3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
b'ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
1QVFM 4WFAL 4IOAL 3CCJN 3G4SN 3CCRN 1NJIO 1M90O 1VQLN 5GAEP 3CD6N 4U67L 3CCMN 1KQSM 3CCSN 1Q7YO 1W2BM 3G71N 1K8AO 1YITN 3CMAN 5DM7L 1VQMN 5GAHP 1YJNN 1VQ9N 1VQ7N 1M1KO 3CC7N 3I56N 5MLCQ 1VQ8N 1VQNN 5H1SQ 1VQ5N 2ZJQL 1YI2N 5GAGP 3CPWM 3CXCM 1YIJN 3CC4N 1JJ2M 3CCQN 1VQ6N 1VQ4N 2OTJN 1VQPN 2QEXN 3CF5L 3G6EN 1S72N 1YHQN 3CC2N 5HL7L 3CCEN 1KC8O 3CCLN 4UY8O 1OVYA 1Q82O 5JVGL 4WFBL 4IO9L 2ZJRL 5GADP 4WF9L 5JVHL 1ILYA 3CCVN 1YJ9N 3J7ZO 1K9MO 3I55N 3CMEN 1Q86O 4IOCL 3OW2M 2ZJPL 1KD1O 1Q81O 3DLLL 1K73O 1VQON 2OTLN 1QVGM 5DM6L 1N8RO 3PIPL 4WFNL 3PIOL 4WCEL 1YJWN 2QA4N 1VQKN 3CCUN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B8CA 5CZ2A 2OANA 4CJWA 3L3UA 4IG0A 3CERA 4B9TA 4BG8A 3H6EA 1VSDA 3RMAA 3FFIA 1C1CA 3CJCA 1JXEA 1MA9B 2CGJA 4GW6A 4H5RA 2IDOA 2HBMA 3HSTB 3LDNA 2O8EA 2QXFA 4CF8A 5AZJA 3DI6A 5B8HA 4IKFA 5AQOA 2A1SA 4DV7K 4OPHA 4KI6A 1HKBA 1RILA 3O08A 5EVZA 4JI6K 4M3TA 3T3FA 2UU9K 5KGXA 3SPYA 4LF9K 1NU0A 2KKZA 3P38A 2QWNA 3K5OA 1FJGK 5HLFA 1EP4A 4RW4A 3ISNC 2YJFA 4M41A 4BR0A 3TAPA 3THWB 2WTUA 4JD2A 3OJSA 5HRRA 4H5NA 5J2NA 2FBTA 1KAZA 4DUYK 1ZYQA 1SV5A 1WOQA 3E66A 3O9RA 4FLXA 2GX9A 5HROA 1NK5A 5JS2A 4OPJA 1VRTA 3BDPA 2GV9A 2E2NA 4BE0A 1GLDG 4FWKA 4FK2A 3UKRB 3D7EO 4IO9L 4NCBA 3AVLA 4CHOA 1BG3A 1K9MO 1OVQA 1JLGA 3LM2A 1SL2A 4E19A 3O9TA 3ULDA 3C95A 4CEAA 1L3UA 5C42A 4HTLA 4FLVA 1N5YA 1YUWA 3NH1A 3U3GA 3VA0A 2F8SA 2VQEK 1R59O 3S3MA 3O80A 1LV5A 1JXBA 2PYJA 3R9PA 2HB5A 3ZSZA 5EOYA 5E84A 4DFJA 1HNWK 5M1NA 1QS4A 2QI2A 4EZ9A 3VQPA 2NRHA 2D0OA 3N4PA 4BRIA 1EQYA 3S9HA 1T3VA 5ELZA 4QS9A 1W2BM 5T7BA 1QQOA 2VG7A 1VSLA 3THXA 4CF2A 4DLEA 5LY3A 4WQ4C 3OYFA 1LWCA 1C0UA 5MLCQ 3V81A 1U48A 3BGRA 1NGDA 3WXIA 4XH5A 3CQ8A 3RMDA 1QQNA 1RBTA 2Q97A 4W5NA 3CXCM 4JV5K 3DXKB 3AO5A 4QCLA 1VQ4N 2ZQBA 4A2BA 1GOBA 2CH5A 4FJIA 1Z6RA 4BC4A 2E88A 4Z0UA 4FJNA 4CGJA 3D2FA 2OCEA 2KHOA 4FWOA 3OYBA 3V1RA 5CE3A 3MXMA 2HHUA 3CCLN 1KSPA 4FWQA 3V9UA 3PX0A 2UXBK 3SQ1A 2GUPA 3VN5A 2NRVA 3ZSRA 2KLAA 3SUOA 4DSJA 3QESA 1YF5L 3HTVA 1O13A 3OBWA 3VA3A 2D0AA 1RDDA 4W5QA 4CFCA 1GLAG 4YOXA 1U2VA 2WC9A 2OPPA 3DM2A 4FPBA 2ZWHA 3M8RA 3KHYA 3JXUA 4KI4A 4DTUA 5F0XA 1FK9A 3CJ7A 4DS5A 3K9JA 4H5TA 4PY5A 5D3GA 4C23A 4BC2A 4BQLA 3O9QA 3MEGA 3PIPL 4WFNL 1NK8A 4KFBA 1NGBA 3KK7A 1VQKN 4CERA 4FYDA 3OYMA 4IO8A 1HQEA 3H3NO 5ADXA 4X64K 3NBPA 5JLFA 3CD6N 3LDPA 4KAZA 3LM9A 1VSEA 2E8AA 4MLHA 4N47A 1VRUA 2Q1NA 3PUFA 3L3VA 3SI6A 1RT4A 1NGGA 2HNZA 1J6ZA 4B9MA 4DTPA 4CZIA 4E7HA 4CEQA 1QHAA 1XUPO 3ZETB 3NH2A 4GNIA 4YFUA 3QNNA 1VQ5N 1L3SA 2QXLA 4HUEA 2VWBA 3QINA 3DAWA 5AQPA 4BRMA 3VENA 4WQ5C 3C7NA 3A2FA 4GVEA 3KKSA 3AO3A 3S41A 1HNVA 4RWTA 3AARA 3M1FA 4Y1DA 4IXCA 1X9SA 3PO4A 3MWTA 4KTWA 2H3GX 4DSFA 5LMNK 1WBBA 3DRPA 3UKUA 4FLTA 1U45A 1ZBHA 4BREA 4EAHD 1BISA 4LY7A 4Y0WA 2XY7A 3RRGA 4CF9A 3K57A 5KRSA 3TAEA 1YJ9N 3HSCA 4JK7A 4FL9A 1HMVA 1TGOA 2A42A 3MK6A 2P9NA 3HJFA 3DLBA 5BPMA 4GV3A 5KTQA 4IOCL 1RT7A 3I8DA 4FO0A 3TSQA 2JWKA 5F2RA 3R8EA 4EP5A 2VWKA 5FROA 4EP4A 2P9SA 2E1YA 1IBLK 4A57A 5HRSA 4CJ4A 1HJOA 3J8AA 2HNDA 3RSEB 4WFAL 4MFBA 4YOWA 2JLEA 2DPNA 5BR9A 3CJAA 1ZBSA 1QHTA 3QBWA 4DF8A 3RR8A 4E0DA 2HHVA 4DTOA 3LDOA 3HVRA 5EX5A 4CHYA 3MEDA 4Z4FA 1FKPA 3UIQA 3T19A 4WYBA 1WSJA 3BF3A 3TSPA 3L2UA 3SNNA 1JLQA 1SQKA 3UB5A 2P9KA 4JN4A 1HNXK 1NJWA 5AZIA 4J2EA 3HI0A 3LWLA 4FJKA 4J2DA 4AILC 5HRNA 4O0IA 4CGHA 1SZ2A 4O44A 1C1BA 1UA0A 4V19S 1QZ5A 1UAXA 1B9FA 3A5OC 1MWKA 3NGIA 5FPMA 3ZX3A 4KHSA 2LSNA 2HBKA 4GV6A 1ATRA 1YAGA 3R1XA 1BCMA 2P9PA 3ZX0A 1NNEA 2QWQA 5I42A 1SAZA 4UQGA 4A61A 2VG5A 3OYEA 4OX9K 4E7JA 2HVHA 3K2PA 1ESVA 1S9EA 4H03B 3OYLA 4CW7B 4A62A 2OA8A 2VYPA 4KHUA 4BR5A 2EX3A 5DMRA 4FOEA 4JEPA 4Z94A 3TWHA 1YVNA 3NE6A 1VSHA 1K6YA 1EXQA 1SS6A 3H1QA 2ZGYA 3AGKA 1UA1A 2HHSA 4HCBA 5BRFA 4L3QA 3DWLA 4ELUA 3C6UA 2IVOA 3HYFA 4ZHRA 4LH4A 5DM6L 4JS5A 4B1ZA 4W5RA 4CIGA 1RT2A 1YJWN 2QA4N 2VQFK 3FZKA 2F4VK 2WFBA 4A5BA 4BC5A 3ZSQA 2HF4A 1J53A 3QETA 4C1NI 4GMJB 4HTUA 4I2PA 3O9UA 2A40A 2IIRA 2AJQA 4H5WA 3MAQA 4DV6K 1HYSA 3QMLA 2D0PA 4CJPA 3WNEA 3LP3A 1IG9A 3QIPA 2Q31A 3AV9A 1BA0A 4CJRA 1NJYA 3FZLA 1Z25A 2YJEA 3SUQA 4CZGA 4H4OA 2X74A 2W42A 1VQ9N 5FRNA 3HO1A 1RT6A 4F9OA 3I56N 4H0PA 1T8EA 1T44A 5AQGA 3DMJA 4FWLA 4C8MA 4CJ3A 1EWQA 2ZM6K 1OKJA 1BHLA 3AA3A 2D0CA 1JLAA 1LAVA 4H0OA 4FXDA 5AQHA 5FPEA 3SK3A 5HOOA 2G8FA 2QWOA 4Z4CA 1D4XA 4B1XB 4X66K 3O3GA 3AVCA 4BGBA 4K8XA 4B1YB 3DOKA 4B9QA 3NFAA 3THWA 4BRFA 3AVAA 5AFUA 3U4LA 1RT3A 1RBSA 3DLRA 1EKEA 4IDKA 3SQ4A 1IBKK 1NLVA 1S6QA 2OZMA 4AHUA 3L8BA 3VETA 3AAPA 5KPZA 4PHTX 2FF3B 4FJMA 2DTUA 4BRKA 1RNHA 2G8KA 2QM1A 2P9UA 5BR8K 3ZT3A 3AVMA 4FJLA 3CM5A 4NO7A 1TUUA 3UKRA 4FWPA 3AO1A 1ASUA 3VEWA 1HRHA 3P39A 3DRSA 3U9DA 5J1EA 3SPZA 1Q81O 2RKIA 1Q8IA 1H1VA 3KIOA 4JKGA 4YY3K 4OLBA 1B92A 1VK0A 1KXPA 4IG3A 1N8RO 2V52B 3VPZA 3I8BA 3WUHA 1NOZA 3IKMA 1K8KB 5CYMA 1WLJA 3L2RA 3MN5A 4KREA 4YDUA 4C8OA 1NJIO 3V9WA 1WSIA 4H0XB 4DV5K 4XIUA 4CBUA 4ICLA 2I7NA 4IEIA 3ITHA 2QWLA 4O8UA 4DUZK 1B9DA 4CZHA 3NVMA 4FM2A 3A5LC 3BEXA 4AQYK 3DLHA 4GKJK 4ID1A 2HMIA 4FK0A 3ZEUB 4R79A 5KQ8A 1VQNN 1RFQA 3K5NA 5AQXA 3DLKA 4BVPA 3KWIA 4IFYA 1GLLO 1RTHA 2HHQA 5LL6Z 2HBJA 2F96A 2HHHK 4K25A 3SLCA 2HHTA 1XHXA 4CZMA 4JI1K 4N5SA 2GUIA 2O8DB 1G99A 3DXKA 1CXQA 1FKOA 1L3VA 4YOYA 5DK5A 3K5LA 1HLUA 1S1UA 4CJEA 1SKWA 3C65A 5LJWA 4UY8O 3W0LA 1W7AA 1Q82O 1KCFA 3LAMA 3SQ0A 3QEVA 4CJQA 4I6MB 4Z4IA 4BE2A 3LDLA 3NHGA 2BE2A 3HXMA 4M7XA 4G1QA 4AM6A 3FLCO 3J7AP 1OH6A 2W6LA 1ASVA 3WT0A 2RN2A 4I9LA 4MLEA 3QFPA 1S9GA 4FVUA 2KFNA 4CF0A 3CJBA 1WSGA 1CLQA 1U6ZA 1WUAA 4HWIA 4CHZA 3D6RA 2ASMA 1XWLA 4XH4A 5C2DA 1RBUA 3IRXA 3VF2A 3WEEB 1QVFM 4ISEA 3BZKA 3KTQA 3F9KA 4K42A 1FXXA 3HM8A 2HMPA 3AAQA 1LW0A 1NKCA 3SV3A 2QW9A 5AQIA 3CIPA 3EL2A 4DTJA 1WAFA 5HP1A 3L2VA 3A5MC 1TKTA 1WBDA 4YOVA 5J2MA 4JKEA 1BCOA 3C6TA 3CMAN 1S5JA 1GLBG 4DR5K 4K43A 5GAHP 3E9PA 2V51B 2XY5A 4LF6K 1TVRA 4CF1A 4LD0A 4M63C 3V9ZA 2PFUA 2ZGZA 4CEEA 3O5BA 1DTTA 3F2KA 4IZ9A 3GDQA 3EKSA 3D0PA 4BDPA 4AHSA 4LH5A 4JAXA 2ITMA 3SJJA 4RW6A 3TI0A 3SV4A 3THVA 2VCPA 4DHYA 4FZZA 4F3OA 2QEXN 4U7BA 3MECA 1S72N 3AY9A 3SMSA 4BE1A 2Z1JA 3HM9A 3THYB 3NF6A 4Z4GA 3U6FA 3MXJA 3EYZA 4FK4A 3KK2A 3MCAB 1J5OA 1NJXA 3HK2A 4XH1A 4BWJA 3FZHA 4BQZA 4W5TA 1RTIA 3NDKA 3H45C 3AVNA 5GADP 1IKWA 2B4JA 3VOVA 3VQ8A 4LF8K 4RG8A 4H8KA 1GOCA 3MN7A 4CESA 2X78A 3J7ZO 1HYVA 2UYTA 4DQQA 4B1UB 3FE1A 4AH9A 4N76A 3V9XA 1C1AA 4ISGA 3E1YA 2KQ2A 3OW2M 5BREA 3SBGA 3HP6A 3QBXA 3IFRA 4M3ZA 5AJ3K 4DV4K 1JCEA 4IWVA 3VQ6A 4CZEA 4DU3A 2I7PA 3TU5A 1RCHA 3OYDA 1XQSC 4CZFA 4JI4K 2P1JA 4BGAA 3KJVA 3ATVA 2VGMA 4O0JA 3OVNA 5C15A 1M90O 3ENBA 4AHCA 3BZCA 2HF3A 1V4SA 4CIEA 4DR6K 3RSEA 4PKIA 4FJHA 2RF2A 3G10A 1O1WA 2RHKA 4DR7K 4W5OA 1RDWX 4PWDA 2UXDK 3VQDA 3NF8A 4KKOA 1HYZA 1VQ7N 5BN9A 4FLZA 2O4IA 4B9UA 5H1SQ 4JNEA 4BRHA 3I0RA 4E7LA 3RR7A 1KFSA 4FZXC 2FXUA 4YOUA 4RW9A 5GAGP 1RTDA 3CPWM 1TK5A 3T1HK 4KHWA 3O1WA 2D1KA 1NGIA 4O55A 3M8PA 3IDHA 3OYHA 1T05A 3NAEA 1JLEA 3RVCA 3ZSVA 4O8KA 3O4QA 3C94A 4NXMK 4CIFA 3JSMA 3E01A 3T1AA 3KK1A 2F8TA 2YX6A 4DTRA 4B9NA 1U04A 5HL7L 1JCGA 3O4WA 3OYIA 1NK6A 4NLBA 1X3NA 4ELTA 4F8RA 4PL8A 3CJ1A 3K9KA 2DFEA 3F5TA 4DV1K 4WFBL 3RTVA 3WQTA 4JKHA 2E4LA 3QEWA 3HT3A 4CJUA 1NGEA 2QWRA 1NG9A 3HOSA 3VF4A 3VQAA 1DGKN 2GELA 5M1FA 3L0QA 4FWMA 4JI5K 1Y97A 1HKCA 4DQSA 1Q86O 3U3YA 4FJJA 3BY5A 4NCGA 2A6AA 2ZJPL 4Q5VA 1IV0A 5SWMA 2W6KA 5AQMA 5GIPA 2UUCK 1JKHA 2FLOA 4BDZA 4DWIA 4FW2A 4DU1A 2AA4A 2WOMA 4AF1A 3OS2A 5AQJA 5TKYA 4CJKA 4HHTA 1Q9YA 3D2EB 1YT3A 2NZTA 3H08A 4BRCA 3VTHA 4YHHK 4BRQA 1EO1A 3MX5A 4B3TK 3IS9A 1VSFA 1D8YA 4IFVA 4O4GA 1WSEA 3CCMN 3SQ2A 1U4BA 1WB9A 2G8WA 5KPRA 2OPSA 3KLFA 1LAWA 4DR2K 4CZKA 3D45A 3M5RA 4IBNA 3WXLA 5KI6A 1ZBFA 4CJVA 2O8CA 5EY4A 4JI3K 3EO3A 5KQDA 1M1KO 4H5VA 1NMDA 3AA5X 2P5GA 4KHYA 3GL1A 1T6DA 3PX6A 4MQ3A 1YXQA 2E1ZA 4FSVA 4J8FA 4KBOA 3B6PA 2AP1A 2OPRA 1BOTO 3O3HA 3TPQA 5CYQA 1BWFO 3NH0A 4BR4A 3CQXA 3QLHA 1TAQA 3TAQA 1KVCA 3KD5E 5AQFA 1X3MA 1REVA 4K41A 1D9FA 4XEIA 5BRHA 3G6EN 3PSIA 3CC2N 2O8FB 4YDUC 4FOIA 3K59A 2HNYA 2DY4A 2IVPA 1DKGD 2E2PA 2GBZA 1NGAA 1KC8O 3VTIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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