3LL3A

The crystal structure of ligand bound xylulose kinase from lactobacillus acidophilus
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
492
structure length
492
Chain Sequence
SLKYIIGMDVGTTATKGVLYDINGKAVASVSKGYPLIQTKVGQAEEDPKLIFDAVQEIIFDLTQKIDGKIAAISWSSQMHSLIGLGSDDELLTNSITWADNCAKSIVQDAKNRGFAQQIYRKTGMPMHPMAPIYKLLWLKNKKTEVFSQAQKWIGIKEYIIFRLTGKLVTDTTMAAGTGILNLKTLTWDQELLDILKIKKEQLPKIAQPTKVIFPIKTEYVKKLGIDSDTKIILGASDGYLSTIGVNAIDSDHCALNVGTSGAIRTIVDQPKIDPSASYFCYPADKTHYLLGGPVNNGGIVFNWARQTLFDADETPQDFLDVAQTAPAGSRNLIFLPYLGGERAPIWDANARGSFVGLTRMHQKPEMARAVIEGIIFNLYDAASNLIKNTKKPVAINATGGFLKSDFVRQLCANIFNVPIVTMKEQQSGTLAAMFLARQALGLNQDLSEIGQFAQADKVYFPNPKEAATYQKLFPLYCEIRNALAASYGKFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Gluconate kinase
publication title The crystal structure of xylulose kinase from Lactobacillus acidophilus
rcsb
source organism Lactobacillus acidophilus
total genus 150
structure length 492
sequence length 492
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.12: Gluconokinase.
pdb deposition date 2010-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ll3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ll3A02
4KBOA 4BRPA 1NGAA 3MMVA 1IJJA 3LM9A 4H5WA 3VPZA 5AR0A 3CHWA 1NGBA 2QW9A 1KAXA 3W3DA 2P9NB 3SLCA 2NZTA 3ATVA 3M1FA 2GWKA 1NGFA 2YHWA 4CBUA 1E4FT 1BDGA 4MLHA 4ISFA 4FOEA 4PKGA 5AQXA 2YI1A 2E1YA 2FLOA 1ATSA 4J8FA 3VF4A 3ATUA 3JXUA 5EVZA 4IXCA 3KHYA 2W40A 1MA9B 3QDKA 4PL7A 5AQFA 5BN8A 3CJ1A 4I6MA 3RSEB 3U4LA 4BR0A 2QWRA 3C7NA 2CH5A 2J4RA 3WXKA 3VEVA 3UKRA 3VGMA 4BG9A 4CZFA 5KPRA 1LOTB 1LCUA 3FGUA 4AM6A 2E2QA 2A40A 2V7YA 4WYBA 4H0XB 4M7XA 3QBWA 2KHOA 3S41A 5AQGA 3LDLA 3C7NB 4FOIA 3DWLA 3O4WA 5LJWA 2UYTA 4FO0A 4XH4A 1S3XA 3JS6A 4Z94A 2I7PA 3BUZB 1QZ6A 2IVOA 1NGEA 1X3MA 4CD1A 4B1VA 4GNIA 3BF3A 2D0OA 3TPQA 2AP1A 3ENOA 4CBWA 3OHRA 3FR0A 1SAZA 5AQQA 2QXLA 2CGLA 3D2EB 3EN9A 4DQ8A 1X9JA 4BREA 4FWPA 3MK6A 1G99A 4O5FA 5BN9A 3UB5A 1C0GA 3W0LA 4EFHA 5JLHA 2VCPA 2CGJA 2CGKA 3CJBA 4EHTA 1T6DA 1QQOA 1YXQA 5FPEA 2EWSA 2F9WA 3EKSA 4M63C 5AQSA 3VF6A 1NMDA 5AQZA 4CBXA 3BF1A 3J8AA 1NM1A 5AQRA 4CZEA 4CJ7A 1J6ZA 2Q2RA 3HSCA 3P4IA 3ULEA 2PBDA 4M7YA 1TUYA 3GOIA 3KVGA 3FZLA 3CQYA 3H1VX 4DHYA 1JCFA 2V52B 3CJ9A 1C0FA 4FPAA 2HMPA 4BRKA 1BG3A 1BA1A 4QS7A 1DEJA 4XH5A 4FWNA 3ZEUA 4A62A 3O8MA 3AARA 2HF3A 4DB3A 1QQNA 5BRHA 3FZMA 4FWLA 3HM8A 2FSJA 4GY2B 3DXMB 1HX1A 1K8KA 3I33A 4WQ4C 4B1WB 2IIRA 1V4TA 4B9QA 3VGKA 1XQSC 5JLFA 3L4IA 3O08A 1JCEA 3FZKA 4LC9B 3U9DA 4QS8A 4BRDA 3AY9A 3VERA 3L6QA 4H5RA 5JMVA 2IVPA 3WEEB 5FPDA 1BOTO 3O1BA 3D2FA 4BVOA 4IJAA 5EXWA 3HI0A 4H5TA 5EOYA 5LJVA 1E4GT 2P9LA 4L3QA 2NRHA 5AQWA 4RWTA 2VYPA 4FPBA 2P9UB 4K25A 4RTFD 4K43A 3BP8A 3LDPA 4BRLA 2HF4A 5AZIA 2P9LB 4JNEA 1KAZA 4BRGA 3ZX3A 3FZFA 1RDWX 3A5MC 2BTFA 2P9PA 1HJOA 4H0OA 2GTDA 4WQ4A 2IVNA 3CQXA 3A5OC 3MN9A 4NB4A 3MN7A 4C23A 4FWKA 5AQNA 2OANA 3MN6A 2ZGZA 4BG8A 2ZGYA 3MN5A 3VEXA 2QWNA 5BRDA 4BQZA 2D0PA 5KPZA 3M6GA 1TYQA 3AAPA 3H46O 4B1ZA 2YHXA 3H6EA 3O80A 1T44A 4BRFA 1QHAA 3H3NO 1XC3A 4I6MB 2A3ZA 1GLCG 4FWOA 4CZKA 5AQJA 3UKRB 3O6WA 4CZMA 1ZC6A 1BUPA 3EO3A 3A8YA 1GLJO 2A5XA 5AQHA 1OKJA 1MDUB 3EKUA 3VEZA 1ZXOA 3CJCA 1H1VA 3WQUA 3ZX2A 1X3NA 5E84A 4BRAA 2GEMA 3GDQA 5AFUA 5AZJA 3MDQA 3FLCO 4BQLA 3CJ7A 1P8ZA 4IJNA 1ATRA 5CE3A 4ISGA 4CD3A 4CZIA 4CZHA 3QMLA 4BR5A 3SMPA 2GELA 4DCHA 5AQIA 4BGAA 4PKHA 1BO5O 3VENA 2P9KA 4BR4A 2CH6A 4BR2A 4B1UB 1IG8A 3VETA 3TU5A 3VEOA 1WOQA 2E2NA 3EZWA 1RGIA 3DXKA 3A0IX 4BRNA 3CIPA 4H5NA 3R9PA 4MO5A 3C0BA 4FWSA 2P9IA 3LDQA 3QFPA 4BC3A 3H45C 1NGIA 1HLUA 5AQOA 4H0TB 3ZETA 4Y0WA 3ULEB 3DXKB 4BRCA 5BPMA 1SQKA 1BA0A 3IUCA 5JICA 5AQMA 2FF6A 1EQYA 4JHDA 5ADXA 2GUPA 1JCGA 5AQTA 2ZWHA 1YUWA 2ASOA 3L0QA 2FSKA 4A2BA 4CI6A 1MWMA 3O5BA 1SZ2A 3KZBA 3ZEUB 4A61A 1KAYA 4CZJA 4JD2A 3VEWA 2QWPA 4FWMA 4O8KA 1K8KB 1GLEG 2E20A 4FSVA 3EL2A 5AQUA 1U2VA 3U9ZA 3DAWA 3U8XA 3WXLA 3CERA 3QFUA 3VGLA 2I7NA 4F9OA 4RCHA 2DPNA 2Q97A 4BRHA 2YCHA 3D2FB 4H5VA 5I9EB 4AM7A 1QQMA 3SJHA 2V7ZA 3UKUA 1CZAN 4CZGA 4EAHD 3H1QA 2P9NA 1NBWA 2A42A 1HUXA 3UE5A 2FSNA 4HTLA 3MCPA 1HKCA 2HOEA 2NLXA 3BEXA 4B1XB 5BPLA 2A41A 5B8HA 5AZIB 2P9SA 3UKUB 3VESA 3R8EA 1WUAA 5E26A 5ELZA 3QICA 2P9PB 4XH1A 3RSEA 4E1JA 1NGCA 2AA4A 4PKIA 4H03B 1U6ZA 1BU6O 3QB0A 3D7EO 2P9SB 4BR9A 1YVNA 4MO4A 2E2OA 3G25A 3B8AX 2ASPA 1DKGD 1TUUA 3HTVA 1TYQB 2Q0UA 4BRMA 5AQPA 2Q0RA 4IO8A 1GLAG 3WUHA 4MLEA 5FPNA 1NGGA 3LM2A 2QWMA 3GG4A 5F2RA 3A5LC 5KPTA 4BC5A 3GBTA 3O1WA 4JAXA 1XUPO 4H0YB 5LY3A 5BRFA 1DGKN 2WUSA 3VEYA 3FZHA 5EX5A 2W41A 4EHUA 4BRIA 5AQVA 1NWKA 4H0PA 1NGHA 3VF2A 3DJCA 3CI5A 3D2EA 1Q18A 2A6AA 4FWRA 3ZX0A 1BWFO 1ZBSA 4YDUC 2ITMA 5AFUH 3LDOA 4K42A 1QZ5A 4JN4A 3WQTA 3IMXA 3R6MA 3IFRA 2YJEA 3LDNA 4IZ9A 5AZJB 4ISEA 3M3ZA 1RFQA 1NGDA 3I8BA 5EY4A 4BGBA 4BRQA 3AAQA 1HKBA 1D4XA 2ASMA 5F1XA 2YHYA 1Y64A 2YJFA 1Z6RA 2H3GX 2P9KB 3LL3A 2D1KA 4BR7A 4BC4A 3CETA 1GLLO 4CZLA 2QM1A 3FFKB 1NGJA 1YAGA 1HKGA 2E2PA 2D4WA 2ZF5O 4QS9A 2Q1NA 4BROA 5FPMA 2QWOA 4IWVA 1HPMA 4WQ5C 2PAVA 1ATNA 3A5NC 1T6CA 4XEIA 2P9IB 1ESVA 3WT0A 3GE1A 1KXPA 1MWKA 2FXUA 5AQKA 2VWBA 2QWLA 3QBXA 4K41A 5ADXH 4A2AA 3HBTA 4FWQA 3ZETB 1GLBG 4YDUA 5F0XA 1R59O 2E1ZA 2Q36A 2Q31A 5KQ8A 4BVPA 4PL8A 2F9TA 3DXMA 5AQLA 3F9MA 4JHDB 3SK3A 3ID8A 2FF3B 1NLVA 5AQYA 4H0VB 2QWQA 5KQDA 2V51B 1S22A 5BREA 3SMSA 3IDHA 1V4SA 2E88A 3H3OB 3WXJA 3WEEA 5BR9A 4HWIA 1Z05A 4B1YB 3CJAA 3HZ6A 4JD2B 5TKYA 2E8AA 4NO7A 3WXIA 3FE1A 3ENHA 5BPNA 3VOVA 4BC2A 2P9UA 1U2VB 4WQ5A 4EIAA 2BUPA 2GWJA 3GL1A 1GLDG 4FL9A 1GLFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I9QA 1U04A 4FM2A 4BRPA 2QXFA 1FKPA 4FJ9A 2A1RA 1NK9A 2P9NB 3B6PA 3ATVA 4DUZK 3RR8A 1BDGA 5DK5A 4PKGA 1Y97A 2YI1A 1YHQN 5C12A 2E1YA 1ATSA 3JXUA 3KLIA 1MA9B 3Q7BA 3QDKA 4PL7A 4N56A 4RW4A 4H8KA 4JKGA 2QWRA 4G1QA 4DQRA 2CH5A 4V19S 4O4GA 4DR2K 4M3XA 4BG9A 5KPRA 1I94K 1BQMA 1WSFA 1ZBFA 2V7YA 4WCEL 2VGNA 3EY1A 4PA1A 3QEWA 4YOUA 4JKGB 2IAJA 1VSFA 1K9MO 3MECA 4E19A 2I7PA 5HRSA 3OJUA 2IVOA 1NGEA 1X3MA 3VQ6A 1W0HA 3O9SA 4NXMK 3S9HA 2G8HA 4GNIA 3BF3A 3G0ZA 3SUPA 1BI4A 1T7PA 1YJWN 1QS4A 2Y1JA 4DS4A 3FR0A 1SAZA 4TSXA 3NMUA 1WLJA 1UA1A 4PHTX 4DQ8A 1FW6A 5CHIA 4FWPA 2WONA 4ELTA 4DMNA 3W0LA 3CMEN 4CHOA 1BI4B 1T6DA 5FPEA 3TAMA 4CJTA 3EKSA 4M63C 3CCJN 5AQZA 4O8UA 3BZKA 3B6OA 3HSCA 1W97L 4DLGA 3ULEA 1TUYA 1D5AA 3K2PA 3TSPA 1JXBA 5JS2A 1RTIA 3CQYA 2HMPA 1BG3A 1BA1A 2F7TA 1DEJA 4PWDA 3TAGA 1YIJN 3ZEUA 3TI0A 1QQNA 3FZMA 4KRFA 3MX5A 4CECA 3DRSA 2E5LK 4GY2B 2ZD1A 3I33A 1BGXT 2O8FB 2IIRA 4CJFA 4O0IA 1JCEA 3FZKA 4LC9B 3U9DA 4BRDA 3PIOL 4WFBL 1DLOA 1OH8A 4M41A 3L6QA 1RBTA 4OKJA 5JMVA 3KIOA 3AGKA 3V1RA 3L4QA 4HCCA 4DWIA 1RT3A 5EOYA 3AVBA 4DQIA 4B3TK 2P9LA 5GAEP 3DLEA 3HOSA 3SYZA 1FJGK 5AQWA 4RWTA 4FPBA 2P9UB 3HP9A 1EX4A 4K25A 4RTFD 5I42A 3AVGA 3HYFA 4JEPA 2O4GA 1WSIA 5AZIA 5IWAK 1T8EA 4FJIA 2P9LB 5C2DA 1M90O 1KAZA 3DI6A 4U7BA 3ZX3A 3TARA 1RDWX 1SUQA 2VQFK 1XC9A 5GADP 3CQXA 4NB4A 3MN7A 1ITGA 4JK9A 1U48A 2ZGZA 3SUOA 1LWCA 4IFYA 4B9SA 1NU0A 2OPRA 5BRDA 4BDZA 4BQZA 5C0YA 2D0PA 3M6GA 1NKCA 1S9EA 2IS3A 4JI6K 2YHXA 1T44A 1NOZA 4I6MB 1D9FA 5JS1A 4LH4A 2OYQA 4BDPA 3TSQA 4M3ZA 4JKHA 1GOCA 3HOTA 4DU4A 3HM9A 4CFBA 3O6WA 3PLAA 3THXB 4FLTA 3O9UA 4FW2A 4O5BA 2A5XA 5FROA 2RHKA 4DSFA 3KTQA 3VEZA 3V6DA 3CJCA 3ZX2A 4B8CA 4KHYA 1X3NA 5HBMA 1BISA 3CJ7A 5CE3A 4FM0A 3QINA 4BR5A 3SMPA 1UA0A 3JSMA 2CH6A 3P5JA 3HJFA 2QEXN 1ZBIA 1VSIA 3A0IX 3ZT0A 4I9LA 3OYCA 3R9PA 4FJ7A 3AO3A 3U6FA 2P9IA 3SPZA 3QFPA 1IKWA 2QA4N 2P5OA 4DR7K 2ATQA 3H45C 3OS0A 2X6NA 3O4NA 4KKOA 2ZM6K 1YJNN 4CHNA 5BPMA 1SQKA 3TR8A 3SQ4A 3PX0A 5AQMA 1EQYA 4WF9L 4JHDA 3RRGA 2RKIA 1L5UA 1QTMA 2RF2A 1BHLA 5AQTA 2ZWHA 3J7ZO 1NK0A 4KTWA 4J2EA 1KVCA 1YF5L 3V1OA 4CJ3A 4CGIA 1RDUA 1HQEA 1NJYA 4F2SA 3U3GA 2ZE2A 4DF8A 2NRRA 3RR7A 3ULDA 1SKRA 4RW9A 2QWPA 4FWMA 2E20A 1FK9A 1U2VA 1ASUA 4JI5K 3HPOA 4CJVA 3U9ZA 3ZT4A 3U8XA 4B9NA 4M3RA 3QFUA 4AHRA 3VGLA 3RTVA 2GBZA 1ZYQA 1TAQA 4F9OA 3I0SA 2GX9A 1T3VA 1FKOA 3SJHA 1QQMA 3V9UA 3H08A 2X78A 3OBYA 3N4QA 4I2PA 5DM6L 1KRPA 5IT9O 4OO1J 3UE5A 3K9KA 3EE9A 2FSNA 2RN2A 4B1XB 4FM1A 3CFRA 4NYFA 4DR5K 3VESA 1WUAA 4LY7A 3DLRA 2P9PB 1K8AO 2HW3A 1NGCA 4DU1A 3CF5L 2VWKA 1VSEA 2I5JA 3G25A 3I8DA 2Z1HA 3C94A 3K5LA 1DKGD 1BIUA 2DFEA 4F2RA 3F9KA 3CC4N 1TYQB 4BRMA 4HCBA 1UWBA 5BR8K 2FBXA 2OPSA 4MLEA 1NGGA 3LM2A 3VQ4A 4L8RB 2QWMA 4RW8A 4AILC 3O1WA 1XUPO 3Q7CA 4FZYA 1JLAA 2G8FA 4KFBA 1HYSA 4CF9A 3HRGA 1VQKN 4AQYK 4YDUC 5AFUH 3KJVA 4CIFA 3ZSQA 3O4QA 3WQTA 2B5JA 2YJEA 2KLAA 1HNXK 3SUNA 4ISEA 1RFQA 4C8LA 2IDOA 4NYNA 3NE6A 1NGDA 5GAGP 5EY4A 2HNZA 4BRQA 4CFAA 2JLEA 1Y64A 2YJFA 1NJWA 1VQ8N 1Z6RA 3LAMA 2EX3A 3LDSA 2QM1A 4Z4CA 3FFKB 1YAGA 1HKGA 1LW0A 4BROA 4NCGA 2YNIA 1CZ9A 4O44A 4A5BA 3CD6N 2QWLA 3QBXA 4BACA 3HBTA 3L2WA 3ZETB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3LDN A;  4IZ9 A;  2FC0 A;  2HNY A;  4NCB A;  4W5N A;  3LPT A;  1RNH A;  3EYZ A;  3QES A;  2A1S A;  5M1O A;  3HK2 A;  3AO4 A;  1C0U A;  3AAQ A;  1RT5 A;  2Y1I A;  4DTP A;  3E9P A;  4HTU A;  2D1K A;  4LD0 A;  3CET A;  1GLL O;  3T1A A;  4N76 A;  4E1N A;  2E2P A;  2ZF5 O;  2Q1N A;  4DTJ A;  1Z25 A;  2QWO A;  1KD1 O;  2P5G A;  4IWV A;  4WQ5 C;  3A5N C;  3JYT A;  1HNZ K;  1T6C A;  2NRV A;  3GE1 A;  1SL0 A;  1KXP A;  2NRZ A;  4K41 A;  4CEQ A;  4CW7 B;  3TAP A;  4YDU A;  2YKN A;  5F0X A;  2Q36 A;  4DFK A;  4PL8 A;  3DXM A;  3TTD A;  4ZHR A;  1ZBL A;  5LL6 Z;  3L2V A;  2QWQ A;  2V51 B;  1O1W A;  1S22 A;  2YHB A;  1LWE A;  3K5O A;  3IDH A;  2E88 A;  2PFU A;  5BR9 A;  3VQ9 A;  3HZ6 A;  1RDB A;  3DRP A;  3NFA A;  4JD2 B;  3RVC A;  3ENH A;  1RTD A;  3VOV A;  3BDP A;  4KB1 A;  3KK7 A;  3EEQ A;  4OGE A;  2GV9 A;  1MU2 A;  3HPH A;  2DFF A;  4MQ3 A;  5LMU K;  2YV0 X; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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