1S22A

Absolute stereochemistry of ulapualide a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
356
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Absolute stereochemistry of ulapualide A
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
total genus 120
structure length 356
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1s22A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1s22A04
4XH5A 2ITMA 5AQSA 5BRHA 4BQZA 2HF3A 3VF4A 4C23A 3AAPA 5FPDA 3VF6A 2VWBA 5AQOA 4CI6A 4CZMA 2E2QA 4I6MB 4B1YB 4BR9A 1SQKA 1ZBSA 3D2EB 3WQTA 3WUHA 4BC4A 3L6QA 3UE5A 1S3XA 4CD1A 1IG8A 3DXKA 2I7PA 2W40A 5AFUH 5AFUA 3J8AA 2YJEA 5AZIB 3EKUA 3BF3A 2P9UA 1HLUA 4K25A 3BEXA 5KPRA 1QZ5A 1V4TA 1Q18A 2E2PA 3EZWA 3EO3A 5AQJA 5JLHA 3D2FA 1SAZA 3ZETB 1CZAN 2Q31A 4FWPA 1V4SA 2P9KB 5KQ8A 3FZMA 3EKSA 3H6EA 3QDKA 4IJAA 3VETA 3C7NB 1ATNA 4H5NA 4BRAA 5JLFA 1NGFA 4PL8A 5AQIA 1BU6O 4EIAA 5LJWA 3R8EA 3LDNA 4A2BA 1KXPA 2J4RA 2YJFA 1RFQA 1NGHA 3MN5A 3VEVA 4KBOA 3CJCA 5EX5A 3D2EA 4BRLA 4K43A 3LDOA 4K41A 4DHYA 3WXLA 4EFHA 3U4LA 3C0BA 1NWKA 2H3GX 1LCUA 2V7ZA 4IJNA 3DWLA 5AQKA 2GWKA 1YAGA 3VGLA 1JCFA 4K42A 4BR0A 5F1XA 4M7YA 3IDHA 2Q0UA 2P9UB 3A8YA 4H0PA 4CZHA 2ASPA 1MWKA 2BTFA 1YVNA 3LM9A 4FPAA 4QS9A 3D2FB 3ZETA 1WUAA 2AA4A 5EOYA 2ZWHA 3QMLA 4WQ4A 2F9WA 5FPMA 2P9KA 3UKRB 1MDUB 2FF6A 2VCPA 4O5FA 4BVPA 4FWMA 3LDQA 3ID8A 1JCGA 4JAXA 4NB4A 1P8ZA 2GWJA 4FWKA 5ADXH 2KHOA 2BUPA 2P9LA 2ASOA 2QWPA 3GDQA 4BGBA 4EAHD 4BRQA 4H0OA 3VERA 2CH6A 3I8BA 3P4IA 3TU5A 4BREA 4H5TA 4BVOA 1HPMA 1BG3A 1XQSC 2V52B 3MN7A 3FGUA 4XEIA 2D4WA 1QZ6A 3HBTA 4MO5A 3HI0A 5JICA 4BRIA 4BC2A 5BRFA 3VEWA 4BG9A 3UKRA 4WYBA 3UKUA 1Y64A 2GEMA 3FZLA 2NLXA 1BUPA 1NGJA 4MLHA 2YHWA 4IO8A 3D7EO 1QQNA 2OANA 3JXUA 1LOTB 4XH4A 1G99A 1HKGA 3GL1A 1GLFO 2QWQA 3O1WA 1E4FT 5BPMA 2P9LB 5AQNA 2A42A 1NGIA 1NGBA 5F2RA 3CJBA 4BG8A 4B1WB 4J8FA 3GE1A 2FSNA 1X9JA 1T6DA 3CQYA 4CD3A 4FWOA 1BO5O 2Q97A 5KPTA 4FPBA 3BF1A 5FPEA 2A3ZA 4M63C 3U8XA 3SMPA 3KVGA 3WQUA 4DB3A 4JHDB 5I9EB 3CERA 1GLJO 4CZFA 3M1FA 3FZFA 3CETA 2QXLA 1K8KA 3WXIA 3UKUB 1GLBG 3VGMA 1WOQA 4RCHA 3FR0A 1BOTO 3CI5A 4H5WA 1YXQA 1EQYA 2DPNA 2ZGZA 4BR2A 3AY9A 2P9NA 3WEEA 2QWLA 4B1UB 4MO4A 1X3MA 2NRHA 3ENHA 3GOIA 5KPZA 1NGEA 2W41A 2AP1A 3AARA 5AR0A 3UB5A 1GLAG 2QWRA 2QWMA 3MDQA 4L3QA 3R6MA 1NGCA 3IFRA 5F0XA 4CBUA 5AQYA 3M6GA 1BDGA 5AQWA 4B1XB 4QS7A 2ZF5O 3KHYA 1DGKN 1DKGD 1S22A 3EN9A 4WQ5A 2HF4A 4PKIA 3MN6A 3O80A 5E84A 5BN8A 2VYPA 4JHDA 3VEOA 4H0YB 2F9TA 3VF2A 4BRPA 4H5RA 4EHTA 3ENOA 4H0VB 1K8KB 1BWFO 4DCHA 4BRCA 1BA1A 2E2NA 4HTLA 3FZHA 2D0PA 2IVPA 1GLEG 2PBDA 4JN4A 4A61A 2P9NB 3WEEB 3O6WA 1MWMA 4CZKA 2HOEA 3LM2A 1C0FA 3H1QA 2I7NA 4CBXA 3FZKA 4Z94A 2GUPA 3MK6A 1GLDG 3OHRA 5AQUA 3VOVA 5AQLA 1GLLO 2ZGYA 2QWNA 2ASMA 3RSEA 2E1YA 2A6AA 1D4XA 4BRKA 4FOEA 2A5XA 5AZJA 2CGKA 5LJVA 5ADXA 3W3DA 3O8MA 2YI1A 5AQGA 1T6CA 3ZX2A 3I33A 3O4WA 3SLCA 1ESVA 3VENA 1NLVA 3QB0A 1R59O 5JMVA 1KAYA 4FSVA 1TUYA 1MA9B 3A5NC 3DXMB 3M3ZA 4O8KA 3F9MA 4Y0WA 1HJOA 5CE3A 3ATVA 3SMSA 3WT0A 2CGLA 2PAVA 3CJAA 1BA0A 1QQMA 2GTDA 1IJJA 1HKCA 3CJ9A 3U9ZA 3HSCA 4BC3A 4EHUA 4PL7A 3FFKB 2E8AA 4YDUA 5AQVA 3RSEB 2E20A 3CHWA 5AZJB 4IXCA 3QFUA 5BR9A 2A41A 3VESA 4JD2B 4H0XB 4H03B 3W0LA 2FSJA 3QICA 2Q36A 4BRGA 4FWQA 1NBWA 4A62A 1C0GA 5FPNA 4CZGA 3VEYA 3FE1A 1ZC6A 1ATSA 2E2OA 1HX1A 1X3NA 3H46O 5BN9A 2E1ZA 3DXMA 5AQXA 1GLCG 4WQ5C 4H0TB 1J6ZA 2A40A 5E26A 3DAWA 3BP8A 4BRDA 2IVOA 1NMDA 2QW9A 1TYQB 4HWIA 5BPLA 4JNEA 4A2AA 3L4IA 2QWOA 5AQFA 1XC3A 3LL3A 4DQ8A 1T44A 5EXWA 2YCHA 4IZ9A 4BROA 4CJ7A 3MMVA 3LDPA 5AQRA 1HUXA 5AQTA 3ZEUA 4AM6A 4JD2A 1ZXOA 4F9OA 1QQOA 4FWNA 4CZIA 3KZBA 4BR4A 4BR7A 5BRDA 3A5LC 3SK3A 4ISFA 1RGIA 1U2VB 3VEXA 5BREA 3S41A 1YUWA 1TYQA 2D1KA 5AQMA 3ZX3A 5TKYA 4FWSA 4FOIA 3H1VX 2QM1A 3L0QA 4ISEA 1Z05A 1QHAA 3EL2A 4WQ4C 2P9SB 2CH5A 2Q1NA 2IVNA 4IWVA 3A5MC 3VPZA 3O5BA 2V7YA 2FLOA 3ZEUB 1DEJA 4M7XA 3VGKA 2Q0RA 3B8AX 3HTVA 4AM7A 4FWRA 5AQQA 1Z6RA 1NGDA 3MCPA 3JS6A 1E4GT 4PKHA 5BPNA 1HKBA 2Q2RA 3ULEA 5ELZA 1RDWX 2NZTA 3R9PA 2P9IB 1U2VA 3H45C 1TUUA 3HZ6A 3IUCA 3CJ7A 4BQLA 4LC9B 4BRNA 4FWLA 3SJHA 4GNIA 4FL9A 4CZLA 4CBWA 3G25A 3CJ1A 1U6ZA 2UYTA 4B1ZA 1NGAA 1JCEA 1ATRA 2P9PB 4BR5A 4CZEA 2EWSA 4XH1A 3CIPA 3O1BA 2P9SA 1OKJA 4YDUC 1NGGA 4BRHA 2V51B 3MN9A 4FO0A 3BUZB 3QFPA 5EVZA 3QBWA 3O08A 4MLEA 1XUPO 4QS8A 5LY3A 3ATUA 4RTFD 3WXKA 3LDLA 2GELA 4BRMA 2CGJA 3HM8A 5AQPA 1H1VA 4I6MA 4NO7A 4H5VA 1NM1A 3ULEB 1KAXA 4ISGA 3WXJA 3GBTA 4B1VA 3H3NO 2E88A 4B9QA 4BRFA 2P9IA 3A0IX 2FSKA 2FXUA 4RWTA 1KAZA 5AQHA 4BGAA 4E1JA 3TPQA 5AQZA 5EY4A 3DXKB 2YHXA 3U9DA 3VEZA 2FF3B 3QBXA 2YHYA 3DJCA 3CQXA 5AZIA 3H3OB 2IIRA 2D0OA 4PKGA 2P9PA 2HMPA 4BC5A 3A5OC 5KQDA 5B8HA 3ZX0A 1SZ2A 3AAQA 3FLCO 4GY2B 3C7NA 3GG4A 2WUSA 3IMXA 4CZJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NNEA 4BQZA 1VSEA 2HF3A 4KO0A 4ZTFA 2D0AA 3VF6A 4CHYA 5AQOA 4CI6A 2YKNA 3UE5A 2ZJQL 5CR4A 1NJIO 1TV6A 3NF9A 3EE8A 3T1HK 2I7PA 2W40A 5AFUA 5C42A 3MXIA 2HBKA 5AZIB 3QEIA 3QO9A 2P9UA 1HLUA 4K25A 1RDBA 3BEXA 1Q18A 4BY9C 2E2PA 4X66K 4TSXA 2GX9A 4HUEA 3ZETB 4F3TA 4FWPA 1WN7A 4OPHA 4DV6K 3V9ZA 2OCEA 3EKSA 3I0SA 3QDKA 3KLFA 1RBUA 1ATNA 4BRAA 1ASVA 1BU6O 4EIAA 3R8EA 1WBDA 1KXPA 2IAJA 1W0HA 3MN5A 3O4QA 4KBOA 3AVLA 3CJCA 4FK0A 4K43A 2DFEA 4DHYA 3KWGA 3V9WA 3WXLA 5E41A 3MAQA 3RMDA 1VSLA 2E5LK 3ZCMA 1NWKA 2V7ZA 4IJNA 3OBWA 4CJLA 4W5QA 5M1PA 1JCFA 2QTDA 4FJ5A 5F1XA 3A8YA 2KFNA 2ASPA 4FZZA 4CJSA 3PV8A 3ZETA 1WUAA 5EOYA 2ZWHA 4WQ4A 2P9KA 2FF6A 2VCPA 4JRQA 4BVPA 4FWMA 4N76A 3LDQA 3ID8A 3AGRA 2RE2A 3CD6N 4FWKA 5ADXH 1JLCA 4QOZB 3DI6A 2FBTA 4BDPA 4EAHD 1Q9XA 3VERA 1C0TA 5JVHL 3KLIA 4BREA 1N5YA 4KB1A 3SPYA 2X6NA 1HPMA 3MN7A 4E1MA 4CF2A 4XEIA 2D4WA 3TSUA 1J9AA 4O0IA 4DF4A 4FCYA 1HNXK 3HBTA 2E6LA 5JICA 4CJUA 1TAQA 2A1SA 5BRFA 3SUPA 1SKWA 1HQUA 3UKRA 2GEMA 2YHWA 1DLOA 1S1TA 4IO8A 4E19A 2OANA 5GAHP 4K8ZA 3CCVN 2UU9K 1G99A 1E3MA 2BANA 1NK9A 3GL1A 2QWQA 3IS9A 2A1RA 1ILYA 5AQNA 3ZSRA 3OW2M 2OZSA 4B3RK 1WSEA 4BG8A 3O4NA 1JKHA 4CJ4A 3DLGA 3K2PA 1Z25A 2VG6A 2FSNA 1X9JA 5HRSA 4CD3A 1BL3A 4A5AA 1BO5O 2DTUA 3U8XA 3SMPA 4DB3A 5AJ3K 4JHDB 1GLJO 2VGMA 4FJ7A 3L8BA 4E3SA 4CK3A 4RCHA 1FK9A 5M1QA 1EQYA 2ZGZA 2VGNA 4YOVA 5J1EA 3WEEA 1TL1A 4MO4A 1NK0A 1K8AO 3TAPA 4A5BA 5KPZA 2Z1HA 1U48A 5AR0A 3PUFA 1IBLK 4M3YA 3RR7A 4YOYA 1FKOA 5F0XA 4CBUA 5AQYA 5AQWA 2IDOA 2D0CA 4OLAA 1DGKN 1S22A 2XO7A 4Q0BA 3EN9A 3ZT2A 1C0MA 4CEEA 4JHDA 3VF2A 2F9TA 4CCHA 4HTUA 3K5NA 3VQ6A 4CEZA 4KHNA 4BRCA 1QSSA 2KQ2A 4W5NA 2D0PA 3DRRA 4JK9A 4Z4HA 3HP6A 2ZJRL 3SYZA 4DF8A 2GBZA 4CESA 1MWMA 4CJPA 3C95A 1HR0K 1C0FA 4CBXA 1W7AA 3FZKA 3TAMA 2GUPA 1GLDG 1IH7A 1VSDA 2W6LA 2OPRA 1GLLO 2KLAA 4B9UA 2QWNA 4DU4A 3RSEA 2E1YA 2JLEA 4FOEA 2PZSA 4M3TA 2VWKA 1HNVA 3AA5X 3OYIA 1VSHA 3VQAA 1YT3A 1T6CA 3ZX2A 4FLWA 1EKEA 3I33A 5CY4A 4JI5K 4M42A 1ESVA 3VENA 2EHGA 3VA0A 3QB0A 4E7LA 3OYGA 3ID6A 4ZTJA 3M3ZA 2KZMA 1SL2A 4KHPK 1D5AA 5CE3A 1TAUA 3WT0A 4DU1A 4B9TA 1W9HA 1S9GA 4CGHA 2WFBA 4DUYK 1IJJA 3CYGA 3CJ9A 3U9ZA 3E9OA 3HSCA 4BC3A 5JS1A 3L3VA 5C10A 2E8AA 5AQVA 4JI7K 4IO9L 4IXCA 3J81O 3WNGA 2RPIA 5KI6A 4DSEA 2A41A 1QE1A 3PX6A 1J5EK 2FBVA 1JLGA 4JD2B 4YOTA 4IDKA 3F73A 2FSJA 2HHQA 2Z1GA 2Q36A 4JI0K 1L3TA 4A62A 1C0GA 3LAMA 3TAQA 4J2DA 3FE1A 2HHXA 4IG3A 4CIGA 3H46O 3DXMA 3B6PA 3NVMA 4C8NA 3S3OA 3QINA 3AVMA 3HOSA 2A40A 3SBGA 4PQUA 3LPTA 2IVOA 4NYNA 2QW9A 3VQ5A 4JKAA 4DTXA 5FLXO 4CJEA 4CHQA 1QSYA 5AQFA 3SAGA 3O9SA 5KGWA 5EXWA 3TR8A 1NG9A 3PX0A 4CJ7A 4DQQA 2I5JA 3V6DA 4OLBA 4JD2A 1QQOA 4ELUA 3VQEA 1L3VA 3QEVA 4LFCK 3SQ2A 4DTJA 2O8FA 1U2VB 1T03A 3VEXA 1GOBA 2D5RA 3PO4A 4DTUA 3S41A 3NE6A 3ZT0A 5TKYA 4FWSA 3ALYA 4FOIA 3AVNA 5C2DA 3L0QA 4ISEA 4WQ4C 3N4QA 4DS5A 3DLBA 1WSHA 4LD0A 4J2EA 1Q8IA 4IG0A 3OYMA 1YITN 3A5MC 3VGKA 1WSIA 3NH0A 1IG9A 3ISNC 1UAXA 4AM7A 4FWRA 3SZ2A 1X1PA 4KI4A 5JENA 1E4GT 2B4JA 5BPNA 4GKJK 3R9PA 2P9IB 2O8FB 3H45C 1HYSA 4DQPA 3IUCA 3AV9A 1DTTA 4FW1A 2HHSA 4RW8A 5DK5A 4CZLA 5JVGL 3CJ1A 2VQFK 5C25A 4FLYA 1JCEA 1BI4B 1ITGA 4RW6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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