3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/actin-binding protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
1KAXA 2ZGZA 1U6ZA 4BRDA 4FWKA 2BTFA 3A5LC 4BC5A 2CGJA 5AQFA 4EIAA 3W0LA 1C0FA 3KHYA 4NB4A 5AQLA 3GL1A 3CJCA 1T44A 5BN9A 3ATVA 3U8XA 3HZ6A 4RCHA 4BRAA 1HKBA 4BROA 1HPMA 4FWSA 2D0OA 3MN6A 1NGFA 3MN7A 4B1XB 5BN8A 1X3MA 3KZBA 5AQPA 1P8ZA 1Y64A 4B1ZA 4M63C 3QFPA 2A42A 1BO5O 3WQUA 1KAZA 3VEWA 2V51B 3H1QA 3BF1A 4H5RA 1HJOA 3VF6A 4PKIA 3L4IA 5BR9A 3EZWA 4CJ7A 1TUUA 4BRFA 5AZIA 4BVOA 1GLDG 3HI0A 1NMDA 5AZIB 3SMPA 5I9EB 4CZIA 2F9TA 3O4WA 5BRHA 3LM9A 4H0VB 2HMPA 3BF3A 1QHAA 4GNIA 3AARA 4A61A 2YJEA 2YI1A 2IVOA 4C23A 3H45C 3A5MC 2D4WA 4K43A 3VF4A 4WQ4C 4AM7A 3O1BA 3M6GA 2P9NA 4LC9B 4BRCA 1BOTO 2P9LA 1GLLO 2A6AA 2P9IA 2YHYA 2P9NB 4BRKA 4FWNA 2P9LB 2P9IB 4IWVA 3UB5A 5F0XA 4FWLA 2E1YA 3I8BA 3CJAA 1BA1A 3H3OB 1SZ2A 5EOYA 5BRFA 3LL3A 3KVGA 4BGBA 2ZF5O 2E2OA 4IZ9A 1IG8A 3CQXA 3O8MA 2PBDA 1Q18A 2P9KA 5EX5A 3H6EA 3VGLA 1NGCA 4FPAA 2QWPA 2A5XA 2P9KB 1EQYA 3R9PA 1C0GA 3WUHA 1ATNA 3HBTA 1XUPO 1QZ5A 4H0PA 4H5TA 2J4RA 2Q1NA 3LDNA 3WQTA 4A62A 4DCHA 5ADXH 5F1XA 1RFQA 3G25A 2YHXA 5AQUA 4EFHA 4XH4A 3AAQA 4CZJA 2FF6A 2Q36A 4CZGA 4H0OA 2YJFA 4JD2A 3VERA 3GBTA 4XH1A 2ASOA 2I7PA 3UE5A 3WXIA 1BU6O 4PKHA 2OANA 2IIRA 3IFRA 4Z94A 1D4XA 1QQMA 2V7YA 5KQDA 2GUPA 1ATSA 3A5OC 3GOIA 2QXLA 3O6WA 3D7EO 2V7ZA 4BRPA 3QMLA 4CI6A 1DEJA 5FPEA 2ASPA 3EKUA 1NGJA 4Y0WA 4EHUA 2QWOA 1S3XA 2HF3A 2V52B 5JICA 3U9DA 4BR9A 5KPZA 1QQOA 2UYTA 3F9MA 3L0QA 3VESA 4BGAA 3FZFA 4B9QA 3VEYA 1NGDA 3C7NA 1J6ZA 5AQWA 3HM8A 3C7NB 4BR0A 5AQYA 4H5WA 4FWMA 4BRHA 4CBWA 2FSKA 5B8HA 3SJHA 1XC3A 3EO3A 3H1VX 4J8FA 5E84A 3JS6A 4FWOA 3WEEA 4CZLA 4H0YB 3FZLA 3J8AA 4BRLA 3WEEB 4H5VA 1QZ6A 3GG4A 3UKUA 4I6MA 4AM6A 5AQRA 4M7XA 3O80A 1NGIA 5AQHA 3UKUB 4I6MB 4WQ5A 3O1WA 2YHWA 3TPQA 3LDQA 5AFUH 1HX1A 1BUPA 2Q0UA 1RGIA 3MMVA 2P9PA 2VWBA 4ISEA 3CJBA 1E4GT 4FWRA 5JLFA 2P9PB 3LDPA 2GTDA 3CQYA 3IMXA 4BVPA 3VGKA 1LCUA 3AAPA 4B1VA 2E2PA 3QDKA 2VCPA 3FGUA 2QWQA 4PKGA 4KBOA 4MO4A 4CZFA 2Q97A 3DXKA 1BDGA 3CETA 3DAWA 2D1KA 4A2AA 1LOTB 3DXKB 4XEIA 5AQKA 2W41A 3O5BA 1MWMA 1V4SA 3O08A 4BRNA 3P4IA 3CERA 4H0TB 1Z05A 4WYBA 3MN9A 1S22A 5AQOA 1MWKA 4RTFD 1CZAN 2GEMA 1E4FT 3SLCA 5AQXA 4FO0A 1XQSC 2FLOA 5FPNA 2QWLA 2ZGYA 1BG3A 2P9SA 3MDQA 3DWLA 1SQKA 4F9OA 5CE3A 2P9SB 4QS7A 2E20A 4BR7A 2PAVA 5ELZA 3L6QA 4FOIA 4CD1A 2QWMA 3U4LA 5JMVA 4BG9A 4QS8A 5BRDA 3UKRA 1ATRA 5AQJA 4DHYA 3EN9A 3S41A 3EL2A 3ATUA 2ASMA 3AY9A 3UKRB 4BG8A 4CBXA 2HF4A 4BR5A 5AZJA 4MO5A 4H5NA 2F9WA 4JN4A 5LJWA 2Q0RA 3WXLA 5AZJB 2H3GX 5AQQA 1TYQA 4B1UB 3CI5A 1GLFO 4IO8A 1TYQB 1HKGA 4FPBA 2FXUA 2CH6A 1GLAG 1JCEA 4CD3A 3IUCA 1R59O 4BR4A 4JAXA 5EY4A 1JCFA 3BP8A 3VEOA 3WXJA 1X9JA 1JCGA 4PL8A 3ZX2A 2AA4A 3FZMA 4FWQA 2BUPA 3TU5A 4L3QA 5AQNA 2YCHA 3MN5A 5KQ8A 3VEVA 1X3NA 2AP1A 4FWPA 5BPLA 2E1ZA 4BR2A 3FE1A 4BREA 1HUXA 1HKCA 4PL7A 2ZWHA 3I33A 4WQ5C 2Q2RA 2VYPA 3FFKB 2IVNA 3EKSA 3FR0A 3LDLA 1NGBA 3ENHA 4EAHD 3MCPA 3RSEA 1NM1A 1HLUA 3RSEB 4BRQA 5EVZA 5BREA 4GY2B 3VETA 3FZHA 5AFUA 1SAZA 3FZKA 5BPNA 4BRIA 3BUZB 4JNEA 3VGMA 1V4TA 1ZXOA 1GLJO 1NWKA 1DKGD 3ZETA 3LM2A 1WUAA 3ZETB 2HOEA 3H46O 3ULEA 3ID8A 1KAYA 3VEXA 4HWIA 3A5NC 3VEZA 3ULEB 3VF2A 3BEXA 1NBWA 3DXMA 4YDUA 3VOVA 2GELA 5LJVA 5LY3A 3DXMB 2CH5A 3HTVA 2NRHA 1NGEA 3DJCA 2GWKA 1YXQA 4XH5A 4CZKA 1GLEG 4MLHA 3IDHA 2QWNA 1ESVA 4K42A 3M3ZA 3ZEUA 4DB3A 5AQMA 5E26A 4BRMA 4DQ8A 3CHWA 3ZEUB 3VENA 4E1JA 3FLCO 3LDOA 4K25A 1G99A 1ZBSA 5AR0A 4FOEA 4NO7A 2A41A 1T6DA 5EXWA 1BWFO 4CZMA 4K41A 3QFUA 3WXKA 5FPMA 3MK6A 3CJ1A 5BPMA 3GDQA 2QWRA 1NLVA 2W40A 5ADXA 2Q31A 2A40A 2FSNA 2E2NA 3CJ9A 1NGAA 3A8YA 2QW9A 2A3ZA 1MA9B 1OKJA 1ZC6A 2E2QA 1NGHA 2D0PA 4CZHA 1DGKN 1U2VA 4CBUA 1YAGA 1U2VB 4O5FA 4B1YB 4BC2A 3R6MA 3QBWA 2NZTA 1GLBG 4BC3A 3A0IX 3SMSA 2KHOA 3R8EA 5AQVA 1Z6RA 3QBXA 4M7YA 5KPTA 4MLEA 4H03B 2DPNA 4JHDA 4QS9A 4EHTA 5JLHA 1NGGA 1YUWA 3CIPA 3QICA 2P9UA 4H0XB 4JHDB 5AQIA 2ITMA 1IJJA 3ZX3A 3W3DA 2P9UB 4BRGA 3H3NO 1MDUB 3ENOA 5AQSA 2QM1A 2FF3B 4B1WB 4ISGA 5KPRA 1BA0A 4WQ4A 4A2BA 4BQLA 4IJNA 1K8KA 4IXCA 3ZX0A 5F2RA 3B8AX 5TKYA 3SK3A 3VPZA 3C0BA 1K8KB 2E88A 1H1VA 4ISFA 4RWTA 3HSCA 4BC4A 2E8AA 3QB0A 3WT0A 1WOQA 2IVPA 4BQZA 1GLCG 5FPDA 4FSVA 5AQTA 4JD2B 1TUYA 1YVNA 2GWJA 2CGLA 3D2FA 4FL9A 4CZEA 5AQZA 5AQGA 2NLXA 3D2EA 3D2FB 4IJAA 3U9ZA 1T6CA 2CGKA 3M1FA 4YDUC 3CJ7A 3GE1A 2FSJA 3D2EB 1KXPA 3JXUA 1QQNA 4O8KA 3OHRA 2WUSA 1RDWX 2EWSA 2I7NA 4HTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WE1A 1TKXA 4LD0A 3K9KA 4I9QA 5JENA 4E89A 3A5LC 3EY1A 3OS1A 4Y1CA 4EIAA 3W0LA 4LF7K 1C0FA 3KHYA 4NB4A 1VQ5N 4Y1DA 1C6VA 3SQ2A 5BN9A 3ATVA 2D0CA 4OO1J 1REVA 3KWIA 3ZT0A 2DFEA 3MN6A 1NGFA 4U67L 4C8NA 1VSIA 4B1XB 1N36K 1FXXA 2G8IA 1S1XA 1T8EA 5GINA 3N4QA 3VTHA 1NNEA 1D9DA 1VRUA 3PIOL 3VQEA 1Y64A 2C1IA 4FLYA 3QIPA 2FBTA 3B6PA 3TAPA 1VSLA 3H1QA 1Q81O 3RRHA 3HOTA 4PKIA 2P51A 4M42A 4CJ7A 2XY8A 1YITN 4BRFA 1B92A 4UQGA 3HI0A 1KVCA 4FLWA 5SWMA 2F9TA 3CMEN 4KV8A 2G8VA 2BDPA 3ALYA 3QEVA 2BE2A 2KTQA 1J53A 2IVOA 4I9LA 3VQ5A 4WQ4C 5J2MA 4LC9B 3AVIA 4WF9L 4KPYA 1BOTO 1GLLO 1F21A 4BRKA 2P9LB 4Z4FA 1WLJA 3UB5A 1D9FA 2E1YA 4MFBA 1VQ4N 4YOXA 3CJAA 3SZ2A 1SZ2A 4N41A 4BGBA 4JI8K 2E2OA 1EO1A 1Q18A 3ZSOA 5EX5A 3H6EA 2Y1JA 2A5XA 1EQYA 2P9KB 3R9PA 1HMVA 1ILYA 1TAQA 4GVMA 4B8CA 2BGGA 4LFBK 4H5TA 2YNGA 3THYB 3ZLJA 2E6MA 3OYCA 2Q1NA 3LDNA 3MCAB 3EE8A 2O4GA 1JL1A 4X62K 3G25A 3R3LA 2HB5A 3OYAA 1VRTA 5GIOA 2OTJN 2QK9A 4OVLA 2Q36A 1E3MA 4IEIA 1YTAA 3D45A 2ZJQL 3UE5A 3OY9A 3S5TA 1HJRA 4C8MA 2OANA 4JI4K 4JKFA 1VQMN 4FLUA 1LW0A 4JI5K 3DLRA 5HROA 3PLAA 1QS4A 2QXLA 1TK8A 1FJGK 3LZJA 4ILJA 4L8RB 1CXUA 3D7EO 2V7ZA 1X9SA 3QMLA 2IDOA 3RTVA 3IAYA 3CYMA 3KK3A 2ASPA 1NGJA 4DWIA 1KFDA 1RDAA 4CHYA 2HF3A 2Z1IA 5JICA 5J2QA 4WCEL 1QQOA 4BGAA 3FZFA 4DQSA 4B9QA 3K5LA 4OLAA 3CPWM 3C7NB 3CCVN 3Q7CA 4BR0A 2FSKA 3V9SA 4JI2K 3ID6A 3DLKA 3AVNA 1RT1A 4AILC 4FWOA 4GMJB 4H0YB 4O8UA 4BRLA 2G8HA 4LFCK 4O5BA 1QZ6A 1KVBA 3AVGA 3O80A 1LWCA 3MAQA 4WQ5A 4CIGA 4NCAA 3DRRA 3I0RA 1NOZA 2Q0UA 1RGIA 1C0TA 2P9PA 4DV6K 1E4GT 3LP1A 4CFDA 4FLVA 3ZSYA 4FZYA 2HSTA 3OYKA 3HVRA 1FKPA 3NHGA 4M3ZA 3HT3A 3M8SA 2IOCA 1U04A 3DXKA 1ASVA 2VWJA 4GKKK 1U47A 1HNIA 5AQKA 2W41A 3RR7A 2HHUA 4DR5K 1SKRA 1Z05A 4CJVA 2JWLA 4WFBL 3AVHA 3K58A 4EP5A 4QAGA 4B3MK 3SLCA 1XQSC 3KD1E 4DSLA 4OX9K 2QWLA 1NU0A 4RW7A 4A5BA 3VQCA 2HBKA 3MDQA 4FJGA 3DWLA 4JS5A 4DSJA 3NF8A 2VQFK 2UU9K 1XC9A 2NUBA 2PAVA 1VSFA 4Q5VA 3NE6A 1CXQA 4FOIA 3U4LA 2BANA 3ISNC 4FJLA 5M1OA 1RBVA 2HF4A 5CYQA 4Z4EA 1RTDA 5AQQA 5C2FA 4RW6A 1TYQA 4E1MA 1GLAG 4J2DA 4CD3A 3IUCA 4DSFA 4BR4A 2Q3SA 3BGRA 5EY4A 3TSQA 3VEOA 4PL8A 3PSFA 5GAGP 4L3QA 5HOOA 2O8DA 3DYAA 3KK1A 3TARA 2AP1A 5BPLA 1VQ8N 3MECA 1SL0A 1HYVA 2P5GA 1KC8O 3CCQN 1HUXA 4CK1A 4H8KA 3AVLA 5A2QO 2UUCK 4B9MA 2XRIA 4AH9A 2F8SA 3LDLA 4BACA 4LF4K 3SAGA 3RSEA 1EWRA 3QIOA 1HLUA 4DV2K 4AHVA 5EVZA 3VETA 1L3SA 3MX5A 5BPNA 4JKBA 2G8KA 1QSSA 1BI4B 2R7YA 3O3GA 4PHTX 4H4OA 4FLXA 4H4MA 3ZETA 3HYFA 3LM2A 4GVEA 2HOEA 4CJ4A 3OYJA 2XY6A 1DLOA 3ID8A 4IEEA 3A5NC 3OYMA 2YNHA 1NMNA 3BEXA 3HOSA 1YTUA 4YDUA 1S1TA 2GELA 3ZSWA 5LJVA 5LY3A 4Q0BA 3L3UA 4BE7B 3HTVA 4XJXA 4CK3A 1NJIO 4LF9K 1YHQN 3NVKA 3TI0A 1RT3A 2PZSA 4MLHA 3NDKA 3IDHA 3SV3A 3ZEUA 2RF2A 3NF6A 3CXCM 4E1JA 3FLCO 4K25A 1G99A 4JKCA 1WSHA 1ZBSA 5AR0A 4FOEA 4NO7A 1HNWK 1EWQA 5FPMA 3HM9A 4PWDA 5HRRA 4X64K 2A40A 5FDLA 2E2NA 4LH4A 1X9WA 4OGEA 1OKJA 1ZC6A 3FFIA 4CZHA 5KRSA 4IFVA 1DGKN 1RT4A 5DM7L 1YAGA 1U2VB 4NCBA 2QKBA 3AV9A 2NZTA 1GLBG 1C0UA 2KHOA 4ELUA 2Y1IA 1Z6RA 5MLCQ 4DR6K 1WSJA 4JHDA 3HVTA 2WFBA 2P9UA 5AQIA 1RTHA 2ITMA 3JAMO 1NJYA 3V9ZA 4W5RA 3VQ7A 1VQ6N 2NRXA 3AVMA 5AQSA 3TABA 4CGIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3MK6 A;  3SNN A;  2HBJ A;  3GDQ A;  2O8B B;  2HNY A;  4FJK A;  1EXQ A;  2W40 A;  4FJJ A;  3QIN A;  2Q31 A;  1VQP N;  2XY7 A;  1HQE A;  2FSN A;  4KKO A;  3CJ9 A;  1LV5 A;  1NGA A;  4KB0 A;  1MA9 B;  4FZZ A;  3P38 A;  1RT6 A;  4JRP A;  4F3T A;  1Q82 O;  4CBU A;  3EEQ A;  3R6M A;  4BDZ A;  3QBW A;  4JK9 A;  1EX4 A;  4M7Y A;  5KPT A;  4YOV A;  3LWL A;  2IGI A;  4E7J A;  4H03 B;  2DPN A;  5KTQ A;  3G0Z A;  3D0P A;  4DTN A;  3ZX3 A;  3W3D A;  3F5T A;  4BRG A;  2KFN A;  1WAF A;  3ASM A;  4V19 S;  1NJZ A;  1VQ7 N;  4GV3 A;  3QEP A;  2QM1 A;  4ISG A;  5KPR A;  1TV6 A;  2HHW A;  3WNE A;  4DTU A;  3B8A X;  3TAM A;  4LY7 A;  2E88 A;  1CZB A;  2W6L A;  2VWK A;  3I56 N;  3SAF A;  1TL3 A;  4BC4 A;  4CF9 A;  4LF6 K;  1QSY A;  1NK9 A;  2GV9 A;  1SL2 A;  1YVN A;  3BZK A;  3D2F A;  4FL9 A;  2F7T A;  2NLX A;  4KHP K;  1IV0 A;  3U9Z A;  3UIQ A;  2CGK A;  2FSJ A;  3NVM A;  3O9R A;  3LZI A;  4DFM A;  1J5E K;  4LF8 K;  1QQN A;  4O8K A;  2W6K A;  3DLE A;  3QER A;  4JK7 A;  5C0Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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