3IMXA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
451
structure length
447
Chain Sequence
GPGSMVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Investigation of functionally liver selective glucokinase activators for the treatment of type 2 diabetes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 167
structure length 447
sequence length 451
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3imxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3imxA01
3ID8A 3D2FA 5AZJA 4IXCA 2HF4A 1MA9B 5AQTA 3FGUA 2HMPA 1V4SA 3MN9A 5CE3A 1JCEA 5ADXH 1QZ5A 2P9PB 2V52B 4RCHA 1DGKN 3IUCA 5FPDA 4CD1A 3BEXA 3ZEUA 3O8MA 2QWOA 3ZETA 3W3DA 3VGKA 1H1VA 1TUUA 2Q97A 4FWOA 3LDLA 2GWKA 2E1YA 3O1WA 2Q2RA 3OHRA 4B1WB 1NGHA 3QDKA 1HPMA 1RFQA 2E8AA 3FZKA 4CZGA 4FOEA 3I8BA 4WYBA 3U4LA 2YHYA 3EO3A 2ZGYA 4ISGA 4H5TA 3H3OB 3L6QA 2CH5A 3IDHA 1MWKA 3D2EA 2P9IB 3M1FA 4BRGA 3LDNA 2DPNA 4H5NA 5LJWA 3FR0A 4FL9A 4B9QA 1Z6RA 3UKRA 3O5BA 4RWTA 4IJAA 2UYTA 1E4GT 3FZHA 4MLHA 5ELZA 4JAXA 4BGBA 4CZMA 3CJCA 3SMPA 1CZAN 1NGDA 3A5LC 1BA0A 5AQWA 4H0XB 3D7EO 4BC5A 2QWLA 2Q31A 4A2AA 4BQLA 4CZJA 3ENHA 5BPMA 2QWRA 1BG3A 1J6ZA 1JCGA 3VEOA 2IVPA 3FE1A 3WQTA 4BR2A 4DHYA 3O6WA 5LY3A 5TKYA 2FF6A 1GLEG 4K25A 1HKGA 3BP8A 4BRNA 3HZ6A 3L4IA 1ATNA 3VEVA 1MWMA 1YXQA 4PKHA 3H46O 3UB5A 3MDQA 1OKJA 1HLUA 2HOEA 4FSVA 5FPMA 2QWQA 4NO7A 3CERA 3GBTA 2W41A 3O1BA 3ZX3A 4FPAA 4FWPA 3ZX2A 1WUAA 2YJFA 3LL3A 3ATUA 4BRIA 4BR9A 2E2OA 3LDOA 2VCPA 2NRHA 1KXPA 3WXKA 2AA4A 1DKGD 4JD2B 1QZ6A 3CI5A 4F9OA 5BR9A 3HBTA 5AQQA 1G99A 3QBXA 5AQPA 2P9KA 1X3NA 5I9EB 4FPBA 5F1XA 5AFUA 3C7NB 2CGLA 5EY4A 4JHDB 3MN7A 4I6MA 1RDWX 3P4IA 4CZIA 3GE1A 2D0PA 4EAHD 3CETA 5AQVA 2GUPA 3IMXA 4FOIA 3R9PA 3A8YA 2E1ZA 3JXUA 1NGEA 1QQOA 5AQKA 4BQZA 2P9SB 3A5OC 2A42A 1ZXOA 3SK3A 2P9NA 3RSEB 5F0XA 3C0BA 3U9ZA 1S3XA 4AM6A 3TU5A 2FSJA 1TYQB 5AQXA 2GTDA 3WT0A 4A61A 1KAYA 1C0FA 4H5WA 3FZMA 1IG8A 3CQXA 4RTFD 5AQYA 2CH6A 4BR5A 4HTLA 5AZIA 4BG9A 3AARA 3VEZA 5KQ8A 2VYPA 2HF3A 4MO4A 3VEWA 4KBOA 4BR4A 3VERA 2V7YA 3UKUA 2Q1NA 1U2VB 4FWRA 4H5VA 5AQHA 3FZFA 5EVZA 3WEEA 4BR0A 3EKUA 3O4WA 4EHTA 3WQUA 3ATVA 2YI1A 3HTVA 2E88A 4QS7A 4MLEA 4DQ8A 4BRMA 2P9PA 3CJAA 4EFHA 4M7XA 3EKSA 1GLDG 5AQGA 1T44A 4LC9B 3D2EB 4H0YB 4BROA 3WXJA 3S41A 4CZHA 5E26A 1BU6O 1BA1A 5BRHA 3DXMB 3FFKB 3UKRB 2I7PA 1K8KB 3SJHA 3H45C 4J8FA 3CJ9A 4K42A 2ASMA 4BRPA 4IZ9A 3MK6A 1S22A 3BUZB 3TPQA 4BREA 1NGBA 1T6DA 3SLCA 3LM9A 1YAGA 1BDGA 3DXKA 1GLBG 2QWNA 4BRCA 4FO0A 5F2RA 2FSNA 4A2BA 4BGAA 1KAXA 2PAVA 5JLFA 3BF1A 5FPNA 2YCHA 3H6EA 3SMSA 4EHUA 3JS6A 4CZKA 5AR0A 5EOYA 1GLCG 1ATRA 1C0GA 5KPRA 1XQSC 1D4XA 2ZWHA 5AQRA 2FXUA 3HI0A 3LDPA 1SZ2A 1HKCA 2E2NA 1QQMA 3R6MA 4K41A 3CJ1A 3GG4A 2WUSA 1HX1A 5AQUA 3MN5A 1BUPA 4DCHA 4O8KA 1KAZA 4H0PA 3VEXA 2A40A 5BREA 3CJ7A 5B8HA 1BWFO 1YVNA 1Z05A 3M3ZA 4YDUA 2A41A 1XC3A 3GOIA 4BR7A 3CQYA 2Q0RA 4PKIA 4CZLA 3EL2A 3U9DA 1NGGA 4XH1A 2ITMA 1SQKA 4E1JA 3U8XA 1MDUB 2E2QA 4FWSA 3W0LA 3VF4A 3HM8A 3VF2A 1R59O 4ISFA 3J8AA 2P9UA 3MN6A 3AY9A 5AQSA 4QS8A 2IIRA 4JN4A 4CBWA 2D4WA 4FWKA 4BVPA 2D1KA 2BTFA 2QWMA 3C7NA 3FLCO 4JHDA 4BRLA 2YJEA 1ZC6A 4H0TB 3ENOA 1NWKA 2FSKA 1NM1A 3O08A 4B1YB 2QWPA 2P9NB 3ULEB 2Q36A 2V51B 3MCPA 4B1ZA 4IJNA 5BN8A 4DB3A 3A0IX 5JLHA 4H03B 4EIAA 5AQOA 5AQLA 5BN9A 2GEMA 4BC2A 5AQFA 5KPZA 4O5FA 2GWJA 3UE5A 2P9LB 1BOTO 3RSEA 4B1UB 3D2FB 4ISEA 4M63C 5AZJB 1NMDA 5AZIB 3LM2A 4K43A 1TYQA 3VOVA 4BC4A 1GLAG 4CZFA 5BRFA 4XH4A 4C23A 3VENA 3UKUB 4CJ7A 5AFUH 4WQ4A 5EX5A 1HKBA 3WXIA 1T6CA 2OANA 3ZEUB 1ESVA 3WEEB 3ZETB 5LJVA 1X9JA 2KHOA 4JNEA 3FZLA 4BRKA 5JICA 1ZBSA 2E20A 2ASPA 4BRAA 1NGCA 3VPZA 1U2VA 3F9MA 5BPNA 3KZBA 3O80A 3QICA 3R8EA 3QFPA 1ATSA 3EN9A 4YDUC 3L0QA 4CI6A 2IVNA 3H3NO 4L3QA 2I7NA 3VF6A 4BG8A 2NLXA 2YHWA 2IVOA 1IJJA 1NGAA 3CJBA 2F9WA 3QB0A 2BUPA 2P9IA 5FPEA 3VGMA 4Z94A 2H3GX 3AAPA 3WXLA 4CD3A 3KHYA 1WOQA 1NGJA 3DJCA 1RGIA 1NLVA 4XH5A 4FWQA 4B1XB 2FF3B 4BVOA 4H5RA 4BC3A 3DXMA 3VGLA 3CHWA 3DXKB 2V7ZA 1K8KA 1NBWA 4WQ5A 2A5XA 4IWVA 3WUHA 3EZWA 2A6AA 3QMLA 2QXLA 4BRFA 1JCFA 2YHXA 4NB4A 4B1VA 5KPTA 2CGJA 1TUYA 4A62A 5AQJA 3LDQA 1BO5O 3QBWA 1GLJO 3HSCA 1LOTB 4CBUA 5BRDA 3BF3A 1XUPO 1P8ZA 3H1QA 4PL7A 1HUXA 5EXWA 4FWNA 3ZX0A 3A5MC 4AM7A 4PKGA 4BRHA 2ZGZA 4FWMA 5AQMA 2GELA 4WQ4C 4XEIA 2J4RA 2P9KB 2CGKA 4H0VB 3MMVA 1GLFO 3I33A 4HWIA 3M6GA 2A3ZA 4JD2A 4I6MB 2NZTA 2F9TA 2FLOA 5KQDA 5JMVA 5AQNA 2ZF5O 1V4TA 5BPLA 5AQZA 5E84A 4H0OA 2P9UB 3AAQA 3H1VX 5ADXA 3KVGA 1Y64A 3A5NC 3DAWA 4M7YA 1GLLO 4GNIA 2AP1A 2ASOA 3G25A 3IFRA 4FWLA 3CIPA 2QW9A 1U6ZA 4QS9A 3VETA 2PBDA 5AQIA 1Q18A 4IO8A 3VEYA 1NGFA 1SAZA 2Q0UA 3QFUA 2EWSA 4BRDA 2P9SA 2QM1A 4Y0WA 4PL8A 3GDQA 1NGIA 1LCUA 1YUWA 2W40A 3ULEA 4MO5A 3GL1A 4CBXA 4CZEA 3VESA 1EQYA 1X3MA 2D0OA 3DWLA 2E2PA 4WQ5C 4GY2B 1DEJA 3B8AX 1E4FT 1QQNA 4BRQA 2VWBA 1HJOA 1QHAA 2P9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D2FA 3O3GA 4J2BA 2HF4A 4W5NA 4JI4K 3FGUA 3QESA 1YT3A 3SI6A 3WNGA 1T03A 4EZ6A 1BIUA 3TAFA 5J2QA 2P9PB 4U7BA 4RCHA 3RTVA 5FPDA 4CJSA 1VQON 4CD1A 4B3MK 3BEXA 3OBYA 4FLYA 3THYA 3O8MA 4KHUA 1JXEA 2GWKA 3O1WA 2Q2RA 1NGHA 4JI6K 1D8YA 2E8AA 1VSJA 3FZKA 4FOEA 4N47A 1OVQA 1U49A 4HUEA 4H5TA 1HNXK 5C2DA 3D2EA 2P9IB 4BRGA 3TTCA 4WF9L 4OPKA 2DPNA 1EP4A 3KJVA 4CJTA 4W5TA 4CEEA 3UKRA 3KWIA 1SL0A 1XWLA 4M3XA 2NRRA 3ZSXA 4DQRA 4CZMA 4FZZA 3CJCA 2BH1A 3SBTA 2QWLA 4A2AA 3ENHA 2QWRA 1JCGA 3ZYYX 3FE1A 3WQTA 4DLGA 1LV5A 5TKYA 1RTHA 4K25A 4KH6A 3HK2A 2OZSA 3SPYA 4NXMK 3UB5A 4OKJA 2FBXA 1BQMA 1IG9A 2QK9A 3CCEN 4M41A 2NUBA 1HLUA 1VSKA 4NO7A 3OYAA 3CERA 3LANA 3QLHA 4CIEA 5C24A 2YKMA 4Z4EA 1WUAA 2BGGA 1QS4A 3P5JA 2E2OA 2XO7A 2IS3A 2UU9K 4QCLA 4DQPA 3J81O 4C8KA 4OLAA 3PSFA 2ATQA 3WXKA 1VSIA 1RDCA 1QZ6A 4MFBA 5KRSA 3ZSVA 2O8EA 3HBTA 4MQ3A 1G99A 4HVJA 1BIZA 1WSGA 2Z1HA 1YVUA 2CGLA 1UAXA 4M42A 4JI1K 1LWEA 3P4IA 4FJHA 2HHVA 3GE1A 4EAHD 1CZ9A 3VA3A 2YNIA 3IMXA 4GV9A 1KVBA 3VA0A 3RRHA 4CJVA 5AQKA 1C0UA 4CEDA 3O3FA 3DLEA 1ZXOA 4JEPA 1T7PA 5F0XA 1T05A 3U9ZA 4AM6A 3NH1A 2FSJA 1NK9A 1WSEA 2OCEA 4UQGA 1QVGM 1VQ6N 3V6DA 1KAYA 1LW0A 5KGXA 4H5WA 1IG8A 3OS1A 3CQXA 5LMUK 4IOCL 3TANA 3AARA 4FLWA 2KKZA 1NJZA 1JLBA 1W2BM 4WFNL 3PX6A 3VERA 3UKUA 1HYSA 1HJRA 2HW3A 3V9XA 3L3VA 5EVZA 4KHQA 4BR0A 4AHCA 3CXCM 2P1JA 2QTDA 4B3OA 3WQUA 3RMBA 2O4IA 3G71N 3K5MA 1XMOK 4IDHA 4CJ4A 2P9PA 2Z1IA 4M7XA 1RTIA 1U04A 4CJPA 3NGYA 1G15A 3V4IA 3S41A 1GOBA 3DXMB 1X9SA 4B9SA 1Q9XA 1K8KB 4N5SA 3H45C 4KHWA 3OYFA 1KFDA 2BE2A 3HVTA 3T1HK 1VQ5N 2ASMA 3CPEA 3OYJA 4IZ9A 4BREA 4H8KA 1RT4A 3K2PA 3CQ8A 3KLFA 4JKBA 4FO0A 5F2RA 3TAPA 3BF1A 1HYVA 4IFYA 4KB1A 1K9MO 5EOYA 3CC4N 3B6OA 1ATRA 1N34K 1C0GA 5KPRA 1D4XA 2ZWHA 5AQRA 2HHSA 3HI0A 1VQNN 3K59A 3L2QA 3OY9A 3TWHA 3AVMA 2EHGA 1KAZA 1W7AA 1SKWA 3VEXA 1VSMA 4DSIA 1DTQA 5T7BA 2A41A 4CVNE 3JSMA 3TABA 2E6MA 3HL8A 4CHOA 2HHUA 4CF8A 3Q7BA 1NGGA 1W0HA 4E1JA 4CHYA 1QQCA 3SUPA 5HOOA 3W0LA 3HM8A 1YI2N 3J8AA 2YNGA 3BY5A 3AVCA 2QWMA 3D45A 2QKBA 2YJEA 1ZC6A 4R79A 3I56N 2FSKA 1N5YA 1BQNA 4B1YB 4X66K 3MXMA 3LP3A 1C0TA 1L3VA 4YHHK 3MCPA 5BN8A 4PUOA 4DB3A 3A0IX 1HMVA 1UA0A 5BN9A 5E41A 5CYMA 3ZSYA 5AQFA 2OTLN 1YJ9N 4KFBA 4CW7B 2P9LB 2O8BB 3PO4A 4M63C 5AZIB 3LM2A 4K43A 2G8IA 3SNNA 4BC4A 4ZTFA 2P51A 4XH4A 4C23A 3VENA 3PO5A 4C8LA 3DLKA 4IO9L 3ZETB 4GVMA 3NF8A 1JLFA 4JNEA 4DTOA 3AVBA 1WNSA 5C2FA 2ASPA 3BGRA 2W42A 3F9MA 3I8DA 5BPNA 4FLTA 1NG9A 3TAQA 1VQKN 4Z4HA 5FRMA 3KIOA 4E19A 2UXCK 1ATSA 1OVYA 4B9TA 1JLEA 4CI6A 2IVNA 3H3NO 2DTUA 2I7NA 5M1PA 2NLXA 1IJJA 3AVNA 1J9AA 3QB0A 5FPEA 4JLHA 3VGMA 1IBMK 2H3GX 3AAPA 3HPHA 3WXLA 1NGJA 1I39A 3AVFA 4RG8A 1JJ2M 4NCAA 2DFFA 3NGIA 1W9HA 2FF3B 5M1OA 4BVOA 3DXMA 4WQ5A 1K8KA 1IKWA 3NBPA 1WAJA 4DV4K 2A5XA 4KPYA 5KGWA 2ITGA 4LSLA 3NAEA 4DR3K 3TAEA 3EZWA 4IBNA 3ZSZA 2A6AA 3QMLA 4DF8A 2QXLA 5JVGL 1RTJA 1VQLN 4DV3K 3NF7A 3HT3A 4A62A 1YHQN 1GLJO 4FYDA 1S6PA 4M3YA 3G6EN 4MDAA 4CESA 2YNHA 3A5MC 4BRHA 3ENBA 4KKOA 2XY7A 4CEAA 4M3RA 4ID5A 2J4RA 4CGIA 1YIJN 4FJ5A 1RBSA 4KH5A 1ASWA 3M8SA 1NOZA 2NRWA 3MMVA 2QXFA 4HWIA 3M6GA 4KB0A 4JD2A 2NZTA 3QEXA 2F9TA 2FLOA 4CECA 2WTUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3KK7 A;  4ILH A;  3LAM A;  3OYI A;  3PUF A;  3DLL L;  3C94 A;  2YHX A;  4LF6 K;  5KPT A;  4IOA L;  2CGJ A;  3TTD A;  1X9W A;  3F9K A;  3SBG A;  3LWM A;  3LDQ A;  3QBW A;  1LOT B;  3DRS A;  5BRD A;  3BF3 A;  1W97 L;  3H1Q A;  1HUX A;  1RNH A;  1KFS A;  4DTS A;  4FM0 A;  4FWM A;  4WQ4 C;  3DOK A;  4H0V B;  4OVL A;  3LWL A;  1NOY A;  3RVC A;  1GLF O;  2WFB A;  5KQD A;  5JMV A;  5AQN A;  2ZF5 O;  1V4T A;  4CEO A;  2P9U B;  3AAQ A;  3DAW A;  4M7Y A;  4CJK A;  1SKS A;  1TKT A;  2WON A;  4FWL A;  4KTQ A;  3THX A;  4FJG A;  1U6Z A;  4AF1 A;  2JGU A;  3KD1 E;  4M3Z A;  5AQI A;  2OYQ A;  1XHZ A;  2NRZ A;  1RDD A;  2IGI A;  3HVR A;  1SAZ A;  1Q81 O;  2P9S A;  4GKK K;  4J2A A;  2Y1J A;  3AO1 A;  5HP1 A;  3NCI A;  3ULE A;  4FJ8 A;  4FJX A;  3VES A;  1SL2 A;  4A5A A;  1EQY A;  3DWL A;  5GAE P;  4GY2 B;  1DEJ A;  1BI4 A;  1REV A;  1QQN A;  1HJO A;  3O4N A;  4DUZ K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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