3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
4WFAL 3CF5L 1VQMN 3CC4N 3PIOL 2QEXN 3PIPL 1YI2N 4U67L 3CCUN 2ZJPL 1Q81O 5MLCQ 2OTJN 1VQ9N 5HL7L 4IOCL 3CXCM 1M1KO 3CCLN 3G4SN 1K73O 2ZJRL 3CCJN 5GAEP 3I56N 4IOAL 3CC7N 5GADP 3OW2M 5GAHP 4UY8O 1VQNN 1N8RO 1KD1O 3J7ZO 5DM7L 1JJ2M 1VQPN 1Q7YO 1KC8O 1W2BM 5H1SQ 1YJ9N 1VQ6N 1K9MO 1QVGM 1KQSM 1VQ5N 3CCVN 4WF9L 2QA4N 1Q86O 3CPWM 1VQ8N 1Q82O 3CCMN 3CC2N 1VQON 1OVYA 5JVGL 1QVFM 3CMAN 1VQLN 1VQKN 3CCQN 4IO9L 4WFNL 3CCSN 1M90O 3CCRN 1VQ4N 4WFBL 1VQ7N 3CMEN 3G71N 3G6EN 3CCEN 3I55N 5DM6L 1ILYA 1NJIO 1YITN 5JVHL 2ZJQL 2OTLN 1YJNN 1YHQN 1K8AO 3CD6N 1YIJN 1YJWN 5GAGP 1S72N 4WCEL 3DLLL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RPIA 4WFAL 2KZZA 1V4SA 3GBTA 2HNDA 2GWKA 4LH4A 1TK5A 2QEXN 3TAQA 2PBDA 3VA0A 1TKXA 3TSQA 4FM2A 5J2NA 2HVIA 2ZJPL 5E26A 5BR9A 3WEEA 3LP3A 1Y97A 2ZJRL 4IDKA 3MXIA 3A8YA 1ASVA 3I56N 3QIOA 2IOCA 3ZX2A 1WNSA 3AY9A 3KLEA 4E89A 3L6QA 4O44A 3HPOA 4IFVA 1U49A 4GV9A 5A2QO 1WUAA 4DS5A 3V6DA 3H3OB 4NXNK 1IKWA 5M1QA 4ILJA 3D6RA 1QVGM 3KLFA 4ELVA 2FBVA 3J80O 2G8VA 2KHOA 4CHQA 1HRHA 1JCEA 1GLCG 1KRPA 1BOTO 1UAXA 1EX4A 3FGUA 1XC9A 1BIUA 1VK0A 4HCBA 4NXMK 2ZE2A 2EWSA 4BR9A 2FBYA 1WAJA 4BREA 4DQPA 2B4JA 4Z4FA 4G1QA 1Z6RA 3VESA 4RG8A 5I9EB 1L3TA 2XRIA 4MLHA 3EZ5A 3AO3A 3CMEN 1XQSC 4FYDA 4JKGB 3SQ1A 3CI5A 3DRSA 4EP4A 1ILYA 1S6PA 1S1VA 2A3ZA 1NKCA 3ALYA 5M1NA 4IEIA 3T1HK 4EP5A 3KK7A 3HOTA 5TKWA 3V9WA 5AZJB 2E20A 4DUZK 5C0YA 4WCEL 1ZBHA 4K42A 1DGKN 2NLXA 3QO9A 4DF8A 1Q9XA 2YNIA 4CGHA 4LFBK 3CF5L 4FJNA 3L3UA 1HNZK 2Q0RA 4KBOA 5BN8A 1F21A 3CCUN 2F7TA 4BRIA 1VQ9N 2Z1IA 4E1JA 1RTIA 2HOEA 3WXIA 1SKSA 4KV8A 1SL2A 5AR0A 4CBUA 4OO1J 1N32K 3OYNA 4CFCA 4A61A 5EY4A 3R6MA 2P9LB 1GLAG 4JK8A 5FPMA 4F2SA 3S41A 3T1YK 3TPQA 4Y1CA 4IDHA 3HOSA 3OBYA 3K5OA 4CZLA 4KHPK 4JKGA 2DFHA 3QFUA 4I7FA 1Q7YO 3WNEA 5LY3A 1D9FA 2OZSA 3AVHA 3O9UA 3TAEA 1EETA 1K9MO 5AQYA 4ISEA 3KWGA 1C0UA 3K9JA 2H3GX 3VQ7A 5AQWA 3VOVA 2QA4N 1S1WA 3QLHA 5BRHA 2VYPA 1QZ6A 2Y1IA 5AZJA 4FWMA 3NE6A 3C65A 4ELUA 3SV3A 1ZBSA 1GLLO 2E88A 4BGBA 3NGZA 4NYFA 4DR5K 4FK2A 3O6WA 1W9HA 4N41A 2HBLA 2YHWA 5BRDA 4EZ9A 5BN9A 2NRTA 3DAWA 4CFAA 4PL7A 2HMPA 4CGJA 3NGIA 5D3GA 4OPJA 4DB3A 1VSMA 1BL3A 2ETJA 1C1AA 3ID8A 4M42A 4FVMA 3G25A 1VSEA 2E2OA 4FWNA 1TL3A 3SI6A 3U9DA 3ZSQA 2KFZA 1OH7A 1YIJN 3PX0A 2UXBK 5F2RA 3CJ1A 2Z1GA 3IFRA 2X6NA 4J2AA 1T6DA 3TR8A 2YCHA 3ZSOA 5AQVA 3EY1A 1GLJO 2HSTA 2KQ2A 3AVGA 3LP1A 4OGCA 4DV1K 4GV6A 2WFBA 4DR2K 2F4VK 3IRXA 1RT2A 4DFMA 3S3OA 3VQEA 4KI4A 5J2MA 1BWFO 4DTMA 3O4WA 1YAGA 3E9LA 3DOKA 2W42A 3R1XA 4F4KA 5CY4A 3ZSRA 2ASMA 1T3VA 2ASOA 1OKJA 4IFYA 4BE2A 4CF1A 3H1VX 2V52B 2Q1NA 3CFOA 2E2QA 3L4IA 2HHVA 1N8RO 3QDKA 3NAEA 4A5AA 3I33A 2CH6A 2QWQA 3M3ZA 3WQUA 4M41A 4DTOA 4JI0K 1TK8A 2UUAK 3AO2A 3OJUA 4CJVA 3NHGA 4FWSA 3W0LA 2Y1JA 4WF9L 1KFSA 4XH1A 2FBTA 3M8QA 4C8NA 2BTFA 4B3OA 3PV8A 3LAKA 2Q97A 3U3YA 2KZMA 5BPNA 3ZT4A 4JK7A 5AQSA 3HT3A 5JICA 4YDUC 4LF9K 1RBUA 4FJ8A 1HKGA 1EWRA 3K9KA 1KXPA 1NOZA 4CE9A 3KVGA 4I2QA 4KB1A 1G99A 5AQIA 2Q0UA 3MK6A 3V9SA 2BH1A 4PA1A 4BGAA 4DV7K 4NB4A 1B92A 4L8RB 3EEQA 4EZ6A 4WQ5C 4DTSA 4PQUA 3I0RA 2JWKA 3V1OA 5AQZA 1IG8A 2XY8A 4CK3A 2P9SA 3FE1A 4GVEA 4CIGA 4YNQA 1BISA 1YJWN 2FF3B 2ZM6K 3OYGA 2UYTA 1Z26A 2OPPA 1ITGA 3K5NA 1E3MA 5K14A 3S3MA 4H5VA 1C0MA 3QMLA 4PKIA 4DTXA 4DV2K 2VQFK 1D4XA 3AVAA 1HMVA 1UA0A 2PYJA 4GW6A 2JWLA 3PIPL 4I2PA 1OH8A 2QW9A 4KO0A 4JRPA 3VQ6A 3T69A 4DR1K 3LWLA 3FZMA 1IBKK 4FJHA 5AQHA 4B1ZA 2BDPA 4O8KA 4FJIA 3AVFA 4J8FA 5KGWA 3EE8A 1TK0A 3LM9A 4JYAK 3AA2A 4ISGA 4N56A 4BRNA 3OYBA 4ZHRA 1HYZA 3OY9A 5FRMA 2AA4A 1SV5A 4C8OA 4LF8K 1UWBA 4JKAA 3NF6A 3VTHA 4LH5A 4BDYA 5SZTA 1FK9A 3WXJA 3DRRA 5LJVA 3MECA 4K8XA 5CZ1A 3K5MA 1TV6A 4CEQA 2F8SA 3CJ9A 4EHUA 3AAQA 4H0YB 3D7EO 4B8AB 2E2PA 1T03A 4N5SA 4KH4A 4C23A 1U2VB 3VEOA 2P9IB 1D5AA 3L0QA 2KTQA 3KD5E 3AVBA 1RT5A 3BUZB 3VQQA 1RTDA 3H6EA 3AA5X 4C8KA 4CERA 2FC0A 4E1MA 3K57A 3PLAA 5SWMA 5HROA 3IG1A 4K0KK 3OTOK 3O3FA 3F5TA 5KPTA 3CCRN 5J2QA 4B1UB 3AVLA 4FWLA 3CCEN 3O4NA 1WB9A 4O5FA 4RTFD 1TYQA 4FJGA 1NJIO 1WSEA 2GEMA 3J81O 4AHUA 4BQZA 4JV5K 3K2PA 2E1YA 4EAHD 3CIPA 3HM8A 1J6ZA 3UKRA 1S9EA 1XI1A 4FM0A 3BEXA 3MAQA 3HJFA 4E7JA 1K8KB 4JD2A 1U4BA 4JI7K 2Q2RA 4IBNA 5ADXH 3VA3A 2P5GA 4CZJA 3HSTB 1YTAA 2GV9A 1DKGD 1U2VA 4BC4A 1NU0A 5FDLA 1FW6A 4FVUA 4U67L 3VQ8A 4KPYA 3SNNA 4CJUA 1XC3A 2NRZA 5IWAK 3B6OA 3BF1A 1NKBA 1HLUA 4CW7B 4JKCA 4ILHA 4FJMA 3CHWA 3VPZA 3RRGA 2QI2A 3VERA 1NWKA 1T8EA 4DSEA 3VQBA 3SMPA 4H4OA 4BE1A 1K6YA 4Z4GA 3VF6A 3QEVA 5CE3A 4AM7A 3KKSA 4RW9A 3PSFA 1KLMA 3LPUA 2P9PA 4IWVA 3EYZA 4RCHA 1VQ8N 4H0PA 3VQCA 1KSPA 2RE2A 5ADXA 3OYMA 2VG5A 4K43A 1SL0A 3V81A 1QQMA 4M3XA 1W0HA 1OVYA 1IV0A 4B9UA 3NBPA 3FZHA 3OYKA 3LDNA 1VSIA 3FFIA 3NCIA 4H0XB 2P9KB 3LDOA 1BQNA 2DFFA 3LM2A 4YORA 4CF8A 3WQTA 4WFBL 4EFHA 3C95A 4B1XB 3F9MA 1JKHA 1NGDA 4B9SA 4KI6A 4BRPA 5KI6A 5B8HA 4Y1DA 1NLVA 4FOIA 1S1XA 1ZBIA 2G8IA 3AVJA 4XH4A 3O9TA 1K8AO 3G0ZA 4KHYA 1CXUA 2ZQBA 3BY5A 4YHHK 3JAMO 4BRMA 4DU1A 3F2KA 4WQ4C 3LDSA 1IKXA 1JLQA 3KLIA 2YHXA 5M1PA 4Z4IA 4RW4A 4GMJB 4DSIA 2G8HA 4NO7A 4ID5A 5GIPA 2CGJA 1BQMA 3IDHA 2E2NA 2Q31A 1NK7A 3CFRA 1JLEA 5M1OA 1YF5L 4M3TA 1G15A 1IH7A 3RSEA 4ELTA 3AVCA 1SS6A 4IOCL 1WSGA 2GUPA 4RW7A 3HXMA 2X6SA 1GOCA 4AHSA 4LY7A 2HNZA 3SAGA 4YOXA 1RTHA 4HUFA 2P9KA 1NGIA 4FK0A 2Z1HA 3C7NB 3HRGA 2GX9A 4H03B 3AVIA 3SAFA 1JLFA 3HPGA 4JKDA 5C25A 2WTUA 4CK2A 4UY8O 5CR4A 3ATVA 3HVTA 3NMUA 3RR8A 3CPEA 4FW1A 4FXDA 3CQYA 4IG3A 4CJ7A 2Q3SA 1Q82O 3I0SA 4C8MA 3C6AA 3IKMA 3WNHA 1RGIA 2PY5A 3CCMN 3QETA 4B1VA 3SYZA 1VQON 3HZ6A 1NMDA 3ZSYA 1C1BA 1YTUA 4MFBA 2F8TA 4B9MA 2V7ZA 2QWOA 3VGMA 3VETA 4CEAA 1NK4A 4WFNL 4DSJA 4BVOA 1UA1A 1J5EK 4E1NA 2YI1A 3B6PA 1SAZA 4JI3K 3THXA 3G71N 2NRWA 4LD0A 4FZXC 1C0GA 1RNHA 4KKOA 3QEXA 1WSJA 4DWIA 2O8EA 3P1GA 2IVOA 3C7NA 2EX3A 3CM6A 4AF1A 4DSLA 3JYTA 4DFPA 3DXKB 2YNHA 3ASMA 1YHQN 3SAHA 2YHAA 3OYDA 2VG7A 5EVZA 5AQXA 5KTQA 1A5WA 2A42A 5AQOA 5C42A 5FPEA 5GAGP 2P5OA 3O1WA 4IKFA 4W5OA 2ZD1A 1KVAA 4FL9A 1QQOA 2CGLA 3RMDA 2O8BB 3AO5A 2NZTA 1SKRA 4BG9A 4LF7K 3P39A 2HHTA 2F9WA 3QEIA 5AQJA 3U3GA 1EKEA 5MLCQ 4FLVA 1HPMA 3LZJA 2PYLA 1NM1A 4PHTX 3ZSWA 3CCLN 2O4IA 2YHBA 4DSKA 4AILC 1RT7A 4Z4HA 3CERA 3SMSA 2W6KA 3U8XA 1EWQA 4F3TA 1CXQA 4CJQA 3MN9A 1RFQA 4CJ3A 1MU2A 4BR0A 4DCHA 4Z94A 4O0IA 3JXUA 4PKGA 3ZT0A 3J7ZO 3NDKA 3C6UA 3DLGA 1LWCA 2YJFA 4BC2A 1HPZA 3SBTA 3JSMA 1RBSA 3DXKA 5AJ3K 3MN5A 4DTUA 3O08A 1NK8A 4LFCK 4AM6A 4DR7K 1VQ5N 4KTZA 2FLOA 3MXJA 1Z05A 4FJ5A 3SPZA 1VSLA 3EO3A 2B5JA 4FLXA 1S3XA 3AV9A 3OA9A 1TVRA 2D1KA 2KKZA 3QBXA 5M1KA 2FBXA 2BUPA 2ZWHA 2O8BA 1NJWA 2UU9K 3ULDA 5EXWA 3VEYA 2VCPA 4W5QA 1BUPA 4BRHA 2O8DA 3DMJA 3THWA 3HSCA 1NK6A 2OPRA 1B9FA 1RDAA 4ICLA 2OZMA 3UB5A 3CM5A 1RBTA 4FLZA 2I7PA 3WNGA 3LDLA 3QBWA 4JKEA 4A2BA 3OYCA 1L5UA 1HJOA 3UIQA 3MEEA 4E7HA 2GELA 3QB0A 4CJ4A 4KRFA 3WXKA 4DV4K 1RT4A 1NJYA 4FJ9A 4EHTA 5DK5A 3KLHA 4B9NA 3PSIA 3FZFA 3V4IA 3F73A 2IIRA 1BDGA 4H5NA 1RCHA 4DV5K 4YFUA 4G9ZA 3G10A 1JLAA 1WN7A 4LSNA 4CIFA 2W40A 5HL7L 1KAYA 2VWBA 1N34K 3MWTA 4A62A 4JS4A 4KHWA 4JAXA 3P38A 5GAEP 5F1XA 3E66A 4JI4K 1QE1A 5EU7A 3LPTA 3MX5A 3EE9A 4FPBA 3OW2M 4F9OA 1QZ5A 3I8BA 1A5XA 1XNRK 1LWEA 4DR3K 3MWPA 2HBMA 1B9DA 1QHAA 1VQPN 3LAMA 1WSIA 3SUQA 3EZWA 5BRFA 1BIZA 2GUIA 5AQFA 5JS2A 5E84A 3SV4A 4JRQA 1E4FT 1RTJA 3RRHA 4AHRA 4FSVA 3NF7A 4BR5A 4CEFA 3CPWM 1BGXT 2D0AA 3V9UA 1BO5O 3S3NA 2I5JA 4EIAA 5C15A 1TKTA 4M3WA 3L2UA 4FJXA 3TSUA 4DKWA 2P9SB 5KQ8A 3SK3A 3TI0A 3AVNA 1VQLN 1LW2A 1RBRA 2QWMA 3CYMA 3N4PA 3O3HA 2RN2A 3L8BA 1J54A 3GE1A 2J4RA 4YOUA 5T7BA 3VEZA 3PO5A 5JS1A 3PX4A 5HRRA 2YKMA 3PO4A 2IS3A 2W6LA 4NYNA 4FO0A 4DU3A 1NGHA 1YUWA 1HJRA 1KCFA 3SUPA 4XIUA 3CD6N 3SZ2A 5KQDA 4E7LA 3KIOA 1IG9A 4J2BA 3IS9A 4UQGA 4H0TB 1QS4A 1QSSA 2O8CA 4B3TK 5I3UA 3OYJA 2VGMA 1KLNA 4CEZA 1DTQA 4HTLA 5AQMA 1RT1A 2XHBA 1FKPA 4M3RA 4CZMA 3NFAA 3ISNC 1OVQA 3L4QA 4CJPA 4H4MA 4OVLA 3NGYA 4DFJA 5I42A 1HYSA 3T19A 3DXMA 1H1VA 4FWOA 4CJEA 3M6GA 4CCHA 4A2AA 3SUNA 3J7AP 2WBNA 2R7YA 4F8RA 5FLXO 5FPDA 3P4IA 4DV3K 1QSLA 2NRXA 4DQRA 1EO1A 1NGBA 4CHNA 1KC8O 1UOCA 1XMOK 5HOOA 4CJWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WFA L;  3CF5 L;  1VQM N;  3CC4 N;  3PIO L;  2QEX N;  3PIP L;  1YI2 N;  4U67 L;  3CCU N;  2ZJP L;  1Q81 O;  5MLC Q;  2OTJ N;  1VQ9 N;  5HL7 L;  4IOC L;  3CXC M;  1M1K O;  3CCL N;  3G4S N;  1K73 O;  2ZJR L;  3CCJ N;  5GAE P;  3I56 N;  4IOA L;  3CC7 N;  5GAD P;  3OW2 M;  5GAH P;  4UY8 O;  1VQN N;  1N8R O;  1KD1 O;  3J7Z O;  5DM7 L;  1JJ2 M;  1VQP N;  1Q7Y O;  1KC8 O;  1W2B M;  5H1S Q;  1YJ9 N;  1VQ6 N;  1K9M O;  1QVG M;  1KQS M;  1VQ5 N;  3CCV N;  4WF9 L;  2QA4 N;  1Q86 O;  3CPW M;  1VQ8 N;  1Q82 O;  3CCM N;  3CC2 N;  1VQO N;  1OVY A;  5JVG L;  1QVF M;  3CMA N;  1VQL N;  1VQK N;  3CCQ N;  4IO9 L;  4WFN L;  3CCS N;  1M90 O;  3CCR N;  1VQ4 N;  4WFB L;  1VQ7 N;  3CME N;  3G71 N;  3G6E N;  3CCE N;  3I55 N;  5DM6 L;  1ILY A;  1NJI O;  1YIT N;  5JVH L;  2ZJQ L;  2OTL N;  1YJN N;  1YHQ N;  1K8A O;  3CD6 N;  1YIJ N;  1YJW N;  5GAG P;  1S72 N;  4WCE L;  3DLL L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2RPI A;  4WFA L;  2KZZ A;  1V4S A;  3GBT A;  2HND A;  2GWK A;  4LH4 A;  1TK5 A;  2QEX N;  3TAQ A;  2PBD A;  3VA0 A;  1TKX A;  3TSQ A;  4FM2 A;  5J2N A;  2HVI A;  2ZJP L;  5E26 A;  5BR9 A;  3WEE A;  3LP3 A;  1Y97 A;  2ZJR L;  4IDK A;  3MXI A;  3A8Y A;  1ASV A;  3I56 N;  3QIO A;  2IOC A;  3ZX2 A;  1WNS A;  3AY9 A;  3KLE A;  4E89 A;  3L6Q A;  4O44 A;  3HPO A;  4IFV A;  1U49 A;  4GV9 A;  5A2Q O;  1WUA A;  4DS5 A;  3V6D A;  3H3O B;  4NXN K;  1IKW A;  5M1Q A;  4ILJ A;  3D6R A;  1QVG M;  3KLF A;  4ELV A;  2FBV A;  3J80 O;  2G8V A;  2KHO A;  4CHQ A;  1HRH A;  1JCE A;  1GLC G;  1KRP A;  1BOT O;  1UAX A;  1EX4 A;  3FGU A;  1XC9 A;  1BIU A;  1VK0 A;  4HCB A;  4NXM K;  2ZE2 A;  2EWS A;  4BR9 A;  2FBY A;  1WAJ A;  4BRE A;  4DQP A;  2B4J A;  4Z4F A;  4G1Q A;  1Z6R A;  3VES A;  4RG8 A;  5I9E B;  1L3T A;  2XRI A;  4MLH A;  3EZ5 A;  3AO3 A;  3CME N;  1XQS C;  4FYD A;  4JKG B;  3SQ1 A;  3CI5 A;  3DRS A;  4EP4 A;  1ILY A;  1S6P A;  1S1V A;  2A3Z A;  1NKC A;  3ALY A;  5M1N A;  4IEI A;  3T1H K;  4EP5 A;  3KK7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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