2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
4BVOA 4BGAA 3WXLA 3AAPA 3ENHA 2F9TA 3HBTA 3KZBA 1NBWA 3CJBA 4IJAA 1BOTO 2E1ZA 4BREA 3C7NB 3LM2A 4BC4A 3B8AX 3BF1A 4O5FA 2Q1NA 4MLHA 3CJ1A 3DWLA 1JCFA 3D2EB 2QWOA 2HOEA 1U2VA 2P9PB 5AQGA 4BRMA 1BWFO 3AY9A 5BREA 3H1VX 2P9UB 5AQIA 3VERA 2QW9A 2YCHA 3L6QA 4BRGA 5CE3A 3O4WA 5EVZA 3QFUA 4M63C 5AZIA 4MO4A 2GTDA 5FPMA 5E26A 3SMSA 3ZETB 4FWSA 3J8AA 4CZLA 3O1WA 3HM8A 3FR0A 3QBXA 4EHTA 1BUPA 4CD1A 5LJWA 3IUCA 4BRNA 2E2NA 5AZJA 4AM6A 2YHXA 3ULEA 3CJ9A 4CZMA 4B1YB 4FPAA 3LDQA 1HKGA 2YJFA 3GBTA 4FOEA 3VEOA 3BEXA 2VWBA 4BC2A 4DB3A 2E2PA 2CGKA 4ISEA 5B8HA 3WXIA 5BRFA 5EOYA 4FL9A 2ZWHA 3EN9A 3M3ZA 5AQFA 1JCEA 1TYQB 4ISGA 2QWQA 3MDQA 3WXJA 4BC5A 4IZ9A 4JNEA 4K25A 4BRQA 5ADXA 4FOIA 4A62A 1RGIA 3EO3A 4H5RA 3UKRA 1IG8A 3DXKA 3O1BA 2D0OA 4I6MB 1X3MA 3BF3A 5ELZA 5BN9A 4DCHA 4BR9A 2AP1A 3O80A 3VF6A 4BG8A 4HTLA 1Z6RA 3TPQA 4K43A 4FWPA 1Z05A 3EL2A 4H0XB 5AZIB 1IJJA 3UKUA 1GLJO 3QFPA 1MWKA 4XEIA 2ASOA 2V52B 4GY2B 3ATUA 2QWMA 1NMDA 3VPZA 3CJCA 3H6EA 1TUUA 1X9JA 1SAZA 4ISFA 3H46O 4IXCA 3JXUA 1CZAN 3CI5A 4H5NA 3HTVA 4B9QA 2CGLA 3C7NA 3G25A 4BR4A 3VGMA 2W41A 5F1XA 3QB0A 5BPNA 3S41A 1C0FA 1HJOA 3CJ7A 3D7EO 1S3XA 4C23A 1HKCA 1D4XA 1Q18A 5JLHA 5AFUH 3DJCA 5EX5A 3O6WA 3L4IA 4NO7A 1RDWX 2YJEA 1GLAG 4GNIA 4JD2B 4BR7A 1DKGD 3WEEA 2NZTA 3DAWA 2J4RA 5AQOA 1NGBA 3IFRA 3LM9A 1E4GT 1HX1A 1NGGA 4MLEA 4M7YA 5JMVA 4CZFA 4LC9B 2GWJA 2ZGYA 3UE5A 3JS6A 4BRCA 1MDUB 1NGAA 3CIPA 5LJVA 1R59O 1MWMA 4O8KA 2GWKA 4A61A 2BUPA 2F9WA 2GELA 4QS9A 5AQKA 4RCHA 1P8ZA 1GLEG 3A5NC 2W40A 1T6CA 3VGLA 4BRAA 4PKIA 5AQHA 1JCGA 2BTFA 5E84A 1HLUA 3ZX2A 4WQ4C 1HUXA 4H03B 5BRDA 3VESA 3A5OC 4BQLA 5AR0A 3C0BA 3EKUA 1G99A 4BVPA 2V7ZA 5AQUA 4H5VA 3H1QA 3R8EA 4BR5A 3GOIA 3WQTA 3FZKA 3SMPA 3R9PA 4CJ7A 1ZBSA 1XC3A 2EWSA 3ZEUA 4QS8A 4EFHA 1ZC6A 3RSEA 2IIRA 1SQKA 2UYTA 1QZ6A 4YDUC 2QWPA 3SLCA 3W0LA 2YI1A 1BG3A 1BO5O 3FE1A 4K41A 4F9OA 5KQ8A 3BUZB 3CQXA 3LDOA 1KXPA 2YHWA 4B1WB 1YVNA 1NWKA 2E2QA 1X3NA 4CZJA 2QM1A 4CZEA 3MMVA 2P9LB 2Q36A 3M1FA 3DXMB 1QQNA 5ADXH 3O5BA 3H45C 5AQQA 5LY3A 2WUSA 4K42A 3MCPA 3A0IX 3VEYA 1BDGA 3FZFA 2GEMA 1GLLO 2P9NA 1KAZA 1NGCA 2Q97A 4BRLA 3LDNA 4DHYA 4KBOA 2A41A 2H3GX 3VENA 1NM1A 2QWNA 2HF3A 1LCUA 3QICA 3FZHA 3HZ6A 2ITMA 4FWOA 4CZIA 1BU6O 1WOQA 4FWLA 5AQPA 3MN6A 1TYQA 4HWIA 4IJNA 4J8FA 4A2AA 3I33A 4IO8A 5EXWA 1YAGA 1DGKN 2E1YA 3KHYA 5EY4A 3O8MA 4EAHD 4PKGA 3ID8A 1K8KA 4FWMA 2P9IA 4PL7A 4YDUA 4BR0A 1T44A 4NB4A 5AQWA 4EIAA 2QWLA 3SJHA 2P9LA 2ZGZA 3WEEB 3FZLA 3F9MA 4MO5A 1V4TA 4CI6A 4E1JA 2ZF5O 1HPMA 2P9SA 3CJAA 4BQZA 4L3QA 1XQSC 3BP8A 3O08A 5AFUA 5AQYA 5JLFA 3VGKA 3HSCA 1QQOA 4BGBA 2Q0RA 2D4WA 4B1VA 3ZEUB 4WQ4A 1V4SA 2AA4A 2D1KA 1YUWA 3D2EA 4DQ8A 1NGIA 2P9PA 5AQVA 1GLFO 4JN4A 1U2VB 1C0GA 2P9UA 3A8YA 3GDQA 3H3OB 3WQUA 3LDPA 4CZKA 1NGFA 2DPNA 4FWNA 2Q0UA 3LL3A 4H0VB 3VEZA 1QZ5A 1LOTB 2HF4A 3M6GA 1ZXOA 2FLOA 4JHDB 1DEJA 1J6ZA 2E20A 1QQMA 3VF4A 5BR9A 1NLVA 1T6DA 2KHOA 4EHUA 5F2RA 1QHAA 1MA9B 3HI0A 1H1VA 1NGEA 2NLXA 3UKUB 3VEWA 1U6ZA 4M7XA 2IVPA 2I7NA 4RTFD 1NGHA 3QDKA 5AQNA 5AQXA 5BRHA 3P4IA 3TU5A 2A40A 4H5WA 3SK3A 1RFQA 4BRPA 5AQZA 1HKBA 2QXLA 5BN8A 3ATVA 1YXQA 4JD2A 1GLCG 1K8KB 3ENOA 4FPBA 4WQ5A 3WXKA 4FWRA 3DXKB 5AQJA 4XH4A 3U9ZA 3U8XA 4CBWA 3A5MC 3LDLA 4QS7A 3UKRB 4PL8A 4H0PA 2V51B 1GLDG 2ASMA 3QMLA 3CETA 5AQRA 5KPRA 3KVGA 2D0PA 3AARA 4CBUA 2PBDA 3VEVA 3I8BA 4BROA 3GG4A 5AQTA 4FWKA 4BG9A 3AAQA 4FO0A 2OANA 5FPDA 4Z94A 1NGDA 4IWVA 3ZX0A 4H5TA 4FWQA 4B1ZA 3CERA 2QWRA 2P9KA 3MN7A 2FSNA 2GUPA 5AQLA 3MN9A 5AQMA 5FPEA 2IVNA 5AZJB 4B1UB 1NGJA 3ULEB 1E4FT 4BRDA 2V7YA 3H3NO 1Y64A 2A3ZA 4H0TB 3DXMA 4H0OA 1OKJA 3W3DA 1BA1A 3U4LA 5FPNA 4XH1A 1KAYA 4CBXA 5I9EB 2P9SB 1KAXA 2I7PA 2E2OA 3FFKB 3ZX3A 4I6MA 4CD3A 2Q2RA 3FZMA 3WUHA 5TKYA 2P9IB 2YHYA 3WT0A 2IVOA 3IDHA 1S22A 4JHDA 3FGUA 2VCPA 3R6MA 1ATSA 1ATNA 2PAVA 3U9DA 1GLBG 3VOVA 4BRIA 5BPMA 1SZ2A 5F0XA 1BA0A 2NRHA 2P9KB 2FSKA 4JAXA 4BRFA 5AQSA 1WUAA 3FLCO 2FF3B 2CH6A 3EZWA 3MK6A 4CZHA 5KPTA 1ESVA 2E8AA 2A42A 4A2BA 2CGJA 4H0YB 4BC3A 3L0QA 4FSVA 2FF6A 4RWTA 3GL1A 2VYPA 3D2FB 1EQYA 1XUPO 2A6AA 4BRKA 2FSJA 2P9NB 5JICA 1TUYA 2CH5A 3QBWA 3VETA 2Q31A 2FXUA 3IMXA 3UB5A 3EKSA 4BRHA 3OHRA 4B1XB 3VEXA 4AM7A 2HMPA 2ASPA 3CQYA 4CZGA 4WYBA 3MN5A 2A5XA 3A5LC 4Y0WA 4BR2A 3VF2A 3D2FA 3CHWA 4XH5A 3GE1A 3ZETA 4WQ5C 2E88A 5BPLA 3RSEB 1ATRA 4PKHA 5KQDA 5KPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BGAA 3ENHA 5KGXA 4GW6A 3CJBA 4CHNA 2XY6A 4WE1A 4BC4A 2Z1HA 3B8AX 5KGWA 4H8KA 3CJ1A 3VQDA 3DM2A 2FBVA 3D2EB 2QWOA 2ZJQL 4CERA 5BREA 3H1VX 3SV4A 2YCHA 4GMJB 2P5GA 2C1GA 3AVMA 4RW8A 3QNNA 4IFYA 3K58A 2G8WA 4M63C 1VSLA 2QA4N 4MDAA 2GTDA 4EP4A 1M1KO 4DSIA 3HK2A 3O1WA 3HM8A 3KKSA 1NJXA 1S1VA 3NH2A 3J81O 1JLAA 3CQ8A 1S9GA 5LL6Z 4CD1A 3DLHA 1KC8O 3OYCA 4BWJA 1D8YA 5AZJA 3THWB 4E72A 3IKMA 4AM6A 1KD1O 4JI4K 1W7AA 4B1YB 1KCFA 3T7ZA 3HPGA 3GBTA 5DM6L 2VWJA 4DTRA 3NH0A 5M1OA 3WNEA 4XJXA 1RBSA 4I9QA 1S6PA 4BE0A 4Z4HA 5FDLA 3M3ZA 4CJQA 3E9OA 1JCEA 1TYQB 4AQYK 5C0YA 4YOXA 1P90A 4BC5A 2G8UA 4K8XA 3SNNA 3JSMA 3LZJA 4BRQA 5DK5A 1ASUA 3TANA 3VQCA 3UKRA 1IG8A 3O1BA 1X3MA 3LP1A 3N4QA 5BN9A 3SPYA 4DSFA 3R3LA 3VQEA 3THYB 4NCGA 1FK9A 3TPQA 5AJ3K 2BANA 2YNHA 1NK0A 4F8RA 4FJHA 3E9PA 1MWKA 1QHTA 1BCOA 3TSQA 3EE8A 4YOTA 2HSTA 3CJCA 4YFUA 1I3AA 2QI2A 1TUUA 1EP4A 3M5RA 4ZHRA 4IXCA 3Q7CA 1CZAN 3CCMN 2YNGA 1QSSA 4H5NA 2KZZA 1SS6A 4B9QA 3D45A 3MXJA 3C7NA 2W00A 2A1SA 3VQ8A 1HJOA 5CYMA 3NHGA 3KJVA 3PIPL 2HB5A 2VG6A 3QEVA 2XY8A 3PX4A 5JLHA 1Q18A 4C8LA 3SQ4A 4ID1A 4NXMK 1RTHA 3OYLA 1S1UA 3KLIA 1NJZA 1RDWX 2YJEA 4YOWA 1N34K 3S3OA 4GNIA 3WEEA 1ZYQA 2NZTA 3DAWA 5AQOA 1NGBA 2LSNA 3KTQA 4OKKA 3BDPA 1E4GT 1F21A 4BWMA 4M7YA 4CZFA 2ZGYA 3CIPA 4O55A 3MCAB 2GWKA 3OW2M 1GOBA 1XC9A 1BI4B 5AQKA 3A5NC 1GLEG 1RT2A 4PKIA 4B8CA 4FLUA 1J5OA 3O9RA 4B3TK 3LWLA 5LMNK 2PZSA 4CGFA 1U47A 5AQUA 1Q82O 3FZKA 4FJGA 2G8FA 1N8RO 1ZBSA 1XC3A 2EWSA 1HR0K 3RSEA 1SQKA 2KQ2A 2E6LA 3SLCA 2QWPA 3AO5A 2YI1A 3AVNA 4M3ZA 5HRNA 3CQXA 1L3UA 2RKIA 5BR8K 5C15A 4B1WB 2WC9A 3DLGA 3LDSA 1CZBA 1HYSA 1X3NA 4CZJA 4CZEA 4PA1A 4CJUA 2Q36A 3M1FA 3DXMB 5ADXH 1K8AO 3H45C 5AQQA 4BY9C 1VQ5N 3TR8A 1HNIA 2GUIA 2XHBA 1L5UA 3A0IX 1JKHA 1UOCA 3KIOA 1GLLO 1KAZA 1RBUA 2Q97A 1U48A 4J2DA 1YVUA 2A41A 4IO9L 2X6SA 1XMQK 1LCUA 1VSJA 4FWOA 1QQCA 5EU7A 1T05A 1W0HA 4CZIA 3HXMA 3SJJA 4FWLA 1LW0A 3MN6A 1J5EK 1QE1A 4A2AA 1YAGA 4FLVA 1DGKN 2E4LA 2I5JA 1B9FA 1J9AA 2JWLA 4PKGA 3ZYYX 4LH4A 1K8KA 4DLEA 2F4VK 4FWMA 4I2QA 2QK9A 3K9KA 4KH5A 1U45A 1J53A 4NB4A 3DMJA 2QWLA 2P9LA 2ZGZA 3AVJA 3ZT2A 4MO5A 4E1JA 3OYBA 4JKBA 1RT7A 4FJ7A 1ZBFA 2YHAA 1XQSC 2HBLA 5FROA 5FRMA 5AFUA 1QQOA 4DR3K 2GX9A 3MX2A 2Q0RA 3BZKA 2D4WA 3KWIA 4GV3A 4DQ8A 3ZT3A 3NGYA 1GLFO 1U2VB 4DQRA 4CZKA 3LDPA 2Q0UA 3VEZA 1QZ5A 4FM0A 4W5TA 4CVNE 1QQMA 3VF4A 5BR9A 4I2PA 3ZLJA 1BCMA 2HHUA 3G6EN 1MA9B 3G71N 1N33K 3AO2A 4M7XA 4B3OA 2I7NA 3OS2A 1NGHA 3QDKA 1C1AA 3I55N 4H4OA 4H5WA 1KVBA 3PO4A 1HKBA 4DU1A 3MWTA 3TSUA 3ATVA 2KKZA 1YXQA 3ENOA 3F5TA 4N56A 3WXKA 3NGZA 4A59A 5AQJA 3U8XA 1YTAA 4ILJA 4LFCK 4O8UA 4CK1A 2NRZA 4H0PA 4CJ3A 3ULDA 4OKJA 1TKXA 2PBDA 1HNXK 4CK2A 4E89A 3GG4A 3AAQA 4HUFA 4DU3A 2P1JA 2OANA 3BGRA 5FPDA 1NGDA 5GAEP 4FJ5A 4B1ZA 3IAYA 4KB0A 2QWRA 1NK5A 3MN7A 4B8AB 1NJWA 3V4IA 1D9DA 4FW1A 5AQLA 3CYGA 2R7YA 1VQMN 5FPEA 4FM1A 3ULEB 2V7YA 3H3NO 4DTJA 2A3ZA 4CIEA 4FJLA 3W3DA 1HJRA 3CF5L 5HP1A 1XHZA 3HJFA 3DOLA 1KAYA 3SV3A 1OVQA 3E66A 3OYKA 4CF2A 4ELTA 2PY5A 1KAXA 3ZX3A 3EEQA 3OVNA 4CF8A 3O9SA 1TAUA 5TKYA 3T19A 4ZTFA 3WT0A 1REVA 3IDHA 3THYA 1S22A 4JHDA 3FGUA 3L2QA 2VCPA 1NKCA 1ATNA 1GLBG 4CJWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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