3IMXA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
451
structure length
447
Chain Sequence
b'GPGSMVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Investigation of functionally liver selective glucokinase activators for the treatment of type 2 diabetes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 447
sequence length 451
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3imxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3imxA01
1JCGA 5CE3A 4BVOA 2CGKA 3BP8A 5I9EB 2E1ZA 5AQZA 5AZJB 2AA4A 3CERA 4IJAA 1NBWA 4K42A 3WXLA 1SAZA 2CGJA 3FR0A 3MN7A 5BPLA 3JXUA 1BOTO 3L0QA 3WQTA 3MN6A 4CZHA 3J8AA 3DJCA 3CJ9A 2ASPA 4K25A 5KQ8A 3SJHA 3M6GA 4BR0A 5F1XA 4PKGA 3H3NO 5TKYA 3ZETB 1Y64A 4B1WB 3WEEA 3ATVA 3FZHA 3G25A 2V51B 3CJCA 3LDPA 4H0TB 2CGLA 5FPDA 4FWLA 3WEEB 5EXWA 3S41A 4M7XA 3A0IX 5KPZA 3M3ZA 1TYQA 4BRFA 1GLAG 5KQDA 5EY4A 1NWKA 4H03B 2E2PA 4RCHA 2FF3B 4BRLA 1TYQB 1P8ZA 4IO8A 4XH5A 1HPMA 3LM9A 4WQ4C 3ULEA 5AFUA 3QMLA 3CJAA 4FOIA 3VERA 1SQKA 3O1WA 2Q0RA 1HUXA 1BG3A 3ULEB 3O08A 4FWPA 5ADXA 4BC2A 2HMPA 3HI0A 4BR2A 5AQJA 3WQUA 4E1JA 4FWRA 4A62A 3UE5A 2QM1A 3W0LA 3QDKA 4ISFA 3VETA 3CJ1A 2QWMA 2QXLA 3WUHA 2ZGYA 5AQWA 1BA0A 1OKJA 3QFUA 4FPAA 2P9NA 4JN4A 4IJNA 4YDUC 4EFHA 3RSEA 5AQUA 3DXMA 3C7NB 2Q31A 2AP1A 3U9ZA 2IVOA 1G99A 5KPTA 2P9NB 2W40A 5E26A 2A42A 3WXJA 4FWNA 4Y0WA 1U6ZA 3RSEB 1NGFA 4BRIA 4M7YA 3DXMB 1XQSC 2E88A 3VF6A 3IFRA 3LDLA 2Q2RA 2IIRA 3O4WA 2GEMA 4PKHA 2D1KA 4QS8A 4FL9A 2E20A 4I6MA 3KZBA 5JMVA 2NRHA 1ESVA 1XC3A 3AAQA 3H45C 4K43A 4DB3A 2NZTA 3CJ7A 4B1ZA 3CQXA 5BREA 4B1VA 4H5WA 4LC9B 2Q1NA 3FZKA 4BG8A 3F9MA 3O8MA 1BDGA 2QWQA 4CZMA 3IUCA 4C23A 2FSKA 4MO5A 1QZ5A 5AZIA 5BRFA 1NGDA 2I7NA 5KPRA 4RTFD 4BVPA 2FSNA 2VYPA 5AQRA 3ENOA 4BC4A 5AQGA 4XH4A 2Q0UA 4CZFA 3AAPA 5AZIB 2PAVA 3SMSA 4CZLA 1QQMA 3VGKA 1EQYA 3ATUA 3SK3A 3AARA 1HKGA 2UYTA 1GLDG 1QHAA 4K41A 3O6WA 1J6ZA 2GUPA 2QWNA 3ZETA 3VEZA 3HM8A 3BEXA 4H5VA 1GLFO 5AQSA 2ZGZA 4IXCA 4Z94A 4PKIA 1QQOA 1YXQA 3VGLA 4B1UB 5F2RA 2J4RA 1BWFO 3HTVA 1QQNA 1X3NA 1CZAN 5JLHA 3M1FA 3O5BA 4QS7A 4BQLA 4CZEA 2KHOA 4BRDA 1RDWX 4AM7A 3AY9A 3ZX0A 4BG9A 2QWPA 5AQYA 1GLEG 1QZ6A 4ISGA 3DXKA 2QWLA 4H0YB 4GY2B 2WUSA 3QICA 4HTLA 4JHDA 4FWMA 2DPNA 1KAZA 2Q97A 5E84A 4NB4A 3B8AX 4DCHA 3DXKB 1MWMA 3DWLA 4H0OA 4RWTA 4CZIA 2FLOA 3FE1A 3GL1A 3EL2A 4JHDB 2Q36A 2FSJA 4H5NA 3VEWA 1NGGA 1T44A 1KAYA 1BU6O 1C0GA 2V52B 3JS6A 5AQLA 3O1BA 4M63C 1IJJA 2EWSA 2W41A 4WYBA 3QBWA 1GLCG 4A61A 1NM1A 3EKUA 4AM6A 4CBXA 2ASOA 5AR0A 1JCFA 2H3GX 4DHYA 4BQZA 5AQNA 3UB5A 2CH5A 3EZWA 3D7EO 2YCHA 5F0XA 4JD2B 1NGIA 1DEJA 4FPBA 5AQHA 5BRHA 2GWKA 3QFPA 5LJWA 1Q18A 4BRKA 5EVZA 4EAHD 2E2OA 3MN9A 1LCUA 1IG8A 2A41A 2PBDA 3LM2A 4H0VB 4WQ5A 2ZWHA 1MDUB 1S22A 3C7NA 3GOIA 4FSVA 4IZ9A 1NGEA 2P9KA 2GTDA 2F9TA 2P9PA 5AQFA 2YJFA 1Z6RA 1X9JA 3SMPA 3WXIA 4DQ8A 4CBUA 5BPMA 5LJVA 4CJ7A 1K8KA 2P9KB 2P9PB 3DAWA 5AQQA 3VEXA 2GELA 5AQOA 4BR4A 1ATSA 3ENHA 4EHUA 2E2QA 1K8KB 3OHRA 3U4LA 4CZJA 3IDHA 3VEVA 1NGCA 1NMDA 3BF3A 2HF4A 3MN5A 4FWOA 2BTFA 3MDQA 1BO5O 2D0PA 1E4FT 4FOEA 3GBTA 4FO0A 3A5MC 3CJBA 4EIAA 1V4SA 4XH1A 1HKBA 4CD1A 1NGAA 5FPNA 3R9PA 3QBXA 4FWSA 4MO4A 2YHYA 3C0BA 3ZEUA 5LY3A 3ZX2A 3VGMA 4BRAA 1HLUA 2YI1A 1DGKN 1Z05A 5BR9A 2YHXA 4HWIA 3LDNA 4PL8A 3ZEUB 1U2VA 1C0FA 2E2NA 5AQPA 2F9WA 3MCPA 5B8HA 4WQ4A 3UKUA 3H1VX 3CI5A 4XEIA 2VCPA 2YHWA 1YUWA 3FGUA 2BUPA 4CZKA 1U2VB 3I8BA 4O5FA 3LL3A 4JAXA 3LDOA 4CI6A 3UKUB 2FXUA 3CIPA 3GE1A 2V7YA 3MMVA 4B1XB 4H0XB 1HX1A 1YAGA 4KBOA 3D2FA 1H1VA 4F9OA 2I7PA 4BGBA 1NGJA 1T6CA 3BF1A 5EX5A 2P9SA 1X3MA 5AQTA 1HJOA 3D2FB 2E1YA 3TPQA 3L4IA 1GLLO 4O8KA 2P9SB 3BUZB 3EN9A 4BC5A 3KVGA 1GLBG 2VWBA 4GNIA 1JCEA 2CH6A 3HBTA 3O80A 3VEYA 2IVPA 4MLHA 4BRCA 1RGIA 1D4XA 4FWKA 4ISEA 4YDUA 2P9LA 2IVNA 4BC3A 3WXKA 3U8XA 1E4GT 3ZX3A 4BR5A 2P9IA 1ATNA 1YVNA 2ZF5O 2P9LB 5AQXA 3VEOA 2A40A 2NLXA 4A2AA 5JICA 3EKSA 2QWRA 2P9IB 3A8YA 3VF2A 4BROA 4H5TA 3FFKB 3H1QA 2A6AA 4JD2A 3D2EA 2HF3A 1RFQA 1GLJO 3FZFA 5ELZA 1S3XA 1ZXOA 5BN9A 5JLFA 3W3DA 1XUPO 5AQMA 3D2EB 3FLCO 4BRQA 1WUAA 5AQVA 4QS9A 2OANA 5EOYA 4BR9A 4J8FA 3HSCA 1MA9B 3EO3A 4CD3A 5AQIA 1SZ2A 2E8AA 2QW9A 3A5OC 3L6QA 3TU5A 4BRMA 3QB0A 3GG4A 4BREA 3VF4A 3MK6A 3H6EA 3HZ6A 3H46O 3IMXA 2ITMA 4BRNA 2A3ZA 1HKCA 2HOEA 3FZLA 1NLVA 1TUUA 1ZC6A 4EHTA 5FPEA 3VESA 1MWKA 3A5NC 4MLEA 1T6DA 4CZGA 3VENA 5AFUH 3VOVA 4H5RA 4IWVA 3ID8A 4JNEA 4CBWA 3KHYA 4BR7A 1TUYA 1WOQA 2YJEA 4PL7A 1NGBA 5ADXH 1NGHA 2ASMA 3U9DA 1LOTB 2D0OA 5BPNA 3P4IA 3VPZA 4H0PA 4L3QA 1ZBSA 2D4WA 2FF6A 3R8EA 4FWQA 5FPMA 1BA1A 5BRDA 2QWOA 3UKRA 3FZMA 5BN8A 2P9UA 4BRHA 1KAXA 4BGAA 1ATRA 2GWJA 3CETA 3CQYA 3UKRB 3R6MA 3I33A 2P9UB 3H3OB 1BUPA 3WT0A 4B9QA 1DKGD 1V4TA 3GDQA 4I6MB 1R59O 4BRPA 4BRGA 3CHWA 2V7ZA 5AQKA 2A5XA 4NO7A 3A5LC 4B1YB 4A2BA 3SLCA 3LDQA 5AZJA 4WQ5C 1KXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JCGA 2BH1A 4FJJA 1ZBHA 3DLGA 5C2DA 3KK1A 2E1ZA 1TGOA 2AA4A 3CERA 4IJAA 4E7JA 5HOOA 5BPLA 3CC2N 1BOTO 4CGHA 1SKSA 1VSEA 3KD1E 2WTUA 4DQQA 4CZHA 3MXMA 4FJ5A 3AVMA 5JS1A 1HNVA 1S1UA 3SJHA 4E0DA 3LP2A 4PKGA 3ZETB 5GIPA 3NH0A 5M1OA 3WEEA 2PZSA 3FZHA 1B92A 3L2WA 4NCBA 3G25A 2V51B 2HMIA 2BE2A 4DTUA 3LDPA 4C8OA 5C12A 3WEEB 4DQPA 4AHSA 4LFAK 4M7XA 4JKEA 3ITHA 3LAMA 1BGXT 3S3OA 1BCMA 3HJFA 2NNWA 3ISNC 2W6LA 4N76A 5GAHP 4XH5A 4DV6K 1BIZA 3VQ4A 2OA8A 1U49A 3PO4A 3F5TA 3ULEA 5AFUA 3TSPA 3SAFA 3PO5A 3QMLA 1IBLK 4FOIA 3O1WA 4KPYA 2Q0RA 1HUXA 4JI8K 3ULEB 3AGRA 2FBXA 2HMPA 4OGCA 1Y97A 2LSNA 3MWTA 1HQUA 3CJ1A 2ZGYA 2IDOA 4OLBA 4CF8A 1OKJA 4FPAA 2B5JA 3KK2A 1RDUA 4YDUC 1NJWA 3Q7BA 3OW2M 3DXMA 3SUNA 2Q31A 2ZD1A 2IVOA 1G99A 5KPTA 2W40A 4Y0WA 1NGFA 4DR1K 3DXMB 1JL2A 3HT3A 1YHQN 3LDLA 1SUQA 1KFDA 4E1MA 3RRHA 2D1KA 4E7LA 1CXQA 3V9SA 4BACA 5BREA 1IKWA 2FBVA 3T1YK 1IG9A 4LC9B 2Q1NA 5FLXO 1HJRA 2HHSA 4F2RA 2F7TA 3O8MA 2G8FA 4CZMA 5T7BA 2RN2A 1XI1A 2O8CA 2Z1HA 5KI6A 1TKDA 3SCXA 4BVPA 4O4GA 2F96A 3ENOA 4YOTA 3I56N 4PUOA 3MWPA 1X1PA 4CFCA 4HUEA 1FXXA 1HKGA 2A1SA 4F8RA 4OPKA 1JXEA 1GLDG 4K41A 2Q3SA 2QWNA 1U4BA 4A5AA 2D5RA 4H5VA 2A1RA 4OJRA 4WE1A 3K57A 4ZTJA 1VQ5N 3CYMA 4PKIA 1EWRA 2Z1IA 3KK3A 3M8SA 1TL3A 2J4RA 4F3OA 1IBKK 3LZIA 1QQNA 1Q7YO 1IV0A 5FROA 4DR6K 1C1AA 3O5BA 3SUQA 1OH6A 1ASVA 4BQLA 4FLXA 2KHOA 4BRDA 4BDPA 3AY9A 3CCUN 4BG9A 2QWPA 4CIEA 1GLEG 2QWLA 4H0YB 4GY2B 3QICA 1KAZA 1WSEA 3NFAA 3K5NA 4M3YA 3O9TA 3DWLA 4RWTA 4DWIA 4JV5K 4CHOA 2FLOA 1GOCA 3J7YP 2ZJPL 3ZSVA 1T44A 3TANA 4K8XA 5AQLA 3TTFA 4WYBA 3DLRA 1RBUA 4GVEA 2ASOA 1UA0A 2H3GX 4DHYA 4JI3K 1ZBIA 1BL3A 5F0XA 1DEJA 3AVIA 2NRRA 4B3MK 3A2FA 3QFPA 4QOZB 4WF9L 4K8ZA 3RMCA 3TR8A 3CPWM 1VHXA 1X9MA 2KZZA 3GOIA 3HPHA 4FSVA 3DOLA 1NGEA 4JI7K 2P9KA 2HB5A 3OYIA 2YJFA 4DQ8A 4CBUA 3QEIA 5BPMA 3HOSA 1L5UA 3FFIA 2P9KB 1KQSM 4KHSA 3P38A 5AQOA 4KHWA 1OH8A 2HHWA 4DKWA 5C42A 3S3NA 3VEVA 2FBYA 2HF4A 3V9XA 3MDQA 5JVHL 4FO0A 1W2BM 4DU1A 2OTLN 4Z4GA 3PX6A 1L3VA 1CZBA 1HMVA 5HBMA 4MO4A 1DTTA 3ZEUA 3VGMA 3HXMA 4CEQA 1BQNA 4HWIA 4PL8A 3ZEUB 1VK0A 1KVBA 2F9WA 4WQ4A 1NJIO 2VCPA 4KI6A 2BUPA 4B3OA 3I8BA 1SKWA 2DFEA 1EWQA 3LDOA 4CI6A 3L3UA 2FXUA 5HRNA 3GE1A 3O9UA 5JS2A 3NHGA 1KCFA 4H0XB 1TAQA 4F9OA 1NGJA 3K2PA 1RT4A 1T6CA 4DSLA 2QEXN 3QO9A 5AQTA 2UUAK 3L4IA 1J54A 2VWKA 4CJ3A 2PYJA 5LMUK 3MEEA 3KVGA 2VWBA 4GNIA 3SAHA 1JCEA 3PSIA 3NF6A 1N36K 2G8VA 3AVLA 4MLHA 3I55N 4BRCA 1QVFM 1WNSA 2DTUA 5GIOA 4FWKA 3BZCA 2HHUA 4GMJB 3WXKA 3ZX3A 1ATNA 4KTQA 1RDAA 2FBTA 2D0BA 2NLXA 3DLLL 4A2AA 3DOKA 2B4JA 2JWLA 4O44A 3LZJA 4IOCL 4DR5K 3LWLA 2A6AA 2KZMA 5D3GA 3AVNA 3AA2A 3CMEN 1GLJO 3FZFA 4DS5A 3T69A 1ZXOA 3W3DA 2AJQA 4BE2A 1WUAA 3BY5A 4QS9A 3U3GA 3K5LA 5J2QA 4LF9K 3RTVA 4YFUA 3SZ2A 4N47A 3A5OC 1NK8A 4OX9K 3TSQA 4NLBA 2UXBK 3GG4A 1JJ2M 4E7IA 5IWAK 1J5OA 5KRTA 2ITMA 5GAEP 1SV5A 2ETJA 2HOEA 4DTSA 4EHTA 4RW7A 3R1XA 4KH4A 3KIOA 4MLEA 4DSEA 4N5SA 1NNEA 1T6DA 1OVQA 2IC3A 2YV0X 4CHYA 1TKZA 1BIUA 4CBWA 3K9JA 3KHYA 3IG1A 2E6MA 4C8LA 1TUYA 1WOQA 2YJEA 4KH6A 2ASMA 1LOTB 2D0OA 5BPNA 3P4IA 4KV8A 1ZBSA 4Y1DA 4FWQA 3HVTA 1U04A 5BRDA 4KAZA 3OYAA 3OBYA 3CCLN 1RILA 4Q0BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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