1V4TA

Crystal structure of human glucokinase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
447
structure length
424
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords glucokinase isoform 2
publication title Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 130
structure length 424
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2003-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1v4tA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1v4tA01
3VEYA 4BR2A 4NO7A 3IDHA 3O1WA 3S41A 4BRNA 2ASMA 2E8AA 3KVGA 5AQMA 2Q0RA 4DHYA 1JCEA 2P9PA 1RGIA 4WYBA 4FPBA 4CZEA 4FOEA 3H3NO 3FFKB 4BG9A 4H03B 2HMPA 1NGGA 1BDGA 3I33A 1NWKA 2UYTA 3UKUA 2D1KA 4EFHA 1GLJO 3QICA 5AQHA 3WQUA 2V7YA 5FPMA 4BREA 3O6WA 3W0LA 2P9NA 3EKSA 4O8KA 2HF3A 3M1FA 3EN9A 2FF6A 5FPEA 4BQLA 1V4SA 2P9LA 3HM8A 3P4IA 2E2OA 3VERA 4B1ZA 1YVNA 4BRGA 3O4WA 4PL7A 5AQRA 5BPLA 5JLFA 4K42A 4H0TB 4B9QA 4Z94A 1X3MA 4IJNA 3ZETB 4B1UB 4RCHA 2ZGZA 2D0PA 5AQUA 1NBWA 1SQKA 3WXIA 2E20A 4CI6A 1U2VB 3I8BA 1DKGD 4JAXA 4JN4A 3EZWA 3EL2A 1SAZA 4B1WB 2NLXA 5LY3A 1U6ZA 3QFPA 4F9OA 1OKJA 3D2EA 2QXLA 2F9TA 1D4XA 3RSEB 3J8AA 3QBWA 4FWSA 2CGKA 2V51B 4IWVA 5F0XA 4H5WA 1DEJA 1QQNA 5LJVA 4BR0A 1P8ZA 1GLFO 4BRIA 5AFUH 5JICA 3WUHA 2V7ZA 2F9WA 2Q31A 3UKRA 4BC4A 5AQYA 1H1VA 4BR5A 3SMSA 3UB5A 3LM9A 1EQYA 4WQ5C 2P9IA 1ESVA 1QHAA 2A6AA 3CJ7A 5E84A 4XEIA 3CJBA 4A61A 4H0YB 4BGBA 3FLCO 5AZJB 3ENHA 4GY2B 3SK3A 3CJ1A 2CGJA 4WQ5A 1GLDG 3FE1A 4FWMA 4BGAA 2ASOA 3M3ZA 1YXQA 2H3GX 4CZHA 5B8HA 3OHRA 1NGAA 5AZIA 4QS8A 3VPZA 3L0QA 1Z05A 1C0GA 1ZC6A 1HJOA 2YJEA 4EIAA 2QWLA 4FPAA 3VF4A 4CZGA 3LDNA 3MN9A 5JLHA 4L3QA 4QS9A 3JS6A 4FWOA 4CD1A 2VYPA 4BROA 1YAGA 4PL8A 3D2FA 3TU5A 4XH5A 4BC2A 2YHYA 3DAWA 5ADXH 1BWFO 5EVZA 2A3ZA 1NGJA 3BUZB 4JHDA 4JNEA 5KPRA 4B1XB 2CH5A 1KAZA 4QS7A 4CZJA 4MO5A 4H0XB 5CE3A 3IUCA 3VEXA 2E88A 5AR0A 4H5RA 3GE1A 4H5VA 5E26A 2P9PB 3MK6A 4BRDA 4DCHA 2ITMA 1YUWA 3VESA 3ID8A 4EAHD 1DGKN 2Q2RA 2FSNA 3CJAA 2P9KA 3UKUB 1HKCA 5AQWA 2GELA 3VOVA 1BA1A 3ZX2A 5KPTA 1TYQA 2FSJA 1GLLO 2IVPA 3IFRA 4BVPA 3C7NA 3WEEA 3WXKA 4BRAA 3WT0A 1BA0A 3A0IX 2P9NB 3CI5A 4J8FA 2I7NA 1XUPO 4BR9A 2EWSA 1GLAG 2GUPA 2QWPA 4FWNA 5EXWA 5BRFA 3ZX0A 1NGBA 1LOTB 2QWRA 4K43A 4I6MA 3BF1A 1RDWX 3L6QA 4A2AA 3QDKA 3VF6A 1C0FA 1MWKA 1TUYA 2VCPA 3GOIA 3HZ6A 4BR4A 2ZWHA 4FO0A 1WUAA 3DXKB 3LDLA 3MDQA 1NGIA 1E4FT 5AQQA 4BRMA 4A2BA 3DXMA 3EO3A 3ULEB 2FSKA 3D2EB 2W40A 4CBWA 1BOTO 4EHUA 5BR9A 3SMPA 2VWBA 2Q36A 5JMVA 3VENA 3ATVA 3O8MA 3TPQA 3VEZA 3O80A 5BRHA 3BF3A 4BC3A 1BUPA 3BEXA 2ZF5O 1NGHA 2PBDA 4CBXA 4EHTA 2Q0UA 4PKIA 3H45C 2BTFA 5ADXA 2IVOA 4IO8A 4XH1A 2P9IB 2YJFA 3U9DA 3ZEUA 2PAVA 1HUXA 1KAYA 4YDUC 3FZMA 3CQYA 1MWMA 2OANA 4M63C 3FGUA 4JD2A 1ZXOA 5BREA 1E4GT 3H6EA 1QZ5A 3A5NC 4RWTA 1GLCG 1BU6O 2QM1A 1NGEA 1GLBG 5BN9A 3LL3A 5BRDA 1X9JA 4CZMA 2BUPA 3VEOA 2FXUA 1NGFA 3AARA 3GG4A 4K25A 3SJHA 3CJCA 2GEMA 2QWOA 1QQMA 4M7XA 5AZIB 1JCGA 4WQ4C 4NB4A 2W41A 2ZGYA 2NRHA 3IMXA 5AQZA 2A40A 3DWLA 5BPNA 3HI0A 3HTVA 3MMVA 3O08A 4A62A 3CHWA 2E2NA 1T44A 1QQOA 3FZKA 3D2FB 4H5NA 3HBTA 3ATUA 2QWNA 4Y0WA 3C0BA 4JHDB 4AM6A 4HTLA 1G99A 2KHOA 3KHYA 3O5BA 3U8XA 2E2PA 4BRCA 2QW9A 1ATNA 3FZHA 3SLCA 1QZ6A 4BC5A 1GLEG 5KQDA 1ATSA 3BP8A 2FF3B 1LCUA 3FZLA 2V52B 3KZBA 2P9KB 3G25A 2YHWA 2AA4A 3AAQA 3L4IA 5EY4A 2P9UA 3LDPA 1TYQB 4IXCA 3A5MC 3C7NB 5AQPA 1K8KA 2ASPA 3GL1A 3LDOA 5AQSA 3R9PA 2YCHA 2CH6A 2IIRA 5F2RA 1S22A 3MN5A 3VEWA 4BG8A 1HPMA 1MDUB 4CZIA 2I7PA 1CZAN 5AFUA 5AQVA 1WOQA 1HKGA 4XH4A 4BRQA 2HF4A 2WUSA 4I6MB 4DQ8A 4FSVA 4ISFA 5AQLA 3FZFA 4BRFA 2P9SA 1HKBA 4BRLA 3D7EO 2P9LB 3U4LA 5AQXA 1NGDA 2Q1NA 4FOIA 4ISEA 2D0OA 5AQFA 2E1ZA 5BN8A 4IZ9A 2QWMA 3VF2A 5EX5A 3QB0A 2YHXA 5AQOA 3DXMB 4B1VA 1IG8A 3GBTA 4KBOA 1NGCA 4PKHA 3MCPA 5KPZA 1BG3A 2GWKA 2GTDA 4K41A 5F1XA 2DPNA 3LDQA 1R59O 1NM1A 3H46O 4FWRA 4C23A 4CZFA 2J4RA 2QWQA 4BRPA 2E2QA 3VETA 3CQXA 5AQTA 4ISGA 5AQGA 5I9EB 4FWQA 4BR7A 1NLVA 5TKYA 1Q18A 5AQKA 5KQ8A 1MA9B 5AQIA 3ZEUB 4H0OA 3UKRB 1KXPA 1Y64A 3DXKA 2CGLA 3DJCA 3VGMA 2AP1A 3WXJA 2FLOA 4B1YB 4CD3A 3VGKA 3ZETA 3ZX3A 4JD2B 3R6MA 3ULEA 2IVNA 4H0PA 1U2VA 5LJWA 4BQZA 3R8EA 1SZ2A 2A42A 3GDQA 3UE5A 1X3NA 3WXLA 5FPNA 3A8YA 4FL9A 3MN6A 5BPMA 4LC9B 4HWIA 2NZTA 3CERA 2Q97A 4CBUA 3RSEA 1XC3A 3F9MA 3EKUA 1BO5O 1JCFA 3CJ9A 4H0VB 1HX1A 1T6CA 4CJ7A 4YDUA 5FPDA 3U9ZA 3W3DA 1ATRA 3FR0A 3M6GA 5EOYA 4E1JA 2E1YA 3HSCA 4MO4A 3WQTA 3QMLA 1XQSC 3CIPA 4BRHA 4CZLA 1IJJA 3MN7A 4O5FA 3AAPA 2D4WA 4DB3A 4MLEA 4BVOA 1J6ZA 4M7YA 3B8AX 5AQNA 4BRKA 2HOEA 1HLUA 4H5TA 3H3OB 4FWKA 2GWJA 5AQJA 3VGLA 5ELZA 4IJAA 4WQ4A 3O1BA 3LM2A 4AM7A 4CZKA 3AY9A 5AZJA 3H1QA 4PKGA 1V4TA 2P9UB 1NMDA 1T6DA 2YI1A 3CETA 3H1VX 1TUUA 1K8KB 3QFUA 4FWPA 1S3XA 2A5XA 3ENOA 1ZBSA 1KAXA 2A41A 3WEEB 4FWLA 3JXUA 1Z6RA 3A5OC 3QBXA 3VEVA 1RFQA 4MLHA 4RTFD 3A5LC 4GNIA 2P9SB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ASWA 2O4IA 4BR2A 2OA8A 5CYQA 3IDHA 1U45A 3S41A 1IV0A 2Q0RA 5JVGL 3O9QA 3KWGA 3VQ6A 2O8DA 3RMDA 4FPBA 5FROA 4FOEA 3HRGA 1SL0A 1XHXA 3G0ZA 4F2RA 2HMPA 1UA0A 4OKEA 3UKUA 5J2QA 4EFHA 2OYQA 3V9UA 3SUQA 4IOCL 3WQUA 5C15A 5FPMA 1LAVA 4PQUA 2F4VK 3IRXA 4JKGA 3DYAA 4LF5K 3EN9A 1N34K 1EKEA 4BQLA 3CCSN 4W5NA 5KGWA 2I5JA 4AHCA 3O4WA 3NF7A 5AQRA 4HUGA 5FRMA 4Z94A 4CE9A 2VG6A 4RCHA 2OPRA 1TKZA 1XMOK 2E20A 1ASVA 4CI6A 1U2VB 2UUCK 4GMJB 1C1AA 1S5JA 2YNGA 3ZSQA 4J2EA 3WNHA 5LY3A 4DS4A 4OX9K 1OKJA 3VQ9A 1D4XA 3J8AA 3EZ5A 1VAZA 4B8AB 2YKMA 2V51B 1EETA 2WOMA 1TKDA 1RDCA 3PIOL 4NLCA 2Y1IA 4DV0K 4DR6K 3A2FA 4CHOA 1HNWK 2Q31A 4AHVA 4CVNE 1NK5A 1I94K 1D9FA 5H1SQ 3LM9A 4WQ5C 2XY5A 1WNSA 3CJ7A 4KHNA 4XEIA 4CEAA 1TL3A 2EX3A 1D8YA 3CJBA 3AA4A 2HBJA 3VQ7A 1U47A 1JLQA 1NKBA 4OO1J 3FLCO 3O9SA 3VQ5A 2QI2A 4YOYA 3AV9A 3TSUA 3V1RA 1CXQA 3CJ1A 3PX0A 3FE1A 4A5BA 1HNIA 1XMQK 2VGNA 4WFBL 2G8KA 1RT2A 4NXMK 1OH7A 1VSDA 4E3SA 5B8HA 5KGXA 4JS5A 4CFBA 4M3WA 3E01A 4ELUA 4RW7A 2Z1GA 1Z05A 3HPOA 1VQNN 2D0BA 4BDYA 1KRPA 3PUFA 3JS6A 4FWOA 4CD1A 4GV9A 4LFAK 3OYAA 1XWLA 1YAGA 4PL8A 2E5LK 4BC2A 3C6AA 3DAWA 1BWFO 1NGJA 4B1XB 3LP1A 4QS7A 4CGFA 2DFEA 4H0XB 4KHYA 1RDAA 3VEXA 1C6VA 3LPTA 4FZXC 1Q7YO 2OTJN 4AHSA 3VESA 3OA9A 3M8SA 2RF2A 1QVGM 1VSIA 5AQWA 3KK7A 1NOZA 3V81A 1FXXA 4FLWA 3ZSWA 4CJWA 1WAJA 1IKXA 3C7NA 1LW0A 2XRIA 4B9UA 3WXKA 3TTFA 1BA0A 1Q8IA 3CYMA 3ISNC 1XUPO 1GLAG 5BRFA 4X65K 2HHUA 4I6MA 1VHXA 3THXA 2HB5A 2VG7A 3VF6A 1C0FA 1MWKA 2VCPA 3QETA 3HZ6A 3KK2A 2ZWHA 1KVCA 1U04A 4FO0A 1WUAA 4FJ8A 4N76A 4IDKA 4LD0A 1BCMA 1E4FT 1S1VA 3THWB 3HVRA 1X1PA 3EO3A 4UQGA 2QK9A 4FK4A 3D2EB 2W40A 2O8BA 4WFAL 4FK2A 3CM6A 4EHUA 2JGUA 2RKIA 2Q36A 1A5VA 5JMVA 3I0SA 4B3MK 3ATVA 3O8MA 3TPQA 4FJGA 3BF3A 2ZF5O 5HLFA 2PBDA 3VQEA 3WNFA 4FK0A 1NKEA 4QOZB 3H45C 2YV0X 4CJRA 3DLLL 1HR0K 4N56A 4CK2A 2G8HA 1IKYA 4BE0A 5C10A 4CEBA 3CQYA 4YOUA 3FGUA 1ZXOA 1E4GT 5C2DA 1YJNN 4OGEA 4JI0K 2EHGA 4FLZA 2HBMA 3C6HA 3CF5L 2KZZA 4HCCA 3AO1A 1XNQK 1NGEA 3LZJA 3LP0A 1VSKA 3NH0A 4K25A 3SJHA 3E9PA 5AZIB 2ZJPL 1QQMA 1KFSA 3VQBA 5BPNA 3HTVA 3O08A 5KRSA 3KK1A 2E2NA 3ATUA 2QKBA 2QWNA 4Y0WA 1Z25A 2RE2A 1G99A 2BH1A 2KHOA 4BRCA 5GAGP 4HTUA 3LALA 3NH2A 1ATSA 3BP8A 4FM2A 1LCUA 2NUBA 4CJUA 3K58A 4FVUA 3TABA 3G25A 4DU3A 2A1RA 4FJMA 3AAQA 5EY4A 1TVRA 2HHWA 3E9OA 4B08A 3ZT4A 5FRNA 4ILJA 3O3FA 3R9PA 5AQSA 3MEGA 2FBXA 2CH6A 4M3ZA 3O9TA 3G6EN 1RTHA 4U67L 3M8PA 4KH4A 5AFUA 3ZSRA 1Q9YA 4FW1A 2HF4A 4CF2A 4JKGB 1HQEA 4W5TA 3AVGA 3FZFA 4BRFA 3LAKA 1U48A 1CZ9A 5HBMA 2XY6A 3CFPA 5AQXA 4O55A 4CEEA 1E3MA 4DFJA 3QB0A 2FBVA 3DXMB 4BE2A 4KBOA 1BQNA 1NGCA 3E1YA 4PKHA 4ID5A 4KTWA 3KJVA 1BG3A 2GWKA 1IBKK 4YFUA 2P51A 4CJTA 5HL7L 3U3GA 4K41A 4GKJK 1R59O 3I56N 1WSIA 4DTMA 4FWRA 1C1BA 2J4RA 3TWHA 3DLHA 1B9FA 4ISGA 1RBRA 5C12A 3VA0A 3SI6A 4CHQA 1N8RO 5AQIA 4FLYA 1KXPA 3P5JA 4I7FA 2AP1A 3WXJA 3L2WA 2UU9K 1YITN 5HRNA 3VGKA 4DFPA 3P83D 3ULEA 4H0PA 1U2VA 5GADP 2P5GA 4E7LA 3THYB 3EEQA 2ETJA 3GDQA 3A8YA 4FL9A 4LC9B 4KTZA 2HBKA 3E66A 3F9MA 3EKUA 1JCFA 4GV6A 4DUYK 3AO2A 3JAMO 4LF6K 2OPPA 1HX1A 5LMUK 1A5XA 3HPHA 2O8FB 2OTLN 1Q86O 4MO4A 3WQTA 4BRHA 1RCHA 3OS2A 3CCVN 4DB3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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