3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DR3K 3H3OB 4Y0WA 3SJJA 5HRRA 4JI2K 4CJUA 4KHWA 2BGGA 3THWA 3VMFB 3V1OA 3TAPA 4CJKA 3LM2A 2EHGA 5AQZA 2YNGA 2VYPA 3RMBA 4BC3A 1VSDA 4FJGA 4PY5A 5CZ1A 1HJRA 3PX0A 3O9SA 1W9HA 3WNFA 4DV1K 3PUFA 3TAQA 5AFUH 4LSNA 4LSLA 4OVLA 5KPZA 1NMDA 3DOKA 1ASUA 4C23A 1FXXA 4GNIA 3JAMO 1GLLO 1S5JA 3KLHA 3AVBA 4R79A 3EKSA 3LPUA 2QWOA 4OPHA 4AHVA 1F21A 4CBUA 4KHSA 4J2AA 2PYJA 4DV2K 4F4KA 1ZBLA 1RBTA 3NF7A 2VGNA 4J2BA 4BRKA 1NGJA 1BL3A 3O9QA 4O8UA 3O3HA 3SK3A 4DTXA 2NLXA 3L2RA 4CCHA 4FM1A 1C0MA 5M1QA 3MX2A 4K43A 3SBGA 2D0OA 4FLVA 3JYTA 1EKEA 4NCGA 3DMJA 3IKMA 4A5BA 3F9KA 3OBYA 1Z26A 2KW4A 3LALA 4BWJA 3DLBA 4R5PA 3KTQA 5M1KA 3QEIA 4JS5A 2BH1A 5AR0A 1NK9A 3CERA 1Q7YO 1YI2N 4HUFA 1VQON 5AQVA 4OX9K 1XNQK 3AO3A 4CF8A 1TK8A 2FBYA 4M3WA 1HKBA 1JLFA 5KQ8A 1IG9A 1ILYA 4LFAK 4DFKA 4O8KA 3ZX2A 1LCUA 1IKVA 4OPKA 3D0PA 4Y1CA 1KLMA 3OYBA 3WQUA 1V4SA 4DTMA 5FLXO 2O8DA 1OKJA 1RTIA 4DU1A 4H4OA 1BCMA 4CJPA 2PBDA 3K9KA 5FDLA 2YHAA 3S3OA 3MEGA 4CJWA 2G8WA 2YHXA 1RFQA 3UB5A 5HP1A 1EQYA 3IG1A 4JI6K 1RT4A 5GIOA 4KB1A 4PUOA 1BISA 4FOIA 5AZIA 1SZ2A 3JS6A 3TAMA 3CETA 4CEQA 4DV3K 4OKEA 3QEVA 1RDWX 1SL0A 4QS9A 4BGAA 4A57A 4BVPA 2KZZA 3L3VA 4CE9A 4F2RA 2NRTA 4C8LA 1MWKA 4IDKA 1BCOA 2IVOA 3JXUA 3TTCA 4H5TA 3E9OA 3TWHA 4FLWA 2WBNA 4IG0A 5BR8K 2Y1JA 2DFFA 1XNRK 4OJRA 4C1NK 4PKIA 3T19A 5FROA 3A5NC 2HHHK 3LDLA 3SJHA 3D2EA 1JCEA 2E1YA 4RTFD 4MDBA 4WFAL 1VQ4N 3CCSN 1Q9YA 4DV7K 1YAGA 3AO2A 3CQ8A 1S22A 4B3TK 4CHPA 3LWLA 1VSKA 4XH4A 3E1YA 4HTLA 4BR4A 4F2SA 1QSLA 1NOYA 4FJNA 4KHPK 3VPZA 5AQWA 4JD2B 2KHOA 3U9ZA 3ULEB 1HNXK 4DSFA 4ZHRA 4NCAA 2XHBA 1EX4A 3S3MA 1K8KB 1WNSA 3WEEA 1XI1A 4FWMA 4B1ZA 2IGIA 1CLQA 5I42A 4A2AA 4DB3A 4CEDA 3PIPL 1C1CA 4C8KA 2IC3A 3A8YA 2A40A 2E2OA 2IAJA 3UKRA 2ZM6K 3O4WA 5JLHA 2G8KA 3VENA 5JMVA 4H4MA 1UA1A 4CD3A 3M8QA 1QHTA 1X3MA 1N5YA 3QO9A 3JSMA 1YT3A 3SZ2A 5BN9A 3NAEA 4OO1J 1L3VA 5AQKA 4FJHA 3BF3A 4A2BA 1IBKK 3CC7N 1NJWA 4AHTA 2X6SA 2VGMA 1W7AA 3P5JA 3KLIA 3THXA 4GW6A 1IBMK 4QS7A 3FZLA 5AQQA 1U4BA 3QESA 4CJ7A 5AQUA 4CJ3A 2AJQA 2BUPA 3FE1A 4WE1A 5CYQA 3ZYYX 4E19A 1XQSC 3UIQA 1SQKA 2HSTA 4X62K 5M1NA 5HL7L 3HT3A 4DUYK 4ZTFA 4M3UA 3ZSZA 3M6GA 4DTPA 3K2PA 4FSVA 1R59O 2GELA 4EP5A 4OPAA 1D9DA 4DMNA 1X9WA 3DAWA 4CI6A 4YOVA 4K8ZA 3NFAA 2E20A 5FPNA 3THVA 4AQYK 1GLBG 2ZE2A 3LDPA 1XUPO 5F1XA 4CZGA 3FFIA 5KI6A 4O0JA 4AHCA 1MWMA 1D4XA 2XY8A 1NKEA 1T6CA 4F8RA 4PKGA 3IMXA 3T1HK 2A41A 2NRRA 5GINA 3RSEB 4O4GA 4JLHA 1U2VB 2D0CA 1SKSA 2ASMA 3DYAA 3KD5E 4CZIA 4FYDA 2V52B 4BC5A 2GUPA 4KTZA 1OVYA 3AO4A 1Q86O 2QXLA 2Q2RA 1RT7A 2HVIA 3J7AP 3VF4A 1VAZA 2OYQA 3LP2A 1ZBIA 2FBTA 3SNNA 3VOVA 1VK0A 5MLCQ 2KTQA 4DSJA 2W6KA 2I7PA 3M8SA 4BRQA 2ZJQL 3EE8A 4O55A 3ZT1A 5C12A 4OKKA 4Q0BA 3ULEA 5ADXA 3KLEA 4E7KA 3NGZA 3L2QA 3RR8A 5KTQA 1YITN 1HRHA 1LW0A 3NDKA 1K8KA 4RW4A 4KHUA 1S1TA 3S41A 3E9PA 5BN8A 4N56A 4RG8A 3K5OA 1NJZA 3DLEA 3W0LA 4O5FA 1REVA 5EXWA 3QEPA 1QSYA 1GLFO 1DLOA 4NXNK 5M1PA 1NLVA 1WSFA 1BIZA 4FOEA 4KTWA 1L5UA 5JICA 4NXMK 2FBXA 3SQ2A 3HRGA 4WYBA 3CCMN 4O44A 3PY8A 5I9EB 4E7IA 4KO0A 2O8CA 3Q7CA 4WCEL 4ID5A 3VEXA 4N76A 3VA3A 3L3UA 4EAHD 1B9FA 1DTTA 2WC9A 4XIUA 4FJIA 3TSUA 1UA0A 4DQRA 1QQNA 2RKIA 1VSEA 3O4NA 4FJMA 4B9LA 4L3QA 1WUAA 3G4SN 4IFVA 2IDOA 2DY4A 2A6AA 3O1BA 1TAQA 3LDOA 5AQOA 4JRQA 4RW7A 3VQ9A 3CJCA 2OANA 1YJNN 4KB0A 4CGIA 3THYA 3LDNA 4CZKA 1BA0A 3CF5L 4B8CA 3DRRA 2GTDA 5J2MA 3F5TA 3N4PA 4MO5A 1BDGA 1P90A 3VGMA 4DTRA 1UOCA 4B1XB 4HCCA 3AVHA 1KTQA 3CD6N 4B08A 5AQMA 3RSEA 1U2VA 3ZEUB 3EZWA 2VQEK 2V7ZA 2FLOA 3O8MA 2FXUA 4JKEA 3DI6A 3VQCA 4FPAA 3QB0A 3EO3A 5E26A 3PIOL 3MAQA 3AVNA 1ESVA 2ZJPL 5TKYA 1JCGA 5AQHA 3QMLA 3KVGA 3L2UA 4CJRA 1BGXT 3B6PA 4CVNE 4FJLA 3AVCA 5J2QA 3A5MC 1ZBHA 4N41A 1ZBFA 4FJ7A 1YTUA 4BG9A 1YJWN 3LWMA 3DLKA 5DK5A 2IS3A 5EOYA 4DFPA 3HYFA 4FVUA 5HROA 2DFHA 1HLUA 4KH6A 4RCHA 4CGJA 1NK4A 3SMSA 1NGHA 1E4GT 4YY3K 3AV9A 3KKSA 4B9NA 3OHRA 2X6NA 2GUIA 3V9UA 2P9UB 4LY7A 4CEAA 4M3YA 4BRNA 3ZETB 4Q5VA 1GLEG 4CERA 5HRSA 3T1YK 1RTHA 2O8FB 5KPRA 1DGKN 3VERA 2JLEA 3DRPA 5J2PA 3HP9A 3DXKB 5FRNA 4B3OA 2HB5A 5AZJA 3ENOA 3TTDA 2Q0RA 4CJVA 1TKDA 1L3SA 4E7LA 1N36K 1BWFO 4Z4GA 3QFUA 3MCPA 5KGXA 4FW1A 2A3ZA 2E4LA 4CHYA 5F2RA 4IOXA 3ID8A 1U04A 1T03A 3RR7A 3WXMB 4DHYA 4E3SA 3SV4A 3DLHA 3EY1A 4I9QA 4J2DA 5EY4A 1SAZA 4JKBA 4JHDB 1KCFA 3TARA 4A62A 1S9GA 4C8MA 4YOXA 1VSMA 1IG8A 4QAGA 3AGKA 1HYVA 4CEEA 2XY5A 3SQ0A 1NJXA 3MWPA 4B3MK 1WSEA 5AQIA 5KPTA 4M7XA 1X3NA 1JLQA 4JI3K 1NGEA 4DV6K 1W2BM 3TU5A 1SV5A 2IOCA 3NMUA 1JL2A 2QXFA 1ITGA 1TKTA 1JLAA 1RBSA 4CGHA 3OS2A 5AQNA 4PKHA 4PWDA 4PA1A 1NG9A 3SAHA 1NGIA 3KK2A 1J6ZA 2OCEA 1IBLK 5SWMA 4BRMA 2KFZA 4MDAA 2FSNA 5LJWA 3LM9A 1CZBA 2GWKA 1IKWA 3HI0A 4GVEA 3WQTA 4K41A 3LZJA 4DUZK 4WQ4A 1HNVA 4CGDA 4HUEA 5E84A 3NH2A 3NCIA 1YUWA 3M5RA 3MEEA 2HHVA 4QCLA 4MQ3A 1QQCA 2KZMA 3LZIA 3OYLA 3CM5A 1CZAN 2YI1A 4MLEA 4FK4A 2YNHA 3PX6A 5EX5A 3O80A 3BDPA 1KAYA 3SV3A 3T69A 3T3FA 4HTUA 4CEBA 1KSPA 1NKBA 1OH6A 2HOEA 5IT9O 1QSSA 2HBJA 3F9MA 1ATNA 2ZGYA 3TSPA 3I0RA 4FK0A 3OS1A 4ISGA 1IJJA 1TL1A 3C6UA 4IEIA 1DKGD 4FVMA 4B9SA 1OH7A 1TYQB 2Q1NA 5TKWA 3GG4A 3C6AA 3VTIA 1LAWA 3KZBA 3AY9A 4DLEA 4C8OA 2JWKA 4W5OA 4DR7K 4NCBA 4Z0UA 3CCVN 3CFPA 3CQXA 3LP0A 2O4IA 4LF5K 4EP4A 3FZKA 4ELVA 4LF7K 2UUBK 2P9UA 1HKCA 4FJKA 1VQNN 1VQKN 5LL6Z 4IXCA 2GWJA 3ZETA 4FJXA 1GLAG 2Z1GA 3FFKB 4GY2B 4YOTA 1X1PA 4DR6K 3OYFA 3SUPA 3CCQN 2O8FA 4JKGB 4M3RA 4BC4A 1S1UA 1VQ9N 4DR4K 2NNWA 3EL2A 4ISFA 4YFUA 3DXKA 4LFCK 1ZBSA 4H8KA 4OGEA 4M41A 5I3UA 1S9EA 5KGWA 3TPQA 3CCJN 5C10A 3J7ZO 4E1JA 3KWGA 3ZLJA 2OPSA 5M1OA 4Z4HA 2NRVA 4KHYA 3WXIA 2RPIA 5KRTA 1K73O 1JKHA 3AVKA 1KXPA 1LAVA 4JHDA 1NBWA 3OTOK 1SKWA 2BTFA 3WT0A 4HCBA 1WSGA 1VRUA 1O13A 4C8NA 3ZSVA 4RW9A 3SUQA 3AGRA 3CCLN 1EO1A 3OS0A 5A2QO 1NWKA 1HR0K 1JLCA 2HBLA 4WQ5C 4B3RK 4YORA 1QVFM 3V81A 3H3NO 2W40A 3DLRA 2V7YA 1NGCA 1YVUA 2FSJA 2P9NB 3D45A 5GADP 2NRZA 3SUOA 1EXQA 2YJFA 1WSJA 1K9MO 2HNDA 4CGFA 5FPEA 1FW6A 2P9IB 2E2QA 5LMNK 4KTQA 2JWLA 1EWQA 5CR4A 4FLXA 1S1XA 3FGUA 3QBXA 3GE1A 3LDSA 3ZX3A 1RT2A 3QBWA 1HJOA 3TABA 4JEPA 2V51B 1B9DA 1VQ8N 1VQ7N 5JVHL 3B6OA 4H0VB 3AA3A 4N5SA 2UUAK 3PO5A 3AVAA 3CHWA 4JI0K 2YX6A 3O1WA 1BOTO 3IS9A 2E88A 3AVGA 3MN5A 4BDZA 1DTQA 4WFBL 3LAKA 3AVFA 3GDQA 2P9SB 4W5TA 5DM6L 4ELTA 1Q18A 1RDBA 2OA8A 3HSTB 4FWQA 2Q3SA 4QOZB 4K25A 3KWIA 3ZT2A 5BPMA 2HNZA 1LWEA 1TYQA 3BUZB 2E8AA 2YHYA 4I2QA 4IWVA 2HF3A 3IDHA 2HBMA 2ZD1A 1RT1A 3G71N 2OZMA 3ZSOA 3L2VA 2O8BB 1N33K 1RILA 4AHRA 1QHAA 3EYZA 1S3XA 3V9WA 1KC8O 3O3FA 2F7TA 1YTAA 2KLAA 2KFNA 1J53A 4LF4K 2P9LB 3I8BA 4W5NA 3O9TA 3A5LC 4CK1A 5LY3A 4DTSA 2P5GA 2ZJRL 3SPYA 4K0KK 4FZYA 5AQLA 1KRPA 5K14A 4AILC 3DRSA 2OTJN 1VQ6N 2IVNA 3BEXA 3NF9A 4UY8O 1QZ5A 1S6QA 2H3GX 4FW2A 3VQ6A 3CCRN 4JRPA 4BR2A 3BGRA 2XY7A 3J7YP 3ENHA 3VQBA 4K8XA 3FZFA 2NRWA 4EZ9A 4JKCA 1T44A 1W0HA 4U7BA 4JS4A 4B9TA 3I0SA 2OZSA 3WNGA 3VEWA 4YHHK 3OYEA 3QFPA 5AQTA 5B8HA 4JK9A 2PZSA 4KI6A 3K59A 2QM1A 2LSNA 3HTVA 2QWQA 4KV8A 4BVOA 1OH8A 3VQPA 2E1ZA 5FPMA 2AA4A 3U4LA 3SAFA 3P39A 1SS6A 3U6FA 1I3AA 1ZC6A 1GOAA 2B4JA 4H0OA 1TAUA 3CCUN 1YJ9N 3D2FB 3ITHA 1WSHA 2HW3A 2ATQA 3MXJA 2ZF5O 3RVCA 1MU2A 2YNIA 3KHYA 5EVZA 5BPLA 3SI6A 3C0BA 3MECA 1XHZA 2WFBA 3ZT3A 4FJ5A 1JL1A 1D5AA 3DLLL 4C1NI 2FSKA 1KFSA 4CF1A 4FM2A 1TKZA 3S3NA 4CEOA 3VEYA 4DCHA 2F8TA 3AO1A 4BRLA 4LFBK 4BR7A 4A61A 3G0ZA 3KK3A 4FJJA 4JD2A 1BA1A 4B9MA 1HKGA 1TKXA 3MX5A 4CZMA 4IG3A 5BRDA 5LJVA 3D7EO 4H03B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3HRG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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