2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
2A41A 4CZKA 3LDPA 3BUZB 1NGGA 2HMPA 1J6ZA 4IJNA 4PKGA 4BR9A 3VGKA 1NGIA 1SZ2A 3O8MA 3FGUA 3GDQA 1U6ZA 4BRFA 5AQPA 4B1ZA 4CZMA 3CETA 4K25A 4BRCA 2CGLA 4FOEA 4EHTA 2D4WA 3UKUB 2FF6A 4BRHA 1U2VB 5E84A 1TYQB 4ISGA 2HF3A 4JHDB 3RSEB 5BRFA 4XH5A 1QZ5A 1WUAA 3H1QA 4BG8A 3O5BA 2EWSA 3ZETB 2FF3B 3VF4A 4CZLA 3TU5A 2YJEA 5EOYA 3EL2A 4XEIA 3VF6A 2QWMA 3A8YA 3J8AA 4FWRA 5E26A 1BA1A 2Q31A 4QS7A 1RGIA 1KXPA 2W41A 1NGCA 3M3ZA 2YHXA 3GL1A 3R8EA 1BA0A 5AQLA 1GLBG 4CZGA 3DJCA 2AA4A 2IVOA 4H03B 1QQNA 2Q2RA 4WYBA 5AQIA 3H46O 5EY4A 3CI5A 3M1FA 3EN9A 3A5LC 3BP8A 3SMSA 3W0LA 2VYPA 1DEJA 3UKUA 5BPLA 2A40A 1V4SA 1T44A 2CGKA 4H5TA 1U2VA 2J4RA 2HF4A 2QXLA 3CJCA 1TYQA 3S41A 4JHDA 1YAGA 2E1YA 4CZIA 3RSEA 2V7ZA 3FZLA 1JCGA 2QWRA 3ZETA 4FWNA 4BVPA 3I8BA 2P9NB 2VWBA 3MN7A 3QBWA 1S3XA 3EKSA 3QBXA 4M7YA 1C0FA 2GEMA 1NGFA 3H1VX 4FWPA 4B1WB 2ASOA 5LJVA 2A5XA 2QWLA 5AQVA 3VEWA 1S22A 2D1KA 4DCHA 4PKIA 3LM9A 1ESVA 3MDQA 4O8KA 4EIAA 5BPNA 4CJ7A 3OHRA 5BRDA 3FE1A 2FSKA 3MN5A 5B8HA 3H45C 5AQOA 1X3NA 3D2EB 2GTDA 1BUPA 4JAXA 5F1XA 2P9IA 3IFRA 3WQTA 4BRKA 1MDUB 3WXLA 4B1XB 3QMLA 3VETA 4CD1A 2Q36A 2ZF5O 4AM6A 5AQTA 3FFKB 3KHYA 1T6DA 2BUPA 1OKJA 4FWOA 1KAZA 4FPAA 3AARA 3ENOA 3ZX2A 4A61A 5JICA 2YCHA 2ZGZA 3U8XA 1XC3A 2P9NA 3JXUA 3D2FB 4BQZA 3HSCA 5CE3A 5FPNA 1BDGA 3ENHA 5AZJB 5AQZA 3VPZA 3MMVA 2PAVA 5BRHA 4FSVA 4WQ5C 3ATVA 3CHWA 5AQMA 4WQ5A 3D7EO 1YXQA 5AQNA 3SJHA 2E88A 5KQ8A 1T6CA 3H3OB 2IVNA 4FOIA 1JCEA 4M7XA 4PKHA 4BGBA 2QWQA 1QZ6A 3VENA 1Z05A 4B1VA 1NGJA 4K43A 3D2EA 5AQRA 1ZBSA 1ZC6A 3VF2A 4NB4A 2VCPA 4BRLA 4FO0A 2KHOA 5AQXA 1NM1A 1NGEA 3BF1A 2A3ZA 3A5OC 5AZIA 1EQYA 1Q18A 2Q0UA 4HWIA 3VERA 4IZ9A 3AY9A 4BC2A 1GLJO 5BPMA 3MN9A 2UYTA 3R9PA 2P9SB 3D2FA 3TPQA 3DWLA 3WEEB 2Q1NA 1SAZA 3CJ9A 5JMVA 5AZJA 3H6EA 4CZEA 4KBOA 4A2AA 4ISEA 4BQLA 3P4IA 1HPMA 4RTFD 4DB3A 5AQHA 3SLCA 2YHWA 4CD3A 2V7YA 5BR9A 2WUSA 2ZWHA 3C7NB 5AQWA 4BC5A 5AQYA 1HKGA 2QM1A 3C0BA 2E2OA 2F9WA 3HBTA 5AFUH 4J8FA 5AQKA 3CJ7A 5AQSA 4BGAA 3LDOA 4F9OA 4I6MB 3U9DA 4XH1A 2F9TA 3LDQA 1LCUA 2DPNA 2BTFA 1DKGD 1E4FT 4B1YB 4BRMA 1IJJA 1G99A 1RDWX 1TUUA 2FLOA 1XQSC 5JLFA 1MWKA 4IO8A 5LY3A 5ADXH 4ISFA 2FSNA 2P9SA 3M6GA 3WEEA 4H0YB 4RCHA 2ASMA 4BRGA 1P8ZA 5EVZA 3L0QA 1GLLO 3LDNA 2E2QA 2YI1A 3QICA 4IXCA 5I9EB 1NGHA 4MO5A 3C7NA 1GLCG 3L6QA 3QB0A 4FWKA 1GLDG 3GBTA 4B9QA 4FPBA 4CZJA 5EXWA 5TKYA 4H5RA 2GWJA 3FLCO 2FSJA 1YUWA 1NWKA 5EX5A 2I7NA 3JS6A 1RFQA 4MLEA 3WXJA 1QHAA 4FL9A 1X3MA 4I6MA 3LL3A 3EO3A 5AQQA 4A2BA 5JLHA 3EKUA 4CZFA 1Y64A 1HJOA 3ZEUB 2AP1A 1BG3A 4BC4A 4RWTA 4M63C 3FZFA 4FWSA 1HKCA 4JN4A 3ZX0A 2P9LB 2YJFA 2IVPA 3O1BA 4DHYA 4CBXA 3U4LA 4BRIA 4PL7A 4H5NA 3L4IA 3FZKA 3CERA 2QWOA 1BO5O 1XUPO 1NGAA 3O08A 4WQ4C 4BROA 1NLVA 2E20A 5F0XA 2ASPA 4WQ4A 1ATRA 4K41A 3VEYA 3WXIA 2I7PA 4A62A 4BRAA 3FR0A 1DGKN 2H3GX 2CH5A 1Z6RA 4BR4A 3CJAA 3G25A 3IDHA 1SQKA 3BEXA 4H5VA 2E8AA 4H0XB 5FPDA 4BVOA 1K8KB 4YDUC 4Y0WA 4GNIA 4C23A 4YDUA 5FPMA 3CQYA 3CIPA 3ZEUA 1MWMA 2V52B 4MLHA 2P9KB 1YVNA 1GLEG 2CH6A 2QW9A 4PL8A 2P9LA 4MO4A 3EZWA 3FZMA 3GE1A 1C0GA 1HX1A 4NO7A 3QDKA 3WXKA 2W40A 3GG4A 3HI0A 4QS9A 4L3QA 4H0PA 3HTVA 3QFPA 1NGBA 3UE5A 3KVGA 3W3DA 1BWFO 1X9JA 4BR2A 3QFUA 5KPZA 1WOQA 1IG8A 2D0PA 2Q0RA 4BRNA 1HLUA 4H5WA 4IJAA 4JD2B 3VOVA 4QS8A 1D4XA 3HM8A 4CZHA 3DXKB 3BF3A 1K8KA 3WT0A 1MA9B 3A0IX 5AQFA 3UKRB 1V4TA 1ATSA 3AAPA 2OANA 2P9KA 5FPEA 3ULEB 3UB5A 1GLAG 3VEZA 2E2PA 5BN8A 4CI6A 3VGMA 5F2RA 3IMXA 2E1ZA 1BOTO 5AR0A 2ITMA 3O80A 4CBWA 4FWQA 1H1VA 3ID8A 1QQMA 2GUPA 3ATUA 4H0VB 4GY2B 2A42A 4DQ8A 4BRDA 4H0OA 1QQOA 4BG9A 4E1JA 5KPRA 1R59O 2NLXA 4O5FA 3MN6A 3VGLA 2E2NA 1ATNA 2P9IB 2P9PB 3VEXA 2A6AA 3O6WA 2NRHA 4JD2A 3U9ZA 5AQUA 3WQUA 1LOTB 4BREA 1NMDA 3WUHA 3DXKA 5BREA 2P9UB 4JNEA 4IWVA 4HTLA 4H0TB 3UKRA 3HZ6A 3CJ1A 5ELZA 2GWKA 4BRQA 3KZBA 5LJWA 3ULEA 1GLFO 3DXMB 3VEOA 2V51B 4Z94A 3CJBA 2D0OA 3VESA 3AAQA 2CGJA 3DAWA 2FXUA 4FWMA 4BC3A 2PBDA 2GELA 2YHYA 3ZX3A 2ZGYA 3MK6A 4XH4A 1HUXA 1HKBA 3LDLA 4CBUA 3IUCA 5BN9A 4EFHA 3F9MA 4EHUA 4K42A 3R6MA 2P9PA 1NBWA 4FWLA 5KPTA 3A5NC 5AQJA 1CZAN 5AFUA 1ZXOA 3VEVA 4EAHD 3MCPA 5AZIB 2Q97A 2P9UA 1KAYA 2NZTA 3SK3A 4BR5A 3O1WA 3A5MC 5KQDA 3SMPA 3O4WA 3GOIA 2QWNA 4AM7A 4BR7A 3CQXA 2QWPA 4BR0A 3FZHA 3B8AX 3DXMA 1E4GT 1JCFA 1NGDA 5AQGA 4LC9B 1KAXA 2HOEA 3LM2A 4B1UB 4BRPA 5ADXA 1TUYA 3H3NO 3I33A 1BU6O 2IIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HYSA 1C0MA 4CFCA 5SZTA 5HRNA 3VGKA 2Y1IA 4AHTA 1TKXA 4DS5A 5C15A 1BQMA 4KH6A 4Z4FA 4CIFA 1WN7A 4BRFA 5AQPA 4Y1DA 4CZMA 3CETA 4FOEA 4CJSA 4YNQA 4YORA 3UKUB 1U2VB 5E84A 1TYQB 4ISGA 4JHDB 4JRQA 1U47A 1HNIA 3O4QA 4KKOA 5BRFA 4AHCA 3LZJA 1NK9A 2G8KA 2FF3B 4GW6A 4AH9A 4K8ZA 5EOYA 3EL2A 3VF6A 2BGGA 4CF0A 1EO1A 4DTOA 5E26A 4KO0A 1D9FA 4IOCL 2VQFK 3LP3A 3AVAA 1QVGM 2HMIA 2F7TA 1ASUA 1HJRA 2YHXA 2XY7A 1OVYA 4Q5VA 2C1GA 1QS4A 3NFAA 3DJCA 1W97L 2AA4A 2IVOA 2GBZA 1QQNA 5JVGL 5AQIA 4I9QA 3P5JA 4E0DA 1Q86O 2VYPA 3CCMN 5BPLA 2A40A 2J4RA 5KRTA 1YAGA 2E1YA 3V4IA 4OKJA 3RSEA 3VTHA 4CJKA 1S6PA 1WLJA 5D3GA 3FZLA 3ZETA 1X9WA 1N5YA 3DI6A 4FWNA 3MN7A 4CGJA 4CEOA 3QBXA 4OVLA 4DV3K 1C0FA 2GEMA 1NGFA 2VG5A 3AVIA 1NU0A 2P51A 4FLTA 3BZKA 2O8DA 4CHZA 1S22A 4DCHA 3KK2A 5KGXA 3P1GA 1VSHA 4CJ7A 1VSFA 3OHRA 5B8HA 5KGWA 2KKZA 1RDUA 1JLFA 2X78A 3DLLL 3ZT4A 1CZ9A 3LP1A 2X6NA 4CD1A 1LWEA 2Q36A 2ZF5O 3L2RA 1K9MO 3FFKB 2YKMA 5JICA 2YCHA 1JXBA 2UUCK 3RWUA 1IKYA 3E9PA 1VQLN 2ZQBA 4CECA 3BY5A 1OH7A 3VPZA 5AQZA 4CJEA 1U48A 4KHNA 1EXQA 4H8KA 2PYLA 1KC8O 2E88A 1J9AA 4FW2A 1REVA 1TK5A 5FDLA 3VQCA 4I2PA 1DLOA 5C24A 1QZ6A 4B1VA 3AVJA 1OH6A 1NGJA 4V19S 4K43A 3D2EA 4CW7B 1ZBSA 2EHGA 4DG1A 3CYMA 3OYIA 2IAJA 5JVHL 3LPUA 2KHOA 2B6AA 5AQXA 1S1UA 4DFKA 4N5SA 5DM6L 3NVMA 3FFIA 5AZIA 3DLGA 2Z1JA 3SAGA 1GOCA 2Q0UA 4BC2A 4FLVA 3DMJA 3L2WA 3MN9A 4B3OA 2P9SB 3DWLA 5FRMA 4W5TA 4DU3A 3NF7A 5H1SQ 1D8YA 4C8NA 4DWIA 4LY7A 5AQHA 3ZT1A 2V7YA 5BR9A 2WUSA 2FBYA 3JYTA 3C0BA 3MAQA 1KFSA 5AFUH 3CC2N 1VSLA 4CFBA 4FM0A 4J8FA 3HO1A 4OGCA 3CJ7A 4OPHA 4F9OA 4I6MB 3U9DA 1WSEA 4XH1A 3ZSXA 2OPPA 3NGZA 4FLWA 3AVMA 4ID1A 4FZYA 4IDKA 1DKGD 4B1YB 3MECA 4K0KK 1JXEA 3CM6A 1IJJA 2QKKA 1HNXK 1XMQK 1G99A 1TUUA 3NCIA 5JLFA 2OPSA 1TAUA 5LY3A 4G1QA 4BE1A 2G8HA 2Z1IA 5ADXH 1L3VA 3AVBA 3WEEA 4H0YB 3SAHA 4B9SA 2ASMA 4BRGA 1P8ZA 5EVZA 3KLGA 3L0QA 3CCRN 5LL6Z 2YI1A 4DLEA 5I9EB 4JI3K 2HNDA 3LZIA 4FPBA 5EXWA 3HXMA 4EP5A 4R79A 5M1PA 3NF9A 4FZXC 4AHUA 3WXJA 4Z4HA 1YT3A 3RMCA 4GV3A 1EWRA 3MWPA 3OY9A 3NGIA 5AQQA 4A2BA 3AA2A 4L8RB 4F4KA 2JLEA 4DTPA 2AP1A 1BG3A 3VA3A 1RT6A 1K73O 4M63C 3AO4A 1HKCA 4FWSA 4KV8A 2YJFA 4DV4K 3L2VA 3U4LA 1ZYQA 4IOXA 3L4IA 3VN5A 1VQ7N 4B8AB 1J54A 2QWOA 1BO5O 2DFFA 1XUPO 4O0JA 4FLXA 1NLVA 2E20A 4IDHA 1N33K 3E01A 3VEYA 3WXIA 2ZJPL 3D0PA 1X9SA 4B9LA 3G25A 4LF6K 3BZCA 4KHPK 4H0XB 4NCAA 1SKRA 4Y0WA 3AO5A 2HVHA 4GNIA 4I7FA 3ZEUA 2V52B 4FM1A 2P9KB 4DFJA 2QW9A 2RKIA 3QNNA 4MO4A 3KTQA 4DSEA 1HX1A 4JKEA 3E9OA 3PUFA 3QDKA 5J1EA 1IKXA 5K14A 2PFUA 4BY9C 4CJ3A 1NGBA 4FLZA 3KVGA 3W3DA 3NF6A 3SUPA 2RPIA 3QFUA 2NRXA 4LSLA 3QETA 1J5EK 4JI6K 2OPRA 4YOVA 3MXJA 4AF1A 3VQ8A 4JD2B 1D4XA 1JLGA 3HM8A 4CZHA 1U49A 4B9UA 3TAEA 4CHQA 3UKRB 5J2PA 1ATSA 4JKCA 1JKHA 2IGIA 5FPEA 3ULEB 4O5BA 3UB5A 3VEZA 4MQ3A 3TTCA 3VGMA 1HMVA 3SUOA 4KB1A 5F2RA 3IMXA 2E1ZA 5AR0A 2YKNA 2ITMA 3HM9A 1VQMN 4FWQA 5FROA 3ID8A 4JI7K 3ATUA 1Q9XA 3U6FA 4DSLA 4H0OA 1XNQK 1X9MA 3HP9A 3WNFA 4BG9A 2E2NA 2P9IB 5GAEP 1EX4A 3SI6A 1LOTB 1NMDA 5BREA 4ELTA 1C1CA 2R7YA 5DM7L 2P9UB 3K57A 2PY5A 4IWVA 3DLKA 5J2NA 2W6LA 3HZ6A 4BRQA 1YJNN 2GWKA 1J53A 3KZBA 2E5LK 2D0AA 3PX4A 4CEBA 3TWHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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