4H5NA

Hsc70 nbd with po4, na, cl
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
b'KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 120
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5nA04
1ATRA 5F2RA 1ZXOA 2NLXA 4WQ5A 1HJOA 3VOVA 2A42A 1X3NA 3ZETA 3FZLA 3EL2A 2E2NA 3R9PA 1LOTB 3R8EA 3BUZB 3BF1A 4H0PA 4B1UB 5AQZA 4H5VA 3VEWA 1GLCG 4NO7A 3FLCO 3WUHA 3W0LA 1HUXA 3FE1A 5AQTA 2Q0RA 4PKIA 3IUCA 2E88A 4FWLA 4L3QA 4MO5A 2QWQA 1HKBA 4BRDA 3QBXA 4IWVA 3W3DA 3JS6A 1KAZA 4GY2B 1RDWX 4IZ9A 1BA1A 4PL7A 5AQYA 2VCPA 4EHUA 5AQUA 3QMLA 3O5BA 2GUPA 4DB3A 5AQSA 1V4TA 3EKUA 4WQ4A 5TKYA 2P9LB 5AQXA 4XEIA 4A2BA 3O8MA 3A0IX 4JHDA 3D2FA 3MDQA 1YUWA 3GG4A 1G99A 1HKGA 5FPNA 4DCHA 1U2VA 4BRLA 2I7PA 4FWPA 1QQMA 4H0YB 5AQLA 4BRAA 1WUAA 3ULEB 2UYTA 4FPAA 3C7NB 2AA4A 4FWRA 4E1JA 3MN5A 5FPMA 3QFUA 4KBOA 5F0XA 4CZGA 4CZIA 1GLAG 2FSJA 2E1YA 3MMVA 1V4SA 5AZJB 2V51B 3LDNA 2Q1NA 3SLCA 4FWOA 3QDKA 3H45C 3ENHA 3ZEUB 3UB5A 4CI6A 1X9JA 4BQZA 2CH6A 5AQRA 4H5WA 1P8ZA 1SQKA 3WXJA 2QM1A 4FWQA 4BRKA 3CJAA 1DKGD 2ASOA 4BC4A 3MK6A 4XH1A 3CJ1A 4B1XB 4BQLA 5FPEA 4EIAA 4BR7A 4YDUC 1S22A 4H03B 2FXUA 4JAXA 3L4IA 2YHYA 1NLVA 4QS7A 4FOIA 4CZMA 3H1VX 3SMSA 2P9LA 4QS8A 3UE5A 3VF4A 3L0QA 3HSCA 5EVZA 2PAVA 1JCEA 5I9EB 2YCHA 3EZWA 3KZBA 2IVPA 4K41A 1BO5O 5B8HA 2EWSA 3AAQA 2CGKA 2I7NA 2QWNA 1YVNA 4PKGA 2V7YA 3UKUB 3CJ7A 2A41A 5AQGA 3S41A 4BRGA 4WYBA 4K43A 4CZFA 3WQUA 3C7NA 4ISFA 2ITMA 3HTVA 4MLEA 3BF3A 1QQOA 1QZ6A 4BRNA 1HLUA 2GWKA 1KXPA 3A8YA 4WQ5C 1Y64A 5AZJA 4CBXA 4CBUA 1QQNA 4CD3A 3GDQA 3O08A 3U9DA 3I33A 3IFRA 4MO4A 4QS9A 3EO3A 5E26A 1NGBA 1U6ZA 3ZEUA 3FGUA 4BGBA 3HI0A 3VGMA 4BR9A 5BPMA 4FSVA 3A5NC 5AQWA 4H5NA 2QW9A 3D2EB 3O4WA 5JICA 2A3ZA 4Y0WA 3QFPA 5AQIA 5AQOA 3O80A 1NGCA 2DPNA 1IJJA 3LM2A 1D4XA 3GL1A 1HPMA 1Q18A 1KAXA 1SZ2A 3FZFA 3QB0A 5BRDA 3VENA 3RSEB 2D0PA 4BC5A 5AQNA 5KPTA 3A5OC 3WEEB 4WQ4C 3M6GA 3O1BA 3FZHA 1JCGA 3ID8A 3CJ9A 5JLHA 1NWKA 2Q2RA 4EAHD 1ATNA 3D7EO 4IO8A 4JD2B 2E2OA 4IJNA 4RTFD 3ZX2A 3J8AA 3UKUA 1GLLO 5AQKA 1X3MA 5ADXA 3TPQA 3VF2A 4Z94A 5KQ8A 5KQDA 5AQHA 1BU6O 4BRCA 2NZTA 4BROA 3LL3A 3O6WA 3WXLA 2H3GX 3O1WA 1S3XA 4H5TA 4O8KA 1MWMA 4O5FA 4RCHA 4BC3A 1WOQA 4FWSA 1DGKN 3A5LC 3MN7A 4A61A 3VEVA 5AQVA 3FZMA 4M7YA 4H0XB 2QWLA 4JN4A 5JMVA 3KHYA 5EX5A 4FWKA 3VF6A 5KPRA 4CD1A 3WXKA 3GOIA 3DXMB 3SK3A 3D2EA 2QXLA 2HF3A 3DXKB 4M63C 3MN9A 1NMDA 3DAWA 4PKHA 4CBWA 1NGGA 3VEZA 2BTFA 5LY3A 1GLDG 4B9QA 1T6DA 4B1ZA 1MDUB 2FLOA 3H46O 3WEEA 3KVGA 3L6QA 1GLBG 4CZEA 4JNEA 4ISGA 1NGHA 3LDPA 3JXUA 3UKRB 3VEYA 1QZ5A 4BGAA 4JD2A 5CE3A 2F9TA 2J4RA 1NGJA 3HZ6A 1ESVA 2P9NB 1DEJA 3DWLA 1BDGA 3BEXA 4AM6A 3VERA 3LM9A 5BPNA 1XQSC 4H5RA 5BRFA 4IXCA 4CZJA 3GE1A 1YXQA 3MN6A 2W40A 1K8KB 1HKCA 2AP1A 3OHRA 1MA9B 3FZKA 2E1ZA 3ULEA 1YAGA 2E2PA 3H1QA 2OANA 2FSNA 1E4GT 1RFQA 2ASMA 3SJHA 2IIRA 3AARA 4CJ7A 3F9MA 4BG9A 4BRHA 3CIPA 4BR4A 3CETA 2D4WA 3QBWA 4DHYA 3DXMA 1TUUA 1H1VA 1XC3A 3CJBA 3GBTA 1GLFO 2ASPA 2P9PB 4F9OA 1LCUA 2D1KA 3DXKA 2E2QA 5ELZA 2QWOA 5AR0A 1R59O 3U8XA 3WT0A 3IDHA 1EQYA 2CGLA 2WUSA 3AAPA 4FOEA 5AZIB 5KPZA 1NGEA 1NBWA 3VETA 5FPDA 3G25A 4HTLA 4A62A 3U9ZA 4XH4A 3VGKA 2ZWHA 4ISEA 4B1YB 5AQQA 1BA0A 5BR9A 4XH5A 2ZF5O 3UKRA 3VPZA 1NGFA 3WXIA 2HF4A 5F1XA 1TYQB 4I6MB 4CZKA 4H0VB 2P9NA 4FO0A 2P9UB 3MCPA 3BP8A 4BRIA 2GTDA 2Q0UA 2VWBA 4CZLA 4RWTA 3ATUA 4BRMA 2D0OA 2P9SB 1MWKA 3ZX3A 5BN8A 2QWMA 1K8KA 4BVOA 5AQJA 1BOTO 3EKSA 5EOYA 3WQTA 1J6ZA 5AFUA 1SAZA 2P9KB 4BRFA 5AQPA 1GLEG 1QHAA 4IJAA 1GLJO 2HMPA 3VESA 4BR2A 3B8AX 2CGJA 1XUPO 2YI1A 4A2AA 3SMPA 2YJEA 1ATSA 5AQMA 1Z6RA 1C0FA 2GEMA 4BG8A 2YHXA 5BN9A 2Q97A 1OKJA 4HWIA 1BUPA 4BC2A 2GWJA 3IMXA 2P9PA 4H0OA 4FL9A 1RGIA 2ZGZA 2P9IB 4K42A 3HBTA 5AQFA 1T6CA 1NGIA 1CZAN 1JCFA 1IG8A 5BREA 4MLHA 1BWFO 5AZIA 4BREA 3R6MA 3I8BA 2E8AA 4DQ8A 1HX1A 4BR5A 4C23A 3ZX0A 3CHWA 4FWMA 3H3OB 2A40A 2CH5A 3VEXA 4H0TB 2V52B 3DJCA 3ATVA 1TYQA 4I6MA 3RSEA 2FSKA 3A5MC 3CERA 2P9UA 3CI5A 3P4IA 5BPLA 2IVNA 4EFHA 1Z05A 3CQYA 2P9SA 3ZETB 1T44A 1BG3A 3FFKB 3LDQA 2IVOA 3LDLA 2F9WA 2PBDA 3C0BA 2QWRA 4J8FA 3VEOA 5AFUH 3FR0A 5ADXH 1NGDA 1TUYA 2KHOA 5BRHA 2P9KA 5LJVA 3QICA 3EN9A 3U4LA 2W41A 2HOEA 2FF3B 3VGLA 3AY9A 1C0GA 3ENOA 4YDUA 5E84A 4FPBA 2Q36A 2E20A 3CQXA 5EY4A 4BRQA 2V7ZA 4AM7A 4BRPA 3H3NO 3M1FA 4GNIA 2YHWA 2YJFA 4EHTA 1ZBSA 4K25A 4PL8A 1ZC6A 2Q31A 4CZHA 4LC9B 3M3ZA 2A5XA 2P9IA 4BR0A 4BVPA 5LJWA 4NB4A 2QWPA 2GELA 1E4FT 1NM1A 4B1VA 4JHDB 2BUPA 3D2FB 5EXWA 1NGAA 5JLFA 1U2VB 2A6AA 3HM8A 4M7XA 2ZGYA 1KAYA 3H6EA 2VYPA 2NRHA 3LDOA 4FWNA 3CJCA 3TU5A 2FF6A 4B1WB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XHZA 1ATRA 3J81O 1IV0A 1HYSA 1TKTA 3G10A 2UUBK 1U48A 3PO5A 3ZETA 4RW7A 3R8EA 3WNHA 4CEZA 4G1QA 3TARA 2OZSA 1GPSA 3HP9A 3VEWA 4NO7A 2GBZA 3WUHA 4YOXA 5AQTA 3K9JA 3R1XA 1I6FA 2N66A 4DQPA 3J80O 4GY2B 4YOUA 4DLGA 4U67L 1CLQA 1XWLA 2VG7A 1BA1A 4AHCA 3O5BA 3QMLA 4CGGA 1JL1A 1VSFA 1V4TA 4WQ4A 3F9KA 5AQXA 4XEIA 4YOVA 3QEWA 3RTVA 2UXBK 1W2BM 4DSEA 4WFAL 3A0IX 2SN3A 4BE2A 5FPNA 1NK7A 4IEIA 5M1OA 1QQMA 3SJJA 5AQLA 3E1YA 2HMIA 2O8EB 4B9TA 4DV7K 2E5LK 4O4GA 3LPTA 4FWRA 3MCAB 1ZBFA 3VQQA 4NCAA 3KP0A 4KBOA 4DV4K 4UJ0A 3JYTA 3K5NA 1JLCA 3KK1A 3PX6A 2FSJA 4PQUA 2OA8A 3MMVA 4IEEA 5AZJB 1FKOA 2Q1NA 3I0SA 3CC7N 3C65A 3DRPA 5DM6L 2ZJPL 2ZM6K 4CGJA 3QEIA 3KLIA 1QE1A 1B92A 4HE7A 1KC8O 3ZT1A 2YNIA 1TAQA 5AQRA 2LI7A 4H5WA 4DTNA 3HL8A 4FWQA 1A5XA 3M8SA 4ILHA 3CJ1A 4FJLA 3WNFA 1JLBA 4EIAA 4ELVA 4FLVA 4JI1K 2FXUA 3HRGA 2YHYA 2BH1A 1YF5L 2LY5A 4DUYK 3UE5A 3V1RA 3TAEA 4YY3K 3RRGA 1C1AA 5I9EB 2JLEA 4CJTA 4F3OA 2YCHA 5J1EA 3KZBA 5B8HA 4DTOA 1S1XA 3AAQA 1N34K 2QWNA 4V19S 4Z4CA 3UKUB 2A41A 3OYFA 2NRRA 1BL3A 3OYAA 4K43A 4LY7A 3C7NA 2PYJA 2O8FA 1NK0A 1BCGA 2UXDK 2UUAK 3HTVA 1BCOA 2P5OA 1QQOA 1IKYA 1QZ6A 2RHKA 5CZ1A 4BRNA 3G71N 4UAFE 1CZ9A 1Y64A 2DFEA 3AO2A 1QQNA 1NJXA 4OPKA 5FRNA 3EYZA 3U9DA 3AO3A 3NVKA 3I33A 4FJ7A 1RDBA 3LP1A 3LP0A 1SKSA 1U6ZA 2WONA 3L3UA 3L2WA 3ZEUA 4CIEA 1L3SA 3QEPA 3IKMA 5BPMA 1WSIA 4E7JA 4CESA 4JKCA 4Y0WA 3T7ZA 3AA4A 3QIOA 5AQOA 2A1RA 3OYCA 2VG6A 5A2QO 4I7FA 4C1NI 3GL1A 2NRXA 3FZFA 4FW2A 3RR8A 4OVLA 3VENA 2W00A 2G8IA 4BDZA 3A5OC 2KSKA 4WQ4C 4DUZK 1XNRK 1VQ7N 4IO8A 4CK1A 3KLFA 3QETA 4JK9A 4KB1A 2KFNA 1POIA 3BZKA 4DV2K 2RKIA 5AQKA 4JV5K 3ID6A 4DKWA 3TPQA 5KQ8A 4O0JA 1JXEA 3AO4A 4DF8A 3RMCA 1WWNA 1BU6O 4A5BA 3T69A 4WCEL 3M8PA 3CM6A 4O8UA 2G8UA 4O8KA 4Z4GA 1SUQA 3KHWA 3TAQA 1WSEA 4J2AA 4PUOA 1DGKN 4FM1A 4KKOA 1WBDA 2QWLA 1K6YA 3VF6A 1KTQA 3ZT4A 4IOXA 3OYHA 1JLFA 3MXMA 4WFBL 1DTQA 2XY7A 1LQIA 4DTXA 3NH2A 2DY4A 2G8VA 3SF4D 3T19A 3S5TA 3MN9A 1RBUA 4DV1K 1HRHA 4HCBA 2E4LA 4R5PA 1NE5A 1NH5A 1ASWA 3H46O 4CHNA 1EKEA 4RW9A 1NGHA 2IGIA 4IO9L 3T1YK 4JI2K 1RT2A 5CE3A 1L3TA 2J4RA 1Q8IA 4FJIA 4DU1A 4DV0K 4FJHA 3DWLA 3V9XA 1BDGA 3BEXA 4CJQA 4M3XA 5BPNA 4E0DA 1XQSC 4DU3A 1HYVA 4DSFA 2W40A 1TAUA 1YT3A 3OHRA 4IDHA 4YOTA 1S9EA 1ZVEA 4GW6A 4CQKA 4KHPK 3C6HA 2OANA 2YEOA 2JWKA 2OTLN 3U3GA 4GKKK 3SJHA 3OTOK 1NRBA 3K5OA 1RDCA 3JSMA 2ZE2A 1TI5A 2Z1GA 4BR4A 4X66K 3HSTB 1CXQA 4B9UA 2FC0A 2P9PB 3NDKA 2GV9A 4ILJA 4HUEA 3DXKA 3U8XA 1TL3A 5AR0A 5FROA 5GINA 4KTWA 5KTQA 5DMRA 4DR3K 4Q0BA 2CGLA 3OYKA 2W6KA 4ZTFA 1NGEA 1NBWA 1QVGM 4XH4A 4CF9A 4FLZA 3AVAA 2Y1IA 4JYAK 4FK2A 5JS2A 4DR6K 4XH5A 4J2DA 3NGZA 3K2PA 3WXIA 1LQQA 1TYQB 1BMRA 2OPPA 5FRMA 1VAZA 4CJEA 2DFHA 4JI5K 1S6QA 2GTDA 4B3TK 4EZ6A 5CZ2A 4BRMA 4NXMK 4R79A 4DR1K 3S3NA 1J53A 1K8KA 4BVOA 3DLEA 3WQTA 3S3MA 1T8EA 4DV3K 3SAFA 4BRFA 3VESA 1GLJO 2HMPA 1L3VA 2B3CA 1W7AA 1RDAA 1XUPO 2XY8A 1ATSA 1C56A 1I39A 4V1DC 4HUGA 3G4SN 3CPEA 3TTCA 4CEBA 1RBVA 1TGOA 1ZU3A 4LF5K 3V1OA 5E41A 4H0OA 1HPZA 4FL9A 1RGIA 2HNYA 1WAJA 2X6NA 3QINA 4CK3A 4KB0A 5AQFA 2DTUA 1M1KO 1T6CA 3E66A 2GMOA 3DLKA 1BWFO 1BIUA 5C10A 4BREA 4C8KA 4DQ8A 2HHXA 2F7TA 2O8DA 4JKDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XHZ A;  1ATR A;  3J81 O;  1IV0 A;  1HYS A;  1TKT A;  3G10 A;  2UUB K;  1U48 A;  3PO5 A;  3ZET A;  4RW7 A;  3R8E A;  3WNH A;  4CEZ A;  4G1Q A;  3TAR A;  2OZS A;  1GPS A;  3HP9 A;  3VEW A;  4NO7 A;  2GBZ A;  3WUH A;  4YOX A;  5AQT A;  3K9J A;  3R1X A;  1I6F A;  2N66 A;  4DQP A;  3J80 O;  4GY2 B;  4YOU A;  4DLG A;  4U67 L;  1CLQ A;  1XWL A;  2VG7 A;  1BA1 A;  4AHC A;  3O5B A;  3QML A;  4CGG A;  1JL1 A;  1VSF A;  1V4T A;  4WQ4 A;  3F9K A;  5AQX A;  4XEI A;  4YOV A;  3QEW A;  3RTV A;  2UXB K;  1W2B M;  4DSE A;  4WFA L;  3A0I X;  2SN3 A;  4BE2 A;  5FPN A;  1NK7 A;  4IEI A;  5M1O A;  1QQM A;  3SJJ A;  5AQL A;  3E1Y A;  2HMI A;  2O8E B;  4B9T A;  4DV7 K;  2E5L K;  4O4G A;  3LPT A;  4FWR A;  3MCA B;  1ZBF A;  3VQQ A;  4NCA A;  3KP0 A;  4KBO A;  4DV4 K;  4UJ0 A;  3JYT A;  3K5N A;  1JLC A;  3KK1 A;  3PX6 A;  2FSJ A;  4PQU A;  2OA8 A;  3MMV A;  4IEE A;  5AZJ B;  1FKO A;  2Q1N A;  3I0S A;  3CC7 N;  3C65 A;  3DRP A;  5DM6 L;  2ZJP L;  2ZM6 K;  4CGJ A;  3QEI A;  3KLI A;  1QE1 A;  1B92 A;  4HE7 A;  1KC8 O; 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