4H0YB

Crystal structure of nad+-ia(e380s)-actin complex
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 127
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0yB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0yB03
3CJBA 1ZC6A 3SJHA 4O8KA 3FZLA 3U9DA 3UB5A 3A8YA 1SAZA 3H1QA 4IXCA 4BC4A 1E4FT 4O5FA 1ZXOA 3A5MC 3LDLA 4JHDA 3SMSA 2A3ZA 5BN8A 3DJCA 3FZMA 2FSKA 2HOEA 4E1JA 2A6AA 1ESVA 3QFPA 3LDNA 3MMVA 4IO8A 1HKGA 3RSEB 1NGHA 4KBOA 1MWMA 2FXUA 4L3QA 5AQVA 4BREA 3BP8A 3ENHA 2GELA 1BU6O 3IDHA 3VEYA 4JAXA 2F9WA 2GWJA 2D0PA 3HM8A 1HUXA 4FPBA 3O1BA 4RCHA 1KAZA 3MCPA 1JCGA 4BRMA 2YJFA 2QXLA 2Q0RA 5KQ8A 3R8EA 2V7ZA 4RTFD 1DEJA 4B1ZA 3WXKA 4K42A 1H1VA 1XQSC 3R9PA 5F1XA 2OANA 5AQPA 1YAGA 3CJ9A 3QDKA 4YDUC 5CE3A 3JXUA 2Q97A 1BWFO 2AP1A 1XC3A 2A42A 3ENOA 4GNIA 4HTLA 5F2RA 4B1YB 2I7PA 3GG4A 2Q2RA 2E2PA 3VGMA 5EVZA 1R59O 2P9IB 1P8ZA 5AQFA 4BRAA 3ZX3A 4CI6A 2P9KB 3VEVA 2DPNA 4H5VA 3I8BA 5AQQA 2QWRA 1JCEA 5KQDA 2IVNA 4H0PA 3IUCA 4MO4A 1QZ5A 5AR0A 3H46O 2AA4A 4A2BA 4IZ9A 3W0LA 4IJAA 1NBWA 3FE1A 5AQNA 2YI1A 5E84A 3SMPA 3O6WA 2E2OA 3BEXA 1KAYA 1U2VA 1DGKN 4HWIA 4LC9B 3WEEA 2W41A 1RGIA 4BR9A 3O5BA 1BO5O 3ZETB 4I6MA 3CI5A 2W40A 5E26A 2YJEA 3KVGA 3VGKA 3VERA 4A2AA 3FLCO 5BPLA 4QS8A 3W3DA 4CZEA 4FOIA 1D4XA 4JD2B 4B1XB 5AZJA 3A5NC 2NLXA 5AZIB 1SQKA 3D2EB 3JS6A 4CZJA 4EHTA 1HJOA 5BRHA 4FWOA 1RFQA 4H5RA 5EX5A 4M7XA 3LM9A 4ISEA 1NWKA 3IMXA 1S22A 1G99A 4FWKA 2HF4A 4WYBA 4K41A 5AFUH 3U9ZA 1BOTO 3ATUA 4FWNA 2YHXA 4A62A 4BRCA 3UKRA 5F0XA 2H3GX 4EIAA 1TUYA 2NZTA 4CZFA 1S3XA 5KPRA 3ID8A 3WXIA 2VCPA 4RWTA 3AAPA 5BPMA 2EWSA 2PBDA 4FWSA 2BTFA 1DKGD 4BVPA 3WUHA 4WQ5C 2P9LA 3A0IX 2PAVA 4FSVA 2ZWHA 3H45C 1C0GA 2FSJA 5AQGA 4BRKA 1HPMA 3ZX0A 3UKUA 1V4SA 4M63C 3ZEUA 3VGLA 2P9UA 2NRHA 1IG8A 1BUPA 1ATSA 2P9UB 4IWVA 4Y0WA 2E20A 4J8FA 3ZEUB 3UKUB 1TUUA 4IJNA 3HZ6A 3FR0A 4BR5A 1Y64A 1SZ2A 3LM2A 1NGAA 2IIRA 2P9LB 5AQHA 4BR7A 3QBWA 5BN9A 1GLJO 3A5OC 4EFHA 1GLFO 3WQUA 5EOYA 1HX1A 2I7NA 1NGCA 4H0YB 1QQMA 4JNEA 4K43A 4BQZA 3LDPA 3EKSA 1IJJA 4AM6A 4ISGA 3UKRB 5ADXH 5AQRA 1QZ6A 1T6CA 3R6MA 1NMDA 1MWKA 3ZX2A 4H5TA 4H5WA 4DB3A 3WXJA 2E2NA 4H03B 4FWRA 2FLOA 2ITMA 4H0OA 5JMVA 4PL8A 3A5LC 1X3NA 4CBWA 1Q18A 4CD3A 3D2EA 3HI0A 4FWMA 5AZIA 4A61A 1NM1A 5AZJB 3L6QA 4JD2A 3H3NO 4JN4A 2Q0UA 3IFRA 4DCHA 5BREA 4I6MB 2A5XA 2QWLA 4FL9A 3ZETA 4BVOA 3O1WA 2E2QA 2A40A 4H0TB 3UE5A 4F9OA 2QWOA 3LDQA 3WEEB 3GL1A 3TU5A 3VF4A 4DQ8A 1U2VB 5EY4A 1BDGA 3EKUA 3EL2A 3GOIA 2CGJA 1GLAG 2BUPA 4B1VA 3HTVA 4BROA 5AQSA 4EHUA 5AQJA 2CH6A 3CJAA 3DWLA 1NGIA 3KZBA 2QW9A 3L0QA 2P9KA 4DHYA 2ZGZA 1GLCG 2Q36A 3MN5A 4ISFA 5AQLA 1J6ZA 2P9IA 5AQUA 2J4RA 2VYPA 2IVOA 3CETA 5AFUA 5BRDA 4C23A 2E1YA 5AQMA 1ZBSA 4NB4A 3CJ1A 3D7EO 4CZGA 3G25A 3EZWA 1YXQA 5BR9A 2UYTA 4XEIA 2QM1A 3CJCA 3CQYA 4FPAA 3AAQA 1Z05A 4BC2A 4BRGA 5JICA 3F9MA 2Q1NA 5AQXA 3VF2A 4BGAA 5FPMA 1ATNA 1T6DA 3VOVA 4BRPA 3CERA 5KPTA 2E8AA 4MLHA 2CGLA 4Z94A 4CBXA 1E4GT 2Q31A 4BGBA 1XUPO 5I9EB 3QMLA 1JCFA 3RSEA 3GBTA 1BG3A 3DAWA 4BG9A 3H6EA 2CGKA 4JHDB 3MK6A 5FPDA 3TPQA 3GDQA 1U6ZA 3SLCA 5LY3A 1C0FA 1NGBA 1GLLO 4BR4A 1HKBA 3BF1A 4K25A 4MLEA 3FZKA 4FOEA 4FWLA 5BPNA 3EO3A 2QWQA 3VETA 2V7YA 1NGDA 3D2FB 4B9QA 2F9TA 4XH1A 3P4IA 4BRIA 2QWPA 1MDUB 2E88A 3FZFA 3U8XA 3MN9A 3VEOA 3H1VX 4B1UB 3HSCA 5AQOA 5AQWA 4BRLA 4QS9A 1TYQB 3B8AX 2YHWA 3I33A 2P9PA 1RDWX 5KPZA 4BR2A 5JLFA 4CD1A 5B8HA 2VWBA 1WOQA 4BC3A 4PKGA 3HBTA 4CZIA 2QWNA 2ZGYA 5AQZA 3DXKB 1X9JA 4WQ4C 4EAHD 2D0OA 3M3ZA 2E1ZA 5EXWA 3BUZB 2P9SB 1HLUA 2FF3B 5LJWA 2P9NB 3M1FA 3VESA 4CZKA 2HF3A 1YUWA 1QQOA 1NGJA 1KAXA 3GE1A 3L4IA 4CZLA 1T44A 3DXMB 3O4WA 2ASOA 2KHOA 3CQXA 4FO0A 4XH4A 3SK3A 2GWKA 1EQYA 3J8AA 4BRFA 2A41A 4CZMA 1GLBG 1HKCA 1BA1A 3ULEA 4BC5A 2GUPA 3QB0A 3U4LA 1BA0A 4BRNA 4PL7A 1X3MA 3CHWA 1KXPA 3VEZA 3WXLA 5ADXA 3O80A 1ATRA 3MN6A 1K8KA 1OKJA 4FWQA 4H0VB 1QQNA 4YDUA 4GY2B 5AQYA 1CZAN 3C7NA 1Z6RA 2WUSA 3C7NB 4XH5A 2GEMA 1MA9B 4CZHA 5TKYA 3WT0A 3VPZA 3O08A 1K8KB 5FPNA 2D1KA 4NO7A 2GTDA 1LCUA 4FWPA 4AM7A 4BR0A 2QWMA 3S41A 1NGFA 4CJ7A 4BRQA 1NLVA 3QFUA 1GLEG 3FZHA 3M6GA 4M7YA 4MO5A 3FFKB 5AQTA 3ULEB 1NGEA 4WQ4A 4QS7A 3QBXA 3C0BA 5FPEA 4PKHA 5BRFA 1YVNA 5LJVA 4BQLA 3DXMA 3H3OB 1LOTB 1WUAA 3CIPA 4PKIA 5AQKA 2P9NA 1QHAA 4CBUA 3AARA 1GLDG 2P9SA 4B1WB 3MN7A 3BF3A 2ASMA 4BRDA 3LL3A 3AY9A 3LDOA 3DXKA 5ELZA 3O8MA 4BG8A 4H5NA 3CJ7A 2HMPA 1NGGA 3WQTA 3KHYA 4WQ5A 2YHYA 4BRHA 2FF6A 3VENA 3QICA 2YCHA 2CH5A 3EN9A 2D4WA 2FSNA 2V51B 1V4TA 2V52B 2P9PB 3VEXA 3VEWA 3VF6A 4H0XB 1TYQA 3OHRA 2ZF5O 2ASPA 3ATVA 3FGUA 2IVPA 3MDQA 5AQIA 5JLHA 3D2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S1TA 1TV6A 4FLZA 3UB5A 2QA4N 1SAZA 1TAQA 4O5FA 3PV8A 1T03A 2G8IA 3CG7A 4ELTA 3K2PA 3SMSA 1WSJA 1X9SA 3ZT3A 5BR8K 4OJRA 1VQ6N 2A6AA 4BACA 1HKGA 1I39A 1N8RO 1LAVA 2IDOA 3IDHA 3R1XA 1NU0A 3PIOL 1S6PA 1IBKK 3O9SA 4B3RK 2Q0RA 3R8EA 4H4OA 2V7ZA 1W0HA 2RE2A 4DV1K 1H1VA 1XI1A 4GVEA 5F1XA 1UWBA 1RBTA 1I3AA 3QDKA 3E1YA 4YDUC 3CF5L 4E0DA 3C6HA 3JXUA 4MDBA 1XC3A 4GNIA 1JJ2M 1WNSA 4FW2A 4B1YB 3VQEA 4NCGA 2Q2RA 4N56A 2P9KB 3VEVA 2I5JA 1QVFM 2QWRA 1JCEA 3ISNC 4H0PA 4MO4A 4JI3K 3EY1A 2RKIA 1JLFA 1BQMA 4B8CA 3ZLJA 1KAYA 3TI0A 4CEBA 2QK9A 4M3TA 2NRVA 4BR9A 2W42A 3O5BA 5FRMA 1IO2A 4EP5A 1EKEA 5E26A 1VQ9N 3OYEA 3OYHA 3FLCO 1RBRA 3CM6A 1EX4A 5AZJA 3A5NC 3U3GA 5AZIB 3D2EB 1DT9A 4CZJA 4CJTA 1HJOA 3PLAA 5EX5A 3LM9A 3QEXA 1NWKA 1RBSA 3WNEA 4FWKA 3U9ZA 2O8CA 3ATUA 3ID6A 2YHXA 4LFBK 1S1UA 4CJQA 5C12A 1NJXA 1J54A 3J7AP 3IAYA 4B9NA 1TUYA 4FCYA 1C6VA 3VQAA 3TAMA 2DTUA 4O55A 4RWTA 1C0TA 3ZT0A 3O3HA 1RDUA 1M1KO 3UIQA 1WSIA 2X74A 2P9LA 2PAVA 3TAGA 5JS1A 2ZWHA 3H45C 1S72N 1TK5A 1KSPA 1HPMA 4CJ4A 4DTPA 3UKUA 1V4SA 1FXXA 2G8FA 4Q0BA 1CXQA 2P9UA 3QESA 1IG8A 1WSFA 1ATSA 1YF5L 4Y0WA 3SAFA 4CK2A 2KLAA 3G71N 3DLLL 3CFOA 3AVGA 2UU9K 4RG8A 1SZ2A 4CHNA 3LM2A 4IFEA 5KRSA 2DFHA 3AVKA 3QBWA 4IDHA 1GLJO 5BN9A 5J2MA 1GLFO 2HHTA 1U04A 3LAKA 1VQKN 5EOYA 1VQPN 4JNEA 4BQZA 3C95A 2F4VK 3HT3A 4JI4K 2PYJA 3CD6N 2ZQBA 3MXMA 2HBMA 2KW4A 3NF6A 4CF9A 1EXQA 3V1RA 3R6MA 3ZX2A 4H5WA 4DB3A 4DTRA 3ALYA 5M1QA 1JKHA 5JMVA 4PL8A 4DS4A 5J2QA 4DR2K 5LL6Z 4KB0A 4JD2A 2FBYA 2O8DB 2Q0UA 4BWMA 2P1JA 4OX9K 5BREA 2HHIA 2QWLA 4KHSA 2NRXA 5M1NA 4FJNA 3UE5A 4F9OA 1W2BM 3HSTB 1KTQA 4RW8A 3TTCA 4BDYA 4MFBA 4KH5A 2OPQA 1HPZA 2OCEA 1WB9A 4DQQA 3GOIA 4WFAL 4CFDA 1C0MA 3HTVA 2DFFA 4KH6A 4PA1A 2XHBA 4F3TA 2CH6A 4KTQA 3DLGA 5LMNK 4IO9L 3O9UA 4ISFA 1U47A 1QVGM 2J4RA 3CETA 1NOYA 3HYFA 3F9KA 4E7IA 3THWA 1Y97A 1YXQA 5FLXO 5CY4A 4C8OA 4XEIA 1KVBA 1RCHA 3CQYA 3AAQA 4CJWA 1RT2A 1YHQN 5GAHP 4DFJA 5AQXA 1YTUA 1YJNN 4FLUA 4JK9A 5KPTA 4OKEA 4MLHA 1K73O 4Z94A 4HTUA 2RN2A 4CBXA 1D9FA 4ID5A 4BGBA 1S5JA 4W5QA 5HROA 1ZBFA 3CMEN 2Z1HA 4BG9A 2PYLA 4DFMA 3TPQA 3GDQA 2UXCK 5LY3A 1JXEA 3G4SN 4MLEA 4CGIA 1NK9A 2PY5A 3EO3A 1NJZA 3D2FB 4JI7K 2FBTA 1OH7A 2QWPA 1MDUB 1SV5A 3OBWA 4CJRA 2ZJPL 1RTJA 3BGRA 5HRSA 1LAWA 3HJFA 2YHWA 3I33A 1ASWA 1KCFA 4CEZA 4BR2A 5JLFA 3VQ5A 2HNDA 1WOQA 4BC3A 4DR5K 2O8BB 2X78A 2QI2A 1XWLA 1KC8O 3Q7BA 1VAZA 2GX9A 5GINA 4A59A 1ZBUA 2YNGA 4WQ4C 5GAEP 4YOUA 4DV3K 4DTJA 4JS4A 1BI4A 3THXA 5C2FA 3BDPA 3RRGA 5LJWA 3VESA 4CZKA 1WSHA 2HF3A 1YUWA 1QQOA 3S3OA 3GE1A 2O8FB 3DRPA 2C1IA 1XHXA 4F2SA 4IEEA 2KHOA 3AVJA 4CECA 3NH1A 1IBLK 4FM1A 5HRNA 3C6AA 3J8AA 4BDZA 1QHTA 4LF5K 2NRWA 2KKZA 1HKCA 1BA1A 1BIUA 3QB0A 1BA0A 4C8KA 2X6NA 1KXPA 3IKMA 3T1AA 4X62K 2UUBK 3AVHA 4CGGA 4FWQA 1CZBA 4GY2B 1BCMA 5AQYA 3KLHA 2QKBA 1ZYQA 4YORA 3BZCA 4CEQA 2GEMA 5TKYA 1K8KB 2X6SA 5DMRA 4DTOA 3K57A 3QFUA 1GLEG 3HO1A 4DKWA 3KLEA 1F21A 5AQTA 5M1KA 1JLAA 3ULEB 2G8HA 5JS2A 3C0BA 5FPEA 1S6QA 5JENA 3G10A 4BQLA 3ZSOA 3H3OB 3CIPA 3VQDA 5DM7L 2P9NA 1GLDG 3ZT2A 5JVGL 2KTQA 4ID1A 3THXB 3SCXA 4J2BA 3MX5A 2O8EB 2Z1JA 3LDOA 4Y1DA 3O8MA 1NGGA 1TKTA 4E7LA 2FF6A 2O4IA 3QICA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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