4IXCA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a small molecule activator.
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
447
structure length
443
Chain Sequence
NSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Matched triplicate design sets in the optimisation of glucokinase activators maximising medicinal chemistry information content
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 171
structure length 443
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ixcA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4ixcA01
4FWPA 3H1QA 2UYTA 1LCUA 4CZMA 5AQTA 5FPDA 4FOIA 4BG9A 5KPTA 3CJ7A 2PAVA 1BO5O 4M7YA 5AZIB 2IVPA 2FSKA 3LM2A 3R9PA 5AQHA 3VEOA 2AP1A 1NWKA 1NGHA 3HZ6A 5BPMA 3EL2A 1QHAA 2FSNA 4H0TB 5KQDA 3ZX2A 3EZWA 4H5NA 2A42A 5AZIA 5EVZA 4FWOA 2Q1NA 3MN5A 2E88A 3WQUA 3S41A 3MN9A 1XC3A 4CZIA 3CQYA 4CBWA 3LDNA 4QS7A 2ASPA 3D2EB 4YDUC 5FPNA 1P8ZA 5BN9A 5LJWA 1KAZA 1WUAA 2P9PB 3H45C 1T6CA 1BDGA 2Q2RA 2ASMA 5AQFA 1XQSC 1MWMA 1MA9B 4H0VB 3QFUA 3UE5A 3VPZA 5AQQA 5AQUA 1ZXOA 3D2EA 3GL1A 4PL8A 2GWJA 2Q31A 2QWPA 4YDUA 3AY9A 4BC2A 3QBWA 2P9PA 4JD2B 4LC9B 4BR2A 3EO3A 3FZKA 1S22A 3VF6A 1ZBSA 2CH5A 4O5FA 2E2NA 3W0LA 4BRPA 1NGEA 2VWBA 5AR0A 1T6DA 3U9DA 4B1WB 4HTLA 4MO4A 4JD2A 4XEIA 1QQMA 3VEWA 2P9LB 1HLUA 4MLEA 2GTDA 5AQVA 4BC5A 4BRKA 4CI6A 5BN8A 2P9SB 1IG8A 2A41A 5FPMA 4IZ9A 5KQ8A 1J6ZA 5AZJB 4NB4A 3M6GA 2P9LA 4EHTA 3ENOA 3IUCA 3R8EA 4CZJA 2FF3B 2Q0UA 3O8MA 3R6MA 3SJHA 4QS8A 2AA4A 3FR0A 1C0GA 3CERA 1GLBG 4CJ7A 2P9SA 3SMSA 3FGUA 3QICA 1TUYA 4FWMA 1HX1A 1GLAG 1HKGA 4BG8A 3VGMA 5AZJA 3HTVA 3H3NO 2FXUA 4CZFA 1NGCA 1KAYA 1ZC6A 5AQPA 4GNIA 4DQ8A 3EKUA 4XH5A 3JXUA 4A2BA 2E8AA 3LL3A 1JCEA 4B9QA 2V52B 3ID8A 4FWNA 1TYQA 2HOEA 1U2VB 2OANA 5AFUA 3CJBA 5LY3A 2YHXA 1YUWA 3GDQA 4M63C 4FWRA 3DXKB 4K43A 5FPEA 2A40A 3BUZB 3FE1A 2GEMA 2V51B 4CD1A 4ISFA 2A3ZA 1NGDA 4IWVA 2QXLA 1NMDA 3HSCA 4BQZA 1ATNA 1NGIA 3TPQA 1NBWA 1X9JA 1U2VA 3GBTA 4KBOA 4EIAA 3WXIA 2YHWA 3VEZA 3DXKA 3WXLA 3GE1A 2E2PA 4B1XB 1HUXA 4PKHA 4ISGA 3QFPA 2QWNA 2P9UB 2NRHA 1QZ6A 4PKGA 3HBTA 1X3NA 2Q36A 4MLHA 1JCFA 1R59O 3I8BA 3P4IA 1KAXA 4RTFD 5AQZA 2BUPA 3SMPA 3VGLA 3OHRA 4FWKA 4H0YB 1E4FT 5AQRA 3O80A 1OKJA 2F9TA 2QWLA 3A5LC 3GG4A 2E2QA 2P9UA 3O1WA 2HF3A 2D0OA 3CJCA 1ATSA 4CZLA 5BR9A 3HM8A 3JS6A 3EN9A 2VYPA 1D4XA 4BREA 4CBXA 4IO8A 1SQKA 3SK3A 4H5VA 3AAQA 1HPMA 3U9ZA 5BPLA 4NO7A 4CD3A 1BUPA 1Q18A 2P9NB 1ATRA 1GLLO 3LDQA 2H3GX 4XH4A 3WEEB 4BR7A 4BRLA 2QM1A 1DGKN 5AFUH 3FLCO 5AQWA 5EXWA 3I33A 2YI1A 1HKBA 3C7NB 1NLVA 3UKUB 5EY4A 1RGIA 4BRHA 3MN6A 2P9NA 3WEEA 1GLCG 5F2RA 4BR9A 5KPZA 3CJ1A 1EQYA 1Z05A 4FL9A 1KXPA 3C7NA 1X3MA 3UKUA 4B1ZA 3UKRA 2QWRA 3SLCA 2NZTA 4O8KA 3BP8A 1BOTO 2WUSA 1V4TA 5BPNA 3H3OB 2ZGZA 4BR4A 3LDOA 2BTFA 2W41A 1RFQA 3QMLA 5TKYA 3H6EA 4H0OA 1QZ5A 2KHOA 1YVNA 1TUUA 2I7PA 3O08A 3U8XA 1XUPO 3DJCA 5AQOA 4A61A 5E26A 3ZX0A 2IVOA 3A5MC 4BROA 2A5XA 5CE3A 3L0QA 2W40A 4IJAA 3VF2A 3WUHA 2YHYA 4BRAA 1TYQB 4BRIA 3M3ZA 2D0PA 5LJVA 3IDHA 2CGJA 4GY2B 3AAPA 1GLDG 5JICA 4CZHA 3FZFA 3AARA 3O6WA 1NGGA 4K25A 3CJ9A 3LDPA 4K42A 4HWIA 1NGAA 3MMVA 5BRHA 1RDWX 2P9IB 1GLJO 2ZWHA 5B8HA 3ATUA 1S3XA 1JCGA 5AQJA 3GOIA 4A62A 4BGBA 4DB3A 4BR5A 3A5OC 3H1VX 3M1FA 3VEVA 3VETA 4FPAA 4FOEA 2DPNA 1U6ZA 1NGJA 2E2OA 2P9IA 4EHUA 4BVPA 1HJOA 2FSJA 3QB0A 3IFRA 3ULEB 5AQNA 2F9WA 1BU6O 2ZF5O 3LDLA 4BQLA 3WT0A 2QWOA 4JHDA 1K8KB 3KVGA 4RWTA 2HF4A 1BWFO 3BF3A 1WOQA 3CJAA 1QQNA 3L4IA 4AM7A 3CQXA 3CI5A 3ULEA 4I6MB 3HI0A 1DEJA 2I7NA 4XH1A 3DXMB 3VOVA 1K8KA 3J8AA 4Z94A 5AQMA 4B1YB 3O1BA 5JLHA 4BR0A 1SZ2A 1G99A 2Q0RA 4B1UB 2FF6A 4H03B 1V4SA 3VEYA 4I6MA 4FWSA 3DXMA 1CZAN 5JMVA 3KZBA 3QBXA 2IVNA 3QDKA 4BRQA 2P9KA 4BRDA 3FFKB 4BRFA 4FWQA 2ITMA 5EOYA 1YAGA 5AQKA 4QS9A 3O4WA 5ELZA 1T44A 1NGBA 2HMPA 2ZGYA 2CH6A 4BRGA 4WQ5C 3H46O 1HKCA 4B1VA 4H0XB 2IIRA 4EAHD 1NM1A 3MK6A 3FZMA 3TU5A 4IXCA 5AQSA 4MO5A 3KHYA 4FSVA 2QW9A 4EFHA 3UKRB 1E4GT 3EKSA 3F9MA 3MCPA 4BC4A 2QWMA 3FZHA 1DKGD 4FPBA 2CGLA 4PKIA 4WQ5A 4AM6A 3MN7A 4WQ4C 4IJNA 5EX5A 1BG3A 4H5RA 3B8AX 4Y0WA 4F9OA 5ADXA 5AQGA 1Z6RA 3A5NC 4C23A 4RCHA 4DHYA 5KPRA 5AQYA 3DAWA 1SAZA 3O5BA 4WQ4A 3UB5A 2A6AA 4H0PA 1ESVA 3RSEB 4H5TA 3IMXA 2ASOA 4K41A 2YCHA 2FLOA 1H1VA 4J8FA 2GELA 4BC3A 5JLFA 2VCPA 3D2FB 2GUPA 2E20A 5BRDA 1BA1A 4A2AA 3U4LA 1MDUB 2V7ZA 5I9EB 2YJFA 3RSEA 3ZEUB 2E1YA 5BRFA 5F1XA 2PBDA 1GLEG 4JNEA 1IJJA 3ENHA 4BRMA 1QQOA 2GWKA 5AQXA 3WXJA 1C0FA 1NGFA 2D1KA 1LOTB 3G25A 3D2FA 4CBUA 4JN4A 1BA0A 4WYBA 3ATVA 3VENA 3WXKA 3ZETB 4H5WA 3BEXA 4ISEA 3ZEUA 2Q97A 2QWQA 4DCHA 3FZLA 3VESA 3CHWA 3CETA 4JHDB 3BF1A 4CZEA 3C0BA 3ZETA 3D7EO 1MWKA 4FWLA 4CZGA 4JAXA 3DWLA 3L6QA 3LM9A 5ADXH 2J4RA 4M7XA 2CGKA 2V7YA 3CIPA 1Y64A 5AQLA 3VF4A 4L3QA 2D4WA 2YJEA 4PL7A 4FO0A 2EWSA 5AQIA 3A0IX 3W3DA 4BVOA 5F0XA 1GLFO 4E1JA 3WQTA 2NLXA 3ZX3A 3VEXA 5BREA 4BRCA 5E84A 3MDQA 4BRNA 4CZKA 2P9KB 3VGKA 3A8YA 3VERA 4BGAA 2E1ZA 1YXQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E0DA 3SYZA 3AO3A 3R3LA 1ZBUA 4JK9A 3ZCMA 3VQCA 4CZMA 1E3MA 4CEFA 5AZIB 1VQ6N 1RT3A 2FSKA 4FZZA 4RW9A 3OYFA 5LMNK 3CF5L 4H0TB 5HRNA 4W5TA 3TWHA 1S6QA 1RDUA 4CF8A 5AZIA 5EVZA 4DSEA 4QCLA 3WQUA 3LDNA 2NRZA 2ASPA 5FPNA 1P8ZA 4CF9A 1WSEA 2WOMA 1T05A 3VA3A 4ID5A 2HBMA 2RF2A 2ASMA 1FXXA 1XQSC 4UQGA 1MA9B 2AJQA 3UE5A 3VPZA 4FJGA 4OKKA 5AQUA 2YX6A 4U7BA 1ZXOA 1RBTA 4DTSA 4KH6A 3KWIA 1L3TA 4CFDA 2CH5A 4C1NK 3C94A 2E2NA 4DFMA 4CFBA 4KFBA 1NGEA 3THYB 2VWBA 1ASWA 4Z4EA 1QSSA 1RT6A 3VEWA 4JI6K 2PYLA 2GTDA 4IFYA 5AQVA 4JKAA 1YJ9N 3LWLA 4WF9L 1Z25A 3P5JA 2F96A 5AZJB 1OH5A 3AVGA 1RILA 4OPAA 1IBMK 1VSHA 4OGCA 2QI2A 2BDPA 1RNHA 3R8EA 4E7HA 5FROA 5C15A 3O8MA 3R6MA 1EX4A 2HVIA 1C0GA 4DTPA 3TAEA 3O3GA 1HNZK 3FGUA 4FZYA 3HOTA 1U47A 5AZJA 4FWMA 1HX1A 4BG8A 2HNDA 3HTVA 2FXUA 5C2DA 1RDDA 1XC9A 3S9HA 3P39A 3I55N 1JKHA 4DQ8A 1EWQA 2A1RA 3JXUA 4R5PA 2DY4A 3T19A 3ID8A 1TYQA 1U2VB 3NGYA 3ZT3A 4JKFA 3RRGA 3BUZB 3FE1A 3UIQA 3CCVN 5C42A 1NGDA 5C25A 3OA9A 3G6EN 3CCEN 3O9TA 1NGIA 3NHGA 2W6LA 1X9JA 1U2VA 1J9AA 3GBTA 1WSHA 2LSNA 3GE1A 3D0PA 4B1XB 1IH7A 4CFCA 1JL1A 4B8AB 2Y1JA 4FXDA 1ZBFA 1LAVA 2P9UB 1Q8IA 1QZ6A 4MLHA 2Q36A 5SZTA 1OVQA 1R59O 1I39A 4LF7K 2QA4N 2DFEA 4FLTA 4DR6K 2F9TA 3C65A 2E2QA 2P9UA 2HF3A 2D0OA 1JLBA 4GW6A 4CZLA 5BR9A 3EN9A 2VYPA 3V6DA 4NXNK 3CFOA 3L2QA 1D4XA 3QEVA 4H5VA 3QEWA 3RMCA 3AAQA 1N33K 4M41A 4CD3A 3MXMA 3PX6A 4DV0K 3FLCO 1VQNN 3PSFA 4AHCA 1C1AA 3KLIA 4CJRA 4IDHA 4OVLA 3MN6A 1EXQA 3JAMO 3VTIA 3OY9A 1OH7A 3ALYA 3O9UA 4PA1A 4FJ8A 1GLCG 4CJSA 5JS1A 3LAKA 1KXPA 2Y1IA 3HJFA 1X3MA 1TL3A 3AVNA 3UKRA 1VQ4N 1VQMN 2GV9A 4O8KA 2WUSA 1V4TA 5LMUK 2KKZA 3LDOA 4Z0UA 2BTFA 2W41A 1RFQA 3PIPL 4A59A 1QZ5A 3AVMA 4FZXC 3U8XA 2HW3A 3IKMA 5CY4A 1N34K 4A61A 1S72N 3ZX0A 4EZ6A 3ENBA 3L2RA 1K6YA 4B9LA 1YVUA 3KTQA 2W6KA 4YHHK 3V4IA 4B9TA 2YHAA 2D0PA 5JICA 4CZHA 3FZFA 4CF0A 1S1TA 1T03A 2DFHA 2ZWHA 3OYLA 4OJRA 1S3XA 5AQJA 3DLLL 3OJSA 3DLHA 3GOIA 3VQ4A 4DB3A 4ZTFA 3A5OC 1GOCA 3F73A 3VN5A 3K2PA 4ILGB 3VQPA 4EHUA 3QETA 4IFVA 4BVPA 5AJ3K 3HO1A 3HVRA 1HJOA 4NCGA 3E9LA 1QVFM 3ULEB 2F9WA 3LDLA 1EWRA 2QTDA 3M8RA 3KVGA 1IBLK 4OKJA 1FJGK 1JL2A 1NKEA 1XNRK 3L4IA 3KLFA 3U3GA 3CI5A 3ULEA 4I6MB 3K5NA 4KHWA 4Z94A 1TAUA 3HSTB 4GV6A 4H8KA 3CXCM 3O1BA 1HQEA 4O55A 4JKBA 5JVHL 1S9EA 1V4SA 2YHBA 3VEYA 4DFJA 4I6MA 1L3SA 2HHWA 4OKEA 1WN7A 3NF8A 1RTHA 3QDKA 3CFRA 4LSNA 1C1BA 3FFKB 2VWJA 4BRFA 2RN2A 1VQKN 2HHTA 1C0TA 3TI0A 4BRGA 4WQ5C 4WFBL 4FLXA 4NYFA 3SQ1A 3DLEA 4YORA 1LW0A 1NOZA 3TAGA 4H0XB 2IIRA 3FZMA 1X9SA 3HK2A 3V9UA 4IOCL 4O0JA 3F9MA 4NLCA 3FZHA 1DKGD 3OYGA 4PKIA 4M3RA 3HPGA 1Z6RA 1CZ9A 4C23A 4W5RA 4DHYA 4PHTX 5KPRA 4HUGA 3VQEA 5CZ2A 4H0PA 2HHSA 4JI3K 4H5TA 3KJVA 4J2AA 5FRMA 2FLOA 4CCHA 1NKBA 4BC3A 2VCPA 3D2FB 3LAMA 1TAQA 3CMEN 2GUPA 1NKCA 1IG9A 1T3VA 2O8FB 3AA5X 4LF5K 1C0FA 4CBUA 1VSMA 3D2FA 4WFNL 2F8SA 4DUZK 3WXKA 2ITGA 3TAPA 2Q97A 3WXMB 1KC8O 2O8FA 1VSJA 3BGRA 4AHRA 3SAGA 1UAXA 3F2KA 1HR0K 4DU4A 3J7AP 3BF1A 4KTZA 4CZEA 3ZSVA 3TSUA 3DRRA 4FW2A 4JKDA 4DTUA 2G8FA 1Y64A 3OYEA 4A5BA 1BISA 4Y1DA 2NRRA 4L3QA 2D4WA 3HVTA 1S1WA 3ID6A 4M3UA 4OPHA 5F0XA 2X6SA 1GLFO 4DWIA 4JKCA 4C8KA 3U3YA 3RTVA 4CGGA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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