3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
b'ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
molecule tags Ribosome
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
1VQLN 1VQMN 3CCJN 4UY8O 3PIOL 3CCLN 3I55N 5JVHL 4WFNL 2QEXN 1K73O 4IOAL 1YITN 3CD6N 3DLLL 4WFBL 5DM6L 1ILYA 4WF9L 3CMEN 3G6EN 3G4SN 3CC7N 2ZJPL 3CC2N 2ZJQL 1KC8O 1VQ7N 1JJ2M 1OVYA 3OW2M 5GAEP 3CCRN 1QVFM 1VQ9N 3G71N 3I56N 5HL7L 3CCSN 1K8AO 1VQ4N 1YHQN 2OTJN 3CF5L 5MLCQ 1W2BM 1Q81O 4IOCL 5JVGL 1M90O 1YJ9N 3CPWM 1YJNN 3CCEN 1YIJN 3CCVN 3CMAN 4WFAL 1VQ5N 1YI2N 1N8RO 1NJIO 5GAGP 1VQKN 1KQSM 1VQNN 1VQ6N 1VQON 1Q7YO 2OTLN 5GADP 1QVGM 4IO9L 1YJWN 1Q86O 5H1SQ 3J7ZO 3CXCM 2QA4N 3CCUN 1K9MO 1S72N 2ZJRL 1VQPN 4WCEL 3PIPL 5GAHP 1VQ8N 1Q82O 3CCQN 4U67L 1KD1O 5DM7L 3CC4N 1M1KO 3CCMN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T3VA 2J4RA 4UY8O 3THXA 1NM1A 4CJ7A 3ITHA 3N4QA 3I55N 1J6ZA 1J53A 3RWUA 1RTJA 3KK1A 3ISNC 3L2UA 4CEAA 2ASPA 4A59A 3SMSA 2QWPA 4EZ9A 1NBWA 4ID5A 3ZYYX 3T1AA 4I7FA 3V9XA 3AVBA 3O80A 4CJKA 4PKIA 5FPEA 4AH9A 4FWRA 3SCXA 2Z1HA 3LZJA 3MECA 3QINA 3JXUA 1HYZA 5KGXA 1RT6A 4Z94A 3NH2A 1HX1A 2WONA 3TPQA 2G8UA 2ZGZA 3RSEB 3IMXA 3MCPA 4ELUA 2VGMA 1N34K 4CESA 1NOYA 1QQMA 4CD3A 1NKBA 4OJRA 1U47A 3D45A 3ATVA 2QWRA 3DI6A 3Q7CA 3T69A 4M41A 3RR8A 4Z4FA 4Z4CA 3D7EO 4JI2K 2Z1GA 4AHSA 3VEWA 3V1OA 3PX6A 1L3VA 4CF1A 3ALYA 4FZXC 2OPRA 3OHRA 1KQSM 1YUWA 3P38A 1VQNN 2OANA 4W5QA 4FLXA 1KSPA 1Q7YO 1A5VA 3M8SA 5C42A 3K59A 4MQ3A 4N47A 5H1SQ 3WXJA 3HZ6A 2IIRA 4CHZA 1RT7A 4GKJK 2DPNA 4CF9A 4PKGA 1J9AA 3GBTA 2VYPA 3P1GA 3OS2A 4B08A 4C1NI 4M3RA 1HPZA 3P31A 3R1XA 1BI4A 4JAXA 5CHIA 3CJ9A 4DR7K 4BDPA 4WQ5A 4B8CA 4FWQA 2AP1A 5AQJA 5AQPA 5GIOA 3TI0A 4MLEA 4CF2A 4A5AA 5AQXA 1FJGK 3D0PA 4JNEA 1OH6A 4QS9A 5AZJA 3OYNA 4A57A 3DLLL 3WNFA 1TKDA 3SQ1A 5E84A 2YNFA 4JK7A 3CC7N 1QZ5A 1WLJA 4KV8A 3L2RA 3LDSA 1TGOA 1Z26A 1GLCG 1UOCA 4DCHA 5KPTA 3VMFB 3BUZB 1JJ2M 4E7HA 2JGUA 2FF3B 3O5BA 4LF7K 3CQ8A 4JRPA 3G71N 3VGMA 3I56N 3QETA 2HHTA 3F9MA 3O08A 3EZ5A 5MLCQ 1SKWA 5AQHA 3ASMA 1YF5L 3MN7A 3EE8A 5CR4A 2PYJA 3HVTA 3TTCA 3TAMA 5JICA 4JKGA 2WTUA 2YCHA 3O1BA 5GAGP 5IT9O 4LF5K 3VQ9A 3EKSA 3ZSXA 1ZBIA 4CI6A 4BGAA 1KVAA 1X9WA 3PO5A 2RPIA 1IV0A 3CM5A 3T1YK 3L6QA 3QEIA 2PZSA 1W97L 4CJQA 4C8MA 1YAGA 3E9LA 4KKOA 4DTXA 1LAWA 3MN6A 4PY5A 1EETA 2E1YA 4DU1A 4CBWA 5KTQA 3PIPL 1D9DA 2Z1JA 5M1OA 4CZFA 4H0XB 1BA0A 4DR4K 4DV2K 3A5MC 3PIOL 3LALA 4BRDA 4IG3A 2QWQA 4R79A 3VN5A 1VK0A 4B3SK 4FJ7A 2PYLA 3OYHA 2QXFA 1I39A 5AQWA 4M7XA 1NWKA 2ZD1A 3ENHA 4O44A 2YNIA 3SK3A 4CHQA 1JLFA 4HHTA 5BPMA 4WYBA 2NRZA 4RWTA 3K58A 1LCUA 5LMNK 4HCBA 4CERA 1LW2A 1GLBG 3M3ZA 4NLCA 4CEQA 1WN7A 3C6TA 1IBMK 2ASOA 2BUPA 4QS7A 3V4IA 4IDKA 3NGZA 4I6MB 2HNYA 3DAWA 5AJ3K 1GLLO 5M1NA 4KH5A 4F3OA 1XC9A 3OYFA 1EQYA 5CZ1A 1B9FA 3A2FA 4C1NK 2VQEK 2KLAA 2A1SA 4TSXA 4CJTA 3ID6A 3VQEA 3OJUA 4C8OA 1JCEA 5HOOA 1FK9A 4YDUC 1S3XA 3HT3A 4GKKK 1IBLK 1XNQK 3LPTA 4CZIA 3ENBA 1TL1A 4CFBA 4CJPA 2OYQA 4OKEA 1V4TA 4CIEA 4E7JA 4ZTJA 3I33A 4CZJA 3UKRB 4M3ZA 3HSCA 1N5YA 3VQBA 5GIPA 3ZEUB 3BF1A 3HYFA 3IAYA 5C24A 1S1UA 4KPYA 4BVOA 4WQ4A 4O0IA 4NO7A 3VA3A 3CCUN 1RBRA 4CZEA 4DB3A 1NGEA 2RE2A 3U6FA 1ZBLA 4B3RK 3VQ5A 1NK7A 3F9KA 3VEVA 2GUIA 5KQDA 4OPHA 1Q82O 3CCQN 1KVBA 3OBWA 4DS5A 1X9MA 2D0OA 1NGGA 1HR0K 5JS2A 2IOCA 4DTNA 4E1MA 4FWKA 2Y1JA 2E88A 1Q9XA 3MXIA 3T19A 3CCMN 4JKFA 3PSIA 2ITMA 4YOTA 2D4WA 3IRXA 3AVJA 4B3TK 1HLUA 1BGXT 2B4JA 4HUEA 4DTMA 2UU9K 1LV5A 3MN5A 1ATSA 2E6MA 2F8TA 4X62K 4A61A 3THXB 2FXUA 5AQTA 4IWVA 5B8HA 3ZT1A 3ZT3A 2HBKA 1NGAA 3KVGA 4M3TA 4YOVA 3PX0A 4I9QA 3TSPA 4FZZA 1IG9A 4NYFA 3UE5A 5JMVA 2OZSA 4E19A 1YVUA 1RDDA 3AVMA 4H0TB 5AQZA 3FZKA 4FXDA 4CIGA 3FZLA 5C2FA 1BIUA 2X6NA 3AA4A 1QE1A 1KCFA 1RDAA 1VSKA 3DRSA 4DV5K 3IS9A 4JV5K 1DEJA 3PSFA 4RW4A 2Q1NA 2QXLA 3EZWA 1JXEA 4OLBA 1YJ9N 3V81A 2RN2A 2V51B 4FJJA 2IC3A 1VSHA 1HQEA 4CBUA 3CCVN 1JL1A 4JI6K 4X65K 1NGFA 3WXKA 2BTFA 4LH4A 4V19S 3WQTA 4KRFA 2ZE2A 4CIFA 1IKXA 3KK3A 3TTDA 1G15A 5K14A 2Y1IA 4ID1A 2VWKA 1VHXA 4CEOA 4CHYA 3QDKA 4N5SA 2O4IA 1IKWA 4BRCA 1J5EK 3SYZA 4PWDA 5I9EB 1NK9A 4WE1A 1NGBA 4X64K 2QK9A 5GAHP 5BR9A 2QKBA 3W0LA 1VQ8N 3L8BA 4FLTA 4JKBA 4BVPA 4OGEA 1OH5A 1XC3A 4FK2A 5F1XA 4OPKA 4Y0WA 1NJXA 3RTVA 1VSMA 4JI7K 4DLEA 3ZSRA 1A5XA 1EX4A 3AA3A 4EHTA 4GW6A 4CEFA 5AFUA 3OYEA 1E3MA 1K73O 4CZKA 3TR8A 1XMOK 2WBNA 3I0SA 4B1ZA 1FXXA 1O13A 4B1XB 3P4IA 5JS1A 4CEZA 1RDCA 3LZIA 5I3UA 4IBNA 4IDHA 5ELZA 1Z6RA 3AVKA 1ILYA 3SUQA 1P90A 3HPGA 3DMJA 2P9IA 3U3YA 4ISGA 5AQMA 3TAPA 5EX5A 1HJOA 3ZSZA 2ZJQL 1Q9YA 5AZJB 3ENOA 4JI0K 4AQYK 3TAEA 3G10A 3NVKA 1MWKA 4K41A 5SZTA 1C0UA 3CCRN 4FJXA 5AQLA 4CCHA 4DLGA 1EP4A 1EO1A 1VQ4N 2CGLA 2O8BA 1IG8A 2XY5A 3D2FA 5IWAK 1HQUA 4CJUA 4XIUA 1HNWK 1IKVA 2YJFA 3QNNA 4DQSA 2AA4A 3J8AA 4W5OA 1Q81O 3BDPA 2HMPA 1LWCA 3SUOA 4DR2K 3HOTA 4CK2A 4B9NA 1VRUA 4RCHA 1YIJN 3OYLA 3SJHA 5HROA 3D2EB 4BRQA 4DMNA 4BC4A 2IVOA 3LWMA 4FM0A 3R6MA 4JI1K 4WQ4C 1WSFA 3A5LC 3HM9A 2XHBA 1NGDA 2GX9A 4B1VA 1GOBA 4KI6A 3VQ8A 4C8LA 5LL6Z 4JKGB 2RHKA 3ZEUA 4RG8A 4BACA 3RRHA 1MU2A 4LSNA 3NCIA 4L8RB 1XUPO 2P5GA 4LY7A 3VGKA 4LC9B 3RVCA 2HHQA 4B1UB 3TWHA 4CGJA 1T7PA 3S3NA 4I9LA 1DKGD 4ELTA 1ATNA 3E9PA 1FW6A 1MA9B 2E2QA 3KD1E 4CGHA 1M1KO 3RMAA 3V1RA 2QWNA 4CZHA 4EHUA 2ZM6K 5C2DA 1VQMN 2G8FA 3CCLN 4CZLA 4AF1A 1NK4A 1TK0A 2UUBK 1WB9A 4WFNL 3S3MA 4FJ9A 4B3OA 1CZ9A 2QI2A 3HO1A 2XY6A 1GLEG 1KVCA 3S3OA 4LF8K 4E7KA 3VEXA 1SL0A 4NYNA 3CFRA 4ZTFA 2X6SA 2NUBA 3AA2A 5BN8A 1NGHA 3ULEB 1X9SA 2YHWA 1S1VA 3E66A 5EXWA 1BG3A 4AHCA 2YHYA 4CJVA 3NAEA 5HRNA 1SUQA 3LM2A 1JCFA 4DHYA 2EX3A 1X3NA 4M7YA 5E41A 5EVZA 4CHPA 3KKSA 4FPAA 3KK7A 4BRLA 2ASMA 2QW9A 3JSMA 1N8RO 4B8AB 4IFYA 3FZMA 3UB5A 3LP3A 3HJFA 1ZXOA 4B3MK 4IO9L 2P1JA 3SAHA 1TYQA 3AAQA 3J7YP 2G8HA 3CXCM 4JI8K 3EKUA 3HI0A 4MDBA 3PLAA 3WQUA 3QBWA 1ZC6A 4YDUA 3A5OC 4FM1A 4FJKA 3VEZA 3NE6A 4DFMA 1JLCA 2FBYA 4FJIA 1JLAA 5KPRA 1S6PA 1ZBUA 4F2RA 3THWA 4DV3K 1XI1A 1BQMA 2JWKA 4ICLA 1GLDG 4MFBA 2Q31A 1QSLA 4UQGA 2P9NA 1YT3A 3R8EA 1A5WA 3O9TA 1T6CA 3WUHA 4WFBL 1G99A 4NXMK 3BP8A 4FJNA 1RNHA 3IDHA 4E89A 5DM6L 3L2WA 4FLVA 1NG9A 2D5RA 4RW9A 1LWEA 3QEWA 1I3AA 3B6PA 2Q0UA 1ATRA 5BRHA 1D4XA 3CETA 4G1QA 4CFAA 5FPNA 3MX2A 3SZ2A 3AVNA 1RILA 3MN9A 5LJVA 4DF8A 4CJWA 1YVNA 2DY4A 2XRIA 3LAMA 1SS6A 3AVGA 4EP5A 3U8XA 3MCAB 4EAHD 3JYTA 1M90O 4CGFA 3CPWM 4BREA 2WC9A 2I5JA 3FE1A 1O1WA 2XO7A 3PX4A 5AQFA 2Q36A 1UAXA 3UKUA 1WNSA 4BWJA 1VQKN 2HF3A 2HBJA 2P9PB 3MX5A 3N4PA 2F7TA 4K42A 4KHYA 3MEDA 4DTRA 2HHUA 3D2EA 4XH1A 1OH8A 2E5LK 4N41A 4JN4A 3K5OA 4CW7B 3DOLA 3TTFA 4FPBA 3IUCA 3DM2A 1SL2A 3VQPA 4F2SA 4MO5A 3C6AA 5I42A 4ISFA 1GOCA 2H3GX 2Q97A 4BE0A 3OYJA 3TAQA 2VG6A 4AHVA 3VTIA 4JHDA 1NK0A 4QAGA 4H0VB 3M8PA 3VGLA 4J2DA 5AQIA 4CGDA 4DV4K 3VF6A 4M3UA 4KBOA 2FBVA 3SLCA 5KI6A 3OYGA 1EWRA 3RMDA 1MWMA 2KKZA 3HPHA 4RTFD 1Z25A 4YORA 1B9DA 3LAKA 3LDQA 3M6GA 4F9OA 1TAQA 1RT2A 3SPZA 3FZFA 5FROA 3E01A 1YITN 2BGGA 3T1HK 2E6LA 3ZETA 4W5RA 2ETJA 2WOMA 2FSJA 3NH1A 4FLZA 4PL8A 4CHOA 3KLFA 3QIPA 3V6DA 4KTZA 2W6LA 3O8MA 3O9QA 3NGIA 4IFEA 4BR9A 1HNVA 4BR4A 4JD2A 3WT0A 3QIOA 2E1ZA 3G25A 2O8CA 4LSLA 1VQ9N 2P9IB 3QEPA 2QKKA 5HL7L 4FJ8A 4HVJA 1L5UA 2V7ZA 4I2QA 1RTDA 5AQUA 1HNZK 1XMQK 4G9ZA 1L3UA 3CG7A 2O4GA 4KAZA 4YOWA 1TVRA 3H6EA 3ULEA 4Z4IA 2A40A 4BWMA 2NRTA 2ZWHA 4IJNA 4CF0A 5FPDA 4IOXA 4PL7A 1HNXK 4FJGA 3AO2A 3QFPA 5D3GA 2O8BB 4BY9C 1VQ5N 3D2FB 4OKJA 1NJIO 4K8XA 4CZMA 1RBTA 3K2PA 1KRPA 5LY3A 2WUSA 4CECA 3SMPA 1VQON 4KO0A 3C7NA 3QFUA 4KTWA 2GWKA 3OA9A 3S9HA 2VG7A 2UXDK 3LPUA 5AQNA 1QVGM 3V9UA 3F2KA 1VSFA 3O9UA 4GNIA 4HUGA 4GVMA 3V1QA 2A6AA 1VSJA 4LH5A 4FVMA 4I2PA 4IFVA 2QM1A 4H4OA 2QTDA 4WCEL 5AFUH 3L2QA 2GWJA 3QB0A 1WSEA 5FRNA 3CFPA 2G8IA 1WBDA 4GVEA 5FPMA 5DM7L 4IEEA 3S41A 3OYAA 2V52B 3AAPA 3OYMA 4FOIA 1C0FA 1RDBA 3H1QA 1OKJA 3TSUA 3R9PA 2YHAA 2FLOA 3NF9A 1TAUA 3AVHA 2QEXN 4NB4A 2HVIA 2KFNA 3BY5A 1K8KB 4M42A 4IOAL 2X78A 1WAJA 2KTQA 1NJYA 3EO3A 3LDNA 2P51A 1XHXA 3CD6N 4DQQA 3O4WA 2VWJA 1RDWX 1CZAN 1ASWA 1JLEA 5DK5A 3SBTA 1WAFA 2KW4A 1DGKN 4NCBA 3TSQA 1YXQA 3M8RA 3PV8A 3QESA 4GY2B 2GBZA 5J2NA 3F73A 3DXKA 4J2EA 4DV0K 4K8ZA 3DRPA 1UA1A 1L3TA 1KTQA 1P8ZA 3WNEA 3I0RA 4CFCA 2BDPA 4IXCA 4YY3K 4E3SA 3AY9A 2NZTA 1NK5A 2BE2A 3F5TA 5KPZA 3WXMB 5JLFA 2AJQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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 1VQL N;  1VQM N;  3CCJ N;  4UY8 O;  3PIO L;  3CCL N;  3I55 N;  5JVH L;  4WFN L;  2QEX N;  1K73 O;  4IOA L;  1YIT N;  3CD6 N;  3DLL L;  4WFB L;  5DM6 L;  1ILY A;  4WF9 L;  3CME N;  3G6E N;  3G4S N;  3CC7 N;  2ZJP L;  3CC2 N;  2ZJQ L;  1KC8 O;  1VQ7 N;  1JJ2 M;  1OVY A;  3OW2 M;  5GAE P;  3CCR N;  1QVF M;  1VQ9 N;  3G71 N;  3I56 N;  5HL7 L;  3CCS N;  1K8A O;  1VQ4 N;  1YHQ N;  2OTJ N;  3CF5 L;  5MLC Q;  1W2B M;  1Q81 O;  4IOC L;  5JVG L;  1M90 O;  1YJ9 N;  3CPW M;  1YJN N;  3CCE N;  1YIJ N;  3CCV N;  3CMA N;  4WFA L;  1VQ5 N;  1YI2 N;  1N8R O;  1NJI O;  5GAG P;  1VQK N;  1KQS M;  1VQN N;  1VQ6 N;  1VQO N;  1Q7Y O;  2OTL N;  5GAD P;  1QVG M;  4IO9 L;  1YJW N;  1Q86 O;  5H1S Q;  3J7Z O;  3CXC M;  2QA4 N;  3CCU N;  1K9M O;  1S72 N;  2ZJR L;  1VQP N;  4WCE L;  3PIP L;  5GAH P;  1VQ8 N;  1Q82 O;  3CCQ N;  4U67 L;  1KD1 O;  5DM7 L;  3CC4 N;  1M1K O;  3CCM N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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