5AQMA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLFSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqmA04
5AZJA 2IVOA 2I7PA 1NGEA 1ATNA 1YUWA 2YI1A 2V51B 4JD2B 3FZLA 2IVNA 1HJOA 4XEIA 3WXIA 4CZGA 2P9SA 3HBTA 2CGLA 4EHTA 1GLJO 4HTLA 4BRLA 4IJAA 2KHOA 4NO7A 3CI5A 5AQRA 4BQLA 1QZ5A 2AP1A 3O6WA 3VESA 1BG3A 4A61A 3H46O 1GLLO 3ENOA 3D2EB 4JHDA 3LDNA 2FLOA 3QBWA 5AQHA 1IG8A 3EKUA 2D0PA 3VENA 2Q31A 3HTVA 5KPTA 1SQKA 1GLEG 3MCPA 5ELZA 3WXJA 3WXKA 1S22A 4WQ5C 4CBUA 5BRFA 3ENHA 2NLXA 3UKRA 3ZETA 4IO8A 5F0XA 2QWRA 4H0TB 2QWNA 1K8KB 5JICA 4L3QA 2AA4A 1NGJA 3VEYA 1HKBA 5FPDA 3MN9A 4FWOA 4H0XB 5F1XA 3CHWA 3VGMA 1IJJA 4BC3A 2DPNA 5ADXH 1NGGA 4H5VA 5EVZA 1MWMA 3AAPA 3DJCA 4QS8A 4K25A 4CZJA 2GEMA 3ULEB 2ZWHA 3F9MA 5KPRA 1E4FT 5EXWA 3VEZA 2D1KA 1NBWA 4FOEA 4B1YB 1HX1A 5BRHA 5ADXA 3VGKA 4PKIA 3O80A 3DXMA 3VEVA 1K8KA 3CJBA 4FWRA 5AQTA 2FF6A 1SAZA 2QWMA 4B1XB 3CQXA 1C0FA 3FZFA 2ASPA 1QQMA 4FWKA 2NRHA 3FE1A 3W0LA 1TYQB 1ZC6A 5E26A 3C7NA 1JCEA 4KBOA 5AQKA 2ASMA 3S41A 1BOTO 3H1QA 4CD3A 2A3ZA 3H3NO 1ESVA 4BRCA 3L6QA 3MK6A 4XH1A 4YDUC 5BPNA 4MLEA 2QXLA 3ZX3A 3IMXA 4FOIA 3TU5A 4WQ4C 3FZMA 1LCUA 3CJ9A 3O1BA 4BVOA 3QFPA 1YAGA 2A6AA 2ZGYA 3VPZA 4BRDA 3FGUA 1YVNA 3AY9A 1Z6RA 3BP8A 3WEEB 4CZFA 3DAWA 4CZMA 5AQMA 1Q18A 4XH4A 3MMVA 2A5XA 4ISFA 4K42A 1NGFA 4JNEA 3WQUA 5KQDA 2W41A 3ATVA 4FSVA 2P9IA 2E2NA 2HMPA 1NM1A 3U9DA 4EHUA 4BR2A 2W40A 5JLHA 4H5RA 3EKSA 4DHYA 4A62A 3VEOA 2J4RA 2GTDA 4E1JA 1NGIA 5AQPA 5AQQA 1QQOA 3O8MA 3IUCA 4PKHA 1YXQA 4I6MA 1HPMA 3GL1A 5FPNA 2HF4A 4BRAA 3QICA 1MWKA 2PBDA 5TKYA 1NLVA 1BO5O 4FWLA 1HKGA 2EWSA 3RSEA 4IZ9A 1XQSC 5KQ8A 2UYTA 3WQTA 5JMVA 5AQXA 4BR0A 4RWTA 4WQ5A 4QS9A 1U6ZA 5AQSA 3IDHA 3CJ1A 2ASOA 2QWQA 3ID8A 3VERA 2FXUA 1NGDA 4RCHA 4B9QA 5BR9A 2QW9A 2P9LA 3HM8A 3SJHA 3EZWA 3QDKA 2YJFA 3M6GA 2E2PA 4FWSA 4HWIA 3QB0A 3LL3A 3KHYA 4Z94A 2GWJA 1DEJA 3A5OC 4BVPA 1GLCG 4FO0A 5AR0A 2FSNA 1KAYA 3D2FA 4BROA 5JLFA 4EIAA 1U2VB 5I9EB 2HF3A 4BRIA 2I7NA 2GWKA 2ZGZA 4JD2A 1WUAA 3VEWA 2P9KB 4FWPA 4BGBA 1MDUB 2VCPA 1DGKN 1SZ2A 1JCGA 2FF3B 3HI0A 4BRNA 1X3NA 1NMDA 2E1ZA 5AQLA 4FPBA 4ISEA 3MN6A 4K43A 1V4TA 4GY2B 4DCHA 2E88A 2F9WA 2E2QA 4M7XA 1LOTB 4QS7A 2Q36A 3ZEUB 1BA0A 4BRQA 3D2EA 1JCFA 3O4WA 1RDWX 3H3OB 2Q0UA 3UE5A 4BG8A 1NGHA 5FPMA 5AZIB 1U2VA 3O08A 3HZ6A 3VF2A 3ZX0A 4AM7A 4DB3A 3DWLA 1OKJA 3CIPA 3DXKB 3R9PA 4BRHA 1HLUA 1P8ZA 2P9KA 1Y64A 4CZHA 4H0YB 3WT0A 2P9NB 4YDUA 3L4IA 1QQNA 5AQWA 3GOIA 1E4GT 3O1WA 4WQ4A 1T6CA 4H0OA 4J8FA 1HKCA 3AARA 4CZEA 5AQIA 1WOQA 4BR5A 5LJVA 5BREA 1ATRA 5LJWA 3U4LA 1G99A 5BPMA 1NGAA 1C0GA 3B8AX 2GUPA 4DQ8A 1DKGD 3ULEA 3O5BA 2YHYA 4ISGA 4MLHA 3M1FA 5AQGA 2YHXA 3FFKB 2H3GX 3CERA 1QHAA 2A41A 3LDQA 4WYBA 4BRFA 5AQFA 2CGJA 1KAZA 4B1UB 2E2OA 3UKUB 1GLAG 1T44A 4M7YA 4XH5A 4A2BA 2E1YA 3A5NC 4Y0WA 2P9PB 4B1WB 5LY3A 1MA9B 4B1ZA 4MO5A 1J6ZA 2OANA 3FZHA 1TYQA 5AQYA 3FR0A 3KZBA 5AFUH 2IVPA 2QWOA 3VGLA 2VWBA 2D4WA 1TUUA 5AZJB 3SLCA 5BN8A 4BC2A 2FSJA 3VEXA 4BRGA 3SMSA 3AAQA 4MO4A 3IFRA 3FLCO 4AM6A 2BTFA 2YCHA 2ZF5O 3CJAA 1S3XA 5AFUA 1BWFO 2P9SB 3FZKA 2NZTA 3GE1A 4F9OA 2CH5A 3KVGA 1KAXA 4O8KA 2QWLA 2V7ZA 1V4SA 3WUHA 3LM9A 4CZIA 1CZAN 3WEEA 2PAVA 4BR9A 5AQZA 4H5WA 2WUSA 3I33A 4JAXA 1X9JA 3D7EO 5FPEA 4EAHD 2CH6A 5EY4A 2FSKA 2A42A 4IJNA 3EL2A 1QZ6A 4FL9A 3A5LC 2YHWA 2P9UB 3UKRB 3ZETB 3H45C 3G25A 1BUPA 4FWNA 3QFUA 3UB5A 2GELA 4NB4A 4CJ7A 3CJ7A 1XUPO 2V7YA 3BF1A 3VOVA 5BN9A 2IIRA 3LDOA 2YJEA 1H1VA 5AQOA 4A2AA 2D0OA 1EQYA 3A0IX 3A5MC 4IWVA 2E20A 2V52B 2CGKA 4FWQA 4H03B 4LC9B 3SK3A 3LDLA 4RTFD 5AQVA 2P9UA 4BREA 3I8BA 1NWKA 3DXMB 2E8AA 4BQZA 4H0VB 1ATSA 1NGBA 3JXUA 3LDPA 4PL7A 4H5NA 3P4IA 1D4XA 2VYPA 1TUYA 3GBTA 3MN5A 5CE3A 1XC3A 1Z05A 3C7NB 4PL8A 3WXLA 4BR4A 4BC4A 5BPLA 1GLFO 4FWMA 5B8HA 3C0BA 1GLBG 3H1VX 1RFQA 3VF4A 3BEXA 4IXCA 3ZEUA 3GDQA 3JS6A 3CETA 4BGAA 4CBXA 4H0PA 3OHRA 2QWPA 1ZBSA 4CZLA 4EFHA 4M63C 4CBWA 1HUXA 4K41A 5AZIA 4CD1A 3H6EA 5AQNA 4O5FA 2Q1NA 3CJCA 3DXKA 4CI6A 3VETA 3QMLA 2HOEA 2P9IB 3W3DA 4C23A 3A8YA 2P9NA 3MDQA 4PKGA 4BRKA 1NGCA 2F9TA 3U9ZA 4GNIA 2Q2RA 3U8XA 4BRMA 4BG9A 5AQUA 2ITMA 4H5TA 1GLDG 1RGIA 2BUPA 4I6MB 5EOYA 3CQYA 5BRDA 1BA1A 3EO3A 1ZXOA 4B1VA 4JN4A 3TPQA 1R59O 3MN7A 4CZKA 5AQJA 3R8EA 4BRPA 3RSEB 2A40A 1BU6O 1BDGA 3VF6A 4BR7A 3BF3A 1KXPA 3ZX2A 3EN9A 3HSCA 3L0QA 5F2RA 2Q0RA 3R6MA 5E84A 3UKUA 5KPZA 2QM1A 3M3ZA 4BC5A 2P9LB 2Q97A 3LM2A 1T6DA 2P9PA 3J8AA 4FPAA 3QBXA 4JHDB 3ATUA 5EX5A 3BUZB 3D2FB 1X3MA 3GG4A 3SMPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FXXA 1TK0A 1YI2N 2GL1A 2IVNA 4KTQA 2KFZA 3C65A 1BCGA 3WXIA 3M5RA 2P9SA 5CY0A 3RRHA 3HBTA 4LFBK 4EHTA 3KK3A 4IJAA 4NO7A 1VNBA 3QEWA 5AQRA 4BQLA 3O6WA 1S1VA 4TSXA 4A61A 3VQ7A 3K0SA 1JLFA 3ENOA 3D2EB 2VQFK 5HROA 4JHDA 1KLNA 1HQEA 1PX9A 3SUNA 1I3AA 3I55N 1SQKA 1GLEG 3ZSRA 1EO1A 3C6UA 3ENHA 1NKCA 3UKRA 3AA3A 4IO8A 4FLVA 3CC7N 4CJUA 4AHTA 1HNZK 3OS2A 4CEDA 3KJVA 1G15A 1NPIA 3RMBA 1ZBFA 1S6QA 4O55A 2YHBA 4NXMK 4CERA 5GAGP 4FWOA 4H0XB 1IJJA 5FDLA 4BC3A 2DPNA 4FJ8A 4JS5A 3ZT1A 4ELTA 4CJWA 2XRIA 5CY4A 4CJKA 1NK5A 4K25A 3MAQA 1WBDA 3U3YA 2LJ7A 3RMDA 1SUQA 3THVA 4J2BA 1P90A 2RPIA 4DTMA 2O8EB 3QEVA 1NJYA 1E3MA 4FOEA 4B1YB 1VSIA 2QTDA 4YOVA 3SQ4A 5J2PA 4M3ZA 3VEVA 1RBRA 1K8KA 3PY8A 4CJLA 4DQSA 1K73O 4H4OA 1NJZA 4F3OA 3F9KA 1OH7A 3OYFA 1RDBA 4B3SK 1ZC6A 2E5LK 4DV5K 3RVCA 4KBOA 4DU4A 3SBGA 3SUOA 4KPYA 1KV0A 4DR7K 5M1PA 4BRCA 3KP0A 4KI4A 1OH8A 2FBTA 3ZSQA 4UJ0A 4MLEA 3V9UA 2G8IA 4FJ5A 2WFBA 1JJ2M 3FZMA 1C0MA 2NNWA 3O1BA 3E7RL 1YAGA 2A6AA 2ATQA 1L3VA 1Z6RA 3F2KA 1X9MA 4CJPA 4CZMA 3MMVA 5E41A 4OVLA 5C25A 2NY8X 3KLFA 4DV1K 2HMPA 4BR2A 3DOLA 4OKKA 3K5LA 3O8MA 3IUCA 3V1OA 5HL7L 3CCMN 3GL1A 3QICA 4O44A 1NLVA 3J81O 2HNDA 3RSEA 4IZ9A 1XQSC 4MQ3A 5KQ8A 2HHIA 3WQTA 4WQ5A 4QS9A 5JS1A 3ID8A 3VERA 3OJUA 3LPTA 1RBTA 2P9LA 3HM8A 3QDKA 1WN7A 3ZSZA 4HWIA 3LANA 1HYSA 3LL3A 4Z94A 5J2MA 3J7ZO 3D2FA 4JRPA 4Z4FA 3ZCMA 1U2VB 4O4GA 4CHYA 4CW7B 5JENA 1L4VA 4FK4A 3NGZA 3N4QA 1NK0A 4HUFA 1J5OA 3CFRA 2Y1IA 2ASCA 2FBXA 3O9TA 4J2AA 2FF3B 3HI0A 3WNFA 3E9OA 5C24A 4W5NA 5GAEP 4M7XA 5JS2A 5KI6A 2P51A 4CEBA 3NMUA 3VA0A 4C8OA 3D2EA 5GINA 1RDWX 3UE5A 1NGHA 3CXCM 5IT9O 3VF2A 4O8UA 2FBVA 3DWLA 4LY7A 5H1SQ 3LZJA 4C1NI 2G2KA 4FJXA 3HVRA 3I0SA 3KOYA 3WT0A 2P9NB 1X9WA 2LY5A 4JI3K 1T6CA 1HJRA 4GW6A 4CZEA 3DLGA 1RTIA 2HBKA 1OMYA 5CZ1A 1L3TA 5BPMA 3ZSYA 4BE2A 1OH5A 1W2BM 2KBJA 3PX0A 3ZSOA 3CCSN 4KAZA 2O8EA 4ISGA 1IH7A 4NCGA 2YHXA 3FFKB 3M8SA 3LDQA 4WYBA 5AQFA 1RDUA 3PX4A 3UKUB 1J53A 2E1YA 2QKKA 3AVCA 4B08A 3PSMA 2P9PB 5LY3A 1HNWK 4DR3K 4BY9C 4DLEA 1T7PA 2IVPA 2QWOA 3L3VA 4CHPA 2VWBA 1VQ5N 3ZLJA 1TUUA 5AZJB 3SLCA 4BC2A 4E1NA 5HOOA 1T7AA 1YJ9N 3VEXA 4BRGA 4YHHK 4CF8A 3JSMA 3SV4A 2VWKA 4LF8K 3ITHA 5CYMA 1VNAA 3OYIA 2G8WA 1WAJA 4CHZA 3CJAA 4O5BA 1CZ9A 3N4PA 4CEAA 3GE1A 4YOTA 2E6LA 3NE6A 2CH5A 4DQQA 1KRPA 1ZFUA 3KVGA 1LWEA 1KAXA 2ZQBA 4O8KA 4OPAA 5D3GA 2WBNA 4I2QA 4BDYA 2PAVA 1RNHA 4BR9A 5AQZA 2UUBK 5GIOA 4EAHD 2CH6A 5EY4A 3KOXA 2B5JA 2A42A 4IJNA 1EX4A 3EL2A 5GAHP 4CCHA 2WTUA 4W5QA 4HUGA 2MBKA 3G25A 4KH6A 3ULDA 1S1WA 3E9PA 3UB5A 3RRGA 2ZM6K 4CJ7A 2MN5A 3MWPA 3KK7A 2V7YA 3VOVA 3J7YP 3KC6A 4ZTFA 3SNNA 1T03A 1H1VA 4Z4CA 5T7BA 3AGKA 3E01A 4DFMA 1S5JA 5AQOA 3SV3A 3CG7A 3DLKA 4CEZA 2XY7A 3HM9A 1DTQA 2N2QA 4RW9A 1SV5A 3NH1A 2P9UA 4NLCA 4FW1A 2NRWA 1U04A 2E8AA 2KLAA 3DXMB 1M90O 4WFBL 2IDOA 2WOMA 3KKRA 2HHWA 4PUOA 2NUBA 1D4XA 4IFVA 4M3WA 3MX5A 1TUYA 3GBTA 3IRXA 5CE3A 3PSFA 5DM6L 3C7NB 2G8UA 4DSFA 3OYCA 4JV5K 2HHVA 4BR4A 3WNEA 3O3HA 5B8HA 1BI4A 2F4VK 2K35A 3HO1A 3AVNA 4GKJK 3JS6A 3O4QA 3K5MA 1DLOA 4AH9A 3FFIA 1ZBSA 3M8QA 4M63C 4CBWA 3LPUA 4O5FA 3CJCA 3D45A 3VETA 3QMLA 4JRQA 3KOWA 2JWKA 1WSFA 2IC3A 2HOEA 3HOSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FXX A;  1TK0 A;  1YI2 N;  2GL1 A;  2IVN A;  4KTQ A;  2KFZ A;  3C65 A;  1BCG A;  3WXI A;  3M5R A;  2P9S A;  5CY0 A;  3RRH A;  3HBT A;  4LFB K;  4EHT A;  3KK3 A;  4IJA A;  4NO7 A;  1VNB A;  3QEW A;  5AQR A;  4BQL A;  3O6W A;  1S1V A;  4TSX A;  4A61 A;  3VQ7 A;  3K0S A;  1JLF A;  3ENO A;  3D2E B;  2VQF K;  5HRO A;  4JHD A;  1KLN A;  1HQE A;  1PX9 A;  3SUN A;  1I3A A;  3I55 N;  1SQK A;  1GLE G;  3ZSR A;  1EO1 A;  3C6U A;  3ENH A;  1NKC A;  3UKR A;  3AA3 A;  4IO8 A;  4FLV A;  3CC7 N;  4CJU A;  4AHT A;  1HNZ K;  3OS2 A;  4CED A;  3KJV A;  1G15 A;  1NPI A;  3RMB A;  1ZBF A;  1S6Q A;  4O55 A;  2YHB A;  4NXM K;  4CER A;  5GAG P;  4FWO A;  4H0X B;  1IJJ A;  5FDL A;  4BC3 A;  2DPN A;  4FJ8 A;  4JS5 A;  3ZT1 A;  4ELT A;  4CJW A;  2XRI A;  5CY4 A;  4CJK A;  1NK5 A;  4K25 A;  3MAQ A;  1WBD A;  3U3Y A;  2LJ7 A;  3RMD A;  1SUQ A;  3THV A;  4J2B A;  1P90 A;  2RPI A;  4DTM A;  2O8E B;  3QEV A;  1NJY A;  1E3M A;  4FOE A;  4B1Y B;  1VSI A;  2QTD A;  4YOV A;  3SQ4 A;  5J2P A;  4M3Z A;  3VEV A;  1RBR A;  1K8K A; 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