1V4TA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
447
structure length
424
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
molecule keywords glucokinase isoform 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 130
structure length 424
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4tA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4tA01
2GELA 4IZ9A 1GLBG 5AZIA 3UKUA 4CBUA 2ZF5O 1BDGA 1ATSA 5JLFA 3UB5A 1JCGA 3D2FA 2NZTA 5AQLA 3VEYA 4CZLA 3MMVA 4BC3A 1XUPO 4JD2A 5AQVA 3RSEA 3BF3A 3SK3A 1X9JA 4H0TB 1GLDG 3BUZB 4FWRA 4MO5A 4BGAA 3G25A 3EZWA 3ENOA 1NGEA 4M7YA 4H5VA 4BVOA 1QQOA 3A5OC 3QFPA 2CH6A 4A61A 3CERA 5I9EB 3DWLA 2P9UB 1H1VA 4BRNA 3I8BA 2P9IA 1BO5O 4BREA 4PKIA 4JHDA 4CZMA 2QM1A 2VWBA 2E88A 2OANA 4Y0WA 2QWRA 1OKJA 1HLUA 3TPQA 5AQMA 1CZAN 1S3XA 3CQYA 3VGLA 1SQKA 4AM7A 1DEJA 3O4WA 3LDLA 1Z6RA 5JLHA 4CZGA 5LJVA 3O8MA 3UKRB 1MA9B 3EL2A 4H0PA 1E4GT 3O5BA 4L3QA 1WUAA 1BG3A 1YAGA 1NBWA 3L6QA 2BUPA 3ID8A 3H6EA 2GUPA 3U8XA 1C0GA 2P9UA 3SMSA 2D0PA 5BPMA 2A42A 1QHAA 2E2OA 3D7EO 4B9QA 2AA4A 5JICA 4BC5A 4B1XB 3LM9A 4BR5A 3H3OB 4RTFD 5BRFA 4JAXA 4C23A 2GWKA 5BPLA 3O80A 4WQ5A 3HBTA 2A3ZA 3AY9A 3GL1A 4XEIA 5AQFA 3VETA 4RWTA 4H0YB 3A5LC 1Z05A 2VYPA 3SJHA 3M3ZA 1TUYA 5EY4A 3VF2A 1DGKN 2P9KA 2FSKA 4BRDA 4BR9A 5TKYA 4MLHA 1G99A 3QICA 3QDKA 2HF4A 4QS7A 3A5MC 4BRMA 1IJJA 3ULEB 5BN8A 4FL9A 5AQNA 3W3DA 3WXKA 5LY3A 3EN9A 4EFHA 1GLLO 1BUPA 2GEMA 5AQTA 1MWMA 3D2EB 4H03B 4BRPA 2CH5A 2ZWHA 3H1QA 1NGHA 5AQIA 1GLEG 1GLAG 1GLFO 4FO0A 4DB3A 2I7PA 1GLJO 2HOEA 1HKBA 3FZMA 3GDQA 4PL8A 3CI5A 2H3GX 4BRCA 3VENA 5AZIB 3UKUB 3C0BA 1QQMA 2E1ZA 2PAVA 3WUHA 2Q2RA 5AQSA 4FPAA 3D2FB 1Q18A 4WQ5C 1IG8A 4XH4A 3J8AA 3R9PA 3VEVA 2W40A 3BF1A 4JD2B 3QB0A 4K41A 4H5NA 4JNEA 3WQUA 2I7NA 3IFRA 1V4SA 1JCEA 3D2EA 5F2RA 3ZEUB 4PKGA 4IJNA 5FPEA 4PKHA 4BRAA 1Y64A 1RDWX 3IDHA 3VPZA 3DXKA 2P9IB 3L0QA 2QW9A 4LC9B 4JHDB 1ESVA 2FXUA 3P4IA 3LDNA 1SZ2A 5EOYA 3HZ6A 3CQXA 1WOQA 3QBWA 2UYTA 1NGIA 2KHOA 4H5RA 3QMLA 4FWPA 4FSVA 3B8AX 3W0LA 4BRQA 3U9DA 2HMPA 5EVZA 3ZEUA 2IVOA 3M6GA 1MDUB 5AFUH 5JMVA 4WQ4A 3HM8A 3VEXA 4B1ZA 2E2NA 4M7XA 2IVNA 1KAXA 3FE1A 3SLCA 2Q0UA 5AQYA 3ENHA 4H0XB 3C7NB 3H45C 5AFUA 1ZC6A 3VGMA 4PL7A 2CGLA 4HTLA 4CBXA 4ISEA 4BG8A 4IJAA 3GBTA 2YCHA 1KAZA 5E84A 2GWJA 3R6MA 4B1VA 4BRKA 3EKUA 2HF3A 5ELZA 3S41A 4EIAA 5AR0A 3H1VX 3QFUA 1KXPA 1S22A 2P9KB 4CZEA 1NGGA 2E8AA 3IUCA 3M1FA 3VESA 2QWQA 1BU6O 3BEXA 3C7NA 4IO8A 5F1XA 4EHTA 5BRHA 2P9LB 4H0OA 3DAWA 4Z94A 3GOIA 2P9NA 4BQZA 1K8KB 1XQSC 3WT0A 4M63C 4WQ4C 1NGAA 4FWMA 4GY2B 4FOIA 1GLCG 3CETA 2YHWA 4JN4A 4NB4A 4HWIA 5E26A 4I6MB 5AQJA 3U9ZA 4MO4A 3VEOA 5F0XA 2A41A 2FF3B 4XH1A 5BR9A 5EX5A 2ZGZA 1BA0A 1MWKA 1HX1A 3HSCA 2P9LA 2CGKA 4BRHA 2FF6A 1BA1A 1K8KA 1D4XA 4A2AA 2PBDA 1RFQA 1U2VA 1BOTO 1E4FT 3VEWA 4A62A 4I6MA 3MN5A 1YUWA 4BR7A 4CJ7A 4BRIA 4WYBA 3ZETB 1YVNA 3CJ7A 1TYQA 2V51B 3HTVA 3MN6A 3DXKB 1ATRA 2NLXA 4K43A 4BROA 1HPMA 5AZJA 1LCUA 3GG4A 3FZHA 1R59O 2P9SA 4BQLA 3AAPA 1RGIA 5LJWA 4CI6A 1HUXA 4BRGA 5KPRA 3CJBA 4CD3A 4K42A 1NGBA 2ZGYA 3MN7A 4AM6A 3WEEA 3TU5A 1TUUA 3A0IX 1NWKA 2F9TA 5FPDA 3ZX2A 2V7YA 1C0FA 3ZETA 2QXLA 4FWOA 5CE3A 4QS8A 1YXQA 2F9WA 3LDQA 4ISGA 1NGFA 3I33A 3LL3A 5AQWA 2ASPA 3JXUA 3VGKA 2VCPA 4DQ8A 1HKCA 3UE5A 1T6CA 3QBXA 2QWLA 2GTDA 2E20A 2P9PB 2DPNA 2NRHA 4ISFA 1XC3A 4BC2A 2AP1A 3WXLA 3LDOA 4J8FA 1J6ZA 3ZX0A 4F9OA 3R8EA 1V4TA 3WXIA 3F9MA 2Q36A 3FZKA 2P9NB 3CJ9A 3A8YA 2EWSA 2Q31A 4RCHA 5AQPA 5AQZA 1P8ZA 3CJAA 2FSNA 3H3NO 2CGJA 3WQTA 3DXMA 2P9PA 2YJEA 2V52B 2YJFA 1X3MA 2A6AA 3VERA 4A2BA 5AQGA 3FZLA 4YDUA 2Q97A 3KHYA 5BREA 2D0OA 3FR0A 3ATUA 3A5NC 2YI1A 4IXCA 2ITMA 2A40A 3MDQA 3L4IA 1QQNA 2QWOA 5EXWA 4EHUA 1LOTB 5KQ8A 5BPNA 1NM1A 4CZHA 1U6ZA 1U2VB 3CJ1A 5B8HA 3FFKB 4B1WB 4GNIA 4BRFA 2A5XA 3VEZA 1NMDA 3U4LA 2YHXA 2D1KA 4BVPA 4CD1A 1ZXOA 3FZFA 4BR2A 3IMXA 2IIRA 1TYQB 3VOVA 1QZ5A 3JS6A 2QWPA 3MK6A 5ADXH 3CHWA 4BR0A 5FPNA 2E2PA 5AZJB 3EKSA 2QWNA 4FWLA 2P9SB 3GE1A 4B1YB 4O5FA 5AQXA 4H0VB 4E1JA 1ZBSA 3MCPA 5ADXA 1NGDA 1DKGD 3O1BA 5FPMA 1HJOA 3LM2A 3CIPA 4YDUC 1T44A 2WUSA 3WEEB 4B1UB 3O6WA 2E2QA 1QZ6A 5AQKA 3UKRA 4BRLA 4FWQA 3MN9A 4MLEA 1T6DA 5AQHA 3O1WA 3LDPA 4DHYA 2V7ZA 3AARA 3EO3A 3OHRA 3CJCA 1NGJA 5AQUA 4FOEA 4KBOA 4EAHD 4FWSA 5BRDA 3ZX3A 3VF4A 4CBWA 2Q0RA 5KPTA 1X3NA 2D4WA 4NO7A 3SMPA 1NGCA 4O8KA 4CZFA 2IVPA 4DCHA 5AQOA 4CZIA 3WXJA 4H5TA 1EQYA 2FSJA 2W41A 3AAQA 4BGBA 4CZJA 2QWMA 2E1YA 1JCFA 5KQDA 4FWNA 2YHYA 1SAZA 4BG9A 4K25A 4H5WA 3HI0A 4BC4A 4IWVA 3KZBA 5KPZA 3DJCA 4FWKA 2ASOA 3FGUA 3O08A 2Q1NA 1BWFO 3FLCO 3ULEA 3VF6A 3KVGA 2BTFA 1NLVA 3RSEB 4BR4A 4QS9A 4XH5A 2FLOA 4FPBA 2ASMA 1KAYA 2J4RA 3DXMB 1HKGA 5AQRA 5AQQA 5BN9A 3BP8A 3H46O 1ATNA 3ATVA 4CZKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVJA 1CLQA 4NXMK 2HVIA 2ZF5O 4CJRA 2KZZA 1ATSA 3UB5A 4ILHA 4W5RA 4EZ6A 4FW1A 3AO4A 3RSEA 3SK3A 1GLDG 1SL0A 2RKIA 4MO5A 4DU1A 4CVNE 3K5MA 4KB1A 3HL8A 4CJLA 2CH6A 3DWLA 1J54A 3DLKA 2P9UB 4BREA 4DSIA 3NBPA 4LD0A 2VWBA 4Y0WA 1OKJA 1C1BA 2YHBA 1S3XA 3VGLA 4CHQA 4E19A 3MWPA 4FJIA 3V1OA 3PSIA 4LF6K 2GUIA 4YOYA 5JLHA 4WFNL 1EKEA 3O8MA 3UKRB 4H0PA 4BDZA 4Q0BA 3HOSA 1BG3A 3SAFA 4EP5A 1TKTA 2GUPA 2FBXA 2P9UA 4YFUA 5HRNA 4FJMA 2A42A 2X74A 2VGMA 3QO9A 4CEOA 3D7EO 3AA3A 3KK7A 4C1NI 1X9MA 3LM9A 4JK9A 1JLFA 3DLRA 4M41A 3SUQA 5BRFA 1VSFA 3THXB 3KWIA 3Q7CA 4HUEA 2GWKA 3CG7A 3KJVA 3RVCA 1X9WA 3HJFA 2G8WA 4GKJK 4WQ5A 5HOOA 4CHNA 3A5LC 1Z05A 3MEGA 5KGXA 4ILJA 4E7LA 3C94A 5EY4A 3LZJA 4BRDA 4LFCK 4NYFA 3RMBA 3QDKA 4QS7A 3TTDA 3ULEB 4DV1K 4FL9A 5AQNA 5LY3A 4EFHA 3THXA 5GIPA 5AQTA 1MWMA 4H03B 3CFPA 3T1HK 4BRPA 4KFBA 1TL1A 4DTSA 2ZWHA 1RBVA 2HBMA 2DFHA 1GLEG 1GLFO 1MU2A 4IKFA 4DB3A 4K0KK 2HOEA 3FZMA 3GDQA 4J2AA 2YNHA 2H3GX 1VSHA 3UKUB 1VQKN 2IGIA 2PAVA 1JKHA 4LSLA 1N6QA 4ELTA 1S1XA 3V9UA 1IG8A 2HMIA 3VEVA 2W40A 4W5QA 3CPWM 3IS9A 4H5NA 4CGGA 1SL2A 3OYEA 2G8HA 3MX2A 4IJNA 5FPEA 1KRPA 1JL2A 1NU0A 1KC8O 3VQPA 3E9OA 1KFDA 1BISA 4JI6K 1OH7A 3E9LA 4JHDB 2KKZA 4CFDA 4AHTA 1W2BM 3AVCA 4AH9A 3QBWA 3TAGA 1NGIA 4DTOA 3S9HA 4H5RA 4CJ4A 4C8KA 4FWPA 3B8AX 1N36K 3SV4A 3U9DA 4B9TA 4DSEA 4FCYA 2HB5A 1MDUB 5AFUH 3P1GA 4KTQA 1RCHA 4AHSA 4OKKA 4B1ZA 3J7AP 1KAXA 2Q0UA 2HHQA 2HHHK 1ZYQA 4CFBA 4ISEA 2WBNA 4IJAA 3KLEA 3E66A 4FM2A 2HHSA 5E84A 2ITGA 4E7KA 2NRWA 2NRVA 3PO4A 2HF3A 5AR0A 3H1VX 3EE9A 3QFUA 1KXPA 3K59A 2E5LK 3L4QA 3JAMO 3LDSA 4GKKK 3VN5A 4CZEA 3AVHA 3IUCA 1WSIA 2Z1JA 3BEXA 4KREA 4LH5A 3CCJN 1RTDA 5BRHA 1L5UA 1UWBA 1M90O 2F8SA 4Z94A 2P9NA 4YOVA 4FJLA 1RTIA 4G9ZA 3WT0A 4WQ4C 1KLNA 3C65A 4JN4A 4DR7K 4DV4K 2DFFA 4I6MB 4FJ8A 4G1QA 3CM5A 5F0XA 3ZSQA 4CEZA 5BR9A 3OYHA 3V81A 5EX5A 1BA0A 3OY9A 1BHLA 4W5TA 5C15A 3NAEA 1D4XA 3AVFA 3TAMA 2PBDA 1JLQA 1ZBFA 1RFQA 1U2VA 4H4MA 4HHTA 3DRSA 4I6MA 3MN5A 3O9RA 3C6AA 4DFMA 4FJKA 1WN7A 4CFCA 1VQ5N 4HUGA 4JKCA 4KAZA 1TYQA 2V51B 2YKNA 2Z1GA 2ATQA 2YKMA 2NLXA 5C10A 4GW6A 4KHWA 4KB0A 4CJQA 3FZHA 5GIOA 3RMCA 1IBLK 1R59O 1IV0A 1KVAA 3O4NA 2OTLN 1GOAA 4KHUA 3AVAA 3LP1A 4CI6A 1J9AA 3CJBA 1VSIA 4CD3A 4CEBA 4JK7A 3MX5A 3TU5A 1Q86O 3A0IX 3SYZA 4HUFA 4F2SA 3ALYA 2F9TA 4FJ9A 4OX9K 1C1AA 1Y97A 1C0FA 3HM9A 2QXLA 3LP3A 1YXQA 2VG6A 4KH5A 3CCQN 1NGFA 1B9DA 1IKYA 4FJXA 3RR7A 4KHNA 3K2PA 4LF4K 3UE5A 3THVA 5HRSA 1VQ8N 4DFKA 1TKDA 4FJNA 4CJWA 3NMUA 4NLBA 2GTDA 2E20A 2B5JA 2P9PB 1XC3A 1F21A 1YT3A 3WXLA 1OH6A 4CEEA 4OKEA 1V4TA 2W6KA 2IAJA 4M45A 3F9MA 4Q5VA 3P31A 1HNZK 3CJ9A 1BGXT 1T05A 3K5NA 4AHVA 1U47A 1P8ZA 3L2QA 3WQTA 4X64K 4CF9A 2P9PA 2Q3SA 2YNGA 4K8ZA 4LH4A 3VERA 4DQQA 1SS6A 3F2KA 1Z26A 4DTXA 1VSEA 3A5NC 1XI1A 5C12A 3OYFA 4CJ5A 3QNOA 1QQNA 4EHUA 2KLAA 5I3UA 2BANA 3Q7BA 1ASWA 1NKEA 4B3SK 5C2FA 1YIJN 3OYGA 2RE2A 5CZ2A 2A5XA 1NMDA 3OW2M 1NOZA 1LAVA 3R1XA 4PY5A 4NLCA 2OTJN 4FLVA 4XIUA 2UUCK 1NK4A 4M3WA 3BDPA 3NF8A 4DTMA 2XO7A 5FPNA 3ZT0A 2QWNA 4FWLA 5KRTA 3B6OA 3DLGA 3BGRA 3F9KA 3NF6A 4O5FA 1OH8A 1ZBSA 3MCPA 5ADXA 4MQ3A 1RDDA 4F3TA 2HNZA 4FJHA 3PO5A 3KWGA 3WEEB 4E1NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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