3ZX2A

Ntpdase1 in complex with decavanadate
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
406
structure length
396
Chain Sequence
NVKYGIVLDAGSSHTNLYIYKWPAEKENVVQQLEECQVKGPGISKYAQKTDEIAAYLAECMKMSTERIPASKQHQTPVYLGATAGMRLLRMESKQSADEVLAAVSRSLKSYPFDFQGAKIITGQEEGAYGWITINYLLGRFKGSTFGALDLGGSSTQITFVPLNSTLEAPETSLQFRLYGTDYTVYTHSFLCYGKDQALWQKLAQDIQVSSGGILKDPCFYPGYKKVVNVSELYGTPCTKRFEKKLPFNQFQVQGTGDYEQCHQSILKIFNNSHCPYSQCAFNGVFLPPLQGSFGAFSAFYFVMDFFKKMASSQEKMTEITKNFCSKPWEEVKASYPTVKEKYLSEYCFSGTYILSLLLQGYNFTGTSWDQIHFMGKIKDSNAGWTLGYMLNLTNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ECTONUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE DIPHOSPHOHYDROLASE 1
publication title Crystallographic Evidence for a Domain Motion in Rat Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolase (Ntpdase) 1.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 123
structure length 396
sequence length 406
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.6.1.5: Apyrase.
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3zx2A01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3zx2A02
3CI5A 4FO0A 3WQUA 5BRDA 3LDOA 2P9NB 3KVGA 5AQGA 2IIRA 3EN9A 3MMVA 1NGCA 2P9PB 2E88A 3CHWA 1V4TA 2V51B 3EO3A 2PBDA 1NGBA 3AARA 3D2FA 5EVZA 4H5NA 5BR9A 5JMVA 2IVPA 4BRMA 2HMPA 4BROA 1U2VA 3H1QA 4CD3A 3H1VX 3DWLA 3QFUA 2ZWHA 5AQMA 3TU5A 2VWBA 3UKRB 5LJVA 1RDWX 3GDQA 2QWOA 4CBWA 4CZHA 4IZ9A 4FWMA 1NWKA 4WQ4C 1HKCA 4BRDA 4CZJA 1YXQA 3D2EA 3HM8A 3R8EA 1GLDG 1E4GT 2Q0UA 5BRFA 2D4WA 5AZIB 3O8MA 5AQZA 4WQ4A 2V7ZA 4CZGA 4RTFD 4BVPA 1ZBSA 2J4RA 2Q31A 1RGIA 1S3XA 2A41A 3D7EO 4GY2B 1R59O 3DJCA 3IFRA 1ESVA 1YAGA 2P9UB 1T6CA 5B8HA 3J8AA 3AAPA 5FPMA 1P8ZA 4BRQA 2ZGZA 3EL2A 4M7XA 4XH4A 1SAZA 4AM7A 3O5BA 3LDPA 4B1UB 4EIAA 3DXMA 3U4LA 1DKGD 1MDUB 2BUPA 3UKUB 1RFQA 5AQWA 3WXKA 2P9LB 3TPQA 4QS8A 2GWKA 3MN7A 3WXJA 1H1VA 2E1ZA 3GBTA 4BRHA 3VEXA 2D1KA 4MO4A 3HI0A 2Q0RA 2QWMA 4BR0A 5EX5A 4CZIA 2F9WA 3CJ9A 3WEEA 5BN9A 1YUWA 4CJ7A 5AQLA 4PKGA 3O1WA 2FLOA 4B1XB 4BRGA 3FZMA 3VF4A 4CZMA 1WUAA 1NLVA 4FWQA 1KAXA 4JN4A 3FZHA 3M3ZA 4B1VA 1HKBA 3BF3A 1Q18A 5AQUA 4BC2A 3C7NA 5AQHA 4H0YB 3FFKB 4LC9B 1KAZA 1BA1A 2YHWA 3U8XA 4BRLA 2GELA 5AQPA 4CBUA 3IDHA 2E2QA 4FWKA 5KQ8A 5EOYA 4H03B 4BRNA 1XUPO 3SJHA 3A5LC 1NGDA 2CGJA 2HF4A 5BN8A 3DXKA 3VEOA 5AQTA 5I9EB 3G25A 1ATSA 4BG8A 2DPNA 1QHAA 3GG4A 3KHYA 4EHTA 5AZJA 3WXLA 2NRHA 1U6ZA 3LDQA 1KXPA 1K8KB 4GNIA 4JNEA 4K41A 1Z05A 3ULEA 4RWTA 2YHXA 5AQKA 4EFHA 3A5NC 3CIPA 4DCHA 3M1FA 4F9OA 1NMDA 1NGAA 4RCHA 4CD1A 1MA9B 4PKHA 1IJJA 4ISFA 1QQMA 4K25A 3VPZA 3D2FB 2A40A 2YCHA 3HSCA 3HTVA 3FR0A 1U2VB 4NO7A 3CETA 2UYTA 3ZX2A 2EWSA 4I6MA 3U9ZA 4BRFA 1ZXOA 4M63C 2BTFA 3CQYA 3MCPA 4YDUC 4BREA 3GE1A 4FWPA 2GUPA 4MLHA 3CERA 4Y0WA 5CE3A 3OHRA 3D2EB 3L6QA 1GLLO 1DEJA 5AQOA 2QWPA 1T6DA 4BR4A 3FE1A 1QZ6A 3BEXA 5AQIA 3WQTA 3JS6A 3SK3A 3ZEUA 1BO5O 1TUUA 5AQQA 3IMXA 3M6GA 4FOIA 1TYQB 4B1YB 4A2BA 3VEZA 4DB3A 3QBXA 3O1BA 1MWMA 3FGUA 2FSJA 5AQFA 3VGLA 5AR0A 4A61A 2P9KA 2GWJA 3C0BA 2CH6A 2YI1A 3DXMB 2YJFA 5KPTA 2QW9A 2A5XA 3R6MA 2HOEA 4BR5A 4BR7A 1NGIA 2FSKA 4EHUA 4KBOA 3DAWA 4PL8A 1NBWA 3EKSA 4FWOA 1T44A 4PL7A 1DGKN 2CGKA 2FSNA 2ASMA 1HLUA 1C0GA 1BA0A 3WEEB 4BQLA 1J6ZA 4CZFA 1GLCG 1CZAN 2ZF5O 4CBXA 2GEMA 5F1XA 2VYPA 4BRAA 2W41A 3O6WA 3SMSA 3MDQA 5E84A 3BP8A 3QMLA 5E26A 3VGMA 3ENHA 1S22A 3VOVA 4BR2A 2FF3B 2QXLA 1HJOA 3U9DA 1E4FT 3VF2A 3H46O 3O80A 4H0VB 2HF3A 4E1JA 1BUPA 1BOTO 3UE5A 1GLJO 4BRCA 1NGJA 5BPLA 4H5RA 1NM1A 4QS9A 2QWRA 2W40A 1NGEA 3ZETA 1QQNA 3A5OC 5FPDA 3LDLA 3H6EA 4Z94A 4XEIA 2KHOA 4IWVA 5AQRA 3DXKB 4FSVA 2GTDA 3MK6A 3WT0A 3QB0A 4NB4A 5AZJB 4BVOA 5LY3A 2I7NA 2PAVA 3CJBA 3VEWA 4A62A 5ADXA 2P9IA 4JHDA 5AFUA 4WQ5C 3RSEB 3MN9A 3QDKA 2P9SA 4HTLA 3A0IX 5FPEA 4BR9A 3CJ7A 4WQ5A 2E8AA 3MN6A 3O4WA 4JD2A 2E2OA 3HZ6A 1SZ2A 1LCUA 2YHYA 1TUYA 1ATNA 1NGFA 2A6AA 4BC4A 3ZX3A 5EXWA 3JXUA 3P4IA 1Y64A 2E2PA 4B1ZA 4H0XB 3ATUA 4DHYA 2VCPA 2E20A 4DQ8A 5AQYA 1GLBG 3I33A 2IVOA 1BG3A 3HBTA 3GL1A 3EKUA 2P9NA 2QM1A 4CZEA 3QICA 4K43A 4FWNA 4FWSA 3CQXA 5F0XA 4BRPA 1GLFO 2Q97A 5ADXH 4IJNA 5AFUH 2P9PA 4YDUA 1YVNA 2ASOA 2WUSA 3L4IA 3LM9A 4PKIA 3FZKA 3MN5A 1HUXA 4CZLA 3VESA 4WYBA 3ZEUB 1X3MA 3R9PA 2F9TA 4FWLA 2QWNA 3BUZB 4BC5A 4B9QA 4H0OA 3UKRA 5BRHA 3EZWA 4MO5A 1D4XA 3QFPA 4CZKA 4H5VA 4BG9A 4XH5A 2E1YA 2NLXA 4M7YA 1X9JA 3H3NO 2ITMA 4H0TB 5AQJA 5LJWA 2P9KB 3FZFA 5JLHA 1HX1A 4H0PA 3A5MC 5AZIA 3F9MA 4H5TA 1V4SA 4ISEA 1LOTB 3AAQA 2YJEA 3VEVA 3VERA 4BC3A 3CJ1A 2V7YA 3VETA 3KZBA 3FZLA 3CJAA 4IO8A 4L3QA 4MLEA 2ASPA 4ISGA 1MWKA 5F2RA 2CGLA 1TYQA 1XC3A 2P9UA 3W3DA 3ENOA 1QQOA 2FF6A 1IG8A 1X3NA 2AA4A 2AP1A 2D0PA 2QWQA 5AQSA 1GLAG 2Q1NA 4JAXA 3GOIA 4BGBA 4FL9A 1GLEG 5AQVA 5BPMA 5BREA 4BQZA 2OANA 4FPAA 4FWRA 3VEYA 2Q36A 3LDNA 4H5WA 4XH1A 3UKUA 3VF6A 1XQSC 1QZ5A 2P9LA 5JICA 3C7NB 1OKJA 3ZX0A 2Q2RA 2FXUA 1G99A 4AM6A 1HPMA 3W0LA 3LM2A 4C23A 3FLCO 3H3OB 3O08A 3LL3A 2CH5A 5KQDA 2D0OA 3ZETB 1SQKA 1JCFA 3B8AX 2V52B 5JLFA 3H45C 2QWLA 3IUCA 1NGHA 4BGAA 3S41A 2ZGYA 3BF1A 1KAYA 5AQXA 3SMPA 3ID8A 3VENA 1JCEA 5AQNA 2H3GX 3QBWA 4O8KA 3UB5A 1WOQA 4FOEA 5BPNA 1BWFO 4QS7A 4EAHD 2A42A 1NGGA 3SLCA 3ULEB 4HWIA 4O5FA 5EY4A 5FPNA 2P9IB 4JHDB 4B1WB 2P9SB 3I8BA 1Z6RA 1HKGA 2NZTA 4K42A 3AY9A 4BRIA 3L0QA 4JD2B 4IJAA 4A2AA 2E2NA 3CJCA 4BRKA 1JCGA 1EQYA 4CI6A 4IXCA 1BDGA 4J8FA 1ATRA 1K8KA 5TKYA 1BU6O 3ATVA 3WXIA 2I7PA 1C0FA 2IVNA 2A3ZA 3A8YA 5KPRA 4FPBA 3WUHA 3RSEA 4I6MB 5KPZA 3VGKA 1ZC6A 5ELZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XRIA 5BRDA 3G0ZA 2VGNA 3KVGA 2IIRA 4DUZK 3THXA 2OPRA 4Z4CA 3NE6A 4HCCA 3CHWA 1V4TA 3EO3A 3CFPA 3ZYYX 1P90A 4CJ4A 1OH8A 2VWBA 1XWLA 4BWMA 3L8BA 1N6QA 4CZJA 4ILHA 1C0MA 2G8VA 1GLDG 3SUOA 4EP4A 3L2RA 1RCHA 1ZYQA 3C6HA 4CZGA 3J7ZO 4CIEA 2UXCK 4AHRA 5KTQA 4NXNK 4GY2B 4LY7A 4Y1CA 4PUOA 3E9LA 2BDPA 1ESVA 1YAGA 2P9UB 2AJQA 3SZ2A 5B8HA 1KRPA 1P8ZA 3EL2A 1RDBA 1NU0A 3AGKA 3TAQA 3ZT0A 1TKDA 4Q0BA 3DLKA 5LL6Z 1VQ5N 1SAZA 1Q82O 1NK6A 1W0HA 1WAJA 3UKUB 2OCEA 1RFQA 5AQWA 3WNEA 2GWKA 1KVBA 4BRHA 4FLUA 1NKBA 2D1KA 4O8UA 1VRTA 2QWMA 1IH7A 1XC9A 4V19S 4ELVA 4BR0A 2RN2A 2BH1A 5C15A 3CJ9A 4CJ7A 4PY5A 3ZSYA 4CHZA 3DLEA 4CJWA 4O0JA 3VF4A 5CY4A 1WUAA 1NLVA 3CPWM 4Z4IA 1KAXA 1NG9A 4JN4A 4B1VA 1ASUA 1NOYA 3FFKB 3LAMA 4LC9B 1KAZA 1RDAA 4OLBA 3U8XA 1RDUA 5K14A 1RTJA 3NVMA 3IDHA 4RW7A 2O4IA 4B3RK 2OPSA 1XUPO 3SJHA 1QHTA 5I42A 3TAMA 1N8RO 4OPAA 3AO3A 2HF4A 3VEOA 5AQTA 4IG0A 4BG8A 2DPNA 5IT9O 4E1NA 3GG4A 4IBNA 3O9QA 2UUAK 4EHTA 3LDQA 4DSFA 1S5JA 2UU9K 3ULEA 4RWTA 1HNZK 3V9XA 3A5NC 4PA1A 2P5OA 4LFBK 3CIPA 3OA9A 4FZZA 3M1FA 4W5NA 4YOVA 4FXDA 4CD1A 4CGDA 1S9GA 4FCYA 3ITHA 3CMAN 4ISFA 3O9SA 3VPZA 1KVCA 3S9HA 3HSCA 1HNWK 3BZKA 4Y1DA 4JYAK 4F8RA 1W97L 4KB1A 1S1VA 4CJSA 1U4BA 4CF8A 1BI4A 4C1NI 2UYTA 4BE1A 3HXMA 3ALYA 4JKDA 3CQYA 3MCPA 4FWPA 5CE3A 1LW0A 3O9TA 1KC8O 1TAQA 4CGHA 4B9TA 3L6QA 2QWPA 4NLBA 3SQ1A 3QO9A 1T6DA 3PX0A 5HP1A 2EX3A 1QZ6A 3TAGA 4WFNL 1VQKN 1RDCA 3SK3A 4DTXA 3RR7A 1IKYA 4KI6A 4CHOA 4B9UA 1MWMA 1ASWA 3FGUA 5AR0A 4FLVA 3N4QA 1XMOK 2GWJA 2KKZA 4M3RA 2CH6A 2YI1A 5KPTA 2QW9A 3R6MA 4WF9L 1F21A 4AF1A 3SJJA 4CF1A 1UAXA 5FRNA 1U45A 5C12A 3T1AA 1DGKN 3U6FA 1OVYA 1YF5L 4DR1K 5DK5A 4BQLA 1J6ZA 1CZAN 2ZF5O 4CBXA 5F1XA 4X64K 1RT4A 1B9FA 3BP8A 3AA4A 4FYDA 1RT1A 2F96A 2NRXA 3ZCMA 1VSEA 2FF3B 1HJOA 1EKEA 3U3YA 3HP9A 4JK8A 3V1RA 2O8CB 1KVAA 3AVKA 3SYZA 2ATQA 3O80A 4O4GA 2HF3A 4W5QA 1GLJO 4X66K 2FC0A 4E7JA 1NM1A 4Z4FA 4QS9A 4H8KA 1HYVA 3T19A 1RILA 5FPDA 4FM1A 4DQSA 2G8HA 2YHBA 4CF9A 1WAFA 1ZBFA 4FSVA 2YKNA 1L3UA 3VN5A 4E7LA 4IOCL 5AZJB 4BVOA 1FW6A 1LV5A 4A62A 2ZJPL 4BDPA 2P9IA 3MN9A 5CZ1A 3A0IX 3DMJA 5FPEA 3K9JA 4QAGA 3HJFA 1QTMA 1X1PA 3MN6A 2OPQA 2HBJA 1SZ2A 4DLGA 5M1FA 1NGFA 2PY5A 4YFUA 4CEDA 3ZX3A 1Y64A 3OYGA 2X78A 4FJ5A 2G8IA 1RTIA 3ATUA 5HRSA 3HL8A 2KQ2A 2E20A 4KKOA 4DR2K 1L3VA 4FM2A 4E0DA 3SAFA 2HVIA 2O8FA 3T69A 1W9HA 1OH5A 1GOBA 3C65A 4JK9A 4K43A 4DUYK 4FWSA 3CQXA 5F0XA 4JKFA 3OYMA 2ASOA 3K0SA 3L4IA 1S1UA 3FZKA 1SKSA 2O8DB 2WOMA 4DQRA 2F9TA 4JRPA 4B9QA 1T03A 4UY8O 3KK7A 4H0OA 5BRHA 3AVMA 2X74A 4CJ5A 4DQPA 4BG9A 3JSMA 4XH5A 3ENBA 1NK4A 5AQJA 5LJWA 4WFBL 3A5MC 3FFIA 3F9MA 4ISEA 4M3UA 1XNQK 4ILGB 3CJ1A 2V7YA 4ILJA 3LP1A 3CJAA 1L5UA 2AA4A 2AP1A 3F5TA 1DT9A 3T1HK 2Q1NA 4FL9A 5BPMA 4JKBA 3M8SA 4FWRA 3VEYA 3LDNA 4H5WA 4XH1A 4CJKA 3DYAA 1QZ5A 2NRRA 3T3FA 5JICA 1OKJA 3T1YK 4JI1K 3MX5A 4AM6A 1K9MO 3W0LA 4J2BA 3H3OB 4OGEA 4B9LA 2A1SA 4IOXA 5J2NA 1SQKA 2YNFA 2ZD1A 3ZT4A 3H45C 1D9FA 3IUCA 2NRVA 1LWEA 3S41A 2ZGYA 3LWLA 3A2FA 1UA0A 3VENA 3QBWA 3M8RA 3UB5A 1WOQA 5BPNA 4YOWA 4EAHD 5GADP 1TL3A 1NGGA 2O8EA 4K8ZA 1L3SA 5KRSA 4O5FA 3K5NA 3WNFA 2BGGA 4RW9A 4FVMA 2F4VK 4KB0A 4I2QA 1Z6RA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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