3HRGA

Crystal structure of bacteroides thetaiotaomicron bt_3980, protein with actin-like atpase fold and unknown function (np_812891.1) from bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482 at 1.85 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GMIDFTKSKQYTLSIRLSTDGFSFSIYNPINDNSQSLFEKEVDTSLSLTANLKNVFHESDFLSYSYKRVNIMIASKRFTMIPLELFEEEQAELLFYHNHQKRENEIVMYNILKKNNVVIIFGIDKSTYTFLNEQYPEARFYSQSTPLIEYFSIKSRLGNSKKMYASVRKDAIDIYCFERGQLLLANSFECMQTEDRIYYLLYVWKQLEFNQERDELHLTGTLSDKETLMNELKKFILQVFIMNPANNIDMQALLTCE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
publication title Crystal structure of Bacteroides thetaiotaomicron BT_3980, protein with actin-like ATPase fold and unknown function (NP_812891.1) from BACTEROIDES THETAIOTAOMICRON VPI-5482 at 1.85 A resolution
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein BT_3980 with actin-like ATPase fold
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12864 DUF3822 Protein of unknown function (DUF3822)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.250 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA01
3.30.420.260 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hrgA02
3HRGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSFA 2LSNA 1C6VA 1TKTA 1FKOA 3OYMA 3T3FA 1IBMK 1YTUA 3O8MA 2G8VA 1K73O 3SLCA 2OPPA 3BZCA 1KC8O 4CK1A 4E1NA 1TUUA 3B8AX 4M63C 4FLUA 3MN9A 2KW4A 2IC3A 5A2QO 2P9KA 1NK4A 3HRGA 4M3WA 5EY4A 1HKCA 3O9UA 4FWLA 5J1EA 1TK5A 3H6EA 5JVHL 4PL7A 1X3NA 4C8LA 4O55A 5BREA 2OA8A 2O4GA 2YHYA 3WUHA 5K14A 3WXMB 3CFOA 3QIPA 2FSNA 2Q36A 5AQKA 3QEPA 1YT3A 1JCFA 3VESA 4EFHA 2F9WA 3DOLA 3HO1A 1NGEA 3F9MA 2HBJA 2P9LB 5BN8A 3PX6A 4M7XA 2Q3SA 2JWLA 1GLBG 3MECA 1GLEG 4ZTFA 1LCUA 3ZETB 2XY6A 3C6AA 4CGJA 3OYNA 3IMXA 3FFKB 4DTPA 4M7YA 4ELVA 4JKGA 3D6RA 1IG8A 1Z25A 2KZZA 1RDDA 3EL2A 3HTVA 1ZBLA 4MO4A 2GX9A 3J81O 4CGFA 3DRPA 1ZXOA 2BTFA 3TAFA 4HCBA 4BRNA 3HYFA 1YVUA 4EIAA 2UXDK 4CJ4A 3K9KA 5IWAK 3NF8A 1SV5A 3EZ5A 1O13A 5JS2A 1WOQA 3U3YA 4O5FA 3ZSYA 2NRTA 3SAGA 4DFJA 1VSEA 4O5BA 2EX3A 1YITN 3PO5A 3WXKA 2GUPA 3AVGA 1W2BM 1XMOK 1RILA 3VQ9A 4GV9A 1EWRA 4QS7A 3AAQA 3U9ZA 2W40A 4JKDA 3K5OA 1KRPA 1RBVA 3PSIA 1KVCA 1JLEA 4DFKA 3M3ZA 3K5MA 1EO1A 1SKRA 1Z26A 3K5NA 4RW8A 3VA3A 3SUPA 1JXEA 4LF5K 3ZSVA 4E7LA 4CEFA 3U8XA 3AO1A 3C7NB 2GV9A 2IVPA 3A0IX 4F8RA 1KVAA 1KLNA 3O3GA 1J54A 4DV7K 4DLEA 1TK8A 1N6QA 5C10A 3DRSA 4K42A 4H4OA 2IVNA 3M6GA 3MDQA 3R8EA 4FLWA 3DAWA 4KHWA 3VN5A 1SZ2A 4KHSA 1VQ6N 3CCRN 3C6UA 2QM1A 1HNIA 3S9HA 2X6NA 4E19A 3GDQA 4BRQA 4OGCA 2P9PB 5KGXA 4CF1A 3PX0A 1RT4A 2YCHA 1W9HA 5JLHA 1RT6A 4PKIA 4IWVA 3N4PA 4DQRA 4I6MB 3CD6N 1Y64A 3OYEA 4CIFA 1NBWA 3AA3A 3AVCA 5AQTA 3O9RA 1HYZA 1TUYA 3FZLA 1SQKA 3BUZB 3M5RA 4DV6K 3CMEN 3V9SA 4IEEA 3CYMA 1ZBSA 3IAYA 4DS5A 4PY5A 2X6SA 5C42A 4BDYA 5M1QA 4DV3K 1Q8IA 3LM2A 4CZIA 3NH1A 3V4IA 4FYDA 4WYBA 3Q7CA 4RG8A 3SQ2A 4F3TA 1QHTA 4CIGA 4FWOA 2G8HA 3JAMO 3DWLA 5F2RA 4B9UA 4C8KA 3SBTA 3EYZA 3UKUB 4AH9A 2X78A 1NGHA 1NKEA 4BRGA 3BDPA 3MCPA 1S72N 3ZSZA 4FVMA 2HHUA 3HL8A 4FM0A 4FOIA 3I33A 3SQ0A 2PFUA 1HKGA 1ZC6A 1IJJA 3IDHA 2XO7A 2HHHK 1BO5O 4CZEA 2E20A 3DLBA 4KTQA 5J2PA 3AVFA 3SAHA 4GV3A 4I2PA 1S9EA 4HVJA 3HK2A 2J4RA 3G10A 4FWSA 1DGKN 2EHGA 5M1FA 2KFZA 1NLVA 3CMAN 1RT5A 1VSKA 3LP1A 4FK0A 1D4XA 2OCEA 5CY4A 5D3GA 3THYB 3MK6A 2D0AA 4Z4CA 3TU5A 4OPKA 3OBWA 3OYCA 2FBXA 4OPJA 1NK0A 3CCVN 1C0GA 1C1AA 4UY8O 3THWB 4BE2A 3QNOA 3EY1A 2P9UA 4PWDA 1NU0A 2HNYA 4CJPA 4CJVA 3JXUA 1I39A 4IFEA 1U45A 4DFPA 2HHTA 3AVKA 1CXQA 3V1QA 3IRXA 3V9ZA 5BR9A 1XI1A 1HNWK 1T05A 1BHLA 1QQOA 1VSIA 2QEXN 1G99A 1JCEA 2QXFA 3AVBA 2AJQA 2OPSA 1DTTA 2Q1NA 2O8BA 1VK0A 4IO8A 2RE2A 4CBXA 3FZKA 2B6AA 4BACA 1BA0A 4E7HA 3RMDA 4IO9L 1A5VA 3LM9A 4CK2A 3IS9A 1W7AA 4JKAA 3GBTA 4MFBA 2I7PA 1RT1A 1UAXA 4YNQA 3LDNA 4BRPA 3NDKA 4YDUC 3VEYA 5CE3A 4YOWA 1HQEA 5AR0A 3TSPA 1RT7A 1QSSA 1C0UA 1Z6RA 4HUEA 5SWMA 3ID6A 3PLAA 2W6LA 3EZWA 1J5EK 4G1QA 2Q31A 4IFYA 1YVNA 1EQYA 4AHCA 1XNRK 1EKEA 1RFQA 4BRHA 4DU1A 1N33K 3CQ8A 2OZMA 2H3GX 4QS8A 3MWPA 3H45C 2RPIA 3M8SA 3R6MA 1RTIA 2D0BA 1QVFM 3LPUA 1IV0A 4BG8A 4NCBA 3AVMA 2JWKA 3OBYA 4CJEA 4OKJA 4KI6A 5FRMA 2AA4A 2X74A 3P39A 2ZQBA 2Z1HA 1M1KO 4OX9K 2KFNA 4QCLA 4NXNK 4FZXC 4DUYK 2GUIA 4OKKA 3NFAA 2HVIA 2DPNA 3VTHA 3CC4N 3ZLJA 4I6MA 4FWNA 3QFUA 3V6DA 5HRNA 1YJ9N 2IVOA 4DTNA 1BISA 2UXBK 4WCEL 2Q97A 5AQPA 3I0RA 4KH4A 5HBMA 3E9PA 1P90A 3M8QA 1IKXA 4E7KA 1WAJA 4CJTA 2G8UA 2QW9A 4YOVA 3WXIA 4B9TA 3HBTA 2P9IA 3CQXA 3TI0A 3ZX3A 2KQ2A 3BF1A 5AQZA 1HPMA 4B9QA 4DTSA 4ISEA 3NGZA 2Z1IA 3RMCA 3DOKA 5HROA 3TAEA 1T8EA 3ULDA 3KZBA 4FWPA 4ZTJA 4IOCL 2RKIA 3BY5A 4Z4GA 3MEDA 4JYAK 2WUSA 4DTJA 1BUPA 2KLAA 2W41A 3D2EA 1K9MO 4CJWA 4CJLA 3ZCMA 4MDBA 3CCLN 2VG5A 3HT3A 1NOZA 3DXKB 4JI3K 2QWQA 4Z4IA 1LWFA 2QKKA 2BUPA 4CEOA 3SQ1A 4CECA 3K9JA 5ADXA 3O9SA 1BA1A 3WNEA 1QHAA 3J7YP 4GW6A 4I2QA 2HHQA 2RF2A 3EKSA 5BRDA 4IG0A 4O4GA 1NGCA 2P9NB 1OH8A 4C8OA 3FGUA 2VCPA 3L4IA 5JLFA 1NK5A 2YKNA 4C1NI 4C23A 3VQBA 2A6AA 5AFUH 3BGRA 3I55N 3CJCA 4OPHA 4XIUA 2YI1A 4JD2B 1U2VA 4O8UA 1YI2N 4IOAL 1BQMA 4LSNA 1BCOA 1V4TA 3LP3A 3WQTA 3OYBA 4FJ9A 3OVNA 1QZ5A 4CGIA 4YHHK 3THVA 4KFBA 3DXMB 3LDOA 4JI1K 2HNZA 3NF9A 3NVMA 4DR3K 1X3MA 3ZX2A 1F21A 4DU3A 3NHGA 4FM2A 5LY3A 1JXBA 3QERA 1UA0A 3A8YA 5C15A 1BCMA 5KQ8A 1RDUA 4NYNA 1L3SA 2NUBA 4LFBK 2HF4A 2Y1IA 4NXMK 3OS0A 4JI7K 4F3OA 4BR7A 3KKRA 3MX5A 4B1VA 5C2DA 2D0PA 4KO0A 4KI4A 3A5MC 3KK3A 1MA9B 1S9GA 3OY9A 1JCGA 3VEWA 3M8PA 3VQ6A 4KHYA 3SK3A 3F5TA 3GL1A 3NMUA 3ZYYX 3OTOK 1DLOA 1ILYA 3FZHA 3QICA 4HUGA 3PIPL 2GEMA 3VTIA 5LMNK 4FPAA 4BG9A 3HP9A 4B3OA 3LDSA 1YF5L 2W6KA 3ZSRA 4JI2K 3QLHA 4MLHA 4X65K 4JI5K 4AHRA 1XMQK 3CHWA 4CHPA 5AQVA 3HPGA 3B6PA 4FJKA 4H5VA 2UXCK 2HHSA 3G25A 3QNNA 4DF4A 1TYQA 2ZJQL 5I3UA 1G15A 2BE2A 1NJIO 1TGOA 2QXLA 2WBNA 4CFDA 1L3VA 2FLOA 3TR8A 2NLXA 2HB5A 4KB1A 3KLHA 1KFDA 3F73A 3ASMA 1VSHA 5GAEP 3SUNA 5LJWA 4CD3A 1GLAG 1HR0K 4AHTA 4U7BA 2VG6A 3KJVA 1U04A 4MDAA 4BDPA 3EKUA 4HUFA 1ATRA 5EU7A 3NGYA 4K43A 1SL1A 3P31A 3VF2A 3WEEB 4Z0UA 2YV0X 3JSMA 4B3SK 1XQSC 1N5YA 1JJ2M 1MDUB 1TL3A 3VPZA 5I9EB 4DR2K 1VRUA 2CH5A 4CJ3A 2O8CB 2O8FB 3OYLA 1EXQA 3C94A 5KPZA 3T19A 4JKCA 4DV2K 4F9OA 2HSTA 1O1WA 3QEXA 4A2BA 1LAVA 4CZHA 3O80A 3P4IA 4ILGB 1S6PA 3DXKA 3OYDA 4EHTA 4Q0BA 3DLLL 4CHOA 2PY5A 3C0BA 2FBTA 5I42A 1QVGM 3IUCA 1OH5A 3UKRA 4CHZA 4CIEA 1J6ZA 4HTLA 1NM1A 3OYJA 3VQEA 2OPRA 4J2BA 3VGMA 1SS6A 4IKFA 3L4QA 4X66K 2Q0UA 1RCHA 4GY2B 3VENA 2UUBK 1JLCA 1VQ7N 1YUWA 4BWJA 1EP4A 4GNIA 3VETA 1RTHA 4FWQA 5E26A 3RMBA 1BI4A 5B8HA 2AP1A 3SAFA 3QDKA 4KH6A 3DRRA 4JEPA 3DLRA 4FW1A 3LZJA 4JK9A 1DKGD 5TKYA 3ZT3A 4FZZA 1GLLO 4AM7A 1LW0A 2WOMA 3L2QA 2ZGZA 3LDPA 1ASWA 1ASVA 3ATUA 2YJFA 3U9DA 5E41A 1MWKA 3L0QA 4CZMA 4JLHA 4H5WA 5KGWA 4LH5A 3DXMA 2QA4N 2QTDA 1M90O 4ISGA 4YOUA 3KLFA 3DI6A 4LF6K 1C0TA 3SYZA 4DFMA 2RHKA 4DHYA 4DV0K 1T7PA 1KXPA 4ILJA 2DFEA 2WFBA 2YKMA 3ZSQA 4RW6A 5F1XA 2YNIA 4M3YA 3SI6A 2DFHA 2NRZA 4Y1DA 4B9NA 3QBXA 4M3TA 4CF8A 4FJHA 4J2EA 3EN9A 4BC2A 4GKJK 3O1BA 3VEVA 3H3NO 3O3FA 2HF3A 3WT0A 5FPDA 2FF3B 2D0OA 3SPZA 1YIJN 3VQCA 1XHZA 1XC3A 2YJEA 3MEEA 1RBTA 3SNNA 1KAYA 2FSKA 3A2FA 4BRMA 4R79A 4DB3A 4R5PA 1KVBA 3ZSWA 1LV5A 1RDCA 2E2NA 1LOTB 3MMVA 5GAGP 3NVKA 3VA0A 1HNZK 1ITGA 3KWGA 4E1MA 1Q9XA 1BU6O 4QOZB 3T1YK 4PQUA 2NRRA 5EX5A 3K59A 1FKPA 4DUZK 5M1PA 4YOYA 4LF8K 5M1KA 1VQ9N 3VGKA 2YHXA 4M3XA 5AQJA 1NKBA 3I8BA 2UYTA 1XC9A 2PZSA 3G6EN 5AZIB 2UUAK 4CD1A 5FRNA 2XY5A 3KLIA 4OGEA 1E4GT 1WSGA 4AHUA 4BR9A 5AJ3K 4FLZA 4LFAK 1OKJA 1HX1A 2HMPA 2Z1JA 4UQGA 3R3LA 3FFIA 4WF9L 1WBDA 4N41A 2D5RA 4YOXA 3G4SN 2VWBA 4QAGA 5AQSA 3UE5A 3AVIA 4RW7A 4DG1A 4DR4K 4FJ7A 3VOVA 4A61A 5C0YA 4DQPA 4WQ5A 3GOIA 5AQGA 1D9DA 2F8SA 4IXCA 3I8DA 4B08A 1NK6A 3CCEN 1ZBFA 1ZBIA 5KPTA 2PBDA 3V1OA 4ELTA 4WQ4A 3J7AP 3RRHA 3K58A 4DMNA 4B9MA 4Z94A 4MLEA 4E3SA 2VWKA 4FJIA 3VEOA 2HHXA 1VQMN 4B8AB 3CXCM 1Q18A 3J7ZO 1E4FT 4DTXA 3CFPA 4PA1A 1YHQN 1YJWN 4N47A 3D2FB 4IFVA 4I9QA 4J2AA 5JICA 3TAQA 5C12A 3SMPA 2OTJN 4JHDB 4CZGA 3V9UA 1ZBUA 3T69A 2P9LA 4KAZA 3O6WA 4JK8A 3OYHA 4IG3A 3ZETA 1EWQA 5EOYA 4F2RA 4OLBA 1HQUA 4KTWA 3KKSA 1X1PA 3IKMA 3AV9A 3RMAA 1NMDA 5H1SQ 1HRHA 1IG9A 3SJJA 4ICLA 3V1RA 2A3ZA 5BN9A 2E88A 4J8FA 3OYFA 5BR8K 3VQPA 2VG7A 4F4KA 1NGFA 4FJGA 4JKBA 1N32K 2GBZA 3DM2A 4CK3A 1HJRA 1TAUA 1RBUA 2BH1A 5FLXO 4FSVA 5KRSA 1CZ9A 1VQLN 3G0ZA 2DTUA 3MXMA 2D1KA 3ZT4A 1VHXA 3TABA 1KCFA 4BRCA 3ZEUB 3NH0A 2YNHA 3NF6A 2Q2RA 2O8DB 4CF9A 5CYMA 3HSTB 4CW7B 1T6DA 5AZJB 3JS6A 3H46O 2ZF5O 2E2PA 2E4LA 1VSFA 4Z4HA 4IEIA 2W42A 1VQ4N 3AO3A 1KSPA 1QS4A 4BC5A 5AQUA 4C8MA 4DQSA 1XWLA 4H0YB 1Q9YA 3E9OA 3QETA 3MX2A 5F0XA 4CJRA 3C7NA 5FPEA 3C95A 4KKOA 4BRDA 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 3HRG A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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