4H5VA

Hsc70 nbd with mg
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 123
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5vA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5vA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5vA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5vA04
5AQMA 4MO4A 3QICA 3RSEA 3VF6A 3FZLA 1HUXA 2ASPA 2FSKA 3KVGA 5AQNA 2YCHA 3CJ9A 3LDLA 4WQ5C 4M63C 3M1FA 4M7XA 1RDWX 1ATNA 3ZX3A 4DQ8A 3CIPA 3VEYA 1LCUA 4CZEA 5JLFA 2ASMA 1KXPA 4O8KA 2A40A 4H0TB 3GE1A 4BRPA 3R9PA 2QWMA 3B8AX 4QS9A 1HKBA 3CJBA 1KAYA 3KZBA 3J8AA 5AQQA 3HTVA 4BRIA 5F1XA 2QXLA 1XUPO 2GEMA 4H5TA 5AQFA 3ENOA 5FPNA 4ISEA 4BRGA 3EZWA 2D0OA 5BRFA 4Y0WA 3C7NB 2FLOA 4H0OA 1R59O 3VOVA 3L6QA 2HF3A 3F9MA 4MLEA 4CZKA 3DXMA 5AFUA 1QQOA 4B1WB 5AZIB 3U8XA 1JCEA 1Z05A 2YHWA 4BRLA 4NB4A 3EO3A 4EHUA 5F2RA 3VF2A 1JCFA 2ZGZA 2FSJA 4WQ4C 2V7YA 4IXCA 3UKUB 1NM1A 2D0PA 3FZMA 4A2BA 5KPRA 3EL2A 4CZLA 5LJWA 5JLHA 5TKYA 1WOQA 3DXKA 4FWPA 2QWRA 3LM9A 2P9PB 1NBWA 4BC4A 3VGKA 2P9SA 4BGAA 3VENA 3IUCA 4PL7A 3O08A 1U2VA 3UKRB 3CETA 5LY3A 2VWBA 2PBDA 4FL9A 3GOIA 3M6GA 1YUWA 1U6ZA 5LJVA 3R8EA 2HF4A 1WUAA 4BRCA 4BG9A 4GNIA 3LM2A 4BRMA 2P9NA 2YHXA 3WXKA 4IWVA 3AARA 3BEXA 3BF1A 4RCHA 3VETA 4DHYA 5ADXH 3FZFA 4BVPA 3MCPA 3ID8A 2H3GX 2P9UA 2Q0RA 3G25A 3GBTA 3QDKA 4B1UB 1SAZA 3ATUA 2GELA 3H3OB 2A41A 1X9JA 3LDPA 3FLCO 2V7ZA 4JHDA 4RTFD 4FWSA 3ZETA 5AZJB 4BR4A 4KBOA 4EHTA 3WUHA 1E4FT 1BU6O 2A6AA 4FPBA 3HBTA 4J8FA 1ATSA 3HSCA 3VEOA 5ADXA 1CZAN 2V51B 1GLJO 3LL3A 4FWQA 3DXKB 4H0YB 3EKUA 4MLHA 4A62A 3CQXA 1YVNA 3O5BA 3AAPA 1QQNA 3WXIA 1NGEA 1NGGA 4FWKA 3UB5A 2QM1A 1RFQA 2ASOA 5AQRA 2ZWHA 4B1VA 4DCHA 2E2NA 3ZEUB 4BC2A 1BA0A 4BQLA 3LDNA 1NGHA 3WEEA 4FWNA 4FWRA 5BN9A 4K43A 2QWNA 4H5VA 2VCPA 1GLLO 4JN4A 5JICA 2P9NB 4BR0A 1ZC6A 3VESA 4BR2A 4H5RA 1KAXA 3D7EO 2F9TA 3ZX0A 2V52B 5EY4A 5BPLA 3DWLA 2P9LA 3U9ZA 2Q31A 1LOTB 3W3DA 3LDOA 4BRDA 3I8BA 3EKSA 3MMVA 2Q0UA 5KPZA 4CD1A 4XH5A 4MO5A 2P9KA 3FR0A 1GLBG 3CJ7A 2QWLA 1TYQB 3BUZB 1KAZA 4AM6A 5AQKA 2CGLA 2Q2RA 1E4GT 3VGMA 5E26A 2AA4A 4AM7A 3QFPA 3VF4A 4FO0A 4BRHA 3D2EA 1QZ5A 4XEIA 3SJHA 5BRHA 1C0FA 5BN8A 4C23A 1OKJA 4BQZA 1GLCG 4CBXA 4CZFA 4BROA 4CBWA 5I9EB 2QWOA 2P9IB 1NLVA 3KHYA 1D4XA 1GLFO 2I7PA 3HZ6A 3RSEB 1XC3A 5AQHA 1NGCA 2GTDA 2Q97A 1IJJA 3QB0A 3IFRA 4A2AA 4WQ5A 2J4RA 2W41A 3O1BA 1P8ZA 1X3NA 4I6MA 5E84A 1S3XA 1BUPA 3DJCA 1SQKA 4FOEA 2CGKA 4FOIA 3ENHA 2P9LB 1HKCA 4GY2B 5AQIA 3ATVA 2ZF5O 3VEZA 4PKGA 3LDQA 4IJAA 3O6WA 4FWOA 1BO5O 3VGLA 2A42A 1K8KA 5BRDA 1ATRA 4PKHA 2FSNA 3ULEA 5AQUA 3TPQA 1NGIA 4EIAA 1HX1A 3JXUA 4Z94A 1Q18A 2YHYA 1BDGA 3QBWA 4B1YB 3DXMB 4CBUA 3QFUA 1MA9B 2E2PA 1G99A 3A8YA 2NRHA 5AQOA 3TU5A 2BUPA 2Q36A 4BRAA 3MN9A 1NGJA 4BRNA 3A5OC 4L3QA 4IZ9A 1NGFA 1NGAA 1NMDA 1MWKA 4ISFA 1Y64A 5KQ8A 5ELZA 4WQ4A 4BGBA 2CH6A 3WT0A 3AY9A 3QMLA 2IVOA 3H3NO 3A5MC 3JS6A 3WXLA 1YXQA 3CHWA 1C0GA 3EN9A 5FPMA 4YDUC 2P9SB 3GL1A 3FE1A 1T44A 3H1QA 5AQGA 1EQYA 2E2QA 3VEXA 4BR5A 1U2VB 1ZBSA 1T6DA 2HOEA 5JMVA 1TUUA 2YI1A 3SK3A 2VYPA 3MN6A 3MK6A 2E1ZA 4IO8A 3CERA 3H45C 4K25A 1SZ2A 2Q1NA 3I33A 4CI6A 1YAGA 1HPMA 2QWQA 3C0BA 4LC9B 3C7NA 3ULEB 4BRQA 3FGUA 4XH1A 4BRKA 3GG4A 3MN5A 3WQTA 4DB3A 4E1JA 2P9UB 4M7YA 5AZIA 5BPMA 3ZX2A 3P4IA 2D4WA 4JHDB 3S41A 1BA1A 5AR0A 3UKUA 5FPEA 3ZETB 1J6ZA 5AQLA 2W40A 3MN7A 3O1WA 3VEWA 1HKGA 4B1ZA 2E1YA 5AQJA 4EFHA 4CZGA 1JCGA 2FF3B 2P9PA 2KHOA 2IVPA 4B9QA 1ESVA 1H1VA 5B8HA 5AQYA 3W0LA 1MDUB 1V4TA 4QS8A 5AQSA 4YDUA 3R6MA 4CZMA 3O80A 2HMPA 1RGIA 3D2FA 5AQTA 2E8AA 2GWKA 2CH5A 3UKRA 3AAQA 3FZHA 5AFUH 3VPZA 4BRFA 2E88A 2I7NA 1DGKN 5AQPA 3H1VX 4PKIA 3FFKB 4FPAA 4K41A 4BVOA 1BOTO 5KPTA 4QS7A 3SMSA 4XH4A 3QBXA 3WEEB 1ZXOA 4FWMA 2ITMA 4CJ7A 3UE5A 3CJ1A 1X3MA 4HWIA 1NGBA 2ZGYA 4ISGA 3HM8A 4A61A 5AQWA 2QWPA 2CGJA 4JD2A 2EWSA 1DKGD 4H5NA 2QW9A 4HTLA 3O8MA 5AQXA 1IG8A 3WQUA 2IIRA 2GUPA 3A5NC 5AZJA 1V4SA 4O5FA 3U9DA 4H5WA 3VERA 3HI0A 4FWLA 4BR7A 4CZHA 2P9KB 1DEJA 2AP1A 3MDQA 5EXWA 2OANA 2DPNA 1QQMA 5EVZA 3A0IX 4IJNA 1HJOA 3A5LC 3L0QA 3D2EB 5AQVA 3SLCA 1Z6RA 2WUSA 3D2FB 3GDQA 1GLAG 2IVNA 5EOYA 4JNEA 3H6EA 3ZEUA 3VEVA 3CQYA 5BR9A 3BF3A 4WYBA 3L4IA 5EX5A 2F9WA 5FPDA 4EAHD 4RWTA 5CE3A 4H03B 2PAVA 1QZ6A 4I6MB 3CJCA 2A3ZA 4H0VB 4CZIA 4JD2B 4F9OA 2E2OA 1NGDA 4H0XB 3DAWA 2YJEA 2GWJA 1NWKA 4PL8A 5KQDA 4B1XB 3FZKA 2D1KA 1QHAA 3H46O 3O4WA 2FF6A 4BC3A 4JAXA 1GLEG 3IDHA 5BREA 1TYQA 4CD3A 5AQZA 1TUYA 4H0PA 3CJAA 3U4LA 2YJFA 1MWMA 1T6CA 1K8KB 2E20A 1BWFO 3BP8A 4NO7A 4BR9A 5BPNA 2NZTA 4BG8A 4CZJA 4FSVA 3SMPA 1GLDG 3IMXA 1BG3A 3CI5A 3WXJA 1S22A 1HLUA 4K42A 3M3ZA 2FXUA 3OHRA 5F0XA 2A5XA 2UYTA 1XQSC 4BC5A 4BREA 2NLXA 2P9IA 2BTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SUQA 3RSEA 1NOZA 3FZLA 1HUXA 1RT2A 5AQNA 3NGZA 3SBGA 1D9FA 1XRSB 1VQMN 4WQ5C 1ZU3A 4FJ5A 4M7XA 1BK8A 1RDWX 4AHRA 3DYAA 3ZX3A 3CIPA 4CJWA 5AJ3K 3LDSA 2A40A 5GIPA 4H0TB 4ILGB 3B6PA 3GE1A 1DJTA 1QSYA 4DLEA 2VQFK 4K0KK 1VQ6N 4IFYA 4JKAA 3O9UA 3KZBA 2Y1IA 1XC9A 3AVHA 1VNAA 3HTVA 4E1NA 3TTCA 5D3GA 1T3VA 5DM7L 4JK8A 4MFBA 4LH5A 4ILJA 4ISEA 3SUNA 3AV9A 4YORA 1ZBFA 2NRWA 3Q7CA 4V1DC 3CCVN 4UAFE 3NCIA 4CZKA 3BZCA 1RCHA 1JLEA 3KK3A 1JXEA 4BRLA 3N4QA 3OYEA 4FK4A 3K5NA 3UKUB 3QI7A 4M3UA 3AVCA 3SCXA 5KPRA 1VQPN 1QVFM 2UXBK 1I94K 5C0YA 4LD0A 4HUGA 3LZIA 3KC6A 4K8XA 1XNRK 5LJWA 1W9HA 4OLAA 5C25A 3DXKA 1U48A 2QWRA 4I7FA 3TTFA 4ICLA 4HCCA 3VGKA 2P9SA 3RMBA 3OY9A 2FC0A 4PL7A 4DSFA 1LWFA 2N66A 3KKRA 3T1HK 4M3YA 4U7BA 4CEOA 2VWBA 1BCMA 2NY9X 1BI4A 1NH5A 4B3TK 4FVUA 4FL9A 3GOIA 3CM6A 2O8EA 4BEBA 3NMUA 2HHTA 3F73A 3LM2A 4KI6A 2P9NA 4NCBA 3TR8A 3NBPA 4DHYA 3L4QA 3SYZA 3IAYA 3SV4A 1TK5A 3CF5L 4CIEA 4NCAA 1DQ7A 1WSFA 2WONA 1KV0A 5CHIA 5HBMA 2EHGA 3KOWA 1XWLA 3PSIA 4CFDA 4FWSA 3ZETA 4BR4A 1LWEA 3HP6A 3NDKA 1E4FT 3PV8A 1BU6O 4NCGA 2A6AA 4FPBA 3RRGA 4J8FA 3HSCA 2IGIA 2KQ2A 3O4QA 1GLJO 3QO9A 4JV5K 4C8NA 3R1XA 4DSLA 4KB0A 3D0PA 5J2QA 1NGGA 3MXMA 4FWKA 1KQSM 3LPTA 4CEBA 3UB5A 3ZSRA 2PYJA 5C10A 3O4NA 2VWJA 2ZWHA 3HO1A 4DV0K 2KFNA 4DQSA 3V9XA 4KO0A 4KFBA 1VSIA 1BA0A 4JKHA 3TABA 1FW6A 3WEEA 2NY8X 3CFOA 5KGXA 1EP4A 4FWRA 1RDAA 3E7RL 3AO5A 5JICA 2XY8A 5HL7L 3VESA 4H5RA 4FJNA 3SUOA 5EY4A 1KLNA 3DWLA 3ZT2A 1WNSA 1QQCA 3LDOA 1JKZA 4AHSA 1T7EA 4DSEA 4CE9A 3MMVA 4AAZA 1CLQA 2DFHA 4I9QA 5KRSA 3TARA 2IOCA 3SAHA 2MN5A 4HHTA 3TAGA 1WAFA 4DFKA 4JK7A 2Q2RA 1E4GT 3VGMA 5E26A 2I61A 3CCMN 4FO0A 3D2EA 3MXJA 1REVA 1C0FA 1BMRA 4AILC 1OKJA 4M41A 5H1SQ 5CYMA 3HVRA 4BROA 4CBWA 3SQ1A 1N6QA 1WSIA 3HZ6A 2GTDA 2P51A 2Q97A 1B9FA 3IFRA 1RT6A 4E7IA 4KHYA 4HE7A 2N2RA 3E9OA 1K6YA 1X3NA 4I6MA 1S3XA 5JVHL 1NJWA 4FOEA 3AVAA 3SQ2A 4CJKA 3J80O 3CYGA 3SAFA 1IKYA 3HP9A 4AHUA 3BZKA 4W5RA 1QSSA 3NF6A 4JKBA 3LDQA 3JAMO 4IJAA 3CMAN 2RPIA 1L4VA 4DV3K 4CGFA 1YITN 4LF4K 4CJEA 4B3OA 3OYGA 4Z4FA 2GBZA 4DTSA 2E6LA 4EIAA 4BE0A 1BCGA 1HX1A 4FLUA 1C0UA 1W7AA 1BDGA 3DXMB 1MA9B 2NRHA 5AQOA 2VGMA 3TU5A 1I2VA 1SKWA 1S1VA 3F5TA 2BUPA 4BRAA 4LF6K 3MN9A 4JKEA 4L3QA 4B3SK 1MWKA 2X74A 2YC1C 1G15A 4WQ4A 1TVRA 2CH6A 1WSJA 4W5QA 4ZTFA 3U3GA 3H3NO 4IKFA 3T7ZA 2PY5A 2BRZA 1YXQA 5JENA 3EN9A 4CJ4A 5FPMA 3I55N 2OTLN 3GL1A 2P5GA 5AQGA 3VEXA 1U2VB 5C12A 1SN4A 1SV5A 3CCJN 1N36K 5JMVA 3QINA 2VYPA 2E0HA 3E01A 4H4MA 3G10A 2E3FA 1HYVA 4K25A 3SQ0A 1SZ2A 2Q1NA 4LSNA 1YAGA 2QWQA 3O9TA 3C0BA 1BL3A 4MDAA 2LY6A 1Q9YA 3S9HA 4A57A 1KCFA 1ASUA 3KK7A 1XMQK 1T7AA 4E1JA 4M7YA 5AZIA 3VQ6A 2G8KA 2Q3SA 3G71N 4ZHRA 4KHUA 4JHDB 1ZYWA 2O8CA 1RBSA 2QK9A 1HKGA 4B1ZA 2E1YA 2BDPA 4CZGA 1T7BA 4LFBK 1NU0A 2FF3B 1ICAA 1YVUA 2P9PA 1H1VA 2F8TA 1MDUB 5AQSA 4YDUA 3R6MA 4CZMA 2E8AA 2CH5A 3AAQA 5AFUH 2YHBA 3VQDA 3F2KA 1LAWA 5AQPA 1ASWA 3H1VX 2HHSA 4BVOA 5KPTA 3SMSA 1VSFA 3K5OA 4LSLA 5KRTA 3HXMA 3CCLN 4DUYK 3Q7BA 3K9JA 3CC4N 4B3MK 4A61A 5AQWA 1RT5A 1WSGA 2IAJA 3S3NA 2NRRA 5E41A 3GKUA 4KHWA 2QW9A 5AQXA 2HVHA 1NK0A 4IEEA 4DTXA 3VN5A 2OPRA 3NHGA 4U67L 4DV7K 2AJQA 3HPHA 4RW7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SUQ A;  3RSE A;  1NOZ A;  3FZL A;  1HUX A;  1RT2 A;  5AQN A;  3NGZ A;  3SBG A;  1D9F A;  1XRS B;  1VQM N;  4WQ5 C;  1ZU3 A;  4FJ5 A;  4M7X A;  1BK8 A;  1RDW X;  4AHR A;  3DYA A;  3ZX3 A;  3CIP A;  4CJW A;  5AJ3 K;  3LDS A;  2A40 A;  5GIP A;  4H0T B;  4ILG B;  3B6P A;  3GE1 A;  1DJT A;  1QSY A;  4DLE A;  2VQF K;  4K0K K;  1VQ6 N;  4IFY A;  4JKA A;  3O9U A;  3KZB A;  2Y1I A;  1XC9 A;  3AVH A;  1VNA A;  3HTV A;  4E1N A;  3TTC A;  5D3G A;  1T3V A;  5DM7 L;  4JK8 A;  4MFB A;  4LH5 A;  4ILJ A;  4ISE A;  3SUN A;  3AV9 A;  4YOR A;  1ZBF A;  2NRW A;  3Q7C A;  4V1D C;  3CCV N;  4UAF E;  3NCI A;  4CZK A;  3BZC A;  1RCH A;  1JLE A;  3KK3 A;  1JXE A;  4BRL A;  3N4Q A;  3OYE A;  4FK4 A;  3K5N A;  3UKU B;  3QI7 A;  4M3U A;  3AVC A;  3SCX A;  5KPR A;  1VQP N;  1QVF M;  2UXB K;  1I94 K;  5C0Y A;  4LD0 A;  4HUG A;  3LZI A;  3KC6 A;  4K8X A;  1XNR K;  5LJW A;  1W9H A;  4OLA A;  5C25 A;  3DXK A;  1U48 A;  2QWR A;  4I7F A;  3TTF A;  4ICL A;  4HCC A;  3VGK A;  2P9S A;  3RMB A;  3OY9 A;  2FC0 A;  4PL7 A;  4DSF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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