3AGRA

Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from neospora caninum
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
591
structure length
591
Chain Sequence
AETEKHISAGKARLQDLRDAERRCHDAWQAIVVIDGGSSATRTNVFLAKTRSCPRGGRHIDPDSIRLLGAGKRFAGLRGVLESWLDAYAGEDWESRSVDSKRLFQHVPEMEDSARGLMQLLEDDAVRILDEKLTEEQKVQVQAMGVPVLLCSTAGVRDFHDWYREALFVILRFLINHPKPGHGYKFFTNPEWTRPITGAEEGLYAFLALNHLSGRLGEDPARCYVDEYGMKQCRNDLVGVVEVGGASTQIVFPLQDGTALPSSIRAVNLQHERFLPSRFPSADVISVSFMQLGVASSSGLFFKELCSNAEFRHQGICYNPCIFRGFRQACSAGDVEILPDGTIVVDEDVRKNKLKPVATYCSANNPEISFKAMNEIQCRVNKIDPTKSLAERLRIDDCFQIVGTGDFDTCQAQVEELLVSPRFPLPANIEAASSGFESVGQVFKFASTASPMVITGGAMYASISTMQGLGLLPKDFQGDLEQLIAASRTYCSSPVVNNGDGLVIQLPNAEQKLTSMNYDLCKTIALTVSLLQHMEAGEHKPSSISWQKTVVGPDGKPRADLGWHVGAILHRVLFTEEWGRTAYETGFTYNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Nucleoside triphosphate hydrolase
publication title Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from Neospora caninum
rcsb
source organism Neospora caninum
molecule tags Hydrolase
total genus 174
structure length 591
sequence length 591
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2010-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA02
4KH4A 4KH5A 4JEPA 3AGRA 4A59A 4KH6A 4A5BA 4A5AA 4A57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O0JA 2NZTA 1U49A 3A5NC 4AQYK 4DTNA 1S6PA 4DR7K 3MCPA 2R7YA 4BGBA 2PBDA 4FWPA 1KQSM 4PA1A 2HHVA 3OYAA 2VG5A 2P9SA 4H5NA 4KO0A 5EVZA 3NE6A 3CC7N 3VQEA 3FFIA 2WTUA 3F9KA 4CIFA 1D9FA 4ILGB 4WE1A 4JRQA 3BGRA 2ASOA 4OPAA 3QO9A 3CM6A 1C0GA 2RF2A 5AQJA 2P9PB 3AAQA 3H3OB 3H08A 4CK1A 3ITHA 2X6SA 1RCHA 4NLBA 3E9OA 3HPHA 4DTPA 1NJIO 3DI6A 1JCGA 4B3OA 4GV3A 3KIOA 3WEEA 4NXNK 3SQ4A 3OYCA 4Y1CA 1KLNA 4OKEA 3R8EA 1LWEA 4FJKA 3F9MA 3M5RA 2W6KA 5JVGL 4FLVA 4DFMA 1HYSA 5AQSA 1VSIA 1IBMK 3IFRA 3ZSXA 3GE1A 4H5VA 2ASPA 3K59A 1NK4A 4B9LA 4JI6K 3TAFA 2G8HA 2OPRA 1RTJA 3HZ6A 3O9QA 1XI1A 4BVPA 4AH9A 3DRSA 1NK8A 1VAZA 3OHRA 4JNEA 4JD2A 3T7ZA 1TUYA 4IKFA 1XC3A 2YV0X 5HOOA 1SUQA 4DTJA 4M41A 3AVKA 3LDLA 4HTLA 5HP1A 2IDOA 3FZLA 4LFCK 4GMJB 4Z94A 1I3AA 1U2VB 1C1AA 1K6YA 1T44A 3ZETB 3VOVA 4FM2A 3OS0A 4FK2A 3VQCA 1NU0A 1CZBA 3VQ8A 4CHPA 1N5YA 1NOYA 1KCFA 1X3MA 2VCPA 4AHVA 1NMDA 3ZT4A 4M3TA 1QQNA 2V7YA 3FR0A 3D7EO 2P9LB 2KTQA 3HVRA 3EE9A 4U67L 1N6QA 2UYTA 5CYMA 4ISFA 3V1OA 4CIGA 3CHWA 3L2WA 3E66A 2AJQA 1OH5A 4KTQA 5I9EB 2XRIA 3NH1A 3AGKA 3DWLA 1ESVA 3KWGA 2ITGA 3GDQA 1TUUA 4DV1K 5C15A 4CJKA 4BVOA 1NMNA 4E1JA 4FWMA 3ENOA 1TK8A 3V81A 4DV5K 4NCAA 3VGKA 2OTJN 3I55N 3L2RA 1NKBA 4C8MA 4IO9L 1IJJA 1TVRA 2G8IA 4LF4K 2F8SA 2G8KA 4ELTA 4AF1A 3LAKA 2VG7A 4B9NA 3DLLL 4KHSA 2GX9A 4CECA 3HO1A 3CIPA 3CFPA 4CK2A 3C6TA 3DOKA 4AHCA 1TKZA 1KD1O 4B1YB 2E4LA 2WBNA 3OW2M 4WQ4C 3P1GA 5LMNK 3L2UA 3CXCM 1D5AA 1KSPA 1NGJA 2Y1JA 3G0ZA 3CJ1A 1T03A 3KWIA 3RSEA 3LALA 3SPYA 4H0XB 4BREA 1CLQA 4JKHA 4CGDA 2KHOA 1HNZK 1WSFA 5HROA 3KJVA 3THXA 4CI6A 1L5UA 1Q9YA 3K2PA 3LAMA 1GOCA 3LM9A 4EP4A 1QHTA 4FJ5A 4HCBA 3QINA 3TR8A 4DU1A 3EO3A 4M3WA 4E1NA 3AO3A 3TABA 3DRRA 1TL1A 1K73O 3DJCA 2QI2A 5KPRA 4CJ5A 5ADXH 4DFKA 3SI6A 4XH4A 4M7YA 4IG3A 4F2RA 3TAPA 3R1XA 1ZBSA 4IFYA 5JICA 2P9UA 3VTHA 1Q8IA 1S1WA 2UUAK 3ULEA 2BE2A 1KRPA 3VA0A 4CVNE 3AGRA 1WNSA 5T7BA 2XHBA 2DPNA 1IKVA 1SKWA 4E7LA 1TK0A 1WBBA 2HVIA 4BR0A 3HOSA 2FSNA 1YAGA 4FPBA 3TSQA 3J7ZO 3AVAA 3V1QA 5F0XA 3J81O 4DLEA 1T8EA 2UXCK 5CE3A 4UY8O 3VQPA 1VQ4N 3SUPA 4FVMA 5HLFA 3ZX0A 1X3NA 1LAWA 3O4NA 1FKPA 3VESA 4YOUA 1KTQA 4MO4A 5HRPA 4J8FA 3L6QA 5BR9A 2KFNA 4OX9K 3MK6A 3OYBA 1RILA 3SZ2A 5BPNA 3OYNA 4DQ8A 2KZMA 1MDUB 4TSXA 2G8UA 3NGIA 3QEPA 3NMUA 3ALYA 2P9PA 3CFOA 3L2QA 4HVJA 1W0HA 1YF5L 3AVMA 3LDPA 4KHUA 3NF7A 1JLFA 1Y97A 5AQFA 2QW9A 4JI0K 3PX6A 1NJXA 4W5NA 3MWTA 3Q7CA 4KV8A 1QVGM 1WOQA 1MA9B 3EY1A 4ID1A 1ATRA 3A5MC 3SAHA 3DLBA 1E3MA 3ZSRA 1ZBFA 4DTOA 4JKFA 1QQOA 4JKAA 3I0RA 2I5JA 1JL1A 3GBTA 1NKCA 1D9DA 4B9MA 4DB3A 3EKSA 4G1QA 3NVMA 2HF4A 4K25A 5FPEA 3K5OA 2QWRA 2ZD1A 2A6AA 4NB4A 4O4GA 4KI4A 3IS9A 3KK7A 3K5MA 3D2EB 3V9UA 2Z1GA 3IKMA 4CEBA 4PHTX 3H46O 3NDKA 4JI5K 4K42A 1X1PA 3HM9A 1U2VA 1IKWA 3WXJA 3ZETA 4LF9K 1DEJA 5AZJB 4BRQA 4GV6A 2FBXA 1EKEA 1RDDA 3KKRA 3QIPA 3M1FA 5BPLA 4KB0A 4KHNA 1JXEA 3VERA 1FW6A 2E2OA 1C6VA 3AVLA 1YIJN 4QCLA 4L8RB 4FWOA 3LZJA 3EZWA 1XMQK 1O1WA 2FBTA 2V51B 4FZZA 4OKKA 3CCLN 2QXLA 4KH6A 4CJPA 4A61A 2ITMA 3VEXA 4YHHK 3ZX3A 3M8RA 3LZIA 4WYBA 1P90A 1HNXK 4LH5A 5C2DA 1TL3A 5FROA 4DQQA 3SK3A 1FJGK 1BI4B 1NK5A 4IG0A 3O4QA 4KREA 4RCHA 3DLKA 5JS1A 1S6QA 3IG1A 4F3TA 3I33A 1BCMA 4NYFA 4FWQA 1BQNA 4CJ7A 4H0VB 2DTUA 4RW4A 1VQ8N 1SAZA 4CEDA 1DLOA 1RBTA 2A3ZA 3MN9A 3RRHA 4BRPA 4G9ZA 1EP4A 1Z6RA 3MEEA 5FRNA 4DLGA 1IKXA 3NH0A 4ZTFA 4HTUA 3MDQA 3NAEA 3R6MA 3O1WA 2W42A 2E20A 4CEAA 4NCBA 3KVGA 1VQ7N 2QWPA 4ZTJA 1U48A 4NO7A 5JLFA 2Z1HA 2YNIA 1SV5A 3VF2A 5KGXA 1ZBHA 2LSNA 3C6HA 2I7NA 4B1ZA 5AQXA 3M8SA 2D1KA 4PQUA 2B5JA 3HRGA 1OVQA 4JKGB 2JWLA 3ZT0A 1BOTO 3WXMB 3V4IA 1KC8O 3VENA 3ATVA 2GELA 5HBMA 2O8BB 4GVMA 3CCMN 3AO2A 4O0IA 1IG8A 1QZ6A 4FLZA 1RT4A 4B8CA 4FWSA 5FRMA 4FVUA 1KAYA 4MQ3A 5M1PA 1RBVA 1TAQA 3TAEA 1NBWA 2ZJRL 4DR1K 4F9OA 3RVCA 1RDBA 2VWBA 3KK2A 4DWIA 2I7PA 1HKCA 3HTVA 3U3YA 4JK9A 4FCYA 3U6FA 3LL3A 2WUSA 3DAWA 3U9ZA 1A5VA 2P51A 4Z0UA 4FOIA 3VEYA 4CJEA 2V7ZA 3RMAA 2F9TA 2HF3A 1SZ2A 4ILJA 3TTDA 5TKWA 1T6CA 2Q0UA 2NRXA 1F21A 4DV6K 1BQMA 3P39A 2O4GA 2NRHA 4FK0A 2HNZA 4FJHA 3FZKA 2W6LA 1K8AO 1V4TA 3CQYA 1X9JA 3N4PA 4H03B 1X9MA 3PO4A 4CEEA 4XEIA 3L4IA 1NOZA 4BRMA 1YTUA 1GOAA 3OYDA 3E01A 4W5QA 1OKJA 1JLEA 2FBYA 1J5OA 2CGKA 4DF8A 4KTWA 1QHAA 1MU2A 5EU7A 3S3MA 4DR2K 2OZMA 3RTVA 3SQ2A 1VQKN 4FWLA 2P5OA 4Z4HA 3CG7A 4M63C 3VEVA 3ID8A 1W2BM 2VGNA 1ZYQA 1TYQB 4C23A 4NXMK 3A5OC 4FYDA 1RTHA 1BHLA 5HRSA 2VGMA 3HVTA 4YOXA 4BRAA 1RDWX 2O8CB 4DR3K 4W5RA 1T7PA 3IAYA 3G10A 2YHYA 4CF8A 3O3FA 5AQMA 3AO5A 3SAGA 4RW8A 4CHYA 4OLBA 4CGJA 2JLEA 4DMNA 2X78A 4M42A 2NRRA 2ZJQL 3DM2A 3NF9A 1WSIA 1YI2N 4YOVA 3TAGA 3LDSA 5EOYA 3G6EN 3D2EA 1YVUA 4IFVA 1BO5O 3LM2A 2YKNA 1XNQK 4OJRA 1NWKA 1H1VA 2H3GX 1VHXA 4LF8K 4IOAL 3S3OA 2QXFA 4DFJA 3AVBA 5DM7L 4FJGA 3E1YA 2QKKA 4KHWA 1BU6O 1ASWA 1YHQN 3HP6A 2ATQA 3M8QA 5AZJA 2YNGA 4PKHA 4CE9A 2V52B 2YNFA 5A2QO 2NLXA 2PY5A 4ELUA 1ATNA 1RDUA 4CJLA 4M3ZA 4DSIA 1YVNA 4BRKA 3GG4A 3OYJA 3CPEA 2D0AA 3EEQA 3IRXA 5MLCQ 2GWJA 1JKHA 4XIUA 3SV4A 3T1YK 3RRGA 3RMBA 3WNFA 3HK2A 4X62K 3KK3A 2FC0A 2NRWA 4C8NA 4K8ZA 4CEQA 4AM6A 3NBPA 1JJ2M 3WNGA 4ICLA 4CHNA 3V9ZA 1NK9A 4Q5VA 1BIUA 4CJ4A 3CJ7A 1CXQA 4DQSA 3QICA 1J9AA 2KQ2A 1HJOA 4CF2A 5LMUK 5KRSA 1EXQA 1BI4A 4QS7A 3TU5A 1UOCA 4LSLA 4IXCA 1S1TA 1B9DA 5FDLA 2E1ZA 2Z1IA 5SWMA 2BANA 3KLFA 1Y64A 4B3TK 2BUPA 2JGUA 3HBTA 2O8FB 2KZZA 1QSYA 4B1UB 3A2FA 4JI7K 4I2PA 4HUEA 3C7NB 4QOZB 4B3SK 5KQ8A 1KAXA 5F1XA 2HHWA 4JI2K 4LF6K 4CZGA 2DY4A 1NK0A 3CI5A 5C0YA 2KLAA 5FPDA 5BN9A 3CCSN 3NF6A 3JSMA 3UIQA 4CZFA 3HXMA 4A2AA 3WXKA 1NGHA 3AV9A 3F2KA 1RTDA 4GV9A 4CFCA 2XY8A 4ISEA 1GLDG 4BRCA 3VQ4A 4JKGA 2Q0RA 1QSSA 1N36K 3HSCA 2O8BA 1LW2A 4YOYA 2ZQBA 1Q82O 3WQTA 3OYHA 4O8UA 4CJWA 1UA1A 4NCGA 1S9GA 3CQ8A 4N47A 5AFUH 3TSUA 1NK6A 4JLHA 4DV2K 1DT9A 4X64K 4B9QA 2WOMA 3SYZA 4DS4A 3IMXA 3ZSOA 1SS6A 3SUOA 2NRTA 3S9HA 4J2AA 2UUCK 4KFBA 5JVHL 3AVFA 4H5WA 2QEXN 4B08A 4JN4A 5BRFA 4RTFD 1UA0A 2QWMA 2VWKA 3AA2A 1NGDA 2AA4A 2IGIA 4OPHA 4UQGA 4DHYA 5AQVA 1HQEA 3OA9A 4CIEA 3D2FB 2AP1A 4A5AA 3LP1A 3DOLA 3O8MA 1EX4A 2YNHA 3VMFB 3OS2A 4JS5A 3THYB 4IEEA 2DFHA 4EAHD 4BROA 3LDNA 3CMEN 3BUZB 1S3XA 4BWJA 4EZ6A 2GWKA 3J80O 4N76A 1Q81O 4RG8A 3L8BA 3AA3A 1RT7A 4CJRA 1QZ5A 2OA8A 4LSNA 5EX5A 4DSLA 2F8TA 3PV8A 5AQUA 4Z4FA 2E2NA 3FLCO 4C1NI 3J7AP 4M3YA 2ZGYA 2FLOA 4GY2B 4PKGA 4BR4A 2X74A 1TV6A 3SMPA 5CYQA 1TYQA 3ZEUA 3SNNA 4MFBA 2J4RA 3B6OA 1VRUA 4KI6A 1QQMA 3VQAA 3VEWA 2D0PA 3SBGA 2DFEA 2QWNA 3MEDA 3VF6A 1V4SA 2O8CA 4IJAA 4IDKA 3HL8A 3ZT2A 5ADXA 3UKUB 2PFUA 4J2EA 1VSDA 2ZM6K 4DQPA 3HOTA 1C0FA 3CJ9A 3HYFA 1N34K 4FJ9A 2UXBK 4CJQA 5C24A 1GLFO 1RT1A 1RDCA 4LC9B 4YDUC 1KXPA 1BGXT 3SJHA 3CFRA 3WXLA 4IDHA 2PYJA 1VK0A 1TKDA 4DUYK 3CCUN 4FM1A 4FK4A 1HPZA 1C0TA 2ASMA 1NKEA 4E0DA 4JEPA 4KH5A 3CYMA 5E26A 1GLJO 4CZEA 3NH2A 5LY3A 3VA3A 1HNIA 5EXWA 3U9DA 2HHXA 1XNRK 4DKWA 3C95A 1KLMA 3D6RA 2UU9K 2OTLN 5C2FA 4W5OA 1BIZA 1WBDA 2HSTA 4Y1DA 3T1AA 1HR0K 5BRDA 2OYQA 2FBVA 2FSJA 3V9SA 4YFUA 4E19A 1RBSA 5GAHP 3WXIA 4O8KA 2D0CA 2QTDA 5GINA 5KQDA 5AQTA 4H4MA 4DCHA 3SJJA 4C8KA 4OVLA 3A5LC 5AQPA 4CHQA 2NRVA 5KTQA 3K5NA 3O3GA 3SBTA 4H4OA 1U4BA 4FW1A 5KPZA 5IWAK 1RT5A 4DV7K 4DSJA 3KD1E 1NGEA 5AQLA 1SKSA 3KZBA 1P8ZA 4B1WB 2QWLA 4CEOA 3K0SA 4FZXC 2FF6A 4MO5A 4FLYA 3QERA 3OYMA 4JS4A 2A40A 2Q2RA 1NJYA 3C94A 4CGIA 1NGFA 4C1NK 1S22A 1SL2A 2E88A 1C1BA 3QDKA 4FLTA 3A0IX 3L2VA 1UAXA 2O8FA 4I7FA 3G71N 4KRFA 3CF5L 1EWQA 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3O9SA 3AY9A 1NGCA 3LDOA 1W9HA 2ZE2A 2BH1A 2A5XA 4JI4K 4CJ3A 2Y1IA 3OBWA 3EYZA 3UKUA 3NHGA 4K43A 4CGFA 1M1KO 1REVA 3QNNA 4FZYA 2NRZA 4FLUA 4AHUA 3DXMB 4GKJK 1G99A 3OYFA 4HUGA 2OCEA 2F4VK 4RW7A 2YHXA 3BDPA 2HW3A 3F73A 5AQNA 2D4WA 4IOCL 1TKXA 1WAJA 3O6WA 4ILHA 1U47A 3DMJA 1RGIA 2ZGZA 3ENBA 1VQ6N 4YNQA 1HRHA 3CJCA 1W97L 1Z25A 1YUWA 2A42A 3D0PA 3LP3A 1YITN 1I94K 4CZJA 5FPNA 4LH4A 1NJZA 4KPYA 1T05A 4CZKA 5AQWA 1QE1A 1NNEA 4A57A 4BR5A 2Q1NA 3H3NO 3ZEUB 3F5TA 3MMVA 1QQCA 4BRIA 1HYVA 2EX3A 3ASMA 3PLAA 1X9SA 4BRFA 4BE0A 2HMIA 2OPQA 3OJUA 4DTXA 4DR4K 1M90O 3RR7A 2QKBA 5J2PA 1RDAA 4DTMA 2EHGA 3L4QA 3NCIA 5GAGP 3VQDA 3CERA 4E1MA 4IBNA 2P5GA 4CJUA 1Q18A 1NGBA 5J1EA 1LCUA 4KKOA 4EHUA 1VQ5N 2HBKA 3ZSYA 4ISGA 4CERA 3K58A 2P9IB 2YJFA 3M8PA 3E9PA 3PY8A 5GAEP 4H0PA 2HVHA 2RN2A 4FLXA 3CJAA 1BWFO 3SV3A 1WSHA 4IEIA 1WLJA 3T3FA 3PSIA 3BY5A 4NYNA 1E4FT 1U04A 3HPGA 3DLGA 3QLHA 1RTIA 4OGCA 3HT3A 1XHZA 1K9MO 5E41A 2RE2A 3TTCA 4QAGA 1J5EK 4BRDA 3ZYYX 1RNHA 3H45C 3V6DA 4BRGA 1NGGA 3K5LA 2Q31A 3I8BA 4KTZA 5AQRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KH4 A;  4KH5 A;  4JEP A;  3AGR A;  4A59 A;  4KH6 A;  4A5B A;  4A5A A;  4A57 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4O0J A;  2NZT A;  1U49 A;  3A5N C;  4AQY K;  4DTN A;  1S6P A;  4DR7 K;  3MCP A;  2R7Y A;  4BGB A;  2PBD A;  4FWP A;  1KQS M;  4PA1 A;  2HHV A;  3OYA A;  2VG5 A;  2P9S A;  4H5N A;  4KO0 A;  5EVZ A;  3NE6 A;  3CC7 N;  3VQE A;  3FFI A;  2WTU A;  3F9K A;  4CIF A;  1D9F A;  4ILG B;  4WE1 A;  4JRQ A;  3BGR A;  2ASO A;  4OPA A;  3QO9 A;  3CM6 A;  1C0G A;  2RF2 A;  5AQJ A;  2P9P B;  3AAQ A;  3H3O B;  3H08 A;  4CK1 A;  3ITH A;  2X6S A;  1RCH A;  4NLB A;  3E9O A;  3HPH A;  4DTP A;  1NJI O;  3DI6 A;  1JCG A;  4B3O A;  4GV3 A;  3KIO A;  3WEE A;  4NXN K;  3SQ4 A;  3OYC A;  4Y1C A;  1KLN A;  4OKE A;  3R8E A;  1LWE A;  4FJK A;  3F9M A;  3M5R A;  2W6K A;  5JVG L;  4FLV A;  4DFM A;  1HYS A;  5AQS A;  1VSI A;  1IBM K;  3IFR A;  3ZSX A;  3GE1 A;  4H5V A;  2ASP A;  3K59 A;  1NK4 A;  4B9L A;  4JI6 K;  3TAF A;  2G8H A;  2OPR A;  1RTJ A;  3HZ6 A;  3O9Q A;  1XI1 A;  4BVP A;  4AH9 A;  3DRS A;  1NK8 A;  1VAZ A;  3OHR A;  4JNE A;  4JD2 A;  3T7Z A;  1TUY A;  4IKF A;  1XC3 A;  2YV0 X;  5HOO A;  1SUQ A;  4DTJ A;  4M41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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