANA 4BR0A 5LY3A 2QWLA 4BRPA 2DPNA 1BOTO 5B8HA 4H0XB 4DCHA 1X3MA 3ATVA 3QMLA 3C7NA 4BRQA 5AQXA 5JLFA 5TKYA 4B1YB 4O8KA 3IMXA 2QWMA 3CQXA 4WYBA 3LM2A 3O1WA 2Q36A 2P9KB 3LDLA 2BTFA 4BRFA 4C23A 3DJCA 2VWBA 4FWNA 4BRGA 2YHXA 1BDGA 4O5FA 1HKCA 4NO7A 1H1VA 2PBDA 3R6MA 5BRHA 1E4GT 4IWVA 3LDPA 1BWFO 4PL8A 1T44A 3WT0A 4BRAA 3ULEA 1NGBA 3BUZB 1NGFA 1NWKA 4H0TB 5AZIB 4XH5A 3U9DA 2P9LA 3M3ZA 4H03B 5LJWA 1U2VB 3FZFA 4BRNA 5KPZA 4FL9A 1GLEG 4ISFA 1IG8A 3C7NB 3FR0A 4BREA 4JD2A 3CJAA 3QBWA 5AQSA 1CZAN 3B8AX 3LDQA 3UKUA 1HUXA 1GLJO 1TYQA 1GLLO 1MDUB 1SQKA 2QWQA 1SZ2A 2J4RA 2E20A 4J8FA 4HTLA 5AQUA 3VOVA 3FZLA 1K8KA 1MWMA 1BA1A 2H3GX 2P9UB 2D1KA 4H5NA 4AM6A 2WUSA 4BQZA 3WQTA 1GLFO 3GDQA 5EX5A 3UE5A 4B1WB 3H1QA 2A41A 2ASMA 3BF3A 3ZX0A 5FPEA 3FGUA 2F9WA 1S3XA 1GLAG 3SMSA 2IVOA 4GY2B 1WOQA 1YAGA 3ULEB 4H0OA 3WQUA 2F9TA 2BUPA 2D0OA 2HF4A 3H6EA 3M1FA 1HPMA 3IFRA 5F1XA 4BRLA 1P8ZA 2P9LB 4LC9B 5BN9A 3MN7A 3GG4A 1J6ZA 2Q2RA 5AQVA 1IJJA 3VENA 5F2RA 4JHDA 2P9KA 3SJHA 2ASPA 2IVNA 3O4WA 4MO5A 1G99A 1ATNA 3WEEA 1QZ6A 3ZEUA 4CD3A 2FLOA 2QWPA 5BN8A 5AQTA 3W3DA 2QWNA 3O8MA 4PKHA 4FSVA 3UKUB 3CIPA 3MK6A 4FOEA 4FWSA 4CZKA 4BRIA 5EOYA 5AQOA 3I8BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBVA 4LH4A 1J5OA 3OYLA 1X9WA 3LPUA 2FSJA 4B8CA 4E0DA 2QM1A 1TKZA 4JNEA 3DLEA 3V6DA 3EN9A 4IOXA 4JRPA 4A2AA 3PLAA 3RRHA 1U04A 3ALYA 3DLRA 3V9WA 1NNEA 1QQOA 4KBOA 1FK9A 4CJQA 2QI2A 3PY8A 4CZLA 3HO1A 5HRRA 1RBSA 3AVBA 4CFCA 4M3ZA 5KRTA 2G8WA 1RDUA 4CW7B 2HNYA 4HVJA 5BR8K 1WSJA 5AQJA 1Y64A 4F4KA 5AFUA 4BVOA 4FJMA 2E4LA 3DRRA 3FE1A 2B4JA 2VGNA 4BRMA 4AHSA 4AF1A 3SNNA 4FJHA 1W7AA 4J2AA 4FPBA 4FJJA 2P5GA 1S1UA 5FPDA 3QB0A 3ZEUB 3EE8A 1QQMA 1BU6O 4Z0UA 3TR8A 4Z4FA 2E1YA 3RMDA 3SYZA 5C0YA 5AQRA 2P9PA 4FWPA 1NJXA 4GNIA 2QWOA 1K9MO 1RTJA 3O08A 4C8NA 3G4SN 3O9UA 2KFZA 5BREA 5KQ8A 1HYVA 1ZBUA 3VQ4A 3NGIA 5HLFA 3V9XA 1TAQA 1BL3A 2GWJA 4K25A 4IJAA 4YOUA 2NLXA 1NGEA 4CEQA 1C0MA 1Q8IA 2ZE2A 3AA5X 3HM9A 4DS5A 4CZFA 5I3UA 3VQDA 3QEWA 5AQLA 4CZHA 4LFAK 4OJRA 5JVGL 1LOTB 4H5VA 2AA4A 3PX0A 3TAFA 1OVYA 1HRHA 3FLCO 3G10A 5ADXA 1BO5O 3ZSXA 1OH5A 1KXPA 3ZT0A 1LV5A 2X78A 2C1GA 3TTFA 4E7KA 3NMUA 4DQ8A 1VQLN 2RKIA 2VWJA 4JI0K 4DV0K 3T1YK 3FZKA 2CGJA 2O8FA 3W0LA 1UA0A 2Q0UA 1Q86O 5AZJB 1C0FA 1W0HA 2D0CA 1JCEA 5IWAK 1WSIA 1NGDA 5I9EB 4FLTA 3GL1A 2IAJA 1RT6A 4CIGA 1RDDA 2AP1A 3VTHA 4CHPA 3VTIA 3OS2A 1T6CA 3DXMA 3O4QA 4FJ7A 3U4LA 2DY4A 4DV2K 4C8LA 2ZGZA 4E72A 3PV8A 2YNHA 4AHTA 4CJTA 1L5UA 4JI2K 3PO5A 1ZBFA 3TPQA 3MDQA 4YY3K 3EYZA 2OZMA 1RILA 1NJZA 2W40A 4JI1K 2P9SB 3NCIA 1S1TA 3TU5A 3SUPA 4CF9A 2XO7A 1X9JA 1KCFA 3H3OB 1EQYA 4LF9K 1QSLA 2ZD1A 3VQ6A 3KWGA 3J7AP 4KV8A 1HNIA 3ZT4A 4EHUA 3VF4A 4I6MB 2Z1HA 3D45A 4BWMA 3AO1A 1BGXT 1EKEA 3H45C 1S1WA 4GVMA 4DTUA 3R8EA 1VSIA 3SQ4A 2KW4A 3F2KA 3MWTA 2WOMA 4IFEA 4CZMA 4ELVA 4GVEA 2KQ2A 4O55A 2G8FA 2VCPA 4CEBA 1N8RO 2QA4N 1HMVA 2E6MA 4O0IA 3E9OA 3UKRB 2P51A 5AZJA 4L3QA 4LF5K 2CH6A 1HYSA 2W42A 1QQNA 1HYZA 4B08A 3SUOA 4EZ6A 5AQQA 3T1AA 4CEFA 3DAWA 3E9PA 1NGIA 5AQNA 3DXKA 4G9ZA 3SUQA 3SAHA 1MWKA 4KHYA 3MN5A 1DTQA 4F2SA 3K5OA 4IDHA 4FJNA 3VF2A 1L3SA 3MXIA 1YUWA 4X62K 3K5LA 1SKSA 3ISNC 3MN9A 2ZM6K 2YCHA 3NF7A 3SI6A 2P9SA 2GUPA 3IRXA 3LWLA 1WLJA 2B6AA 3HBTA 2VGMA 2PFUA 4JKFA 3V1OA 2PYJA 1HX1A 4DWIA 3AVNA 1J5EK 3KVGA 2Q97A 3KWIA 1NKEA 1HKGA 2NNWA 4JKEA 1RT2A 4Y1DA 5FDLA 4NB4A 4E1JA 3VQBA 1IO2A 2NRXA 1VRTA 4EFHA 1YVNA 3TAEA 3K9JA 4JRQA 5J1EA 4M7XA 3NVKA 4CJUA 4A62A 4ISGA 1NJYA 2Q31A 4CK2A 4DR2K 3CJBA 3H08A 4YFUA 1OH7A 3I33A 4JV5K 4CJLA 2XY6A 2ATQA 4E7IA 4FYDA 4OKEA 4JN4A 4RG8A 1Q7YO 4DTSA 1CXUA 1S22A 2F8SA 4FWRA 4IXCA 3VPZA 5HRNA 1YTAA 1YJWN 4N76A 4JD2B 1U6ZA 3QINA 2Q3SA 1N33K 4J2EA 1ATRA 1VSKA 1NK4A 4FLUA 4DB3A 4CI6A 1KC8O 3LL3A 1VSMA 4CIEA 1NGHA 3T3FA 3VN5A 4AHVA 4KHQA 1X9SA 1OH6A 4M41A 5AZIA 1CZBA 5CE3A 3CJ7A 3H1VX 3U6FA 1G15A 2W00A 4B9MA 3J7YP 4O4GA 2X6NA 1TAUA 5CR4A 1M90O 4JS5A 4BRQA 3V9UA 5TKYA 4B1YB 4BDZA 2QWMA 4EZ9A 3CQXA 4WYBA 4H8KA 3LM2A 3O1WA 1QVFM 2BTFA 4KH5A 4FWNA 3HSTB 2FBTA 1BI4B 1HKCA 3ASMA 4H4OA 1H1VA 2O4GA 2OTLN 4NXMK 3DLGA 1WBBA 1WAFA 2HBKA 4IOCL 4PL8A 3WT0A 1T44A 4ZTFA 3ULEA 1NOYA 1EXQA 4CGIA 2PYLA 1KLMA 2FBXA 4DF8A 2BANA 1YJ9N 3R3LA 1JJ2M 4DUZK 1RDCA 4I2PA 4K8XA 4A59A 3V81A 1NK9A 4JD2A 1CZ9A 4E89A 1GOBA 1YHQN 2KKZA 4CHOA 3Q7BA 4EP4A 3VOVA 3FZLA 1MWMA 4DV3K 3T19A 4H5NA 5C2DA 4AM6A 5AJ3K 4DFKA 4PQUA 4BQZA 3CPWM 4OGEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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