3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
5GADP 3I56N 2ZJRL 1K8AO 2ZJQL 1VQLN 1S72N 1VQON 5GAGP 1QVFM 4WFBL 3PIOL 3CD6N 1W2BM 2QA4N 4WFNL 3OW2M 3G6EN 1VQ5N 1KQSM 1YIJN 3CCMN 1KD1O 2QEXN 3I55N 5MLCQ 1VQMN 5JVHL 3DLLL 2ZJPL 1K9MO 1VQNN 3CCRN 3CCQN 5HL7L 3CCJN 1YI2N 1Q81O 4IOCL 3CC4N 1M1KO 5GAEP 4UY8O 4WF9L 2OTJN 1YJWN 1VQPN 3CMAN 1NJIO 3CC7N 4IOAL 1YITN 3PIPL 4WFAL 5DM7L 1Q7YO 4U67L 1VQ4N 3CCLN 1VQ6N 5GAHP 3G71N 1VQ7N 3CCUN 1Q82O 3CCVN 3CF5L 2OTLN 1YJNN 1M90O 5DM6L 5H1SQ 5JVGL 1YHQN 3CCEN 3CMEN 3G4SN 3J7ZO 4WCEL 1JJ2M 3CC2N 3CXCM 1K73O 1QVGM 1Q86O 3CPWM 1ILYA 1N8RO 3CCSN 1OVYA 1VQ9N 1VQKN 1VQ8N 1KC8O 1YJ9N 4IO9L
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYMA 4W5RA 1UA0A 2HNZA 4BR7A 3O3FA 4A59A 2RF2A 1K8KA 3U8XA 1IO2A 1RT5A 5JS1A 2Q3SA 3AVJA 4JRQA 1NOZA 1HQUA 5CHIA 4KHYA 4DFPA 1ZBSA 3G6EN 3O3GA 3TPQA 5KPTA 5LMNK 3V81A 3ZEUB 2ZQBA 1DTTA 3Q7BA 4OJRA 1NK7A 1HYZA 5J2PA 2IS3A 4FL9A 3ULEB 4Y0WA 3QNOA 3HJFA 2E4LA 4JRPA 2FBYA 3PX0A 4CEFA 4LF4K 4DFJA 4B9MA 5HP1A 4AQYK 2ITGA 4M45A 2W6KA 3A5LC 3WEEA 4B3SK 3O4WA 4IFYA 5JLFA 3RMBA 1YVNA 3RMDA 3DXMA 3VESA 1T44A 4O44A 4CIEA 4B9SA 1SZ2A 3OJSA 1YJWN 3SAHA 1OVQA 1BQMA 3L2WA 2GBZA 4CD1A 1TL3A 2UXCK 5SZTA 2A41A 4OPAA 3U6FA 2QXFA 3F9KA 3OS1A 1MU2A 3VQQA 4BC3A 4DQ8A 3FFKB 2IDOA 3BZCA 1JL1A 3VQ4A 1IV0A 4IDHA 1WLJA 1SL1A 4DWIA 1C0TA 2ASPA 2ZWHA 3FLCO 3CQ8A 5HOOA 3KLHA 4H5RA 3A5OC 3CFOA 1EP4A 3CCEN 1YHQN 4KTQA 4DTJA 2HBKA 4ICLA 4DSIA 4B3OA 3UKRA 3MCAB 5BRFA 3CPWM 5AQVA 3NAEA 2PAVA 2FSNA 5AQZA 1RBRA 1HPZA 1YJ9N 3HVTA 3KVGA 2ZJQL 3ZSYA 2W42A 3VQEA 3VMFB 4FO0A 4ID5A 5TKWA 3WXIA 4DG1A 3NVKA 2EHGA 3H1QA 5BRDA 1WB9A 3CD6N 4LF9K 2QWOA 5AQQA 3T7ZA 4OVLA 1BO5O 3AGKA 3V1QA 4RWTA 4CZJA 2F96A 5I3UA 1VHXA 4B9TA 2CH6A 3L2RA 3THWB 4OPKA 2Z1IA 4ELVA 3K2PA 4DU3A 3AA5X 1TAUA 3AO2A 1VRTA 2UUAK 3V1OA 5HL7L 3H3OB 4BRLA 3P31A 2FC0A 3RMCA 4FYDA 3HYFA 1ASUA 3ULDA 2FF3B 3V9XA 3CC7N 1NJYA 3HP9A 2D0CA 1E4GT 1T3VA 3GBTA 4DV0K 1NGJA 2JGUA 3EKUA 4I7FA 3J7AP 3RMAA 4DCHA 4JS4A 2O4IA 1YF5L 4CZLA 2JLEA 4J8FA 2DPNA 1FXXA 1HLUA 1C1CA 1RBSA 3DMJA 3P5JA 1JKHA 4CJKA 1NKEA 1BQNA 2YHWA 3LPUA 1L3TA 4KH4A 2W41A 1ATRA 1GLJO 4FJ7A 4Z4GA 3DXKA 1BCMA 3SUNA 1NGGA 3W3DA 1BUPA 2DFHA 5H1SQ 3O9QA 1YTAA 3SUOA 3NFAA 4DTNA 3QEIA 2P9IB 3PUFA 3J7ZO 4DV6K 4FWPA 2Q1NA 4DTPA 1WBDA 1QVGM 4IJNA 5GINA 3EL2A 4A2BA 2KTQA 1L3SA 3LDLA 3VEVA 1N8RO 3TSUA 4JI4K 1BCOA 3LWLA 1OH5A 3DI6A 4V19S 4JI2K 3SV4A 2UU9K 1K8AO 5A2QO 1TKDA 1NK8A 2XY5A 3O08A 4CZEA 3J8AA 5GAGP 4JKDA 4YDUC 3HP6A 1NNEA 4RG8A 3SMPA 2OPPA 2VYPA 4ILGB 4BR2A 2NRVA 4CJEA 3OYAA 5ELZA 4WFNL 3TAGA 1TKXA 1WSJA 2B4JA 3K5LA 2AP1A 2A6AA 3ZLJA 3AVBA 4FM2A 4BR5A 4K43A 3E9OA 1HJRA 1KFSA 3V4IA 2P9NA 4B1ZA 3OYGA 3PX6A 1VQNN 2BUPA 4BRKA 5AJ3K 4NCAA 3LDPA 1CZBA 4BRPA 2BH1A 1OKJA 2QXLA 4IZ9A 1IKWA 1TUUA 4QOZB 2OZMA 3ZYYX 3TTCA 1RDCA 3AA2A 3BEXA 1VSDA 3CMAN 3PSFA 4KO0A 4IFEA 2WOMA 3HRGA 5AQLA 2IVOA 1X9SA 1HQEA 4CJLA 3CERA 3S3MA 3GOIA 3IG1A 5M1QA 4LSNA 3KLEA 1KVCA 3K5NA 5E26A 1BA0A 4C1NK 4DQSA 4DV3K 2NRXA 4DTSA 1QE1A 3L2VA 3K0SA 5GIOA 1RNHA 3EKSA 3O9UA 1E4FT 3FE1A 1T6CA 1WSIA 1MA9B 1RT7A 3VF2A 3NHGA 2P9SB 1FK9A 3OYKA 4DLGA 4DSFA 3L2UA 2Z1GA 4BRGA 2HMIA 3LP0A 3HI0A 4CJQA 3V9UA 3IS9A 4O0IA 3AA3A 1JL2A 3N4PA 4OGEA 4FOIA 3QB0A 1RT1A 4F9OA 4B9NA 1C0FA 1HNVA 4M7YA 5M1KA 1YUWA 2FBXA 4DUZK 1ATSA 1S6PA 2F8SA 4CF1A 3QETA 1T03A 3P39A 1TGOA 3UKUA 4J2DA 2Q36A 4BRHA 4H8KA 2X6NA 3KK2A 3LM2A 2D0AA 4E7IA 1HYSA 3HXMA 3SQ4A 3G0ZA 4N76A 3QBXA 5AQHA 5AQMA 2ZGYA 3AVGA 3NF7A 2RKIA 3WNHA 4FJ5A 4M3XA 1GLCG 3PX4A 4KREA 3H08A 3I55N 4CW7B 1KXPA 4FM0A 5CYMA 4YOWA 3P38A 2IVNA 4B1UB 2IC3A 3R8EA 2E6MA 3S3OA 4OKKA 2OCEA 1U04A 3FZMA 5F2RA 2E1YA 3ZT2A 5KQ8A 1NGFA 3FZLA 3AO1A 3B8AX 3AVFA 1S1XA 3ZX0A 4FJLA 3CQXA 1YITN 4FJIA 3OYHA 4BVPA 2V7ZA 2WFBA 2IIRA 3F9MA 5AZJB 4OO1J 1J53A 4YOUA 3VEZA 1C1AA 3D2EB 4NXMK 4UQGA 1RGIA 2O8DA 1GOBA 2QK9A 3EE9A 3G10A 4M3UA 4PL7A 1SL2A 1KFDA 5CZ2A 3NGYA 4QAGA 3SBGA 2JWLA 3OJUA 4AHCA 5FPDA 2BANA 2RHKA 3VQ7A 1FKOA 1WSGA 2YHXA 3SAFA 5J2QA 2FXUA 4CEQA 4AILC 1P90A 3VGKA 4FZYA 3KK3A 3CMEN 2PYJA 5FRMA 1T7PA 1XNQK 3TAEA 2P9KB 1ZBHA 3QNNA 3R1XA 3ZSQA 4YORA 2A40A 3CC2N 4BE2A 4KTWA 5JMVA 1TL1A 3EYZA 4IJAA 3WXJA 3CFRA 3C6HA 4DV1K 4KHNA 3C6AA 4I2QA 1OVYA 1VQ9N 4B8AB 4CF0A 3GL1A 3I33A 1VQ8N 5AQTA 5LL6Z 3O1WA 3MAQA 5M1OA 3MX2A 5GADP 1RT6A 1JLQA 4FWNA 3OYIA 2CH5A 1RDDA 4CHPA 4IWVA 1S72N 3W0LA 2FSKA 1VRUA 3SJJA 3S41A 2GUIA 2OPRA 2O8EA 3ENOA 1QQMA 4CHZA 5AQRA 4CFDA 4BVOA 2Q97A 3IAYA 3CJ7A 3K9KA 1NK9A 1KLNA 1C6VA 3O3HA 1C1BA 4FWQA 4KHSA 3O9SA 4AF1A 4H0VB 4C8LA 1U2VB 1DKGD 2E20A 5HRPA 3SUQA 2HF3A 4A2AA 3F2KA 4NCGA 2P9PB 3QFUA 3OYDA 3CYMA 4DTXA 2R7YA 2O8CB 3GDQA 2E8AA 4LF8K 2P9IA 4RW9A 3CJCA 4O8UA 4FJJA 3VQPA 5DMRA 4JI3K 3RRHA 3DWLA 4B3MK 3ZSRA 1UWBA 3THYA 3U9DA 3HBTA 2YJFA 4U67L 2O8FB 4I9LA 1BI4B 3CCLN 3ZSOA 3ZX3A 2Q0UA 3AARA 3U9ZA 2NNWA 4PWDA 2YI1A 4CGIA 2ITMA 3LPTA 2IOCA 1FW6A 1IBKK 2A42A 3QDKA 4WQ5C 4GY2B 3LZJA 3RWUA 5D3GA 3T1HK 2B5JA 3JXUA 3TANA 5AZIA 4HTLA 4FW1A 2HVIA 1N32K 2BE2A 2O8BA 3VF4A 4H5NA 1FJGK 2PY5A 4Z4HA 4G9ZA 3D2FA 2V7YA 3LDNA 3O4NA 3TWHA 5M1NA 3RRGA 1O1WA 5BPMA 4ID1A 1HJOA 4WQ4C 3OVNA 5EX5A 3K5MA 4CJUA 3VENA 4AHSA 3KZBA 3N4QA 1VQKN 4H0PA 2NUBA 4K25A 1DTQA 4YOTA 4Z0UA 1ESVA 4OKEA 4WE1A 4O0JA 4H5TA 3C7NB 1RCHA 1VQON 4BC2A 4OLAA 3LDOA 4FW2A 3OYJA 2YCHA 3KJVA 4BE1A 4J2BA 3PLAA 1VSEA 2UUBK 2P9LA 4CGFA 3OBYA 1KQSM 1GOAA 4CHOA 4E0DA 5KGXA 5BPNA 4CCHA 1EETA 2D1KA 4I6MB 4N47A 5MLCQ 4RW8A 4JKFA 3SBTA 2ZJPL 4CEOA 1NGHA 5BR9A 5FPMA 2HF4A 3CETA 4JD2B 3A5NC 4LFBK 3RTVA 1TYQA 5AQWA 4CJWA 1D9FA 3VTHA 1QHAA 1NMNA 2P1JA 4BGBA 4E89A 4FWOA 4FJHA 5C25A 1VAZA 3QBWA 1ZBIA 3I0RA 3IFRA 5BN8A 4WF9L 2OTJN 4DSJA 3D0PA 3H46O 2Y1JA 1I94K 2G8WA 3L4QA 4HTUA 3DLHA 4M42A 3FFIA 4JKHA 1C0MA 2OYQA 4FWMA 4MQ3A 1NKBA 4Z4EA 4FJGA 3HM8A 4CEAA 4C1NI 4DV7K 3ZT1A 2PFUA 3WNFA 3LM9A 3CCVN 1BGXT 3DLBA 5EXWA 2HHWA 4F3OA 3Q7CA 2HMPA 1RBVA 5HLFA 1HMVA 1J5OA 4FWSA 4FPBA 1D8YA 4FVUA 4FLYA 1WNSA 4WCEL 2ZM6K 3A2FA 4DTRA 3VEYA 3K58A 3O8MA 4CHYA 3ENBA 4O5FA 3FZKA 1Q86O 3TU5A 4RW6A 1YT3A 4CJ7A 5B8HA 4DS4A 5IWAK 4IBNA 2Q31A 1J9AA 3HPGA 4CEDA 4E3SA 4CJTA 5AFUA 5E84A 4OLBA 4LFCK 2KFZA 2F9WA 2VGNA 1WSFA 2DY4A 4BRFA 1XC3A 4CI6A 1GLLO 2QA4N 3DOLA 3M1FA 3AV9A 4CK3A 3LAMA 2YJEA 4EHUA 4ZTJA 1NOYA 3NGZA 3IMXA 4F8RA 4NYNA 1RFQA 3CCMN 4PA1A 2E1ZA 3CJBA 3TARA 2QEXN 3OBWA 4EAHD 4MDBA 1RT3A 4B1YB 4B08A 4E1MA 5IT9O 4CEEA 3DLLL 3VTIA 5LJWA 5KTQA 4BRMA 3OYFA 4A61A 5DK5A 1BDGA 4ILHA 2BGGA 3WNEA 1GLAG 1JCGA 1RDUA 4FK0A 3HM9A 2G8KA 4BRDA 3ISNC 3O9TA 3I8DA 3SCXA 3O80A 4IOCL 1Q81O 3VQ9A 4B9VA 4BG9A 5AQNA 2QWPA 5JLHA 2VG5A 2P9KA 4DQPA 4HUFA 3AVNA 2J4RA 5CZ1A 3AVCA 5I9EB 4O4GA 3V6DA 4IOAL 4X62K 4Q0BA 1NK5A 1N34K 4K8ZA 4CK1A 2G8IA 4QS7A 3QEWA 1BA1A 3BF1A 1ZBFA 3AVKA 3SJHA 2NRZA 1RT4A 3CHWA 3AO4A 1UOCA 4OX9K 3VQCA 2YNFA 4F2RA 1QQNA 4GVMA 4H4MA 4H0XB 2WTUA 3ZETB 4O5BA 4LSLA 3NH2A 4YDUA 1NK0A 2UUCK 2FBVA 1KCFA 3G4SN 3TAQA 4TSXA 1NGIA 4NCBA 3VQ6A 3MECA 4L3QA 1P8ZA 3THVA 4FLXA 2AA4A 3OYNA 3A0IX 1W9HA 4E7HA 1RTHA 4HUGA 4DV4K 4DSEA 5KGWA 3RSEB 2HB5A 2P9PA 4IEEA 4CGJA 3C6UA 4DFKA 2XY6A 4KKOA 5AQUA 4EP5A 3I56N 3RR8A 4O8KA 1IG9A 2O8CA 4M63C 2PBDA 4AH9A 4I9QA 1WN7A 4YNQA 2HBLA 3V1RA 3DLKA 1JLFA 2HHUA 1LAVA 5AQPA 4KPYA 1U6ZA 2Q0RA 3MX5A 2P9UB 1U48A 3TAMA 5AQYA 2P5GA 3FGUA 4CD3A 3BZKA 4YFUA 1BI4A 1Z05A 4C8OA 2UXBK 4DR1K 3JAMO 4AM7A 1V4SA 1HNIA 3L2QA 1K6YA 1SKWA 1C0GA 4A5AA 3SYZA 2F4VK 2VG6A 1JLCA 3ATVA 2CGJA 3L6QA 5E41A 3V9WA 1Q18A 3KK1A 4F4KA 5GAEP 3EZ5A 1NG9A 3O9RA 3TR8A 3OS0A 4BR0A 4JI1K 3J80O 2ZF5O 4CIFA 4JN4A 1HYVA 1HUXA 2QKBA 4LH5A 1NU0A 4JNEA 4CZGA 4M3TA 2FLOA 4F3TA 1G15A 4JKEA 3H3NO 5GAHP 4BC5A 2Y1IA 2VGMA 1S22A 2OPSA 4MO4A 1EKEA 1TUYA 3CCUN 1N6QA 1MWMA 4JKGB 4JK9A 4YHHK 4DR3K 2YNHA 2UYTA 1S9GA 3OS2A 5JVGL 3E01A 3FZHA 1CLQA 3MEDA 1EWQA 3WXLA 3AO3A 2G8UA 3SAGA 5AQFA 1RILA 2YNGA 3P83D 4JD2A 4DTMA 2OANA 2HVHA 2BTFA 5FROA 2KZZA 3BP8A 1VSLA 3MN7A 1L5UA 1TVRA 3VETA 4CERA 2ZJRL 2XRIA 1RDBA 3BF3A 4CBXA 2GEMA 4W5TA 5LJVA 4MO5A 4KB1A 4FXDA 3ZEUA 3SV3A 1C0UA 4DQIA 2XY8A 4ELTA 2VQEK 4MFBA 3F5TA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5GAD P;  3I56 N;  2ZJR L;  1K8A O;  2ZJQ L;  1VQL N;  1S72 N;  1VQO N;  5GAG P;  1QVF M;  4WFB L;  3PIO L;  3CD6 N;  1W2B M;  2QA4 N;  4WFN L;  3OW2 M;  3G6E N;  1VQ5 N;  1KQS M;  1YIJ N;  3CCM N;  1KD1 O;  2QEX N;  3I55 N;  5MLC Q;  1VQM N;  5JVH L;  3DLL L;  2ZJP L;  1K9M O;  1VQN N;  3CCR N;  3CCQ N;  5HL7 L;  3CCJ N;  1YI2 N;  1Q81 O;  4IOC L;  3CC4 N;  1M1K O;  5GAE P;  4UY8 O;  4WF9 L;  2OTJ N;  1YJW N;  1VQP N;  3CMA N;  1NJI O;  3CC7 N;  4IOA L;  1YIT N;  3PIP L;  4WFA L;  5DM7 L;  1Q7Y O;  4U67 L;  1VQ4 N;  3CCL N;  1VQ6 N;  5GAH P;  3G71 N;  1VQ7 N;  3CCU N;  1Q82 O;  3CCV N;  3CF5 L;  2OTL N;  1YJN N;  1M90 O;  5DM6 L;  5H1S Q;  5JVG L;  1YHQ N;  3CCE N;  3CME N;  3G4S N;  3J7Z O;  4WCE L;  1JJ2 M;  3CC2 N;  3CXC M;  1K73 O;  1QVG M;  1Q86 O;  3CPW M;  1ILY A;  1N8R O;  3CCS N;  1OVY A;  1VQ9 N;  1VQK N;  1VQ8 N;  1KC8 O;  1YJ9 N;  4IO9 L; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OYM A;  4W5R A;  1UA0 A;  2HNZ A;  4BR7 A;  3O3F A;  4A59 A;  2RF2 A;  1K8K A;  3U8X A;  1IO2 A;  1RT5 A;  5JS1 A;  2Q3S A;  3AVJ A;  4JRQ A;  1NOZ A;  1HQU A;  5CHI A;  4KHY A;  4DFP A;  1ZBS A;  3G6E N;  3O3G A;  3TPQ A;  5KPT A;  5LMN K;  3V81 A;  3ZEU B;  2ZQB A;  1DTT A;  3Q7B A;  4OJR A;  1NK7 A;  1HYZ A;  5J2P A;  2IS3 A;  4FL9 A;  3ULE B;  4Y0W A;  3QNO A;  3HJF A;  2E4L A;  4JRP A;  2FBY A;  3PX0 A;  4CEF A;  4LF4 K;  4DFJ A;  4B9M A;  5HP1 A;  4AQY K;  2ITG A;  4M45 A;  2W6K A;  3A5L C;  3WEE A;  4B3S K;  3O4W A;  4IFY A;  5JLF A;  3RMB A;  1YVN A;  3RMD A;  3DXM A;  3VES A;  1T44 A;  4O44 A;  4CIE A;  4B9S A;  1SZ2 A;  3OJS A;  1YJW N;  3SAH A;  1OVQ A;  1BQM A;  3L2W A;  2GBZ A;  4CD1 A;  1TL3 A;  2UXC K;  5SZT A;  2A41 A;  4OPA A;  3U6F A;  2QXF A;  3F9K A;  3OS1 A;  1MU2 A;  3VQQ A;  4BC3 A;  4DQ8 A;  3FFK B;  2IDO A;  3BZC A;  1JL1 A;  3VQ4 A;  1IV0 A;  4IDH A;  1WLJ A;  1SL1 A;  4DWI A;  1C0T A;  2ASP A;  2ZWH A;  3FLC O;  3CQ8 A;  5HOO A;  3KLH A;  4H5R A;  3A5O C;  3CFO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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