3AGRA

Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from neospora caninum
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
591
structure length
591
Chain Sequence
AETEKHISAGKARLQDLRDAERRCHDAWQAIVVIDGGSSATRTNVFLAKTRSCPRGGRHIDPDSIRLLGAGKRFAGLRGVLESWLDAYAGEDWESRSVDSKRLFQHVPEMEDSARGLMQLLEDDAVRILDEKLTEEQKVQVQAMGVPVLLCSTAGVRDFHDWYREALFVILRFLINHPKPGHGYKFFTNPEWTRPITGAEEGLYAFLALNHLSGRLGEDPARCYVDEYGMKQCRNDLVGVVEVGGASTQIVFPLQDGTALPSSIRAVNLQHERFLPSRFPSADVISVSFMQLGVASSSGLFFKELCSNAEFRHQGICYNPCIFRGFRQACSAGDVEILPDGTIVVDEDVRKNKLKPVATYCSANNPEISFKAMNEIQCRVNKIDPTKSLAERLRIDDCFQIVGTGDFDTCQAQVEELLVSPRFPLPANIEAASSGFESVGQVFKFASTASPMVITGGAMYASISTMQGLGLLPKDFQGDLEQLIAASRTYCSSPVVNNGDGLVIQLPNAEQKLTSMNYDLCKTIALTVSLLQHMEAGEHKPSSISWQKTVVGPDGKPRADLGWHVGAILHRVLFTEEWGRTAYETGFTYNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Nucleoside triphosphate hydrolase
publication title Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from Neospora caninum
rcsb
source organism Neospora caninum
molecule tags Hydrolase
total genus 174
structure length 591
sequence length 591
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2010-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA02
4KH6A 3AGRA 4A57A 4JEPA 4A59A 4A5AA 4KH4A 4KH5A 4A5BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QTDA 1MWKA 1T6CA 4I2PA 2YNGA 3EZWA 3MX5A 4OJRA 4UY8O 3MN5A 3IDHA 4IBNA 3DMJA 4PY5A 1RDUA 4E0DA 5JVHL 2P9KA 3VOVA 3L2VA 4HUFA 3O6WA 3CCUN 1KVCA 5GAGP 4W5QA 2J4RA 3TI0A 2ZF5O 3O9RA 3SBGA 3AVFA 5J2NA 1F21A 4B9QA 1BI4A 3AARA 4CJLA 4BROA 4FJLA 2CGKA 2YKMA 1NKBA 3C65A 2G8WA 4B9LA 2Q3SA 3CCEN 4FJ5A 4I6MB 2O8EA 3K5OA 4IZ9A 3WXMB 1HYSA 4GKJK 3CJAA 3AO5A 1KCFA 5C0YA 4AF1A 1I94K 4C8NA 1U45A 1JXBA 3R9PA 4AHUA 1M90O 2WTUA 3NGZA 3QBXA 3H08A 5CY4A 1LOTB 3N4QA 4R5PA 4JD2A 3CG7A 4FJ7A 2NLXA 3TU5A 1WSIA 4DV6K 4CEFA 3NE6A 3CCJN 4IOXA 3ID6A 1SQKA 3CCVN 3OYHA 3NVMA 4CZHA 1S72N 4IFYA 2CGJA 4FWLA 2A41A 4KHPK 2HSTA 1HLUA 4M7XA 2X74A 3UKUB 1BWFO 3EL2A 4KAZA 4RTFD 5B8HA 3DYAA 5J2PA 4FJHA 4CBWA 4CHOA 1WSEA 4CZGA 1N5YA 2HMPA 3FZLA 4BWJA 4Z4FA 3MN9A 3P39A 4I9QA 2AJQA 4CHZA 3G4SN 4GY2B 4C1NI 4O44A 4AM7A 4Z94A 3ZT0A 4LF6K 3DLEA 5E26A 1KVAA 4DLGA 3MEDA 1JCEA 3ISNC 3QFPA 4E1MA 3KD5E 4CGHA 3E1YA 2IVNA 4HCCA 3MAQA 3LDOA 1EP4A 4WF9L 3HTVA 3KLIA 4FPBA 4FJKA 1QHAA 1BISA 3JXUA 3F9MA 4RG8A 5BRFA 2NRTA 4DR3K 3SQ1A 1L5UA 3J7YP 3VQ8A 1YVUA 1XC9A 2D5RA 3ULDA 3LDNA 1BQNA 3B8AX 3ZT1A 4JHDA 3UE5A 2KZMA 1SV5A 4H5TA 3WEEB 2E6MA 3CFOA 3V9ZA 4C8OA 4IFVA 4BRLA 2HF4A 4DCHA 2VCPA 4XH4A 4JI7K 4E7KA 4FVUA 1JLFA 5AJ3K 3OS2A 4CCHA 1CZAN 3PSFA 3DLBA 3LP1A 5CYMA 3B6PA 1YXQA 2G8KA 1TL1A 1JCGA 3MWTA 5EU7A 3VQ5A 4M41A 3T1AA 4BGBA 3SUOA 2Y1JA 1KXPA 5AQXA 2DPNA 3DOKA 2WUSA 3TWHA 3ZX3A 3ZCMA 4PKHA 3NF9A 4JKAA 4FWRA 1U6ZA 4BC2A 3C94A 5LY3A 1CXQA 4MO4A 4LC9B 2PYJA 4DSIA 1A5WA 4M3UA 3KZBA 4KI4A 1ATNA 1E4FT 4OLAA 1WNSA 4FJ9A 2A6AA 2V7YA 2FLOA 3NGYA 2FBTA 1RDBA 2RN2A 3BF1A 4JKCA 4B1ZA 4I6MA 1TK8A 2FSNA 2UXDK 3DLGA 4M3ZA 2HBKA 2YJEA 3V9SA 3K5LA 1HNZK 2XY6A 5J2MA 3DM2A 4KV8A 1TK5A 4EHUA 4FVMA 1XWLA 1BGXT 3QINA 2F4VK 1ZC6A 4LD0A 1K8AO 3O4WA 4M42A 1VSKA 3P31A 3OYAA 1RT2A 3GG4A 4BACA 1Y97A 4A2AA 4A59A 3AVNA 2AP1A 2D0BA 3IMXA 4CEAA 4CI6A 1Q7YO 4IKFA 4A5BA 3OS1A 4CEBA 3VTHA 3DAWA 3NHGA 5C24A 2BUPA 2YKNA 3UKUA 1ASVA 2UXBK 4XH1A 3VQCA 3EZ5A 5LJWA 4R79A 3ZYYX 4CZLA 4CF2A 1NGAA 1NG9A 1QQCA 1GLBG 1XQSC 4OO1J 2I5JA 3ZSYA 2YNHA 4KFBA 3FE1A 4EZ9A 3PX4A 3VEXA 1RFQA 3AAPA 2E2NA 2NUBA 3FZMA 3DRRA 3SMPA 1T8EA 4ILJA 3HVTA 2XY5A 1NGGA 3HO1A 1KAYA 5AZJB 1SL1A 1BCMA 3VEYA 1Q18A 3SK3A 5AQNA 5FRNA 1XHXA 1WN7A 5AFUH 3OYGA 1VQ5N 4G1QA 3THYB 1HPZA 4CJRA 4NYFA 5TKWA 3ITHA 1NJXA 4HTUA 2QWRA 4FM0A 3FZHA 4CECA 2UYTA 4PUOA 4B9MA 1BDGA 5BR9A 2FSJA 5SWMA 4N76A 1IJJA 3WEEA 3AA5X 3ZT4A 3VTIA 2XY7A 1EKEA 3T1YK 1H1VA 1QVFM 1GOBA 4KHSA 3R1XA 1TAQA 2DFFA 3QIOA 1FW6A 4CHYA 3ZX2A 4DR4K 3ZLJA 1REVA 1BIZA 3K59A 3SYZA 2OANA 1K73O 3V1RA 3C6HA 3L8BA 2GUIA 5BREA 3L6QA 5F0XA 5GAHP 4H5RA 4C23A 3RVCA 3MK6A 1T05A 4B1XB 3CQYA 5HRPA 4LFBK 1S3XA 3D2FB 3L4IA 3HT3A 1E4GT 3VF2A 1KD1O 2KFNA 3VERA 3KLEA 4DTXA 5JS2A 4CJ7A 3MN6A 2HBJA 1OH5A 4AM6A 4DSJA 3ZEUB 1NK7A 1L3TA 1D8YA 3SQ0A 4JKGB 4OGEA 4FWSA 2GWKA 4JK7A 1T44A 3SBTA 4GW6A 4BDZA 3O8MA 2XHBA 3VQBA 1VSFA 1SL2A 4E7LA 4DF4A 3CHWA 4QAGA 5HLFA 3B6OA 3LDLA 3W0LA 3WNFA 4WQ5A 3P83D 3WQTA 3THVA 1Z05A 1N33K 1YTAA 4A5AA 1RT6A 1Q9YA 5FPNA 3QEIA 3L2WA 5AZIB 1XUPO 1FJGK 3QBWA 1Q81O 1MU2A 2JWKA 4FYDA 4AHTA 3QERA 3SQ2A 2IVOA 1IKXA 3HL8A 3VN5A 1QQMA 2VWJA 4GV6A 4FWOA 3SZ2A 5LL6Z 1HMVA 4FWKA 3O3FA 1DKGD 1P90A 1B9DA 3LP3A 1JCFA 3V9WA 4AQYK 1VQPN 1EWRA 5GAEP 1TYQB 4F4KA 2QA4N 3EYZA 2VG7A 1T03A 4Z4EA 4BDPA 1OVYA 1C1AA 1J5EK 4EP4A 3G25A 3GDQA 3OYKA 1NMDA 2QKBA 2A5XA 3H3OB 4QS7A 1K8KB 4K0KK 3DLHA 3NDKA 3O1BA 1NGBA 4FCYA 3AA4A 4BRKA 4BG9A 2HNZA 4DSKA 3L0QA 3HOTA 4BRNA 1ITGA 4CK3A 5AZJA 3MEEA 3GE1A 5HBMA 2P9SB 2VG5A 3EKSA 2FXUA 4JV5K 3THYA 3TAPA 3TR8A 3AAQA 3CIPA 2YX6A 3RR7A 4QS8A 3ZSQA 4YY3K 2E8AA 1VK0A 4B9UA 2KTQA 2XY8A 3K5NA 2Q2RA 1GLAG 3TAFA 2Q97A 2YHWA 3SMSA 3CQ8A 3J8AA 4FZYA 4K43A 4WFBL 4M3RA 2W42A 4B3MK 1RBVA 4BE1A 3QNOA 3LM9A 1HQUA 3CC4N 3A2FA 1T7PA 1I39A 2E4LA 2RKIA 3BDPA 4FJ8A 2O8FB 4BQLA 4CE9A 5DMRA 3NAEA 1HNVA 4XH5A 3OA9A 4W5RA 2QEXN 3H46O 5HP1A 3CI5A 3AVKA 1WSJA 1NK5A 4OX9K 5EX5A 4CESA 4YHHK 3WXKA 4Z4IA 3T1HK 3S41A 1CLQA 3SJJA 2CH5A 2YHBA 4DTJA 3HK2A 5BPNA 4X62K 3D2FA 3O9QA 3VMFB 5FDLA 2OPRA 1NK4A 4IJAA 3HPGA 1LAVA 3MECA 4KI6A 1IBMK 4WQ5C 1NGFA 3NBPA 4BC4A 5BRDA 4B9VA 4NXMK 5BPMA 2BTFA 4B1WB 4B08A 3CM5A 4OPAA 3M8RA 3CXCM 2D0PA 4O5FA 1X1PA 4BRMA 4BVOA 3ZEUA 3QNNA 3CJBA 4KTZA 4DFPA 1NJWA 1HKCA 4JKGA 1YIJN 1HNXK 4ELUA 4PHTX 2IGIA 1GLCG 4HTLA 3K58A 1CZ9A 4KHQA 3KK2A 4NCAA 1DTQA 2YHYA 3BZKA 4E1NA 4JRPA 5FPMA 3NMUA 3WXLA 3C6TA 3KLGA 3HSTB 2F9TA 5AQIA 4YOVA 4GVMA 4L3QA 1IH7A 2WFBA 2E1ZA 5JICA 5I42A 1BQMA 4DTRA 4MLEA 5AZIA 4DTPA 3L2QA 4CFCA 2O8DB 2CGLA 1W7AA 4LF5K 3QLHA 3P5JA 1D9DA 2OCEA 4MO5A 1S6QA 3ZSZA 3AV9A 5HL7L 3VEOA 1TYQA 1C0TA 2E6LA 2Q0RA 5KPZA 4A57A 4ILHA 3FR0A 3O3HA 3SUNA 4FLUA 3ULEB 1EETA 3DI6A 4FK0A 4BREA 5FPEA 4HWIA 4DV7K 2ZWHA 4YOWA 1K8KA 5AQKA 4W5OA 2HVIA 3A0IX 1RNHA 2GELA 4M3WA 5EY4A 2OPSA 1SS6A 3JS6A 2F8TA 1KFDA 4UQGA 4JYAK 1W0HA 1P8ZA 2P9SA 1NGIA 4FM2A 1BO5O 4QCLA 3ENHA 5ADXH 5H1SQ 1NLVA 4B3RK 5C2FA 2QW9A 3WXJA 2VG6A 2PZSA 4KKOA 3NVKA 4JRQA 4FLXA 2DFHA 1GOAA 4FSVA 4X64K 3CCQN 4PWDA 2ITGA 2B4JA 3SAHA 1LW2A 5AQRA 1X9WA 1WBBA 1KAXA 3OW2M 3O80A 3QEWA 2OPPA 4Q5VA 3AVAA 2G8IA 3TABA 3ZSVA 2RE2A 3C95A 2W41A 2W6KA 5BR8K 4ELTA 2O8FA 1DT9A 4YDUA 5DK5A 3WUHA 1S1WA 1IG8A 1TKTA 4JAXA 1QHTA 1IBLK 5AQFA 5KPRA 3CJCA 3CC2N 1U48A 1Q86O 2HHQA 1LV5A 5A2QO 1WLJA 4FW2A 3EE8A 4X65K 1WAJA 2NZTA 2B6AA 3QEXA 1RBRA 1HYZA 3J81O 1IBKK 4NO7A 5F1XA 4CBXA 4FLZA 1UA0A 1VQ4N 1Z25A 4DLEA 4HUEA 3HM8A 4MFBA 1KVBA 3VEWA 4CJPA 5C12A 3RMDA 3U6FA 3HVRA 4CJ4A 2B5JA 2V52B 4F9OA 1Q9XA 3VQQA 1VSEA 4KB0A 4DV4K 1K9MO 1VSLA 4OPJA 3I8DA 4BRQA 2Q36A 3OBYA 3THWB 4FOIA 5HROA 1XHZA 2JLEA 3HJFA 3IG1A 3R3LA 2FBXA 3AVJA 4HCBA 5GIOA 1ASUA 1VQLN 3KVGA 1QS4A 2G8VA 1FKPA 4GV3A 3T3FA 4F3OA 3ALYA 3DLKA 3KK3A 4CGJA 1U49A 4BQZA 5JS1A 1MA9B 3P38A 3W3DA 4JS4A 1OKJA 4C8LA 2DY4A 2HHWA 1BA1A 4AH9A 1LWFA 2YJFA 3LDQA 1S9GA 5AQQA 3O4NA 4DV2K 1B9FA 4K25A 5KGWA 1RT3A 1S1TA 2UUBK 2HB5A 4CJ3A 3VPZA 3P4IA 1TKDA 4ELVA 3EN9A 4PKIA 2O8DA 4H5VA 2GUPA 1WB9A 4FK2A 1HRHA 3CFPA 1RBSA 5KRSA 3PUFA 4JI1K 1NU0A 4CD1A 1VQ9N 2WOMA 1HPMA 1VQ6N 1C0GA 4CFBA 1U4BA 3QFUA 3BGRA 5BN8A 3K9JA 3CMAN 3ULEA 2NRVA 1QVGM 3S3OA 4FLTA 2HMIA 1U47A 5JLFA 2P9IB 3IRXA 4CZJA 2OPQA 4NCBA 1SKRA 2E2OA 4E7HA 2O4GA 3U4LA 4RW8A 3RWUA 1RT4A 4YDUC 4HHTA 3IAYA 4JI3K 1D4XA 1LWEA 3K2PA 4CHQA 4BRDA 1NK8A 1U2VB 2IAJA 1NMNA 4DTSA 2ETJA 4B3TK 3QEVA 4BRGA 3IS9A 3HPOA 4KH4A 1IKVA 1QE1A 4LFAK 4BRCA 4OKJA 3DXMB 4F2RA 3VENA 3U8XA 4IDHA 4KRFA 3OJUA 1NKCA 4JKDA 1O13A 3CJ1A 4KB1A 4JLHA 1TKXA 3ID8A 4O4GA 3VGKA 2PAVA 1GOCA 1FK9A 3J7AP 4JI2K 4ZHRA 3RRGA 2YNFA 1YUWA 1HJRA 4FWNA 4IOAL 4O5BA 4JI0K 1SZ2A 3SI6A 1WSHA 1J5OA 4QOZB 2BH1A 3TTFA 4H5WA 3OBWA 4CJKA 4DFMA 2QI2A 4H0XB 1ATSA 3WXIA 1CXUA 1S1VA 4CW7B 2D0CA 1JJ2M 1NGDA 4KH6A 4DUZK 3PY8A 1HNWK 2Z1GA 3AVGA 3I33A 1VSMA 1QTMA 4CZIA 4DU4A 3NH1A 4NB4A 1RT7A 5CZ2A 3ZX0A 1VSHA 3T69A 4KHNA 2KKZA 1WSFA 4IEEA 3THWA 3DLLL 2PYLA 4HUGA 2RPIA 4CJWA 1QQNA 3N4PA 4B1UB 5KRTA 3DXKB 1HYVA 2VGNA 4JKEA 3FZFA 5AQJA 4DFKA 1QSYA 3OY9A 1BOTO 3I0SA 2DFEA 5M1FA 3R6MA 4OKEA 1HKGA 3CF5L 5AR0A 3PO4A 4LH5A 3L2UA 5J1EA 4H0OA 2A42A 2F7TA 4DMNA 1KC8O 2O8BB 1JLBA 4B9TA 3VQEA 2NRRA 3NCIA 3VQ4A 4GV9A 3ZSRA 3RSEB 3C6AA 4I9LA 2A1SA 3T7ZA 2A1RA 2QK9A 4Y0WA 2QM1A 2ATQA 4A62A 1KQSM 2H3GX 1J6ZA 1YF5L 5JVGL 1LW0A 3DWLA 3THXB 3F9KA 4CJUA 2ZM6K 4V19S 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KH6 A;  3AGR A;  4A57 A;  4JEP A;  4A59 A;  4A5A A;  4KH4 A;  4KH5 A;  4A5B A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QTD A;  1MWK A;  1T6C A;  4I2P A;  2YNG A;  3EZW A;  3MX5 A;  4OJR A;  4UY8 O;  3MN5 A;  3IDH A;  4IBN A;  3DMJ A;  4PY5 A;  1RDU A;  4E0D A;  5JVH L;  2P9K A;  3VOV A;  3L2V A;  4HUF A;  3O6W A;  3CCU N;  1KVC A;  5GAG P;  4W5Q A;  2J4R A;  3TI0 A;  2ZF5 O;  3O9R A;  3SBG A;  3AVF A;  5J2N A;  1F21 A;  4B9Q A;  1BI4 A;  3AAR A;  4CJL A;  4BRO A;  4FJL A;  2CGK A;  2YKM A;  1NKB A;  3C65 A;  2G8W A;  4B9L A;  2Q3S A;  3CCE N;  4FJ5 A;  4I6M B;  2O8E A;  3K5O A;  4IZ9 A;  3WXM B;  1HYS A;  4GKJ K;  3CJA A;  3AO5 A;  1KCF A;  5C0Y A;  4AF1 A;  1I94 K;  4C8N A;  1U45 A;  1JXB A;  3R9P A;  4AHU A;  1M90 O;  2WTU A;  3NGZ A;  3QBX A;  3H08 A;  5CY4 A;  1LOT B;  3N4Q A;  4R5P A;  4JD2 A;  3CG7 A;  4FJ7 A;  2NLX A;  3TU5 A;  1WSI A;  4DV6 K;  4CEF A;  3NE6 A;  3CCJ N;  4IOX A;  3ID6 A;  1SQK A;  3CCV N;  3OYH A;  3NVM A;  4CZH A;  1S72 N;  4IFY A;  2CGJ A;  4FWL A;  2A41 A;  4KHP K;  2HST A;  1HLU A;  4M7X A;  2X74 A;  3UKU B;  1BWF O;  3EL2 A;  4KAZ A;  4RTF D;  5B8H A;  3DYA A;  5J2P A;  4FJH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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