2CH5A

Crystal structure of human n-acetylglucosamine kinase in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
344
Chain Sequence
PQFMAAIYGGVEGGGTRSEVLLVSEDGKILAEADGLSTNHWLIGTDKCVERINEMVNRAKRKAGVDPLVPLRSLGLSLSGGDQEDAGRILIEELRDRFPYLSESYLITTDAAGSIATATPDGGVVLISGTGSNCRLINPDGSESGCGGWGHMMGDEGSAYWIAHQAVKIVFDSIDNLEAAPHDIGYVKQAMFHYFQVPDRLGILTHLYRDFDKCRFAGFCRKIAEGAQQGDPLSRYIFRKAGEMLGRHIVAVLPEIDPVLFQGKIGLPILCVGSVWKSWELLKEGFLLALTQGRAQNFFSSFTLMKLRHSSALGGASLGARHIGHLLPMDYSANAIAFYSYTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of Human N-Acetylglucosamine Kinase in Two Complexes with N-Acetylglucosamine and with Adp/Glucose: Insights Into Substrate Specificity and Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords NAGK PROTEIN
total genus 113
structure length 344
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2ch5A02
5F2RA 5JICA 3KHYA 3VF6A 4DCHA 1KXPA 3ZX0A 2FF3B 3J8AA 3H3NO 5AQKA 3TU5A 3VF4A 1QQMA 3IFRA 5ELZA 5AZJB 4B1VA 3DAWA 2NLXA 1TUUA 1NGEA 3M3ZA 4QS7A 5BN8A 2QM1A 1NGBA 4H5NA 2QWQA 4BRAA 1ZXOA 4FSVA 3VEXA 4BGAA 3CJBA 5AQJA 4JD2A 1ATSA 3ZEUA 1QZ5A 4BQLA 3MN7A 5EY4A 1GLFO 3ULEA 3FE1A 3CIPA 3CJ9A 2I7PA 1KAXA 1LOTB 4XEIA 5LJWA 3KZBA 3VGMA 1GLLO 4IJNA 3U9DA 4H5TA 4ISEA 1X3MA 4H0TB 4BRFA 2CH5A 1RFQA 3CJ1A 2PAVA 4BRCA 3CQYA 1K8KA 2V7YA 3A5OC 4BRIA 4FPAA 3WUHA 5AQXA 2UYTA 3UKUA 4A2BA 3MN6A 3GOIA 5F1XA 3HM8A 5F0XA 2E20A 4BR9A 5AFUH 1HLUA 3ATVA 3BEXA 1NGCA 5EOYA 1HKBA 4EFHA 4BG9A 4GY2B 3FLCO 5AQWA 4BREA 4CZHA 1T44A 3B8AX 4FWPA 1LCUA 4FO0A 2D0PA 3VF2A 5EX5A 1CZAN 2D0OA 4CZLA 2YHXA 4IWVA 5BPMA 2E2NA 2FSKA 2E2QA 4H5VA 4H0OA 3ZX2A 1XQSC 2EWSA 1H1VA 2HMPA 1E4GT 2QW9A 3GBTA 4PKIA 4WYBA 3SLCA 5KQDA 2Q0UA 5AZJA 4BRLA 5FPMA 1TYQB 3CERA 3A8YA 4CZJA 3F9MA 5AQGA 3TPQA 5AQUA 5I9EB 3O80A 3A5LC 5AQPA 2A3ZA 4J8FA 2GEMA 5AQNA 1QQOA 1NGDA 3O4WA 5AQTA 4CBUA 1GLBG 3H1QA 2E2PA 1GLEG 3BF1A 3QMLA 3AAPA 3LDOA 1NGIA 4IZ9A 4BR5A 2F9WA 3MN9A 5LY3A 3O1BA 3R8EA 2P9KA 3BF3A 1NLVA 1NGJA 2P9UB 5AZIB 5E26A 2ZF5O 3VENA 1NGFA 1ATNA 1BA0A 2ITMA 1ZBSA 3S41A 4MLEA 4RWTA 3DWLA 3VGLA 5AQLA 5EVZA 4K41A 4Y0WA 4JAXA 3RSEB 3DXKA 3HBTA 2I7NA 4K43A 4KBOA 1T6DA 2A42A 5BREA 4AM7A 4JN4A 3GE1A 1DGKN 1Q18A 2QWLA 3GL1A 3QFUA 5CE3A 3WXKA 3M6GA 3C7NB 5ADXA 4A61A 1ZC6A 1XC3A 2YCHA 3MDQA 1JCFA 3HZ6A 5BN9A 2HOEA 5BR9A 4XH5A 5AQVA 2W40A 5JLHA 1ESVA 4FOEA 4FPBA 3VESA 4HTLA 1OKJA 3FZLA 3ZX3A 4DHYA 3VOVA 2Q2RA 3OHRA 3WQTA 3LDPA 2E1YA 3EO3A 4FWOA 4PL7A 5AQOA 2A40A 3LDNA 1TYQA 2Q31A 4M63C 1XUPO 5AQIA 1R59O 4GNIA 4B1XB 5AQFA 5B8HA 2AP1A 4PKHA 5AQZA 2NZTA 4FWSA 1HPMA 2P9KB 1V4SA 2P9IB 1GLDG 2VWBA 3JS6A 3CJAA 2YJFA 5FPEA 1YVNA 4ISGA 4FWKA 2A41A 4EIAA 4JHDB 4PKGA 4RCHA 5AZIA 2P9UA 3ENHA 2AA4A 3DXKB 3VEYA 3CQXA 1SQKA 3QB0A 5KQ8A 3ZETB 1E4FT 3SMPA 3O6WA 4MLHA 1HX1A 1Z05A 1QZ6A 4QS9A 3H45C 2FSJA 2Q0RA 4CZIA 3I8BA 5KPZA 4BC5A 1S22A 1V4TA 3A5MC 3RSEA 5BPNA 4H0VB 3L4IA 4BGBA 1P8ZA 2A5XA 2ASMA 3HI0A 5TKYA 1SAZA 2W41A 4H0YB 1T6CA 2ZWHA 1X3NA 3ENOA 3L6QA 3CI5A 2ZGZA 2WUSA 1HJOA 1RDWX 2F9TA 3C7NA 1C0GA 3AAQA 3MN5A 3SJHA 4EHTA 1QQNA 1U2VB 1YXQA 2D4WA 3MCPA 4B1ZA 1WUAA 5EXWA 1DEJA 5KPTA 1EQYA 2IVOA 3LM9A 4H0XB 3O1WA 1NGHA 2E2OA 3U4LA 2J4RA 4WQ4C 4I6MB 4CJ7A 4O5FA 2Q1NA 2DPNA 1GLJO 4YDUC 3WEEA 4H5RA 4BVOA 2A6AA 3UKRB 1NM1A 1GLCG 1JCEA 2GWJA 4RTFD 2YJEA 1JCGA 2FSNA 2P9IA 3WXJA 1ATRA 3R6MA 4MO4A 3SK3A 2BTFA 2E8AA 3CETA 4LC9B 4JNEA 4BRMA 3VEZA 3VGKA 4C23A 4BC2A 4CZKA 2CGJA 2HF4A 2YHYA 4BR0A 4JHDA 4BR2A 2D1KA 4Z94A 2VCPA 5AQQA 2P9SB 5AFUA 2QXLA 3QDKA 3DXMB 4XH4A 3ZETA 2ASOA 4EHUA 3WQUA 4QS8A 4CZFA 4H0PA 3CJ7A 3VPZA 4A2AA 5AQHA 3JXUA 1HKGA 3GG4A 4FWQA 2QWPA 2YHWA 4A62A 3KVGA 2IVNA 3D2EA 3C0BA 1MA9B 2IIRA 4E1JA 3VETA 1NGAA 3IDHA 4WQ5A 3HTVA 4BVPA 1C0FA 5AQRA 3D2FB 2QWMA 1U2VA 5LJVA 2E1ZA 4FOIA 3O5BA 3FZFA 3WEEB 1BU6O 3O08A 3EL2A 5BRHA 1IG8A 2VYPA 1QHAA 5AQMA 4IJAA 3CJCA 2H3GX 1D4XA 4I6MA 1MDUB 2P9NB 2GELA 1TUYA 3ID8A 3LDQA 4WQ5C 4IXCA 3U8XA 1Z6RA 5KPRA 3LL3A 3UKRA 3WXLA 1BG3A 3WT0A 1DKGD 4BR4A 2P9LB 3VERA 4CZGA 3H3OB 3DJCA 2P9PB 4AM6A 3A5NC 5AQYA 4M7YA 4BQZA 3CHWA 3M1FA 4CI6A 4ISFA 4XH1A 1IJJA 1U6ZA 3A0IX 1BO5O 2V52B 3W0LA 4FWLA 3IUCA 4BRQA 3ATUA 3BP8A 5JMVA 3UE5A 1NMDA 2GUPA 2FF6A 4BRDA 4FL9A 3SMSA 1KAZA 4NB4A 2P9SA 2Q36A 3D2EB 4WQ4A 1S3XA 1BA1A 3DXMA 1YUWA 3EKSA 4MO5A 5BRDA 5FPDA 3H46O 2GTDA 4H03B 4FWNA 2HF3A 2ZGYA 3MMVA 4B9QA 4YDUA 2IVPA 2QWRA 2CGLA 2FXUA 3IMXA 3LM2A 5FPNA 3QICA 5ADXH 1BOTO 4BRHA 4FWRA 2GWKA 3MK6A 5JLFA 2E88A 1RGIA 1BDGA 1SZ2A 2FLOA 4B1UB 3H6EA 3O8MA 4BG8A 1NBWA 2OANA 3GDQA 4CD1A 3QFPA 4K42A 4CZEA 4DB3A 4K25A 3FZMA 4BRPA 5BRFA 3LDLA 4BC4A 3D2FA 4IO8A 1YAGA 5AR0A 1HKCA 2ASPA 2CGKA 1BUPA 2V7ZA 1J6ZA 4JD2B 3WXIA 3ZEUB 1MWMA 4O8KA 1GLAG 3ULEB 3U9ZA 2QWOA 2P9NA 1KAYA 3VEVA 2V51B 4F9OA 4BC3A 1X9JA 2YI1A 3EKUA 3FZHA 2P9LA 3P4IA 1WOQA 3AARA 3BUZB 2P9PA 4L3QA 1K8KB 4BRNA 4BR7A 4NO7A 5BPLA 4FWMA 4BRGA 3FGUA 3UKUB 3HSCA 4H5WA 1NWKA 3I33A 2CH6A 4PL8A 1HUXA 3W3DA 4B1WB 4CBXA 3EZWA 1Y64A 2QWNA 4B1YB 4BROA 3L0QA 2NRHA 3D7EO 3EN9A 4EAHD 4CZMA 4DQ8A 4CBWA 1BWFO 2PBDA 3G25A 3QBXA 3UB5A 3R9PA 3VEOA 4M7XA 3VEWA 4BRKA 3H1VX 3FZKA 3QBWA 2Q97A 1NGGA 5AQSA 3FFKB 3AY9A 4HWIA 5E84A 3FR0A 4CD3A 2BUPA 1G99A 2KHOA 1MWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JICA 3KHYA 3AVCA 1KXPA 3ASMA 1IKXA 3JYTA 3SAGA 3L8BA 5ELZA 1DTQA 4B1VA 3BGRA 5DM6L 3EY1A 4DSLA 3KK3A 1TUUA 1NGEA 4YOXA 5JVHL 4H5NA 4QAGA 4LD0A 5HLFA 1ZXOA 3CMAN 1YTUA 4DU4A 1U4BA 4BGAA 1I94K 3CJBA 3ZEUA 4KV8A 3HK2A 3O4NA 4B9LA 4NYFA 1NK5A 3FE1A 3TAFA 3CJ9A 1LOTB 3LAMA 4U7BA 4H5TA 2UXBK 4ISEA 3J7YP 1JJ2M 3AVFA 1YI2N 2PAVA 4O55A 5M1NA 3FFIA 4N76A 2B6AA 4A5BA 1S72N 3K5MA 1IKWA 4GKJK 3WUHA 2YX6A 1KQSM 3MN6A 5FRNA 3C6TA 5F1XA 3O9UA 4WFNL 1BI4B 1B9FA 2GBZA 2E20A 2GX9A 4WF9L 1HLUA 4IEIA 2XHBA 3T69A 4GY2B 3FLCO 5AQWA 4JK8A 1BGXT 4FWPA 1XHXA 1LCUA 3MCAB 1KFDA 3LP3A 5CHIA 4EZ9A 3JAMO 2D0PA 5EX5A 4FYDA 3PSFA 1TL3A 2FSKA 1WLJA 4B3RK 2O8CA 3HVRA 3CPEA 2KFZA 3GBTA 3QNNA 5HRSA 4NXMK 4UQGA 3U3GA 4DV7K 4FM0A 1ZYQA 3CERA 2HMIA 4CZJA 1WNSA 1YT3A 2JGUA 5I9EB 2RPIA 3O80A 5AQPA 2YV0X 2A3ZA 4FK0A 5HOOA 4C1NK 3HSTB 5AQNA 4KB1A 1FKPA 5AQTA 4CBUA 3H1QA 1Q81O 4NCGA 3AAPA 4I2QA 1L3UA 2F9WA 5LY3A 1JLQA 3RWUA 4M45A 3OYGA 1RTDA 4O0IA 2YHAA 2HHSA 4MLEA 1YJNN 2HSTA 1EWRA 2UU9K 5LMNK 3VGLA 1XNQK 4M3RA 2O8BA 1CLQA 4K41A 3K58A 3LALA 4Y0WA 1E3MA 3RSEB 1HNIA 4CGJA 2I7NA 4K43A 3ZSOA 3OYNA 1HYVA 2VWKA 4JN4A 3TTDA 3NGZA 4CERA 1U49A 1B92A 4RW4A 3GE1A 2QWLA 4JEPA 1ILYA 4OVLA 4DG1A 3QFUA 1L5UA 3S3OA 5ADXA 2YCHA 1TKTA 1NK4A 3PIOL 3P39A 1S9GA 4FPBA 4HTLA 3KK7A 1OKJA 3ZSWA 4MFBA 3CCVN 4JI8K 1RTHA 1D8YA 2EHGA 4CF9A 3HOSA 3THYB 3EO3A 4PL7A 5AQOA 1TYQA 2Q31A 4BE1A 3CCLN 4YFUA 4CK3A 2AP1A 4PKHA 4FWSA 5C15A 3VTIA 2P9KB 3F73A 1V4SA 1U45A 2P9IB 2R7YA 3VQ9A 4YHHK 1RNHA 2YJFA 3CJAA 1ZBHA 1VQLN 4NCAA 4IDHA 4K8ZA 1O1WA 5I3UA 2W42A 1WSJA 4CGFA 3MWTA 4F3OA 5AZIA 2P9UA 1BIUA 3CC7N 4DTPA 4R79A 1J5OA 4U67L 2DTUA 3QB0A 5KQ8A 2NRVA 3O6WA 2BANA 4MLHA 1HX1A 5J2QA 4FLVA 5EU7A 4CZIA 2Q0RA 5GAEP 3I8BA 3LWMA 4FJ8A 5C12A 5KPZA 3E66A 4HVJA 5BPNA 4H0VB 3AA2A 3L4IA 1P8ZA 2W41A 4CFDA 4DTRA 2OTLN 4Z4HA 3ENOA 1IKYA 2ZGZA 3O3FA 1RDWX 3C7NA 3KLFA 1C0GA 4CJ5A 4CJLA 4EHTA 2Y1IA 1IBMK 2ZM6K 1Z26A 2D4WA 3MCPA 4B1ZA 1RT2A 4KHPK 3AVIA 3LM9A 2KFNA 3NH1A 2X74A 4CJPA 1NGHA 2IOCA 3IS9A 2D0CA 3NFAA 1UA1A 1LWEA 3L2VA 3OS1A 4AILC 1C6VA 4CJ7A 1SUQA 4CFBA 3WEEA 1WB9A 1NM1A 3WNFA 4OGEA 2GWJA 1NNEA 4RW6A 1JCGA 2W6KA 1YTAA 2FSNA 2F8SA 3VQQA 3HJFA 3NE6A 3QEVA 4O0JA 5HBMA 3OYEA 3TR8A 4MO4A 3SK3A 2BTFA 4YNQA 2OCEA 1S5JA 3CETA 4BRMA 3VGKA 1EX4A 4Z0UA 5JS2A 3PUFA 4BR2A 3OYBA 4B9NA 1D9FA 2QKBA 2FBYA 3OYAA 2VCPA 5AQQA 1NMNA 2QXLA 3QDKA 1ZBIA 5FLXO 4E3SA 2ASOA 1WSIA 4B9VA 2HB5A 3WQUA 5M1OA 4H0PA 2NRWA 2BH1A 3CJ7A 5AQHA 1HKGA 1QSYA 3LP2A 2BDPA 2QWPA 3G10A 3KVGA 4DTSA 3HPGA 4AHVA 4IDKA 1MA9B 2VQFK 1L3VA 1HNZK 3L3UA 1S1UA 1S1WA 1YHQN 4OLAA 1C0FA 2IC3A 3VTHA 2XRIA 3OYIA 5LJVA 4E7LA 4IFEA 3SJJA 5FDLA 4AF1A 4FOIA 3OYDA 4DQSA 5TKWA 1BU6O 2BGGA 4DR2K 1VQ7N 1IG8A 4OPJA 1X9MA 4JKGA 3NF9A 1LW2A 2P9NB 1N34K 1KVBA 1QTMA 3I56N 4AHSA 3QEWA 3LL3A 3P31A 2Z1GA 3WT0A 2P9LB 4CZGA 1IG9A 1L3TA 2P9PB 5C0YA 4AM6A 3P38A 1XMQK 5AQYA 4E89A 5CYQA 1JLFA 1KLMA 4C1NI 1RCHA 4KI4A 1IJJA 1U6ZA 1RBVA 1BO5O 3W0LA 3F5TA 1NK6A 5JMVA 3KLGA 1RDUA 4YY3K 2FF6A 2OPQA 4FL9A 4KPYA 2IS3A 4ID1A 3EKSA 4Z4IA 4NXNK 2GTDA 3I8DA 2OPPA 2PFUA 2D0BA 1VSEA 3MMVA 4CJTA 3HP9A 1U47A 2QTDA 2IVPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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