5JLHA

Cryo-em structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
EEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, cytoplasmic 2
publication title Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 93
structure length 374
sequence length 374
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5jlhA03
2Q0UA 3KHYA 1HUXA 3EN9A 3G25A 3H6EA 4H5TA 3VEWA 3IMXA 5FPMA 4BG8A 2P9PA 3BP8A 2D1KA 3O80A 4FWKA 1YVNA 4XH5A 4C23A 2V7ZA 1RFQA 4YDUA 4M63C 4CD3A 3FFKB 1QQNA 3R8EA 5AQMA 4JNEA 4M7XA 1Q18A 4FO0A 2ASPA 1ATRA 2KHOA 2P9LB 1DEJA 2P9UA 2CGLA 2D0PA 5AQWA 1KAZA 3CIPA 4PKGA 1GLBG 2W40A 1T6DA 2FSNA 3H1VX 4CZGA 2E88A 3EKUA 4JD2A 1BWFO 1SQKA 3ZETA 4FPBA 4A62A 4B1YB 2OANA 3C7NA 4H0YB 3P4IA 3FZMA 5AZJA 5BN8A 2HMPA 2QWQA 2GUPA 3ZEUB 3GDQA 4CZMA 1MDUB 2D0OA 1GLJO 3SMPA 4CZEA 4CJ7A 4ISEA 5KQ8A 2Q1NA 4EAHD 4H0XB 2F9WA 2FXUA 5AQKA 2D4WA 3FE1A 4NB4A 4PL8A 2E1YA 1LCUA 5AQNA 4BC4A 4JAXA 2CH6A 2HOEA 2NLXA 3A0IX 3L0QA 3VF6A 4K43A 4CZIA 1HLUA 3I33A 4BRKA 1GLDG 5AQIA 1C0GA 4FSVA 3VGLA 3HZ6A 3TU5A 3U4LA 3FZHA 1S3XA 1KXPA 1K8KB 1CZAN 3IDHA 4XH1A 4WQ5C 1DKGD 4Z94A 3WXLA 1EQYA 3VEXA 3SLCA 3ULEB 1ATNA 3QFPA 3EKSA 2WUSA 4CZKA 3MN5A 5AQZA 1ATSA 4RCHA 3VERA 5BPNA 3SJHA 2BTFA 4A2AA 4BRGA 1NGAA 5AQPA 3A5MC 3VPZA 3QMLA 3H45C 2PAVA 3IUCA 4FWQA 1BA0A 2ZWHA 3VENA 3VOVA 2Q2RA 4IZ9A 3VETA 3LL3A 1HJOA 5B8HA 2IVPA 4XH4A 3WT0A 3DXKA 3LDNA 4HWIA 5EXWA 4K41A 5JLHA 4IWVA 1X9JA 1MA9B 2P9UB 2GWJA 4MLEA 4O8KA 2Q0RA 3O5BA 1X3NA 4ISFA 4B9QA 2P9KB 5AQRA 4JD2B 3FGUA 3C7NB 2AP1A 4BRAA 2P9IA 3D7EO 4IO8A 4CBUA 1NGJA 1KAXA 5LY3A 3MDQA 2E2OA 3UKRA 3LDPA 3GL1A 3JS6A 3ZX3A 4A61A 2GELA 3CQXA 2A6AA 3CJBA 1GLLO 1NGCA 3L4IA 3H3NO 5BR9A 3AAPA 4I6MA 1NGEA 4CI6A 3MK6A 3EL2A 1NLVA 4PKHA 1J6ZA 1HX1A 3HTVA 5ADXA 2V52B 1HKGA 3ATUA 4WYBA 4BR7A 4JN4A 1SZ2A 2A40A 3A5OC 4FPAA 3FZLA 3LM2A 1TYQB 2CH5A 4BRFA 5AFUA 2NZTA 2FF6A 1ZC6A 3QDKA 5BRDA 2J4RA 3SMSA 5AQSA 4RTFD 2Q97A 1HPMA 3UKUA 2ASOA 3H3OB 4M7YA 4YDUC 4B1VA 3LDOA 1GLEG 3GG4A 1U2VA 1GLFO 3CI5A 2BUPA 2YHYA 4EHUA 1G99A 4CZJA 3O08A 2IVNA 3BEXA 5LJWA 5KPRA 4BRIA 2A5XA 2W41A 1MWMA 5I9EB 2E20A 4BRNA 4H5WA 4H0PA 4BQZA 3LDLA 2HF3A 3ZX0A 4DHYA 5FPNA 4ISGA 4EHTA 2YCHA 3A8YA 4IXCA 4EIAA 2P9SA 2ITMA 3MMVA 3HM8A 5EX5A 3DJCA 4FWMA 3CJ7A 1WUAA 3MN9A 3M6GA 4JHDB 3LM9A 3L6QA 3DXMA 4F9OA 1XQSC 3BF3A 3H1QA 2A41A 3BF1A 4QS7A 3GE1A 5F1XA 2GEMA 4I6MB 4MO4A 4BRPA 3BUZB 4FWLA 4BR9A 1V4TA 3WXJA 3DAWA 2P9PB 3VGKA 1Z05A 4FWPA 2E2QA 1Z6RA 3GOIA 1KAYA 2P9NA 2QWLA 1XUPO 2NRHA 3CQYA 2E2NA 4H0TB 2HF4A 4NO7A 4CBXA 4BR2A 1BUPA 5BRFA 5F0XA 1TUYA 3UKUB 3W3DA 5CE3A 3UB5A 2ZGYA 1U2VB 1YUWA 1GLAG 1BA1A 2YJFA 2ZF5O 3FZKA 1NGIA 4WQ4A 4PL7A 3CJAA 2IVOA 5AQLA 5AR0A 4BC2A 4BRDA 5BREA 1OKJA 3ZETB 5EVZA 4MLHA 1IJJA 1T44A 2QM1A 5AZJB 3JXUA 1NWKA 5AQOA 4QS8A 1ZBSA 1LOTB 4L3QA 3I8BA 3B8AX 3R9PA 3VEVA 4CBWA 3RSEA 4BRCA 3M3ZA 4BC5A 1S22A 3W0LA 3CHWA 1JCGA 2IIRA 3CJCA 2P9SB 3U9DA 5FPEA 2E1ZA 3D2EA 3WEEA 3ZEUA 1P8ZA 3O6WA 4FWOA 3DWLA 4B1UB 1NBWA 3M1FA 2FSJA 1BU6O 4DB3A 1NGFA 4BQLA 4DQ8A 3FLCO 1Y64A 5KPTA 1H1VA 3ZX2A 3H46O 5AQGA 1NGHA 4A2BA 2GWKA 3DXMB 4BRQA 3CJ9A 1YXQA 2ZGZA 4BVPA 3QBWA 3EZWA 4FWSA 4H03B 3IFRA 2ASMA 4B1ZA 2VWBA 1NM1A 3SK3A 5AQYA 3ID8A 4FL9A 5AQXA 4B1WB 2I7PA 1DGKN 3ULEA 1BDGA 1E4GT 1SAZA 4J8FA 1E4FT 2P9NB 5E26A 4RWTA 2V7YA 2QWRA 3F9MA 2QW9A 4H5NA 2QWMA 3CERA 3WXKA 3DXKB 5EY4A 3D2FA 1WOQA 2H3GX 4H5VA 1QZ6A 5AZIA 4BRHA 4KBOA 3O1WA 4CZLA 4XEIA 4H5RA 4BROA 1NGBA 2QWNA 5EOYA 3OHRA 3MCPA 3U8XA 3VGMA 2QXLA 1D4XA 5E84A 4BR0A 3MN7A 2EWSA 4BR4A 2VCPA 4GNIA 5AQQA 2P9IB 2A3ZA 2P9KA 3S41A 4EFHA 5LJVA 1TUUA 5TKYA 5AQTA 3RSEB 1IG8A 1V4SA 1RDWX 4H0VB 1QQMA 3UKRB 3O1BA 4BC3A 5AQJA 2AA4A 3D2EB 5FPDA 4BR5A 3WEEB 2FLOA 3HBTA 5AQFA 3QICA 2V51B 5BN9A 2QWPA 3WQUA 3WQTA 2FF3B 1YAGA 2FSKA 2F9TA 1ESVA 3HI0A 2Q36A 1HKBA 4BGBA 2CGJA 5JICA 5JLFA 4WQ5A 4QS9A 1C0FA 2QWOA 5ELZA 4MO5A 3ATVA 2I7NA 2VYPA 5KQDA 2UYTA 3WUHA 3CJ1A 4FOEA 3VEZA 3FR0A 1ZXOA 1HKCA 1BOTO 3ENOA 4CD1A 3A5NC 1BG3A 4BRLA 1R59O 5F2RA 4IJNA 2GTDA 3ENHA 1TYQA 5BRHA 5BPLA 4IJAA 4HTLA 3LDQA 3J8AA 3KZBA 2YI1A 3QB0A 1X3MA 3VF4A 4CZHA 5AQVA 3C0BA 1JCEA 3D2FB 1XC3A 2Q31A 3EO3A 4BG9A 1T6CA 4Y0WA 5ADXH 3KVGA 4K25A 5AQHA 4O5FA 5AZIB 4K42A 5BPMA 4FWRA 2P9LA 3VF2A 1GLCG 4WQ4C 2E8AA 2YHWA 5JMVA 3O4WA 5AFUH 1BO5O 3R6MA 1NMDA 4CZFA 2PBDA 3MN6A 1RGIA 4AM6A 1NGDA 3VEYA 1JCFA 1U6ZA 4E1JA 1QHAA 3O8MA 3TPQA 3GBTA 1QQOA 5KPZA 1MWKA 3AAQA 3AY9A 4BVOA 2A42A 2YJEA 3QFUA 2CGKA 2YHXA 2E2PA 2DPNA 3HSCA 4B1XB 4BREA 3VEOA 4LC9B 3U9ZA 3CETA 3WXIA 4H0OA 3A5LC 4FOIA 4JHDA 4PKIA 3FZFA 4FWNA 4BRMA 1QZ5A 4AM7A 5AQUA 3AARA 1K8KA 4GY2B 3VESA 4BGAA 3UE5A 1NGGA 4DCHA 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KHYA 4C8LA 3G25A 5FPMA 4BG8A 2D1KA 4FWKA 3HSTB 1YVNA 2HBMA 3SPYA 4BE7B 3VQ7A 4J2AA 1OVYA 2O4GA 1ASUA 1QQNA 3EE8A 5GIOA 4B9SA 4JKAA 4M7XA 5JS2A 3AGKA 1U48A 5CYMA 2G8WA 2G8UA 1YHQN 1DEJA 3HT3A 2P9UA 4FJKA 4JI3K 4MDBA 3EYZA 1L3VA 1N32K 1OH5A 3EKUA 4NYFA 4DFJA 3THXB 1EO1A 4DUYK 1S1WA 4H0YB 3P4IA 3FZMA 5C15A 2QWQA 3V1OA 3GDQA 3NVKA 4H0XB 2D4WA 3BZCA 3L4QA 3VQ6A 4F4KA 4CGIA 4BC4A 4AHCA 2WTUA 3NH2A 2GV9A 4CW7B 2CH6A 2HOEA 3F9KA 4DSIA 4DR5K 5HRPA 1IKVA 2YHBA 4ILHA 1W97L 1CLQA 3V9SA 3TU5A 5KRTA 1LAWA 1K6YA 3RR8A 4F3TA 1S3XA 1K8KB 1CZAN 3IDHA 4XH1A 2Z1IA 1DKGD 4AILC 1SKWA 4I9QA 3WXLA 1EQYA 3SLCA 3ULEB 1ATNA 2WUSA 2HHQA 4FVMA 3ALYA 1OH6A 5JS1A 5BPNA 1XNQK 2BTFA 3C6TA 4B9TA 4O5BA 4KTQA 3ZSZA 3MXIA 3H45C 2PAVA 4FWQA 2KZMA 4OKEA 1W7AA 4F3OA 1S1VA 2IVPA 3AVBA 4XH4A 3WT0A 3DXKA 4PA1A 4PQUA 3CCVN 5EXWA 4DTSA 1RILA 4IWVA 4AF1A 1X9JA 2P9UB 4C1NK 2GWJA 2Q0RA 4DWIA 1X3NA 4ISFA 3E01A 5KTQA 2DY4A 2P9KB 5AQRA 1RTIA 4NCGA 4DF8A 3SI6A 2IAJA 4LSNA 3D0PA 3SQ0A 2YNGA 4E1MA 1RCHA 2B5JA 1W9HA 3TI0A 3MDQA 4CHPA 3UKRA 3JS6A 4LF4K 4A61A 4WFAL 3VQ8A 3CQXA 5CZ1A 4DV5K 3L4IA 3M8SA 3AAPA 1KC8O 5HOOA 3HPHA 1YTAA 2V52B 4LSLA 5DMRA 5TKWA 4ELVA 4JN4A 1JL2A 2QKBA 4FLYA 4CF9A 4FK0A 2JLEA 3AVCA 2OYQA 1VSKA 4OGEA 4J2EA 2J4RA 4CERA 3C6AA 4KPYA 1D8YA 2ASOA 3H3OB 4M7YA 4KH5A 3H08A 4B1VA 4KH6A 1CXQA 4IEEA 2O8FA 3GG4A 3CQ8A 1GLFO 4LY7A 4DSFA 4O8UA 3LDSA 4BRIA 2W41A 2ZD1A 1BQMA 3PSFA 3QLHA 4FJNA 4H0PA 2E6LA 2Y1JA 1RTHA 3K9KA 4EP5A 2HF3A 1NK5A 1A5VA 1RT1A 3ZX0A 4KHPK 4EHTA 2JWKA 1K9MO 2YCHA 4IXCA 2P5GA 1NK6A 2P9SA 1VQLN 3E1YA 3KK7A 1K73O 4DLGA 5EX5A 2KTQA 3DJCA 2HBJA 4FWMA 4KV8A 3AVHA 1HNVA 3C6UA 2ATQA 4NXNK 1WN7A 4J2BA 3BF1A 4CK3A 2DFFA 5F1XA 1J9AA 3EEQA 2RHKA 4IDKA 4DQIA 4LH5A 4BRPA 1U04A 1BQNA 1TKZA 3VQDA 2KQ2A 4XJXA 4CFBA 4FWPA 4BDZA 4OPJA 2E2QA 2IOCA 1S6QA 2NRXA 3ID6A 3GOIA 1KAYA 2QWLA 3VTIA 3OYJA 2WFBA 4EP4A 4FJHA 2G8IA 1F21A 3HJFA 5A2QO 3TABA 1TUYA 4JS5A 1L5UA 3J7ZO 2ZGYA 4DF4A 1GLAG 2YJFA 4DFPA 4CF2A 4PL7A 1KQSM 3CJAA 4R79A 1VSJA 1OKJA 4MLHA 4PY5A 4IBNA 2HNZA 4JI0K 5AQOA 1NWKA 2Q3SA 1CZBA 3I8BA 1RBSA 3RSEA 1S22A 3U9DA 3CJCA 4QOZB 2P9SB 5FPEA 3DWLA 3ZT0A 3M1FA 3C95A 2HBKA 1Y64A 2G8HA 1QQCA 2GWKA 3KKRA 1HNXK 4E1NA 1YJ9N 3CJ9A 3MWTA 4PUOA 4B9UA 3OYAA 3AV9A 4IFVA 3DLHA 3DYAA 2ASMA 3SK3A 4I2PA 1RTJA 3CCSN 1DGKN 4J8FA 3ZT2A 4CJPA 5E26A 1R0AA 1NOYA 4GKJK 3LZJA 1XHXA 2VG5A 2EX3A 5EY4A 4CJRA 1WOQA 1QS4A 4W5RA 2OPPA 4H5VA 1QZ6A 2XRIA 4CIFA 1IBMK 3A2FA 1NGBA 3DM2A 3LANA 2P5OA 3MCPA 1UOCA 3WXMB 3KWGA 1GOCA 2QXLA 4BR0A 2IDOA 3TSPA 3VQCA 2QA4N 3AA3A 1OVQA 3KJVA 1YJNN 4CEQA 4M3WA 3S41A 1JXEA 1TUUA 4DTMA 5AQTA 3RSEB 4JS4A 4FJMA 1V4SA 3OYDA 3QNOA 4F2RA 4BC3A 2AA4A 5FPDA 4BR5A 2XHBA 1EKEA 1QSLA 3MXJA 3QICA 3WQTA 1YAGA 4CEZA 3ZYYX 3SAGA 2F9TA 1ESVA 1NJXA 3HI0A 4BGBA 2CGJA 4F8RA 4CCHA 2VGNA 4WQ5A 4QS9A 1C0FA 1N5YA 4MO5A 2F7TA 4E7JA 2JGUA 4DTUA 2C1IA 3FR0A 1W0HA 4RW9A 3G4SN 1BG3A 3MECA 4IJNA 1SKSA 3I0SA 1VQMN 4IJAA 4JKGA 4C8KA 2GBZA 4ZTJA 5AQVA 1IKYA 3S3NA 4YHHK 4DR4K 4K25A 3E9LA 4O5FA 1TAUA 5BPMA 4FWRA 3D6RA 2P9LA 4WQ4C 1BO5O 1NMDA 1IG9A 3AGRA 1O13A 1WSEA 1XHZA 1VSLA 4BWMA 1NGDA 3VEYA 5SZTA 3AO1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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