3AGRA

Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from neospora caninum
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
591
structure length
591
Chain Sequence
AETEKHISAGKARLQDLRDAERRCHDAWQAIVVIDGGSSATRTNVFLAKTRSCPRGGRHIDPDSIRLLGAGKRFAGLRGVLESWLDAYAGEDWESRSVDSKRLFQHVPEMEDSARGLMQLLEDDAVRILDEKLTEEQKVQVQAMGVPVLLCSTAGVRDFHDWYREALFVILRFLINHPKPGHGYKFFTNPEWTRPITGAEEGLYAFLALNHLSGRLGEDPARCYVDEYGMKQCRNDLVGVVEVGGASTQIVFPLQDGTALPSSIRAVNLQHERFLPSRFPSADVISVSFMQLGVASSSGLFFKELCSNAEFRHQGICYNPCIFRGFRQACSAGDVEILPDGTIVVDEDVRKNKLKPVATYCSANNPEISFKAMNEIQCRVNKIDPTKSLAERLRIDDCFQIVGTGDFDTCQAQVEELLVSPRFPLPANIEAASSGFESVGQVFKFASTASPMVITGGAMYASISTMQGLGLLPKDFQGDLEQLIAASRTYCSSPVVNNGDGLVIQLPNAEQKLTSMNYDLCKTIALTVSLLQHMEAGEHKPSSISWQKTVVGPDGKPRADLGWHVGAILHRVLFTEEWGRTAYETGFTYNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Neospora caninum
publication title Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from Neospora caninum
rcsb
molecule keywords Nucleoside triphosphate hydrolase
total genus 174
structure length 591
sequence length 591
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2010-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA02
4A5BA 4A57A 4KH5A 4KH6A 4JEPA 4A5AA 3AGRA 4KH4A 4A59A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VQEK 1IBMK 3CMAN 4AH9A 4DCHA 2W6LA 4IJAA 1J5OA 1TUUA 4FZZA 2WOMA 5JLHA 1ATRA 3MN9A 3N4PA 3SPZA 1TGOA 5DMRA 2P9PA 4FPBA 2Y1IA 3ZYYX 1EQYA 4PKIA 3OYCA 4JI2K 1CZAN 1W0HA 3VTHA 1QSSA 2VGNA 4PKGA 2HHHK 3CJBA 2E88A 3K0SA 3O9TA 3M8QA 1T6CA 3KD5E 4CZGA 2ZJQL 3MDQA 1YF5L 1SKRA 1FK9A 2A5XA 3E9LA 5MLCQ 1H1VA 1NGHA 2HBKA 3O9RA 2I5JA 2NRZA 3DJCA 4BG8A 2RHKA 5AFUA 3ENHA 1RBRA 4HTLA 1LAWA 3ALYA 3VEWA 3OS0A 2NNWA 1REVA 5C0YA 3WXKA 4BRHA 1ITGA 1N5YA 3EKUA 3CYMA 4KTWA 4N47A 4BRFA 3E1YA 2PFUA 3DLKA 3QO9A 1HNZK 2O8BB 2A3ZA 2ASMA 4OPAA 1K8AO 1MA9B 3AVCA 3ZSYA 4B8AB 3LDLA 5M1NA 4W5NA 4C8OA 1WAFA 3CJAA 3HJFA 2AP1A 4J2AA 3Q7CA 5KRSA 3H3NO 4E89A 3R9PA 3WQTA 1V4TA 3OYNA 2V51B 3OW2M 4ILJA 1SL1A 1IKWA 3O08A 3O3GA 2YX6A 2HVHA 1HQEA 3UE5A 2E20A 2I7PA 5K14A 1GLBG 2EWSA 4A2BA 1QE1A 3OBYA 3V9WA 4MLHA 5AQTA 3ZEUA 5LMNK 5C25A 3AVFA 1VQON 5LJVA 2NZTA 3E9PA 1VQ7N 3CM5A 4H4MA 1NK4A 4DR6K 1L3TA 3SZ2A 5TKWA 2HNDA 5AQHA 4CJEA 4CEDA 1RGIA 1D9FA 3QEWA 2P9KB 4RW6A 1WB9A 1TKXA 4B1UB 4JD2B 4CHQA 1E4GT 1IH7A 2X74A 5IT9O 4MLEA 4JV5K 4O55A 4IOCL 1ZBLA 2CH6A 3QEPA 1WSJA 2EHGA 3QEIA 4FSVA 4FVMA 1BCMA 3K58A 5JS1A 2VCPA 1RBSA 1NJYA 3O9SA 4PQUA 4LH5A 4YORA 2XO7A 3DOKA 1Y64A 4BQZA 4ISFA 2BANA 1W2BM 5BN8A 3SBTA 1W7AA 2Q0RA 5M1FA 4RCHA 3HVRA 1J9AA 3BGRA 4ILHA 1Q7YO 4M3TA 3KLFA 4ZTJA 3DMJA 4CJTA 3AA3A 3KK2A 1RT6A 2P9LA 4QS9A 5HLFA 4CZEA 2P9NB 1XMOK 3VMFB 3RTVA 3I55N 3CFRA 4CK3A 1S1UA 1ZBSA 3LDSA 3QIPA 1S1TA 4DG1A 1JCGA 4NCBA 3SI6A 2FXUA 3FZLA 1ESVA 1A5XA 4QS7A 3J8AA 3WT0A 2QA4N 4CEFA 4DTNA 2IVOA 3H46O 3FZKA 2QM1A 1X9WA 3RWUA 4CFDA 2CH5A 1FKOA 4FJNA 2D0CA 2ASOA 3HSCA 3V9ZA 4CJQA 2VWJA 4Y1DA 4AHTA 4CJSA 4IBNA 1NJXA 5CYQA 4FJ9A 4IFVA 4KPYA 2YJEA 4CZHA 4JKGB 1QSYA 4BY9C 2AJQA 4A5BA 3CCSN 2F8TA 5GADP 3SV3A 5EOYA 4V19S 3ATUA 1J53A 3KKRA 4CFCA 1RT2A 4CF9A 3QINA 3AVLA 1L3UA 3AA5X 3QBXA 4I9LA 1HNXK 2OA8A 2QWMA 1EXQA 5AQZA 4LFBK 1S9EA 1YTUA 1C0MA 2B5JA 5AZJA 3IDHA 3E9OA 1YUWA 3F9KA 4CD1A 3EL2A 3SAGA 1VSEA 1L3VA 3PIPL 1SL0A 4FWKA 4KRFA 5BR9A 3C6TA 2P9UA 1XUPO 4PL8A 1TAUA 1U48A 4H0XB 2G8WA 4CW7B 3BF1A 3DRPA 3OYFA 1GOCA 3DOLA 1RTJA 3KLIA 3RRGA 2CGKA 3NH0A 3K57A 3O4QA 3THYA 1S1WA 3LM9A 2PZSA 4OPJA 3T1HK 4DS5A 3DI6A 1Z05A 2O8DA 4I2QA 3TSPA 3HO1A 4DSKA 4CHYA 1YJWN 3MEDA 3S3NA 3O1BA 1NK6A 1ZBFA 4LF4K 1Q8IA 1VSDA 3GDQA 1XI1A 2ETJA 5CZ1A 5J2MA 4OKJA 4MDBA 4E0DA 3OYKA 1XHXA 4DV2K 3MWPA 4H5WA 2G8FA 1E3MA 3DLRA 4CIFA 2YHXA 1HYSA 2HF4A 3DLEA 2A1RA 4Z4FA 1WBBA 3C65A 4IG3A 4QAGA 4GNIA 1N33K 2YNHA 3M8RA 2FC0A 1G99A 3Q7BA 4F2RA 4DFPA 3BDPA 3FLCO 4CK1A 3HRGA 5AQYA 1NJWA 1N8RO 1IKYA 2F8SA 4CECA 1SL2A 2VQFK 4DV6K 5GINA 5CHIA 1HYVA 4AQYK 1HKBA 1WOQA 3JS6A 5BPNA 2ZGZA 5F1XA 5AQFA 3NGIA 2GUIA 2VG5A 3SUPA 1P8ZA 3AY9A 2ZE2A 4BROA 3CCQN 1S3XA 1GLJO 3CQXA 4JRQA 3HP6A 1S1XA 1LAVA 3ENBA 5F0XA 3CMEN 1KAZA 5GAEP 5BRFA 1X9SA 3G71N 4NCAA 4ZTFA 1SKWA 3OYMA 1XMQK 1Q9XA 1LW2A 2FBYA 4NYNA 5E26A 3O6WA 4AILC 3QIOA 4BWJA 3PIOL 1JLAA 5JS2A 4B3SK 5FRMA 3V9UA 4CEOA 3P38A 4EP4A 3F9MA 4FLYA 3ATVA 4DTXA 2BH1A 2GTDA 5GIOA 4YOTA 2I7NA 3ISNC 1NKCA 2VWKA 5TKYA 4FK0A 2IVNA 2GELA 4U7BA 4JI6K 3I0RA 3IS9A 1Q86O 4DSIA 3OYDA 2E2NA 1VQNN 2OPPA 2QEXN 1EETA 5BRHA 4NXMK 4IOAL 4BDPA 3RMDA 1I3AA 4K0KK 1BWFO 3ZETB 2O8FA 4DV5K 3BEXA 5J2QA 2V52B 2ZD1A 4FJXA 4CJFA 3H08A 1QTMA 4WYBA 3AVMA 4YOVA 2KW4A 4CJPA 2HNZA 2E8AA 3T3FA 4CHNA 4CJ3A 4BE0A 3NF9A 2QXLA 4GW6A 4HCBA 1U2VA 1QQOA 2IC3A 1U4BA 3TWHA 3EYZA 1KAXA 1HPMA 1Z6RA 2OTLN 1YJ9N 2VG6A 3S3OA 4IFYA 4B9LA 4IKFA 4Z4GA 1KFDA 2FF3B 1G15A 1X3MA 4FZYA 1KVBA 4JI5K 2YV0X 4WE1A 3W3DA 4QCLA 2JWLA 2A40A 4A59A 1VK0A 3D2EB 1ASWA 3LALA 4BACA 3PSFA 4FCYA 2HHUA 1RBTA 3QDKA 5AQLA 3AVGA 1K8KA 3SJJA 4X65K 1U04A 3SPYA 1YJNN 3CCVN 2VYPA 1D4XA 1JLFA 1JCEA 3TANA 4CJ7A 4DLEA 3WNFA 2KHOA 5C24A 4E7IA 4DV1K 1Q18A 3S41A 4C8LA 2RN2A 1S72N 4BC2A 2BDPA 3RVCA 4BC4A 5J2PA 3VEOA 3MK6A 5EX5A 4OLBA 4NLBA 3EKSA 3RSEA 2HHXA 5FDLA 3VA3A 4NYFA 3I0SA 4JHDA 3SMSA 3VEVA 4O4GA 2P51A 4FJLA 4C1NK 2YHBA 4KTQA 3L2RA 4H0PA 3DYAA 2D0OA 3NDKA 4E19A 1IO2A 3PLAA 4M45A 4BVPA 3WEEA 4U67L 2ZM6K 4E7KA 4DSJA 3RR7A 3L3UA 4YOWA 2OZMA 3ZT3A 2HBJA 5HP1A 3A0IX 3TTDA 5AQUA 2B4JA 5AQXA 4BQLA 3D0PA 5FRNA 3MCAB 3ZT0A 2YI1A 3NH2A 4DR1K 1IKVA 3KZBA 1UA1A 4CF1A 3WEEB 5CZ2A 3CPEA 4ZHRA 3SQ2A 1HLUA 1NG9A 3MXIA 3OVNA 3HSTB 5AQQA 4OO1J 1A5WA 2D0AA 1I39A 5HRRA 1SS6A 1VSFA 3FFKB 4K25A 4KHNA 2WC9A 4NCGA 5T7BA 4DFMA 1C0TA 4FJ5A 1WLJA 1RTHA 1BCOA 2O8CA 2HSTA 1NK0A 1U49A 2XY7A 4BRQA 3AGKA 4PY5A 2QI2A 3OA9A 5C42A 4KKOA 1VQMN 2FSNA 5ELZA 4E7JA 1TL3A 2B6AA 4CHPA 1TUYA 3VENA 1ZBHA 5KRTA 3FZHA 3J81O 2Q31A 3KWIA 4JI3K 2O8CB 2XHBA 3CQ8A 1HPZA 4CFBA 3NMUA 3K5LA 3CCRN 2GUPA 4DQRA 5AQPA 2YNFA 3LP2A 4GV6A 1BDGA 3O80A 5M1KA 4RW4A 3LAKA 5KI6A 4FM0A 4JI4K 3BZKA 3OYJA 3C6UA 2QWLA 3EE9A 4LF6K 1NMDA 4DR2K 4FO0A 3U9ZA 1KD1O 4CGDA 4M3XA 3TAPA 1LWFA 1W9HA 4I6MA 5AQVA 1NOYA 5CYMA 1M90O 4A5AA 2P9PB 4CHZA 3IG1A 2D0BA 1T05A 1JLBA 4FLZA 4PA1A 4Z4CA 2NRXA 2UXCK 4B1YB 3V81A 4CJLA 5KPTA 3RR8A 4DKWA 4FJKA 2DPNA 2ZQBA 5FROA 1KRPA 1S1VA 3THWA 4CBUA 2PYLA 1TK5A 4X64K 4JK7A 2O4GA 1GOAA 4K42A 4CEAA 4FL9A 3DLLL 3WNEA 4W5QA 3ZSRA 1BGXT 1RNHA 3UKRA 3HTVA 1RDWX 2X6SA 4CD3A 3QFUA 3CJ7A 3AV9A 4JLHA 4CIEA 4DUZK 3J7YP 5EU7A 3KHYA 4CGJA 4FXDA 3SNNA 2OTJN 4KH6A 3VQQA 4CGIA 4A61A 2KTQA 4GY2B 4I2PA 1BQNA 2UYTA 3ZSZA 4FJJA 2BUPA 4PUOA 1S6PA 2Q36A 2P5OA 4I9QA 1BA0A 2V7ZA 3PX4A 4LH4A 3HOTA 4LFAK 2W40A 1RDAA 2NLXA 5E84A 1BA1A 4CZJA 4OPHA 4E1NA 2NRHA 3JAMO 2GEMA 3L2WA 3AO1A 4JAXA 4H4OA 4H5TA 2DFEA 4IEIA 3VGMA 5D3GA 5DK5A 3G4SN 3ZT2A 3SAHA 3WXLA 2E5LK 5BN9A 4BG9A 3I56N 3LZJA 3DM2A 3L6QA 4H0VB 3ZEUB 1KFSA 4DMNA 3TAMA 3MECA 4G9ZA 3C6HA 3D2FA 2VGMA 3B6OA 2X78A 4JN4A 1YXQA 4BRPA 2YNIA 3AGRA 3AO2A 3KK1A 3VQ6A 1KVAA 1SZ2A 2KFZA 4MFBA 4J8FA 3V1OA 1NGCA 3KKSA 4XIUA 3ASMA 3GL1A 1RBVA 2NRWA 2KQ2A 4BRNA 4FWOA 4DTOA 3IUCA 1K9MO 4EZ9A 4CF8A 5GAHP 3WXMB 3V9SA 3ZX0A 4W5OA 4B3OA 3E01A 3OYGA 1LWEA 2NRTA 3LPTA 3AVHA 4ID1A 4FLTA 1IG9A 3L4IA 3GE1A 2FBVA 2ZGYA 1LCUA 2IS3A 2E6MA 1C1CA 1N34K 1XNQK 3BUZB 4JYAK 1D9DA 3CD6N 5KPZA 4FLVA 4DV4K 4LD0A 4X62K 4FWQA 3MN6A 4FWSA 4YY3K 4R5PA 4A57A 3THXA 3CCJN 3O3FA 3WXJA 2Y1JA 1FXXA 2F9WA 3OYHA 4OPKA 1FW6A 1RT7A 4BGBA 1XHZA 4EP5A 1BIUA 2F9TA 1WBDA 3VPZA 1U45A 4LC9B 2W41A 2HMPA 1L5UA 2P9LB 2Z1HA 2QTDA 4F8RA 3BY5A 2P1JA 4BREA 4CGHA 3K5OA 4CE9A 3WNGA 3SCXA 4BR4A 2X6NA 3B6PA 4CZMA 1HQUA 4MO5A 1KAYA 3K59A 3EO3A 2W6KA 5C10A 3EY1A 1HR0K 3CCLN 4WF9L 3VQPA 2YJFA 1JL2A 3ULEA 3F2KA 2ITGA 1A5VA 4WCEL 1QQMA 1JLQA 3OY9A 4HUEA 1NNEA 2ITMA 4FJ8A 1FKPA 4M3YA 3DXMA 1JXEA 4OGCA 2HHQA 1NJIO 3SMPA 3SK3A 3VQ7A 3QNOA 5B8HA 3LPUA 1VRTA 4BE1A 1HX1A 3KLGA 2ZF5O 4IG0A 4J2DA 4HCCA 3SLCA 4IWVA 3P31A 4FVUA 4DR7K 4HWIA 3CCEN 5FLXO 4UY8O 3NE6A 3AA2A 4WFNL 3WNHA 3MN5A 2Q0UA 3R1XA 3NCIA 3ZSVA 3DXMB 4EHTA 3U4LA 3K9JA 5AZIA 4CZKA 5AZJB 4RWTA 2E1ZA 3LZIA 4DTPA 2FBTA 1U47A 2HHTA 4CEEA 1T44A 4FW1A 3ID6A 3TAQA 1M1KO 3QERA 3MAQA 5AFUH 2P9UB 3CI5A 4E7LA 1JLCA 3WUHA 3ENOA 4KBOA 1LWCA 3DLHA 5HRNA 1SKSA 3G25A 4H0TB 1NU0A 1BU6O 3MEEA 4AM6A 1QVFM 5EY4A 3NBPA 4IJNA 3SQ0A 3DLBA 1RDCA 1Q82O 3THYB 4N76A 4JI0K 5IWAK 4B9QA 2OANA 1Q81O 2YHYA 3H1VX 2O8DB 3EEQA 3VQ9A 4Y0WA 3MX5A 3LP3A 4XH1A 3VQAA 2HB5A 3HZ6A 5AQWA 3VETA 2P9IA 3H1QA 1BHLA 2FF6A 4KI6A 2NRRA 2OPRA 2YHAA 1MDUB 1C0FA 1CZBA 1VQ5N 3U6FA 3K5NA 4CJRA 4DR3K 1IG8A 4IXCA 1HJRA 2OPQA 4CIGA 4ID5A 3IFRA 2O8EA 3A2FA 2P9IB 4O0JA 1ILYA 1RT4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A5B A;  4A57 A;  4KH5 A;  4KH6 A;  4JEP A;  4A5A A;  3AGR A;  4KH4 A;  4A59 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VQE K;  1IBM K;  3CMA N;  4AH9 A;  4DCH A;  2W6L A;  4IJA A;  1J5O A;  1TUU A;  4FZZ A;  2WOM A;  5JLH A;  1ATR A;  3MN9 A;  3N4P A;  3SPZ A;  1TGO A;  5DMR A;  2P9P A;  4FPB A;  2Y1I A;  3ZYY X;  1EQY A;  4PKI A;  3OYC A;  4JI2 K;  1CZA N;  1W0H A;  3VTH A;  1QSS A;  2VGN A;  4PKG A;  2HHH K;  3CJB A;  2E88 A;  3K0S A;  3O9T A;  3M8Q A;  1T6C A;  3KD5 E;  4CZG A;  2ZJQ L;  3MDQ A;  1YF5 L;  1SKR A;  1FK9 A;  2A5X A;  3E9L A;  5MLC Q;  1H1V A;  1NGH A;  2HBK A;  3O9R A;  2I5J A;  2NRZ A;  3DJC A;  4BG8 A;  2RHK A;  5AFU A;  3ENH A;  1RBR A;  4HTL A;  1LAW A;  3ALY A;  3VEW A;  3OS0 A;  2NNW A;  1REV A;  5C0Y A;  3WXK A;  4BRH A;  1ITG A;  1N5Y A;  3EKU A;  3CYM A;  4KTW A;  4N47 A;  4BRF A;  3E1Y A;  2PFU A;  3DLK A;  3QO9 A;  1HNZ K;  2O8B B;  2A3Z A;  2ASM A;  4OPA A;  1K8A O;  1MA9 B;  3AVC A;  3ZSY A;  4B8A B;  3LDL A;  5M1N A;  4W5N A;  4C8O A;  1WAF A;  3CJA A;  3HJF A;  2AP1 A;  4J2A A;  3Q7C A;  5KRS A;  3H3N O;  4E89 A;  3R9P A;  3WQT A;  1V4T A;  3OYN A;  2V51 B;  3OW2 M;  4ILJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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