2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
3FGUA 2D0PA 3M6GA 4BRCA 4C23A 3UKRA 2QXLA 1WOQA 1U6ZA 4IWVA 1MWMA 2QWOA 1BA1A 3ZX0A 4B1UB 5F0XA 3AAPA 3VPZA 5AQMA 3C0BA 3QDKA 4M7YA 4BR2A 4M7XA 2Q2RA 4FL9A 3QB0A 2A3ZA 4H0YB 2A6AA 1KAXA 2ASOA 2D4WA 4FWNA 5AFUA 3MN5A 3O6WA 1GLJO 1GLEG 5EOYA 3O8MA 3CQYA 3AY9A 2UYTA 2P9PB 5BN8A 2GELA 3JXUA 2QWMA 4BRQA 3WQUA 4H0TB 3SMSA 4RTFD 3FZMA 2ASMA 1HX1A 4BVPA 1U2VB 4CBWA 2IVOA 3ZEUB 1DKGD 1BUPA 1MDUB 2E1YA 2YHYA 4CZEA 4H5VA 4WQ4A 3UE5A 5AZJA 2P9SA 3WT0A 4BRFA 2PAVA 3VERA 1ZBSA 1ATNA 1XUPO 3W0LA 4CBXA 4FWLA 4BGAA 5BPNA 3BF1A 1T6CA 5AFUH 2ASPA 4DCHA 3I8BA 1NLVA 4JHDB 5AQFA 2FSJA 1GLFO 2A5XA 4H0OA 3G25A 1NGFA 4H5NA 4FWQA 1S3XA 1NGHA 3UB5A 5AQPA 4IZ9A 2FXUA 5FPNA 1T44A 2CGKA 1GLBG 3A5LC 2E2NA 3MK6A 2BUPA 2QWNA 4M63C 3H1VX 2PBDA 5BN9A 4XH4A 4WQ5C 3ZX3A 2GTDA 4XH1A 1ATRA 1LCUA 3GE1A 2QM1A 3VENA 3H3OB 3QFUA 1ATSA 1DGKN 3H46O 1BO5O 1GLLO 4NB4A 2GWJA 3R8EA 2Q0RA 4H0PA 5AQYA 1JCGA 3EZWA 5AQSA 2WUSA 3FR0A 1G99A 3LDPA 4B1XB 3TU5A 4B1WB 1XQSC 3MN7A 1BU6O 2H3GX 3O80A 3JS6A 3WQTA 4A2AA 4BRIA 4FPBA 4BRMA 4BRDA 5AQNA 4IJAA 1BDGA 3LDOA 1U2VA 5EX5A 5BPLA 4IJNA 3ZEUA 3GBTA 4H5TA 1S22A 2CGJA 2HMPA 1X3MA 4CZFA 4BRGA 3R9PA 4CZJA 5BRHA 5E26A 2VYPA 4ISEA 5EVZA 5LJVA 4H5RA 1SQKA 4WQ4C 5AQZA 5F2RA 3IMXA 4BREA 2GWKA 3EKUA 1IG8A 4PKIA 5CE3A 3FFKB 3W3DA 1HKBA 3DXMA 4BR7A 4IO8A 3U9ZA 1RDWX 4BRHA 5AQIA 3TPQA 5KPZA 3DXKA 4PL7A 4NO7A 4JNEA 3MMVA 5AQJA 2FF3B 1K8KB 2I7NA 4EFHA 4BROA 5E84A 3RSEB 2VCPA 2NLXA 4B1YB 4MO4A 5KQ8A 2CH5A 2P9IB 3DWLA 3J8AA 4HWIA 5BPMA 1TUUA 1YAGA 4FPAA 3FZLA 3H1QA 3WXIA 3I33A 1NGCA 1C0GA 5JICA 2P9KB 3VGKA 3WUHA 4FO0A 4CI6A 4GNIA 4JAXA 4J8FA 3KHYA 4JD2B 2P9NB 1NWKA 2QWRA 1YVNA 2HF4A 2QW9A 2E2OA 4BGBA 2F9TA 3HSCA 5AZIA 2ZGZA 2IIRA 4E1JA 3CJ9A 5AQWA 5KPTA 3M1FA 3LDNA 3VEVA 4CJ7A 2CH6A 3H3NO 5AQQA 2W41A 3C7NB 2ZF5O 2A41A 2YI1A 2YCHA 2NZTA 3BUZB 3D2EB 2E2PA 4CD1A 1SZ2A 3ZETA 4AM7A 1GLDG 3KZBA 3CERA 1P8ZA 4B1ZA 3VEYA 1NGBA 3FZKA 1TYQB 1NGJA 4H03B 5JMVA 1E4GT 4K41A 1NGGA 4BR0A 4BR5A 5AQTA 3WEEB 4CZGA 3CI5A 3R6MA 4O5FA 4A62A 4AM6A 1NGAA 3O5BA 3CHWA 1BOTO 2CGLA 2YHXA 2Q1NA 3UKRB 3A8YA 2QWLA 5FPMA 3S41A 2HF3A 1DEJA 4BG8A 4FWOA 2J4RA 3ENOA 2Q0UA 3BP8A 3MN6A 3P4IA 2GEMA 2V7YA 4PL8A 3VESA 3WXJA 4YDUA 1QQMA 1RGIA 1BA0A 2GUPA 2QWPA 2NRHA 3RSEA 3CQXA 2I7PA 3FZHA 4FSVA 1C0FA 2P9IA 4IXCA 1OKJA 1X9JA 4RCHA 4CZLA 3GOIA 3LM9A 3AARA 3UKUB 1WUAA 2P9PA 4K42A 3O1BA 5TKYA 2W40A 1QZ6A 3EN9A 3VF4A 2KHOA 4DB3A 5EY4A 3EKSA 3VF2A 4EIAA 4BRPA 4BVOA 3L6QA 4JD2A 3MN9A 3VEOA 1Y64A 2P9NA 4BR4A 2P9UB 3GG4A 1KAYA 3O1WA 3CJAA 3CJBA 3CETA 3ULEB 2FSNA 4FWSA 3SK3A 4K25A 4BC4A 3ATUA 4BG9A 1QQOA 2YHWA 2P9SB 4CD3A 4K43A 1NGIA 3L0QA 4F9OA 3LDLA 4A2BA 3O4WA 4MLEA 3FZFA 3FE1A 3VGLA 4JHDA 4FWKA 2IVNA 2V51B 3ENHA 4XEIA 3LL3A 2FSKA 1NBWA 1D4XA 1V4SA 3VF6A 4FOIA 5AQKA 1HKCA 5LY3A 3GL1A 4CBUA 2VWBA 1BG3A 4JN4A 3FLCO 5BREA 1MA9B 5AQUA 1TYQA 3WXLA 3D7EO 5AQHA 3IFRA 3WEEA 5JLHA 2A42A 2IVPA 3QICA 3KVGA 1NGEA 4LC9B 1HJOA 3HM8A 4HTLA 1KAZA 2Q97A 3QFPA 1GLCG 2F9WA 4CZKA 4B9QA 3L4IA 1TUYA 3D2FB 5JLFA 3VETA 4CZMA 1GLAG 1CZAN 4Y0WA 3U4LA 1MWKA 2EWSA 2E88A 3F9MA 3IDHA 3GDQA 4GY2B 2AP1A 3SJHA 4YDUC 4EHTA 4BC3A 1KXPA 2P9LB 3QMLA 3UKUA 4DHYA 4FWRA 4ISGA 4O8KA 3AAQA 5ELZA 4BQLA 1IJJA 2E8AA 1EQYA 2ITMA 2D0OA 2YJEA 1RFQA 4QS7A 4B1VA 3HTVA 1ZC6A 1NMDA 2P9UA 4BRNA 1HPMA 4Z94A 1YXQA 3ULEA 5BR9A 5I9EB 1HLUA 3M3ZA 4BR9A 3HI0A 3U9DA 1HUXA 3ATVA 5B8HA 4I6MB 4RWTA 1V4TA 1NM1A 5BRFA 3VEWA 1JCEA 5AQOA 3H45C 3OHRA 2ZWHA 4QS8A 3CJ7A 3VEXA 3VOVA 1Z05A 3A5OC 3H6EA 4BRLA 3DXMB 1NGDA 2ZGYA 5AQXA 3CJCA 1Q18A 5ADXA 2OANA 5AQRA 4FOEA 3BF3A 4QS9A 3DAWA 5AQLA 3LM2A 4EHUA 2E2QA 1LOTB 3DJCA 3DXKB 1K8KA 1QQNA 3MCPA 4EAHD 3WXKA 2Q36A 4WYBA 1QZ5A 3O08A 4BC2A 3CJ1A 4MO5A 3HBTA 4PKHA 3A0IX 3MDQA 4FWMA 3ID8A 3VGMA 5FPEA 3D2FA 5AQGA 5AR0A 2P9KA 3SMPA 3CIPA 2YJFA 2BTFA 2Q31A 3EL2A 3QBWA 3EO3A 4L3QA 3A5MC 3SLCA 2QWQA 5ADXH 5EXWA 4MLHA 5KQDA 4XH5A 4H0XB 4H0VB 2E20A 2AA4A 5AZJB 2P9LA 2A40A 2HOEA 4BRKA 1YUWA 3VEZA 1X3NA 5AZIB 2D1KA 1Z6RA 4PKGA 5F1XA 4H5WA 5AQVA 1HKGA 5BRDA 4DQ8A 3C7NA 1SAZA 5FPDA 1BWFO 1QHAA 1E4FT 1T6DA 1R59O 2FF6A 3D2EA 4BQZA 3QBXA 1ZXOA 3U8XA 4CZIA 3B8AX 2DPNA 2V52B 2V7ZA 1XC3A 3IUCA 3LDQA 4FWPA 5LJWA 3ZETB 1JCFA 3A5NC 2E1ZA 4WQ5A 3ZX2A 1H1VA 4ISFA 4BC5A 4I6MA 4KBOA 5KPRA 2FLOA 3HZ6A 3BEXA 4BRAA 4CZHA 4A61A 1J6ZA 1ESVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RPIA 4CJPA 4FW2A 4C23A 3ZSRA 4KHNA 4JRPA 3T1YK 2QXLA 1NOZA 1WOQA 4FJXA 3IRXA 4FXDA 2QWOA 5JVGL 2O4GA 4GKJK 4B3OA 5CZ2A 3VPZA 1YT3A 2IC3A 1RT7A 3JAMO 4BE7B 3L2RA 2JWKA 5M1KA 1KAXA 4WCEL 3F9KA 1L3UA 5GAEP 4DF8A 2YKNA 5FDLA 3BDPA 3PX6A 3CQYA 5KRSA 4CFAA 2P9PB 2GELA 2QWMA 2OTLN 4F2SA 3HK2A 3KLEA 1U2VB 4J2BA 3ULDA 3SCXA 4B9MA 3HJFA 4CZEA 4W5TA 3WT0A 4DV3K 2DY4A 2D5RA 1TKTA 2X74A 1ZBSA 4JKDA 3JSMA 3PSFA 4DR7K 4YNQA 4FWLA 3VA0A 4DCHA 1S1WA 4E19A 4JI2K 5AQFA 3V9UA 1GLFO 1VAZA 3ZT0A 1NGHA 4M3YA 4IZ9A 1Q82O 4CJTA 2CGKA 4MDBA 1IV0A 2QWNA 1NKCA 3KKRA 4CJUA 4AHRA 4JI5K 3V81A 1RTHA 3DLLL 2RN2A 1LCUA 1E3MA 3OS0A 1DGKN 3H46O 1BO5O 1GLLO 2B5JA 4O55A 1NK8A 3RTVA 4IG0A 4NCAA 3TTCA 1JCGA 1XHXA 4YOXA 4LF7K 3EZWA 3NGYA 5C2DA 3T3FA 3OYEA 3OYCA 4C1NK 4BWMA 1C0TA 5AQSA 3OYKA 4M3ZA 3AGKA 3ENBA 4CE9A 4E72A 1VQON 3WQTA 3JS6A 4BRMA 3ALYA 3ITHA 4BRDA 5AQNA 4FLXA 3AVGA 3LDOA 1C0MA 3ZSOA 3TAPA 3GBTA 3TR8A 3TSQA 4X66K 1S22A 2P5GA 4N5SA 1QVFM 1RDUA 3QEXA 1JKHA 4BRGA 2QI2A 5BRHA 1KRPA 4M3RA 5E26A 4PY5A 3L3UA 1ZYQA 4W5QA 5AQZA 1S6PA 1IG8A 5CE3A 3VQAA 3W3DA 1HKBA 4BR7A 1Q7YO 3G71N 3CD6N 3LPTA 3QEWA 3ZSYA 1RDWX 3LDSA 1MU2A 1KFSA 3DXKA 3IKMA 4B8AB 4CVNE 1K8KB 2HNDA 5DK5A 2NLXA 1GOAA 1VSJA 4CFBA 4Z4EA 3SAGA 3LZJA 2P9IB 4HWIA 3J8AA 4B3TK 4B3SK 2ZD1A 3MWPA 3HPOA 4OGCA 5GINA 1NGCA 3AVAA 3OS2A 1WBDA 4BECA 2D0BA 1JLEA 1TV6A 1RCHA 3KHYA 3VMFB 3L4QA 1Y97A 2HHHK 3I8DA 1KFDA 2HF4A 4FLWA 3LAKA 1NNEA 4BGBA 2F9TA 3HSCA 5AZIA 4I9LA 2ZGZA 4DSKA 4KV8A 3M1FA 4JI1K 3AVCA 4I7FA 3OYLA 3HT3A 1C1BA 2NRVA 2A41A 1LV5A 4Z4GA 1VQLN 2YCHA 4HHTA 4KPYA 2HHSA 3OJSA 4DG1A 1SZ2A 2BGGA 3KZBA 3CERA 4B1ZA 3DLKA 1QE1A 4K41A 1IKYA 3THWB 2P5OA 3HRGA 4GW6A 4O5FA 3O5BA 4OX9K 3J7ZO 2YHXA 1JJ2M 1NMNA 1J9AA 3UKRB 4LH5A 3CG7A 3ZCMA 4BG8A 4FWOA 2G8WA 1QSYA 1EP4A 2OZMA 2GEMA 2V7YA 4DUYK 4B9NA 2KLAA 2QWPA 1IH7A 3CQXA 4IFYA 1NK0A 1K73O 4XJXA 3CQ8A 4RCHA 3AVKA 4CZLA 1HNZK 3NH1A 5M1PA 4DR1K 2G8UA 2P9PA 3CCUN 2C1GA 1TKXA 4C8NA 1YVUA 4DB3A 3RMAA 5EY4A 4DTUA 3EKSA 4CEQA 3ZSQA 3KLFA 4X64K 4BVOA 3MN9A 1Y64A 4CEBA 2P9NA 3AO1A 1XMQK 3CJAA 3CJBA 3CETA 2FSNA 4FWSA 3U6FA 1EETA 4H8KA 1OVYA 4YOVA 2YHWA 2P9SB 1NJIO 4K43A 1NGIA 4F9OA 4A2BA 4CK2A 4DFMA 1HNXK 1YJ9N 3E66A 1ASWA 2IVNA 2FSKA 3OTOK 2F8TA 3VF6A 4U7BA 4NXMK 2ZJQL 1YHQN 1L3SA 1HKCA 3CFOA 5LY3A 2D0CA 4YFUA 5BREA 3CM6A 5AQUA 3WXLA 4RW6A 4CIFA 2X78A 3DLGA 4OLBA 4KREA 2Z1GA 1YITN 2IVPA 3VQDA 1RT3A 1KAZA 4X62K 1NOYA 4B9QA 3L4IA 4E0DA 2UXDK 3AVIA 4CIEA 4JS5A 3ZSWA 1GLAG 1CZAN 3U4LA 4FCYA 1LWFA 5A2QO 2EWSA 1NKEA 1NK7A 2E88A 4IBNA 3T69A 1RTIA 2YNGA 4GY2B 4YDUC 3MX5A 5KGXA 4R79A 2IAJA 3BZKA 4BC3A 1Z26A 4DHYA 3J81O 4FWRA 4O8KA 2XY7A 2E8AA 4A59A 1EQYA 4DR3K 4IOCL 1JXBA 3HTVA 1K6YA 4AH9A 2P9UA 3CPEA 4BRNA 4Z4HA 4LFAK 3G0ZA 4Z94A 3NE6A 1VQ5N 4JKAA 3M3ZA 4BEBA 3HI0A 3L2QA 4J2DA 1HUXA 1VQMN 4W5NA 1VSIA 3FFIA 4MFBA 2ZWHA 2GBZA 5CYQA 3VEXA 1OH5A 3OYMA 5AQXA 3CJCA 3T19A 5ADXA 4BDYA 4LSNA 3BF3A 4DV7K 3THYA 4IEIA 3DAWA 1LOTB 1K8KA 3QO9A 4DQPA 3WXKA 1KVCA 1S1VA 4NCGA 3SNNA 3AVMA 4BC2A 1U04A 3CJ1A 2WC9A 5FPEA 1HR0K 1RBUA 4M3XA 1LAWA 5AR0A 2E6MA 1NKBA 2BTFA 2Q31A 3EL2A 3QBWA 3NCIA 4EZ6A 2HVHA 4B3MK 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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