4IXCA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a small molecule activator.
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
447
structure length
443
Chain Sequence
NSQVEQILAEFQLQAADLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHAAASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase isoform 3
publication title Matched triplicate design sets in the optimisation of glucokinase activators maximising medicinal chemistry information content
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 171
structure length 443
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ixcA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4ixcA01
4BRFA 4FWPA 1KXPA 2QWPA 1U2VA 4H0VB 4BRKA 5AQQA 3DWLA 1BO5O 1BG3A 2ASPA 3O80A 4BC5A 2KHOA 4BRAA 5BREA 3ZX2A 2BTFA 4IZ9A 3VERA 1SZ2A 4NO7A 3R8EA 5AFUA 2WUSA 4JD2A 1BDGA 3IDHA 2CGKA 3CHWA 4PKHA 2W40A 4FL9A 4H5TA 4B1ZA 1NWKA 2FXUA 5AQFA 3KZBA 2QM1A 1LCUA 3VEYA 3VEVA 3WXLA 2QWMA 3L6QA 5EOYA 5AZIA 3O1BA 3SMPA 4WQ4C 4M63C 1ATNA 1HKCA 2YI1A 2Q97A 1DEJA 3HBTA 3DAWA 4FWLA 3VF2A 4B1VA 5FPDA 3M6GA 5AQXA 3WEEA 4H5VA 4EAHD 2IIRA 2CH6A 4BG8A 3CJ9A 3GE1A 3CI5A 1U2VB 3ULEB 5AQNA 4BRIA 3O8MA 1QZ6A 1NGFA 1EQYA 3EKUA 3TU5A 4K43A 3HI0A 3ATUA 1NGEA 4CD1A 3H45C 3CJ7A 1MWKA 5AQMA 1E4FT 1T44A 4JD2B 3O6WA 5AZJA 2CH5A 5E84A 3UB5A 5B8HA 1C0FA 4XH5A 2CGJA 1TYQA 3KVGA 5BRHA 5AZIB 2OANA 1KAZA 4BVPA 3FZLA 4C23A 4H03B 5TKYA 1CZAN 2ZWHA 3G25A 4FPAA 3VEOA 3U9ZA 2E88A 5BRFA 2ZGYA 3WQUA 4FOEA 4H0XB 3WEEB 3QBWA 2Q0RA 3ENOA 5I9EB 4L3QA 2P9KB 2E2PA 4K42A 5EXWA 2E2NA 3H1VX 2YJFA 4FPBA 3D2FB 1NGCA 3CJBA 5AQIA 1C0GA 1GLDG 2QWRA 3QFUA 4MO4A 3EKSA 5AQGA 3VEWA 4DQ8A 3SLCA 5AQRA 1ATRA 1Q18A 1GLJO 3SK3A 2E20A 2I7NA 4BRHA 2E8AA 1HKGA 4YDUA 1R59O 1BWFO 1HLUA 2NLXA 4XH4A 5FPNA 2GEMA 4BC3A 1BU6O 2P9UA 4M7XA 3W0LA 2A41A 4BRDA 4EFHA 3WUHA 1YAGA 3QFPA 3UKRA 4A61A 1TYQB 2ASOA 4GNIA 3QDKA 4NB4A 3CQYA 5JLFA 2Q0UA 4O5FA 5F2RA 5BN8A 2VYPA 2PAVA 4QS8A 4A2AA 3ZX3A 3ULEA 4H0YB 1IG8A 1ATSA 3VEXA 5ADXA 4BR7A 1ZXOA 4FWSA 2GELA 4PL8A 3H3OB 1NGHA 1YUWA 2HOEA 3CETA 3DXKA 4B1WB 1WOQA 4IJNA 2YCHA 1E4GT 4KBOA 3WT0A 2AA4A 2E1YA 2QWQA 2FSNA 1NMDA 4H0TB 1YXQA 4EHTA 3DJCA 1NGIA 2P9UB 3L4IA 1ESVA 1GLAG 2GWJA 4PKGA 3UKRB 3UKUA 3HM8A 4K25A 4BR2A 4CBXA 2HF4A 4ISGA 1Y64A 5AQUA 3LDNA 1ZBSA 3W3DA 4HWIA 3GDQA 3P4IA 1P8ZA 2YHYA 1NM1A 1JCEA 1YVNA 4IWVA 4CD3A 5AQVA 4B9QA 4XH1A 4FWRA 1Z6RA 2I7PA 1RFQA 3QMLA 4IJAA 5EVZA 4FO0A 2P9KA 2Q1NA 3HTVA 3RSEA 2QXLA 4PKIA 5JICA 3D2FA 3CQXA 3ZEUA 4BREA 4YDUC 1ZC6A 2P9IA 4J8FA 3VOVA 1BUPA 1HPMA 4AM6A 4LC9B 3MMVA 5KPRA 3H46O 2CGLA 4BG9A 5F0XA 4CZLA 4FOIA 3DXKB 2GUPA 4CZKA 5AQJA 5BRDA 1XUPO 3H1QA 3R6MA 3MN6A 1GLCG 3QB0A 2AP1A 3A0IX 4JNEA 5EX5A 1DGKN 4CZHA 2P9SA 4BRNA 3O5BA 2VCPA 1X9JA 4PL7A 2NRHA 3UKUB 4K41A 4DHYA 2YHWA 4BR4A 2D1KA 1G99A 1NBWA 3MK6A 4CBWA 1J6ZA 4CJ7A 5AQOA 2ITMA 1Z05A 3O1WA 4FWKA 4H0OA 5LJVA 3WXIA 4WQ5A 3FZFA 2GWKA 1HUXA 2V7ZA 1QQMA 3A8YA 1OKJA 3LM2A 3RSEB 4MLHA 2E2OA 4CBUA 2QWOA 4FWOA 2F9WA 4ISFA 3ID8A 3GL1A 3J8AA 3ZEUB 4XEIA 3IMXA 4DB3A 4EIAA 2P9IB 3MN5A 3VF4A 4H5WA 1HJOA 3MDQA 1MDUB 5E26A 3A5NC 4CZJA 4FWQA 5AQPA 1K8KB 4BRQA 3B8AX 2QW9A 3FLCO 1IJJA 2P9LA 4EHUA 5AQYA 3BEXA 2A3ZA 2P9SB 2W41A 3JXUA 5KQDA 2VWBA 4E1JA 3EL2A 3M3ZA 1HKBA 4FWNA 2NZTA 3VGKA 4B1YB 3EO3A 1QZ5A 3C0BA 3BUZB 3OHRA 5LJWA 3ATVA 3L0QA 2UYTA 3LDOA 3CIPA 2YJEA 3D7EO 1NGJA 3C7NA 5AR0A 1JCGA 4FWMA 5AQZA 3VGMA 3FE1A 3D2EA 1H1VA 3JS6A 1BA1A 3BF3A 3FGUA 4F9OA 2FF3B 3VETA 3SJHA 1D4XA 4AM7A 2E1ZA 3KHYA 2D0PA 4BRMA 1QHAA 2FSKA 2Q2RA 2V51B 3EZWA 3O08A 2Q31A 3FR0A 1TUUA 2V7YA 4CI6A 2P9PA 1NGGA 5BPLA 2P9LB 2DPNA 5LY3A 2IVOA 4BRCA 4JN4A 3QICA 1HX1A 4O8KA 4BR0A 5FPEA 1LOTB 4H0PA 5ELZA 4B1XB 3AAPA 4WQ5C 4BR5A 4BVOA 1V4SA 1T6CA 1QQNA 1DKGD 1X3MA 3LDLA 5KPTA 1KAXA 4CZGA 3AY9A 3SMSA 3ENHA 3IFRA 2V52B 1NGAA 1U6ZA 4A2BA 3FZKA 4CZIA 1GLFO 3I33A 3EN9A 3VF6A 4BRGA 3C7NB 4HTLA 3O4WA 5CE3A 1S22A 3D2EB 5FPMA 1SAZA 2HMPA 4BC2A 3A5MC 4Z94A 3LL3A 4JAXA 4FSVA 5BPMA 1S3XA 5KQ8A 4WYBA 3DXMB 5JLHA 4H5RA 4QS9A 4BGAA 3I8BA 2A40A 1K8KA 3IUCA 4BQZA 3VGLA 3GOIA 4BQLA 2P9NA 4GY2B 1XC3A 1NGDA 5AQKA 1SQKA 2F9TA 2FF6A 4H5NA 4BGBA 3F9MA 3AARA 3MCPA 2P9PB 2D4WA 5AQSA 3FFKB 2D0OA 3UE5A 5AQWA 4M7YA 5EY4A 2ZGZA 3S41A 3TPQA 3R9PA 2QWLA 1NGBA 1XQSC 3MN9A 3AAQA 4I6MA 1GLBG 4MLEA 5ADXH 3WQTA 4RCHA 4BRPA 1TUYA 3LDPA 4Y0WA 5AFUH 3LDQA 4JHDA 4BC4A 2IVNA 4A62A 3H3NO 3CJAA 2FLOA 5BN9A 4CZEA 4CZFA 4ISEA 3LM9A 3WXKA 3A5OC 2PBDA 3CJCA 3ZETA 3QBXA 3GG4A 3M1FA 3CERA 1BOTO 4WQ4A 5JMVA 2H3GX 1GLEG 1WUAA 4DCHA 3FZHA 1RDWX 4MO5A 5AQTA 3VEZA 2P9NB 1QQOA 3VESA 4QS7A 4IXCA 5AQLA 2Q36A 3GBTA 2HF3A 2YHXA 3FZMA 3HZ6A 4BR9A 1NLVA 4B1UB 4RTFD 1GLLO 2ZF5O 3HSCA 1V4TA 2QWNA 2EWSA 2E2QA 4I6MB 4RWTA 2GTDA 3BF1A 1RGIA 2FSJA 1BA0A 2ASMA 5AZJB 3U4LA 3BP8A 2IVPA 3CJ1A 3VPZA 1MWMA 4BRLA 3VENA 4JHDB 3U9DA 5KPZA 3A5LC 2A5XA 4IO8A 1KAYA 2J4RA 5F1XA 1X3NA 3H6EA 1MA9B 3WXJA 5AQHA 2A6AA 3MN7A 3DXMA 2BUPA 4CZMA 3U8XA 2A42A 3ZETB 3ZX0A 4BROA 1JCFA 5BPNA 5BR9A 1T6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRFA 2VG6A 1KXPA 3OYEA 3KK2A 3P1GA 4C1NK 4QCLA 3F5TA 2UXCK 5AQQA 3DWLA 1BG3A 2Y1IA 2RPIA 2B6AA 5BREA 1LWEA 5BR8K 1I3AA 2B4JA 3ISNC 2Q3SA 4M3RA 2WUSA 4JD2A 2W40A 4B1ZA 3AVLA 5M1FA 2FXUA 3KZBA 2QM1A 4KH4A 1NK9A 3OJUA 1KVCA 4KTQA 2UUBK 1S1TA 2FBVA 5AZIA 2F7TA 1VQ5N 2O8CA 1EWRA 1HKCA 5J2NA 2G8KA 1DEJA 3HBTA 5AJ3K 4FWLA 1QS4A 4JI6K 4B1VA 2Z1GA 3LALA 4BDZA 3M6GA 3M8PA 4BG8A 4DV3K 3DOKA 1HYVA 3GE1A 4DV6K 2HVIA 1W0HA 1NK0A 3AGRA 3DLRA 1NGFA 3ZCMA 3ATUA 4DV5K 3CCVN 2OTLN 2QEXN 2QKKA 3NVMA 1NKBA 4FLVA 1RDBA 1SL0A 4M3YA 4JD2B 4LF5K 1RT6A 3O6WA 2CH5A 3VA0A 3C6UA 4A5BA 1M1KO 4Q5VA 1VRTA 3LP2A 3PIPL 1TYQA 3KVGA 3DLBA 4LY7A 1IO2A 5AZIB 1KAZA 1IKVA 3FZLA 2O8CB 4C23A 2NRVA 4H03B 5TKYA 3TAEA 1JLQA 4FPAA 3L2VA 2E88A 5BRFA 4K8ZA 4RW8A 3G10A 1JKHA 3KLHA 3QBWA 3TANA 1TKZA 3C6AA 5I9EB 4OLBA 4L3QA 2P9KB 4CGJA 2JWKA 4FVUA 3O3HA 4CFCA 1KSPA 3NFAA 1VQ6N 2Z1JA 1GLDG 2QWRA 3V1OA 3VEWA 4W5NA 3OYNA 4BRHA 2I7NA 2HB5A 1HKGA 1EO1A 1VQON 4DFKA 4DR2K 2IDOA 4BC3A 4JRPA 4IDHA 3W0LA 2A41A 4BRDA 4YOVA 1TYQB 3AVIA 3SQ4A 4GNIA 3I0SA 4NB4A 3FFIA 3CQYA 4CJPA 5IT9O 1JL1A 3PSFA 5GAHP 1YJNN 1HNWK 2VYPA 4W5TA 3QNOA 2Z1HA 4N47A 4DFJA 5K14A 3CC2N 3ULEA 1ASUA 5CY4A 3KD1E 1CZBA 3E9OA 4FLZA 1X1PA 4BR7A 5IWAK 4FWSA 3S3NA 3LZIA 4DSKA 2GELA 4IBNA 3NDKA 3CETA 4CJUA 4IJNA 2XY8A 2YCHA 3EE8A 2AA4A 4G9ZA 2QWQA 3OYHA 1NGIA 3VQ6A 4PKGA 3SUOA 1U49A 4FK0A 3K59A 4C8LA 3M8QA 3THWA 3Q7CA 1R0AA 1G15A 5AQUA 3LDNA 3KK3A 1HNZK 5CZ1A 4JI7K 4NCAA 4BWMA 1B92A 1NM1A 1JCEA 4JLHA 4B9QA 3AO3A 1L3TA 2I7PA 3QMLA 1NJWA 4FO0A 3HM9A 1RILA 3AA2A 3OW2M 4DSFA 3RSEA 4PKIA 4E0DA 2QKBA 1NJIO 5JICA 1DT9A 2XO7A 4JI4K 2P9IA 4J8FA 3VOVA 1BUPA 3KK1A 2O4GA 4FK4A 4YHHK 3AGKA 1C0UA 2CGLA 3AVFA 4CZLA 3VMFB 1TL1A 2GUPA 3J7AP 5AQJA 3H1QA 3R6MA 4GKKK 4DR7K 4W5OA 1BL3A 3T7ZA 1NMNA 3QB0A 3A0IX 3ZSWA 2W42A 3F73A 4K0KK 3CCUN 2P9SA 3T1HK 1KC8O 2VCPA 4J2DA 3BY5A 3CFOA 2NRHA 4K41A 4DHYA 2BH1A 3THWB 2IAJA 4IDKA 4DKWA 4U67L 1O13A 3O3FA 1J6ZA 3CXCM 4FLUA 2KZMA 3WNEA 5MLCQ 4FJ7A 2G8UA 4OPJA 3RSEB 4MLHA 4CIGA 4ISFA 1YJ9N 4LF9K 3ID8A 4ELTA 1YVUA 1UA0A 1S6PA 2P9IB 1WBDA 3AVKA 2JWLA 5DMRA 3VF4A 1HJOA 1MDUB 5M1PA 5E26A 3A5NC 3H08A 4FWQA 1K8KB 4BRQA 4NCBA 4HCBA 2O8FA 3AVCA 4DS4A 1RDAA 2NNWA 3O4NA 2P9SB 2HNYA 2VWBA 1NJXA 3P83D 1HKBA 4LSLA 4FWNA 1FKOA 4F3OA 4B1YB 4RG8A 4KHUA 2F8TA 4FJIA 4OO1J 3L4QA 4B3MK 5SWMA 3BZKA 4DQSA 2XHBA 3ALYA 4B9TA 1FW6A 3VGMA 1JCGA 3EYZA 3FE1A 3MX5A 4IG3A 4ILHA 3BF3A 3T1YK 2O8EB 2RN2A 3SJHA 1D4XA 1RT3A 4OPAA 2OPQA 4AM7A 3LWMA 4QAGA 2ZD1A 4JKCA 2HBJA 4FZZA 3QEVA 2G8FA 1JLEA 4GV3A 1DTQA 5KRSA 2O8FB 3A2FA 3QIOA 3ZT3A 4W5RA 2VWJA 4B9NA 4BRCA 3OY9A 1RDCA 3DLEA 3CD6N 4J2AA 4CF2A 4O0IA 3CCRN 4H0PA 1RTJA 4AF1A 3QETA 1KAXA 1VSHA 1VSEA 3HPOA 2PY5A 2G8IA 3EE9A 3SPZA 4IOCL 3IFRA 5KI6A 1T7PA 2D0BA 1U6ZA 1C6VA 3V9UA 3EN9A 3O4WA 3VQQA 1SAZA 2VQEK 2ATQA 1RTIA 3LL3A 5BPMA 5KQ8A 1S3XA 4C8MA 3SBGA 3N4PA 4DTNA 3THYA 1J53A 2YNIA 3CM5A 1JLCA 3VGLA 3GOIA 4BQLA 2P9NA 3SNNA 4GY2B 2OTJN 1NGDA 1S1VA 3DLHA 4DMNA 1SQKA 2FF6A 1L5UA 4BGBA 4FJLA 3AARA 3SPYA 3RR7A 3EZ5A 4WF9L 3K5NA 4JS5A 3S3MA 4C8NA 3UE5A 3ENBA 4M7YA 3JYTA 3TPQA 1NGBA 3S3OA 3AAQA 5DM7L 4MLEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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