2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
3EZWA 1S3XA 2VCPA 1ATRA 4DCHA 3LDLA 4HTLA 3D2EA 1K8KA 5AQUA 3BF1A 1HPMA 1P8ZA 2Q31A 4CI6A 5KPZA 1DEJA 3LM9A 5I9EB 1Q18A 4WQ4A 4FOEA 1GLCG 1YXQA 2ASOA 2Q97A 4FWLA 4O5FA 3VEZA 3WT0A 1NGAA 4BR0A 3BF3A 2A5XA 4H0TB 4CZGA 1GLLO 1HX1A 2WUSA 4BC4A 2QWQA 2IVNA 4IWVA 4RCHA 3UKRA 1SZ2A 3R8EA 1TUUA 4C23A 3ZEUA 3O1BA 3G25A 4IJAA 4XH1A 1TYQA 2V7ZA 1NGJA 4BR7A 1WUAA 2CH6A 4WYBA 5AZJB 3O08A 2YHXA 3VEVA 3GL1A 5EVZA 3LL3A 4B1VA 1G99A 4H5VA 1YVNA 4H0VB 3FZFA 4LC9B 3HTVA 3JS6A 5BRFA 2A41A 2ZWHA 1C0FA 3SJHA 5AQZA 2P9KB 4ISGA 2YHYA 3H1VX 3QBXA 3VESA 1BA0A 3UE5A 2V7YA 4JAXA 4BRKA 4CZKA 3MN9A 2QXLA 3SLCA 4EFHA 4FWRA 3VETA 1NBWA 2A6AA 3A5MC 3W0LA 3D7EO 1QQMA 1MDUB 3R9PA 1V4SA 2NRHA 1JCFA 2P9IB 3LDPA 3VEOA 1H1VA 1HKCA 3FZHA 4FPBA 2E2OA 4JHDB 2VWBA 3UKUA 3H3OB 2D4WA 3GG4A 1NGBA 3SK3A 1XUPO 2P9SB 3M6GA 2CGKA 4H03B 3VF6A 3A5OC 3M3ZA 3MK6A 3D2EB 3GOIA 1K8KB 4BRHA 3AAPA 2FLOA 3U9ZA 1U2VA 3GE1A 3VGMA 4BRQA 5F1XA 3L6QA 4BR9A 5CE3A 1GLEG 2FF3B 5EOYA 2P9NA 5F2RA 1MWMA 4IXCA 5AQFA 3AY9A 5E26A 3QICA 5BPLA 3CJ7A 1BOTO 5BN9A 3QBWA 3ZEUB 3DJCA 2I7PA 3R6MA 5ELZA 3VF4A 1TYQB 3A5NC 2J4RA 4BC2A 1QQOA 4H5WA 5AR0A 3L0QA 5JMVA 2ASPA 4PKIA 3EL2A 4QS8A 1ATNA 4Y0WA 1HLUA 4YDUC 2E8AA 4FWKA 2W41A 2HF3A 3OHRA 3ZETA 3WXJA 3WXIA 4B1XB 3MCPA 3SMPA 4A2BA 1YAGA 5AQMA 1X3NA 4L3QA 3WQTA 1RDWX 3MN7A 1KXPA 1ZBSA 2Q0UA 1ESVA 4I6MA 4CBXA 3ATVA 5BPNA 3S41A 1BDGA 3LDQA 2DPNA 2F9TA 2E2QA 3EKUA 4WQ5A 3HM8A 2I7NA 5AQRA 3UKUB 3TPQA 3BUZB 2ZF5O 5JICA 4K41A 5AQNA 2QWMA 2P9LA 3LDOA 4XH5A 4CZMA 4FL9A 4RWTA 1T44A 2D0PA 4BRIA 4BREA 2PAVA 2FSKA 3BP8A 1U2VB 1D4XA 3CJCA 3UB5A 4BRLA 3VGLA 1SAZA 4H0PA 1X3MA 4PKGA 4BRDA 5AQPA 4IO8A 2BUPA 4BGAA 1R59O 2P9NB 1OKJA 1E4FT 3CI5A 4PKHA 1NGIA 2GWKA 1S22A 3B8AX 3IDHA 3KHYA 3CERA 3IMXA 3VPZA 3IUCA 5EXWA 4H0YB 3O4WA 1JCEA 4BR2A 2H3GX 2VYPA 2IVOA 3FGUA 1KAXA 3HSCA 2OANA 2P9UA 5AQTA 2QWPA 3FZMA 5BRDA 5KQ8A 1X9JA 3C7NA 1E4GT 3QFPA 1KAYA 2FSJA 1BO5O 1V4TA 4H5NA 5AQOA 4CZLA 2GWJA 2A40A 5AQGA 1DGKN 2F9WA 1CZAN 4IZ9A 1QQNA 4FWSA 5FPNA 3ZETB 3EN9A 3D2FA 2PBDA 3FE1A 4GNIA 1ZC6A 3HZ6A 4M7XA 2D1KA 3O80A 2E2NA 3DXMA 2E20A 4BRNA 1BA1A 1Z6RA 2QWNA 3VGKA 4A62A 1QZ5A 1GLBG 4I6MB 3SMSA 4E1JA 4QS7A 1KAZA 5AQIA 4PL7A 3DXKA 4DHYA 5BRHA 4RTFD 3CETA 5AQQA 5BN8A 1Z05A 4CZEA 3ULEA 4B9QA 4FSVA 2QW9A 2NZTA 3FZKA 3IFRA 4DB3A 1ZXOA 2EWSA 3QB0A 4H5TA 2P9LB 2GTDA 3WEEA 2IVPA 1RGIA 4XEIA 3BEXA 3UKRB 3HBTA 4EHUA 5KPRA 4NO7A 3ENOA 2A3ZA 1GLDG 2ZGZA 3A0IX 3ENHA 3FZLA 3M1FA 4BRFA 3RSEA 3KVGA 3QDKA 3VEWA 1T6CA 3EO3A 2W40A 2CH5A 4BGBA 3KZBA 5AFUH 3U4LA 5LJWA 3JXUA 2Q1NA 2CGLA 2FSNA 3J8AA 5AFUA 3AAQA 3WQUA 4MLHA 4JN4A 4FWMA 1DKGD 1NGDA 4EHTA 3AARA 4B1ZA 3FLCO 2P9UB 4QS9A 3TU5A 4JD2A 4NB4A 3C7NB 4B1UB 4CD1A 3CJ1A 3QFUA 4K42A 1EQYA 1HKBA 1LCUA 5AQXA 2FF6A 4H0XB 2QM1A 4BC5A 3ZX3A 4BQLA 3VOVA 1HKGA 4CBWA 2FXUA 2P9PA 2HOEA 3DWLA 3D2FB 4BRCA 3C0BA 4BROA 3VEYA 5B8HA 4AM6A 4M63C 2GELA 1NGGA 5AZIA 1BG3A 3DXMB 1NGFA 1NLVA 4FWPA 4BR5A 4PL8A 2ITMA 1YUWA 3CQYA 3MN5A 4MO4A 5BR9A 3FFKB 3ATUA 3DXKB 4BQZA 1NGCA 3ZX2A 3WXLA 1NM1A 4MLEA 2E2PA 3LDNA 4ISEA 4MO5A 3ULEB 4HWIA 1BU6O 2E1ZA 3I8BA 2ASMA 3H6EA 2E88A 2YCHA 4FWQA 4O8KA 2V52B 1HUXA 4K43A 2BTFA 4BRPA 3WEEB 5E84A 4FO0A 4M7YA 4AM7A 5AQHA 5FPEA 4BVOA 3H1QA 3I33A 5EX5A 3RSEB 2Q2RA 1U6ZA 4BRGA 4F9OA 3L4IA 1XC3A 5LJVA 3U8XA 1MA9B 3GDQA 3HI0A 2HMPA 3ID8A 4YDUA 5KQDA 3H46O 4EIAA 2E1YA 4FOIA 5TKYA 4XH4A 2QWOA 2CGJA 3MMVA 1NGEA 3CJ9A 4BC3A 4CBUA 4JD2B 5AQSA 1RFQA 4CZFA 1NMDA 2HF4A 1HJOA 5KPTA 3U9DA 4BR4A 5AQJA 4WQ4C 1XQSC 2AA4A 2QWRA 4A61A 4WQ5C 1LOTB 2A42A 5AQYA 3CHWA 1GLJO 2P9PB 4DQ8A 1BUPA 4GY2B 3CJAA 3A8YA 1Y64A 2QWLA 4H5RA 4BRMA 3O8MA 5AZIB 2NLXA 1TUYA 1C0GA 3MN6A 4Z94A 3H3NO 3DAWA 3CQXA 3VEXA 2IIRA 5AQLA 2KHOA 3P4IA 5AQKA 4B1WB 3A5LC 4FPAA 3O1WA 4J8FA 2Q0RA 4K25A 5LY3A 4H0OA 2UYTA 1QZ6A 4IJNA 3VERA 1ATSA 2GUPA 2ZGYA 3VF2A 5AZJA 1NGHA 2GEMA 2AP1A 3WXKA 4EAHD 2YI1A 4CD3A 4KBOA 1QHAA 1NWKA 2YJFA 5EY4A 5JLFA 3EKSA 5BREA 3F9MA 4CZJA 1GLAG 3W3DA 3CIPA 5JLHA 3O5BA 3CJBA 1WOQA 2D0OA 5AQWA 5FPDA 1J6ZA 1IG8A 2P9KA 1IJJA 4CZIA 3O6WA 5ADXH 1BWFO 4BRAA 2YHWA 4B1YB 5ADXA 1MWKA 3LM2A 3QMLA 4FWNA 4FWOA 4BG9A 3WUHA 2P9IA 5F0XA 5FPMA 2Q36A 4ISFA 5BPMA 3MDQA 3ZX0A 1SQKA 4BG8A 1GLFO 2YJEA 3H45C 4CJ7A 2V51B 4JHDA 4JNEA 3VENA 4BVPA 1T6DA 3FR0A 3GBTA 4CZHA 2P9SA 5AQVA 1JCGA 4A2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSQA 4OPHA 3LDLA 1SL1A 1NJZA 3VQ5A 2WONA 3BF1A 1R0AA 2VG7A 4A5BA 4DUZK 3J81O 2OPSA 1Q18A 4H4OA 5HRPA 4WQ4A 4RW8A 4ELTA 4FWLA 4O5FA 3WT0A 2GUIA 3VTHA 3LALA 1VQ9N 2QWQA 5M1PA 3UKRA 3EEQA 1WNSA 1TUUA 3ZT4A 4DU1A 3TAPA 4IJAA 1IKWA 1X9SA 4NLBA 4HCBA 3L2VA 4E3SA 4CJQA 2D0AA 2UXBK 4A57A 2XRIA 3CCQN 3GL1A 5EVZA 3LL3A 1G99A 1RTJA 3QEWA 1LWCA 4C1NK 3PX6A 3AVCA 1N32K 3JS6A 1VQNN 2A41A 4ZTJA 1S1VA 3OYFA 4DQQA 5AQZA 4ISGA 4GW6A 1BA0A 2V7YA 3NAEA 3I8DA 4EFHA 4M41A 1QSSA 1IV0A 1C0MA 2IS3A 2YNHA 3DLKA 1NBWA 2A6AA 1MDUB 3QINA 1V4SA 1VRUA 2NNWA 4LFBK 2P9IB 1H1VA 1IBKK 1HKCA 4BECA 2F4VK 3LANA 3H3OB 4KHPK 1F21A 3CYMA 3SK3A 3M6GA 3TANA 4I9QA 4H03B 2PYJA 3VF6A 1JXBA 2GX9A 3GOIA 3AAPA 2C1GA 4GV6A 1U2VA 1WSJA 3O9QA 4BRQA 3CXCM 4BR9A 4AHUA 4CVNE 4WFAL 5SZTA 1XMOK 4NCGA 2P9NA 4CE9A 1I94K 1MWMA 4CEQA 3BY5A 5BR8K 5AQFA 4ICLA 2RF2A 3AY9A 5E26A 2FC0A 4KHWA 3QICA 1EP4A 3SV4A 3HO1A 5BN9A 4LF4K 3OBWA 1D9FA 4X62K 2X74A 1K8AO 4FLXA 4BC2A 4H5WA 1RT3A 3MAQA 3MXJA 3TAQA 2DFFA 2UUAK 4NYNA 1YVUA 4YDUC 3CPWM 3RVCA 3HRGA 4YY3K 1WAFA 4BE1A 1HNIA 3THVA 4DV4K 5CYMA 3WXIA 4W5RA 5M1KA 3ALYA 3SMPA 4A2BA 1YAGA 1VQLN 1RNHA 1CZBA 4L3QA 4DTNA 4O55A 3AO5A 4B3TK 4ZHRA 1KXPA 5KRTA 5LL6Z 2P5GA 3ATVA 5BPNA 1NJWA 3ZSWA 1NK9A 4B9SA 2F9TA 4WQ5A 4FJXA 4DFMA 5AQRA 5C24A 1RTDA 4B9TA 2P9LA 3LDOA 1ASWA 4XH5A 4CHQA 4IFEA 4DUYK 2PAVA 2FSKA 2ZJQL 1U2VB 3ITHA 3UB5A 4BRLA 3DYAA 1W7AA 3M8QA 1SAZA 3QEVA 4H0PA 1X3MA 3KWGA 4BRDA 3T69A 4IO8A 4M3UA 2P9NB 3SNNA 1VQON 1VSMA 4DFPA 4FLZA 3ZT2A 3EY1A 3IMXA 3NF8A 3VPZA 3SAGA 4FLTA 4H4MA 1YTAA 1K73O 3HL8A 1SL2A 1K6YA 5C2FA 2HBJA 4DF4A 3THXA 2P9UA 3CCVN 2QWPA 4M3YA 5BRDA 1UOCA 1TK5A 1T3VA 3C7NA 3VQBA 3QFPA 4FJKA 1BO5O 1CXQA 2YHBA 3KLFA 1YJ9N 4FXDA 1DGKN 4IZ9A 1CZAN 1CXUA 1QQNA 1NOZA 5FPNA 3EN9A 1EO1A 1HPZA 4M7XA 1IKVA 2D1KA 2E2NA 4AHCA 3V9SA 3RR8A 2QWNA 4A62A 3SMSA 2IC3A 5AQIA 1WLJA 3DLEA 3LP0A 5BN8A 4CZEA 2NZTA 4KHQA 4B08A 2GV9A 4FJHA 1ZXOA 3HVRA 2P9LB 2GTDA 3WEEA 4XEIA 1NKCA 3HBTA 4FJ5A 1VQ4N 5C2DA 4MQ3A 4CF0A 2HMIA 5FDLA 1RT1A 4KRFA 4G1QA 5KTQA 3RMDA 3SQ4A 1XMQK 4DLEA 2CH5A 4ILJA 3ZT3A 3KZBA 4BDPA 5AFUH 4OKJA 3T1YK 3AAQA 1HYVA 1OVQA 3THXB 3FLCO 2P9UB 3CCLN 3KD1E 4LH5A 2KQ2A 3TR8A 2BGGA 3QETA 3LPTA 4O0JA 2FBXA 3C7NB 4B1UB 3SI6A 4CD1A 1KVBA 1JLEA 4K42A 3DOLA 2KKZA 4CJLA 1LCUA 3PIOL 3O9RA 2QM1A 4BC5A 4Q5VA 2P9PA 4BRCA 1N6QA 3WNEA 4BROA 3OJUA 5B8HA 4AM6A 4DTUA 2O8DA 4DV1K 3ZSXA 4M3ZA 3CYGA 1RT7A 2ITMA 3MN5A 5FLXO 4MO4A 4CJ3A 2OZSA 3B6OA 1NGCA 3ZX2A 1D5AA 3WXLA 1IBMK 3EE8A 4CEEA 3I8BA 4N5SA 5HBMA 2E88A 2YCHA 4FWQA 4O8KA 4DKWA 4OKKA 1HRHA 1L3SA 1T03A 3OYEA 2JGUA 3WEEB 2YKMA 3DOKA 3KKRA 3J7ZO 1HYZA 3SJJA 1GOCA 5AQHA 4BVOA 2P5OA 4IEEA 3H1QA 3I33A 1VQ6N 3I0RA 4FJIA 1VSHA 4BRGA 1U6ZA 4CF9A 1JLGA 4FJ7A 2ZD1A 1XC3A 3IRXA 4FJNA 5JVGL 1OH7A 1NMNA 4FZYA 5A2QO 2X6NA 1QSYA 4YDUA 5KQDA 4OGCA 5C0YA 4FOIA 2CGJA 3MMVA 5CZ2A 4CBUA 3V9XA 1HJOA 5KPTA 4EZ9A 4WQ4C 3AVIA 1XQSC 5I3UA 1LW2A 1VSIA 4CGGA 2HNYA 3TSUA 2G8FA 2A42A 5AQYA 3CFPA 4DV2K 2P51A 4E7HA 1WBBA 1I39A 2P9PB 4DQ8A 4KKOA 4YOWA 1W0HA 1Y64A 2QWLA 2NLXA 2O8DB 4IDHA 1TUYA 3NH1A 1C0GA 5KI6A 2VGNA 3MN6A 1BHLA 1KCFA 3KWIA 3VEXA 1KD1O 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2Q1N A;  5AFU A;  3WQU A;  4MLH A;  3PX4 A;  3MX2 A;  2OA8 A;  4FLV A;  4JKG B;  3TU5 A;  4JD2 A;  4DS4 A;  4CJF A;  4JK8 A;  2Y1J A;  1TK0 A;  1NNE A;  3Q7C A;  1HKB A;  3TAR A;  5C42 A;  3OYM A;  2VGM A;  3O4N A;  1HKG A;  3D2F B;  4J2A A;  2OPR A;  4NXM K;  4KPY A;  2JLE A;  4U7B A;  4M63 C;  2GEL A;  4CIG A;  4IOA L;  4CIE A;  2ZE2 A;  4FWP A;  3LP2 A;  4DQP A;  3CQ8 A;  3FFK B;  4DF8 A;  4BQZ A;  4CJ5 A;  1NK5 A;  4MLE A;  1VQ5 N;  2KTQ A;  1BU6 O;  2JWK A;  4GKK K;  2ASM A;  3RRG A;  2V52 B;  1U49 A;  1RT5 A;  2O4I A;  3O3G A;  1X9M A;  1WSH A;  4BRP A;  3J80 O;  4KAZ A;  5C10 A;  4M7Y A;  4WE1 A;  1VAZ A;  2NRV A;  3CCS N;  4AM7 A;  3KTQ A;  5TKW A;  5FPE A;  4DU4 A;  1HJR A;  4FLU A;  4ILH A;  4FJJ A;  5EX5 A;  4DV0 K;  2Q2R A;  3C6H A;  3CCR N;  1T05 A;  4E19 A;  2HVH A;  3CFR A;  3CPE A;  4V19 S;  5KGX A;  2XHB A;  4K0K K;  2BH1 A;  1WB9 A;  1MA9 B;  1KQS M;  1X9W A;  3VMF B;  2IGI A;  2VG5 A;  4CGD A;  4DQS A;  4C8O A;  4Z0U A;  2NRZ A;  5TKY A;  1Y97 A;  3CJ9 A;  4JD2 B;  2HF4 A;  3MEC A;  4DSL A;  4BR4 A;  5AQJ A;  1NJY A;  1RDB A;  2AA4 A;  2QWR A;  4CW7 B;  1S9E A;  3BDP A;  4WQ5 C;  1LOT B;  2G8I A;  2B4J A;  5GIN A;  5GAD P;  3WNF A;  3A8Y A;  3HOS A;  4H5R A;  3QEI A;  4C1N I;  3DAW A;  3CQX A;  4GVE A;  3NBP A;  1RBV A;  2IIR A;  1HNX K;  3DLB A;  3OVN A;  3P4I A;  2QXF A;  5AQK A;  2HHI A;  4FPA A;  4CEF A;  5HP1 A;  3O1W A;  4K25 A;  4H0O A;  1QZ6 A;  2HHT A;  1LV5 A;  1SL0 A;  4M45 A;  1UA1 A;  2I5J A;  3WXK A;  1TL1 A;  2OZM A;  4FW1 A;  3NMU A;  4KBO A;  2HW3 A;  2HHU A;  2YJF A;  4R79 A;  5I42 A;  1XI1 A;  1EET A;  1GLA G;  1VSK A;  4FM2 A;  2YV0 X;  1NJX A;  3VQP A;  3O6W A;  5ADX H;  4BRA A;  2YHW A;  1C1B A;  1W97 L;  1BCM A;  3QML A;  1C0U A;  4FWO A;  3HXM A;  2A1R A;  3WUH A;  2P9I A;  3NHG A;  4DMN A;  5FPM A;  2Q36 A;  4ISF A;  5BPM A;  3QER A;  4KTW A;  1SQK A;  4BG8 A;  3U6F A;  4DLG A;  4CJ7 A;  1VQK N;  4JNE A;  3L2U A;  3MEE A;  4KH6 A;  5J2Q A;  3WNG A;  3FR0 A;  3GBT A;  1ASU A;  3JYT A;  2IOC A;  1O1W A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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