4K41A

Crystal structure of actin in complex with marine macrolide kabiramide c
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
371
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural and biochemical studies of actin in complex with synthetic macrolide tail analogues.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 118
structure length 363
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4k41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4k41A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4k41A03
2GELA 4B1VA 3D2FB 3GBTA 4L3QA 2P9IB 2KHOA 4BRDA 1Q18A 2PBDA 5LJVA 4BRGA 4EHTA 2A42A 1V4SA 2IIRA 3A5LC 3DXMB 2DPNA 4BRIA 5AQUA 3O1WA 3VESA 1BU6O 4IXCA 4BC3A 1D4XA 1NGIA 4AM7A 4H5VA 2V7ZA 1QQMA 3ZETA 3CJAA 1KAXA 4BG8A 5EY4A 4A62A 1TUUA 4H0VB 2CGJA 4K42A 3H45C 3EO3A 1MDUB 3O08A 2EWSA 4H0XB 5ADXH 2CGLA 1V4TA 3O1BA 2VWBA 2ASPA 3O6WA 4RTFD 1HX1A 3UKRB 3O5BA 5AQWA 3ZX0A 2QWRA 5CE3A 4M7YA 1ATSA 5F0XA 2QWNA 3CJ7A 4H0YB 4B1XB 4CBUA 4BGBA 3RSEB 3J8AA 2CH6A 1IJJA 4FPAA 4BR4A 4PL7A 4C23A 4FOEA 2P9UA 5I9EB 5AFUH 4BROA 2P9NB 4FWOA 4K41A 5KQDA 4RWTA 1GLEG 5AQPA 3I8BA 4BR7A 5AQGA 1BO5O 5AZJA 5BN9A 4I6MA 3L4IA 1NGDA 4ISFA 3SMSA 4FSVA 3FE1A 3SK3A 4H0TB 1LCUA 2FF3B 5JLHA 5AQRA 1P8ZA 3A5MC 5AQLA 3VENA 4PL8A 4BRQA 3WQTA 2A5XA 2V7YA 4JAXA 3U9DA 4CZHA 2V52B 2NRHA 1EQYA 3A5OC 2YI1A 3AY9A 4JD2A 4BQLA 5AQHA 4CD1A 5E26A 5BPMA 4BRCA 3GG4A 1NGEA 5BPLA 2YHXA 3ULEA 1HUXA 3FZMA 5ELZA 5AQVA 3AAPA 1TUYA 3VF4A 4B1UB 2WUSA 3VEWA 4YDUA 2D1KA 2VYPA 4CD3A 2OANA 1SZ2A 2AP1A 4F9OA 4BQZA 4JHDA 2QXLA 3U4LA 3WXKA 3SLCA 3P4IA 2P9KA 4NO7A 1NM1A 2E2PA 3EL2A 3O80A 1KAYA 3UE5A 1WUAA 4BVOA 3LDLA 4BG9A 1NGAA 3S41A 4IJNA 1J6ZA 3MCPA 3VF6A 3MK6A 4JNEA 3CJBA 2CH5A 4A61A 3GL1A 2YHYA 3QDKA 2GTDA 2J4RA 3IUCA 4CZMA 1E4GT 4HWIA 1HPMA 2A40A 1Y64A 3R8EA 3ZETB 4BR2A 4XH5A 1YXQA 1JCFA 3HTVA 5AZIA 3VPZA 5AQZA 4B1YB 3I33A 4BRHA 4M7XA 1ATRA 3VOVA 5AQQA 3VEVA 4CI6A 5TKYA 3LDQA 4MLEA 3H46O 4RCHA 3UB5A 1XQSC 5AQYA 1X9JA 1YVNA 1NGBA 2E1ZA 5AQMA 1G99A 5BR9A 5KQ8A 3DXKA 2IVNA 4WQ4A 4CZGA 4IZ9A 4EIAA 3FR0A 3QBXA 2PAVA 5AQTA 4EAHD 4O8KA 3FZFA 3D2EB 5FPEA 4YDUC 4J8FA 2ZGYA 4FWQA 3CQXA 3VF2A 1ZXOA 3D7EO 1BUPA 1ZC6A 3FZHA 3R6MA 3WXLA 3A8YA 2P9UB 3DWLA 3EKUA 4FOIA 2FXUA 2A3ZA 1C0FA 2QWLA 2QW9A 1S22A 4H0PA 5B8HA 5AZJB 4BC2A 1MWMA 3HSCA 2D0PA 3LDNA 4CZIA 4I6MB 3WXIA 5KPRA 2ZGZA 4H0OA 2E8AA 3W3DA 4AM6A 4FWMA 2AA4A 4B9QA 1S3XA 4MO5A 1SQKA 3VEXA 2GUPA 2NZTA 4K43A 3VEOA 1KAZA 4XEIA 2F9WA 1ESVA 3ID8A 3ZEUA 1Z6RA 3B8AX 4H5RA 3ZX3A 4WQ5A 4ISGA 4JD2B 4ISEA 4MLHA 2P9SA 1BA1A 4BR0A 3O8MA 2GWJA 2Q1NA 1YAGA 4WQ4C 4XH1A 1IG8A 1QQNA 4BR9A 1H1VA 4EHUA 3ULEB 1MWKA 1BOTO 5BREA 1RDWX 2F9TA 2HMPA 3TU5A 4BRKA 3H1QA 3IFRA 4BRFA 1RGIA 3BF3A 2ITMA 3FLCO 4Y0WA 3A5NC 4JHDB 5EVZA 3VEZA 2CGKA 1Z05A 3M1FA 3IMXA 4CZLA 3CJCA 1GLAG 2P9KB 1RFQA 3MMVA 4BVPA 1WOQA 2HOEA 3G25A 3UKRA 1GLFO 4H5WA 5JMVA 4FWSA 4BGAA 2FLOA 5AQJA 1T44A 3C0BA 1U6ZA 3VGKA 3RSEA 1X3MA 3H3OB 3EN9A 3ATUA 1XUPO 2GWKA 4HTLA 3VGMA 4CZFA 2P9NA 5AZIB 4PKHA 3MN5A 1X3NA 3MN6A 2IVOA 2QWMA 1ZBSA 4B1ZA 4O5FA 4BC4A 3L6QA 5KPZA 4MO4A 3WT0A 2FSJA 1YUWA 3O4WA 2ZF5O 3FFKB 3DXKB 4GY2B 5BN8A 2YJFA 3L0QA 3M3ZA 5FPNA 4PKIA 4CBXA 3QMLA 3C7NA 5EOYA 1TYQA 5EX5A 2HF3A 3GDQA 5JICA 4NB4A 4CZEA 1CZAN 2NLXA 3EZWA 5BRFA 3BEXA 3LM2A 1GLCG 1GLLO 3IDHA 5AQFA 3MN7A 3QB0A 5AR0A 3QICA 1U2VA 3HBTA 1K8KA 2ZWHA 2W41A 3VGLA 2FF6A 2Q0UA 5FPDA 3KZBA 1BA0A 4QS8A 4PKGA 4FO0A 3HI0A 2E2NA 2Q31A 4DQ8A 3QFUA 5AQSA 4A2BA 3BUZB 5FPMA 3FGUA 1NWKA 4H5TA 2UYTA 2VCPA 4FL9A 4FPBA 1LOTB 4GNIA 2D0OA 1QHAA 3ZEUB 3JS6A 3CIPA 3AAQA 3UKUA 2P9PA 4IWVA 3TPQA 5ADXA 3H3NO 3LDOA 3GE1A 4IO8A 3U9ZA 2QWPA 1NGGA 4FWRA 3WEEA 2ASMA 2H3GX 2P9SB 3VEYA 1HLUA 3ZX2A 3WXJA 4DB3A 1HKGA 1OKJA 3H6EA 3CQYA 3OHRA 4Z94A 1ATNA 4DHYA 3SMPA 2A6AA 2P9LA 1MA9B 1R59O 1HJOA 5BPNA 3DAWA 2E2QA 4FWKA 4LC9B 1NLVA 1T6DA 2I7PA 2I7NA 4FWNA 3D2FA 2BUPA 4H5NA 2P9IA 1NGFA 3GOIA 3QFPA 4XH4A 5AFUA 1NGJA 2BTFA 3ATVA 3WQUA 5AQOA 1QZ5A 2YHWA 1GLDG 3DXMA 3LL3A 4QS7A 3CHWA 3WUHA 4WYBA 1NGCA 5E84A 1SAZA 1XC3A 3D2EA 1E4FT 3FZKA 5LY3A 3BF1A 1JCGA 5F1XA 1QZ6A 1DKGD 2Q97A 1QQOA 4FWPA 1KXPA 5AQNA 2E1YA 5BRHA 2QM1A 2Q0RA 4BRPA 4BREA 4E1JA 3VERA 3QBWA 3CJ1A 4CZJA 4BC5A 3ENHA 5JLFA 4FWLA 3FZLA 4BR5A 3M6GA 4QS9A 4H03B 2HF4A 4M63C 4DCHA 1JCEA 1DGKN 5AQIA 2E88A 4BRMA 1DEJA 3C7NB 1TYQB 3JXUA 3MDQA 5KPTA 3HZ6A 1HKCA 2Q36A 3CETA 3A0IX 1C0GA 1NBWA 3F9MA 5AQXA 4CJ7A 4WQ5C 3VETA 3LM9A 3LDPA 3U8XA 4IJAA 2YJEA 1U2VB 1K8KB 3ENOA 4B1WB 1GLBG 2GEMA 4KBOA 2IVPA 3SJHA 2QWOA 4CBWA 2FSNA 2ASOA 3W0LA 5EXWA 3CI5A 2D4WA 3DJCA 4CZKA 1T6CA 1HKBA 4BRNA 4BRAA 1BDGA 1BG3A 3HM8A 2V51B 3MN9A 3H1VX 2FSKA 3UKUB 2P9PB 2A41A 2E20A 3AARA 4BRLA 3R9PA 1NGHA 5F2RA 3WEEB 3CJ9A 5LJWA 3KHYA 4A2AA 1GLJO 2W40A 1NMDA 5BRDA 1BWFO 3BP8A 3KVGA 4EFHA 2P9LB 3CERA 5AQKA 2Q2RA 3EKSA 2QWQA 2E2OA 2YCHA 4K25A 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CK2A 5C24A 3HPGA 4L3QA 4OPJA 4CIGA 3L2VA 4BRDA 4UY8O 2PBDA 2EHGA 4BRGA 3ZSQA 3TTDA 1SUQA 2Y1JA 2VG6A 4FJMA 1T03A 3CFRA 4BRIA 3VESA 3C6AA 3RRHA 2RKIA 3ITHA 2V7ZA 1L3VA 2YKMA 3ZETA 1KAXA 4HTUA 1C1BA 1WNSA 2CGJA 4K42A 1BL3A 2IAJA 3O08A 1HRHA 3BZCA 1V4TA 2E6LA 3EY1A 3CMEN 3O6WA 4RTFD 3UKRB 4CK1A 5AQWA 1EWRA 2ZJQL 1N8RO 5CYQA 3R1XA 5CE3A 4M7YA 1VQ4N 2ZD1A 1NJWA 2G8IA 3QNNA 4WCEL 3TAEA 1U4BA 1MU2A 4FK0A 1LWFA 3RSEB 3J8AA 3DLKA 1YITN 4BR4A 2O8BB 4PQUA 4FYDA 2P9UA 1FW6A 5KGWA 2P9NB 1BCOA 3THYA 5KQDA 5AQPA 1TL3A 3I8BA 2YHAA 1NGDA 4ISFA 1CZBA 1Q86O 3FE1A 3SK3A 4M3WA 1P8ZA 3CFOA 1KSPA 4RW6A 4ILJA 4BRQA 3KD5E 2A5XA 3VQ9A 3DLGA 3LWLA 3M8PA 4F8RA 3ZLJA 1EQYA 3A5OC 4JD2A 3OTOK 5HP1A 2O8CA 3K9KA 1HYZA 4JI1K 4R79A 3WNFA 3RMDA 3VQBA 4JKCA 3OBWA 3KLGA 5C10A 4GV6A 1HUXA 3FZMA 5AQVA 3AAPA 4B8AB 1NKBA 3L2QA 5M1OA 4BQZA 2QXLA 4B3MK 3P39A 2P9KA 4NO7A 1RBRA 2E2PA 3O80A 4DTSA 2ATQA 3WXMB 2XHBA 4O5BA 1C1AA 3MCPA 3WNGA 3UIQA 2CH5A 4QOZB 4B08A 4Z0UA 2J4RA 3IUCA 2NUBA 3C6UA 4G1QA 1Y64A 4K8ZA 4BR2A 3EEQA 3CM5A 1LW2A 4BRHA 3TARA 4XJXA 4IEIA 4CI6A 5C42A 3LDQA 4YOYA 3VQDA 4CF8A 1WSJA 3CCJN 3KTQA 2E1ZA 5BR9A 5M1PA 3DXKA 4IZ9A 3DLEA 4MQ3A 4O8KA 4CEDA 2WOMA 1YJNN 3DLRA 5JS1A 3CQXA 3OBYA 2Q3SA 3R6MA 4YOTA 3SYZA 4OPHA 1XHZA 4B3RK 3V81A 1Q7YO 2OZMA 2QWLA 3ZSVA 1HR0K 4ICLA 1K6YA 3OYDA 5B8HA 3AVMA 1MWMA 2GV9A 3QEWA 4FJ8A 4H0OA 3LP3A 1S6QA 5KTQA 2AA4A 5KRTA 3ZSYA 2YV0X 4DUZK 1YVUA 3AVFA 3K9JA 1VSMA 2HW3A 3MEGA 3VEOA 1N33K 1ZBHA 1Z6RA 4J2EA 4IKFA 4ISGA 4B9LA 1W2BM 4GMJB 5T7BA 3CCVN 4GKKK 3VN5A 1YTUA 3V9XA 1K73O 4B3OA 4JK9A 4XH1A 1IG8A 1QQNA 3ULEB 1BOTO 1KTQA 5BREA 4F4KA 1RDWX 3TU5A 2O8EA 4FJNA 2WFBA 4AQYK 3FLCO 3A5NC 5EVZA 3OYEA 5J2MA 3VEZA 1GLAG 1RT6A 3J7ZO 1KLMA 4CEQA 4BVPA 3UKRA 3MEEA 4H5WA 4LF8K 4DTOA 4MDBA 4BGAA 2FLOA 1T44A 2FC0A 1SKSA 3PSIA 3RSEA 1VSFA 4IBNA 4DV6K 3ATUA 2KTQA 1XUPO 2GWKA 2OPPA 2HHSA 1NJXA 4HTLA 4M45A 3KWGA 2P9NA 4JS4A 2IVOA 3MWTA 1YF5L 5C12A 4JK8A 3L6QA 4JKDA 3CC4N 1S9GA 3QEVA 1JLCA 3FFKB 2YJFA 3DOLA 3L0QA 1QVGM 3NF8A 1SKWA 5EX5A 1YT3A 4DS5A 1IH7A 3GDQA 3LM2A 3THWB 3AA2A 1GLLO 1HNIA 3QEXA 4FJJA 3QICA 3CCQN 1XC9A 2HHTA 1U2VA 3HBTA 2ITGA 3RWUA 4KREA 4CJQA 4CGIA 1KLNA 4LFAK 4ZHRA 3AVLA 2UYTA 4BACA 2O8FA 3BY5A 1LOTB 2HHIA 3THXB 2D0OA 2DFFA 1Y97A 3JS6A 5ADXA 4DR3K 5FROA 1JLAA 1A5WA 3U9ZA 3PO5A 2QWPA 4E89A 3WEEA 1DLOA 2ASMA 2JWKA 2P9SB 3NH0A 3WXJA 3TANA 3TAMA 4C8OA 2VG5A 1ATNA 4AH9A 2P9LA 5FRNA 1MA9B 4E7KA 2HB5A 1R59O 4FWKA 1FJGK 4AHSA 2I7PA 2I7NA 2BUPA 1NGFA 4XH4A 3I8DA 2IOCA 2BTFA 4O8UA 3NGYA 2QA4N 1HNZK 2GX9A 1BIUA 2WTUA 2KZMA 3LP1A 4CGDA 3LALA 1W7AA 4WYBA 3I0SA 5E84A 3MECA 3PO4A 1XC3A 1U49A 3FZKA 1BHLA 4YHHK 1JCGA 4JV5K 3T1YK 1DKGD 3I55N 4CHQA 1WSEA 1WBBA 4E0DA 4BRPA 2IGIA 4MFBA 4CZJA 4NCAA 4LFBK 3VMFB 5I42A 2O4GA 4FLYA 4QS9A 1C1CA 4JEPA 4KH4A 3OYJA 2PYJA 4CIEA 4CHNA 4ELUA 4KB0A 5AQIA 4BRMA 3C7NB 4IOAL 4DTRA 4M41A 4DU1A 5KPTA 4J2AA 4EZ6A 2UU9K 3QERA 1C0GA 4CJ7A 3E01A 3LM9A 1NJIO 3LDPA 3U8XA 1VSIA 1HPZA 3PX0A 1S5JA 2YJEA 2QEXN 4IOCL 1YI2N 3CG7A 2GEMA 4KBOA 1TK0A 2IVPA 3C65A 5M1KA 5CR4A 4CBWA 5EXWA 1UA1A 1U47A 5HRPA 3MEDA 4JI4K 4CJVA 1XHXA 1W0HA 3VQCA 5GAHP 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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