4K41A

Crystal structure of actin in complex with marine macrolide kabiramide c
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
371
structure length
363
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural and biochemical studies of actin in complex with synthetic macrolide tail analogues.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 118
structure length 363
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4k41A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4k41A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4k41A03
4XEIA 3SJHA 3L6QA 2GELA 3UKUB 4KBOA 5AFUA 4K41A 4B1YB 2GWJA 4BR0A 3ATVA 2BTFA 1BG3A 5AQUA 3VEXA 1Q18A 5KPZA 1GLJO 4H5TA 3ZX0A 4C23A 4E1JA 2W40A 3LDLA 3ULEA 2YHYA 2V52B 3CJCA 1ESVA 3VERA 3CJ9A 4AM6A 2A3ZA 2AP1A 4A62A 4FWLA 5AQSA 4BC5A 3CIPA 3BP8A 3OHRA 2FSNA 3VF2A 5F1XA 3O4WA 3D7EO 3VEYA 4BRPA 3MDQA 4LC9B 3TPQA 3U9DA 4A2BA 5LJWA 2E1YA 3KVGA 2GWKA 5BRFA 4BR2A 3VF4A 2QWQA 3KHYA 4CBWA 1YXQA 3H1QA 5ELZA 4FL9A 3A5OC 3D2FB 3R9PA 3WXJA 4CI6A 1EQYA 1P8ZA 1X9JA 2P9KA 1NGIA 1T6CA 1NLVA 1DKGD 5KQ8A 3M6GA 2HOEA 1RFQA 4PKIA 1U6ZA 1V4SA 3DWLA 3O1BA 3QBXA 4CZKA 2GUPA 3GBTA 4DHYA 5AQLA 3FE1A 2P9UB 4M7XA 1Y64A 4H5WA 3BEXA 2D1KA 3WEEA 4EFHA 5AQKA 1E4FT 3VEOA 4H5NA 2Q36A 3H45C 3VEVA 4H5RA 1X3NA 5CE3A 5KPTA 2AA4A 1HKGA 3VGLA 1S22A 3EZWA 4FWOA 3O5BA 3VGKA 4BREA 2YJFA 2E1ZA 3EN9A 4CZMA 4BRKA 3TU5A 4Z94A 3EKUA 1QZ5A 3VEZA 3AAPA 3ENHA 4BRDA 3FZMA 2I7PA 2P9IB 2KHOA 1NGGA 4FWPA 2HF3A 1U2VA 2FSKA 2ITMA 4IWVA 4EHTA 2D4WA 1D4XA 1WUAA 1QZ6A 3DAWA 4BR5A 1MWMA 3O08A 5AQPA 2QWOA 1JCGA 4CD1A 4BRGA 1BOTO 4IO8A 2IVNA 5LJVA 2ZGYA 3I8BA 3J8AA 4DB3A 5AZJA 1HX1A 1CZAN 3H3NO 3CERA 4WQ4C 4H0YB 4O8KA 2Q0UA 4K25A 5FPMA 1NWKA 1YVNA 3U4LA 3LDPA 1BWFO 3D2EA 4CZJA 5AZIA 5EOYA 3G25A 3O8MA 2VCPA 5AQFA 5AQOA 3ULEB 1NGCA 4BQZA 1KAXA 2FXUA 4WQ4A 4WQ5C 5BN8A 3HI0A 3DJCA 5JLFA 2PAVA 5BREA 4QS7A 5AQNA 1BU6O 4JHDA 2ZWHA 2CGJA 2FSJA 3QDKA 1NGAA 4FPBA 1TUYA 3QFUA 5I9EB 3FLCO 1BA1A 3H6EA 3LDNA 3H1VX 4BRNA 2QM1A 3DXMB 3HZ6A 4IJAA 1S3XA 2A42A 3ZEUB 2V7YA 3WT0A 1JCFA 3UKRA 3ZETA 1QQNA 3HBTA 4BR4A 3U9ZA 1KXPA 4JN4A 5AQZA 4FWMA 5JLHA 3LDOA 2P9KB 3FGUA 3P4IA 4BC4A 2P9LA 4BVOA 1KAZA 1H1VA 2GTDA 3IUCA 2A5XA 1NGHA 1TUUA 2HF4A 1GLAG 1WOQA 5BPMA 5EXWA 1ZC6A 4XH1A 4BRAA 4BRCA 1NGDA 3MMVA 3W0LA 5FPEA 3S41A 3QMLA 5BPLA 1V4TA 2P9SA 2Q0RA 2Q1NA 3QBWA 4MLHA 1SZ2A 3GDQA 1NGBA 1GLDG 1XQSC 3AARA 3EO3A 3GG4A 3FR0A 3BF3A 5TKYA 2UYTA 2P9PA 4M63C 3C7NB 2E20A 1K8KA 4BRQA 2V51B 4YDUC 3EL2A 1QHAA 4CZLA 2QXLA 3EKSA 4K43A 3CJBA 4JNEA 5FPDA 4ISEA 5F0XA 3QFPA 2QWPA 4YDUA 1U2VB 5AQWA 5AQVA 4CBXA 4BR7A 3UKUA 2EWSA 5AQJA 2Q2RA 3MK6A 4DQ8A 3ZX3A 4BRFA 1G99A 2ZGZA 3W3DA 4NO7A 4FOIA 5KPRA 2CH6A 2YI1A 3I33A 4IXCA 4MO5A 5AFUH 2DPNA 2E2PA 2YCHA 2W41A 3A5MC 2YHXA 2A41A 1TYQB 2FF6A 3KZBA 4DCHA 5B8HA 2FLOA 4F9OA 5AZIB 2D0OA 5FPNA 3O1WA 3CI5A 3CQXA 4B1UB 4RCHA 3WXIA 5AQYA 3ENOA 1HUXA 4PL8A 5BRDA 1C0GA 1XUPO 4I6MA 2E88A 4JHDB 4AM7A 1GLCG 4IJNA 3AAQA 3DXKA 3IDHA 3HSCA 4JD2B 4ISGA 3CJ7A 4WYBA 3O80A 3WXKA 3D2FA 1HKCA 2NLXA 3F9MA 2OANA 3CETA 2FF3B 2P9NA 4EHUA 1ATNA 1HKBA 1NBWA 3A8YA 4K42A 1GLLO 5EY4A 3ATUA 4PL7A 5BN9A 3GOIA 3WQUA 3O6WA 5JICA 1ATRA 5AQQA 4B1VA 4BGAA 3BF1A 3MN9A 4H0TB 4BGBA 4MO4A 2GEMA 5AR0A 3RSEA 1NGEA 1X3MA 2F9WA 1LCUA 5ADXH 3FZKA 1GLFO 3H3OB 2Q97A 4B1WB 3MN7A 4BRIA 1BDGA 2ASMA 1NGFA 2QWNA 3IFRA 4FSVA 4ISFA 5AQHA 3FZFA 3C0BA 3VENA 1QQMA 2P9PB 3VGMA 4BROA 4FWRA 3FZHA 4BRHA 4CJ7A 4JAXA 4QS8A 4FWKA 1QQOA 1ZBSA 3CQYA 4H0VB 5AQIA 4FWNA 1ZXOA 3R8EA 4BG9A 2VYPA 4BC3A 1LOTB 4FWQA 3GE1A 3ZX2A 5EVZA 3LM9A 4CZHA 4H0XB 3HM8A 2V7ZA 1MA9B 3WUHA 4O5FA 5EX5A 4FOEA 3WEEB 4EAHD 1DEJA 1JCEA 5AQRA 4A2AA 3VEWA 3VOVA 2Q31A 5AQXA 2YHWA 4EIAA 4RTFD 5BR9A 4BVPA 2E2OA 4BC2A 3M1FA 5AQTA 2YJEA 5BPNA 3LL3A 4I6MB 1DGKN 2VWBA 3VPZA 4A61A 2ZF5O 2IVOA 1SQKA 3VESA 3SK3A 3DXMA 3DXKB 2ASOA 4H0PA 4XH5A 3ZEUA 2E2NA 2IVPA 3SLCA 4Y0WA 3AY9A 4L3QA 4MLEA 3UB5A 4M7YA 4BQLA 3VF6A 3SMPA 1IG8A 2QW9A 3CJAA 1T6DA 3BUZB 3CHWA 2QWLA 4GNIA 4QS9A 5AZJB 1GLBG 2P9NB 1MDUB 4HWIA 4PKGA 3FFKB 4PKHA 2A6AA 4B1XB 4CZEA 2NZTA 2H3GX 3ID8A 3D2EB 3VETA 1C0FA 1E4GT 4CZIA 3JXUA 1NM1A 4XH4A 2QWRA 2CH5A 5ADXA 3H46O 2PBDA 3B8AX 1OKJA 1YAGA 3FZLA 1BO5O 4FWSA 3R6MA 4NB4A 1SAZA 4CZFA 3LM2A 5AQMA 4BG8A 5E84A 3RSEB 1BUPA 4BRMA 3C7NA 4RWTA 3QB0A 3LDQA 4GY2B 2NRHA 3QICA 3JS6A 3WXLA 5BRHA 2BUPA 5E26A 4B9QA 1J6ZA 2D0PA 3UKRB 3ZETB 3IMXA 3U8XA 2E2QA 3L0QA 4CD3A 1HPMA 1BA0A 1Z6RA 4BR9A 1R59O 5KQDA 3A5LC 3CJ1A 1HJOA 3GL1A 2P9LB 4FO0A 4BRLA 2P9UA 4HTLA 4CBUA 1KAYA 1RGIA 1IJJA 2WUSA 4H03B 1RDWX 1T44A 4B1ZA 2I7NA 4J8FA 1XC3A 2P9SB 2F9TA 2IIRA 4CZGA 2J4RA 3A5NC 2ASPA 1TYQA 3WQTA 3HTVA 2E8AA 5AQGA 1ATSA 5LY3A 3MN5A 1K8KB 1MWKA 2A40A 2CGKA 3UE5A 1NMDA 2P9IA 1GLEG 3MCPA 2HMPA 1YUWA 2CGLA 3MN6A 4FPAA 4H0OA 1Z05A 3SMSA 1HLUA 4IZ9A 3A0IX 5F2RA 4WQ5A 4H5VA 5JMVA 4JD2A 3L4IA 1NGJA 3M3ZA 2QWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SJHA 3C6TA 2GELA 3G0ZA 1F21A 4HUFA 1NK8A 4FLZA 2ZJQL 1Q18A 2HBMA 5KPZA 3NCIA 1GLJO 4DR2K 2KQ2A 2G8FA 4KPYA 2YHYA 3WNGA 2V52B 1J9AA 4M3XA 3CJ9A 4NXNK 4BEBA 1SKSA 2AP1A 2B5JA 4HHTA 3ZLJA 3CIPA 5JVHL 1IO2A 3LAKA 1HNXK 4FLWA 1X9WA 3CMAN 4DV2K 4C8NA 3L2WA 5LJWA 4OVLA 5BRFA 3NGIA 2IOCA 5C24A 3HP6A 3ISNC 3OY9A 1BHLA 4DKWA 1TK0A 1EQYA 3EE8A 1JJ2M 3KKSA 1X9JA 1NLVA 4Y1CA 5KQ8A 3M6GA 2FBXA 3THWB 4JLHA 4Z0UA 4GKJK 3QBXA 4DHYA 1YJNN 4B9UA 1JL2A 1ZBFA 3FE1A 1MU2A 2P9UB 1N34K 4C8LA 4H5WA 1RT4A 3KLEA 4O0JA 4PA1A 4JYAK 1VSFA 3AGRA 3VTIA 3DYAA 4BDYA 4BDZA 1KD1O 3P1GA 1KFSA 5CE3A 5KPTA 4KB0A 3VQ6A 1RDCA 4LFCK 4RW6A 1VSHA 3O5BA 3VGKA 4BREA 1FJGK 3SNNA 1VQ7N 4M3UA 2A1SA 1C1BA 1N36K 1VRTA 4JI2K 1C1AA 1BISA 3ENHA 4BRDA 3CFPA 2I7PA 5H1SQ 2OZSA 4FWPA 3AVBA 4AHTA 1D9DA 2ITMA 3D0PA 1D4XA 4CJUA 1G15A 4BR5A 3RTVA 2IAJA 3TABA 3O08A 2QWOA 4CD1A 1JLFA 4ILHA 2ZGYA 3I8BA 5AZJA 4MFBA 3OYCA 3H3NO 3CERA 1RT7A 1U49A 2Q0UA 4K25A 4G9ZA 4YOYA 1NWKA 3U4LA 3IRXA 2ZQBA 3LDPA 5HOOA 3N4QA 4JI5K 4CEOA 3G25A 1WB9A 3F5TA 1KAXA 2FXUA 3QO9A 2O8FB 3LP3A 3AVJA 4GMJB 4DV5K 1C0TA 3CF5L 3QDKA 2HBKA 3TAFA 4QCLA 3BZCA 1RBSA 3AVAA 1KQSM 3LDNA 3H1VX 2QM1A 5HRNA 4LF9K 4KFBA 3HZ6A 3ZEUB 1JCFA 1NK7A 3ZETA 1QQNA 3NBPA 1EKEA 4C1NI 3U9ZA 2P5OA 4FJXA 3C65A 4FWMA 1KVBA 4JI1K 1NJIO 4BC4A 1KAZA 4IEIA 2FBYA 1QSLA 1HQUA 1NGHA 4DV3K 4NYFA 3RMCA 2DFFA 3A2FA 1GLAG 1WOQA 5BPMA 2VWJA 4BRCA 3AVKA 3QMLA 1V4TA 3O3HA 2Q0RA 3QBWA 2HSTA 4X64K 4LSNA 5GAEP 3KK3A 1GLDG 3C6HA 3GG4A 4ILJA 1TK8A 4OJRA 4DR3K 5TKYA 1T05A 2P9PA 4DSEA 3HVRA 1SKRA 2E20A 3CCEN 1HMVA 2V51B 3KD1E 3UIQA 5CR4A 4YDUC 4UY8O 3OYKA 1JXBA 2YV0X 3EKSA 1TKDA 3DLLL 3I8DA 3L3UA 4XJXA 2RKIA 4JNEA 3AA3A 4YDUA 1JLQA 4CF8A 4CHPA 2HW3A 1G99A 2ZGZA 1QSYA 4LF8K 1DTQA 3I33A 5KPRA 3QNNA 2PYJA 3C6UA 4DTOA 1BQNA 2GBZA 5AFUH 2E2PA 3HM9A 2UUCK 2A41A 3KZBA 4F4KA 2D5RA 3CYGA 4Z4HA 5AZIB 4E0DA 5J1EA 4LFBK 3O1WA 3J81O 2LSNA 3Q7BA 4YOTA 3O3FA 4B1UB 4RCHA 3WXIA 1HUXA 2ZD1A 4CVNE 1C0GA 4I6MA 3RRHA 4JHDB 3SQ0A 5AJ3K 4FM0A 3NF6A 2O4IA 3AO3A 3SBGA 1JLBA 4C1NK 4CEEA 3WXKA 4DFKA 1HKCA 1NMNA 2FF3B 4EHUA 3SPYA 3A8YA 3S3MA 4CJTA 4A57A 1EWRA 5MLCQ 1GLLO 4JEPA 5EY4A 5J2QA 1VSKA 2RE2A 3EEQA 1NJZA 3MXIA 2DTUA 4KH4A 3K2PA 2YNIA 3S3OA 3VQ4A 2GEMA 4CGIA 4DMNA 1NGEA 1X3MA 5FDLA 2F9WA 5ADXH 4FLUA 1GLFO 2Q97A 4BRIA 4ISFA 1VQKN 2QWNA 3M8QA 4W5TA 4B8AB 4GV9A 2PFUA 1QQMA 1D5AA 2G8KA 2KKZA 3VGMA 4E72A 3FZHA 4CJ7A 4FWKA 1QQOA 4BWMA 2D0BA 5AQIA 4CGDA 4FWNA 3B6OA 1SV5A 4CFBA 1N6QA 4FWQA 3GE1A 4CZHA 4KHWA 1S1WA 4N76A 3PLAA 3HOSA 3NH2A 2XY5A 4J2BA 3AA4A 3ZCMA 2NRRA 4FOEA 1XHXA 4JKCA 1JCEA 3KLGA 4OGEA 4KHNA 5AQRA 1JL1A 3VEWA 4OPJA 2O8FA 3MWPA 4EIAA 4OO1J 1X9SA 2JGUA 4F8RA 3OJSA 3KKRA 2I5JA 1WSIA 1W0HA 1EXQA 3LL3A 2RHKA 3ZT0A 2IVOA 3SAGA 4XH5A 3ZEUA 2E2NA 3SLCA 3K58A 4Y0WA 4L3QA 4M7YA 1T6DA 1RNHA 4FJ5A 2QWLA 3FFKB 4YOWA 4B1XB 1T3VA 2H3GX 3ID8A 2ZJRL 2HVIA 3MCAB 4FZXC 3H46O 4FJMA 3B8AX 2ZM6K 1YAGA 5D3GA 1BO5O 4AHUA 3R6MA 4NB4A 4IFVA 3R3LA 2HHHK 2XO7A 5AQMA 4BG8A 4LF5K 2XY7A 3VQDA 3OYIA 3AV9A 3P39A 1QVGM 5KTQA 3RR8A 4O55A 4AHRA 3AVCA 3QICA 3WXLA 3HRGA 4AH9A 5E26A 2D0PA 3UKRB 1J54A 3OBYA 4IOXA 4DSIA 3KK2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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