2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
4BGBA 2ASMA 4CBXA 3CI5A 3H1VX 3VEYA 3VOVA 3W0LA 4BROA 1J6ZA 2GWKA 2Q1NA 2QWRA 2YHXA 3SK3A 3SMSA 2PBDA 2Q0RA 3KZBA 2V7YA 5AQSA 2CGJA 2GELA 1BO5O 2CH5A 4H0VB 5BN9A 2J4RA 4BVPA 5AQWA 3ID8A 3ZETB 1ATNA 1HLUA 3WEEA 2P9SA 5KPRA 1BG3A 3AARA 1KAYA 4MO4A 1BU6O 1JCGA 1RFQA 1NGGA 3P4IA 2YJFA 3BUZB 4BR7A 3VPZA 3I8BA 4IWVA 3ATVA 4IJNA 4B1VA 3ZX3A 3KVGA 2Q36A 3WT0A 3UKUA 3FGUA 4K25A 1NM1A 3H45C 1QQMA 5CE3A 3VGMA 4ISGA 5I9EB 2Q97A 1U2VB 5FPEA 4FWPA 3VGLA 4FOEA 4A62A 2I7PA 3CQYA 1T6DA 4CZEA 3MMVA 4BC4A 5F1XA 2CGLA 3C7NA 3FZHA 2VCPA 3DXKA 3ULEA 3WEEB 3LDNA 5BPLA 3LM9A 2P9SB 2P9NA 3DJCA 3FE1A 3ZX0A 4B1YB 3O1WA 2NZTA 4QS7A 3CJBA 1BA1A 2P9UB 3O08A 2QWMA 1SZ2A 3HTVA 3R9PA 3VEWA 2QXLA 5E84A 1NWKA 2P9IB 4KBOA 4FPAA 4WQ4C 3OHRA 3HM8A 4L3QA 5ADXA 4BREA 1MWMA 3UKRB 4AM6A 3GL1A 2ZGZA 3ENOA 3GG4A 5AZJB 5BPNA 2QWPA 3C7NB 1BWFO 5FPNA 4DQ8A 2NLXA 3DXKB 5AQUA 1Y64A 3VERA 3QICA 2D4WA 4BC5A 2P9NB 1C0GA 3VF6A 3DXMB 4B1WB 1YVNA 2HF4A 4PL8A 1ZC6A 5AQXA 3CJ7A 2AP1A 3ZX2A 3B8AX 4BR0A 1NGBA 4FWQA 4BR5A 2FSJA 1X3MA 2I7NA 3JS6A 4J8FA 4A2AA 3WQUA 3CIPA 4FWRA 2Q2RA 4K43A 1SAZA 3GE1A 5AQRA 2BUPA 5AQKA 3HBTA 3ENHA 2ZWHA 1TYQA 5AQTA 3FFKB 1HUXA 2F9TA 5KPTA 3J8AA 2E8AA 3A5MC 5JICA 2UYTA 1QZ5A 2A3ZA 3GOIA 5JLFA 3I33A 2QW9A 3D2EB 4RTFD 5AQJA 4Y0WA 4EIAA 5BPMA 3EN9A 3O80A 5AQFA 5LY3A 5LJVA 4E1JA 4C23A 4FWOA 5AZIA 3WXLA 2YI1A 5AQOA 4GNIA 3C0BA 1WOQA 1K8KA 1GLJO 4CZFA 4I6MA 1JCEA 3DAWA 4BG8A 5AQGA 5AQHA 1GLCG 2V52B 3BF3A 4B1ZA 1NGJA 5B8HA 3A5OC 1Q18A 4CD1A 2ASOA 3VGKA 3RSEA 5BRHA 4BRGA 4CI6A 1T44A 1WUAA 5EXWA 4BGAA 1BOTO 1NGEA 3FZMA 3MN5A 5AQNA 2ITMA 2D0PA 4XH5A 2YHYA 3CJ9A 3GDQA 1BA0A 4BRCA 2V51B 2E1YA 2HMPA 4FWKA 3CJAA 4FWSA 5AQMA 3AY9A 3MDQA 3UKUB 3LDPA 4BRQA 3A0IX 3IMXA 2GUPA 4CZJA 3M3ZA 3VETA 4BG9A 2VYPA 4JD2B 3SJHA 3VESA 4QS9A 2E2PA 1HX1A 1RGIA 1GLEG 4BR9A 1IG8A 4O5FA 4FL9A 4DHYA 4A61A 1E4GT 3ZEUA 4NO7A 4H5NA 1MDUB 4BRNA 2A6AA 5EX5A 3M1FA 4ISFA 3VENA 4BRPA 3M6GA 4FPBA 3CERA 1HKBA 3UB5A 2P9IA 3D2EA 5AQIA 3EKSA 1GLDG 1LCUA 3ZETA 5FPMA 3WXKA 5BRDA 3MN9A 4WQ5A 4BQLA 4O8KA 4FWMA 2E1ZA 1RDWX 5KQDA 4CD3A 2VWBA 3W3DA 5JLHA 4BRLA 4BVOA 1QQOA 3U9ZA 4I6MB 4EHUA 1QHAA 1MWKA 1Z6RA 3CHWA 3DWLA 1TUUA 4H0PA 3MCPA 4QS8A 4EAHD 2CGKA 2F9WA 4B9QA 3EZWA 5AQVA 4MO5A 3O8MA 1U2VA 1NBWA 3KHYA 1JCFA 3CETA 3RSEB 1GLAG 1X9JA 4RWTA 3CQXA 1YAGA 4XH4A 5EY4A 3WXIA 1C0FA 3FZFA 4BR4A 4HWIA 1HKCA 1KXPA 5AQPA 4LC9B 4YDUA 3HSCA 4F9OA 2A42A 2D0OA 4IO8A 4H0OA 1XQSC 3G25A 1EQYA 2OANA 4H0XB 1MA9B 2AA4A 4XH1A 1TUYA 3GBTA 3WXJA 4BC2A 4GY2B 5EOYA 3U8XA 3L0QA 4B1UB 2P9LA 5AQZA 5BN8A 2A40A 3F9MA 3O6WA 3H1QA 1ESVA 3QMLA 5AR0A 3ZEUB 3DXMA 2W41A 1BUPA 3SMPA 2GEMA 3A8YA 1ZXOA 1NGAA 2P9KA 4PKGA 3EKUA 2E2NA 4IJAA 2YJEA 1XC3A 2GTDA 2QWQA 4EHTA 2EWSA 1V4SA 3FZKA 5AQQA 4H0YB 5AQYA 4CZKA 3L6QA 4PL7A 1NGHA 3VEZA 4FSVA 4JHDA 4CZLA 5F2RA 3MN6A 5LJWA 2Q0UA 1LOTB 4FO0A 3ULEB 2YCHA 1T6CA 1TYQB 3VEXA 1HJOA 4HTLA 3BF1A 1XUPO 3QB0A 1DKGD 3IUCA 4MLHA 4PKHA 4FWNA 2P9UA 2IVPA 2P9PA 3TU5A 2CH6A 3D7EO 2P9KB 5AFUA 4K41A 2DPNA 3BP8A 3QFUA 2HF3A 5KPZA 2E20A 3EO3A 2D1KA 3IFRA 4CBUA 4H5TA 1QQNA 4DB3A 3TPQA 2QWLA 1G99A 3AAQA 3D2FB 4H0TB 4FOIA 4AM7A 5AQLA 3UKRA 2NRHA 4K42A 2PAVA 5F0XA 1E4FT 5AZJA 4BRAA 2A41A 4BRHA 3QBXA 4XEIA 2FLOA 2FF3B 4BRMA 3U9DA 4PKIA 1D4XA 3LDQA 1OKJA 3WQTA 1U6ZA 1YXQA 3LDLA 4IXCA 3U4LA 3S41A 1GLBG 2IIRA 3MK6A 3AAPA 4ISEA 1R59O 1CZAN 1GLFO 2P9PB 3VF2A 3VF4A 3H6EA 3H46O 4JNEA 4M7YA 4M7XA 3FR0A 3UE5A 3H3NO 2Q31A 3O5BA 4CZMA 3D2FA 2P9LB 2WUSA 2H3GX 3O1BA 1H1VA 3QDKA 4CBWA 5E26A 4FWLA 3H3OB 1NGFA 3IDHA 2BTFA 3JXUA 4CJ7A 4BR2A 4JAXA 5BR9A 1ATRA 4RCHA 4WQ4A 3HZ6A 1S3XA 3O4WA 4BRFA 2ZGYA 4BRDA 1IJJA 4CZGA 3R8EA 3SLCA 1NLVA 1HKGA 3WUHA 5TKYA 4JHDB 2V7ZA 3A5LC 4Z94A 5AFUH 4A2BA 3CJCA 3HI0A 4BRKA 1QZ6A 3MN7A 3R6MA 2A5XA 1V4TA 5AZIB 1KAXA 4H03B 1NGDA 4H5VA 4BC3A 1SQKA 1NMDA 1K8KB 4CZIA 5BRFA 2IVNA 2FXUA 2E2OA 1HPMA 2QM1A 5FPDA 3LL3A 3EL2A 5KQ8A 1KAZA 3L4IA 1GLLO 4YDUC 2QWOA 3CJ1A 1ZBSA 4BRIA 3BEXA 2ASPA 2E88A 2QWNA 3A5NC 2E2QA 3VEVA 1Z05A 2GWJA 2FF6A 4WQ5C 2FSKA 4M63C 2KHOA 3QFPA 4CZHA 2ZF5O 3VEOA 5ADXH 4NB4A 2HOEA 3FZLA 4MLEA 4H5RA 5BREA 1ATSA 3QBWA 4IZ9A 4EFHA 5JMVA 2YHWA 5ELZA 4DCHA 3LM2A 3LDOA 1DGKN 4BQZA 5EVZA 3ATUA 1P8ZA 1DEJA 1NGIA 4B1XB 3FLCO 1BDGA 2FSNA 2IVOA 1YUWA 4JD2A 4WYBA 4JN4A 1NGCA 1X3NA 4H5WA 1S22A 2W40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVIA 3VOVA 3RR7A 1J6ZA 3SK3A 1L3SA 4FJ9A 5CZ2A 2NUBA 1EXQA 4EZ9A 5AQSA 1C1CA 2CGJA 3K9JA 2CH5A 5BN9A 5AQWA 1YTUA 3ZETB 1S72N 1HLUA 4WE1A 1A5XA 5KPRA 5KI6A 4OLAA 4MO4A 2F96A 1BU6O 1JCGA 4DR3K 4B9UA 4I9QA 1NGGA 4FJXA 2YJFA 1U04A 2HHWA 1NOZA 3ZX3A 2HHHK 3UKUA 3OJUA 1SL1A 4CEEA 2HHTA 1SKRA 3ZSQA 2ZJRL 1QQMA 2ITGA 2QI2A 3TAFA 2G8UA 4YOYA 1U2VB 3VGLA 3K5NA 4I7FA 2I7PA 3KLEA 3FZHA 3LAKA 2VCPA 3DXKA 2FBXA 3R1XA 1T03A 1VQKN 2QWMA 3OS2A 1YITN 3VEWA 3ENBA 3ZSZA 1WSEA 2KFZA 4WFNL 1X9WA 4YOWA 3HO1A 3OHRA 3HM8A 4L3QA 3O3HA 1FJGK 1MWMA 3UKRB 1JL1A 3KLGA 1YIJN 5BPNA 3CFPA 2DFEA 5FPNA 1SL0A 4DQ8A 3DXKB 1S6PA 1Y64A 1S1TA 3AO1A 4HVJA 3QICA 2D4WA 3RMBA 1C0GA 3O9UA 4B1WB 1LWFA 3THWB 4O55A 1ITGA 4CEQA 2AP1A 4Z4GA 1KC8O 4E7IA 1VAZA 5KRSA 3KK2A 2FSJA 3T1YK 3D45A 2HW3A 4CK3A 4CJ5A 4KKOA 1S1UA 1BIUA 3SAHA 1N36K 2Q2RA 4JI0K 3SBGA 4CHOA 3GE1A 4ILHA 5FLXO 4A57A 3ENHA 1TAQA 3B6OA 1HUXA 2O8FB 5KPTA 3KLIA 3FFIA 3A5MC 1M1KO 1YTAA 2A3ZA 4CJUA 1S1WA 2HVHA 3O80A 2HBMA 3ULDA 5LY3A 3VQEA 2BGGA 5J2NA 1W97L 3L2QA 2ZD1A 4GNIA 3C0BA 3K58A 1WOQA 5GAHP 4W5OA 1GLJO 2BE2A 4CGDA 4CK2A 4HCCA 2WBNA 5AQHA 1WSHA 5JVHL 4CJKA 2PY5A 3A5OC 5SZTA 1Q9YA 1JLFA 4BDPA 4KB0A 4O4GA 2E6MA 3NCIA 4CI6A 5C2DA 4DV0K 3TR8A 1OH7A 1JKHA 1NK4A 1BOTO 1UWBA 3RMDA 5GIOA 2UUBK 2YHYA 3OYIA 2HMPA 4CJQA 2ZJQL 4FLTA 3CJAA 3RRHA 5AQMA 3VQ7A 3THXB 5M1OA 1S6QA 3IS9A 5LMNK 3TAEA 4LD0A 1VQON 4AHUA 4BG9A 3PO4A 4OPAA 3AA2A 3RVCA 3VESA 4B3TK 2E2PA 3SUQA 1RGIA 1GLEG 1EETA 1IG8A 2KZZA 2VQFK 5BR8K 4A61A 1E4GT 1MDUB 4W5NA 1TK0A 4KAZA 4X65K 4BEBA 5EX5A 3NF7A 1JLCA 2A1RA 3VENA 2B6AA 5HLFA 2HBJA 1IBKK 1HKBA 2P9IA 1EWQA 3EKSA 4GV6A 4FCYA 1XMQK 3MN9A 4O8KA 4FWMA 3PIPL 4CF9A 4CHPA 5KQDA 2VWBA 5JLHA 4DFJA 2P1JA 3DRSA 2GBZA 2OTJN 2YKMA 1BQMA 4JI8K 3MCPA 4CFCA 4B9QA 1X9MA 4JI6K 1KLMA 1NBWA 3KHYA 4AHVA 3CETA 1P90A 3RSEB 1X9JA 1RBRA 3SCXA 1F21A 5EY4A 3FZFA 4HWIA 1CLQA 1HKCA 1KXPA 3ZT4A 2F8TA 3ZT0A 1WSFA 4LC9B 3KLHA 4YDUA 3QEWA 4F9OA 1S5JA 4H0OA 3G25A 1GOAA 1N8RO 3AV9A 4ZTJA 3OYAA 4JI3K 1RT3A 4FLYA 4E3SA 4WF9L 3EY1A 4R5PA 3HVTA 4GVMA 1HR0K 4JKDA 1RT2A 2X6NA 2VG7A 4KTQA 4YORA 1IV0A 3O6WA 1ESVA 3DOLA 3CCVN 1VRUA 2W41A 5MLCQ 4DUYK 3SMPA 4M3TA 5FRMA 3QIPA 4JK8A 3PV8A 4IJAA 2FBYA 1TAUA 5C0YA 1RDBA 1BL3A 4GKJK 1Q86O 3OVNA 4CZLA 2GX9A 4YOUA 2YNIA 3MN6A 5C24A 4FK0A 4DR6K 3LZJA 3N4PA 3QNNA 3S3OA 4K0KK 4I2QA 2P9UA 3VN5A 2IVPA 1QSYA 4K41A 3BP8A 1WB9A 4NLBA 5KPZA 3EO3A 2D1KA 4MDAA 4DB3A 4H5TA 1QQNA 3QIOA 4FOIA 5AQLA 1K6YA 3TI0A 3QNOA 4B08A 4NLCA 3V9WA 3K5MA 1E4FT 3ZYYX 5AZJA 4BRAA 3R3LA 1XNQK 3K5OA 3PY8A 3OS1A 4E7KA 3U9DA 2XY7A 4FZZA 4IXCA 3NF9A 4IOCL 3S41A 1GLBG 2IIRA 5SWMA 3AAPA 4B8CA 3AVCA 4G9ZA 3H46O 2UXBK 3F5TA 2R7YA 2O8DA 3O5BA 2ZM6K 2WUSA 2H3GX 3QDKA 3V81A 2DFFA 4YHHK 3MX2A 4WFBL 1RDDA 1Q9XA 3H3OB 3MEGA 4E19A 4CJ7A 1YJNN 1SL2A 4HUGA 4N56A 5BR9A 4WQ4A 2HHSA 2UUAK 4IKFA 3EE9A 2JWKA 4BRFA 5HRRA 2RPIA 4JHDB 5HP1A 4DU1A 1RTJA 4KHPK 2O8EA 1HNZK 3CJCA 3G0ZA 4NXMK 2RN2A 1U45A 3PIOL 3IAYA 1RDUA 2F7TA 3U6FA 1JLQA 5AZIB 2UXDK 4H03B 1QSLA 3HRGA 4DR2K 1FKOA 3THWA 1I39A 4DU4A 4LF6K 4DQQA 3C65A 4KHSA 2E2OA 1HPMA 2YNHA 1KAZA 4LSLA 1ZBHA 3OYFA 5M1PA 4KREA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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