2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Homo sapiens
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
3LM9A 1S3XA 4J8FA 3L6QA 1BO5O 2CH5A 2V51B 3FZFA 4M7XA 1NGIA 3KVGA 2NRHA 4CZIA 2ASOA 5AQYA 1ZBSA 3A5LC 1T6DA 3LDQA 4FO0A 1J6ZA 3FZLA 4C23A 4BC3A 2P9KA 1RGIA 2A5XA 4JN4A 4MO4A 4XH5A 3FZKA 1ZC6A 4B1XB 2E2QA 3VF6A 1MWKA 4XH1A 3MN6A 2D4WA 3IUCA 3LDNA 4CZGA 1IJJA 4FOEA 3H1QA 4K43A 5JLHA 4ISGA 4JD2B 4BR2A 4BRCA 5CE3A 5AQHA 5FPEA 2CGJA 4QS9A 3D2EA 4H0VB 4FWMA 3FLCO 4FPAA 5AQWA 2YJFA 3M6GA 1DKGD 4WQ4C 4AM7A 3C7NA 3VGKA 2PAVA 1EQYA 3IDHA 1YAGA 4AM6A 3O1WA 1Z6RA 1MA9B 3U9DA 3ZEUB 2Q97A 1E4GT 5BR9A 4I6MB 5KPRA 1D4XA 4FWOA 4H0TB 2FF3B 1GLDG 4CD3A 2HMPA 1OKJA 3VEOA 2FSNA 1C0GA 5AQTA 2Q36A 3HI0A 3RSEA 5AQJA 2A41A 3CERA 4BRFA 3CJCA 1SZ2A 1P8ZA 1TUYA 4XEIA 2DPNA 2KHOA 3LL3A 3CJ1A 3VEXA 4JNEA 2ZGZA 2VYPA 3I33A 4H5NA 5AQIA 2E1YA 5AZJB 3DWLA 1H1VA 3MDQA 3QBXA 3VPZA 4QS8A 4B1ZA 3WXIA 4CI6A 4H0PA 1XQSC 2ASPA 2E8AA 4BR5A 4BRMA 3U8XA 5KQ8A 4FWLA 3VF2A 1U6ZA 2HOEA 1C0FA 3GDQA 4IXCA 5EVZA 2ASMA 2E2OA 3H3NO 2V52B 1BA1A 4O8KA 1NWKA 3H3OB 3WXJA 3ZETB 4BROA 2NZTA 3ZEUA 2GWKA 5AQZA 3J8AA 4CD1A 4I6MA 3IFRA 1SQKA 3C0BA 1V4SA 3AY9A 4FL9A 1NGCA 3CJ9A 3VGMA 2QWOA 1Y64A 1GLEG 4NB4A 3BP8A 2IVOA 3SLCA 4H0XB 2GTDA 3ID8A 3SMSA 2QXLA 3R8EA 4K42A 3DXMB 3IMXA 3L0QA 3ZX3A 4BR4A 4GNIA 4A2AA 3QMLA 1BUPA 2E2PA 3O08A 4PKIA 3DXKB 5AQNA 4L3QA 4CBXA 1NGAA 3CJBA 3FE1A 1XUPO 5AQUA 4WQ5C 2QWPA 5BPMA 1KAXA 3LDOA 4K41A 3BUZB 2P9IB 2Q2RA 2A40A 4WQ4A 4H5VA 4QS7A 1BG3A 5ELZA 5TKYA 4BC2A 3ZETA 4CZHA 2A6AA 5AQPA 3GBTA 4BC4A 1CZAN 2F9TA 1HKCA 4PKHA 3LDPA 5EXWA 4BRAA 4LC9B 1DGKN 5I9EB 4YDUC 5BRDA 3U4LA 2UYTA 4B1YB 3ULEB 2P9UB 3HBTA 3GE1A 3JS6A 5KQDA 5F0XA 3O5BA 4JHDB 3L4IA 4KBOA 4WYBA 3QICA 2QM1A 1JCEA 1T6CA 3CJAA 3BF1A 1GLLO 3DXMA 5AQFA 5AQVA 3CQXA 3FZMA 3A8YA 1KXPA 2A42A 1ATRA 3ATVA 4RWTA 3WXKA 3LM2A 4A62A 4CZMA 4CZKA 5LY3A 4BRQA 4FWPA 5AFUA 2Q0RA 2I7NA 3CI5A 2GEMA 1HUXA 4EHUA 1KAZA 1IG8A 2YHWA 1QQOA 2P9IA 4HWIA 3A0IX 4MO5A 1ESVA 4BRGA 2WUSA 2OANA 3F9MA 3HM8A 5FPDA 1MWMA 4DHYA 1GLJO 3I8BA 4EHTA 3A5MC 1QQNA 3VESA 3UKRB 4FOIA 3ULEA 2P9UA 1LCUA 1K8KB 2IVPA 4PL7A 5ADXA 4JHDA 3HTVA 3QFUA 5AQQA 2Q0UA 5F1XA 3A5OC 3ENOA 4JD2A 5E26A 5BN9A 4CJ7A 5AZIB 2QW9A 5BRHA 3DJCA 3FR0A 3O6WA 2CH6A 3VGLA 4BR7A 4XH4A 3EZWA 5AQOA 4HTLA 4IJAA 2CGLA 2IVNA 2FF6A 2D0PA 5FPMA 3ZX2A 2EWSA 3W0LA 1TYQB 1HPMA 4ISFA 3MCPA 3MN7A 3VEZA 2P9SB 1E4FT 3ENHA 3VEWA 5BPNA 1NM1A 3WEEB 4WQ5A 3FFKB 5E84A 4MLHA 3WQTA 1JCGA 4BRPA 4CBWA 3SK3A 4E1JA 4IJNA 3QFPA 2V7YA 4FPBA 5BRFA 3UKRA 3M3ZA 3QBWA 1X3MA 4BGBA 1V4TA 3VENA 4YDUA 2P9PB 4H5TA 1K8KA 3ATUA 5AQKA 5AZJA 4BRIA 3WUHA 4CZFA 4MLEA 4Y0WA 1RDWX 2QWLA 2YHXA 5AZIA 1BOTO 1MDUB 5EOYA 3G25A 4IZ9A 5AR0A 2YJEA 3GL1A 3MMVA 1BDGA 3UKUB 3AAPA 3EKUA 2W41A 2GUPA 4B1VA 2QWQA 1HKBA 4BR9A 1TYQA 2QWMA 4IWVA 3TPQA 1QZ6A 5F2RA 3H6EA 2P9SA 5AQXA 3AAQA 4H03B 3WEEA 1SAZA 5JLFA 4A2BA 1GLBG 4Z94A 2BTFA 4BG9A 4BRNA 3SJHA 3EKSA 5AQSA 4F9OA 4FWNA 4H5RA 5JICA 4BREA 4BRLA 4PL8A 5AQGA 3KZBA 4DQ8A 1GLFO 4BRDA 1ATSA 3S41A 2P9LB 1U2VB 3ZX0A 2P9PA 5LJVA 1YUWA 4EFHA 2QWNA 3RSEB 3D2FB 1Z05A 1X9JA 2H3GX 4EAHD 2E88A 4BG8A 3H46O 2D0OA 3CETA 3O1BA 3VF4A 3WQUA 2VWBA 3HSCA 3DXKA 2W40A 2ZF5O 4B1WB 5AQMA 4H0OA 3BF3A 4H0YB 3CIPA 4FWQA 4BGAA 4FWKA 5AFUH 1NBWA 2I7PA 2NLXA 5FPNA 3UKUA 1BU6O 1WOQA 2VCPA 2AP1A 2E2NA 5EY4A 1NGFA 2E1ZA 1KAYA 4IO8A 2J4RA 1NGGA 3VERA 4M63C 4ISEA 3MN5A 4JAXA 3OHRA 3R9PA 2Q31A 3EN9A 4H5WA 4BRHA 4CZEA 3TU5A 3BEXA 4CZJA 1R59O 2FXUA 3UE5A 2YI1A 1QHAA 4BRKA 4BVOA 4A61A 2E20A 5JMVA 2V7ZA 5BN8A 4O5FA 2P9LA 1S22A 1XC3A 1U2VA 1Q18A 2FLOA 4BR0A 5ADXH 3VETA 1NMDA 2FSJA 3AARA 3VOVA 2FSKA 3FGUA 3VEVA 1JCFA 1NGDA 2CGKA 3D2FA 2IIRA 4FWSA 3EL2A 3U9ZA 1HLUA 3VEYA 3O8MA 4B1UB 3EO3A 1NGBA 3HZ6A 4M7YA 3GOIA 1BWFO 4EIAA 3P4IA 1NGJA 5KPTA 1QZ5A 2AA4A 2P9NB 2QWRA 4FSVA 4BVPA 5BREA 5LJWA 1BA0A 4K25A 2GWJA 1QQMA 2ZGYA 1ZXOA 3O80A 4BQLA 1GLAG 2D1KA 3QDKA 1GLCG 3CHWA 3H1VX 5B8HA 3QB0A 3D7EO 3B8AX 3WXLA 1RFQA 2HF3A 3WT0A 4PKGA 3MN9A 4DCHA 1YVNA 4GY2B 3MK6A 3W3DA 2BUPA 3A5NC 3FZHA 2HF4A 2YCHA 5AQLA 3UB5A 3LDLA 5EX5A 1DEJA 4BQZA 4CZLA 4RTFD 1NLVA 1TUUA 2A3ZA 2ITMA 1ATNA 4BC5A 5KPZA 3CQYA 1WUAA 2P9KB 5BPLA 3O4WA 2GELA 1HKGA 2F9WA 1HX1A 4CBUA 3R6MA 4B9QA 2ZWHA 3H45C 1NGEA 1X3NA 2Q1NA 1G99A 1HJOA 1NGHA 1LOTB 3KHYA 3DAWA 4DB3A 2YHYA 1YXQA 2P9NA 3CJ7A 3JXUA 3M1FA 2PBDA 3D2EB 3C7NB 4RCHA 1T44A 3SMPA 5AQRA 4NO7A 4FWRA 3GG4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4J8FA 2FBYA 3L6QA 1BO5O 3P1GA 1XWLA 3KVGA 2NRHA 4CFBA 4ID1A 2YX6A 3LDQA 3CC2N 1J6ZA 2G8HA 3FZLA 4DV0K 4DSFA 2G8FA 3V9WA 4BC3A 1FJGK 3ZSVA 4X64K 1Q82O 3WNHA 3RMCA 4JN4A 1VSFA 4WFAL 3HRGA 2WOMA 1VSMA 3MN6A 3IUCA 3AVFA 2HNYA 4B3TK 3OYCA 4BR2A 3NH2A 4BRCA 2X74A 5FPEA 4E7HA 1NJWA 4QS9A 3D2EA 3CMAN 3QEPA 2VQEK 3S5TA 3QEVA 3HPGA 1EQYA 1X9MA 4CEFA 4LFCK 3NF7A 3OS1A 1TKZA 1Z6RA 4CJ5A 4WE1A 2WBNA 3BGRA 3TWHA 1OH8A 2X6NA 3ZEUB 2G8UA 4M45A 5BR9A 5J2MA 4XIUA 4AF1A 1S9GA 1OKJA 1I3AA 1S6QA 3DLKA 4FLTA 2KZMA 5AQTA 3HI0A 1M1KO 5I3UA 3RSEA 2XO7A 4CK2A 4XEIA 2DPNA 5LMNK 3CJ1A 1OVYA 4IKFA 2VYPA 2FBTA 3I33A 3V9XA 5J1EA 3CFPA 5AQIA 3MDQA 4RW7A 3WXIA 3V1RA 4CI6A 3PX0A 1VQPN 4KTWA 1TKXA 3ASMA 4CJLA 4BRMA 2JLEA 4FWLA 3VF2A 4B9NA 2G8WA 4WF9L 1BIZA 4IXCA 5EVZA 3H3NO 3QEXA 1YVUA 3E01A 3WXJA 2NZTA 3NGIA 4HTUA 3J80O 5AQZA 5HBMA 3G10A 3IFRA 1D8YA 4CFCA 2HHXA 3NVKA 1F21A 1ASUA 3D6RA 4FL9A 5CY4A 3CJ9A 2QWOA 4PY5A 1EWRA 4NB4A 4DQPA 3I55N 1Q81O 4O0IA 4J2EA 3IAYA 5HRRA 2IVOA 3SLCA 4A59A 2O4IA 3KK7A 3SMSA 1RCHA 1RTDA 4LH5A 1UA1A 3HOTA 3G4SN 3TSPA 4GNIA 2P1JA 4KH6A 2W42A 2GUIA 2D0CA 4PA1A 3O08A 1O1WA 3O3HA 4CEOA 5AQNA 4CBXA 4RW8A 3SUPA 1HNIA 4WQ5C 2QWPA 3AA4A 3BUZB 4DSKA 2Q2RA 2A40A 4DV1K 2KTQA 4QS7A 5TKYA 4BC2A 5C42A 4YOTA 5AQPA 3VTIA 1CZAN 3VQ8A 3NH0A 4BRAA 1DGKN 4CIFA 3CC4N 1WSIA 3CG7A 2YNHA 2IGIA 3ULEB 3NAEA 2EX3A 4M3YA 4KHQA 4KBOA 2G8KA 4WYBA 3QICA 2QM1A 4FLZA 1S9EA 5AQFA 5M1PA 3ZCMA 1VQMN 4N47A 3VQ9A 2YKNA 5CR4A 3ZSQA 4CEAA 1KVAA 3HPHA 4RWTA 3LAKA 3CCUN 5GIPA 4A62A 1SL1A 2BH1A 5LY3A 4QCLA 2VWJA 4DSIA 1KVBA 2QXFA 3OYHA 5FRMA 2NRVA 4ILHA 3MECA 3VQQA 2F8TA 3NMUA 2YHWA 2P9IA 4CGHA 4EP4A 3A0IX 4OKJA 1ESVA 4IFYA 4BE2A 4BRGA 2HBKA 4E7IA 3HM8A 4AHVA 3C65A 1U48A 1HNVA 4W5RA 4CGJA 1ASWA 3TTDA 2NUBA 4LSLA 4EHTA 5KGWA 3A5MC 1NK9A 5T7BA 1C0MA 1N6QA 3SBGA 3T3FA 1NK8A 3H08A 4PL7A 3ZSXA 3L4QA 4CF0A 3MWPA 4IG0A 2Z1HA 3A5OC 3ENOA 5E26A 3DJCA 4CESA 1VQ6N 2CH6A 2Y1JA 4XH4A 3EZWA 4HTLA 2D0PA 1C1CA 4KHYA 4IEIA 3C6HA 5KTQA 4M3WA 3RR8A 3AO3A 3AVKA 4OGEA 2Q3SA 4L8RB 4WQ5A 4YOUA 4DTUA 4YHHK 4FM2A 3AA3A 4MLHA 1WBDA 1RT7A 1JCGA 4BRPA 3M8PA 3OBWA 3SK3A 3B6OA 4BACA 3SUQA 4QOZB 3DOLA 3PSFA 2V7YA 4F8RA 1LWEA 1X3MA 3R3LA 3PIOL 1BI4A 4DTJA 3ID6A 3SQ2A 5AQKA 4KHWA 1VQ5N 4MFBA 2O8EB 2PYLA 4H8KA 4HCCA 1RDWX 5AZIA 2WONA 3VQ5A 1BOTO 4FJHA 4DU3A 3FFIA 2IDOA 1EX4A 3GL1A 5BR8K 4UQGA 4GV6A 4B1VA 3OYMA 4GW6A 3TPQA 2HHWA 3SBTA 2P9SA 1G15A 3TAPA 1RT5A 4E3SA 4Z0UA 2VG5A 3MX2A 1GOCA 2WTUA 4H5RA 5JICA 3CCJN 5AQGA 3KZBA 3KJVA 4E19A 1KFSA 3UIQA 2PZSA 1ATSA 3PIPL 4CF8A 1U2VB 5I42A 4FVMA 5LJVA 4DTNA 1YUWA 4K8XA 1HNWK 3RSEB 1KFDA 4OKKA 4CHPA 2UUAK 3VF4A 2VWBA 3HSCA 4Z4EA 3HM9A 4JKGA 4PWDA 3BF3A 4FWKA 5AFUH 2BDPA 3KD1E 1BU6O 2VCPA 4JS5A 4W5QA 2HB5A 3HYFA 5EY4A 1W7AA 2DFFA 1BGXT 4FM0A 3VERA 4M63C 3S3NA 3MN5A 3TAEA 5C2FA 2QA4N 2Q31A 4BRHA 3M5RA 1R59O 2O8CA 5MLCQ 3CYMA 1TKDA 4BVOA 3K5OA 3QESA 4Q5VA 3THXA 3MWTA 1BISA 4CJSA 1ZYQA 2P9LA 1XC3A 4N41A 4BR0A 2BANA 1QE1A 1JCFA 1QTMA 4FWSA 4E1MA 1N5YA 3ZSYA 1N36K 1KVCA 3O8MA 3T7ZA 4B1UB 1N34K 4LF4K 4JKBA 1RBSA 2W00A 2XY5A 2QTDA 4EIAA 2DY4A 3P4IA 5KPTA 3LZIA 2AA4A 2P9NB 2QWRA 5BREA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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