5JLHA

Cryo-em structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
b'EEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 2
publication title Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 93
structure length 374
sequence length 374
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5jlhA03
4XH4A 4FPAA 1JCFA 3EN9A 4H5TA 2EWSA 1NGDA 4JNEA 4CZIA 3UKRA 3O1BA 3FZMA 4QS7A 4BVPA 3AAQA 4B1XB 2QWQA 1K8KB 2QXLA 3VEYA 5AQYA 5AQIA 3A5NC 3CERA 1ESVA 4YDUA 3GDQA 5KPZA 1HJOA 5AFUA 4B1ZA 4BRPA 1KAZA 5AZJB 3A8YA 3MDQA 5AQKA 4BRKA 4JHDA 2P9IB 4Y0WA 4FL9A 1LCUA 2CGLA 3CJAA 4H5NA 5AQWA 4BR2A 5EVZA 3EZWA 5AQFA 1BG3A 1QQOA 3MN9A 4J8FA 3R8EA 4BRGA 1BO5O 2V51B 3UB5A 5AQLA 3D2FA 3GE1A 3KHYA 1J6ZA 4HWIA 3HTVA 1ATRA 1YUWA 3ZX2A 3L6QA 1BA1A 3A5LC 3QICA 2PAVA 1MDUB 4H5WA 4A61A 3LM2A 1JCGA 2NZTA 3HM8A 1NGBA 3VGKA 3I8BA 3QMLA 5AQZA 4BREA 4BGBA 2AA4A 2P9PA 2FXUA 3GL1A 4BRDA 1GLDG 1CZAN 3L0QA 5AQPA 5AQTA 1WOQA 2FF6A 2HF3A 2E2OA 4H5VA 4BQZA 4PKIA 3MN6A 4FWSA 4JHDB 5AQVA 3WXKA 1HPMA 5JICA 3HSCA 4BRNA 4M7XA 2VWBA 4FPBA 1G99A 1ATNA 1BU6O 3CJ9A 3CQYA 3LDPA 2FLOA 4JD2A 2IVNA 2H3GX 3FR0A 4BR5A 2ITMA 1IG8A 2P9NA 4BRLA 3O5BA 4MO4A 4BC4A 2YJFA 3FLCO 5E84A 3EKUA 3D2FB 3LDNA 2E2NA 2UYTA 3FZKA 3VESA 3ZEUA 3TPQA 4EIAA 3HI0A 2Q36A 2A6AA 3FZHA 2GEMA 4B1UB 1X3MA 2FSNA 4BR7A 4FWNA 5EXWA 3H45C 3A5OC 3VPZA 2YJEA 2Q0RA 1MWKA 1RDWX 4DB3A 3LDOA 2P9KA 4WQ5C 2CH6A 1P8ZA 2ZF5O 3CJ1A 3VGLA 4BR0A 3CJ7A 2YI1A 4QS9A 4IJNA 3KZBA 1ZXOA 2D1KA 5BR9A 5CE3A 4A62A 5TKYA 1QZ5A 4FOIA 2Q2RA 1E4FT 4JD2B 2QM1A 2ZGYA 2YHXA 3H3OB 4RWTA 4EAHD 5AQGA 2P9NB 2GTDA 3MMVA 4FWQA 4H0VB 3WXIA 2F9TA 3M3ZA 4C23A 4JN4A 1BUPA 3ZEUB 2V52B 1NGEA 2WUSA 4H0OA 3BF3A 4AM6A 2IVOA 2GWKA 4L3QA 2QWRA 3H6EA 3ENOA 2Q97A 3U9ZA 1BDGA 4XEIA 3O6WA 3WXJA 4CD3A 3HBTA 1MA9B 2E20A 1V4SA 4H0YB 3TU5A 3VEVA 5F0XA 2P9KB 2KHOA 1XQSC 4BR9A 3CJCA 3FZLA 5ELZA 4JAXA 5ADXA 4CBUA 1QZ6A 4O8KA 4BRHA 2QWOA 4XH1A 2QWMA 3BUZB 4BRMA 3DJCA 2QWPA 3ATUA 1NBWA 2I7NA 5BPMA 5AFUH 5AQMA 3IDHA 3OHRA 3IUCA 3MN5A 2VCPA 3ID8A 3ZX3A 3AY9A 4RCHA 1NGFA 3LM9A 5JLHA 4PL7A 3ATVA 2E1YA 2IVPA 1V4TA 4MLHA 4B1VA 2W40A 2E2PA 3SK3A 5EX5A 4FSVA 5KQ8A 4WQ5A 1T6DA 5EY4A 1DEJA 2E88A 3WQTA 3BF1A 4CZGA 4H5RA 2QWLA 3MN7A 4PKGA 3W0LA 3QBWA 3VOVA 3A5MC 5EOYA 1QQMA 1HUXA 2A3ZA 4HTLA 3VF4A 5BPLA 3CJBA 1BA0A 5KQDA 1RGIA 2E8AA 2E2QA 4A2BA 3R6MA 5LY3A 1BOTO 1EQYA 1HKGA 3M1FA 4RTFD 2CH5A 4FWLA 4E1JA 1X3NA 4FWOA 3GG4A 4GNIA 4BC5A 4CI6A 4BRCA 4IJAA 1GLAG 2F9WA 3VEXA 1NGCA 3SMPA 1ZBSA 4CZEA 2QW9A 3I33A 4MLEA 3QB0A 3L4IA 4M7YA 4EHTA 2I7PA 1OKJA 1Z6RA 4BRFA 3IMXA 5KPRA 2P9SA 1E4GT 3MK6A 1Y64A 3H46O 4PL8A 4CZJA 3ZETA 2D0OA 5AR0A 3VETA 1C0FA 3B8AX 2ZGZA 1HKBA 2FSJA 4CBWA 5AQHA 3FE1A 3VERA 2FF3B 3AAPA 4XH5A 2DPNA 2ZWHA 4K42A 4BRIA 2HF4A 2FSKA 5FPDA 3F9MA 4IWVA 2HMPA 2NRHA 2YHYA 4BRAA 4EFHA 3O08A 3VF6A 5JLFA 2P9SB 5FPNA 4BC2A 3ZETB 1Z05A 4F9OA 5AQUA 4BRQA 3W3DA 1GLLO 3S41A 2P9UA 4CZFA 1H1VA 1MWMA 2GUPA 1DKGD 1NGJA 4CD1A 1HX1A 1KAYA 5ADXH 3CQXA 3KVGA 3QFUA 3RSEA 1GLFO 1KAXA 1TUUA 3WQUA 3DXMA 3H1VX 5F2RA 2V7YA 4BG8A 1S3XA 1GLEG 3DXKA 3LDLA 3IFRA 4FWPA 3R9PA 3VEZA 3FFKB 1HKCA 4BC3A 5BPNA 1NGIA 4IXCA 1S22A 3U8XA 4FOEA 4BROA 1X9JA 3M6GA 4FWMA 4O5FA 3SMSA 5BRFA 5BN8A 3EL2A 1SZ2A 1HLUA 1NLVA 4BGAA 2AP1A 2IIRA 3ULEA 2P9UB 5BREA 2ASOA 4K25A 5LJWA 4H0TB 2Q1NA 3WEEA 5JMVA 3MCPA 5KPTA 5BN9A 2GWJA 4CBXA 3FZFA 3JXUA 1T44A 1WUAA 4ISGA 3RSEB 1TYQA 2V7ZA 3DXMB 3SLCA 4H0XB 3BP8A 1JCEA 4NO7A 4WQ4C 4B9QA 5FPEA 1NGHA 3DXKB 3DWLA 3G25A 3EO3A 4CZHA 4I6MB 4IZ9A 3CETA 2GELA 1SQKA 3P4IA 4K41A 4B1YB 1QHAA 5AQQA 1C0GA 3GBTA 4FO0A 2YCHA 1SAZA 4FWRA 5AQJA 3UKRB 3HZ6A 5AQOA 3ULEB 3C0BA 1KXPA 4CZMA 3WEEB 3H1QA 4ISEA 2D0PA 2CGKA 4H03B 4DQ8A 2Q0UA 3D2EA 5AQNA 3WT0A 3UKUA 4FWKA 5E26A 1GLJO 1NMDA 1XC3A 1TYQB 3U4LA 3DAWA 5BRHA 1QQNA 5AQRA 5B8HA 1R59O 5FPMA 1Q18A 1DGKN 3ZX0A 4QS8A 3VEWA 4MO5A 1BWFO 1NGGA 2P9LA 2ASPA 1NGAA 3A0IX 3QBXA 4KBOA 3VF2A 4K43A 1LOTB 1RFQA 3JS6A 3VENA 3D7EO 4DCHA 4ISFA 3O1WA 2PBDA 4CZLA 1IJJA 3J8AA 4LC9B 3CI5A 3BEXA 4YDUC 1ATSA 3WUHA 1GLCG 2D4WA 1U2VA 2Q31A 2A5XA 4CJ7A 1NWKA 4IO8A 1YXQA 3C7NA 5BRDA 5F1XA 3UE5A 1YAGA 2YHWA 3D2EB 1U6ZA 4CZKA 2BUPA 1D4XA 3H3NO 2P9PB 5AZIA 3UKUB 4WQ4A 2HOEA 4A2AA 4M63C 2BTFA 2W41A 3VEOA 2E1ZA 4NB4A 3WXLA 3QDKA 3O80A 4BVOA 3QFPA 4EHUA 4AM7A 1XUPO 3CIPA 3AARA 3O8MA 5AQSA 4BQLA 3SJHA 2A42A 1K8KA 4DHYA 4B1WB 5I9EB 1GLBG 2P9LB 3U9DA 3ENHA 1ZC6A 3O4WA 2CGJA 2A40A 2NLXA 5AQXA 1TUYA 3LDQA 3CHWA 1T6CA 3LL3A 2A41A 4PKHA 1U2VB 5AZJA 4BG9A 2J4RA 2QWNA 3C7NB 4BR4A 2P9IA 4Z94A 4GY2B 4H0PA 4I6MA 1NM1A 3FGUA 3VGMA 5LJVA 2VYPA 3GOIA 2ASMA 1YVNA 2OANA 5AZIB 4WYBA 3EKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW8A 3THVA 2LSNA 3HXMA 3AVKA 3MX2A 2PYLA 1WNSA 4PUOA 4CF2A 2G8IA 1SUQA 1IBKK 1DT9A 3AAQA 4UY8O 1N32K 2NUBA 3AVNA 5AQIA 4ILHA 3WNEA 4B9MA 4N56A 3QO9A 2RPIA 3S3NA 1HJOA 1P90A 2DFFA 3ZCMA 3OYEA 1IG9A 5AQKA 3MXIA 4BRKA 2NRXA 2W6KA 4LF6K 4WE1A 4CK1A 4DFMA 4DU4A 4M3XA 3K9JA 4BR2A 1UAXA 2Q3SA 1Q82O 3EZ5A 1QQOA 3LPUA 3R8EA 4BRGA 3VQQA 1BO5O 1Z25A 5AQLA 1C1AA 3D2FA 3SAFA 1YUWA 3KLEA 4Y1DA 3A5LC 4CGJA 4FJGA 2O8FB 1EWRA 1VQKN 3VGKA 2UXCK 5AQZA 3MXMA 2AA4A 2P9PA 3HPHA 4BDPA 4ICLA 4I9LA 4E7LA 1LAVA 3K5NA 1WOQA 2A1RA 2E2OA 4OX9K 3DLLL 2VG6A 4YOVA 4PKIA 3MN6A 4ILJA 3WXKA 3HSCA 2NRWA 2VWBA 3AVFA 5FLXO 4CJFA 2O8EB 1ATNA 2VWJA 4RW9A 4OGCA 4JRPA 4HUFA 4JKBA 4ZTFA 1IV0A 1C0TA 2ITMA 1IG8A 2P9NA 3FLCO 5E84A 4DTOA 3KD1E 2UYTA 4B3SK 2ZJRL 3TPQA 2WBNA 2FC0A 4EIAA 5C10A 2Q36A 3KK2A 4CJQA 3WNHA 1LAWA 4AHTA 2VGMA 3WNFA 1RDWX 3P5JA 4DR6K 3B6PA 3CJ1A 1P8ZA 4DR5K 3TTCA 5SWMA 1T7PA 4IJNA 5BR9A 3ZLJA 2Q2RA 1RDUA 4JD2B 2QM1A 3KLGA 4JYAK 3H3OB 4RWTA 3NH1A 2HHHK 1JLEA 5KTQA 3ISNC 4KTZA 3QEPA 1NK0A 4KREA 1I39A 1NGEA 2WUSA 2O8CA 3BF3A 4AM6A 4B9LA 4OPJA 2GWKA 3H6EA 5HROA 2HBJA 3U9ZA 1BDGA 4XEIA 4LH5A 4FJIA 4FZZA 3HBTA 1MA9B 4U67L 1TKXA 1JL1A 1VHXA 4CJ4A 4JRQA 2P9KB 3LALA 4BE1A 3CJCA 5ADXA 4CBUA 1BISA 1UWBA 4MDBA 4O8KA 4BRHA 5JS1A 2QWMA 4CEQA 3DJCA 3OHRA 3VQAA 3V81A 3HOSA 3AY9A 4DTRA 3TSUA 4Z4HA 1QHTA 4DG1A 3ATVA 4JI2K 2GBZA 3RTVA 2X78A 4A59A 3SUNA 4FW2A 4MLHA 5J2MA 1TAUA 3SK3A 3ASMA 1FKPA 4IDKA 4LD0A 4E19A 3TI0A 4C8KA 1UA1A 1JL2A 4I2PA 1FXXA 4DUYK 3MN7A 4PKGA 1KSPA 3W0LA 3QBWA 3NF7A 3A5MC 1W2BM 1QQMA 1HUXA 2A3ZA 5BPLA 2UUBK 5M1PA 1HYSA 3U3YA 4X64K 1RBVA 1WSIA 4BE2A 4BWJA 3R6MA 3LP3A 1EQYA 3M1FA 2BANA 3I0RA 2CH5A 4DF4A 2E5LK 4FWOA 2O8BA 2BDPA 4IEIA 1S9EA 4E7IA 2G8KA 3A2FA 1GLAG 1KLMA 4B9NA 3O9QA 4DTSA 1VQ7N 4DSFA 1ZBSA 2OPRA 4M7YA 3L4IA 1QSYA 4W5OA 2YHBA 3ZSXA 3P39A 3CMEN 1FKOA 5KPRA 1E4GT 1K73O 1N34K 2RN2A 1QTMA 4G9ZA 3VETA 4F3TA 1Q7YO 3HM9A 3LDSA 3SPYA 1C0FA 2ZGZA 3AVGA 3AVAA 5AQHA 5D3GA 4KH6A 3ZT0A 3VERA 4HCCA 4N47A 3AAPA 4XH5A 2ZWHA 4K42A 3FFIA 3AVMA 2HHVA 5FPDA 1OVQA 1RT6A 3TSPA 4JK7A 2YHYA 2UXDK 2ATQA 3L2QA 3THXB 3TANA 3O08A 4CEFA 3I8DA 2XY8A 1ZBHA 2QKKA 4DR4K 5FPNA 3ITHA 4CJ3A 3RMBA 4BRQA 1RT1A 4NLBA 4FJXA 4IEEA 5JVHL 1IKXA 4YOUA 1MWMA 3V1RA 2GUPA 4TSXA 3O9TA 3N4PA 1DKGD 3KVGA 1VSEA 3RSEA 1GLFO 4X66K 3AV9A 4YHHK 3H1VX 2PZSA 2WOMA 1OH5A 2UU9K 4JKEA 4CJLA 4DTJA 1WSJA 1HNZK 3EE8A 1W97L 4B3TK 1YT3A 3TAQA 1RTIA 3HRGA 1NGIA 1S22A 1WSGA 4DSJA 2BGGA 4FM0A 3U8XA 4FOEA 1TKZA 1X9JA 4FWMA 1WLJA 3SMSA 2OYQA 1SZ2A 4XJXA 3RVCA 3ZSWA 2Z1IA 4DTNA 5KRSA 2IIRA 1KTQA 2ASOA 3OYFA 5LJWA 4H0TB 2Q1NA 4FCYA 3CF5L 3PX4A 1A5WA 2HHUA 4KKOA 4WFNL 3RMDA 1MU2A 1WUAA 1T8EA 1RTDA 1WSEA 2QEXN 1HNWK 5HLFA 2ETJA 3DXKB 3K57A 3T1YK 4O55A 4CJKA 4I6MB 5GAHP 2YNHA 3LP2A 3K5MA 1S1TA 4GV3A 1QHAA 4KAZA 3HT3A 2HVIA 1YHQN 3CC4N 4WFBL 1SAZA 4DUZK 5AQJA 5C15A 3K59A 1HNIA 3ULEB 4FYDA 5HRPA 1BQNA 2F8TA 2JLEA 2CGKA 4DQ8A 4DTUA 1VSLA 2XY7A 5A2QO 4DU3A 4CJTA 2KW4A 4CFBA 1GLJO 4IG0A 1YJWN 3AVBA 3E66A 4IDHA 1XMQK 3VMFB 1R0AA 4DTXA 4DSEA 4JEPA 4C8MA 4C8LA 3THYB 4LF4K 2ASPA 4K43A 4B8AB 3JS6A 4ISFA 1IJJA 3SV3A 3J8AA 4LF9K 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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