2V52B

Structure of mal-rpel2 complexed to g-actin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
373
structure length
360
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Molecular basis for G-actin binding to RPEL motifs from the serum response factor coactivator MAL.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein/contractile protein
total genus 123
structure length 360
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v52B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v52B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v52B03
3JXUA 2HF4A 3B8AX 4CZKA 4B1YB 2E88A 5EXWA 4CJ7A 4PKHA 3SMSA 2Q0RA 5AQXA 5BRFA 1BDGA 2F9TA 2V52B 2OANA 2VYPA 3FFKB 3VEZA 3LM2A 1SQKA 2ITMA 5AQYA 1JCFA 4H5TA 5AFUA 5AQOA 1GLJO 1RDWX 5KPZA 5EOYA 3IMXA 1NBWA 4A2BA 4BG8A 4JNEA 4BC4A 3LL3A 3VESA 4BROA 3CI5A 4QS8A 3F9MA 4CZFA 5TKYA 4RCHA 3TU5A 4DHYA 1GLEG 3D2EB 3RSEB 1BU6O 2P9IA 3D2EA 3HSCA 5FPMA 3QB0A 2IVPA 4PKIA 4M7YA 2P9PA 2Q0UA 3CJAA 4FWMA 2A40A 4E1JA 1U6ZA 4EHUA 3A5LC 4L3QA 3QMLA 3G25A 3CHWA 4M7XA 2E8AA 5BR9A 3EZWA 1TYQB 2E1YA 3H3NO 5AQFA 4FOEA 1ZXOA 3AY9A 3ZETB 4CBUA 4JHDB 4BVOA 1TYQA 1XC3A 3ZETA 1GLAG 5JLHA 4JHDA 4MLHA 4WQ4A 5AQRA 3VF6A 1C0FA 5LJWA 3VGKA 3WQTA 4FWQA 5JICA 3O6WA 4GY2B 1MA9B 4IO8A 3CJ7A 4BRPA 4JAXA 1RFQA 3ATUA 1MWMA 2IVOA 5AZJB 1EQYA 1K8KB 3H46O 4M63C 3M6GA 3FZLA 4GNIA 4BR9A 1Z05A 2CGKA 3OHRA 4IJNA 3GG4A 1BWFO 1K8KA 2D1KA 1HKGA 4JD2B 4EIAA 5AZIB 3W3DA 2CH6A 4JD2A 3FZHA 2A41A 3U4LA 2DPNA 4WQ4C 3WT0A 5AZIA 1KAXA 4FPBA 3QBWA 3KVGA 1NGAA 4EHTA 4BRDA 3M1FA 3UE5A 1WUAA 3VEXA 5AQIA 3H45C 1C0GA 4XEIA 3C7NA 3BEXA 1J6ZA 4CZEA 3VGLA 5AQKA 2E2QA 4B1VA 1HKBA 3VF4A 1BO5O 5F1XA 1S3XA 3BUZB 3LDPA 1HX1A 3O1WA 3M3ZA 5ADXA 3MCPA 3WXLA 2P9SB 4CD1A 2E2NA 5KPRA 5BPNA 3MK6A 2P9SA 3O1BA 2Q1NA 3MN9A 1NGFA 4KBOA 2NLXA 3BP8A 4CI6A 5AR0A 2P9LB 4F9OA 2Q31A 4FSVA 2P9LA 4BRAA 1X9JA 4FL9A 4BRKA 1NGDA 4BR5A 5BRDA 3VERA 4XH1A 3SLCA 1NGBA 3CIPA 2E2OA 3WXKA 1ATNA 3U9ZA 4H0PA 1BG3A 3DWLA 3ZX3A 4BGAA 2P9KB 4BR7A 5AQUA 2A3ZA 4YDUA 1SZ2A 4BRMA 4FWLA 2P9KA 1BA1A 5KPTA 3WQUA 2E1ZA 1YUWA 4CZHA 3QICA 4CD3A 1X3MA 1ZC6A 1HJOA 3A5OC 5FPEA 1LOTB 3QDKA 3W0LA 2QWNA 3D2FB 4BRGA 5I9EB 3CJ1A 2ZF5O 3L4IA 2AP1A 3D2FA 2QWPA 4H0XB 1MWKA 3WUHA 2YI1A 1KAZA 3UB5A 4A2AA 3A0IX 3R9PA 4FWRA 4H5NA 3CETA 3GL1A 4CZJA 1IG8A 5JMVA 3VOVA 3ZEUB 4YDUC 3LDNA 4H0YB 4RTFD 3RSEA 2BTFA 3LDQA 1T6DA 3ULEB 1KAYA 1SAZA 2P9UB 4CZIA 5EVZA 4FWNA 4IXCA 4PL8A 3ULEA 2BUPA 1QZ6A 3AARA 3LDOA 3R6MA 4BRHA 2V7ZA 4QS9A 1T44A 2YHXA 4IJAA 5JLFA 3ZX2A 3I33A 4BQLA 4FWPA 1KXPA 3SMPA 4IZ9A 1NGCA 5E26A 4K25A 3FZKA 3BF3A 2YHYA 4A62A 3H6EA 5LJVA 4C23A 3VENA 1QQOA 3CQYA 4O8KA 3VEYA 4BRIA 4FO0A 1GLDG 2GTDA 4AM7A 1V4TA 3O8MA 2GWKA 3S41A 3SJHA 3P4IA 5BN9A 5AZJA 1DEJA 4LC9B 5FPDA 1BUPA 1E4GT 4BC5A 4CZLA 2FSKA 2QM1A 2YCHA 3FR0A 2A42A 2ZGYA 4FOIA 5ELZA 5AQLA 2HF3A 4B1UB 1Y64A 4B9QA 2Q36A 2FSJA 3DAWA 2QWLA 2YJEA 4MLEA 3LDLA 2V51B 2QWRA 3H1VX 2HMPA 4DB3A 2UYTA 2QWQA 1WOQA 4O5FA 4H0VB 4WYBA 5AQGA 5BPMA 1CZAN 3KZBA 2QWMA 3UKRB 2NRHA 4H5RA 1NLVA 3TPQA 2ASMA 4DQ8A 3U9DA 2EWSA 1HPMA 3FGUA 3UKRA 4B1WB 1X3NA 1LCUA 2QXLA 2ASPA 3ID8A 2PAVA 1ESVA 5EX5A 1TUYA 3A5MC 3MN6A 3FLCO 1ATSA 3WXIA 4BC3A 5BN8A 3IFRA 2A5XA 4NB4A 1GLLO 2CGJA 3QFUA 1D4XA 3WEEB 3FE1A 1JCEA 5AFUH 1NGHA 2GELA 2E2PA 2H3GX 3VEVA 3WEEA 5F0XA 3A8YA 1NWKA 5AQPA 4RWTA 3MDQA 1BA0A 1T6CA 4BREA 4CBWA 2YHWA 4BQZA 3KHYA 3UKUB 3DJCA 3EKUA 3O80A 4ISFA 3CERA 4ISGA 4Y0WA 2I7PA 3UKUA 3L0QA 3BF1A 3CQXA 2FLOA 2GUPA 5AQTA 1S22A 3IUCA 4MO5A 4BC2A 4BR0A 3HM8A 5AQHA 3DXKB 4BR2A 1TUUA 1NGEA 1H1VA 2Q97A 2WUSA 3L6QA 3R8EA 3IDHA 1YAGA 3EL2A 3DXKA 3MN5A 4B1XB 3ZX0A 2ASOA 4BRCA 3ZEUA 4K41A 4XH5A 2ZWHA 3VF2A 2E20A 3EN9A 4CZMA 3JS6A 4QS7A 3VPZA 1R59O 2P9UA 4BRLA 1NGJA 2IIRA 4WQ5A 3AAPA 2FXUA 1V4SA 3A5NC 3FZFA 5AQVA 2P9IB 4CZGA 5LY3A 2D4WA 1Q18A 4Z94A 1HUXA 5AQSA 4NO7A 1BOTO 2P9PB 5F2RA 1HKCA 3VEOA 2GEMA 4H5VA 3ENHA 1GLBG 4MO4A 4HTLA 3I8BA 3MMVA 2FSNA 3GDQA 1Z6RA 4EFHA 4WQ5C 3H1QA 5FPNA 1NGGA 3EO3A 4AM6A 3U8XA 2FF6A 4JN4A 3MN7A 4K43A 2AA4A 1DKGD 3QBXA 2D0PA 4FWSA 2GWJA 3EKSA 3AAQA 4FWOA 1YXQA 2I7NA 1NGIA 3ENOA 2QWOA 3LM9A 1HLUA 2CH5A 5AQMA 1RGIA 2QW9A 4BRQA 2VWBA 3D7EO 1P8ZA 4PKGA 1G99A 5E84A 5ADXH 1U2VB 2CGLA 3HTVA 4BRFA 5KQDA 1DGKN 1U2VA 2IVNA 3GE1A 3VGMA 1GLFO 1QZ5A 4DCHA 3CJCA 3O08A 3ATVA 5AQWA 1JCGA 2W41A 2D0OA 1OKJA 2YJFA 2KHOA 1QHAA 2V7YA 3GOIA 4I6MB 1QQMA 3DXMB 4HWIA 3C0BA 4XH4A 5KQ8A 4H5WA 4I6MA 3GBTA 3DXMA 4H0OA 4CBXA 4A61A 5CE3A 3VEWA 1NMDA 1XQSC 4K42A 4BG9A 2W40A 3CJBA 1ZBSA 3C7NB 3WXJA 4ISEA 5BRHA 5AQNA 3HZ6A 4IWVA 2A6AA 4J8FA 2P9NB 4H0TB 5EY4A 1YVNA 4FWKA 4H03B 4BVPA 3O5BA 2P9NA 1NM1A 1QQNA 2ZGZA 1IJJA 4BR4A 4EAHD 3HBTA 3HI0A 2NZTA 5BREA 4BRNA 1GLCG 4BGBA 1XUPO 3O4WA 1ATRA 2J4RA 5AQQA 3QFPA 2Q2RA 3SK3A 5BPLA 4PL7A 1MDUB 2VCPA 5AQJA 3VETA 4B1ZA 3FZMA 5AQZA 2FF3B 3CJ9A 1E4FT 2F9WA 3H3OB 5B8HA 2PBDA 4FPAA 2HOEA 3J8AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JWKA 4HUEA 2HF4A 3KIOA 4C1NI 2E88A 3LALA 5EXWA 4CJ7A 1WSFA 3BZKA 4I2QA 1WNSA 4DTNA 4DTSA 4MFBA 3BY5A 2Q0RA 4IG3A 4E72A 1BDGA 1BGXT 3KLIA 2OANA 3VEZA 1LV5A 1SQKA 2ITMA 4ELUA 4H5TA 5AQOA 3L2RA 2RHKA 3AV9A 4A2BA 4DKWA 4BROA 3L8BA 2EX3A 4YOXA 5TKYA 1VQPN 4RCHA 3WNFA 5M1OA 4AHCA 3AVMA 3HYFA 5E41A 3TI0A 1WSEA 3SPZA 3CJAA 5SWMA 4E19A 3IRXA 4C8MA 3CCRN 4L3QA 4YNQA 4CGDA 2ZD1A 1IBMK 4CJKA 3SV3A 4CFBA 5BR9A 2NRVA 3H3NO 2B6AA 4CBUA 4YOWA 1T03A 4JHDB 2RN2A 1HR0K 4CEZA 3VQ5A 4M3RA 3K2PA 3P31A 5AQRA 4F8RA 3P83D 4FWQA 2C1GA 5JICA 2XY5A 1NG9A 1WAJA 3PX6A 4R5PA 4NLBA 3LWLA 4I2PA 1RFQA 4MDBA 1MWMA 2IVOA 5GINA 1EQYA 3LWMA 3RWUA 4E7IA 1Z05A 5JVGL 2VGMA 3KKRA 4YHHK 2G8HA 3GG4A 1K8KA 4JD2B 5KRTA 1YJ9N 3KLHA 2ZJRL 3FZHA 2HB5A 2DPNA 2O8CB 4AILC 3R1XA 3QEWA 3HVTA 3O9TA 1M90O 1VQ8N 4H4MA 1KTQA 2NNWA 2OZSA 1C0GA 3DLEA 3CF5L 4B3OA 3BEXA 1J6ZA 1NK8A 4CZEA 3VGLA 2E2QA 5KTQA 4FM0A 4X62K 3BUZB 4Z4FA 1HX1A 1JKHA 1LW0A 4HUFA 3UIQA 3OYFA 1KRPA 2ZQBA 4DV2K 5BPNA 4FJIA 4DWIA 4F3OA 2ZJQL 2Q3SA 4XJXA 1XHXA 4CI6A 2KKZA 3VQCA 3DMJA 1JXEA 2NUBA 3AO5A 4GW6A 1QHTA 5DK5A 5C10A 4LFAK 3EYZA 3SLCA 4CJTA 4AHVA 4BDZA 3DLHA 4YDUA 4JS5A 2X74A 4BRMA 2P9KA 1BA1A 5HRNA 5KPTA 5DM7L 2QEXN 3QICA 1Q9XA 3NGIA 1HJOA 5FPEA 1LOTB 3W0LA 1G15A 3H08A 5CYQA 3NGZA 3HP6A 4C8LA 4DV6K 4M3WA 4AH9A 3C6UA 5I9EB 3L4IA 5LMNK 4DFMA 5CZ2A 4IO9L 1CLQA 4A2AA 1X1PA 3HO1A 4IG0A 4DR4K 5JMVA 1IG8A 1C1CA 3U6FA 2IGIA 4IEIA 3ZEUB 3N4QA 1YIJN 5JS1A 3NF9A 2IC3A 3EE8A 2BUPA 1RDDA 2ITGA 3QERA 3B6PA 4ELTA 1QVFM 4AHRA 1A5XA 5JLFA 4FLVA 3LP2A 3ZX2A 2Y1IA 4DS4A 4FWPA 1KXPA 3HM9A 1YITN 2DY4A 4CFCA 5E26A 1HMVA 1I39A 1KLMA 3DOLA 4B9NA 3LP0A 3BF3A 2WONA 2F8TA 4DR6K 4A62A 3Q7CA 4F3TA 1C6VA 2G8VA 4WFBL 3VENA 4FVUA 4BACA 2G8KA 1GLDG 3I8DA 2GWKA 3VTIA 4LH5A 2E6LA 2IS3A 1I94K 3P4IA 1DEJA 3VMFB 2PYJA 4OPJA 4BC5A 3VQBA 1XI1A 3FR0A 1U4BA 4N56A 4FOIA 1NK0A 4LFCK 1Y64A 5LL6Z 4B9QA 4FK2A 2O8CA 4U67L 1VK0A 4JI0K 1A5VA 3ZT2A 1U04A 1S1VA 3SYZA 2V51B 4A59A 2HMPA 2QWQA 3CYMA 3P1GA 3J7YP 5AQGA 3ZCMA 3QEVA 4OLBA 2RKIA 3G10A 4H5RA 2GX9A 2ASMA 4DQ8A 4CE9A 1HPMA 3FGUA 3CFOA 3UKRA 3THXB 1X3NA 1LCUA 2QXLA 4OKEA 1S6PA 4CHQA 3CXCM 2PAVA 5EX5A 4CGGA 4ELVA 2KLAA 3IFRA 2R7YA 4NB4A 3VQ6A 3KKSA 2CGJA 4YOVA 3WEEB 1JCEA 1WBBA 5H1SQ 3I0RA 4WCEL 3OYIA 1N32K 2GELA 3AO4A 3VEVA 2DFHA 4CEQA 1BA0A 1T6CA 4CBWA 3TARA 4BQZA 3JAMO 1HPZA 3CERA 3KLEA 4HTUA 5AJ3K 1YTUA 3AVGA 1S22A 5TKWA 3IUCA 3CCQN 4JI2K 4DTPA 4DU1A 4BR0A 3HM8A 3HRGA 2WFBA 1TUUA 1NGEA 2WUSA 3IDHA 4B1XB 2W42A 4C8OA 4A57A 4DR7K 1RDAA 4WE1A 4BRCA 3ZEUA 2GV9A 3EN9A 4CZMA 5HL7L 4JK8A 3IAYA 2IIRA 3AVNA 4EP4A 3AO1A 1KLNA 1N34K 4OJRA 5LY3A 3NVKA 4W5TA 4JKGA 4HUGA 4YY3K 2DTUA 2HBJA 1DTTA 2P9PB 3ZSXA 3SUOA 4OX9K 2I5JA 3VA3A 2G8IA 1QQCA 1GLBG 1D9DA 4HTLA 5J2QA 1Z26A 2P51A 3L2UA 2HBMA 4EFHA 5FPNA 1NGGA 1J5OA 4AM6A 3U8XA 4YOTA 1ASWA 4DFKA 3MN7A 4LF4K 1GOCA 3QBXA 2D0PA 4FWSA 4BE1A 3ENOA 3TSPA 4OPHA 1RGIA 3SNNA 2VWBA 3D7EO 4DTMA 2CGLA 4CFDA 1F21A 4BRFA 2IDOA 4DR1K 3VQAA 3S9HA 3VGMA 4CCHA 2HHWA 3CJCA 2HBKA 4DV4K 3OYGA 2YJFA 1X9WA 4FZZA 2KHOA 4I9LA 2FBXA 3QIPA 4HWIA 3WXMB 3MXIA 4FJ7A 4LSNA 1R0AA 4KHQA 3S3OA 3TWHA 1IKYA 3OJSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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