3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ISNC 1NK0A 4HTLA 1DEJA 4WQ4C 4DR5K 2KHOA 1WNSA 1WBDA 4CEEA 1ZXOA 3TTCA 2Q31A 3VQBA 3NHGA 4U67L 3AO5A 3AVCA 3QEPA 3VPZA 1E4GT 5AQFA 4H5NA 4CJKA 4ZHRA 3P31A 1BO5O 4H4OA 4DR4K 3OHRA 1RT6A 4DR3K 1NNEA 1QHTA 4C8NA 4BRLA 4RW4A 3M5RA 4LF5K 1HQEA 4ISEA 3TI0A 4DFJA 4XEIA 1IJJA 4IJAA 5J2QA 1M1KO 3BF1A 3DOLA 1WBBA 4M3RA 3UIQA 1N36K 3GE1A 4KHPK 4Y1CA 3TPQA 3THWB 5AZJA 2E20A 4TSXA 1J5OA 2O8CA 3HT3A 4BWMA 1NK4A 3L2WA 4DTRA 1NMNA 3VOVA 4CFAA 5DM7L 3NMUA 5KI6A 1JXEA 3DMJA 1WSGA 3V81A 1KAYA 3AVLA 3OVNA 4IDHA 4ELTA 4FM2A 1KC8O 4YOUA 1JLBA 4DFPA 2A42A 1E4FT 4QCLA 3CMEN 2HW3A 5KQ8A 3E66A 4RWTA 4DSJA 2HVHA 3W0LA 1BA0A 4I7FA 4DV5K 4OLAA 2O4IA 4QAGA 1SL1A 2OPPA 1KLMA 4Y1DA 3DWLA 4C1NK 2UUBK 4CIFA 1HQUA 2CH6A 4HWIA 2FSJA 1RDBA 4MO5A 2ZGZA 4CIEA 2QXLA 3CQ8A 3MECA 3OYJA 2HSTA 4EZ9A 3U8XA 2QKKA 1JCGA 3F2KA 2HOEA 5EOYA 4IDKA 2BANA 2YNHA 4DCHA 4B9VA 3OYIA 1EQYA 2IS3A 2IVOA 4DV3K 4E3SA 3THXB 4IO8A 3ZEUB 2ZGYA 1HNZK 4CEZA 3VN5A 4W5NA 2FSKA 4JK7A 3QERA 1C1CA 4DF4A 1RT3A 4FVUA 4FLTA 4BG8A 5I9EB 5M1NA 1BDGA 1CZBA 1MU2A 1ATSA 3F9MA 3N4QA 4AHRA 4BRIA 4K8ZA 3NH1A 1Q81O 1NGBA 1RT1A 3QICA 2YHBA 2ITMA 1TKTA 4CJVA 4KHNA 4OX9K 1BISA 2PZSA 1TVRA 3HSCA 1VQKN 4GW6A 3QEWA 4FZXC 3L6QA 2W42A 1YJ9N 3CETA 3CMAN 1IKVA 4NCGA 3ENOA 3W3DA 1XNQK 2XY5A 4CBWA 3O5BA 3G6EN 4ILHA 3PO5A 2E6MA 1RBVA 4WCEL 4LF9K 4B3MK 1BL3A 1GLJO 1YAGA 4FWLA 4M63C 4DTNA 4GV9A 3PX4A 3AVKA 3HM8A 4J2EA 2UU9K 2FSNA 4G9ZA 4MQ3A 4CJ3A 4NLCA 3DXKB 3K58A 4BR9A 3EKUA 5AJ3K 4HUEA 4CZMA 3WXIA 3MN7A 3VQEA 1W9HA 1BQMA 1LWCA 4I2PA 2DTUA 3VQ4A 3QFUA 3I8DA 4FLYA 3E01A 1QZ6A 1RDAA 5HLFA 4FPAA 4IOCL 3VEVA 4Z0UA 3BEXA 4EAHD 4CJEA 5KTQA 4NCBA 3NFAA 3WT0A 4BC5A 1IKXA 4FL9A 1TYQA 3CCLN 2B4JA 4DQQA 3KTQA 3IMXA 5ELZA 2XHBA 1LAWA 2JWLA 3VETA 4HUFA 1U4BA 4H5RA 4BWJA 4CIGA 3OS1A 4A2BA 5HOOA 1NM1A 3ULDA 5BREA 2HNZA 2ZJPL 3MN6A 3J7AP 4CCHA 3RMDA 3O9SA 2AJQA 2DFEA 4FLXA 3WNEA 3CD6N 2P9NB 3SJJA 2J4RA 3QFPA 3SLCA 3OYCA 4PKIA 3OYKA 4J2BA 3V1OA 4DV2K 4AQYK 3L2QA 4AF1A 3QESA 3CCRN 4IKFA 4K0KK 4C1NI 1RDUA 3HRGA 2O8EB 1JLQA 4CZGA 4K41A 5J2NA 4XH5A 4W5RA 1IKWA 2HHSA 2PY5A 4BGAA 3AGKA 4EP5A 3ZSXA 5DM6L 2YHYA 2NRVA 1J5EK 1BWFO 4L3QA 5HL7L 4CEBA 3FFIA 3UKUB 3HSTB 2NUBA 4BQZA 2F4VK 1KD1O 2P9IA 3QEXA 4GKJK 3E9LA 1ASWA 2ASPA 4DB3A 5AQWA 3ZSWA 4NB4A 2P1JA 3HVTA 3F5TA 3CJ1A 5EY4A 3AO3A 2BUPA 1EX4A 3CJAA 3H3OB 1P90A 1S6QA 3VEXA 2KKZA 1K8AO 3OBYA 4H0VB 5AQSA 3ID6A 3WNHA 3L2UA 3DI6A 4CEOA 3SUOA 3MDQA 4BRHA 3SCXA 4B8AB 1P8ZA 4GVEA 4Z4FA 1L3SA 2W6LA 1NK8A 3OW2M 5JS2A 3CCQN 1QSSA 4JKBA 1WAFA 3O1BA 3V9WA 4CHPA 1C1BA 3V9SA 3JYTA 4RW6A 2VWKA 5BRFA 2D1KA 4F4KA 1XUPO 3V9ZA 3RRHA 3NBPA 3DXKA 3ULEA 4FJ8A 4YDUA 1RNHA 3H6EA 3CCSN 5AZIB 2OYQA 3ZLJA 4F8RA 1NJIO 2XO7A 5AQZA 3SPZA 2P9SA 4N56A 2HBMA 4HTUA 5JMVA 1ZC6A 4CEQA 1ESVA 4BRFA 2BTFA 5HRPA 4F9OA 1OH6A 4BROA 4CZIA 2NLXA 4W5QA 1NK5A 2P9UA 3QIPA 4O55A 3H1VX 2KQ2A 1U04A 3QLHA 3VQAA 3NF9A 2G8IA 5AQPA 3LAMA 5TKWA 1HKGA 4ID5A 4WFBL 3IDHA 4OKKA 2VQFK 5GINA 1EXQA 2ZJQL 4FK2A 3AVAA 5AQLA 3EZWA 3THVA 3DJCA 4Y0WA 4BR2A 2G8HA 4CI6A 4BRNA 4CZFA 4YOWA 3D0PA 1N32K 1BG3A 4A5BA 5GIPA 1HLUA 4O0IA 1XMQK 3ZT4A 2WONA 2NRHA 1DLOA 2FBXA 2CGLA 4DFMA 3VQ9A 1RTDA 4PWDA 1I3AA 4GVMA 1S1VA 2P9LB 4LSNA 1K8KB 1FKPA 3D2FA 1YXQA 4DWIA 5FLXO 3U9DA 3KD1E 1C0FA 4KH6A 3QIOA 4CGJA 2WOMA 4WFNL 1IBKK 4H0XB 2EWSA 4CFBA 1JJ2M 4YOTA 5KRSA 2X6NA 4KHQA 3CCEN 1BOTO 2XY6A 1KFSA 4ILGB 3VQ8A 1N34K 5CYMA 3CERA 3SBGA 3RMCA 3V9XA 1RDWX 4MO4A 3A5OC 3MXJA 4W5TA 4X65K 4JI4K 1A5WA 1VSEA 3TAQA 2JGUA 5BPLA 4NCAA 3M8QA 4CJTA 1W2BM 2D0BA 3THWA 5AZJB 3M8PA 3CHWA 2RN2A 4M3TA 4ELVA 5FRMA 2A1SA 1D9FA 5E84A 4AHSA 4LF7K 2IIRA 4JYAK 3VQDA 3NF8A 3NCIA 1OH5A 5FPMA 3VQPA 4CEDA 3C7NB 4LY7A 1CZAN 1TYQB 2D0CA 4DQIA 3B6OA 2HMPA 4KFBA 4DSLA 4DTOA 2GUPA 1X9MA 3PUFA 3D45A 3ZX3A 3A0IX 2I7PA 3CJCA 2ASOA 4IO9L 3SPYA 3GBTA 4BR0A 4FWKA 2GX9A 4CBUA 3AVFA 3KLGA 4FOIA 3QO9A 4FW2A 1NJXA 3U9ZA 4FJNA 3MXMA 3RRGA 4B3SK 4RW9A 2E2PA 3ZCMA 3QBXA 3IUCA 1C0TA 3VENA 4N41A 3QDKA 2VQEK 4JKFA 4PKGA 1JLEA 5SWMA 2KLAA 2YHWA 1N8RO 5JVGL 4JS5A 3L8BA 4H8KA 5IT9O 3HBTA 2O8DA 1S9EA 1TL1A 1QTMA 1HNWK 4DV6K 2I5JA 3QB0A 3VGMA 3O80A 1C1AA 2P9NA 3J81O 1YIJN 4DR6K 1VQON 1IG9A 1NLVA 5C2DA 1TUYA 3AVBA 3VF6A 4L8RB 3MEGA 4JEPA 1R0AA 4NYNA 1RTJA 1BQNA 3SQ0A 1SKSA 4DQSA 4B9UA 3TSPA 1WOQA 1BIZA 2A3ZA 1MWMA 1HNVA 3ZSZA 2ZJRL 3KK3A 3ZETB 3SJHA 3VQ6A 2AA4A 4B9LA 2G8FA 4B1VA 3HPOA 3IS9A 3M1FA 4OPAA 3JAMO 3O3FA 3OYNA 3CG7A 2RE2A 1TK0A 2BDPA 3R1XA 4XIUA 5C24A 4BRAA 3DM2A 5HBMA 1SUQA 3DXMA 1U6ZA 4FLVA 2QWLA 1IV0A 3WEEA 4CD1A 3CM6A 4CHZA 1S1WA 1S22A 4BRGA 2X78A 2P9PB 5J1EA 4GY2B 4BVOA 5FPDA 2P9IB 3SUQA 4ILJA 3EZ5A 2E5LK 1IG8A 4BRQA 3R8EA 2Z1IA 5C25A 3CPEA 2B5JA 4CF8A 3ZX2A 3KKSA 1QSYA 4CJ4A 3D2EA 3HI0A 3CFRA 2D0OA 5AQHA 2Q36A 2HHQA 4AHTA 1KSPA 4DTPA 4LSLA 3FZLA 4OKJA 2UXCK 4IG3A 3LP1A 1E3MA 3CIPA 4E1MA 4DKWA 2UYTA 3OJSA 1RT4A 2EHGA 3LPUA 1HYSA 1SL0A 1ATRA 4FW1A 1LW0A 3FFKB 5C42A 4KHYA 3PSIA 3AV9A 1NJZA 3V4IA 4JKGA 4DLEA 4E7HA 1FXXA 2HNYA 4KHUA 1X9SA 1GLLO 5J2PA 3RWUA 4DV1K 2W6KA 3OA9A 4IWVA 4LC9B 5C2FA 1KFDA 2VCPA 1V4TA 5FPNA 2QWPA 4H0PA 3P83D 5C0YA 2OCEA 3F9KA 3PSFA 3CYMA 3C94A 3LL3A 4FJMA 5GAGP 4E0DA 4AH9A 4A5AA 1EO1A 1MDUB 3THYB 4ZTJA 4B08A 4FZYA 3H45C 4BQLA 3CCJN 2ZQBA 3SYZA 1S3XA 2OZSA 3WQUA 3KD5E 3EN9A 4PKHA 2FF6A 2Q1NA 2GTDA 2P9KB 4DTUA 4BDPA 4H0YB 4BR7A 3TU5A 5GAHP 1NGCA 1OH8A 4M41A 5B8HA 5KPTA 4H4MA 1VSFA 5I42A 4GNIA 2F9WA 4DV4K 1U49A 4CVNE 2Q2RA 3OYLA 4DMNA 4CFDA 3TABA 3P1GA 3PY8A 3AA3A 4NYFA 4X62K 3OYFA 4DUYK 2FF3B 1NGFA 1TUUA 4ID1A 3KLFA 4KB0A 4CE9A 1YTAA 1U2VB 3U3GA 2P9LA 1KTQA 3PV8A 1GLEG 4I2QA 2A6AA 3SNNA 3KZBA 4IFEA 4FZZA 4OO1J 3D2FB 5AFUH 1TKDA 4WQ4A 2Q97A 4OLBA 5BN8A 4BC4A 4Z4HA 4RCHA 3ATVA 4B9TA 4KAZA 2XRIA 4V19S 5CHIA 3DAWA 5AQGA 4BE1A 5TKYA 2HBJA 2O8CB 2OPQA 1ZBHA 2UUAK 1X3NA 4B3OA 1RT5A 3QNOA 5HRRA 3OYBA 4B1XB 5CZ2A 4IBNA 2D4WA 4JKCA 4OJRA 2XY7A 1B92A 1YTUA 3NH2A 4CZEA 3AAQA 3TR8A 3VQQA 4F2SA 5MLCQ 3A2FA 5JLHA 2HHHK 1SV5A 4MLHA 3LDPA 3V9UA 4EZ6A 5FPEA 4JI5K 3SQ2A 2QWMA 4FM1A 3DLBA 4JI8K 1QSLA 5JICA 1JKHA 3FZMA 4BY9C 3O3HA 3S3NA 2VWJA 3CC2N 3GOIA 3T1YK 3V6DA 1WLJA 3CJ7A 3ENHA 3CC4N 5KQDA 3I0RA 1VQ8N 1NGJA 1IBMK 1IO2A 4CFCA 3ZT1A 1YJWN 1ASVA 2FBVA 3L0QA 3WXJA 5HRNA 5AQXA 1JL2A 2KFNA 1CZ9A 3AVMA 1CLQA 1KAXA 4KO0A 3PIPL 3Q7BA 3RR8A 3P38A 5BR8K 1C0MA 4LH5A 3VGLA 5LJWA 1NK7A 2PBDA 2WFBA 3ZETA 1JLAA 1NGHA 1WSHA 3THYA 2WTUA 3MEEA 3NDKA 2F9TA 3CFOA 4BACA 1B9FA 1T6DA 1GLDG 4Z4IA 2P9KA 4CEAA 1JLCA 3FZKA 3MN5A 2P5OA 1VQ6N 1W0HA 2YHAA 4C8OA 4CJLA 5BPNA 4H5VA 4O5FA 3AVJA 1RCHA 1RBUA 4DF8A 4CJQA 1JL1A 2Z1GA 3BDPA 4JS4A 1D8YA 2IVPA 1RT2A 3VQCA 1DT9A 3K5MA 5LJVA 5SZTA 1G99A 2YNGA 4K42A 5D3GA 3OS2A 1VK0A 4FWSA 2NRZA 1NJWA 2RKIA 1SQKA 2HHTA 4IZ9A 4LF4K 5DMRA 1SL2A 1Z6RA 4LFCK 4CJWA 3O6WA 4BE2A 4CGFA 2E1ZA 1HPMA 4JKDA 4GMJB 1N5YA 3HYFA 2D5RA 4CJ7A 1NBWA 1NJYA 4KI4A 3SQ1A 1DKGD 2WUSA 4HCCA 2OTLN 3P39A 1X1PA 1SAZA 4JKEA 4ICLA 3RSEB 2HHWA 1RT7A 4CJ5A 2E88A 2ZWHA 1HKBA 1HKCA 2YJEA 5AQTA 1EWQA 1IBLK 4JAXA 4RTFD 2QK9A 3MX5A 1U47A 2HHXA 1OKJA 2HHUA 3P4IA 1KRPA 3NF7A 1FW6A 1VHXA 3DRPA 2RF2A 2HF3A 2YCHA 3AY9A 3PLAA 2ZE2A 3LM2A 1EWRA 2DY4A 4AM6A 3TANA 3NGIA 1NGIA 5LMNK 3OS0A 5AFUA 1RILA 1VQ9N 2P51A 4Z4EA 3HOTA 5IWAK 1FJGK 4JI2K 4CHOA 2X6SA 5DK5A 2O4GA 4A59A 1YT3A 5KPZA 1TK8A 4A57A 3VEOA 4B9SA 1B9DA 1J6ZA 3SUNA 5KGXA 3THXA 2VGMA 3ZEUA 4FXDA 4UQGA 1X3MA 4ISFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3HRG A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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