1V4TA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
447
structure length
424
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords glucokinase isoform 2
publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 130
structure length 424
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4tA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4tA01
4K43A 1XC3A 2D0OA 2Q0RA 2W41A 4H0TB 1TYQA 4WQ5A 1S3XA 3HSCA 1TYQB 3UE5A 3O08A 4BR4A 4LC9B 3BEXA 1KXPA 2CGJA 4CZLA 4AM7A 1ZBSA 4IJNA 4C23A 4RTFD 4A2BA 3QBXA 3IFRA 2ASOA 2GUPA 4H0YB 2Q31A 2D4WA 5AQGA 2QW9A 4BVPA 5FPEA 5AQKA 5ADXH 1JCEA 2I7NA 4BRLA 4JHDB 5BN9A 4FL9A 4BROA 3I33A 3L4IA 2HF3A 3GOIA 3WXJA 1BOTO 1S22A 3ATVA 1J6ZA 1QQOA 1HUXA 2A5XA 3VETA 3FZKA 5AQOA 2D1KA 5BR9A 2CGKA 3UKUA 3UKUB 1Y64A 4ISEA 4I6MA 5AQUA 4I6MB 5AQJA 4BVOA 3MMVA 3R8EA 1YXQA 3MN7A 2D0PA 3U8XA 5JLHA 2FSNA 4HTLA 4BGBA 2GWKA 3HTVA 3HZ6A 4K42A 3MN5A 5AQYA 3U4LA 3CERA 5BPLA 4H5VA 1ZXOA 3CJAA 3MN6A 5LY3A 3AAQA 5BPMA 2HMPA 1V4TA 5ADXA 3L0QA 2AA4A 2ZGYA 3M6GA 1NGCA 4WQ4A 3VPZA 5AQLA 1NM1A 3GBTA 4MLEA 1X3NA 1JCGA 4BRNA 4BRCA 1QQMA 1QQNA 1KAZA 3FZLA 2EWSA 5EX5A 4PL8A 4JD2A 4EFHA 2P9LB 4JD2B 4B1XB 3CHWA 4BRGA 4BC5A 5BN8A 2BUPA 2ZGZA 3W3DA 3GL1A 3KVGA 5FPDA 2VWBA 3RSEA 4BRDA 3RSEB 1SQKA 3DJCA 1MWMA 2YCHA 4BR7A 5CE3A 4BR9A 4FWNA 3O5BA 5BRHA 1RFQA 3H1VX 4KBOA 1NGDA 1R59O 1C0GA 3WXIA 2YJEA 3H46O 2I7PA 4FSVA 3KZBA 4B1ZA 3QFPA 1HPMA 1Q18A 2E8AA 3C7NA 2YHWA 1NGGA 1GLJO 5FPMA 3C7NB 3M3ZA 3VEYA 2E2PA 2GEMA 5AQVA 1NGBA 1SZ2A 1YUWA 3ENOA 5AQNA 2QWMA 4XEIA 3EO3A 3HI0A 1NGJA 5AQSA 2V52B 3IUCA 3A8YA 2ZF5O 3MN9A 5BRDA 4A61A 3ENHA 2A42A 4H0PA 1NBWA 1SAZA 3CI5A 1IG8A 3VESA 3M1FA 5KPRA 3QDKA 1V4SA 2GWJA 1KAYA 2A3ZA 4FPAA 3FE1A 4HWIA 3FR0A 2NLXA 1NMDA 3B8AX 4CZKA 5BPNA 1NWKA 3QICA 4JHDA 3TU5A 3IMXA 4BRPA 3ULEA 2Q0UA 3ULEB 4BG8A 4CBUA 3VEVA 3A5LC 4B1WB 5KQDA 3UKRA 4BGAA 4Y0WA 3DXMA 3UKRB 2FSJA 3DXMB 2FSKA 2HOEA 4O8KA 3VERA 1ATRA 2GTDA 3AY9A 3VEXA 3O1BA 3H3OB 4FWMA 3VGMA 1JCFA 3EZWA 4WYBA 3W0LA 2E88A 1MA9B 5AQRA 2V51B 3FZMA 2NZTA 3HM8A 3CQXA 1C0FA 4BR0A 1LCUA 4H0VB 5EOYA 1NLVA 3A5MC 3ZEUA 4BRMA 5KQ8A 2Q36A 3ZEUB 3KHYA 3H1QA 3ID8A 5F0XA 1GLLO 3TPQA 3BF3A 1YAGA 1BG3A 1OKJA 4FWPA 4F9OA 5KPTA 3FZHA 3VOVA 3AAPA 2AP1A 1K8KA 1HKBA 1K8KB 4GY2B 2ASMA 4CI6A 3O1WA 4JNEA 3EKUA 3LDPA 2F9WA 2QWQA 4A2AA 5JLFA 1HKGA 2A41A 3GDQA 4M7YA 4BRFA 2QWOA 5LJWA 1RGIA 2E2NA 4QS9A 2YHYA 3G25A 1GLBG 5LJVA 3CJ9A 4FWQA 4IXCA 4CZMA 2QXLA 4PKIA 3FLCO 1ZC6A 2FF3B 2E1YA 3MDQA 3WT0A 4H0OA 2E2QA 2Q97A 4CD3A 2F9TA 3AARA 2E1ZA 1ESVA 3O4WA 4CZJA 1KAXA 1EQYA 5AQZA 4BQLA 3IDHA 3WQTA 2P9LA 4H03B 4CZGA 4IWVA 4RCHA 4YDUC 4QS7A 2PBDA 3VGLA 2P9SB 3VF4A 5EVZA 4CBXA 1RDWX 1IJJA 3MK6A 3VGKA 3GE1A 4L3QA 2CH5A 4EIAA 4DCHA 2HF4A 4GNIA 3VEOA 1U2VA 3UB5A 1U2VB 5AFUH 4DHYA 4EHUA 3SLCA 5AQTA 4K41A 1NGFA 3D2EB 5KPZA 2P9IA 2CH6A 2J4RA 2P9IB 3CJBA 4CZEA 4BG9A 3DAWA 2VCPA 1BO5O 1X9JA 1G99A 4BR2A 1GLCG 1E4GT 3CETA 3EL2A 2E2OA 4MO5A 3WQUA 4PL7A 2V7YA 3O8MA 3CQYA 3VEZA 4QS8A 5JMVA 3SK3A 4BQZA 4FWLA 1ATNA 2QWRA 1QZ6A 1GLDG 3JXUA 5AQMA 1DKGD 2Q1NA 3QMLA 2ASPA 5E84A 5AZIB 2V7ZA 2QM1A 3EKSA 3ZX2A 2H3GX 1NGIA 4O5FA 4XH4A 3F9MA 3VEWA 4FWSA 1QHAA 3ZETB 2BTFA 3LDNA 1GLEG 1BU6O 4H0XB 2QWPA 2P9UA 3FGUA 1HJOA 2P9UB 4PKGA 5B8HA 3WXLA 1HLUA 5AFUA 2WUSA 4JAXA 3CJ7A 1NGEA 5AQXA 3QB0A 4WQ5C 2FF6A 3BF1A 4CZHA 4CBWA 4H5RA 1NGHA 4ISGA 2NRHA 4DB3A 3L6QA 1MDUB 3DXKA 2IVPA 3CIPA 4MLHA 3DXKB 2UYTA 2FXUA 4B1VA 3H3NO 4M7XA 1E4FT 5EXWA 4BRKA 1XQSC 1ATSA 1GLAG 3R6MA 3R9PA 4FOEA 1Z05A 3O80A 2QWLA 5AQWA 3WEEA 4B9QA 1D4XA 2A40A 3WEEB 4BC4A 3BUZB 4PKHA 4A62A 3VENA 2IVNA 3LDOA 4RWTA 4FWOA 1T44A 1DGKN 1MWKA 2IVOA 4XH5A 4EAHD 3GG4A 3LDQA 1BA1A 5AZJA 2E20A 5AZJB 1Z6RA 3H6EA 4BR5A 5BREA 5FPNA 1T6DA 1TUYA 4FO0A 4B1UB 4IJAA 3U9ZA 2W40A 4CZFA 5I9EB 2ZWHA 4J8FA 4AM6A 5E26A 1BUPA 5JICA 3ZX3A 3QBWA 2VYPA 2P9NA 1WUAA 2P9NB 3H45C 3A5NC 2CGLA 4EHTA 2P9KA 4CZIA 4E1JA 3FZFA 2P9KB 2FLOA 3HBTA 4YDUA 4NB4A 1NGAA 2ITMA 4BRQA 4CJ7A 2IIRA 4XH1A 4BRIA 3WUHA 4BRHA 3LL3A 1HKCA 5BRFA 1WOQA 1GLFO 1TUUA 3D2FA 3D2FB 3D7EO 2P9SA 2Q2RA 2GELA 1YVNA 4FOIA 2YHXA 4IZ9A 1BWFO 5AQPA 2P9PA 2P9PB 5AQQA 3SJHA 1P8ZA 3QFUA 4IO8A 3LM9A 4WQ4C 4K25A 3I8BA 1BDGA 3D2EA 1DEJA 4JN4A 2YJFA 3SMSA 1X3MA 3P4IA 3VF2A 4H5NA 5ELZA 5AQFA 3VF6A 2OANA 3U9DA 4H5TA 1H1VA 3J8AA 3CJCA 4FWKA 3OHRA 4CD1A 5TKYA 4FWRA 2PAVA 3ATUA 3DWLA 4B1YB 5EY4A 3A5OC 1HX1A 4FPBA 5F1XA 1BA0A 4ISFA 4Z94A 4H5WA 5AR0A 5F2RA 5AQIA 3FFKB 4NO7A 3ZX0A 4BC3A 3ZETA 3LDLA 1CZAN 3JS6A 5AZIA 3BP8A 2QWNA 4BREA 3LM2A 3SMPA 3S41A 4DQ8A 3A0IX 4BRAA 1LOTB 1U6ZA 3C0BA 3O6WA 4BC2A 3MCPA 2YI1A 4M63C 5AQHA 2A6AA 1T6CA 3CJ1A 2DPNA 3WXKA 1QZ5A 2KHOA 4MO4A 3EN9A 1XUPO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OVLA 4OLAA 2Q0RA 1B9FA 1TYQA 3HYFA 5C12A 3SUQA 4PQUA 4C23A 3QBXA 3IFRA 3SQ2A 3TTCA 2ASOA 2BDPA 3LAMA 3OY9A 5AQGA 4BDYA 3V9XA 4CJVA 4U67L 2I7NA 2E6MA 4JHDB 1WBBA 5BN9A 1BCMA 4FL9A 4BROA 4EP4A 3I33A 3CCEN 3L4IA 3GOIA 4JRPA 1NK4A 4B9TA 1NMNA 1S22A 1ZBFA 1WN7A 1J6ZA 1UOCA 1C6VA 4CGIA 2A5XA 3HPGA 2HSTA 3VETA 5DMRA 4GKKK 4B3RK 4H8KA 2G8IA 3NF9A 3LZIA 3VQ9A 5BR9A 2O8FA 4H4OA 2EHGA 4I6MA 4O44A 1QTMA 4M3ZA 1SV5A 3T19A 4I9QA 1RBSA 4CJFA 4CEBA 3NFAA 4ZTFA 1BHLA 2FSNA 1XC9A 3DOKA 2NRVA 4OKJA 5JVHL 3VA3A 3HTVA 2NRTA 4FXDA 2E5LK 2ZJQL 3Q7CA 4DFMA 3U4LA 4CE9A 3CERA 4CW7B 5LMNK 4FJ5A 1VSJA 1ZXOA 3CJAA 3AAQA 1J53A 5BPMA 3LP2A 4Z4GA 1VK0A 4DV7K 1QSSA 3VQEA 3LZJA 2AA4A 4GW6A 4ILJA 5C0YA 3DLKA 4FLZA 3PO4A 3H08A 2G8HA 3VPZA 1KTQA 3CYMA 1X3NA 4JK9A 2RHKA 4FK0A 4FJ7A 4G9ZA 1UWBA 3OYJA 4EFHA 4JD2B 3NBPA 4NXMK 4B1XB 4FVUA 1NK8A 2WFBA 4B9NA 2BUPA 3KVGA 3JYTA 5FPDA 1KVBA 2Y1IA 3EYZA 1MWMA 4IDHA 1JXEA 4OLBA 5CE3A 4O0IA 5GIPA 4OPHA 2HHVA 3CCJN 2IOCA 3FFIA 4Z4FA 1U47A 3VQBA 1GLJO 5FPMA 3M3ZA 4BACA 3VQCA 1JL1A 5T7BA 2UUAK 2E2PA 5AQVA 1NOYA 1SZ2A 4BE2A 1L3VA 4DTJA 2WTUA 4YOXA 3ENOA 3PUFA 3EO3A 1KD1O 3HI0A 2NRXA 1NGJA 2KKZA 4DV3K 1NJXA 3MN9A 4XIUA 4IG3A 3S3OA 3AVMA 3CI5A 3T1YK 3QDKA 1KAYA 2ATQA 1YJ9N 4HWIA 1S9GA 3U6FA 3AVCA 4DF4A 1S9EA 4CZKA 1JLFA 5BPNA 1NWKA 3TU5A 4CHQA 4CJTA 1JLCA 2Z1JA 3K58A 4BG8A 3G71N 1OH7A 3A5LC 4JKFA 1QSYA 5K14A 2VG7A 4AQYK 3DXMA 5JS1A 1U04A 2FSKA 1TGOA 2GTDA 3VGMA 3QINA 4CFCA 1VQ9N 4BE0A 5AQRA 3NE6A 1EETA 4DS5A 2G8FA 1SS6A 5DM6L 2HHQA 4AF1A 4E1NA 4DFPA 5IT9O 1NLVA 3A5MC 4O55A 1YVUA 2Q36A 3ZEUB 3KHYA 4Z4IA 1GLLO 3TPQA 2O8BA 4A5AA 3L2UA 4KAZA 5HL7L 1X9WA 3AAPA 2AP1A 1T05A 4DF8A 1K8KB 4GY2B 3ZSRA 4CI6A 3O1WA 4RG8A 3EKUA 1N33K 5JLFA 2QWOA 2B6AA 5LJWA 3OYLA 1RGIA 2E2NA 1ZBHA 4QS9A 2YHYA 5LJVA 1D9DA 3SV4A 4CZMA 4YHHK 4PKIA 3KLGA 3FLCO 4HCCA 1W0HA 3VQ8A 3I0RA 3TSQA 2OZMA 4E3SA 3LAKA 3TI0A 3P39A 3VTHA 4IWVA 1SL0A 4CESA 3AGKA 4QS7A 2P9SB 1RT7A 2W6LA 1S1XA 4CEQA 2CH5A 4DWIA 1SL1A 1NK7A 3VEOA 1DT9A 3J7ZO 1RT1A 1U2VB 4DHYA 2RE2A 4CHYA 2O8DA 4TSXA 2JWKA 2CH6A 2J4RA 4YOYA 1FKPA 4B3OA 4CZEA 1KVAA 1EO1A 1G99A 1NJIO 1Q9XA 1Q82O 1N5YA 3LWMA 4LSNA 4MO5A 2V7YA 4DMNA 4JLHA 3VEZA 3C94A 4CIFA 3SK3A 2A1SA 4ILHA 1QZ6A 4NCBA 1GLDG 3G0ZA 3WNHA 1F21A 5AZIB 4JKCA 3NF7A 1TKTA 1Q7YO 2QM1A 1TV6A 4DTRA 3BZKA 1YITN 4FWSA 4EZ6A 3ZETB 4DFKA 3CMEN 5KRTA 3SPZA 4B9VA 4H0XB 4FLXA 4E7HA 3QEPA 1HJOA 4B8CA 4WF9L 3S3NA 4JAXA 1SKRA 5FLXO 3OYAA 3QB0A 5HBMA 1CXUA 1T8EA 1RT3A 2O8EB 4DB3A 3L6QA 1MDUB 1M1KO 5CZ2A 3DXKA 2UYTA 2FXUA 5TKWA 3H3NO 5EXWA 3G6EN 4BRKA 1XQSC 4DLEA 1VHXA 4FOEA 1REVA 1VQ4N 5C10A 2QWLA 4B9QA 3WEEA 1D4XA 3MXJA 3BUZB 4BC4A 4UY8O 2VG5A 4HUFA 3MX2A 3J7YP 3LDOA 2G8UA 3OYMA 1DGKN 1DLOA 4XH5A 4DR4K 1S1UA 2F8SA 1EWRA 3AVJA 3DLHA 4KHQA 2NUBA 3LPUA 4CK2A 3V1QA 3IS9A 3DLBA 4BR5A 1T6DA 1HR0K 4B1UB 3U9ZA 2W40A 3OJUA 1RBVA 5E26A 5JICA 3VN5A 4CEEA 1TKDA 4DSFA 2P9NA 1WUAA 2KFNA 3T7ZA 1LAWA 4GVEA 1S72N 3VQ5A 3ZSZA 4CGFA 2ITGA 3R1XA 4YDUA 4NB4A 2ITMA 3NMUA 4CJ7A 2IIRA 1N36K 1HJRA 4UQGA 1VSMA 5A2QO 3KLHA 3PO5A 4M3WA 1WOQA 2OPSA 2X6NA 3D2FA 4BWMA 3D7EO 4CGGA 3AV9A 2Q2RA 1YVNA 2YHXA 3TAEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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