4H5NA

Hsc70 nbd with po4, na, cl
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 120
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5nA04
2ASPA 3H46O 3LDQA 1P8ZA 1MWMA 5BRDA 2P9SB 3LDOA 1BG3A 4PKGA 2Q1NA 3CJ9A 1ATNA 5AQMA 1KAZA 5AQOA 4BRKA 4K25A 5KPRA 3VETA 1OKJA 2A41A 2CH5A 3VEXA 1NMDA 3BF1A 4CZEA 2F9TA 2AP1A 2P9LB 4FWNA 4J8FA 3VERA 3B8AX 4MO5A 5B8HA 3L4IA 1IG8A 3L0QA 3ATUA 2J4RA 2ASMA 3I33A 3IFRA 3JXUA 3CQXA 3LM2A 4M63C 3AAPA 3UB5A 3GG4A 1E4FT 5TKYA 1MDUB 5ADXA 3JS6A 1DEJA 3CJBA 1ZBSA 3MDQA 2IVNA 1GLAG 5ELZA 1DKGD 2P9NB 1T6CA 3KVGA 2BUPA 2QWMA 3EKSA 2P9UA 3VEYA 3UE5A 2YJFA 4Z94A 3FZLA 1U6ZA 2E2QA 3O80A 4JHDB 1XUPO 2YHYA 3TU5A 4Y0WA 3CI5A 1D4XA 4WYBA 1YAGA 2FF6A 3WQUA 1RFQA 4I6MB 3D2FA 4BRAA 1X3NA 3J8AA 4O5FA 1NGCA 2YJEA 4B1ZA 3HTVA 4FOIA 1XC3A 4BRQA 3UKRB 3VEWA 3FZKA 3MMVA 2H3GX 3HM8A 5AQZA 1K8KA 3LDLA 3GE1A 4AM7A 5I9EB 4FWQA 4BRGA 4PL8A 5FPEA 3FFKB 4CD3A 4CZGA 2ZGYA 4BRFA 1T6DA 3ENHA 2GUPA 1S22A 4H0VB 3L6QA 2KHOA 1BU6O 2FSJA 2PAVA 4FOEA 4IJAA 4WQ5C 1HJOA 1NM1A 5ADXH 5JLHA 2VCPA 3IDHA 3HI0A 1SAZA 4FO0A 1WUAA 2P9KA 3O4WA 3QMLA 4BRPA 4BRLA 5AR0A 3H3NO 3WEEA 4DCHA 4BROA 4FL9A 4BQLA 4CJ7A 4FWKA 1GLFO 3KHYA 2CGJA 5BN9A 1GLCG 1YXQA 3O8MA 3VOVA 4B1UB 3H1QA 2VWBA 3M1FA 4WQ4C 2VYPA 4BR7A 3G25A 3DXMB 2QWNA 2HF3A 5AQWA 2I7PA 4BGAA 4A62A 4A2AA 5BREA 5AZJB 1NGBA 3DXKB 5JMVA 4BRHA 4IZ9A 3QB0A 5AQIA 3WUHA 3FGUA 4RCHA 3CERA 4HWIA 2P9IA 2HF4A 3GL1A 2FLOA 2GTDA 1NGEA 1IJJA 2QWQA 5F2RA 2V7YA 2A42A 2FSKA 2I7NA 3QDKA 2P9IB 5F0XA 5E84A 3H1VX 3DWLA 2IVOA 3MK6A 3A5OC 3VGMA 2GEMA 1S3XA 4O8KA 4BR0A 2GELA 3IMXA 4EAHD 2ZWHA 1Z05A 3EKUA 5BRHA 3BUZB 3F9MA 3O08A 3U9DA 1QZ5A 1CZAN 2PBDA 3P4IA 4B1XB 2E1ZA 3QFUA 4IXCA 1JCGA 3FE1A 3ZEUA 3QBWA 3LDNA 4CBUA 3WXLA 5KPTA 4IO8A 4FPBA 3CJ7A 1BWFO 3C7NB 3CHWA 2Q36A 3KZBA 4K42A 4BR4A 3ZX2A 4EIAA 4JD2B 1TYQB 2D1KA 2P9KB 2FF3B 3VGLA 3VF4A 2QWRA 4GNIA 1BDGA 2BTFA 2D4WA 2E1YA 4CZIA 3UKRA 5LJWA 1NWKA 1U2VA 4XH5A 4NO7A 1XQSC 3TPQA 3ZX3A 1LCUA 1H1VA 1T44A 3VEOA 3ATVA 4CZFA 4FSVA 4H5RA 1GLBG 1TUYA 1BA1A 5BPMA 2CGLA 3R8EA 4HTLA 5LJVA 3AY9A 1RDWX 2D0PA 3QFPA 5BN8A 4PKIA 1LOTB 4CZKA 3EO3A 3BF3A 4QS9A 5AQHA 2YCHA 4H0OA 1V4TA 3ENOA 3WXIA 4JAXA 3MN6A 3AAQA 3GDQA 4I6MA 4IJNA 4H5VA 1NLVA 4DB3A 1C0GA 4GY2B 4K43A 1HLUA 3A8YA 1Z6RA 4BC5A 5EX5A 2HOEA 4M7YA 4M7XA 4BVPA 3A0IX 3SMPA 4DHYA 4H0TB 5AQFA 3RSEB 2EWSA 3U8XA 1DGKN 3I8BA 4CZMA 4YDUC 3QICA 4YDUA 3CIPA 3D7EO 1JCFA 3GOIA 1X3MA 4BR5A 2Q31A 2P9NA 5AFUA 4BGBA 2P9LA 2Q0UA 3W0LA 2D0OA 1G99A 2YHXA 3R9PA 3RSEA 3M6GA 3QBXA 3SMSA 4JN4A 4BRMA 3IUCA 1BA0A 4BRNA 1ZC6A 3ZETB 5AQYA 2AA4A 3MN5A 2ZF5O 4WQ4A 3D2FB 1NGJA 1QQOA 4FWOA 4H5WA 3DJCA 4EFHA 1GLLO 4A61A 5EOYA 1YUWA 2GWJA 2A40A 3ZETA 1NGGA 5AQTA 3M3ZA 4MO4A 4JNEA 4K41A 3LM9A 4MLHA 3CJAA 3SJHA 2P9UB 3FZHA 4QS8A 3W3DA 1ATRA 1EQYA 2ZGZA 4E1JA 5EY4A 2FSNA 2E8AA 4AM6A 5KPZA 3VF2A 2V52B 5E26A 3FZMA 3DAWA 2Q0RA 4XH1A 3HSCA 5CE3A 1MA9B 2E2NA 1NGHA 4BRIA 4EHUA 4FWSA 3CETA 4BRDA 1GLDG 2E20A 2IVPA 1R59O 3VPZA 2HMPA 3H3OB 4FWRA 1BUPA 3FLCO 2P9PA 3WXKA 1ZXOA 5AQRA 2V7ZA 3VGKA 2A6AA 5AQVA 2E88A 2W40A 3EN9A 1HX1A 2NRHA 1HKBA 2CGKA 5BR9A 3GBTA 3CJ1A 3ZEUB 3EZWA 3FR0A 1GLJO 3O1WA 4BR2A 1U2VB 1NGDA 5FPDA 3S41A 1Y64A 2E2PA 3H6EA 2FXUA 1QHAA 5AQSA 4JD2A 4L3QA 3U4LA 2P9SA 1HKGA 4IWVA 3VENA 4C23A 1QQNA 3CJCA 1JCEA 5AQPA 3BP8A 2IIRA 3FZFA 4CZJA 3D2EA 2GWKA 4ISFA 4BC3A 4QS7A 1QZ6A 3VEZA 3HZ6A 1MWKA 2QWPA 4PKHA 4CI6A 3MN9A 2UYTA 5KQ8A 5JLFA 3VEVA 3LL3A 4H0XB 4MLEA 4XEIA 3ULEA 4BC4A 3UKUB 2V51B 5AQKA 4H0PA 1J6ZA 4CZLA 1C0FA 1SQKA 4CBXA 4CD1A 5KQDA 3DXKA 1ATSA 1QQMA 4FPAA 4FWPA 1GLEG 3ID8A 1HKCA 3C0BA 1NBWA 2E2OA 5BRFA 1ESVA 1TYQA 3DXMA 3EL2A 4H5NA 4FWMA 2ITMA 3SK3A 1Q18A 3LDPA 3C7NA 2ASOA 5AQNA 3WT0A 5JICA 2NZTA 5AQGA 3HBTA 5BPLA 4RWTA 3U9ZA 3A5LC 2Q97A 5EVZA 2QXLA 3WXJA 5FPNA 1BOTO 4CZHA 1KAXA 2NLXA 1WOQA 3A5NC 3MCPA 3ULEB 2WUSA 5AZIA 4ISGA 1HUXA 5AFUH 3ZX0A 5AZIB 3VF6A 2A5XA 2F9WA 2YI1A 5AQXA 1NGIA 4BREA 3SLCA 3O1BA 4CBWA 4EHTA 4FWLA 4WQ5A 3BEXA 3WQTA 1V4SA 2W41A 4BG9A 5AQJA 2QW9A 3UKUA 4XH4A 2DPNA 3H45C 4H0YB 4B1VA 1HPMA 3R6MA 4BC2A 1NGFA 3AARA 4BRCA 1KAYA 4B9QA 4RTFD 4KBOA 3O6WA 2CH6A 1X9JA 5F1XA 4A2BA 4B1YB 3VESA 1BO5O 5FPMA 4F9OA 4H03B 5AZJA 3WEEB 5AQLA 4NB4A 1YVNA 1E4GT 4DQ8A 1TUUA 2P9PB 4LC9B 4BQZA 3OHRA 4B1WB 3CQYA 4BR9A 1K8KB 3MN7A 4JHDA 5BPNA 5EXWA 1SZ2A 1NGAA 4H5TA 4ISEA 2QWLA 5AQQA 1KXPA 1RGIA 2YHWA 2QM1A 2Q2RA 4BVOA 4PL7A 3D2EB 2A3ZA 3A5MC 4BG8A 5LY3A 3O5BA 5AQUA 2OANA 2QWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HPHA 4CGDA 3P5JA 3VQ8A 5BRDA 3MEEA 3VTHA 3K5LA 3CJ9A 3AVHA 5AQMA 3CC2N 1N8RO 5AQOA 3QETA 4JRQA 3E01A 3VETA 4RW4A 4OKKA 2CH5A 3QIPA 3B6OA 4H4MA 3VQ5A 1VQNN 3D45A 1BGXT 1NPIA 3OYLA 3L0QA 3SAHA 1L4VA 2YC1C 3I33A 2HBJA 3CQXA 4GV6A 2E6MA 4M63C 4YORA 3GG4A 3UB5A 1KC8O 1E4FT 4W5NA 2QI2A 1K8AO 2SN3A 1EWRA 2IOCA 2RN2A 3DI6A 3RMAA 1N34K 4BDZA 2IVNA 5GINA 3IKMA 5ELZA 1HNXK 3KC6A 4OGEA 1SUQA 1T6CA 4FLWA 4YY3K 3AVAA 3VEYA 2HNDA 4IBNA 2YJFA 3PSMA 3O9RA 3O80A 3MCAB 1MR4A 2ETJA 4Y0WA 3WNHA 4CF1A 4BY9C 1XNRK 1KVBA 4ID5A 1T7BA 4KFBA 4V19S 3SF4D 1CZ9A 2B5JA 4HCCA 4IFYA 3LAMA 1YITN 4BRAA 1YI2N 3KOWA 3KD1E 1TVRA 3HTVA 1HR0K 4FOIA 1XC3A 3UKRB 1TGOA 2OPPA 2HHUA 2H3GX 1HMVA 1NJYA 4FWQA 3ZT2A 3FFKB 3DYAA 4CHNA 5HRRA 2AJQA 4CJPA 2BH1A 2GUPA 2YHAA 3AA4A 4NXNK 1S22A 3L6QA 1S1XA 1VQON 1W0HA 1ZBIA 5C2FA 3ITHA 1SAZA 2LJMA 3RMDA 4CK2A 3G71N 2N2QA 1BISA 5AR0A 3J7YP 3NF9A 3DLKA 1SN4A 4FL9A 3LDSA 4ILJA 3VA0A 4DF8A 4JI5K 3LP2A 3THWB 1YXQA 3O8MA 3VOVA 4LFBK 2YIPA 1XNQK 2VWBA 1WSJA 1WT7A 1FKOA 4XIUA 1NRAA 4DSFA 2YBRC 4BR7A 3G25A 1J5OA 3DXMB 2FBYA 1WBDA 1VSLA 3J7ZO 1OVQA 1W2BM 1W7AA 4AQYK 3Q7BA 3SV3A 4CEOA 3QIOA 3TAEA 4A2AA 5AZJB 4IKFA 1RBSA 3EY1A 1NGBA 1P90A 3DXKB 3Q7CA 5JMVA 3VQ4A 4BRHA 1YTUA 1EKEA 4ILHA 4DU1A 3HPOA 1NK9A 2HF4A 3GL1A 4LF8K 5C0YA 3WNGA 2FSKA 4LSLA 5I3UA 4E1NA 4ZTFA 1MYNA 1SL1A 1KFDA 2OYQA 2E3FA 3BK3C 3OA9A 3VGMA 2GEMA 1CN2A 4O8KA 5KRSA 4BR0A 4JKDA 2C1GA 1C0TA 1Z05A 1K9MO 5BRHA 4IOCL 3NE6A 3U9DA 1QZ5A 1HNVA 1B9DA 1UA1A 4JKCA 3P4IA 4CEQA 2E1ZA 3QFUA 4IXCA 3FE1A 2RE2A 4CBUA 3G4SN 1VSFA 3AGRA 3WXLA 1ASVA 3VQPA 1DT9A 4WE1A 1IBLK 1XC9A 4DV6K 1S72N 3VGLA 3K5MA 1WBBA 1RBTA 2D4WA 3TANA 4DQRA 3L3VA 1OZZA 5LJWA 3SUPA 4FJLA 1NWKA 1U47A 4FK0A 1BIZA 1CZBA 2VWKA 2XY7A 3V6DA 3QEWA 1H1VA 1T44A 4CJKA 4CZFA 4DSEA 3VQDA 3KKSA 4HTUA 1NK5A 5BPMA 2CGLA 5J2QA 4CCHA 2D0PA 3QFPA 1LOTB 3PX0A 3OTOK 4E7HA 4IDKA 1D8YA 4QS9A 2YCHA 1V4TA 2XHBA 4JAXA 4FJ9A 3HT3A 1Q9XA 3NF8A 3H08A 2IDOA 1NJWA 1QQCA 4CFDA 3KLFA 2YNHA 4BC5A 1JZAA 1YF5L 4M7XA 1RDDA 4I9QA 4FM2A 1SV5A 3OYGA 1VQLN 2UU9K 2YHBA 1KVAA 1JLCA 2VG7A 2WOMA 3I8BA 4YDUC 4CZMA 1TKXA 2KLAA 3QICA 4AH9A 3AA5X 1X3MA 4KHWA 2Q31A 3CQ8A 3PY8A 2P9LA 3KLHA 1SL0A 4JV5K 3RSEA 3SMSA 2LR3A 3V9XA 2O4GA 2XO7A 3MN5A 4CHZA 4JI0K 4LF9K 3D2FB 4FJJA 4FWOA 2EHGA 2IAJA 1RT6A 1FW6A 3K2PA 1GLLO 2GWJA 5CHIA 1C1CA 3ZETA 3BGRA 3M5RA 4IOXA 5KK4A 2E5LK 3C65A 4JNEA 4Z0UA 4MLHA 4B9UA 2P9UB 3OVNA 4KO0A 3W3DA 3CG7A 2FSNA 1BQMA 2E8AA 4DU4A 3P39A 3FZMA 5JVGL 2Q0RA 1MA9B 1NGHA 3ISNC 4E1MA 3OS1A 4CJEA 2IVPA 1R59O 1TKTA 4FWRA 1BUPA 4GVEA 1I6FA 2VGMA 3C6HA 4Z4IA 3NBPA 2E88A 4KV8A 4CGFA 2P5OA 4FLUA 3ID6A 1HKBA 3ZT1A 2OTJN 4DTUA 3EZWA 3FR0A 3O1WA 1U2VB 1D5AA 5FPDA 1Q8IA 2QKKA 3NF6A 4IEEA 3CCLN 4FJ8A 3U6FA 4FZZA 4YOXA 3U4LA 4BE2A 4C23A 1HKGA 2B4JA 4IWVA 1N5YA 1P0AA 3OJSA 2IIRA 1N32K 4DSLA 3HVTA 5C15A 5IWAK 4QS7A 1QZ6A 1C6VA 4CJLA 3THYA 3F5TA 3QESA 5I42A 4BC4A 5KTQA 2HMIA 1A5WA 4AHSA 4CD1A 1TAUA 1ATSA 4K8XA 4F2RA 1GLEG 2GBZA 3L2RA 4F4KA 2E2OA 1TYQA 2ZJPL 3NGYA 4M41A 4A5AA 5JICA 4Y1DA 4FXDA 2A7TA 3K5OA 4CZHA 1T03A 3ZSQA 1HUXA 1ZVEA 5AZIB 2A5XA 4CJQA 3O3GA 5AQXA 3TABA 1PTXA 3SLCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HPH A;  4CGD A;  3P5J A;  3VQ8 A;  5BRD A;  3MEE A;  3VTH A;  3K5L A;  3CJ9 A;  3AVH A;  5AQM A;  3CC2 N;  1N8R O;  5AQO A;  3QET A;  4JRQ A;  3E01 A;  3VET A;  4RW4 A;  4OKK A;  2CH5 A;  3QIP A;  3B6O A;  4H4M A;  3VQ5 A;  1VQN N;  3D45 A;  1BGX T;  1NPI A;  3OYL A;  3L0Q A;  3SAH A;  1L4V A;  2YC1 C;  3I33 A;  2HBJ A;  3CQX A;  4GV6 A;  2E6M A;  4M63 C;  4YOR A;  3GG4 A;  3UB5 A;  1KC8 O;  1E4F T;  4W5N A;  2QI2 A;  1K8A O;  2SN3 A;  1EWR A;  2IOC A;  2RN2 A;  3DI6 A;  3RMA A;  1N34 K;  4BDZ A;  2IVN A;  5GIN A;  3IKM A;  5ELZ A;  1HNX K;  3KC6 A;  4OGE A;  1SUQ A;  1T6C A;  4FLW A;  4YY3 K;  3AVA A;  3VEY A;  2HND A;  4IBN A;  2YJF A;  3PSM A;  3O9R A;  3O80 A;  3MCA B;  1MR4 A;  2ETJ A;  4Y0W A;  3WNH A;  4CF1 A;  4BY9 C;  1XNR K;  1KVB A;  4ID5 A;  1T7B A;  4KFB A;  4V19 S;  3SF4 D;  1CZ9 A;  2B5J A;  4HCC A;  4IFY A;  3LAM A;  1YIT N;  4BRA A;  1YI2 N;  3KOW A;  3KD1 E;  1TVR A;  3HTV A;  1HR0 K;  4FOI A;  1XC3 A;  3UKR B;  1TGO A;  2OPP A;  2HHU A;  2H3G X;  1HMV A;  1NJY A;  4FWQ A; 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