2E20A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with diadenosine tetraphosphate (ap4a)
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate Kinase
publication title Crystal structures of Salmonella typhimurium propionate kinase and its complex with Ap4A: evidence for a novel Ap4A synthetic activity.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 136
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2006-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e20A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e20A02
3TPQA 3DXKA 3ZETB 4BG9A 4PKIA 2AA4A 1MDUB 2D1KA 3QICA 5AQWA 2IVPA 4BGAA 2I7NA 3VEYA 1CZAN 3M3ZA 4K43A 3GL1A 1R59O 1X3NA 3HBTA 3MDQA 3VEWA 5BPNA 2FSNA 3FLCO 3CJ7A 2CH6A 4CZLA 4H0YB 3H1VX 3FZFA 4FPBA 4O5FA 2QWLA 4K41A 3M1FA 4DCHA 2A40A 4DB3A 4IJAA 3CJ9A 5AQIA 2W40A 4H5VA 3VENA 4BR4A 2UYTA 1MWMA 1SAZA 4B1WB 2YI1A 1GLEG 1MWKA 5LJVA 1GLBG 5BN8A 1GLFO 1NWKA 1IG8A 4Y0WA 3HZ6A 4WQ5C 3C7NA 4K25A 1HLUA 5EY4A 4FWMA 1ZBSA 1BO5O 1BA0A 3D2EA 3O8MA 3WXJA 1NGAA 2GELA 5AR0A 4CZHA 4F9OA 5AZIA 2D0PA 3EZWA 2Q2RA 3VF4A 4A2BA 3GBTA 3UKUB 3RSEA 4FWRA 3SMSA 2QWRA 1ATNA 3CHWA 2YHYA 3VF6A 1GLAG 2A41A 3SJHA 5AQXA 1H1VA 1Y64A 4H0XB 3GDQA 3HTVA 1TYQA 3MCPA 4BRLA 4Z94A 1NGBA 5BPLA 4BRDA 3H45C 4BRCA 2FSJA 3AY9A 5ELZA 3DJCA 4KBOA 1C0FA 1RGIA 3H46O 2QM1A 4J8FA 3AAQA 3IFRA 4BRIA 3JS6A 2VYPA 2E88A 4WQ4A 4BRFA 2QWMA 1U2VA 4BQLA 3OHRA 1MA9B 1C0GA 2KHOA 1JCEA 4DQ8A 2QWNA 3DWLA 2P9KB 3ULEA 3ZEUB 1S3XA 3MK6A 1ATSA 4B1YB 3QBXA 4M63C 2IVNA 3WEEA 2E1ZA 2H3GX 3O1WA 4WQ5A 2HOEA 2I7PA 4FL9A 3CETA 3TU5A 1ATRA 2HMPA 3LDOA 4FWLA 5BN9A 2P9UA 4GY2B 1NGEA 4E1JA 3FZKA 4CZMA 1QQMA 2J4RA 3EL2A 3A5LC 3M6GA 5EOYA 3QFUA 2A6AA 3BF3A 4RTFD 2Q1NA 2ZF5O 2P9NB 4QS9A 3SLCA 4A62A 1XQSC 3KHYA 3DXMA 2QW9A 1QZ6A 2GEMA 1BA1A 3FR0A 3J8AA 1JCFA 1T6CA 2IVOA 3C7NB 1NGGA 1BU6O 4PL7A 1G99A 3A5NC 3CJCA 5AQMA 2P9IB 4H5TA 1E4GT 1WOQA 3JXUA 3IMXA 5BPMA 3IUCA 4BRQA 2NRHA 5F0XA 3WXLA 4WQ4C 4XH4A 5JLFA 4H0PA 1X3MA 3ENHA 5F1XA 4DHYA 2PBDA 5AQZA 4FSVA 4C23A 5LY3A 2GUPA 4JD2A 3WXKA 1ZXOA 4GNIA 5AQJA 1QHAA 1V4SA 1K8KB 1YXQA 4JHDB 4MO5A 3WUHA 2GWKA 1Q18A 4M7YA 4H0TB 4MLHA 4EIAA 1RFQA 5AQTA 3H3OB 1J6ZA 2Q31A 2VCPA 1ESVA 5BRFA 2FXUA 4FO0A 5AQOA 4FWNA 2CGLA 1DKGD 2Q36A 5FPNA 3VF2A 3ZX3A 4BR7A 5FPDA 2V51B 4FWQA 1KAZA 3UKRB 2E2OA 3LM9A 5BRDA 2P9LA 3LDQA 4ISEA 4ISGA 1NGCA 2QWOA 1DEJA 4M7XA 2HF3A 3CQXA 3CERA 3LL3A 4QS7A 3EO3A 2P9PB 2E8AA 2D0OA 2HF4A 3LM2A 1TUYA 5EXWA 5KQ8A 4CZFA 2E20A 3CJAA 4L3QA 2ASPA 4BR2A 2P9SB 4BRKA 1HPMA 5KQDA 4H5NA 1BWFO 2OANA 3ZETA 2ASOA 3MMVA 4H5RA 2E1YA 2F9TA 5AZJB 2W41A 1LOTB 2ZWHA 4H03B 4YDUA 5EX5A 2QWQA 1QZ5A 3ATVA 1WUAA 4NO7A 1QQNA 4BC5A 3D2FB 3ZX2A 2BUPA 5AQVA 3L0QA 3VPZA 1SQKA 3BP8A 4B1UB 3QMLA 5AQGA 1NMDA 3QBWA 3EKSA 4XEIA 4BC2A 4EHUA 3QFPA 3L4IA 3BUZB 4A61A 2PAVA 3FFKB 4FOEA 2Q0UA 4CD1A 3EKUA 3I8BA 4LC9B 1KXPA 1GLCG 5KPRA 1P8ZA 3DXKB 5AQSA 4RCHA 4B1ZA 5ADXA 4BG8A 2YJEA 2E2NA 5E26A 3G25A 4BREA 2FLOA 4I6MA 1QQOA 4CZKA 3WXIA 5AFUA 1T44A 5AQKA 4CJ7A 1NBWA 3O80A 1HKBA 4FWSA 5LJWA 3ENOA 3AARA 3O08A 3UKUA 2ZGZA 4CI6A 1X9JA 3CJBA 3ID8A 1HJOA 1Z05A 4HWIA 1YVNA 3U9DA 1LCUA 4CBXA 4CZGA 3MN9A 5AQUA 5ADXH 1NGHA 3QDKA 3GE1A 4XH5A 4BRHA 3O6WA 4BC4A 1GLJO 3A8YA 2DPNA 3HSCA 4FPAA 4NB4A 4QS8A 4YDUC 5AFUH 1EQYA 1BDGA 3VOVA 4WYBA 3VGMA 4H5WA 3SK3A 4BRNA 1U6ZA 1YUWA 2CGKA 2EWSA 3D2EB 5I9EB 1IJJA 3U8XA 3DAWA 3C0BA 3VGKA 5AZIB 4BRGA 5EVZA 4MLEA 2NLXA 3O1BA 3RSEB 3UB5A 1HX1A 3CI5A 3F9MA 3A5OC 2FF3B 3MN7A 1ZC6A 3CQYA 2P9KA 3ZEUA 1TYQB 2E2QA 3WQUA 3HM8A 4O8KA 4IO8A 4AM6A 3FZLA 4B1VA 2QWPA 4CZEA 3A0IX 3GG4A 2GWJA 2V7ZA 3LDPA 2E2PA 3VEXA 3ATUA 4BR9A 3H3NO 4BR5A 2NZTA 2YJFA 3CJ1A 1XUPO 5JLHA 4PKHA 2GTDA 3B8AX 3R6MA 5AQRA 3WQTA 5JMVA 1JCGA 3HI0A 5TKYA 3O5BA 4EAHD 2Q0RA 3H6EA 1HKCA 1U2VB 5AQQA 1BOTO 2FSKA 2P9NA 4PKGA 1DGKN 4FOIA 3U4LA 3SMPA 3VETA 2FF6A 3CIPA 4BRPA 3LDLA 5BREA 2BTFA 3FE1A 3ULEB 2A42A 4MO4A 1NGJA 4BVPA 5AQPA 1D4XA 4PL8A 5FPEA 4EFHA 4JAXA 4I6MB 2V7YA 1NGDA 2QXLA 3EN9A 2P9IA 3WT0A 1T6DA 3WEEB 5AQHA 3KZBA 4JN4A 3VEVA 2YCHA 1OKJA 4H0OA 2P9UB 3I33A 3R8EA 2CGJA 1GLDG 3A5MC 4H0VB 4CBWA 3FZMA 1GLLO 5AQFA 3QB0A 5E84A 3P4IA 3O4WA 4IJNA 1K8KA 4JHDA 3W0LA 3DXMB 5BRHA 1NM1A 1TUUA 1S22A 3VEOA 3MN5A 4ISFA 2Q97A 5AQNA 2CH5A 2YHXA 4BR0A 4K42A 4BGBA 3BF1A 4BRAA 3UE5A 4JNEA 1NGFA 3UKRA 1HUXA 1SZ2A 1Z6RA 3VEZA 1RDWX 5JICA 1E4FT 5KPTA 4BROA 4IZ9A 5BR9A 2ASMA 3D7EO 3KVGA 5FPMA 4BVOA 3LDNA 2P9PA 5AQYA 5F2RA 3H1QA 4CZIA 3L6QA 4JD2B 4BRMA 3BEXA 2P9SA 4HTLA 4BC3A 3U9ZA 3S41A 4EHTA 3IDHA 4FWPA 2A5XA 4CZJA 1HKGA 2ITMA 1NLVA 1YAGA 4BQZA 2IIRA 5AQLA 5AZJA 3R9PA 1KAYA 4IXCA 4RWTA 1KAXA 3W3DA 5KPZA 3AAPA 4A2AA 2V52B 3D2FA 4CD3A 2A3ZA 1BUPA 3FZHA 2P9LB 2F9WA 3ZX0A 1V4TA 1XC3A 4IWVA 2YHWA 4B9QA 2AP1A 5CE3A 3VESA 2VWBA 2ZGYA 3FGUA 2WUSA 4XH1A 3VERA 3MN6A 1NGIA 4CBUA 4FWKA 3GOIA 5B8HA 4AM7A 4B1XB 3VGLA 2D4WA 4FWOA 1BG3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KZZA 4PKIA 5IWAK 3P83D 1JLAA 4J2AA 3VEYA 5I3UA 3KKRA 4K43A 5CYMA 3WNEA 1N32K 4GV3A 1A5XA 1ASWA 4RW6A 5BPNA 3FLCO 2Z1GA 4FXDA 3PV8A 4LFBK 4CZLA 1NJIO 4CK2A 3OJUA 4O5FA 4K41A 1YI2N 1LAWA 4WF9L 2A40A 3U6FA 5AQIA 1NK9A 4ICLA 1JLGA 3AA3A 4N56A 1ASUA 1XNRK 3THWB 3SPZA 3VENA 1YJ9N 2XHBA 4GW6A 4JI5K 3SPYA 4LFAK 1IH7A 4Y0WA 4JKDA 4WQ5C 2G8VA 4X62K 3TTCA 1BA0A 3O8MA 4JS5A 3WXJA 1NGAA 4AHCA 3VQ4A 4F9OA 5AZIA 2ZQBA 1LWEA 2HSTA 2Q2RA 3IS9A 4A2BA 3RR8A 1BGXT 3PO4A 2HHUA 1DT9A 4MFBA 3MEGA 4OVLA 4M3WA 1W7AA 1U04A 1Y64A 4CGJA 3GDQA 4YHHK 1HR0K 2O8DA 3ZT2A 1TYQA 5C10A 1RT2A 3THXB 4CGDA 1NK8A 3KK2A 4ID1A 4KBOA 3EZ5A 1RBUA 1RGIA 3TSQA 3K5OA 1YJNN 1JLCA 3IFRA 1RT7A 4GMJB 3L2WA 3NH0A 1VQ4N 4DV6K 4BRIA 1TKZA 3KLFA 4QCLA 2QWMA 4BQLA 3EEQA 1JCEA 1VSEA 4CEEA 3ULEA 4KI4A 1RTIA 1YIJN 3RVCA 1B9DA 3QBXA 4GV9A 1U49A 3Q7CA 3AGKA 3WEEA 3NH2A 3TAQA 4YORA 2HOEA 4CJWA 4CK3A 5GIOA 2HMPA 3J7AP 1GOAA 3SQ4A 1HQUA 3LP3A 2P9UA 4GY2B 5BN9A 3RWUA 1WAFA 4JI3K 1NGEA 5E41A 4RG8A 4CZMA 1QQMA 2J4RA 3EL2A 3QETA 3AA4A 3ZSYA 1WNSA 3MX2A 2A6AA 3QFUA 2ZF5O 2P9NB 3CQ8A 2PYJA 3KHYA 4JV5K 3D45A 2GEMA 1BA1A 1JCFA 3CCVN 1HYSA 4Q5VA 1QSYA 1VQ7N 4BE1A 4FW1A 4ILHA 4R79A 4FW2A 5AQMA 2P9IB 4Z4EA 1WOQA 1UA0A 2VG5A 3HL8A 4BRQA 4MDBA 4M3TA 3OYFA 1HQEA 2YV0X 4H0PA 1X3MA 4UY8O 4FSVA 1RDUA 5LY3A 3SQ0A 3WXKA 1ZXOA 2O8CB 3AVJA 4FJ7A 4B9MA 3RTVA 1UAXA 4PHTX 3OBWA 1Q18A 4H0TB 5EU7A 1RTHA 2Q31A 1J9AA 3E01A 2HNDA 1ESVA 1Q9YA 5KRSA 2CGLA 2Q36A 3ZX3A 3VF2A 5CR4A 4CF2A 1KAZA 1T7PA 1KD1O 1NMNA 1CXQA 3TSUA 3OS1A 4CW7B 5AJ3K 2XY6A 3NFAA 3CERA 3LANA 3EO3A 3CCJN 4KHPK 3OYDA 4CZFA 1HRHA 3CJAA 4L3QA 4BRKA 2HBMA 1BWFO 4JKAA 3MMVA 1NNEA 1OVYA 4H4MA 1DTQA 1K8AO 4YDUA 3VA0A 5EX5A 2KKZA 1S9GA 2JWLA 1WUAA 4Q0BA 3ZX2A 1C1AA 2YHBA 4W5RA 2BUPA 5AQVA 3VPZA 3MX5A 4FJ8A 3QMLA 5AQGA 1NMDA 4CIEA 3P39A 3EKSA 4BC2A 4CHNA 1NOYA 3L4IA 1NK0A 2FBVA 3AVGA 3PLAA 4FOEA 4KO0A 2O8FB 4CD1A 4IFYA 2PYLA 3EKUA 4CGHA 1P8ZA 3CC7N 5GAEP 4FYDA 4B1ZA 3C94A 4FJJA 2YJEA 3PUFA 3G25A 1NKBA 3M8SA 3WXIA 5LMUK 1HNXK 2PFUA 3V81A 3LZIA 4FWSA 4E1MA 5LJWA 3HK2A 3MAQA 3AARA 4KHUA 4FJMA 3QEIA 3HSTB 4KTQA 1YVNA 3U9DA 1TVRA 1Y97A 5AQUA 1N36K 1NGHA 2OPRA 4JKGA 4XH5A 4M3UA 3AVBA 3DYAA 1X1PA 4BRHA 1W2BM 4BC4A 1GLJO 3HSCA 5JVGL 1EWRA 5AFUH 2IC3A 4J2BA 3VTIA 1BL3A 3L2VA 3SK3A 3CCEN 1U6ZA 2EWSA 3SUNA 1TK8A 1BCMA 2BGGA 4B9TA 1GOBA 4IO9L 1XMQK 2RF2A 1KSPA 4DSFA 1CXUA 1RT1A 3M5RA 1SKWA 1X9MA 3CI5A 2R7YA 5FROA 1SV5A 3AVFA 3CQYA 4F3OA 3QIPA 3T19A 4AM6A 4JKHA 3HT3A 2QWPA 3A0IX 2GWJA 3EE8A 2G8IA 5HRPA 1VQ9N 3ATUA 3SAHA 1BQMA 2F8SA 3B6OA 1YF5L 4LF4K 4FLYA 4PKHA 4RW9A 1UA1A 3O5BA 4EAHD 3T1AA 2Q0RA 3AVLA 3DMJA 1HKCA 1U2VB 5AQQA 2FSKA 1TAUA 4DFKA 4C8KA 2FF6A 4WFNL 5I42A 3CIPA 4BRPA 3TAMA 3FE1A 4MQ3A 3AO3A 4MO4A 4BVPA 1Q8IA 1K6YA 3IRXA 3K57A 1U4BA 5M1KA 4CJVA 4JLHA 4AQYK 4JN4A 1JXBA 4RW8A 2YCHA 1OKJA 2O8EB 4H0OA 4C8MA 3G71N 1RT3A 2X6NA 2HHSA 3A5MC 5JS2A 3MWPA 2JLEA 4DR6K 2NNWA 1RBTA 1BHLA 1WBBA 4JHDA 3W0LA 3DXMB 5BRHA 5KTQA 1NM1A 4JRPA 3SUQA 3WNFA 1RNHA 4C8LA 4ISFA 2CH5A 3PX6A 1WSGA 2YHXA 4W5NA 3UE5A 3CC2N 3FFIA 4J2EA 4Y1DA 3UKRA 1JJ2M 1HUXA 3RRHA 1LWCA 5KPTA 1C1BA 4OPKA 2XO7A 3C6HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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