2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
4H0PA 2ITMA 3LDLA 3U8XA 3D2EB 1NMDA 2NRHA 2QXLA 5EOYA 3ENHA 3UKUB 2YHYA 4F9OA 5JMVA 1SQKA 1BDGA 3AARA 3AY9A 3ZETB 3C7NB 4CZMA 1T44A 3L6QA 3FLCO 4FWRA 4JD2B 5BRFA 3LDQA 3CI5A 3H6EA 3MN6A 1IG8A 3U9ZA 3A0IX 2P9NB 2QWOA 2NLXA 1XC3A 5E26A 1GLAG 2Q0UA 4B9QA 1H1VA 2BTFA 3S41A 1QQNA 3F9MA 2D1KA 3I8BA 3AAQA 2FSJA 4BR0A 2E2QA 2QWPA 3A5MC 3U4LA 3U9DA 4EAHD 4M7YA 3DAWA 2P9SB 2GWKA 4L3QA 3LDOA 4CD3A 3DXMA 3MK6A 3LL3A 1TUYA 4FWMA 2FF6A 3VEZA 2HF4A 3DXKA 3A5NC 3EZWA 2IVNA 2E8AA 3IFRA 3C0BA 5AQSA 3WEEA 4MO4A 4BR5A 1NM1A 4A62A 5LY3A 2P9UA 2ASPA 4BRLA 5I9EB 4NO7A 1RFQA 3WXJA 3DXMB 3ENOA 4WQ4C 3CERA 4BR9A 1E4FT 4K41A 5FPNA 3EO3A 1GLDG 1DKGD 1NGCA 3QBWA 4H5WA 3DXKB 2CGKA 4CZLA 3ZX2A 4BREA 5BPLA 3CJCA 2Q1NA 2QWQA 3WEEB 1NGFA 4FOIA 4BRPA 1P8ZA 2EWSA 4XEIA 2P9UB 1ATSA 3CJ1A 3WUHA 3R6MA 4QS9A 2FLOA 4CZEA 3UKRA 2NZTA 4BC3A 1T6DA 4BROA 4C23A 4NB4A 1DEJA 3ULEA 3GBTA 3EKSA 3I33A 4BRNA 3DJCA 4A2AA 1LOTB 1GLJO 3R8EA 2OANA 3O08A 4H03B 4BQLA 2FSNA 2WUSA 5BREA 2QWNA 2CGLA 4CJ7A 3VGKA 2V7ZA 3D2FA 1JCEA 1YUWA 2YHXA 1T6CA 2IVPA 1RGIA 3VENA 2VWBA 3H3OB 5AQWA 3UB5A 1ZXOA 3MCPA 5AQZA 4CD1A 3SK3A 5CE3A 2Q2RA 4FSVA 3UKRB 5AQVA 4I6MB 3ULEB 1MA9B 1E4GT 3FZLA 5BPMA 1HJOA 3ZX0A 4FWKA 2CGJA 1RDWX 5AFUA 2YCHA 4B1VA 3VF2A 1U6ZA 1TYQA 2D0PA 3D2FB 1U2VB 4PL7A 4K42A 3CJAA 2P9PB 4BRGA 3JXUA 3SJHA 3FE1A 5AQRA 3LM9A 3VEYA 4CBUA 1GLLO 1HKGA 5AZIA 4H5NA 4A61A 3VETA 5BPNA 1ZBSA 4IWVA 3WQUA 5AFUH 4KBOA 4QS7A 1TYQB 1BG3A 4CBXA 1NGGA 1NGDA 2DPNA 2QM1A 3VERA 3AAPA 3GE1A 1J6ZA 4JNEA 1ZC6A 4BVOA 4B1UB 3O1WA 5AZIB 4B1YB 1ATRA 5F1XA 1Z6RA 3CETA 4ISFA 3A5OC 3LDNA 3FZHA 4BR2A 3HTVA 2QWRA 4BC4A 1NLVA 2AP1A 3G25A 1KAXA 4BQZA 2D0OA 4PKHA 1S22A 3EN9A 2Q36A 4BVPA 1NGAA 2E2PA 4FPBA 4EFHA 1HX1A 4M7XA 1X3NA 4IZ9A 5AQFA 1C0GA 2HOEA 4AM7A 3LDPA 4CZJA 1QZ6A 2F9WA 3FFKB 2A5XA 5KPZA 3ATUA 4H5TA 4MLEA 3M3ZA 3VF6A 3QICA 3BP8A 5FPDA 1GLBG 2IIRA 4B1WB 2PBDA 2AA4A 4BRHA 3QDKA 3QB0A 5BN9A 4XH1A 2GUPA 4M63C 3RSEA 3D7EO 4GY2B 3H1QA 1NGHA 4HTLA 5AQMA 1EQYA 1NGJA 4BGAA 3DWLA 3SLCA 1V4TA 4H0OA 5FPMA 3FR0A 3FZMA 2GWJA 4LC9B 4A2BA 1DGKN 3J8AA 5JLFA 1SAZA 3O5BA 3MN9A 3H45C 3H3NO 4BGBA 3BUZB 4H5VA 3ID8A 3WXKA 1MDUB 5AQOA 1C0FA 3A5LC 4IJNA 2ZGZA 1KXPA 3VPZA 4BRQA 2YHWA 2CH6A 5KQ8A 1GLCG 1MWMA 1HKCA 4Z94A 2H3GX 4BRIA 3W3DA 2Q97A 4H5RA 3VEVA 5AZJB 3FZFA 4GNIA 3LM2A 4PL8A 1GLEG 4H0VB 2VCPA 1KAYA 4BR4A 3VOVA 3CQYA 3ZEUA 4BRAA 3SMPA 1BU6O 2Q0RA 2Q31A 1LCUA 3GOIA 3L0QA 2E1ZA 2ZWHA 3O1BA 4EHTA 1NBWA 2FF3B 2GTDA 3CHWA 4FWLA 5AQIA 5JICA 2ZGYA 4EHUA 3TPQA 5ADXA 1BA1A 3FZKA 1ATNA 1BUPA 4RWTA 2IVOA 4MLHA 1BOTO 4FWQA 3VGLA 5AQNA 1NWKA 4JAXA 4JN4A 4FWNA 2QW9A 3ZEUB 2P9IA 5AQPA 3O80A 1BWFO 2ASMA 3GL1A 3M1FA 1JCFA 4IO8A 3W0LA 4EIAA 2GELA 3GDQA 4FO0A 3HBTA 2UYTA 3HI0A 3O8MA 3VEOA 5EXWA 1K8KA 2ASOA 4K43A 4B1ZA 2ZF5O 5ADXH 4FWPA 1X3MA 3FGUA 4PKIA 3WQTA 4CZHA 2P9IB 4DQ8A 5BRHA 3WXLA 5AQLA 5AR0A 3VESA 4WQ5C 1BA0A 2E88A 3KHYA 4AM6A 4CBWA 1X9JA 5TKYA 2YJFA 3M6GA 2A42A 1K8KB 3WT0A 2A3ZA 3KZBA 4PKGA 1Q18A 2W41A 4BRMA 3MN5A 4CZIA 3L4IA 1XUPO 5KPTA 1SZ2A 2FSKA 3EKUA 3EL2A 1JCGA 1QQOA 1Z05A 2FXUA 2P9SA 1NGBA 1KAZA 2KHOA 3ATVA 2P9KA 4FL9A 2V7YA 1TUUA 3HM8A 5LJVA 4BRKA 5EX5A 3O6WA 5AZJA 5AQQA 2J4RA 2E1YA 2A41A 4YDUA 3B8AX 4BG8A 5ELZA 2W40A 4ISGA 3UE5A 3IDHA 4BRDA 1QQMA 3R9PA 3JS6A 2V52B 4DB3A 4E1JA 3QMLA 1YAGA 5E84A 2P9KB 3BF1A 4MO5A 3CQXA 5BR9A 2E2OA 4CZKA 3GG4A 3BEXA 4IXCA 4WQ5A 4WYBA 4H0YB 1BO5O 4JHDA 2VYPA 4FWSA 3VGMA 5KQDA 1XQSC 4BC5A 4RTFD 1V4SA 5FPEA 3OHRA 3RSEB 1G99A 3SMSA 1ESVA 2PAVA 2HF3A 4Y0WA 4QS8A 4O5FA 1HLUA 2I7PA 4J8FA 4XH5A 3H1VX 2P9LA 4JHDB 1WOQA 4IJAA 1IJJA 3VEWA 5LJWA 4BC2A 2A6AA 4DHYA 3CJ7A 2YJEA 3IMXA 1S3XA 3IUCA 5AQJA 2BUPA 3ZX3A 4I6MA 1OKJA 2QWLA 4H0XB 4BG9A 5F0XA 1CZAN 3CIPA 4FWOA 2E20A 3HZ6A 3QBXA 4CZFA 3TU5A 4RCHA 2V51B 2QWMA 2A40A 2P9LB 4O8KA 1YVNA 1U2VA 1NGEA 4HWIA 5KPRA 1R59O 3MDQA 5AQKA 4FPAA 2I7NA 5EY4A 1HUXA 4B1XB 3CJ9A 3QFPA 1GLFO 2P9PA 4BRFA 1YXQA 2GEMA 4YDUC 1HPMA 5BN8A 5AQGA 5EVZA 1QZ5A 1D4XA 3MN7A 4DCHA 4BR7A 5B8HA 3A8YA 5BRDA 1WUAA 3D2EA 3O4WA 2E2NA 3MMVA 3HSCA 2HMPA 4WQ4A 3VEXA 3QFUA 3UKUA 4CZGA 4CI6A 3WXIA 2D4WA 5AQTA 1HKBA 3ZETA 3C7NA 5AQHA 5AQXA 3BF3A 4H0TB 5AQUA 1QHAA 4K25A 1MWKA 4JD2A 4ISEA 2CH5A 4XH4A 3H46O 3VF4A 4FOEA 2F9TA 3P4IA 1Y64A 4BRCA 5JLHA 3CJBA 2YI1A 2P9NA 5F2RA 3KVGA 5AQYA 1NGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0PA 3D2EB 4F9OA 5JMVA 5FRNA 3AARA 4C8OA 1YITN 3AY9A 4FK4A 1NG9A 4JI5K 1BIUA 3LDQA 1QQCA 4MDBA 3V1OA 2IAJA 3V9XA 3A0IX 3PIOL 3OYEA 2QWOA 4DSKA 1GLAG 2Q0UA 1D5AA 3OVNA 4KHWA 2D1KA 1BIZA 2FSJA 2QWPA 1XC9A 3G0ZA 3MX5A 3KK1A 2X6SA 2P9SB 4JEPA 4L3QA 3I8DA 3HP6A 3F73A 4CD3A 4B9SA 3DXMA 3MXJA 2HW3A 3CYGA 3VTHA 5M1OA 4DTXA 1UA1A 1N6QA 5KGXA 3JSMA 1TUYA 1JLBA 3P83D 4F3OA 4CHNA 3DOLA 2IVNA 2OYQA 3VQBA 1O1WA 1SV5A 4MO4A 4BR5A 3HPOA 2P9UA 4FJLA 4DR6K 4NO7A 3WXJA 3ENOA 1QVGM 1E4FT 2NRTA 4K41A 3AVJA 5FPNA 4I2PA 1DKGD 3E9PA 4Z4IA 4DFPA 1BQNA 4IFYA 2IOCA 1EKEA 3ZX2A 3TWHA 3U6FA 4R79A 4BRPA 1P8ZA 2OZMA 1JLGA 3DYAA 4KH6A 2BANA 5KI6A 3WUHA 4QS9A 4CZEA 3UKRA 4JI2K 2ETJA 3HO1A 3R8EA 1JLAA 3O08A 4LSNA 1TGOA 1A5VA 3J7ZO 3SQ1A 1RT1A 3NHGA 3ULDA 2CGLA 5GADP 2V7ZA 1EO1A 1WSGA 2YHXA 2IVPA 3VTIA 3VENA 2VWBA 3VA3A 3MCPA 5FLXO 3SNNA 2JGUA 4Z4HA 5AQVA 3O9SA 1RDUA 1RNHA 2EX3A 3P1GA 1MA9B 3FZLA 4GMJB 3L2RA 1HJOA 4FWKA 2HBLA 4CK2A 2RPIA 4HHTA 1WSEA 4X66K 1B9FA 1U2VB 2KFNA 3NH0A 1QE1A 1OVQA 1ASWA 4PY5A 3VQDA 4F8RA 3CCJN 4ZTJA 4PL7A 1CXUA 4FK0A 3AA4A 4DV0K 1HNWK 4KTQA 1RT2A 5AQRA 1B92A 5AZIA 4H5NA 2E5LK 4H8KA 4CE9A 1NK5A 5BPNA 2Q3SA 1ZBSA 4IWVA 4FCYA 4OVLA 1TYQB 3PO4A 4CBXA 3VQ8A 1NGGA 3OYIA 3T1YK 3MECA 4FZYA 3DLLL 3NVKA 4GV3A 1J6ZA 3SAHA 3TSQA 4CF1A 4GV6A 1YVUA 1ATRA 5GIPA 2QWRA 4JKCA 4BC4A 2DFFA 3CMEN 3LWMA 4DUZK 2D0OA 2Q36A 4KB0A 5JENA 3MXIA 4FPBA 4EFHA 1HX1A 4M7XA 4CJ4A 4BWJA 2PYLA 4FJNA 4Z4CA 1DTTA 3SV4A 4ILHA 3NVMA 5KPZA 1DT9A 4YOWA 4H5TA 1VQ7N 3VF6A 3BP8A 3HRGA 1S1UA 3JYTA 3EY1A 3OW2M 4DKWA 1KSPA 1GLBG 4J2EA 2VGMA 4M63C 2NRXA 3KJVA 4CJKA 1NGJA 3CPWM 1D9DA 4M3TA 1RTJA 1DGKN 3O5BA 3H3NO 5KRSA 1MDUB 5GAGP 5AQOA 1QSSA 1N33K 4DSIA 5KQ8A 4E7HA 4DQSA 4G9ZA 1MWMA 4I9LA 2NRZA 1BHLA 4CK1A 5HP1A 4YNQA 4CJ3A 1W7AA 2WBNA 4RW8A 1GLEG 3P5JA 5M1NA 4JI4K 1KAYA 4IBNA 4BRAA 4ELTA 2YNFA 3SMPA 3RMCA 1NK9A 2Q0RA 2ZM6K 3GOIA 3L0QA 2VQFK 4FJIA 4BE7B 2E1ZA 1NBWA 4A5AA 3E01A 2OPRA 3CHWA 4FWLA 5JICA 4EHUA 2P5GA 5C2DA 5ADXA 3DRRA 4RWTA 1LAWA 2O8EA 2E4LA 4DTOA 3ZSVA 4JAXA 3RR7A 3ZEUB 2P9IA 4CEEA 1CXQA 3QERA 1Q9XA 3CCMN 4QCLA 4YORA 4A5BA 4FJJA 3VEOA 2YHAA 4OGCA 1S9GA 1X3MA 3WQTA 3O4QA 1VQLN 3NGZA 3WXLA 3IS9A 5AQLA 3VESA 4HTUA 1IG9A 3E1YA 3HPHA 1X9JA 1VQ4N 3QO9A 4IO9L 4E7JA 4DV6K 1TAUA 1Y97A 1SL1A 4DV7K 2Z1JA 3T1AA 1SKWA 1XUPO 2O8FB 3SBGA 3O9RA 1SZ2A 3EL2A 2FXUA 4KRFA 1NGBA 1VRTA 5I42A 3SUPA 1TUUA 5LJVA 2FBXA 3QEWA 3HK2A 5AQQA 1HNIA 2E1YA 3S9HA 4HCCA 3CCQN 4YDUA 3B8AX 4BG8A 1A5WA 4ISGA 1RBSA 3IDHA 4BRDA 3VA0A 3TTCA 3SUQA 4K8XA 1BI4B 3ZT0A 4M3ZA 4DB3A 4E1JA 4M3UA 3RVCA 1HYZA 3BF1A 4G1QA 4GKKK 3CQXA 3NBPA 4UY8O 3NAEA 4WQ5A 4W5NA 1BO5O 4CHOA 3MEGA 4DR5K 1N34K 1FK9A 4AH9A 1G99A 1ESVA 3CXCM 4OJRA 2PAVA 4Y0WA 1HRHA 1VSDA 2RE2A 4FW1A 2OZSA 3KKRA 3AV9A 3D0PA 3L4QA 1N8RO 2C1IA 2P9LA 1WOQA 4O0IA 4JI8K 4OKKA 1BCOA 2YJEA 1S3XA 3IUCA 3ASMA 4RW7A 4I6MA 1OKJA 3QEPA 3TSPA 1KLMA 2E20A 3OYAA 3HZ6A 2IDOA 2YHBA 3CPEA 1WB9A 5HOOA 4PHTX 2QWMA 3NCIA 1JL1A 1LWCA 4GKJK 5KPRA 1D9FA 1EX4A 1NK6A 3UIQA 2G8WA 1BCMA 4B3RK 1VAZA 1DLOA 3CJ9A 3AO3A 1IV0A 2HSTA 4CESA 4YDUC 3KLEA 1D4XA 4PQUA 3R1XA 2ITGA 4CF2A 3H08A 1I94K 3I0RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4M3Y A;  4WE1 A;  1NMN A;  3OYL A;  2I7P A;  4KKO A;  1E3M A;  4PUO A;  4KRE A;  3HM9 A;  3TAR A;  3H1V X;  2HHX A;  3NFA A;  4TSX A;  3CYM A;  1P90 A;  3CF5 L;  1VSI A;  1HJR A;  4DHY A;  3QIP A;  3CJ7 A;  3IMX A;  2P5O A;  3CIP A;  3OYG A;  4CZF A;  3M8P A;  2G8V A;  3TAF A;  2V51 B;  5LMN K;  1X1P A;  2A40 A;  2P9L B;  1S5J A;  1YVN A;  1U2V A;  1VSH A;  3NF6 A;  5IWA K;  4DU3 A;  3AVK A;  1R59 O;  4LF7 K;  4H4O A;  3NMU A;  1RTH A;  2I7N A;  1HUX A;  2WOM A;  1M1K O;  4E0D A;  4DTU A;  1J5O A;  1YXQ A;  3AO5 A;  3V1Q A;  3AVG A;  2F96 A;  5EVZ A;  2ZJQ L;  4CJQ A;  1ITG A;  3MN7 A;  4NXM K;  1RBV A;  3CMA N;  3L2V A;  3EEQ A;  4KHY A;  5BRD A;  2O8C A;  2E2N A;  3HSC A;  4CF0 A;  3K9J A;  3VEX A;  1KFD A;  3AVF A;  2NUB A;  4JRQ A;  1I39 A;  5AQH A;  2D0B A;  4V19 S;  3WNH A;  5DMR A;  3SZ2 A;  4IFV A;  5TKW A;  3VF4 A;  1NOY A;  2Z1I A;  3P4I A;  1Y64 A;  4LY7 A;  5JLH A;  2OPQ A;  2X78 A;  4KTZ A;  2P9N A;  3VQQ A;  5HL7 L;  4DV5 K;  2A1S A;  4BRQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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