1D4XA

Crystal structure of caenorhabditis elegans mg-atp actin complexed with human gelsolin segment 1 at 1.75 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
368
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGVVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITVGNERFRCPEAMFQPSFLGMESAGIHETSYNSIMKCDIDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of nonvertebrate actin: implications for the ATP hydrolytic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Caenorhabditis elegans
molecule tags Contractile protein
molecule keywords C. ELEGANS ACTIN 1/3
total genus 116
structure length 368
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1d4xA03
4RWTA 5LJVA 5FPEA 3WQTA 3GDQA 3WXJA 5KQDA 4JNEA 4BRCA 4Y0WA 1NGBA 4XH1A 4B1WB 2CGLA 4A61A 4CZFA 2A42A 3VEYA 5LJWA 3EZWA 3MN5A 4CZGA 4BC2A 4WQ4C 3C7NB 2YJEA 4JD2B 2EWSA 3VGKA 5I9EB 2FSJA 4FPBA 4BR0A 1JCFA 3LDOA 5AQVA 5AR0A 2ZWHA 4JHDA 5AZJB 2P9SA 2VWBA 5BPLA 3BF3A 5AFUA 1T6DA 2CH5A 3A5MC 3IUCA 4O5FA 1BUPA 3HM8A 3LDQA 3O8MA 2F9TA 2IVNA 3WQUA 4EHTA 2W41A 2FF3B 4H0YB 3ZX2A 3JS6A 4FWMA 3VOVA 2P9LB 3CJCA 1IJJA 1GLAG 3FGUA 3GG4A 1JCGA 3UKRB 1QZ5A 4JD2A 4YDUA 1RFQA 1ZBSA 2V7ZA 3IFRA 2ASPA 5AQGA 4CZKA 3VF2A 5CE3A 2W40A 4DCHA 5FPNA 2YHWA 3CQXA 4BRHA 3FLCO 5F1XA 5TKYA 4FWNA 1SQKA 3VF6A 3MN9A 5KPTA 1G99A 1BG3A 2P9LA 3W3DA 2BTFA 4PL8A 2GWKA 3FFKB 4ISFA 2P9IB 3EKUA 5AQIA 4FWLA 4RTFD 1S22A 1J6ZA 4I6MA 4A2BA 3HZ6A 4K43A 2DPNA 2HF4A 5EOYA 3D7EO 3MMVA 3O6WA 1WOQA 4MO5A 2YJFA 2QWLA 2P9PB 4F9OA 2V52B 5AQKA 2J4RA 4RCHA 3DXKA 2A3ZA 4MLHA 1KAXA 3H1QA 3A5NC 3QFPA 3VETA 3D2FA 5BRFA 3QBWA 3U9ZA 3FZMA 4JAXA 1K8KB 3SK3A 3EKSA 4EHUA 3MN7A 4BR2A 1IG8A 4BR7A 1HJOA 2HF3A 5E84A 4CD3A 4FPAA 1QQOA 4EFHA 3UKUB 3SLCA 1BO5O 1T44A 2E20A 2QWQA 4QS7A 3O5BA 3QMLA 2ZGZA 3L4IA 2AA4A 1ZXOA 2V7YA 3ENHA 1SZ2A 1HPMA 4BG8A 1HUXA 2YHXA 4M63C 4IZ9A 4WYBA 4BGBA 4FOIA 3CI5A 3EL2A 3SMPA 3BUZB 3VF4A 5AZJA 2P9SB 4EAHD 4AM6A 4EIAA 4H5WA 4K42A 3LL3A 1E4FT 2A41A 2QWPA 4CBUA 1QHAA 5JICA 1X3NA 1X9JA 3QDKA 2GWJA 4H5NA 4B1ZA 1BOTO 3D2EB 3WEEB 2QWOA 1ATNA 4AM7A 1RGIA 1R59O 5ADXA 4BG9A 3BP8A 5BN9A 3GL1A 4BRPA 5FPMA 3FZFA 4FWRA 5AQTA 1BA1A 3TU5A 5AQUA 3CJ1A 2P9UA 4GY2B 1TYQA 3EO3A 4BRAA 4BRMA 5FPDA 2NLXA 2YI1A 1Z6RA 3O1WA 5AQFA 3CJAA 5AQPA 4BRLA 5E26A 3FZLA 1NGAA 1QZ6A 1SAZA 4FWOA 2NZTA 3QBXA 1ESVA 1GLLO 1QQMA 1YXQA 2QW9A 1BDGA 3KVGA 1NWKA 3CJ9A 3WT0A 1EQYA 4KBOA 4HTLA 3VGLA 2VCPA 5AQZA 4H0TB 2P9IA 4IXCA 4CZEA 1ATSA 3HI0A 1LCUA 3UKRA 1TUUA 4PL7A 4FO0A 1GLDG 1NGJA 4CZMA 3HBTA 2IVPA 2P9PA 1NGDA 2ZF5O 3DJCA 3WXLA 3AAPA 2H3GX 5ELZA 4ISEA 3U9DA 3DAWA 2I7PA 1TUYA 3WEEA 1MDUB 2PAVA 4H0PA 5AQNA 3ZX3A 3DXKB 4BC3A 1D4XA 2AP1A 5BN8A 4ISGA 3VEWA 1KXPA 4M7YA 3D2FB 1BU6O 3H45C 1NLVA 1Z05A 4BR4A 2ASOA 2IVOA 4BROA 4B1UB 2YCHA 3WUHA 4B9QA 3CQYA 1NM1A 1E4GT 1XQSC 2ITMA 3VERA 3VESA 4I6MB 4B1XB 3GE1A 5AQJA 3LDLA 2WUSA 1ATRA 4IJNA 1HKBA 2FXUA 4FWKA 4Z94A 1C0FA 4XH4A 1H1VA 3F9MA 1NBWA 2D0PA 4MO4A 4O8KA 3QICA 2QXLA 2PBDA 3A0IX 2P9NB 3ULEA 3VEZA 1GLCG 3S41A 4BQZA 2Q31A 5AQSA 1NGCA 3FE1A 4PKHA 5BREA 4FSVA 4GNIA 3U4LA 1NGEA 1S3XA 2D4WA 5ADXH 3AY9A 2Q1NA 2IIRA 3VEOA 3MK6A 3ZX0A 3KHYA 3GBTA 4C23A 1Y64A 4CBWA 5BPNA 1NGHA 3JXUA 3H3OB 3M3ZA 2P9KA 3QFUA 3M6GA 1HKCA 1MWMA 2E1YA 3LDNA 4NB4A 4HWIA 1RDWX 4PKGA 2HMPA 3VEXA 4FWQA 3ZETA 3CJBA 1WUAA 1V4SA 2UYTA 3DXMB 4E1JA 2ZGYA 5F0XA 2GELA 2E2PA 1U2VB 3FZHA 3H3NO 3C0BA 4IJAA 3TPQA 1YUWA 3CETA 4BREA 4DHYA 2Q0UA 3R9PA 4BC4A 3AAQA 3IDHA 2P9NA 4H03B 3VENA 4JN4A 3ZETB 3M1FA 4BRKA 3I33A 5AQRA 3WXIA 1U2VA 3MCPA 3SJHA 3VPZA 5BR9A 4H0VB 4BVOA 4IWVA 1MA9B 2F9WA 3L0QA 2FLOA 3O1BA 3QB0A 5LY3A 3L6QA 2VYPA 2QM1A 5EVZA 3OHRA 5EXWA 4J8FA 1C0GA 1X3MA 5AQQA 2E88A 4BRGA 3J8AA 5AQYA 1YAGA 1TYQB 1DKGD 3LM2A 1MWKA 1NGFA 1P8ZA 3CERA 2A6AA 2NRHA 3H46O 4MLEA 5KQ8A 3RSEA 4DQ8A 4LC9B 4FOEA 1U6ZA 4H0XB 2ASMA 4H0OA 3FZKA 5AZIA 3ZEUB 5EY4A 3KZBA 1XC3A 1KAZA 2CGKA 4WQ5A 3A5OC 3HSCA 2Q0RA 3A5LC 5AQMA 5AQLA 1BWFO 2CH6A 3ULEB 3CIPA 4A62A 4BR9A 5BRDA 3EN9A 4H5RA 5JLHA 2QWMA 1V4TA 4FL9A 3C7NA 3LDPA 3DWLA 3CHWA 4NO7A 3RSEB 2QWNA 5KPRA 3B8AX 1GLFO 3LM9A 5AZIB 3BF1A 4WQ4A 3UKUA 1YVNA 1HKGA 3VEVA 4CZLA 4CI6A 5AQHA 3O08A 4FWSA 1NGGA 3UB5A 1BA0A 2E8AA 5AFUH 3UE5A 5BRHA 3U8XA 3ID8A 4WQ5C 2BUPA 4BRFA 1JCEA 2CGJA 2E1ZA 1DEJA 3IMXA 3AARA 3MDQA 5JMVA 1ZC6A 1K8KA 2V51B 1LOTB 2OANA 3CJ7A 2FSNA 3O80A 3O4WA 4BC5A 1NGIA 4YDUC 1XUPO 3ENOA 4H5VA 3H1VX 4H5TA 5BPMA 4XH5A 1HX1A 4BRQA 2I7NA 1QQNA 3G25A 2E2OA 4FWPA 4BRNA 5B8HA 3HTVA 4B1YB 1OKJA 3ATVA 2Q97A 2D1KA 4CZHA 1CZAN 4B1VA 1T6CA 2HOEA 1Q18A 2E2QA 4BRIA 4QS9A 4CBXA 3VGMA 5EX5A 4M7XA 1DGKN 3H6EA 3R8EA 2Q36A 2P9KB 3A8YA 2GTDA 4CJ7A 4CZJA 2A40A 4L3QA 3WXKA 5AQWA 3SMSA 3GOIA 1KAYA 2Q2RA 3P4IA 4CD1A 1GLBG 1GLEG 4A2AA 4K41A 3DXMA 3MN6A 2QWRA 5F2RA 3R6MA 5AQXA 5JLFA 2FF6A 4K25A 3I8BA 2GEMA 2A5XA 1HLUA 3BEXA 5AQOA 3W0LA 4XEIA 2P9UB 2YHYA 3ATUA 3FR0A 4QS8A 4DB3A 2D0OA 4BR5A 1NMDA 1GLJO 2FSKA 4BQLA 4BVPA 4JHDB 4CZIA 4IO8A 2E2NA 3D2EA 4BRDA 2KHOA 2GUPA 3ZEUA 4BGAA 5KPZA 4PKIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IAYA 4PY5A 4NCGA 3HPHA 1DLOA 4H4OA 4BRCA 3TAFA 2HHSA 3CCQN 4CZFA 2A42A 1JXEA 2D5RA 3MN5A 4BC2A 4GVMA 4IOAL 2EWSA 5I9EB 1TL3A 3PIPL 4PWDA 1KCFA 1R0AA 1WLJA 3T1HK 5JS1A 4IDHA 5HRPA 1SKWA 3J81O 4DF4A 1UWBA 4FJKA 2IVNA 1EWRA 3KWIA 2W41A 3IS9A 2XO7A 4Z4IA 2FF3B 1KFSA 2RN2A 5A2QO 3WXMB 1GLAG 4EP4A 3GG4A 3DMJA 3UKRB 4CJEA 1WBBA 4JD2A 2O8EA 1O1WA 4FVMA 3KLIA 3K58A 5JVGL 1C1AA 3LP2A 1VQKN 3AVBA 3VF2A 1D8YA 1RBUA 2YHWA 3CQXA 3M8PA 4DSFA 1SQKA 3VF6A 3MN9A 4B8CA 5GADP 1RBSA 3MX5A 3W3DA 4DSEA 4PL8A 4CJFA 2HW3A 3EKUA 1S9GA 3QNNA 4MDAA 1WSEA 3LALA 1KQSM 2DPNA 2HF4A 3V1OA 4DR1K 5C24A 3RVCA 3O6WA 1RDBA 1RT5A 4JS5A 3MWTA 1JLAA 4F9OA 4WFBL 4CF1A 1OH6A 4RCHA 5HBMA 4DR2K 1XNQK 4MLHA 3H1QA 3QBWA 4ID5A 1LW2A 3ZT3A 3FZMA 1D9DA 1A5VA 2OPQA 4G9ZA 3SBGA 3OBYA 4FW2A 2O8EB 3SLCA 1WSJA 3S3NA 1T44A 4F8RA 1UA1A 4LFBK 1NMNA 4CJVA 3QMLA 4JLHA 2XY8A 1VQ8N 4IOXA 3FFIA 2YHXA 4M63C 4IZ9A 3TAEA 3IRXA 1N34K 3DM2A 3BUZB 4RW6A 2O8BB 2P9SB 3K5MA 5IT9O 4DF8A 1BI4B 2RKIA 2X6SA 4K42A 4EIAA 2QKBA 4K8XA 3P38A 3NCIA 3K9KA 2HNDA 3WNFA 1X9JA 1G15A 3QDKA 4CEZA 5FDLA 3LWLA 4BG9A 4TSXA 2NRXA 2GX9A 5AQTA 3AVAA 1VAZA 4C1NI 4GY2B 4CGJA 2XHBA 3AA3A 4B9SA 3RR8A 3QEPA 3EO3A 1NNEA 4FZXC 5FPDA 1S6PA 2NLXA 2DFEA 5AQFA 3THXA 3C6TA 4FJNA 3SPZA 5CZ1A 4FLUA 1NGAA 1OH8A 1HPZA 1QZ6A 1WAFA 3QBXA 1GLLO 2ZE2A 1YXQA 4WE1A 3AO5A 3NBPA 1IV0A 3CFRA 3WT0A 4KBOA 4FM0A 1NKBA 2VCPA 2Q3SA 4KRFA 3HI0A 4CFCA 3MWPA 3OYMA 1LCUA 4PL7A 4FO0A 3MAQA 2E4LA 4CZMA 3K5LA 2IVPA 3OYNA 3OYAA 4KI6A 4KH4A 3WXLA 3AAPA 4ISEA 4H0PA 4OO1J 3CPEA 3ZCMA 2AP1A 3MXJA 4B8AB 2P5GA 4ISGA 4M7YA 1Z05A 4BR4A 2ASOA 1VQ6N 4CJPA 4BROA 4B1UB 1BGXT 4CJUA 1BCMA 3QINA 4OKKA 4FLVA 4DTOA 4OJRA 4B1XB 4I6MB 5C12A 1ILYA 2WUSA 3P39A 1HKBA 2FXUA 4KB0A 4CF9A 4XH4A 4X65K 4BE2A 3QEIA 4MO4A 2QXLA 2YX6A 4LF9K 2UXCK 2PBDA 1HYZA 1GLCG 4B08A 3IKMA 3VQCA 4CHQA 1YJ9N 2VQFK 3E66A 4CHOA 1BI4A 4YOTA 4DSIA 4Q5VA 3TSQA 2E5LK 4OLAA 2Z1HA 2IAJA 5GINA 5HRNA 1TK0A 3AY9A 2Q1NA 1NK0A 1TKZA 5GAHP 4G1QA 3OYCA 4FW1A 5KGWA 3GBTA 4CIGA 2YKNA 4CERA 3AO2A 1FKPA 4CBWA 1XC9A 3SQ2A 1WSGA 3QFUA 3MCAB 1MWMA 4NB4A 1SS6A 4HWIA 3AVCA 3CJBA 1WUAA 1V4SA 3KKSA 1J54A 4C8NA 5F0XA 4JRQA 2GELA 2R7YA 1TV6A 1VSLA 1JXBA 3TPQA 2Z1GA 1U4BA 4JI1K 3TTCA 1KVAA 5J2NA 3AAQA 1C0MA 3LPUA 2HHIA 3L3UA 5SZTA 1Y97A 4FJ8A 2UXDK 4OPKA 3TAQA 2G8VA 3ZETB 3SCXA 3R3LA 1EX4A 3VPZA 1EO1A 5H1SQ 1MA9B 2F9WA 3L0QA 3CPWM 2FLOA 3DI6A 1YI2N 4OGEA 1RTDA 3CCLN 3F73A 3NGIA 5C2FA 1C0GA 1X3MA 4CF2A 3C6UA 3K59A 2QI2A 3SUQA 5KQ8A 1QVFM 5C10A 3CCUN 4JI3K 4LC9B 2NRTA 3PY8A 1U6ZA 2ASMA 1S6QA 4H0OA 3T69A 4LF5K 2AJQA 1L3VA 4WQ5A 2IS3A 3HVTA 2HHXA 3THYB 3HOTA 3CIPA 4ZTJA 5JLHA 2QWMA 4JKGA 1M1KO 3CHWA 4NO7A 4H8KA 3QERA 5KPRA 3B8AX 2KFZA 1S72N 1QHTA 3LM9A 3L3VA 5KI6A 2OPSA 1CLQA 2YKMA 5FLXO 2RF2A 2A1RA 1B9FA 4XIUA 4CHNA 2G8KA 3UB5A 2E8AA 5AFUH 4B9NA 3QLHA 4X62K 2VG5A 1XMOK 2PFUA 3VMFB 5C15A 3E1YA 4CFAA 2CGJA 4FYDA 2E1ZA 4RW4A 3C65A 4BWJA 3PX0A 3A2FA 3AARA 2HNZA 4E7LA 3F5TA 1ZC6A 4FJ7A 1KVCA 2DFFA 2V51B 4FM2A 4NXNK 1TK5A 4C8KA 4AQYK 4FLZA 4CJLA 3O4WA 3NH2A 4DR7K 1QQNA 3G25A 3CYGA 4DTSA 1ZBFA 2Q97A 1CZAN 4CJKA 1T6CA 4F3TA 1C1BA 2HOEA 4CE9A 3PSFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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