2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
4FWKA 4CZKA 2E2PA 1NGHA 1JCEA 1KAXA 4K41A 3C7NA 3CHWA 4RCHA 4BRNA 1CZAN 1QQMA 3M3ZA 3UKUA 3CJ1A 4NB4A 1Q18A 4WQ4A 2ZWHA 3ZX3A 1QQNA 3B8AX 3WQTA 1WOQA 3VEZA 1T6DA 4BGBA 2HOEA 3GG4A 3A5NC 5AQYA 4GY2B 2Q2RA 4MLHA 1GLDG 3SJHA 1GLFO 2BTFA 1KAZA 3QMLA 5KPTA 1HLUA 1ESVA 1X3MA 1X9JA 3ATVA 2GTDA 2CGLA 2QW9A 3EL2A 2YI1A 3QBXA 4Z94A 5AQFA 2CH6A 3IMXA 3MN6A 1XUPO 3WXKA 3ENHA 5B8HA 4NO7A 1HKGA 2FSJA 3WXIA 2P9NB 2Q0UA 5KPZA 3HM8A 3HBTA 4KBOA 4DCHA 3DAWA 1BOTO 4FWSA 1MDUB 3UB5A 3CI5A 2P9PA 3U9ZA 4BRKA 3H45C 4K25A 5AQOA 4FWQA 3UKRA 5AQLA 3R8EA 3SLCA 3M6GA 2J4RA 3TPQA 2V7ZA 5EY4A 3WUHA 1R59O 3DXMB 1U6ZA 1NGGA 3D2EB 2DPNA 1BA0A 2W41A 4BR4A 4RTFD 3BF3A 4H5RA 4BR9A 5AZIB 1YVNA 1QHAA 4FWOA 5AQRA 4B1UB 2E1ZA 3QICA 2HF3A 2A40A 2CGJA 4FOEA 1SZ2A 4O5FA 3J8AA 2FF3B 2A6AA 4PKHA 1MWKA 4BR2A 1NGAA 4BC5A 1DGKN 2GWJA 1GLLO 3IDHA 4B1WB 3IFRA 3LDQA 1GLEG 4BR0A 1HKCA 4IJNA 5E84A 1V4TA 3BUZB 3R9PA 3H1QA 3ZEUA 4BRAA 1NBWA 1NGBA 5BN9A 4JHDB 4CJ7A 2IVNA 4H03B 2CH5A 5FPNA 3ENOA 3ZX2A 5KQ8A 4M7XA 3FZLA 1ATSA 4BRCA 1SAZA 4FPBA 2E1YA 3UKUB 4I6MB 4BRPA 1WUAA 2QWPA 1GLAG 3KVGA 4H0OA 5JLHA 4FWRA 3HZ6A 4H0PA 4CZMA 3BF1A 4I6MA 4BRGA 4IZ9A 1TYQB 1BU6O 5AQPA 5F1XA 4CBWA 2QWNA 2E20A 3CJCA 2GWKA 3W3DA 2I7PA 5F2RA 3ULEB 5AZJB 2QXLA 1LOTB 5BPLA 2NLXA 4JNEA 5BREA 3ID8A 5ADXH 4BC3A 2ASMA 5I9EB 4CI6A 1ATNA 1GLJO 3LDNA 4BRMA 3RSEB 2QWMA 2P9UB 1XQSC 4H5NA 4CZFA 4PKIA 4XH1A 1ZBSA 3QFUA 3S41A 4DQ8A 2D1KA 1QQOA 4FSVA 1YXQA 2YJFA 2P9PB 3BP8A 1C0FA 1T44A 2HMPA 3ZETA 3CQYA 3LDOA 4H0YB 4XH4A 4ISEA 4XEIA 1DEJA 2IIRA 2P9SA 4EFHA 5JICA 2FSNA 2GEMA 4L3QA 4CD1A 1MA9B 4QS8A 2Q31A 3A5OC 3H6EA 3CJ7A 2ASOA 4HTLA 4BG8A 3KHYA 3H3OB 4BRDA 5AQZA 3JXUA 4BRHA 3O4WA 4WYBA 3FZMA 1RDWX 3MN7A 1K8KA 2QWLA 1NLVA 3C0BA 3KZBA 2QWQA 4CZLA 3ZX0A 2E8AA 4AM6A 3BEXA 1HUXA 4ISGA 4J8FA 1KAYA 2IVPA 1MWMA 2PBDA 4JD2A 1LCUA 2QWRA 5AZIA 4CD3A 2E2OA 3ZEUB 4DHYA 3CERA 4A62A 4QS7A 1HX1A 3A5LC 1NM1A 4FL9A 3O1BA 3VF2A 4EAHD 2CGKA 5CE3A 4EHUA 4FO0A 3VEVA 4MO4A 1NGIA 1V4SA 3WEEB 2AA4A 4CZEA 1YAGA 5FPDA 4WQ5A 3U8XA 1NGFA 3D2FB 3QBWA 4EHTA 3VOVA 1EQYA 3MN5A 3P4IA 2A42A 1BA1A 2W40A 3EKSA 4MO5A 3A8YA 4PL8A 4BC2A 4H0VB 3FE1A 5AFUA 3O8MA 1GLBG 1QZ5A 2Q0RA 3EO3A 3HSCA 4BVOA 3H3NO 1JCFA 3SMPA 5EOYA 3LM9A 3H1VX 2FXUA 5TKYA 3CJAA 3CETA 2Q97A 4B1YB 4BRFA 3I8BA 1DKGD 1K8KB 4WQ5C 3FFKB 2YHWA 3TU5A 3GBTA 4CZIA 3O5BA 5JLFA 2F9WA 3HI0A 3QB0A 4CBUA 1C0GA 1HJOA 2E88A 3RSEA 3GDQA 2ZGYA 4QS9A 3CJ9A 3A0IX 4BREA 2NRHA 3OHRA 1Z05A 2D4WA 5BRHA 4BR7A 4E1JA 5LY3A 3UE5A 3VEXA 4B1XB 2Q36A 3ULEA 2AP1A 3W0LA 1J6ZA 3GE1A 4BRIA 3LL3A 3M1FA 5BRFA 4YDUC 2V51B 4HWIA 3WT0A 3U9DA 1YUWA 3VETA 5BPMA 2YJEA 4EIAA 2YCHA 5AQSA 5AQQA 3JS6A 5AQKA 2UYTA 1RFQA 4RWTA 1BG3A 1JCGA 1NWKA 1OKJA 4H5VA 4O8KA 2KHOA 3VGLA 5BR9A 4K43A 2NZTA 5AQWA 4JHDA 4AM7A 3DXMA 5AZJA 3O1WA 3VEOA 1SQKA 3U4LA 3VEWA 3DWLA 4F9OA 4BROA 1IG8A 5AQGA 4IXCA 4MLEA 5F0XA 3AAQA 1BDGA 2P9KA 5AQNA 4CZGA 5ELZA 2QM1A 2EWSA 3SMSA 3CQXA 4CZJA 2QWOA 4B1VA 2FF6A 2F9TA 3R6MA 4BG9A 1S22A 3FGUA 4K42A 5BPNA 4JN4A 2I7NA 3VESA 3VF6A 3DXKB 2PAVA 4FWNA 4JAXA 4LC9B 5LJWA 3GL1A 3FZHA 4CBXA 3WXJA 2YHXA 1Y64A 4FWLA 4BRLA 5AQJA 3FZFA 3VGKA 2ASPA 1BO5O 2P9LA 3D2EA 4A61A 3C7NB 4M63C 2ZF5O 5AQIA 5JMVA 5E26A 4GNIA 3UKRB 5AR0A 3VGMA 3SK3A 4DB3A 4ISFA 1H1VA 1U2VB 4B9QA 3VENA 3WEEA 3MCPA 4BQZA 2D0OA 4Y0WA 5AQHA 1ZC6A 3FZKA 3G25A 5EVZA 5KPRA 4IWVA 3EN9A 3EZWA 1BUPA 4BRQA 2P9SB 3VPZA 1TUUA 5ADXA 1G99A 3LDLA 3FR0A 4WQ4C 2ITMA 2V52B 3A5MC 3O6WA 2A41A 3O08A 3VEYA 2HF4A 4A2BA 4H5TA 2E2QA 3WQUA 1GLCG 3L0QA 3H46O 1NGJA 3AAPA 1TYQA 4BR5A 3QDKA 3F9MA 3CIPA 3HTVA 3D7EO 2YHYA 5AFUH 4B1ZA 2P9IA 4M7YA 1S3XA 3L4IA 3LM2A 4FWPA 4BGAA 5EX5A 2P9UA 4FPAA 3QFPA 2P9KB 2E2NA 5FPMA 1ATRA 1Z6RA 2GUPA 4H0XB 5LJVA 1ZXOA 3DJCA 3O80A 4PKGA 4IO8A 3MDQA 5AQMA 1HPMA 2WUSA 4A2AA 5AQXA 5KQDA 2IVOA 5BN8A 4H0TB 3IUCA 3AY9A 3ZETB 1NGDA 2H3GX 1E4GT 5BRDA 2BUPA 3VERA 3ATUA 4IJAA 3DXKA 3L6QA 1U2VA 1X3NA 3MK6A 5EXWA 4C23A 3FLCO 1E4FT 3D2FA 3WXLA 4FWMA 3GOIA 3CJBA 2A3ZA 3MN9A 5AQUA 1D4XA 4FOIA 2P9NA 2VCPA 4H5WA 1NGCA 1NMDA 2VWBA 3I33A 5AQTA 4XH5A 1NGEA 2P9LB 2P9IB 1HKBA 1XC3A 1RGIA 3LDPA 3AARA 2V7YA 3VF4A 1KXPA 2Q1NA 3MMVA 4BC4A 4BQLA 2VYPA 4YDUA 2A5XA 4JD2B 2FLOA 2FSKA 2GELA 1BWFO 5AQVA 5FPEA 1QZ6A 2D0PA 1TUYA 1P8ZA 4BVPA 3EKUA 4PL7A 1T6CA 4CZHA 1IJJA 2OANA 2ZGZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJKA 4CEEA 4N41A 3QINA 1VQ7N 2UUBK 3S5TA 2YNGA 1I94K 4FWKA 4FLUA 3THVA 4CZKA 2E2PA 1NGHA 2FBTA 2FBXA 2QI2A 4IBNA 4KHUA 4O44A 4LSNA 4BRNA 3VN5A 1R0AA 3RRGA 3KLGA 4JLHA 1WOQA 3VEZA 5AJ3K 1K73O 4DR1K 4CW7B 4MLHA 2Q2RA 4FXDA 1GLFO 2BTFA 1KAZA 5KPTA 1HNZK 5MLCQ 3ATVA 1ESVA 1X9JA 2GTDA 3EL2A 3KWIA 3QBXA 1CZ9A 4JI4K 1WBDA 4CESA 4ICLA 3WXKA 1RT4A 1RTDA 5B8HA 4NO7A 4CHNA 3AVJA 2VGNA 2XRIA 2VQEK 3CCEN 4BE1A 3DAWA 3UB5A 4B8CA 3CI5A 2HHUA 3P83D 1S5JA 5J2MA 4FLYA 4B3MK 3HPGA 3SLCA 5GAHP 3WUHA 4CJUA 2Z1HA 2W41A 1T7PA 3AVHA 4RTFD 1QSYA 3M5RA 3BF3A 4H5RA 4LF6K 5I3UA 4BR9A 2Y1JA 1VSLA 1KLMA 5C15A 2E1ZA 1I39A 3SJJA 2A40A 4Q5VA 3C65A 1RTJA 1VQ8N 2HHHK 3D6RA 1NGAA 1S6QA 3T1AA 1GLLO 3DLGA 3IFRA 3IKMA 4CJPA 1HYVA 4BR0A 1V4TA 3BUZB 4LH4A 3NH0A 2DFHA 3ZSWA 3CCSN 3V1OA 5KQ8A 1J5EK 4BRCA 3MX5A 2E1YA 3UKUB 4I6MB 3I0RA 2HHIA 3KVGA 5JLHA 3SPYA 1Q81O 3CPEA 4DR4K 1QHTA 1RBRA 1S1WA 3VQ7A 1C0UA 3W3DA 4JI2K 5F2RA 2X78A 5BPLA 2NLXA 1W0HA 1WSIA 3QNNA 1NK4A 5M1KA 4CJKA 1KQSM 4KHNA 4H5NA 1ZBSA 1VQ4N 1D8YA 1LWEA 1GOCA 4JI1K 2OPQA 1LW2A 4ILHA 3QERA 1BHLA 4XH4A 5C0YA 4DV4K 4C8LA 2F8SA 1WB9A 4EFHA 2GEMA 4V19S 1JKHA 3ITHA 1OVYA 3JXUA 4FJLA 3O4WA 3R3LA 4CIGA 1G15A 4FJJA 2VWKA 3MN7A 2WBNA 1K8KA 1RT7A 3BY5A 3PX4A 3DLHA 3KZBA 2W6LA 4XIUA 1FK9A 1VAZA 4ISGA 4CHOA 4IOAL 2ATQA 4C8NA 2IGIA 4E19A 4Z0UA 2HMIA 2PBDA 1LCUA 4HUEA 4FJIA 2D5RA 4CD3A 3ZEUB 4JKEA 4A62A 2UU9K 1IKXA 1NKBA 2HSTA 3SUOA 5CZ1A 1NGIA 3OJSA 1LWCA 2AA4A 3THXA 3AVKA 4UQGA 1EQYA 4LH5A 2W40A 5FRNA 4CECA 4ID5A 2DFFA 5KRTA 3C6HA 1SL2A 3FE1A 5AFUA 3O8MA 1GLBG 3F2KA 4Z4IA 1RCHA 4LF4K 2HBJA 3HSCA 3SQ1A 1EO1A 3KD5E 2OA8A 2DY4A 4IEIA 1NNEA 4B1YB 1IBMK 3PUFA 4WQ5C 4Y1DA 1JLEA 3MEDA 4NXNK 4DV1K 2F9WA 4N76A 4A59A 1VK0A 2Q3SA 2ZJPL 4PUOA 3EYZA 1C0GA 1HJOA 3RSEA 3VQ6A 4B9NA 1VQ9N 4B9VA 4YOXA 2ZQBA 5KTQA 1NMNA 4HVJA 1Z05A 4BR7A 2OCEA 3VEXA 1C0TA 3LZJA 2AP1A 3W0LA 3GE1A 4CJ4A 3LL3A 3OYJA 3M1FA 3CYMA 3SZ2A 4OX9K 2O4IA 1L3VA 3U9DA 1RT1A 4ZHRA 4DTMA 3UIQA 1JXBA 5A2QO 2O8CB 3JS6A 4FM2A 4KAZA 3RR7A 4AHRA 3AO4A 5BR9A 5AQWA 3DXMA 3DRSA 4M3WA 3E9PA 3DWLA 3K5LA 4FZZA 3E9OA 1IG8A 2O8FB 4CEOA 4NXMK 1WN7A 5F0XA 3OYMA 2RF2A 1JLBA 4CZGA 2QM1A 2EWSA 3CCJN 1T8EA 2WOMA 1HYZA 2XY7A 4CZJA 1SL0A 3IRXA 1TKZA 3TAFA 1BI4A 4BG9A 4DV2K 4K42A 3FGUA 2O8EB 4JN4A 3VESA 1EKEA 3VF6A 3J81O 1WSHA 3CC7N 3PY8A 3GL1A 3FZHA 3WXJA 1Y64A 5H1SQ 4ELTA 2O8DA 4DKWA 2JGUA 3PLAA 4F2RA 4LF5K 2VG7A 4BRLA 1W7AA 3FZFA 3TSPA 2ASPA 4B9LA 5JS1A 4JKGA 3OYBA 4GNIA 5T7BA 3THYA 5J1EA 1XNQK 3F9KA 3TAGA 2ZD1A 1H1VA 3AA3A 3L4QA 3OYNA 1NK8A 4JRPA 3ZT0A 2XHBA 4A57A 2D0OA 5AQHA 4BWMA 1ZC6A 3G25A 5KPRA 4KV8A 4AQYK 3PIPL 1BUPA 4CFDA 2HHQA 3HOSA 3FR0A 4WQ4C 2V52B 3O6WA 4CEAA 4EP5A 3AVLA 3P31A 3SUPA 3QESA 1GLCG 3L0QA 2HVHA 3AAPA 4BR5A 3P1GA 3HTVA 3D7EO 2YHYA 5AFUH 4B1ZA 4KTWA 4CK3A 1S3XA 4G1QA 2E6MA 5EX5A 3O9SA 2UXCK 2O8FA 4X62K 4PKGA 1IV0A 3MDQA 3QIPA 3LPTA 4A2AA 5KQDA 3G6EN 1SKRA 3F73A 1S1TA 4E1NA 2Y1IA 1ASWA 2HBLA 4ZTFA 1ITGA 5BRDA 2BUPA 1YI2N 4YOYA 3ZLJA 1S72N 2GV9A 3FLCO 3K5OA 2A3ZA 4C8MA 4DR5K 1EWQA 4O55A 3MEEA 2VWBA 2EHGA 3A2FA 3AA4A 1XC3A 1RGIA 3AGKA 3AVBA 3LDPA 1A5VA 3ZSVA 3VF4A 1KXPA 2P5OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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