3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein/actin-binding protein
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
3MN7A 4QS9A 1QZ6A 4FL9A 3VPZA 1ATRA 4O5FA 4NO7A 2VWBA 4BQZA 5AQIA 5EVZA 1RGIA 4WQ4A 3ZETB 4K43A 4HWIA 3ATUA 3CIPA 4BRHA 1NGIA 1T44A 4H0PA 5KPZA 2FF6A 3EO3A 1K8KA 3UKUA 5ADXH 4A2AA 3CERA 1NLVA 3CQYA 3FGUA 2Q0UA 1NM1A 4J8FA 2CGJA 3EKUA 1T6DA 3U8XA 1OKJA 3HZ6A 1GLDG 3ZX3A 1XC3A 2W40A 3WXIA 4JAXA 1KAXA 1HKCA 2H3GX 3WQTA 4WQ5A 3VGLA 2HMPA 1IJJA 5AQFA 4BRFA 4DQ8A 2P9PB 4AM7A 4PKHA 3TU5A 1HKBA 3FFKB 1NGDA 4BC5A 2CGKA 2Q2RA 4EAHD 3ZEUB 4XH1A 4I6MA 1X3MA 5AQGA 4HTLA 2V51B 4BRIA 2YJFA 3IFRA 2P9LA 3MDQA 3FE1A 4CZIA 3D2EB 5AQYA 2W41A 1QHAA 2QWOA 4MO4A 4BRAA 2A40A 2J4RA 5LJWA 3EL2A 1XUPO 4MLHA 1HPMA 3VEWA 3F9MA 3GOIA 1E4GT 2GEMA 3LDOA 3LM2A 4H5WA 2CH5A 3ZX2A 4JHDB 5AQTA 4IZ9A 2ASPA 4B1UB 3VEOA 3I33A 4CBXA 1ESVA 1X3NA 3O1BA 2D0PA 3O5BA 4IJAA 2I7NA 1YXQA 4RWTA 3GE1A 2P9SA 2DPNA 1TUUA 2I7PA 1ZBSA 3CJ9A 4YDUA 5AQKA 3AY9A 3WXJA 3O08A 4EFHA 4FSVA 1YAGA 1BOTO 4H03B 1BG3A 1NBWA 3LDPA 2YHWA 4H5VA 5AZJA 1HLUA 3IUCA 1K8KB 4PKIA 2GUPA 4Y0WA 3EZWA 3VGMA 1BDGA 2YHYA 3L0QA 2BTFA 3ULEB 4BRKA 3WT0A 5BREA 5KPRA 4K41A 4BRDA 3BP8A 1HKGA 3OHRA 5FPNA 4JD2B 1GLFO 3QFPA 2A6AA 2FLOA 1MA9B 3VEVA 2PBDA 3H45C 1Z6RA 4K42A 3O4WA 1BUPA 4CZGA 4EHTA 4BRMA 1NGAA 1GLBG 2P9IA 3SLCA 1MWKA 3H3NO 3AAPA 3MK6A 4XEIA 4BR0A 4QS8A 3H46O 3KHYA 4IWVA 2GWJA 2V7YA 3DXKA 4BC2A 3MN5A 4FWNA 3HTVA 5AFUH 1NGGA 2Q97A 4FWRA 4RCHA 2ASMA 3C7NB 5KPTA 3WQUA 2A41A 1G99A 4H0XB 2CGLA 1E4FT 1QQOA 3GL1A 5KQDA 1BO5O 1C0GA 4CZJA 2YHXA 3CI5A 4KBOA 3VESA 2QWNA 1Q18A 3WXLA 3W0LA 3H3OB 4DB3A 1J6ZA 3P4IA 5BRHA 3U9ZA 1RDWX 4BRNA 5LY3A 2YJEA 2GWKA 5F1XA 3A5NC 3W3DA 2ASOA 3DXMB 2HF3A 2A42A 5AQJA 4BR5A 5FPEA 3J8AA 2P9SB 4GY2B 4H0OA 4FWMA 3QMLA 4BRCA 4FWLA 5AZIB 4BRPA 4BR4A 3HBTA 3EKSA 3IDHA 5BPLA 3G25A 3LDNA 4CJ7A 1NGFA 4BROA 5ELZA 5I9EB 1TYQB 2E88A 4H0TB 1T6CA 4XH4A 3D7EO 3SJHA 5AQWA 3MCPA 1H1VA 5E84A 3FZHA 4BG9A 1HJOA 3VEYA 5JICA 3U4LA 4MLEA 2UYTA 2F9TA 2OANA 3JXUA 4BR9A 2YCHA 2GTDA 2P9KA 4QS7A 4PL7A 3GG4A 3WXKA 4H5RA 5EY4A 2FSNA 3A0IX 5AQVA 2P9IB 3H6EA 2E2OA 1WUAA 2QW9A 3KZBA 4M63C 2Q1NA 1GLAG 2AP1A 3D2FB 5AQRA 3ENHA 3KVGA 4CBUA 4CI6A 2FF3B 3A5OC 2P9UB 3WEEB 2E2NA 4CZKA 3O1WA 3CJCA 2P9NB 3ENOA 4BRLA 2VCPA 4WYBA 3HSCA 4FOIA 4CZLA 1GLEG 3AARA 4FWKA 4BQLA 3DAWA 2QWLA 4ISEA 2D4WA 3R6MA 4H5TA 4PKGA 1CZAN 2BUPA 1RFQA 3M6GA 4GNIA 4IJNA 4LC9B 3ZETA 5EX5A 2PAVA 4FPAA 5E26A 3UKUB 3R8EA 4H0YB 4CD3A 3ID8A 2IIRA 4CZFA 2A5XA 4FWSA 3B8AX 4BC4A 2FXUA 3AAQA 1HX1A 5B8HA 3BF1A 3LDQA 1DGKN 3L6QA 1DKGD 2IVOA 2E1YA 3ZX0A 3BF3A 2HF4A 2Q36A 4E1JA 3MMVA 3HI0A 4MO5A 3R9PA 4B1WB 2ZGYA 3FZMA 3C0BA 3A5MC 4CZMA 3VEZA 2P9PA 4I6MB 1GLJO 3VGKA 3CHWA 3LDLA 4DHYA 4BGBA 5AQOA 4B1XB 2FSKA 2P9LB 2NZTA 5CE3A 1NGEA 3ZEUA 5FPMA 3CJBA 2NLXA 3GBTA 2D1KA 5ADXA 1MWMA 2FSJA 1NMDA 4O8KA 1V4TA 3FZFA 4FOEA 4B1YB 5LJVA 4BVOA 5BPMA 3D2EA 5EOYA 5F0XA 4AM6A 2VYPA 3SMPA 5TKYA 3QB0A 3S41A 5BRFA 4BRQA 2NRHA 1ZC6A 2QXLA 1EQYA 1U2VA 4FO0A 2F9WA 1S3XA 4JHDA 3O8MA 4B9QA 5BN9A 1LOTB 3CQXA 3RSEA 4CD1A 1U6ZA 5BR9A 3H1QA 3O6WA 1NGHA 2EWSA 4NB4A 5AQQA 3VF2A 1DEJA 5AQMA 3MN9A 5JLHA 1NGJA 5AZJB 2QWQA 4JNEA 4BR2A 4IO8A 3QBWA 4B1ZA 3H1VX 1D4XA 3GDQA 2KHOA 4EHUA 4FPBA 4B1VA 3VERA 3LL3A 5FPDA 4ISGA 2QWRA 3A5LC 1WOQA 3ULEA 2HOEA 4H0VB 2V7ZA 4BR7A 2E2QA 2ZGZA 3UKRA 5AR0A 1IG8A 1V4SA 3IMXA 1S22A 4JD2A 2GELA 5BPNA 3JS6A 1LCUA 3U9DA 2AA4A 3EN9A 4BG8A 1NWKA 4YDUC 3DXKB 3O80A 5AQHA 2V52B 1GLCG 1NGBA 1ATNA 1MDUB 4A62A 1NGCA 2WUSA 2ITMA 3QDKA 5AQXA 1C0FA 3VETA 2E1ZA 5AQNA 5BN8A 2YI1A 5EXWA 1BA0A 4BC3A 1R59O 3ATVA 2ZF5O 3I8BA 5AQPA 2Q0RA 3CETA 3M3ZA 3DJCA 3C7NA 4PL8A 4CBWA 4CZHA 2QM1A 3UE5A 4A2BA 3QFUA 4H5NA 5BRDA 1U2VB 1BU6O 5KQ8A 3TPQA 3A8YA 3FZKA 1QQNA 5F2RA 4XH5A 3UB5A 1ATSA 4BVPA 1ZXOA 3RSEB 4JN4A 2ZWHA 3DXMA 3VEXA 5AQSA 1YVNA 4BGAA 1XQSC 1JCFA 5AZIA 1JCGA 3VF4A 5AFUA 1X9JA 4BRGA 1JCEA 3BEXA 3MN6A 3BUZB 4EIAA 5JLFA 4L3QA 1Z05A 2E2PA 4FWPA 4RTFD 4C23A 1Y64A 1TYQA 4ISFA 4M7YA 4Z94A 3HM8A 4A61A 4FWOA 1YUWA 4IXCA 3L4IA 4WQ4C 5AQZA 1KAZA 2P9KB 2E20A 3FZLA 3UKRB 1QZ5A 3CJAA 3QBXA 1P8ZA 3M1FA 2IVNA 3QICA 3LM9A 3DWLA 1BA1A 2E8AA 1SAZA 3WUHA 1SZ2A 3VOVA 4CZEA 1KXPA 5AQUA 4DCHA 1GLLO 2A3ZA 2QWMA 4FWQA 4M7XA 1HUXA 3D2FA 5JMVA 4K25A 2Q31A 4F9OA 4WQ5C 3CJ1A 2D0OA 3FLCO 1TUYA 3SK3A 3CJ7A 5AQLA 3SMSA 3VF6A 4BREA 2P9UA 2IVPA 1SQKA 2QWPA 3WEEA 3FR0A 1KAYA 2P9NA 1QQMA 2CH6A 3VENA 1BWFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZD1A 2QA4N 1QZ6A 4Z4GA 2BE2A 3AVGA 5GAHP 4PUOA 4DTOA 4BQZA 3E66A 1WAJA 4WQ4A 3ATUA 2VGNA 4H0PA 5KTQA 4CECA 4DR3K 1Q7YO 4A2AA 1G15A 4FW2A 4BECA 5HLFA 1NLVA 1SKRA 1NM1A 5M1PA 1D8YA 3U8XA 1OKJA 3WXIA 4RW7A 4FK4A 4CJTA 3TI0A 1HKCA 2H3GX 3WQTA 2HMPA 3SPYA 1IJJA 5AQFA 2QKBA 1OVYA 2PZSA 4DQPA 2WOMA 1RBSA 3AO5A 4BC5A 3S3NA 4FK2A 3OJSA 3C6HA 4HVJA 5AQGA 2G8WA 2V51B 4F8RA 3FE1A 1QHAA 3NGZA 4FCYA 3RTVA 2Q3SA 4NYFA 3VEWA 3G4SN 4DR2K 3GOIA 2A1SA 1VQ7N 3LM2A 3HOTA 3ZX2A 1BISA 4JHDB 4AHRA 4MFBA 4QCLA 4B1UB 4MDBA 2BDPA 4LY7A 3I33A 4CBXA 3P83D 3RR8A 3O5BA 4RWTA 1YXQA 3GE1A 2P9SA 4AHCA 3CMEN 2O8FB 3OBWA 4NCGA 1ZBSA 3CJ9A 4YDUA 1RNHA 4O8UA 3WXJA 4EFHA 1KFDA 4Z4FA 2FBXA 4FSVA 4OPHA 4Z4IA 1NBWA 3LDPA 2YHWA 4H5VA 5AZJA 4FJMA 3HK2A 1QVGM 4PKIA 1RDDA 4IDKA 1BI4A 4JI4K 3OYKA 3VGMA 2YHYA 3CFRA 1QTMA 4K41A 3VQ6A 1DTTA 4KKOA 2BH1A 4HTUA 4R79A 1MA9B 1IKVA 1KD1O 3TTCA 4CK2A 4FM2A 4CGGA 4DTNA 1L5UA 3VEVA 1XNRK 3ZSVA 3H45C 4K42A 3O4WA 1BUPA 4EHTA 4BRMA 1GLBG 1KVBA 4FW1A 3QIPA 1RILA 3MK6A 3AAPA 3CCVN 3MN5A 4KB1A 1S1XA 3HTVA 2X74A 4J2EA 3ZSOA 1NGGA 4FWRA 1BQNA 4RCHA 1GOAA 2ASMA 3OYGA 3C7NB 3WQUA 1G99A 5JS1A 3QLHA 1C0GA 2YHXA 3CI5A 3ZT3A 4KBOA 3P5JA 3VESA 4LFCK 3H3OB 3KKSA 4KHWA 3VN5A 3PSIA 3U9ZA 1RDWX 5LY3A 2GWKA 2ASOA 5AQJA 2W6LA 3SV3A 3LAKA 3P1GA 5AZIB 4BR4A 3HBTA 3EKSA 4Z4CA 4KHNA 2NRVA 4IEEA 1TKDA 3G0ZA 5ELZA 3L2UA 3QEIA 2YNFA 2OPQA 3MCPA 5E84A 4KRFA 3HOSA 1I39A 3C94A 1SL0A 2Y1IA 2HHHK 2O8EB 2GTDA 3G71N 2O4IA 4PL7A 5DK5A 3AVJA 1O13A 3E1YA 5EY4A 2FSNA 3A0IX 5AQVA 2E2OA 2QW9A 3THWB 1JXEA 2P51A 4YOYA 2HBLA 1U49A 5C24A 2FBTA 1JJ2M 2P9UB 5T7BA 4KH5A 3QEWA 4NYNA 2IC3A 4DSFA 2E2NA 3I0SA 3NVMA 2P9NB 3ENOA 3AVMA 5C12A 4BRLA 2UXCK 4FOIA 4W5NA 1MU2A 3NMUA 3EY1A 4FJXA 3DAWA 3FFIA 1N33K 3PLAA 4FXDA 1WB9A 3R6MA 1XWLA 4KV8A 1RFQA 3M6GA 4FPAA 4A5BA 4K0KK 4H4OA 4DTXA 2IIRA 3MX5A 5JVGL 3QO9A 1S5JA 3B6OA 1B92A 4XIUA 4BC4A 4AHUA 3KK3A 3ZSZA 4IG3A 4NXMK 4JYAK 3K5NA 1SKWA 1LWFA 2EHGA 3TSPA 3L6QA 4O55A 3OYNA 2IVOA 2E1YA 3AGRA 4KPYA 1Y97A 2HF4A 1HPZA 3VQAA 4E1JA 4FLXA 2OTLN 3SCXA 1M1KO 4W5TA 4ELVA 3WNFA 1K6YA 1OVQA 2P9PA 4H8KA 1GLJO 3VGKA 4DTPA 2HHTA 3HVRA 1ILYA 4DHYA 4JI6K 4BGBA 2FSKA 3E9PA 4CJ4A 4RW4A 2UUBK 2D1KA 4CJ5A 3NGIA 1MWMA 2RF2A 1NMDA 3HYFA 4FOEA 3DI6A 3HRGA 3D2EA 5F0XA 4DTMA 4AM6A 3C6TA 4N5SA 3MECA 5TKYA 5BRFA 2NRHA 3JYTA 1HQEA 1U2VA 4FO0A 1SL2A 1VAZA 4F3TA 5BN9A 2HHWA 3L4QA 1LOTB 2WFBA 1NK0A 4ILGB 4G9ZA 3H1QA 2UXDK 4CHYA 3QNOA 1OH8A 3WXMB 4FLTA 4M3UA 5AZJB 2QWQA 3SUOA 3VQ5A 3KD5E 4JI2K 1S1WA 1YIJN 4Q5VA 4EHUA 1T7PA 3NH1A 3J7ZO 4CEOA 5FPDA 2QWRA 3A5LC 4E19A 4B9MA 3RMCA 3SAHA 1LAVA 2V7ZA 1C1AA 5AR0A 4BE1A 1WSFA 3QIOA 3I56N 4W5QA 3JS6A 3IRXA 1N32K 4X66K 1FK9A 2O8BA 1NWKA 1DTQA 4DFMA 1L3VA 4CFBA 2G8IA 3ZT0A 3F73A 1IH7A 3QERA 5AQHA 4LF5K 2VG6A 4QOZB 1ATNA 1MDUB 1NGCA 1VSKA 2WUSA 3Q7CA 3VMFB 4CK1A 3O3FA 1C0FA 2E1ZA 5AQNA 4M41A 4LF7K 1BA0A 4BC3A 3ATVA 5AQPA 5C15A 2YHBA 4CFAA 2WTUA 2B5JA 1SUQA 4BE2A 3PY8A 4I9QA 2XY7A 2NRXA 4NLBA 3S5TA 4BEBA 3LDSA 2B4JA 4C8NA 3K5OA 1JLQA 1RT5A 2HB5A 3P31A 3RSEB 3DM2A 1VHXA 1HNIA 1YVNA 2DTUA 5M1QA 2NUBA 3TAQA 3BEXA 4DV5K 2JGUA 1C0MA 1BCMA 3TR8A 1WSGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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