2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
2GEMA 1HKGA 2E20A 5AQFA 1X3NA 4BQLA 1YXQA 2D0PA 4K25A 4H0PA 5AQRA 4BRPA 2OANA 1GLJO 3FZHA 2QM1A 5BRDA 5BRFA 3WXLA 3WXIA 3CJAA 1G99A 3IMXA 5EVZA 3A8YA 1QHAA 5FPMA 3QFPA 2CGKA 1HX1A 4BRQA 3ZETB 2YHYA 2AA4A 3HM8A 3G25A 3O08A 1ESVA 3SK3A 4CZMA 4YDUA 1V4TA 5AFUH 2KHOA 3VF6A 5KQ8A 5LJWA 4FOEA 1QQOA 3HSCA 3JXUA 4QS8A 3MK6A 5E84A 3DXKA 3CJCA 4A2BA 3WXKA 2P9IA 3IDHA 4J8FA 4IJAA 2Q1NA 3ULEB 2IVOA 5EXWA 1ATSA 4K43A 1BG3A 3WUHA 2QWPA 1KAXA 4AM6A 2YJEA 2P9LA 3DJCA 3CERA 4BRCA 5JICA 3QBWA 2FSKA 1ATNA 1GLAG 3VEWA 5KPRA 4WQ4A 4RTFD 5BPNA 3H3OB 4PL7A 3MN6A 3GG4A 4Z94A 2Q36A 4H0YB 3AARA 4BR2A 5BPLA 3EL2A 4JAXA 1HJOA 3R6MA 5AQZA 5AZIB 5AQHA 1DKGD 3H6EA 1EQYA 3LDLA 3S41A 2GTDA 1D4XA 3B8AX 3I8BA 2HF4A 2YCHA 4FWPA 4H5RA 4A2AA 3VERA 1NBWA 4WQ5C 4IJNA 4H0TB 4B1WB 2A6AA 3VEOA 4CZHA 3HBTA 1JCFA 1JCGA 1S22A 2UYTA 4FWQA 1QQNA 3LDNA 3R8EA 1U2VB 4BGBA 2I7PA 1KAYA 1WOQA 1NMDA 5B8HA 2E2OA 3L6QA 3FZMA 3WXJA 1GLBG 4ISGA 2YHWA 1TYQA 2ASPA 3EKSA 3ZX2A 2P9NA 3C7NA 1NGJA 3SLCA 3SMSA 4MO5A 3U8XA 2GWJA 3W0LA 3LL3A 4BRKA 1BA1A 3A5LC 4H03B 4M63C 3TPQA 2P9UA 4BRLA 3FZLA 2A3ZA 4AM7A 4FWKA 4H5WA 1BWFO 5BR9A 4PKHA 3VOVA 2IIRA 2EWSA 5BN9A 3O1WA 2AP1A 2P9UB 4DCHA 4PKGA 2GELA 5AFUA 3SJHA 4M7YA 3UKRB 5AZJA 5ELZA 2ASMA 3MN7A 4DHYA 4B1ZA 2H3GX 1GLLO 3U9DA 3ZEUA 4FWNA 4BREA 5BPMA 4FWOA 5AZJB 3VENA 3EKUA 3GBTA 4GNIA 2D4WA 2FF3B 2FSJA 3WEEB 3ZEUB 4FO0A 4BR9A 1ATRA 4F9OA 3ZX3A 5AQJA 3ZETA 4IZ9A 4CZGA 5AQNA 3A5NC 1Z6RA 5EOYA 3WQTA 4BR5A 3I33A 1ZBSA 1S3XA 2HMPA 4BROA 4CJ7A 1NGHA 2Q0UA 3CI5A 4I6MB 3IUCA 4QS7A 2Q97A 3JS6A 3KZBA 3AY9A 3VF2A 4BRFA 3FZKA 1WUAA 5BN8A 4FWRA 5F2RA 3VETA 1IG8A 3ULEA 4PKIA 1T6CA 3O80A 4BVPA 2ZWHA 2W41A 3CJBA 2VYPA 2ZGYA 2ITMA 4MLEA 2I7NA 2HF3A 2NLXA 2P9SA 3VEXA 1KAZA 3F9MA 2D0OA 3CQYA 1LCUA 3ENOA 4B1VA 2Q31A 3HZ6A 1C0FA 5AQOA 5F1XA 5I9EB 5BRHA 1GLEG 2CH5A 3ATVA 2P9SB 5AQVA 2E1ZA 2CGLA 4FL9A 1SQKA 5AZIA 2HOEA 1Z05A 3AAQA 5AR0A 1MWMA 2V7ZA 1Y64A 3FLCO 1CZAN 3HTVA 2J4RA 4MO4A 1MA9B 4IWVA 2E88A 1ZC6A 1DEJA 4BR4A 2CGJA 4JN4A 2Q0RA 2PAVA 3LDOA 2QWOA 3M3ZA 5JMVA 1K8KB 3MCPA 3DAWA 3DWLA 3A5OC 3ZX0A 1U2VA 1X9JA 5AQWA 3VF4A 5AQLA 3BF3A 3CIPA 3EZWA 3BP8A 4DB3A 1NWKA 4L3QA 4BRGA 4BG8A 4M7XA 4NB4A 1QZ6A 1E4GT 3VPZA 4BRNA 3AAPA 3ID8A 5BREA 4EHTA 1NGIA 3GE1A 3BF1A 2V52B 1XQSC 5AQTA 4NO7A 4YDUC 1BOTO 3UKUA 3VEYA 4B1YB 4JHDA 3TU5A 4O8KA 4XH5A 1H1VA 3IFRA 4BC4A 2YJFA 3CETA 4EAHD 4BC5A 3FGUA 4K41A 1BO5O 2BTFA 2E2PA 3ATUA 3UKUB 5JLFA 3VEZA 4JHDB 2ASOA 5AQGA 4B1XB 1TUYA 5AQSA 3LDPA 1SZ2A 4IO8A 2D1KA 3UKRA 1HPMA 4H5VA 3SMPA 1NGEA 1HUXA 1V4SA 4C23A 1JCEA 4FOIA 4IXCA 4H0VB 4CZIA 1NLVA 1GLDG 2A42A 1GLFO 3H46O 4CZFA 2A41A 3O4WA 3A5MC 4QS9A 3H3NO 4PL8A 3RSEB 3WEEA 2FLOA 1MDUB 4BGAA 3OHRA 4FSVA 1BDGA 1XUPO 2E8AA 5ADXH 3MMVA 3VEVA 1R59O 2P9KB 3D2FA 4BR7A 4XH1A 3DXMA 2E1YA 2W40A 4I6MA 5FPEA 2PBDA 4HWIA 2DPNA 3BUZB 3BEXA 2QWMA 1BUPA 1MWKA 2NRHA 5AQKA 4H0XB 1NGDA 3CJ9A 3D2FB 4BVOA 2NZTA 4CZJA 4LC9B 5AQUA 3DXMB 5KQDA 3WQUA 2P9PB 2IVPA 2QWRA 1KXPA 4H5TA 4XH4A 3M1FA 2A40A 1RDWX 4WQ5A 2V51B 5AQMA 1BA0A 3CJ7A 4BRDA 2BUPA 4CBWA 4EHUA 2VCPA 3R9PA 2VWBA 1HKBA 4CD3A 3ENHA 2E2QA 3CHWA 2F9WA 4H5NA 4EFHA 3QMLA 4FWMA 3VGLA 4BR0A 4JD2A 3FZFA 2IVNA 3J8AA 4BQZA 2YI1A 3EN9A 5FPDA 5LJVA 2FSNA 2GUPA 3A0IX 3QDKA 3D2EA 5EY4A 3L0QA 3QICA 4BRMA 4JD2B 5LY3A 3C0BA 1U6ZA 3VGMA 3WT0A 4CI6A 4A61A 4A62A 1NGFA 3D2EB 5AQXA 1K8KA 3M6GA 4BRAA 2QWNA 4CBUA 3U9ZA 5AQYA 2FXUA 3CQXA 3D7EO 3DXKB 5F0XA 2E2NA 4BG9A 1ZXOA 2P9IB 1QZ5A 3HI0A 4ISEA 4Y0WA 3QFUA 1LOTB 5AQIA 1TUUA 3VESA 2P9LB 1RFQA 4CZEA 1NM1A 4CBXA 2GWKA 3MDQA 3P4IA 4GY2B 2Q2RA 3EO3A 3LM9A 3QBXA 4B1UB 4B9QA 5TKYA 4JNEA 2QXLA 1NGCA 1P8ZA 3CJ1A 3LDQA 3FE1A 3QB0A 4K42A 4KBOA 3GL1A 3U4LA 2QW9A 3KVGA 5ADXA 4RCHA 3O6WA 1YAGA 3H1VX 1DGKN 2CH6A 3O8MA 2V7YA 1GLCG 3GDQA 1YVNA 3KHYA 4DQ8A 1BU6O 5AQPA 3MN9A 4FWLA 1XC3A 3FR0A 2YHXA 4ISFA 2FF6A 1Q18A 1X3MA 1HLUA 1NGAA 5EX5A 3RSEA 1J6ZA 4O5FA 1YUWA 1E4FT 4FPBA 2WUSA 1HKCA 2F9TA 3W3DA 4WQ4C 4FWSA 3UE5A 4BC2A 1C0GA 1TYQB 1NGGA 3L4IA 4BRHA 3H45C 2P9KA 2P9NB 4HTLA 3C7NB 3VGKA 3O1BA 4RWTA 1T6DA 4CD1A 5FPNA 5JLHA 4EIAA 1SAZA 4MLHA 3H1QA 2P9PA 5KPTA 4FPAA 4XEIA 1IJJA 3FFKB 1QQMA 4BC3A 4E1JA 5CE3A 1OKJA 4H0OA 5AQQA 3LM2A 1NGBA 3MN5A 4CZLA 2A5XA 5E26A 1T44A 2ZGZA 2ZF5O 3GOIA 1RGIA 4WYBA 3UB5A 5KPZA 4BRIA 3O5BA 4CZKA 2QWLA 2QWQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E20A 3NF6A 5JVGL 1WBBA 3KD1E 4BQLA 1ZBLA 4FZXC 4RG8A 1GLJO 1YTUA 2QM1A 5BRDA 4LD0A 3WXIA 3CJAA 4JK7A 4M3RA 2FBXA 5EVZA 1YVUA 3A8YA 4CHPA 4NYFA 3OYCA 4BRQA 2YHYA 2P51A 4DV4K 3O08A 1NJZA 1ESVA 4DR4K 5AFUH 4FJNA 4KHQA 2KHOA 4ZTFA 3AVMA 4FOEA 3M8SA 1QQOA 3HSCA 1REVA 5C24A 3VQAA 3DXKA 1WSEA 3K5MA 2P9IA 3V9ZA 1ATSA 3PX4A 4BACA 4GKKK 4FJGA 4W5RA 2DFFA 3HSTB 4DTOA 1YITN 2PY5A 3HK2A 2Y1JA 3T69A 3QBWA 4CJWA 1WB9A 2FSKA 1GLAG 4WQ4A 5BPNA 3THWB 4XJXA 1NJYA 1D5AA 5FRMA 2Q36A 4H0YB 4BR2A 3OA9A 3PIOL 5CY4A 4ID5A 3CYMA 3HPHA 5AZIB 1TAQA 2E5LK 1S1WA 4JKDA 4CJUA 2KQ2A 2HF4A 3SQ4A 3VERA 4WQ5C 3L2QA 1NKBA 3NGIA 3C65A 4B1WB 4M42A 3KLHA 4KTQA 3ULDA 4CZHA 3OS2A 4JS4A 5C0YA 5M1NA 1S22A 4FZYA 4FWQA 2ZD1A 3PLAA 3DM2A 5FRNA 3HXMA 2FBTA 2UXDK 1QE1A 4OKEA 3QEPA 1LWCA 4CF8A 3SPZA 4JI1K 4DTNA 4CEFA 3RTVA 3SLCA 1VQON 2GWJA 4CJTA 3LL3A 4M63C 4BRLA 3I56N 1B9FA 3AGKA 5BR9A 4PA1A 3AVBA 1C0MA 1E3MA 2P9UB 5HLFA 4DCHA 4ICLA 3SJHA 3UKRB 2E6MA 2IAJA 2H3GX 1IV0A 4DF8A 1N5YA 1XNRK 2F7TA 4DSEA 4FWOA 4CF9A 3O9RA 4LH4A 3EKUA 3PO4A 4H4MA 3T3FA 4JKFA 1LAVA 2FF3B 4ILHA 4NLCA 4BR9A 4F9OA 4FO0A 3ZETA 3M8PA 3KLEA 3VQBA 4OKJA 3A5NC 3TAFA 5JS2A 4ID1A 4G9ZA 4IBNA 1ZBSA 2HMPA 4UQGA 3BDPA 3CI5A 4I6MB 4EZ9A 4C1NK 2Q97A 1TKDA 4KRFA 3VETA 4C8OA 4ILGB 4Z0UA 1T6CA 3AVJA 3C6TA 3CJBA 2VYPA 3HOTA 4MLEA 3K59A 3F9MA 4TSXA 4YHHK 4C8NA 5GINA 1B92A 3AA2A 3V9WA 1C0FA 5AQOA 1GLEG 2CH5A 3ATVA 5GAEP 3AVHA 1CZBA 5D3GA 5HP1A 3ZYYX 3QEWA 4E7JA 1ZC6A 1DEJA 4BR4A 4E89A 4ELUA 3V9SA 4FCYA 2QWOA 3DLKA 5JMVA 1K8KB 3MCPA 4FJIA 3DAWA 1LAWA 5TKWA 1BI4A 2YNFA 4GMJB 4F4KA 1LWEA 3BF3A 4A59A 4YNQA 5C2DA 4DR5K 3TAPA 4L3QA 4M45A 3SJJA 4BG8A 4DU1A 4ZHRA 4NLBA 4NB4A 4DR3K 1HQEA 3AVLA 4BRNA 1BL3A 2RHKA 5BREA 1NGIA 4DR2K 3GE1A 3BF1A 3L8BA 5T7BA 1XHZA 3V1QA 1HPZA 1FK9A 1BOTO 3CCMN 4DFKA 3TU5A 2O8CB 3NHGA 2W6LA 2YJFA 3CETA 3VQEA 4BC5A 4K41A 5HOOA 3UKUB 4DR6K 4CHQA 3KJVA 3LDPA 4IO8A 2D1KA 3TR8A 4DFMA 2Z1GA 5SZTA 4FLWA 1V4SA 1NGEA 5FROA 4C23A 3O3GA 1UAXA 1NLVA 2A42A 1UWBA 2OPQA 3HVRA 3AVGA 3DYAA 4DQIA 4DSKA 1XNQK 3O4WA 3A5MC 4FW1A 1Q8IA 4HUFA 3H3NO 4CE9A 2FLOA 3U6FA 4BGAA 5M1QA 3QEIA 2E8AA 4BE1A 1IBLK 4B3SK 3J81O 3KD5E 2P9KB 4XH1A 5FPEA 4DV6K 2DPNA 4IOAL 1VSLA 2O8DB 3OYIA 4AHRA 3HJFA 4BVOA 2HVIA 3CM6A 4DV1K 4M3TA 2EHGA 2HW3A 2QWRA 2X6NA 4XH4A 4B08A 2DTUA 1RDWX 1TKXA 2V51B 4DQSA 1L3SA 1EWQA 4KB1A 2BUPA 4CBWA 2HHIA 1OVYA 1CXQA 3P31A 5KI6A 4F3OA 1HKBA 3MAQA 1TV6A 2E2QA 3VN5A 3CHWA 2F9WA 3ZSWA 1TL3A 3VQ5A 2HHXA 4JD2A 4B9UA 3J8AA 4KV8A 5LJVA 3SAGA 2GUPA 4CGGA 3SZ2A 4KHNA 2VQFK 5EY4A 2Q3SA 5E41A 4BRMA 4DTXA 4IO9L 1UA1A 1VRTA 4CI6A 1KFDA 4AHUA 3QESA 3G4SN 5AQXA 4DMNA 4CBUA 5AQYA 4N56A 3VA3A 2NNWA 3D7EO 4JI2K 5F0XA 1UA0A 2O8FB 1QZ5A 5IT9O 4G1QA 3QO9A 4AH9A 1WSGA 4YY3K 4GVMA 4B9MA 3SBTA 3VQ4A 1OVQA 2VQEK 4FLVA 3EO3A 4B1UB 4B9QA 4WFAL 2OPPA 5MLCQ 1NGCA 3M8QA 1VSFA 3CMEN 1P8ZA 4DQPA 1A5VA 4OVLA 2XY8A 2BE2A 3MEDA 3FE1A 4AHSA 1IKXA 4BE2A 3AVNA 3RRHA 1IKVA 3WNEA 4DU3A 1RBVA 3U4LA 4AHCA 3PO5A 1VQNN 5ADXA 4F3TA 4M3XA 2CH6A 3O8MA 5KTQA 4KHYA 2F4VK 1Q9YA 3QEXA 3OY9A 3IS9A 1IBMK 3KWGA 3FR0A 4I9QA 1X9WA 4ISFA 3THVA 4DUYK 4DR1K 1JXEA 1HLUA 4DSLA 2GV9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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