3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AFUA 3ZLJA 3D0PA 3OYNA 1HPMA 4CECA 5CHIA 3P38A 1TL1A 3AO3A 4Q0BA 2AP1A 2G8FA 4EP4A 2A41A 3G6EN 4DV4K 3A2FA 2P9IB 1BA1A 2NZTA 3CCQN 5AQMA 3TAQA 1SQKA 3E9PA 3IFRA 3OYLA 4H5WA 4XEIA 1P90A 1JXEA 4CF1A 3TTDA 2RF2A 4O8UA 1L5UA 1RT4A 1J5OA 3NF8A 3RRGA 3C6TA 1MDUB 1HKBA 1DEJA 1R59O 3WEEA 2IVNA 5IWAK 1QHTA 3RRHA 2RN2A 4F9OA 5HRNA 1RCHA 5BPMA 2PAVA 1TYQA 3H6EA 3TAFA 4GNIA 4CJQA 4BY9C 5KQDA 1WLJA 4L3QA 4PA1A 2JGUA 2E20A 3C6UA 1ASVA 3I8BA 3EKSA 1CZAN 4O4GA 4DS5A 5HBMA 3SK3A 2P9SB 5FPDA 3OYCA 2HW3A 1FXXA 4IOXA 4BC3A 1OH7A 4NYNA 4OGCA 3ENHA 4CVNE 4DTUA 4JI7K 5I9EB 3FZFA 1NKCA 3A0IX 2ETJA 1BCOA 3KWGA 4CJFA 4WF9L 3VEOA 2HHTA 1C1CA 1KVBA 2FC0A 3M5RA 5HOOA 4H4MA 4CD3A 2P9IA 4YHHK 1GLBG 3R3LA 1QZ5A 5TKWA 3NF7A 4BE1A 3BP8A 2OA8A 5EVZA 3UE5A 1DKGD 4BDYA 2GWKA 2RPIA 4NXMK 3NMUA 2FXUA 5LJVA 1TGOA 1EWRA 4FJ8A 4IXCA 4UY8O 4CF2A 3SAGA 4FZYA 3AVFA 2ZE2A 1GLDG 3GOIA 1G99A 3VQ7A 5BRHA 1J54A 1JLQA 4EZ6A 1U48A 5SWMA 1HNZK 2P9LB 2NRWA 4DTJA 1T3VA 3VQAA 2P9SA 3PUFA 4DMNA 4FLVA 1S22A 2E2PA 2YHYA 1BHLA 2ZWHA 5AQQA 1T44A 4X64K 5C2DA 2A40A 3EE9A 1LAVA 3CCUN 3FLCO 3VENA 3B6OA 4K25A 4MDBA 1VAZA 2JWLA 3DLRA 1ZBLA 1NKBA 3V9ZA 5AQGA 4ISFA 2HHVA 4CJ3A 4U7BA 1BU6O 2W40A 4B9UA 2XHBA 4HTLA 4FPBA 4IJNA 4JEPA 3S3MA 3QNOA 3MMVA 5LMNK 4FK2A 4O44A 4KH4A 3MX5A 4BRKA 3B6PA 5AQUA 3OTOK 1SV5A 3OYFA 3FE1A 1RILA 1U6ZA 1IKXA 3O9RA 1Z26A 4DS4A 1UOCA 3CI5A 3N4PA 2EX3A 2HOEA 2GEMA 3DOKA 3LM2A 3QINA 1VSKA 1WSHA 3WNHA 5AZIB 3MEDA 4KTZA 1NMDA 3WNEA 2Y1IA 3WXIA 3PX6A 2P9LA 2W6KA 4O55A 4C1NK 3HP9A 3V6DA 2AJQA 4GW6A 4DR2K 4LFBK 4NCGA 3EO3A 3IUCA 5SZTA 4BRLA 3HOTA 4H0YB 4O5BA 4DSIA 3TAPA 3AVKA 3TARA 1NOZA 2NLXA 1QS4A 4DV3K 3IKMA 4KH5A 4GV6A 4B3OA 1NGCA 3ASMA 4Y1DA 5KQ8A 1U47A 3U3YA 2VG5A 3T3FA 4B9QA 3V81A 3LWLA 4IOCL 1C0FA 4FLTA 1DGKN 2DFEA 4YORA 4PWDA 1NGJA 2WBNA 1NGAA 2BDPA 4JRQA 3DXMB 2OZMA 5AZIA 1A5WA 2GUIA 1DT9A 3AGRA 4IKFA 2QM1A 1W9HA 5AZJB 2E4LA 2VWBA 5FLXO 1C6VA 3S3OA 4GVEA 1JCEA 1X9MA 1UA1A 4Z4GA 5C25A 5JS2A 1KXPA 4XH4A 5DK5A 2IIRA 3F9KA 3U4LA 3T1YK 2CGKA 5HL7L 1K9MO 4CEAA 3ZT1A 3KWIA 5FRMA 1TVRA 1SKSA 3TAGA 2DY4A 1ATNA 4JKHA 1NOYA 4KBOA 3LALA 4BGAA 2ITGA 3T69A 3E01A 3CCRN 2Q97A 4DLGA 4KKOA 1X3NA 3V1OA 4ILGB 3PIPL 5KPZA 3TANA 4A57A 3D7EO 4F2RA 3PSIA 4IFEA 4OPHA 4YDUC 2HHQA 4A2BA 2O8DB 4ZTFA 4BQZA 2O4IA 2HHHK 1NK0A 4ELUA 1JLCA 4CBXA 3NGIA 2A3ZA 3R1XA 1CZ9A 4BRCA 1FKPA 1NK4A 2HB5A 1YAGA 1LWFA 1JL2A 3DXMA 2E1YA 3O80A 2BTFA 4FM1A 1T8EA 5KGXA 2VCPA 1I3AA 3EYZA 2G8WA 2V7ZA 5AZJA 2QWNA 3DLKA 5CR4A 4DSFA 3PIOL 3PO4A 2WTUA 1KVAA 1NJZA 4N76A 4CGHA 4JI3K 3LZJA 4FWRA 4NO7A 1BQNA 1FW6A 1ILYA 2P9PB 4B1ZA 1ESVA 4CZJA 5GIPA 2E2QA 4CZIA 3VF6A 1NGEA 3I55N 1A5VA 1KSPA 3U6FA 4CGJA 2NUBA 4K8XA 5HRPA 3BZKA 1HQUA 1WBBA 3EZ5A 1XMOK 1KC8O 3E9OA 4EAHD 4E0DA 1QQOA 1QQNA 2UUCK 2FBVA 4H0VB 4YY3K 2VYPA 4OO1J 2WUSA 3GDQA 3MAQA 1U45A 4JYAK 1FK9A 1ZBFA 2VGNA 1ATSA 3M8PA 1S72N 3K9KA 3CC4N 3C95A 1OVYA 2O8DA 2HBKA 2G8IA 4DV7K 2FBXA 3VETA 3CD6N 2IVOA 3SQ4A 2YNFA 3LPUA 4AHCA 2HVIA 3LDLA 4FW1A 4N5SA 3EN9A 4YOYA 1H1VA 4DV5K 3BGRA 1ASWA 4IOAL 1L3SA 4CJTA 3ZT4A 2KKZA 4PUOA 1NGBA 3KLIA 2I5JA 3CM6A 3QEXA 3VEWA 3OYBA 2P9PA 5BR9A 5I42A 1NNEA 4RWTA 1KVCA 1ZBSA 3O8MA 2FBYA 2HF3A 3HYFA 1WBDA 4E19A 4FLZA 4FJHA 4LY7A 2VWJA 1VQMN 3QO9A 1SL0A 5F1XA 4JI6K 4DG1A 4DLEA 3S3NA 4GKKK 2YKNA 2GV9A 4PKGA 2ASPA 4FLXA 1BI4B 2I7PA 1NGIA 3VQBA 3OYEA 4CD1A 2YHWA 3ZSVA 3FGUA 3KD1E 2E2OA 2O8BB 3G25A 1IBKK 3NFAA 1VQ4N 1NJIO 4CIFA 3Q7BA 4KI4A 3FZHA 2Q0RA 1NGGA 3ZSQA 1C0TA 4K41A 3ZYYX 1WAJA 3QBWA 1NGFA 3VN5A 2QWLA 3AO4A 3K9JA 1RT6A 2ATQA 2HNDA 5AQVA 1TUUA 3O9SA 3C0BA 1T7PA 1C0UA 2HHUA 3CG7A 4PL8A 2E5LK 3I56N 1B92A 3L2WA 2OTJN 3VPZA 3DLHA 2O8CB 2JLEA 2KZZA 4H5VA 4WYBA 3VGKA 4DTPA 4FK0A 3TABA 1NJXA 1J5EK 3PV8A 5I3UA 1V4TA 5EOYA 1BQMA 3TAEA 2ZQBA 5CYMA 4FSVA 1XQSC 4HUEA 1BI4A 3OW2M 1XC3A 3HPOA 5H1SQ 4W5TA 3RMBA 3TAMA 4YDUA 2P5GA 3CIPA 4OPKA 3K2PA 3CERA 4FJJA 1GLLO 4FLYA 4JD2B 5AQKA 2O8BA 1X3MA 1NMNA 4FVMA 4OPJA 4CEDA 4FWLA 4IG3A 2A1SA 2UU9K 3NHGA 3SYZA 4CK1A 2F7TA 4A2AA 1Q7YO 3OYKA 3J7ZO 4YOUA 2FBTA 2X6NA 1IH7A 2O8FB 1ZC6A 1MWKA 4JK8A 1B9DA 3TSQA 3CMEN 1QSSA 4F8RA 2D0AA 5K14A 3O1WA 2A1RA 3PX0A 4DKWA 4PKHA 3THYB 5D3GA 2O8CA 4HVJA 3OS2A 2UUAK 5LL6Z 5BN9A 3G71N 2HVHA 4BRAA 2ZJPL 4O0JA 1HLUA 5FPMA 5BREA 1HNXK 3C6HA 2QWMA 3DRSA 1Q82O 2G8UA 1JKHA 4B1XB 1TKZA 2AA4A 4DSLA 4BR0A 4I9QA 5C0YA 4QOZB 2I7NA 3W3DA 4WQ5C 3EY1A 1JLGA 3DRPA 3VQ9A 4H03B 3BUZB 4UQGA 3RR7A 1HQEA 4JD2A 4DR6K 3AVHA 4E7JA 1KCFA 1E4GT 5JICA 2E88A 4KH6A 3J81O 1S9EA 4Y0WA 3ZETB 3RR8A 4CJLA 3QLHA 1IG9A 1SUQA 3LDSA 4H5RA 3V1QA 2Z1HA 4M3RA 4H0OA 4ISGA 4LF5K 1RDAA 2HHWA 2OPPA 4CGIA 4C8KA 3VERA 3KK3A 3SMSA 3LANA 4FJ7A 1I39A 2UXBK 1M1KO 4CFAA 4CZEA 3DLLL 1RDWX 2O8FA 4ELTA 3PO5A 3QEVA 4W5NA 2QXFA 4CJUA 1IV0A 3ZSZA 3D2EB 4B9SA 3B8AX 3THYA 4B1UB 3FR0A 3H1QA 3S9HA 4CHYA 4B3RK 3VQ4A 2D0PA 2F96A 2OANA 3ZX3A 4Y1CA 3THVA 3VA0A 3E9LA 4OKKA 3SUQA 1HNIA 4ISEA 5J2PA 4WE1A 4CEOA 4BG8A 1GOAA 3OBWA 4JI2K 4FOIA 3NDKA 3OYMA 4L8RB 4DB3A 5KPRA 4BRMA 3HSCA 4G1QA 4KFBA 5HLFA 4DV1K 1TAQA 2NRZA 2YNGA 3CPEA 3QEWA 5C2FA 1GLCG 4CJ7A 3EKUA 2D0OA 3ZETA 1WN7A 4F3OA 3R8EA 3ZSYA 1MWMA 5ADXA 3QFUA 3GL1A 5J2QA 4NCAA 1CLQA 4F3TA 1BUPA 1HPZA 1BL3A 4LF8K 3C7NB 2OTLN 4QS8A 4LF9K 1VSDA 2QA4N 1EQYA 3LP0A 4M3XA 3PSFA 3AY9A 3IG1A 4H0TB 4AHRA 1TKDA 3JYTA 3LPTA 4DHYA 2VQEK 4JI5K 3D2EA 1S1UA 2BANA 1HMVA 1ZXOA 2A42A 4JKGB 1QQCA 1WSFA 1UAXA 3SQ0A 5AQXA 1XNRK 3QIOA 4AILC 3CQXA 4OPAA 2FSKA 4CCHA 3H08A 2UXDK 1RDCA 4RW4A 1VSMA 3VEXA 4JKCA 2XY8A 3H1VX 3VOVA 4B08A 1DTQA 4KO0A 2FF3B 2GWJA 3O4QA 2QXLA 4CJSA 4CK3A 1S1VA 4H5TA 5C24A 4U67L 3G4SN 2E2NA 1YVNA 5M1QA 4EHUA 1D9DA 3JS6A 3NH2A 2B4JA 3NF9A 3SUPA 2XY6A 3L3VA 1QSLA 1JCGA 4A5AA 4OLAA 3KVGA 3C7NA 4FZXC 1NGDA 4GKJK 1NK9A 1JLAA 2EHGA 3CHWA 1KLNA 1YJNN 4CESA 4BR4A 2KTQA 2HNYA 3DAWA 2OCEA 3WXLA 4BRGA 3L2VA 1IO2A 2IC3A 5CZ1A 4A59A 4FO0A 4JKGA 3KLFA 3AGKA 4DV2K 3OJSA 3AO1A 3K57A 1QSYA 4AHTA 1Z6RA 4J8FA 2FSNA 4YOVA 2BH1A 3RMCA 4KAZA 4CJWA 3HSTB 5EU7A 1XHXA 3KKSA 4JK9A 1YJ9N 4BC5A 4CW7B 1RFQA 1S9GA 4WQ5A 3KKRA 4DR3K 3T1AA 1A5XA 1Q8IA 3ZT0A 4ID5A 4E7HA 3CXCM 3SJJA 3KLEA 1BO5O 1U49A 4MLEA 4WFBL 4DFMA 2XY7A 3NBPA 4AHVA 3HJFA 1DLOA 4CERA 2A5XA 3I8DA 3VQ6A 4CIGA 4BRFA 1Q86O 1LWEA 3IMXA 5KPTA 5AQJA 3HVTA 1XUPO 4HUGA 4MLHA 4DQ8A 4FJ5A 3CCVN 3CF5L 4FWQA 2P51A 4B9TA 5T7BA 3QETA 1BGXT 3WT0A 4BDZA 5AQZA 3D6RA 2E8AA 1ZBUA 1K8KB 3JAMO 4M7YA 3CPWM 1IBLK 3JSMA 2CH5A 1N8RO 4GMJB 3I33A 2VQFK 3TSUA 4E7LA 4R5PA 2YV0X 3P1GA 4HTUA 3KLGA 3AVLA 5GAGP 2QWPA 2OPRA 1KRPA 2HBJA 3VQEA 1D5AA 4NXNK 4BROA 1KTQA 3NGZA 3SBTA 3HTVA 1GLJO 1HKCA 4RCHA 4IEIA 4BGBA 1YXQA 4BWMA 3IAYA 1REVA 5EX5A 2F9WA 4Z4FA 5M1FA 4WFAL 2R7YA 2Z1JA 5AFUH 2DFHA 4FL9A 1QTMA 3CFPA 4DTXA 4H0PA 1KD1O 3AVBA 4DTOA 3AA5X 3TI0A 1RGIA 4FVUA 4CEZA 4YOXA 4C8MA 4RW8A 3LZIA 1LW2A 2YHAA 3LAMA 4BRPA 2FLOA 2QW9A 4MFBA 1KAYA 5GAEP 4DWIA 3MXMA 3OYAA 1BISA 3HO1A 4JI1K 4O0IA 3P39A 3ZSRA 4CHPA 1K8KA 2EWSA 4OVLA 5J1EA 1WB9A 4OGEA 4QAGA 1Q9YA 2DPNA 4QCLA 2XRIA 1VSIA 1JCFA 3HRGA 4BVPA 2HBMA 4C1NI 5LMUK 4E1NA 5GINA 4F4KA 4BWJA 3F73A 2NRXA 4FPAA 2FSJA 3CFRA 2G8VA 3NE6A 2YX6A 1C0MA 4KRFA 4B9LA 3U9DA 2D1KA 4N47A 4CIEA 4CJKA 4HWIA 4FOEA 3TU5A 2BE2A 2W6LA 3SPYA 2GTDA 4M63C 1HKGA 1BWFO 4J2BA 1XWLA 2Q36A 3PX4A 3CCMN 2Q0UA 2CH6A 3ITHA 3TTCA 1BDGA 2Q31A 4KHYA 1GOBA 1LWCA 4H8KA 4FYDA 2KZMA 3M8RA 3FZMA 3OYIA 3HPHA 3HT3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3HRG A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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