2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
3CJCA 3GBTA 4IWVA 1NWKA 1YVNA 4IJNA 4QS8A 4EFHA 2A41A 3VEOA 2P9UA 4H0PA 5F2RA 5AQKA 4CZFA 1V4SA 4FWRA 3GDQA 3LL3A 1YAGA 1BG3A 1NBWA 4FWQA 3EKSA 3H46O 4ISGA 5EVZA 1HX1A 1HKGA 3VEWA 4CZKA 1NGAA 3M1FA 2E2NA 2YCHA 2VWBA 4IO8A 5EXWA 2I7NA 1BA0A 2Q31A 2GWJA 2HMPA 1XC3A 5AQVA 1E4GT 1HJOA 2GWKA 1SAZA 2VCPA 3CJ1A 1MWMA 4BC5A 2YJEA 5EOYA 4H5TA 4E1JA 3I33A 3SLCA 1MDUB 1WOQA 3VETA 3IDHA 3VGKA 4BGBA 3BF1A 2P9PB 1ZC6A 1RFQA 4ISFA 3MN5A 1LCUA 3O1WA 3MCPA 4BRHA 2QW9A 3H1QA 2GUPA 4FPBA 4F9OA 4CZJA 4H5VA 1YXQA 2NZTA 1DKGD 1R59O 1BU6O 2Q0UA 3FZMA 4CZLA 2Q2RA 5AQWA 4M7XA 4Y0WA 1G99A 5AQNA 1S22A 1E4FT 3CIPA 1X9JA 3M6GA 1D4XA 3QDKA 2PBDA 4FWNA 1BUPA 3UE5A 4CBUA 4FWKA 3VF4A 5F1XA 1JCFA 3D7EO 3KZBA 5AQXA 2Q0RA 4ISEA 4QS9A 3HSCA 4EHUA 3JS6A 2P9PA 4BC3A 3MK6A 1MWKA 2YI1A 2DPNA 2FF3B 2IVPA 2AA4A 2PAVA 2Q97A 4NB4A 5BRFA 4A61A 4JD2B 2OANA 4H5RA 2D0PA 4BR2A 3CJAA 4B1UB 4B1YB 1NGIA 3QMLA 5BRHA 2V7ZA 4B1VA 2P9KB 3M3ZA 1ATNA 2KHOA 3VPZA 5ADXH 4BVOA 3HI0A 3A0IX 3BF3A 3O1BA 4BC4A 1J6ZA 5AZJB 4MO5A 1NLVA 3VF6A 1NGDA 3O80A 4BROA 1HUXA 2P9SB 3KHYA 3ENHA 1XUPO 3QFUA 3AARA 3CETA 1BO5O 4H5NA 4JD2A 5AQFA 5AQZA 1KAXA 3UKUB 3BUZB 2QWLA 5JMVA 1IG8A 2EWSA 2ASOA 4FSVA 4IJAA 2P9KA 3VGMA 3WQTA 3VEXA 3A5MC 4JNEA 1V4TA 1GLEG 4YDUC 3P4IA 1NGEA 5AQUA 3L6QA 2P9NB 5AZJA 1BA1A 2YJFA 3SMPA 4O5FA 5FPNA 4EHTA 3LM2A 5ELZA 2Q1NA 1CZAN 3VEYA 2P9SA 3ZX0A 2QWNA 4CZHA 4FOEA 3L0QA 4RTFD 4GY2B 4KBOA 4NO7A 2A40A 4O8KA 4CZEA 3VOVA 3HBTA 2ITMA 1WUAA 4DB3A 3FFKB 3O5BA 2CH5A 3UKUA 5LY3A 1GLCG 3QB0A 3QBWA 2D4WA 4AM6A 4BC2A 1NGFA 1Y64A 3AY9A 5AZIB 4MLEA 2FSKA 5FPMA 2P9NA 4K43A 1KAYA 5AQQA 4RCHA 1ZXOA 3GG4A 3LM9A 5BPLA 4HWIA 4BRCA 3L4IA 1TYQB 5AQYA 4MO4A 3WQUA 2BTFA 3MDQA 4FWPA 4BVPA 4PKGA 1X3MA 4CZMA 2CGLA 4H0YB 2QWPA 1NM1A 4A2BA 3HTVA 4BG9A 3C0BA 4BRDA 2UYTA 3U9ZA 3JXUA 3FZKA 2IVOA 4FL9A 5AZIA 5BPNA 4CZGA 1HLUA 4FWMA 3R9PA 1NGCA 4MLHA 4FPAA 1LOTB 3CJBA 4RWTA 5F0XA 4M7YA 4B9QA 1T44A 4PKIA 1TYQA 3J8AA 3AAQA 3U9DA 3O4WA 4IXCA 1QQNA 2V51B 2QWRA 3MN9A 3DWLA 4PL7A 4FWSA 2A42A 1GLJO 4XEIA 2HF3A 3UB5A 4EIAA 3VGLA 1XQSC 3WEEB 3UKRB 1SQKA 3FR0A 2NRHA 4XH1A 3W3DA 4PL8A 5E26A 3MMVA 4BR9A 2QWMA 3D2EB 4WQ5C 5B8HA 5KPRA 2YHXA 1Z6RA 3HZ6A 3BEXA 2FLOA 4CJ7A 4A62A 4C23A 2FXUA 1U6ZA 2E2QA 3GOIA 3LDPA 2ZF5O 2QM1A 2BUPA 5KQ8A 1RGIA 5AQGA 3U8XA 2GELA 4H5WA 2E1ZA 5CE3A 3H3OB 3WEEA 3UKRA 2E20A 4BREA 1JCGA 3GL1A 3EL2A 5AQMA 3ULEB 4XH4A 5LJVA 3B8AX 3H1VX 1JCEA 4XH5A 1P8ZA 3D2EA 4IZ9A 5JLHA 4YDUA 5EX5A 5KQDA 4BR7A 3ATUA 4BRLA 1SZ2A 4H0TB 4WYBA 1DGKN 2V7YA 4FWLA 1EQYA 5AQIA 4BRKA 2IIRA 3ZEUB 4M63C 5AQRA 4K25A 4Z94A 3ZX3A 5JICA 2QWOA 3EZWA 2FF6A 3IUCA 2D0OA 3TPQA 3LDLA 1NGGA 3SJHA 4GNIA 4WQ4C 3ULEA 2HF4A 4B1ZA 2P9IA 3CQYA 1BWFO 1QHAA 5FPDA 1ATRA 3LDOA 4CBWA 2CGJA 4L3QA 3W0LA 4H03B 3D2FB 3WT0A 5AQLA 2CGKA 3ZEUA 1HPMA 2GTDA 3EN9A 1BOTO 5BREA 1GLBG 1DEJA 4JHDA 3FZHA 5EY4A 3AAPA 3RSEB 4DQ8A 3FZFA 3MN6A 1NGBA 4CD3A 3ATVA 4CI6A 3QICA 3VF2A 2E1YA 2VYPA 4H0XB 5BRDA 1S3XA 4A2AA 4PKHA 3CHWA 5JLFA 1HKBA 3D2FA 4J8FA 5AFUA 3DXKB 5I9EB 3LDNA 3S41A 1QQOA 1KAZA 4AM7A 5AQJA 3G25A 3F9MA 3RSEA 2ZWHA 1IJJA 1K8KB 1OKJA 1U2VB 3WXJA 4H0VB 2ASMA 2H3GX 3BP8A 4CD1A 2HOEA 2D1KA 4BR4A 4BG8A 4BQZA 4EAHD 5AR0A 3FZLA 3A5OC 2YHWA 2ZGZA 3ZX2A 3A5LC 2E2OA 4BRFA 4JN4A 2F9TA 2J4RA 3DXKA 3EKUA 5LJWA 4H0OA 3H6EA 4BRQA 3R6MA 4WQ5A 1ZBSA 3IMXA 3WUHA 3O08A 4I6MB 1NGJA 1NGHA 4BQLA 2W41A 1QZ5A 3CJ9A 3FE1A 2CH6A 1K8KA 1U2VA 5BR9A 2A6AA 3WXIA 4DCHA 2QWQA 3H3NO 3WXLA 3FGUA 2IVNA 4FWOA 3CJ7A 2E88A 4BR5A 3DAWA 5E84A 1RDWX 3CERA 3CI5A 4K42A 5KPTA 5AQSA 2P9LB 2E8AA 3HM8A 3KVGA 1MA9B 4BRNA 5BN8A 2ASPA 2NLXA 2ZGYA 3SK3A 1TUUA 2I7PA 3ID8A 4BRPA 1GLFO 4K41A 2F9WA 3TU5A 4BGAA 1Q18A 2GEMA 5KPZA 4CBXA 3DXMB 1GLLO 2E2PA 4BRAA 5TKYA 3CQXA 1YUWA 4I6MA 3ENOA 3FLCO 1ESVA 3U4LA 2FSJA 2P9IB 3EO3A 4BRIA 1T6CA 4DHYA 4BRMA 4B1WB 3R8EA 1GLAG 5BPMA 3A5NC 3WXKA 5AQOA 3QBXA 2P9LA 4HTLA 5BN9A 3SMSA 2AP1A 1ATSA 2Q36A 3GE1A 4JHDB 5AQPA 3ZETB 4BRGA 4WQ4A 3VESA 3A8YA 4BR0A 1X3NA 2V52B 4JAXA 4FO0A 3DXMA 1NMDA 3DJCA 4LC9B 5AQHA 3VEZA 2A5XA 5AFUH 4FOIA 3C7NB 3VEVA 3VENA 4B1XB 2YHYA 1BDGA 3O6WA 1TUYA 2P9UB 3O8MA 5AQTA 5FPEA 3VERA 1HKCA 1H1VA 3IFRA 2WUSA 3OHRA 2FSNA 2A3ZA 3MN7A 2W40A 3ZETA 5ADXA 1QQMA 1T6DA 1GLDG 1C0GA 3H45C 3QFPA 1C0FA 1Z05A 3C7NA 2QXLA 3LDQA 4CZIA 1KXPA 1QZ6A 3I8BA 4QS7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DLOA 4B9UA 4IJNA 2VGNA 4EFHA 2A41A 3V4IA 3VQCA 4FJJA 1T8EA 4W5RA 3DLRA 1TK8A 4YY3K 3KIOA 3LL3A 3P5JA 3TANA 4B9NA 1YAGA 1BG3A 4DU1A 3H46O 4ISGA 5EVZA 4JS4A 1HKGA 1NGAA 3SV3A 3THVA 4C8MA 1VK0A 4OKJA 1NU0A 5EXWA 1HRHA 3LP3A 2GWJA 3G71N 1SAZA 3CJ1A 4KTWA 4BC5A 1C1AA 3VQQA 4E1JA 4ILJA 2VQEK 3SLCA 4HHTA 1MDUB 1WOQA 5I3UA 4ILGB 3TAEA 3VETA 3IDHA 4ZHRA 2O8BA 4BGBA 3AV9A 3VN5A 3CCMN 3T1YK 4RW6A 1I94K 3VQ7A 2OPRA 2O8CB 1RFQA 4ISFA 4DTSA 1EO1A 2QW9A 1YXQA 1QVGM 3NGZA 5M1QA 3F5TA 1YJNN 4C8LA 4CHNA 2X78A 1X9JA 3G6EN 3M6GA 4JKEA 4Z0UA 1BQMA 2PBDA 3AA4A 2HNYA 4FZZA 1UA1A 2E4LA 4JI4K 3VF4A 4CVNE 1JCFA 1TKTA 3SPZA 1HNWK 5AQXA 1IBLK 2P9PA 3MK6A 2XY5A 2FF3B 2IVPA 2Q97A 3KK7A 4DV4K 3SZ2A 4B9VA 2OANA 4H5RA 2D0PA 1D9DA 3QEVA 1NKBA 3PX4A 5BRHA 3P38A 4J2BA 4B1VA 2P9KB 3I0SA 3VPZA 3O3FA 3HI0A 4BC4A 4KHWA 4JKGB 4AH9A 3KLHA 3NCIA 3E9PA 4UQGA 5M1OA 2NRWA 4CF2A 1C0MA 1BQNA 4LF7K 3L8BA 4R79A 1KAXA 3C6UA 3LZIA 3ZSQA 3NDKA 5JMVA 2PFUA 2EWSA 5KRTA 2F7TA 4JNEA 3THYB 1CXQA 3P4IA 3OYGA 3AA3A 4ELVA 2QK9A 5AQUA 4X65K 1EWQA 2P9NB 3G10A 4O5FA 1WNSA 2AJQA 3LM2A 3D6RA 4OPJA 2P9SA 4DV6K 1T3VA 4LFAK 2KLAA 4FOEA 3TAPA 3L0QA 3RVCA 4GY2B 3LDSA 3BGRA 5DM7L 4FLXA 5HL7L 3C94A 2ZQBA 3VOVA 3F73A 4DB3A 2WFBA 1QSYA 3UKUA 3N4QA 4FJIA 3KJVA 4FVMA 4FJ5A 5FLXO 4Z4FA 1NGFA 3N4PA 4DTUA 1OH8A 5FPMA 1Z26A 1TKZA 5AQQA 2PZSA 3HOSA 4BDZA 1C1BA 3T1AA 4KHYA 2Y1JA 3QNNA 3RMBA 1X3MA 4CZMA 3TAFA 4H0YB 3K9JA 5GAGP 4A2BA 4CEQA 5DK5A 4FW2A 3S3MA 4WF9L 4FWMA 1XMOK 3HOTA 4MLHA 3CJBA 1C0UA 4LFBK 5KTQA 3CCQN 5CR4A 3U9DA 1VSIA 3KK3A 1CLQA 3HK2A 1OVYA 2W42A 1IV0A 4TSXA 1W97L 3DWLA 5CZ1A 1TL3A 4ZTFA 4O8UA 3ZT1A 2C1GA 1VRTA 3NE6A 1WN7A 3UB5A 3LWLA 3L3UA 4JKCA 1XQSC 2VG5A 5M1PA 4PL8A 1TK0A 3K2PA 4BR9A 4DTXA 2QWMA 3D2EB 4WQ5C 5B8HA 3E01A 5M1FA 4FK0A 5KPRA 1SKRA 1Z6RA 4KPYA 1K73O 3DRSA 2ETJA 3T3FA 3BEXA 4CJ7A 1L5UA 4FLYA 2O4GA 3TWHA 4F8RA 3J7ZO 3NVMA 2ZF5O 3OY9A 5GAHP 5KQ8A 1RGIA 2F8SA 1VQ7N 2GELA 4GV3A 4M3TA 5CE3A 1Z25A 3UKRA 2IAJA 2OTLN 2OZMA 5HROA 2VGMA 3CQ8A 3B8AX 3H1VX 4EP5A 4IZ9A 1I3AA 2UXBK 4OJRA 2V7YA 4FWLA 1EQYA 3O9SA 3TTFA 4BRKA 3OS1A 2FBYA 2IIRA 3ZEUB 4JI2K 3ZT4A 1BIZA 3THXB 4M63C 3DLHA 1ASUA 5JICA 2QWOA 3EZWA 2FF6A 4DWIA 3TPQA 3LDLA 2X74A 3SJHA 1QE1A 3VQEA 4DR4K 4CEOA 4HVJA 3ULEA 4IG0A 3ITHA 3AVFA 1BL3A 4CIGA 3AVHA 3LDOA 2CGJA 3W0LA 4H03B 3CPEA 5C2DA 2CGKA 4KB1A 4CJFA 4OVLA 1OH5A 1DEJA 5LL6Z 3U3GA 4NLBA 4DQ8A 1RT6A 4HUFA 4B3MK 3V9UA 4FM2A 2HHTA 3CMAN 1DTTA 4CD3A 4CI6A 1S6QA 3QICA 3VF2A 4B8CA 3AO4A 3OS0A 4YFUA 2DFHA 1T03A 4X66K 5JLFA 1HKBA 3SQ2A 4FYDA 3K0SA 1NG9A 3C6AA 1R0AA 4M3YA 1XMQK 1RDUA 3S41A 3AGRA 4LH4A 3NFAA 5GIOA 3R3LA 1NJZA 2VG7A 2HHHK 1W9HA 3V81A 4FJMA 4B9MA 3AVAA 4OGCA 2G8HA 3JSMA 1IG9A 2KZZA 4FJHA 3HL8A 3A5OC 3QEPA 2P51A 3Q7BA 2Y1IA 3TABA 2W00A 3H6EA 1S1TA 1ZBSA 4OGEA 2NUBA 2W41A 1K8KA 4DCHA 3TSPA 3CJ7A 2HHXA 3DAWA 5E84A 1RDWX 4CF1A 5BR8K 3HVTA 2E8AA 3ID8A 3QO9A 3WNEA 4CEDA 4K41A 3TU5A 3TTCA 1Q18A 2GEMA 5J2QA 4CBXA 3DXMB 1GLLO 2E2PA 3WNGA 1HNVA 1RDCA 1B9FA 5TKYA 1YUWA 3FLCO 3U4LA 2FSJA 4B8AB 4O5BA 3I0RA 4OKKA 3HJFA 3R8EA 5JENA 4F3TA 2YNFA 4CJ5A 4H4MA 3WXKA 5HOOA 2O8EA 3WXMB 4OPKA 4MDBA 5BN9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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