1D4XA

Crystal structure of caenorhabditis elegans mg-atp actin complexed with human gelsolin segment 1 at 1.75 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
368
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGVVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITVGNERFRCPEAMFQPSFLGMESAGIHETSYNSIMKCDIDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords C. ELEGANS ACTIN 1/3
publication title The structure of nonvertebrate actin: implications for the ATP hydrolytic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Caenorhabditis elegans
molecule tags Contractile protein
total genus 116
structure length 368
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1d4xA03
5JLHA 2E2QA 4K25A 2VWBA 2QWLA 1NGEA 1EQYA 4BRDA 5EY4A 5BPMA 3WEEB 2YHXA 1QQOA 5AQMA 3MN5A 3ZX3A 1X9JA 5JLFA 1BDGA 3LM2A 4O5FA 4B1WB 3TPQA 4CZJA 3AY9A 1CZAN 2DPNA 2IVPA 3C7NA 4CBWA 4CZFA 2QWMA 1E4FT 3QFUA 2YCHA 4IJNA 3VEZA 3CJCA 4WQ4C 1U2VB 3RSEA 4BR7A 1OKJA 2QWRA 3F9MA 1NGBA 2CGJA 2A3ZA 2P9PB 1YXQA 3SLCA 3ENOA 4QS8A 3H3NO 2E1YA 3KZBA 3L4IA 4GNIA 5AQKA 4BR2A 3M1FA 4M7XA 3VETA 4H5VA 4FL9A 4IO8A 2BTFA 5EVZA 3VGKA 1RFQA 3FZFA 4M7YA 4E1JA 3D2EA 3FZLA 4BVPA 5JMVA 4ISFA 5KQ8A 5AQSA 5FPNA 3A8YA 4BRIA 4DHYA 3CQXA 4QS9A 3LM9A 4A61A 2E2OA 2V7YA 3VEXA 5AQZA 5BPNA 3GG4A 4FPAA 5AR0A 4FSVA 3HTVA 4BG8A 3GOIA 3O6WA 3DXKB 5AQXA 4WYBA 3VF6A 4BVOA 3B8AX 1JCGA 1YUWA 4K42A 3CQYA 2ASOA 3ID8A 3SMPA 2W40A 2A6AA 4BRMA 2I7NA 5AQLA 4A62A 4BG9A 2PAVA 4XH4A 2AA4A 4FOEA 2GUPA 2E20A 2P9UA 2VYPA 4YDUA 3VERA 1MDUB 2P9NB 4Y0WA 3D7EO 4ISGA 3EKUA 1TUYA 4Z94A 1NGCA 2FF6A 2P9IA 1Z05A 3LDQA 4CZMA 1S3XA 1BA0A 3SJHA 5LY3A 2Q0UA 2VCPA 2WUSA 1Z6RA 5JICA 5AZJA 3UKUB 5FPMA 3ZETA 4GY2B 2GWKA 4BR4A 3O1BA 5EOYA 5LJWA 2J4RA 3S41A 4MLEA 1K8KB 2F9TA 1SQKA 2YJEA 4BRNA 1GLBG 2NZTA 4JHDB 5AQJA 2D0PA 5AZIB 3TU5A 2ZGZA 3DXMA 4FO0A 1HUXA 3LDLA 4AM6A 3H1QA 4B9QA 4EIAA 1HKGA 1SZ2A 1DGKN 3WUHA 1XUPO 3O1WA 3O08A 4BGAA 3SMSA 2D1KA 3MDQA 1KAZA 3O4WA 3QBWA 4H5NA 3FFKB 2V7ZA 5AQWA 5E26A 1E4GT 3ULEA 4CZEA 5F1XA 2FF3B 2BUPA 2P9LA 5AQHA 1NGDA 2P9KB 3WXJA 4A2BA 5AFUA 3OHRA 3MN6A 1LCUA 4ISEA 5EXWA 1IJJA 2YI1A 2Q31A 2KHOA 5AQQA 4BC2A 2FLOA 1HLUA 4YDUC 3IUCA 3QMLA 5AQYA 3BF3A 1HX1A 1BOTO 1X3MA 4L3QA 4FWKA 4K41A 4CZKA 2A42A 3CJ9A 3MN9A 3AAPA 4FOIA 4H0OA 1BG3A 1TYQA 4PL7A 3C7NB 4BRCA 4B1XB 3EN9A 5AQPA 4FWSA 1X3NA 4I6MA 3ZX0A 3VESA 1NM1A 3A0IX 3FGUA 3RSEB 1TYQB 2D4WA 1V4SA 4DQ8A 3VGLA 3H45C 1HJOA 4QS7A 4B1VA 3EL2A 2YHYA 3AARA 2V51B 2YJFA 3EZWA 3U8XA 4BRKA 2PBDA 3BF1A 4BREA 1MWMA 3ENHA 3HI0A 5BR9A 4CD3A 3CERA 1NMDA 3I33A 4RWTA 3D2EB 3A5MC 4IZ9A 4XEIA 2HF3A 3QB0A 5TKYA 1QZ6A 2NRHA 3CJAA 4FWRA 5AQUA 1S22A 1D4XA 4WQ5A 2E2PA 3GL1A 4NB4A 3GDQA 4MO4A 3VEVA 4BC5A 1IG8A 2GELA 4JNEA 4RCHA 3U9ZA 2QM1A 1Q18A 4B1YB 3ZEUA 1QZ5A 2GWJA 4BRPA 3JXUA 3QFPA 5AQGA 3BUZB 1WOQA 4CD1A 4EAHD 1HKCA 2QXLA 3I8BA 2ZF5O 3J8AA 2EWSA 5AQOA 5F0XA 4BRAA 3UE5A 3BEXA 5I9EB 1DEJA 2IVNA 3M3ZA 2Q97A 4H0TB 5KPTA 3LDOA 1U6ZA 2Q1NA 1T6CA 2P9UB 4CZHA 4CBUA 1ESVA 3JS6A 2Q36A 2CGLA 3O8MA 4J8FA 1MWKA 4CJ7A 1JCFA 4CZIA 2HOEA 3CJ1A 1C0GA 3C0BA 3DWLA 1LOTB 2P9IB 5E84A 5BRDA 3R9PA 3A5LC 1NWKA 2QWQA 4FWMA 3QBXA 1BA1A 4FWNA 4MLHA 3SK3A 4BR9A 1BU6O 1H1VA 3FZHA 3O5BA 1ATSA 4BRQA 3WXLA 5FPDA 1BWFO 2Q0RA 3HBTA 4BROA 1T6DA 5AZJB 3QICA 4BRGA 3ZETB 2W41A 5ADXH 3VEOA 4IXCA 2AP1A 1XQSC 2E1ZA 3VF2A 1V4TA 2P9SA 3H6EA 4DCHA 3VEWA 4IJAA 2FSJA 5KQDA 1C0FA 1NGHA 1ZC6A 4BQZA 3EO3A 1QQNA 3H1VX 4H0PA 2UYTA 4NO7A 1DKGD 3DXMB 4CBXA 4JD2A 4FWQA 4CI6A 3FZMA 3MMVA 1KAXA 4WQ5C 4H0XB 3MK6A 3P4IA 4PKHA 1GLJO 3U4LA 1J6ZA 4A2AA 4M63C 4BRLA 2QWNA 3ZX2A 2ASMA 2E2NA 3LL3A 1KXPA 3MCPA 2IVOA 3R8EA 4FWLA 5AFUH 3ULEB 3WXIA 5BRHA 4H5TA 4XH1A 5AQIA 3H46O 3U9DA 2P9LB 3DJCA 3CETA 3WEEA 1GLDG 3IFRA 4AM7A 1G99A 1RDWX 1GLCG 3UKRA 2HMPA 2QWOA 4JN4A 2A5XA 5AQNA 4MO5A 1NGFA 1YVNA 2OANA 1U2VA 2QWPA 4EHUA 3UKRB 3IDHA 4K43A 4HWIA 4EHTA 2P9PA 3LDPA 4O8KA 2A41A 4RTFD 3VGMA 5BRFA 2CH5A 1NGJA 3KVGA 2ASPA 4FWOA 4H5WA 4I6MB 5KPRA 5EX5A 3CI5A 1NLVA 2IIRA 2E88A 1ZBSA 1QHAA 3ATVA 3GBTA 5F2RA 1Y64A 1XC3A 4CZLA 5CE3A 4BC4A 1NBWA 3CJ7A 3FLCO 2F9WA 2ZGYA 1P8ZA 2CGKA 2ZWHA 1NGAA 3VF4A 4PL8A 1NGIA 4B1UB 3IMXA 3A5NC 4DB3A 4H5RA 5LJVA 1BUPA 3DXKA 3VOVA 4BR5A 2QW9A 1QQMA 3WXKA 4JAXA 1T44A 3CIPA 1ZXOA 3M6GA 3ZEUB 2Q2RA 1R59O 3HSCA 5AQVA 4BGBA 4C23A 4PKGA 3FR0A 2GTDA 1JCEA 3H3OB 2ITMA 1WUAA 3UB5A 1GLEG 1GLAG 2YHWA 3FE1A 2GEMA 5BREA 4BR0A 2P9NA 1HPMA 4H03B 3MN7A 3GE1A 1SAZA 5FPEA 3R6MA 2A40A 3D2FA 3KHYA 4XH5A 5BPLA 3DAWA 3AAQA 2D0OA 1ATNA 3UKUA 3D2FB 3FZKA 1HKBA 4HTLA 1K8KA 2NLXA 1NGGA 4WQ4A 2H3GX 4JHDA 3VPZA 1BO5O 3ATUA 2CH6A 5KPZA 4BQLA 5AZIA 4F9OA 3HZ6A 1GLLO 2HF4A 5AQFA 4PKIA 4FPBA 5AQTA 3WQUA 2P9SB 3EKSA 4BRFA 1YAGA 2FXUA 3VEYA 2V52B 3WT0A 4H0VB 4B1ZA 4H0YB 4BRHA 5ADXA 3LDNA 5BN9A 1TUUA 2FSKA 3G25A 1MA9B 2I7PA 4JD2B 3VENA 3BP8A 4LC9B 3QDKA 1RGIA 2FSNA 4KBOA 3CJBA 5BN8A 3O80A 5AQRA 3CHWA 4FWPA 4BC3A 4IWVA 2P9KA 5ELZA 1ATRA 3HM8A 3A5OC 4EFHA 5B8HA 4CZGA 3W0LA 3L0QA 3L6QA 3W3DA 1GLFO 2E8AA 1KAYA 3WQTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JLHA 2ZM6K 4K25A 2VWBA 3KK7A 1EQYA 5EY4A 3WEEB 2YHXA 4CEZA 3DLEA 4H8KA 1NK7A 4O5FA 4B1WB 4LFCK 2PYLA 2O8BB 1W0HA 2E6LA 2QWMA 3VQQA 5C12A 1OKJA 4LF6K 1NGBA 3VQCA 2CGJA 2A3ZA 5TKWA 3ZYYX 1BGXT 3H3NO 2E1YA 3L4IA 4GNIA 1OH6A 3M1FA 3K9JA 2IOCA 3LP1A 4H5VA 4KV8A 2BTFA 1RTDA 5EVZA 5J2QA 4HHTA 2P51A 1UWBA 3QIOA 5JMVA 4DTJA 4FZZA 2VGNA 4CHPA 4BRIA 4HUEA 4QS9A 3LM9A 4A61A 3DM2A 3VEXA 3E9PA 2P1JA 5BPNA 4FJ7A 3GG4A 2G8UA 1SS6A 4FW1A 4FSVA 4YY3K 3SUOA 4M3XA 3DXKB 5AQXA 3VF6A 4JK9A 1JCGA 1YUWA 1TKTA 3V9XA 2BANA 1N5YA 1LW0A 3CQYA 2W40A 2A6AA 4BRMA 3DLBA 3T1AA 1JL2A 2GUPA 2E20A 2VYPA 4KTQA 1QHTA 3VERA 4OKKA 3ZSVA 1MDUB 2F7TA 4C1NK 1VQMN 1LAWA 3HPGA 1Z05A 3VQ4A 4KREA 5J2NA 1RTHA 4CJRA 4BDZA 5FPMA 4GY2B 4DUZK 3O1BA 5EOYA 2ZE2A 1VQ7N 1K8KB 2F9TA 1SQKA 1RDUA 2YJEA 4BRNA 2Y1JA 1SKWA 3TU5A 2G8HA 5HBMA 4YOXA 2B4JA 4JKGB 4W5OA 3DXMA 3E66A 4X62K 3ZLJA 4FO0A 3AA4A 1HUXA 1WSIA 4JYAK 3ZT1A 1DGKN 2OPRA 1HQUA 3O08A 4GMJB 3SAHA 5DM7L 3SMSA 5DMRA 1KCFA 3SBGA 1N34K 2HHXA 3OBYA 5JS2A 3OS0A 1WSEA 1BQNA 1RCHA 4CZEA 1BL3A 2FF3B 3M8QA 5SWMA 1NGDA 3WXJA 4CEAA 3TSPA 5AFUA 4GVMA 1LCUA 4MFBA 3OYJA 2Q31A 1D9FA 1HNWK 4CIEA 4DUYK 3T1HK 3QMLA 2NRTA 4IBNA 1VSEA 1HX1A 1WSGA 2RF2A 5M1KA 4K41A 3I55N 3CCUN 1T8EA 3MXIA 3MWPA 1TYQA 2VG6A 2DFHA 3CC2N 3C7NB 3V4IA 4FJXA 4IFYA 4DSEA 3VA0A 4CF8A 1L3UA 1IG9A 3FGUA 3ZT0A 1TYQB 4QAGA 1WSHA 4ILHA 2OYQA 5LL6Z 1HJOA 4QS7A 4B1VA 4K8ZA 1T05A 3THXA 2NRVA 4BREA 3K58A 1K9MO 1MWMA 3AVJA 3OYDA 3ENHA 4CIGA 4OKEA 1Q8IA 3S3MA 1KVAA 1TL1A 1DT9A 1NMDA 4NLBA 4CJUA 4X65K 4YFUA 1RDDA 4IZ9A 4Z4FA 2HMIA 5J2MA 1D4XA 4F8RA 4C8NA 4FM1A 2GELA 4DSFA 3ZEUA 5EU7A 3QFPA 4FZYA 5CY4A 4DR2K 4FLTA 4DQIA 4ELUA 5KGWA 1WOQA 1RT6A 4EAHD 1TAUA 3PIOL 3I8BA 2ZF5O 3MECA 4OX9K 3SV3A 3AVGA 3BEXA 5I9EB 3TWHA 2X74A 2IVNA 3M3ZA 4N5SA 2F8TA 2F8SA 3LDOA 4LH5A 3P5JA 1A5XA 2Q36A 2CGLA 4E7KA 3LPTA 3WNEA 4DWIA 4FJJA 4CF2A 3DWLA 4ID1A 5E84A 5BRDA 3R9PA 3F9KA 3VQ6A 3T3FA 3OJSA 3FZHA 2QTDA 3KKSA 1T6DA 4NYFA 4FJ8A 4Y1DA 3VEOA 1XQSC 2E1ZA 3VF2A 2P9SA 1N8RO 4DCHA 3VEWA 4JKEA 1NGHA 3EO3A 1FKOA 2UYTA 3L2RA 3Q7BA 4KO0A 5HRSA 4JD2A 4IDHA 3VMFB 4FK2A 1KAXA 2HHQA 3G0ZA 4KRFA 3C6HA 2R7YA 3DRRA 1J6ZA 2BE2A 4WCEL 3LZJA 4M3ZA 4A2AA 1X1PA 4M63C 4JI4K 3M8RA 4C1NI 4GKJK 2E2NA 3LL3A 3NBPA 1KXPA 2IVOA 4B9MA 5BRHA 1TAQA 1XWLA 2P9LB 4DSLA 3DJCA 3QERA 1J5EK 2HHVA 4CECA 4YORA 2F96A 1KC8O 1FW6A 1EETA 4N56A 1JLCA 1YHQN 1N6QA 2ZJRL 2QWOA 1T3VA 2YHAA 4HVJA 4CHQA 4DS5A 4KHSA 1YVNA 1A5WA 5JVHL 3NF6A 3SJJA 3EZ5A 3PX4A 1VSIA 4Z4EA 2P9PA 3LDPA 1TK0A 4JLHA 3TTFA 4CCHA 5BRFA 1RBTA 5KPRA 4I6MB 1HNIA 3CI5A 1BCMA 2RPIA 5DM6L 4DV5K 4PWDA 1XC3A 1NBWA 4FJMA 1Q7YO 1VSDA 4DTPA 3J7ZO 2CGKA 1NGAA 3VF4A 1RBUA 5C42A 5LJVA 4DSJA 3TAFA 1BUPA 1VSKA 4HCBA 3AVKA 1W9HA 1OVYA 4CHZA 2NRZA 1R0AA 1RT3A 3WXKA 4CJVA 1VQ6N 3B6PA 5E41A 1N36K 3HSCA 4NYNA 3THYB 1ITGA 3CFPA 2GTDA 2ITMA 3EY1A 1VQ9N 2BGGA 3CM6A 3NGYA 2YHWA 3TANA 3MN7A 4DMNA 3WNHA 2YNGA 4B9NA 4KHQA 5FPEA 3CCJN 4FCYA 3DAWA 3V9WA 1OH8A 1I3AA 3AAQA 5SZTA 3HL8A 1C1AA 3K57A 1ZBHA 4YOWA 3FZKA 3OYCA 2PYJA 4CFCA 2NLXA 4HUFA 1NGGA 2H3GX 1S9GA 3BY5A 2IC3A 3I0RA 4JHDA 4JI0K 3VTHA 4AHTA 1BO5O 1JLFA 1YI2N 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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