2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
2E88A 5JLHA 5BN8A 5AQGA 3HTVA 2ZGYA 3GE1A 3CJ9A 4Z94A 1TYQA 1YAGA 1YUWA 4FWKA 5CE3A 2P9KA 2H3GX 1H1VA 3FE1A 1HPMA 4JAXA 1BDGA 3LDOA 1MA9B 5BRDA 5AQSA 4BRHA 3H1QA 1JCGA 3ULEA 1P8ZA 1NGBA 3A5OC 4FL9A 3SJHA 4K25A 4L3QA 1BO5O 2ASPA 4QS9A 5E26A 2IVOA 2F9WA 4IJAA 1DKGD 4RCHA 4F9OA 1ZBSA 5AQIA 3GL1A 4BGBA 2ZF5O 4B1VA 2GUPA 1K8KA 3QBXA 3C7NA 2F9TA 4FPAA 1NLVA 4BR9A 1YXQA 2CGKA 2A3ZA 2J4RA 5F1XA 2E2QA 3D7EO 1GLBG 4M7XA 4KBOA 4H0TB 2FF3B 2OANA 4B1ZA 4EFHA 3WT0A 3OHRA 1U2VB 5AQVA 1RFQA 4H0VB 4H5NA 3CETA 4BGAA 3AAQA 2D1KA 5ADXH 3DXMA 3A0IX 2YJFA 4QS8A 4CZJA 1XC3A 2YHXA 3DXKB 5EXWA 5ELZA 4FWPA 3CJAA 1BOTO 4BC3A 4CZFA 2IIRA 1GLLO 4A62A 5E84A 3EZWA 3BP8A 3BF1A 3IDHA 4BREA 3MN6A 3LDNA 1NM1A 1ZC6A 5JMVA 4Y0WA 5BR9A 3J8AA 3CIPA 3P4IA 4BRPA 3O1BA 4O8KA 4MLHA 4ISGA 2Q31A 3DAWA 2E8AA 1RDWX 3LDQA 1C0FA 4JD2A 4BR4A 5LJWA 3AAPA 1NGEA 3RSEB 4FWQA 3WQUA 4DCHA 4FWRA 4K41A 1BA1A 3HBTA 3O80A 2PBDA 1GLDG 1NGGA 1GLFO 3L0QA 2P9PB 3ATUA 4CBUA 3D2FA 2V7ZA 3ATVA 1JCFA 3WUHA 2QXLA 2FLOA 3VEVA 4H0PA 1HJOA 1MWKA 1ATSA 4EAHD 1SZ2A 3B8AX 4MO5A 4PKHA 3FGUA 4JN4A 3CQXA 2P9SA 1C0GA 4FOEA 5AQMA 4O5FA 1QZ6A 1U2VA 3SK3A 1GLCG 2ZGZA 4BVPA 1ATNA 3R9PA 1TUUA 1Z05A 4B1WB 2QWQA 2D0PA 2E2NA 2E20A 4M63C 1NMDA 3VERA 3VEOA 4BR7A 4BR0A 1QQOA 1RGIA 4XEIA 1Z6RA 1GLAG 4BC4A 3IFRA 3G25A 3CERA 5ADXA 3FZMA 4BG9A 5AQKA 5BRFA 1NWKA 3VPZA 5BN9A 3ZEUB 3BF3A 1GLEG 3GBTA 3MK6A 4H03B 5AZJB 4XH4A 3UKUA 1OKJA 4FOIA 5BPNA 4B1YB 3HZ6A 4CJ7A 1S3XA 1BU6O 4FWOA 3CQYA 5AQXA 3TPQA 1QQMA 2Q2RA 2YCHA 3S41A 1NGDA 5AQTA 3QBWA 3QFUA 5AQZA 2AP1A 1KXPA 4XH1A 3R8EA 3CHWA 2EWSA 3RSEA 5KQ8A 4A61A 4C23A 2A40A 2HF3A 4WYBA 4H0YB 3IMXA 1NGHA 2IVPA 2CGJA 1QQNA 3FZFA 3VGLA 2QWMA 2VWBA 3WXIA 4J8FA 3SMPA 1HKCA 4BRKA 4BRLA 4CD1A 4B1UB 4BRGA 3U4LA 3DWLA 2P9NB 3LM2A 2YHWA 4BR2A 3AY9A 3MMVA 2E1YA 4GY2B 2KHOA 1LCUA 4A2BA 5FPNA 3SLCA 2Q0RA 4K42A 2HF4A 3MCPA 3HI0A 3QDKA 2W41A 1S22A 2UYTA 1QHAA 1IG8A 2YI1A 3WEEB 4FWNA 5AQYA 3ZX0A 3HM8A 2FSJA 5KPTA 4BRNA 2GWJA 3W0LA 5AQHA 3O08A 5AFUA 5AZJA 1J6ZA 1X9JA 1NGAA 1KAXA 2D4WA 2HMPA 2P9LB 5AQLA 4CZIA 3CI5A 4H5RA 5JICA 1SAZA 1D4XA 2NRHA 5BREA 2W40A 1WUAA 3GDQA 4CBWA 3CJ7A 3MN5A 2VYPA 3WQTA 3EL2A 3EO3A 4IXCA 2FSKA 1V4TA 3QB0A 5AZIB 3F9MA 3CJCA 1U6ZA 3FLCO 2BTFA 5EOYA 4CD3A 3LDPA 2ITMA 1KAZA 3ENHA 3O6WA 4FWLA 3VF2A 2A6AA 5KPZA 2Q0UA 1ATRA 2GTDA 3CJ1A 1ZXOA 2P9NA 2ASOA 4K43A 1TYQB 2A41A 1DGKN 5AQRA 5LY3A 4BROA 4FWMA 3QMLA 2YHYA 1BA0A 3D2EB 4FO0A 4IWVA 3M6GA 3ZETB 2P9IB 3H46O 5BPLA 2I7PA 1MDUB 3TU5A 4B9QA 4DQ8A 2A5XA 2FSNA 3H45C 5FPMA 3VF4A 4IO8A 5LJVA 4BRAA 4CZMA 3MDQA 1HLUA 1T6CA 2GWKA 5JLFA 3ID8A 2E2PA 3L6QA 5KPRA 3BEXA 5AFUH 3DXKA 3VETA 2Q97A 4IJNA 3KVGA 5AQNA 5FPEA 4H5WA 2V7YA 2CGLA 1BUPA 3VEYA 1LOTB 4YDUA 2CH6A 3H6EA 3VF6A 2HOEA 4BRIA 4B1XB 2D0OA 2QW9A 4I6MB 4PKIA 1K8KB 5AQWA 3C7NB 3VENA 2IVNA 5B8HA 4BQLA 5BPMA 4WQ5A 3AARA 4PL8A 3FZHA 4CZHA 3H1VX 4JNEA 2PAVA 5EVZA 5AZIA 3U8XA 3UE5A 2VCPA 2V52B 4DB3A 3FZKA 3FFKB 4BR5A 3VGKA 1V4SA 4BRCA 4IZ9A 4GNIA 3MN9A 1E4FT 3KHYA 5TKYA 3LL3A 1E4GT 3WXKA 4XH5A 4BRFA 3DXMB 3O5BA 3W3DA 4YDUC 2P9PA 5EX5A 1DEJA 3C0BA 1G99A 1X3MA 2WUSA 4LC9B 3EKSA 1WOQA 4RTFD 1T44A 3U9ZA 4WQ5C 4BRQA 3D2EA 1BWFO 4H5VA 3UB5A 5AQOA 4NO7A 4AM7A 3ZETA 4BRMA 2P9IA 3HSCA 4JHDB 4CZGA 1XQSC 3FR0A 1R59O 2NZTA 5AQUA 5AQQA 4PKGA 1HKBA 3UKRB 4JD2B 1GLJO 2FF6A 2ASMA 4A2AA 4DHYA 1HKGA 3LM9A 4I6MA 3ZEUA 1TUYA 4QS7A 2P9UB 3EKUA 2DPNA 3VEXA 4WQ4A 3GG4A 4BC5A 3CJBA 1NGFA 3D2FB 4ISEA 4BVOA 1YVNA 1NGIA 5F0XA 4CZEA 2CH5A 3M3ZA 4HTLA 1CZAN 2E1ZA 4H0OA 2QWNA 2FXUA 2E2OA 4NB4A 2P9SB 4EIAA 1QZ5A 4EHUA 2Q1NA 1HX1A 4FWSA 1KAYA 3BUZB 2GELA 3QICA 3JXUA 1IJJA 3FZLA 4CZLA 3VESA 4CI6A 5I9EB 1HUXA 3KZBA 1ESVA 3O1WA 3H3NO 4BG8A 3M1FA 1NGCA 3H3OB 4RWTA 3VEWA 2GEMA 4CZKA 3SMSA 4H0XB 4ISFA 4WQ4C 2QWOA 1Y64A 1NBWA 3A5NC 3EN9A 5F2RA 3WXLA 3UKUB 4FPBA 1JCEA 4BQZA 1MWMA 4JHDA 5AR0A 1Q18A 1XUPO 3VOVA 4PL7A 2P9KB 4EHTA 3IUCA 3I8BA 3A8YA 5EY4A 5AQPA 3UKRA 4FSVA 4E1JA 4MO4A 3ULEB 3WEEA 2QWPA 4HWIA 1EQYA 2BUPA 5FPDA 5KQDA 3I33A 2P9UA 1X3NA 2AA4A 4CBXA 2QWRA 2NLXA 2P9LA 4AM6A 2YJEA 2ZWHA 5AQJA 3ZX3A 3U9DA 4BRDA 2V51B 3VEZA 4MLEA 3A5MC 1NGJA 3O8MA 3WXJA 1SQKA 4H5TA 4M7YA 5BRHA 2QM1A 1BG3A 3QFPA 3L4IA 2Q36A 2QWLA 3R6MA 3MN7A 5AQFA 2A42A 3O4WA 3VGMA 4BC2A 1T6DA 3DJCA 2I7NA 3ENOA 3GOIA 3JS6A 3ZX2A 3A5LC 3LDLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E88A 4DF8A 4DFPA 1CZBA 3VQBA 3GE1A 4KFBA 2VG7A 5CE3A 3MXMA 1N36K 1GOCA 1I39A 4LSNA 1L5UA 4JAXA 3K5OA 4X66K 1MA9B 4U67L 5BRDA 3H1QA 3OBYA 2IOCA 4W5OA 4K25A 4B9NA 3QO9A 2ASPA 4HVJA 3VQEA 3LDSA 2IVOA 4M3UA 3BY5A 3D45A 4IJAA 4E3SA 2O8BA 3RTVA 1A5VA 5AQIA 4AHSA 4N41A 1WSJA 2RN2A 1VQKN 3QBXA 4CK2A 3LWLA 3SNNA 1TK5A 2Z1IA 3QEVA 3VQAA 3QEIA 4BDPA 5F1XA 3PIPL 1IKYA 2B4JA 4NYNA 3TSUA 3PO5A 4DR6K 4H5NA 3TAFA 4FJHA 4KHYA 4C8NA 2YX6A 2D1KA 5ADXH 3VQQA 2YJFA 3MEEA 4JI7K 3P83D 4CZJA 1DT9A 1QQCA 3ZSVA 4CK1A 4KAZA 4C1NK 1VK0A 2BDPA 4FWPA 4CJTA 2ZJPL 3LP3A 3AVIA 4JKGA 3BF1A 4KB0A 1ZC6A 1FKPA 4F4KA 1NK0A 1NJZA 4CFAA 1B9DA 3TAPA 1HYZA 1RT1A 4NYFA 4CCHA 1NJIO 4DU3A 2Q31A 2YV0X 1C0FA 4BR4A 3DLBA 3AAPA 5I3UA 5I42A 2D0BA 3RSEB 4AHRA 1IKVA 3OS1A 3HBTA 3EZ5A 4B3MK 3AVCA 3BZKA 3O80A 2PBDA 3HT3A 4QAGA 2P9PB 1JCFA 1LWCA 2QXLA 2FLOA 3VEVA 4Z4CA 1MWKA 3WNEA 3CM5A 1RCHA 3ZSOA 1C0GA 5AQMA 3CXCM 1U2VA 3SK3A 4CHZA 2VQFK 4BVPA 1YI2N 3V9WA 4M63C 4FJ9A 3LP0A 3VQDA 3VEOA 3R3LA 3WNHA 1Z6RA 3S3NA 1NOZA 3IFRA 3AA2A 2XY7A 3CERA 3FZMA 1NWKA 3VPZA 4YHHK 5BN9A 3BF3A 3MK6A 1JKHA 1W7AA 5AZJB 3V81A 4M3XA 4ZHRA 4I9LA 4XH4A 3UKUA 1K8AO 4DV5K 3O9SA 4B1YB 3M8QA 4DTXA 1TGOA 4DV1K 4Z4EA 3S41A 4PA1A 1X1PA 5AQTA 2JLEA 3MCAB 3ZSWA 1IV0A 3OYLA 1KFSA 4DU1A 3TAGA 2IVPA 2F7TA 4FJ8A 1RILA 1JLEA 4BRKA 3AVAA 4GV3A 1HNWK 3DWLA 4KH6A 2P9NB 3LM2A 3CC4N 1IBKK 3CCEN 3SLCA 3KLEA 3E01A 1FJGK 1UOCA 3ZSYA 4HUFA 3AVKA 3MCPA 3PSIA 4GVMA 4LFBK 3O9RA 2NRVA 1REVA 2UU9K 4CGJA 4MDBA 4NCAA 5AQHA 2VQEK 1J6ZA 4FJXA 1NG9A 3BZCA 4JKCA 3JYTA 4KPYA 2IS3A 2D5RA 4CF8A 4CZIA 4IEEA 4H5RA 3MAQA 3CCSN 4DQSA 4PHTX 4LF9K 3QEPA 3GDQA 4C8LA 4YORA 4KKOA 2O4GA 3O9TA 3G71N 4JKHA 3EYZA 1RT3A 2LSNA 1HQEA 1XHXA 2FSKA 3F9MA 1U6ZA 1KAZA 3LALA 3HYFA 3LPUA 4CEOA 3O6WA 1QE1A 1L3SA 3S3MA 3SBTA 2GTDA 5GINA 3CCJN 4K43A 4DQPA 3MX5A 4ILGB 4CF0A 3HPOA 2ITGA 1DGKN 3AO3A 5AQRA 4N56A 5H1SQ 3QMLA 3OYBA 2FBTA 3DLRA 4CHNA 4CJLA 2E6LA 3ZETB 2UXBK 3HVRA 1SV5A 5BPLA 3O4NA 2A5XA 3H45C 5LJVA 4IO8A 1LWEA 4BRAA 1FKOA 3MDQA 4B08A 1HLUA 3S3OA 3BEXA 1Q81O 2Q97A 4IJNA 5AQNA 5FPEA 4H5WA 3KK1A 2JWLA 4YDUA 1U4BA 4MQ3A 1Q82O 2D0OA 1KLMA 3VQ4A 3M8PA 1D5AA 3HVTA 4GMJB 4BQLA 2GBZA 4DS4A 3VA3A 4WQ5A 1WBBA 2HSTA 3AARA 2OPPA 3H1VX 1ITGA 2G8KA 3ZSZA 3AVNA 1CXUA 4BRCA 4IZ9A 1RBVA 5TKYA 3KHYA 4B8CA 3QEXA 1S6PA 3DXMB 2X74A 2P5OA 5K14A 5C0YA 3E1YA 2KZZA 2P9PA 5HOOA 5CY4A 4FK0A 3F5TA 5CZ1A 2EX3A 4KI4A 1TKDA 4I7FA 1T44A 4NLBA 3U9ZA 1I3AA 4NO7A 4IEIA 1K73O 1TVRA 2WFBA 4JKDA 4BRMA 1HRHA 5KTQA 3O4QA 2PZSA 5AQUA 4M3YA 1GLJO 2FF6A 3EEQA 3PY8A 4DTSA 2HNZA 4FJKA 1WSEA 2JGUA 4OVLA 4QS7A 2DPNA 3GG4A 4DMNA 3CJBA 1NGFA 2FC0A 2HBLA 2CH5A 4HTLA 4DSFA 3OW2M 4CIFA 1LW2A 4RW4A 4HUGA 4EIAA 4EHUA 4E1NA 4DTRA 3NGZA 3J81O 5GIPA 1TAUA 3BUZB 4FJJA 4J2BA 2GELA 1IJJA 1HQUA 1G15A 4E7LA 3K9KA 1NKCA 2UUBK 3O3HA 4BG8A 5BR8K 4Q5VA 4CGIA 3OYHA 4JI5K 5CHIA 1KFDA 3MWPA 4H0XB 4ISFA 4WQ4C 1VQMN 1NBWA 4DSIA 4LF4K 4FPBA 3PV8A 4R79A 3D0PA 1WB9A 4JK9A 4CFBA 3I8BA 3UKRA 4FM1A 2X78A 4E7JA 3CCQN 2P5GA 1EQYA 3ZT3A 2KQ2A 1IKXA 1RDUA 3OJSA 3ASMA 3MX2A 4JEPA 4FLYA 2YJEA 2ZWHA 5AQJA 1S1XA 3ZX3A 4BRDA 3MWTA 2QI2A 4B3SK 3PO4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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