1D4XA

Crystal structure of caenorhabditis elegans mg-atp actin complexed with human gelsolin segment 1 at 1.75 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
368
Chain Sequence
b'EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGVVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITVGNERFRCPEAMFQPSFLGMESAGIHETSYNSIMKCDIDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords C. ELEGANS ACTIN 1/3
molecule tags Contractile protein
source organism Caenorhabditis elegans
publication title The structure of nonvertebrate actin: implications for the ATP hydrolytic mechanism.
pubmed doi rcsb
total genus 116
structure length 368
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1d4xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1d4xA03
1S22A 2QXLA 5BN8A 3FR0A 5AQIA 4BC2A 5EOYA 3A8YA 3EZWA 2E8AA 4H0TB 3O8MA 4BRNA 3A0IX 4DCHA 2P9SA 4CZKA 2QWNA 1BA1A 2Q2RA 3CJBA 4BQLA 2HMPA 1TYQA 3QBXA 2FSKA 3FFKB 5F1XA 4MO5A 1NGEA 1S3XA 3A5LC 1KXPA 3H3NO 5AQXA 3ZETB 3F9MA 1ATNA 1K8KB 4J8FA 1NGGA 3BUZB 1U2VB 2KHOA 3VEOA 4ISGA 3AY9A 5AQGA 1NGAA 3CQXA 4ISFA 3L4IA 4BRAA 2E2QA 3MMVA 4K25A 3VGKA 4B1XB 2E1ZA 4EHTA 2W41A 4H03B 3VEVA 5BREA 3SK3A 5CE3A 5KQ8A 3O6WA 2QWPA 3C0BA 4BVPA 5BPNA 4BR7A 1SZ2A 1P8ZA 4FL9A 3M6GA 1RDWX 5AQZA 1XC3A 1DGKN 4PL8A 4BR2A 3HM8A 4FOIA 2A41A 3JXUA 4RWTA 4H0VB 3MCPA 3SLCA 4CZMA 5AZJA 5AZJB 1ATRA 1NGDA 3GG4A 2Q31A 4O8KA 4XH4A 2OANA 2H3GX 3EL2A 4JNEA 3LDLA 3U4LA 3H1QA 1HKGA 3FZMA 4K43A 4ISEA 1OKJA 4AM7A 3M1FA 2NLXA 2QWRA 4BC5A 2FF3B 5AQNA 4FO0A 1Y64A 5AQVA 4FPAA 3D2FA 3P4IA 2V52B 1BWFO 1BDGA 3LDQA 2P9SB 3FZKA 3WXKA 2ASPA 3H6EA 2P9LB 5AFUH 5BPLA 1YXQA 2F9TA 4BRQA 2E20A 2YJEA 3LM9A 3UKRA 2PBDA 5E84A 3R9PA 2CH5A 2A42A 2AP1A 5FPDA 1GLJO 5LJVA 3IFRA 3O80A 2ZF5O 4YDUA 1RGIA 1V4TA 3O5BA 3S41A 3U8XA 2Q0UA 2Q97A 1TYQB 5EXWA 2P9IB 1ATSA 3GBTA 3W3DA 3VEZA 5E26A 3QMLA 2FSJA 1IG8A 2QWQA 3CETA 5EX5A 1V4SA 4BR4A 3LM2A 3OHRA 5BRHA 4M7XA 1NWKA 4GY2B 2CGKA 4FWSA 2P9NA 2E2PA 4JAXA 3R6MA 4FWOA 5KPRA 2V7ZA 4QS7A 4B1VA 4B1YB 4BG8A 2HF3A 5BN9A 4NB4A 4BGAA 4BQZA 4LC9B 4CBUA 1KAXA 3J8AA 3EO3A 4RTFD 1QZ5A 4JD2B 4CZIA 1HUXA 3B8AX 5ADXA 1TUUA 4CZHA 1CZAN 4FWQA 1GLEG 5JICA 3D2FB 5FPNA 5LJWA 3FE1A 4FWKA 3ULEB 5BRFA 3HI0A 5AQUA 2Q36A 4K41A 1T6DA 2ZGYA 3HZ6A 3H46O 1NGJA 4BRIA 3DXMB 2P9PA 2D0OA 4CBXA 3MN5A 2P9KB 4I6MB 2WUSA 3KVGA 3LDNA 1NGHA 3WQUA 3H1VX 5AQHA 2I7PA 3ID8A 3H45C 4GNIA 4CBWA 2NRHA 4WQ4A 1E4GT 4FWRA 2F9WA 1H1VA 3M3ZA 1HKCA 5TKYA 1SQKA 4HWIA 3RSEB 1NGBA 3GDQA 4L3QA 3CERA 4H0XB 5AZIB 2GWKA 3H3OB 1RFQA 4Y0WA 3ENHA 3QFUA 4B1WB 3ATUA 4CI6A 4YDUC 1X3NA 1ZXOA 4BRLA 5KPZA 1NBWA 4JHDB 1ESVA 1NGCA 4QS9A 4BRHA 3UE5A 3I8BA 3O08A 1DKGD 4CZLA 4IZ9A 1XUPO 3D2EB 5AQJA 3WEEA 2CH6A 3VERA 5KQDA 3DJCA 4I6MA 4KBOA 2P9KA 2QWLA 4H0YB 1GLLO 1QQNA 4RCHA 5LY3A 2BTFA 3SMSA 3BEXA 3VOVA 5JMVA 2GUPA 3ZX0A 4FSVA 3C7NA 3I33A 2D0PA 3ZEUA 2GTDA 2A3ZA 3LL3A 1HPMA 1C0FA 3R8EA 2QWOA 3CI5A 2ZWHA 4FOEA 1SAZA 5FPMA 3TU5A 2GELA 1YAGA 3CJ1A 3WT0A 4BRFA 2AA4A 1JCGA 4CZFA 4FPBA 1NM1A 1BOTO 3LDPA 3WXIA 2VWBA 4BC4A 2Q0RA 4WQ5C 2NZTA 4HTLA 4IO8A 4BRCA 4QS8A 2GEMA 3FLCO 4CD3A 4M7YA 4B9QA 3VF2A 1JCEA 1Z6RA 2YJFA 2ITMA 3MN6A 2ASMA 1ZC6A 2W40A 3O1BA 3VEYA 1JCFA 1MWKA 4A2BA 1U6ZA 2IVNA 4XEIA 4C23A 4H5RA 1T44A 3VPZA 3VESA 4H5TA 5F2RA 1BO5O 1HJOA 4IJAA 4CD1A 3L6QA 3CJAA 4IWVA 5AQTA 4XH1A 2E2NA 1NGIA 4WQ4C 3W0LA 3WUHA 4A62A 2HOEA 4BRKA 1EQYA 3FZLA 1DEJA 2P9UB 2V51B 1K8KA 3A5OC 3GOIA 2IIRA 3MN9A 5F0XA 3VGLA 4JHDA 5EVZA 2FF6A 3CJ9A 4DHYA 3ZX2A 1TUYA 1MWMA 4CZGA 4WYBA 1R59O 1MA9B 2P9LA 5AQQA 4FWLA 3ATVA 4BROA 5AZIA 3CIPA 3ZEUB 1BA0A 5FPEA 4O5FA 5AQMA 3AARA 3C7NB 1YUWA 2QM1A 3MDQA 1WUAA 2VYPA 1WOQA 3EN9A 4H0PA 5AQSA 3SJHA 2YHYA 3ENOA 2FXUA 3UKUA 3SMPA 2A6AA 3HBTA 3QFPA 2Q1NA 4IXCA 4MLHA 5AR0A 3QDKA 3VF6A 3D2EA 4BR5A 2IVPA 4PL7A 5AQRA 2D1KA 3EKUA 4FWMA 2E2OA 5ELZA 3VEXA 4BC3A 3O1WA 5AQWA 3FZFA 5AFUA 4WQ5A 3CQYA 3UKRB 1ZBSA 4EFHA 1QQOA 3QB0A 2J4RA 4K42A 2E88A 3ULEA 3MK6A 1QZ6A 1QQMA 2BUPA 4H5NA 5BRDA 1GLFO 3UB5A 1NLVA 3VETA 1U2VA 3WQTA 3KZBA 2FLOA 4CZJA 3QBWA 4A2AA 4NO7A 4H0OA 4JN4A 4EHUA 1LCUA 4MO4A 3ZETA 4MLEA 1GLAG 2DPNA 3BF3A 4B1ZA 2GWJA 1GLCG 3WXLA 3LDOA 3U9ZA 2A5XA 4H5VA 5AQLA 5JLFA 1XQSC 4AM6A 5JLHA 3DWLA 1GLBG 1HX1A 2YHWA 4E1JA 5B8HA 2P9NB 2EWSA 2PAVA 2FSNA 2QWMA 3CHWA 3TPQA 1KAZA 3RSEA 3BF1A 4JD2A 5EY4A 1NGFA 2ZGZA 3QICA 3VENA 5AQYA 1YVNA 2V7YA 2E1YA 1E4FT 4DB3A 3MN7A 3WEEB 1GLDG 1Q18A 3CJCA 5AQPA 4BR0A 4DQ8A 1X9JA 3L0QA 3FGUA 4A61A 3UKUB 3O4WA 4BRDA 2QW9A 3AAPA 1J6ZA 3DXMA 1C0GA 3CJ7A 1IJJA 4BREA 1MDUB 4BVOA 3GE1A 1D4XA 1Z05A 2HF4A 3A5NC 1G99A 3WXJA 3A5MC 3DXKA 5ADXH 4IJNA 4Z94A 4B1UB 2P9IA 1BG3A 2YCHA 4CZEA 4EAHD 3VEWA 4BRGA 3AAQA 4F9OA 3VF4A 3IMXA 3KHYA 3EKSA 3FZHA 3U9DA 3IDHA 4BGBA 1BUPA 2P9UA 2CGJA 4FWPA 5AQKA 3HTVA 4BR9A 2P9PB 4BRMA 1LOTB 1NMDA 2D4WA 4M63C 3HSCA 2IVOA 1KAYA 4BRPA 5AQFA 2CGLA 4PKHA 4CJ7A 3GL1A 3JS6A 1HLUA 4BG9A 4PKIA 4EIAA 3DXKB 2UYTA 5KPTA 5I9EB 3BP8A 3D7EO 4H5WA 4XH5A 2ASOA 2YI1A 3G25A 3VGMA 2A40A 1X3MA 3DAWA 2YHXA 3ZX3A 5BPMA 4FWNA 3IUCA 2VCPA 1BU6O 1HKBA 1QHAA 1T6CA 5AQOA 2I7NA 4PKGA 5BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SUPA 5AQIA 4IFVA 4N76A 3A8YA 1JLCA 4B9UA 3O8MA 3V4IA 1Y97A 1WBBA 3OA9A 4CZKA 3SCXA 4PWDA 3G4SN 4B9SA 4BQLA 4DV1K 1ZBHA 3QBXA 2FSKA 1C0MA 3TSPA 5F1XA 3CPWM 3AVHA 1VSJA 4JI3K 1SUQA 3A5LC 3BZCA 4AQYK 2RN2A 3ZETB 1K8KB 5HBMA 4FK2A 1NGGA 4M42A 3MEDA 4CHZA 1NGAA 5C25A 1RBSA 2E2QA 3CFRA 4W5OA 3E9LA 3VQ8A 4GVMA 1GOAA 2OZMA 4DU1A 4H03B 3C0BA 4BVPA 5BPNA 4FLYA 2YNFA 1QVFM 4ICLA 1SZ2A 4N56A 1RTIA 1P8ZA 4PHTX 3M6GA 5AQZA 3PV8A 3KJVA 2UU9K 2A41A 3JXUA 4K8ZA 3B6OA 3UIQA 5AZJA 1XWLA 4DQIA 4XH4A 2H3GX 3F5TA 3AA3A 3U4LA 3H1QA 3OS2A 1NK0A 3AO3A 4DFMA 4ISEA 5C10A 3M1FA 2NLXA 3O3GA 2QWRA 4BC5A 5LMUK 3CC2N 4WE1A 1BWFO 3WXKA 2P9LB 3IKMA 2ETJA 2JLEA 5BPLA 5GAHP 4BRQA 3V1RA 4AHCA 2FBXA 1QHTA 3L2WA 1YTAA 3CYMA 3R9PA 2CH5A 3SI6A 3ZT1A 4E0DA 3IFRA 4YDUA 4ELTA 1BIZA 3L4QA 2Q0UA 4DV6K 1HRHA 1RDUA 3AO5A 5HRRA 4DFPA 2OCEA 2O8DB 1RDDA 5C0YA 5DM7L 3EEQA 1IG8A 3CETA 4EZ6A 1VQPN 4HCCA 2HNZA 1V4SA 4ZHRA 3LANA 3KK1A 1DLOA 4GV9A 4CW7B 2P9NA 4JAXA 3TTCA 1N8RO 3E9PA 4KHPK 4QS7A 1XNQK 2HF3A 4OLBA 1C0TA 5BN9A 4BQZA 4DR2K 3J8AA 4JKGB 2XY8A 3TARA 3K59A 3T19A 3EE9A 1HUXA 1RBUA 4AILC 4A57A 1VQ8N 2G8KA 1BI4A 2ATQA 5FPNA 3RRHA 4KI4A 4I9QA 2W6KA 5BRFA 2ZGYA 3HZ6A 4BRIA 1NOZA 3OBWA 3DXMB 5HRNA 1TKTA 4FK4A 3TAMA 3LDNA 4JK7A 2I7PA 3LP2A 3KTQA 1B9DA 4DSFA 3PO4A 3ZSVA 3ZSRA 1RBTA 4DTRA 2FBVA 5J2NA 1HYVA 4OLAA 3TR8A 3BY5A 1EWRA 1K6YA 3H3OB 2PY5A 4B9VA 1RFQA 3PUFA 3WNFA 4Y0WA 4C8OA 3RMCA 1Q86O 4YDUC 2YHBA 2VG6A 5KPZA 1ITGA 4JHDB 1ESVA 2KZMA 4Y1DA 3O08A 3O3HA 4CEFA 5LMNK 5AQJA 2CH6A 3SJJA 3ZT0A 5KQDA 1O13A 1RTHA 1GLLO 3BEXA 4FJIA 1N6QA 2GUPA 4NLBA 4DR7K 3I33A 3ZEUA 1SL2A 2QWOA 2ZWHA 3G10A 4CK1A 3CM6A 4DR4K 1JCGA 4WF9L 4FPBA 3TABA 1BOTO 3HOSA 4DQSA 1N32K 4GKJK 1VQKN 3CCSN 1IO2A 4WQ5C 3K5MA 2XY6A 4YOYA 1L5UA 1KTQA 3ZCMA 2ITMA 3PIOL 2WOMA 2UUCK 3O1BA 2D0CA 4KH4A 3L2RA 4XEIA 3LWMA 4CVNE 2HHIA 1HJRA 4I2QA 2ZE2A 3NBPA 4C8MA 1TKDA 2IC3A 3B6PA 3I0RA 2G8HA 1BO5O 3T3FA 3CC4N 1HJOA 1S9EA 3L6QA 2OA8A 5AQTA 4CFDA 2E2NA 4CHNA 1EQYA 1DEJA 4F3TA 3VTIA 4CEZA 1KVBA 4CGGA 1IKVA 4OX9K 1FKOA 4JHDA 4JKCA 4DSJA 3ZX2A 4AHSA 4CZGA 2P9LA 1MA9B 3DOLA 1GOBA 3MXIA 4BROA 5AZIA 5M1PA 4O5FA 4WCEL 1YUWA 1NNEA 4RG8A 1HNVA 3MDQA 2VYPA 3PY8A 3HP9A 2YHYA 5GINA 3TSUA 2ITGA 3HBTA 3AVBA 4BR5A 4JS4A 4FM2A 4PL7A 4E72A 5J1EA 3I55N 3VEXA 3EKUA 2E2OA 4QOZB 1YF5L 2HHHK 1JLQA 3VA0A 2LSNA 5AQWA 1TL3A 3FZFA 3U3GA 4FJ5A 1OVYA 4DU4A 3K5NA 5I42A 3THYA 3QB0A 5KRSA 5I3UA 1WAJA 2E88A 4HTUA 1W9HA 1Q9XA 2HBLA 1NKEA 3KLHA 3K5LA 2F8TA 4YNQA 3OYHA 2UUAK 1U04A 3NVKA 3SQ2A 1DTQA 4DFJA 1J9AA 4ID5A 1CLQA 4KTZA 4YY3K 3J7YP 3D6RA 3WQTA 3BZKA 4GVEA 4KH5A 4CF8A 3HT3A 4NO7A 5JS1A 3QETA 5CYMA 1L3SA 3OYKA 3K57A 1JXEA 1VQNN 4JKAA 3NH1A 3OJUA 4DFKA 3N4QA 5AQLA 2P51A 3I0SA 5JLHA 1HX1A 4E1JA 4E3SA 4KI6A 4K0KK 1A5XA 1U49A 2QWMA 5GAGP 1TK5A 4KTQA 2WBNA 3RSEA 4J2EA 2UXBK 5FLXO 4J2BA 1NGFA 3VENA 5HOOA 4GKKK 1VAZA 4DB3A 4IO9L 3SBTA 1TK8A 2UXDK 4CEOA 1IV0A 4DQ8A 1X9JA 4KPYA 3LZJA 3AAPA 3QEWA 4U7BA 3DXMA 1IJJA 1HNZK 4BREA 5C15A 3L8BA 3FFIA 2VG5A 3GE1A 1D9DA 2HF4A 3CQ8A 3JAMO 4DV4K 3DXKA 2UUBK 3ALYA 5ADXH 1NK4A 2X74A 3QIPA 1BG3A 1FXXA 4Q0BA 3AVMA 3AAQA 2KKZA 3KHYA 3EKSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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