1D4XA

Crystal structure of caenorhabditis elegans mg-atp actin complexed with human gelsolin segment 1 at 1.75 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
368
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGVVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITVGNERFRCPEAMFQPSFLGMESAGIHETSYNSIMKCDIDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords C. ELEGANS ACTIN 1/3
publication title The structure of nonvertebrate actin: implications for the ATP hydrolytic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Caenorhabditis elegans
total genus 116
structure length 368
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1d4xA03
2GWKA 3ID8A 4JAXA 3CJ9A 3H46O 1GLCG 1T44A 3FGUA 3DXKB 1Q18A 3GBTA 1U2VA 4PKGA 4H0XB 3HZ6A 5AQLA 5AQSA 2Q2RA 3RSEB 2P9LB 1ATSA 5AR0A 3ULEA 3UE5A 3QFUA 1GLAG 1ZC6A 3FE1A 1HPMA 4K43A 5KQ8A 5AQNA 2ASOA 2FSNA 4BRCA 4YDUC 4MO4A 4BRKA 4BC4A 1X3NA 4CJ7A 4BR9A 4M63C 5E84A 3WQTA 3EZWA 2DPNA 3O1WA 4NB4A 1HLUA 1HKCA 3LDQA 3IUCA 2YHYA 5FPNA 1T6CA 4RTFD 4IZ9A 4JD2B 4FWNA 4QS7A 3DWLA 3IFRA 4BRNA 4CZEA 5JLFA 3CQYA 2ASMA 4WQ4C 1HKGA 1GLBG 3VEOA 5ELZA 3ZEUB 3I33A 1BU6O 2A6AA 2YCHA 5AQKA 4K42A 2P9NB 3ENHA 1BWFO 1R59O 3MK6A 4EHTA 2PBDA 2YHXA 4JHDB 3HI0A 2IVOA 2NLXA 3FZKA 4BRMA 5EY4A 2FF6A 1Y64A 4B1XB 2Q0RA 3A0IX 3O80A 2GUPA 5KPZA 2Q1NA 2QXLA 4A62A 1MA9B 1NLVA 3DXMB 1XQSC 1RFQA 3CHWA 3MCPA 5AZIA 2P9SB 4GY2B 5KPRA 4FWOA 4KBOA 5AZJA 2E1ZA 3QFPA 3MN6A 1MWKA 3LM2A 1U6ZA 2ZGYA 1CZAN 1RDWX 1C0FA 2GTDA 4FSVA 4MLEA 4GNIA 3SMPA 4AM7A 2FSJA 2E2PA 3H1VX 3MN5A 1NBWA 2YHWA 4H0VB 3WQUA 2HF3A 2HOEA 5F0XA 3EL2A 4BC3A 3F9MA 3EN9A 4FOEA 3AARA 4MO5A 4BROA 3CIPA 1K8KB 3SJHA 1GLJO 2A40A 3FR0A 2CGKA 3A5LC 5BPNA 2QWQA 1BOTO 3QBXA 4M7XA 1ATRA 4FWMA 3BF3A 3VEYA 3H1QA 3LM9A 2QWNA 4Y0WA 1MWMA 2AP1A 3LDOA 3VERA 2UYTA 2VCPA 4EFHA 3WEEA 3O6WA 3UKRA 1RGIA 4FWKA 2E8AA 2KHOA 1TUUA 4H0YB 2QM1A 1BG3A 3O5BA 4MLHA 3MDQA 3VOVA 1BDGA 4IJNA 1QZ6A 3A8YA 4BRPA 1DKGD 4FWLA 4FO0A 4I6MA 1HX1A 4WQ5C 5EXWA 3WXIA 2CGJA 5KPTA 2BUPA 1NGDA 2CH6A 2V7YA 3M3ZA 1KXPA 3D2FA 1BA1A 3VETA 2P9PB 4JNEA 5AFUA 4FPAA 2A5XA 3SK3A 4PL8A 3R9PA 4CZHA 1ESVA 1X3MA 3D2EB 3CQXA 4BRIA 5AQPA 3AY9A 5FPEA 1Z05A 4CBUA 3WXKA 1TYQB 3ZETB 4CD1A 4DCHA 2WUSA 3QBWA 3LDNA 3ZX0A 4BG9A 4IO8A 5ADXA 3TU5A 2EWSA 1NMDA 2AA4A 1TUYA 2YI1A 3B8AX 2F9WA 1XUPO 3AAPA 5BRFA 2QWRA 3AAQA 3OHRA 3LL3A 4H5WA 4H5NA 4PKHA 2CGLA 1IJJA 3VF6A 1NGAA 3GDQA 3UKUA 1SZ2A 4PKIA 3EO3A 3D7EO 4XH1A 4J8FA 2QWPA 5AQUA 4CZGA 1XC3A 3VEWA 1LCUA 3U9ZA 2OANA 4ISGA 3CJ7A 1KAYA 1YUWA 2P9KB 2Q0UA 4XH5A 5FPMA 3U8XA 2P9IB 4K25A 5B8HA 5AQZA 3A5NC 1MDUB 4BQZA 2FF3B 2D4WA 2BTFA 1C0GA 4DQ8A 2CH5A 3O1BA 3I8BA 5AQHA 4BGAA 3CETA 2W40A 4YDUA 3TPQA 2P9UA 2QWMA 5I9EB 1U2VB 4DB3A 2VWBA 3JS6A 3CI5A 3H6EA 4CI6A 4DHYA 1D4XA 3ULEB 1NGJA 4CZLA 5FPDA 2Q31A 2V51B 3C7NA 4JHDA 2E1YA 2V7ZA 3VENA 1JCFA 3FZLA 4FWRA 4FWQA 5EVZA 5ADXH 2GWJA 3DXKA 5AQQA 1HJOA 4WYBA 2VYPA 4H5VA 3RSEA 4BC5A 4BVPA 2P9LA 2PAVA 3QDKA 1NGEA 3IDHA 2HF4A 4WQ4A 2ASPA 5KQDA 5BN8A 3S41A 3O08A 5EX5A 3FFKB 4B1UB 1YAGA 3HSCA 3A5MC 4BRHA 2IVNA 1GLFO 4O5FA 4K41A 2ZGZA 4BR4A 1BUPA 3GL1A 3SLCA 1KAZA 4BRLA 4EHUA 5F2RA 3L6QA 2A41A 3VGKA 4B1WB 3VEXA 2Q97A 3VGMA 3VEZA 1E4GT 1V4TA 2E2QA 1SQKA 4BREA 3BEXA 1X9JA 3C7NB 4JD2A 1H1VA 1EQYA 5JLHA 4HWIA 3WXJA 3CERA 2IIRA 3DJCA 5LJVA 4PL7A 2QWOA 4BRAA 2FLOA 4FPBA 4QS9A 1JCGA 1GLDG 3ATVA 3HBTA 4H5RA 2I7NA 5LJWA 4XH4A 5E26A 3ZEUA 4RCHA 5JICA 4CZKA 4CZMA 5AQXA 3G25A 4H5TA 4EAHD 2ZF5O 2GELA 3H3NO 4A61A 5AZIB 1Z6RA 2E2NA 2F9TA 3MN7A 4B1YB 2NZTA 3HM8A 2YJEA 4HTLA 3BF1A 2FXUA 1NGIA 5AZJB 3GE1A 4BGBA 4FOIA 5BREA 3ZX3A 1J6ZA 2D1KA 3DXMA 3LDPA 1GLEG 4LC9B 2H3GX 4BR0A 4XEIA 2P9SA 3KZBA 4E1JA 1S22A 2HMPA 3DAWA 5CE3A 5AQVA 3CJ1A 3H3OB 3QICA 1NGCA 1S3XA 4Z94A 1P8ZA 4AM6A 4IXCA 4C23A 2D0PA 4BR2A 3IMXA 4H0TB 5BR9A 5BPLA 1E4FT 3CJCA 3MMVA 3FZFA 3UB5A 3JXUA 3WT0A 1ATNA 4NO7A 1JCEA 2I7PA 4BVOA 2W41A 4M7YA 1ZXOA 4BRQA 3ENOA 1QQOA 3GOIA 1YVNA 3A5OC 3VPZA 2QWLA 3O4WA 2A42A 4WQ5A 3VEVA 1K8KA 4FL9A 3QMLA 3WEEB 3UKRB 2GEMA 3KHYA 5AFUH 4CBXA 3L4IA 5AQJA 1G99A 1NWKA 1QHAA 2J4RA 1HKBA 1NGGA 3HTVA 3R6MA 5AQRA 3MN9A 4FWPA 3VF4A 3CJAA 3BUZB 2ZWHA 5AQFA 3ATUA 3W0LA 5F1XA 1IG8A 4H03B 2A3ZA 4RWTA 4I6MB 4CZFA 1GLLO 1DEJA 3GG4A 3D2FB 2E2OA 4L3QA 2Q36A 2FSKA 4BC2A 4H0OA 3U4LA 3M6GA 3FZMA 2D0OA 3WXLA 1ZBSA 4ISEA 5BRHA 4CD3A 4BR5A 1HUXA 3VGLA 5TKYA 3O8MA 3VESA 4A2BA 1NM1A 2IVPA 1V4SA 3W3DA 2P9PA 4B1ZA 4BR7A 1OKJA 1QQMA 1KAXA 3ZX2A 1DGKN 3D2EA 3BP8A 3P4IA 2QW9A 5AQTA 5AQWA 3CJBA 3U9DA 1TYQA 1QZ5A 2ITMA 3EKSA 3ZETA 3KVGA 5EOYA 1WOQA 4CZJA 3J8AA 5BPMA 1YXQA 4A2AA 3UKUB 3FZHA 5AQYA 1NGHA 3H45C 3M1FA 2NRHA 1NGFA 5BRDA 4BG8A 4CBWA 3SMSA 5AQMA 4JN4A 4FWSA 3LDLA 4B9QA 1BO5O 4IJAA 2P9NA 4IWVA 4CZIA 4F9OA 5AQIA 2YJFA 1T6DA 4H0PA 4BQLA 3FLCO 1BA0A 2E88A 4O8KA 5AQOA 1NGBA 4BRFA 4ISFA 2E20A 4BRGA 4EIAA 4BRDA 2P9UB 4QS8A 1QQNA 2P9KA 3L0QA 3R8EA 5LY3A 2P9IA 2V52B 5BN9A 3WUHA 3QB0A 3C0BA 1LOTB 1WUAA 3EKUA 1SAZA 3VF2A 5JMVA 5AQGA 4B1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I56N 3CJ9A 2PYLA 3C94A 4ELTA 3PX6A 3DXKB 3UIQA 1Q18A 2IOCA 1LWFA 3GBTA 4NXMK 2PYJA 5DM6L 5AR0A 4LF4K 1LWEA 1ZC6A 1ZBHA 3ISNC 3SUQA 1BCMA 4K43A 4BDPA 1X1PA 1QS4A 2ASOA 1LAVA 3L2VA 5A2QO 3CD6N 3NF9A 3VTHA 4BC4A 3L2UA 4BR9A 1HR0K 3NH2A 2P51A 1X9MA 1RDDA 4NB4A 3LDQA 4CIFA 4RTFD 4FLWA 1NK8A 3MAQA 4E7HA 3KK1A 4JD2B 3DWLA 3IFRA 1VSEA 3OS0A 3G10A 4KHYA 1N6QA 3OYMA 4CEZA 1ASUA 3VEOA 3SUPA 4ILJA 1C1CA 2A6AA 2YCHA 4K42A 4CIGA 1VRTA 1BWFO 3CCRN 1R59O 2IC3A 3A2FA 3OYIA 2PBDA 1S1TA 3FZKA 2D5RA 4H4OA 2FF6A 4FJNA 1Y64A 2OZSA 1WB9A 2Q0RA 3SI6A 3L3VA 3ZYYX 1HNXK 1W97L 2OA8A 2C1IA 2YKNA 2Q1NA 4FCYA 4C8NA 2XY8A 3PX0A 1WLJA 3DXMB 4B08A 3CHWA 3MCPA 3AO2A 1WNSA 2W42A 1F21A 4YHHK 4CJUA 1ZYQA 4CK2A 1M1KO 5AZJA 4F8RA 1NG9A 2O8FA 3LM2A 2ZGYA 5KGWA 1HQUA 4DV6K 2GTDA 3AVCA 1G15A 4KHQA 2JWLA 4JEPA 2E2PA 4CHYA 3NGIA 3K0SA 3TSPA 4H0VB 4N56A 2HOEA 1S6QA 2VG6A 1HNVA 3DM2A 1QSSA 3HT3A 4FXDA 1TL1A 4HUEA 3H08A 2O8EB 3NF6A 5SWMA 1RT5A 1C1BA 3FR0A 4V19S 1RT4A 5BPNA 1HYVA 1TK5A 1VQ7N 3AA3A 4CJKA 1TKXA 2NUBA 3KK7A 3DMJA 3M8SA 3K9JA 1VHXA 3VEYA 4A5BA 2UYTA 4DQPA 2HB5A 3WEEA 3K57A 1RGIA 3AVLA 4DSIA 1RILA 1BG3A 3DRPA 4ELUA 3RVCA 3VN5A 1BDGA 3L2WA 3A8YA 4BRPA 4W5RA 3M8QA 4ELVA 3B6PA 4FWLA 1HX1A 5KPTA 4HCBA 2E4LA 3V4IA 4FLTA 2P9PB 5AFUA 3OBYA 5MLCQ 2W6LA 4CGJA 1RBRA 2OPPA 4CZHA 2HVIA 1ZBLA 3C65A 1ESVA 4LF8K 2PFUA 3CQXA 2NRZA 4I9LA 5AQPA 5FPEA 3ZETB 3ZT2A 3I0RA 4WE1A 4CEDA 3HYFA 4E72A 3ZX0A 3RMAA 4IO8A 3VQ6A 1EXQA 1NMDA 2AA4A 1TUYA 4E1NA 1RTJA 3OA9A 4H5WA 3GDQA 3T1HK 3SQ4A 3AVFA 4CF2A 4PKIA 5CHIA 3QEPA 1VQON 4XH1A 2C1GA 2QWPA 3TANA 1VSLA 1XC3A 3K58A 2BE2A 3U9ZA 3LWMA 3O9TA 1YUWA 4K25A 3CYGA 1YITN 4DSJA 4BQZA 4JK7A 2WFBA 1RTDA 4I9QA 3I8BA 5AQHA 4BGAA 2O8DA 2VQEK 5I9EB 1OH8A 2QTDA 4CI6A 1KLNA 1D4XA 1LV5A 3ULEB 2ZJPL 4CZLA 5FPDA 4PWDA 2Q31A 2ZQBA 2F8TA 1WSGA 2V7ZA 4ZTJA 1JCFA 2GWJA 4NCGA 3KLEA 1C0MA 1VSIA 2VYPA 4H5VA 4BVPA 4BC5A 2X78A 5M1KA 4M45A 3LAMA 4CCHA 4ICLA 3I0SA 3IDHA 4WQ4A 4U7BA 4OGCA 3C6TA 3S41A 2G8VA 3FFKB 4AHUA 1YAGA 4LF5K 3HSCA 3V1RA 2IVNA 4O5FA 4K41A 1W2BM 4F2RA 5IWAK 1IV0A 4IG3A 3THVA 1UAXA 4ILHA 1RT6A 3V81A 4CF1A 1E4GT 1TK8A 1VQMN 2E2QA 1YJWN 4FJHA 3D45A 1H1VA 1EQYA 5GINA 3EYZA 1SL0A 2AJQA 3DJCA 4PL7A 1KVBA 4FPBA 3P1GA 5LJWA 2I7NA 3S5TA 3NF8A 1YJNN 4YFUA 3DI6A 4Z0UA 3RMCA 4CHZA 3H3NO 2F9TA 2NZTA 4XIUA 1YHQN 1YJ9N 1NKEA 2GV9A 3LP3A 1WAJA 3LP1A 1K6YA 4FOIA 5CZ1A 1J6ZA 2KLAA 4CE9A 5C0YA 3K59A 3MXJA 3PV8A 3LDPA 2P9SA 3SPYA 2HHVA 1B92A 3V9XA 1I3AA 5DM7L 1JLCA 1KCFA 3CM6A 3QICA 1NGCA 3CCQN 1S3XA 4Z94A 1P8ZA 1VQKN 4GKJK 4AM6A 4IXCA 4DLEA 4O44A 3VQ9A 5LMUK 4AILC 3MCAB 4FJKA 2KFNA 1UOCA 5BPLA 1U4BA 3MMVA 4KB0A 3UB5A 3JXUA 3THYA 1ATNA 4EP4A 3R3LA 1IBMK 1VQPN 4JRPA 5J2NA 3S3NA 2Z1JA 4OLAA 1JLBA 2FBXA 1QQOA 1YI2N 3GOIA 3VPZA 1ITGA 3AVNA 4N41A 4WQ5A 4O5BA 4FL9A 2GEMA 5C12A 4CJ5A 5I42A 1G99A 4JRQA 3SNNA 1QHAA 3PIPL 1JXBA 1NGGA 3R6MA 2DY4A 4NLBA 3VF4A 3BUZB 3P83D 1BI4B 3CCSN 1IG8A 4I6MB 1S1XA 4JKDA 2D0BA 4DR3K 2E2OA 2FSKA 1VQ4N 4KHSA 3O3FA 4BECA 3M6GA 4O0IA 3SQ2A 1ASVA 1HUXA 4C8OA 1FXXA 3O8MA 1W9HA 3HP9A 4HUGA 1NM1A 3W3DA 4FLXA 4M3YA 1OKJA 2HBLA 3RWUA 4NCBA 3SAGA 4M3UA 3KIOA 3P4IA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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