3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I5JA 5AZJB 3KK3A 4C8NA 5FPEA 2DFHA 4CHOA 2FF3B 2HHXA 3VQDA 4DQ8A 2HW3A 1VSDA 4H5VA 2EWSA 3KHYA 3OYAA 4B9UA 3KIOA 3WNEA 3VEZA 2JWLA 1Q81O 2Z1IA 3DOLA 4JKBA 1KAYA 5HLFA 3R3LA 3BZKA 1U4BA 2BUPA 1GLBG 3B6PA 3CFOA 4MO5A 1HKGA 1BGXT 4FLTA 2YHWA 3A5OC 4B8CA 4DR7K 1GOCA 2AA4A 1KQSM 2E2NA 4Z4CA 3EY1A 4EP5A 3CHWA 3OA9A 3OJSA 5EOYA 3WNGA 2D0BA 4H0XB 3MWPA 3SMPA 4BR2A 4CHZA 1QZ5A 4BRIA 5DK5A 5I9EB 3NCIA 2KTQA 3SBTA 1NGJA 3J7YP 4NCBA 2HHTA 3AVBA 4AQYK 4A5BA 5KI6A 2P9UA 3IDHA 4BDZA 4DR5K 3J7AP 1CLQA 1V4SA 3BEXA 2BE2A 4E1NA 3O4WA 4BR4A 2VG5A 2PYLA 5DM6L 4CD3A 5AQQA 3VQ6A 4DV0K 4W5NA 4BVPA 5EY4A 3TAGA 3KLEA 4PL8A 3LP0A 4CIEA 3O5BA 3KK1A 1IG8A 5I42A 3AVAA 2KW4A 1BI4B 4GMJB 5BRHA 4JKDA 2FSNA 2QTDA 3C6UA 4WE1A 5GINA 1TKXA 5AQOA 3O6WA 4B8AB 3C94A 4CZEA 3ENBA 2HF4A 2F9TA 3S41A 4NB4A 1SKRA 3ZSZA 2G8WA 3ATUA 1VQ9N 4FWNA 1C0MA 3ZLJA 2P9KB 4E7LA 2PAVA 3QESA 1ZYQA 3M3ZA 4CZGA 2AP1A 4FL9A 1NBWA 2IAJA 4NCGA 2KHOA 3VF6A 2YCHA 4JKGA 2JGUA 4A61A 3FGUA 2F9WA 2HSTA 5GAHP 4Z4EA 4C8MA 4U67L 3AVKA 3Q7BA 3EZ5A 4HUEA 1P90A 1RDAA 2W6KA 5TKWA 3IRXA 5AQYA 4IOXA 5ADXH 3IG1A 1BQMA 1RT4A 4O5BA 4X64K 4MLEA 3MN6A 4FJMA 4I9LA 4ILJA 1TL1A 3C7NA 3ISNC 3QEVA 1NU0A 1NWKA 4AM7A 4B9NA 2RE2A 3U6FA 3CF5L 2QXLA 3DLLL 4H0VB 2O8EA 3KLFA 3T69A 4YNQA 1NJWA 3AA5X 3VQBA 4W5RA 3A5NC 1YJWN 4M3TA 3AO5A 2D5RA 2WONA 3ENHA 4ZHRA 3VQ8A 1S6QA 3FR0A 2DTUA 2RF2A 5AQPA 4BC4A 4DSKA 3AVHA 1KAZA 2PBDA 3O8MA 2O8FB 4IEEA 5AFUH 1FK9A 3O4NA 5C15A 1BOTO 1K8KA 2WOMA 3ZX0A 1GLDG 4CGDA 3O9TA 4K42A 4RW6A 1HNXK 2G8FA 3DXMA 5HBMA 4DV3K 5AQTA 3VTIA 3AGKA 2ZF5O 5ADXA 5KQ8A 1IBLK 4CJ7A 4BGBA 2YKNA 3ULEA 4CBUA 2H3GX 3VEYA 5AQMA 5KPRA 1NK6A 2O8BB 4CHYA 3M5RA 4XH5A 1HQEA 2XRIA 2CGKA 4HUGA 3HZ6A 1CXQA 1MWMA 4IDKA 2NLXA 2G8UA 4IDHA 3HSTB 4YOXA 5JS1A 2A40A 3VQPA 3CFRA 1RDCA 3DXMB 3L6QA 2WTUA 3SUNA 1YVNA 3QNOA 5CY4A 5AFUA 5J2MA 1TL3A 3Q7CA 4AHUA 4NO7A 5AQWA 3EE9A 1NKBA 2D0PA 4NXMK 1U49A 2R7YA 3R1XA 4DFKA 1W7AA 4CK1A 1QSYA 4CJ3A 4QCLA 3LZIA 2OPRA 3W3DA 4FLUA 3AY9A 3DYAA 4FJKA 4B3SK 3L3UA 1HX1A 3U3GA 1YI2N 4YOWA 4ILHA 2VWJA 1N32K 4DQQA 3WEEA 4CEQA 2X6NA 3K58A 1I3AA 1KFDA 1T03A 1N5YA 2B5JA 1DGKN 5CYQA 1JCFA 1HPMA 1S1WA 3FZKA 2V51B 1G15A 3BDPA 2OCEA 4B1ZA 1VQ6N 4R79A 3LALA 1T6DA 3CIPA 3V9SA 4LF9K 3VTHA 4CGFA 2O8CB 3O9UA 2A5XA 1JCGA 4FSVA 4HUFA 1BDGA 1NM1A 5C2DA 1K9MO 3KTQA 3QLHA 4KI6A 1WSEA 4OJRA 1OVQA 4DLEA 4CJUA 3T7ZA 4BRPA 1QZ6A 2QWOA 2YNHA 4KV8A 3RMDA 4ZTFA 4N47A 1WN7A 3AVMA 1HKCA 3LDQA 4DUZK 4O0JA 4FZZA 1VQ4N 4JNEA 3H08A 5BPNA 3LP2A 4OKKA 3EO3A 3GOIA 2W42A 2NRRA 3CJ9A 4NYFA 2HHSA 3CJ7A 3KLIA 2RN2A 2YNGA 3QIPA 1T6CA 4CCHA 3H1QA 2VWBA 2KZZA 2NRZA 5AQLA 2CH5A 3OYGA 1N8RO 3ULDA 4DR3K 1ZBFA 3WXIA 2O4IA 4DV4K 1KC8O 4FM0A 3MWTA 4KTQA 3SZ2A 2BANA 4DLGA 4OGCA 2XY5A 3VA0A 4PA1A 4JD2B 5J2NA 3K9KA 1U6ZA 1WBDA 3JS6A 3NF9A 3OY9A 3V9ZA 1VSHA 1FKOA 2Y1JA 3TSUA 3ZSYA 5HOOA 1QHAA 1ATRA 1HQUA 1OH6A 1GLFO 4NYNA 4OKEA 3SUQA 1HR0K 2Q2RA 3F2KA 3K59A 5FPMA 4KPYA 3I0SA 1J6ZA 4RWTA 4KH4A 3WXJA 4NXNK 1SKSA 2ZWHA 3UIQA 2QWLA 1BA1A 5AQNA 1ZBUA 3HPHA 4H0YB 3P38A 4JKFA 4FWMA 3DJCA 4PHTX 4CEEA 4J2BA 2BH1A 2ZGYA 4DQIA 1C1BA 3BY5A 1S22A 4BR5A 4EHTA 4X65K 4B1YB 4A2AA 1HPZA 1HNIA 3OBYA 3CQYA 3QB0A 3JAMO 1MU2A 3HT3A 1LWFA 1YTAA 2Y1IA 3CMAN 4UY8O 5JLFA 5C12A 4I6MA 1R0AA 2B6AA 2E2PA 1ESVA 2X6SA 1Y64A 1D9FA 3VEWA 4PL7A 3LWMA 4M3YA 3TTFA 2GTDA 1VQ7N 4AHVA 1FKPA 3D2EB 4E1MA 1Y97A 4B1UB 4YORA 3DLKA 4DU4A 1HMVA 5BREA 1REVA 4JI8K 4BRAA 2XY8A 4FLYA 3BGRA 3CC2N 3GBTA 1UWBA 3I33A 3RRHA 3ZX3A 3CERA 4J8FA 4IG0A 4EAHD 3OYLA 4M3ZA 2Q36A 3AVFA 3IUCA 4K0KK 3V1QA 3HP6A 4GVEA 4H4MA 3DMJA 1HUXA 3THWB 3ZT4A 3S3NA 2HB5A 4JKCA 2P5GA 4HTUA 4GKJK 2UXCK 3GG4A 4RW8A 3U9ZA 3MCPA 4BE0A 1YITN 2ZM6K 4W5TA 5AQKA 5HP1A 1K8KB 4K8XA 3TABA 3MECA 3ZSQA 2PZSA 4LF8K 1UAXA 4KHUA 4E7IA 1L3TA 1K73O 2IC3A 2P9SA 4F2RA 4FZXC 4CEBA 1QVFM 2FXUA 4DHYA 2OZMA 4RW9A 1WBBA 3C0BA 5CHIA 4DSLA 2FC0A 1FJGK 1NGCA 2Q97A 4IZ9A 5HRRA 1NK8A 4F3TA 4IJNA 3NMUA 3TSQA 4DF4A 3DI6A 3VQEA 3P5JA 1JLCA 4DV5K 1S1VA 1GLEG 3AVNA 3HYFA 1KTQA 1OH8A 3L0QA 5C25A 4FOEA 4CGHA 4YOUA 1KLMA 3NH2A 2QKBA 1XC3A 3ALYA 3SJJA 1F21A 1JLQA 5AQXA 1XUPO 3UB5A 4HVJA 2UUAK 2V7YA 4UQGA 2KQ2A 4EFHA 1X9JA 1WLJA 3DM2A 1S9EA 5F0XA 3OHRA 3K5MA 2ASOA 3ENOA 1D4XA 1KSPA 2G8VA 4K25A 4PKIA 1U2VB 2HHWA 3CETA 1W0HA 4JI3K 1TKTA 3I55N 3CJ1A 5HRSA 4ISGA 5JLHA 4DFPA 1HYSA 2P9KA 3VPZA 4DTNA 2E4LA 2HBMA 3QIOA 1MWKA 3VN5A 1DKGD 5GAGP 1BCMA 2IGIA 3O1BA 2NZTA 3DAWA 2E6MA 4C8LA 3LAMA 3ITHA 2I7PA 3ID6A 3OS2A 1RGIA 4BG9A 4M42A 5LJVA 1HNVA 4DTSA 1W97L 2GUPA 1NGAA 3D2EA 5AQSA 2YHAA 1HJRA 1IKVA 3GE1A 3D7EO 1R59O 4PQUA 3NF8A 3DLGA 4BQZA 2OZSA 3NBPA 4DF8A 4LF4K 3WNFA 4HCBA 1X9MA 1YAGA 1RT1A 4BVOA 1NNEA 2G8IA 3PO5A 1K8AO 3CQXA 4FCYA 5I3UA 5DMRA 3HJFA 3RR7A 1MDUB 2P9PA 3M6GA 5AQZA 1VQ8N 3CCQN 3C6TA 3CPWM 1L5UA 3MN7A 3V9XA 4DU1A 2P9LB 1NMNA 1J53A 4KB1A 1LV5A 3C65A 5BN9A 3OYBA 3CPEA 3F9MA 3SAFA 3VGMA 3UKUA 4CZIA 5AQVA 3WQTA 2OTJN 5AQUA 3G0ZA 1TK8A 4Z4IA 4E19A 3VF2A 4ID5A 2CGLA 4BRNA 1X1PA 5M1QA 4DQPA 2ASMA 2P9LA 4CF8A 4IEIA 3EE8A 3MEDA 3L3VA 3CC4N 3OYHA 3D45A 2ITGA 3KK7A 3HPOA 3QINA 5JS2A 5AQIA 4X62K 4O55A 4AILC 3LPTA 3CCVN 1M90O 4DSFA 4BRQA 1S6PA 3T1YK 3JXUA 1KLNA 4FJLA 4JKHA 3PSIA 1ILYA 4CHNA 3ZT2A 5HRPA 2ZJRL 4LFAK 1C6VA 4BRGA 3QEWA 4LD0A 2V52B 3RTVA 3M8RA 3HM8A 5J1EA 2D0OA 3MDQA 1JL2A 4Z4GA 3OYMA 3P83D 3MXMA 2WC9A 2RPIA 4C23A 4KI4A 3AVLA 4BY9C 2VG6A 4WYBA 1OH5A 5JICA 4H5NA 4QAGA 2W40A 5BPMA 5BN8A 4IFEA 3U9DA 4IOCL 2KLAA 1I94K 3QEIA 3MX2A 3V1OA 4LH4A 1BU6O 4F2SA 2ATQA 3H3NO 3MMVA 4C1NK 1LW0A 2HMPA 3RRGA 1BA0A 1BUPA 3RSEA 1NOYA 4IXCA 3FZLA 4JHDA 1N33K 4H03B 4LY7A 2OYQA 1YVUA 5B8HA 3LL3A 1S1TA 3NGYA 3UKUB 3MK6A 1YTUA 2NNWA 1IKXA 4ICLA 3IS9A 4N41A 1TGOA 2W41A 3LDLA 4OLAA 4V19S 3M1FA 1IBMK 5BR9A 1RBUA 3SJHA 3ZCMA 4FK0A 5LY3A 3VQ9A 4CGGA 3AO3A 1DLOA 3VEOA 4E7JA 2PFUA 4JKAA 5T7BA 3QEXA 4FZYA 4BWMA 5BR8K 3W0LA 3QDKA 4FJ8A 2X78A 4CJKA 2DFEA 4DV1K 2LSNA 3E9PA 1Z26A 2EHGA 2FF6A 3VF4A 3O3HA 4DCHA 3SPZA 2Q1NA 1KAXA 4FK4A 4K41A 4JD2A 4CW7B 5M1PA 2YX6A 3CCUN 4CEAA 5EX5A 1NKCA 1BIZA 5CZ1A 4CF0A 1RTHA 1ASWA 3F73A 4DR6K 3AO2A 3SK3A 3G4SN 2YHXA 2D4WA 2P9IA 3ZT1A 2QW9A 4B1VA 4IO9L 4RCHA 4DQRA 3TAEA 3QFUA 1WSFA 4CF1A 3KJVA 5KPTA 3TR8A 1HNWK 4KB0A 3NVMA 4DSIA 1FW6A 3AARA 2Z1GA 2ZGZA 4CEDA 5EVZA 4Y0WA 4C8KA 3CJBA 4B1WB 1P8ZA 1NGGA 5M1KA 4FJHA 3VESA 3KWIA 3NGZA 1WSGA 3E9LA 4DFMA 3KD1E 3GL1A 2O4GA 4BG8A 4N76A 4BDPA 1L3UA 4IKFA 3DRRA 4HCCA 4NCAA 4FM2A 3PX6A 2HBJA 3HSCA 4C8OA 4I6MB 4U7BA 4FLZA 3SPYA 4CEOA 2OANA 4Z4FA 1ZC6A 4BC5A 4GV3A 4RTFD 4GW6A 2GUIA 1B9DA 4M7XA 1BO5O 2UXDK 4CGIA 4K8ZA 5FPNA 4XH4A 3EYZA 3HOTA 4JRPA 2QEXN 3PUFA 2GWKA 2RHKA 3ZETA 4B1XB 2A3ZA 4LH5A 2OA8A 3CXCM 3OYIA 4M3XA 3SMSA 3H46O 4EIAA 4LF7K 3KVGA 3OYNA 1T3VA 1ASUA 3HRGA 3SQ2A 4JV5K 4G9ZA 4CJTA 1C0FA 3MN9A 1CZBA 1WB9A 3SQ4A 2GV9A 2YV0X 3LZJA 3TTDA 1NGFA 4E7KA 4BREA 3OTOK 4BRDA 3EKUA 5SZTA 4BE2A 5HROA 1TUYA 2P1JA 1VQ5N 1U2VA 1ZBSA 1DTTA 5AQJA 4ELVA 5LMUK 2D1KA 4BR0A 4FYDA 4DU3A 3T1HK 3CMEN 3DLEA 3QO9A 4O4GA 1NK7A 3K9JA 3SYZA 1ATSA 1RCHA 3FZHA 3SUPA 4H8KA 3VGLA 3EKSA 4CFBA 1RTIA 3LPUA 4GV6A 4CEZA 4F8RA 2GEMA 5J2PA 4KAZA 1XNRK 3FZMA 2XY6A 4CJRA 3CFPA 4DTMA 4XIUA 4CGJA 1WAJA 3NF6A 1XMQK 1KFSA 1BL3A 4KHWA 2ZE2A 3D2FA 4FO0A 4OPJA 3KD5E 3H6EA 3AA2A 4JI5K 1Q9XA 1RBTA 2P9SB 4DB3A 3BZCA 3BF3A 3T1AA 3RR8A 4LFBK 1SL0A 3WNHA 1U47A 2YJFA 1YXQA 4EZ9A 1BQNA 2QK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3HRG A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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