2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Mus musculus
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
3NH1A 4JS4A 3QEVA 4IG3A 2X78A 3TAPA 1U45A 4DU4A 3KKSA 1TK0A 1EXQA 3ZSVA 2D0CA 1IKWA 1WSGA 1ZBUA 4B9MA 5EU7A 2OPRA 4LH5A 4QAGA 3LWLA 3QEPA 3EYZA 2OPPA 2X6NA 3VN5A 1RBSA 2XO7A 3TAQA 3U3GA 5CZ2A 5JS1A 4DU3A 1KVAA 3A2FA 2OPQA 3L3VA 3VQDA 5HROA 1HYZA 1O1WA 3TANA 4NCAA 4DTNA 3C95A 4F3TA 4FCYA 3KJVA 3LALA 2RF2A 4IFVA 1YVUA 3DRSA 4CGDA 1YTAA 4JLHA 4RW8A 4BWJA 4BACA 4DU1A 2FBVA 1J9AA 5HRPA 3OYHA 3PV8A 2G8KA 4E7JA 2B4JA 3IG1A 4DMNA 1TVRA 3NHGA 4FJLA 3QERA 3DRPA 3ZSOA 1JL2A 4JS5A 4FLTA 4DF4A 2KW4A 3SQ0A 4CEQA 4KB0A 2HHTA 3SI6A 1IH7A 1NJWA 3I0RA 4FZZA 3P1GA 3OYIA 3TAFA 1YT3A 4CGJA 3UIQA 4DQQA 4B9NA 3HK2A 1RTJA 2KZMA 3M8RA 4M3XA 3B6PA 4DSFA 1CZ9A 1KLMA 2HNDA 4K8XA 4CJTA 5T7BA 2F8SA 1L3TA 3SUOA 3MXJA 2ATQA 1S1VA 4FM2A 1BI4A 3DLEA 3QLHA 3PY8A 4F2RA 4KHSA 1EX4A 4NYNA 1VSKA 3NF8A 5HRNA 3M8SA 1JL1A 4BE1A 2RKIA 3TR8A 1F21A 1SV5A 5J2QA 3TAGA 3LP2A 4M41A 3VQBA 3OJUA 3SYZA 3SUPA 2EX3A 4ID1A 3V4IA 4DQPA 4ZTFA 1C0TA 1Q9YA 1C0UA 4CJQA 1RBTA 4OVLA 1U4BA 4DSLA 1Z26A 1FKOA 4MQ3A 1HQEA 1QSYA 2IS3A 1NK7A 2G8IA 3AA5X 3EY1A 2NUBA 4JRPA 4CK2A 3U3YA 3OVNA 2KQ2A 1TL3A 4CFBA 3LWMA 1WNSA 2Q3SA 3HVTA 3QNNA 3OS2A 1EKEA 4I7FA 2X74A 3LAMA 2PY5A 3OS1A 2Y1IA 5KGXA 3V1QA 3O3FA 3K2PA 3K5NA 1SKWA 1K6YA 1VSLA 4CE9A 3OYFA 3ZT3A 2E4LA 4WE1A 4CJSA 1VK0A 1B92A 5C42A 1RBUA 4OJRA 4CGFA 4F3OA 2VG5A 4B08A 3O4QA 1HNIA 1RT6A 1RT7A 1VSEA 1EP4A 2X6SA 3NBPA 3NDKA 5J2MA 2B5JA 2F96A 1SL1A 2DTUA 4O0JA 4XIUA 1U48A 1NJYA 4E0DA 4J2BA 3ZSRA 1Y97A 1RTDA 1FK9A 4ELTA 4DTMA 1QTMA 2P1JA 3AA2A 4ZHRA 4AHSA 4CJ3A 2PZSA 4FK0A 3O4NA 1IKYA 3HT3A 3VQEA 4FJ5A 4OKKA 3HPGA 4RW6A 2PYJA 3AO2A 3C94A 1ASWA 4OPKA 4M3WA 2Z1HA 2DFEA 4EZ6A 4CEOA 4M3ZA 1U47A 4LSNA 4B9VA 4DS4A 2JLEA 3KK1A 4DLEA 3MXMA 4I9QA 2WOMA 2XHBA 3DM2A 3PO4A 3OY9A 4DFJA 3QEWA 3MEDA 3L2QA 2YV0X 1ZBIA 4M42A 2O4IA 4AHVA 4PQUA 4CJWA 3SPZA 2FBXA 1LW0A 4DWIA 4GVMA 3H08A 5HRRA 3K58A 4N76A 2IGIA 2G8WA 3VQAA 3SUNA 3KD1E 2OA8A 3AVHA 4HVJA 1HNVA 4FM0A 4QCLA 4ZTJA 1BQNA 5I3UA 4BDPA 5HP1A 1REVA 3CM5A 2P51A 1QSSA 2HHSA 4I9LA 4B9SA 3MECA 4BE2A 3DLKA 3NGIA 4FJGA 1CXQA 5C24A 4FYDA 3QEIA 4M3YA 1WSJA 4KHNA 1L3VA 4KFBA 1KTQA 4CF8A 3JYTA 3VQQA 4CHNA 3L8BA 1UA1A 2VG7A 3HSTB 1B9DA 4E1NA 3AO5A 2FBTA 3AA3A 3OYEA 3SQ1A 2XRIA 3DOLA 1UAXA 3VQ4A 3CM6A 4CIGA 3ZSWA 1UOCA 3NH2A 2HHUA 3SV3A 2GBZA 3ZT4A 4OLBA 1JLAA 2E6LA 4B8AB 3L2VA 4FZYA 3LP1A 1NJZA 3ZSYA 2DY4A 5SZTA 4R5PA 1KFSA 5KI6A 2HNZA 4ELVA 4I2QA 1BIZA 2YNIA 4O55A 3ZCMA 5KTQA 3JSMA 1L3SA 2YKMA 1Q8IA 2ZE2A 4FJNA 2DFFA 4CJ4A 2I5JA 1QE1A 1UWBA 1TKZA 3QINA 3ASMA 3TWHA 4KI4A 3SV4A 3MAQA 4K8ZA 1T7PA 3NGYA 1EETA 2A1RA 1XHZA 1S5JA 2OPSA 2O4GA 3AVGA 4KTWA 4FJIA 2HW3A 4KHUA 3HP9A 1W9HA 3HPOA 3DMJA 2IC3A 4RW9A 4Z4EA 4B8CA 3OYCA 5I42A 2G8UA 4N5SA 1SKRA 2LSNA 3SJJA 1C1AA 3ALYA 4H4OA 1JLEA 1R0AA 2G8FA 3DLBA 2BDPA 4TSXA 3RR8A 3LPUA 4DQRA 1TGOA 3C6TA 3QIPA 1BHLA 1D9FA 1GOAA 4O0IA 4KPYA 2FBYA 4J2EA 3K57A 4HUFA 4KKOA 4DTPA 2VG6A 4Z0UA 4CEDA 1KCFA 4AILC 4DSEA 3VA3A 1WSEA 4E89A 1RDDA 4KV8A 2BANA 3DLRA 1RDBA 2XY8A 3CFRA 4FXDA 4F4KA 4FW2A 5KRTA 4FJ9A 1KVBA 1VSIA 3RMAA 4CGIA 4CEFA 1LWCA 3OYBA 1BCOA 1S1UA 2PYLA 1NK6A 1U04A 1WSHA 3OYKA 1WLJA 2RPIA 4AHUA 1NJXA 4EZ9A 3KLFA 1W0HA 2R7YA 1LAVA 2JGUA 4ID5A 3OYJA 1WSIA 1QSLA 2F8TA 4CGHA 4FJMA 3HL8A 3DLHA 4FJHA 1RT4A 4H4MA 4MFBA 1IG9A 4LH4A 4YFUA 3QESA 4CK1A 4G1QA 4M3TA 4C8LA 3MEGA 3WNGA 1NK4A 2ZQBA 4CECA 1NK9A 2HB5A 3KKRA 3V9UA 3PX4A 1HJRA 3ZSZA 3SNNA 1BL3A 4C8MA 4RW7A 1BQMA 1J54A 3AVIA 1NK0A 4CF9A 2OZMA 4DS5A 1ZBFA 1UA0A 2ETJA 3DOKA 1B9FA 4DG1A 2IDOA 5CYMA 1LV5A 2HVHA 2KFNA 1U49A 3ZT0A 3HO1A 1RNHA 3CFPA 1D5AA 1SL0A 3L3UA 1HYSA 3NH0A 4IBNA 3RTVA 2HHVA 1C0MA 2D5RA 4E19A 3AVBA 4C8NA 4J2DA 1I3AA 1LWEA 3LPTA 4HHTA 5FRNA 1C6VA 1RDAA 3DI6A 2VWJA 3V81A 4KTQA 1HQUA 4CESA 4OLAA 1TV6A 3KIOA 3RRGA 1LAWA 1NOZA 3AVNA 3IS9A 4O44A 3V1OA 3MXIA 3F9KA 4FLZA 2Z1IA 2QXFA 4DTSA 3RRHA 1X9MA 3B6OA 4AH9A 3OYGA 3LP3A 2YHAA 3AO1A 3QIOA 1KVCA 4O5BA 4O4GA 5DMRA 3KLEA 1NKEA 4KAZA 4N47A 3NCIA 3D45A 5HLFA 4RW4A 4KHYA 2B6AA 1S1WA 1G15A 4E1MA 4Z4HA 3L2RA 3V9ZA 3DRRA 4W5RA 3NGZA 5E41A 1A5WA 1JLCA 1VSHA 4DTUA 1X9SA 3VQPA 4Z4FA 1J53A 3TARA 4CEEA 4FLVA 3S3NA 1T03A 4N56A 2E6MA 2D0BA 3AV9A 3VQ7A 1TK8A 3M8QA 1N5YA 1RT3A 3ITHA 1IKXA 2FC0A 3DYAA 3SPYA 1NOYA 3QO9A 3CG7A 4HCCA 4CJVA 2KFZA 4CEAA 1VSMA 3HYFA 3SZ2A 4FJ7A 1J5OA 3TAMA 2XY6A 4KHQA 3VQ6A 3WNEA 3HJFA 1HPZA 1BI4B 4DFKA 1JXBA 2G8VA 1Q9XA 2YHBA 4BDYA 3P5JA 2IOCA 3HP6A 3IAYA 4F2SA 3DLGA 5CZ1A 1S6PA 4FJXA 4CJFA 3OYLA 1IKVA 2Y1JA 2HVIA 1RBRA 4ICLA 4DLGA 4LY7A 3G10A 3RMDA 1RT2A 3AVJA 4FW1A 4Y1CA 3SCXA 3MEEA 4IDKA 1TKXA 3HM9A 1VRTA 4I2PA 3NAEA 1D9DA 2EHGA 1JLFA 1LWFA 3ZSXA 4IKFA 1RCHA 3VQ8A 2VWKA 4RG8A 3V9SA 2GUIA 4CHZA 4W5NA 3SQ2A 1KSPA 1WSFA 4CHQA 3KLGA 2BGGA 4CEBA 4CHOA 3O3GA 4DSIA 3F73A 1WAFA 1TAUA 4DQSA 4HTUA 1SL2A 4AHRA 4N41A 5CY4A 3ULDA 4EP4A 4GW6A 3CYMA 4W5TA 3TI0A 3T3FA 3PX0A 3AO4A 5HRSA 4CERA 1NKBA 5FRMA 4FLYA 3PUFA 3V9XA 1JLBA 4NYFA 1L5UA 3CQ8A 4M3RA 1CLQA 4CFAA 1WN7A 4CJKA 3OYDA 3OJSA 3AVKA 1Z25A 4Y1DA 1NK5A 1SKSA 3VA0A 1CXUA 3G0ZA 4BWMA 5DK5A 4OKEA 2Z1GA 3HPHA 3T1AA 3WNHA 4YNQA 3BDPA 4DTXA 1JXEA 1KLNA 2HMIA 4ELUA 2G8HA 1DTQA 1GOCA 1ZBHA 3OS0A 1RTHA 4AHTA 2OYQA 1D8YA 2YNFA 1BGXT 3CFOA 4QOZB 1ASUA 4CJPA 4FLWA 3THVA 3P83D 4FJKA 4PY5A 1KFDA 3L2UA 3OYMA 3KK3A 1S9GA 3ISNC 3BGRA 3VQ5A 4LD0A 3TABA 4FLXA 3LZJA 3S3OA 4KREA 4FJJA 1HMVA 3PX6A 4HCBA 2QKBA 3PO5A 1HYVA 2Z1JA 1A5VA 2WONA 1VSFA 1HRHA 3SQ4A 3LZIA 3KLIA 4CIEA 4FM1A 4BE0A 2AJQA 2P5GA 2HHXA 3E01A 4CIFA 4NCBA 5J1EA 1X9WA 1XWLA 4E7KA 4CJEA 4PUOA 3K5MA 1NK8A 5SWMA 1FKPA 3IRXA 3OYAA 4CF2A 1T8EA 3V9WA 4F8RA 1RILA 1JKHA 4CJ5A 4KTZA 1NKCA 1DTTA 3VQCA 3LDSA 4CGGA 1BIUA 3O3HA 3QETA 1JLQA 3FFIA 4W5QA 4KHWA 5HBMA 2QK9A 2QKKA 4DFPA 3KK2A 4HUGA 1XI1A 1XHXA 4CCHA 1VSDA 1RTIA 3AA4A 2DFHA 3NE6A 3M8PA 1QQCA 1TKTA 3V1RA 3NF9A 1BISA 4OKJA 3WNFA 1BCMA 1A5XA 1JLGA 2OZSA 3LP0A 2GV9A 1RBVA 4CJRA 3U6FA 3AVLA 3I0SA 1SUQA 5D3GA 2HNYA 1QS4A 1MU2A 4CK3A 4CF1A 2KTQA 1LW2A 2RN2A 3K59A 4DF8A 3AVFA 4E7LA 3V6DA 5FDLA 4B3OA 3ZT1A 2XY5A 4KI6A 4FVMA 4B9LA 1L3UA 2A1SA 4DTOA 1C1BA 3AVAA 1ZBLA 5J2NA 1TL1A 4W5OA 2YKNA 1DLOA 4E3SA 3RMBA 3KD5E 4B9TA 4J2AA 4FK2A 1T05A 4FZXC 1X1PA 4PA1A 1TAQA 4OPJA 3C6UA 4DFMA 1C1CA 4DQIA 4L8RB 4DSJA 1XC9A 1FXXA 3NFAA 3TAEA 4CHYA 5FROA 3EZ5A 1CZBA 1ASVA 5C25A 5J2PA 2IAJA 4C8OA 2HHWA 5JS2A 2W42A 4UQGA 4Q0BA 4GMJB 2ZD1A 4AHCA 4CFCA 1QHTA 3I8DA 2XY7A 4OGCA 3NF7A 4CEZA 2P5OA 4FLUA 4JRQA 4Q5VA 1S1XA 3QEXA 3RWUA 3KLHA 3RR7A 5K14A 2YNGA 4CJUA 4KO0A 3ZSQA 2YNHA 1IO2A 4IFYA 4NCGA 5KGWA 4HUEA 4CHPA 1TKDA 1S1TA 4Z4CA 4CF0A 4C8KA 4LSLA 4DSKA 1VRUA 3OYNA 3LANA 1ITGA 1GOBA 1KRPA 2ITGA 2D0AA 1RT5A 3AO3A 1S6QA 3LAKA 3ZT2A 3RMCA 1RT1A 4FJ8A 4CJLA 1RDCA 1S9EA 4M3UA 4Z4IA 3HXMA 2BE2A 4DTJA 3VQ9A 1TK5A 4CFDA 4E7IA 4EP5A 1N6QA 3AVMA 3SUQA 3NF6A 4H8KA 3AVCA 3L2WA 3QNOA 5KRSA 3D0PA 4BDZA 1WAJA 3S3MA 3S9HA 4B9UA 4PWDA 4KRFA 2HHQA 4M45A 2KZZA 4KB1A 4IG0A 3T19A 1VSJA 1YTUA 4E7HA 3K5OA 4DTRA 3HVRA 4Z4GA 1ZYQA 4OGEA 4FK4A 1I39A 3K5LA 5CYQA 3KTQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH1A 4JS4A 4DV7K 3QEVA 4IG3A 2X78A 4FWRA 3J7YP 2O8EA 4EAHD 3UE5A 4FWPA 4CBWA 3FZKA 4X65K 2OPRA 2X6NA 3VN5A 3SK3A 5AZIA 3A2FA 5HROA 3C95A 3KJVA 1YVUA 1P90A 5AFUA 4BACA 1J9AA 1LOTB 1YXQA 3IG1A 2HBKA 1TVRA 3ZSOA 3TTCA 3Q7CA 4KB0A 3VF2A 4BR4A 4IJAA 5GAEP 3P1GA 3FZLA 1W7AA 3W0LA 4B9NA 4JHDB 4JI2K 4DSFA 1CZ9A 1KLMA 4K8XA 4MDBA 3QFUA 4CJTA 2ATQA 3DLEA 4F2RA 1SS6A 1ZBSA 5KQDA 4XH1A 4LC9B 5HRNA 5DM7L 5M1FA 4H0VB 3QDKA 3SYZA 1LCUA 4A57A 4B3MK 4OVLA 4DSLA 1VAZA 4MQ3A 1QSYA 3AA5X 4CK2A 3OVNA 3QNNA 1EKEA 4B1XB 4BRHA 2E2QA 1M90O 5KGXA 3V1QA 4EIAA 3TSQA 4CE9A 3OYFA 3WQTA 1RBUA 4OJRA 2VG5A 3O4QA 3O1WA 4G9ZA 1KAZA 4BRNA 5M1PA 3E1YA 1IBMK 4O0JA 1NJYA 3WXIA 4E0DA 4BR2A 2OTJN 4ELTA 3LDPA 3AA2A 3OBYA 4FK0A 4BC4A 1IKYA 3HT3A 3HPGA 3LDNA 2PYJA 4LF6K 1ASWA 4NLBA 4CZGA 3H1VX 4JI6K 3KHYA 1IV0A 3O5BA 5AQYA 3SPZA 4GVMA 3D2EA 3H08A 5HRRA 3K58A 2IGIA 1YIJN 3AVHA 1HNVA 4FM0A 1BQNA 5I3UA 4OPAA 3CM5A 2P51A 5LL6Z 1WBDA 4B9SA 4GV6A 1WB9A 4FJGA 5C24A 2FF6A 1KTQA 4ILHA 3L8BA 3HSTB 4MDAA 4BRQA 1MWMA 3OYEA 3SQ1A 3VQ4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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