3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/actin-binding protein
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
4CBUA 1K8KB 1NWKA 3IFRA 2A3ZA 3OHRA 1ZC6A 4HTLA 3A5LC 1NM1A 4H5WA 1NGGA 2CGJA 3MN9A 1WUAA 2HOEA 3L6QA 4A62A 5KQDA 5CE3A 3HZ6A 2VCPA 1BUPA 2Q36A 3TU5A 1MWMA 1ATSA 3VPZA 1QQMA 1TYQB 1YXQA 3DXKA 3SMSA 3VERA 4BC5A 1IG8A 3DAWA 3KVGA 4L3QA 3WUHA 2YHYA 2ZGZA 4BC2A 4BGAA 3R9PA 1TUYA 3LM9A 2Q2RA 3H45C 3ZEUA 5F2RA 1V4SA 4CBWA 3D7EO 1CZAN 1KXPA 4DQ8A 1KAXA 4Y0WA 2P9UB 3WQUA 3BP8A 1GLBG 1BOTO 2D0OA 5JLHA 1TUUA 2QW9A 2CH5A 3D2FA 3WXKA 3C0BA 1HX1A 3O8MA 1KAZA 1EQYA 3LM2A 3L4IA 4EHTA 3SLCA 2Q0UA 4M63C 4WQ5C 4EAHD 5AZIA 5AQVA 5ADXH 1BA1A 3RSEB 4BRDA 4DHYA 2I7NA 3GBTA 2GELA 3D2EB 3IDHA 2W41A 4BG9A 3W3DA 4EFHA 2NZTA 4CZEA 3H6EA 1U6ZA 4FWRA 5LJVA 4FWOA 2QWOA 1GLCG 2W40A 3O80A 3UKRB 1HKBA 4IO8A 4XEIA 5FPDA 5LJWA 2IVOA 3EN9A 2FLOA 4FWMA 2GTDA 1HLUA 1BWFO 2V7YA 3VENA 1BU6O 2FSNA 1T6CA 3MDQA 5EY4A 2F9TA 5ADXA 2YHXA 1ATNA 1U2VB 2BUPA 2YI1A 1XUPO 1OKJA 2QXLA 3GL1A 1BA0A 1DEJA 2QWPA 4H0PA 5EX5A 2GUPA 2HF3A 3H46O 3FZFA 3CIPA 1ESVA 1HKCA 2YHWA 2CGLA 2HF4A 4B1XB 4IWVA 3ID8A 5AFUH 4WQ5A 4K43A 3G25A 3GOIA 3I8BA 3ZX3A 4JAXA 4BR5A 3CJCA 1LOTB 4WQ4C 4F9OA 1NGAA 4FPBA 5B8HA 3WEEB 4FWNA 5E84A 4A2AA 4JD2B 4C23A 2ASOA 1GLDG 5AQTA 1QQOA 3FGUA 3WXJA 1NGJA 3CHWA 3VF6A 1C0GA 4B1UB 5F0XA 5AQLA 1S22A 3UE5A 4A2BA 4CZHA 1YUWA 4JNEA 2FF6A 2QWQA 3B8AX 4BR9A 2IVPA 3KZBA 4BR0A 3LDLA 4GY2B 3O08A 2P9UA 5AFUA 1V4TA 5BPLA 3DXMB 4M7XA 3EKSA 4ISGA 4ISEA 4EHUA 2P9SB 4BROA 3L0QA 2DPNA 5AQOA 3A5MC 3O1BA 3R6MA 4IZ9A 3QBXA 2E1YA 2PAVA 2GWJA 4MO5A 4RWTA 1GLEG 4GNIA 3RSEA 3UKUB 1JCGA 4FSVA 4K41A 3D2EA 1NGFA 4IXCA 2Q97A 4WQ4A 1MWKA 4BG8A 4BR2A 2E2NA 2D0PA 3C7NB 3H1VX 3JXUA 3BF3A 2UYTA 3QMLA 3UKRA 3DJCA 4XH1A 4WYBA 1NGIA 4BC4A 3O4WA 1DGKN 3CQXA 4QS8A 3U4LA 4B9QA 3FFKB 3LDQA 5AQZA 2P9IB 3ZX2A 4BRMA 5AQQA 1BDGA 2OANA 5AQJA 5BN8A 3CJAA 1G99A 4IJNA 3EKUA 3R8EA 4H0TB 2A5XA 2P9NB 4PL7A 5AQXA 1Z05A 3H3OB 2AP1A 1GLLO 3LL3A 3QICA 3SK3A 3ZETB 2E2OA 4CZJA 2PBDA 2NRHA 3O6WA 4MLHA 1QQNA 4FWPA 1P8ZA 2WUSA 5AQUA 3FR0A 5AQNA 5JICA 3CJ7A 5AQPA 4JN4A 2P9KA 3U8XA 4QS7A 4CZIA 2QWNA 2J4RA 3A8YA 4NB4A 4CZKA 3ENHA 4EIAA 5AQFA 1XC3A 4FWQA 4BQZA 5AZJA 1RGIA 3MN5A 3QDKA 2A41A 4JHDA 2V52B 5I9EB 3WXIA 2QM1A 3CETA 5KPZA 1NGHA 4JD2A 1DKGD 4H5NA 1HKGA 2QWMA 2NLXA 2AA4A 3EZWA 3FZKA 4FPAA 5FPEA 3JS6A 2D4WA 3HBTA 5AQGA 3M1FA 4B1VA 2FSKA 4BRQA 2VYPA 5BRFA 1ZXOA 4FOEA 3VESA 2A40A 1R59O 3CQYA 2FF3B 3DXMA 3CJ1A 1K8KA 2BTFA 3FE1A 2P9SA 4BRPA 5BN9A 1H1VA 1Y64A 2P9PB 3UB5A 3ZEUB 1XQSC 2HMPA 5LY3A 3O1WA 4PKHA 4NO7A 3W0LA 4FL9A 1HUXA 1NMDA 3UKUA 3VETA 3FLCO 5BPNA 4LC9B 3A5OC 4A61A 5JLFA 1WOQA 3QBWA 1ATRA 3HTVA 4BRHA 1J6ZA 5EOYA 5BR9A 2A42A 1TYQA 4PKGA 4H0XB 1BG3A 4BRAA 4BVPA 2H3GX 3C7NA 2ITMA 1ZBSA 5BRDA 5AZIB 5AQMA 3CI5A 4BRCA 3VEWA 4FWLA 4K25A 1LCUA 5KPRA 4YDUC 3GDQA 3A5NC 2Q31A 3LDOA 4CZMA 4QS9A 4FO0A 3ENOA 1JCFA 1C0FA 2IVNA 3AAPA 5E26A 3SJHA 3ZETA 3BUZB 3DWLA 1E4FT 3CJBA 3VF2A 1S3XA 4CI6A 4BREA 4BRNA 2E20A 3SMPA 3VEZA 1E4GT 4E1JA 3ULEB 4BRGA 5BPMA 3VEVA 1QZ6A 4BRFA 3S41A 4H0OA 1SAZA 3O5BA 5FPMA 2V51B 1X3MA 1KAYA 3I33A 3FZMA 3HI0A 3F9MA 1T6DA 3ZX0A 5AQKA 1SZ2A 3VEYA 5EVZA 4IJAA 2E2QA 2P9LB 1JCEA 4CZFA 2F9WA 2E2PA 4B1WB 1QHAA 3ATVA 3MMVA 3IMXA 4KBOA 2V7ZA 5BREA 4H03B 2D1KA 4AM7A 3KHYA 3AARA 4Z94A 2QWLA 3VGKA 2GEMA 1NBWA 4XH4A 2YJEA 4PKIA 4I6MB 4YDUA 3EO3A 5EXWA 3AY9A 1U2VA 3IUCA 4CZGA 3CERA 5BRHA 4H5RA 3EL2A 2ASMA 1RFQA 4O8KA 4DB3A 3MCPA 3VEOA 1SQKA 1QZ5A 3MK6A 1GLJO 5TKYA 4BVOA 4DCHA 2ZWHA 1Q18A 2P9PA 3MN6A 1D4XA 4PL8A 4BR4A 2Q0RA 3WT0A 2E88A 2ASPA 4O5FA 1IJJA 4BC3A 4BQLA 2YJFA 5AQHA 2CGKA 3QFPA 5AQRA 4J8FA 5AQIA 4ISFA 1NGEA 3WEEA 1GLFO 3H3NO 2E1ZA 2YCHA 4H0VB 3FZLA 1NGBA 2ZGYA 5AQYA 3GE1A 2CH6A 1YVNA 3VEXA 3VOVA 4MO4A 2FXUA 4CJ7A 3J8AA 2Q1NA 2EWSA 1YAGA 2GWKA 3HSCA 4K42A 4RCHA 3M6GA 3VGLA 3DXKB 4BGBA 3H1QA 3VGMA 1NGDA 3MN7A 4M7YA 2A6AA 4BRIA 1NLVA 1Z6RA 2QWRA 4H0YB 3ULEA 4BRKA 1MDUB 3WXLA 3ATUA 4H5VA 3U9DA 1X9JA 2KHOA 4AM6A 3D2FB 3QB0A 4FWKA 5F1XA 4BRLA 2P9LA 3P4IA 2I7PA 4CD1A 4CD3A 3FZHA 3HM8A 1HJOA 2P9KB 1GLAG 4XH5A 5ELZA 5AQWA 4B1ZA 2P9IA 3VF4A 2FSJA 2ZF5O 5AZJB 3AAQA 5KQ8A 1RDWX 2E8AA 4BR7A 3BEXA 4JHDB 2IIRA 2P9NA 4I6MA 1NGCA 3LDPA 3M3ZA 3BF1A 4FOIA 4HWIA 1T44A 5AQSA 3CJ9A 3WQTA 1X3NA 1BO5O 3TPQA 4H5TA 5FPNA 5KPTA 3LDNA 4MLEA 4CBXA 4CZLA 5AR0A 1MA9B 3A0IX 2VWBA 3GG4A 4FWSA 4B1YB 3U9ZA 3QFUA 1HPMA 4RTFD 5JMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CBUA 3IFRA 1W0HA 2A3ZA 4CJEA 3TANA 3A5LC 4H5WA 5C15A 2BGGA 4YORA 2YKNA 4A62A 2D0AA 3QIOA 4WF9L 2ZJQL 2VQEK 4J2EA 1KRPA 1VQ8N 1HYSA 2OTJN 4JI6K 1QQCA 4BY9C 3BZCA 4AHRA 2OPRA 4RW6A 4B3OA 3VPZA 2IC3A 4ICLA 4PQUA 1TYQB 3HOTA 3ZCMA 3CFOA 4BC5A 3KVGA 3V9UA 2ZD1A 2YHYA 3K5LA 4GV9A 3MX5A 3PX0A 4K8XA 3CM6A 3M8RA 4CBWA 3TARA 1KAXA 2P9UB 1YJ9N 1BOTO 4FJNA 1TUUA 2HHQA 1S1TA 3WXKA 1ZBFA 4DR7K 3O8MA 1VQNN 1HNVA 3WXMB 1EP4A 4B9LA 3T1HK 1SS6A 5JVGL 1T7PA 4EHTA 4U67L 4WQ5C 4IFVA 5AZIA 4DTRA 1BA1A 3DRRA 3NF6A 4MDBA 4Z4IA 3IDHA 3SQ4A 4BG9A 1VRUA 1XI1A 5M1NA 2JLEA 3NAEA 3ID6A 5LJVA 3OYKA 3SPYA 3AO2A 1XHXA 3AVAA 5C12A 5LJWA 3OYFA 3C6AA 4M3TA 1BWFO 2V7YA 1BU6O 2W42A 3QEIA 3CC4N 4BACA 2WOMA 1U2VB 2BUPA 1HYVA 4AHVA 5LMNK 4YNQA 1UA0A 3GL1A 3HPGA 3LAKA 4LF8K 4PY5A 2QWPA 4CJVA 2NUBA 5EX5A 4CF1A 4WQ5A 3GOIA 4BR5A 3CJCA 3I0RA 3P1GA 2E5LK 3G10A 3TSUA 5B8HA 2VGNA 3OYBA 5DM7L 2X74A 1JXBA 3SAGA 4F4KA 1KFDA 1QQOA 1C1BA 4DR1K 4C8MA 1EXQA 4KHSA 3CHWA 5I3UA 1SL0A 4B9VA 3PSFA 1S22A 1YUWA 2QWQA 4JI2K 4BR9A 2OA8A 1FKOA 4HUEA 3O08A 3EKSA 2P9SB 4FM1A 1NKCA 3O1BA 4IZ9A 3V9ZA 4LSNA 2RHKA 4DU4A 4MQ3A 4DV7K 1FXXA 3D2EA 4IXCA 4IFEA 5KRTA 1CXQA 3I8DA 3C6UA 3OYLA 3IAYA 1W9HA 2UU9K 3C7NB 4FW2A 3QESA 4WYBA 4BC4A 1W2BM 2PYJA 3O4WA 1DGKN 3CQXA 4QS8A 4B9QA 4DG1A 3FFKB 3LDQA 5AQZA 3TTFA 4BRMA 2RE2A 5AQQA 1HQUA 3NDKA 3N4QA 2QK9A 2OANA 5BN8A 1U45A 2RF2A 1I3AA 3V1RA 4IJNA 3ZT3A 3DLBA 4PL7A 1GLLO 3RTVA 2XY8A 2E2OA 2KLAA 3L2UA 2ATQA 2HVIA 1NNEA 1QQNA 2WUSA 3FR0A 1F21A 5AQNA 3QEVA 5JICA 2O8FB 3CJ7A 5AQPA 3DRPA 3ISNC 2P9KA 3OYIA 3U8XA 4QS7A 3SV4A 4NB4A 4CZKA 2O4GA 2BANA 5J1EA 5AQFA 3K5OA 1HQEA 1RTDA 4GMJB 1RGIA 4HTUA 3MN5A 3LP0A 4WFAL 3WXIA 2QM1A 3CCEN 4H5NA 3HK2A 5M1KA 1X9SA 1D9DA 4FPAA 2Z1JA 3HBTA 3SUPA 3U3GA 1B9DA 5FLXO 5C2DA 1WSJA 4F3OA 3ASMA 3M1FA 4B1VA 3PSIA 4BRQA 3D0PA 4AHUA 5BRFA 1J5OA 4IOCL 3V9WA 1R59O 4ELTA 2FF3B 2NRVA 3CJ1A 3ALYA 3OS1A 3FE1A 4BWMA 3O3FA 4CW7B 3TR8A 1YF5L 1H1VA 5BN9A 5C0YA 3UB5A 2G8VA 4JRQA 3ZLJA 2Y1IA 4NO7A 3JSMA 1E3MA 3QBWA 3ZSVA 1I39A 4JEPA 3NF7A 4PKGA 1IKVA 4OGEA 4KH6A 4BRAA 4BVPA 4OPJA 3EE8A 4OKJA 3DMJA 1NK4A 2W00A 3MWTA 4ELUA 5JS1A 2YX6A 1LCUA 5KPRA 3A5NC 2F7TA 1NKEA 2YKMA 2Q31A 3ZT2A 3OYJA 1K73O 4FO0A 3AO3A 3ENOA 5E26A 2QI2A 3SJHA 5C10A 4N47A 4DF4A 3CJBA 3VF2A 4CI6A 3MEGA 4BREA 4CGJA 4GV6A 1QZ6A 3CCRN 1Q7YO 3IG1A 4CJLA 2V51B 1N6QA 3E01A 3VTHA 4FLTA 1T6DA 3ZT4A 4CVNE 4KRFA 4R5PA 3HVTA 1VQON 3CC7N 5HBMA 4OKEA 3CF5L 3ATVA 3MMVA 3LP2A 1WAJA 1ZBIA 3IMXA 4DTJA 3LDSA 4JK9A 4FVMA 4AM7A 3KHYA 3AARA 1RT7A 2GEMA 4CHOA 2DFFA 3EO3A 5EXWA 3IRXA 3AY9A 3IUCA 4CZGA 3L3UA 1O1WA 1NU0A 4ILHA 1X1PA 1C1AA 3RR7A 4BE0A 1VSLA 1IO2A 5KI6A 4KB1A 5J2PA 4CJ3A 4DSLA 4O4GA 2CGKA 4DTPA 4KTQA 4OPHA 5AQRA 4J8FA 3CD6N 4ISFA 1GLFO 4PWDA 2YCHA 2IAJA 4AQYK 5GINA 4CJWA 1C0UA 1CZ9A 2E4LA 1TKXA 4JI8K 1YVNA 3ZT1A 4MO4A 4FJXA 3K9KA 3O3HA 4BDPA 5M1QA 4N56A 3OBWA 4RCHA 3M6GA 2VWJA 3AO4A 3DXKB 2HHXA 3VTIA 1MU2A 1VQ7N 2PYLA 4BRIA 4IDHA 3VN5A 1NLVA 4DQSA 3SQ0A 1HRHA 3ULEA 1LAVA 4BRKA 3WNEA 3WXLA 3F9KA 3AGRA 3PV8A 4KHYA 1YJNN 3U9DA 4BDZA 1L3TA 4AM6A 4IOAL 3D2FB 4FWKA 3KK3A 1RTIA 5F1XA 2F8SA 2P9LA 3WNHA 3K2PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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