2A41A

Ternary complex of the wh2 domain of wip with actin-dnase i
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 125
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a41A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a41A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a41A04
1NGDA 4BG8A 1BU6O 3CJ7A 2P9PB 1BOTO 4B9QA 4Z94A 4BRIA 1QQNA 1OKJA 4B1VA 1ZC6A 2W40A 1NMDA 4K42A 1WUAA 3U8XA 3ZEUA 3FZHA 4XEIA 3FLCO 4BRPA 1IJJA 3DXMA 3J8AA 3FE1A 1ESVA 1DGKN 3CQXA 5BN9A 2DPNA 5AFUH 3C7NB 3H1VX 2Q31A 1V4SA 2D1KA 3A0IX 5AQHA 1HKBA 4A2BA 4BQLA 3UKRB 4BC5A 1EQYA 3KHYA 2F9TA 3SLCA 3VOVA 3QICA 4MO5A 4ISFA 3A5OC 2YJEA 4EHTA 4CJ7A 5FPDA 4JNEA 2P9LA 3VENA 4PKGA 4WQ4A 3R8EA 2E88A 1G99A 1C0FA 3GDQA 2HF4A 2HF3A 1YXQA 2YI1A 1P8ZA 1RDWX 4O5FA 2ZF5O 4FWLA 4CI6A 2OANA 4BRGA 1U6ZA 5AZJA 4EAHD 4PKIA 3QMLA 3MN7A 4BROA 2A5XA 2PAVA 4FWOA 5BREA 3SK3A 1HKCA 3IMXA 5BRHA 2IVOA 3ZEUB 2ASMA 1K8KA 2P9SB 3D7EO 4CZIA 1X9JA 3DXMB 3O80A 3VPZA 5EY4A 3CJBA 4RWTA 3O4WA 3WEEA 1ATSA 1ZXOA 1ZBSA 5AQXA 4BVPA 3FZFA 3ZX2A 4QS8A 4FWKA 4EIAA 4RCHA 2V51B 3AAQA 3HI0A 4MO4A 4H0VB 5AQOA 1MDUB 3EO3A 1KAYA 2P9PA 2P9LB 2QXLA 2ASPA 4BGAA 4CD1A 4WYBA 2ZGZA 3ZX0A 4Y0WA 4B1XB 3B8AX 4ISEA 4JN4A 4BRAA 2P9IB 5BPMA 1RFQA 2KHOA 4BVOA 4F9OA 3LDOA 4NB4A 2F9WA 4BREA 2I7PA 1TYQA 5AQQA 3WT0A 5AZJB 1XQSC 1TUYA 2GWJA 4H5RA 1GLFO 2QWMA 2V7ZA 3HTVA 4H0PA 5ADXA 1GLCG 4J8FA 5JLHA 4C23A 4CD3A 5EOYA 2VCPA 1T6DA 1Y64A 4MLEA 2ZGYA 2QWQA 3DJCA 4H0OA 3O6WA 3WEEB 3CQYA 4FWPA 2QWOA 4M7YA 3ATUA 1J6ZA 3JS6A 4M7XA 3O08A 2CH5A 4B1UB 3W3DA 3H3OB 3O8MA 1D4XA 2FSJA 5F0XA 3BP8A 3I33A 3QFPA 3VEVA 2QM1A 3W0LA 3D2FB 2NRHA 4BC4A 4CBWA 4GY2B 2VYPA 1U2VA 3UE5A 2E2OA 3H6EA 3FZKA 4KBOA 5AQLA 1XUPO 1C0GA 1Q18A 1BA0A 4B1WB 4FO0A 4M63C 2WUSA 1E4FT 4XH4A 4O8KA 2P9SA 5AZIA 5LJVA 2H3GX 4YDUA 2IIRA 4HWIA 1MWKA 3UKUA 1TYQB 2E20A 4CZGA 5LY3A 1GLEG 1NGGA 2FXUA 3HBTA 5BRDA 1HKGA 3IUCA 1KAXA 3UB5A 3QBXA 3IFRA 3VEYA 1GLBG 2EWSA 4A62A 3A5NC 3MCPA 3HSCA 4FL9A 1MA9B 3L4IA 3CERA 5KQ8A 4I6MA 3WXIA 3QDKA 5AQVA 1R59O 4YDUC 5BR9A 5F1XA 3OHRA 4BRNA 2Q0UA 2E1ZA 2FF3B 3JXUA 3P4IA 2QWRA 1BO5O 1NGJA 2BUPA 2P9IA 4IXCA 3VESA 4BRCA 1GLJO 3EL2A 4JD2A 3M3ZA 2D4WA 4BRLA 1BDGA 1U2VB 4A61A 3WXLA 2P9NA 2QWPA 3LM2A 5I9EB 4E1JA 4QS7A 2YCHA 1GLLO 1JCEA 1Z6RA 2E2PA 4BG9A 4BR7A 2FF6A 5BPLA 4WQ4C 2GTDA 3U4LA 3GE1A 5AZIB 2E1YA 5AQPA 3TU5A 1QHAA 3UKUB 3BF3A 3QFUA 1JCGA 1BWFO 3L6QA 4GNIA 4BR9A 3O1BA 4B1YB 5E26A 5AQFA 5AR0A 4BRDA 3RSEA 3AARA 5BPNA 1KAZA 4JHDA 1GLDG 2I7NA 3LM9A 4IO8A 2ASOA 3A8YA 5TKYA 5AQYA 1S22A 1NLVA 4BC2A 2GUPA 3D2FA 4IJNA 4I6MB 3HZ6A 1V4TA 3U9DA 3MN9A 2NLXA 3WXJA 5CE3A 5LJWA 2CGJA 4JD2B 4BRMA 4MLHA 4H0TB 5ELZA 1GLAG 2IVPA 1LOTB 4FWNA 4CZMA 2P9NB 3GOIA 3TPQA 3D2EA 2HMPA 5BRFA 3A5LC 2P9KA 4BRHA 5JMVA 4PL7A 2J4RA 1RGIA 3M1FA 1YAGA 4FWMA 2VWBA 2QWNA 2V7YA 4WQ5A 4XH5A 3VGMA 4EFHA 1SAZA 5JLFA 1NM1A 2QWLA 2AA4A 2GWKA 1HJOA 1NGEA 2CGKA 2IVNA 2A6AA 3SMSA 3M6GA 3LDLA 3FFKB 1E4GT 1XC3A 3GG4A 3RSEB 1NGBA 4QS9A 2GELA 3FZMA 4JHDB 3VGKA 4BGBA 3VF4A 4AM6A 4DCHA 4CZHA 4K43A 3FGUA 3SMPA 1NGFA 1SQKA 2Q1NA 3MDQA 4WQ5C 3LDNA 2NZTA 5JICA 3EKUA 4IWVA 3AAPA 1BG3A 4CBUA 3ATVA 2FSNA 4IJAA 3VEOA 1HPMA 1NGHA 3CJ9A 4RTFD 3QB0A 4XH1A 4DHYA 5BN8A 3MMVA 5F2RA 1WOQA 1X3NA 1MWMA 4FOEA 2E2NA 2E2QA 2YJFA 5EXWA 3D2EB 3VERA 1YVNA 4CZKA 3H46O 2P9KB 3VEXA 3ZX3A 3AY9A 3VF2A 3EKSA 2A42A 3CJAA 1QZ5A 3VGLA 5AQRA 2YHXA 3O1WA 2YHYA 2Q0RA 3KVGA 3H3NO 1KXPA 1HLUA 4BR4A 2E8AA 3KZBA 4H5TA 2Q36A 2D0PA 5KQDA 3ENOA 4FWQA 2Q97A 3LDQA 3R9PA 2W41A 4AM7A 1ATRA 3GL1A 3WQUA 5AQTA 1NWKA 1HX1A 3R6MA 1JCFA 4H5NA 4FWSA 1NBWA 5FPNA 3DXKA 2CH6A 3ULEA 2P9UB 4FSVA 1NGAA 2QW9A 2BTFA 4K25A 1SZ2A 2ITMA 1YUWA 1T6CA 5AQGA 4EHUA 3VEZA 2FLOA 5EVZA 3DAWA 4BQZA 4CZJA 2V52B 3WQTA 2GEMA 5KPRA 5AQJA 4K41A 3ENHA 3CHWA 3QBWA 1QQOA 5AFUA 4CZEA 5AQZA 5AQWA 4CBXA 3A5MC 4HTLA 4L3QA 3ZETA 3S41A 5KPTA 2A3ZA 1BUPA 1QQMA 1LCUA 1CZAN 1HUXA 3CIPA 4CZLA 3EZWA 1H1VA 3CETA 3DWLA 3VETA 4FWRA 3O5BA 4BR2A 4PL8A 3MK6A 4BRKA 4BC3A 4H0XB 3BEXA 2PBDA 5ADXH 3G25A 3CJ1A 1QZ6A 3C0BA 4BR5A 2ZWHA 3I8BA 4BRFA 5AQNA 4DQ8A 4JAXA 1TUUA 3DXKB 2AP1A 3EN9A 4BR0A 3ULEB 3L0QA 4FOIA 5AQIA 3CI5A 3H45C 4LC9B 3MN6A 2A41A 5EX5A 4H5WA 1BA1A 4FPBA 2Q2RA 4NO7A 5AQSA 5E84A 2YHWA 2FSKA 4FPAA 1NGCA 3BUZB 1Z05A 2CGLA 3ZETB 4H0YB 3U9ZA 3WXKA 3SJHA 1ATNA 3H1QA 4H5VA 3C7NA 2UYTA 1T44A 3CJCA 3FR0A 3VEWA 3ID8A 4BRQA 3FZLA 5AQKA 5AQUA 3UKRA 2HOEA 5KPZA 4CZFA 2P9UA 4DB3A 3BF1A 1K8KB 3LDPA 3GBTA 4A2AA 3LL3A 3MN5A 5B8HA 1DKGD 3F9MA 3VF6A 1IG8A 3HM8A 3WUHA 5FPEA 3IDHA 4IZ9A 5AQMA 1DEJA 4B1ZA 1NGIA 5FPMA 4ISGA 4PKHA 2D0OA 2A40A 1S3XA 4H03B 1X3MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2RA 4JKEA 3VQBA 2OA8A 4BRIA 1QQNA 2F7TA 4B1VA 4K42A 1RBRA 4ICLA 5JS2A 3ZEUA 3PY8A 3FLCO 1IJJA 3DXMA 3D0PA 3J8AA 3QETA 3QEVA 3FE1A 1ESVA 1O1WA 5GINA 3RTVA 1S1UA 3C7NB 5AFUH 4HTUA 3SI6A 1TAQA 4BQLA 3KHYA 2F9TA 4B9NA 3L8BA 3LWMA 4DS5A 4MO5A 4CJUA 3J80O 4GKJK 4O44A 4B3RK 2HNZA 3KLFA 4JNEA 4IDKA 4BWJA 1Q86O 2VWJA 1C0UA 1NKCA 4M3XA 2E88A 3TAFA 2HF4A 2HF3A 2YI1A 4OGCA 4RW6A 1RDWX 3TSQA 5I3UA 3OYMA 2ZF5O 1VHXA 2OANA 2P1JA 3C6HA 5C2DA 3THXA 4FYDA 3QMLA 3MN7A 2PAVA 4R5PA 4FWOA 5K14A 3OYDA 3SK3A 1HKCA 3IMXA 2F8TA 2IDOA 1NJIO 1DTTA 2OPPA 2HBMA 3KJVA 3D7EO 4CZIA 1Z25A 5M1NA 3PO4A 1X1PA 3AVIA 4RWTA 3AVCA 3KWGA 3WEEA 1ATSA 4JKDA 4OLAA 4DTOA 3O9UA 1TK8A 4BVPA 4E1NA 3ZX2A 3L2UA 4GMJB 3SCXA 5CYMA 4CHPA 4FVUA 3D6RA 3THVA 2V51B 1F21A 1TAUA 4FJIA 3DRSA 4E1MA 4Y0WA 2VG5A 3B8AX 4ISEA 4BRAA 3AO1A 2O8FB 4QCLA 3MXIA 2FBVA 4F3TA 2F9WA 2I7PA 5AQQA 1NOZA 1SL2A 3DLGA 3T3FA 3NE6A 4FJKA 2GWJA 3LP3A 2QWMA 2Z1IA 2V7ZA 4YFUA 3OYCA 2UUBK 5ADXA 1JLCA 4C8OA 1XHZA 5GAGP 4CD3A 4DV2K 3J7AP 3KKRA 4KTWA 2VCPA 4YOWA 4FLXA 1T6DA 1Y64A 4JKGA 3NH1A 4DUYK 3TSPA 3NVKA 4A57A 3ATUA 3JS6A 1RDBA 3O08A 1NJYA 1N5YA 3HSTB 1XMQK 2FSJA 4HUEA 3Q7BA 3I33A 3QFPA 2DFHA 5CYQA 2G8FA 4JV5K 2HW3A 5FLXO 4GY2B 4BE7B 2E2OA 3LP1A 5AQLA 4BDZA 3CC7N 3QIOA 4C1NI 1BA0A 2R7YA 4DSLA 2O8CA 1IKWA 1KQSM 1E4FT 4FLVA 4XJXA 5HL7L 2HMIA 4OKEA 2NNWA 4NCGA 1DTQA 4HWIA 4JI3K 1TYQB 2GBZA 4AHVA 2GUIA 3KK2A 4WF9L 1GLEG 5BRDA 2BH1A 3AA2A 3ID6A 4E7HA 4V19S 4CEOA 4ID5A 1WB9A 2HHWA 3QBXA 3EE9A 4JK9A 4A62A 3A5NC 4DFPA 3MCPA 3OYLA 4DU3A 4CJTA 3HSCA 4J2DA 3IKMA 4I6MA 3NGZA 1R59O 2VG7A 4YDUC 3OHRA 1HYSA 4BE2A 1S9GA 2Q0UA 5HLFA 1IBLK 4LFBK 4LD0A 5M1QA 3VESA 2EHGA 2ZE2A 3CQ8A 1TL3A 2D4WA 4B9TA 3ZT4A 1IG9A 4CIGA 4BRLA 2ZQBA 1U2VB 3WXLA 3AVAA 3LM2A 5I9EB 4DFKA 5J1EA 4U7BA 4QS7A 1Z6RA 3CCRN 4F8RA 2FF6A 5BPLA 3B6OA 2G8VA 2NUBA 2C1GA 2E1YA 4YY3K 3QLHA 4G9ZA 3UKUB 3BF3A 1NKEA 5AR0A 5AQFA 4BRDA 1EXQA 3QEIA 3AARA 4A59A 1KAZA 5HRRA 4JHDA 2I7NA 4IO8A 4KHPK 4E7KA 1S22A 5JENA 3NAEA 4DU1A 4U67L 3NH0A 2YHAA 4OGEA 4KB0A 3HZ6A 3VQEA 4DU4A 3ZT3A 1O13A 4KTQA 4E89A 4YORA 3MAQA 4IEEA 4FJNA 4MLHA 1WSFA 5C12A 4CF2A 1LOTB 4CFDA 3OYNA 3SAHA 3NDKA 3CCQN 4JI1K 1XNRK 4CIEA 3GOIA 3D2EA 3SQ1A 4F2RA 4LFCK 2P9KA 4BRHA 4CGIA 5JMVA 3PX4A 4FWMA 4EFHA 1YAGA 2V7YA 1SAZA 1U48A 2QWLA 2OCEA 2AA4A 4DQPA 3TWHA 4CJKA 4CHZA 3QNOA 3AA4A 2IVNA 3AVJA 3FFKB 3E9PA 3KK3A 1XC3A 1D9DA 3GG4A 3J7ZO 4K8ZA 1RDUA 1NGBA 3VGKA 4DV3K 5KTQA 3DRPA 1TKDA 3K5OA 4WCEL 3MCAB 4K43A 4YOUA 2B5JA 2Q1NA 3MDQA 2HVHA 1VQMN 2DFFA 1EO1A 4IWVA 1BG3A 3ATVA 3VEOA 5J2PA 1WNSA 2HHVA 4KAZA 4CCHA 4HHTA 4OJRA 4CJ3A 4IG3A 1WSEA 4DFMA 4CJWA 1X3NA 4FOEA 4Z4FA 4JKHA 5GADP 2Q3SA 4JRQA 1NK0A 3K2PA 3ZX3A 3AY9A 3VGLA 2YHXA 4BR4A 1TK5A 5KQDA 1L3UA 3CFOA 4GKKK 1ATRA 3GL1A 2FBTA 4BECA 1NWKA 1Q8IA 4FK0A 4CF1A 3NVMA 4H5NA 3MEEA 4FWSA 3HL8A 4DR1K 5DM7L 4I9QA 1T3VA 2CH6A 2P9UB 4FSVA 3V9ZA 1J53A 5KGXA 1HQUA 2ITMA 3QNNA 3SZ2A 5AQGA 1VQ8N 2JGUA 2W00A 3VEZA 3F9KA 2FLOA 4FJ7A 3DAWA 3J7YP 4CZJA 3WQTA 2GEMA 2HSTA 4K41A 3I56N 3ENHA 5AFUA 1SL0A 1JXEA 1X9SA 4HTLA 3ZETA 2XY8A 3TABA 5KPTA 1K6YA 4CESA 1BIUA 1YJWN 1LCUA 1CZAN 4DFJA 3KK7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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