3AGRA

Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from neospora caninum
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
591
structure length
591
Chain Sequence
AETEKHISAGKARLQDLRDAERRCHDAWQAIVVIDGGSSATRTNVFLAKTRSCPRGGRHIDPDSIRLLGAGKRFAGLRGVLESWLDAYAGEDWESRSVDSKRLFQHVPEMEDSARGLMQLLEDDAVRILDEKLTEEQKVQVQAMGVPVLLCSTAGVRDFHDWYREALFVILRFLINHPKPGHGYKFFTNPEWTRPITGAEEGLYAFLALNHLSGRLGEDPARCYVDEYGMKQCRNDLVGVVEVGGASTQIVFPLQDGTALPSSIRAVNLQHERFLPSRFPSADVISVSFMQLGVASSSGLFFKELCSNAEFRHQGICYNPCIFRGFRQACSAGDVEILPDGTIVVDEDVRKNKLKPVATYCSANNPEISFKAMNEIQCRVNKIDPTKSLAERLRIDDCFQIVGTGDFDTCQAQVEELLVSPRFPLPANIEAASSGFESVGQVFKFASTASPMVITGGAMYASISTMQGLGLLPKDFQGDLEQLIAASRTYCSSPVVNNGDGLVIQLPNAEQKLTSMNYDLCKTIALTVSLLQHMEAGEHKPSSISWQKTVVGPDGKPRADLGWHVGAILHRVLFTEEWGRTAYETGFTYNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Nucleoside triphosphate hydrolase
publication title Crystal structure of nucleoside triphosphate hydrolases from Neospora caninum
rcsb
source organism Neospora caninum
total genus 174
structure length 591
sequence length 591
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.1.15: Nucleoside-triphosphate phosphatase.
pdb deposition date 2010-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.530 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA01
3.30.420.540 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3agrA02
3AGRA 4A57A 4JEPA 4KH5A 4A59A 4KH6A 4A5AA 4A5BA 4KH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3J8AA 1RBRA 3RRHA 4WFAL 1FW6A 3AVBA 4F3TA 2XY5A 4EZ6A 4X65K 3SUQA 3F73A 3SNNA 4CGGA 4FLVA 4DV5K 5DMRA 3OJUA 2UUBK 1MDUB 3A5MC 1WSGA 1EQYA 1RCHA 4CGDA 1FKOA 2QEXN 2IC3A 3MN9A 2Z1GA 4FZYA 1ZBIA 4H5WA 3SMSA 5LMNK 5FRNA 3UB5A 4WF9L 1OH8A 1TVRA 3K0SA 4KHQA 3AVAA 4WFNL 1IO2A 4CJUA 5FROA 3I0SA 4CE9A 3M5RA 4DUZK 2A41A 3AARA 2O8DA 1J5OA 3QINA 4DTSA 2ASMA 2KHOA 4RTFD 3ULDA 5D3GA 2NLXA 3F2KA 4B9SA 3CQYA 3RMCA 4YORA 2E2NA 2QXFA 2HHWA 1VQ5N 3O4NA 4BC2A 4WE1A 4O5FA 3TI0A 1K8KB 3GG4A 5AZIA 3EL2A 3AVGA 3K5LA 4DSFA 1S3XA 2HBJA 2RHKA 3B6PA 3OYKA 1VQMN 4KB0A 1ATRA 2P9IB 4JI1K 3AVKA 3SQ4A 2VQFK 2P9NB 4BC5A 4CEOA 4AILC 2YNIA 1T05A 4J2AA 4M41A 4KV8A 2P9KB 2EX3A 4DR1K 3V4IA 2PAVA 4LY7A 1ZBUA 1WSFA 1VHXA 2RF2A 1HQEA 3TR8A 5EOYA 4JKDA 1HQUA 1CXUA 3ZSYA 5AQTA 2OPRA 4A59A 3THYA 3LDPA 1S9GA 4B3RK 3A2FA 4DR3K 2RE2A 4CJRA 4CJPA 3CG7A 3JSMA 4FW2A 2DFEA 3RMDA 4I2QA 4O8KA 1NBWA 3BDPA 3A5NC 3VEYA 3TAGA 4CJ3A 2IVOA 2CGJA 4AQYK 1BOTO 4HTUA 4LFAK 4EP5A 3CC2N 4BRDA 3HZ6A 3CJBA 1RT7A 5JICA 1ZBFA 1N33K 1LW2A 3P1GA 4BR0A 3NGZA 1HRHA 2FBTA 4X62K 4CEZA 4GY2B 1TYQA 1HNXK 4W5TA 1J53A 3DAWA 2P9UA 3PIOL 3LAKA 3HP9A 3R1XA 3LDLA 3GBTA 4PA1A 1D9DA 4H5VA 4CJQA 5BN8A 1RT3A 2PYLA 1W7AA 4LH5A 4PWDA 5I3UA 1N5YA 4IEIA 3HL8A 4KH5A 4HWIA 4JK8A 3H45C 5CYMA 5GADP 2QWMA 4NYFA 1U04A 2QWNA 2V51B 2IVNA 2Y1JA 1DGKN 4H03B 2F8SA 3NGYA 4BG8A 2WBNA 4CJ7A 3O80A 4UQGA 2D0OA 3K2PA 1NG9A 2KFNA 3K5MA 3V81A 3OTOK 4ISGA 3D6RA 3SMPA 3SUOA 1XNRK 5EX5A 1XWLA 3VQQA 1YF5L 4FJGA 1JLEA 3VQ6A 4E1NA 4LSLA 2QTDA 2FF6A 3OVNA 4FO0A 2P9PB 3CM5A 4GW6A 4HUFA 4FJNA 4DFMA 2YNHA 4GMJB 2BUPA 4FM0A 3SAFA 4J2BA 3TSUA 4LSNA 4I9LA 3UIQA 5FPDA 4JKCA 1SV5A 3ZLJA 2W6LA 3AGKA 3QEIA 3PY8A 4FWQA 2VQEK 1T44A 1P90A 5A2QO 4JV5K 3E9PA 2E2QA 1JCEA 4B3TK 4IFEA 1NK9A 3GL1A 3I8DA 1EWQA 4B3MK 5AZJB 4FOIA 1SL1A 5F1XA 3LDSA 1IKXA 1W9HA 3JYTA 3PO4A 4IJAA 3QBWA 4WCEL 3K57A 4ELVA 4LF7K 5M1KA 2PZSA 3OS1A 1RT1A 1XC9A 2BDPA 3E9OA 2P9SB 3LWLA 1HLUA 4DQSA 5TKYA 4BQLA 4B9TA 4M45A 5C2DA 3PIPL 3NF9A 3D2EB 3SJJA 1RFQA 3TSPA 4F3OA 3CPEA 4YFUA 4C8NA 3HJFA 3CMAN 3HTVA 1JKHA 1KXPA 3NBPA 4B8CA 3PO5A 3CETA 3DLBA 1TK8A 4K8XA 2VWBA 1ITGA 3HOTA 4DF8A 3LPTA 2E6MA 1KQSM 3GDQA 3IMXA 1HR0K 1RDUA 1QHAA 3H46O 3IUCA 1NJWA 4FJXA 2A42A 4M7YA 4IO9L 3V9WA 2IAJA 4M3WA 2GEMA 2YJFA 5JVGL 3KKSA 3DYAA 3VESA 3TPQA 1NMDA 2ITMA 1Q81O 3C65A 1VSIA 3SQ1A 4Z4HA 3T1YK 1NGEA 1NM1A 2NNWA 1M90O 1QQMA 1BI4B 2JWKA 3OYHA 3FGUA 4CF2A 4JEPA 1NJIO 4ZTJA 4J2EA 3VGMA 2O8FB 5AQLA 2P5OA 1UA0A 3PUFA 4DQRA 3ATUA 5GIOA 1FJGK 4H0OA 2A1SA 4I6MB 1SKSA 1S1UA 4I9QA 2F9TA 2FSJA 4BR7A 2F4VK 2FF3B 3O1WA 1N36K 4FW1A 1VSMA 1NMNA 3SV4A 1TUYA 5AQFA 3VENA 1YI2N 1X9SA 3S3NA 3C7NA 2O8CB 1NLVA 2I7PA 4FWPA 3CIPA 3QNNA 4NCBA 3ZSWA 3BF3A 3TAPA 4JHDA 2IOCA 4DV3K 2A1RA 4YNQA 3CFPA 1L3TA 3JXUA 4DR4K 4LFCK 1VSDA 3C6AA 3MN6A 4DUYK 5AQJA 3SBTA 1GLDG 4G1QA 2JGUA 3M8SA 1X3NA 2HBLA 1SUQA 3R9PA 1K6YA 3J7YP 2Q97A 4BE0A 1LW0A 1T03A 3WQTA 1WNSA 3CF5L 4WQ5C 3VQCA 3U3GA 4FZZA 1WSJA 3DRSA 4B1YB 3G71N 1NJZA 3NFAA 2FC0A 2GELA 4C1NK 4HCCA 3QNOA 4FK2A 1QQCA 4E89A 4IFYA 3EE8A 4B9VA 1XUPO 1QQOA 3SJHA 2G8WA 3H3OB 4ILHA 4JKEA 3WQUA 3CFOA 4YY3K 2VCPA 2PYJA 1Q8IA 4DV6K 3CD6N 4FXDA 3NHGA 3SCXA 3OJSA 1HUXA 4DTUA 1GOAA 5C0YA 2X6SA 3RSEA 1KD1O 3H6EA 3SLCA 2HOEA 4N47A 3DOLA 4KHSA 3VQ9A 4OKKA 4MLHA 1S72N 2X74A 4FWKA 4N76A 2D5RA 5FPNA 5AQMA 4CERA 5MLCQ 4GV3A 1SZ2A 3VQ7A 1OH5A 3VQBA 4FJ5A 3DM2A 3I55N 4EHUA 5AQKA 4X64K 2ZQBA 3TU5A 1TAUA 1RBUA 1TKDA 3ZSZA 2KKZA 4CD1A 1SKRA 4Z4CA 4CZGA 3VPZA 3ZT1A 4FWSA 5I42A 3OHRA 3PSIA 2HNZA 1EKEA 5CZ2A 1QHTA 4AHSA 3UKRA 3T7ZA 4BQZA 3O6WA 1WN7A 4FM1A 4NB4A 4U67L 1EETA 4WYBA 1KSPA 4E3SA 4EP4A 4CCHA 2P9LB 4CHOA 3W0LA 3AV9A 4FLUA 3H3NO 3D2FA 3SAGA 4NXNK 5GAGP 2E5LK 3PX0A 1YAGA 4CFAA 4ILGB 4QS8A 1U47A 3AAQA 4A57A 4PQUA 2UUAK 3VQEA 3I33A 4JLHA 1JJ2M 4LH4A 4IEEA 2DFFA 2YKMA 3V1RA 1RDBA 4BY9C 3LM2A 5E41A 2D0PA 3OYBA 2IVPA 2HBMA 3S3OA 1RT6A 1VSKA 4DQIA 4F9OA 3ZX2A 2Q0RA 3HVRA 1CLQA 1IBMK 1HX1A 4Y1CA 2OPQA 3BUZB 3SYZA 2Q3SA 2WFBA 4H0PA 2UUCK 3OYFA 5HRRA 2XHBA 4IOCL 4RW9A 5KTQA 3VGKA 4JNEA 4JI2K 1Q18A 3DRRA 4EAHD 1OVQA 1D5AA 1QVGM 2W41A 1K73O 2G8HA 4F2SA 1VQ8N 4DR6K 2YKNA 1UOCA 3DLGA 1I94K 3QEVA 1WB9A 3VMFB 4F2RA 3LP2A 1NGGA 1E3MA 3LDNA 2FLOA 3FLCO 4E1JA 1VQON 3DRPA 3VGLA 2HVIA 1WAJA 1J5EK 4RG8A 5FDLA 4KHYA 3AA2A 4KB1A 3AO1A 4K8ZA 1V4TA 5AQPA 4CIEA 5C25A 3HRGA 4H5RA 2GWJA 3AVNA 2F8TA 2HHUA 4Y1DA 2HMIA 3G4SN 2YHWA 2FSKA 4JI8K 2H3GX 2I5JA 4O4GA 1TK0A 3V1QA 4KI4A 1HNIA 2HB5A 4C8MA 3VQ5A 3ZT0A 2P9IA 1NK6A 4O0JA 5KPTA 3OYMA 4E7KA 5C10A 1RDWX 3VA0A 1TKTA 2JWLA 4EHTA 4GKJK 3CM6A 4FJKA 1GLAG 1A5VA 1VSHA 4K41A 1WOQA 5FRMA 1MWKA 4MLEA 3ZT2A 4DG1A 5GAEP 2AA4A 3NAEA 5SWMA 2OZSA 1IKYA 3EE9A 3LP0A 5C12A 1WLJA 4H4MA 3CXCM 1SQKA 2VYPA 4CF8A 4CBUA 4CJVA 2ZE2A 3SQ2A 1IG8A 3C6HA 4KH4A 3DWLA 1QSLA 1NKBA 3THWB 2CH6A 4QOZB 3NH0A 4YOYA 4V19S 3PV8A 1T3VA 5HRSA 1EWRA 4BRQA 2OYQA 4CGIA 2W42A 1SAZA 3O4WA 2E1ZA 3QIPA 3DXMB 4ID5A 1J6ZA 3LL3A 1S6PA 1DEJA 3QIOA 4C1NI 3DLKA 4K25A 3ZT4A 2NRWA 5B8HA 1BA0A 1XQSC 3AVIA 3I56N 3WNHA 1HNVA 2YHYA 5KRSA 1RDCA 3IKMA 4F8RA 4CZIA 4DF4A 4FWRA 4CD3A 2ZJPL 1KAYA 1LWCA 4B8AB 1VQ9N 1KAXA 4JI0K 3VF4A 3MAQA 2HHVA 1TV6A 1NK7A 3KLIA 2OPSA 1NKCA 1SL2A 2NRZA 3ZSQA 2Q36A 4Z4FA 4DTNA 5CYQA 4IDHA 4FZXC 3HI0A 4KRFA 2B4JA 1VK0A 3T1AA 4KKOA 3Q7BA 4DS4A 1WSEA 5HBMA 4QS7A 1VQ7N 4OX9K 4JD2B 3ASMA 3SPYA 2UXCK 4W5QA 2KW4A 5AFUA 2A5XA 3KIOA 3DLEA 3CCEN 3ZSVA 3OYNA 3HK2A 4MDAA 3OS0A 3RWUA 3F5TA 3NVKA 5BPLA 3QO9A 2E1YA 2JLEA 3TABA 4JKFA 3AA4A 4XEIA 2VWKA 1ASUA 1YVUA 5KGWA 3G10A 3NF6A 3KTQA 3KZBA 3RTVA 3D0PA 1NJYA 2HNYA 4AM6A 2P9PA 4AF1A 4BRIA 3V1OA 4HCBA 3WEEB 3VQ4A 5JMVA 2UYTA 5EY4A 5C42A 2UU9K 4OLAA 3TTFA 2G8KA 2QK9A 1CZBA 4JI5K 3HOSA 2F96A 3F9MA 3LAMA 2XO7A 4DSLA 3VEOA 4CEEA 1TGOA 2Q0UA 1GOCA 3CPWM 5GINA 4BR9A 3AVFA 4AH9A 4YOXA 1E4FT 4JKHA 3CCVN 4BVOA 3WXJA 4LF4K 1SKWA 5CE3A 1E4GT 4WQ4A 4HUGA 1RTDA 3NF8A 4CK2A 3QERA 5AZIB 1NWKA 4CHZA 4CZKA 3V9SA 2FXUA 4BROA 4CW7B 4R79A 5CR4A 4YDUC 3SBGA 5KI6A 3AA3A 3OYEA 3D2EA 3G0ZA 4RW7A 3NH1A 3HM8A 5AQXA 4JKBA 1VQ4N 3EEQA 2B6AA 1P8ZA 2HVHA 3ZX3A 4B3OA 1DLOA 4DQQA 2A3ZA 1JLBA 5BR9A 3WXIA 3LALA 2D1KA 4AHTA 2GUPA 1HKGA 4DR5K 1XC3A 1S1WA 4DB3A 5AFUH 4ISEA 5KQDA 4DTRA 5C15A 4NCAA 3TWHA 1NGDA 1M1KO 3M1FA 3VEVA 4IOXA 4BRFA 4IO8A 4B9UA 4M7XA 2OZMA 1JLAA 1ZC6A 3CHWA 2Y1IA 4B9LA 1S1TA 4A2BA 1Q7YO 3AVLA 4O55A 4PKIA 4BRMA 1BI4A 1BO5O 4IG0A 2W40A 3IS9A 2HHTA 4DFKA 2O8FA 2HF3A 4FLZA 3K59A 4FVUA 4F4KA 3VTHA 3CCJN 5J2QA 3EZWA 1IKWA 3K9JA 4I2PA 5AR0A 2O8EA 4DLGA 4WFBL 1YT3A 4BE1A 1TYQB 3BF1A 1D9FA 4E1MA 4M3RA 4H4OA 3C95A 1FXXA 4G9ZA 2P9UB 3VERA 1T7PA 2NRRA 5J1EA 3L8BA 2QWPA 1RGIA 4IXCA 4EIAA 4CESA 1XI1A 1BA1A 1U4BA 2I7NA 2O8CA 4CJWA 4K0KK 3O9QA 3IRXA 5SZTA 1TL3A 4CFDA 3NH2A 1C1CA 5EXWA 1L5UA 4KI6A 3FZHA 3TARA 4KHNA 3RR8A 2HF4A 3M3ZA 4YOWA 3CJAA 3KVGA 3CJ1A 1RT2A 3QEWA 4M42A 1CZ9A 4MO5A 1XNQK 3OYIA 4KTQA 4DU4A 4UY8O 4BDZA 2G8VA 4CK3A 5AQIA 1TKXA 1I39A 3VEWA 2QW9A 3H1QA 3QEPA 2G8IA 2WONA 4BR5A 3V6DA 4JK7A 3IDHA 3NE6A 5AQVA 2IS3A 4H5TA 4CJSA 1FK9A 1REVA 4OO1J 1EXQA 1LCUA 4DV4K 2Z1HA 3J80O 1X9JA 3MEGA 3C94A 4CHPA 3KK1A 3HM9A 2D0AA 4LF6K 4FYDA 2YHBA 3CQ8A 4BG9A 3A8YA 1QZ5A 2E2OA 2QWRA 3K5OA 3MXMA 5HOOA 2FBYA 1BG3A 3MN5A 4U7BA 1L3UA 1JXBA 3WUHA 2YJEA 1HNWK 1ZBLA 2OPPA 4BRLA 1ATSA 1HKBA 3OYJA 2VG5A 3QEXA 3O9SA 3MN7A 3WXLA 1HJOA 3EKSA 5JVHL 2OCEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AGR A;  4A57 A;  4JEP A;  4KH5 A;  4A59 A;  4KH6 A;  4A5A A;  4A5B A;  4KH4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3J8A A;  1RBR A;  3RRH A;  4WFA L;  1FW6 A;  3AVB A;  4F3T A;  2XY5 A;  4EZ6 A;  4X65 K;  3SUQ A;  3F73 A;  3SNN A;  4CGG A;  4FLV A;  4DV5 K;  5DMR A;  3OJU A;  2UUB K;  1MDU B;  3A5M C;  1WSG A;  1EQY A;  1RCH A;  4CGD A;  1FKO A;  2QEX N;  2IC3 A;  3MN9 A;  2Z1G A;  4FZY A;  1ZBI A;  4H5W A;  3SMS A;  5LMN K;  5FRN A;  3UB5 A;  4WF9 L;  1OH8 A;  1TVR A;  3K0S A;  4KHQ A;  3AVA A;  4WFN L;  1IO2 A;  4CJU A;  5FRO A;  3I0S A;  4CE9 A;  3M5R A;  4DUZ K;  2A41 A;  3AAR A;  2O8D A;  1J5O A;  3QIN A;  4DTS A;  2ASM A;  2KHO A;  4RTF D;  3ULD A;  5D3G A;  2NLX A;  3F2K A;  4B9S A;  3CQY A;  3RMC A;  4YOR A;  2E2N A;  2QXF A;  2HHW A;  1VQ5 N;  3O4N A;  4BC2 A;  4WE1 A;  4O5F A;  3TI0 A;  1K8K B;  3GG4 A;  5AZI A;  3EL2 A;  3AVG A;  3K5L A;  4DSF A;  1S3X A;  2HBJ A;  2RHK A;  3B6P A;  3OYK A;  1VQM N;  4KB0 A;  1ATR A;  2P9I B;  4JI1 K;  3AVK A;  3SQ4 A;  2VQF K;  2P9N B;  4BC5 A;  4CEO A;  4AIL C;  2YNI A;  1T05 A;  4J2A A;  4M41 A;  4KV8 A;  2P9K B;  2EX3 A;  4DR1 K;  3V4I A;  2PAV A;  4LY7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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