5AQMA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
SMSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLFSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqmA04
4XEIA 2QWMA 4JHDB 3WQTA 4H5NA 3IMXA 1GLJO 3FZMA 1E4GT 4XH4A 4QS8A 1MWKA 1WOQA 3LL3A 4BC5A 4B9QA 5AQXA 1TYQA 4H0XB 4CZIA 4DHYA 1GLCG 5BREA 4BR5A 5AQKA 3H3NO 1GLFO 5CE3A 4L3QA 1XC3A 1KXPA 3MN6A 4PKGA 4BRCA 3LDNA 1RGIA 3LDLA 3F9MA 2Q36A 1Z05A 2WUSA 3TU5A 4H0YB 4M63C 4ISGA 4B1ZA 1YVNA 4ISFA 5AFUA 2Q0UA 2A41A 5AQVA 2YI1A 1GLDG 2CH6A 2QXLA 2P9NB 3L4IA 3WXIA 4H0TB 4B1WB 4PKIA 5BRFA 2UYTA 1NBWA 4A61A 4GNIA 4BQZA 3I8BA 1NMDA 2J4RA 1NLVA 2IVOA 3ATVA 5FPEA 4FPBA 5JLFA 4B1XB 5AZJB 3ATUA 5AQFA 3M6GA 1NGIA 2FXUA 2P9SA 4PKHA 2E2OA 2E88A 4CZMA 1XQSC 2YCHA 4CZHA 5AQUA 4BRGA 4JD2B 4J8FA 4BRLA 2VCPA 2V7YA 3MMVA 2QWLA 3GL1A 5LJWA 5BN8A 4I6MA 5I9EB 1GLAG 3FZLA 3WXKA 1NGEA 1NM1A 1Z6RA 4DCHA 1KAXA 4QS9A 3H46O 1SQKA 5AQIA 1BWFO 5AQWA 2FLOA 2HMPA 3ENHA 2NRHA 3EKUA 2P9LA 4IJAA 4M7XA 1T6CA 1BUPA 2PBDA 4BR0A 1HX1A 3A5OC 4ISEA 4BRDA 1BU6O 4DB3A 3LDQA 1TUYA 4K41A 2H3GX 3DXMA 3VPZA 4BC2A 1OKJA 4IJNA 3R8EA 1RDWX 4WQ4C 2ITMA 3QFUA 3CIPA 3IUCA 3UKUA 3ZETA 5ELZA 2V7ZA 4IWVA 2E20A 3A5MC 2QM1A 4JNEA 3IDHA 1SZ2A 2ZF5O 3O5BA 3QICA 3M3ZA 3VGMA 1TYQB 3U8XA 3D7EO 3FLCO 3GDQA 3UB5A 3QBXA 1BO5O 4CBUA 2GUPA 4FPAA 3EL2A 1HKGA 3ID8A 1NWKA 5EY4A 2Q97A 3G25A 5AQPA 2PAVA 4NB4A 3S41A 4BRPA 3HM8A 3R6MA 3H3OB 2VWBA 3UE5A 4BROA 4BG9A 3FFKB 3VETA 3QMLA 5AQNA 2GELA 1Q18A 2QWRA 2FF3B 4BGAA 3VGKA 3C7NA 4KBOA 3GG4A 2FF6A 5AQMA 1QZ5A 2ZGYA 2P9KA 3BUZB 3H45C 4CZLA 4BRIA 2I7PA 3VEVA 2D1KA 3AAPA 3D2FA 2P9SB 3VEXA 1NGCA 4EHUA 3MN9A 1U2VA 1DKGD 1D4XA 5AFUH 4FSVA 2EWSA 3O4WA 3QBWA 1ATNA 2QWPA 4A62A 4CBXA 1E4FT 4BVPA 1DEJA 3HI0A 2P9IA 3O1BA 5AZIA 4RTFD 5FPNA 3GOIA 4CI6A 4O8KA 2HF4A 3RSEA 4O5FA 4I6MB 1SAZA 2IVPA 1T44A 3LM9A 1BDGA 1JCGA 3H1VX 3FGUA 4BRFA 3B8AX 5KPZA 2QWOA 1GLBG 4BR2A 2P9LB 4FO0A 2AA4A 1JCEA 2Q0RA 3QB0A 1V4TA 2GTDA 2P9PA 4FWSA 4GY2B 3FR0A 1ATSA 1ZXOA 1BOTO 3W3DA 5F0XA 3DXMB 3OHRA 3HBTA 3M1FA 3CJ7A 4BRAA 5AQGA 3EO3A 3ULEA 3GE1A 4XH1A 1MA9B 5KQ8A 2A3ZA 1HLUA 3CERA 3H6EA 3UKUB 3ZETB 4FWLA 4H0PA 4K25A 5E84A 1V4SA 4BQLA 1GLLO 3VEYA 2ZWHA 5B8HA 4AM6A 3CJ1A 4BR4A 4Z94A 4FWMA 1Y64A 3EZWA 4B1UB 3U4LA 5AQJA 1ZC6A 3EN9A 1C0GA 1HJOA 5AQTA 2P9UA 5F2RA 4Y0WA 2QWNA 4DQ8A 4FWNA 3LM2A 2YHWA 1BA1A 4CZJA 1P8ZA 4QS7A 5LY3A 5BPMA 3ENOA 3FE1A 5AQLA 4A2AA 3CJCA 4H5VA 5BN9A 5FPMA 1NGDA 3C7NB 5BR9A 2FSJA 2AP1A 4C23A 4BRQA 1X3NA 5EOYA 3U9DA 2Q31A 1K8KA 3O08A 3MDQA 1DGKN 3SMSA 1QZ6A 2P9KB 4A2BA 2GWKA 2A40A 3SJHA 2E1YA 3C0BA 3O80A 4FWPA 3UKRA 3WUHA 2FSKA 4CZGA 4EIAA 4PL7A 3D2FB 4AM7A 4BREA 1ESVA 1U2VB 4RWTA 4YDUC 1ZBSA 4B1YB 3SMPA 1MWMA 2GWJA 3L0QA 3MK6A 4WQ5A 5KQDA 2F9TA 3A8YA 2P9IB 4PL8A 5AZIB 4CD1A 5BPNA 4BGBA 3VF4A 2YJEA 1RFQA 3RSEB 3A5LC 3CHWA 2ZGZA 3VOVA 4BC4A 2E2PA 4H5TA 2A42A 5EVZA 4BRMA 5JLHA 1KAYA 4BR9A 3VESA 1LCUA 3ZX2A 4NO7A 1NGHA 5AQHA 2P9PB 4K43A 3LDPA 4FWQA 4M7YA 4WQ4A 1S22A 4FOIA 1NGGA 3R9PA 4E1JA 3ULEB 3VERA 4FL9A 4HTLA 3WXLA 1LOTB 3O1WA 4BRNA 5F1XA 2A5XA 1R59O 1EQYA 4H5WA 1WUAA 4EAHD 4MO5A 5LJVA 3DWLA 3CETA 2P9UB 2I7NA 3W0LA 3D2EA 2DPNA 2HOEA 3LDOA 1IJJA 3HSCA 3BEXA 3ZEUA 2Q2RA 4CBWA 5EXWA 5AQYA 5KPRA 1BG3A 4CZFA 2ASMA 1HKBA 1QQOA 2NLXA 3WXJA 3H1QA 2BUPA 2IVNA 3CJ9A 1HPMA 1NGAA 3CQXA 2F9WA 3A0IX 3HZ6A 3FZFA 1K8KB 5BRDA 3FZHA 1H1VA 5AQZA 4IZ9A 2D4WA 2IIRA 3WEEA 2CGLA 3QFPA 1X9JA 4CJ7A 1YAGA 3UKRB 3DXKA 3SK3A 4B1VA 2QWQA 1NGBA 1CZAN 1HKCA 5AQOA 3MN7A 4IXCA 3BF1A 2GEMA 1YUWA 3VF6A 3KVGA 3SLCA 4WYBA 3A5NC 5JMVA 3AAQA 4FWOA 4JHDA 3QDKA 4FWRA 4BR7A 4BRKA 4BC3A 1XUPO 1G99A 1TUUA 1U6ZA 3MCPA 5AR0A 3VEWA 1YXQA 3FZKA 5BPLA 1NGFA 1QHAA 3U9ZA 3J8AA 2ASOA 4RCHA 3JS6A 1GLEG 3GBTA 3P4IA 1BA0A 2KHOA 4WQ5C 3CI5A 3DJCA 3KZBA 3ZX0A 5AQRA 4FWKA 2YHYA 3JXUA 5AQSA 4HWIA 2OANA 1S3XA 4F9OA 1J6ZA 3ZX3A 4CZEA 3KHYA 2W41A 3VEZA 2E2QA 2YJFA 3BP8A 2A6AA 2FSNA 2BTFA 3VENA 1C0FA 4H03B 4JAXA 5ADXH 4K42A 2P9NA 1MDUB 3BF3A 3VEOA 5KPTA 5E26A 2V51B 4H0VB 4FOEA 1JCFA 3TPQA 1ATRA 1T6DA 2HF3A 5TKYA 4BRHA 5AZJA 4BVOA 5JICA 3L6QA 3D2EB 1NGJA 2CH5A 5BRHA 4MO4A 4H5RA 2NZTA 3VGLA 4EFHA 3ZEUB 2E1ZA 5ADXA 4BG8A 4JD2A 3HTVA 4XH5A 4CD3A 4JN4A 3MN5A 4MLEA 2YHXA 2D0OA 3CJBA 5AQQA 4H0OA 1KAZA 2W40A 3WQUA 4EHTA 2V52B 3CJAA 3AY9A 3IFRA 3I33A 2E2NA 5FPDA 4IO8A 2CGKA 3WEEB 3EKSA 2D0PA 2ASPA 4LC9B 3O8MA 3DXKB 1HUXA 4MLHA 3VF2A 3O6WA 4YDUA 3DAWA 2CGJA 2E8AA 4CZKA 1QQMA 2QW9A 3CQYA 1X3MA 1QQNA 3AARA 3WT0A 2VYPA 5EX5A 1IG8A 2Q1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSHA 2QWMA 1RBRA 4H5NA 5GINA 3FZMA 3QERA 1KV0A 3R2VA 3NMUA 4ZTFA 2WONA 1VSMA 4JRQA 2NY9X 1GOBA 4H0XB 1GLCG 2ZJRL 4BR5A 2JWKA 3TAFA 3LDNA 1RGIA 3VN5A 3F9MA 2Q36A 3TU5A 4ISGA 4LH4A 4DSKA 4M41A 5AQVA 1RTIA 1JKHA 4IOCL 3N4PA 1GLDG 2QXLA 3L4IA 3WXIA 2OPRA 4FLVA 4H0TB 2D5RA 3OYLA 4GNIA 3I8BA 1NH5A 3ATVA 4FPBA 3TAEA 5JVHL 2P9SA 4CEAA 4BE7B 3ISNC 2E88A 1JKZA 4UAFE 2LN8A 4M3RA 3SBTA 4IKFA 4CZHA 5HOOA 1WWNA 2B68A 4BRGA 3TANA 4J8FA 4BRLA 2VCPA 3KP0A 2B3CA 3LDSA 3MMVA 1NOZA 4FW2A 5BN8A 5LJWA 5I9EB 1D5AA 2WTUA 3WXKA 1LAWA 1TL3A 1NM1A 2VGNA 4QS9A 1XMOK 1XWLA 1T7BA 4JI6K 2NRHA 4JS4A 4HUEA 1HYZA 4IJAA 1BUPA 2MBKA 3RR7A 4M3UA 4DB3A 1N34K 3LDQA 1TUYA 4FYDA 2UUAK 3V9ZA 3SUQA 4I2PA 3DYAA 3CIPA 1VQ8N 2NRXA 3ZETA 3M8RA 5ELZA 2V7ZA 4FJ8A 3KOYA 4KHQA 1SZ2A 2NY8X 3QICA 4U7BA 1HQUA 1WSJA 4AHTA 1WN7A 3FLCO 3ZT1A 2YX6A 2UXBK 4CBUA 1SNBA 2GUPA 4YHHK 1BISA 1VQMN 4FPAA 4WF9L 4M3ZA 1CZ9A 3ID8A 3MEEA 4DR4K 3G25A 1NG9A 5AQPA 1SUQA 3S41A 4DFJA 3H3OB 3O9SA 3UE5A 1RCHA 2OPPA 1KC8O 3FFKB 5KRSA 1W97L 4FJ9A 3HM9A 1VQNN 2QWRA 3PIOL 4N41A 1J5EK 2E4LA 2RN2A 4F3TA 1I94K 2FF6A 1JLCA 1N32K 1UWBA 2HNYA 3CCMN 2G8FA 2P9KA 3H45C 4IEIA 4C1NK 1FH3A 3WNHA 4BRIA 3U6FA 2I7PA 4ILHA 2OPQA 2P9SB 1B7DA 1U2VA 3SPYA 1NJXA 4Z4EA 2RPIA 3CFOA 1T0ZA 3J7AP 1QS4A 3O4WA 2DFEA 4A62A 1W2BM 2JGUA 4IG0A 1TKZA 2HBJA 1JJ2M 2IDOA 2LSNA 2PYLA 3DLGA 1Q81O 2N69A 2IVPA 3H1VX 1W7AA 4BECA 3QEVA 3O4NA 1S1WA 4BR2A 2X6NA 2D0AA 4HTUA 1L3SA 2E0HA 1IKWA 3VQQA 1QSYA 3PO4A 4GY2B 3W3DA 1CXQA 1KFSA 3ZT4A 3CJ7A 4B9UA 2F4VK 3TTDA 1ZBHA 3VQEA 5KQ8A 5HLFA 3H6EA 3CERA 4J2AA 3ZETB 1BCOA 1IV0A 5HP1A 1Z25A 2IAJA 4DV7K 5E84A 1BI4A 3VEYA 5B8HA 4AM6A 3PO5A 2X78A 2UXCK 3TARA 3CJ1A 3P39A 5SWMA 4QCLA 1YT3A 4AILC 3EZWA 4B1UB 3CYMA 2YNIA 5AQJA 3EN9A 3OYKA 1BK8A 3OYHA 3KP1A 4DQ8A 1I39A 5KRTA 2VGMA 1ZBUA 4W5NA 4CGDA 1P8ZA 2KGQA 1RBVA 4E1MA 2G8UA 4DV1K 5LY3A 3ENOA 5AQLA 5BN9A 2SN3A 3NF9A 2FSJA 4FLXA 3L8BA 3CPEA 4BE2A 1X3NA 4CK3A 2GV9A 1K8KA 3C94A 1A5XA 3ZSOA 3ASMA 2P9KB 4O5BA 4WCEL 4FWPA 4DR7K 4DV0K 4EIAA 4CZGA 1MYNA 4DTOA 1I2UA 2KJAA 2BH1A 4BREA 1ESVA 1U2VB 4RWTA 3Q7BA 4LH5A 4B1YB 2VWJA 2GWJA 1G15A 3CG7A 1Q9XA 4GW6A 1VRUA 4Y1DA 5M1OA 3LPTA 3E7UX 3SAHA 5J2QA 3JSMA 3A5LC 3CHWA 2ZGZA 3VOVA 4WFNL 4KREA 2YBRC 4H5TA 2E2FA 1XNRK 4DU3A 1S1TA 1XC9A 4DSJA 3ZSZA 4PUOA 4JI4K 2HVHA 3SCXA 2G8KA 3CCSN 4E1JA 3O9QA 4Z4HA 3VERA 3P38A 4HTLA 5M1KA 3ZLJA 3NF8A 1NKCA 4CEBA 3OBYA 3G71N 1NKBA 3WXLA 3RMDA 4Z4CA 1BI4B 1ITGA 1LOTB 3IS9A 4J2DA 3TABA 2LY5A 5F1XA 3IAYA 4B3RK 3SUPA 1WAJA 4DF4A 1IBKK 2NNWA 3PX0A 1POIA 3TR8A 2XRIA 1SL0A 1Q82O 1WUAA 5LJVA 2G8VA 3W0LA 3D2EA 1RT6A 2DPNA 3LDOA 1FK9A 3HSCA 1RT1A 4JK9A 2QKKA 2Q2RA 1T7EA 4CBWA 1YITN 3NF7A 4G1QA 1KFDA 3ZSQA 3NHGA 1P0AA 3OW2M 3NGYA 1YTUA 1VQLN 1IKVA 3P83D 3A0IX 5JS2A 3FZFA 1K8KB 4DTJA 1WBDA 1J5OA 1SN1A 3QFPA 1X9JA 4CJ7A 4CF8A 3SK3A 3B6PA 1P90A 1TAQA 3NBPA 1LWFA 4DR5K 1CZAN 3M8QA 1HKCA 3CD6N 3MN7A 4IXCA 3BF1A 4ELVA 3GKUA 5HL7L 1YUWA 4E7LA 3V1RA 3AAQA 4CHPA 4JHDA 3TSUA 1EO1A 4FWRA 2W42A 3OA9A 1XUPO 1KLNA 1K8BA 5EU7A 3PY8A 1U6ZA 3TAGA 1YXQA 4DUYK 2QK9A 1X9WA 3L3UA 1QHAA 3LAKA 3J8AA 1RDAA 2ZD1A 3CFPA 5LMUK 1VQ7N 2ASOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3GBT A;  3P4I A;  1BA0 A;  2KHO A;  4WQ5 C;  3CI5 A;  3DJC A;  3KZB A;  3ZX0 A;  5AQR A;  4FWK A;  2YHY A;  3JXU A;  5AQS A;  4HWI A;  2OAN A;  1S3X A;  4F9O A;  1J6Z A;  3ZX3 A;  4CZE A;  3KHY A;  2W41 A;  3VEZ A;  2E2Q A;  2YJF A;  3BP8 A;  2A6A A;  2FSN A;  2BTF A;  3VEN A;  1C0F A;  4H03 B;  4JAX A;  5ADX H;  4K42 A;  2P9N A;  1MDU B;  3BF3 A;  3VEO A;  5KPT A;  5E26 A;  2V51 B;  4H0V B;  4FOE A;  1JCF A;  3TPQ A;  1ATR A;  1T6D A;  2HF3 A;  5TKY A;  4BRH A;  5AZJ A;  4BVO A;  5JIC A;  3L6Q A;  3D2E B;  1NGJ A;  2CH5 A;  5BRH A;  4MO4 A;  4H5R A;  2NZT A;  3VGL A;  4EFH A;  3ZEU B;  2E1Z A;  5ADX A;  4BG8 A;  4JD2 A;  3HTV A;  4XH5 A;  4CD3 A;  4JN4 A;  3MN5 A;  4MLE A;  2YHX A;  2D0O A;  3CJB A;  5AQQ A;  4H0O A;  1KAZ A;  2W40 A;  3WQU A;  4EHT A;  2V52 B;  3CJA A;  3AY9 A;  3IFR A;  3I33 A;  2E2N A;  5FPD A;  4IO8 A;  2CGK A;  3WEE B;  3EKS A;  2D0P A;  2ASP A;  4LC9 B;  3O8M A;  3DXK B;  1HUX A;  4MLH A;  3VF2 A;  3O6W A;  4YDU A;  3DAW A;  2CGJ A;  2E8A A;  4CZK A;  1QQM A;  2QW9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VSH A;  2QWM A;  1RBR A;  4H5N A;  5GIN A;  3FZM A;  3QER A;  1KV0 A;  3R2V A;  3NMU A;  4ZTF A;  2WON A;  1VSM A;  4JRQ A;  2NY9 X;  1GOB A;  4H0X B;  1GLC G;  2ZJR L;  4BR5 A;  2JWK A;  3TAF A;  3LDN A;  1RGI A;  3VN5 A;  3F9M A;  2Q36 A;  3TU5 A;  4ISG A;  4LH4 A;  4DSK A;  4M41 A;  5AQV A;  1RTI A;  1JKH A;  4IOC L;  3N4P A;  1GLD G;  2QXL A;  3L4I A;  3WXI A;  2OPR A;  4FLV A;  4H0T B;  2D5R A;  3OYL A;  4GNI A;  3I8B A;  1NH5 A;  3ATV A;  4FPB A;  3TAE A;  5JVH L;  2P9S A;  4CEA A;  4BE7 B;  3ISN C;  2E88 A;  1JKZ A;  4UAF E;  2LN8 A;  4M3R A;  3SBT A;  4IKF A;  4CZH A;  5HOO A;  1WWN A;  2B68 A;  4BRG A;  3TAN A;  4J8F A;  4BRL A;  2VCP A;  3KP0 A;  2B3C A;  3LDS A;  3MMV A;  1NOZ A;  4FW2 A;  5BN8 A;  5LJW A;  5I9E B;  1D5A A;  2WTU A;  3WXK A;  1LAW A;  1TL3 A;  1NM1 A;  2VGN A;  4QS9 A;  1XMO K;  1XWL A;  1T7B A;  4JI6 K;  2NRH A;  4JS4 A;  4HUE A;  1HYZ A;  4IJA A;  1BUP A;  2MBK A;  3RR7 A;  4M3U A;  4DB3 A;  1N34 K;  3LDQ A;  1TUY A;  4FYD A;  2UUA K;  3V9Z A;  3SUQ A;  4I2P A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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