5AQMA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLFSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqmA04
3A8YA 4BR4A 3CETA 4DHYA 4BR2A 3LDNA 4B1YB 1KAZA 1QQMA 4C23A 3H3OB 2Q36A 2QW9A 2Q0RA 3GL1A 1U2VB 4H0YB 3S41A 3AAQA 1ZXOA 2P9NB 5ADXH 3CQYA 5AQQA 1S3XA 4WQ5C 4I6MA 2Q1NA 5AZIB 3BUZB 3C0BA 1DKGD 4FWRA 3WQTA 1T44A 4BGAA 4Y0WA 5I9EB 4A2AA 3CJBA 3WXJA 3WT0A 1MDUB 3I8BA 4CJ7A 3CI5A 3M3ZA 1ZBSA 3BF1A 3GG4A 4BGBA 3LDOA 1SQKA 2YHYA 3SLCA 3IUCA 4A2BA 2YCHA 3QMLA 1S22A 2E2OA 5AFUH 4FPBA 4M63C 2P9NA 5AQPA 4M7YA 3R8EA 5TKYA 4BQZA 5AQKA 1HJOA 1BDGA 2D0PA 3CERA 3DXKB 4CZEA 3BP8A 3VEXA 5BRHA 4BVPA 1QQOA 5AQRA 3CJAA 4GNIA 3J8AA 2V51B 3ENOA 3WEEB 4BROA 4BR9A 4K25A 2EWSA 4LC9B 2VYPA 4BRNA 4H0TB 4FO0A 4BC4A 1GLJO 2Q0UA 4JAXA 5EXWA 5E84A 3TU5A 3DXKA 4ISEA 1GLDG 3H1QA 2QWRA 1E4FT 1Q18A 1KAYA 3EN9A 5BPNA 4ISFA 4K43A 5E26A 4XH1A 2F9WA 2P9IB 1QHAA 3D2EB 1GLLO 3EKSA 3HZ6A 2WUSA 4MO4A 3WEEA 2I7NA 2ZF5O 1R59O 3KVGA 4NO7A 2Q97A 3H3NO 4BC5A 1NGDA 4H5NA 4CZFA 4B1XB 1ESVA 3MN9A 3VOVA 1DGKN 1NM1A 5AQMA 3A0IX 4FWMA 1T6DA 1GLCG 3WXIA 2E1YA 1SAZA 4ISGA 4WQ5A 3M6GA 4J8FA 4BC2A 3UE5A 3D2EA 2QWMA 1MWMA 3H1VX 2FF6A 3A5NC 4IJAA 3I33A 1K8KB 1BO5O 5EVZA 2P9KB 4MO5A 3ULEB 3CJ7A 4BRQA 3QICA 3LL3A 1P8ZA 3CHWA 3AAPA 5AQTA 2P9UB 1J6ZA 1HKCA 2QM1A 2V7ZA 3UKUA 2YI1A 1D4XA 5EX5A 3L0QA 4MLEA 2ZGZA 4XEIA 1NGBA 3VEZA 2GWKA 5AQWA 4RWTA 3CJ9A 1K8KA 4I6MB 4JNEA 3VGMA 2P9KA 4H0PA 2YJEA 4BR5A 3O8MA 3ULEA 1ATNA 4B1VA 4BRDA 3KHYA 4BG8A 4HWIA 3WXKA 1QZ6A 4CZMA 3HI0A 1EQYA 4EIAA 2P9UA 4K41A 4AM7A 3VF6A 4BRFA 5BPMA 1JCGA 3O1BA 4FL9A 5EY4A 2PBDA 3ATUA 3U9DA 2HF4A 3VF2A 2HOEA 4H03B 2D1KA 3LDLA 5AQVA 4B1ZA 3A5OC 1HUXA 2NZTA 4H0OA 2GWJA 3FE1A 2I7PA 3EO3A 1BU6O 3CJ1A 5F1XA 5LJVA 1BOTO 4EHUA 5B8HA 4CD1A 1C0GA 1NGAA 3F9MA 2CGKA 2V52B 2ASOA 3DXMA 4CBXA 3EZWA 5AQNA 3RSEB 4BRCA 2AP1A 2FLOA 5AQZA 1TUUA 3CIPA 4QS8A 3GBTA 4PKIA 3FGUA 3A5MC 1SZ2A 4PL8A 2PAVA 3JS6A 5AQYA 4A61A 5KQDA 3DAWA 5CE3A 3VF4A 2A3ZA 4K42A 1IJJA 5BPLA 3RSEA 5JMVA 1LOTB 4CZJA 2VWBA 1MA9B 4BC3A 3VEOA 1BA1A 2P9LA 1LCUA 3MCPA 1HLUA 3FZMA 5BRDA 4NB4A 3LDPA 5F2RA 1GLEG 2ZWHA 1NGIA 5BN9A 3VETA 1HKBA 2YJFA 4PL7A 5KPRA 4H5VA 4IO8A 1YVNA 4FOEA 4E1JA 1BA0A 4CZIA 3A5LC 1Z05A 2F9TA 4YDUA 5AQFA 1NWKA 2BUPA 2A5XA 3M1FA 2CGJA 5BRFA 4CD3A 3U9ZA 3D2FA 5JICA 4AM6A 5ADXA 3HM8A 3VEWA 4B1UB 1HPMA 1KXPA 4QS9A 4FWNA 1TYQA 5AR0A 1NGHA 4GY2B 2IVPA 1BG3A 1RFQA 4FWOA 3ZX3A 4BRLA 2GELA 4JN4A 2VCPA 3VEVA 2E2QA 1XQSC 1NMDA 3GOIA 3UKUB 2DPNA 2UYTA 2D0OA 4WYBA 4A62A 5BREA 3H46O 4DQ8A 3FZHA 5AQSA 1QQNA 1XC3A 4RTFD 5BN8A 4Z94A 1ATRA 3VGLA 4O5FA 3VPZA 3WXLA 2P9SB 3SK3A 2FXUA 5FPMA 3P4IA 2A6AA 4IJNA 4FWPA 4CBUA 3EL2A 2BTFA 5EOYA 4CZKA 2ITMA 2OANA 1GLFO 3IMXA 3QFPA 2HF3A 1GLBG 1JCFA 1U6ZA 2IVNA 2FSJA 4JHDA 3O4WA 4BRMA 3BEXA 3FR0A 5ELZA 4BRPA 4YDUC 3ID8A 1TUYA 2A41A 4JD2B 1X9JA 1X3MA 1YAGA 4BQLA 3W3DA 4CZLA 2P9SA 3O5BA 3SJHA 4L3QA 1KAXA 3GDQA 4F9OA 5JLFA 3IFRA 4BG9A 5AQLA 3O80A 1G99A 4QS7A 3DXMB 5FPEA 3VEYA 4BRGA 2J4RA 1T6CA 3HSCA 4FWLA 2QWQA 1IG8A 3R6MA 4CI6A 3UKRB 4JD2A 2FSNA 4FPAA 3WUHA 5AQUA 2YHXA 4FWSA 2E20A 4IXCA 5AQJA 4MLHA 4FWQA 4H0XB 4BREA 2IIRA 1X3NA 3R9PA 1RDWX 1QZ5A 4BRIA 1H1VA 3LDQA 1RGIA 4H0VB 4O8KA 3VENA 4BRAA 5BR9A 3ZETA 1NBWA 2V7YA 3ATVA 1ZC6A 3ZEUA 2P9LB 3ENHA 5AZJB 2GTDA 3AY9A 3UKRA 1Z6RA 1E4GT 3HBTA 3CQXA 2A40A 3OHRA 2GEMA 2QWPA 5AQHA 3UB5A 4CZHA 5AQXA 2W41A 3QBXA 3U4LA 5F0XA 3VERA 1NLVA 3SMPA 2FSKA 3GE1A 1DEJA 3U8XA 1BUPA 4HTLA 1U2VA 3MN5A 2P9PB 4B9QA 4BRHA 1WUAA 4XH4A 2FF3B 3C7NB 3D2FB 3VESA 5AZJA 4FSVA 1YUWA 2ASPA 3CJCA 5AZIA 3W0LA 2ZGYA 4DB3A 1HKGA 3JXUA 3FFKB 1TYQB 3QBWA 4XH5A 3VGKA 4M7XA 2E8AA 2Q2RA 4H5WA 5AQGA 1NGGA 4H5TA 2E2NA 3AARA 4FOIA 2P9PA 4BR7A 3O08A 5KPZA 3FZFA 4CZGA 3C7NA 1WOQA 4EAHD 2QWLA 2QWOA 4BRKA 1YXQA 4EFHA 4CBWA 1CZAN 5KPTA 3D7EO 2QWNA 4H5RA 4IWVA 5AQOA 4WQ4A 3B8AX 2GUPA 3O6WA 1GLAG 4PKGA 2QXLA 3QFUA 1NGFA 3TPQA 4JHDB 3HTVA 3MN7A 5AFUA 5AQIA 2E1ZA 3MK6A 2YHWA 1NGCA 1JCEA 1XUPO 3FZLA 3DWLA 3O1WA 2A42A 4IZ9A 1OKJA 3ZX0A 3MDQA 2D4WA 2H3GX 2AA4A 3FLCO 3KZBA 1NGEA 1MWKA 3H45C 2HMPA 4PKHA 5FPDA 2P9IA 5LJWA 3WQUA 2NRHA 5FPNA 3QDKA 4B1WB 1HX1A 3EKUA 3LM2A 1NGJA 2Q31A 2W40A 2E88A 3FZKA 3SMSA 3ZX2A 4DCHA 3DJCA 4FWKA 5JLHA 3G25A 2IVOA 1V4TA 5KQ8A 3IDHA 2CH5A 2NLXA 3LM9A 1C0FA 2CGLA 3QB0A 2KHOA 3BF3A 4BVOA 3L4IA 4KBOA 3H6EA 3ZETB 1Y64A 1ATSA 3MN6A 4RCHA 3ZEUB 3L6QA 2CH6A 4BR0A 5LY3A 1BWFO 2ASMA 3MMVA 4WQ4C 4EHTA 1V4SA 2E2PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LD0A 1KVBA 1VQ9N 1K8BA 3LDNA 3SNNA 1TKXA 2Y1IA 3H3OB 1FKPA 2QW9A 1WMTA 3GL1A 1U2VB 1BISA 3OS0A 3NF8A 4KH6A 3S41A 2OZSA 3QEPA 1ZXOA 3RMDA 4FJGA 1VQMN 3CQYA 2QI2A 1DKGD 3VQ5A 3CCEN 2PY5A 4Y0WA 3RRHA 1RT3A 4CEDA 5J2QA 3HOSA 3M3ZA 1DLOA 1ZBSA 4MFBA 4BGBA 2YHYA 3SLCA 3IUCA 3P31A 4A2BA 4BE0A 5M1OA 3QMLA 2YKMA 4M63C 1DJTA 5AQPA 1NPIA 5TKYA 1JKHA 1E3MA 2WC9A 4O4GA 4X66K 2PYLA 4CZEA 2DY4A 3DRRA 3LP1A 4CGGA 1QE1A 1D5AA 4CIGA 3MECA 3VA3A 1NRBA 4OKJA 1N36K 5CHIA 4BROA 2OCEA 2DFFA 3SZ2A 4BRNA 4H0TB 2KZZA 4FO0A 3DLKA 2QK9A 3P5JA 3V4IA 5C2FA 4WE1A 3AVCA 1O13A 4MDBA 2KSKA 3O9QA 4M45A 4LF5K 2KTQA 3DXKA 4ISEA 1B3CA 3T1AA 5LMUK 1TV6A 1KCFA 2JWLA 3OA9A 1UGLA 4K43A 4XH1A 1JLQA 4DSKA 4DTJA 4OPHA 3D2EB 3QINA 4O8UA 1EETA 1NMNA 2YC1C 2HHXA 2I7NA 1NK6A 4G1QA 1R59O 4H5NA 3T1HK 1K9MO 3WNEA 3NH1A 4ZTJA 4FYDA 4CHOA 3AVNA 3L4QA 3THVA 4WQ5A 4DF8A 3BK3C 4YHHK 3A5NC 4IJAA 1T0ZA 2AJQA 3I33A 4YOWA 1K8KB 3LZIA 4DR2K 4BE1A 4YOTA 2KQ2A 4BRQA 3IAYA 4FVMA 4ELVA 1P8ZA 3CHWA 3AAPA 4CK1A 4O0IA 2E6MA 2VGNA 3CC2N 4B9UA 4CF0A 4NCAA 1LAVA 1MR4A 1B9FA 2WTUA 3RMAA 4QAGA 1NK0A 5E41A 4DQQA 1NK8A 1AHOA 3CJ9A 3AVIA 1VRUA 4H0PA 3HO1A 2HHIA 1ATNA 3G10A 4BG8A 1LWCA 1TAQA 3WXKA 4CZMA 1NKCA 3HI0A 2P9UA 3VA0A 3WNFA 3VF6A 2HHHK 1JCGA 3ZT1A 2UU9K 5EY4A 3BY5A 3CQ8A 3ZT4A 3LDSA 3ATUA 1W0HA 5C2DA 3VF2A 4ILGB 3S3MA 4WFBL 3AA4A 3OTOK 1FJGK 4CHNA 4OPKA 4HVJA 1RT1A 4HUEA 1IBKK 2E5LK 3MWPA 1GPSA 4WCEL 1L4VA 3AVJA 1T7BA 1N32K 4CBXA 5M1FA 2B6AA 5KTQA 2AP1A 5AQZA 1TUUA 3ZSVA 4QS8A 3GBTA 2N69A 1RBSA 1NG9A 4GVMA 3FGUA 5JVHL 3THWB 1HR0K 4J2AA 3AO4A 3PUFA 4PL8A 4MDAA 4E7HA 2GBZA 1HNIA 3LP2A 3JS6A 4IG0A 1UA1A 2DFHA 2W00A 3DRSA 2X78A 3KKRA 5M1PA 5BPLA 3T7ZA 4KFBA 4AF1A 4CZJA 4FJNA 1MA9B 1JZAA 3V9SA 3SYZA 2WFBA 3NF9A 4CJVA 3PO4A 1LCUA 5FROA 3MCPA 4DU1A 3FZMA 1KFDA 4B9NA 4A57A 1GLEG 1NGIA 5BN9A 3TANA 1QS4A 4LF9K 4H5VA 3I8DA 4YY3K 1SUQA 2F9TA 4YDUA 5AQFA 4IOCL 2QEXN 3M1FA 2CGJA 3TAQA 1YT3A 1VSMA 1ZBUA 3CCVN 5JICA 1Q7YO 2WONA 3THXA 1RDBA 3L56A 4FWNA 3HSTB 1UOCA 4W5NA 4FWOA 3CG7A 3VQ6A 3VEVA 1M1KO 1XQSC 5A2QO 3UKUB 3DLHA 2DPNA 3K5LA 3P39A 1NJWA 1J53A 4JKFA 3VQEA 3KLHA 3FZHA 1QQNA 3L2RA 2BGGA 1QQCA 5BN8A 1LWEA 3O4QA 1NJYA 4O5FA 4B8AB 2B3CA 5HRNA 1EX4A 4B9MA 3E66A 5EOYA 4CZKA 1NKBA 4NCGA 2O8CB 3IMXA 3M5RA 1GLBG 2IVNA 5KI6A 2FSJA 4JHDA 4BRPA 5ELZA 4KYPA 4Z4FA 2IS3A 3EE9A 2HVIA 1X3MA 4BQLA 1NH5A 3W3DA 4DU3A 4RW8A 2XY7A 1Q86O 3TWHA 2YHAA 4F9OA 3T19A 3BDPA 4XJXA 2VQFK 3KK3A 1IKXA 1G99A 4QS7A 3DXMB 3TTCA 4DU4A 5FPEA 3VEYA 3HSCA 1DQ7A 1MYNA 4AQYK 2QWQA 2VG6A 2HHWA 4UADE 2MBKA 4JD2A 2N2QA 4YORA 1BGXT 4AH9A 3DLBA 2E20A 5HP1A 3OYCA 3THYA 2RHKA 1X3NA 4BRIA 4H0VB 1W7AA 3PX4A 2NRRA 3KLIA 5FDLA 2V7YA 3TTDA 1OH6A 1ZC6A 4IEIA 4KHNA 3DLGA 1BQMA 2Y1JA 1S1UA 4ILHA 1PX9A 2GEMA 4Z0UA 3F2KA 3QIPA 4RW4A 1XHXA 2W41A 1EXQA 3QIOA 2BRZA 3U4LA 3WNHA 1MU2A 1DEJA 4H4OA 3U8XA 1BUPA 3MN5A 5M1KA 1NE5A 1VSKA 2FF3B 3VESA 2R7YA 4CIEA 2ASPA 3CJCA 5AZIA 4KHYA 2ZGYA 5C25A 2HHTA 2LKBA 4CW7B 3O9UA 4NYFA 5TKWA 4DUYK 1VNBA 1HQEA 2KBJA 4FOIA 1EWRA 5H1SQ 1BIUA 4H4MA 1VSFA 4MQ3A 3O08A 2P5OA 4IFYA 3V9ZA 2HMIA 1UA0A 1TK8A 3FZFA 4PA1A 2YIPA 1I2UA 5FLXO 3U3GA 2QA4N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4LD0 A;  1KVB A;  1VQ9 N;  1K8B A;  3LDN A;  3SNN A;  1TKX A;  2Y1I A;  3H3O B;  1FKP A;  2QW9 A;  1WMT A;  3GL1 A;  1U2V B;  1BIS A;  3OS0 A;  3NF8 A;  4KH6 A;  3S41 A;  2OZS A;  3QEP A;  1ZXO A;  3RMD A;  4FJG A;  1VQM N;  3CQY A;  2QI2 A;  1DKG D;  3VQ5 A;  3CCE N;  2PY5 A;  4Y0W A;  3RRH A;  1RT3 A;  4CED A;  5J2Q A;  3HOS A;  3M3Z A;  1DLO A;  1ZBS A;  4MFB A;  4BGB A;  2YHY A;  3SLC A;  3IUC A;  3P31 A;  4A2B A;  4BE0 A;  5M1O A;  3QML A;  2YKM A;  4M63 C;  1DJT A;  5AQP A;  1NPI A;  5TKY A;  1JKH A;  1E3M A;  2WC9 A;  4O4G A;  4X66 K;  2PYL A;  4CZE A;  2DY4 A;  3DRR A;  3LP1 A;  4CGG A;  1QE1 A;  1D5A A;  4CIG A;  3MEC A;  3VA3 A;  1NRB A;  4OKJ A;  1N36 K;  5CHI A;  4BRO A;  2OCE A;  2DFF A;  3SZ2 A;  4BRN A;  4H0T B;  2KZZ A;  4FO0 A;  3DLK A;  2QK9 A;  3P5J A;  3V4I A;  5C2F A;  4WE1 A;  3AVC A;  1O13 A;  4MDB A;  2KSK A;  3O9Q A;  4M45 A;  4LF5 K;  2KTQ A;  3DXK A;  4ISE A;  1B3C A;  3T1A A;  5LMU K;  1TV6 A;  1KCF A;  2JWL A;  3OA9 A;  1UGL A;  4K43 A;  4XH1 A;  1JLQ A;  4DSK A; 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