4H5VA

Hsc70 nbd with mg
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 123
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5vA04
3WUHA 4MLHA 2Q2RA 2QWOA 3H3OB 5AZIB 5AZJB 4FL9A 1J6ZA 1X9JA 3UE5A 2IVOA 5I9EB 2Q97A 5AFUA 5AQUA 2A42A 2E2OA 5BREA 3W0LA 4HTLA 1GLDG 4BQZA 5JLFA 3B8AX 2QM1A 3KHYA 3D2FA 3H1VX 4FWQA 4B1ZA 4BRIA 4CJ7A 2P9SB 3GDQA 3O5BA 5AQJA 1BU6O 2ASMA 2BUPA 3L4IA 2GUPA 1X3MA 1NGFA 5FPMA 2E1YA 2P9UA 3ULEA 2P9NA 3MN7A 3I33A 1HLUA 3U9DA 2E2QA 3W3DA 3AAPA 3A5NC 3LDQA 2FF6A 4EIAA 1SAZA 2QWMA 4E1JA 1IG8A 1ZC6A 1YAGA 2ASPA 2CH5A 4XH1A 3DXKB 1U2VA 2P9LA 3MCPA 3GG4A 1QZ6A 4ISEA 1NGAA 2D0OA 1GLFO 1MDUB 5EX5A 3M1FA 1GLCG 3LDNA 3UKRA 3WXJA 1TYQB 2A40A 4CD3A 5BRFA 3QB0A 3BEXA 5AQOA 3WQUA 3FR0A 5LJWA 1WUAA 2QW9A 3GL1A 2D1KA 3R8EA 3ATVA 3MDQA 1LOTB 2HF4A 5JLHA 4WQ5C 4EHTA 3L6QA 3JXUA 3VF4A 2Q1NA 2NZTA 5BPNA 4H0YB 4H0XB 4L3QA 4FWPA 2CGLA 3DXMA 3SMPA 1NLVA 5AQLA 1Z05A 3IMXA 4JD2A 1ATSA 1DEJA 4BRLA 1E4FT 3EKSA 3MMVA 3C7NB 1BOTO 1GLLO 3AY9A 1YXQA 4FWKA 4A61A 1QQOA 4DCHA 5BN9A 4BVPA 2CGKA 4Z94A 4BR9A 1YVNA 4A62A 3M3ZA 1NGEA 1Q18A 4H0PA 2V7ZA 1LCUA 4DHYA 5KPZA 3D2FB 4IJNA 4MO4A 4MO5A 3CJAA 4ISGA 4B1WB 3FE1A 3KVGA 3EO3A 5CE3A 3FFKB 5BR9A 2E2PA 2P9UB 3ULEB 4CZHA 2FXUA 5BPLA 4B1XB 3HM8A 5KPRA 4CZGA 4YDUA 1T44A 1MWKA 2NLXA 2P9PB 2QWQA 4PL8A 1HKBA 4BRGA 4O8KA 4H03B 2NRHA 4XEIA 3LM2A 4CZKA 3O6WA 2P9LB 5ELZA 4KBOA 3ZX0A 3CJCA 1KAZA 2P9IA 5AQKA 4K25A 4BRHA 4H0TB 4FWLA 2VWBA 3P4IA 4DB3A 3FZMA 1GLEG 4FWNA 3CERA 3VESA 4H5WA 4I6MA 5KQ8A 3DXMB 5ADXA 1NGHA 3WXKA 4CZMA 3VGLA 3MN6A 2W41A 4IXCA 4BC3A 1MA9B 4BVOA 1NMDA 3CQYA 5KPTA 4O5FA 4FWMA 3FZHA 4J8FA 1D4XA 1V4TA 5AQPA 1K8KB 4QS7A 3VF6A 4XH4A 4CZFA 3UKUA 2E8AA 1QQNA 3ZETA 3KZBA 3EN9A 4PKHA 1YUWA 1S3XA 5AQVA 1NBWA 4GNIA 5JICA 1NGBA 4FOIA 3L0QA 3OHRA 4BR4A 2YCHA 3HZ6A 1G99A 3WXIA 4CZLA 2FSJA 2HOEA 4F9OA 2ZWHA 4K42A 4BRKA 3CJBA 3IDHA 4BQLA 4AM7A 3FGUA 5F1XA 2ZGYA 4BRNA 5AQFA 3VEOA 2P9IB 1XC3A 2A6AA 4BG8A 2VCPA 1T6CA 1QZ5A 2P9KA 1TUYA 3IFRA 4FO0A 3ZEUB 4FPAA 3O80A 3CQXA 2YJFA 3G25A 2E2NA 1RFQA 4CI6A 2YHWA 3O08A 2F9WA 2V7YA 4JN4A 1NGGA 4I6MB 5AFUH 3ID8A 3CETA 4BR0A 3WQTA 3GE1A 3HTVA 4BR7A 1C0FA 3AAQA 3EL2A 3O1WA 4M63C 2F9TA 2IVPA 5FPDA 1MWMA 1E4GT 5F0XA 5LJVA 2FSKA 1ATNA 3BP8A 1JCGA 4XH5A 5LY3A 3ZX2A 1GLJO 5F2RA 4FWSA 4C23A 5AZJA 3QBWA 2PBDA 5AQTA 4H5VA 3A5MC 3LDPA 2QWPA 2P9NB 1EQYA 2I7NA 4WQ4A 4FSVA 4FWRA 1ZBSA 4JHDA 3CJ7A 2P9SA 4EHUA 1XQSC 3WXLA 3MN9A 2KHOA 4BRFA 4YDUC 4MLEA 3VEVA 4IJAA 1U2VB 1BO5O 1BG3A 2FLOA 3HBTA 3O1BA 3U8XA 1WOQA 4FPBA 2A5XA 3A5LC 3UKRB 4M7XA 3LL3A 2H3GX 2E1ZA 3IUCA 4K41A 4CD1A 1BWFO 3ZX3A 3JS6A 1P8ZA 3DXKA 4DQ8A 4IO8A 2W40A 3QFUA 4H5RA 2P9KB 3QBXA 5JMVA 4BRQA 3FZKA 3RSEA 3BF1A 1IJJA 5AQWA 1HUXA 2UYTA 1XUPO 1KXPA 2Q36A 2D4WA 3D2EA 3HI0A 2VYPA 4JD2B 5AQXA 1NWKA 5E26A 4FOEA 4K43A 3HSCA 1JCFA 2YI1A 3CJ1A 2BTFA 3DAWA 1NGJA 3GBTA 5BN8A 4NO7A 4RCHA 4BC2A 4BRAA 4EFHA 2YHYA 2FSNA 3VEWA 4CZJA 2HF3A 3R6MA 3C7NA 2DPNA 3CIPA 3VEYA 2PAVA 1BUPA 3EZWA 2QWRA 3FZFA 4A2BA 1RDWX 5BRDA 4EAHD 1QHAA 4BC5A 1HJOA 3SJHA 2ZF5O 3DWLA 4WYBA 3UB5A 2IIRA 5BRHA 1KAYA 4H5NA 3VEXA 3VGMA 3VF2A 4RTFD 3EKUA 5AQRA 1ESVA 1ZXOA 3U4LA 2ZGZA 3QMLA 4JHDB 4AM6A 3D7EO 4RWTA 5TKYA 3QFPA 3O4WA 3SK3A 4FWOA 1HKCA 2J4RA 1HKGA 3R9PA 3SMSA 2P9PA 5AQSA 4B1VA 1TUUA 1GLBG 4BROA 2ASOA 2GELA 1HPMA 5EVZA 3DJCA 1C0GA 1U6ZA 2FF3B 2E20A 1QQMA 1Z6RA 5AQNA 2QXLA 5AQIA 3TPQA 2GEMA 5AQHA 5ADXH 3WEEA 2ITMA 4B1UB 2CGJA 4BRPA 1Y64A 2WUSA 2GTDA 4BR2A 5AR0A 3QDKA 4WQ5A 3RSEB 4BRDA 1NGDA 3H3NO 4H5TA 3H1QA 3FZLA 1DKGD 4B9QA 5FPNA 4HWIA 1SZ2A 2YHXA 3D2EB 1HX1A 5B8HA 1BDGA 4IZ9A 2OANA 3QICA 4H0OA 2A3ZA 2IVNA 4BGBA 2Q31A 2E88A 3SLCA 3CHWA 1NGIA 5AQQA 1OKJA 2QWNA 1CZAN 1H1VA 4B1YB 5KQDA 1BA0A 3FLCO 2Q0UA 4BGAA 5EXWA 5AZIA 2AA4A 3M6GA 3UKUB 3U9ZA 3ATUA 2AP1A 2CH6A 4A2AA 2EWSA 3BF3A 4NB4A 3H45C 4GY2B 3ZETB 3BUZB 3MN5A 3LDLA 4LC9B 4IWVA 3H6EA 1K8KA 1R59O 5AQZA 3A0IX 4CBXA 3O8MA 2I7PA 3WT0A 3ENOA 4WQ4C 3VEZA 3LDOA 1S22A 2HMPA 2D0PA 5EOYA 3VOVA 4Y0WA 2GWJA 4PKIA 4CBUA 4BRMA 5E84A 4CBWA 2YJEA 4M7YA 1JCEA 1GLAG 4JNEA 5AQMA 4BC4A 1V4SA 4H0VB 3CJ9A 2QWLA 3A5OC 2V52B 1NGCA 1DGKN 1ATRA 2A41A 3ENHA 1TYQA 1SQKA 4PKGA 4QS9A 4QS8A 3VPZA 4PL7A 3I8BA 3VETA 3WEEB 1RGIA 1X3NA 2GWKA 3AARA 3H46O 5EY4A 3F9MA 1T6DA 4ISFA 4JAXA 4BR5A 3J8AA 3ZEUA 5BPMA 2Q0RA 1BA1A 5FPEA 3VERA 3MK6A 2V51B 3LM9A 3VGKA 1KAXA 5AQGA 3CI5A 1NM1A 4BREA 4BG9A 4CZIA 3VENA 3C0BA 3GOIA 4BRCA 3TU5A 5AQYA 4CZEA 3A8YA 3S41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E4LA 2Q2RA 4K8XA 1LWCA 5AZIB 1J6ZA 1ZYVA 5BREA 3NGIA 1WSEA 4HTLA 2P5OA 1GLDG 3DLGA 4JI4K 5JLFA 4FYDA 3AGKA 1U48A 4KTWA 3KHYA 1RT6A 4FWQA 4B1ZA 2GBZA 4BRIA 2ASMA 1NK0A 2BUPA 3TTFA 2GUPA 4YOVA 4ILHA 3IRXA 1HLUA 3W3DA 3A5NC 4N56A 4F3TA 1NPIA 1SAZA 4YOWA 1TAUA 4KFBA 1IG8A 3CFOA 1ZC6A 1YAGA 1BK8A 4B9TA 1SEGA 4XH1A 2IC3A 5KI6A 1K8BA 4ID1A 3VQBA 2YILA 4FLVA 1S9EA 1GLFO 1T7BA 2I5JA 4DU4A 1HNZK 2ZQBA 3UKRA 1TYQB 4B3RK 2A40A 3TAFA 3SUOA 1Q86O 1I39A 2JWLA 3FR0A 3GL1A 3RVCA 5JLHA 3KLIA 1WN7A 4KHUA 3CC2N 3L6QA 3JXUA 3CM5A 2OZSA 5GAHP 5BPNA 4L3QA 2G8WA 3SV3A 1AYJA 5I3UA 4J2AA 3DXMA 3SMPA 1NLVA 4PUOA 1K73O 4JD2A 1ATSA 1DEJA 1C0UA 2HNYA 1E4FT 4BRLA 1U45A 1MR4A 1BOTO 3CG7A 3J80O 1GLLO 3E66A 4A61A 1NKEA 3SPYA 3V9ZA 1TKTA 4UADE 2YKNA 4OKKA 3PY8A 1ZYQA 4F4KA 4BR9A 4O0IA 2PY5A 3MX2A 2X6NA 3K58A 5M1FA 1Q18A 4H0PA 2V7ZA 4DSEA 3OYIA 1TKXA 3VQ6A 1WSJA 4CVNE 3CJAA 4IOCL 4B1WB 1JXEA 1YJWN 5CE3A 1VSFA 4N76A 4B1XB 4DV6K 2KZZA 4FJLA 3HM9A 2P9PB 4KV8A 1T7AA 2LY5A 4ILJA 4O8KA 1HNWK 4XEIA 3L2RA 3HPHA 4DV2K 3T69A 3O4QA 3E1YA 5BR8K 4IDHA 4KBOA 1YJ9N 3ZSVA 3Q7BA 3OVNA 3CPWM 3CJCA 2WONA 1QE1A 4DF4A 1JZAA 1M1KO 3LALA 4H0TB 2HSTA 3NMUA 3BY5A 1NK5A 1RT5A 4DQSA 4YOXA 3PX4A 2LT8A 2C1IA 4PHTX 3P1GA 3FZMA 1C1CA 4CW7B 4CJVA 2LY6A 5CZ1A 3VESA 4C1NI 5D3GA 3ALYA 3DXMB 4CFBA 5ADXA 3K2PA 2A1SA 4CZMA 4BE7B 3VGLA 4MFBA 1DTTA 1EKEA 3J7YP 2LJMA 2Q3SA 5DK5A 4XJXA 4OKJA 3FZHA 2NY9X 1EXQA 1V4TA 5C0YA 5IT9O 3THXA 3T7ZA 5J2NA 3ISNC 3NFAA 3CQ8A 1NMNA 4DF8A 4CZFA 3OS1A 3A2FA 4DFKA 3UKUA 2X74A 1JKZA 4E89A 1QQNA 4H4MA 1TGOA 3AVIA 3K59A 3RRHA 5LMNK 1YUWA 1CZBA 5JS1A 1BCMA 4GNIA 1CN2A 1X1PA 3AVHA 4Z0UA 3MCAB 4FW1A 3OHRA 4BR4A 4HUGA 4FM0A 2KFNA 2FSJA 5CY4A 3OYFA 4K8ZA 3K9KA 4RW8A 1SN1A 5F1XA 2KFZA 4CJWA 2WC9A 4BEBA 1XC3A 4BG8A 2VCPA 5KTQA 3NAEA 1VQ5N 3IFRA 4FO0A 3ZEUB 3O80A 3C94A 3F5TA 4LFBK 1IKWA 3G25A 4CGGA 4CEDA 4QAGA 3LPTA 3WNHA 3KOZA 3GE1A 1L4VA 1LQHA 1UOCA 4YOTA 2OZMA 3CXCM 2VG7A 5A2QO 2F9TA 3AVLA 2VGMA 2IVPA 3OBYA 2VQFK 2QEXN 3I0RA 3TAPA 2B68A 4HUFA 3CW4A 1ZBHA 3LP2A 1VNBA 3GKUA 1GLJO 1W0HA 5F2RA 3THXB 4FWSA 1N5YA 3RR7A 2HHTA 4CJ3A 3QBWA 4E1MA 2PBDA 3DRRA 1KVCA 2MZ0A 2B4JA 1EQYA 1YF5L 3MEGA 4FWRA 3RTVA 4JHDA 2DFEA 3OYEA 3MN9A 2KHOA 1J54A 3MXIA 4MLEA 3VEVA 4UAFE 4FJ8A 1A5VA 4DR2K 4FPBA 4DS5A 2A5XA 3OJUA 2YNIA 4QOZB 3A5LC 4MQ3A 4K41A 4CD1A 3P5JA 3LAMA 2D0BA 3AVAA 4CJFA 4DTXA 1LWEA 2DTUA 4CK2A 3SNNA 3QBXA 2KKZA 3PIOL 3TAQA 4FJIA 4FJ5A 4CFAA 2UYTA 1XUPO 1KXPA 4EP5A 3MEDA 2D4WA 3D2EA 2HHWA 1NWKA 4K43A 4LH5A 4FZZA 2D5RA 3CJ1A 3CPEA 1CXQA 2BTFA 4AEIA 3VQ8A 3OYAA 2OTLN 5BN8A 1VSKA 3PLAA 1I3AA 2FSNA 4DV3K 5M1OA 1A5WA 3C7NA 3CFPA 4DLEA 3CCUN 2LJ7A 3EEQA 4JK9A 3U6FA 3VEYA 2G8HA 4AILC 4PY5A 1VQKN 1TAQA 1U4BA 2E2FA 1RDWX 1SN4A 4BC5A 3P38A 1YIJN 2NNWA 4WYBA 1DLOA 3UB5A 3DLBA 2IIRA 4H5NA 3VGMA 4B9SA 3VF2A 2NRZA 1GOBA 4E7JA 3M8RA 1ZXOA 2O8BA 1B3CA 3QMLA 4JHDB 4AM6A 2E3FA 1WWNA 3HRGA 1RT4A 4FJ9A 3SK3A 4FWOA 1HKCA 2J4RA 3C6TA 4CFCA 1KLNA 2FBTA 4FJJA 3ID6A 4DFPA 1XC9A 1FJGK 4DQIA 2KTQA 3NGYA 1WBDA 5FRMA 4JYAK 1U6ZA 4WFBL 1S72N 1VQPN 1QQMA 4CHQA 4M3UA 3CF5L 2HVHA 3MWTA 4B1UB 4BRPA 1Y64A 4BR2A 2N2RA 2M8BB 4H5TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E4L A;  2Q2R A;  4K8X A;  1LWC A;  5AZI B;  1J6Z A;  1ZYV A;  5BRE A;  3NGI A;  1WSE A;  4HTL A;  2P5O A;  1GLD G;  3DLG A;  4JI4 K;  5JLF A;  4FYD A;  3AGK A;  1U48 A;  4KTW A;  3KHY A;  1RT6 A;  4FWQ A;  4B1Z A;  2GBZ A;  4BRI A;  2ASM A;  1NK0 A;  2BUP A;  3TTF A;  2GUP A;  4YOV A;  4ILH A;  3IRX A;  1HLU A;  3W3D A;  3A5N C;  4N56 A;  4F3T A;  1NPI A;  1SAZ A;  4YOW A;  1TAU A;  4KFB A;  1IG8 A;  3CFO A;  1ZC6 A;  1YAG A;  1BK8 A;  4B9T A;  1SEG A;  4XH1 A;  2IC3 A;  5KI6 A;  1K8B A;  4ID1 A;  3VQB A;  2YIL A;  4FLV A;  1S9E A;  1GLF O;  1T7B A;  2I5J A;  4DU4 A;  1HNZ K;  2ZQB A;  3UKR A;  1TYQ B;  4B3R K;  2A40 A;  3TAF A;  3SUO A;  1Q86 O;  1I39 A;  2JWL A;  3FR0 A;  3GL1 A;  3RVC A;  5JLH A;  3KLI A;  1WN7 A;  4KHU A;  3CC2 N;  3L6Q A;  3JXU A;  3CM5 A;  2OZS A;  5GAH P;  5BPN A;  4L3Q A;  2G8W A;  3SV3 A;  1AYJ A;  5I3U A;  4J2A A;  3DXM A;  3SMP A;  1NLV A;  4PUO A;  1K73 O;  4JD2 A;  1ATS A;  1DEJ A;  1C0U A;  2HNY A;  1E4F T;  4BRL A;  1U45 A;  1MR4 A;  1BOT O;  3CG7 A;  3J80 O; 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