3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
b'GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K2PA 3VQ7A 1VQ6N 3CJCA 3NH1A 4JAXA 3C94A 2UU9K 3DRPA 4JKDA 1U45A 3PX0A 4BGAA 1ZXOA 3ZX2A 4PL7A 1O13A 5K14A 2E2PA 3NBPA 3UKUA 4CZEA 2P9PA 5KTQA 1KAZA 4CJ7A 3M3ZA 4HWIA 1HMVA 4DSLA 4FLZA 4TSXA 4KHQA 3QLHA 3GE1A 2QWRA 3MWPA 5KPZA 5M1PA 2KKZA 4OLAA 4KFBA 3DXMA 3SV3A 4C1NI 2ZD1A 4FWMA 4FWOA 4CJPA 1LW2A 4RW8A 3L8BA 4MO5A 4B1YB 2WOMA 2ETJA 4BR9A 3AVCA 1HJOA 4IEEA 4DFJA 4I2PA 3T19A 1BDGA 1N33K 3B6PA 1IO2A 3SAFA 1P90A 2WONA 3VQ8A 4CJLA 4DR4K 3SPZA 4JKAA 4KREA 4H03B 4DUZK 2W42A 4PKIA 4CJUA 4WFNL 1NMDA 1J9AA 3AVLA 4A57A 1JLAA 3L4IA 3BF1A 3L2QA 3PSIA 3IKMA 4BRIA 1NJXA 4FM2A 1HUXA 3R1XA 4C1NK 2E2NA 2OPQA 5M1NA 3TANA 2RN2A 3WXKA 4IEIA 3CJAA 4OO1J 3OYAA 3O4WA 2OPSA 3OS1A 1VSLA 3QNOA 2GBZA 1OH8A 4CJQA 1NKBA 3QINA 4M3XA 1WSGA 1NMNA 4EIAA 1KVBA 3D2FB 1U2VA 2LSNA 2YHXA 4LFAK 4YOUA 3V1QA 3K59A 3ULEA 2UXBK 2YX6A 4IZ9A 2E5LK 5M1QA 3VQ9A 2Z1GA 4DSFA 5HRNA 2NNWA 1U47A 1ZBHA 5AJ3K 2P9NA 3D7EO 4WQ5C 1YF5L 4FJJA 5F2RA 2YKNA 3CG7A 4JKCA 2E6LA 4BDYA 4GV3A 4FWKA 4FWSA 1XHZA 2RPIA 3H3NO 5AZJB 4B3SK 1GLCG 2HF4A 2B6AA 3C6AA 1NJZA 3BUZB 2HMPA 1QSYA 3M8SA 4L3QA 2Z1HA 4XEIA 3OJSA 1A5WA 3NFAA 3ZSZA 5BPLA 4M42A 1NGJA 1A5XA 1Q18A 4Z0UA 1R0AA 5EX5A 2CH6A 1NK4A 1IKVA 4MDBA 3DWLA 3ZSVA 2VCPA 3DLRA 4M3ZA 4FVUA 3KK3A 5AQJA 1IKYA 1REVA 3O08A 1C6VA 4BVOA 4CI6A 5M1FA 4DB3A 2B4JA 1NJWA 1NK9A 2P9IB 3M1FA 3J7AP 3GOIA 1N34K 5TKYA 4NXNK 4B08A 2V7ZA 4E7HA 1HR0K 3VEZA 1BIUA 1JLCA 1N32K 3V9SA 2A1SA 3CHWA 4H0TB 3NMUA 1OKJA 4KH4A 3WEEB 1DTQA 4FYDA 1BCOA 3SYZA 3ZT0A 3SJJA 1HKCA 3C6UA 3OYCA 3TTFA 2O8CA 4ELUA 4WE1A 3L0QA 5KGXA 1HYSA 1NGGA 4CIEA 4FZZA 5AQVA 4GVEA 2Q1NA 1VSFA 3A5NC 1K8KB 2OZSA 2E1ZA 1RTHA 4KPYA 4YHHK 3AV9A 4CZLA 3AA3A 3G0ZA 4YOWA 1T7PA 3O4NA 3E9PA 4BRNA 2OTLN 3D6RA 4CGIA 3CQXA 4CHQA 3TSUA 3N4QA 1V4TA 2VGNA 3HSCA 3L2WA 4KTQA 2IAJA 3AVMA 1BIZA 4WQ4C 4BRCA 4BRDA 4CEOA 3RWUA 2X6SA 3K58A 2GUPA 2DY4A 4CE9A 5AQQA 3MCPA 3PV8A 5FPEA 1RBSA 2O8FA 1J5EK 3V9WA 2Q97A 1NK0A 3O1WA 3CETA 1C1BA 4H0OA 1DLOA 4JKHA 3SBGA 1VQLN 4CFAA 3PIOL 2QA4N 3G10A 2Z1JA 1IBMK 3SUPA 2YHBA 1OH6A 4L8RB 2P9UB 1UOCA 1JCFA 1NU0A 3FE1A 3THYB 1JKHA 1N6QA 3S3MA 5DM7L 4IDKA 3MXIA 4KAZA 4DFPA 1XNQK 4A5BA 3J80O 1VQNN 3MK6A 3LANA 2NRWA 3THWB 4FJ9A 1HX1A 4ID1A 2Q3SA 2P5OA 1ATRA 4BREA 5KPTA 4H4MA 3WXIA 1G15A 4IG3A 1SAZA 4BWMA 4E1NA 2ZJPL 5AQWA 2OPRA 3IFRA 4HHTA 4B1XB 1B9DA 4J2DA 1YVUA 3AY9A 3PSFA 3K5OA 1ZYQA 4KB1A 4AH9A 1D4XA 3ZSQA 1S1WA 5C0YA 1BL3A 1HYZA 4FJ5A 4AM7A 3HI0A 1HNXK 1FJGK 3MN5A 2F7TA 4CHZA 3NCIA 3P5JA 2WUSA 3IRXA 2IVNA 4CF2A 4IO9L 4O4GA 3GG4A 4DTJA 2IIRA 2XHBA 4BR0A 3MECA 3V4IA 4I9LA 4DV1K 4E7KA 2H3GX 3V9UA 2A3ZA 2KQ2A 1S22A 4BC3A 1BA0A 3CXCM 4H5RA 4KHYA 1IBLK 5I3UA 1QVFM 4CW7B 4LFBK 4AHVA 5CHIA 2UUAK 3DOKA 4BE2A 3VEYA 2YNFA 1UAXA 4FOIA 4WQ5A 3QERA 3LDPA 3AVFA 2F8SA 3VQBA 5J2MA 2IC3A 3KHYA 4YDUA 3SV4A 3ZETB 4CBWA 4NB4A 3CCVN 4FWLA 3CC2N 2YHAA 4Z4EA 4BE1A 2FSNA 3G71N 4DQRA 3P4IA 2ASOA 2WTUA 2XY7A 3K57A 5CZ2A 4DG1A 3R8EA 2NRHA 2V51B 2R7YA 3KD5E 1Z05A 4AHSA 2CGLA 3VA3A 1GLDG 2VGMA 3IMXA 3BF3A 4CZJA 4DS4A 1VSDA 1A5VA 4H0PA 2HF3A 4DR3K 3PO4A 3NGYA 2OPPA 5HOOA 1BWFO 4KHUA 3S41A 4I6MB 3SMPA 4JKEA 3NGZA 2NLXA 1YIJN 2V7YA 4C8NA 3U8XA 1RDWX 2P1JA 4BC4A 2KZZA 1ZBSA 4JHDB 1NJYA 2QTDA 4F3TA 5J1EA 1E3MA 3CF5L 1D5AA 2IGIA 2ZE2A 1HQUA 5KGWA 5BPMA 4RG8A 1RTIA 1SL1A 4JYAK 3VEOA 4E19A 3K5MA 4O8UA 1I94K 4W5RA 3MXMA 4O44A 2YHWA 1OVQA 2NRRA 4AHCA 4CHYA 4B1ZA 3T7ZA 1TKDA 3W0LA 1KVCA 3RMDA 1VQMN 3OW2M 3H45C 3E9OA 2OANA 1L3SA 3HOSA 3KLFA 3OBYA 1ILYA 4NLCA 3EY1A 3KZBA 3CMAN 1KSPA 3UB5A 4KTWA 4HTUA 4UY8O 5JVHL 3WXMB 1Q9XA 3CCEN 1ATNA 4OLBA 4A2AA 2ZWHA 5HBMA 4FLYA 3HSTB 3M8QA 3DAWA 3OS0A 5BRDA 4BRQA 3KWIA 3A8YA 3U3GA 1SV5A 3UKRB 4WQ4A 2A5XA 3ZLJA 1EQYA 1YTUA 4CCHA 5BPNA 4NXMK 3DMJA 4CJWA 3KK2A 2F8TA 2VWBA 2O4GA 2KW4A 1LOTB 2BDPA 3MX2A 2ZJQL 4CZFA 1ESVA 5T7BA 4C23A 2JLEA 3CIPA 2YV0X 1Q8IA 2BTFA 3QDKA 4IOXA 4K43A 1CZAN 4ISGA 4RW7A 2QWMA 3C7NA 4DTOA 3BZKA 4X66K 1K9MO 4DR7K 1CXUA 2G8IA 5HROA 2NRVA 2X74A 4W5QA 4Z4FA 4F4KA 3MDQA 3OYFA 4FJ8A 4FLVA 4DQIA 1VQ8N 3O9RA 2V52B 4NCBA 2KLAA 4KKOA 4FWRA 1TUUA 3HZ6A 4DQ8A 3ITHA 3ZSOA 1RBUA 4O0JA 4JS5A 5GAGP 4M3RA 5IWAK 4ZHRA 4OPKA 4FK0A 2YHYA 1M90O 4FOEA 4DSJA 3IG1A 4IJAA 3UKUB 3G4SN 4DV6K 1HRHA 1HJRA 3P83D 3TTCA 3NE6A 3SAGA 1UA0A 3AVKA 3CQ8A 1FXXA 2O8EA 3WNHA 3DXMB 1T6DA 4C8OA 2HBKA 3M6GA 4FJHA 4FJLA 5HP1A 4FWNA 3WQTA 1RT1A 1D9FA 4N76A 3CJBA 1VK0A 2FBVA 4HVJA 4FLTA 2DPNA 1X9JA 1TKTA 3MEDA 2YCHA 5D3GA 1RDBA 3FR0A 3HP6A 4J2AA 3H6EA 4O5FA 3AA2A 1HNVA 1C0UA 2QXLA 4BRAA 2BANA 3DXKA 3I8DA 2I5JA 3H46O 3CMEN 3O1BA 2PYLA 2A1RA 3FGUA 4OGEA 2HBMA 1RBTA 4JV5K 4QOZB 1YI2N 2OYQA 3SQ2A 1X9SA 1K8AO 4IWVA 3DOLA 4GKJK 4B9MA 4C8KA 1YJWN 2A6AA 3F5TA 3LM9A 4FK2A 4E7LA 4M41A 1TK0A 2QKKA 3GDQA 3LP1A 1CZBA 2GELA 5AQMA 3CFRA 3RMBA 2E8AA 1RDAA 4JD2B 2HB5A 4CGDA 1N8RO 1SL0A 1NK7A 5I42A 5J2NA 1XQSC 3P1GA 3V1RA 5M1KA 3QESA 3HT3A 1OH5A 3PUFA 5AQIA 2GWKA 3PIPL 1U2VB 1NGBA 3BGRA 1QQOA 4MQ3A 2YNIA 2P9SB 3PLAA 1WAFA 4LH5A 4FZXC 1T8EA 1HLUA 1QS4A 3K9KA 3WXLA 3TAEA 5TKWA 3C6TA 3MAQA 4JI7K 1QZ6A 1L3VA 2DFEA 4KO0A 3WNEA 4DTSA 3DLBA 2RKIA 4Q5VA 1KRPA 2P9NB 4BDZA 4K25A 4JK9A 3BZCA 3EZWA 3HL8A 5FRMA 1D8YA 3RR8A 2HHTA 2A42A 4QS7A 5J2QA 1WSFA 1BQNA 3NVKA 1QSLA 2ASMA 3D0PA 4CEQA 3MN7A 1J6ZA 4CZIA 4A62A 1LW0A 3LL3A 4CGHA 1ZC6A 3SAHA 4YFUA 2W6KA 4CEDA 4W5TA 4CJ4A 4JKFA 4FJ7A 4CHPA 3AA5X 4DCHA 4JN4A 3PX4A 3ID8A 3C6HA 4PHTX 3OJUA 5AFUA 4PY5A 4KBOA 1RT4A 2I7PA 1X9WA 5C24A 4DV7K 3SZ2A 1JXBA 4FWPA 3V1OA 3VEWA 1KVAA 4CJTA 3KWGA 4KI4A 3ALYA 2F4VK 2F96A 2P9KB 5AQRA 4AQYK 2IVPA 1U48A 4FJNA 3OA9A 1HKGA 2F9WA 5DK5A 4CZHA 3O3GA 4EHUA 1YHQN 2XO7A 3SQ1A 3FFIA 3FZFA 4I7FA 5HRSA 1DGKN 2FXUA 4GKKK 4LF7K 4Z94A 4FVMA 4YDUC 3VQQA 4FLUA 4CK1A 2HMIA 2W41A 4HCBA 2YKMA 2D4WA 4FL9A 3OS2A 4JKBA 4EP5A 3UIQA 2PBDA 1FK9A 4W5NA 3CM6A 4BGBA 1TVRA 4FO0A 4RTFD 4PKHA 4B3TK 4JI8K 2FBXA 3CJ7A 4E7JA 2E4LA 2AJQA 1R59O 1YT3A 1RCHA 3TAGA 1I39A 4F2SA 1BQMA 3WT0A 4HCCA 3QBWA 4YY3K 3ZT4A 2XY5A 4FJXA 2ZQBA 2PAVA 2FF6A 1QHAA 3JSMA 1TKXA 3TAFA 1HPMA 1S1UA 1U04A 4CEZA 4CIFA 5GAHP 3LALA 3OYHA 1XC9A 5C25A 5MLCQ 2OTJN 1Q86O 3QETA 1S3XA 2CH5A 3O4QA 5BRHA 3M8PA 3HBTA 1S1VA 1XC3A 3AVHA 4DHYA 4EAHD 2XY8A 3VQ6A 3EN9A 4J8FA 3D2FA 3KTQA 4K42A 4BQLA 4KHNA 4DR6K 4DTRA 3E66A 1CLQA 3NF9A 4KV8A 4DV3K 1CXQA 4DQPA 1XHXA 1H1VA 5HRRA 5EU7A 4CBXA 1RT7A 3J8AA 3IUCA 2DFHA 3AO2A 2EX3A 3EL2A 2HBLA 3B6OA 1IJJA 4CF9A 4AILC 3O5BA 3MWTA 1NGFA 4RWTA 3T69A 4CZGA 2UXCK 4FJIA 1SQKA 1RT2A 1LAWA 3TR8A 3VPZA 1MU2A 2IDOA 4FM1A 4NCAA 1XWLA 2D0OA 4RW9A 3SI6A 3VQCA 1LCUA 3L3VA 1ASVA 1VRTA 3HVTA 4M7XA 4QS8A 1WBDA 4BR5A 4CJ3A 1YITN 1NGAA 3QICA 3EEQA 5LL6Z 3HK2A 1J54A 4LC9B 4DTPA 5AQYA 4PWDA 5J2PA 1HNWK 3CCSN 4F8RA 3ENOA 4H5TA 3CCRN 3Q7CA 3HP9A 3QB0A 3ATUA 4AHTA 3I8BA 2RHKA 1YJ9N 4KI6A 5AQSA 2EHGA 1GLAG 3H1QA 3ZT3A 1W2BM 4ISFA 1M1KO 1NLVA 3VETA 2Q31A 3VEVA 1EWQA 1FKOA 4E7IA 3CCJN 3LM2A 3QNNA 1J53A 5BN9A 4KH5A 1QVGM 2QWPA 3DLKA 3ISNC 4JKGB 4CEEA 1QQCA 3WEEA 3OHRA 1RT5A 2VYPA 3FZLA 4DV2K 3EYZA 2ITMA 4JRPA 1K6YA 3RRGA 4ELVA 4OKEA 3HM8A 3A5OC 1EO1A 4V19S 4N56A 1BI4B 4GVMA 1K8KA 3FFKB 4BY9C 4M7YA 5JS2A 1XI1A 2QXFA 4U67L 1TL1A 4CF8A 2X6NA 3NF8A 3KD1E 1LWFA 1JCEA 1RBVA 1S9GA 4NYFA 3H08A 4YOVA 4LY7A 1T03A 3QFPA 1TV6A 2B5JA 2J4RA 1TYQA 2OCEA 5HL7L 4XH5A 3S3OA 5KQDA 4YNQA 5F0XA 4AM6A 3WNGA 4A2BA 4DU4A 3U4LA 4U7BA 3THXA 3SQ0A 4ILHA 2VG6A 3SJHA 3SUNA 1C1CA 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 3HRG A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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