2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
1N6QA 3BGRA 2XRIA 1TL3A 4DQPA 4IBNA 3KLFA 3NGYA 4CECA 1QE1A 3SUQA 4CJSA 4AH9A 3HP9A 2XHBA 4DQRA 3V1OA 3NDKA 3I8DA 4B9SA 3QEVA 4DSIA 2HB5A 3WNFA 3OYFA 4E7KA 1VSIA 3O4QA 1JLGA 1RCHA 1QHTA 3SNNA 4AHVA 3NHGA 1NOYA 1LAWA 3HO1A 1X1PA 4CEBA 1XWLA 3MECA 3OYDA 4CIFA 1BL3A 3HVRA 1JKHA 3V1QA 4N47A 4HUGA 1X9WA 3CM5A 3DRRA 4LSNA 4FK0A 4DF4A 3S3NA 1XI1A 2IOCA 2NUBA 3V9SA 4DSEA 4FJLA 3V1RA 3OYHA 1NKEA 1HQEA 3RTVA 5HBMA 4KHSA 4PWDA 2IGIA 4CHNA 3LWMA 4M3WA 3VQAA 1I3AA 4J2AA 4CJVA 4W5RA 4JS5A 3DMJA 3U6FA 3AO1A 3S9HA 1NK0A 2Y1JA 2G8VA 2E6LA 1LWEA 5C25A 4DU3A 1HRHA 1T8EA 4CFDA 1D9DA 1G15A 3B6PA 2HNZA 4BE2A 4OKEA 1FKPA 3AVMA 4DTOA 4YFUA 3OYEA 1QQCA 1NKCA 3P83D 4HVJA 1RNHA 4QCLA 4F3OA 2PZSA 2YNFA 4NCAA 3MXIA 3HJFA 4RW6A 4DTPA 1K6YA 3K58A 1RTHA 3AVLA 3RMCA 4EZ9A 3LZJA 3AO3A 3AVIA 2HHXA 1IH7A 5CYQA 3SQ1A 5J2QA 4FK4A 1DTTA 1KTQA 4C8MA 4N76A 3SUNA 1HNIA 3ZSZA 1XHXA 1HMVA 1NKBA 4F2RA 5HRSA 4FJHA 1A5XA 3LALA 3ALYA 3VQ4A 5I3UA 4RW9A 3ZT2A 4UQGA 1KFDA 4PQUA 3DLHA 3NE6A 3HT3A 5HRPA 4FJ8A 4OLBA 1WSHA 5HP1A 4CGJA 3VQBA 4DLEA 1Q8IA 3HVTA 4IG0A 1I39A 1VSJA 4B9NA 3MEGA 2DFHA 2HNDA 5HROA 4BACA 4FK2A 1S5JA 3LP0A 2IC3A 4Y1DA 3ULDA 4DTMA 2YKMA 1TKZA 3OYAA 1WSGA 4OGCA 2YNIA 1ZYQA 3OYLA 4FJKA 3OS1A 3V9XA 2E4LA 1HPZA 2DFEA 3KIOA 2A1SA 4CJ5A 2PYLA 4CJUA 5J2MA 4DTSA 4B9MA 1DTQA 1NK4A 1F21A 4TSXA 2IAJA 5SWMA 3OJSA 5KGWA 3QNNA 1ASVA 1HNVA 1RT7A 3QINA 5FRMA 1X9MA 4DTJA 4G1QA 3KK2A 2P5GA 4CJEA 2Z1IA 3ZSXA 2HNYA 1RT3A 3ZSWA 3VA0A 1Q9YA 3OYKA 2GV9A 1RT6A 1B9DA 1VSDA 3CFOA 5C42A 3OY9A 3AO5A 4O0IA 1VK0A 3QEPA 1NJYA 2RF2A 1HQUA 3TAPA 4CIGA 4CHZA 3KLHA 4ICLA 4N41A 3TAQA 4J2EA 1ZBHA 3OYNA 1FKOA 3VQDA 1Y97A 1RTJA 1VRUA 2FBXA 3VQ5A 4CEDA 3SV3A 1MU2A 2Y1IA 3K5LA 2ZQBA 3IG1A 3RRGA 3QLHA 1CXUA 1ZBIA 3O3FA 1SL1A 3PO4A 1L3TA 2FBYA 1HYVA 1ZBFA 3C6UA 5FDLA 4KHNA 1KCFA 2F8SA 1C0TA 4JRQA 4DFKA 1LWFA 2X6SA 1KFSA 2G8HA 4CCHA 2BGGA 4QOZB 2HHQA 1ZBUA 5T7BA 4BE1A 3VQCA 4KB0A 1XHZA 4IKFA 1UA0A 4FW2A 4C8LA 1BCOA 4BDZA 3RRHA 1NK8A 4KO0A 3LAKA 3SJJA 4E1MA 4N56A 2HHTA 4OJRA 3BDPA 3K5NA 3KLGA 3C95A 2QKBA 4M3ZA 1VRTA 1N5YA 2HVHA 3SQ2A 4MQ3A 4DWIA 3WNEA 4NCGA 3PX4A 1YTUA 4DQIA 3HYFA 4NYFA 4CJQA 3VQ8A 4FJ7A 1L5UA 2BDPA 4OVLA 4W5OA 2Z1HA 4E0DA 1BQNA 2WOMA 4DQQA 4CHYA 3AVAA 4CJ3A 1IO2A 1LW0A 3MEDA 1D5AA 3MEEA 3TAMA 4CFCA 1XC9A 2O4IA 4O5BA 4QAGA 2XY7A 3QNOA 2OPPA 1B92A 4OKJA 1RBUA 4CJ4A 3P5JA 1W0HA 1JLEA 1WNSA 2OZSA 4I9QA 4I2QA 1TVRA 2YNHA 3CFRA 1QSLA 1GOCA 4CJLA 3QESA 3VQEA 2KW4A 5HRRA 3TANA 1IG9A 1KLNA 1YVUA 2OPQA 4KFBA 3VQQA 3DLKA 3PX0A 5C24A 4CEOA 4DSLA 3KKRA 1C1BA 3TI0A 3ZSQA 2W42A 3AO2A 3CQ8A 4DTNA 2G8UA 3ZT0A 4DFJA 3V4IA 3VQPA 2P5OA 5KRTA 1YTAA 1SKSA 1O1WA 1KVCA 2YHAA 3HL8A 3NF7A 4B08A 3OS0A 4W5NA 2JLEA 4HHTA 1SUQA 3LP1A 4LD0A 3V6DA 4FCYA 4OGEA 4BWJA 1HYZA 1RBVA 3NGIA 3OJUA 1GOAA 4DFMA 3NCIA 3PX6A 1U48A 1NJWA 1WAJA 2ATQA 2G8FA 2FBVA 4OPKA 2IS3A 3G0ZA 4FLTA 4E19A 2QK9A 1B9FA 4ZHRA 1RTIA 4FJ5A 2ZE2A 4FVMA 4FXDA 2IDOA 4DLGA 3NGZA 4M3TA 1GOBA 4CERA 4Z0UA 3AVFA 4FZZA 3KD5E 4N5SA 4CHOA 4CF2A 4OLAA 3DRSA 4O4GA 1JLQA 3SUOA 4CJRA 1RT5A 3HPGA 4ID5A 4DU1A 1ZBLA 2ZD1A 4ELTA 4CGDA 1TKDA 4ELVA 4Q5VA 3K57A 2DTUA 1VSEA 4Y1CA 2QKKA 4CHPA 1DLOA 3K5MA 4LY7A 3V9ZA 3SQ0A 4B9LA 3SQ4A 4FZYA 2O4GA 1U47A 1LWCA 2LSNA 3ZT1A 4DQSA 1UAXA 4F8RA 4O0JA 3LDSA 2PYJA 4IG3A 3ZSYA 1TK0A 4DF8A 3K5OA 3UIQA 4JLHA 4CE9A 1X9SA 4M42A 1WSJA 2HHUA 3KLIA 3AA4A 2KFZA 2KQ2A 3HPOA 4E7HA 3LP3A 1L3VA 1T05A 4KHYA 3LZIA 2VG6A 4BE0A 4KAZA 3TAGA 4DFPA 1ITGA 1C0MA 3QO9A 4H4MA 4R5PA 1QTMA 3VN5A 2KFNA 2VG7A 4M45A 4AHUA 5HRNA 3ITHA 4CGGA 1S1UA 3RR8A 1HYSA 4CF0A 3M8RA 1Z26A 3M8PA 4Z4IA 4LH5A 3LP2A 4RW4A 4CJTA 3RMBA 2FC0A 1KLMA 4OPJA 1IKYA 1RBSA 2AJQA 4DTXA 1VSKA 1RBRA 3D0PA 1JXBA 3L2QA 4J2BA 2GBZA 3M8QA 4O55A 2VWJA 4NCBA 1BGXT 4H4OA 4OKKA 2R7YA 5FRNA 3QEXA 3RMAA 3L2RA 3V9UA 4AILC 3L2UA 1TKXA 4CEZA 3JYTA 1D9FA 1TGOA 4KTZA 4RW7A 3V9WA 5DK5A 1IKWA 4AHTA 3NH1A 4BDYA 4I2PA 1C1CA 1IKVA 3TAFA 1U04A 3AVGA 3ZSVA 1WN7A 3LAMA 4E1NA 3C94A 4FM2A 3NBPA 3AVJA 3THVA 4GMJB 4CGHA 4K8ZA 1YT3A 4KB1A 3DRPA 4M3UA 1BI4A 4ZTJA 3NAEA 4FJJA 3S3OA 4FJGA 1U4BA 3L2WA 4AHSA 3ASMA 1REVA 4Z4CA 4KRFA 1CZ9A 1NK6A 4E3SA 2HVIA 4IDKA 1NJXA 3AVNA 1TK5A 1A5VA 1T7PA 2XY6A 4E7IA 3SV4A 1CLQA 3TR8A 4PY5A 4KI6A 3NF6A 4FJIA 1S1VA 3NF8A 4HUEA 1CXQA 3SI6A 1RDDA 1RT2A 3NH2A 1JLFA 2HHWA 1BISA 1EXQA 4EP4A 3EY1A 4J2DA 1WSEA 4KTWA 3DLRA 1L3UA 3QEWA 4AHRA 4F4KA 2HW3A 2D0AA 4FJ9A 3IAYA 3MXJA 4FLWA 4KHQA 1UA1A 4RG8A 3AVBA 4FLZA 1KVAA 3D45A 3MXMA 3U3YA 4DTUA 2D0BA 1KSPA 2G8WA 3SYZA 2A1RA 4RW8A 1WAFA 3E01A 4FM1A 4FLYA 3SPZA 1RDCA 4CJWA 4F3TA 4IFVA 3DLEA 4ZTFA 1NK7A 4GW6A 2QXFA 4JRPA 1JLAA 5KTQA 3LWLA 4CK2A 4FLVA 4FJNA 2I5JA 3DM2A 3O4NA 4CEFA 2B4JA 2EHGA 2OPSA 3ZT4A 3VQ7A 1J5OA 5HLFA 4KI4A 1JL1A 4MFBA 4CK1A 1HJRA 3U3GA 4DS5A 3PY8A 1SL0A 3HSTB 1TV6A 3QIOA 1BQMA 3C6TA 3QETA 1Q9XA 1LW2A 2KTQA 3KLEA 3T19A 3OYBA 1SV5A 1KRPA 4FLXA 3PV8A 2FBTA 3L2VA 4FLUA 4IFYA 3WNGA 3NH0A 2HHVA 4DS4A 4K8XA 4B3OA 4I7FA 5KRSA 4CGIA 4CIEA 4B8CA 2PY5A 5CZ1A 4YNQA 3AA5X 2YNGA 4GVMA 4E7LA 3MAQA 2DFFA 4HUFA 2X6NA 2WONA 3HPHA 1VSHA 2P1JA 4NYNA 3SCXA 2F8TA 1NJZA 3ZSRA 4B9VA 4XIUA 2HMIA 4KHUA 3DLBA 4DSKA 4BWMA 4CEEA 1S6QA 4KPYA 4CJPA 2OPRA 4CF1A 4W5TA 1L3SA 4EP5A 4C8OA 1S1XA 1TKTA 4JS4A 3QIPA 4E7JA 4Z4HA 2X78A 4CFBA 3LANA 1S9EA 5KGXA 3OYGA 2B6AA 1S1TA 2EX3A 4DTRA 3AVHA 1LAVA 1NOZA 2VWKA 2YV0X 2Z1GA 3L3UA 3F73A 3PO5A 1J9AA 2BANA 2Z1JA 4B9UA 5CY4A 4ELUA 4I9LA 4WE1A 3A2FA 3ZSOA 3G10A 3AO4A 3HK2A 3JSMA 1UWBA 3SPYA 4CEQA 1EX4A 1CZBA 1SKRA 2GUIA 3AVKA 4DG1A 3RWUA 1UOCA 4FJMA 5CYMA 3OYCA 1RILA 2D5RA 5I42A 3L8BA 4CK3A 2VG5A 3OYJA 1BIZA 3RMDA 1T03A 4KV8A 4PA1A 3ZCMA 3K59A 1VSFA 2RN2A 4H8KA 4CF9A 3OS2A 3OYMA 3T3FA 3S3MA 4M3YA 3CM6A 4Z4FA 3NF9A 1LV5A 1ASUA 3KTQA 4AHCA 4FZXC 1U45A 3DOKA 3TWHA 1J53A 3LPTA 3B6OA 1KVBA 3H08A 4CESA 4PUOA 3ISNC 1SL2A 4LSLA 4O44A 4Z4GA 2XO7A 2JGUA 3T1AA 1Z25A 3AA2A 4B8AB 4W5QA 2KZMA 4LH4A 4FYDA 2YHBA 3IS9A 4ID1A 1R0AA 1RTDA 2RKIA 2Q3SA 1D8YA 2OYQA 1WSFA 1A5WA 4CEAA 4Q0BA 3EYZA 3RR7A 4B9TA 4FJXA 1VSMA 2DY4A 4M3RA 1JLBA 5KI6A 1QSSA 3KK1A 3DLGA 2D0CA 1QS4A 3DI6A 5CZ2A 5FROA 1S1WA 2ITGA 3I0RA 5D3GA 2YKNA 3AVCA 3KK3A 3VQ9A 1C1AA 3HXMA 3VA3A 4M3XA 4DU4A 1TL1A 1BI4B 1JLCA 1BCMA 1BIUA 3LPUA 3AV9A 1C6VA 3CG7A 3L3VA 3IRXA 4CJFA 1RT1A 3TAEA 1NK9A 4M41A 4EZ6A 4HCBA 4HCCA 3AA3A 2KZZA 2E6MA 3P1GA 4HTUA 3V81A 4C8KA 1TAQA 1IKXA 4FW1A 3SZ2A 1JL2A 5E41A 4L8RB 2G8IA 5J2PA 4BDPA 4KREA 1WSIA 3DYAA 3K2PA 5J1EA 4FM0A 1W9HA 1J54A 4DSFA 3TARA 1NK5A 4KHWA 2OA8A 1TAUA 1EKEA 2XY8A 2B5JA 2BE2A 5SZTA 1C0UA 3PUFA 3TABA 1VSLA 3HP6A 4F2SA 4Z4EA 3CFPA 1WLJA 3SUPA 3KKSA 1RBTA 1RDBA 3NFAA 4CHQA 2F96A 5JS2A 1FXXA 3CYMA 1RDAA 1RT4A 3FFIA 5K14A 3WNHA 3OVNA 3O3GA 3HM9A 4DMNA 1S6PA 4CFAA 2XY5A 1QSYA 4CF8A 4CGFA 2G8KA 2RPIA 3O3HA 5DMRA 1SKWA 2X74A 1BHLA 4DSJA 1S9GA 3DOLA 2ETJA 3F9KA 1JXEA 1U49A 5EU7A 1EP4A 4KKOA 3KJVA 3M8SA 3QEIA 1TK8A 3KD1E 1EETA 5J2NA 2OZMA 3VQ6A 3ZT3A 3OYIA 3I0SA 1ASWA 2P51A 1FK9A 2HHSA 4C8NA 5JS1A 3QERA 3EZ5A 4KTQA 4CJKA 4E89A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YCHA 4DR2K 1TL3A 2Q31A 3NGYA 1QE1A 5TKYA 4OO1J 3VEVA 4DV1K 3HP9A 3V1OA 3NDKA 2HB5A 1JLGA 4FWSA 3HO1A 3P39A 3HVRA 4CIFA 1BL3A 4WQ5A 3V1QA 4N47A 4R79A 4LSNA 3K0SA 4DF4A 2W6KA 4KHSA 1NKEA 1HQEA 4PWDA 2GWJA 2CGKA 4CHNA 4LF9K 5LMUK 4X65K 4J2AA 5C2FA 3U6FA 3I8BA 1QZ5A 4CFDA 4BRLA 5JVHL 5BR8K 1FKPA 2O8DA 3CMAN 1NGEA 3P83D 1RNHA 3CCJN 2PZSA 1K6YA 4NB4A 1RTHA 3AVLA 4EZ9A 2P9SB 3CETA 1XHXA 5AQIA 3GDQA 5DM7L 4FJHA 3ENOA 3O08A 3VQ4A 5IWAK 4GY2B 4M7YA 4MLHA 4PQUA 3HT3A 2NLXA 1WSHA 2QWNA 3VQBA 4FPAA 2DFHA 1S5JA 3ULDA 4JKCA 2P9PA 3NMUA 4PKGA 4FJKA 4BR9A 3O9TA 3OS1A 5E84A 2A1SA 4CJ5A 2HBKA 1DGKN 5J2MA 2UXCK 4TSXA 4K42A 3QNNA 2HMPA 1HR0K 4I6MB 2O8FA 2P5GA 3VENA 4CBWA 3ZSXA 1RT3A 3ZSWA 3VA0A 1QQMA 4BVPA 2GV9A 3AO5A 1HLUA 2EWSA 4FWLA 1VK0A 4CHZA 4ICLA 2NRHA 3SAGA 3VGMA 3VQDA 2QWMA 2FBXA 3VQ5A 3A5MC 2ZQBA 3IG1A 3MN6A 4B3RK 2HSTA 1SL1A 5FDLA 4KHNA 3OTOK 1KCFA 4QOZB 2X6SA 2BGGA 5AQUA 2HHQA 4BE1A 1NGGA 4BREA 4DB3A 3EL2A 4FW2A 1ATNA 3RRHA 1NK8A 4E1MA 4N56A 2HHTA 3HM8A 3BDPA 3C95A 3CIPA 4CVNE 3H46O 4E0DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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