2E20A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with diadenosine tetraphosphate (ap4a)
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
b'FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate Kinase
publication title Crystal structures of Salmonella typhimurium propionate kinase and its complex with Ap4A: evidence for a novel Ap4A synthetic activity.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Transferase
total genus 136
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2006-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e20A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e20A02
3LM2A 4M7YA 4BC4A 2CGLA 3UKUA 5BRHA 3WT0A 4A2AA 5BRDA 3BF3A 4BRQA 2P9IA 2ITMA 2QM1A 5AQTA 4FOIA 4BC3A 5AQVA 1NGGA 3A8YA 2E2OA 3WQUA 1QZ5A 3VEZA 3ATVA 4CBXA 3WXIA 1BUPA 3GBTA 2P9PB 1K8KB 4XEIA 4EHTA 1MWMA 3HM8A 5F1XA 1NGJA 4BRCA 4YDUC 5AR0A 5ELZA 2CGJA 2E2QA 5F0XA 1HLUA 3IFRA 2QXLA 5LJVA 4HWIA 3S41A 2GWJA 4GNIA 2P9SA 1S22A 3LDOA 3VEWA 5ADXH 2P9UA 3W0LA 4BROA 3BUZB 2GTDA 4CD3A 1YXQA 4HTLA 1GLEG 2HMPA 2OANA 5AZIA 4CI6A 5BPLA 5AQZA 3VESA 5BPMA 2UYTA 5AQPA 1NGFA 2P9NB 4CZLA 3ENOA 4BR2A 4BG9A 3H3NO 2W40A 4FL9A 5LY3A 1Q18A 2D1KA 5AQQA 3WEEB 3VEYA 3CQXA 3AAQA 3LDPA 1WOQA 1LOTB 3FR0A 3MN5A 3OHRA 4FWRA 4PKGA 3RSEA 1ZXOA 5KQ8A 3CHWA 3KZBA 4K42A 1JCEA 2Q1NA 1JCFA 3DXKB 3GG4A 4WQ5C 3WXJA 3VETA 4BRDA 4XH5A 1ZBSA 2P9PA 2E8AA 3DJCA 1TUYA 5AQNA 3SMSA 2Q0RA 4CZKA 3VGKA 4BRHA 1YAGA 3SMPA 4CZEA 2IVOA 1NGAA 2F9WA 4BRLA 2IVPA 1HUXA 5AQRA 1HKCA 3ID8A 5AQYA 4EAHD 4H5TA 4K43A 3UKUB 5AQGA 3H45C 1NGDA 5ADXA 4FWOA 1MA9B 4BR9A 1NBWA 3DXMB 4CZIA 3J8AA 4F9OA 4A62A 1DEJA 2CGKA 3VPZA 3CJBA 2V7YA 4WQ4A 4XH4A 4FWMA 3DAWA 5KPRA 4BQZA 1SQKA 2A40A 3KVGA 2KHOA 3AARA 4CZMA 3GL1A 3O4WA 2V51B 4CZGA 2D0OA 2IIRA 3A5MC 5AQMA 2GWKA 1D4XA 1G99A 5BR9A 4BR5A 5AQKA 2ZGZA 3WXLA 3FE1A 2Q0UA 2VCPA 2P9SB 2W41A 3B8AX 4WQ5A 4JD2A 3QBWA 5BN9A 3VF4A 4XH1A 4BQLA 2A42A 3QB0A 3I8BA 4KBOA 1KAYA 1XUPO 4ISGA 4FPAA 3VEOA 4JHDA 4I6MA 1WUAA 3D2EB 4H5WA 3R8EA 4B1YB 2F9TA 3BEXA 1RGIA 3ATUA 4RTFD 4IWVA 4GY2B 3M1FA 2FSNA 1HJOA 5I9EB 3RSEB 2GUPA 3DXMA 1KXPA 1Y64A 5EVZA 4A61A 4CZFA 1KAXA 3U9DA 2ZGYA 4RCHA 3C7NB 5JLFA 1RFQA 2QWOA 2QWMA 4BRKA 4M7XA 4BRIA 5KPTA 4AM6A 4JN4A 2E2PA 5AQUA 3H1VX 3TPQA 1S3XA 5FPMA 3CI5A 3QBXA 3MDQA 1GLLO 3CJCA 4BGAA 4FWPA 4BVOA 3O80A 3EKUA 3LDQA 3ZEUB 3D2FA 3QFUA 2A41A 4J8FA 4DQ8A 4H0YB 3QDKA 2GELA 2PBDA 3DWLA 4WQ4C 2GEMA 1GLCG 3FLCO 1U6ZA 1QQMA 1BDGA 2E2NA 2J4RA 3BP8A 3D2EA 4FPBA 1BO5O 4H5VA 4CBWA 1R59O 1SAZA 3H1QA 3JS6A 2FF6A 5LJWA 5FPEA 4BVPA 1SZ2A 2QWNA 1LCUA 2E20A 5CE3A 4RWTA 3GOIA 2D4WA 4H03B 4H5NA 4B1ZA 2P9LB 3EL2A 1NM1A 2ASPA 4FWNA 4QS7A 2E1YA 1BG3A 3VF6A 4BC5A 3WUHA 4FWLA 4BRPA 3VEXA 4B1WB 3BF1A 3CERA 3C0BA 4JD2B 1MDUB 1H1VA 2QWRA 1HKGA 3C7NA 2YCHA 3M6GA 4ISFA 4H0XB 4H0TB 1ATNA 4LC9B 2CH5A 3F9MA 4BG8A 1ZC6A 3VEVA 3VOVA 1GLJO 3CQYA 1V4SA 1T44A 1C0GA 4JHDB 4PL7A 4IO8A 4I6MB 3VGLA 3L4IA 5TKYA 1NGCA 4PKIA 3EZWA 4MLHA 4CJ7A 2V7ZA 3H3OB 1X3NA 2PAVA 2VYPA 5AQHA 4JAXA 2FSKA 3ZEUA 3CJ1A 4BGBA 1OKJA 1NWKA 4E1JA 1P8ZA 3TU5A 5FPDA 4IJAA 5AQIA 5B8HA 2V52B 1GLAG 3R9PA 3VERA 4EFHA 2ASMA 3VENA 2ASOA 1GLDG 2FF3B 4O8KA 3IDHA 1Z6RA 3MCPA 2H3GX 2P9LA 1GLFO 4BRGA 3VGMA 2A5XA 1NGIA 3EN9A 3ZX0A 5EXWA 5BN8A 5EOYA 1Z05A 4IJNA 4BR7A 2Q97A 4AM7A 3D2FB 2YJEA 2FSJA 4WYBA 1MWKA 1JCGA 5AQJA 1QHAA 2I7PA 5AQXA 3QICA 3A5LC 1T6DA 1X3MA 3L6QA 2WUSA 5EY4A 4FOEA 1BA1A 1HPMA 4MO5A 4BR4A 3UKRB 4JNEA 3CJ7A 3MMVA 1HKBA 3O1BA 1RDWX 3MN9A 3GE1A 1X9JA 1YUWA 2QWLA 3LL3A 3SLCA 1NMDA 3U8XA 3WQTA 4FSVA 4BRAA 2Q2RA 5E84A 2A3ZA 4BRMA 3P4IA 4EHUA 2DPNA 4BREA 2AA4A 3HSCA 3U9ZA 1ESVA 4IZ9A 3ZETA 2FXUA 1BU6O 5AQOA 2ZWHA 4DB3A 4MO4A 5AZJB 2D0PA 5EX5A 3W3DA 1IG8A 2A6AA 1QZ6A 3UE5A 5KQDA 3HTVA 1E4FT 3HI0A 5KPZA 3A5NC 3GDQA 3A5OC 2NLXA 3MK6A 2HF4A 1NGEA 2QWPA 2QWQA 3AAPA 5AFUH 4BR0A 3SJHA 4CD1A 2P9KA 3O5BA 3UKRA 4NO7A 1TYQB 1QQOA 1IJJA 2FLOA 2NRHA 2NZTA 3UB5A 1ATRA 3ULEA 3H6EA 4Z94A 4B1XB 1NGBA 2IVNA 3AY9A 3FFKB 1ATSA 3MN7A 3QMLA 3VF2A 4PKHA 4A2BA 4CBUA 3FZFA 4FWSA 4B9QA 1NLVA 1BWFO 5BRFA 4C23A 4Y0WA 4B1UB 2Q31A 1TUUA 4H0VB 3D7EO 3WXKA 2I7NA 1C0FA 4H0PA 5JICA 2CH6A 5F2RA 3CJAA 1QQNA 3O08A 5AZJA 5E26A 5BREA 1HX1A 3CIPA 5AQSA 4H5RA 1DKGD 1U2VB 4BC2A 1GLBG 4H0OA 2YI1A 1K8KA 3CETA 1EQYA 4L3QA 4DHYA 2QW9A 3H46O 4PL8A 2EWSA 1BOTO 4K41A 4FWKA 4YDUA 1CZAN 1NGHA 3LM9A 2YJFA 3O8MA 1T6CA 3O1WA 5AFUA 4BRFA 4IXCA 3LDNA 1TYQA 3ZETB 3G25A 5JMVA 2E88A 1XQSC 3U4LA 1KAZA 3FZMA 2YHYA 3QFPA 2HF3A 2P9IB 4FO0A 4FWQA 3EO3A 4O5FA 2VWBA 3ZX3A 4CZJA 3JXUA 5AQWA 3L0QA 3CJ9A 2P9NA 3IUCA 3LDLA 3HBTA 3ENHA 3MN6A 3IMXA 3WEEA 2YHXA 3KHYA 4BRNA 4EIAA 3R6MA 3FZKA 3A0IX 4QS9A 2HOEA 3SK3A 5JLHA 4M63C 4K25A 3FZHA 2P9KB 2Q36A 2ZF5O 3I33A 2BUPA 3DXKA 3M3ZA 3O6WA 1XC3A 1U2VA 1DGKN 2AP1A 2E1ZA 5AQLA 3ULEB 1E4GT 4QS8A 2P9UB 5BPNA 4NB4A 2BTFA 4CZHA 3FZLA 4DCHA 5FPNA 4MLEA 3EKSA 2YHWA 3HZ6A 5AZIB 4B1VA 4ISEA 3FGUA 1J6ZA 5AQFA 3ZX2A 1BA0A 1YVNA 1V4TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V1OA 4E7HA 1RT5A 4K8XA 4IDKA 2OYQA 4CJ5A 5JVHL 4BC3A 5AQVA 3TABA 2UU9K 5BR8K 1UWBA 2IC3A 2E2OA 3LALA 3ZSWA 1QZ5A 3VEZA 4CJRA 3SI6A 1BUPA 3QIOA 2P9PB 4CFCA 1MWMA 3L8BA 4BRCA 3O4NA 4JRPA 5AR0A 2CGJA 4O5BA 3VQPA 4CGFA 4DUYK 1C1CA 4E89A 4B9TA 3SAHA 4IOAL 5ADXH 3KLEA 3THWB 1J5EK 3CCLN 4JK9A 4JLHA 3OS2A 3BUZB 3CCVN 1VQ7N 1OH7A 2BGGA 1RBUA 5BPLA 3TAMA 3DRRA 4CI6A 2GBZA 2P9NB 4CZLA 4BR2A 3I56N 1L3VA 1VRUA 5AQQA 3OY9A 4Z4IA 3QNOA 3O9TA 1WOQA 3Q7BA 3MN5A 1NK9A 1JCEA 3NHGA 1C0TA 2IGIA 1BGXT 3VETA 3MAQA 1BCOA 3QO9A 2HMIA 4DSJA 2P9PA 1X9SA 3SMSA 4IFVA 3KK7A 4CZKA 4AHUA 4CZEA 3K59A 3F9KA 3EYZA 4B9LA 1DT9A 1WSEA 2F4VK 1X9MA 3V9ZA 2VQFK 1N34K 2XO7A 3THWA 5AQGA 1NGDA 4RW6A 4DQIA 3LP3A 4KTZA 4A62A 3VPZA 4WQ4A 4FWMA 1VQ4N 3AO2A 3DAWA 4B08A 5FROA 1UA1A 5KPRA 4BQZA 2A40A 4CF2A 1BISA 3CF5L 4CZMA 2ZD1A 2YKNA 2D0OA 3I0SA 2GWKA 2OTLN 4JI8K 3PUFA 4HUGA 2HVIA 1RBTA 4G1QA 2BDPA 3AA2A 4BDPA 3K5OA 3IG1A 4CFAA 4BQLA 4CHOA 3M5RA 4ISGA 4FPAA 1YI2N 4BWMA 1WUAA 4OKKA 3ZSRA 4DTNA 3G6EN 2YNHA 3BEXA 4CHQA 2UUBK 1U45A 3OYEA 4IWVA 1HJOA 5I9EB 1XI1A 3C6TA 1KXPA 3P31A 4CZFA 5EVZA 2VG7A 4ZHRA 4FJNA 3U9DA 2OPSA 2ZGYA 4BDZA 2G8FA 4BRKA 2UXCK 4CJKA 3ULDA 4CGDA 1NK8A 1XHXA 4JKDA 2XY5A 2PZSA 1VQ8N 4BGAA 1ASVA 3PX4A 3LPTA 3QFUA 2HHXA 4J8FA 4DQ8A 1IG9A 3OYFA 3QDKA 5CZ1A 1NJIO 1VK0A 2W6KA 4PY5A 2RF2A 3FLCO 4CIGA 1BDGA 2UUCK 2NRVA 3ZYYX 1SAZA 3H1QA 2FF6A 5LJWA 5FPEA 4BVPA 1SZ2A 2ZQBA 2QWNA 2ZJRL 1REVA 1SV5A 2ASPA 1ZBFA 2NRZA 2NRWA 4KTWA 4B1WB 5C2FA 4E7LA 4QCLA 2NUBA 1MDUB 2QWRA 3OTOK 1HKGA 2IS3A 1TV6A 2YCHA 3M6GA 1YJNN 3RR8A 4ISFA 1VQMN 4H0TB 2CH5A 4DTJA 5D3GA 3F9MA 4DFJA 3VOVA 2ZE2A 3DOLA 3CQYA 1B9DA 5I3UA 2O8EA 2VG5A 4OPKA 4IO8A 4I6MB 3VGLA 2KZMA 3L4IA 1IKWA 3T1AA 4CJ7A 4WCEL 2V7ZA 3TSPA 2DFEA 2VYPA 2WFBA 1YF5L 4B9NA 1P8ZA 4FLZA 4FJ8A 2D0AA 4KAZA 1J54A 5FPDA 4IJAA 5GADP 2HHHK 3CCMN 3KLHA 1GLAG 3R9PA 2ASOA 4GVMA 4KB1A 3J7AP 1N32K 1IKYA 4OKEA 1Z6RA 5LL6Z 1HNIA 1L3UA 1NGIA 4YOUA 3U3GA 3F5TA 4CJPA 3HJFA 5EOYA 3BY5A 4CJQA 4AM7A 1BIZA 3D2FB 1EKEA 5AQJA 3QINA 4ILHA 4DV1K 2I7PA 1ILYA 3RVCA 4MDBA 3NGYA 3QICA 3A5LC 4XIUA 4HTUA 3OYAA 1X3MA 2WUSA 3NE6A 4FOEA 1BA1A 1RT1A 1HPMA 4A59A 4EP5A 1YJWN 2GUIA 1XC9A 2DFFA 3MN9A 1X9JA 2XRIA 1TK5A 1NMDA 2Q2RA 3IRXA 5E84A 4W5QA 3J7YP 3SUQA 4BRMA 4N47A 4B8CA 4KHWA 4DMNA 2O8CA 1QSLA 2G8KA 3U9ZA 4J2AA 4DFMA 3LZJA 4FW1A 3CCJN 3RRGA 4DB3A 4DQRA 2EX3A 4MO4A 4H8KA 1ZBLA 3HPOA 5EX5A 4Z4HA 4GV9A 1Q7YO 4PUOA 2GX9A 1NK6A 1QZ6A 4LSNA 5KQDA 3NMUA 3DRPA 3KKSA 3HTVA 4KI4A 1VRTA 3A5NC 4JK8A 3A5OC 3MK6A 2HF4A 1RILA 3OYIA 4DR2K 1CXUA 2QWPA 1D8YA 4BR0A 3OYCA 4UY8O 5KGXA 1LAVA 2NZTA 2FLOA 4B3MK 2NRHA 4G9ZA 3ULEA 3H6EA 3VTIA 3MECA 3AY9A 1ATSA 3MN7A 3VF2A 4A2BA 1VSKA 4DV2K 3CQ8A 2KW4A 4CJWA 1S1UA 5KRSA 4JI6K 5GAGP 1CZBA 4WFNL 3T7ZA 1HJRA 4LSLA 5M1PA 1TUUA 3QLHA 2I7NA 1A5WA 1C0FA 4H0PA 2X6NA 1QQNA 3RMCA 1RT3A 3WNGA 4UQGA 3CIPA 1DKGD 1U2VB 4JI4K 1GLBG 3TARA 2ATQA 3NAEA 1K8KA 4CEBA 3CETA 5C2DA 4QAGA 3PLAA 1KRPA 4X62K 4K8ZA 4CF9A 3ZLJA 3OYBA 3L3VA 1U4BA 1NJZA 3VQ8A 1HMVA 1WAFA 4I9LA 4PQUA 1KAZA 3P1GA 4DR5K 2HNDA 1WAJA 4O5FA 3OYKA 2VWBA 3I8DA 1LWEA 2QTDA 3L0QA 3CJ9A 5AQWA 3DLLL 3LDLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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