3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/actin-binding protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
3KHYA 4JD2A 2V51B 2FXUA 3D2FB 4I6MA 3A5LC 4QS9A 5FPMA 1QZ6A 2F9TA 4BR0A 3D7EO 2P9PA 4H5NA 1NGJA 4HWIA 1NGHA 4B1WB 4PKGA 3CJBA 1S3XA 5AQVA 2A40A 4AM6A 4CZIA 1RDWX 4IJAA 3MN6A 4BQLA 1BO5O 4I6MB 3U4LA 3GDQA 3DXKB 4CZHA 5AQUA 1GLDG 5FPNA 2A42A 3LDQA 1X9JA 5AQRA 4CZLA 2YJEA 2Q31A 3ZETB 3DXMA 2HF3A 4MLHA 4CZFA 1QQMA 4FWPA 5AQOA 3C0BA 5BRFA 2VCPA 2V52B 3L0QA 4DCHA 1GLCG 4FOEA 3MDQA 3WEEA 1HKGA 3UKUB 2P9SA 4FL9A 4FWNA 1RGIA 1YXQA 4O5FA 3UE5A 3QICA 3AAPA 2V7YA 3IMXA 3QFPA 5ADXH 4IZ9A 2QM1A 3U9ZA 4CD1A 1ZC6A 5EXWA 3ZEUB 3WQUA 4M7YA 4EFHA 4H0TB 3FFKB 4FPAA 1EQYA 1C0GA 2ASMA 2P9NB 3VEZA 4BC3A 4A62A 1TUUA 3FE1A 3D2EA 5AQJA 3VESA 3WEEB 3QDKA 1Z05A 4ISFA 4BRKA 4Z94A 3GE1A 4H5VA 3VEYA 3CERA 2GWJA 4JNEA 1YUWA 1BG3A 3RSEA 1MWMA 3C7NB 1IJJA 4MO4A 4K43A 4RCHA 4L3QA 4BROA 1HPMA 3VETA 2EWSA 1NBWA 2GTDA 3VF4A 4Y0WA 1BWFO 5AR0A 3O1BA 3O80A 3HSCA 5JLHA 2ZWHA 3KVGA 1TUYA 3EKSA 4B1XB 3EKUA 3VEWA 3CJCA 3WXLA 4BR7A 1LOTB 2AP1A 3R8EA 2YHXA 3O5BA 3BUZB 2WUSA 3UB5A 5CE3A 1QQNA 1ATRA 3LDNA 4BR2A 1K8KB 4CBWA 3LL3A 4HTLA 5AZIB 5BN8A 2GELA 4BRCA 4CZEA 5F2RA 3ENOA 1HUXA 3LDOA 3VGLA 2F9WA 4M63C 2GUPA 4BVOA 2CGLA 3CETA 3JXUA 3A5MC 4YDUC 1ESVA 2YI1A 1P8ZA 4NO7A 3U9DA 3R9PA 3GBTA 3QMLA 1X3MA 2E88A 4BRGA 3D2FA 2GWKA 5LJVA 5KPRA 2V7ZA 4BR5A 3ATUA 4BR9A 2IIRA 1Q18A 3SK3A 3O8MA 4B1VA 3QFUA 4FOIA 3P4IA 5AQQA 4DB3A 3R6MA 4RTFD 1R59O 2D4WA 1NGDA 3EN9A 3DXKA 4YDUA 3ZX2A 1KAXA 1NGAA 1BU6O 3EL2A 4FPBA 3H46O 3A0IX 2CH5A 4IWVA 1XC3A 3ZETA 3MCPA 2Q2RA 5KQDA 4WQ5C 4WYBA 4K25A 5AQWA 1G99A 5AQYA 4AM7A 3CJ1A 4FWMA 2A6AA 3CIPA 2BTFA 2OANA 3HZ6A 3UKUA 4BRNA 2UYTA 3CHWA 4H0OA 2P9LA 1YVNA 3FZFA 3WQTA 3W3DA 1V4TA 4BG8A 1NGBA 3M3ZA 3J8AA 3ZEUA 4BRFA 5AQNA 1YAGA 2P9UB 4B1UB 2E20A 2P9NA 4FWKA 5EX5A 2ASOA 4BC4A 5AQKA 3WT0A 3BF1A 3VENA 1NGCA 2D0OA 2P9LB 3SJHA 2YHWA 1MA9B 1GLAG 3A8YA 4WQ5A 3QBWA 1OKJA 2J4RA 3VEVA 4BC5A 1JCGA 1NGIA 3BP8A 3WXIA 3IDHA 1SQKA 3C7NA 5ADXA 5KPZA 1NGFA 5F0XA 4BRPA 3DAWA 2HOEA 3TU5A 4FWOA 3WXKA 1U2VB 2Q0RA 5BRDA 1U6ZA 1D4XA 4QS8A 4WQ4C 5AQZA 5JLFA 2D0PA 2NLXA 3QB0A 3O08A 1IG8A 1ZBSA 4BRQA 1HLUA 1C0FA 3CJ9A 3H6EA 4PKIA 4GNIA 1XQSC 5F1XA 1E4FT 1ATNA 1SAZA 2P9KB 1K8KA 3AAQA 1J6ZA 5AZIA 3IFRA 4H5TA 3FZHA 4M7XA 1ZXOA 1WOQA 4BVPA 2QWQA 3H45C 2I7PA 1DGKN 4FWLA 4RWTA 5AZJA 4WQ4A 2QWOA 3CQYA 4DQ8A 3F9MA 4H03B 3VGMA 4BC2A 3VEXA 2DPNA 1WUAA 3VERA 2E1ZA 4IXCA 3JS6A 2E8AA 4CZJA 4J8FA 2FSNA 1T44A 3TPQA 2PBDA 3ENHA 2ZF5O 3WXJA 1HJOA 5AZJB 4DHYA 2CGKA 3MN9A 5B8HA 4BRLA 4CZMA 2YCHA 3A5OC 4JHDA 4BQZA 1GLJO 4B1YB 3M6GA 4CD3A 4A61A 4H0XB 3MMVA 4H5RA 2QWLA 4ISGA 4BRMA 1KXPA 4IO8A 2A5XA 2H3GX 3HBTA 5BN9A 4JAXA 5AQLA 3VF6A 1KAZA 3O6WA 5AQSA 3DWLA 5AFUH 1V4SA 4CJ7A 1Y64A 3I8BA 3S41A 4JHDB 5EOYA 1QHAA 5LJWA 1NLVA 1T6DA 1RFQA 1Z6RA 2P9IB 2E2OA 5BPNA 5EY4A 2FLOA 5AQIA 4IJNA 3LDPA 4O8KA 3DJCA 4BGAA 3UKRB 5AQXA 4FWQA 5TKYA 1QZ5A 5FPDA 3ULEA 2KHOA 4QS7A 5JMVA 3SLCA 1HX1A 4CBUA 3BF3A 4XH5A 2P9UA 1GLBG 2W41A 3W0LA 4BRAA 4H0PA 5LY3A 1LCUA 3VOVA 4C23A 2IVNA 4E1JA 3OHRA 2QW9A 1NWKA 1NM1A 2HMPA 2W40A 4BRDA 3FZKA 2CH6A 2BUPA 5ELZA 1HKBA 2QWRA 2A3ZA 2QXLA 4FO0A 3ULEB 3FZLA 3A5NC 3HTVA 3CJ7A 3FLCO 1H1VA 4EIAA 3BEXA 1BA0A 2GEMA 4BG9A 4BR4A 5BPMA 2NZTA 5BPLA 1KAYA 4JD2B 3O4WA 4MLEA 1BA1A 3CQXA 4FWSA 4F9OA 2ITMA 1U2VA 1QQOA 2QWMA 2P9PB 2FF6A 3H3NO 5EVZA 3B8AX 3VF2A 4B9QA 3MK6A 1DKGD 4H0YB 4K41A 3ATVA 5AQMA 4BRHA 3CJAA 5AQTA 5JICA 2ASPA 1BDGA 3GG4A 3HI0A 2I7NA 4A2AA 3FZMA 4EHUA 3AARA 2P9KA 3LDLA 2PAVA 4LC9B 2E2NA 5AQGA 3VGKA 4K42A 3FGUA 1E4GT 2A41A 4MO5A 1X3NA 3DXMB 1BOTO 2QWPA 3VPZA 1MWKA 3CI5A 1T6CA 4ISEA 1XUPO 2CGJA 4BRIA 3MN5A 5AQPA 1ATSA 1TYQA 4BREA 4GY2B 3GOIA 2D1KA 2ZGZA 4NB4A 4BGBA 3L6QA 2Q0UA 2NRHA 5BR9A 2FSKA 2P9SB 3SMPA 5FPEA 1JCEA 5E26A 5AQHA 2VWBA 3ID8A 4FSVA 4XH1A 4CZGA 1DEJA 3M1FA 1GLEG 3MN7A 3AY9A 4EHTA 3L4IA 1NGGA 1TYQB 3VEOA 1BUPA 2FSJA 3ZX3A 4EAHD 3D2EB 3EO3A 3FR0A 4CI6A 5BRHA 3LM9A 4CZKA 5AQFA 1NGEA 1NMDA 3O1WA 4CBXA 4H0VB 2Q36A 3H1VX 4JN4A 3RSEB 4A2BA 1GLLO 2IVOA 4H5WA 5E84A 4PL7A 2QWNA 3U8XA 1S22A 2Q1NA 3H3OB 3I33A 2P9IA 2E2PA 2IVPA 4XH4A 3LM2A 5I9EB 4PL8A 1MDUB 3ZX0A 3SMSA 2E2QA 2Q97A 2AA4A 5KPTA 3HM8A 1HKCA 4KBOA 4B1ZA 2VYPA 3UKRA 1CZAN 2YHYA 3H1QA 2ZGYA 3IUCA 5AFUA 3EZWA 1JCFA 3GL1A 1SZ2A 3G25A 3QBXA 5KQ8A 2YJFA 2HF4A 4XEIA 4FWRA 1GLFO 2E1YA 5BREA 3WUHA 3KZBA 2FF3B 4PKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HT3A 3KHYA 1WBBA 3KIOA 3KTQA 4IOAL 1VSHA 2F9TA 3AVHA 2PZSA 3SQ4A 4X62K 4JKAA 3DM2A 1GOBA 4E72A 4CZIA 1NOZA 4AM6A 4FLUA 3AVKA 4CESA 4LH5A 4I6MB 4FVMA 3KLFA 3SV4A 4DR5K 4BY9C 1EWQA 5AQUA 3HPGA 1LV5A 2A42A 1X9JA 2D0BA 1KVBA 1VQ4N 3LPUA 3OYDA 4O44A 2G8HA 1S9GA 3CMAN 4FLTA 1DTQA 1UA0A 1RBTA 2VCPA 2HHXA 4MFBA 3MDQA 3WEEA 1IG9A 1HKGA 3UKUB 2P9SA 4B9VA 3K58A 3HYFA 2XY7A 2EX3A 1Q8IA 3I56N 1M1KO 1ZC6A 5EXWA 1NK5A 3LAMA 4H0TB 3FFKB 1EQYA 2ASMA 2YKMA 1Z05A 4FLXA 3CD6N 3GE1A 4CF8A 3VEYA 3CERA 4KI6A 4CJVA 1BIZA 4RW9A 4MO4A 3SYZA 2IGIA 4DQQA 4RCHA 4RG8A 3VQ5A 1TV6A 1BI4A 1KCFA 4BROA 1HPMA 1KFDA 1TK0A 1D9FA 1BWFO 1J5OA 5AR0A 1JLBA 2IOCA 1TUYA 3EKSA 1VHXA 3O4QA 1NK7A 1BCMA 1JJ2M 4JK9A 3WXLA 4O8UA 2PYJA 1HPZA 5GADP 5LMNK 3SI6A 2GELA 4LFCK 2GX9A 3C6TA 2VQFK 4CHNA 4M63C 1Q7YO 3JXUA 3OYHA 1ESVA 4IG3A 4CJ5A 3OYAA 2X78A 4W5TA 3QEWA 3R9PA 3QMLA 2XY6A 4A5AA 2E88A 4FW2A 4ID1A 4YOUA 1T7PA 4BR5A 4GV6A 3ATUA 2HBMA 4NLCA 3WNHA 4CEFA 5J2MA 3P4IA 3G10A 3OBYA 2E6LA 4CF9A 2PFUA 3OS0A 3QERA 3ZX2A 1W7AA 1BU6O 3EL2A 4PUOA 2A1SA 1HYSA 3A0IX 2HHWA 3JSMA 1XC3A 3AVNA 2Q2RA 5CYQA 5AQWA 4H4OA 1YHQN 3CJ1A 2A6AA 2BTFA 1B92A 3CPWM 1C0TA 3NF6A 3UKUA 1W97L 5HRPA 4CHOA 3SAFA 3DRSA 4N5SA 4DFJA 3C65A 3AA2A 4YOTA 3WQTA 3HP6A 3K5MA 2KFZA 3ZSQA 1NK9A 1C1CA 1V4TA 3E1YA 3SZ2A 5AQNA 3SQ0A 3V6DA 4CHPA 3SPYA 1HYZA 4KKOA 2ASOA 4BC4A 5AQKA 3BF1A 3QO9A 3L4QA 2D0OA 2YX6A 4E89A 5SZTA 4DTXA 2J4RA 1N6QA 3M5RA 1SQKA 1U04A 3MXIA 3DAWA 2HOEA 4JK7A 4OPHA 4J2AA 1QVFM 5KTQA 4FWOA 5A2QO 2Q0RA 3J80O 1RTHA 5BRDA 5FLXO 4QS8A 1D4XA 4FZZA 5JLFA 2D0PA 2NLXA 4I2PA 3DLRA 3KK7A 1WN7A 1ZBSA 4KHWA 5C2FA 1HLUA 1C0FA 3S3NA 3CJ9A 3H6EA 1HYVA 3DLHA 1UAXA 4GNIA 3TI0A 4LF8K 5F1XA 4CVNE 4FLWA 4AF1A 2QK9A 1ATNA 1SAZA 2P9KB 3AAQA 1NK0A 1L3TA 1LWEA 4B8CA 3QLHA 4M7XA 4W5OA 3NVKA 3CFPA 3VMFB 2QWQA 3ZLJA 1KFSA 4FLVA 1DGKN 2UUCK 3KK2A 4WQ4A 4I9QA 4H03B 3VGMA 1S1UA 3T3FA 2VGNA 3E9PA 2JWKA 1WUAA 3CC4N 3PSFA 4DKWA 4IXCA 1Q86O 5KGXA 4CFAA 4YORA 2VG6A 3MN9A 2UXBK 4CZMA 2YCHA 1O13A 1GLJO 4B1YB 1M90O 3AGRA 4H5RA 4IFEA 4FLYA 1QQCA 1KXPA 4OX9K 1VSLA 4IO8A 2A5XA 3PIPL 2H3GX 3HBTA 3RVCA 3EE9A 1RDUA 3L2QA 3DWLA 4CW7B 4CJ7A 1VRUA 1QHAA 1NLVA 5DM7L 3QEIA 2KTQA 2RE2A 1SKSA 3CM6A 4JKEA 1YT3A 4OVLA 4OGCA 3PLAA 2UXDK 3BGRA 4W5RA 3CC7N 1IKYA 2O4GA 4FWQA 5JMVA 5FPDA 3ULEA 1JL2A 3CCVN 1WB9A 3V1OA 4BRAA 3W0LA 4J2EA 4H0PA 3SUOA 3Q7BA 1C0MA 1HRHA 3OYCA 2QW9A 2HMPA 5M1NA 3FZKA 2BUPA 5LMUK 2G8KA 5ELZA 2QWRA 4CHQA 2QXLA 1YJWN 4Q0BA 4E1NA 4OKKA 4EIAA 5BPMA 1BA0A 4DTMA 4F2SA 3RR7A 1KAYA 4MLEA 3CQXA 4FWSA 4F9OA 2ITMA 1QQOA 1WAJA 4OKJA 3MXJA 2WC9A 3CC2N 2R7YA 1EO1A 4Z0UA 3VF2A 3CCLN 4H0YB 4K41A 4KI4A 1BCOA 1UOCA 3TTFA 4BRHA 4BE7B 1YF5L 2ASPA 3MEEA 3O3GA 3EYZA 4EHUA 4FW1A 2P9KA 5SWMA 3HJFA 2IS3A 1X3NA 1O1WA 1BOTO 1RNHA 4BE1A 1HR0K 1TYQA 1I94K 4L8RB 3L6QA 3NF9A 2HVHA 2P5GA 5CHIA 1KLMA 2FBTA 1HQEA 1JCEA 4YOVA 4XH1A 4H4MA 1DEJA 3DRRA 4JV5K 3T1HK 4HCBA 4OKEA 3L4IA 4NYNA 4R5PA 4YHHK 3VEOA 3L2RA 2FSJA 3SJJA 3D2EB 5BRHA 1K6YA 3AVCA 5AQFA 2KW4A 1B9DA 4M45A 3VQQA 1VQON 4DTRA 4JN4A 1BGXT 3BZCA 4A59A 4A2BA 4PL7A 5M1OA 4CF1A 1B9FA 2QI2A 1S22A 3KKSA 3H3OB 4NCAA 2IVPA 2HHTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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