2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
b'NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
1RDAA 1UAXA 4O0IA 4Z4EA 4E0DA 4BWJA 4AHSA 3V1OA 2Z1GA 4CJ3A 3SQ1A 2JGUA 4CF8A 3NBPA 3OYBA 1EX4A 3HP6A 3VA0A 3AO2A 3AVNA 4I2QA 4E89A 1J54A 4QAGA 4W5NA 4DQQA 4CK2A 4FM0A 3AVGA 4O4GA 3DRPA 4KKOA 4RW4A 1Q9YA 4DQIA 1VSKA 3OJUA 4KHNA 3KD5E 3RR8A 2IOCA 3BDPA 4IKFA 3TR8A 4AHCA 1KTQA 4IFYA 4KRFA 2A1RA 1SL2A 1RBTA 1VSIA 1W9HA 2DFEA 4DTRA 4C8OA 3I0SA 2RN2A 3WNFA 1U49A 1RNHA 3D45A 3LPTA 3DLHA 4FJXA 4OKEA 3O3FA 1TAQA 3V9SA 1T7PA 4E7KA 1GOBA 4KHUA 1HNVA 4IG3A 5SWMA 1SV5A 3OS0A 1Y97A 2KQ2A 4FW2A 3OYNA 1NOYA 3SJJA 2IGIA 2HB5A 3KK2A 2EX3A 3PUFA 4CK3A 4YNQA 1IH7A 4B8AB 3QETA 1KSPA 4DTNA 1ASVA 3LAKA 3OYGA 2G8UA 1ZBLA 1L3SA 3V1RA 4CEZA 1QQCA 2D0CA 4F3TA 4NYNA 1N6QA 1X9MA 2HNZA 4LH4A 1IKXA 4RW8A 3LP2A 4CEBA 4DFMA 4EP4A 3HVTA 5FRNA 4AH9A 3OVNA 4CJRA 1QTMA 4CCHA 3KKSA 3K57A 1JLBA 4Z4FA 3OYIA 4HHTA 2O4IA 2XY5A 3RMBA 1RT7A 4CESA 1NK4A 4L8RB 1HQUA 5J1EA 4FCYA 1B9FA 3LWLA 4Q0BA 2Y1JA 3TANA 2DY4A 2HHVA 3KIOA 1EETA 1ASWA 4LD0A 3AVLA 3O4QA 3TAQA 1DTTA 1L3VA 2HNDA 1BGXT 2BE2A 3AVMA 3HL8A 2Q3SA 1J5OA 1NJYA 3ZSZA 3JSMA 3NDKA 3SUNA 1BI4A 5C24A 3L2RA 3EZ5A 1T8EA 4J2BA 4MFBA 4PA1A 1TKZA 1D5AA 2OYQA 3AVJA 4GMJB 4KTQA 4FK4A 3KLEA 5J2QA 3SPYA 3JYTA 4FJ9A 3KLGA 3TAPA 4J2EA 2RPIA 1YTAA 1ASUA 3THVA 5HP1A 1ITGA 1XHZA 4CGHA 1BIZA 3DRRA 4PWDA 4DF8A 4C8KA 1QE1A 3A2FA 4K8XA 4CJ4A 1HJRA 4JRPA 4KO0A 4FK0A 4O5BA 3V9XA 2YKNA 4IFVA 3UIQA 4DSJA 4BDZA 1SKRA 4DS4A 3TAFA 3SYZA 1UA1A 3HO1A 3NH1A 2KW4A 3HK2A 1TAUA 2OPQA 4CF1A 3VQQA 3L3UA 3MEEA 5CZ1A 4FVMA 4E1NA 3QO9A 1SKWA 4FJ8A 4DF4A 3AO5A 3AV9A 3CM6A 3DLKA 4M45A 3ZT1A 4DFKA 4B9UA 4F4KA 1QHTA 1VSDA 4FJGA 1HPZA 2DFFA 3OYCA 1JLQA 3K2PA 3QIPA 3MEDA 3NF6A 4W5OA 1VSMA 1NKEA 2DFHA 5J2NA 4B9SA 3KKRA 1D8YA 2IAJA 3MXJA 3MAQA 3V81A 1UWBA 5DMRA 4AILC 4GVMA 3WNHA 3B6OA 5C42A 2VG7A 3NFAA 3QINA 4CJVA 1LWFA 2Y1IA 2HVIA 1EXQA 2BGGA 1JXEA 3K5NA 4O44A 1YT3A 1RT2A 1D9DA 3K58A 5HRSA 3SI6A 3DLBA 1RBUA 2EHGA 4E7HA 3ZT3A 4GW6A 5DK5A 1BQMA 3VQDA 3AVBA 3P1GA 3ALYA 4FJIA 3RMAA 3DOLA 1RTHA 4KTZA 4F2RA 3V9ZA 1C0TA 1XWLA 4BE0A 4DFPA 5KRSA 3AA5X 4OGEA 3ZSQA 1X9SA 3EY1A 4I7FA 4DTSA 3I8DA 4B9VA 2A1SA 1T03A 4Z0UA 2B6AA 1SL0A 3C95A 2HHTA 3DRSA 1JLGA 4CGIA 3M8RA 1SL1A 1L3TA 2BANA 3VQBA 4DSLA 1Z26A 3B6PA 4FZZA 1BI4B 3LZJA 4FXDA 2VWKA 3QESA 4F3OA 2FBYA 1S1UA 4FLWA 2QK9A 4CJUA 2VG6A 4HCBA 5I3UA 4E7LA 4EZ6A 3QEVA 4FJMA 4PQUA 3ULDA 1J9AA 4DSFA 1RT4A 2E6MA 1NK7A 4B9TA 4EZ9A 2X78A 3TAEA 4F8RA 2R7YA 5JS1A 3C94A 3OY9A 3P83D 4DS5A 1NKBA 4AHRA 3VQAA 2YKMA 1HRHA 1MU2A 1XI1A 1L5UA 4FLTA 4OGCA 1I3AA 3RMDA 4DTOA 3SNNA 3NHGA 1HYZA 3TI0A 4C8LA 2LSNA 4BE2A 1RILA 2PYLA 2B5JA 3NE6A 1K6YA 4WE1A 3QEIA 3OYLA 3LPUA 3AVCA 4E7JA 3KK3A 1RTJA 1QSLA 1VRUA 4ELTA 1TKTA 1TVRA 3U3GA 4E3SA 4FK2A 4FJLA 5HRPA 1VSFA 4IBNA 1R0AA 4M42A 2RF2A 3PX0A 3LALA 1T05A 4N56A 1JL1A 4CHZA 4DU1A 5K14A 3RR7A 3O3GA 4DU4A 4CFCA 1RT5A 4OKJA 1RBVA 1LAWA 3L8BA 3SUOA 3QLHA 3K5MA 2FC0A 1TK8A 1KFDA 3LP1A 1KLMA 1W0HA 3VQ4A 3OYDA 1FKPA 2P5GA 4KI6A 3KK1A 3G0ZA 1TK5A 4HTUA 3HSTB 2D5RA 4IDKA 3ZT0A 4BWMA 2Z1JA 4DTPA 3M8QA 3MXIA 2OPSA 5HRRA 1HMVA 2PYJA 4QOZB 2P51A 2G8IA 1TGOA 3V9UA 5J2MA 3VQ8A 4ELVA 4E19A 5KRTA 1S1VA 5KGWA 3KLFA 4Y1CA 1N5YA 3S9HA 3LP3A 3EYZA 3S3OA 4H4OA 1S9GA 5D3GA 3OYEA 3SUQA 4DQPA 1S1TA 4LSNA 3AVIA 3V9WA 1RT6A 5HROA 3O3HA 3TARA 2XRIA 4KHSA 4N47A 3MXMA 4KHQA 3DMJA 2IDOA 2FBTA 4KV8A 4UQGA 3QIOA 4KTWA 3O4NA 1RT3A 4CE9A 4HVJA 3NGZA 4CEAA 1BCOA 3SZ2A 1ZBFA 1REVA 3DI6A 4ZTJA 3NH0A 3AVHA 2QKBA 1BQNA 4CJWA 3C6TA 1I39A 4KFBA 3VN5A 4OKKA 4Z4CA 2OZSA 4FLUA 1U4BA 4I9QA 4M3XA 4PY5A 3T19A 4ID1A 2YNIA 1CLQA 3E01A 4CERA 2BDPA 4NCAA 4BDYA 3P5JA 4CIFA 3PO4A 4FJKA 1BIUA 5E41A 2FBVA 3RRGA 4CK1A 5KI6A 4CGDA 3VQPA 4CJTA 1LW0A 4B9NA 1SKSA 2G8VA 3VQ7A 1RCHA 3HYFA 3SUPA 3ZT2A 2HMIA 1NK9A 4N41A 2WONA 1UOCA 3BGRA 3SQ2A 1WLJA 3CM5A 3NCIA 4DTMA 1RBRA 4HUFA 3NH2A 4FJHA 4M3YA 1GOAA 5CY4A 2DTUA 1NOZA 3M8SA 1L3UA 4DTUA 3OYAA 3L2WA 2WOMA 2X74A 3CQ8A 1X9WA 4LSLA 4KHWA 4CHNA 4ID5A 3ITHA 3QEWA 4DSKA 1JXBA 4XIUA 1TKDA 4M3UA 4DTXA 1A5WA 4J2AA 4Z4GA 4CJ5A 1B9DA 1JLAA 4OPJA 4W5RA 1IG9A 2OA8A 2X6SA 1WSJA 2HHUA 4FLXA 2X6NA 1UA0A 4CJKA 1S5JA 5HBMA 1EP4A 4JS4A 4OPKA 4OJRA 3RMCA 3HM9A 3HXMA 1TL1A 4FLVA 1FKOA 3QEXA 1KRPA 4KPYA 1KVAA 1XHXA 3L2VA 3CFPA 2HHXA 2ETJA 2KFNA 1C1AA 2OZMA 3S3MA 3AA2A 3NGIA 5JS2A 3T3FA 4FM1A 1KCFA 1CXQA 1NJXA 1C0MA 1HYVA 3MECA 4FJNA 2HVHA 1WAJA 3ISNC 2KZMA 3LDSA 1S1WA 1NJWA 4CJLA 4KHYA 1WSFA 4CEDA 2QKKA 1RDDA 5FRMA 1U04A 3VQCA 4CHOA 3OJSA 3WNGA 4CJPA 5I42A 4KI4A 1LWEA 3LAMA 4E7IA 1NK0A 4AHVA 4B9MA 3T1AA 3QEPA 1QSYA 4KAZA 2IS3A 1IKVA 4CJSA 3AO4A 5FROA 4MQ3A 3RWUA 4CF9A 4BDPA 2YHAA 4CGJA 2G8KA 3F73A 3DOKA 2HW3A 1VSJA 4ICLA 1D9FA 3L3VA 4CF0A 3HPHA 3TWHA 4R5PA 1TK0A 2RKIA 1C1CA 3DM2A 1TL3A 3NGYA 4CIEA 3PV8A 3K59A 4CHPA 1WSHA 2HNYA 3AVAA 4M3WA 1WN7A 3AA4A 5J2PA 4FJ5A 1QSSA 1IKYA 4I2PA 3H08A 4B8CA 4J2DA 4FM2A 3F9KA 1ZBUA 2W42A 3K5LA 1VSEA 1FK9A 4Z4IA 2KFZA 3V6DA 2XHBA 3KTQA 2OPRA 3OYJA 3TABA 4DLEA 4ELUA 1SUQA 5HLFA 1JKHA 3AVFA 4Q5VA 3NAEA 1LV5A 4EP5A 4RW6A 4E1MA 3VQ9A 1G15A 1S1XA 3TAMA 4CFDA 1ZYQA 3PX4A 4C8NA 4M3TA 4RW7A 4N76A 1C0UA 3ZSRA 3MEGA 4BACA 4FLYA 4CGFA 3IG1A 4FJ7A 3KD1E 2YHBA 3IAYA 2PY5A 3SV4A 1JLFA 3QNOA 2IC3A 1RTDA 4F2SA 3D0PA 3K5OA 4AHTA 3HPOA 4HCCA 2XY7A 3NF7A 3HT3A 1NJZA 1BHLA 1CZBA 4G1QA 4KREA 1BISA 1RT1A 2GBZA 3PX6A 4DSIA 4NCBA 3OYFA 5EU7A 3PY8A 1IKWA 2ITGA 4CJEA 4H8KA 1BL3A 3SPZA 2GV9A 3ZSWA 4BE1A 3ZCMA 1HNIA 4CEQA 3HP9A 2PZSA 3ZSYA 2YV0X 3AA3A 3IS9A 4C8MA 4DG1A 1S6QA 3OS1A 4M3RA 1GOCA 1Q8IA 2QXFA 1C1BA 1TKXA 3LANA 3ZSXA 1F21A 1KVBA 4CHQA 1VSLA 3WNEA 5KTQA 1RBSA 2FBXA 3C6UA 2VWJA 5KGXA 3CFRA 4DTJA 4HUGA 2G8FA 1J53A 1WNSA 1WSEA 3VQ5A 3V4IA 3SQ0A 4RG8A 1LWCA 3AVKA 3OS2A 4RW9A 1WSGA 1YVUA 3FFIA 3OYKA 4FYDA 2E6LA 3V1QA 1KVCA 2P1JA 3AO3A 1FXXA 4DQSA 3PO5A 3CG7A 2I5JA 4M41A 4CEOA 1TV6A 2Z1IA 3LZIA 4FLZA 1X1PA 1KFSA 2G8HA 3KLIA 3I0RA 4Y1DA 4DLGA 4W5TA 4KB0A 3LP0A 1KLNA 3VA3A 4YFUA 2JLEA 3QERA 4KB1A 5FDLA 1LW2A 3G10A 3OYHA 4AHUA 4JRQA 3RTVA 1CZ9A 1Z25A 4NYFA 3SCXA 3ASMA 3VQ6A 1NK8A 4CECA 4CFBA 4ZTFA 3SQ4A 4CEFA 3RRHA 1WSIA 4JLHA 3ZSVA 1RDBA 2D0BA 4FJJA 4CFAA 1ZBIA 1DLOA 2YNHA 3VQEA 1O1WA 4B08A 5HRNA 1ZBHA 2GUIA 3HPGA 1B92A 5C25A 4H4MA 3HVRA 4K8ZA 1VRTA 2F96A 2HHWA 4QCLA 4PUOA 3L2QA 3U3YA 4B3OA 4CF2A 4DFJA 5SZTA 3U6FA 1HYSA 2ZQBA 1S6PA 3AO1A 2ZE2A 2OPPA 1HQEA 3M8PA 4OLAA 1JL2A 2D0AA 2AJQA 2VG5A 2YNGA 1CXUA 4CGGA 4CJQA 2P5OA 2HHQA 1NK6A 4M3ZA 3KJVA 3L2UA 4B9LA 4CIGA 2F8SA 1JLCA 4FZXC 1A5XA 2XY8A 1Q9XA 1DTQA 4IG0A 3DLEA 3NF9A 3KLHA 1JLEA 3DLRA 1YTUA 4FW1A 4NCGA 5T7BA 1LAVA 1WAFA 4JS5A 3HJFA 1C6VA 1IO2A 3IRXA 4Z4HA 4DWIA 4OVLA 3TAGA 4HUEA 4CHYA 1VSHA 2HHSA 4TSXA 4W5QA 2B4JA 3S3NA 4CJFA 3NF8A 2KTQA 2YNFA 4O55A 4LY7A 1QS4A 5CYQA 3DLGA 4ZHRA 4DU3A 2XY6A 1NKCA 1NK5A 1RDCA 4I9LA 1BCMA 3CYMA 3QNNA 1RTIA 4DSEA 3ZT4A 2ZD1A 3ZSOA 3SV3A 2XO7A 2G8WA 4FZYA 5CYMA 1U45A 2ATQA 2Z1HA 5CZ2A 1U47A 4DQRA 4O0JA 3OYMA 3DYAA 4N5SA 1U48A 2NUBA 2F8TA 2KZZA 1A5VA 4DMNA 3CFOA 1EKEA 4LH5A 2E4LA 2O4GA 3LWMA 1XC9A 1S9EA 4OLBA 4CEEA 1VK0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDAA 2FSJA 3MK6A 4CJ3A 5DM6L 3TU5A 4H0XB 4PKIA 3AO2A 3MN7A 1J54A 2W41A 3CETA 3AVGA 4CZGA 2ASMA 4DQIA 1BO5O 4H0YB 5BRHA 1KTQA 4KRFA 1SL2A 2DFEA 1D4XA 3I0SA 2RN2A 5F2RA 4A2AA 1U49A 1BDGA 5C12A 1T7PA 3OS0A 5C15A 5SWMA 1DKGD 3SJJA 2IGIA 3TSQA 3PSFA 4CZMA 1ASVA 3K0SA 4WQ4A 1HNZK 4CZHA 1IV0A 2VCPA 1JJ2M 2P9PB 5E84A 3CCUN 4CEBA 3H46O 4IO9L 3HVTA 3OVNA 4LF6K 1JLBA 4CZKA 3OYIA 4HHTA 1LCUA 4M63C 4L8RB 5AQXA 1BUPA 4Q0BA 3TANA 4OX9K 3KIOA 3LM2A 5E26A 4DKWA 1ASWA 4H5VA 3MWPA 3O4QA 3TAQA 5C0YA 1L3VA 1MA9B 3AGKA 2HNDA 1NJYA 3ZSZA 3JSMA 3NDKA 2FF6A 3EZ5A 5GAHP 2P9UB 4PA1A 1D5AA 2QWPA 5FPDA 3O1WA 4DQ8A 2YI1A 2V51B 3P31A 4J2EA 2D1KA 3DRRA 4BGAA 1WB9A 3UE5A 4JRPA 2YKNA 1GLDG 4ILGB 3TAFA 3SYZA 3HO1A 1TAUA 3G6EN 4CF1A 4E1NA 5AZIB 3G4SN 3D2EA 3ENBA 1SKWA 4A57A 3DLKA 1VSDA 3JAMO 3NF6A 3CQXA 1WBBA 1D8YA 2IAJA 4FWLA 3WNHA 4DV0K 4RTFD 3NFAA 3QINA 3Q7BA 4H5RA 1YHQN 4H0OA 1RT2A 1D9DA 4KH6A 3SI6A 5AQMA 4E7HA 3ZT3A 3THWB 2GTDA 2NRHA 3PSIA 4GW6A 4DR1K 2UU9K 4BRAA 3CCJN 4U7BA 3ALYA 1YJ9N 2GWKA 1X9SA 3ZSQA 4XH1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 1NJW A;  4CJL A;  5GIN A;  1NGH A;  3VQC A;  4JN4 A;  4JI1 K;  3U9D A;  5I42 A;  1NGD A;  1LWE A;  3LAM A;  4AHV A;  1GLL O;  1IKV A;  4CJS A;  4CF9 A;  4X65 K;  2YHA A;  3DOK A;  1VSJ A;  4GV9 A;  4I6M B;  3CIP A;  4BRK A;  2HST A;  3DM2 A;  4CHP A;  4RCH A;  4IWV A;  4M3W A;  1VQN N;  3AA4 A;  3HM8 A;  1IKY A;  2P9U A;  3FZM A;  4XH5 A;  3K5L A;  2YJF A;  1VSE A;  1FK9 A;  3ENO A;  1YI2 N;  3N4Q A;  1NGE A;  4DLE A;  1ATN A;  4C1N I;  5HLF A;  3LDN A;  4EP5 A;  5AQN A;  2NRT A;  4FWN A;  4JK7 A;  4CFD A;  1ZYQ A;  4C8N A;  5TKY A;  4N76 A;  5FPE A;  4CGF A;  4FJ7 A;  3IAY A;  2PY5 A;  1JLF A;  5AQY A;  3DJC A;  4IEE A;  2XY7 A;  3HT3 A;  4LFC K;  1BHL A;  1OH7 A;  1BIS A;  5EX5 A;  4DSI A;  4YHH K;  1QZ6 A;  3OYF A;  1IKW A;  3EO3 A;  3SPZ A;  1NGF A;  3FZK A;  3ZCM A;  4B1X B;  3HP9 A;  4CEQ A;  2YV0 X;  3AA3 A;  3CER A;  4C8M A;  1S6Q A;  4CZJ A;  4UY8 O;  4FWK A;  2FSK A;  3ZSX A;  3C0B A;  1LOT B;  3AAQ A;  2CGK A;  4CBX A;  1RBS A;  5KTQ A;  4C23 A;  3C6U A;  3IFR A;  2VWJ A;  1S22 A;  4BRQ A;  5KGX A;  4CI6 A;  3AVK A;  4A2B A;  3FFI A;  1M90 O;  3ZET A;  1KVC A;  2P1J A;  5AQO A;  3AO3 A;  3ZX3 A;  1Q18 A;  3VER A;  1TV6 A;  1RGI A;  1SZ2 A;  4IXC A;  3KVG A;  3KLI A;  4DLG A;  4W5T A;  3VA3 A;  4YFU A;  1VQK N;  1HNW K;  1LW2 A;  4HWI A;  3H1Q A;  1Z25 A;  4NYF A;  4BGB A;  3ASM A;  4CEC A;  5AQT A;  2P9I A;  4JLH A;  1VQ7 N;  1Z6R A;  3VQE A;  4B08 A;  1B92 A;  2QWN A;  4H4M A;  4K8Z A;  1XNR K;  2F96 A;  3ENH A;  1HYS A;  5SZT A;  3H45 C;  2VGN A;  2ZE2 A;  2OPP A;  3F9M A;  1CXU A;  3KJV A;  4B9L A;  2F8S A;  3VOV A;  3DLE A;  1RFQ A;  3WT0 A;  4JS5 A;  4NCG A;  1LAV A;  3HJF A;  4HTL A;  4CHY A;  2E8A A;  1Q82 O;  4W5Q A;  3WQT A;  2Q1N A;  3AY9 A;  2FSN A;  5AQW A;  1NK5 A;  4I9L A;  1K8K B;  1BCM A;  4FZY A;  3ZSO A;  5EXW A;  3OYM A;  3DYA A;  1U48 A;  2F8T A;  2NUB A;  2KZZ A;  4GKJ K;  2KHO A;  1EWQ A;  3CFO A;  4BR2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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