3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
1YI2N 3CXCM 1VQLN 3CD6N 1JJ2M 3I55N 4WFAL 1YJ9N 1YJNN 1M1KO 1VQ5N 1YJWN 4U67L 3OW2M 4IO9L 3CCLN 3DLLL 2OTLN 1KQSM 1KD1O 5MLCQ 3CCVN 1YHQN 4WFNL 1N8RO 5DM7L 3CCMN 4IOAL 2QEXN 3CPWM 3CC7N 2ZJPL 2QA4N 1VQ9N 1VQ4N 2ZJQL 3CMAN 4IOCL 3CC2N 3CC4N 1VQNN 1Q82O 1VQ8N 1VQ7N 4UY8O 4WFBL 1NJIO 5JVHL 1Q86O 1K73O 1M90O 1YITN 3CCEN 1VQ6N 1OVYA 2ZJRL 4WF9L 3G4SN 5H1SQ 3CCQN 1K8AO 3CCRN 3CCJN 1Q81O 1VQKN 1QVFM 3PIOL 1YIJN 3CF5L 5GAGP 4WCEL 5GAEP 3I56N 5HL7L 5JVGL 3G6EN 1VQMN 3CCUN 1Q7YO 3PIPL 3CCSN 2OTJN 1ILYA 5GADP 1S72N 3J7ZO 1VQON 3CMEN 1KC8O 5DM6L 1VQPN 5GAHP 1W2BM 1K9MO 1QVGM 3G71N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LSNA 1XNRK 4Z4IA 4B3SK 4YOTA 3VQEA 1WSGA 5I9EB 5I42A 1SL1A 1HUXA 3DXKB 5FROA 4BC4A 4GMJB 4JKBA 3AVFA 1TKDA 5AR0A 1LOTB 4O8UA 5C12A 2YKMA 3DLEA 1TK5A 2YHYA 1HRHA 2VQFK 5M1OA 3U3YA 3VQAA 3MN9A 2KZMA 5EU7A 4BG8A 3KZBA 2XY5A 5MLCQ 2V7ZA 4YDUA 4RWTA 2HBJA 2A41A 2IGIA 3AARA 4K43A 4KTWA 2UYTA 3MX5A 3WQUA 2ZGZA 4N47A 3OYNA 1XWLA 1BOTO 4JKAA 3H46O 5AQGA 1Z6RA 3AO2A 2Z1HA 1D4XA 3DXMA 3M6GA 3KLHA 1BDGA 2KLAA 3L2UA 1K6YA 2Q1NA 4JKEA 4WFBL 4MLHA 3FZKA 3RMBA 3QEIA 3ZT4A 4BWMA 1SZ2A 3WNHA 4CJRA 2P9SB 1ESVA 4O0IA 4I9QA 3K58A 2YHBA 4BROA 4JK7A 3HTVA 4E1NA 2NZTA 2G8UA 2OZSA 3ZYYX 4X66K 3LALA 2E4LA 3OYHA 4WCEL 4BRHA 1QQMA 3FZMA 4B8CA 4IDHA 1XHXA 4FPAA 2P9KA 2YHWA 3THYB 3S3NA 3RMCA 2QWOA 3IKMA 4J2BA 2HOEA 3VA0A 1KLNA 2FSKA 2Q3SA 3PIPL 3M1FA 3OYCA 1NMDA 3MEGA 2A42A 5GADP 4KFBA 3NF6A 4E7KA 3O3GA 1ZC6A 3QETA 3PX0A 1CLQA 4FXDA 1NG9A 1YUWA 1LW0A 3DAWA 2VYPA 3KK7A 3M8RA 5CYMA 3PY8A 4B9VA 1RDWX 1B9FA 4BREA 3AVHA 1XMOK 3THXB 4DB3A 2E20A 4CJ4A 2HHUA 3OYKA 5CR4A 1BI4A 3CJBA 2XO7A 3C65A 4CHPA 1YAGA 5KQDA 3PO4A 2E1YA 1M1KO 1RDUA 4A5AA 3CHWA 2IVPA 1TUUA 3SK3A 2RPIA 4DHYA 5C25A 2O4GA 4FJIA 5JLHA 3KWGA 5AZJA 3UKUB 4YY3K 1HNIA 1ASUA 2OPQA 2Y1IA 1T7PA 1D9FA 3IDHA 3UB5A 3LDOA 3S9HA 4B9QA 3SZ2A 4FJGA 2O8DA 4FW2A 1ZXOA 4HCBA 2ITGA 4IOCL 1U49A 1N36K 3R8EA 3NH0A 1VQ7N 4K42A 1GLBG 5AQXA 3OYJA 2FBYA 4BR5A 3ZEUA 5H1SQ 5HRSA 3ZSVA 1T6CA 2ITMA 1BO5O 1SQKA 2A6AA 3VA3A 2HVHA 2OCEA 1ASWA 1QVFM 3U9ZA 4JKDA 2FBXA 1IV0A 3THVA 3QFUA 2VGMA 3LAMA 4CEQA 3QERA 4IJAA 4JLHA 4FWSA 3O1BA 3F9KA 3TR8A 4DLGA 4M63C 3PO5A 3EKSA 3PX6A 1XHZA 3OTOK 1J53A 2KHOA 3OY9A 3K9JA 3QEVA 2A1SA 4FM1A 1NGCA 4DS5A 4FJ8A 4NYNA 4N76A 3M8PA 3C6TA 4CK1A 1CZ9A 4AHSA 4E7HA 1T03A 4DUYK 4ILJA 1C0MA 5AQKA 4KH5A 1YVNA 2HSTA 3QNNA 2GTDA 3VGLA 3WQTA 3CJCA 5HOOA 5C0YA 3AAQA 1P8ZA 1Q8IA 2W41A 4CJQA 4DV7K 3CFPA 2VQEK 1IKYA 1Z26A 1YJNN 3S3MA 1RBRA 2O8CB 5AQFA 5FLXO 3OA9A 2OA8A 4H4MA 5AQNA 3VQQA 1VSEA 3DWLA 3HSTB 3WXJA 1KQSM 2HBMA 1KD1O 1MWMA 2FBVA 1VRTA 1BQMA 1U2VB 3A5NC 5BREA 3KVGA 3RSEA 3R1XA 4BRAA 3FLCO 4I2QA 4W5TA 2QEXN 4FVUA 4IOAL 3K59A 5LY3A 1QQOA 1NJYA 3AV9A 4MDAA 4IFYA 4JKHA 3MECA 3TANA 2AA4A 4B1YB 3V9SA 2E2NA 1RDBA 3CC2N 1A5XA 3EZ5A 4M3YA 4BVPA 4CJTA 1NOZA 2E5LK 1JLAA 5KGWA 3UE5A 4I9LA 2YNGA 2GEMA 1NU0A 3K5OA 5ADXA 3SBGA 1BA1A 4JK8A 3UKRB 3TAPA 3SV4A 3CM5A 4H0YB 3M8SA 2ZJRL 4H0XB 4H0PA 1OH8A 1ZBHA 5AQTA 4B8AB 3K0SA 4DFPA 2XY6A 4M7XA 4NO7A 2O8BB 2PFUA 2Z1GA 3TTFA 3PIOL 3VQ6A 4CERA 4Y1DA 4PL7A 3E9LA 3I56N 3VETA 1WSEA 5HLFA 1NLVA 5HL7L 5AFUA 4W5QA 1ZBLA 4IWVA 3A0IX 1LV5A 3L2RA 3WUHA 4DQSA 3ID6A 3V9WA 4BQLA 3SUQA 4JYAK 5LJVA 1A5VA 1NGGA 4KO0A 5AQWA 4QS9A 5E41A 4YFUA 1ILYA 1S72N 1RT6A 3VEYA 4NXNK 4KTZA 4CZIA 2YNHA 1KC8O 2YI1A 4J2EA 1RT4A 2D1KA 3O5BA 5DM6L 4B9MA 3GOIA 1L3UA 4FPBA 1I39A 4A59A 4H5RA 3F5TA 4CF0A 3VQ7A 4FLZA 1SAZA 4CFDA 4HTLA 3V1OA 4DV5K 1YXQA 2WBNA 3MEDA 1G99A 3AAPA 3CFOA 4AHVA 1U48A 1S1XA 3KK3A 2HF3A 1EP4A 4ELTA 3QICA 2Q2RA 2G8KA 2XY7A 1OH6A 1KVBA 1QZ6A 4H4OA 4FL9A 3HT3A 3QIOA 3DLLL 3O1WA 4BGAA 3A5MC 4CJ7A 4CJPA 3GDQA 1JLEA 5SWMA 3RR8A 4BRNA 1NKEA 3UIQA 4H8KA 4JV5K 4ISGA 2HW3A 2ETJA 1BUPA 3PSFA 3OYBA 4H0TB 3HM8A 4CJSA 4CBXA 1MA9B 5T7BA 2G8IA 2VG5A 3L4QA 4R5PA 1IH7A 3AY9A 3T69A 3GE1A 3Q7CA 4WQ5C 3ZX2A 3EO3A 2BTFA 1KAZA 3DLBA 3DYAA 4LSLA 3TTCA 5C2DA 3S41A 5KPZA 3BF3A 1DGKN 2WONA 1FKPA 4J8FA 2NRHA 5AZIA 3I8DA 1VQMN 3ENBA 1KSPA 3HP9A 2NRWA 3G10A 3AVLA 4YOXA 2B6AA 4W5RA 3CCSN 3ZT2A 1D5AA 3Q7BA 4BC5A 3W3DA 1SKSA 2DPNA 2E6LA 4DWIA 1S1TA 5HROA 1HJOA 3JAMO 4BE1A 4KKOA 1XI1A 1HJRA 4DTSA 4WYBA 5AQHA 3QIPA 3DLHA 4KHSA 4O8KA 1FXXA 4IDKA 4M3UA 3HOTA 2QK9A 4DSFA 2FC0A 4OJRA 3WXLA 2QW9A 3HM9A 2BE2A 4DF8A 4OLBA 2Z1IA 3WXKA 4LFCK 4CJUA 3VGMA 1NK5A 3ZSZA 4DTNA 5C42A 4GNIA 3K2PA 3VQ5A 3FE1A 4LF7K 4CZFA 3TAFA 3WT0A 5DM7L 3H3NO 3O3HA 4RG8A 2CH6A 1DTQA 4KHUA 1VQ4N 2GWKA 4EAHD 3LL3A 5JS2A 4DR2K 1U4BA 1HKBA 3D7EO 4O5BA 3FR0A 4JRPA 1CZAN 4KAZA 1L3VA 1BG3A 1BIZA 5F0XA 2KFNA 4E1MA 4CGJA 1M90O 3MX2A 1I94K 4OLAA 2HB5A 2P9PA 1HNWK 1GOCA 4A2BA 3EZWA 4DKWA 2QTDA 3EKUA 4Z4HA 1QQNA 3GBTA 5KI6A 3LP1A 5HRNA 2E2PA 3BDPA 2KW4A 1NK9A 5J2NA 2ASMA 4FLXA 4BE2A 3MN7A 3EY1A 2IVOA 5DMRA 4DFKA 2HNZA 3ITHA 1NGFA 4RW6A 3CCUN 2YHXA 1Q7YO 2HHTA 1W7AA 2ZD1A 4N56A 1T8EA 4I6MA 5CZ1A 5FPNA 2VGNA 1Y64A 3ENOA 2O8FB 3VPZA 4RW7A 2YV0X 1JCGA 4C8NA 4F8RA 2UUBK 4FJNA 4JI1K 3VEZA 4CJEA 3K5LA 2P9NA 3E01A 3PLAA 1YI2N 4LF8K 4CVNE 1IG9A 1KCFA 1ZBIA 4ISFA 3LPTA 3NDKA 1VQLN 4CGFA 3QEPA 1K8KB 4CI6A 4AHCA 3CJ9A 5J2QA 4DV6K 1VSKA 3SNNA 4JKFA 4LY7A 4CESA 3L2VA 1HLUA 4N5SA 2OPRA 1YJWN 3OYFA 3IAYA 1FK9A 1JLQA 4ICLA 1UAXA 4JKCA 5AQQA 2OZMA 2AJQA 4H5NA 3OYMA 4KI4A 4MO4A 1BCOA 3HXMA 2VG7A 2X6NA 2GWJA 3CCVN 4BDPA 2CH5A 4EZ6A 2P9IB 3CCMN 3O9SA 4FJHA 4G1QA 3VTHA 4O55A 3EEQA 4CK2A 3NVKA 3VERA 2UUAK 2KTQA 4CHOA 4AM6A 1P90A 1J54A 3SJJA 2YHAA 2NLXA 2GUPA 2KQ2A 1IJJA 3QFPA 4DV4K 2NNWA 5BRDA 4FLWA 3NH2A 1QHAA 3G4SN 4MFBA 3OBWA 4BR2A 3P83D 5KQ8A 4GKKK 3L4IA 2VWKA 3ZSXA 5HP1A 3OS2A 3MWTA 4DTMA 5JLFA 4DTPA 3H08A 4BRDA 4BRQA 4TSXA 3SPZA 3T1HK 4ZHRA 3CJ7A 1BIUA 4BWJA 4BGBA 3BZKA 2YX6A 3VTIA 3D6RA 3LAKA 4NXMK 3NBPA 3AA2A 4JS5A 1HYSA 4LFAK 5HRPA 2YNFA 1NNEA 2HHXA 4B1ZA 4FWKA 4KHQA 4PKHA 4MDBA 2D0AA 1NWKA 1KAYA 5JS1A 1W2BM 4BQZA 4OKKA 3TAMA 4YOWA 4DFJA 1C1CA 4HUGA 1I3AA 3T7ZA 3KD5E 1RDDA 4WE1A 3OYEA 3KJVA 4LH5A 3O8MA 1MDUB 3EE8A 3KLGA 4GV6A 3NAEA 2P9UA 3HJFA 2ZWHA 5AQMA 4JI2K 3VESA 4CHZA 2V52B 2H3GX 1HX1A 1DEJA 4IO9L 3D0PA 3SUNA 4FM2A 4DFMA 4QS7A 1E3MA 4JKGA 3MXMA 5D3GA 3C94A 1IKXA 1RBUA 1JXEA 5AQPA 4W5OA 4H03B 3F9MA 3AVNA 2OPSA 3MWPA 4Z4EA 2PAVA 4CEZA 3BP8A 3CJ1A 3P31A 3CJAA 1WSJA 4CK3A 2OPPA 5E84A 3T1YK 1S1WA 4JHDA 3ID8A 4LF4K 3VOVA 2PYJA 1ITGA 3ATUA 3O9TA 3ZT3A 4DR3K 3ULEB 2VWBA 3VQBA 4FLYA 1JCFA 3FFIA 3SMSA 4DV3K 3LDPA 3SQ0A 3J8AA 1QS4A 1IG8A 1IO2A 4JEPA 3SPYA 3CCRN 1RDAA 1U04A 1YF5L 3ZETB 4B1WB 3DLKA 4CHQA 1RT2A 3MN5A 3D45A 4CIFA 1FW6A 3V9ZA 5EVZA 2FBTA 2WOMA 3HP6A 1NK0A 1HNXK 4E7LA 5FPDA 3TSUA 4H0VB 3K5NA 4PL8A 1NJWA 4CJ5A 3O4WA 2YNIA 3F2KA 4KTQA 1LW2A 3D2EA 2QWLA 1E4GT 3LPUA 3KD1E 3QEWA 2E2OA 3KK2A 1C1BA 1ZBUA 1RTDA 3CMEN 4HUEA 1RGIA 4IEEA 4HUFA 3LM2A 4CIEA 2ZGYA 1MU2A 3C6UA 4FWLA 1T6DA 1ATSA 3I8BA 1N6QA 3MEEA 1QVGM 3OYIA 4CEDA 2HF4A 4MQ3A 1VSJA 3BGRA 1RBTA 1WAJA 2F96A 4LF9K 1VSHA 3E9PA 3D2FA 5BPLA 3KTQA 1RTHA 1VSIA 4U7BA 4WFAL 2ZE2A 2BUPA 1BQNA 2V7YA 4CJVA 1CZBA 1TYQA 1WUAA 1KTQA 1JXBA 1W97L 4NCAA 2OTLN 4BRKA 1WSFA 3SI6A 2A1RA 1JKHA 4JI5K 4OGCA 3GL1A 5EY4A 1T05A 3MCAB 4CFAA 1WB9A 3T1AA 4LF6K 4HVJA 3HSCA 2QKKA 4CGDA 4IKFA 1HQUA 4CBUA 3QNOA 3HZ6A 3AVBA 1GLLO 3IG1A 4FOEA 1BL3A 3KLIA 3FZFA 4JD2A 5AQJA 1OVYA 3FFKB 3K9KA 1TL3A 4X62K 1HNVA 2I7NA 3OJUA 3O80A 3J81O 4DQIA 4LSNA 3SAHA 1RFQA 3BZCA 3ISNC 2GBZA 4CZLA 1UA0A 3RWUA 3OYDA 4FW1A 3O3FA 2CGLA 3QBWA 3MAQA 3QINA 3V4IA 4O5FA 4FJXA 2P5OA 1QE1A 4GKJK 3VEOA 1KAXA 4ILHA 2G8VA 3WEEA 1VQON 2P51A 3TWHA 5BPMA 4B1VA 1KRPA 3ZX3A 3L3VA 1NGHA 3K57A 3DXMB 3DI6A 1VQPN 4HHTA 1C0TA 2UXDK 1S1VA 2KZZA 1IBKK 1B9DA 2JWLA 4CIGA 2G8WA 1XMQK 3CD6N 5CHIA 1RCHA 1UWBA 2D0PA 3DMJA 3HVRA 3I55N 3T3FA 4YDUC 1NK6A 1WOQA 2QWPA 2GELA 3M8QA 4KV8A 2BGGA 2IC3A 4KRFA 3MN6A 4DTUA 2P9KB 5GIPA 4DR1K 3C7NA 4EHTA 4PY5A 4FWPA 3KLEA 3MXIA 1RBSA 3VQ4A 2UXCK 5KTQA 2Q36A 4Y0WA 4LC9B 4FJLA 3ENHA 4M7YA 3M3ZA 1U6ZA 2ZJPL 2JLEA 2A5XA 1FJGK 1RT1A 1VQNN 4A2AA 4CJFA 4M45A 3L3UA 3LWMA 5JVHL 4JAXA 2RHKA 4BDZA 2J4RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YI2 N;  3CXC M;  1VQL N;  3CD6 N;  1JJ2 M;  3I55 N;  4WFA L;  1YJ9 N;  1YJN N;  1M1K O;  1VQ5 N;  1YJW N;  4U67 L;  3OW2 M;  4IO9 L;  3CCL N;  3DLL L;  2OTL N;  1KQS M;  1KD1 O;  5MLC Q;  3CCV N;  1YHQ N;  4WFN L;  1N8R O;  5DM7 L;  3CCM N;  4IOA L;  2QEX N;  3CPW M;  3CC7 N;  2ZJP L;  2QA4 N;  1VQ9 N;  1VQ4 N;  2ZJQ L;  3CMA N;  4IOC L;  3CC2 N;  3CC4 N;  1VQN N;  1Q82 O;  1VQ8 N;  1VQ7 N;  4UY8 O;  4WFB L;  1NJI O;  5JVH L;  1Q86 O;  1K73 O;  1M90 O;  1YIT N;  3CCE N;  1VQ6 N;  1OVY A;  2ZJR L;  4WF9 L;  3G4S N;  5H1S Q;  3CCQ N;  1K8A O;  3CCR N;  3CCJ N;  1Q81 O;  1VQK N;  1QVF M;  3PIO L;  1YIJ N;  3CF5 L;  5GAG P;  4WCE L;  5GAE P;  3I56 N;  5HL7 L;  5JVG L;  3G6E N;  1VQM N;  3CCU N;  1Q7Y O;  3PIP L;  3CCS N;  2OTJ N;  1ILY A;  5GAD P;  1S72 N;  3J7Z O;  1VQO N;  3CME N;  1KC8 O;  5DM6 L;  1VQP N;  5GAH P;  1W2B M;  1K9M O;  1QVG M;  3G71 N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2LSN A;  1XNR K;  4Z4I A;  4B3S K;  4YOT A;  3VQE A;  1WSG A;  5I9E B;  5I42 A;  1SL1 A;  1HUX A;  3DXK B;  5FRO A;  4BC4 A;  4GMJ B;  4JKB A;  3AVF A;  1TKD A;  5AR0 A;  1LOT B;  4O8U A;  5C12 A;  2YKM A;  3DLE A;  1TK5 A;  2YHY A;  1HRH A;  2VQF K;  5M1O A;  3U3Y A;  3VQA A;  3MN9 A;  2KZM A;  5EU7 A;  4BG8 A;  3KZB A;  2XY5 A;  5MLC Q;  2V7Z A;  4YDU A;  4RWT A;  2HBJ A;  2A41 A;  2IGI A;  3AAR A;  4K43 A;  4KTW A;  2UYT A;  3MX5 A;  3WQU A;  2ZGZ A;  4N47 A;  3OYN A;  1XWL A;  1BOT O;  4JKA A;  3H46 O;  5AQG A;  1Z6R A;  3AO2 A;  2Z1H A;  1D4X A;  3DXM A;  3M6G A;  3KLH A;  1BDG A;  2KLA A;  3L2U A;  1K6Y A;  2Q1N A;  4JKE A;  4WFB L;  4MLH A;  3FZK A;  3RMB A;  3QEI A;  3ZT4 A;  4BWM A;  1SZ2 A;  3WNH A;  4CJR A;  2P9S B;  1ESV A;  4O0I A;  4I9Q A;  3K58 A;  2YHB A;  4BRO A;  4JK7 A;  3HTV A;  4E1N A;  2NZT A;  2G8U A;  2OZS A;  3ZYY X;  4X66 K;  3LAL A;  2E4L A;  3OYH A;  4WCE L;  4BRH A;  1QQM A;  3FZM A;  4B8C A;  4IDH A;  1XHX A;  4FPA A;  2P9K A;  2YHW A;  3THY B;  3S3N A;  3RMC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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