4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
1YVNA 3U9DA 3WT0A 4Z94A 1GLDG 5FPDA 5KPRA 1DGKN 3KZBA 5BRDA 2QWOA 4CZHA 4AM7A 2P9PB 2FSJA 2W41A 4DHYA 1TYQB 3CJAA 4IJAA 1NWKA 1P8ZA 5AQZA 3QICA 3MMVA 3JS6A 4BRGA 3O1WA 4BC3A 5LJVA 1U2VB 2QM1A 4F9OA 4CJ7A 3EKSA 5AQVA 3C0BA 2D0PA 4IJNA 4IWVA 1R59O 1BWFO 5AQOA 4BRDA 2Q97A 3IMXA 2ZWHA 4A62A 2YI1A 3TU5A 1HKGA 4B1XB 3VF4A 1TUYA 1NGHA 3MN6A 3RSEA 3M3ZA 1NGEA 2P9IA 2D0OA 4FL9A 4GY2B 4RTFD 1BO5O 1X3NA 3SMPA 4BRMA 1ZXOA 3WQUA 1RFQA 2E1ZA 3ZETB 4CZIA 4BQLA 5BRFA 2QWLA 3VEXA 1GLAG 3A5LC 4CZMA 5EX5A 1YUWA 4MLHA 5AFUA 1GLEG 3DXMA 5JLFA 1HPMA 5FPNA 3WXIA 2A3ZA 3FLCO 4H5WA 2Q0UA 2P9IB 2P9UB 2J4RA 3BF3A 3JXUA 3DJCA 3M1FA 3VEYA 3VENA 1XC3A 2I7NA 3GDQA 4FWPA 4BRLA 2GWKA 4K43A 1MA9B 5ADXA 1U6ZA 4B9QA 3MN7A 1ATSA 2CGKA 3ID8A 1QZ6A 3WEEB 3SMSA 3BF1A 4JN4A 4B1ZA 3A0IX 4BR2A 3MCPA 1NBWA 3VEWA 5F0XA 5AR0A 1NGCA 1ZC6A 3CQYA 3ATVA 2VCPA 3F9MA 4AM6A 1NGJA 5E26A 3HI0A 2BUPA 1KAXA 1S3XA 2P9SA 4H0YB 2HF4A 2QWMA 4BRKA 3D2FA 4BRNA 2CH6A 2E2NA 1HUXA 3ZX0A 5AFUH 3UKRB 3VETA 4EHTA 3FZFA 3C7NA 4JD2A 5AQFA 1NGDA 4IO8A 4XH4A 3LM2A 2IIRA 5E84A 3VF6A 4BGAA 2I7PA 2P9SB 1K8KA 3HSCA 3O6WA 5ADXH 3BP8A 4JHDB 5LY3A 4M7YA 3GBTA 4FPAA 4BC2A 4JD2B 3MN9A 1KXPA 3WXKA 2HOEA 1GLLO 3AARA 4BR9A 1K8KB 5EY4A 5JLHA 1NGFA 2WUSA 3H3NO 1NGIA 2P9PA 5BN8A 1TYQA 2E88A 1C0GA 3VESA 4LC9B 4FSVA 2ITMA 2A6AA 3R6MA 1QQNA 3CJ1A 3ULEB 3QDKA 1U2VA 3FZLA 4IXCA 1T6CA 1NLVA 3W0LA 3W3DA 2F9WA 1X9JA 2VWBA 5AZJB 3FZKA 5B8HA 4Y0WA 4BRFA 1MDUB 3WXLA 1BUPA 1JCFA 3CJ7A 3FZMA 4WQ4C 3MDQA 1DKGD 2F9TA 4NB4A 4PKHA 4CD1A 4E1JA 4PKGA 1KAZA 3VEVA 3O5BA 3M6GA 1BOTO 5EOYA 4BRQA 3BUZB 3KHYA 1JCEA 2YHYA 2UYTA 3FGUA 2FXUA 3IFRA 3L6QA 4K25A 5JMVA 4CZFA 4H0XB 5AQMA 3ZETA 1D4XA 3VGKA 5ELZA 4BROA 3SLCA 4WQ4A 3GOIA 2P9LB 5BPLA 1NGAA 5KPTA 3FR0A 3DXKB 2HMPA 4WYBA 1NMDA 2P9UA 4M63C 5AQNA 1YXQA 3J8AA 2V7YA 2ASPA 5BPMA 4CI6A 5AQKA 1BU6O 3EZWA 1G99A 4JAXA 3GG4A 3U4LA 1RDWX 1HKBA 1NGGA 3IUCA 1DEJA 3WEEA 1LOTB 4A61A 3H45C 3DAWA 2GUPA 4MO4A 3QBXA 2CH5A 4H5RA 1ATNA 3DWLA 3EL2A 2P9KB 3ENHA 2D4WA 3L4IA 3ATUA 3ZEUB 4CZKA 2YHXA 4XH1A 5AQHA 3CJCA 3R9PA 1E4GT 2Q31A 3SK3A 3LDOA 3UKRA 3FFKB 3LDQA 4DCHA 5AZIB 4PKIA 5AQXA 3HZ6A 2Q0RA 2IVOA 3H6EA 4EHUA 4L3QA 3I33A 3VOVA 2EWSA 3UKUB 5BRHA 2FSKA 3A5MC 5EXWA 5FPEA 4FWOA 5AQGA 4CD3A 1NGBA 2D1KA 3P4IA 1SZ2A 1Y64A 2FF6A 2P9NB 4JHDA 4FWQA 5AQSA 2ZGZA 3GL1A 5AQWA 1NM1A 4RWTA 5CE3A 3MK6A 3TPQA 4FOIA 1WUAA 2PBDA 2YHWA 3AAQA 3VPZA 3R8EA 4FWLA 4KBOA 3ENOA 2DPNA 5BPNA 2QWQA 3HM8A 4FWMA 5TKYA 4EAHD 4FWRA 3H1VX 1IJJA 4BQZA 4CBXA 4H0TB 3H3OB 4WQ5A 3CJBA 3IDHA 3ZX3A 4H0OA 3UE5A 2CGLA 3WQTA 4H0VB 1OKJA 3A5OC 4DQ8A 3QBWA 4J8FA 1GLFO 3ULEA 5BR9A 1E4FT 2NLXA 5AZJA 4IZ9A 4B1WB 3EKUA 1Z6RA 4O5FA 3QMLA 2Q36A 3O8MA 1H1VA 2VYPA 5F2RA 2IVPA 5AQLA 4BR5A 1V4TA 1EQYA 4I6MA 3A8YA 4BVOA 2A41A 3WUHA 1YAGA 3MN5A 3O4WA 5AQTA 3OHRA 3VEOA 4MLEA 5KPZA 4BC5A 5BN9A 2E1YA 3G25A 2QWRA 2E8AA 4CBUA 4GNIA 4BREA 2FSNA 1Z05A 2P9LA 4H5VA 3VERA 4JNEA 4M7XA 4HTLA 3DXKA 4B1VA 1QZ5A 5AQUA 2E20A 2QWNA 4I6MB 3O1BA 5EVZA 2E2PA 4CZEA 4NO7A 4FOEA 4BRAA 4FO0A 2A5XA 1BDGA 2Q2RA 3ZX2A 3CQXA 5KQDA 5KQ8A 1TUUA 3I8BA 4RCHA 1QQOA 2KHOA 2W40A 3O80A 3FZHA 3U8XA 2A40A 4K41A 1X3MA 4CZJA 2H3GX 2NRHA 4FWSA 2ASOA 2PAVA 2V52B 3A5NC 3VGMA 2P9KA 3CERA 3ZEUA 1HKCA 4XH5A 3VF2A 4BR7A 1BA0A 1HLUA 3KVGA 2A42A 3LM9A 2NZTA 4FWKA 4EIAA 1GLCG 1JCGA 2Q1NA 3VEZA 3S41A 5AZIA 1C0FA 1GLBG 3U9ZA 4EFHA 3H46O 4PL7A 4CZGA 2E2OA 4ISFA 3UKUA 4CBWA 4B1UB 1IG8A 2IVNA 2V51B 2ZF5O 2CGJA 3FE1A 3GE1A 3D7EO 2ASMA 2P9NA 3CETA 4MO5A 4ISEA 1RGIA 2FF3B 3RSEB 3D2EA 2FLOA 1ZBSA 4BRPA 4C23A 3CIPA 1MWMA 3QFPA 2V7ZA 3HTVA 1WOQA 4BGBA 1MWKA 5F1XA 1BG3A 4H0PA 3AAPA 1T44A 3BEXA 2ZGYA 4PL8A 3EN9A 1SAZA 2E2QA 3LL3A 3DXMB 3QFUA 4WQ5C 4BR4A 4FWNA 1HJOA 2QW9A 4QS7A 5I9EB 3D2EB 4CZLA 3CI5A 3O08A 5BREA 3EO3A 1HX1A 2YJFA 4XEIA 4BG8A 4YDUC 5AQIA 1S22A 4BVPA 2GEMA 1CZAN 2QXLA 1T6DA 3B8AX 2GTDA 4QS9A 3QB0A 4A2BA 2GELA 1Q18A 5FPMA 1GLJO 5LJWA 1BA1A 2AA4A 4BG9A 3CJ9A 1ESVA 4YDUA 4BRCA 4QS8A 4BRHA 3CHWA 2HF3A 5AQPA 2BTFA 4DB3A 4FPBA 3D2FB 3UB5A 4K42A 3WXJA 5AQYA 2GWJA 5JICA 3C7NB 4A2AA 1QQMA 4B1YB 1SQKA 1XUPO 2QWPA 4H5TA 3SJHA 4BR0A 4ISGA 1V4SA 3L0QA 4H5NA 3HBTA 4O8KA 4BC4A 3LDPA 5AQJA 4H03B 1J6ZA 2YCHA 1ATRA 5AQQA 3LDLA 1LCUA 1XQSC 3VGLA 3H1QA 1KAYA 3LDNA 3AY9A 2YJEA 2AP1A 2OANA 4BRIA 5AQRA 1QHAA 4HWIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U9DA 2G8VA 4OVLA 3ZSWA 4CJ3A 4DQQA 1VSIA 4AHUA 3PSIA 1DGKN 2QKKA 1HYVA 2DFFA 4AM7A 1BCOA 2BGGA 2W41A 4IBNA 1NK9A 5AQZA 1S6QA 3JS6A 1NK7A 3LDSA 1GOCA 4BC3A 5AQVA 4IJNA 3QEPA 1R59O 1JL2A 3VQ6A 3P1GA 1BWFO 1VQ7N 4GV6A 4LH4A 5AQOA 4G9ZA 3QETA 1RDCA 2Q97A 4CF8A 4FM0A 2YI1A 4B9VA 3LALA 4B1XB 3V9XA 4JKDA 4X64K 3L2VA 2D0OA 3SPZA 2OPPA 4KTWA 4JYAK 3EE8A 2OYQA 1X3NA 4BRMA 4KH4A 3G4SN 1VAZA 3ZETB 4DFKA 2PYJA 4DWIA 4W5OA 5DMRA 5AFUA 1SL0A 3ZSOA 3WNGA 1D8YA 5K14A 1J5OA 2YV0X 4B3SK 4H5WA 3KJVA 4EZ6A 5BR8K 2G8WA 2P9UB 4DR4K 3M1FA 3VEYA 4DS4A 3JYTA 2UXDK 1JKHA 2I7NA 3QEVA 4E1NA 1NOZA 4BRLA 4RW7A 5JVHL 1HYSA 1MA9B 3CMAN 1U6ZA 3MN7A 1WN7A 1NK4A 4CHZA 2OTJN 2RF2A 4FJHA 4CEEA 4U67L 4CF1A 3QEIA 3TAEA 3B6PA 1NGCA 4CEQA 3F9MA 3E1YA 5E26A 4DUZK 3U6FA 3ALYA 1S3XA 2HF4A 2QWMA 3AO2A 1CXUA 2DY4A 1IKXA 3D2FA 2YKMA 1WAJA 2CH6A 4BRNA 1RBUA 1HUXA 1Q86O 3UKRB 2O8FB 3EZ5A 2WFBA 4JD2A 1A5XA 4M3RA 3HT3A 5JS2A 2GBZA 5C12A 1WLJA 3CXCM 1K8KA 3MX2A 1LAWA 2UU9K 1Z26A 3BP8A 4JHDB 4IOCL 2KFNA 4JLHA 4M7YA 3AVMA 1RBVA 4R5PA 1WNSA 2D5RA 3WXKA 2A1SA 4KHUA 3E01A 4IEEA 1J9AA 1C1BA 1NJZA 3VQQA 3LANA 5DK5A 2VG6A 2WUSA 3OYBA 1KC8O 3A2FA 1NMNA 3CPEA 3E9PA 1VSEA 3VESA 4ELTA 4LC9B 4FSVA 3RMDA 1BIUA 2ITMA 4FK0A 3R6MA 3NDKA 1QQNA 4KAZA 3QDKA 1LW0A 1T3VA 4BDZA 2Z1IA 4JI0K 4JKGB 4HCBA 5AZJB 1NK0A 4O44A 5J2QA 3FZKA 2X74A 4Y0WA 4BRFA 4DLEA 2VQEK 1BUPA 1JCFA 1JLEA 4KHSA 1R0AA 2HHSA 2G8HA 2F9TA 1JXEA 4JI8K 3AV9A 3RMBA 2ZQBA 4ZTJA 2UYTA 1NJWA 4W5NA 2FXUA 3P39A 3IFRA 3TAMA 3CCUN 5JMVA 4H0XB 3SBGA 4C8LA 1T05A 1HNXK 1D4XA 2IDOA 4AQYK 3AGKA 3OJUA 5KPTA 1HQEA 2R7YA 3FR0A 3DXKB 4W5QA 4M63C 5AQNA 4V19S 1ZBIA 2B6AA 3J8AA 2V7YA 3CC4N 2OTLN 5BPMA 4CECA 3AVHA 1BU6O 2W00A 3EZWA 4CFCA 4JAXA 3T1HK 3OYKA 4FJ7A 4CJWA 1XMQK 1RDWX 1NGGA 3IUCA 1DEJA 4CJ4A 1J5EK 5I3UA 4E72A 3J7AP 1WBBA 3DAWA 3G0ZA 4YOXA 4CIFA 3DLRA 3QESA 3J7YP 3ENHA 3L4IA 1UWBA 1VQ4N 4DTOA 3ATUA 3ZEUB 3PIOL 3QEXA 1JLFA 3SNNA 3R9PA 4CFDA 4OX9K 3LDOA 1BCMA 3BZKA 4DCHA 3SQ2A 3VMFB 5C0YA 4M3XA 3KK1A 4L3QA 1YJ9N 4JK8A 3ZT2A 1S72N 2EWSA 3LWMA 3L3UA 3G10A 4FWOA 4CD3A 4Z4FA 3O3HA 3KKRA 1NGBA 2D1KA 3P4IA 1QSLA 3CCLN 3ENBA 1NJYA 1NKBA 4FWQA 5AQSA 3THVA 3GL1A 5AQWA 4RWTA 3MXIA 3LP2A 3AAQA 1Q82O 4M45A 2HHUA 1ZBFA 4FJ5A 1F21A 2F8SA 3NGZA 1EP4A 3THWB 2DPNA 4DV4K 3V9ZA 3HM8A 4FWMA 5KGXA 3H1VX 1RBSA 1IJJA 1CZBA 4B3OA 4RW9A 3AVJA 4WQ5A 3I56N 3SI6A 1KCFA 3WQTA 3D45A 3HOSA 3IG1A 3QBWA 4DV7K 4PY5A 4E19A 4JV5K 1RDAA 4CJSA 3CYGA 3WXMB 4B1WB 3AGRA 3T3FA 2Q36A 3VQBA 4DFMA 2IVPA 4ILHA 1YJWN 3SBTA 1G15A 3A8YA 1SL2A 3WNFA 3ZT4A 4KRFA 5M1PA 1CXQA 3AVLA 2VWJA 3QERA 4KH6A 3G25A 4BREA 1VSJA 1Z05A 2JLEA 4KTQA 3R3LA 4M7XA 4CJTA 1VSDA 1W0HA 4FM2A 1C0TA 4XJXA 3HL8A 5EVZA 3ZSVA 4FK2A 3CPWM 3JAMO 1RT6A 4DR7K 4FOEA 4BRAA 4I9LA 4I2QA 2A5XA 2B5JA 3IRXA 4CFAA 1JLBA 1TUUA 2VGNA 1N36K 1QQOA 1REVA 2NUBA 2A40A 3QNOA 2OZMA 3DLHA 2O4GA 4CZJA 4C8NA 4C1NK 1VQ6N 2P9KA 1SUQA 2W42A 1ZBHA 4FVUA 4EIAA 4FZXC 1GLCG 3CD6N 2D0BA 3VEZA 3SJJA 3HPGA 3HYFA 1C0FA 3U9ZA 1VQON 3H46O 4DS5A 3OBYA 2E2OA 2HBMA 3HPOA 4LF8K 3ISNC 3UKUA 1S1VA 4JRQA 1VQMN 4B1UB 1O1WA 2IVNA 3I0SA 2HMIA 1MU2A 3GE1A 3FE1A 4EP5A 3D7EO 3MEGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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