2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
b'ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
2P9LA 2YJEA 2P9LB 1KAZA 2QWMA 3DXMB 1Q18A 3VEVA 3AAQA 5AQTA 3VGKA 1BUPA 4M7YA 4IWVA 4DCHA 3MN7A 5AQGA 4BGBA 3CJ7A 1NWKA 4FO0A 1GLJO 2E8AA 3DJCA 1EQYA 5CE3A 3QICA 4C23A 4H0OA 4BQZA 4I6MB 3ZEUA 4CI6A 1NM1A 4WQ4C 4EFHA 3VEXA 4KBOA 3SMPA 1HJOA 1E4GT 5FPEA 3HTVA 3D7EO 1BWFO 3FFKB 1BA0A 3U4LA 4CZGA 1GLFO 4XH4A 5AQIA 4PKGA 1Z6RA 3BF1A 4BRGA 1NGDA 3H46O 4H5WA 3UE5A 4BRAA 2Q31A 3A5MC 4CZFA 3ID8A 2NLXA 3LL3A 2CGKA 2A41A 3SJHA 2V51B 3QDKA 1WUAA 1GLDG 2FXUA 2FSNA 2D1KA 1ATNA 3VOVA 2P9KB 3HZ6A 3MMVA 4IXCA 1JCGA 3M6GA 5AQYA 1K8KA 2ZGYA 1J6ZA 1K8KB 3HI0A 3VPZA 3KVGA 5B8HA 2HOEA 4FPBA 4AM6A 3O6WA 3LM2A 2YI1A 4CBWA 3FGUA 1HPMA 3FE1A 1R59O 1E4FT 4B1XB 3FZLA 3AAPA 3VF4A 3D2EA 3WT0A 3ULEB 2V52B 3VETA 4BR9A 3ZETB 2AP1A 1YVNA 1BDGA 4B9QA 5F1XA 3BUZB 1LCUA 3G25A 1S3XA 5AZJB 3IUCA 1RDWX 4BRIA 5AFUA 3DAWA 3CHWA 3VEYA 3LDNA 3RSEB 3BF3A 2QXLA 5E26A 2QW9A 3O1BA 4O5FA 3VGLA 4NB4A 3WXJA 3I33A 3EN9A 4MLEA 4ISGA 5BPLA 5AQLA 2QWQA 4BRPA 1GLEG 1V4TA 3WXLA 4FPAA 3QFUA 2Q2RA 2P9UA 3H3OB 2QWOA 4MLHA 2VWBA 2GTDA 3WQTA 4CJ7A 1BG3A 2Q0UA 4FWSA 2YHWA 3ENOA 3CI5A 3CERA 4MO4A 5AQKA 4AM7A 1SAZA 4BGAA 3VERA 2P9PA 3D2FA 2Q36A 2WUSA 3CJAA 1NBWA 3A5LC 5ADXH 1QQOA 4WQ4A 4ISEA 1QQMA 3R6MA 3P4IA 5AQUA 3UB5A 4B1VA 4BG8A 1HLUA 3HM8A 4CD1A 3KZBA 2E1YA 4QS7A 3QFPA 1LOTB 3IFRA 4F9OA 3SK3A 1YUWA 3MK6A 4BC3A 1GLCG 3H1VX 3L6QA 5FPNA 4PKHA 4BRNA 4BRMA 2F9WA 2Q97A 4QS8A 3FLCO 3WEEB 1SZ2A 2E2PA 4FOEA 2ITMA 3VGMA 3VEWA 4JD2B 5AFUH 1HKBA 3ZX3A 4EIAA 3DXMA 2A40A 2FF6A 4HTLA 3A8YA 4PKIA 3QMLA 4H5TA 3UKUB 4JHDB 4O8KA 1WOQA 3A5NC 1MA9B 4H0PA 4K42A 5AQMA 3H45C 5AQFA 4BR4A 5AZIB 5JICA 4I6MA 1CZAN 5BPMA 3U8XA 1XQSC 3O8MA 3WXIA 4B1UB 1D4XA 2FF3B 3BEXA 3EKUA 4Y0WA 2W40A 5AQVA 1C0GA 1T44A 4BRCA 4H0TB 2D0OA 4FWLA 3O08A 5BREA 1ZBSA 2A3ZA 2QM1A 5FPDA 1NMDA 2FLOA 4FWQA 1X3NA 1T6DA 3DWLA 3HSCA 4E1JA 3H1QA 4IZ9A 5BPNA 4DB3A 2PAVA 2P9KA 4CBXA 2GUPA 5AQWA 4BG9A 1G99A 5BRHA 1H1VA 2E2OA 2QWPA 3WQUA 4H0VB 1KXPA 2YHXA 2V7YA 4WQ5A 3IDHA 3J8AA 1TYQB 1IJJA 4JNEA 4BVOA 3ZX2A 5AQPA 1HX1A 5JLFA 1HKGA 3MN6A 4A2AA 3ULEA 2DPNA 2P9SB 5BR9A 1JCFA 1ZXOA 3ZETA 3TU5A 3F9MA 3AARA 5AZJA 5LJVA 2CH5A 5KPRA 5LY3A 1SQKA 3GL1A 1NLVA 4GY2B 3FR0A 1C0FA 3QBWA 3RSEA 3VESA 1HUXA 5AQRA 4CZIA 5KPTA 2E88A 2IIRA 2GEMA 1U2VB 3GBTA 2D0PA 1V4SA 2A6AA 4M63C 5EOYA 3SLCA 4FOIA 4K25A 2QWNA 2OANA 5I9EB 3WXKA 4CBUA 2FSJA 4NO7A 4A62A 3LM9A 2CGLA 2P9IB 3FZKA 2GWKA 4FWNA 3VEOA 4FWKA 4H0YB 3O5BA 1TUYA 4CZKA 1NGGA 5AQJA 1BOTO 3CQXA 4BQLA 3DXKB 4WQ5C 5AQZA 3C0BA 5E84A 1RGIA 5JLHA 4EAHD 2ZF5O 1QQNA 4YDUA 4M7XA 4CZEA 4FWMA 3CIPA 1ATRA 2A5XA 2P9NB 1NGJA 1QHAA 2BUPA 5KQ8A 2UYTA 4GNIA 1NGHA 2V7ZA 2E20A 1P8ZA 3LDOA 4BR0A 3FZMA 3WEEA 3LDLA 5EVZA 3GG4A 4ISFA 2QWLA 3CJCA 3WUHA 3AY9A 4JD2A 2D4WA 3O80A 3MDQA 5BN8A 4IO8A 2ASMA 4RCHA 2H3GX 2ZWHA 1GLAG 2E2NA 1BA1A 3UKUA 4JHDA 3ZX0A 4PL8A 1BO5O 2CH6A 3BP8A 3HBTA 5JMVA 5AZIA 2ZGZA 4H03B 3H3NO 3QBXA 5F0XA 3M1FA 2GELA 3B8AX 3CJBA 3EL2A 1X3MA 4B1YB 5BRFA 3UKRB 5KQDA 4JAXA 1TUUA 1NGBA 4BROA 5EXWA 4BC2A 5EY4A 4L3QA 4YDUC 3GE1A 1GLBG 4MO5A 3CETA 3CQYA 3MCPA 5BN9A 4BR5A 1QZ6A 5AQHA 2J4RA 5AQXA 5BRDA 2AA4A 4FSVA 4BC4A 3LDPA 1MWMA 3W0LA 3QB0A 2KHOA 4IJNA 5AQQA 3L0QA 1KAYA 2F9TA 4LC9B 3O4WA 2NRHA 1DKGD 3LDQA 5TKYA 3ZEUB 4BRLA 4HWIA 4JN4A 2QWRA 3JXUA 3EZWA 4BRDA 1YAGA 4IJAA 5AR0A 4CZJA 3M3ZA 2VYPA 4H5VA 4WYBA 4BREA 1NGEA 4QS9A 4BVPA 3H6EA 1TYQA 3KHYA 4DQ8A 4XH5A 2Q1NA 4EHUA 1JCEA 2IVPA 3CJ9A 2P9SA 4K43A 2EWSA 4DHYA 2CGJA 3R9PA 2PBDA 1GLLO 3I8BA 4A2BA 4H5RA 3OHRA 3MN9A 4PL7A 5ADXA 2VCPA 2YCHA 1KAXA 3U9DA 2IVOA 2NZTA 3VF2A 3A0IX 3FZHA 3CJ1A 3A5OC 1U2VA 1T6CA 5KPZA 1BU6O 4BRHA 1NGCA 3W3DA 2YJFA 5AQOA 2BTFA 4H5NA 2A42A 2FSKA 5AQNA 1S22A 3U9ZA 5AQSA 5FPMA 4BC5A 1XC3A 2P9IA 3D2EB 4EHTA 3VF6A 3EKSA 4CZMA 3R8EA 3IMXA 4FWPA 3VENA 3MN5A 2HF3A 5ELZA 1RFQA 1Z05A 3ATVA 4H0XB 4BR2A 5LJWA 3DXKA 4BRQA 2YHYA 4RTFD 1OKJA 4K41A 2W41A 3FZFA 1ZC6A 1NGFA 1X9JA 3GOIA 1Y64A 1QZ5A 1MDUB 3ENHA 2ASPA 2HF4A 4CZLA 2IVNA 4BRKA 4BR7A 3JS6A 2P9NA 2E1ZA 3L4IA 2P9UB 4XEIA 1U6ZA 3GDQA 2HMPA 1NGIA 4A61A 4CZHA 2P9PB 1XUPO 3ATUA 4XH1A 3D2FB 3O1WA 3SMSA 4FL9A 4BRFA 4FWRA 5EX5A 1MWKA 4FWOA 1IG8A 4J8FA 1NGAA 2Q0RA 1DEJA 3VEZA 3TPQA 4B1WB 2GWJA 1DGKN 4RWTA 4CD3A 3UKRA 2E2QA 3S41A 4B1ZA 3C7NA 1ATSA 3C7NB 1YXQA 2I7NA 4Z94A 2I7PA 1ESVA 1HKCA 2ASOA 5F2RA 3EO3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SQ4A 2X6NA 4GV6A 1KAZA 3AVNA 3VTIA 2E5LK 3DXMB 4M7YA 4DCHA 5AQGA 2JGUA 4BGBA 1NWKA 4FO0A 4DTUA 2E8AA 5C12A 3HPHA 4LD0A 3QICA 4IFYA 4KO0A 1N34K 1REVA 4BQZA 4CI6A 4CE9A 3E9PA 1IBKK 3ULDA 3SPZA 1D9FA 1HJOA 4ILHA 4CJQA 1KCFA 3EE8A 4DTSA 3F9KA 4XH4A 4FZXC 1VQMN 4FK0A 3H46O 4KB0A 1QTMA 2HHSA 3E9LA 3AVAA 3V9WA 3K9KA 3RTVA 3K5OA 4CZFA 3E9OA 1BGXT 3ID8A 3WNEA 3AVKA 2NLXA 3LL3A 3T1YK 4FVMA 1WUAA 1GLDG 3NGYA 2FXUA 1JL1A 4R5PA 3CQ8A 3MMVA 4IXCA 4O0JA 3M6GA 1NU0A 4FM2A 4EP4A 4X66K 4FJHA 5AQYA 3CPWM 1K8KA 3HRGA 1WBDA 2DTUA 1GOAA 1K8KB 3KVGA 3HOSA 2HOEA 3OYKA 3CMAN 3LM2A 3K57A 3RRGA 4CBWA 2XY6A 1FW6A 1EXQA 3NH0A 1E4FT 4B1XB 4KH4A 4CFAA 4E19A 2V52B 3ALYA 3SNNA 4LY7A 2D0AA 1OH5A 4ELTA 3T1HK 4B9QA 1BDGA 1VQ4N 1S3XA 2EX3A 1RDWX 4BRIA 1RILA 3CHWA 3PUFA 4LF7K 4BE0A 1IKYA 5E26A 1HYZA 5H1SQ 3VGLA 4FLUA 4IG3A 3WXJA 4BRPA 4CGJA 4HTUA 4FPAA 3QFUA 3H3OB 1VRUA 4MLHA 1KVCA 2GTDA 5C15A 4DFMA 1BG3A 2QXFA 1ZYQA 4AM7A 2P9PA 1KC8O 1Q82O 1TKZA 4Q0BA 4GVEA 4HUFA 3A5LC 4ISEA 1QQMA 3P4IA 5AQUA 3UB5A 4B1VA 4BG8A 1RTJA 4CGDA 4KHUA 1HLUA 3HM8A 3SAHA 5GIPA 3SZ2A 3M8RA 3QFPA 4CK2A 2F7TA 3CCUN 1YUWA 1FXXA 3KLEA 1JXEA 4HUEA 4NXNK 4BRNA 1RCHA 4KKOA 1BQMA 2YNHA 3BZKA 3WEEB 2HVHA 3VGMA 1IV0A 3G0ZA 2IDOA 4YOYA 5AFUH 1D9DA 5HL7L 3ZX3A 1VQ7N 2A40A 4AHSA 4PKIA 5KTQA 3BDPA 2RKIA 4H0PA 4LH5A 5KRSA 5AQFA 4FJKA 5FROA 2O4GA 2FBVA 1K6YA 2O8EA 4IBNA 4NLBA 4HHTA 3O8MA 2O8CA 2ETJA 2P1JA 1BL3A 2F8SA 3O9TA 2W40A 4JEPA 1VQ5N 4M3UA 4Z4HA 4QAGA 4H0TB 4FWLA 4W5RA 1RDAA 3RMCA 1ZBSA 2A3ZA 2QM1A 5FPDA 2HHVA 4KFBA 4LFBK 3C6TA 3C6HA 1CZ9A 3HSCA 3DWLA 1X9MA 4CK1A 3H1QA 3RMBA 3OYMA 4C1NK 4CBXA 2ZE2A 5AQWA 3H08A 3JYTA 2HHUA 2QWPA 4DKWA 2YHXA 3MXIA 2HHHK 4DS5A 3HJFA 3OBYA 3ZX2A 4FK2A 3ZYYX 5BR9A 3CYGA 3ZETA 3LPTA 3NAEA 1NKCA 4W5OA 5LJVA 3VQDA 4C8NA 3P83D 3CM6A 2PYLA 4KI6A 3C95A 3N4QA 3KLHA 1HUXA 3QLHA 4BDYA 3NVMA 2IIRA 5HOOA 4X65K 1JXBA 2VGMA 4CFCA 4FOIA 1RT7A 3PV8A 2EHGA 2UXBK 3G6EN 2P9IB 3FZKA 4BEBA 3VEOA 3HVRA 1I3AA 1NJXA 1NJZA 3HP6A 1UA1A 3C6AA 4BQLA 3TTFA 2D0BA 3VQQA 3ZSRA 4CF1A 4DTXA 3JAMO 5GADP 3QEIA 2PY5A 2PYJA 4FWMA 3TAGA 3CIPA 1QHAA 2UYTA 3M5RA 4WFNL 3EEQA 2F4VK 3O4NA 1KVBA 4AHVA 1NGHA 2PFUA 4TSXA 3CCVN 4FJ5A 1RBSA 4CIEA 5EVZA 4ELUA 4M41A 3CJCA 3WUHA 3NHGA 1IO2A 4JD2A 3O80A 5BN8A 5LMNK 4IO8A 5JVHL 4Y1CA 3ZLJA 1BA1A 4JHDA 3DM2A 3ZX0A 1S6QA 2CH6A 4YOWA 5JMVA 4DWIA 1NK8A 1RT5A 3RMAA 2VQEK 2HNZA 4C8OA 4IOAL 1XC9A 4JAXA 3S3OA 2G8WA 1OVQA 1NGBA 1W97L 5EY4A 5DMRA 5DM6L 1DT9A 1GLBG 5FLXO 1XHXA 2UU9K 4BE1A 5AQHA 4O0IA 1OH6A 5AQXA 4MQ3A 2WTUA 2DFHA 4YHHK 3HL8A 3CF5L 2KHOA 2Z1JA 5AQQA 2QEXN 1KAYA 2F9TA 4EZ6A 3VQCA 2BDPA 2NRHA 3LDQA 1RBTA 3ZEUB 4BRLA 1VHXA 3MCAB 4BRDA 4CJRA 5AR0A 4WCEL 1NK4A 2XHBA 3AVLA 4QS9A 3H6EA 3TAFA 4FJMA 3AVCA 1JCEA 2IVPA 4CF2A 4OGEA 1EX4A 4HUGA 1SL1A 2HBLA 2PBDA 4C8MA 1R0AA 4LF9K 4B3OA 3MN9A 1Z26A 1KAXA 3VTHA 3RWUA 4LSLA 2NZTA 4ILGB 1L5UA 4LF8K 1HQEA 2JLEA 1T6CA 1YJWN 5KPZA 1BU6O 2G8KA 4BRHA 2YJFA 1C6VA 5AQOA 4F3TA 2A42A 3M8PA 1IKVA 2FSKA 4CJLA 4BC5A 4DTPA 4EHTA 2HNDA 4V19S 3L8BA 4M3XA 1KFDA 3R8EA 3DRPA 3SUNA 3SBTA 5HRNA 3MN5A 2HF3A 1EETA 1N32K 4KHWA 4BR2A 3ISNC 2O8BB 4M3TA 3DXKA 4BRQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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