1S22A

Absolute stereochemistry of ulapualide a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
356
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin
publication title Absolute stereochemistry of ulapualide A
pubmed doi rcsb
total genus 120
structure length 356
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1s22A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s22A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1s22A04
4FWLA 4DQ8A 1Z6RA 1XUPO 3HI0A 3WEEA 5I9EB 1V4SA 3BUZB 2D0PA 4PKGA 3UKRA 3VEVA 3FGUA 5AQYA 4DB3A 2E20A 2Q0UA 3D2EA 3O8MA 2FLOA 1S3XA 3ZEUA 3QDKA 3B8AX 3A5NC 4PKHA 3D2FB 2UYTA 3L0QA 2GEMA 2W41A 1J6ZA 4K42A 3HSCA 3A5OC 4WYBA 3ZETA 4FL9A 2Q2RA 3BF1A 1GLJO 2IIRA 1U2VB 2FXUA 4FWOA 1QZ6A 3D2FA 4B1ZA 1X3MA 2Q31A 3C7NA 4BC5A 1XQSC 3GG4A 4H0VB 2VYPA 3VF2A 3A5MC 4HWIA 4BC4A 4CZGA 1HJOA 3DWLA 3ENOA 4K43A 5BN9A 3VETA 1U2VA 4IJNA 3R9PA 2J4RA 3D7EO 3O4WA 2HF4A 1NBWA 3FR0A 2CH5A 3EO3A 3FE1A 3GBTA 3MN7A 3H3OB 5KQ8A 3F9MA 2PBDA 4BG8A 2Q97A 2QWMA 1GLAG 1C0FA 3LL3A 2E2OA 3EZWA 4JD2A 1YAGA 3IDHA 4QS8A 2W40A 4M7XA 1MWMA 5ELZA 3I33A 5KPTA 5BRHA 4IZ9A 2QWQA 4CBUA 1NGFA 5BPLA 2V52B 4AM6A 4BR2A 5AZJB 1HX1A 5BRDA 1JCFA 3CJ1A 3AY9A 5AQLA 2A42A 1IG8A 2FSNA 3CQYA 3JXUA 2CGJA 2H3GX 1DKGD 3SMPA 4BG9A 3WXLA 3BP8A 4BQLA 4FOIA 4DHYA 4FWPA 1RFQA 3ZX2A 3QB0A 5AZJA 1KXPA 2BUPA 4J8FA 2A6AA 1KAZA 5KQDA 3IMXA 2FF6A 1H1VA 1BA0A 2E2QA 4WQ5A 1GLBG 4CZHA 4L3QA 1HLUA 2I7NA 1MWKA 4FOEA 1T44A 2A41A 5AQPA 5KPZA 1NGEA 3GE1A 3H1VX 4BRHA 2QM1A 4A2BA 2OANA 4MO5A 5AZIA 4I6MA 3VEWA 3L4IA 4B1XB 2P9NA 1BDGA 3UKUB 2VWBA 4AM7A 1D4XA 2HMPA 2P9PB 2NRHA 2GELA 5KPRA 3G25A 1T6CA 2FSJA 1GLFO 5AQTA 4H0OA 3O5BA 2ZGYA 5FPDA 2GTDA 3MK6A 1NGDA 3CIPA 1HKCA 5BPMA 5ADXH 3UKUA 1G99A 2IVOA 4H0PA 3SLCA 3WEEB 4EHUA 3O1BA 5EX5A 5AQGA 3UKRB 4H5RA 2P9PA 2NZTA 4A2AA 5LJVA 1R59O 1EQYA 2P9IB 2ASMA 3CETA 3D2EB 3FZLA 2FF3B 4NO7A 3VPZA 1NWKA 3ZEUB 5AQWA 2F9TA 3RSEB 2ZGZA 4NB4A 3QBXA 1NGAA 3M3ZA 1QQOA 4BVPA 2E2NA 4FO0A 5AQQA 3AARA 3EKUA 4K41A 5BRFA 5LY3A 3FZFA 3ZETB 2YHYA 2GWKA 5AQMA 5JLFA 2P9IA 3WT0A 4BC3A 3O08A 1Q18A 3VESA 3RSEA 4A62A 1E4GT 3VEZA 3C7NB 2I7PA 2D1KA 3LDLA 4JNEA 1ATNA 4RTFD 1SQKA 3GL1A 3I8BA 3VEOA 2IVPA 3U8XA 4BRQA 1V4TA 4FSVA 4FWSA 4BREA 1S22A 5AQKA 4CZFA 2QWNA 1NGHA 3W3DA 3ENHA 4RCHA 4CZKA 4H5WA 4BR5A 2NLXA 4FWQA 5F2RA 1LOTB 2Q36A 5AQFA 3H6EA 3VOVA 1NMDA 4PL8A 3ATVA 4FWKA 5AR0A 5AQXA 4JN4A 4E1JA 1ZBSA 1Z05A 3CERA 3S41A 4XH5A 1NM1A 4JD2B 1GLCG 3CHWA 3FZKA 4BGBA 4FPBA 1YVNA 2YCHA 2QWPA 3EN9A 3VGMA 3HBTA 4H5VA 4O5FA 2ITMA 1K8KB 2AA4A 5EVZA 4IO8A 4BRKA 1NLVA 5BR9A 1BO5O 4MLEA 3QFPA 4B1WB 1NGCA 2VCPA 3LDNA 5FPMA 4CBXA 5F1XA 3CJ7A 5BPNA 4BR7A 3O1WA 3O80A 1K8KA 1C0GA 4BRIA 3VF4A 3U9DA 3H46O 4QS9A 3SJHA 3WXJA 4BRMA 4BRFA 3LDOA 2Q0RA 3VENA 3ATUA 3ZX3A 4FWRA 4M7YA 3CQXA 3IFRA 4MO4A 4BR9A 4GY2B 2ASPA 5AZIB 1HUXA 4I6MB 2BTFA 3LM9A 3QFUA 2CGLA 2P9NB 3TPQA 5AQVA 5CE3A 3EKSA 4B1UB 3SK3A 3C0BA 2P9SA 4EIAA 4BR4A 2Q1NA 4BQZA 4O8KA 4M63C 4PKIA 3L6QA 3LDQA 2D4WA 4QS7A 2ZWHA 1ZXOA 3MDQA 1HKBA 3A8YA 3U4LA 3A5LC 4WQ5C 5AQOA 3VGLA 1TUYA 3WXIA 2P9UB 2E1YA 3CJAA 2ZF5O 2P9KB 5TKYA 4BC2A 5AQSA 4FPAA 2QW9A 4BRNA 1NGBA 4JHDA 3O6WA 4BRPA 4CJ7A 1NGGA 2AP1A 3QBWA 1P8ZA 1OKJA 3VGKA 2GWJA 2E88A 4ISFA 1MDUB 2QWLA 2P9UA 3H1QA 1ATSA 3TU5A 2E8AA 2P9KA 2YHWA 3MCPA 1GLLO 4GNIA 3KZBA 1WUAA 1TYQB 3WQTA 5EOYA 4PL7A 1ESVA 2V7YA 2P9LA 5AQNA 3M6GA 3MN9A 4IXCA 4YDUA 2YJFA 4DCHA 1YUWA 4Y0WA 3CJBA 4BROA 5ADXA 3FFKB 5JLHA 3UB5A 1Y64A 4H0XB 1IJJA 3R6MA 3MN5A 2A3ZA 2CGKA 1TYQA 3LDPA 2V7ZA 1RGIA 2A40A 1GLEG 1X9JA 2FSKA 3CI5A 5F0XA 5B8HA 3WXKA 5EY4A 1HPMA 2YI1A 3FZMA 5LJWA 4B1YB 4YDUC 3OHRA 4C23A 4CZIA 3VEYA 4CD3A 3KVGA 2E2PA 3AAQA 3MN6A 1LCUA 2CH6A 2QWRA 3J8AA 1BA1A 4H0TB 2IVNA 3ID8A 1NGIA 5FPNA 1KAXA 3DXMB 1GLDG 5AQZA 4WQ4A 1MA9B 4H0YB 5AQHA 3UE5A 5AQIA 4CBWA 2PAVA 4XH1A 5AQUA 5AQRA 4BRAA 3M1FA 2ASOA 3ULEB 2D0OA 3JS6A 4BR0A 2F9WA 4CZJA 3DXMA 3EL2A 3BEXA 4CZLA 2HOEA 2WUSA 4EAHD 3R8EA 2KHOA 1TUUA 4BVOA 3AAPA 1DEJA 3HTVA 4ISGA 4WQ4C 3ULEA 3VEXA 3W0LA 5E84A 1QQNA 4CD1A 4LC9B 4K25A 2P9SB 3H45C 2EWSA 3HZ6A 1YXQA 4BRLA 5FPEA 1BU6O 4Z94A 4H03B 4EFHA 4B9QA 4RWTA 5AFUH 1ZC6A 5E26A 3GOIA 4KBOA 1BOTO 4MLHA 1QZ5A 4EHTA 3WQUA 3DJCA 1JCEA 3P4IA 4CZEA 4CI6A 4H5NA 3QMLA 4XH4A 3DXKB 5AQJA 5BN8A 4BRDA 1E4FT 1WOQA 1QHAA 1HKGA 3ZX0A 1CZAN 2V51B 4CZMA 1JCGA 3CJ9A 4IWVA 1BUPA 4JHDB 2QXLA 3BF3A 3FZHA 2E1ZA 3GDQA 3VF6A 3MMVA 3DXKA 3A0IX 2GUPA 3H3NO 1RDWX 1DGKN 5BREA 3CJCA 5JMVA 2QWOA 3FLCO 2DPNA 3QICA 3LM2A 4IJAA 5AFUA 4B1VA 2HF3A 1XC3A 3DAWA 2YJEA 2A5XA 5JICA 4BRGA 2P9LB 3U9ZA 4H5TA 5EXWA 4BRCA 1QQMA 3HM8A 4FWMA 1T6DA 1SZ2A 1X3NA 3KHYA 4BGAA 1KAYA 3WUHA 1BWFO 4F9OA 4A61A 1SAZA 1U6ZA 1BG3A 3VERA 3IUCA 1ATRA 4XEIA 4ISEA 3SMSA 4HTLA 2YHXA 1NGJA 4JAXA 4FWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJMA 3KWGA 5FLXO 3M5RA 4JI5K 1Z6RA 1V4SA 2WC9A 3UKRA 5JS1A 3VEVA 4DB3A 2LSNA 5AQYA 1IBLK 2E20A 3O8MA 2FLOA 3QDKA 4PKHA 5DM7L 2UYTA 1NJIO 3O9TA 2O8EB 2W41A 2HHQA 1J6ZA 4K42A 4NCGA 1WB9A 3HSCA 3QEWA 3DYAA 4ZTFA 3ZETA 4FL9A 3PX0A 4GKJK 3ZSQA 4QCLA 1YJWN 3VTIA 3V81A 4M42A 1IKXA 4AHSA 5JS2A 2Q31A 3GG4A 2VYPA 4BC4A 4CZGA 2KZZA 4CFDA 4FJ5A 5K14A 1WBBA 2AJQA 3MECA 3D7EO 4ICLA 3O4WA 3CFPA 2RKIA 2OPQA 2CH5A 3V1QA 3EO3A 4J2BA 3FE1A 3GBTA 2IGIA 3SV3A 2QWMA 1GLAG 2E2OA 4QS8A 1XHZA 4M7XA 3VMFB 1MWMA 3I33A 4X66K 5BRHA 4BDYA 2HBJA 3NH2A 1VSMA 1X9MA 4CK3A 2OTLN 5LMUK 5BRDA 5C42A 3HOTA 3AY9A 1IBMK 1U49A 4OGEA 3AVJA 3JXUA 2H3GX 4BG9A 3WXLA 3DLBA 3AVLA 4BQLA 4Y1DA 3VQCA 4FOIA 1IH7A 4DSLA 4JKGA 4FWPA 1RFQA 1W0HA 3KLFA 4EZ6A 3QB0A 2NUBA 1KXPA 1X9WA 1FKPA 2FF6A 1BA0A 4PQUA 1GLBG 1WSFA 4CZHA 4L3QA 3K58A 1HLUA 1MWKA 3LDSA 2KFZA 2HVHA 4V19S 4FOEA 1T44A 1ZBHA 1NGEA 1R0AA 5T7BA 4FJXA 4GV6A 1CZBA 2QM1A 4A2BA 3S3MA 1L5UA 3L4QA 5AZIA 2WBNA 2YKNA 3L4IA 4JRQA 4WFNL 2RF2A 4DR6K 2VWBA 1D4XA 2HB5A 2FSJA 1GLFO 5AQTA 4JYAK 2P5GA 3O5BA 3TTCA 3VQ9A 3NF7A 4B9NA 3K2PA 2GTDA 3MK6A 3OYDA 5ADXH 3CFRA 1K8AO 2IVOA 2O4GA 3L2UA 1GOCA 4DQQA 5AQGA 3UKRB 2P9PA 3OYJA 1R59O 4E89A 1EQYA 2ASMA 3FZLA 1K73O 5AQWA 3ZSXA 4YOUA 2ZGZA 3NH1A 1NGAA 3PO5A 2KFNA 3K57A 1JXBA 2OZMA 4C1NK 4ZHRA 3EKUA 4K41A 2A1SA 3ZETB 4DV6K 4IEIA 5C2DA 3SAFA 4BC3A 3O08A 3HO1A 3O9SA 1IKVA 5D3GA 4CFAA 3CCVN 1TKDA 3VEZA 4N5SA 1XNQK 4B3TK 3VA3A 1NOZA 5C25A 1I39A 3HP6A 3I8BA 4DSJA 4KTWA 3OS2A 4DTPA 3ASMA 4CJPA 4FSVA 4BREA 4HUEA 4RCHA 4NCBA 4FW1A 2W6LA 1EWQA 1HYVA 4C8MA 4CK2A 5F2RA 2PFUA 4MQ3A 3N4PA 4B9SA 3H6EA 1NMDA 3S3NA 4RW6A 3V1OA 4I9LA 3DLGA 5AQXA 3SQ0A 2Q3SA 4KO0A 4E1JA 1ZBSA 1Z05A 2XY5A 3FZKA 4BGBA 2Z1GA 3DLRA 3E9LA 3ZT3A 4CGHA 3WNFA 2HW3A 4CGIA 2ZQBA 1NLVA 1CLQA 3CF5L 4JI3K 1BI4A 2ZJRL 4H4OA 3TWHA 2RN2A 4DR3K 5BPNA 4BR7A 3H08A 1REVA 4OPHA 4BRIA 3ZSRA 2XY7A 4BRMA 3SJHA 3WXJA 3AGRA 3LDOA 4DTJA 4BACA 5HP1A 3VENA 4DLGA 2HHUA 3K5MA 3ZX3A 3NGZA 4E7HA 1KFDA 4DSKA 3G0ZA 2ASPA 4PWDA 5AZIB 3V1RA 3SUQA 4AF1A 2BTFA 3LM9A 4UQGA 2CGLA 1WSIA 3OYBA 4DV5K 1TAQA 5DK5A 1WLJA 5CE3A 4X62K 3CXCM 2VGNA 3A2FA 1S6QA 3C0BA 3VTHA 2Q1NA 3QO9A 1BGXT 3AVNA 1Q7YO 4RW9A 3C6HA 1YITN 4LH4A 2JLEA 3NF9A 3J7AP 2D0AA 3HJFA 5IWAK 3A8YA 3U4LA 4HHTA 1WN7A 4WQ5C 4WFBL 3VGLA 3VN5A 1TKTA 2OA8A 2E1YA 3OJSA 2OPSA 1FW6A 2IDOA 5KRTA 1NGBA 2G8FA 3I56N 1NGGA 2AP1A 3QBWA 1P8ZA 4CJ5A 1OKJA 3VGKA 4ISFA 5CZ1A 1JL2A 4W5RA 4R5PA 2P9KA 1WAFA 3RMBA 3ZSWA 4DV2K 3WQTA 4JI4K 1YJ9N 1NKEA 1RCHA 1TL3A 4YDUA 2YJFA 3WXMB 3CJBA 1SKRA 3FFKB 3UB5A 4RG8A 4DUZK 1YIJN 3THYB 3R6MA 3VQ8A 2A3ZA 2CGKA 3LDPA 1RGIA 4FJLA 2FSKA 1ZBLA 4OO1J 1KLMA 1VRTA 1KVAA 2OCEA 5LJWA 1RBUA 4PA1A 4B8CA 5KI6A 4CZIA 1VRUA 1NG9A 2B6AA 3OA9A 2G8WA 4BECA 3L8BA 1BI4B 4FK4A 4BDZA 2O8DA 2PZSA 3NGIA 4NXNK 3HPGA 1Q9YA 5FPNA 1VQ9N 3THXB 4H0YB 3UE5A 1QSLA 5AQIA 4AHTA 3LP2A 4XH1A 1LWCA 4NLCA 5AQRA 4TSXA 3WNHA 4FLUA 3EL2A 5KGXA 4FJ8A 3NE6A 4GVMA 4PHTX 2YHAA 2YKMA 4DF8A 4BVOA 3AVIA 2GV9A 3ZSZA 4ISGA 3TTDA 4WQ4C 3ULEA 1QTMA 3AVCA 5E84A 4CF1A 2W42A 3WNGA 3PY8A 2DFFA 2EWSA 4KHSA 1YXQA 4BRLA 4DQIA 3OYCA 4M45A 3C65A 4Z94A 2HSTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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