2E6MA

Structure of mouse werner exonuclease domain
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
189
structure length
186
Chain Sequence
NLPFLEFPGSIVYSYEASDCSFLSEDISMRLSDGDVVGFDMEWPPPGKRSRVAVIQLCVSESKCYLFHISSMSVFPQGLKMLLENKSIKKAGVGIEGDQWKLLRDFDVKLESFVELTDVANEKLKCAETWSLNGLVKHVLGKQLLKDKSIRCSNWSNFPLTEDQKLYAATDAYAGLIIYQKLGNLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title probing the roles of active site residues in 3'-5' exonuclease of werner syndrome protein
rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog
total genus 61
structure length 186
sequence length 189
ec nomenclature ec 3.6.4.12: DNA helicase.
pdb deposition date 2006-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01612 DNA_pol_A_exo1 3'-5' exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 2e6mA00
1TK8A 4FLWA 4FLZA 1X9MA 1U49A 4DTOA 1VRTA 2X78A 4CJ3A 3RWUA 4FJHA 3DLBA 3O4NA 4FJ7A 4AH9A 4M3UA 5HRPA 3TAPA 2IDOA 1RTDA 1NKBA 4GMJB 2IC3A 4DFPA 2OZSA 4KAZA 1S6QA 4L8RB 1RTJA 2PYJA 3HPHA 1U04A 2FBXA 2FBVA 4M3RA 1JLEA 3KLGA 3AO4A 3SUNA 3TAMA 4HVJA 2JGUA 4DFMA 1LWCA 1BQMA 5CY4A 4CF1A 3RR8A 3QIPA 3WNGA 1N6QA 2HW3A 3NH0A 1U4BA 3L2VA 3AVBA 5DMRA 3KLFA 4E7JA 1C1AA 3V1QA 4DFKA 3DLKA 4DQIA 2VG6A 3IG1A 2GBZA 2ATQA 4KHUA 4W5TA 3OYDA 2B6AA 3VQ8A 2HHTA 4DU4A 3ZSZA 5JS1A 4E7HA 3NDKA 4FZYA 1SKSA 3LP0A 3PX6A 3SPZA 4FLYA 1IG9A 4DS5A 1JLGA 4N41A 1ASWA 1NJYA 3KKSA 4OKEA 1JL2A 4DTXA 1WNSA 1C6VA 3QLHA 4RW4A 3LWLA 3AVKA 2NUBA 1UWBA 1LW2A 3C6UA 4CEFA 4OLBA 3SYZA 1LV5A 3KTQA 1XWLA 3AV9A 1ASUA 4CGIA 1NK7A 4ID5A 2EX3A 4DU1A 2G8IA 4B8AB 4CGGA 1UOCA 2PY5A 1UA1A 2D5RA 2D0BA 2YKMA 1VSDA 3VQBA 4CF9A 3KD5E 3SCXA 3OYMA 1B9DA 2KZMA 1QHTA 5KGXA 3RR7A 5CYQA 2QKKA 3AVIA 4I2PA 4M3ZA 1T7PA 1S1UA 4G1QA 4JRPA 4OLAA 4CJUA 3LWMA 4O4GA 4KB0A 1EETA 4IBNA 3NE6A 2E4LA 4OJRA 4ZTJA 2GUIA 5KI6A 1L5UA 4RG8A 4WE1A 3MXMA 4Z4EA 1X9SA 3CG7A 1NJZA 1J54A 4BE2A 3NGIA 4DLEA 2KQ2A 3OJUA 4DMNA 3CFPA 3AO3A 4DSJA 3ZSYA 4HUGA 2OYQA 2XY6A 1FK9A 4EP4A 3L3UA 5HRSA 3OYEA 1IKWA 5KGWA 4JRQA 1TKZA 3O3HA 3SV4A 4NCGA 1R0AA 1ZYQA 2G8HA 3VQQA 1NKEA 4OKKA 4I2QA 4F2RA 3ASMA 3VQ5A 3LALA 3NGZA 1JLFA 2HNYA 2DY4A 5HRNA 4OPJA 3QETA 1NK0A 5EU7A 2EHGA 2RPIA 1HPZA 5J2NA 2YHAA 3AVGA 4PWDA 5CZ1A 1DTTA 2OZMA 1RBRA 3RTVA 3SNNA 2PZSA 3LDSA 3NAEA 4KV8A 3OYLA 4FJ9A 4CHYA 4FK2A 1KVCA 1QS4A 4CK2A 3NF9A 2G8FA 1WN7A 4Z4IA 1VSJA 3DLEA 4AHUA 3IRXA 4C8NA 4CK1A 2XO7A 2Y1IA 4RW8A 3SQ1A 1VSEA 4OGEA 4M3TA 2P5OA 1CZ9A 2Q3SA 4E1MA 3QEXA 4FZXC 5I42A 4QCLA 2VG7A 1KCFA 4CEBA 4CJKA 3K5OA 3K59A 4DF4A 2G8KA 4Z4CA 4CGFA 1CZBA 1Q9YA 2VG5A 2X6NA 5CZ2A 4BDZA 1KLNA 1JXEA 1X9WA 3DI6A 4NYNA 2B5JA 3ZT1A 5K14A 3LZJA 3NFAA 3OYAA 3TABA 4ELVA 4M42A 3AO5A 3H08A 4EZ9A 1C1BA 1NJWA 3C95A 2Y1JA 3G10A 5C24A 4JS5A 3CFOA 1GOCA 4CJSA 3EYZA 1S1XA 3SZ2A 4DSIA 1SV5A 1BIZA 4CJRA 3V81A 3SUOA 4BWMA 1YVUA 4DU3A 4F4KA 2LSNA 2DTUA 1RT2A 3HP9A 4C8MA 1S1VA 4ZTFA 4N5SA 4NYFA 4AHRA 4FJMA 3L3VA 3RMCA 5I3UA 3NH2A 1YTUA 3AO2A 2GV9A 4BDYA 2HVHA 4M45A 4LSLA 1U48A 3ZSRA 3OVNA 4RW6A 4HUFA 2HVIA 4CF8A 1CXUA 3OJSA 3QNOA 1L3UA 4F3TA 1RT3A 1VRUA 5SZTA 4PQUA 4Z4FA 3S9HA 1W9HA 4OPKA 4DS4A 1RBTA 3KK1A 4CEEA 1RT7A 3K58A 4FJKA 1RT4A 4AHVA 1C1CA 1N5YA 3HYFA 3AVJA 3HVTA 2XY7A 3PO5A 2XY8A 4NCAA 1IKXA 3F9KA 4DWIA 4KB1A 1Z26A 4W5RA 1RTIA 3AA5X 1UA0A 4CCHA 1QSYA 3VQPA 4AHCA 4CEOA 2YNGA 2F8SA 2OPSA 2Z1GA 1KVBA 5D3GA 3D45A 1IO2A 1A5XA 2ZD1A 3A2FA 4Z0UA 3NHGA 1JLCA 1A5WA 1YTAA 4H4MA 3L2QA 1SKRA 4KHQA 3I0RA 4FYDA 4E89A 4ELTA 3NF6A 1T8EA 4KKOA 4JS4A 4DQRA 1SL1A 4W5NA 1Q8IA 4KPYA 2B4JA 2VWKA 3VQEA 5KRTA 4LSNA 1G15A 2O4IA 1JLAA 4FM0A 4K8XA 5FDLA 4HHTA 1RDAA 2HHXA 1WSGA 3JYTA 1HNIA 3ALYA 4NCBA 3TI0A 4I7FA 3DYAA 5HROA 1NK8A 3ZSWA 1HYVA 3VN5A 4B9LA 3AVAA 1LW0A 1JLBA 5DK5A 4DG1A 1TK5A 4CEAA 4F2SA 2F96A 4CHNA 3S3MA 4DTRA 4DTPA 5KTQA 3LAMA 3TAQA 1J53A 3AVHA 1QQCA 1NKCA 3C94A 1QE1A 1RBSA 1WLJA 2FBTA 4Z4HA 3L2RA 3KK2A 4DSEA 1D9FA 3T3FA 1TAQA 4QOZB 4R5PA 1CXQA 4TSXA 3VQ9A 4DLGA 3TAFA 4FJ5A 2HHUA 2A1RA 1BCMA 1J5OA 4KI6A 3JSMA 3OYJA 4FVMA 1ZBFA 3AVMA 4BE1A 1TKTA 4CGDA 3HSTB 4CIGA 4E7LA 4W5QA 3P83D 1QSSA 2HHQA 4N47A 1VSFA 4CE9A 3QEPA 3S3OA 3PO4A 4B9VA 4GW6A 5FROA 4CJ5A 2QXFA 1IKYA 3L8BA 3V1RA 3QEVA 4RW9A 4O55A 3KJVA 3KLHA 4DTMA 4EZ6A 1BIUA 2DFEA 3VQ7A 4UQGA 2KTQA 3T19A 3EY1A 3KD1E 1C0TA 4FLXA 4CF0A 1HMVA 1LWEA 1Z25A 2D0CA 2O4GA 2YKNA 2A1SA 3ZT4A 4CJQA 3V9UA 1TKXA 4E3SA 4C8OA 4E0DA 1B9FA 2HMIA 3OS2A 1O1WA 1Y97A 4IFVA 4ZHRA 3VA3A 4CJTA 5SWMA 1IKVA 1KTQA 2X6SA 4KTWA 4CESA 1QSLA 3V9WA 2WONA 2X74A 2BGGA 2P1JA 2F8TA 2FBYA 2HB5A 3LAKA 4OVLA 4FJLA 1BI4B 3B6PA 1EP4A 1Q9XA 4ELUA 2QK9A 4AHSA 1RDBA 4FM2A 3QEWA 2YNHA 1RBVA 4CHZA 1HYZA 3IS9A 4FJNA 3HL8A 2IGIA 4FW1A 1FXXA 1S6PA 3CM6A 3OYKA 3LPUA 3VQCA 4FLUA 4W5OA 3V4IA 4B9NA 2IOCA 2OPRA 1C0MA 1BQNA 1WSJA 4RW7A 4DSKA 4CIFA 2KFZA 3OYBA 1RT6A 1D5AA 3OS0A 4J2AA 3SQ0A 4OKJA 1NK9A 3ULDA 2E6LA 4IFYA 4KTQA 3T1AA 3MXJA 3M8SA 1NOZA 4CJ4A 3C6TA 3HK2A 3S3NA 3P1GA 3ZSVA 3KLIA 2YNFA 4CFAA 4M3XA 4FLTA 3V9ZA 3B6OA 1EX4A 3OYGA 4DSFA 1TL3A 4J2BA 4FK4A 1NK6A 4FZZA 4PUOA 1RDCA 1L3VA 1NJXA 1WSFA 1D9DA 1JKHA 2KZZA 1HQUA 4IDKA 1RBUA 2P51A 4FCYA 4DTNA 1FKOA 4KFBA 4F8RA 4FJ8A 1X1PA 4Z4GA 4J2DA 2IAJA 4IG0A 1WAJA 4O5BA 3O3FA 3V9XA 3MEDA 4B8CA 3PX0A 4IKFA 2BE2A 4K8ZA 3NBPA 4Q5VA 3TWHA 3WNHA 1KVAA 1REVA 5J2MA 4CEDA 4FXDA 4E7IA 1SL0A 4B08A 1A5VA 1HQEA 4N76A 4FM1A 3QNNA 2E6MA 2HHSA 3QO9A 1TL1A 2OPPA 3ZT3A 1QTMA 4CJPA 4KHYA 3K2PA 2G8UA 3IAYA 5FRNA 2ZQBA 3ITHA 5HBMA 4DTUA 5HRRA 4DF8A 1KSPA 3KLEA 1LAWA 4J2EA 2BANA 4CECA 2Z1JA 3AA3A 3SUQA 4FW2A 4CHPA 4BE0A 3AVNA 3QINA 1WSEA 3AA2A 1SKWA 4KTZA 4B9UA 1TGOA 2IS3A 4DFJA 3MEEA 1RT5A 3QIOA 3LP3A 4CJVA 2XY5A 4EP5A 1XI1A 4C8LA 1TVRA 3DLRA 3U3GA 3ZCMA 3SQ2A 4CHOA 5C42A 2OA8A 4O44A 4Q0BA 3DOKA 3UIQA 4O0JA 3RMBA 1C0UA 1GOBA 4DTJA 2KW4A 5C25A 3AA4A 3AVFA 1UAXA 3AVCA 4BACA 1L3TA 2Z1IA 4CHQA 1XC9A 2OPQA 1VSLA 4O0IA 3HVRA 1RILA 3M8PA 4BDPA 4ID1A 1CLQA 2DFFA 1KRPA 2RN2A 4KHWA 4M41A 3O4QA 1I39A 1VSKA 3ZSXA 2Z1HA 3AVLA 3L2WA 3NH1A 1MU2A 3SV3A 3DLGA 4CK3A 1RDDA 3TANA 3WNEA 3E01A 1JXBA 4FJJA 3OYHA 1FKPA 3VQ6A 3PUFA 2YHBA 4IG3A 3U6FA 2R7YA 3PY8A 1F21A 2RKIA 4JLHA 3NGYA 1ASVA 4CF2A 3HM9A 2BDPA 1KLMA 4DSLA 3K57A 2ETJA 4CJWA 3D0PA 3THVA 4CFBA 1NK4A 1IH7A 1BGXT 1GOAA 1HRHA 1L3SA 1U47A 3QESA 3SI6A 2D0AA 3MXIA 4DQPA 3ZSOA 3DRRA 3NCIA 3MEGA 3LPTA 1NOYA 4MQ3A 3K5LA 1JL1A 4LY7A 3VA0A 3HJFA 4HUEA 1S5JA 4B9TA 1ZBLA 3SQ4A 1HJRA 2P5GA 2YV0X 3M8RA 5CYMA 1T03A 2YNIA 2VWJA 3K5MA 3HP6A 4QAGA 3EZ5A 3SUPA 3OYCA 2G8WA 4OGCA 3VQAA 1RTHA 1ZBUA 1D8YA 1KFSA 4PA1A 4Y1DA 5T7BA 3NF8A 1I3AA 4YFUA 3PV8A 4CJLA 3HPOA 3LANA 3SPYA 4FJGA 4DQSA 1ZBHA 1JLQA 3TR8A 4DQQA 2HNDA 3LP1A 4AILC 4M3WA 3I8DA 2ITGA 1WSIA 2XHBA 1VK0A 1LAVA 3ISNC 3HXMA 4CJFA 1TAUA 4B3OA 3V1OA 3OYIA 4CJEA 3OS1A 3LZIA 5HLFA 1BCOA 4LH4A 2XRIA 4H8KA 3BGRA 1SL2A 4FJIA 2DFHA 3G0ZA 2I5JA 4B9MA 4MFBA 4FJXA 1HNVA 5KRSA 4CFCA 3CQ8A 1RNHA 3OYNA 4E1NA 1SUQA 4CEZA 3F73A 5J1EA 3DLHA 3KKRA 4KI4A 5E41A 3CYMA 4CGHA 3TARA 1ZBIA 2PYLA 3RMDA 1ITGA 3RMAA 4I9LA 3ZSQA 2JLEA 3AO1A 1TKDA 4LH5A 3K5NA 1WAFA 2RF2A 2KFNA 3CM5A 3HT3A 2AJQA 4E7KA 3P5JA 3HO1A 3DM2A 4ICLA 3V6DA 3BDPA 1BISA 1NK5A 4HCBA 5JS2A 1HYSA 1S9EA 1EXQA 1BI4A 4CGJA 3DRSA 3ZT2A 4HTUA 5J2QA 2QKBA 5HP1A 2ZE2A 4BWJA 4LD0A 3O3GA 1U45A 2G8VA 4M3YA 4PY5A 2WOMA 1TK0A 1DLOA 1K6YA 1VSMA 4CIEA 4F3OA 3OY9A 3TAEA 3DOLA 3SJJA 3RRGA 4HCCA 3LP2A 3HPGA 3QERA 3FFIA 3NF7A 4N56A 1T05A 4YNQA 4XIUA 4GVMA 4KO0A 3VQ4A 3OYFA 3RRHA 4FK0A 2W42A 5J2PA 3L2UA 1LWFA 3DMJA 4CEQA 3VQDA 5FRMA 3ZT0A 1VSHA 3QEIA 4C8KA 2HHWA 1RT1A 4KHSA 3WNFA 3CFRA 1S1TA 2HNZA 2FC0A 1XHZA 3V9SA 1KFDA 4B9SA 4AHTA 3MAQA 1S9GA 4CERA 4DTSA 3MECA 3I0SA 1J9AA 1BL3A 1S1WA 4Y1CA 4KRFA 1XHXA 2HHVA 1BHLA 1EKEA 3DRPA 4CFDA 3KK3A 1W0HA 3PX4A 4KHNA 3U3YA 1DTQA 1WSHA 1TV6A 3KIOA 4FLVA 4E19A 3TAGA 1B92A 4KREA 1YT3A 3M8QA 1VSIA 4H4OA 1RCHA 4I9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLWA 4FLZA 1X9MA 3WEEA 3CC4N 4DTOA 1HUXA 1KXPA 3HTVA 1YI2N 2EWSA 1NKBA 2IC3A 1S6QA 1U04A 2YHWA 2FBXA 3DXKB 3ZEUB 1EQYA 2NZTA 3SUNA 3R3LA 4DFMA 1LWCA 2UUBK 3BF3A 3RR8A 1U4BA 1NGAA 3L2VA 3AVBA 3CJ1A 3HBTA 1C1AA 3V1QA 3I56N 4DQIA 3T1YK 4H0PA 3VQ8A 4DU4A 4FZYA 4IO8A 4WFNL 3LP0A 3SPZA 2QWNA 4BQLA 3MN7A 5GIPA 1T44A 2QW9A 4JKBA 1JL2A 1VQ9N 4DTXA 5M1OA 1C6VA 3DXMA 3BZCA 3CJ7A 3KTQA 2QWLA 3AV9A 2HSTA 4ID5A 2EX3A 2HF3A 1UOCA 4GY2B 4MLEA 3HSCA 3VQBA 4CF9A 3KD5E 3DLLL 5AZIB 4G1QA 2WUSA 4NXMK 1QHAA 2VQFK 4RG8A 1X9SA 1J54A 3O1BA 3CFPA 3A5MC 4DSJA 3E9PA 3VERA 1EWQA 2QWOA 1W2BM 3OYEA 5KGWA 2P9UB 4JRQA 4RCHA 2DPNA 2G8HA 3VQ5A 4AF1A 2YI1A 4BR0A 4DR2K 5EU7A 2W6LA 2OZMA 3RTVA 5AFUH 1VQPN 2IIRA 3O4WA 4FK2A 4CHYA 3H45C 4ILGB 4EIAA 3VENA 4BRNA 2XO7A 4M63C 4M3TA 5EVZA 3O6WA 2VG7A 4CJKA 3PIPL 2FF6A 1NBWA 1RGIA 3KWGA 1WOQA 3O9QA 4C1NI 1BWFO 3DI6A 3MN5A 1DEJA 2HMPA 4MDBA 3OYAA 4M42A 5LMUK 3H08A 3A5LC 4YOXA 3C95A 1NJWA 3G10A 5C24A 3EYZA 1S1XA 4F4KA 4BWMA 3CCUN 1S1VA 4AHRA 2GUPA 2IVNA 4H0VB 2GV9A 2O8EB 4JI8K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LP1 A;  3I8D A;  2ITG A;  4PL8 A;  1WSI A;  2HBK A;  2XHB A;  1LAV A;  3ISN C;  4O5F A;  3V1O A;  3F2K A;  4X64 K;  3VOV A;  2UXD K;  1IG8 A;  1S3X A;  2DFH A;  2I5J A;  4R79 A;  2UUA K;  3C7N B;  4E1N A;  1SUQ A;  2PAV A;  5J1E A;  1GLB G;  3KKR A;  4H0O A;  3CYM A;  3IFR A;  3CQY A;  3QIC A;  3QB0 A;  3UKU B;  3RMD A;  3ZSQ A;  2JLE A;  3CQX A;  3QBX A;  5AQJ A;  4A5A A;  2RF2 A;  3HT3 A;  4E7K A;  3V6D A;  3VGL A;  1YXQ A;  5JS2 A;  2O8B A;  4HTU A;  4H5N A;  4CVN E;  4M3Y A;  4JN4 A;  4JI1 K;  4JHD B;  1P90 A;  1SZ2 A;  3OY9 A;  3RRG A;  2UYT A;  4GVM A;  4FK0 A;  3OYF A;  4H03 B;  2W42 A;  5GAD P;  1LWF A;  4DV3 K;  3NVM A;  1NGJ A;  1RT1 A;  4NO7 A;  3CFR A;  1OKJ A;  2FC0 A;  3NVK A;  2VGN A;  3MAQ A;  4BY9 C;  4DTS A;  3MEC A;  1S1W A;  2HHV A;  1BHL A;  1KAZ A;  4JHD A;  1XNQ K;  3U3Y A;  1WSH A;  3KIO A;  1VQN N;  1B92 A;  1YT3 A;  3L6Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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