2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
1YVNA 3SLCA 3LDOA 3ID8A 1IJJA 4C23A 1EQYA 3D2FB 4FPAA 2NZTA 5FPNA 4FOEA 4B1WB 3C7NB 1Y64A 4CZGA 2YCHA 5E26A 4A2AA 1R59O 5FPEA 3M3ZA 1XC3A 3DAWA 3MN9A 2UYTA 1DGKN 5EXWA 4BRAA 4WYBA 2EWSA 4MO4A 5AZIA 4FOIA 3VF6A 3WXIA 1MWMA 5AQXA 1Z05A 3EN9A 1QQNA 5AQUA 3H46O 3O6WA 2V7ZA 2QWOA 3SJHA 2D1KA 5ELZA 3VEXA 2Q97A 4H0XB 3H45C 5BPLA 2ASPA 3MMVA 3MK6A 3AAQA 5AR0A 4GY2B 2E2NA 1GLFO 3LM2A 5LJWA 3ULEA 3VEOA 4A62A 3ENHA 3QBXA 4CZKA 3UKRA 1KAZA 5AFUH 2Q0UA 4CD3A 3GG4A 3RSEB 4BRQA 3JXUA 1NBWA 4BR2A 4B1YB 5JMVA 2AP1A 3HTVA 5KPRA 1U6ZA 1U2VB 2CGJA 3A8YA 3OHRA 1T6DA 4PKGA 1SAZA 4CZFA 5ADXH 2HF3A 1JCEA 2F9TA 5AQIA 4IJAA 3WQUA 3VEVA 4H5NA 1GLBG 2D0OA 4JAXA 2ITMA 3ZETB 3MN5A 1XQSC 4BR5A 2P9KB 3UKRB 4F9OA 1RGIA 1ATNA 1WUAA 4BR7A 3EO3A 5AQQA 4I6MA 3ENOA 3O1WA 3R6MA 3DJCA 4WQ5C 3FZKA 2V7YA 4CZEA 4BRGA 2NLXA 2D0PA 3UE5A 4K43A 2FF3B 3CI5A 2Q0RA 3M6GA 4EAHD 5TKYA 5AZIB 4AM6A 2YJEA 4CZMA 4H5WA 2Q2RA 3HZ6A 3W3DA 1KAXA 4RTFD 1E4GT 1C0GA 3FR0A 3QMLA 5AQOA 3ZX3A 5AQHA 1KXPA 2QWLA 1KAYA 1P8ZA 3QDKA 3VGLA 4NO7A 5BPMA 3CJBA 1BG3A 2P9NB 5FPDA 1ZBSA 3H3OB 1HLUA 5AQTA 4ISGA 3JS6A 3U9ZA 3H6EA 4BREA 2BUPA 1HX1A 4BG8A 3BF3A 4KBOA 1V4TA 2IVOA 3GOIA 3HI0A 4BR4A 2FSKA 4LC9B 4EIAA 2A42A 2YI1A 3I33A 3LDPA 5EVZA 4H5TA 5EY4A 4CD1A 3O8MA 1Z6RA 2ASOA 1ESVA 3DWLA 1Q18A 4CZHA 4M7XA 4AM7A 4DB3A 3AAPA 1YUWA 1X9JA 3D2EB 4HWIA 3FFKB 4XH4A 3CJ7A 3IUCA 4H03B 3VESA 4B1UB 5AQPA 3FLCO 3A5NC 2CGKA 1HJOA 1NGJA 3VETA 4FWQA 5BREA 5BRFA 5ADXA 2A41A 3ZX2A 4K25A 1YXQA 2IVPA 5BN9A 3CJ9A 2HF4A 3WXJA 2ASMA 2ZF5O 4XH1A 3IMXA 3L6QA 1K8KB 4PL7A 4BRKA 4QS9A 4CZIA 1T6CA 3W0LA 3O4WA 5AQFA 4ISEA 2YHWA 4WQ4C 5AQWA 2GEMA 2FXUA 3A0IX 5LY3A 3H1QA 3ATUA 4QS7A 2ZGZA 5BRDA 1NGGA 3VGKA 4H5VA 1JCFA 1NGBA 1HPMA 4CZLA 3A5OC 4NB4A 4BGBA 1OKJA 1K8KA 1IG8A 3MDQA 3GDQA 1BDGA 4H0OA 3AARA 2E8AA 3FZMA 3LL3A 4I6MB 1JCGA 4B1VA 3ZEUA 3CETA 4WQ4A 5B8HA 1ATRA 4MO5A 4K41A 4FL9A 1WOQA 1QHAA 1DEJA 2QWQA 3BUZB 4H5RA 4YDUC 5AQNA 1BA0A 3A5LC 2P9SB 4Z94A 2CGLA 1NGDA 2PAVA 2V52B 4M63C 3GE1A 1U2VA 3MCPA 3DXKB 1HKGA 1XUPO 5F0XA 2D4WA 4FWPA 3D7EO 3O5BA 3U9DA 2I7NA 1NGIA 4BC4A 3SMSA 3CJ1A 3KHYA 4JN4A 2A40A 2BTFA 3CERA 4FSVA 4H0YB 2HOEA 4A2BA 3H3NO 1QZ6A 4A61A 3I8BA 4B1ZA 5KPZA 3P4IA 2VWBA 1T44A 4QS8A 3VF2A 2P9LA 2CH5A 3DXKA 1GLLO 4WQ5A 4BR9A 1BA1A 2AA4A 3LDQA 4JHDA 3QFUA 5EX5A 3L0QA 3R8EA 5EOYA 2GWJA 2A3ZA 1NWKA 2GELA 4XEIA 3BF1A 5JICA 4BRDA 3MN7A 4JD2B 4CI6A 2E2QA 2W41A 2IIRA 1RDWX 4H0PA 3VOVA 5E84A 2NRHA 3O1BA 1MWKA 2P9UB 5AQYA 2P9LB 4RWTA 2YJFA 3TPQA 4HTLA 1X3NA 4RCHA 2I7PA 2V51B 4FWNA 3VERA 2E1ZA 2QWPA 2W40A 4FPBA 3KVGA 5AQKA 2Q1NA 3A5MC 3GBTA 1QZ5A 1BOTO 3QBWA 4FWLA 3IDHA 2E2OA 4BQLA 1SQKA 1QQOA 3EZWA 3R9PA 1S22A 4B9QA 2QW9A 4EHUA 1GLDG 1HKBA 3U4LA 1GLCG 1NGFA 2P9UA 3LDLA 3VEWA 1NGEA 4BGAA 4PKHA 4M7YA 1GLJO 3BP8A 2CH6A 4DHYA 3H1VX 5BPNA 2FLOA 3CQXA 3UKUA 2ZGYA 1QQMA 4XH5A 2OANA 2QWRA 3WUHA 4BRNA 3WEEB 2YHXA 5JLFA 2J4RA 4EFHA 4E1JA 4BRLA 4EHTA 3D2FA 4BC5A 1DKGD 5KQDA 1BU6O 2E20A 3B8AX 2QWMA 2ZWHA 3C7NA 4BRIA 2P9SA 1ZXOA 4JNEA 1NLVA 2HMPA 3HSCA 1C0FA 3F9MA 3LM9A 1TUYA 2A6AA 2FF6A 1TUUA 3QB0A 3VEYA 3WQTA 3SMPA 4L3QA 4DQ8A 4PL8A 3CQYA 3VPZA 3GL1A 3WEEA 4ISFA 1J6ZA 2E88A 4IZ9A 3ZX0A 1ATSA 3QFPA 5AFUA 5AZJA 1D4XA 2P9PA 4BR0A 4Y0WA 1SZ2A 1HUXA 5AQRA 4B1XB 1TYQA 1NGCA 4FO0A 3CJCA 2P9IA 3ZEUB 4IWVA 3O08A 3MN6A 4O8KA 4CJ7A 4JHDB 2FSNA 4BRCA 2QWNA 2WUSA 3AY9A 4BC3A 1NGHA 3EL2A 2H3GX 3M1FA 3VF4A 4JD2A 2P9PB 2E2PA 3HBTA 4BROA 2VCPA 3FE1A 1TYQB 1S3XA 3CHWA 4FWKA 3TU5A 3L4IA 1CZAN 4CZJA 1NMDA 3DXMB 3WXLA 4IJNA 2QM1A 4FWRA 4CBWA 2P9KA 1BUPA 2IVNA 5AQMA 3WT0A 4O5FA 3O80A 2DPNA 2GUPA 5F1XA 4IO8A 4J8FA 3LDNA 2F9WA 4GNIA 4BVPA 1V4SA 1HKCA 3CIPA 2GTDA 1LOTB 3C0BA 3UB5A 3SK3A 3WXKA 5CE3A 4DCHA 4BRPA 3KZBA 2A5XA 3G25A 3ULEB 4BC2A 4BRFA 4BRHA 5AQJA 1LCUA 1ZC6A 2QXLA 3RSEA 2VYPA 1YAGA 3CJAA 5AQGA 1X3MA 5AQSA 4CBXA 5LJVA 4H0TB 1GLEG 4K42A 5AQZA 2E1YA 3HM8A 3IFRA 3EKSA 3J8AA 1H1VA 4PKIA 4BVOA 4FWOA 3ZETA 3FGUA 3FZLA 4CBUA 4BG9A 2YHYA 3VGMA 3VENA 3FZFA 4IXCA 4MLHA 4BRMA 3S41A 5I9EB 5BN8A 4YDUA 4FWMA 1MA9B 5KPTA 2Q36A 1MDUB 1G99A 5AQLA 5JLHA 1BO5O 4BQZA 5KQ8A 2PBDA 1GLAG 3U8XA 2Q31A 3QICA 4MLEA 3FZHA 1NM1A 3BEXA 3DXMA 3D2EA 3ATVA 5BRHA 3EKUA 3VEZA 2KHOA 1RFQA 5AZJB 1NGAA 5FPMA 5BR9A 3UKUB 5F2RA 2GWKA 1BWFO 2P9IB 1E4FT 4H0VB 2FSJA 5AQVA 4FWSA 2P9NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OBWA 1IJJA 1KTQA 3MX2A 4N56A 3NF6A 4B1WB 5M1PA 5C42A 3ZSZA 2R7YA 2W6KA 2YCHA 5E26A 3EY1A 3CYGA 1BHLA 4H8KA 4FM0A 4ILHA 4M45A 1SV5A 1KQSM 5CYQA 4B3SK 4MO4A 3VF6A 2NRWA 4E19A 5I42A 3EN9A 3H46O 3O6WA 3OYGA 3VEXA 3H08A 4M3TA 2C1IA 3HM9A 2YNIA 3T7ZA 3MMVA 3MXMA 3E01A 4NCBA 3AAQA 3K2PA 2O8DB 3EZ5A 3NGIA 3U3GA 4FLXA 5LJWA 3ULEA 1DLOA 4A62A 3D0PA 4OKKA 4N76A 3VQ5A 4YOWA 1IH7A 3NHGA 2XY5A 4CJTA 4BRQA 3JXUA 3KWIA 5JMVA 1RT5A 4B1YB 3T1AA 3WNGA 5KPRA 1VSFA 4JI7K 1U6ZA 1U2VB 4DR4K 4LSLA 4CZFA 3C6UA 1TL3A 4BY9C 1JCEA 2A1RA 1IG9A 1N36K 3CYMA 1XQSC 3PSIA 4BR5A 3UKRB 4BWJA 4JKFA 4Z4HA 1W0HA 2ZE2A 5AQQA 4FK4A 3O1WA 1Q9YA 3R6MA 4DQRA 3DJCA 3TARA 2KZMA 3FZKA 2V7YA 4CZEA 3CD6N 2JWKA 2OTLN 4FLTA 5FROA 4EAHD 5TKYA 3BGRA 1HNXK 1Z26A 4AM6A 2BH1A 5GAGP 4RTFD 4DU1A 3NMUA 3QMLA 1NOYA 3THXB 2QWLA 1KAYA 5SZTA 5HRNA 4B8AB 5BPMA 3V81A 1NJWA 3CJBA 3DLRA 3MWPA 3BY5A 3KKRA 4DSEA 3JS6A 3U9ZA 2IDOA 3V1RA 1IKYA 3KIOA 2BUPA 3HOSA 3OYKA 3BF3A 5KI6A 4WF9L 4OX9K 2NRTA 3OTOK 2IVOA 3GOIA 1YJWN 1RDAA 2A42A 5EY4A 4CJFA 3O8MA 3KLFA 2ASOA 3NH2A 2FBYA 4DQIA 3ZLJA 1YUWA 2X74A 3D2EB 3CMEN 4C8KA 4KHUA 2O8FB 2CGKA 5ADXA 4NCGA 2A41A 3KTQA 1VSMA 2HBJA 4FJ8A 4K25A 4CGHA 3V4IA 3AVNA 4HVJA 1MU2A 1C0TA 5LMUK 2HF4A 1N34K 1GOCA 5JS2A 5C12A 2ZD1A 1Q82O 4ILJA 1ZBLA 2ZF5O 4GVEA 3PO4A 3M8PA 4F2RA 1JXEA 3PUFA 1TL1A 4CZIA 3MAQA 4ISEA 4EZ6A 2YHWA 1LV5A 3AO3A 5AQWA 5LY3A 1RTHA 3HO1A 2ZGZA 3J7ZO 1T8EA 3B6OA 4H5VA 1JCFA 4PWDA 2EX3A 4CZLA 3A5OC 4NB4A 3I0SA 1OKJA 1WSJA 1U47A 3MDQA 1X1PA 3LL3A 1WB9A 1EWRA 4Y1CA 1OVYA 3CCEN 2OYQA 3C95A 4JS5A 2ZJRL 3OS1A 4FL9A 3M8SA 3G0ZA 1KC8O 2QWQA 1NKCA 3IG1A 4YDUC 4M3ZA 1NJXA 5FDLA 3K59A 1VQNN 1TAUA 1NGDA 1U2VA 3KK7A 1XUPO 3ZSVA 5F0XA 2E6MA 4AQYK 1HNZK 4Z4FA 3J81O 4OPAA 1WAJA 5DMRA 4M3WA 4AILC 2A40A 2QA4N 4FSVA 2P5GA 4C8OA 4M3YA 4RW7A 4Z4IA 1NK7A 4DFPA 1BI4B 3H3NO 1QZ6A 4ZHRA 4BE1A 4B9TA 3I8BA 3K5LA 4GV3A 4DV3K 4B1ZA 3DXKA 1GLLO 1HPZA 4WQ5A 2AA4A 5EX5A 4B3TK 3OYJA 4JRQA 1ZBIA 4NYNA 1NWKA 5JICA 4XEIA 4B9NA 4E7KA 3MN7A 4CI6A 2E2QA 4WE1A 1RDWX 3C94A 1IKWA 2P9LB 4B9SA 3CCQN 3TPQA 1VQ7N 1TGOA 1S1VA 1VQON 3LDSA 3THYB 2QKBA 4FWNA 3VERA 4A57A 4NCAA 2ZM6K 3NCIA 3DLBA 2AJQA 3VQAA 3IDHA 2E2OA 1WBDA 2ZQBA 2G8KA 3UIQA 4I9QA 1O1WA 2HSTA 3C6AA 1GLCG 3VEWA 4PKHA 2UXDK 1SUQA 2VG6A 4M7YA 1T7PA 3BP8A 3VMFB 3HL8A 4CFCA 3U3YA 4I9LA 3UKUA 2ZGYA 4DTOA 4FYDA 1XWLA 3VQ6A 4E1MA 4DQSA 2KQ2A 2OANA 3WUHA 3KLGA 4BRNA 1C0MA 2HBKA 2YHXA 3WEEB 3L2UA 3SZ2A 5JLFA 4IEIA 4EFHA 2O8CA 3BZKA 4KHQA 3D2FA 3CQ8A 1TKTA 2G8VA 1BU6O 2E20A 3B8AX 3C7NA 4DUYK 2P9SA 2B4JA 4CJ5A 1U49A 4CF2A 3CC4N 3RR7A 1KLMA 4LD0A 4BDZA 2HMPA 2VG7A 2XHBA 1C0FA 4Y1DA 3LM9A 5HROA 3NF9A 3WQTA 3SMPA 4B08A 4DQ8A 4PL8A 3CQYA 3VPZA 4E7HA 3LPTA 4TSXA 3TSPA 2G8HA 3NAEA 4KHPK 1BIUA 2KW4A 3QFPA 4KO0A 4CFAA 4KTQA 3VQ4A 5FRMA 1ASUA 2P9PA 3P31A 4BR0A 3L4QA 3E1YA 1SZ2A 4JI4K 3LZJA 4ID5A 5AQRA 3IS9A 3TSUA 5C10A 3CJCA 3I56N 4LF5K 3ITHA 4IWVA 3SPZA 3ZT3A 3TAPA 2GV9A 3QEIA 4CJ7A 3SUNA 1L3VA 1JXBA 4PQUA 4F3TA 1VQPN 3RMBA 3M1FA 4RW9A 4HCCA 3MXIA 4JD2A 4DSIA 4N41A 2HHHK 5C24A 3DRSA 4OKJA 1NJYA 4B9MA 4FWKA 4BE2A 1NMDA 4IJNA 4CJLA 3RR8A 2QM1A 4CBWA 4YOXA 2IVNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3BDP A;  4EHU A;  4ZTJ A;  2PZS A;  3U4L A;  3C65 A;  1NGF A;  4CE9 A;  3LDL A;  4CEO A;  1NGE A;  4BGA A;  1WLJ A;  3ULD A;  3ZSQ A;  3CFR A;  3V9U A;  5M1O A;  4YOR A;  1QQM A;  2ITG A;  1YHQ N;  3EEQ A;  3THV A;  1KCF A;  1F21 A;  2O4G A;  1P90 A;  2J4R A;  4CJP A;  4BRL A;  5DM6 L;  3OYI A;  4DTP A;  2QWM A;  5GAD P;  1ZXO A;  4JEP A;  4ZTF A;  1BGX T;  3JAM O;  4JKB A;  4BDP A;  1ZBU A;  2P1J A;  2A6A A;  3P1G A;  3QB0 A;  3VEY A;  1K73 O;  4CJV A;  4DS5 A;  4L3Q A;  3WEE A;  3JYT A;  3GL1 A;  1VQM N;  4ISF A;  1J6Z A;  2E88 A;  2FBX A;  1ATS A;  4A5A A;  5A2Q O;  1OH6 A;  5AZJ A;  3CM5 A;  4M42 A;  1HNW K;  2A1S A;  3QER A;  1WN7 A;  1ITG A;  3NDK A;  1M1K O;  4Y0W A;  4FJM A;  1HUX A;  2HBM A;  1TYQ A;  4DFJ A;  1YJN N;  3ZT1 A;  4N5S A;  2KFN A;  3O08 A;  1SKS A;  1FKO A;  1CZ9 A;  1EWQ A;  4JRP A;  4JHD B;  2HHV A;  4DF8 A;  2VQF K;  3O9U A;  1W2B M;  1SL2 A;  2HHU A;  2DTU A;  4BRC A;  5KRT A;  2QWN A;  2WUS A;  3AY9 A;  4BC3 A;  2YNF A;  1RDC A;  2KKZ A;  4DV7 K;  1QSS A;  2P9P B;  4BRO A;  4YOY A;  1HQE A;  3CC2 N;  3LAN A;  3QIN A;  1RT6 A;  3KJV A;  4OPH A;  4F3O A;  1S3X A;  3CHW A;  1YIT N;  3L4I A;  3QEX A;  3V1Q A;  3S9H A;  1CZB A;  1BUP A;  3VQ7 A;  3VQP A;  3WT0 A;  3VQD A;  5C2D A;  2GUP A;  4RG8 A;  3TR8 A;  1KLN A;  2QKK A;  3WNH A;  3OYB A;  4FJL A;  4BVP A;  3L8B A;  4DKW A;  5CE3 A;  4GV6 A;  3TTC A;  4BC2 A;  4BRH A;  3TAE A;  4KPY A;  4LH4 A;  3M5R A;  3DLE A;  3A2F A;  3CCL N;  2HHQ A;  4CEB A;  5AQS A;  2HHS A;  2HNZ A;  5LJV A;  1QE1 A;  3HM8 A;  4KH6 A;  4BVO A;  4O0I A;  1BIS A;  4FJ9 A;  1C0U A;  3FGU A;  3SUP A;  1RT3 A;  4CHZ A;  3SBG A;  3HVR A;  4BAC A;  3VGM A;  3FZF A;  1SL1 A;  3KLE A;  3S41 A;  2EHG A;  5KPT A;  2Q36 A;  2HVH A;  2RE2 A;  5AQL A;  1BO5 O;  4BQZ A;  5JS1 A;  1T05 A;  3U8X A;  2Q31 A;  3O9R A;  3QIC A;  3DXM A;  3D2E A;  5BRH A;  3QIO A;  4ICL A;  3VEZ A;  3N4P A;  5FPM A;  5IWA K;  1EXQ A;  1HJR A;  2GWK A;  3LAK A;  2P9I B;  4H0V B;  4LF4 K;  1YVU A;  3DMJ A;  5AJ3 K;  4FWS A;  2P9N A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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