4H5NA

Hsc70 nbd with po4, na, cl
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 120
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5nA04
3H3OB 5I9EB 2AP1A 2H3GX 3ULEA 1X9JA 2QWRA 3GDQA 3VEZA 1HX1A 3EO3A 1GLEG 3FZHA 1GLBG 1IJJA 3IMXA 2BTFA 1EQYA 3VF2A 1P8ZA 2HMPA 2P9PA 4BR0A 3A0IX 1Z6RA 1KXPA 2P9IB 3I8BA 3RSEB 2P9KB 2A42A 1BU6O 1Z05A 4RWTA 1JCEA 4PL8A 4BVPA 1ZXOA 3U9ZA 3VETA 4EHUA 5AQTA 2UYTA 3AY9A 4JN4A 4XH5A 1LOTB 2E8AA 2CGJA 1NGHA 3BF1A 1BUPA 1HUXA 1DGKN 1K8KB 2PAVA 2HF3A 3RSEA 2P9KA 1NGCA 3LDPA 2A40A 3MN9A 2NZTA 5FPNA 1NGGA 2ZGYA 3HBTA 2VCPA 3O4WA 3DXMB 3L0QA 4L3QA 2QWMA 2CH5A 4YDUA 4BC2A 1K8KA 1NGJA 3WXIA 3W3DA 3WT0A 2Q97A 1LCUA 4BR9A 3WXKA 4BC5A 3DXKA 1MWMA 2P9LA 3DXMA 4BRAA 5AQSA 3FE1A 1ZBSA 1GLAG 3CERA 4BGBA 3ZX3A 3GG4A 1NBWA 2D0OA 3CQXA 5AQKA 1HKGA 3MCPA 4FWMA 1YXQA 4CZMA 3CJBA 1DKGD 1NLVA 4H5VA 5ADXA 3QDKA 3AAPA 1WUAA 4BRIA 4CD3A 4JAXA 4BROA 2YJEA 2IVNA 5FPMA 2VWBA 2YHXA 2IVPA 2Q2RA 2NRHA 4FOIA 4XH1A 1QQMA 1GLLO 4CBXA 4QS7A 1TYQB 3SMPA 3L6QA 4ISEA 3ID8A 2FSJA 1NGIA 3B8AX 3FFKB 1R59O 3VF6A 1QZ5A 2Q0UA 4E1JA 4FWPA 4MO5A 2QXLA 1GLCG 2D1KA 2V51B 4EHTA 3ZETA 3HM8A 2P9UB 2ZGZA 2GWKA 4B1WB 2J4RA 3EN9A 4JNEA 5AQJA 3A5LC 3ZX0A 4FL9A 1NM1A 3F9MA 3R6MA 4H5WA 1XQSC 5BRDA 4FWQA 1GLDG 1BDGA 2I7PA 3VEWA 4FWRA 2P9UA 4FOEA 3U9DA 3QMLA 1NWKA 3A5OC 4BREA 1HLUA 4FWLA 2GTDA 1V4SA 1NMDA 1Y64A 2GUPA 1H1VA 4KBOA 3O1WA 2HF4A 3CJAA 4H5RA 5F0XA 3MMVA 4WQ5A 3O80A 5BPMA 2ITMA 4BQZA 5AQUA 2BUPA 3HTVA 3LL3A 3H6EA 3O5BA 5ELZA 3WXJA 4IO8A 4A62A 4AM7A 5ADXH 3MN7A 1OKJA 3GE1A 3SMSA 3VEYA 4PKGA 1BA1A 3EZWA 3ZX2A 3HZ6A 1HPMA 3FR0A 1KAZA 2PBDA 4CZEA 3VOVA 3W0LA 3C0BA 2ZWHA 3FGUA 4BRHA 5AZJB 4B1XB 4O5FA 4BRLA 2A6AA 1GLJO 3U8XA 3H1VX 5BPNA 3VEXA 4BG9A 3VGLA 1U2VB 2P9SB 5AQNA 2ASOA 2YJFA 4NO7A 3H1QA 4WQ4A 1D4XA 5FPDA 1NGDA 4NB4A 5AZJA 2CH6A 3EKUA 4BC4A 3DAWA 5FPEA 5AQOA 4B9QA 1E4FT 3DXKB 2P9LB 2E1ZA 2YHYA 4PKIA 3C7NA 2D0PA 5EVZA 1U2VA 4RCHA 2P9SA 2V52B 3D7EO 5JMVA 4FO0A 5EY4A 5AQYA 4H5TA 1S3XA 5AR0A 3A5NC 5E26A 5LY3A 5BPLA 2E2QA 4CBWA 3VPZA 1NGFA 3VF4A 1YAGA 1T44A 4BQLA 2QWOA 1QQNA 3CI5A 2QW9A 4MO4A 3LDOA 3CIPA 4DCHA 4H5NA 1Q18A 2CGLA 2IIRA 2YI1A 1ATNA 2QWPA 2A3ZA 3S41A 2GWJA 3H45C 4FWSA 4K25A 3J8AA 4FSVA 5AQZA 4CZLA 4FPAA 3AAQA 3KZBA 3QB0A 4CZFA 1SZ2A 3WQTA 3UB5A 3LM2A 3QBXA 3HSCA 2EWSA 1BA0A 4H0OA 4B1ZA 5JLFA 4DB3A 1QZ6A 4BVOA 4JHDA 3FZFA 5AFUA 3WEEB 3KHYA 1SAZA 1SQKA 5KPRA 4BRDA 1XUPO 3VENA 1ESVA 1T6DA 2I7NA 4BRKA 3ZETB 3M3ZA 3A5MC 2A41A 4MLEA 2A5XA 4GY2B 5AQMA 3DJCA 2FF6A 4H0PA 3WEEA 4B1VA 5BREA 4BC3A 3MK6A 1J6ZA 4MLHA 4QS9A 1NGBA 4O8KA 4JD2B 2GEMA 1KAYA 1E4GT 4CZHA 4HWIA 3TU5A 2ASPA 1QQOA 3P4IA 5AQQA 4JD2A 3OHRA 4IWVA 4B1UB 2AA4A 2QWLA 5AZIB 3VEOA 3DWLA 3CETA 4CZKA 4A2BA 4GNIA 4ISGA 4BRNA 2HOEA 4H0YB 4HTLA 3O08A 4EFHA 3LDQA 4LC9B 4DQ8A 5F1XA 3VERA 4BRCA 3H3NO 2D4WA 3WUHA 4BRFA 1QHAA 1RGIA 4H0VB 5AZIA 1JCFA 4PL7A 3CHWA 2CGKA 4ISFA 4K43A 4A2AA 4C23A 4YDUC 4EAHD 1ATSA 3QBWA 1YUWA 2FF3B 3A8YA 1TUYA 4XEIA 1TUUA 3QFUA 1U6ZA 5AQXA 1C0FA 1BG3A 2E2PA 3LM9A 5CE3A 1MWKA 4FWKA 4IJNA 4FPBA 1RFQA 5AFUH 1S22A 1NGEA 2E2OA 1GLFO 5AQFA 3ZEUB 3QFPA 3C7NB 5F2RA 3BEXA 2V7YA 3BP8A 2F9TA 3JS6A 3VGKA 3UKUA 5BRHA 5KPZA 5AQGA 3GBTA 3TPQA 4AM6A 5JICA 2VYPA 5AQWA 4I6MB 5LJVA 5KQDA 3O1BA 5AQIA 3I33A 3ZEUA 1X3MA 3D2FB 4J8FA 3IFRA 4BR5A 3O8MA 2OANA 1HJOA 5AQVA 1T6CA 2ZF5O 3CQYA 4BGAA 4EIAA 5TKYA 2FSNA 4M7YA 2FXUA 1NGAA 1C0GA 4I6MA 2Q0RA 2P9IA 4BR2A 5KQ8A 2Q31A 2YCHA 4Y0WA 3D2FA 3BF3A 3QICA 3H46O 1G99A 4BG8A 3R9PA 1YVNA 4JHDB 1ZC6A 3O6WA 3IUCA 3AARA 4IXCA 2V7ZA 3LDLA 1IG8A 5EOYA 3KVGA 3UKRB 3ATVA 5BN8A 4F9OA 1V4TA 4QS8A 2P9NB 2E88A 1KAXA 5KPTA 1DEJA 3EL2A 2YHWA 3U4LA 3FZKA 3MDQA 4CZJA 4CJ7A 3M6GA 1WOQA 2E2NA 4M63C 3UKRA 5EX5A 3R8EA 2P9NA 3BUZB 1BO5O 4WQ5C 3WQUA 3MN5A 5BRFA 2ASMA 2E20A 2IVOA 3IDHA 4CZIA 3WXLA 5BN9A 1XC3A 5AQRA 2KHOA 4FWNA 4K41A 5AQLA 4M7XA 1RDWX 4FWOA 4CBUA 2QM1A 3D2EB 5B8HA 5EXWA 1MDUB 4CD1A 2E1YA 4BRGA 4CI6A 1JCGA 4CZGA 4H0XB 1CZAN 3CJ7A 4H0TB 1BOTO 3HI0A 3GL1A 5AQPA 1HKBA 1TYQA 2W41A 2NLXA 3L4IA 2Q36A 5E84A 4H03B 4B1YB 5JLHA 2FSKA 4Z94A 2FLOA 3SLCA 3D2EA 2Q1NA 4K42A 4WQ4C 4IJAA 4BR4A 3UE5A 3ENOA 1BWFO 3M1FA 3SK3A 1ATRA 4RTFD 3CJ1A 3FZMA 3FLCO 3FZLA 3EKSA 4BRMA 1MA9B 4DHYA 2QWNA 4PKHA 5AQHA 3MN6A 1HKCA 2F9WA 2DPNA 2GELA 4BR7A 1X3NA 3ATUA 4IZ9A 3ULEB 4A61A 3VGMA 4BRPA 3VESA 3VEVA 3G25A 3CJCA 3UKUB 3LDNA 4WYBA 2QWQA 2W40A 4BRQA 5BR9A 3GOIA 3CJ9A 4XH4A 5LJWA 3JXUA 2P9PB 2WUSA 3ENHA 3SJHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AP1A 3ULEA 1X9JA 2MZ0A 1NPIA 4KB1A 3EO3A 1IJJA 4HTUA 5KGWA 2P9PA 3VQEA 2P9IB 4HUFA 4CJEA 1SNBA 1FH3A 1JCEA 4FJJA 3SV4A 1L4VA 3VETA 1C1CA 2ETJA 3AY9A 2E8AA 2HBJA 3SUOA 3VA3A 1K8KB 1BK8A 3AVKA 3TAPA 4BWMA 4CEFA 2O8CA 1NK8A 3OYLA 2B6AA 2VCPA 1ZBLA 2AJQA 4L3QA 3L0QA 3NH1A 2KTQA 4G9ZA 4YDUA 3DRRA 2C1GA 1T05A 4IFYA 3WT0A 3TARA 4DV7K 2Q97A 2HSTA 3DOKA 3P31A 1LCUA 4CJFA 3G71N 1RBTA 2P9LA 4C8NA 4O8UA 3ZSRA 1IBKK 3FE1A 4AEIA 2KBJA 1GLAG 3CERA 4JI1K 4GVMA 1SKRA 4CK2A 3M5RA 4CESA 4CZMA 3CJBA 3LANA 1C6VA 1NLVA 4LSLA 2LJ7A 4FZXC 3AAPA 1Q9YA 3I56N 2E5LK 2ITGA 4JAXA 4CK1A 2YJEA 3K57A 4CERA 3UIQA 5FPMA 2YHXA 3O3HA 2IVPA 4DTMA 4CBXA 4JEPA 1LQHA 1KD1O 3C65A 1TYQB 3MEEA 1HYZA 2OTLN 5M1NA 1OMYA 3ID8A 3PSFA 4CEQA 4CJSA 4CHNA 2FSJA 4FJKA 3D6RA 1NGIA 3VQQA 4HE7A 3PIPL 2YBRC 1R59O 2WBNA 3WNFA 1QZ5A 5DM6L 5JVGL 4J2BA 1I94K 1GLCG 2D1KA 4CJ5A 1S6PA 3MXJA 2K35A 2P9UB 2G8WA 4KO0A 3RRHA 2GWKA 2HVHA 2J4RA 1N6QA 4ILHA 3EN9A 1KLMA 1NJWA 2ZD1A 3SJJA 2IOCA 1NM1A 4JI2K 4CF8A 2LR3A 5BRDA 1BDGA 4FWRA 1Q82O 3U9DA 1HQUA 3PV8A 2FBVA 4JKGB 3AO1A 3HPOA 1T7BA 1UGLA 2D56A 3CJAA 4H5RA 1VQ9N 4WQ5A 3O9TA 1VRUA 2UXCK 2BUPA 1RTIA 5M1FA 1VNBA 2HNYA 2W6KA 3H6EA 4DS4A 1NJIO 3HXMA 1TAUA 4IO8A 4DTJA 4PKGA 3EZWA 4DQQA 1JL2A 3HZ6A 3FR0A 2PBDA 1BI4B 4E89A 3VOVA 2HW3A 3T1AA 2ZWHA 2O8CB 4X62K 2HMIA 1U4BA 3L3UA 4M3UA 4C8MA 4BRLA 2A6AA 2BH1A 3H1VX 3VEXA 4BG9A 3OYIA 1OH6A 3ZT2A 3ISNC 2QXFA 4NO7A 5AQNA 2ASOA 1RTJA 4WQ4A 1WT7A 4DQRA 1T8EA 1UWBA 4I9QA 1YI2N 2P9LB 4W5RA 2HNDA 3CM6A 4CJ4A 3SZ2A 1SL2A 4J2DA 1NH5A 1BISA 5E26A 2E2QA 4CBWA 3VPZA 2XY7A 1YAGA 2WOMA 4DV5K 4ZHRA 1TGOA 3CIPA 4AHRA 4DCHA 4H5NA 1Q18A 2CGLA 1HNXK 1ATNA 2IS3A 4K25A 1A5XA 4FPAA 3QB0A 3LM2A 5KTQA 3DLBA 1NG9A 4FJGA 2EWSA 3NVMA 4B08A 1BA0A 4B1ZA 4OKJA 1BIZA 4H4MA 4JKEA 5GADP 4JHDA 4A59A 3WEEB 3PSMA 5KPRA 3RWUA 3KK7A 1ESVA 2I7NA 3M3ZA 2WFBA 2A41A 2A5XA 2BDPA 1CLQA 3V9ZA 4YY3K 5AQMA 3DJCA 3F9KA 4B9NA 2VG6A 2M8BB 1BCMA 3CCMN 4B1VA 1REVA 4K8XA 4HUEA 3LAMA 1C55A 4QS9A 3TSUA 3HSTB 4DUYK 1YJNN 1NGBA 4KTZA 2O8DA 5JENA 5HLFA 3TAFA 2W6LA 1KAYA 1L5UA 1KCFA 4HWIA 2E6LA 4KPYA 1QVGM 3TU5A 2ASPA 1TV6A 3P4IA 1T03A 2LKBA 1VSDA 4BDYA 2QWLA 3DWLA 3CETA 2N2QA 3K59A 4HCCA 1KVBA 5DMRA 4Z4CA 4KH4A 4FJLA 4HTLA 4EFHA 3LDQA 1X9WA 2KGQA 4DTNA 4FZZA 4FJIA 3K5MA 2VQFK 3MXMA 1TK8A 3H3NO 1W7AA 2XY6A 3V9WA 4H0VB 4B9UA 3CHWA 3E01A 4ISFA 4HUGA 4FJ9A 4K43A 4YDUC 1RTDA 4LF6K 3J7ZO 2KPYA 2E4LA 3ID6A 2KFZA 1TUUA 4DSKA 4F2SA 1TKZA 5AFUH 1S22A 4LFBK 2E2OA 2R7YA 1X9SA 3THVA 3BEXA 1DQ7A 4CHQA 3BP8A 5BRHA 5AQGA 4AM6A 1ASWA 5JICA 4ELTA 2VYPA 4DV3K 3SPZA 2OZSA 5AQIA 3ZEUA 1NMNA 3AVIA 5CY0A 3M8QA 2HHIA 1XHZA 3Q7CA 1Q8IA 2E0HA 4CGHA 2A7TA 2FXUA 4YOXA 3RMDA 3AVBA 3SUNA 2Q31A 4CGDA 4GW6A 1S1VA 2VY6A 2DFFA 1VQ8N 3CFPA 1G99A 3KK1A 2LJMA 4DTPA 4JHDB 3LPUA 3OTOK 1ZC6A 4FJNA 3KKSA 3O6WA 2O8FA 4BY9C 2V7ZA 1KC8O 1D9DA 3ATVA 1BHLA 3QIPA 4Z4FA 4GKJK 3EZ5A 1RTHA 1DEJA 1HNWK 3V9UA 2D5RA 3MDQA 4CJ7A 3B6PA 4M63C 3KLEA 3OYCA 4NCAA 1EXQA 3BUZB 2O8DB 1CZBA 2G8VA 1IH7A 1BO5O 4WQ5C 3WQUA 3MN5A 5BRFA 2MN5A 3WXLA 4PY5A 3SQ0A 2KBHA 2KHOA 4FWNA 4K41A 1RILA 2OPSA 1XWLA 5KRSA 1T0ZA 3PX4A 1QTMA 1W0HA 4WFNL 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2AP1 A;  3ULE A;  1X9J A;  2MZ0 A;  1NPI A;  4KB1 A;  3EO3 A;  1IJJ A;  4HTU A;  5KGW A;  2P9P A;  3VQE A;  2P9I B;  4HUF A;  4CJE A;  1SNB A;  1FH3 A;  1JCE A;  4FJJ A;  3SV4 A;  1L4V A;  3VET A;  1C1C A;  2ETJ A;  3AY9 A;  2E8A A;  2HBJ A;  3SUO A;  3VA3 A;  1K8K B;  1BK8 A;  3AVK A;  3TAP A;  4BWM A;  4CEF A;  2O8C A;  1NK8 A;  3OYL A;  2B6A A;  2VCP A;  1ZBL A;  2AJQ A;  4L3Q A;  3L0Q A;  3NH1 A;  2KTQ A;  4G9Z A;  4YDU A;  3DRR A;  2C1G A;  1T05 A;  4IFY A;  3WT0 A;  3TAR A;  4DV7 K;  2Q97 A;  2HST A;  3DOK A;  3P31 A;  1LCU A;  4CJF A;  3G71 N;  1RBT A;  2P9L A;  4C8N A;  4O8U A;  3ZSR A;  1IBK K;  3FE1 A;  4AEI A;  2KBJ A;  1GLA G;  3CER A;  4JI1 K;  4GVM A;  1SKR A;  4CK2 A;  3M5R A;  4CES A;  4CZM A;  3CJB A;  3LAN A;  1C6V A;  1NLV A;  4LSL A;  2LJ7 A;  4FZX C;  3AAP A;  1Q9Y A;  3I56 N;  2E5L K;  2ITG A;  4JAX A;  4CK1 A;  2YJE A;  3K57 A;  4CER A;  3UIQ A;  5FPM A;  2YHX A;  3O3H A;  2IVP A;  4DTM A;  4CBX A;  4JEP A;  1LQH A;  1KD1 O;  3C65 A;  1TYQ B;  3MEE A;  1HYZ A;  2OTL N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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