3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
1K8AO 1Q86O 4WF9L 5JVGL 1NJIO 1JJ2M 3CC7N 3CMEN 1KQSM 1VQ8N 1K73O 1VQON 2QEXN 4IO9L 1VQNN 3CMAN 1M1KO 1QVGM 1KD1O 3CCJN 1YJNN 1Q7YO 3CCEN 4WFNL 5GAEP 3PIOL 5GAGP 5MLCQ 3G4SN 3CD6N 1VQ9N 3CCSN 1VQ6N 3CPWM 3I56N 1Q82O 5DM7L 3CF5L 3CCRN 1ILYA 1VQKN 4UY8O 3CCVN 4WFAL 1KC8O 3OW2M 2OTLN 5DM6L 3G6EN 3CXCM 1YJ9N 3CCMN 1K9MO 3CC4N 5JVHL 1YIJN 3DLLL 4WCEL 3CCUN 1YJWN 2OTJN 3CCQN 1VQLN 5HL7L 3G71N 3J7ZO 1S72N 4IOAL 2ZJRL 4IOCL 3CC2N 5GAHP 2QA4N 2ZJPL 1W2BM 5H1SQ 1Q81O 1VQ7N 1YI2N 3PIPL 1M90O 1VQPN 1VQ4N 1QVFM 1N8RO 1VQMN 1YHQN 3CCLN 2ZJQL 4U67L 4WFBL 3I55N 1YITN 1OVYA 1VQ5N 5GADP
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QO9A 3ENBA 3ENOA 2OPQA 1NGBA 1FXXA 2I7NA 1RTIA 3MCAB 2F8SA 5AQNA 5HRNA 3LAMA 3SQ1A 4B8AB 3EZWA 4X65K 4CZMA 3FZHA 4JD2B 2QKKA 2GBZA 2KQ2A 5GINA 4IFYA 5E84A 4J2EA 3CPEA 3H3NO 4YOYA 4BGBA 1DT9A 1MDUB 5F0XA 5I9EB 3L2VA 2YI1A 2JWLA 2V51B 4RW7A 4DFMA 4BC3A 4ZTFA 3CFPA 2HSTA 4B9QA 3H3OB 3SV3A 4OPJA 4PUOA 1NK0A 2UXDK 4DV0K 1HKGA 2HOEA 4MO4A 4FWKA 1KAXA 1Q82O 2ASOA 5FROA 4RG8A 3QFPA 2FF6A 4DR4K 1T6DA 1HNVA 5AQTA 1JLCA 4DR7K 4CF9A 1WOQA 1YVNA 4C1NI 4WFAL 4G9ZA 5T7BA 1Z6RA 4B8CA 4DKWA 3C6HA 2NRZA 4JKGB 4CZHA 1VSHA 4PL7A 3CCMN 5JLHA 2KZZA 3THYB 1KFDA 3VGMA 1N5YA 4LSNA 4H0VB 5M1KA 1BOTO 1YJWN 3CCQN 4W5QA 1FJGK 3HTVA 4JAXA 1VQLN 4B9VA 3CJ1A 4LFBK 4CGIA 3C94A 4C8LA 3TU5A 4NCBA 2YX6A 3VQAA 2PZSA 2Q97A 1W2BM 5H1SQ 5ELZA 1E4GT 3VPZA 4E0DA 1BGXT 4CEDA 4KB1A 2XRIA 1NMDA 3AVBA 1QVFM 1RBRA 2KFZA 4JI7K 4FOEA 4PL8A 3OYIA 3IAYA 2OPSA 3LDQA 4CJKA 3ZLJA 1LCUA 1Q86O 4E7JA 4ELVA 3AVLA 3QINA 3VEXA 3CQXA 1TAQA 3C0BA 4EP5A 4K42A 1J53A 2VWKA 2ZGYA 4YOVA 3MN5A 3VEYA 1S1UA 4IFEA 4HUFA 3KK3A 4DLEA 5TKWA 2J4RA 2GELA 1QHTA 2PBDA 4KREA 4IG3A 3HI0A 4BRAA 4Y1DA 1IBLK 3PIOL 3M8QA 4DV2K 1QTMA 1I94K 4A2BA 4FLVA 1S6QA 1X9SA 3RVCA 1JLQA 3CFRA 3VQCA 3E9PA 1LW0A 4O4GA 1QS4A 3SAHA 3FZMA 3H46O 4OLBA 4CGGA 1E4FT 4B1VA 1X3NA 5SWMA 3K2PA 1J54A 3MDQA 1G99A 3G0ZA 5AQHA 5BN9A 2YNGA 4FJMA 3VA0A 2FBTA 4MLEA 1CZBA 1NKCA 4PKIA 1JLEA 2O8CA 1HLUA 4CF2A 1LAWA 3A5LC 4CCHA 4DSIA 4CEBA 4L8RB 3QICA 4EFHA 3DRPA 4OLAA 2P9PA 1UOCA 3KTQA 1RBTA 3T7ZA 1Q9XA 2NRWA 4BG8A 4U7BA 3SJJA 3HPHA 3IDHA 5C2FA 3TTDA 4CEQA 4DR1K 4K25A 4KH5A 3QBXA 4KB0A 4NCAA 4GKJK 4NB4A 4DSFA 3S9HA 4DLGA 3DAWA 4FJGA 3QBWA 4W5TA 4JRQA 2YHAA 4YORA 4FJLA 3NF7A 3EKUA 2GUIA 1QSLA 1ASUA 4FZYA 1SAZA 1IV0A 4Y0WA 5KQDA 3THWB 4LH5A 3HOTA 1IO2A 3WNFA 4LSLA 2HW3A 2WC9A 3SJHA 2ATQA 4C8KA 3B6OA 3H45C 3FGUA 1IG8A 2QK9A 3ZSRA 4CEEA 4Z94A 4OKJA 5JLFA 2QWOA 3ZSYA 1YTAA 3SK3A 4BACA 2DTUA 2YNHA 1UWBA 3OYFA 1RTJA 3QIOA 1OKJA 4DU4A 4CHPA 1BA1A 5FPEA 4Q5VA 4KI4A 3S3OA 3AAQA 4IXCA 1IBMK 4J2BA 1KCFA 1VHXA 2LSNA 3DLRA 1LWEA 1WN7A 5KPRA 4IBNA 5FRNA 1ZBHA 4CERA 5HOOA 3CHWA 4E89A 2E6LA 3E01A 1NG9A 4OPHA 4RCHA 5DMRA 4JI3K 2X78A 1C1BA 2QWMA 3TABA 2VGNA 1RT4A 1S6PA 3AVFA 3SPYA 4B08A 4CHNA 4JI6K 4OO1J 2BUPA 4Z4FA 4NYFA 4CK3A 4BRHA 3TAPA 5AQFA 4C8MA 2AJQA 1T8EA 4HCCA 1K9MO 5KGXA 3SNNA 5FLXO 5DK5A 2VGMA 1VSIA 2RF2A 4CJ3A 1IKWA 3GE1A 4B1UB 3QEWA 4DTPA 1NBWA 1A5WA 5AQXA 3ID8A 3CJ7A 1NM1A 1TK8A 1SKWA 4BE2A 3E9OA 1TKDA 4B3TK 2KW4A 1BG3A 3CC2N 4DR5K 4KHPK 2OZMA 3DOLA 4BR4A 2BTFA 1NK9A 4EZ6A 5CYMA 2B6AA 3DYAA 5HLFA 4BRLA 1EETA 4JS5A 1VQ4N 4E7IA 4ZHRA 1GLAG 3AVIA 2P9KA 3THXB 1N6QA 5BR9A 2HNZA 5CR4A 3MX2A 1BISA 4DTXA 4CZKA 3L4IA 4PWDA 4BRGA 4WFBL 3SUOA 3AO2A 4O5FA 3ZX3A 3OHRA 1BQNA 3CC7N 1W97L 3THXA 3DXKA 1WNSA 2W41A 3H6EA 2O8FA 4EHTA 3AO3A 4H03B 4YDUC 2F96A 4HTLA 1RT2A 1GLLO 2Q1NA 3SQ2A 4BRMA 1HKCA 5I3UA 2QI2A 1YJNN 3THVA 4FLXA 2W6LA 4YNQA 2D0PA 4CJVA 1UAXA 3G4SN 3VQEA 4CZLA 1VRTA 3N4PA 4L3QA 4JKBA 4JK9A 5A2QO 1KTQA 1TV6A 2FBVA 3JXUA 3UE5A 4B9SA 3WXMB 1DTQA 3DI6A 1C6VA 4PY5A 3KJVA 2E2OA 4KO0A 2A1SA 3KHYA 3M1FA 4NYNA 5JMVA 4JKEA 3EO3A 2HHUA 1JCGA 4FWMA 1SQKA 1TL3A 1VSLA 1XHXA 2QTDA 2P9UB 4LF5K 1BI4A 1S1TA 3MK6A 4GY2B 4MQ3A 3NHGA 4DUZK 3NGYA 3OBWA 3AAPA 1YJ9N 3KKRA 2KKZA 4KHSA 2Z1HA 3MAQA 2YV0X 4JKAA 3CQYA 4RW4A 3F2KA 1HYSA 3RSEA 2F9TA 3PSFA 4WCEL 3CCUN 2P9SA 4LY7A 3VF6A 3O8MA 5FPNA 3G71N 1HR0K 3THYA 3KKSA 1LWFA 5AZJB 1U47A 1S9EA 4FLZA 2RE2A 4DTJA 3GG4A 2QA4N 4O0JA 4FJNA 2D0CA 1VQPN 1B9DA 3MX5A 2GWKA 1NJWA 2VG7A 4B1WB 1K6YA 2GWJA 1NGGA 3PO4A 2I7PA 3DXMA 1U6ZA 4DV6K 1U49A 1W0HA 3CMEN 5M1FA 2RN2A 5HBMA 3NCIA 4FVUA 5AQWA 3V4IA 4F3TA 1ZXOA 5HRSA 1W9HA 4B9TA 3IS9A 1QVGM 4W5RA 2IVPA 3BF3A 4DSKA 4LFAK 3EKSA 5AQIA 1C1AA 3NF8A 3AA3A 3CCEN 1LV5A 1XNQK 2QWLA 5GAGP 4IDKA 2HF4A 1SZ2A 2KFNA 1ZBSA 3QMLA 1U45A 1NJXA 4DU3A 4GV3A 5HRPA 2BDPA 4E7LA 2OYQA 5AJ3K 2YKNA 1KXPA 3DLKA 2A42A 3SQ4A 4IDHA 3OS1A 1V4TA 4KH6A 5AFUA 1TK0A 3T1AA 3ALYA 3HBTA 3O4WA 1GLFO 1T6CA 2D4WA 3CYMA 2IIRA 2E4LA 4HUGA 1WAFA 4DR2K 2CH5A 2W6KA 3T1HK 3TPQA 3G10A 4FK4A 3J7AP 3CJCA 1VSFA 4BGAA 5JVHL 3AO4A 2DFHA 1JLFA 4DSLA 3CJ9A 1U04A 4CHQA 3DMJA 1TYQA 3O1WA 3TSPA 4BG9A 2KLAA 3O3FA 4FZXC 1HYZA 4K0KK 3IUCA 4DFPA 3CG7A 2FC0A 1K8KB 3J7ZO 1RDDA 3NH2A 4JKGA 2P9PB 4IOCL 3NFAA 5GAHP 3KD1E 4KHYA 4JHDA 4AQYK 1L3UA 1FW6A 4EP4A 5AQZA 3VOVA 4MDAA 1D8YA 3CETA 2JWKA 1RBVA 4CJEA 3D6RA 4AILC 1N33K 4JLHA 2A5XA 1NMNA 3S3MA 2BH1A 4ILGB 1YUWA 4CJ7A 3LP0A 1HMVA 3QNOA 1KRPA 1OVYA 2OPPA 1VSJA 4FSVA 1ATSA 3V1OA 1RDUA 4H4OA 2Q2RA 4KTZA 2NRHA 3KLEA 1L3TA 4Z4EA 3PSIA 3BP8A 1X3MA 4K41A 2G8HA 4LF9K 1JKHA 1VQNN 3VF2A 3OYBA 3QESA 3O80A 1TKTA 1YAGA 1JL2A 4RW6A 4M45A 4OX9K 3K58A 4N41A 3KVGA 1QSYA 1OH6A 2P5GA 1EO1A 1CZAN 4BWMA 1NGIA 1E3MA 2EHGA 2PAVA 1RT7A 3OYAA 2IVNA 4DQPA 4W5NA 2A6AA 1U2VB 3OYLA 5EX5A 4CZFA 3HM9A 3EZ5A 4Z0UA 1U4BA 4DV4K 2ZQBA 3DWLA 3LM9A 4DTSA 4E7HA 2X6SA 4CZIA 4BQZA 2EX3A 3MWPA 2QWPA 3K5NA 2UUCK 4CBXA 4H5RA 5EVZA 1S22A 4FWRA 2DFFA 5AZIB 3T1YK 5C12A 3ZT2A 3DLHA 1BUPA 4DR6K 3V1RA 3VQ8A 3W0LA 2HHTA 2NRTA 2Q36A 1ITGA 4J8FA 3ZX0A 2H3GX 3O9QA 4LC9B 4BDYA 2EWSA 4CVNE 3HSCA 4CJSA 3FZLA 4WQ5C 4FYDA 3ZX2A 3MXMA 2XY8A 4CGJA 1QQMA 4KTQA 1S72N 1RDAA 3LWLA 4IOAL 3T3FA 1NGAA 2VQEK 2OZSA 4IOXA 4CFCA 3O4QA 2DFEA 2QWNA 3AVHA 4FLYA 1NU0A 4CBUA 4ILHA 4BR5A 4JK8A 1HNWK 3ZSWA 3NH1A 1C0MA 3KIOA 1GLEG 1RILA 1Q18A 4I6MA 1JCEA 3S41A 4W5OA 1SKRA 4GKKK 1QQNA 3ZETB 2ZWHA 3IKMA 3W3DA 3V6DA 4BR9A 4CF1A 1RBSA 3R1XA 4QS7A 2E1YA 3WXKA 3QEVA 1XC3A 4BC2A 3EYZA 3F9KA 3D2EB 2O4GA 4H5TA 3EY1A 4DQIA 4FM2A 2ZE2A 4H0PA 1C0GA 4E7KA 2WUSA 4H0TB 3KLFA 5HRRA 4CZGA 1NGHA 4PHTX 3ISNC 2DY4A 2P9IB 3E66A 4JK7A 1EP4A 4B9LA 4OGCA 5ADXA 5LMUK 1XWLA 3CF5L 1QQCA 4HHTA 3JYTA 4H0OA 5AQRA 3C6UA 3HO1A 1EX4A 4JEPA 4CD1A 3RMDA 4M42A 1T03A 5E26A 1ESVA 3SPZA 3NE6A 2Z1IA 2ZM6K 1TYQB 3LDPA 2ZGZA 3UKUB 4ELUA 1JLGA 3DRSA 1WB9A 2ITGA 2DPNA 3TSQA 3QEIA 4CJFA 1BA0A 5EU7A 4H4MA 5AZIA 3CC4N 3MEGA 4F3OA 2HVIA 2QW9A 4B1XB 4V19S 5CYQA 2OTJN 5AR0A 4NO7A 4FCYA 1NOYA 2CGJA 3CM6A 3O9TA 3MN6A 4QAGA 3K9KA 1KAZA 1X1PA 4CIGA 4J2DA 1IKXA 2P9UA 5KGWA 2P9LA 3V9UA 1CXUA 4TSXA 4Z4HA 4DV5K 2ZJRL 3VQ6A 4BRCA 3J8AA 3U9ZA 1L3SA 3VGKA 2ZJPL 3AA4A 1Y97A 1ZBUA 4NCGA 4JRPA 5BR8K 2VYPA 4JD2A 3AA5X 3CCLN 2A40A 3O5BA 3ATUA 5BPNA 3NGZA 2YNIA 1JCFA 1VSDA 2Q31A 1NGJA 4EHUA 4R79A 5M1QA 4JI5K 3NVKA 1ATRA 2X6NA 4K8XA 3HRGA 5M1PA 2E8AA 2G8FA 2ETJA 4BR7A 2CH6A 2VQFK 3CCJN 4DQ8A 4FWOA 1NJZA 4GVEA 3TI0A 5GAEP 3VEVA 3I8BA 4DTUA 3MXIA 2YHWA 1ATNA 3J80O 3HT3A 2WFBA 3GBTA 3HXMA 4DTNA 4E3SA 2UUBK 1RBUA 4LD0A 2E88A 3P5JA 3JSMA 3ZT1A 1TVRA 5CHIA 4FM0A 1ILYA 3AY9A 5AQJA 2A3ZA 4BE0A 3BZCA 2F4VK 4CD3A 2ASMA 1V4SA 2D1KA 1J9AA 3SV4A 1TL1A 4YOWA 4BRKA 3CFOA 2NZTA 4MDBA 3NF9A 3D7EO 4AHVA 2YKMA 4KH4A 3K5LA 4BY9C 3NH0A 4DFKA 1IH7A 5KTQA 4GV6A 2YCHA 1FK9A 4RW8A 4CJTA 4B1ZA 1RT1A 3MECA 5C10A 3DLLL 1MWKA 3VQ5A 3KLIA 3OBYA 3C6TA 1NOZA 4OGEA 4RW9A 4M3RA 3I8DA 3VENA 4FW2A 4M3YA 3U3YA 4ISFA 3OJUA 4CJPA 2P5OA 3VEWA 4FZZA 4IJNA 1EWQA 3UIQA 3ZETA 5J2NA 1GOCA 3L2UA 4FLWA 1A5XA 2XY5A 3U4LA 4ID5A 3LM2A 3O08A 3LANA 2F9WA 3VQPA 4ISGA 3NDKA 1WSHA 3ULEB 3ULDA 2G8IA 1DTTA 4BC4A 1BL3A 5AFUH 1BWFO 4H5WA 3HOSA 4CI6A 2G8VA 2I5JA 2W40A 4WF9L 1OH5A 3ID6A 4C23A 2E20A 3EEQA 4FJHA 2VG5A 2R7YA 4X66K 3CM5A 2D0BA 4HCBA 1XC9A 1WBBA 3CI5A 3LL3A 1H1VA 4WE1A 2P9IA 4C1NK 3F9MA 2E2PA 3V9WA 5KPTA 1HPMA 3CERA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1K8A O;  1Q86 O;  4WF9 L;  5JVG L;  1NJI O;  1JJ2 M;  3CC7 N;  3CME N;  1KQS M;  1VQ8 N;  1K73 O;  1VQO N;  2QEX N;  4IO9 L;  1VQN N;  3CMA N;  1M1K O;  1QVG M;  1KD1 O;  3CCJ N;  1YJN N;  1Q7Y O;  3CCE N;  4WFN L;  5GAE P;  3PIO L;  5GAG P;  5MLC Q;  3G4S N;  3CD6 N;  1VQ9 N;  3CCS N;  1VQ6 N;  3CPW M;  3I56 N;  1Q82 O;  5DM7 L;  3CF5 L;  3CCR N;  1ILY A;  1VQK N;  4UY8 O;  3CCV N;  4WFA L;  1KC8 O;  3OW2 M;  2OTL N;  5DM6 L;  3G6E N;  3CXC M;  1YJ9 N;  3CCM N;  1K9M O;  3CC4 N;  5JVH L;  1YIJ N;  3DLL L;  4WCE L;  3CCU N;  1YJW N;  2OTJ N;  3CCQ N;  1VQL N;  5HL7 L;  3G71 N;  3J7Z O;  1S72 N;  4IOA L;  2ZJR L;  4IOC L;  3CC2 N;  5GAH P;  2QA4 N;  2ZJP L;  1W2B M;  5H1S Q;  1Q81 O;  1VQ7 N;  1YI2 N;  3PIP L;  1M90 O;  1VQP N;  1VQ4 N;  1QVF M;  1N8R O;  1VQM N;  1YHQ N;  3CCL N;  2ZJQ L;  4U67 L;  4WFB L;  3I55 N;  1YIT N;  1OVY A;  1VQ5 N;  5GAD P; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QO9 A;  3ENB A;  3ENO A;  2OPQ A;  1NGB A;  1FXX A;  2I7N A;  1RTI A;  3MCA B;  2F8S A;  5AQN A;  5HRN A;  3LAM A;  3SQ1 A;  4B8A B;  3EZW A;  4X65 K;  4CZM A;  3FZH A;  4JD2 B;  2QKK A;  2GBZ A;  2KQ2 A;  5GIN A;  4IFY A;  5E84 A;  4J2E A;  3CPE A;  3H3N O;  4YOY A;  4BGB A;  1DT9 A;  1MDU B;  5F0X A;  5I9E B;  3L2V A;  2YI1 A;  2JWL A;  2V51 B;  4RW7 A;  4DFM A;  4BC3 A;  4ZTF A;  3CFP A;  2HST A;  4B9Q A;  3H3O B;  3SV3 A;  4OPJ A;  4PUO A;  1NK0 A;  2UXD K;  4DV0 K;  1HKG A;  2HOE A;  4MO4 A;  4FWK A;  1KAX A;  1Q82 O;  2ASO A;  5FRO A;  4RG8 A;  3QFP A;  2FF6 A;  4DR4 K;  1T6D A;  1HNV A;  5AQT A;  1JLC A;  4DR7 K;  4CF9 A;  1WOQ A;  1YVN A;  4C1N I;  4WFA L;  4G9Z A;  5T7B A;  1Z6R A;  4B8C A;  4DKW A;  3C6H A;  2NRZ A;  4JKG B;  4CZH A;  1VSH A;  4PL7 A;  3CCM N;  5JLH A;  2KZZ A;  3THY B;  1KFD A;  3VGM A;  1N5Y A;  4LSN A;  4H0V B;  5M1K A;  1BOT O;  1YJW N;  3CCQ N;  4W5Q A;  1FJG K;  3HTV A;  4JAX A;  1VQL N;  4B9V A;  3CJ1 A;  4LFB K;  4CGI A;  3C94 A;  4C8L A;  3TU5 A;  4NCB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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