2NLXA

Crystal structure of the apo e. coli xylulose kinase
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
484
structure length
476
Chain Sequence
MYIGIDLGTSGVKVILLNEQGEVVAAQTEKLTVSRPHPLWSEQDPEQWWQATDRAMKALGDQHSLQDVKALGIAGQMHGATLLDAQQRVLRPAILWNDGRCAQECTLLEARVPQSRVITGNLMMPGFTAPKLLWVQRHEPEIFRQIDKVLLPKDYLRLRMTGEFASDMSDAAGTMWLDVAKRDWSDVMLQACDLSRDQMPALYEGSEITGALLPEVAKAWGMATVPVVAGGGDNAAGAVGVGMVDANQAMLSLGTSGVYFAVSEGFLSKPESAVHSFCHALPQRWHLMSVMLSAASCLDWAAKLTGLSNVPALIAAAQQADESAEPVWFLPYLSPQAKGVFFGLTHQHGPNELARAVLEGVGYALADGMDVVHACGIKPQSVTLIGGGARSEYWRQMLADISGQQLDYRTGGDVGPALGAARLAQIAANPEKSLIELLPQLPLEQSHLPDAQRYAAYQPRRETFRRLYQQLLPLMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Xylulose kinase
publication title Structural and kinetic studies of induced fit in xylulose kinase from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 147
structure length 476
sequence length 484
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.17: Xylulokinase.
pdb deposition date 2006-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nlxA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2nlxA01
2QWNA 2VCPA 4BRLA 2ZGZA 3O1BA 4K41A 3H1VX 3H6EA 3L4IA 4B9QA 2E2OA 3EKSA 4PL8A 2DPNA 4Y0WA 5AQZA 3ULEB 1LCUA 5B8HA 4MLEA 2ASOA 4B1ZA 1U2VA 2EWSA 1BA1A 3KHYA 5JLHA 3D2FB 1BO5O 1YAGA 2QWLA 1D4XA 1GLEG 3EKUA 3ATUA 3I33A 1S22A 4A61A 1DKGD 4BRQA 3O80A 4CD1A 2NRHA 3FZHA 5AFUH 1YUWA 3ID8A 4QS7A 3BF1A 4H03B 2FLOA 3BEXA 5AZJB 3MN6A 4BRGA 2UYTA 2Q97A 4WQ5C 3RSEB 2WUSA 3ULEA 1YXQA 3VGKA 3LL3A 3D2EB 4JHDA 3M6GA 3QFPA 1JCGA 5BRDA 1NGGA 2QWPA 2E1ZA 2D0OA 3U9DA 1RFQA 2ZGYA 3A8YA 3UKRA 2E2NA 3QBWA 4O5FA 3OHRA 4H0TB 4MLHA 3ZX0A 1RDWX 4FWNA 5AQJA 2P9NB 3FFKB 3P4IA 3RSEA 1HJOA 1GLFO 2Q0UA 3CJBA 5E84A 4BRPA 1HPMA 4BRKA 3LDLA 4EHUA 2ZWHA 1NGAA 4CZKA 1NWKA 3WT0A 4DQ8A 4H0XB 1KXPA 3SLCA 3WQTA 3VOVA 3HSCA 4BRIA 5BR9A 2IIRA 1NGIA 4CJ7A 2I7PA 1GLLO 2A40A 4XH1A 4H5NA 3M1FA 2IVNA 3WXIA 2P9NA 4NO7A 3VEZA 4RTFD 2PAVA 4A2BA 1NLVA 5AQWA 4PKGA 2F9TA 3FZKA 3HZ6A 4BR4A 4BGAA 4MO5A 5KPTA 2VYPA 3GBTA 4CBUA 3ZX2A 2GWJA 3A5OC 2QM1A 4PKHA 3TPQA 3EL2A 2YHYA 1NGBA 2IVOA 5ADXA 2E2QA 5AQQA 3FZMA 4CZEA 3AAQA 1ZXOA 3A0IX 4DB3A 2OANA 3H3OB 5AQGA 5KPZA 5AQTA 4IJAA 3WQUA 4BR2A 2A3ZA 2FF3B 4O8KA 3ZEUB 3IDHA 1HX1A 3F9MA 3GOIA 4FWRA 2D0PA 2GTDA 3HI0A 5AQNA 3AARA 2YJEA 3KVGA 1TUUA 4H5VA 2FSKA 2BUPA 4WQ4C 2YHWA 3CIPA 4K43A 4M7XA 2E20A 2V7YA 2HF4A 2P9LB 5AZIB 2IVPA 2FF6A 4F9OA 4BRCA 1U6ZA 1V4SA 2W41A 3IUCA 4EIAA 5KPRA 2V52B 1DGKN 3C0BA 3U4LA 4IXCA 5AQHA 4HWIA 1YVNA 3W3DA 3DXKB 4J8FA 3ZEUA 3BP8A 4BG9A 3ATVA 5BRFA 4B1WB 1XC3A 5LJVA 1IJJA 2E2PA 3DXMA 3VF6A 3QB0A 1X3NA 1OKJA 3SK3A 2P9LA 4BR9A 2HF3A 4DHYA 4BR7A 2QWQA 3ENHA 3IFRA 1Y64A 3C7NB 4CZMA 2VWBA 3CJCA 5CE3A 5AR0A 1NGDA 4KBOA 3FE1A 4H0VB 3QICA 3EZWA 1TUYA 4LC9B 5AQKA 2A6AA 4BR5A 4BR0A 4CD3A 1MWMA 2QWOA 5AFUA 1KAXA 4M7YA 4WQ5A 1JCFA 4H5RA 3AAPA 2PBDA 5KQDA 1BOTO 3VEXA 2ASPA 4BRNA 4CI6A 5AQRA 1ATNA 3CJ1A 3BUZB 3LDPA 3U8XA 1JCEA 1WUAA 5FPEA 3IMXA 2D4WA 3C7NA 3VF2A 1XQSC 4CZLA 4E1JA 5AQUA 4AM6A 3FR0A 3U9ZA 3O08A 1C0GA 1MWKA 3D2FA 3UB5A 1ZC6A 2NLXA 2V51B 1GLDG 2KHOA 5EVZA 2ASMA 3A5NC 3I8BA 2QXLA 4FWMA 3VGLA 4YDUC 4BREA 1T44A 3CJAA 4CZGA 3LM2A 3R9PA 2YCHA 4FOIA 5AZJA 5EXWA 5LY3A 1Z05A 4GY2B 1Q18A 3LDNA 3D2EA 1QQOA 4CBXA 1TYQB 3VEOA 1P8ZA 1WOQA 5AQLA 5JLFA 3HBTA 3KZBA 3WXLA 2P9PB 2ZF5O 3LDQA 2P9KB 2ITMA 3D7EO 4JNEA 2HOEA 3CERA 2FSJA 5BN9A 2W40A 2Q1NA 3A5MC 4BRMA 3SMPA 2Q0RA 2CH5A 3WXKA 4I6MB 3R6MA 4QS9A 1SAZA 3O4WA 3HTVA 1C0FA 2YHXA 2A42A 5JMVA 2CH6A 2GEMA 3O1WA 1E4GT 3WEEB 1TYQA 3MN9A 4M63C 1MDUB 1HKCA 2P9PA 3MN5A 1NM1A 1J6ZA 4H0PA 5AQXA 2FXUA 2P9KA 3L0QA 2V7ZA 1LOTB 4FWSA 4WQ4A 1GLBG 4EAHD 1H1VA 1DEJA 4I6MA 4FOEA 5AQSA 4H0YB 4ISFA 2D1KA 3ZETB 4BROA 3CJ9A 4AM7A 3S41A 2P9SB 3MDQA 4PL7A 1HUXA 2P9IB 1NGJA 2GWKA 1QQNA 5EOYA 3QMLA 1E4FT 3H1QA 3VEWA 5ADXH 4H0OA 2CGLA 2A5XA 4PKIA 3BF3A 3LDOA 3O8MA 4FWKA 1Z6RA 4BRDA 4MO4A 1ESVA 5TKYA 4A2AA 2Q31A 1GLJO 4Z94A 4FSVA 4EFHA 1K8KB 2F9WA 3AY9A 3MK6A 3VF4A 3MMVA 2P9IA 3CQYA 1BDGA 3R8EA 3FZLA 2E1YA 5EX5A 5AZIA 3FGUA 3GG4A 4RWTA 3B8AX 5BPMA 1GLCG 3FZFA 3LM9A 4CZHA 4CZFA 5BREA 4IZ9A 5BPLA 3GE1A 3JS6A 4WYBA 3CI5A 4BRAA 3DXKA 3JXUA 1ATSA 5AQFA 3A5LC 4CZIA 2YJFA 4BVPA 2QWMA 5F1XA 1K8KA 4C23A 3GDQA 4JN4A 5FPMA 1GLAG 4L3QA 3WXJA 5FPDA 2H3GX 4JD2B 1X3MA 2I7NA 1ZBSA 1CZAN 4BRHA 1HKGA 4IJNA 4YDUA 4JHDB 1QQMA 3EO3A 3CQXA 1SZ2A 3UKRB 3SMSA 2BTFA 1NGCA 5LJWA 1T6DA 5AQIA 4K42A 5AQVA 3H3NO 5E26A 1KAYA 5AQMA 5AQYA 3CETA 2P9UB 1NMDA 3CHWA 4JD2A 4XEIA 2GELA 4BC2A 4CBWA 1NGEA 4ISGA 4XH5A 4BVOA 4A62A 4XH4A 2J4RA 1RGIA 4BGBA 3UKUB 1ATRA 4EHTA 3TU5A 3GL1A 4BQZA 3DAWA 3QDKA 4BG8A 4H5WA 4BRFA 3J8AA 5AQOA 3H46O 5EY4A 2Q36A 3DJCA 4IWVA 2QW9A 3DWLA 2P9UA 1QHAA 3VEYA 3VENA 4FWQA 4HTLA 1NGHA 5ELZA 4BQLA 4B1VA 2Q2RA 4FPBA 4CZJA 3UE5A 1EQYA 3UKUA 1HLUA 1BA0A 2CGJA 2YI1A 2CGKA 1T6CA 3O5BA 4FWPA 5F2RA 2HMPA 3M3ZA 3QFUA 5BRHA 5I9EB 3O6WA 5AQPA 1BWFO 5KQ8A 2E88A 2AP1A 1S3XA 4FPAA 4B1UB 1QZ6A 2A41A 4DCHA 1R59O 2GUPA 5F0XA 3CJ7A 3WEEA 1G99A 5BN8A 2QWRA 4K25A 4FO0A 3SJHA 1KAZA 4ISEA 4NB4A 1XUPO 1BUPA 4B1XB 1MA9B 3HM8A 4JAXA 1V4TA 4BC3A 2AA4A 3ENOA 3VGMA 4RCHA 2NZTA 3ZETA 3VESA 2FSNA 1HKBA 1SQKA 5FPNA 3DXMB 4H5TA 3G25A 3L6QA 4GNIA 2P9SA 3VETA 1NGFA 4FL9A 2E8AA 3EN9A 1BG3A 1IG8A 4FWLA 3WUHA 1X9JA 3H45C 1NBWA 4QS8A 3VEVA 3VERA 4IO8A 1QZ5A 5JICA 5BPNA 1U2VB 1BU6O 3W0LA 3ZX3A 4B1YB 3QBXA 3VPZA 4FWOA 4BC4A 3MN7A 3MCPA 3FLCO 4BC5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZGZA 1Z25A 4IG3A 3H1VX 3L4IA 3P5JA 2E2OA 4RW8A 4PL8A 2DPNA 5D3GA 3AVJA 2EWSA 3MXIA 2RE2A 4ZHRA 4B9UA 1TAQA 1FK9A 4OX9K 4LSNA 2GBZA 3V9UA 4KV8A 4A61A 4BRQA 2D0CA 2NRHA 1NK6A 3ID8A 3MECA 1ASWA 3BF1A 2FLOA 4HUEA 2WTUA 4O0IA 2UYTA 4JKAA 1J54A 4FCYA 4DV5K 3D2EB 4DV7K 4JHDA 1U4BA 4KKOA 1S1VA 3M6GA 1RTJA 3HT3A 2D0OA 3U9DA 4PA1A 2IC3A 3A8YA 3SUQA 4O5FA 1VSKA 4MLHA 1RDWX 3OA9A 3RMDA 3FFKB 4AH9A 4HHTA 3P4IA 1GLFO 3ZT4A 2Q0UA 3WNEA 3CJBA 4CJKA 1NU0A 4BRKA 4DU1A 3LDLA 3LP0A 1KTQA 4EHUA 2ZWHA 2YNGA 4CZKA 3SLCA 2GX9A 1NK7A 5BR9A 4DV4K 4NCGA 4FJLA 4H5NA 3WXIA 2IVNA 4ELTA 4JI8K 4JI0K 2UXCK 4LY7A 5CZ2A 2F9TA 3HZ6A 2PFUA 3ASMA 4C1NK 1ZBIA 4MO5A 3THWB 1S1WA 4IFYA 2QM1A 2OYQA 2HBKA 2YHYA 2E2QA 5AQQA 1U45A 3SAFA 3VQPA 1IKYA 3CG7A 3KLIA 1JJ2M 5C24A 4FW1A 3IDHA 1HX1A 5AQNA 3LDSA 4FJJA 2WOMA 2YJEA 3AARA 3KVGA 1TUUA 5KI6A 3NDKA 2BUPA 3HYFA 4FLUA 3CIPA 1KSPA 4FLVA 2HF4A 1S72N 5M1KA 5KPRA 1BHLA 2GUIA 2V52B 3C0BA 1BQNA 5DK5A 1YVNA 3DXKB 3BP8A 4B3TK 1VQLN 2HHHK 4B1WB 1XC3A 4LF5K 5LJVA 4FK0A 4MQ3A 1XWLA 4CGIA 1YJNN 1JLQA 2BH1A 3SAHA 4E7IA 3SK3A 1VQ7N 3ZSQA 4BR9A 3ZCMA 2QWQA 3IFRA 4KH6A 3EYZA 3QEIA 1EWQA 1JLFA 2HB5A 3OY9A 3EZWA 5CHIA 1OVQA 1RT4A 3U6FA 4G1QA 4BR5A 2VGNA 3V9ZA 4BR0A 4CJEA 2QWOA 5AFUA 1KAXA 4WQ5A 1JCFA 3VN5A 1QTMA 4CW7B 4GMJB 1BOTO 3O9TA 2ASPA 4BRNA 3F5TA 5FROA 3V9WA 1NK4A 3VQBA 4KH4A 2DFFA 5FPEA 3VA3A 3MX5A 3JAMO 3SJJA 4FJ7A 1VQ8N 1NG9A 3M8RA 1U49A 2D5RA 5AQUA 3O08A 3AVKA 3D0PA 3UB5A 3ZSRA 4CF2A 4CFBA 1BIZA 1QSSA 2ZQBA 3T1YK 4FWMA 3O4QA 3CJAA 4QAGA 3LM2A 4CEQA 4Z4IA 1IH7A 5C12A 4B3MK 5AZJA 1MU2A 5EXWA 5LY3A 2Z1GA 2DFEA 1Q18A 4NYFA 4FZXC 4CBXA 3NF9A 3I8DA 3HBTA 1TL1A 4K0KK 2ZF5O 1RDCA 4KB1A 3CERA 1W2BM 2Y1IA 5GINA 4OPJA 4BE2A 3SMPA 3OYEA 1Q81O 4ELVA 4IOAL 4CJTA 1HMVA 3OS0A 3O4WA 3K5MA 3EE9A 3HTVA 3O9UA 4AQYK 2HMIA 3DLBA 2GEMA 1E4GT 4O0JA 1BI4B 1TKTA 4FM1A 1MDUB 1HKCA 3ENBA 4O55A 4H0PA 4FM0A 1WSFA 5FRMA 3C94A 3MWTA 4BDYA 3CM6A 4LFCK 2BANA 1GLBG 2I5JA 1CXQA 4EAHD 5AQSA 4H0YB 4ISFA 5I3UA 3JSMA 3VQ8A 1TVRA 1GOCA 1BGXT 4JKEA 3PV8A 1NGJA 5EOYA 4B3OA 3QMLA 1E4FT 3VEWA 3P83D 3KLHA 3C65A 3CD6N 4M3ZA 2CGLA 2A5XA 4Z4FA 3LDOA 4A2AA 2Q31A 3I0SA 3AA3A 1SKRA 4Z94A 2F9WA 3AVMA 3DI6A 1IKXA 1RTDA 1WSJA 1NNEA 3T19A 3FZLA 3AVLA 3FGUA 1S1TA 4B9LA 1B92A 3SBGA 3KK3A 5BPMA 4EZ6A 1GLCG 2YHAA 3FZFA 3LM9A 3JS6A 2W42A 4WYBA 2HNYA 1RTIA 1ATSA 4JI1K 5AQFA 2YJFA 4DF8A 4BVPA 4FJIA 4JRPA 3GDQA 1GLAG 2Z1JA 3WXJA 1L3VA 1LW0A 3QO9A 1LAWA 1OH8A 4CJRA 5FPDA 4KAZA 1ZBSA 3L2UA 3V1RA 2ATQA 4IJNA 4YDUA 3ZT0A 2UUCK 3MXMA 4ICLA 2NRTA 4KTZA 3DLKA 5HRNA 4DQSA 3NH2A 5KTQA 4E3SA 2BTFA 4CGFA 3PO5A 3WNGA 3LP1A 5LJWA 4B9TA 4OJRA 5AQIA 4FK2A 3H3NO 5E26A 5AQYA 1NMDA 1YIJN 2HBLA 4CBWA 1NGEA 4XH5A 1YJWN 3C6HA 4FLTA 2J4RA 2HBMA 2NRXA 4I9LA 3P1GA 5GIPA 3UKUB 2W6KA 1ATRA 4EHTA 3TU5A 1JLAA 5KGXA 1XC9A 5C15A 1WSEA 4U7BA 5AQOA 3H46O 3ZSWA 2ZJPL 4HUGA 1E3MA 2G8HA 3DJCA 3KTQA 2KFNA 2X74A 3VQAA 3V81A 4EP4A 3NMUA 4IFEA 4HTLA 3HK2A 1ASVA 1VSHA 3SV3A 4FPBA 4OVLA 3UKUA 1NKEA 4FJXA 1BA0A 2CGKA 3NH1A 1S9GA 3P39A 3AA2A 1KVAA 5I9EB 5DM7L 3EE8A 4DR3K 3DLEA 2HVHA 4DS4A 1HYVA 4KHUA 4OGCA 4JRQA 4CE9A 4OKJA 1U48A 1QZ6A 4CJQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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