2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
2XY5A 3E01A 3G10A 2OPQA 4OKEA 3V1OA 3V6DA 4B9TA 2OZSA 4B3OA 1CLQA 1RT3A 1HQEA 4L8RB 1TKXA 1R0AA 1NK9A 1N6QA 3VQ6A 2Z1GA 4BACA 4KTZA 1U48A 1BI4A 1BQMA 4CJUA 3V9XA 3QINA 4RW4A 3VQ4A 3AO2A 3MXIA 4KTWA 4ID5A 4CJLA 3OYGA 4DF8A 4JLHA 3ZSQA 4CJ4A 4B9VA 3KTQA 4BDPA 3OJUA 1GOAA 4FJ7A 2ZD1A 3VQQA 1KSPA 4LD0A 4KREA 3LAMA 1L5UA 4W5NA 4CF0A 2GUIA 3TABA 1CXUA 4B8CA 3LWMA 1HNIA 4DWIA 1RTIA 2DFEA 3AVAA 3AVIA 2HVHA 4DTXA 3KKRA 4E7IA 3AO4A 4KAZA 1TL1A 1XI1A 4EP5A 4DTPA 2VWJA 4KI4A 1EP4A 1T05A 3ZSRA 4M42A 3G0ZA 4RW9A 1NJYA 4CK2A 1HYSA 4M41A 4FJJA 3HL8A 1BCMA 1JLEA 4CEFA 1U47A 3AA2A 2ZE2A 3NFAA 3FFIA 4O4GA 5SWMA 1LWEA 4Z4HA 5JS1A 2RKIA 2F96A 1O1WA 3QEVA 2X6NA 3VQ8A 2ITGA 1RBVA 1U04A 1NK6A 1C0TA 3HJFA 3TAQA 3WNGA 4CEZA 1Q9XA 2E6LA 2KFNA 4CK1A 3MEDA 1RT5A 4CIGA 4Z4IA 4KRFA 4RW8A 4OJRA 3K5NA 1TK8A 4KB0A 3MEGA 4W5RA 3VQDA 1KCFA 2LSNA 4DMNA 3TAEA 3L2VA 1WSJA 3DRRA 1NK0A 2Y1IA 1NJZA 3NDKA 2IDOA 3I0SA 3O4QA 3HVRA 4DFMA 1YTAA 4I2QA 3K5OA 3DRSA 4H4MA 3ZT2A 2DY4A 4HCBA 1RT7A 1C6VA 2X6SA 4NYFA 2HNDA 3VQCA 2DFHA 4FJ5A 1IO2A 3D0PA 4FM2A 4FM0A 1UOCA 1VSEA 2YNGA 1Y97A 4DF4A 4CCHA 1A5XA 3CM6A 3QERA 1ZBHA 1FKOA 1CZBA 3WNHA 4Z4GA 3L2RA 4CGHA 3S3NA 3RRGA 5J1EA 4DTUA 4KFBA 4FLXA 4E0DA 4FK0A 1GOCA 3M8QA 3KJVA 2HMIA 2OZMA 1RDAA 4CJSA 3EY1A 4FJMA 2HHVA 4MQ3A 1A5VA 2XY6A 3DLBA 3HXMA 1IG9A 3P1GA 4DTOA 3H08A 2A1SA 3QIPA 4OPKA 3KLHA 4WE1A 4O0IA 2YHAA 4Z4FA 1NKBA 4ZTJA 2PYJA 3V1QA 4W5OA 3L2UA 4O55A 4LY7A 4CFDA 3S3OA 1SV5A 3NF7A 2FBTA 3K58A 1ZBLA 4M3TA 4E7KA 4DU3A 4JS5A 3S3MA 1RILA 1VSHA 3B6OA 1KRPA 5KRSA 4KHNA 3SV4A 3AVFA 2O4GA 2YKMA 3A2FA 1JL1A 5HRNA 3RRHA 4B9SA 1JLBA 4F4KA 1CZ9A 3P5JA 3OYCA 4J2DA 2XY7A 3U3YA 4NCAA 3TAGA 3OJSA 3V9ZA 1QHTA 1WSIA 1KFDA 4FJLA 2X74A 4F3OA 1MU2A 2YNHA 2KQ2A 1HJRA 4ELTA 2AJQA 3ASMA 4DQRA 5I3UA 4FK4A 3TI0A 3IAYA 1NJWA 1S9EA 1RDDA 1RT1A 4KHWA 1S5JA 2OPSA 1LWFA 3VQPA 4KPYA 5DMRA 4CHOA 2D0CA 3SJJA 3RWUA 3ZSZA 2IOCA 4M3RA 4LSLA 2ZQBA 2WONA 1IH7A 5KTQA 1BISA 1LAWA 4OPJA 3NH2A 1XHZA 4IBNA 3SQ2A 4I9QA 3DOLA 4KV8A 3SZ2A 4E89A 3VQ7A 1NJXA 4CEQA 1LAVA 4BDZA 4DU4A 3AVNA 4N41A 2D5RA 1S6PA 3V81A 2PYLA 3DYAA 3PX4A 3AA5X 2YKNA 3ALYA 3ISNC 3HT3A 2HNZA 3KLIA 2JGUA 1X9WA 3PX0A 1LV5A 3OS1A 1VSFA 3I8DA 3QEXA 3CM5A 4CGGA 4KB1A 5E41A 1GOBA 1VSKA 4IFYA 3KK3A 4HTUA 1TKDA 1B9FA 4OGCA 1VK0A 3BGRA 3O3GA 5HRRA 3CFOA 3KD1E 3OYEA 3DLGA 4PWDA 4CEEA 3OS0A 3ZSYA 3ZSWA 3HP6A 1X9MA 3OYAA 4FJHA 1EKEA 2D0BA 2YHBA 3C94A 2HB5A 1TVRA 2KZZA 1XC9A 1UAXA 1S1TA 2B4JA 3NF6A 1RT4A 2EX3A 2P51A 5EU7A 4Z0UA 1C1AA 4UQGA 4ZTFA 4CEOA 1HMVA 2YV0X 5CY4A 3SUOA 1NK7A 4C8OA 4CGIA 4N5SA 2WOMA 4CGFA 3RMBA 1L3UA 1RBTA 3OYNA 1SKRA 1D9FA 4YNQA 1TGOA 1C0MA 3V9UA 1SKSA 2W42A 4DQQA 4KHSA 4QOZB 2B5JA 3NHGA 1U4BA 4KO0A 3WNEA 4CJTA 1U49A 2HHWA 5HRPA 1J53A 2IS3A 3DRPA 1KLNA 1DTQA 3HP9A 5C42A 4PA1A 4TSXA 3HVTA 1TAQA 2XO7A 3F73A 2I5JA 2P1JA 4Y1DA 5KGWA 3OYKA 4JRPA 4AILC 4FVMA 3VA3A 3AA4A 4CFCA 4AHRA 1LWCA 2XHBA 2R7YA 1K6YA 3QESA 3K57A 4FZXC 5J2PA 4CF8A 2G8UA 3C6UA 3SQ0A 1WNSA 2F8SA 1Z26A 3O3FA 1SKWA 3V4IA 5J2QA 4CJQA 2IAJA 1F21A 4KKOA 4DTSA 4FCYA 1TK0A 1KVBA 1VSMA 2B6AA 3IG1A 1C1BA 3DMJA 4CHQA 1JL2A 1FK9A 3EYZA 3NF9A 4CJ3A 4KHYA 1S1VA 1IKXA 1DLOA 3PO5A 3TAPA 3HPGA 1VSDA 3SI6A 4KHUA 1UA0A 2RPIA 4O44A 4CFAA 4NCGA 3MAQA 1X9SA 4GVMA 3HSTB 2OA8A 3HO1A 4OLAA 1W0HA 3V9WA 1L3SA 2OPRA 1ZYQA 1YVUA 4LH4A 1WAFA 1QE1A 3OYFA 4E7JA 4GMJB 4FZYA 4FLYA 3QNOA 4M45A 3T19A 4IKFA 4CF1A 1LW2A 3TAFA 3M8PA 3RR7A 3VQ5A 2DFFA 4HUEA 4DQIA 3RR8A 5HROA 3DLKA 3SNNA 1YTUA 4CECA 3U6FA 3DLRA 1ASVA 4BWJA 4DSKA 4PY5A 1FXXA 4HVJA 3I0RA 3HPHA 3QETA 3T1AA 1ZBFA 3PV8A 4F2RA 2HHSA 3VQ9A 3CG7A 4M3ZA 4JRQA 1W9HA 1UWBA 2P5OA 1Z25A 5J2MA 1ZBUA 4OKKA 4DQSA 3KIOA 4N47A 3L2WA 1EETA 4B9NA 1I3AA 4XIUA 4Q0BA 4AHCA 2HW3A 3L8BA 1G15A 4B9UA 3OS2A 4E1NA 3LZJA 3OYIA 2O4IA 3BDPA 4E1MA 2G8HA 4EZ6A 2BE2A 3SPZA 4O0JA 1RT6A 2GBZA 1S1XA 4BE1A 4BWMA 4IG3A 4DTMA 1QTMA 3C95A 1RTHA 3L3UA 3AVCA 1FKPA 1L3VA 4GW6A 5JS2A 4FYDA 3AO3A 4B9MA 1I39A 1RDCA 3O3HA 1QSYA 5J2NA 3IRXA 5CZ1A 5CYMA 3KD5E 2RN2A 3QO9A 1TV6A 4CERA 3MXMA 4Y1CA 4MFBA 4N56A 1TKTA 4DS4A 3TANA 5I42A 5C25A 5FRMA 1SUQA 3ZSOA 3D45A 4I7FA 1J5OA 4B08A 2FBXA 1RBSA 3CYMA 3OYBA 2E4LA 2G8VA 3AA3A 4E3SA 4KTQA 4AHUA 1TAUA 5K14A 1S1WA 1QSSA 3JYTA 3RMDA 3SCXA 2Z1HA 4CJFA 4OGEA 4ELUA 4FLWA 3K5MA 3QEWA 3HK2A 2HHUA 3KK2A 3LP3A 3V1RA 2PY5A 3KKSA 2ATQA 2XRIA 5FRNA 1RBUA 2IC3A 1XWLA 1LW0A 2JLEA 3NE6A 3SQ1A 4FXDA 1IKYA 4CESA 4DTRA 2P5GA 4FM1A 3PO4A 4J2AA 2FC0A 2VG6A 1NKEA 1KFSA 4CHYA 4DSIA 1TKZA 3AO1A 1NOYA 3KLFA 4IFVA 1RNHA 1BIZA 3VQEA 2HNYA 4R5PA 3V9SA 4DTNA 1JLAA 3VA0A 1KTQA 3HYFA 5DK5A 3DOKA 4C8LA 4CEBA 4FW1A 4C8KA 4CJ5A 3NGYA 4LH5A 2X78A 3NF8A 4CEDA 4CJVA 4LSNA 3PUFA 3U3GA 1HRHA 2Q3SA 4I9LA 1RT2A 4CGDA 3KK1A 4HUFA 1NK5A 2BDPA 3ZT3A 3SUPA 4CK3A 4N76A 1ITGA 1VSJA 4NCBA 2VG7A 1EX4A 4J2BA 4KI6A 2Y1JA 5C24A 1T7PA 4CHNA 4M3WA 2VWKA 4DFKA 1IKVA 4YFUA 3F9KA 5FROA 1IKWA 4HCCA 1ZBIA 1QS4A 4W5TA 3NH0A 4IDKA 4CJRA 3THVA 3RMAA 3K2PA 5HP1A 1VRTA 1YT3A 1UA1A 3LPUA 1JLFA 4DFPA 2NUBA 4DFJA 1Q8IA 4CJKA 4DSFA 4JS4A 4OLBA 2YNFA 3L3VA 1WAJA 1U45A 2KZMA 1ASUA 1EXQA 4C8MA 4FJ9A 2XY8A 4PQUA 3ZSVA 4ZHRA 4OVLA 1BL3A 1RTDA 2RF2A 1QQCA 1VSIA 3LALA 4B8AB 1QSLA 2PZSA 4AHTA 1J54A 4E7LA 4FLVA 2G8FA 4QCLA 4BDYA 1HYVA 3SQ4A 5KGXA 1NK8A 3UIQA 3K5LA 4FJKA 1HNVA 3TR8A 5CZ2A 2EHGA 1BCOA 4CF9A 4ID1A 4W5QA 3TWHA 3TAMA 3QIOA 3AVMA 4RW7A 3KLGA 3K59A 2A1RA 4DQPA 2F8TA 4F3TA 2E6MA 3CQ8A 4DLGA 1BIUA 3QLHA 4FLTA 4FZZA 1RDBA 1VRUA 3B6PA 1T8EA 3AV9A 3ITHA 4FLUA 3PX6A 4CHPA 1B92A 1HPZA 1D9DA 1CXQA 1ASWA 3CFPA 4AHSA 3DLEA 1JKHA 4RW6A 3SV3A 3AVJA 5CYQA 4CHZA 5KRTA 3ULDA 4DSEA 3ZT0A 3SPYA 3DI6A 3NCIA 3VQBA 4H4OA 3OVNA 3SUNA 4CEAA 3DM2A 2OPPA 4Q5VA 1N5YA 2OYQA 3RMCA 3ZT4A 1NK4A 3OYDA 5HRSA 3C6TA 3T3FA 2KW4A 1D5AA 4CF2A 3KLEA 1S1UA 2YNIA 2QKBA 1T03A 1SL2A 1HYZA 3O4NA 4C8NA 2D0AA 4IG0A 2QK9A 3OYMA 1XHXA 4DLEA 4CJEA 1SL1A 4CJWA 3L2QA 1D8YA 1JXEA 3MXJA 4RG8A 5D3GA 1B9DA 1JLQA 4Z4CA 3LZIA 3MEEA 2G8WA 1REVA 3OY9A 3OYJA 3LWLA 3DLHA 4DSJA 4Z4EA 3RTVA 4J2EA 1WSEA 2KFZA 4OKJA 1TK5A 3CFRA 3LP1A 3QEIA 2FBYA 1BGXT 4CJPA 3NH1A 3QNNA 4I2PA 3ZT1A 3ZSXA 1WSHA 4DU1A 4K8XA 3LANA 3WNFA 1KLMA 4CGJA 4DSLA 1X1PA 4M3XA 3HM9A 1JLCA 1S6QA 2BANA 4EP4A 4K8ZA 2Z1JA 3NAEA 2BGGA 1WLJA 3AVLA 4AH9A 5HLFA 3AVKA 3P83D 4CIEA 4DTJA 4F2SA 4FJ8A 3AVHA 2HVIA 4BE2A 2DTUA 3LP0A 4FJNA 4E19A 1KVAA 3TARA 1C1CA 3LPTA 3NGZA 1SL0A 4H8KA 4BE0A 1C0UA 2HHQA 1NKCA 1DTTA 3IS9A 4AHVA 1L3TA 4FJXA 3JSMA 1VSLA 4HUGA 3LAKA 4F8RA 1HQUA 4G1QA 3QEPA 2FBVA 1WSFA 4FLZA 5T7BA 3EZ5A 4CE9A 5KI6A 3LP2A 1WSGA 4CFBA 1JLGA 2ETJA 3M8SA 4PUOA 1BHLA 1JXBA 1S9GA 1A5WA 3AO5A 3M8RA 4DG1A 3LDSA 1J9AA 3SYZA 4M3YA 4DS5A 1Q9YA 3AVBA 4O5BA 4FJIA 3NBPA 2VG5A 2QKKA 1BQNA 2HHXA 5HBMA 4HHTA 3NGIA 3OYHA 4NYNA 2GV9A 3MECA 3ZCMA 4FJGA 2HHTA 5FDLA 1TL3A 5SZTA 4M3UA 3AVGA 1WN7A 4FW2A 3PY8A 2G8IA 4QAGA 3OYLA 3VQAA 4E7HA 4EZ9A 4KHQA 1NOZA 2IGIA 4FK2A 1RTJA 4CIFA 3S9HA 2KTQA 4ICLA 1RBRA 1BI4B 3VN5A 4ELVA 2G8KA 3SUQA 1RCHA 4B9LA 1KVCA 3HPOA 2QXFA 2Z1IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LM9A 3G10A 3EN9A 4OKEA 1RT3A 1T3VA 4BC4A 3VQ6A 4BACA 1BI4A 3V9XA 3AO2A 4A57A 3OYGA 4FWKA 3ZSQA 4BRAA 2E2OA 1L5UA 2GUIA 1HNIA 3AVAA 3AVIA 3KKRA 1OH6A 3KZBA 4GV9A 4E7IA 3VPZA 4EP5A 4DTPA 4OPHA 4CBXA 2YCHA 3JAMO 1NJYA 1G99A 3E9PA 2UXDK 2ZJPL 1JLEA 1YUWA 3NFAA 3QBXA 1LWEA 4YOTA 1Y64A 5JS1A 5C2FA 4JN4A 2F96A 3QEVA 3R9PA 3H3NO 1RBVA 1U04A 5JLFA 1Q9XA 4CZHA 3MEDA 1RT5A 2HF3A 4CIGA 3SAGA 4RW8A 1TK8A 2A42A 4FWQA 1KCFA 1WSJA 2ZGZA 1NK0A 1VQNN 2Y1IA 2IDOA 3ENHA 5ELZA 4H4MA 1HLUA 1QQNA 4HCBA 1RT7A 1KQSM 4NYFA 4FL9A 2HNDA 2DFHA 4FWNA 4FM2A 5KPRA 1XMQK 4YY3K 4CZIA 5IWAK 1CZBA 4Z4GA 3L2RA 3RRGA 4IZ9A 4E0DA 1R59O 3MN9A 4KFBA 4DTUA 1FW6A 4PKHA 5KQ8A 3KJVA 4CJSA 2HHVA 2H3GX 4MQ3A 3I8BA 3HRGA 5AQGA 4WE1A 1HNZK 1XNRK 1VQ5N 3NVMA 4Z4FA 4ZTJA 4LC9B 2PYJA 3V1QA 4CFDA 3S3OA 5AQUA 4JKDA 2FBTA 1HKGA 3ZYYX 1ZBLA 4IOAL 2A6AA 4JS5A 4C23A 1RILA 1VSHA 2CGLA 3AVFA 1KXPA 2YKMA 3CJ7A 3RRHA 4F4KA 1JLBA 3P5JA 3ZLJA 2ASPA 1YF5L 4J2DA 3TAGA 4Y0WA 1KAYA 3V9ZA 1KFDA 2KQ2A 1HJRA 3ASMA 4AM7A 4FK4A 3IAYA 4DR5K 1RDDA 2DPNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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