4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
2D0PA 5EX5A 4K41A 3H1QA 4FL9A 2CGLA 3EL2A 3ZX2A 4Y0WA 3GG4A 2GWJA 3GDQA 4EFHA 1BA1A 4WQ5A 4CZEA 4FWMA 1BOTO 1V4TA 5AFUA 2WUSA 4ISGA 4CZJA 3CJ1A 3RSEA 3C7NA 2D4WA 2H3GX 3B8AX 3J8AA 2QM1A 1ZBSA 2P9KA 1BWFO 1OKJA 3ULEA 3CQXA 4H0YB 2W40A 4JHDA 3MN5A 2Q31A 3G25A 5CE3A 3VEXA 4A2BA 2ZF5O 4H5RA 5BN9A 3DXKA 2ZGZA 4CBWA 4ISEA 1GLCG 1TYQA 4NB4A 3EO3A 3L0QA 2P9LA 3QB0A 3ID8A 4H0PA 3O80A 3W0LA 3AAQA 1BO5O 4PKGA 4IJNA 3VERA 3U9DA 2BUPA 1S22A 2FSJA 3VEYA 5AQGA 3WXJA 5EXWA 4XH4A 3EN9A 1HKCA 1QQNA 2FF3B 4BRLA 3D2EB 4DQ8A 2P9UB 1GLEG 1ESVA 2IVNA 3U8XA 3LDNA 1BUPA 1GLLO 3AAPA 4FOEA 2E2OA 1ATRA 4A61A 2E88A 4WQ5C 2V52B 4BRDA 3FR0A 2IVPA 2ASOA 3HSCA 2NZTA 5AQSA 3O08A 3I8BA 5AQRA 5F1XA 2VCPA 3CQYA 4H5TA 1QQMA 3O5BA 2YHWA 1NLVA 3OHRA 3F9MA 3FE1A 4WQ4C 1Z05A 1BG3A 4LC9B 4L3QA 3SMSA 1X3MA 4JNEA 4BVOA 3FZKA 4DHYA 3WEEA 1LOTB 2FXUA 4BR2A 1NGHA 1EQYA 3O8MA 4BRMA 4CZIA 5LY3A 4BGAA 3EZWA 3FZHA 4BC5A 4QS7A 1NGFA 4A2AA 1IG8A 3A0IX 3D2EA 1BA0A 3WUHA 1R59O 1RDWX 4BQZA 2FF6A 4BRNA 3O1BA 4CJ7A 1KAXA 1NGGA 4B1UB 5FPEA 2IVOA 1K8KA 5AFUH 3DJCA 4H5VA 5F2RA 4QS9A 3VESA 1NGJA 3AARA 5BRDA 4M7YA 3VGLA 2ITMA 4KBOA 1MWKA 3TPQA 3O4WA 4MLHA 1NGDA 5KPRA 3BF3A 5BPLA 4EAHD 1SQKA 3SK3A 1XUPO 1TYQB 2YCHA 2Q36A 2P9LB 3UKUB 4BRGA 3SJHA 5BN8A 1KAZA 1QZ5A 3O1WA 4K42A 4JD2B 1HKGA 1MDUB 2Q97A 3FFKB 1T6DA 3QICA 1U6ZA 1MWMA 4B1WB 4B1XB 4H5NA 3BP8A 4IWVA 2Q2RA 1SAZA 2A3ZA 5E26A 3HZ6A 3UB5A 3VGKA 1BU6O 4FO0A 5AQZA 1HJOA 3SMPA 1T6CA 2QW9A 4FOIA 4BG9A 3VPZA 3WQTA 4C23A 1ZXOA 2FLOA 1YXQA 3QBXA 4JAXA 2UYTA 3HM8A 3WXKA 1P8ZA 4NO7A 2QWOA 2QWNA 3BF1A 3HTVA 5AQIA 3CIPA 3R6MA 4AM7A 2BTFA 3JS6A 5EY4A 2E2QA 3CERA 3KHYA 3LDLA 3ZX3A 3LM2A 1HUXA 2V7YA 3UKUA 1HX1A 5AZIB 5TKYA 4BC2A 1KXPA 4F9OA 3BEXA 4PKIA 4XH1A 4BRFA 4JD2A 3HBTA 3DAWA 4ISFA 1XQSC 2OANA 3WEEB 3VEVA 2A40A 3GOIA 4CD3A 5ELZA 1Q18A 3VENA 4BROA 3M1FA 4BR0A 2A5XA 5AZJB 4M63C 2AP1A 1LCUA 3A5LC 4B1YB 4FWQA 4IZ9A 4H03B 4O5FA 2J4RA 3D2FB 5ADXH 3MN6A 3DWLA 4FWOA 2YHYA 2Q0UA 5BRFA 4BRPA 1K8KB 1IJJA 2YI1A 4BC3A 2GEMA 2QWMA 1E4FT 2NRHA 5AZIA 4PL7A 2FSKA 3WQUA 1JCFA 4IO8A 2W41A 1ZC6A 1TUUA 3JXUA 3BUZB 4FSVA 1NGCA 2GWKA 2QWQA 1Y64A 1RGIA 4H0VB 5LJVA 3R9PA 4EHTA 2GUPA 4XH5A 1JCGA 2E20A 5KQDA 3IMXA 2QWLA 3VF6A 4FWSA 3UE5A 5JMVA 3CJBA 4BR4A 1NBWA 2NLXA 4BR9A 5AZJA 1NMDA 3H45C 4PKHA 4BRAA 5E84A 1C0FA 2A41A 2E2NA 4IXCA 1QQOA 1ATNA 3D2FA 4MO4A 3CETA 3VF2A 4CI6A 3MN7A 3H1VX 3VOVA 3H6EA 2E1YA 2YJFA 1Z6RA 3MK6A 1J6ZA 3H46O 1DKGD 3L4IA 3M3ZA 2F9TA 1X9JA 1S3XA 4CZHA 5AQUA 3KZBA 2ASMA 2P9PB 1GLAG 2CGKA 3A5NC 3FZMA 4H0XB 1U2VB 2P9NB 4K25A 4XEIA 4BRCA 4HWIA 2Q1NA 3IDHA 3MMVA 4BGBA 2DPNA 3CJCA 1DGKN 3FZLA 4FWKA 1CZAN 5AQXA 3CHWA 1NGAA 3QDKA 1C0GA 5AR0A 4BQLA 5KQ8A 4JN4A 1QHAA 4Z94A 4I6MB 4QS8A 2ZGYA 2PAVA 3LL3A 3H3NO 4FPAA 3WXLA 2QWRA 3W3DA 2V51B 5FPNA 3DXMA 3UKRB 1NGIA 3I33A 2VWBA 3VGMA 5AQMA 3D7EO 3SLCA 4CD1A 2P9PA 5JLHA 2V7ZA 4FWLA 1U2VA 2P9NA 2E2PA 4BRQA 3CJAA 2A42A 4AM6A 5F0XA 4BRIA 3ZEUB 4YDUA 4GY2B 3ATUA 4FPBA 3VETA 4BG8A 1G99A 4HTLA 1E4GT 5EOYA 5AQPA 4H0OA 4CZMA 1GLDG 3CI5A 1D4XA 1WOQA 3KVGA 4WQ4A 2ZWHA 4I6MA 5I9EB 4EIAA 1GLJO 3C0BA 5AQWA 5FPDA 4B9QA 5AQNA 5BPMA 2QXLA 5JLFA 1YUWA 3LM9A 2F9WA 2QWPA 1XC3A 5AQJA 1HKBA 5AQFA 3FLCO 3ZX0A 4A62A 2YHXA 3UKRA 2ASPA 3ZETB 5BRHA 3FGUA 3MN9A 4GNIA 4H5WA 2I7NA 3S41A 4H0TB 3U9ZA 4RCHA 1NGEA 4MLEA 3WXIA 3CJ9A 3LDQA 4CBUA 3H3OB 3AY9A 2D0OA 4CZGA 4IJAA 3VEZA 3GBTA 3ZEUA 2D1KA 3VEOA 4CZFA 3EKSA 5JICA 5KPTA 4DCHA 3MCPA 3QBWA 3LDPA 1HLUA 3IFRA 1GLBG 4K43A 1H1VA 3FZFA 3IUCA 3M6GA 4FWNA 2CH6A 3U4LA 5KPZA 4EHUA 5AQHA 1RFQA 4B1ZA 4BR5A 4BC4A 5AQTA 5AQQA 4E1JA 5AQYA 3EKUA 4MO5A 2A6AA 4YDUC 2IIRA 3ZETA 2KHOA 1GLFO 2FSNA 3R8EA 3QMLA 1BDGA 3HI0A 2I7PA 2P9SB 1YAGA 3CJ7A 5BREA 2P9IB 3QFPA 2E8AA 4O8KA 3TU5A 5AQVA 1QZ6A 1X3NA 1NWKA 2GTDA 4M7XA 4CZKA 3DXMB 3LDOA 1SZ2A 3MDQA 4CZLA 1DEJA 4RWTA 1MA9B 5FPMA 2P9UA 4FWPA 2AA4A 3GL1A 1TUYA 5AQLA 5ADXA 3VEWA 4J8FA 3O6WA 4BRKA 3GE1A 1YVNA 5AQKA 1ATSA 4PL8A 5B8HA 4BRHA 1WUAA 4BREA 4FWRA 3RSEB 2CH5A 5BR9A 3C7NB 3ENOA 2PBDA 3A5MC 2HOEA 2HMPA 2GELA 1T44A 4BR7A 2P9KB 5EVZA 4CBXA 2EWSA 1JCEA 4DB3A 5LJWA 4WYBA 3ULEB 3QFUA 3VF4A 2P9SA 4BVPA 4JHDB 3A5OC 2CGJA 1HPMA 2E1ZA 2VYPA 2P9IA 1NM1A 1NGBA 3L6QA 2HF4A 2HF3A 5AQOA 4B1VA 1KAYA 1V4SA 2YJEA 3A8YA 2Q0RA 3DXKB 5BPNA 3WT0A 3P4IA 3ATVA 3ENHA 4RTFD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EX5A 3VQ9A 3OYHA 3V9SA 2DFHA 1U4BA 3T1AA 1DLOA 2OPPA 4LF8K 4DFPA 4JKBA 3GDQA 4JK7A 2HBJA 4ICLA 4CZEA 4DSFA 1IBLK 1J9AA 3P39A 1XHZA 3B8AX 3J8AA 2B5JA 1HNXK 4JI5K 2UXDK 1L3TA 2Q3SA 3HOTA 2ZJPL 1BWFO 2DTUA 4LF5K 2HMIA 3G25A 2E4LA 2JGUA 3TAMA 4FJXA 5BN9A 1HQUA 3THXB 5I42A 1GLCG 4NB4A 3K57A 5CHIA 1JKHA 3HRGA 3L0QA 1YJWN 3QB0A 1VQON 3DLHA 4N56A 4FVMA 3P31A 1SL0A 4JLHA 3U9DA 3AO4A 4M3RA 4CGFA 2X6NA 3T7ZA 3MAQA 2GBZA 5AQGA 4FJNA 1IKXA 5EXWA 1QQNA 3EN9A 5SWMA 1UAXA 4MDAA 4BRLA 2NRTA 2P9UB 1RDAA 3KKRA 4J2AA 4KHNA 4O4GA 3NH1A 4A61A 1JXEA 4WF9L 3KD1E 4BRDA 4CEBA 2ASOA 2WBNA 5AQSA 3I56N 1KQSM 1IV0A 5CZ2A 4FLVA 4RW8A 4JK9A 4DF8A 3OHRA 3FE1A 4FYDA 1Z05A 1BG3A 3SMSA 1OH6A 3FZKA 2JWLA 2QKBA 4IEEA 4FLTA 4KI6A 2FXUA 2KFZA 1EQYA 3O8MA 4E7KA 3OVNA 1YJ9N 5J2QA 4DV2K 3C6TA 4X64K 4Y1DA 4DR7K 3VTIA 1JXBA 4B1UB 3D45A 5FPEA 5AFUH 4H5VA 3VQ7A 2YNIA 3O9SA 4W5NA 2ITGA 1Q9XA 2OPQA 2RE2A 4ELVA 2ITMA 1MWKA 5DK5A 3TPQA 1TK0A 3ALYA 4M3YA 4MLHA 1NGDA 3J81O 4KHQA 4JKFA 3BF3A 1N36K 4EAHD 2AJQA 1SQKA 4PUOA 5GAHP 2Q36A 1U47A 3UKUB 2HHSA 1KAZA 4JD2B 1MDUB 2Z1JA 5M1FA 2HHTA 1T6DA 1U6ZA 4B1WB 4IG0A 4JS5A 4Z4GA 1SAZA 3UB5A 5E26A 4KHUA 1BI4A 4FO0A 3SMPA 2QW9A 4KHSA 3WNEA 4E1NA 2FLOA 1YXQA 3QBXA 4JAXA 1NK5A 4AF1A 1REVA 1P8ZA 2QWOA 4IFYA 4FJ9A 5KRTA 2HSTA 3CCQN 5EY4A 3VA3A 3CERA 2F96A 3KHYA 3ASMA 3LWMA 4KRFA 3TSPA 2V7YA 5AZIB 3BEXA 3NF6A 2HVHA 5SZTA 4BRFA 3MX2A 4KH6A 4M41A 4C1NK 4ISFA 1VSEA 1XQSC 3VEVA 1U04A 4Z0UA 3LPTA 3NDKA 3HL8A 4RW7A 1VRUA 4BROA 5GIOA 3THYA 3AA5X 4BR0A 4B9LA 1W0HA 3NF9A 3QESA 3K5LA 1LCUA 3PX4A 2RHKA 2BDPA 3DWLA 5FDLA 1LW2A 4HCCA 2YHYA 2Q0UA 5M1OA 4BRPA 2YI1A 1NK9A 2QEXN 3KK3A 4OLBA 4OKEA 1QE1A 4R79A 3WQUA 1VSIA 1NJWA 3DLEA 4EP5A 4W5RA 3OJUA 4GV6A 5LJVA 2GUPA 4LH5A 3V4IA 1JCGA 3CMAN 3VQ8A 3THWA 4KREA 3B6OA 3Q7BA 1ZBLA 4FWSA 4V19S 4CHQA 3CJBA 2UUBK 3CCRN 3OYCA 4PKHA 2ATQA 3M5RA 3ULDA 3KTQA 4F2RA 3VQ4A 2A41A 1TV6A 4Z4IA 2OPRA 3D2FA 5KRSA 3KLEA 3I55N 4KH5A 1A5WA 2B6AA 4Z4HA 1RDDA 2UUCK 4CJ3A 4IKFA 3MX5A 3H6EA 3K0SA 1QSLA 3NGYA 4CJVA 3S3OA 2YJFA 1S1UA 3NF7A 1BI4B 3MK6A 4HHTA 2HHVA 1VSHA 4JKGA 3M3ZA 2F9TA 4IFEA 1IG9A 4YOYA 3IG1A 1O13A 2O8FB 2P9NB 4K25A 4XEIA 5CY4A 4BRCA 3DM2A 1XWLA 1K6YA 1JLEA 3AO5A 3DLKA 3S5TA 4BGBA 3CQ8A 3OBYA 1G15A 4FWKA 1CZAN 4DR4K 3CHWA 1NGAA 5AR0A 4CFBA 1S1XA 1C0MA 4CEEA 1JLAA 1J5EK 1TAUA 1OH5A 4FPAA 5GIPA 3O4NA 4DTPA 3IKMA 3THYB 4CFDA 4FLZA 2IAJA 2QWRA 3LAMA 3CFRA 5FPNA 4DU3A 1IO2A 3VGMA 4FZXC 2ETJA 5AQMA 3BGRA 3D7EO 3SLCA 4DR2K 1T3VA 2P9PA 1NK8A 4JRQA 4YNQA 1RTDA 4BRQA 3G4SN 2E5LK 2A1RA 4KKOA 3CM6A 3CC7N 4GY2B 3VETA 1D5AA 4F8RA 1TKTA 2YHAA 4JI4K 3ID6A 3CFPA 3TR8A 1O1WA 1WOQA 3F5TA 1S1WA 4FJKA 3KKSA 1ZBIA 3ZSQA 5FPDA 5BPMA 1YUWA 1L3VA 3M8PA 2VQEK 5AQJA 3ZT3A 3DRPA 2YKMA 3FLCO 3ZX0A 5FRNA 4B3TK 1VQ4N 5BRHA 3OYKA 3DLLL 3S41A 3VQ5A 5HL7L 3ZSYA 1YIJN 4LY7A 4MLEA 1JLQA 1JJ2M 3LDQA 4I2QA 2KTQA 3AY9A 3ZSRA 3AVHA 1FJGK 1K9MO 3MEDA 1A5VA 3GBTA 1QQCA 2D1KA 4CZFA 1FK9A 3WNFA 5JICA 4CJFA 3MCPA 1KLMA 1H1VA 3FZFA 3LP3A 3K59A 3M6GA 4FWNA 4GW6A 4F4KA 3RRGA 4DSIA 2DFFA 1RFQA 3G71N 4BR5A 4BC4A 3NCIA 5AQQA 5AQYA 1DT9A 3CG7A 1QVFM 4HUFA 4FW1A 3MCAB 4CJQA 3R8EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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