2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
2HMPA 4BRGA 4BC3A 3U9ZA 5BN8A 1NGIA 2CGKA 3EO3A 2YJEA 4H0VB 5JMVA 5EX5A 5CE3A 3CETA 3VOVA 4CI6A 4YDUC 1T6CA 4JD2A 3VF6A 1SQKA 3CJ1A 1ESVA 2A42A 2ITMA 1SAZA 3ZX2A 3UKUB 1BA1A 3UKRA 2CGLA 1GLDG 3QICA 3CHWA 3MN6A 5BRHA 1D4XA 5AQHA 1GLFO 5AQPA 5EOYA 4EFHA 4B1VA 5AQSA 3KVGA 5AQVA 4BQZA 2E2PA 5BPMA 5LJVA 2P9NB 4RWTA 4MLEA 4H0PA 1QZ5A 3BEXA 2ASPA 1S22A 2IVPA 3JS6A 3ZEUB 1HUXA 3ZETA 1QQNA 2J4RA 1HKBA 2QWQA 4XH5A 4CBWA 4CBXA 1G99A 4XEIA 5EVZA 1Z05A 3VGLA 4B9QA 4YDUA 4BROA 4EAHD 4FOIA 3S41A 2P9KB 3ATVA 1U6ZA 1BO5O 3VF4A 3G25A 3AAQA 3DXKB 3MK6A 3L4IA 1ATNA 2I7NA 1DEJA 3UE5A 4O8KA 3BUZB 1T6DA 3EL2A 3VENA 5AQZA 4BR5A 4BVPA 5ADXA 3JXUA 5BRDA 4BRDA 3LM9A 1BDGA 1NGBA 4JN4A 3UKUA 5FPDA 5BR9A 2CGJA 1C0FA 3M6GA 4FSVA 3SLCA 2F9TA 3AAPA 4H03B 4HWIA 4Z94A 3CIPA 2FF3B 3CJBA 2P9NA 4BRKA 2VWBA 2A6AA 3R6MA 2QWNA 3H3OB 3ZEUA 3IDHA 4AM6A 3DXMB 5F0XA 5JLFA 4IXCA 4BRMA 5BRFA 4BC5A 1LCUA 3WT0A 4GNIA 4K41A 4FPBA 3VETA 2E2NA 3IUCA 1RDWX 3LDOA 4WYBA 2NLXA 2P9KA 2YHXA 4NB4A 5AZIB 3W0LA 4BRHA 3MN5A 2ASMA 4F9OA 3DXKA 3U4LA 4BR7A 5KPRA 2A5XA 1IG8A 3CJAA 4K43A 2E2QA 2P9IB 2DPNA 5AQUA 2A3ZA 1LOTB 4A2BA 2P9PB 2E20A 1MDUB 1QQOA 2V52B 5AQFA 3VGMA 4EIAA 1C0GA 3I33A 5KQDA 5AZJB 3A8YA 1R59O 4A2AA 1WUAA 3TPQA 4B1YB 4E1JA 1MWKA 2PAVA 4H0TB 3WEEB 5AR0A 1V4SA 3L0QA 3O8MA 2KHOA 3VEVA 3LDQA 4IJNA 2VCPA 1XUPO 3U9DA 1X3NA 3GE1A 3H6EA 4PKHA 3H45C 1GLAG 4BRPA 1E4GT 4CZGA 5BPNA 3FFKB 2FXUA 5AQOA 4BRAA 2NZTA 4BRFA 4H5WA 3DWLA 3ID8A 4B1XB 4B1UB 5AZIA 1BG3A 2CH6A 4BRQA 2QWMA 5AFUH 1Z6RA 1NGDA 3O08A 4BC2A 2Q0RA 1NMDA 2P9IA 1WOQA 3BP8A 4M63C 2Q1NA 4BG9A 2P9PA 2FSNA 3H1QA 4RTFD 1KAZA 5AQMA 1BOTO 1XQSC 3FZLA 4B1WB 4I6MB 2E1YA 2ZGYA 1YAGA 2FSKA 4FWPA 4IZ9A 3ENHA 2PBDA 1YVNA 3HI0A 1HLUA 3FE1A 5AZJA 2HF3A 2P9SB 2YI1A 1BUPA 1GLBG 1H1VA 3OHRA 4ISGA 1QHAA 3WEEA 3R9PA 4CD3A 3I8BA 2FLOA 2IVOA 4H0YB 5AQGA 3QB0A 1NGFA 3RSEB 3IFRA 2CH5A 4PKIA 4QS8A 3AY9A 4CBUA 4LC9B 2NRHA 1ATSA 1J6ZA 3D2FB 3MCPA 3VGKA 2VYPA 3A0IX 1NGHA 1U2VB 3MN9A 1QZ6A 3EZWA 4PKGA 2GUPA 4A61A 3DJCA 5AQTA 4PL7A 1HJOA 5AQJA 3C7NB 2YHWA 4AM7A 2ZGZA 5LJWA 1BU6O 5AQIA 1KXPA 4H0XB 4FWRA 1TUUA 4I6MA 4BC4A 4MO5A 1KAXA 3HBTA 3DAWA 1HKGA 2P9SA 3FZKA 2V7YA 3O5BA 3BF1A 4CZHA 3MN7A 2V7ZA 1K8KB 3L6QA 3D2EB 3LM2A 4QS9A 3VESA 2YCHA 3IMXA 1HKCA 3GBTA 4FWMA 3WQTA 3RSEA 5AQKA 3ZX0A 1NWKA 4WQ5A 4H5VA 1T44A 3D2FA 2P9UB 3O4WA 1U2VA 5EXWA 2E8AA 4BG8A 2E88A 2W41A 2YHYA 2HOEA 4XH4A 1TUYA 3SMPA 3VEZA 4CZIA 5B8HA 2QWPA 3CERA 2IVNA 3M3ZA 3C7NA 3ENOA 4QS7A 5AQWA 3SJHA 1JCEA 1BWFO 3VEXA 1S3XA 1ATRA 4A62A 3AARA 4L3QA 4MLHA 5I9EB 1CZAN 3FLCO 3EKUA 3EN9A 5ELZA 3WXIA 4JD2B 2V51B 3CQXA 5JLHA 4DHYA 4IJAA 4Y0WA 1K8KA 3M1FA 3DXMA 3D2EA 3VEYA 4IWVA 5BPLA 1OKJA 3EKSA 2AP1A 2H3GX 1NGJA 4J8FA 5AQQA 1JCFA 1NLVA 4FWKA 5FPEA 3VF2A 2BUPA 4JAXA 3QDKA 2A41A 2Q31A 4PL8A 2YJFA 4CZJA 4B1ZA 4FOEA 4JHDB 1NBWA 3R8EA 5F1XA 1HPMA 1HX1A 4WQ4A 3LDNA 5AQNA 5JICA 5KPZA 3WUHA 1DKGD 2QWRA 4IO8A 2ZF5O 3QBXA 1BA0A 4BRCA 5BREA 3VERA 1DGKN 1RFQA 1GLJO 4MO4A 2EWSA 3A5NC 1MWMA 3LDPA 4M7YA 1RGIA 3B8AX 3QFUA 2P9LB 1NGAA 2Q2RA 4CJ7A 5TKYA 3LL3A 4H5NA 4BGBA 3P4IA 5E26A 5AQYA 3FR0A 4DCHA 4FPAA 4NO7A 3H3NO 4FO0A 4RCHA 3WXLA 1ZBSA 4EHUA 3WXKA 1IJJA 3WQUA 4FWOA 3GOIA 4CZEA 3F9MA 2E1ZA 3H1VX 3ZX3A 2GTDA 4K42A 4FWSA 4C23A 3KZBA 2D1KA 1GLEG 2QWLA 1ZXOA 2HF4A 3SMSA 3GDQA 5EY4A 2UYTA 4BRLA 3LDLA 4JNEA 2GELA 4FWLA 4BR0A 4ISEA 4JHDA 5KQ8A 3GL1A 2Q97A 4DQ8A 1Y64A 3CJCA 4FL9A 3FZMA 2WUSA 4WQ5C 3H46O 3HM8A 3C0BA 3A5LC 4BR4A 2IIRA 1TYQB 4KBOA 2D4WA 3TU5A 2D0PA 3GG4A 5FPNA 1GLLO 1E4FT 1MA9B 3D7EO 3CQYA 3ULEB 3BF3A 1YUWA 5KPTA 3CJ7A 2P9LA 3O1WA 4M7XA 1V4TA 3HSCA 3HZ6A 1NM1A 2ASOA 1XC3A 5AQRA 2QM1A 3VEWA 1P8ZA 4CZFA 3VEOA 4BRIA 2ZWHA 2Q0UA 1KAYA 4CD1A 1X9JA 1X3MA 3WXJA 4BRNA 3A5OC 5F2RA 1SZ2A 3W3DA 4H5TA 5ADXH 5AQLA 2QWOA 4K25A 3A5MC 3QFPA 3SK3A 3VPZA 4BREA 4FWNA 2GWKA 3U8XA 1ZC6A 4BVOA 4XH1A 3FGUA 3O6WA 1EQYA 3CI5A 1TYQA 2A40A 3J8AA 2E2OA 4GY2B 4H0OA 4CZMA 2Q36A 1JCGA 4WQ4C 2D0OA 3ULEA 2QW9A 5FPMA 2I7PA 3ATUA 3FZFA 5LY3A 2QXLA 3CJ9A 4FWQA 4CZLA 5E84A 1NGCA 3O80A 1GLCG 5AQXA 3UKRB 3KHYA 2BTFA 2FSJA 2GEMA 4ISFA 5AFUA 3FZHA 4BQLA 4EHTA 2W40A 1Q18A 2F9WA 4BR9A 3HTVA 3QMLA 2AA4A 4H5RA 4DB3A 3QBWA 1QQMA 4BR2A 2FF6A 3MMVA 4BGAA 2P9UA 3UB5A 3MDQA 5BN9A 3ZETB 1NGEA 2GWJA 1NGGA 4HTLA 4CZKA 3O1BA 1YXQA 4O5FA 2OANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VQ6N 4JK8A 2NRTA 4BRGA 4M3TA 5I42A 4GW6A 2Q3SA 4H0VB 5EX5A 1T3VA 5CE3A 4B3MK 1F21A 4CI6A 4JV5K 4YDUC 1S9EA 2XY5A 3VF6A 3TR8A 1WB9A 2A42A 3NGYA 4CEOA 1SAZA 1BA1A 3UKRA 4CGFA 3OY9A 1BQMA 1GLDG 4B3TK 3QICA 3CC2N 1GLFO 4EFHA 3NDKA 4GVMA 4H8KA 2QKBA 5LJVA 1KRPA 2P5GA 4RWTA 3WNFA 4CEQA 4J2BA 3DLGA 4E7LA 2IVPA 3NH1A 1QQNA 3K9JA 4DTMA 2HHUA 4DR4K 4M41A 4XEIA 1Z05A 3VGLA 4B9QA 2X78A 2F7TA 2I5JA 2JWKA 4ELTA 4K0KK 2BANA 3OVNA 3OYLA 3LWMA 5JS2A 1U6ZA 1DTQA 1HNZK 4W5TA 1QVFM 2FC0A 5SWMA 4OKJA 5GIOA 4F3OA 2I7NA 3VENA 3BUZB 4EP5A 5AQZA 3VQ7A 4BR5A 4G1QA 1XNRK 3P38A 1RBTA 3V9UA 3AVKA 4YFUA 4FSVA 3V6DA 3SLCA 3MECA 4O0JA 3CIPA 4FLVA 3CJBA 1J5OA 1GOBA 4BRKA 2VWBA 2YNIA 3MAQA 3OYFA 1SKRA 2A6AA 4MQ3A 3HO1A 4AM6A 5F0XA 1SL0A 1LAVA 3S9HA 4LF9K 4BRMA 2XY8A 3T1YK 3KLGA 4DR1K 3WT0A 4GNIA 3SBGA 2DTUA 1RDWX 3LDOA 4WYBA 3RRGA 4O4GA 3MN5A 5AJ3K 1Z25A 3U4LA 4WCEL 3ZT4A 1Q82O 1J5EK 4Z0UA 2A1SA 5KPRA 1D9FA 2E2QA 1X9MA 1SS6A 2P9IB 1FKOA 2A3ZA 1RDBA 3OYHA 1ZBIA 4NCAA 1YIJN 1QQOA 2V52B 4PY5A 4LH5A 3P39A 4OVLA 4X66K 1HNWK 4DSFA 5DK5A 1WUAA 4H0TB 1V4SA 3LDQA 1XUPO 3OYDA 2D5RA 3ZT2A 1GLAG 4CZGA 2FXUA 4FLZA 2WONA 2NZTA 3DWLA 4B1UB 4CGIA 4N76A 2CH6A 2KW4A 1IBMK 3DM2A 1NGDA 3TSPA 3O08A 1N33K 5JS1A 2P9IA 4M63C 1WOQA 1TK8A 1EX4A 2Q1NA 5E41A 1KAZA 5AQMA 1BOTO 3K9KA 4I6MB 4B9UA 3T7ZA 3CFPA 2G8WA 4AHSA 1GLBG 3S3NA 3NAEA 3ZYYX 2OTLN 4M3ZA 4FLYA 4CJ3A 3R9PA 1LAWA 3S5TA 4CCHA 4U67L 4E3SA 3QB0A 1NK5A 4YORA 2QA4N 4AHCA 4CBUA 4Z4CA 4LC9B 5KGWA 3VGKA 2OPQA 3MCPA 4FJ9A 2RKIA 1WAFA 3SV4A 2GUPA 1ASUA 4DQPA 1C0MA 4A61A 3DJCA 4DV3K 3KWGA 1LW2A 4JKFA 5AQTA 4RW7A 3VQ6A 5AQJA 1VSKA 3C7NB 2YHWA 4LFBK 1C1CA 1UA1A 1BU6O 5M1FA 2HHWA 4I6MA 1JLGA 4BC4A 1KAXA 3HOTA 5HOOA 2Y1IA 4B9TA 3DAWA 2RE2A 1IO2A 3BF1A 4CZHA 3MN7A 3OW2M 3VTIA 1NKEA 2HBJA 3ZX0A 5AQKA 1K73O 3IAYA 4JI5K 3K0SA 1KLNA 4B08A 5EXWA 5HLFA 2E8AA 2W41A 2O4GA 1REVA 2YHYA 3OBYA 2HOEA 3SMPA 3RR8A 2X6NA 4GVEA 1M90O 3VEZA 1IH7A 2IVNA 3DMJA 3NF6A 2O8BB 3CCSN 3OYBA 3C7NA 4JS5A 4QS7A 5AQWA 4E19A 1JCEA 1S3XA 3PY8A 4N5SA 4L3QA 4MLHA 4DR2K 5CYMA 1K8AO 5JLHA 4E7JA 2E6LA 2C1IA 2H3GX 1T7PA 4Q0BA 5AQQA 3TANA 3LP2A 3AA3A 3QDKA 4DF8A 4B1ZA 3CCRN 4JHDB 5C2FA 4AHRA 5J1EA 1HPMA 4WQ4A 1TAQA 3HT3A 1JXEA 1BIZA 5JICA 3WUHA 3ZSWA 1HNVA 1DKGD 1ZYQA 1U48A 3SQ4A 3C6TA 2O8BA 2G8IA 3E9PA 3LDPA 5HP1A 3M5RA 4KTQA 1NGAA 3O9RA 3F2KA 1KQSM 1JJ2M 4BGBA 3LP1A 3AVFA 2NRVA 4BWMA 4CESA 4NO7A 4RCHA 5C2DA 4X64K 1VAZA 4FWOA 3GOIA 2E1ZA 3PX4A 3I0RA 2DY4A 3AVNA 2GTDA 4FZYA 4FWSA 1N6QA 2D0CA 1RT4A 1ZXOA 3LDLA 5JVGL 3TAEA 4JHDA 3QNNA 3QEIA 4K8XA 4AHTA 4AQYK 2YKNA 4IOAL 3C0BA 3A5LC 4E72A 1WSFA 3HP6A 4B3RK 4JK7A 1E4FT 1MA9B 3CQYA 1NK6A 3BF3A 2OYQA 2HNYA 3O1WA 4RW9A 1W9HA 2BH1A 3C6UA 2HBMA 3HXMA 2ASOA 2XO7A 1SL2A 1KSPA 1QVGM 3VEOA 4BRIA 4ZTFA 1TL1A 4KKOA 3J7ZO 5I3UA 3CCEN 1BQNA 3BZCA 1X9JA 5C10A 4NYNA 4CW7B 5BR8K 2UUBK 4C8KA 4M3WA 3TI0A 4K25A 4CECA 2OZMA 1NJIO 1VQPN 3PX0A 1WLJA 2GWKA 4KB1A 3K5NA 3LPUA 3FGUA 3O6WA 2HBLA 4O5BA 1HNXK 4H0OA 2OA8A 1S1WA 4WQ4C 2D0OA 4FCYA 1J53A 3NVKA 1CZBA 3D45A 5JVHL 4JI7K 4I9LA 5C24A 4HCCA 5CZ1A 1CXQA 1L3VA 3OYCA 3HJFA 1GLCG 3CYGA 3OYAA 3KHYA 3LWLA 2BTFA 3NVMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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