2VCPA

Crystal structure of n-wasp vc domain in complex with skeletal actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Interactions of isolated C-terminal fragments of neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) with actin and Arp2/3 complex.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 104
structure length 370
sequence length 371
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2vcpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2vcpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2vcpA04
1NGBA 2FXUA 3ZETA 4PL7A 2PBDA 2D0OA 1TUYA 3B8AX 3M6GA 3G25A 3A0IX 3DAWA 2QWLA 3R9PA 2FF3B 3QICA 5AQJA 2E1ZA 3WEEA 4BRFA 3WXKA 5BPNA 3VENA 4O5FA 3R8EA 3QB0A 1E4FT 3M1FA 4XEIA 1ATRA 4FO0A 5KQ8A 2Q36A 3CQYA 4L3QA 3SMPA 5AQTA 2P9NA 3C0BA 2Q0UA 2D1KA 2P9UB 4B1WB 2HF4A 3I8BA 4WQ5A 3EL2A 5ELZA 2EWSA 3FLCO 3ZX2A 2YHXA 4B1VA 2YI1A 5JLHA 2A42A 4Y0WA 5KQDA 2UYTA 4DQ8A 5BRFA 3UKRA 4K43A 3VERA 1JCEA 2F9TA 3KZBA 4H0VB 1BG3A 4O8KA 2A5XA 3H1VX 4BRAA 3ZEUA 5BPLA 4PL8A 3ATVA 2GTDA 1QQMA 3EN9A 4HWIA 4BRIA 3HZ6A 3DWLA 2IVPA 5F1XA 3WXIA 1KXPA 2P9LA 4QS7A 4DHYA 2A6AA 4WYBA 5AZIB 5AZJB 5JICA 1XUPO 4DCHA 5FPEA 4H5VA 3WT0A 1QZ6A 1E4GT 3D2FA 4IZ9A 2IVNA 2AP1A 2PAVA 3SMSA 1NGEA 5EY4A 2YHYA 3DJCA 5FPMA 4CBUA 2IVOA 4K42A 4A2BA 3GDQA 5ADXH 3H3NO 4EAHD 1X3NA 3BEXA 3WQTA 3O1WA 3HM8A 4PKIA 3O8MA 1NM1A 1V4SA 1QZ5A 3I33A 1NGGA 4YDUC 2GEMA 4JD2A 5AQWA 3TPQA 2CH5A 4AM6A 1V4TA 2Q97A 2CGLA 2ZGYA 4M7XA 3LDNA 1K8KB 3WQUA 1CZAN 3A5OC 4H0TB 1U6ZA 3SJHA 1MDUB 1U2VA 4FWKA 1MWMA 2E8AA 3O4WA 3W0LA 3WXJA 5JMVA 4BC2A 3VGLA 2V51B 2FSJA 3VEOA 4B1ZA 4ISFA 2ZGZA 3H1QA 3CJ1A 1C0FA 4CZKA 4FPAA 3CERA 3MN9A 4CBWA 2WUSA 3SK3A 1Z05A 3QFUA 3BF1A 4YDUA 3IFRA 5BPMA 3HSCA 5JLFA 1T6CA 2YCHA 2YJEA 3UKUB 3VEVA 5ADXA 5LY3A 3WUHA 1HX1A 2E20A 1TYQB 5KPRA 4NB4A 1C0GA 2YHWA 4FWNA 2P9SB 3CJBA 2W41A 5AQHA 5TKYA 2QWRA 4JAXA 3DXMB 3DXKA 2FF6A 2D4WA 3AAPA 2NZTA 4XH4A 4XH1A 1HJOA 3QDKA 2ITMA 4FWPA 2NRHA 4JHDA 4KBOA 4H0OA 4M63C 4BC4A 1S22A 3LL3A 1R59O 1DKGD 4ISGA 3RSEA 5AQGA 4IWVA 1BA0A 3JXUA 1RGIA 3L4IA 2H3GX 1QQNA 3VGKA 3JS6A 3HTVA 3MN5A 1JCGA 1HLUA 3A5NC 4FWLA 3ZETB 4BRCA 3CJ9A 2Q1NA 2I7NA 4BVOA 3ULEB 1HKBA 2VWBA 4PKGA 4ISEA 5LJVA 3O08A 1ATNA 3GE1A 3AAQA 1NGCA 1T44A 4B1UB 3WEEB 5AQFA 3CQXA 2HF3A 3U9ZA 3UB5A 2V52B 3D2EA 3M3ZA 4LC9B 1WOQA 2HMPA 5AQXA 4BREA 5CE3A 3OHRA 3BUZB 1GLDG 1GLJO 1XC3A 2BUPA 5BR9A 5KPTA 2E2OA 1HKGA 1HUXA 3C7NB 1RFQA 1NGJA 1X9JA 2FLOA 5AZJA 3FFKB 3H6EA 1NGAA 4BGAA 4E1JA 4H5RA 4BR4A 2NLXA 4H5NA 1BOTO 2P9KB 3FZMA 3H45C 5FPNA 1WUAA 3ID8A 5AQZA 3F9MA 3ZEUB 1LCUA 4BRPA 4BQZA 2P9PB 2D0PA 1GLBG 2Q31A 5AQLA 5E26A 5AQVA 3IUCA 1T6DA 1Y64A 5AQQA 3KVGA 4BRNA 1HPMA 4A61A 1SQKA 5BN9A 3D2FB 2GUPA 3CJAA 2Q2RA 4CZEA 5BREA 3ENHA 4FWSA 4BGBA 4A62A 4FSVA 1BWFO 2DPNA 2E2NA 2QWOA 3CETA 1IG8A 3EZWA 5EVZA 4RCHA 4QS9A 2F9WA 4FOIA 1K8KA 3O80A 1NLVA 5AQPA 1NGDA 4FPBA 3VGMA 1GLEG 3GBTA 4BVPA 2E88A 4BG9A 3FZLA 4I6MB 1DEJA 2YJFA 4CZHA 5KPZA 3EO3A 1H1VA 3AY9A 1D4XA 3HI0A 4WQ4C 3QBXA 4BR0A 1YAGA 5E84A 2ASMA 2J4RA 2KHOA 4CZGA 3H3OB 5AFUH 2V7ZA 2QWMA 3U8XA 4AM7A 4MLHA 4BG8A 3CJ7A 5EX5A 1MWKA 4B1XB 4RWTA 1SZ2A 4FWRA 1U2VB 3BP8A 1BDGA 1GLAG 3VESA 2P9IA 1ZC6A 4H0YB 4BC5A 3MMVA 2P9SA 1TUUA 2CGKA 2FSNA 1DGKN 3CHWA 2QXLA 2A41A 3DXMA 4XH5A 1ESVA 4FWQA 3S41A 3CI5A 1MA9B 1BO5O 1KAZA 3LDPA 4A2AA 2CGJA 3FGUA 4QS8A 4BRGA 4BR5A 2QM1A 4NO7A 3IMXA 4HTLA 5AQIA 1NGFA 4BRLA 4BRQA 3CJCA 2E1YA 3MK6A 3DXKB 1BU6O 5LJWA 3MCPA 4WQ5C 4CZIA 1GLFO 4JHDB 3U9DA 1ATSA 3ULEA 4CJ7A 4EHUA 5AQMA 4CZLA 4EFHA 2ASOA 1NWKA 1NGHA 3ZX3A 1LOTB 3LDOA 5AFUA 1XQSC 1S3XA 2P9UA 4BRDA 5F0XA 1J6ZA 4H5WA 3RSEB 1KAXA 2QW9A 3GOIA 4IXCA 3BF3A 2GELA 4IJNA 4GNIA 1NMDA 4RTFD 5BN8A 2ZWHA 2BTFA 4FL9A 5AQUA 4Z94A 2AA4A 2V7YA 3EKUA 4H03B 5I9EB 4CI6A 3AARA 3FR0A 3FZHA 3VF2A 1BA1A 5F2RA 2ZF5O 1OKJA 2P9NB 3H46O 3MN6A 4BRKA 1YVNA 4GY2B 4MLEA 2QWPA 3U4LA 4M7YA 3W3DA 4FOEA 4BR9A 5AZIA 3C7NA 2HOEA 3EKSA 4MO5A 4CZMA 4CD1A 3QFPA 3UKRB 3P4IA 5EOYA 1YUWA 2E2PA 3VETA 2P9KA 2VCPA 5AQYA 3ENOA 3D2EB 4PKHA 3A5LC 4CZJA 5AQKA 2P9PA 3VEXA 5AR0A 2P9LB 4IO8A 4B1YB 2A40A 2FSKA 4K41A 3O5BA 4H0XB 4EHTA 3TU5A 1SAZA 4BR2A 1X3MA 3D7EO 3VEWA 3L0QA 4JN4A 3A5MC 2Q0RA 1BUPA 2OANA 3MN7A 3LM2A 3VF4A 2E2QA 3HBTA 3VPZA 3FE1A 4J8FA 5AQRA 2QWNA 4FWMA 3UE5A 3ZX0A 3FZFA 4DB3A 4B9QA 4BC3A 4BRMA 4CD3A 1JCFA 2CH6A 2GWJA 3SLCA 2I7PA 4I6MA 3WXLA 3GL1A 4C23A 2A3ZA 4H5TA 1Q18A 1YXQA 5B8HA 4JD2B 5AQSA 5BRHA 1ZBSA 3VOVA 1RDWX 1QHAA 4JNEA 3L6QA 3O6WA 5EXWA 4BRHA 4K25A 4H0PA 3GG4A 3UKUA 4CBXA 3MDQA 2GWKA 5AQOA 1EQYA 3LDQA 4IJAA 1TYQA 4MO4A 1ZXOA 1G99A 3QMLA 4FWOA 2VYPA 5AQNA 1GLLO 4EIAA 3O1BA 3LDLA 3CIPA 4BROA 1NGIA 1QQOA 4BQLA 2ASPA 5FPDA 1KAYA 3QBWA 4WQ4A 3A8YA 5BRDA 4BR7A 2P9IB 1GLCG 4F9OA 2IIRA 3ATUA 4CZFA 3FZKA 3VEZA 1NBWA 3J8AA 1HKCA 1IJJA 3IDHA 1P8ZA 3KHYA 3VEYA 2QWQA 2W40A 3LM9A 3R6MA 3VF6A 1Z6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XY5A 3OYIA 2ZE2A 1NK6A 1TUYA 2F8TA 4KH5A 1KSPA 1TK0A 2D0CA 4AHRA 2OTLN 3CM6A 5GAEP 3M6GA 3A0IX 5GIOA 1O13A 2P5OA 4DSFA 3DMJA 5AQJA 2FC0A 3CFRA 2Y1JA 5LMNK 4O5FA 3QB0A 1VQLN 1HNWK 4KPYA 3T69A 2I5JA 5AQTA 3SMPA 3KIOA 4A5AA 3C0BA 2P9UB 4B1WB 3OYNA 5JLHA 3FLCO 4KB0A 2YHXA 4CF0A 1VHXA 5KQDA 2UUBK 4B3SK 3OYAA 2UYTA 4DQ8A 4O5BA 5BRFA 3S9HA 2OZSA 4MDAA 4B9MA 3NHGA 4O8KA 2A5XA 4IOAL 3ZEUA 5BPLA 4YOXA 4PL8A 4KH6A 4Z0UA 3LWMA 1KLNA 3LP1A 1SL2A 3E9LA 3TR8A 1EETA 2OCEA 3SQ4A 2A6AA 3KTQA 4X65K 4LSLA 1QZ6A 1WSGA 1E4GT 3D2FA 3SMSA 1NGEA 1U48A 2E6MA 3FFIA 1NK0A 1P90A 5FPMA 3KLIA 3MX5A 4IDHA 5SWMA 4A2BA 2BH1A 4IOXA 2E6LA 2GV9A 3O1WA 3VQ5A 4QOZB 4PKIA 1QZ5A 1RT6A 3N4PA 1OVQA 4IG0A 4Z4CA 4KTZA 4W5OA 2A1SA 3M8RA 4CIFA 3RRGA 1BGXT 1FXXA 4OJRA 4CEFA 4DF4A 3SJHA 4G1QA 1TAQA 4M3XA 1MDUB 3AVFA 4FWKA 3O4WA 1SKSA 3WXJA 3K9KA 2UXBK 3VGLA 4M3TA 4B1ZA 4ISFA 3Q7CA 4CZKA 2PYJA 3AVKA 3VQCA 1CZ9A 2VG6A 3QFUA 4YDUA 4DKWA 2HHWA 3IFRA 5CYMA 3OYKA 3T1AA 1T6CA 2DFFA 3VEVA 3WUHA 3R1XA 1TYQB 5KPRA 3LPUA 3ZT2A 2GUIA 2W41A 5AQHA 1TGOA 3AVHA 4CFAA 2D4WA 3NVMA 3NAEA 1BCMA 2G8VA 3QDKA 4KREA 2X78A 1S22A 3LL3A 1QVFM 1DKGD 4ISGA 1E3MA 1K8AO 4OPAA 2KFNA 1RGIA 4O0JA 3J81O 3JYTA 1RDBA 4J2DA 3MN5A 1JCGA 3DI6A 1B9FA 4M45A 3NVKA 3ZETB 3SYZA 4DTOA 4OKJA 3AVNA 5LL6Z 4BVOA 4DTRA 2VWBA 4ILHA 3KLHA 3OYGA 5FROA 3O08A 4FM0A 3CXCM 3AAQA 2FBVA 3VQ7A 3OYCA 4M3RA 1QS4A 3SCXA 2YV0X 4FJGA 4JI1K 4B9SA 3D2EA 1W9HA 5AQXA 2HVHA 4NYNA 2OZMA 5CE3A 4DTPA 4DV4K 3HRGA 2UXCK 3S3NA 3KJVA 4HUFA 3L2WA 1IH7A 4H5RA 2RN2A 1YF5L 4DR6K 1C0UA 5AQZA 3F9MA 4CJRA 2GBZA 2P9PB 1GLBG 2QKBA 3IKMA 5E26A 1DLOA 3EZ5A 2YNFA 1RDCA 4FVMA 4C8OA 4LFAK 1GOAA 1NK8A 1VQKN 1JLBA 4CEOA 1HPMA 4A61A 2G8KA 4CZEA 4FJ8A 3VQDA 4YOYA 1BWFO 2DPNA 3JSMA 1ASWA 4FJ5A 4C8MA 1LAVA 2UUAK 1KTQA 4H8KA 3RMDA 2WC9A 4FK4A 1NGDA 4FPBA 3L2QA 1BQMA 3VGMA 4BVPA 2E88A 1HYSA 3FZLA 1DEJA 4CZHA 4FLUA 1OH8A 4CEDA 1D4XA 3BDPA 4WQ4C 1YAGA 3TAGA 1TVRA 1NK7A 4CZGA 1L3TA 3CPWM 3KLGA 4DV6K 5SZTA 1T03A 3CF5L 4GV9A 2V7ZA 4AHCA 3AVLA 5J2MA 2HNYA 5AJ3K 4B1XB 1SZ2A 3BP8A 1GLAG 1VSFA 3ZLJA 3D0PA 4BC5A 3F2KA 5KRTA 1K6YA 3HK2A 1HJRA 2O8CB 1ESVA 4CJQA 3CI5A 3PIPL 3L2RA 3PSIA 4PUOA 1DTQA 1EP4A 2VG5A 4C8LA 4YOVA 4DQQA 3QEIA 1NGFA 2O4GA 1IV0A 4BRQA 2E1YA 2B4JA 3NMUA 5LMUK 1GLFO 3SBTA 3U9DA 4CJ7A 1NGHA 2E5LK 1LOTB 3LDOA 1XQSC 1TK8A 3HXMA 1C0MA 3SAGA 3RSEB 1O1WA 3E9OA 4M3ZA 3AVJA 3GOIA 1RT3A 4GVMA 4LFBK 2HNZA 1BIUA 1J5EK 1BIZA 2HBLA 2BTFA 4FL9A 4B9TA 4H03B 5HLFA 1VQ5N 1U04A 4NCAA 1YVNA 4NCBA 3BZCA 4MLEA 2QWPA 3S5TA 4WFAL 3DLLL 4M7YA 4V19S 4BR9A 3I56N 3NE6A 4MO5A 4ZTJA 4RG8A 4CD1A 3QFPA 1CXQA 4CZMA 1DTTA 3P4IA 5EOYA 3AO4A 1ZYQA 1QE1A 2VCPA 5K14A 5C24A 1TKDA 4PKHA 4B3RK 3DRRA 3A5LC 5AQKA 3LAKA 2P9PA 3DLGA 2A40A 4CJ5A 2FSKA 2IGIA 4ZHRA 1CXUA 1U4BA 1VQ8N 3OYEA 1RT5A 5DM6L 4UY8O 2R7YA 3K5MA 3A5MC 2Q0RA 3ZT0A 4KI4A 1WBBA 3MXJA 2E2QA 4N76A 5J2QA 3NF9A 3AVGA 1JLQA 2QWNA 2F96A 1VSHA 1HNIA 1J54A 1IBMK 2KQ2A 1VQ6N 1RNHA 4O0IA 3FZFA 1A5VA 4B9QA 4BRMA 5FDLA 4AHUA 4CJSA 3HM9A 2CH6A 2I7PA 1RT4A 4CJLA 4DTNA 4H5TA 1YXQA 1FW6A 4JD2B 1ZBSA 3CFOA 4KKOA 3OTOK 1J9AA 2PZSA 3OBYA 4KFBA 2RF2A 3L6QA 5EXWA 3EE9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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