2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
4FWKA 3UE5A 1ZC6A 1QZ5A 2J4RA 2DPNA 2FSKA 5F2RA 2Q97A 3P4IA 5CE3A 3UB5A 4K42A 1HJOA 2F9TA 2P9UB 1WUAA 5EOYA 4Z94A 3VEWA 4BVOA 5EVZA 5I9EB 5TKYA 3QICA 3ENOA 5AQWA 3BF3A 3C7NB 3QDKA 4QS8A 3JXUA 3D2EA 2H3GX 2QWLA 4BRHA 5AFUA 4A2BA 3D2FA 4BRAA 3VOVA 3W3DA 4QS7A 3VPZA 4EHTA 5FPEA 4I6MB 5AZJB 4J8FA 4BRKA 4MO4A 1Z6RA 4B1YB 4CJ7A 2HF3A 1U2VB 3U4LA 3W0LA 1G99A 2V7YA 2VWBA 3I8BA 2P9NB 5BN9A 1MWMA 3A5LC 5AQTA 3I33A 3M3ZA 4QS9A 4FPAA 5AQUA 4CZIA 2IVOA 5AFUH 2HMPA 5AR0A 1NGIA 4H5RA 3ENHA 4ISGA 4XH5A 2IVNA 1NGDA 1SQKA 4BG9A 4FPBA 4GY2B 1XUPO 2ZF5O 3CJAA 1X3NA 4BR4A 3R9PA 2A41A 3FZHA 3LL3A 3ZEUA 2ZWHA 2ZGYA 5B8HA 3ATUA 3O8MA 5AZIB 1ZBSA 2NRHA 3VEYA 1TYQB 1K8KB 1V4TA 3ULEB 5JICA 3CJ1A 1IG8A 2E1ZA 1RDWX 2P9UA 1GLBG 2F9WA 3O1BA 5BRDA 3SMPA 3A0IX 5AQFA 4BRNA 4BGBA 1BWFO 1HPMA 3FZKA 3L4IA 5AQSA 1D4XA 5FPDA 5AQKA 3C7NA 4CBUA 3QB0A 4ISFA 2W41A 3EKSA 4FOEA 4CZGA 4IJAA 3HI0A 2D0OA 3QMLA 4FO0A 5BR9A 3LDNA 3VF4A 3TU5A 2P9PA 3FGUA 3WXJA 4C23A 4BREA 1T6CA 5AZJA 3VEXA 3DAWA 4RTFD 1U2VA 3D2EB 1GLAG 3MN6A 4MLEA 4A61A 2PBDA 4BRIA 2GTDA 2Q0RA 4XH1A 3WQUA 3D2FB 4PL7A 3O5BA 2FSJA 3AY9A 3BF1A 5E84A 2A6AA 3BUZB 4B1WB 3CJ9A 2P9IB 3MN5A 4BRQA 4BR9A 4JN4A 4E1JA 4DHYA 1QHAA 3DXKA 2QWPA 4BRMA 1XC3A 4BG8A 1HKBA 1LCUA 2CH6A 1NMDA 1KAXA 4H0XB 2NZTA 2ITMA 3VF6A 5LJVA 5AZIA 3CERA 4K25A 3CHWA 4CZHA 4JHDB 3GOIA 4IZ9A 4YDUC 3BP8A 3H1QA 1QQMA 5E26A 2FF3B 3U9DA 4B1VA 1CZAN 1Q18A 2D4WA 2WUSA 3ZEUB 4H0PA 5JMVA 3FR0A 3VEZA 2I7PA 4M7YA 5AQOA 3KVGA 1JCGA 3SK3A 1ESVA 5ADXH 4H0OA 3LM2A 2Q2RA 4AM6A 1T44A 1HKGA 1X3MA 3GDQA 4RCHA 2FSNA 3EN9A 3O80A 3QBXA 2QWNA 4FSVA 1OKJA 4BRCA 4HTLA 3A8YA 4MLHA 2P9PB 3AAPA 2Q0UA 3A5MC 3R8EA 1NGFA 2P9IA 5ELZA 3VEVA 3VEOA 4CZEA 2ASPA 2E88A 1R59O 3KHYA 5AQMA 4B1XB 5LJWA 2V7ZA 3MMVA 5BN8A 1BU6O 3SMSA 4H03B 4FWSA 3VERA 5KQ8A 4DQ8A 3WEEA 3VF2A 1NGGA 1YVNA 3ZX3A 4EIAA 3FE1A 5AQLA 4JHDA 3DXKB 3QFUA 2CH5A 3IUCA 1C0GA 5EXWA 3CJCA 1Y64A 4K43A 5AQQA 1NM1A 3ZETA 5F0XA 4BRPA 5AQYA 2AA4A 1P8ZA 2OANA 3JS6A 4ISEA 5BRHA 3H3OB 1RGIA 1NGCA 5FPNA 5JLFA 5EY4A 2BTFA 4IO8A 3EKUA 2E2OA 5LY3A 5KPTA 4BRGA 3HZ6A 5AQRA 4CZMA 3VGKA 3QBWA 2VCPA 3IFRA 2CGJA 2E2QA 3AARA 4JAXA 3MK6A 4M63C 2V52B 1GLEG 3F9MA 1GLFO 4YDUA 2A40A 4BR7A 1C0FA 4CD3A 3DWLA 3IMXA 2QW9A 2CGLA 4PKGA 4FWLA 4B1ZA 3ID8A 3VGLA 4H5WA 1DKGD 1NGHA 1EQYA 3GG4A 4CZFA 3DXMA 1QZ6A 3G25A 3EL2A 3RSEA 3FZMA 3H6EA 3CI5A 4CZKA 3LDOA 2YHXA 3L6QA 1NGBA 1SZ2A 5EX5A 4BVPA 4Y0WA 3GE1A 5BREA 3GL1A 2NLXA 3VENA 2QWMA 5BPLA 1S3XA 1NGJA 2QWQA 2ASMA 3MDQA 4HWIA 1BO5O 3WEEB 1NGAA 4BC5A 5JLHA 1NBWA 2GEMA 3IDHA 3WXKA 1Z05A 3MN7A 4XEIA 3DJCA 2BUPA 2AP1A 2FF6A 4DB3A 5F1XA 4XH4A 1KXPA 4CZLA 3EO3A 4WQ4C 5FPMA 4JD2A 3ZETB 1MWKA 2GELA 4BQLA 3FLCO 4FWOA 4RWTA 2FLOA 2IIRA 3CQYA 4H0VB 1GLJO 4F9OA 2P9LA 3UKRA 4BR5A 2D1KA 4AM7A 2HF4A 1MA9B 3HBTA 3WT0A 2HOEA 3U8XA 1SAZA 3O1WA 1TUUA 4BC3A 2IVPA 4A2AA 3WXIA 2QM1A 1YAGA 2V51B 2A5XA 1H1VA 4BC4A 3S41A 5AQNA 3WQTA 1ATNA 2Q1NA 2UYTA 2YHYA 2YJEA 4DCHA 2W40A 4O8KA 3CIPA 4A62A 4FWNA 4EAHD 4BRFA 4CBXA 1S22A 4WQ5C 3O4WA 2YI1A 5AQVA 3U9ZA 4FWPA 4IWVA 1LOTB 3MCPA 3DXMB 1QQNA 3H45C 3RSEB 2P9SA 4EFHA 2QXLA 3LDQA 4H5VA 2E8AA 4BQZA 5AQPA 3LM9A 2Q31A 3KZBA 2P9KB 4IXCA 2QWRA 3H3NO 4FL9A 4FWQA 1BDGA 3LDPA 3UKUA 3SLCA 4PL8A 5KPZA 4K41A 1E4GT 3AAQA 4B1UB 1ZXOA 4LC9B 3EZWA 1WOQA 3MN9A 1NGEA 1HKCA 4MO5A 1E4FT 3FZFA 3VESA 3O6WA 1BA0A 4H0YB 3WUHA 4B9QA 1DEJA 1V4SA 3M1FA 1KAZA 1DGKN 2E2NA 4JD2B 1GLDG 1MDUB 3CQXA 1ATSA 3HSCA 2PAVA 3TPQA 1ATRA 3OHRA 3HTVA 4BRDA 1XQSC 2P9LB 4H5TA 3UKRB 3VETA 2ZGZA 3CETA 2I7NA 2GWJA 2EWSA 5KPRA 1GLLO 4WQ4A 4CZJA 2E1YA 3M6GA 3ZX0A 3O08A 4NB4A 5AQZA 2QWOA 1HLUA 3D7EO 2VYPA 3WXLA 3H46O 2GWKA 3J8AA 1QQOA 5KQDA 2A42A 5BPMA 3L0QA 2KHOA 4NO7A 4BRLA 5AQHA 2P9KA 1YUWA 5BPNA 2E2PA 4WYBA 1YXQA 4O5FA 1HUXA 1NWKA 1J6ZA 4M7XA 3A5OC 1BG3A 2A3ZA 5AQXA 4BR2A 3C0BA 4BROA 3H1VX 3VGMA 4I6MA 2P9SB 2ASOA 4L3QA 3CJ7A 2GUPA 3HM8A 2P9NA 4WQ5A 1JCFA 3UKUB 1KAYA 3B8AX 3ATVA 5AQGA 4BGAA 4BC2A 1BOTO 3BEXA 4GNIA 4FWMA 4IJNA 3QFPA 3ZX2A 1NLVA 4PKHA 1X9JA 4CD1A 3FFKB 3A5NC 4BR0A 3GBTA 2E20A 4H5NA 4JNEA 4CBWA 1BA1A 1JCEA 4H0TB 1BUPA 4CI6A 2D0PA 1RFQA 2CGKA 5AQJA 2Q36A 4KBOA 2YHWA 3SJHA 3FZLA 1TYQA 5ADXA 1K8KA 3ULEA 1GLCG 4FOIA 1TUYA 1HX1A 5BRFA 2YCHA 4EHUA 1U6ZA 3LDLA 3CJBA 2FXUA 2YJFA 1T6DA 4FWRA 1IJJA 4PKIA 3R6MA 5AQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZC6A 1BIZA 3TTCA 1YJWN 2VG7A 3DRSA 4JKGA 5F2RA 1NK0A 3PX0A 5CE3A 3OYNA 4K42A 3OS2A 4H4OA 3THYA 1XWLA 2YNHA 4Z94A 3VEWA 1D5AA 4CIEA 2W6KA 4PHTX 4DV2K 3QICA 1VQKN 4F2SA 4QS8A 2XY6A 1LWEA 1WB9A 4CJ4A 1QSYA 5AFUA 1EX4A 3SYZA 1UA1A 3BGRA 3W3DA 4ILHA 3VPZA 4EHTA 3RMAA 2G8HA 3TTDA 2JWKA 2A1RA 2HF3A 4DU1A 3IRXA 3U6FA 4EP5A 3KKSA 3W0LA 1G99A 3I8BA 3KLHA 5CYQA 3KJVA 1RT2A 3I33A 4QS9A 3TTFA 4FPAA 4BE2A 3QETA 2ZD1A 3OYKA 5FROA 1XC9A 1NK7A 3ENHA 4FJ8A 5IT9O 2HSTA 2IVNA 1NGDA 4FPBA 4DSLA 1XUPO 2XHBA 3E1YA 1KD1O 4CEOA 4FM0A 1U4BA 3LL3A 3VQ9A 3HOTA 5B8HA 2UUAK 4CVNE 1V4TA 3OVNA 2X78A 4JI1K 4WFNL 1B92A 2E1ZA 5GAGP 2NRVA 5LMNK 4E1MA 2P9UA 3S3OA 1HR0K 2FBXA 3WNFA 3SMPA 3I8DA 1WSIA 2HVIA 4BGBA 1BWFO 4JKEA 2E5LK 3V9SA 1HNVA 5AQSA 4IFEA 3IG1A 1S1UA 1T8EA 1N6QA 2W41A 3TSUA 4FOEA 3ZSQA 4CZGA 1QE1A 2D0OA 2A1SA 2P9PA 4IDKA 1VSHA 1RT6A 1T6CA 5AZJA 4RTFD 3K5LA 1U2VA 5CZ1A 1VQLN 2PBDA 2XRIA 2GTDA 5CR4A 2G8FA 2QKKA 2A6AA 3PO5A 4KO0A 2NRRA 1ZBFA 1XNQK 1VQON 3JYTA 4A57A 2P5GA 4DHYA 1QHAA 2D5RA 4Z0UA 4BRMA 4KHSA 3AVBA 4CF9A 4DV5K 4W5NA 3E9OA 2NZTA 1KFDA 4C8NA 3OYGA 5I42A 3GOIA 4IZ9A 4YDUC 3BP8A 5T7BA 3U9DA 4KH5A 2D4WA 3AVNA 4YFUA 5JMVA 1BI4B 4OO1J 1C6VA 1VSJA 3QEIA 1CXQA 1W7AA 3O80A 3AVJA 2QWNA 2OA8A 2FC0A 5M1OA 1RT5A 4YOVA 5HRSA 4E3SA 2Q0UA 1K9MO 2IC3A 4FZZA 4CZEA 2KFNA 3EEQA 4FJ7A 2E88A 1R59O 3AVCA 5AQMA 2VWJA 1L5UA 3OTOK 4C8OA 3MMVA 3OS0A 4FJHA 3CCVN 5KQ8A 3VERA 3LP2A 2HBLA 1YVNA 4LSLA 1TGOA 3DLGA 5J2PA 4DQQA 4JK7A 3IUCA 4NLBA 4CW7B 5AQQA 4K43A 1XNRK 2FBVA 5J2MA 4ELTA 3SAFA 4IFYA 2AA4A 4Z4IA 1ASVA 4ISEA 4AHUA 4CF2A 4CHZA 3KK7A 5FPNA 1CZ9A 2QEXN 4BRGA 1P90A 3PV8A 3CM6A 4CZMA 3VGKA 3SBGA 3QBWA 2JGUA 4JYAK 2CGJA 2E2QA 1Z26A 3AARA 3F9MA 5HOOA 3KTQA 2BANA 4B9VA 3ASMA 4F3TA 1C0FA 4DTSA 3DOLA 3DWLA 3IMXA 2ZJPL 4F3OA 4NXNK 1M1KO 4KFBA 4B1ZA 1MU2A 4DV4K 3OYIA 5JVGL 3C6UA 5DK5A 3T1AA 3AVFA 1HYZA 3GG4A 4CEFA 5FLXO 1QZ6A 4CZFA 3G25A 3RSEA 3S3NA 3QNOA 2HHQA 3LDOA 1Z25A 1RNHA 4NCBA 3VQEA 4Y0WA 3KD5E 4DTNA 3GE1A 2XO7A 3SQ2A 1FXXA 4GVMA 4OPJA 5BPLA 2QTDA 2G8WA 3B6PA 4ICLA 3R3LA 1Q7YO 3WEEB 4PUOA 4BC5A 2Z1HA 5JLHA 3OYFA 2KW4A 3UIQA 1RBTA 5I3UA 2O4GA 1K8AO 2FF6A 3RTVA 2RPIA 4XH4A 3FFIA 1HPZA 4WQ4C 4JD2A 1MWKA 4AHSA 4M45A 4B8CA 4O5BA 3FLCO 4BWMA 4BQLA 4E7KA 3LANA 2P9LA 3UKRA 4RW9A 2XY7A 4KB0A 4CFAA 4DR2K 2D1KA 4AM7A 4FK0A 2HHTA 2G8KA 1JLEA 4A2AA 3WXIA 3DRPA 2VGNA 4LFCK 2GX9A 1Q81O 2P5OA 4JI7K 1BHLA 2A5XA 1H1VA 4NLCA 2KKZA 5AQNA 1ATNA 2Q1NA 2UYTA 2YHYA 3SAGA 4E0DA 2WTUA 1C1CA 3CIPA 4EAHD 4PQUA 4BRFA 3CF5L 3V6DA 3HJFA 4IWVA 3L2QA 3SCXA 4JK8A 3DXMB 3TSPA 1GOAA 3DRRA 4CFCA 4H5VA 4BQZA 1S1TA 5AQPA 3LM9A 1VQ8N 4IXCA 3PX6A 1O13A 1XMOK 3H3NO 1BDGA 4O44A 4K8XA 3UKUA 4FM1A 4LSNA 4PL8A 3HP9A 2IAJA 1SV5A 5KPZA 4B9SA 4LC9B 3MN9A 1FW6A 2DFFA 4ID1A 1NKBA 4MO5A 3P31A 1NJZA 3O6WA 4AHVA 3TWHA 2YHBA 4E89A 3OBWA 4E7JA 4HHTA 2O8DB 4QAGA 1GLDG 2YNGA 1KFSA 3TI0A 3TPQA 4O55A 3O4QA 1X1PA 2EX3A 4H5TA 2HMIA 4CJFA 2IGIA 4YY3K 5LMUK 3AO2A 5K14A 2GUIA 1VRUA 3VQ7A 4XJXA 3VTHA 4NB4A 4KHQA 4CJRA 2E6MA 3HXMA 1D9DA 4DQRA 3RRGA 3CCRN 1ZBHA 2VYPA 3H46O 2VGMA 3AVGA 2GWKA 4G9ZA 2O8FA 4ELUA 3L0QA 5BPNA 1YUWA 3HPGA 4X62K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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