4H5NA

Hsc70 nbd with po4, na, cl
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 120
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5nA04
3QFUA 1GLAG 5ELZA 5BRDA 3CERA 3FLCO 5AQZA 2DPNA 3QICA 3BEXA 3MN6A 4BC2A 4CZJA 3VF2A 2P9SB 2NLXA 2Q0RA 3AAQA 3MMVA 2CH5A 3VF6A 2I7PA 5ADXA 2GTDA 3L6QA 3HBTA 2UYTA 5BRFA 3LDPA 3QFPA 1BO5O 2GWKA 4GNIA 4CZMA 4PL7A 1HKGA 4H0TB 3L4IA 1NGJA 2GUPA 3CJBA 3VETA 4RWTA 4BG8A 4M7XA 3WXLA 3LDOA 1KAYA 3WXIA 3VPZA 4H0XB 2YJFA 3P4IA 3VEXA 3M6GA 5JLFA 4H03B 2BTFA 4K42A 2IIRA 3H3NO 3U9ZA 3CJ1A 4BRAA 2P9KA 1QZ6A 2E1ZA 1GLEG 2CGKA 3HM8A 3ATUA 2F9TA 1BG3A 1BOTO 2VCPA 2FF3B 4HWIA 3CJAA 4RTFD 4RCHA 3O5BA 1P8ZA 1NM1A 2E88A 5BREA 3SMSA 5F0XA 4FWKA 1SZ2A 1YVNA 4QS9A 4CI6A 5AQVA 1LOTB 4NO7A 1NWKA 3VEVA 5E26A 1HLUA 3LM9A 4EIAA 2KHOA 4IZ9A 4EHUA 2ASOA 3M3ZA 4QS7A 5AZIB 2QWRA 1QZ5A 3WEEB 2NRHA 3UKRA 2P9UB 3GDQA 5LJVA 4FL9A 2FSJA 4XEIA 2IVOA 1NMDA 3O4WA 3VF4A 4A62A 3ULEA 1XC3A 2V7YA 2FSKA 4Z94A 3R8EA 5AQXA 2Q31A 5AQQA 2YCHA 2ASPA 4B1ZA 2QWLA 4H5RA 2YJEA 3FGUA 1RFQA 3D7EO 4FWNA 5AZJA 3BF1A 1E4GT 1KAZA 1X3MA 4FOEA 1Y64A 3A5NC 3VEYA 1Q18A 5AQYA 4BRQA 4MLEA 1J6ZA 3R6MA 4BGBA 4B1YB 4MLHA 3MK6A 1BUPA 2A6AA 1RDWX 3D2EB 5EY4A 2A3ZA 2W40A 3VEWA 4M7YA 1GLJO 1MWKA 4JD2B 3WQUA 3FZFA 1JCFA 4BR4A 1E4FT 1K8KA 4WQ4C 2CGJA 4YDUC 2CGLA 2P9LA 4B1XB 3DAWA 1MWMA 2P9PB 4BR0A 1EQYA 2CH6A 3MCPA 1SAZA 4AM7A 5AQMA 4CZKA 3CI5A 5BR9A 1WUAA 3TPQA 4FWSA 1NGGA 3LDLA 1GLDG 2F9WA 1IJJA 5FPEA 4FWMA 3O1WA 4CD1A 4FWPA 3FFKB 3H6EA 3D2FB 2HF3A 3A5MC 2YI1A 3ENHA 4FOIA 2YHXA 5EOYA 3ZX3A 4A2AA 4CJ7A 1TYQB 3JS6A 1HKBA 1JCGA 1TUUA 5F1XA 3LDQA 2E2QA 3VOVA 4B1UB 2P9NB 5AQKA 2PAVA 3EO3A 2E2PA 4CZIA 5BN8A 3EKSA 4LC9B 4DQ8A 2P9IB 4K41A 2QWOA 1U2VB 2HOEA 5AQWA 2Q1NA 2IVPA 1G99A 1JCEA 4GY2B 1R59O 5AQLA 2HF4A 3HZ6A 4H0YB 3UB5A 4BVPA 5BPLA 3MN7A 3HI0A 4B1WB 1QQNA 5AR0A 1U6ZA 1Z05A 4BR2A 5ADXH 4B1VA 3IFRA 3VESA 1NGIA 2ZWHA 1S3XA 1NGBA 5AQPA 2GEMA 4CZLA 1HPMA 3SJHA 3DXMA 3GE1A 2FXUA 5AZIA 2FLOA 5B8HA 4JHDA 3SMPA 3GOIA 3CHWA 2D0PA 1BA1A 1XUPO 4BREA 3A0IX 4I6MA 3DXKB 3VEZA 2A40A 3M1FA 5AQUA 4JN4A 4WQ5A 4FWOA 3I33A 1WOQA 2VWBA 3ZEUA 4H5VA 3CJ9A 3AY9A 5AQOA 3DJCA 3GG4A 1SQKA 4WQ5C 3FZKA 1ATRA 1TUYA 2V7ZA 4FWQA 1XQSC 4O5FA 1LCUA 1V4SA 2V52B 1NGCA 1C0FA 4BG9A 4K25A 2WUSA 3H46O 5JICA 1QQMA 4CZFA 2J4RA 4H0VB 2D4WA 3O1BA 4IJNA 3VGLA 2Q0UA 3H45C 3LL3A 2BUPA 2P9PA 5AQJA 3O8MA 3S41A 2YHWA 1BA0A 4ISGA 3F9MA 3UKUA 3FR0A 4BQZA 1NGAA 3QB0A 1GLCG 1IG8A 5KQ8A 4H0PA 3W3DA 3HSCA 3L0QA 4WQ4A 3WT0A 2FF6A 2I7NA 4YDUA 4J8FA 2NZTA 5AQGA 3VEOA 4CZHA 1HKCA 3GL1A 1DGKN 2V51B 1D4XA 4Y0WA 4BR5A 5JLHA 3VENA 1GLLO 1KAXA 3D2FA 5I9EB 1KXPA 2FSNA 2H3GX 4PKGA 4CBUA 4ISFA 1T44A 3H1QA 3RSEB 3ID8A 5AQRA 2P9SA 4BRFA 2PBDA 3A5OC 3FE1A 1DEJA 4FPAA 1ZBSA 2P9NA 4BVOA 5LY3A 3UKRB 3CQYA 3J8AA 3R9PA 4BRKA 3QDKA 2E8AA 1U2VA 5AQFA 4BRHA 4DB3A 3WUHA 3OHRA 3WQTA 3H3OB 3UE5A 4XH4A 3TU5A 4E1JA 5AZJB 2YHYA 4BRMA 4BC5A 3AAPA 2ZGYA 3HTVA 1MA9B 5E84A 1NGEA 4PL8A 4XH5A 4EFHA 3DWLA 3A5LC 4H5NA 4F9OA 5EXWA 5F2RA 4A2BA 1RGIA 3CQXA 1YXQA 1K8KB 3CJ7A 5CE3A 1GLBG 1S22A 4K43A 2ZF5O 2P9LB 5AQHA 4BGAA 3MN5A 4BR9A 3DXKA 5LJWA 1BU6O 3C7NB 3U4LA 4H5WA 3ZETB 4CZEA 1ATSA 2D1KA 3QBWA 3VGKA 1C0GA 1NGDA 4IXCA 3O08A 5FPDA 1ZC6A 3CJCA 3SLCA 1H1VA 4NB4A 3KHYA 2Q36A 4BRDA 4FSVA 4CD3A 5KPTA 3IDHA 5FPNA 4ISEA 3EL2A 1HJOA 1YUWA 3IUCA 3WEEA 2P9UA 2OANA 1Z6RA 5FPMA 2E20A 1MDUB 2Q2RA 4B9QA 1NLVA 5TKYA 4O8KA 4CBXA 3H1VX 4BRGA 4BRCA 4FO0A 4BC3A 2GWJA 4DHYA 3O80A 3FZMA 3VGMA 3I8BA 3VERA 3JXUA 3QMLA 2E2OA 4BQLA 5KQDA 4H0OA 4BC4A 4M63C 4C23A 3ATVA 3EKUA 1DKGD 3KVGA 3WXKA 4BROA 2QWNA 4CZGA 2AA4A 3D2EA 2E2NA 4BRIA 1GLFO 4JD2A 1BDGA 3MDQA 1NBWA 4QS8A 2W41A 2QXLA 4FWRA 3GBTA 3CIPA 4JAXA 5BPMA 4WYBA 4PKHA 3MN9A 4FPBA 5AQSA 1ATNA 2VYPA 2P9KB 5EX5A 3RSEA 2QWPA 5JMVA 4HTLA 5AQNA 3DXMB 2D0OA 4PKIA 1CZAN 3BF3A 4IO8A 4JHDB 2E1YA 4EHTA 3W0LA 2QWMA 1T6CA 3G25A 2A5XA 3FZLA 5AQTA 3BP8A 2IVNA 1ZXOA 1QQOA 4I6MB 1YAGA 3O6WA 3ENOA 3B8AX 1ESVA 3ZEUB 2HMPA 4BRLA 3U8XA 5AFUA 5BPNA 1HUXA 3CETA 4AM6A 3C0BA 2ZGZA 4MO5A 4EAHD 4CBWA 1TYQA 2ASMA 4BRPA 3EZWA 4DCHA 5BRHA 1T6DA 3ZX2A 2GELA 3WXJA 1QHAA 5KPRA 1OKJA 3ULEB 3A8YA 2P9IA 2QM1A 2QWQA 1HX1A 1BWFO 2ITMA 3FZHA 3KZBA 5AQIA 3AARA 4BR7A 5KPZA 2A41A 5AFUH 3ZX0A 5BN9A 4BRNA 3QBXA 4L3QA 3IMXA 2QW9A 3C7NA 4FWLA 4JNEA 2A42A 3UKUB 4IWVA 3ZETA 2EWSA 3U9DA 2AP1A 3SK3A 3LDNA 3LM2A 5EVZA 4IJAA 4MO4A 1X3NA 1NGFA 1V4TA 4H5TA 4A61A 1NGHA 4KBOA 2Q97A 3EN9A 4XH1A 3BUZB 1X9JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQ7A 2IC3A 4E7KA 1GLAG 1TL3A 2Z1JA 3M8PA 5BRDA 3FLCO 1FK9A 1DTTA 1T03A 4GVEA 4FJ7A 3MMVA 1SL0A 4DTNA 2E6MA 2I7PA 2GTDA 4KHSA 1JKHA 4OKJA 4CHQA 4DU3A 2YHBA 1BO5O 4GNIA 3KOWA 4PL7A 2WTUA 1C0MA 4H0TB 3L4IA 3QEIA 2RHKA 2Z1GA 3VETA 2IS3A 3RMBA 3CW4A 3N4PA 3J80O 3LDOA 1N34K 4H0XB 3M5RA 3DLBA 3P4IA 3CMEN 3NF6A 3SPZA 4CVNE 3KJVA 4AAZA 1U45A 2VY6A 1HYZA 4B8CA 2RE2A 3VMFB 1RNHA 2KZMA 1BG3A 1BOTO 2BH1A 4MQ3A 4CHZA 2HHXA 5C2FA 1NJIO 2HHVA 1J54A 2WBNA 4ICLA 4QS9A 4CI6A 1SV5A 1LOTB 3CG7A 4Z4GA 4X65K 4IFEA 3LM9A 4FLYA 1XHXA 4EIAA 4UQGA 4IZ9A 3KWGA 5CY4A 2ASOA 3V1OA 4IBNA 4DUYK 2ZQBA 4JS4A 3O9SA 2UUBK 4Z4HA 4K8ZA 2QWRA 2O4IA 2NRHA 3HVTA 4DV7K 3GDQA 5LJVA 4FL9A 4XEIA 5HLFA 1NMDA 4I2QA 4A62A 2GV9A 1VQNN 2VGNA 3MX2A 4E19A 4YY3K 1ZVEA 2D0BA 4CJUA 4KYPA 5GIOA 3HP6A 4DTOA 4HCBA 2FSKA 5C25A 3AA3A 1CXQA 2VG5A 4CECA 3PUFA 1WBDA 2QWLA 4E7IA 2G2KA 3AV9A 3NVMA 1L4VA 1X3MA 1Y64A 1Q18A 4BRQA 1SKWA 1K6YA 3HK2A 3SQ4A 3SI6A 1BUPA 4JEPA 2A6AA 1NJXA 4BACA 3VEWA 4M7YA 3ITHA 3H08A 4CGJA 1K8KA 1BIZA 1A5XA 4B1XB 3DAWA 3L2UA 4K8XA 4LH4A 2GX9A 1HNVA 2BE2A 4DFJA 3AVLA 4FLVA 2HHIA 5AQMA 4CZKA 1Q8IA 3CI5A 5BR9A 2NRTA 3QERA 3OYCA 3E1YA 1NGGA 3CCRN 3G6EN 3NH2A 5CYQA 1P00A 3T69A 1XHZA 4FXDA 3TWHA 4Y1CA 1VSIA 4G1QA 2JDQD 3B6OA 4IOXA 4F2SA 5AJ3K 5EOYA 1TKZA 1S6PA 2YNGA 3BDPA 1K73O 2KW4A 3JS6A 3O9RA 1JCGA 3LDQA 3VOVA 4B1UB 2P9NB 3V1QA 2PAVA 4H8KA 2QEXN 3SAGA 5BN8A 1WSJA 5I3UA 1YITN 2HHUA 3OS1A 4LC9B 4K41A 3O4NA 1U2VB 5AQWA 2Q1NA 4JRQA 3IAYA 1XRSB 3S9HA 3HZ6A 3D45A 3OYLA 4BVPA 5FROA 3RVCA 2NRVA 4W5TA 4DFMA 1IKXA 3GKUA 3CC7N 2E0HA 1OMYA 3BY5A 1HPMA 2WFBA 3GE1A 1Q9YA 3OYDA 2FLOA 4JHDA 3SMPA 3L2RA 2EX3A 3SUQA 1PE4A 4JKBA 1MR4A 3HSTB 3AO1A 3LZIA 3TAMA 2A40A 4C8MA 4JI1K 1LQIA 3I33A 1UAXA 1WAJA 2VWBA 4M41A 4H5VA 1W7AA 5DMRA 1X9WA 4FJ8A 1D5AA 3DJCA 3DM2A 3F9KA 4A5BA 1YIJN 1ZBUA 1SQKA 4FM1A 1RT5A 4OPHA 1VSFA 3F5TA 4FWQA 3HOTA 4RW6A 1LCUA 3OYBA 4M3YA 4CEDA 1IV0A 4CHOA 2LI7A 1NGCA 1C0FA 2OA8A 1E3MA 4K25A 2MZ0A 1HNIA 2WUSA 5JICA 3HPHA 1KLMA 4CZFA 2J4RA 2Z1IA 3BGRA 4KRFA 4DV0K 2D4WA 4JI2K 1VSMA 2HSTA 4BDPA 3VGLA 2JGUA 2Q0UA 3ZSRA 1K8AO 3P38A 3O8MA 2YHWA 4CE9A 4DKWA 4DQIA 1WSIA 3FR0A 4BQZA 4J2BA 4BDYA 3LWMA 3V9ZA 1FKOA 3W3DA 1WSEA 2I7NA 3S5TA 2NZTA 3VEOA 2LJ7A 3JYTA 1RDCA 1GPSA 1DGKN 4DUZK 1S6QA 4M45A 1BMRA 3TTCA 1K9MO 3QNNA 5M1NA 3SUOA 2VGMA 4ISFA 1T44A 4JK9A 1ITGA 4BRFA 1VQMN 3A5OC 4FK4A 4JI7K 1SL2A 2P9NA 3Q7BA 3J8AA 1ZBFA 3BZKA 4FVUA 1WBBA 4DR6K 3LAMA 2YX6A 1EWQA 4JK7A 1U2VA 4WCEL 4BRHA 3SNNA 1NK4A 4LSNA 4XH4A 1SS6A 4FJNA 4E1JA 1O13A 2I61A 2ZGYA 3HTVA 2ZJRL 2HNDA 4XH5A 1I3AA 1J9AA 3OBYA 4EFHA 3NF7A 1I39A 3C65A 3A5LC 5LMNK 1VRUA 3KLEA 5CYMA 2BRZA 4A5AA 1KCFA 2NRZA 2GUIA 4IOCL 1RGIA 2RF2A 3CF5L 4DF4A 3CQXA 5JVHL 3I55N 3QETA 1GLBG 2ZF5O 2P9LB 5AQHA 4BGAA 4HTUA 3KD1E 1YTUA 4OKKA 2ZD1A 3U4LA 3NDKA 4H5WA 4RW7A 3NH1A 1HNZK 1ATSA 3QBWA 1Z25A 4FM0A 3CFPA 3CFOA 2JWKA 3OBWA 3O08A 3P31A 4M3ZA 3V9SA 2ETJA 2Q36A 3I0SA 4KTWA 4BRDA 1X9SA 3VQ4A 4E89A 4ISEA 1LAWA 4YOYA 3SQ2A 4BE1A 2FBXA 3IUCA 3CCLN 4N47A 2HB5A 3ZSQA 4J2DA 4JI8K 3SJJA 4B9LA 4CJPA 4O8KA 4CBXA 4M3XA 2FBVA 1XI1A 4OGEA 4FO0A 3OJSA 3CCSN 3AVAA 3O80A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VQ7 A;  2IC3 A;  4E7K A;  1GLA G;  1TL3 A;  2Z1J A;  3M8P A;  5BRD A;  3FLC O;  1FK9 A;  1DTT A;  1T03 A;  4GVE A;  4FJ7 A;  3MMV A;  1SL0 A;  4DTN A;  2E6M A;  2I7P A;  2GTD A;  4KHS A;  1JKH A;  4OKJ A;  4CHQ A;  4DU3 A;  2YHB A;  1BO5 O;  4GNI A;  3KOW A;  4PL7 A;  2WTU A;  1C0M A;  4H0T B;  3L4I A;  3QEI A;  2RHK A;  2Z1G A;  3VET A;  2IS3 A;  3RMB A;  3CW4 A;  3N4P A;  3J80 O;  3LDO A;  1N34 K;  4H0X B;  3M5R A;  3DLB A;  3P4I A;  3CME N;  3NF6 A;  3SPZ A;  4CVN E;  3KJV A;  4AAZ A;  1U45 A;  2VY6 A;  1HYZ A;  4B8C A;  2RE2 A;  3VMF B;  1RNH A;  2KZM A;  1BG3 A;  1BOT O;  2BH1 A;  4MQ3 A;  4CHZ A;  2HHX A;  5C2F A;  1NJI O;  2HHV A;  1J54 A;  2WBN A;  4ICL A;  4QS9 A;  4CI6 A;  1SV5 A;  1LOT B;  3CG7 A;  4Z4G A;  4X65 K;  4IFE A;  3LM9 A;  4FLY A;  1XHX A;  4EIA A;  4UQG A;  4IZ9 A;  3KWG A;  5CY4 A;  2ASO A;  3V1O A;  4IBN A;  4DUY K;  2ZQB A;  4JS4 A;  3O9S A;  2UUB K;  4Z4H A;  4K8Z A;  2QWR A;  2O4I A;  2NRH A;  3HVT A;  4DV7 K;  3GDQ A;  5LJV A;  4FL9 A;  4XEI A;  5HLF A;  1NMD A; 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