4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
3VEVA 1HKBA 3HTVA 3UKRB 4B1ZA 2Q0RA 1U2VA 1V4SA 2IIRA 4DQ8A 4H0OA 5AQRA 2QWNA 3QDKA 2QWPA 4I6MA 3ZX3A 1MWKA 3H6EA 4H0YB 1YXQA 4XH4A 2E88A 4CZLA 5BR9A 4BRLA 2NRHA 3EZWA 1T44A 3ZX2A 3KZBA 3LDNA 4CZKA 4B1YB 2P9PA 5AQPA 3VPZA 3GE1A 3ZX0A 4K43A 2PAVA 4H5NA 4BRQA 3B8AX 5AZIA 2UYTA 3D2FA 3A8YA 3MN9A 4DHYA 2IVOA 4IJNA 3VF6A 3VERA 5F2RA 4CZIA 5BN8A 2CGKA 2FLOA 2YJFA 2E1YA 1Y64A 1K8KA 2ASMA 2BUPA 5AQJA 1HLUA 4EHUA 5AQVA 3C7NA 1Z6RA 5KQDA 3VOVA 2BTFA 4M7XA 1ZBSA 4EFHA 4C23A 2QWQA 1XC3A 3UKUA 4FPAA 4FWLA 3QB0A 4KBOA 4BRNA 3UE5A 3W3DA 3A0IX 2Q0UA 2QM1A 4H5WA 2E2QA 2ZGYA 1GLEG 1NGGA 4MLEA 4AM7A 3VESA 4BR2A 3QICA 4QS8A 3SJHA 3R6MA 4YDUC 4HTLA 4BG9A 2DPNA 1BA1A 3F9MA 3GL1A 4B1UB 2E8AA 5AQXA 3ZETB 3LM2A 3ENOA 4BR9A 4CJ7A 3I8BA 2WUSA 3LDPA 3SMSA 4A2BA 1IG8A 5B8HA 2P9LB 1MA9B 4B1VA 1R59O 1KAYA 1JCEA 3O80A 5AQYA 3H1QA 3A5MC 4BC3A 5BRFA 2A40A 3D7EO 3BUZB 3H46O 2FXUA 2GTDA 4B1XB 4JD2B 5E84A 4BRGA 2QXLA 5LY3A 4CZJA 4A61A 1NGFA 5EVZA 3TU5A 5FPMA 3VF2A 5F1XA 4PKGA 1G99A 3FLCO 1RGIA 1GLJO 3G25A 4BVOA 4RWTA 1ZC6A 3HSCA 3SMPA 3A5NC 2D4WA 2GELA 3BEXA 4CZGA 3QFPA 1X3MA 1NGBA 2P9NB 5AFUH 3MMVA 3J8AA 4BQLA 1TUYA 1GLBG 2NZTA 5AQZA 3HM8A 2ZWHA 5AQHA 1BG3A 3MN7A 4H5VA 4BQZA 1CZAN 2E2NA 3L6QA 1DGKN 1T6CA 4NB4A 1SAZA 2W40A 2ASPA 2QWRA 3I33A 5AQGA 4FPBA 3CETA 2FF3B 5AQUA 2Q31A 1QZ5A 2AP1A 3UKUB 4BR7A 2E2OA 5AQOA 3ZETA 4IXCA 3L4IA 4CZFA 3FZMA 4WYBA 1BU6O 2P9LA 4CBUA 2CH5A 3RSEA 5EXWA 2D0PA 4PKHA 4CD3A 4BRKA 3LDOA 2FSJA 4XEIA 4A62A 1KAXA 3M3ZA 4PL7A 4O5FA 1TYQB 4J8FA 1KXPA 4JD2A 4O8KA 4FWPA 3FE1A 5EX5A 4CBXA 3GOIA 1Z05A 1RFQA 3CJ9A 3M6GA 4DB3A 2A6AA 4GY2B 4ISEA 2QWOA 1NBWA 4Z94A 3M1FA 3FZLA 3WQTA 4FWMA 4EIAA 4CZHA 3WXJA 2P9NA 1BUPA 3JXUA 5JLHA 1HKGA 3U9ZA 2FSKA 4H5TA 3JS6A 5BPNA 1BA0A 4QS9A 4BC2A 1SZ2A 5AQSA 4YDUA 2CGJA 4CZEA 4FWKA 3FGUA 4XH1A 1J6ZA 5AQQA 3CIPA 2GUPA 4BGBA 2QW9A 5KPZA 2PBDA 4FOEA 1BWFO 1LOTB 1HKCA 3VGKA 5AQIA 3QBWA 2ASOA 1U6ZA 5AQMA 3IFRA 4Y0WA 3BF3A 3MN6A 1BOTO 2ZF5O 4GNIA 2YHYA 3OHRA 2YJEA 4BRMA 4BR5A 2I7PA 3ATVA 2QWMA 4IWVA 5FPEA 2IVNA 2CH6A 3CJ1A 3CQYA 3EO3A 1TYQA 3VENA 5ADXH 4BR0A 3MN5A 4RCHA 1XUPO 4H03B 3AARA 3MCPA 4H0XB 1QHAA 4QS7A 4BC4A 1NM1A 3FZHA 3H3NO 2I7NA 4CZMA 5FPNA 5F0XA 3LDLA 3CJ7A 3HI0A 2EWSA 2NLXA 3RSEB 4BRIA 3VEWA 4WQ4C 3BP8A 1QQOA 2VCPA 2VWBA 3U4LA 4FWNA 4FL9A 5LJWA 3R9PA 4FWRA 1BO5O 1NLVA 3BF1A 2Q97A 2Q36A 3ENHA 3ULEB 2Q1NA 4K42A 3KHYA 1NGHA 5KQ8A 2V52B 1YAGA 1TUUA 5KPRA 4L3QA 1T6DA 3LL3A 3VEZA 1P8ZA 1NWKA 4ISGA 4B1WB 3O6WA 4FWSA 3VF4A 3IDHA 4ISFA 5AQFA 4H0VB 2W41A 4EHTA 1X9JA 3MK6A 1NMDA 3EN9A 3QMLA 4DCHA 1GLAG 1NGDA 2P9KB 2HOEA 3C0BA 5ELZA 3IMXA 5AQTA 1QQNA 1Q18A 1HJOA 3WXIA 3DXMA 3ZEUA 1WOQA 4BRPA 3H1VX 1S22A 3H45C 3GDQA 2KHOA 4M7YA 3ATUA 2OANA 1JCGA 2E1ZA 3MDQA 1X3NA 1ATSA 3CHWA 3O08A 5BRDA 3O8MA 1MDUB 4PKIA 3WXLA 2YHXA 5JLFA 1IJJA 3FZKA 3R8EA 3U8XA 5BPMA 2FSNA 4AM6A 1YVNA 2GWJA 1ATNA 3W0LA 4BRCA 5AQLA 2V7YA 2Q2RA 3O1BA 2FF6A 4PL8A 3GBTA 2YCHA 3CERA 4JNEA 4HWIA 3CJCA 5JMVA 3AAPA 5FPDA 1C0FA 3ULEA 4BROA 4EAHD 1HX1A 3DAWA 3FFKB 1QQMA 2J4RA 4FO0A 3VGLA 4WQ5C 2V7ZA 5AQKA 3FR0A 2ZGZA 1ESVA 3TPQA 4CI6A 3VETA 3AY9A 3CI5A 1QZ6A 3A5OC 4A2AA 4B9QA 5I9EB 3QFUA 2QWLA 4CD1A 1C0GA 3EL2A 1E4GT 5JICA 2A5XA 4FWOA 2P9KA 2P9UB 2YI1A 3VGMA 4BRHA 4BVPA 4IJAA 4BRDA 5AFUA 4BR4A 1SQKA 1GLCG 2HF3A 1WUAA 3WEEB 1NGAA 2HMPA 2HF4A 3ID8A 4JHDB 4WQ4A 4CBWA 1GLFO 1MWMA 1RDWX 2ITMA 5EOYA 1HUXA 4JN4A 4MO4A 5BPLA 3EKUA 5E26A 3DXKB 4BRAA 2F9TA 3LM9A 4FWQA 3UB5A 3AAQA 2A42A 1KAZA 3EKSA 1JCFA 2A41A 4IO8A 2D0OA 1YUWA 3FZFA 5AQNA 1NGEA 2V51B 3WT0A 3O1WA 3HBTA 3O4WA 1V4TA 3DXMB 3IUCA 3ZEUB 4LC9B 4NO7A 3UKRA 1BDGA 4MO5A 3H3OB 4H0PA 4RTFD 1DEJA 1NGCA 1HPMA 1OKJA 5LJVA 3L0QA 2IVPA 3HZ6A 1D4XA 3WQUA 2P9SB 2H3GX 4FOIA 4BC5A 3D2EB 5AZJB 3VEYA 3P4IA 2E20A 1NGJA 5AQWA 4K41A 2P9IB 4JAXA 3WUHA 3VEOA 2P9UA 1DKGD 3CJBA 1S3XA 3CJAA 1E4FT 4BGAA 3SLCA 5TKYA 1U2VB 3A5LC 1EQYA 3WEEA 5CE3A 2VYPA 4JHDA 4I6MB 2A3ZA 2E2PA 2D1KA 3QBXA 3VEXA 3DXKA 4E1JA 3O5BA 4BRFA 5KPTA 3U9DA 1H1VA 1NGIA 2F9WA 2P9PB 1XQSC 4K25A 2AA4A 3SK3A 4IZ9A 4F9OA 2GWKA 3WXKA 1GLDG 4M63C 5AZIB 5AR0A 3D2FB 4WQ5A 5BREA 2CGLA 4XH5A 1ATRA 2YHWA 1ZXOA 5ADXA 4H5RA 1K8KB 2P9SA 5BN9A 5BRHA 3S41A 3KVGA 3DJCA 4FSVA 1LCUA 4BREA 3C7NB 4H0TB 3D2EA 5EY4A 5AZJA 2GEMA 3CQXA 3LDQA 3GG4A 4BG8A 1GLLO 4MLHA 2P9IA 3DWLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F2SA 2ITGA 3TWHA 1N34K 2RKIA 4NLCA 2NRWA 3AVJA 3Q7CA 3V1OA 5AQRA 4DS4A 3QDKA 3OYFA 1REVA 4C1NK 2BANA 2HVIA 3ZX3A 2G8WA 5J2QA 1IBLK 4CZLA 5BR9A 4BRLA 2OTLN 3BZKA 5C12A 3KZBA 4B1YB 1S1VA 2O8FB 1LAVA 3GE1A 1C1AA 1VSKA 3AO3A 4IEIA 3PUFA 2KKZA 3ITHA 3A8YA 2P1JA 3CFRA 2O8BB 4CGJA 1VQ4N 2FLOA 5CY4A 3PIOL 4CJEA 1KQSM 2BUPA 1HLUA 4YOVA 3C7NA 4KFBA 2BTFA 2FBXA 2VG6A 1UA0A 3IS9A 1TAUA 4EFHA 4MFBA 1XC3A 4OPJA 1QVFM 4N5SA 3QB0A 4DR3K 4E72A 2XHBA 3ZYYX 1RTHA 1C1BA 2YHAA 4O44A 3W3DA 4ICLA 1N6QA 2RE2A 2ZGYA 1NGGA 3VESA 3TAQA 1OH8A 4LF5K 1YTUA 2PYLA 2IGIA 1B9FA 3DLLL 1BISA 4YHHK 4O4GA 2DPNA 1RDBA 3C6AA 4OJRA 3F9MA 1YI2N 4IOCL 3ZETB 4LY7A 3I8BA 4CEEA 3SMSA 4ZHRA 5B8HA 3QERA 1E3MA 5M1FA 3LWLA 1MA9B 1VQ8N 2ZJPL 1R59O 1N5YA 4BE7B 1GOBA 3ULDA 4JRPA 4ZTJA 5J2PA 3H1QA 2HHIA 3P5JA 4BC3A 4CEAA 5BRFA 2Z1IA 5AJ3K 4KI4A 1BIZA 3OYLA 4FJ8A 3ZSOA 2FXUA 4B1XB 4JD2B 4BRGA 2C1IA 2F7TA 2QXLA 1HJRA 4JI5K 2QTDA 4LD0A 1IKXA 1RT7A 3TU5A 3VF2A 4B9UA 4B08A 1G99A 3PSIA 1RGIA 3V4IA 4BVOA 5J1EA 4CIEA 1ZC6A 4XJXA 4FJ7A 2XY6A 2D4WA 3BEXA 1HNIA 3QFPA 1NGBA 2HNDA 1TUYA 1KLNA 5DM6L 5C2DA 3HM8A 3LP0A 1VQKN 3B6OA 4BQZA 1CZAN 2W40A 3KLGA 2ASPA 4CHPA 3TSQA 5KGXA 1BHLA 4CJSA 4CJ3A 2Q31A 4C8NA 3UKUB 4CHNA 3U6FA 1XMQK 5AQOA 4IXCA 4CCHA 3OA9A 4C8OA 2P9LA 4CBUA 1IBKK 4C8KA 4BRKA 5I42A 4Z0UA 3P38A 1JXEA 4BE1A 4A62A 1SKSA 5GAHP 3MXMA 1TKTA 4WCEL 5EX5A 3NGYA 4E7IA 1Z05A 5GAGP 1RFQA 4FVUA 1VQ9N 1S9EA 2WOMA 4DSFA 1NBWA 1D8YA 4DFJA 4Z94A 1W7AA 1W0HA 2OCEA 3M1FA 2PFUA 3P31A 3WQTA 2PZSA 2G8VA 4EIAA 2IOCA 5JLHA 1HKGA 1MU2A 3KWGA 1EWRA 3JS6A 3S3MA 1BA0A 3ZSYA 5C2FA 4BC2A 4YOUA 4CFDA 3OYGA 2CGJA 4CZEA 4FWKA 3KK7A 3P39A 1ZBUA 4XH1A 5AQQA 3HVTA 3CIPA 2GUPA 5KPZA 5KTQA 4M42A 2E6LA 4K0KK 3MX5A 3HPHA 1HKCA 5AQIA 3QBWA 2ASOA 3IFRA 4Y0WA 3VQDA 1KTQA 1RBSA 3OYKA 1TGOA 4CJ4A 3H08A 2I7PA 2QWMA 3LP1A 4CHYA 3EO3A 1RILA 1RT2A 1NJXA 4HVJA 3AARA 4H0XB 3LDSA 4FJKA 2PY5A 3FZHA 4DTOA 2ETJA 4OPAA 3PO4A 3LDLA 3MXJA 2EWSA 1LWFA 2NLXA 3M5RA 4OKKA 3OYDA 4E7HA 3A2FA 3AVGA 3TAFA 4B9NA 4YOXA 4FLTA 3PY8A 2VCPA 4B3RK 3KKSA 3U4LA 4NCAA 4FWNA 4WFBL 3O3HA 5LJWA 3CXCM 3SUOA 3R9PA 5CHIA 1BI4A 4B9SA 4CF8A 3WNEA 2D0CA 2Q97A 4DUYK 2F8TA 1VQLN 4LSNA 3ENHA 2VGNA 3THXB 1WBBA 3KHYA 1YAGA 4CEQA 2YNHA 3O4QA 4B9MA 2JGUA 3VQAA 3O6WA 1U48A 1HNZK 1LAWA 4CEBA 4IDHA 1VQPN 4M3XA 5IWAK 2P9KB 3CM5A 5GINA 3RTVA 3ATUA 2E1ZA 3THVA 4XIUA 3SI6A 4JEPA 1ATSA 3CHWA 3O8MA 3WXLA 4AILC 2BE2A 1IJJA 4AF1A 5BPMA 1J53A 2GWJA 3O3GA 2Q2RA 4O5BA 3PSFA 4Z4HA 2HBJA 3CERA 4JNEA 4HWIA 3CJCA 1M1KO 1WSJA 4FJXA 3ULEA 2UXCK 2R7YA 4BROA 4JKHA 4KPYA 2UUAK 3LPUA 5JENA 1QQMA 4WQ5C 1UWBA 2ZGZA 3TPQA 1VQ6N 4RW9A 3VETA 3HSTB 3AY9A 4DF4A 1QZ6A 2KFZA 2QA4N 1IKVA 3MECA 4A2AA 4B9QA 4GMJB 5HOOA 1JL1A 3NBPA 1SKWA 4YFUA 3V9WA 4JRQA 3AVKA 1NK9A 2F4VK 3HXMA 2IC3A 1DTTA 2HBMA 2P9UB 3D0PA 5SZTA 3WNGA 1NOZA 4BRDA 5AFUA 4BDPA 1SQKA 4DSJA 1KLMA 3VMFB 2HMPA 3TAGA 4WQ4A 3U3YA 4K8XA 1FW6A 1HUXA 5BPLA 4B9VA 5E26A 1NU0A 4KAZA 2FBVA 3HL8A 4V19S 1KAZA 1JCFA 1ASVA 2YKNA 4IO8A 2Q3SA 3TSPA 3FZFA 2V51B 2JWKA 3DXMB 4E3SA 4DTJA 3NVKA 4MQ3A 4KTQA 3HK2A 1U04A 4RW4A 4M3WA 3V6DA 4CGFA 1D4XA 1HPZA 3WQUA 2HNZA 1WSFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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