4K41A

Crystal structure of actin in complex with marine macrolide kabiramide c
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
371
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural and biochemical studies of actin in complex with synthetic macrolide tail analogues.
pubmed doi rcsb
total genus 118
structure length 363
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4k41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4k41A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4k41A03
5KPRA 4CZJA 1YVNA 2E1YA 1G99A 1MDUB 4FOEA 4CJ7A 2IVPA 3SLCA 3RSEB 3WXKA 4B1YB 4LC9B 3FZKA 3CHWA 4DHYA 3L4IA 3CJCA 3CI5A 3H46O 2CGJA 3IMXA 3DJCA 4B1XB 1BU6O 5BRDA 3CJ9A 3CQYA 4WQ4A 3QBWA 4XH5A 4C23A 2HMPA 2I7NA 2I7PA 2W41A 4IJNA 4HWIA 3R9PA 3LM9A 3GG4A 2FF6A 2Q0UA 1S22A 1NGFA 1GLEG 4QS8A 4BRLA 5AZJB 5JLHA 1ZC6A 4BR0A 3DWLA 3TU5A 1HUXA 3ATUA 2ASMA 1XUPO 1IJJA 1ESVA 5JMVA 5AQKA 4BRFA 3I8BA 1BOTO 1NBWA 4M7YA 3QICA 3ZX2A 1NLVA 2QM1A 1U2VA 1QZ6A 2DPNA 2Q0RA 1LCUA 2A6AA 5LJWA 2H3GX 3SMSA 3U9ZA 5FPEA 3AARA 3BEXA 2A3ZA 3ID8A 4BRKA 5AQIA 1ZBSA 2VWBA 5FPMA 1YAGA 5AQSA 1MA9B 1YUWA 2HF3A 1HLUA 3HM8A 3VEXA 3L0QA 1NGGA 3A5LC 4H5VA 4EHTA 3VENA 1IG8A 1S3XA 3GDQA 3BF3A 4IO8A 4CZLA 1GLAG 3FR0A 4MO4A 4MO5A 5EVZA 4A62A 5AQRA 3FZHA 4BR4A 3MMVA 4JHDB 2AP1A 3MN5A 2FF3B 2IVOA 4IZ9A 3O08A 3JXUA 2FSNA 4K42A 4I6MA 2GWJA 1TYQB 5AQLA 1TUUA 1GLBG 3HBTA 1QQNA 1X9JA 5AQHA 3MCPA 4CBUA 4BRMA 1NGHA 3VETA 3WQUA 3LDQA 3FLCO 1HJOA 3S41A 2FSJA 3CJ7A 2P9UB 4CZHA 3D2FB 3A0IX 2GWKA 3GBTA 5BPNA 2QWLA 3HI0A 3DXKB 1NWKA 2P9KA 1P8ZA 2E8AA 2E1ZA 4Y0WA 4PL7A 1SQKA 4O5FA 3A8YA 4FOIA 3EO3A 5EX5A 2J4RA 3LL3A 5AQNA 3VEWA 4BQLA 3D7EO 1V4TA 3VF6A 1T6CA 4CI6A 2NRHA 3LM2A 4BC3A 4PKIA 5BRHA 4FWQA 2P9SB 1H1VA 4BRHA 5AFUH 3UKUB 4H0VB 1Q18A 1K8KA 3QFUA 1Z6RA 1GLLO 2FXUA 3MK6A 3QB0A 4IJAA 4CZIA 2P9PA 3CJ1A 3A5NC 1R59O 2V7YA 3WEEB 5ADXH 5BPLA 1GLJO 3ZX3A 4B1UB 2QWNA 1NGDA 5AZIB 1C0FA 5TKYA 4H0OA 3UKRB 2QXLA 2V7ZA 1BA1A 3U9DA 5BR9A 2ZGZA 3D2EB 1DEJA 3WXJA 2A42A 5EY4A 3O1BA 4JD2A 4BRIA 2ITMA 5AZJA 3EZWA 2QW9A 5KQ8A 3VEOA 1X3NA 1C0GA 1KAZA 3LDOA 1EQYA 2F9WA 1J6ZA 3FFKB 3QMLA 4BC2A 3UE5A 3KZBA 3GL1A 1QQOA 3VF2A 4CZFA 1GLDG 1ATNA 2YCHA 2BUPA 2ASPA 2NZTA 2ZGYA 4H0XB 1RFQA 3DXMA 1KAYA 4WQ5C 4BRAA 3WXLA 1YXQA 4BC4A 4A2BA 3KVGA 3JS6A 4E1JA 5AQQA 4CZEA 3CJBA 1GLFO 3VGMA 3H1QA 3VPZA 3A5MC 3O4WA 3EKUA 5FPDA 3H45C 1E4FT 3VEYA 4IXCA 4YDUC 4ISEA 4AM7A 5AQZA 1BDGA 2P9LB 3FE1A 3CERA 5E84A 1X3MA 4MLHA 1NGJA 1U2VB 4DB3A 3M3ZA 1BA0A 4FO0A 4BR5A 1T6DA 1DKGD 1NM1A 3C7NA 2CH6A 3FZLA 1BWFO 1HKGA 4K25A 1XQSC 3J8AA 3FGUA 3WUHA 5AQTA 2CGLA 3LDLA 4WYBA 3ULEB 4RTFD 2CGKA 4DQ8A 3CETA 1JCFA 3M6GA 3O5BA 3IUCA 4EFHA 2E88A 3WXIA 4MLEA 3W0LA 5F0XA 3BF1A 3HSCA 4BREA 5F1XA 4BC5A 4BRPA 2UYTA 1RGIA 2P9UA 2E2PA 3H3NO 4B1VA 5EOYA 4H0YB 3D2FA 4B9QA 4BVPA 2PAVA 5AQWA 3WT0A 4BVOA 3VGLA 5AQMA 5AQXA 3ZEUB 3L6QA 2P9IB 1NMDA 2P9NB 3P4IA 1HKBA 3R6MA 4GY2B 3EKSA 3OHRA 4CZMA 3DXKA 4BQZA 3QDKA 2E20A 1BUPA 4B1ZA 1MWKA 4GNIA 4XH4A 4EAHD 4F9OA 1SAZA 3CJAA 3H6EA 4BRGA 3VF4A 4WQ5A 3C0BA 2E2QA 3MDQA 4BR2A 3VERA 3EL2A 2PBDA 4FWRA 2D4WA 4RWTA 3SK3A 3LDPA 4BR7A 3ZETA 4FSVA 5KPTA 3AAQA 3CQXA 4AM6A 4FWMA 2ZF5O 2ASOA 4PKHA 4YDUA 3RSEA 4NB4A 4BR9A 3UKUA 4M7XA 3U4LA 3VESA 4FL9A 4BRDA 1Y64A 2P9KB 2CH5A 2KHOA 4CZGA 4B1WB 2GUPA 4H5WA 1TUYA 3W3DA 3QFPA 3VGKA 2OANA 4FWSA 2YHXA 1ATSA 2V52B 3O1WA 4FPBA 3BUZB 3UKRA 4H5RA 4CBXA 4CZKA 4JN4A 3ENHA 2QWQA 4BRCA 2AA4A 3U8XA 3SMPA 4BGAA 3M1FA 2GELA 2BTFA 3CIPA 2Q31A 2YHYA 5E26A 1HKCA 1BG3A 5AQVA 4PKGA 4PL8A 2VCPA 2YHWA 3IDHA 4ISFA 3TPQA 5BREA 2QWOA 4CBWA 3O80A 1K8KB 3MN7A 1NGCA 2P9PB 2IVNA 4BG9A 5JLFA 1QHAA 4XEIA 2GEMA 1LOTB 3B8AX 3FZMA 4HTLA 5AQYA 1JCGA 5BPMA 4M63C 3QBXA 4H0PA 5EXWA 4A61A 4DCHA 3IFRA 5KPZA 5BN9A 2Q1NA 4JD2B 4CD3A 4H0TB 3VEVA 1XC3A 4IWVA 4BROA 5BRFA 1OKJA 3DAWA 2EWSA 2YI1A 4O8KA 1NGEA 2D0OA 2E2NA 4H5NA 3F9MA 3BP8A 1GLCG 2P9LA 4Z94A 3LDNA 2D1KA 1WOQA 2YJEA 2ZWHA 1DGKN 2NLXA 2Q97A 2D0PA 5LY3A 3DXMB 1HPMA 4JHDA 1V4SA 2FSKA 4JNEA 3R8EA 3H3OB 4ISGA 2HF4A 2F9TA 1NGAA 1T44A 3ULEA 1E4GT 2A41A 2V51B 1ZXOA 2HOEA 2W40A 1Z05A 2VYPA 4FWOA 1BO5O 1TYQA 4FWNA 5AQPA 4CD1A 4FWKA 2QWMA 5AQOA 5KQDA 1JCEA 5AQUA 4NO7A 3I33A 3VOVA 3FZFA 3O8MA 5CE3A 4K43A 1MWMA 3SJHA 2GTDA 3ZEUA 3HZ6A 4QS9A 2P9IA 4XH1A 2P9NA 3UB5A 3H1VX 4EIAA 2A5XA 1D4XA 5AR0A 1U6ZA 1SZ2A 4RCHA 3C7NB 1QQMA 3EN9A 4WQ4C 4H5TA 3VEZA 4L3QA 1RDWX 2YJFA 2Q2RA 4BG8A 1NGIA 4FWLA 4I6MB 5AQGA 3ENOA 3MN6A 4BGBA 5B8HA 2FLOA 2QWPA 4K41A 1NGBA 4KBOA 5ELZA 5I9EB 3GOIA 5AQJA 1ATRA 3KHYA 2QWRA 3ATVA 2A40A 2WUSA 4FPAA 3A5OC 3HTVA 2Q36A 5F2RA 2P9SA 5BN8A 5JICA 1KAXA 5AFUA 3ZX0A 4A2AA 1KXPA 5AQFA 3WQTA 4H03B 1CZAN 3MN9A 1WUAA 1HX1A 4JAXA 5ADXA 4BRQA 3O6WA 3WEEA 4FWPA 4QS7A 1QZ5A 5FPNA 3AY9A 5AZIA 4BRNA 4EHUA 3G25A 3GE1A 5LJVA 4J8FA 3ZETB 2IIRA 3AAPA 3D2EA 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CZJA 3AVAA 2E1YA 3NH0A 1MDUB 4FJKA 4CJ7A 3TWHA 3WXKA 3FZKA 3MEGA 3ZYYX 3CJCA 3H46O 4DR1K 2QEXN 3KKSA 4H8KA 4ICLA 3T1YK 1QSSA 1BU6O 5M1OA 3WNFA 4Q0BA 1BISA 3O9SA 2QA4N 1IKWA 3J7AP 4DR3K 4E3SA 2W41A 4IJNA 3THWA 3CCVN 4M3XA 3GG4A 1TKZA 2FF6A 2Q0UA 3TTCA 4AHSA 3MXIA 4KKOA 4JLHA 5AZJB 5JLHA 1ZC6A 4BEBA 3O3HA 4JKFA 3J80O 4E1NA 4ID1A 1BOTO 4M7YA 2G8VA 3QICA 4MDAA 1NLVA 3CFRA 1G15A 3MX5A 1QZ6A 2DPNA 2Q0RA 4CJSA 4I7FA 1VQ7N 3HPGA 5LJWA 5DM7L 4BACA 4DLEA 3OS1A 3ID8A 1LAWA 4JV5K 1J53A 1MA9B 1YUWA 2HHXA 1W9HA 4IBNA 4N76A 1UOCA 1Q9YA 3O9UA 4J2EA 3DLGA 2XY5A 1IG8A 1S3XA 4CZLA 3M8RA 3HJFA 1GLAG 4N41A 3CD6N 3RR8A 3O9QA 3VQ9A 4MO5A 3TABA 5EVZA 4BE0A 3FZHA 4CHQA 3PX4A 2AP1A 2IVOA 4Z4CA 3EYZA 5LL6Z 4Z0UA 1L5UA 4B9LA 4MDBA 5AQLA 4KH5A 1SL1A 2ITGA 2LSNA 3NMUA 4C8OA 3OYLA 4CBUA 2W6LA 4BRMA 4B8CA 3OYCA 4LF8K 1HJOA 2P9UB 1WB9A 1EKEA 1DLOA 4JKAA 3OYEA 5AJ3K 3KK3A 3ULDA 4F3OA 3SCXA 5BPNA 4B08A 3QEPA 3AO5A 3HI0A 1TAQA 1P8ZA 4DV0K 3S3MA 2E1ZA 1U04A 4Y0WA 2NUBA 2OTJN 4PL7A 1ZBIA 1TVRA 3A8YA 4FOIA 3QERA 5EX5A 2J4RA 3KLIA 2F8SA 1CLQA 3SUQA 1T6CA 3LM2A 1EX4A 1C1BA 3K2PA 4CFBA 1VSFA 3S5TA 3ZSXA 3K58A 4B3TK 3K5OA 3UKUB 1YJNN 1N33K 3QFUA 1VQLN 1Z6RA 1GLLO 1NMNA 4U67L 5KRTA 3CJ1A 1R59O 3WEEB 2YKMA 3ZX3A 4BE7B 5TKYA 1VQON 3UKRB 1BA1A 5BR9A 4CEQA 2JWKA 4G1QA 1TKXA 4JI3K 4BRIA 3MWTA 3TARA 3VEOA 2OZMA 4JKGA 4KTZA 4JKDA 5HLFA 3LDOA 3TAEA 1EQYA 2F9WA 3PY8A 1J6ZA 3FFKB 2E4LA 4IG0A 1CZ9A 3NF9A 4DV1K 3OYMA 1U49A 4DU4A 1S5JA 3OY9A 4FJ9A 2BUPA 1RT1A 2ZGYA 4DFJA 2F8TA 4H0XB 1RFQA 1KTQA 3DXMA 4KHNA 3D45A 1VQ6N 1Q86O 4A2BA 3SUOA 2UUAK 3V1OA 3CJBA 4DWIA 5JVHL 3H1QA 1TAUA 3VPZA 1D5AA 5T7BA 2D5RA 1YTAA 1HYSA 3HO1A 4FJ5A 4RW8A 5FPDA 2O8BA 3H45C 2HNYA 3NF8A 1QSLA 2YNHA 1NOYA 1C1AA 3ENBA 4FZYA 4JI8K 5AQZA 4JS5A 3SUNA 2DFFA 1ZYQA 1X3MA 4MLHA 1U2VB 2KLAA 2O8DA 4BR5A 4FO0A 1NM1A 1LAVA 4CK2A 1I94K 1HKGA 2WFBA 4AILC 1NJWA 1S1TA 5AQTA 3CCEN 4WYBA 3ULEB 3I56N 2BE2A 4CEEA 1JCFA 4XIUA 1VQKN 2E88A 2PFUA 5LMNK 1CZBA 3BF1A 2G8HA 4FK2A 1YI2N 4CF0A 2NRVA 4CHPA 3D2FA 4JI0K 4DR4K 5AQMA 5AQXA 3RMAA 4OPAA 1VQ4N 3CCLN 1RTJA 2HHWA 1VAZA 1KFSA 3EKSA 3AA4A 4CZMA 1X9SA 2ZJRL 3SPYA 1KLMA 3TAQA 1NK7A 3V1QA 3ZT4A 5IWAK 3VF4A 3C0BA 3MDQA 1UWBA 2HHSA 2D4WA 4RWTA 1HNXK 3SK3A 3LDPA 3P38A 2O8EA 4BR7A 4KH6A 2RHKA 1OH7A 3VQDA 2Q3SA 4KV8A 3AAQA 4ILHA 2ASOA 3BZKA 4OVLA 3L2VA 1BI4A 4PKHA 3VQ6A 3U4LA 5BR8K 4FM1A 2P9KB 3VMFB 4R79A 4DR5K 1TKTA 1TUYA 1W0HA 4JKHA 4N47A 2OANA 4FWSA 1WBDA 2V52B 2OCEA 3BUZB 4O5BA 1WSFA 4CFCA 4Z4FA 4JN4A 4A5BA 2G8IA 5HL7L 3M1FA 4CGFA 2YHYA 4B9MA 3L4QA 3OBWA 1VRTA 4F2RA 1J5OA 4CBWA 3TANA 2WOMA 1L3SA 3LP1A 4UQGA 3MN7A 1NK9A 5JLFA 1QSYA 1ZBHA 5JS2A 4O8UA 5AQYA 1JCGA 3O3FA 3L2UA 3SI6A 4FVMA 1L3UA 2FBXA 5M1KA 3CM6A 4A61A 4DCHA 5KPZA 4C8LA 3DLBA 1SL2A 1JLBA 1OKJA 3NH2A 3DAWA 2EWSA 1NGEA 2D0OA 3P83D 3NCIA 5CY4A 3ZCMA 4LD0A 1GLCG 4CIEA 5CHIA 2ZWHA 2NLXA 1YT3A 2FBTA 3TSPA 5LY3A 3D6RA 4BWJA 3DLKA 1KQSM 1W97L 3R8EA 4AH9A 1T44A 4X64K 1XNRK 4DQPA 2D0BA 1LWFA 5C10A 2W40A 3OS0A 4FWNA 4CD1A 4DG1A 2YNGA 4BWMA 4YORA 5AQUA 1NK5A 3FZFA 2NRRA 1A5XA 3THVA 2NRTA 4BE1A 4DTXA 2P9IA 4AQYK 4XH1A 5HP1A 4WCEL 3H1VX 1GOBA 3ZLJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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