2OANA

Structure of oxidized beta-actin
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
366
structure length
355
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Molecular and Structural Basis for Redox Regulation of beta-Actin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
total genus 116
structure length 355
sequence length 366
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2oanA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2oanA03
3EL2A 1BA1A 1U2VA 3A8YA 4BRIA 3H6EA 3H3OB 1MDUB 1Z6RA 2E88A 4H0VB 3KVGA 4FWQA 3G25A 3O6WA 1DEJA 3VETA 4WYBA 4FO0A 2Q97A 4DQ8A 3CQYA 5I9EB 3MN6A 3EKSA 2BTFA 2CGKA 5AZJB 2QWQA 4Z94A 3FR0A 4XH1A 3DJCA 3CHWA 3GBTA 4K42A 2Q2RA 4FSVA 2QM1A 1NGAA 2P9PB 1GLFO 3VF6A 3WQTA 4ISEA 2NLXA 3ENOA 1G99A 1NWKA 2HF3A 2GTDA 4RWTA 3ULEB 2NZTA 3D7EO 3WQUA 5JLHA 5KQ8A 3WT0A 4K41A 5BPNA 1T6CA 2IVNA 4IXCA 1P8ZA 1NGBA 2EWSA 2P9IB 4H5TA 3HZ6A 4JHDB 4BGAA 3ATUA 1X9JA 2NRHA 3ZEUB 5BREA 1X3NA 4BRKA 4M63C 4PKHA 3LDNA 4JN4A 3LDLA 3U9DA 4H0YB 4EHTA 3CJ1A 3D2FB 3FZFA 1HJOA 2D0OA 2E2NA 5F2RA 1LOTB 2HF4A 3VEYA 4GNIA 5AQRA 3JS6A 3D2EB 3MN9A 1HX1A 3CJCA 3CJAA 4FWOA 4K43A 1CZAN 2OANA 4K25A 4Y0WA 5AQVA 4BRMA 4CZGA 4CD3A 4EAHD 2E8AA 2H3GX 1GLLO 4BG8A 4A2BA 4H0PA 2HMPA 5JICA 4BC4A 3UKUB 2ASOA 4BC2A 5KPZA 1HUXA 3CJBA 4FWPA 3O4WA 5LY3A 4BRHA 1KXPA 4DHYA 1NLVA 2IVPA 3SMSA 2BUPA 1Q18A 1E4FT 4PKGA 1EQYA 2V7YA 4YDUA 4CZMA 2V7ZA 4NO7A 2P9NA 3ULEA 4HTLA 3DWLA 4H0TB 3C7NA 2Q36A 5AZJA 4MLEA 5LJVA 4A2AA 3QFUA 2YJFA 4CZFA 5AQWA 4IZ9A 4CZJA 1NGFA 3A5MC 3SLCA 1Z05A 5E26A 1D4XA 3FZKA 5AQZA 3W0LA 3ZETA 4RCHA 2E1YA 4CZLA 4C23A 4B9QA 2DPNA 4CBWA 3ZX0A 1IJJA 3O1WA 2A42A 1TYQA 2FF6A 4AM6A 3VEZA 3LDPA 4BC3A 1U6ZA 4FWRA 4CJ7A 5EXWA 5EY4A 1RDWX 3BF1A 1HPMA 4QS8A 2FF3B 3U9ZA 4JNEA 1JCFA 2ASMA 2YCHA 4H03B 1BDGA 1ZC6A 4B1YB 1WOQA 1ESVA 2QWPA 2QWLA 2V52B 3CJ7A 3HSCA 1GLJO 3FZHA 4BC5A 4CD1A 1XQSC 1GLEG 4F9OA 1GLDG 3GOIA 4B1VA 5BPLA 1BUPA 2UYTA 1Y64A 3A5NC 5TKYA 2PBDA 4B1ZA 4BR9A 3VGKA 4FWLA 5BR9A 4BR7A 3FE1A 2Q0UA 1NGDA 2FXUA 2QWMA 3VESA 3B8AX 4L3QA 5B8HA 1T44A 1XC3A 2P9SB 1T6DA 2Q0RA 3QBWA 4BVOA 5AZIB 1QZ6A 4FOIA 1V4SA 3U8XA 1QQNA 1V4TA 3S41A 5AQNA 4BRFA 3FFKB 4KBOA 3EZWA 5EOYA 5AQYA 4NB4A 1KAYA 3VEWA 2HOEA 2QW9A 3UKRB 1RFQA 2V51B 3M6GA 4EIAA 3CIPA 4YDUC 3HM8A 3MN7A 1S22A 1YVNA 1WUAA 3L6QA 5F1XA 3GE1A 3C0BA 2QXLA 2PAVA 2W40A 3L4IA 3VOVA 3DXMB 2FSKA 3H3NO 1TYQB 4QS9A 3QBXA 1E4GT 5AQTA 3UKUA 3UKRA 1GLAG 4O5FA 3RSEB 2KHOA 3EO3A 3VGLA 3O1BA 3AY9A 5BN9A 3A0IX 4BVPA 4E1JA 3EKUA 1YAGA 2VCPA 4BQLA 4FOEA 5AQIA 4AM7A 1MWKA 4I6MA 3CJ9A 3ZX2A 2I7PA 2CGJA 4H5WA 3KZBA 4FWKA 2YJEA 5FPDA 4BR4A 2ITMA 4BRCA 4IJNA 1SAZA 2Q31A 1K8KB 5AQKA 3MCPA 1LCUA 3KHYA 3VPZA 3LDOA 4B1UB 1HLUA 1QQMA 5EX5A 2A5XA 4MO4A 4PL7A 3W3DA 5AZIA 4CZIA 3M3ZA 3VEVA 5AR0A 1X3MA 5BRHA 3MDQA 5FPNA 3WXKA 1H1VA 3AAQA 3D2EA 4FL9A 3QICA 3WEEB 1NGCA 3CERA 4MLHA 5AQMA 1NGHA 4BRLA 1NGEA 4J8FA 2F9WA 4EFHA 2P9LA 4IWVA 1HKBA 5ELZA 1YXQA 3HBTA 3DAWA 3VEOA 3ENHA 4QS7A 3O80A 4DB3A 1YUWA 2W41A 3BUZB 2P9UA 3R8EA 1BU6O 4XEIA 5E84A 4XH4A 2ZGYA 1TUYA 5AQFA 4BQZA 1KAXA 4BR2A 4FWNA 3D2FA 2QWRA 5BPMA 2ZF5O 4BRAA 5AQGA 3WUHA 4BRDA 3MK6A 4JD2A 4H5RA 3I33A 4CZEA 2D0PA 2P9PA 4B1WB 3RSEA 5AQQA 4BRNA 3I8BA 3LM9A 2IVOA 3R6MA 1BA0A 1IG8A 1KAZA 3H1VX 3LDQA 3SJHA 3DXKA 4RTFD 2FSNA 3LL3A 4ISFA 5BRFA 2F9TA 1J6ZA 2FSJA 5AQSA 2P9IA 3O08A 5AQLA 3VF4A 2ASPA 3L0QA 4PL8A 3VGMA 2ZGZA 1NGJA 4XH5A 5LJWA 1R59O 1ATRA 5FPMA 4DCHA 1ZBSA 3BP8A 1MA9B 1C0GA 1K8KA 4BG9A 2P9NB 3QFPA 4IJAA 2ZWHA 4BRQA 1TUUA 2D1KA 2AA4A 3H45C 3EN9A 4BRGA 1SZ2A 4H0XB 3SK3A 1JCGA 3VEXA 4H5NA 5AFUH 4WQ5C 3QB0A 5AFUA 2E2OA 2Q1NA 3CETA 1ZXOA 1C0FA 2QWOA 3AARA 4WQ5A 1XUPO 1QZ5A 3J8AA 5AQHA 3FGUA 4JHDA 5AQJA 3P4IA 4WQ4A 3WXLA 4BREA 5JLFA 2P9LB 3CQXA 3IUCA 4EHUA 2P9SA 5CE3A 2IIRA 4MO5A 3VERA 2D4WA 5BN8A 3GL1A 3GG4A 4HWIA 2P9KB 4M7XA 4IO8A 1RGIA 2GEMA 4JAXA 3SMPA 1BOTO 2A40A 1BO5O 2FLOA 1U2VB 5KPTA 4LC9B 2VYPA 3WXIA 3M1FA 4BROA 4JD2B 1QHAA 2A41A 4CBXA 3ZX3A 2CH5A 3VF2A 3ZEUA 2CH6A 4CBUA 5FPEA 4H5VA 5AQOA 3DXKB 2GUPA 3AAPA 2AP1A 5JMVA 2A6AA 4FWSA 3UE5A 3A5OC 4CI6A 1NM1A 3IMXA 1S3XA 2YI1A 3GDQA 3LM2A 1SQKA 4O8KA 5ADXA 3QDKA 1DGKN 2WUSA 4CZHA 4BRPA 3BF3A 4H0OA 4GY2B 2I7NA 2E2PA 3HI0A 3A5LC 1QQOA 3ZETB 4BR5A 3H1QA 3CI5A 4FPBA 5BRDA 1ATSA 1MWMA 2QWNA 3MN5A 4FWMA 4B1XB 3H46O 4I6MB 3UB5A 5AQPA 1NGIA 4FPAA 1BWFO 1BG3A 3FZLA 3R9PA 4CZKA 3JXUA 5F0XA 1ATNA 4PKIA 3BEXA 2J4RA 3ATVA 1NMDA 5KPRA 3WXJA 4ISGA 2YHXA 1DKGD 2E20A 3F9MA 3O8MA 2CGLA 3TU5A 3U4LA 3QMLA 3DXMA 1GLCG 3OHRA 2E1ZA 3HTVA 5AQUA 2GWKA 3C7NB 3O5BA 1GLBG 1HKCA 2GWJA 5KQDA 4A62A 2P9UB 3FZMA 2A3ZA 2VWBA 4WQ4C 1HKGA 2P9KA 5EVZA 3VENA 1JCEA 2YHYA 2GELA 3FLCO 3IFRA 4A61A 4BGBA 5AQXA 3ID8A 1NBWA 1OKJA 1NGGA 2YHWA 3MMVA 4M7YA 3TPQA 4BR0A 2E2QA 3WEEA 5ADXH 3IDHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5GAEP 3OYFA 3OYDA 2PZSA 4DKWA 3ASMA 2OPPA 1MDUB 4B3RK 3OYBA 1DEJA 1QVGM 3NCIA 4CGGA 4M42A 1VQNN 3MN6A 3EKSA 2BTFA 2CGKA 4DQIA 4FJHA 3MECA 2W00A 3DJCA 3C65A 2IS3A 4BE0A 4IG0A 4K8XA 4X64K 2QTDA 3QEWA 4AHUA 3ENOA 3NF9A 1NWKA 2DFEA 3IAYA 3DLBA 1NG9A 1WNSA 2F4VK 5KQ8A 1LWFA 1BGXT 1T6CA 1QE1A 1ZBIA 3HVTA 1P8ZA 5K14A 3OY9A 4C1NI 4H5TA 2HW3A 2HHXA 4KTQA 3VQPA 5BREA 1X3NA 3ZT4A 1YVUA 4BRKA 4PKHA 2G8FA 4JN4A 4FJ9A 3NVMA 4KO0A 3SQ1A 1RBRA 3DLLL 2D0OA 4I9LA 4ELUA 2YKMA 3O9SA 4HVJA 1RT7A 3JAMO 2NRZA 5JS1A 2HF4A 5DM6L 5HROA 4GNIA 4MDBA 1T7PA 3JS6A 3SUPA 3CJAA 4CGDA 1RDCA 3HSTB 4Y0WA 5LL6Z 3ZSRA 1S1VA 2H3GX 3SAHA 4BECA 1GLLO 4N5SA 4BE1A 4H0PA 2NNWA 3UKUB 1D8YA 2UUAK 3LP0A 1CXQA 2XY5A 3MXIA 1HYVA 1Q18A 4PKGA 4NXMK 4JK8A 3AO4A 4CJQA 4NO7A 3ULEA 1SS6A 3AO1A 3O3HA 4OKEA 5M1OA 4HTLA 2I5JA 2W6LA 1L5UA 4TSXA 3TR8A 5LJVA 3QFUA 4JK7A 2YNGA 4IZ9A 1NGFA 3AA3A 4CFAA 3VQ7A 1D4XA 2GV9A 3P31A 3BDPA 3NVKA 1CZBA 4RCHA 3ID6A 4CK1A 3UIQA 4FZYA 1C0UA 4OKJA 3ZX0A 1SL1A 4DU4A 2NRWA 4JI7K 1JLQA 1TYQA 2FF6A 4Y1CA 3TSQA 4YY3K 2FF3B 4GVMA 1Q9XA 1JCFA 3CC7N 1ASUA 4AF1A 3G10A 1K6YA 3BY5A 3QIPA 4RW9A 2QWLA 3HSCA 4E7KA 4E7LA 3FZHA 4CD1A 4C8KA 2X6NA 3SBGA 3CC2N 1Y64A 5TKYA 1LW2A 2ZM6K 1Q81O 4BR9A 4N76A 4IFEA 2Q0UA 5KTQA 4LH4A 3KWGA 1N33K 1N32K 4KHYA 1TL3A 1T44A 2BGGA 4C8LA 1QZ6A 2YX6A 4FOIA 1IKVA 5I3UA 1QQNA 3MEGA 5EOYA 5AQYA 4OGCA 4J2EA 3MXJA 4KREA 5GADP 3ZT0A 1C1CA 2HOEA 5CZ2A 2JWLA 1VSFA 4DSJA 3KLHA 3B6PA 4AILC 3C6UA 3DLHA 3SBTA 3M6GA 4EIAA 3TAGA 1U48A 3K5MA 4NCGA 1S22A 2QKKA 4DF8A 4Z4HA 1N34K 5F1XA 4KHSA 3GE1A 1RTJA 1YIJN 2QXLA 4HUGA 1UAXA 2W40A 4IG3A 3DXMB 4IOXA 3OJUA 5J2QA 1J5OA 4O4GA 4KRFA 3RSEB 2KHOA 3AVMA 3RMAA 2QEXN 1VQKN 1YAGA 2ZJQL 2LSNA 1JJ2M 3VQ5A 5EU7A 3VN5A 4DG1A 3V1RA 3LWMA 4I6MA 3C6AA 1XMQK 1WSGA 2HHWA 3KZBA 2YNHA 4FWKA 4HUFA 3TWHA 1L3VA 2YJEA 5FPDA 3CCVN 4A5AA 3L2RA 4BR4A 3V1QA 1SAZA 3L2UA 1F21A 1B9DA 4DUYK 1KFSA 2KQ2A 2DY4A 2O8BB 1QQMA 1M90O 3AVFA 4WFAL 4DQQA 4DU3A 4YFUA 4LFBK 4B3TK 4OGEA 4FLZA 1SKRA 3B6OA 2RF2A 5AZIA 4CHQA 3BGRA 4PA1A 1Z26A 3AGKA 5AR0A 4KHNA 4CF1A 1FKOA 2UUBK 3MDQA 4JI1K 4KB1A 3AAQA 4FL9A 3AVGA 3QICA 4ELVA 1KFDA 4CJFA 2YNFA 4BRLA 2D0AA 1NGEA 1TKZA 2IGIA 1J54A 2P9LA 1JLEA 1RNHA 4B9UA 3HBTA 1RT5A 3O80A 3EEQA 1YUWA 3BUZB 3DLRA 3DRSA 1T3VA 3OYEA 4XEIA 1A5WA 2ZGYA 1TUYA 3J7ZO 3F2KA 4KHWA 3ZT2A 2QWRA 4E1MA 3PV8A 1IBLK 3J81O 4YOVA 1KC8O 5HL7L 1BL3A 3I33A 1C6VA 3TABA 4B1WB 1VSIA 4BRNA 2IVOA 3R6MA 1BA0A 3LAMA 5TKWA 3I0SA 2HSTA 1FKPA 5J1EA 3LL3A 5M1KA 4V19S 2F9TA 1J6ZA 2FSJA 3O08A 2HHHK 4PL8A 3VGMA 1NGJA 3HOTA 3DM2A 3CM6A 5KGWA 3ZSXA 1ZBSA 3LP3A 2ZWHA 2D1KA 3PO5A 3EN9A 1BISA 4BWJA 3SK3A 1ASWA 5AJ3K 4YHHK 5C42A 4F3OA 3TSUA 2QWOA 5AQJA 3CCUN 3DLEA 3K58A 4WE1A 3WNEA 4BREA 3SQ2A 1TKDA 3CQXA 4EHUA 4JKGB 3TTDA 4CFDA 1BCOA 5GAHP 3AO3A 1RILA 3GL1A 4M7XA 3I8DA 2D0BA 5C2FA 1JXBA 4JAXA 3SMPA 1BOTO 1C1BA 1TAQA 4DFMA 3K5OA 4DSEA 1YJ9N 1QHAA 5IT9O 1Q8IA 3ZX3A 4CHPA 3NGIA 3HPGA 3CPWM 1NK5A 3VF2A 5FPEA 1FXXA 3HJFA 2GUPA 2R7YA 3BZCA 4Z4EA 4HHTA 3MWPA 2IOCA 4DLEA 2O8CA 1NM1A 3HT3A 1YTAA 4FJMA 4O55A 1S3XA 3OYHA 4PY5A 1SQKA 3QDKA 4BRPA 4O0IA 3AVNA 4LF8K 3A5LC 4BR5A 3J7YP 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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