5CE3A

The yersinia yopo - actin complex with mgadp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
b'VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMHVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAASTSLEKSYELPDGQVIAIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKTKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPGIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin
publication title The Yersinia YopO - actin complex with MgADP
rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Contractile protein/transferase
total genus 122
structure length 358
sequence length 370
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ce3A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5ce3A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5ce3A03
3R6MA 4WQ5A 3WXJA 3FE1A 5F2RA 4BC2A 3FLCO 4JNEA 2WUSA 2IVPA 1BDGA 3UKRA 4CI6A 3ZX3A 2Q0UA 5FPDA 2J4RA 5AQXA 3WXLA 3EZWA 2KHOA 4PKHA 3WXIA 4BROA 4CZEA 5BRDA 1X9JA 4FWKA 3FR0A 1BWFO 1U6ZA 3ATVA 3CJ9A 4B1XB 4A2BA 1C0FA 1TUYA 3IMXA 5AQLA 1BA0A 1V4TA 3I8BA 4DHYA 4ISFA 3ATUA 5AQVA 2A42A 3FZMA 3VF4A 2ASPA 3BF1A 4BQZA 3ULEB 4BRLA 2ZGZA 1RDWX 2YHYA 4JAXA 4BGBA 2ZF5O 4M7XA 1U2VB 4XEIA 4BREA 4WYBA 1BA1A 3EN9A 3DWLA 5BREA 2YJFA 4BRFA 4RWTA 3AARA 3VEOA 2DPNA 1S3XA 4AM7A 3EO3A 3P4IA 1NLVA 1SZ2A 2V52B 4CZHA 3HI0A 4DCHA 5AQRA 4BRMA 5BRFA 1WOQA 4E1JA 3CJBA 4BR9A 1JCGA 1HKBA 5F0XA 4JD2A 4BRAA 3CHWA 3WT0A 3VEYA 2QWOA 1ZBSA 4BRGA 4K41A 2P9IB 1HX1A 5FPEA 1HJOA 4H0OA 1MA9B 4K43A 3GL1A 3QFPA 4CJ7A 4JHDA 3O80A 4LC9B 1TYQB 4IZ9A 4BRHA 1S22A 2CGJA 4QS7A 3DXKB 3VF2A 1HKGA 1LOTB 2P9UA 4GY2B 3ZETA 4B1UB 3KHYA 3ID8A 2V51B 3FZKA 1T6CA 3LM2A 4WQ4A 4FWQA 3A8YA 4GNIA 3SMPA 1E4GT 2GEMA 3OHRA 1DKGD 5BPMA 1OKJA 2GWJA 4BRQA 1XC3A 5EOYA 4XH5A 1HKCA 1YVNA 4M63C 5KQ8A 4YDUA 3WUHA 4L3QA 5AQOA 2QXLA 5JMVA 3H1VX 4J8FA 4ISEA 1K8KB 1NGIA 3KVGA 5AQQA 5ADXH 5AR0A 1YAGA 1ZXOA 2HF4A 3VPZA 2D4WA 3CQYA 5JLHA 1T44A 4PKIA 4CD1A 3FFKB 4K25A 5LJVA 5AFUA 2P9LB 2FSNA 1NGJA 3VOVA 1MWKA 2ZGYA 4H0VB 3M3ZA 2QWMA 4Z94A 2Q36A 3JXUA 2AP1A 4BRCA 2P9PB 4FWLA 3MN7A 2IVNA 3A5NC 3M1FA 3MCPA 1NM1A 3SK3A 3WQTA 4BC5A 4DQ8A 4BR0A 3HBTA 4FOEA 4YDUC 3ULEA 4BRPA 5BR9A 4RTFD 3FGUA 1GLBG 2Q0RA 1QQNA 3FZHA 1U2VA 3L6QA 3DAWA 4A62A 3WXKA 2Q31A 4CBUA 4MLHA 3FZFA 1GLEG 5F1XA 1Y64A 2NLXA 4EIAA 4A2AA 1GLJO 1BOTO 2A40A 3UKUB 2W40A 3UB5A 4B1YB 3CJAA 5E26A 3H1QA 4DB3A 2Q97A 3LM9A 2PAVA 4MO4A 2D0PA 4MO5A 2QWLA 4H5RA 2P9KB 3LDPA 1V4SA 3M6GA 2GWKA 4FSVA 5AQTA 4CBXA 3IDHA 4PL8A 4B1ZA 3O8MA 3BF3A 4NB4A 4RCHA 4BR4A 2CH6A 1QQOA 3CJCA 4IWVA 2PBDA 4H0YB 3ZEUA 3MK6A 1ATSA 2YCHA 4BQLA 5B8HA 1C0GA 2QWQA 2A5XA 3QB0A 5KPTA 2UYTA 3CI5A 1QZ5A 3VGMA 3CETA 4BG9A 2NZTA 3CERA 3J8AA 1KAYA 4BG8A 3SLCA 4FWRA 4H0XB 2A3ZA 1XUPO 3MMVA 3FZLA 3GDQA 3DXMA 3AAQA 3QMLA 1TYQA 2AA4A 5EXWA 1J6ZA 2FSJA 3CJ7A 3MN5A 3WEEB 4XH1A 3QDKA 4BR2A 2FXUA 1NGAA 3MDQA 5AQNA 3UKRB 5AQPA 3D2FB 5E84A 3JS6A 5AQHA 4H0PA 3VESA 5AZIA 3U8XA 1K8KA 5ELZA 3AY9A 1GLFO 2E2QA 3S41A 3O1BA 3D2EA 3O1WA 2ASOA 5EVZA 2E1YA 2D0OA 5BPLA 2HF3A 3SMSA 1LCUA 3LDQA 2P9NB 3D7EO 1X3NA 3GG4A 4FWOA 3H6EA 2V7ZA 4H5WA 4I6MA 4A61A 4H5TA 3VENA 4BC4A 4CZMA 1SAZA 3VEWA 1NGEA 1JCEA 5AQKA 1IG8A 3O6WA 3U9DA 1MWMA 4QS8A 4BRDA 4BVOA 3C7NA 1KAXA 3RSEB 3LDOA 5EX5A 3L0QA 3AAPA 4QS9A 4ISGA 4JN4A 4BRKA 4H5VA 2FLOA 2P9SB 3A0IX 3BEXA 3VF6A 1NGCA 3ZX2A 4FOIA 4EAHD 3MN9A 4JD2B 2VYPA 2V7YA 1WUAA 1GLDG 3QICA 3C0BA 3SJHA 5KPRA 2W41A 1NBWA 4IXCA 5AFUH 4CZKA 3H3OB 4BR5A 3HTVA 1NGBA 3R9PA 1Z6RA 5AQUA 1QHAA 4O8KA 2E20A 2YI1A 1NGFA 3GBTA 4FL9A 4K42A 2GELA 3HZ6A 4FPAA 3I33A 2E8AA 4H0TB 2BTFA 1P8ZA 3BUZB 1R59O 1NGHA 5AQSA 5KPZA 1JCFA 4CZGA 1CZAN 5AQMA 3ZX0A 3A5OC 1E4FT 3IUCA 3GE1A 3U9ZA 3H3NO 3UE5A 4NO7A 3VEXA 2Q1NA 2QWRA 1H1VA 1GLLO 3ENOA 4FWSA 2VWBA 2IIRA 4FO0A 3TU5A 1HPMA 5I9EB 1X3MA 1QZ6A 1BG3A 1HLUA 2QM1A 2I7PA 4CD3A 5AQYA 1SQKA 1Q18A 2I7NA 4MLEA 1BO5O 3D2FA 5LJWA 1DGKN 4IJAA 2HOEA 3W0LA 2P9IA 4EFHA 4CZFA 2HMPA 1IJJA 4IJNA 1NGGA 3GOIA 4Y0WA 3ENHA 1GLCG 5AZJB 3R8EA 1YXQA 2FF3B 3TPQA 2BUPA 5AQJA 3EKSA 3O4WA 4H03B 4BVPA 3F9MA 4CZIA 3H46O 3VEZA 2ZWHA 2CH5A 1NGDA 4KBOA 2P9NA 3DXKA 3L4IA 5JLFA 5BN8A 3EKUA 2E88A 4WQ5C 2ITMA 4XH4A 1RFQA 2CGKA 4HWIA 4H5NA 4AM6A 2E1ZA 2H3GX 2F9WA 1EQYA 2IVOA 2YHWA 4FPBA 1RGIA 3QBWA 5AQZA 3MN6A 1ATRA 3RSEA 4EHUA 4C23A 3DJCA 4CZLA 3B8AX 3WQUA 2QW9A 4BRNA 2E2OA 1YUWA 1KAZA 2A41A 3A5MC 4BRIA 1BUPA 2P9SA 3HM8A 3U4LA 3HSCA 1DEJA 3A5LC 5BN9A 3ZEUB 1BU6O 2P9LA 4PKGA 4FWNA 5FPMA 5CE3A 5AQWA 2EWSA 5EY4A 2P9PA 1XQSC 2FF6A 3VGKA 4FWPA 4BGAA 2NRHA 1Z05A 5AQGA 2YJEA 3W3DA 4O5FA 5JICA 3DXMB 4BC3A 5AQIA 4EHTA 3LDLA 5KQDA 2A6AA 2GUPA 1NWKA 4HTLA 1GLAG 3QFUA 3UKUA 1NMDA 2YHXA 3O5BA 1ATNA 1QQMA 2D1KA 5LY3A 1D4XA 1ZC6A 3VGLA 3EL2A 4CZJA 3QBXA 5BPNA 2P9KA 3G25A 1T6DA 5BRHA 2E2PA 3CIPA 2VCPA 3VEVA 5AZIB 5ADXA 2QWPA 4BR7A 5TKYA 4B9QA 3D2EB 3CQXA 3H45C 3O08A 3VETA 1ESVA 4JHDB 1HUXA 2ASMA 4PL7A 1KXPA 2GTDA 4IO8A 3BP8A 5FPNA 3VERA 3KZBA 2P9UB 3ZETB 4F9OA 1G99A 2OANA 3IFRA 4I6MB 5AZJA 4WQ4C 4M7YA 1TUUA 2F9TA 4CBWA 1MDUB 4B1WB 2Q2RA 2QWNA 5AQFA 2E2NA 2CGLA 2FSKA 3LL3A 3LDNA 4B1VA 3C7NB 3CJ1A 3WEEA 4FWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JJ2M 2HNDA 4BC2A 1VK0A 3C6TA 2IVPA 4XJXA 2Q0UA 2FBXA 1N33K 3EZWA 3LPTA 5BRDA 4FWKA 1BWFO 3ATVA 4I9QA 3P31A 2IDOA 3BZCA 5HROA 1K6YA 4A2BA 1WSIA 3LP2A 3I8BA 1C6VA 2F7TA 4DHYA 2FBYA 1HYZA 5AQVA 3FZMA 3VF4A 2ASPA 3SZ2A 3ULEB 4BRLA 3KLHA 1NJYA 4NLCA 5J1EA 5HP1A 4BGBA 4M7XA 1RBTA 4BREA 1SKWA 3AO4A 4NYNA 3VQ9A 2ZE2A 3KD5E 4RW4A 5C15A 3PV8A 4DQPA 1S3XA 3ISNC 1VQ9N 3B6PA 4IG0A 1SZ2A 3ZSZA 2V52B 3NVKA 4DCHA 4BRMA 5BRFA 3CJBA 4BR9A 1HKBA 2NNWA 5HRSA 3AA5X 2QTDA 3VQ4A 3CHWA 4U67L 1RT2A 1HPZA 3THXA 1NKCA 3CCLN 4K41A 1E3MA 4Z4GA 3O9TA 3AVGA 3OW2M 3O80A 4BRHA 4QS7A 4F2SA 3VF2A 2P9UA 1QSLA 4CESA 3KHYA 1WBDA 4FJIA 4BACA 4DR5K 4E0DA 3CM5A 4E7HA 1E4GT 1DKGD 1OKJA 1XC3A 3NF8A 1HKCA 3WUHA 5MLCQ 1KCFA 5AQOA 4FJ9A 4ILGB 4BE1A 2BDPA 4ISEA 4B9TA 1BCMA 2F8TA 5AR0A 3RMDA 2HHTA 2HF4A 3E66A 3TWHA 2D4WA 5JLHA 3DRSA 4DLEA 1C0TA 3KWGA 1Q82O 2P9LB 2FSNA 4YORA 4Z94A 5K14A 1ASWA 4DR2K 5M1FA 4FJLA 2FBTA 2P9PB 4J2AA 2IVNA 3SQ0A 4BC5A 1NM1A 3I0RA 3OVNA 3HBTA 4YDUC 4BRPA 5BR9A 4DQQA 1QQNA 2VWKA 1U2VA 1C0MA 4MLHA 1GLEG 1Y64A 2NLXA 4JI0K 5I3UA 4NCGA 1GLJO 3NF9A 3UB5A 1NU0A 3CJAA 2HSTA 1WSFA 2G8UA 2D0BA 4MO4A 1U48A 2NRXA 2P9KB 3LDPA 3M6GA 2PY5A 4CBXA 3IDHA 4B1ZA 3O8MA 3VMFB 2DY4A 3D0PA 4Z4CA 3ZEUA 2YCHA 3QB0A 3AVBA 1TVRA 3CETA 5KRTA 4FJ5A 1OVYA 1KAYA 5JVGL 3SLCA 1QSYA 3L2QA 1QTMA 2KW4A 1RTDA 4DF4A 2A3ZA 1XUPO 3MMVA 3ZSQA 4J2EA 3FZLA 5HBMA 1RCHA 1YVUA 4H8KA 2KFZA 1TYQA 3EE8A 1J6ZA 4JK8A 3WEEB 4CHQA 3V1QA 2OYQA 3ZSOA 2ZQBA 3CYMA 1NOZA 4CGGA 1DTQA 1RBSA 3UKRB 1CXQA 3JS6A 3O9QA 1IKWA 3SPYA 1IBKK 3PIPL 3S41A 3O1BA 1UAXA 4M3UA 2ASOA 3AO2A 1YTUA 2E1YA 3PX0A 3KLGA 4O8UA 2P9NB 4IFVA 4FJNA 3SPZA 1X3NA 3GG4A 4CEEA 3H6EA 2V7ZA 3J7YP 1UA0A 4A61A 4W5TA 3OYNA 1NKEA 1JCEA 1HNIA 1IG8A 3O6WA 1S1WA 3M5RA 1VQPN 1Q86O 3TAFA 1CZBA 3V1RA 1KAXA 2LSNA 5J2QA 3L0QA 1BQNA 3AVKA 1M1KO 4FM0A 4PY5A 4JN4A 2YHAA 4H5VA 1JL2A 2FLOA 2P9SB 3A0IX 3LZIA 4Z4IA 3VF6A 3ZX2A 2VYPA 3VQQA 2OTJN 3ALYA 3SJHA 5GIOA 1TKTA 5KPRA 4JS5A 2W00A 4JKHA 3SCXA 4TSXA 1UOCA 4EP4A 3L3UA 3HTVA 3P5JA 1Z6RA 1YTAA 3CPEA 1SKSA 4DSEA 3LAKA 4C1NI 1S72N 4JKGB 3OBYA 3I33A 2E8AA 3AGRA 3NCIA 5BR8K 3BUZB 5KPZA 1NGHA 4IEIA 1JCFA 4B9LA 4WFNL 5C2DA 1T7PA 2KLAA 3ZX0A 4KI6A 3HOTA 3KLIA 2O4GA 1IBLK 1IG9A 4DFKA 1H1VA 3ENOA 4KHUA 4J2DA 2IS3A 2VWBA 4FJKA 3TU5A 5TKWA 4CK2A 4JV5K 1RTJA 2YNHA 1WBBA 1TL3A 2I7NA 3D2FA 5HRPA 1W7AA 5LJWA 2A1RA 1DGKN 1C1BA 2QEXN 4CZFA 4Y0WA 1HR0K 3TPQA 1F21A 4HUFA 3O4WA 4H03B 4A59A 3H46O 2G8VA 3I0SA 1S1TA 2QI2A 3L4IA 5JLFA 5BN8A 1LV5A 4WQ5C 4CJTA 3KK7A 2ITMA 1X9SA 1XMOK 2CGKA 4HWIA 3VA0A 3QEXA 3OJSA 1EQYA 4E1MA 4AF1A 2YHWA 3K0SA 1OVQA 1S1VA 3QBWA 3ZLJA 1RT4A 2WOMA 4EHUA 2ITGA 2VGMA 4DV4K 2ZM6K 3HRGA 1QS4A 4BRNA 3CPWM 1KAZA 3DLHA 4B3TK 2IOCA 4KHQA 4H4MA 4BRIA 1BUPA 3U4LA 2WONA 3MAQA 3ID6A 1DEJA 1JLFA 4E7IA 2IGIA 3NGYA 5BN9A 3C95A 4PKGA 2GBZA 4GKJK 5FPMA 2X74A 5CE3A 4FJ7A 1C0UA 4OLAA 1HJRA 4FJHA 5EY4A 1WSGA 1JLQA 3VGKA 4BGAA 1JKHA 4AHRA 4OO1J 3W3DA 3M8RA 3HP6A 2GX9A 5JICA 4BC3A 1S9GA 3PO5A 5KQDA 3NH1A 3UKUA 1NMDA 2YHXA 3O5BA 1ATNA 4F3TA 3QLHA 3PUFA 1NJZA 3VGLA 4DR4K 3EL2A 4W5RA 1T05A 3QBXA 4DTPA 3KLFA 5BPNA 3G25A 4GVEA 3RRHA 5I42A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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