4FWNA

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase (tdcd) in complex with adenosine tetraphosphate (ap4)
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
b'FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Transferase
total genus 132
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2012-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fwnA02
5AQJA 4BQZA 1C0GA 3WXLA 3MMVA 4JHDA 2P9KB 3VENA 1NGIA 5EX5A 3DWLA 5BPMA 1XUPO 5BN8A 3GOIA 1ATSA 3CJAA 4H0TB 4B1UB 4F9OA 3A0IX 4DHYA 5AZIA 4YDUA 2V7ZA 1G99A 1DKGD 4H0VB 3R8EA 4CJ7A 2F9TA 3G25A 2E1ZA 1GLCG 3H46O 3LDNA 3A5OC 3LDLA 2QWNA 1TYQB 3SMPA 1MA9B 5F0XA 2E88A 1JCFA 3IMXA 1NGAA 1K8KB 2YHXA 5EVZA 2W40A 2AP1A 3O08A 3H45C 1BDGA 1WOQA 1V4TA 2P9PA 3IUCA 1ESVA 2GWJA 3M1FA 3VETA 3A5MC 3U4LA 5AQRA 4A61A 2ASPA 3SJHA 1HKBA 4BR2A 4BRCA 4AM6A 3BUZB 4IJNA 2H3GX 2IVNA 1U2VA 1NLVA 2V51B 3HM8A 4PL8A 1DGKN 2V52B 5E26A 2I7PA 4NB4A 3WEEA 4FOIA 4CI6A 4BREA 5AR0A 2FF3B 3VF2A 5AQMA 4XH5A 5AQNA 4B1ZA 4WQ5A 2FSJA 4MLHA 4H5VA 2YHYA 4BR7A 5FPMA 3ZX2A 1E4GT 3AAQA 3FLCO 1BU6O 4CZKA 2NRHA 1ZBSA 3DXKB 4IWVA 4XH4A 5LJWA 2FXUA 3GE1A 3O1WA 5JMVA 3S41A 3W0LA 3L4IA 4JN4A 3ZEUB 1BO5O 5EY4A 3UKRA 4H5RA 2D0PA 1DEJA 4PKHA 3JXUA 4A62A 4E1JA 5KQ8A 3ENOA 3FZHA 3HZ6A 4K42A 3CJCA 1NGHA 5AQIA 3VEZA 2GTDA 1Y64A 4CZIA 4DB3A 1NGFA 3I8BA 1Z05A 2QWRA 2IVOA 3HBTA 1OKJA 3HTVA 2A40A 1D4XA 1T44A 4IZ9A 5AQTA 5JICA 3VEYA 3A8YA 4JD2A 2VWBA 5JLHA 2Q0RA 5BRFA 4ISGA 4FWPA 2QM1A 3M6GA 4DCHA 2A6AA 5BRDA 4CZGA 4A2AA 3ATUA 1EQYA 2NZTA 3LM9A 3SK3A 1NGGA 1GLJO 1ATNA 5BR9A 3CJ9A 1Z6RA 4B1XB 4EIAA 2A42A 2IIRA 2W41A 3KHYA 2CH5A 1U6ZA 2HF3A 2P9LA 1GLDG 3KVGA 1KAXA 2A3ZA 1GLLO 2Q97A 4B1WB 5BPLA 4CZLA 3R9PA 4RTFD 4BG8A 3BP8A 3VGLA 3WT0A 5AZIB 1HX1A 1QHAA 2E2NA 2VCPA 2IVPA 3H6EA 4EHTA 3LM2A 4Z94A 3O1BA 4FWNA 2QW9A 3OHRA 4M7XA 1LOTB 5KPZA 1NGBA 3CHWA 3UKUA 5AQUA 2Q0UA 1S3XA 4FWMA 3CIPA 4CBXA 4QS9A 3EKUA 2P9PB 2A41A 3FFKB 3ID8A 4CZEA 4JAXA 2ASOA 1YAGA 3GG4A 3M3ZA 2A5XA 5BRHA 4BRPA 3CQYA 2Q2RA 3O4WA 3VEWA 2DPNA 1RFQA 1U2VB 3CERA 5KPTA 3HSCA 1YXQA 3H3OB 3B8AX 3DJCA 3VOVA 2QWMA 3WEEB 1CZAN 1TUUA 2P9IA 3FE1A 3ULEA 4PL7A 2D1KA 4H5TA 2ZF5O 4FPBA 3DAWA 3VGKA 5ADXH 2GELA 4H03B 4BC4A 1J6ZA 3AAPA 1XC3A 5AQPA 4BRKA 2YCHA 1RDWX 2D0OA 1MWKA 4O5FA 2CH6A 2OANA 4I6MA 5AZJA 4B1YB 3WQTA 1MDUB 2P9UA 3VESA 3AY9A 4M63C 4RWTA 3UKRB 4L3QA 4BVPA 2GEMA 4DQ8A 1NGJA 5EOYA 2CGJA 1NWKA 2BTFA 2Q36A 1GLAG 3O6WA 4H0XB 2CGKA 3MN9A 5KPRA 3H1QA 3IFRA 3H1VX 5AFUA 4EAHD 1HLUA 4C23A 4BVOA 5LJVA 4CZFA 4HWIA 3KZBA 5BPNA 1QZ6A 2PAVA 3QMLA 4XEIA 3D7EO 3QICA 3TPQA 3FGUA 5BREA 4JD2B 3H3NO 1NGCA 4BRDA 2E20A 3JS6A 4AM7A 1C0FA 3EN9A 3AARA 3QFUA 1HJOA 1JCEA 3F9MA 4J8FA 1H1VA 2QWQA 3A5LC 2P9NA 2ITMA 1GLFO 1KAZA 3FR0A 3SMSA 1NBWA 3D2EA 4IXCA 5AQKA 3EKSA 2J4RA 4H5WA 1WUAA 4BC2A 3EZWA 2E2OA 3O80A 4FWOA 3RSEA 2WUSA 5AQOA 3C0BA 5KQDA 5FPEA 3UE5A 2F9WA 3W3DA 2P9LB 3WQUA 3J8AA 1IG8A 4FWKA 4YDUC 3VEXA 3TU5A 2UYTA 3C7NA 1QQOA 4IO8A 3U9DA 2HF4A 5ADXA 4BGAA 3QB0A 3U9ZA 4ISFA 4M7YA 2ASMA 2V7YA 4CBWA 3CETA 2P9SA 3FZMA 4JNEA 4WYBA 2YHWA 1BA0A 3ENHA 4WQ4C 2QXLA 2KHOA 3HI0A 2Q1NA 4FOEA 4BROA 2E8AA 4XH1A 1V4SA 3EO3A 3GBTA 1HPMA 4FO0A 4CZJA 4H0PA 2NLXA 3CI5A 4BRNA 1NGDA 4IJAA 5AQHA 5AQVA 5AFUH 3WXIA 3MDQA 3UKUB 2HOEA 1X9JA 4BGBA 4MO5A 5F1XA 5I9EB 3QFPA 2ZGYA 4LC9B 5F2RA 3LDQA 4BR9A 3BF1A 3GL1A 3QDKA 1XQSC 3DXMB 2BUPA 2PBDA 3A5NC 3BEXA 3CJBA 3SLCA 4FWQA 2YJEA 3O5BA 5AQLA 4CBUA 4QS8A 2FSNA 3FZFA 3VPZA 5JLFA 3VEVA 1E4FT 3DXMA 1P8ZA 2P9KA 4B1VA 4WQ5C 2QWPA 1YVNA 4CZMA 4GNIA 4QS7A 4CD1A 2E2QA 3VEOA 2P9IB 3ULEB 1QZ5A 3FZLA 4KBOA 3IDHA 4BR0A 4Y0WA 3GDQA 4H0YB 5BN9A 4BC3A 4K41A 1YUWA 5AQZA 4CZHA 1BUPA 4BG9A 4BR5A 3QBXA 4WQ4A 3VF6A 5FPDA 3BF3A 4FL9A 1NGEA 1TYQA 4MLEA 3U8XA 2YJFA 4RCHA 1K8KA 3UB5A 4I6MB 5AQQA 5AZJB 2VYPA 1MWMA 2P9UB 4NO7A 5AQSA 1KXPA 3ZX3A 1R59O 2HMPA 1BOTO 5FPNA 3P4IA 5E84A 4O8KA 1X3MA 5AQXA 1NMDA 2FF6A 3MK6A 3R6MA 1JCGA 1T6DA 4BRMA 2FSKA 2Q31A 4H0OA 1RGIA 4BRIA 4MO4A 2E1YA 2EWSA 3L0QA 1LCUA 2QWOA 3MCPA 5CE3A 2CGLA 4B9QA 3MN6A 3VF4A 1SAZA 3QBWA 3WXKA 2QWLA 5AQYA 5TKYA 3MN5A 3VGMA 1TUYA 4BQLA 5LY3A 4BRQA 4HTLA 1HUXA 1IJJA 4BRHA 2AA4A 2GUPA 3DXKA 1QQMA 2P9NB 1BA1A 4BRFA 3VERA 4FPAA 3D2EB 4A2BA 1HKCA 1KAYA 1S22A 2YI1A 1BWFO 3RSEB 3ZEUA 4BRAA 4FSVA 1T6CA 3FZKA 4FWRA 4ISEA 3WUHA 1ZXOA 3L6QA 5EXWA 3CQXA 3ATVA 4BC5A 1QQNA 2ZWHA 3C7NB 4EFHA 4EHUA 1HKGA 3CJ1A 2D4WA 1GLBG 2P9SB 4PKGA 3ZX0A 1ZC6A 3CJ7A 3WXJA 1ATRA 1SZ2A 4BRGA 3ZETB 3MN7A 1X3NA 4GY2B 2I7NA 4H5NA 3D2FB 4BRLA 4CD3A 2E2PA 3ZETA 2ZGZA 5ELZA 1NM1A 5B8HA 1GLEG 3D2FA 2GWKA 3LDOA 5AQWA 3I33A 3LDPA 1BG3A 3EL2A 1SQKA 4FWLA 4FWSA 4PKIA 4K25A 5AQFA 2FLOA 4BR4A 4K43A 3LL3A 3O8MA 1Q18A 4JHDB 5AQGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KTQA 1YF5L 3MMVA 1YITN 2XO7A 3V9ZA 1NGIA 5BPMA 3GOIA 1ATSA 4B1UB 4B9TA 4F4KA 2V7ZA 3B6OA 2DFFA 1G99A 5A2QO 3R8EA 1KD1O 4CHNA 3F2KA 4CJ5A 2HBLA 3G25A 2E1ZA 4OPJA 3H46O 3LDNA 3SMPA 2QWNA 1UOCA 2KW4A 4DU1A 1Q82O 3IMXA 1LW2A 1NGAA 1K8KB 2YHXA 2AP1A 3VQ4A 1V4TA 3V9WA 3RVCA 1GOBA 3U4LA 5AQRA 3SJHA 1J54A 4I9QA 4Z4HA 3RR7A 4IJNA 1FKOA 3V81A 3HM8A 5KGXA 1KRPA 2RPIA 3BZCA 1NKBA 4LF4K 2Y1IA 4HHTA 5HL7L 5E26A 4NB4A 3WEEA 4OGEA 4FOIA 5JVHL 1B9FA 4FK4A 5AR0A 3ZSQA 3O9SA 3LP0A 2F7TA 3MXJA 4WQ5A 4H5VA 3I0RA 3G10A 2PY5A 4A59A 1TKTA 3PIOL 1ZBHA 3I8DA 5BR8K 2QEXN 3NVKA 4FXDA 1XNRK 4XH4A 3DXKB 4LF7K 3QIOA 5LJWA 3KWIA 1XMQK 4JKEA 3S41A 2ZE2A 1N36K 3OYCA 4CGDA 3OW2M 1NNEA 4ID5A 2KQ2A 3S9HA 1BO5O 5EY4A 1FXXA 2BANA 4WFAL 4GVEA 4E1JA 3ENOA 3CJCA 5AQIA 1Y64A 4GVMA 3O4NA 1TL1A 1HR0K 4DB3A 1NGFA 4FYDA 3I8BA 1Z05A 1KLNA 4NYNA 1HNIA 4Z4GA 1HYVA 1W9HA 5AQTA 5JICA 3OS2A 4JD2A 2HHUA 4CEAA 4FWPA 2QM1A 4DS5A 3C6TA 4CZGA 4A2AA 4FW1A 4C8MA 2P5OA 4O0JA 1EQYA 3LM9A 3SK3A 3HOTA 4NCAA 1GLJO 3K9KA 4R79A 1B9DA 4JLHA 2YV0X 3THWB 2I5JA 1RILA 5LL6Z 1U6ZA 2HF3A 1U45A 1ITGA 3CPWM 3R9PA 3MEEA 2Z1IA 1TKXA 4BE1A 4DR3K 3VGLA 1VQ7N 4IOXA 3SYZA 4ELUA 3MAQA 3K5MA 4OKKA 5AZIB 4NXMK 1SS6A 1I39A 3H6EA 1EKEA 4Z94A 5M1FA 1N6QA 4AHSA 4BACA 3VQ7A 3UKUA 4JK8A 3G71N 3CIPA 2A41A 4FW2A 3ID8A 4CZEA 1QVGM 5BRHA 3OA9A 3VEWA 4FLUA 1N32K 1RFQA 1T8EA 1U2VB 3DRRA 4C8LA 3CERA 5GIPA 2EX3A 3VOVA 1K73O 1XNQK 1CZAN 1TUUA 2P9IA 3KWGA 2VG7A 1UA0A 4H5TA 2ZF5O 4DWIA 1BHLA 5FRNA 2FBTA 4JI0K 5GAEP 1J6ZA 2JWLA 3AAPA 4JK9A 4BY9C 1XC3A 4BDYA 3SUQA 3VQEA 5K14A 2OA8A 2D0OA 4O5FA 1TAUA 2OANA 4TSXA 1RT6A 1HPZA 4FJIA 2DTUA 1ZBIA 1X9MA 3VESA 4DV4K 4DV5K 4L3QA 5EOYA 3OYBA 2KZZA 3L3UA 3KK2A 1GLAG 1CZBA 2KZMA 1Q81O 4CCHA 4HVJA 1HLUA 4BVOA 2GV9A 1HYSA 4CZFA 1VQNN 4DFKA 4DU4A 2A1RA 3QMLA 1VRTA 5C24A 3FFIA 3TPQA 3FGUA 1C6VA 5BREA 1NKEA 1HNVA 4BRDA 3ZCMA 4LF6K 1WB9A 4Z4EA 3CM5A 1KVBA 4O5BA 1RNHA 1HMVA 3RRHA 3A5LC 5DM6L 2P9NA 2ITMA 1WSGA 5GADP 1VQON 1KAZA 3FR0A 4IXCA 5HLFA 1T7PA 4M42A 4BC2A 2E2OA 3KD1E 4DSLA 1BCMA 4CJUA 2O8CB 1IG8A 4YDUC 3VEXA 3TR8A 4O55A 2UYTA 2W6KA 3QB0A 3U9ZA 4DR5K 1VQ5N 2V7YA 4CBWA 1OH7A 3HPGA 4WYBA 4J2DA 2YHWA 4DQQA 4E7LA 4WQ4C 4OX9K 2KHOA 1Q9XA 2KKZA 4CZJA 5HRPA 3OYIA 4H0PA 4IG3A 4IFYA 3O9UA 4U67L 3T19A 2HOEA 3HP6A 5C15A 3AVIA 2ZGYA 4ICLA 3AA2A 4WE1A 3BF1A 3GL1A 4JRPA 4KH4A 3A5NC 4JKGA 1S9EA 3O5BA 5AQLA 3VPZA 5JLFA 4JV5K 2B5JA 1UAXA 2HNDA 5M1KA 3DXMA 1HYZA 4B1VA 5SWMA 3P83D 1NJZA 4GNIA 4QS7A 4CD1A 3VEOA 3ULEB 4G1QA 3HL8A 1BISA 3K0SA 2O8FB 4A5AA 5BN9A 3V1RA 1BQMA 2HSTA 3KK7A 4GW6A 5AQZA 4N76A 4CZHA 4KO0A 4BG9A 3BF3A 1U04A 1JLCA 3EE8A 1VQLN 2E6MA 4RCHA 4EZ6A 2X74A 4I6MB 2VYPA 1O1WA 2P9UB 5AQSA 1KXPA 3ZX3A 3KLEA 2HMPA 1BOTO 3OYFA 1RBTA 3ITHA 3P4IA 1KC8O 1X3MA 3WNHA 3MK6A 4BRMA 4FLTA 4C8NA 1C1AA 3OJSA 5MLCQ 4Y1CA 2P51A 3K9JA 4I2QA 3IRXA 3SBTA 5KGWA 3MCPA 3DYAA 3MN6A 3NH0A 1SAZA 3H08A 1VSKA 1RT3A 5TKYA 3LAMA 3KLFA 2AA4A 1SUQA 2RKIA 4OGCA 3VQPA 5KRTA 1XMOK 3L3VA 4FJJA 4FPAA 5HRNA 5EU7A 1S22A 2F8TA 4ISEA 4CF0A 4JRQA 5DMRA 3CQXA 3ATVA 3N4PA 1QQNA 1LAWA 1OVYA 1W0HA 4EFHA 4EHUA 2ZD1A 4KFBA 1LWFA 3CJ1A 3ENBA 2D4WA 1GLBG 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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