3IMXA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
451
structure length
447
Chain Sequence
GPGSMVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Investigation of functionally liver selective glucokinase activators for the treatment of type 2 diabetes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 447
sequence length 451
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3imxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3imxA01
2E1YA 5AQVA 3GG4A 3WXJA 3A5NC 1TUYA 2Q31A 3GDQA 3VGKA 3HI0A 3R8EA 5LJVA 4FOEA 2FF3B 3JS6A 3CJCA 5KQ8A 4I6MA 5BRHA 4BR4A 4Y0WA 3FZFA 2QM1A 4BROA 3UKUA 1U6ZA 4FO0A 3WXKA 3L4IA 3TPQA 1RDWX 2P9NB 1BDGA 3CJ7A 1QQMA 5BN9A 1BWFO 3O6WA 2AA4A 4B1UB 2GTDA 1YUWA 3WUHA 2FSNA 3GOIA 4EHUA 1NGIA 3J8AA 3M6GA 4PKHA 4AM7A 2A41A 4BRIA 2GWJA 1XQSC 2YHWA 4RTFD 5KPZA 4MLEA 4MLHA 2VYPA 5AFUA 1BOTO 1BG3A 3CQYA 2E8AA 1GLFO 2HMPA 1YVNA 4JNEA 4BVOA 4BRKA 3R6MA 4BRDA 3ZETA 2A6AA 3D7EO 2KHOA 1ATSA 5EXWA 4F9OA 1MWMA 2ASPA 4FPBA 1HJOA 5BPLA 5AZIA 4RWTA 2E1ZA 1KAXA 1V4TA 4CJ7A 2BUPA 1D4XA 1NMDA 1JCEA 4I6MB 5F2RA 3VEOA 3MDQA 3UKUB 4PL7A 3ENHA 2D1KA 2IVPA 2F9TA 3AARA 3QICA 4DQ8A 4FOIA 2GELA 3D2FA 3VEWA 1NWKA 3LM2A 3SK3A 4H5NA 5AQLA 5AQPA 3O80A 1HLUA 3LDPA 2FXUA 4PKIA 4E1JA 5BPMA 1NGCA 2P9SA 5AQYA 3LDNA 2WUSA 1DKGD 1NGAA 4FWMA 4QS9A 3EN9A 3FR0A 2H3GX 4CZKA 4WYBA 1HUXA 3A5OC 2IVOA 3HSCA 1NBWA 2P9IA 3U4LA 3M1FA 4BR0A 1QZ5A 1TYQA 3M3ZA 3C7NA 3BF1A 1BA0A 5FPEA 1JCFA 2EWSA 2ZF5O 5AQUA 1ZBSA 2FSJA 4YDUA 5AZIB 4H0VB 1TUUA 3MMVA 1E4FT 5AQXA 4L3QA 4IZ9A 3VF6A 5AQSA 4A2BA 2A42A 3EL2A 4FSVA 4B1XB 1BO5O 1T6DA 3H3OB 4FWRA 3HM8A 1GLCG 2FF6A 3DXMA 1HX1A 3EO3A 4XH4A 1XC3A 4DHYA 1RGIA 1Z05A 3D2FB 3H1QA 3LDLA 5EVZA 2ASMA 4PKGA 1ZXOA 4NB4A 4WQ5A 4A2AA 3O1BA 3DWLA 1ATNA 1NGDA 2P9SB 2NZTA 2P9UA 3QB0A 2D0OA 3BP8A 5AQOA 4M63C 3QMLA 3I8BA 2NLXA 3H45C 4NO7A 1HPMA 1S22A 3H6EA 4CZHA 5BPNA 2P9IB 2Q2RA 1X3NA 1TYQB 5TKYA 3H3NO 3MCPA 3VGMA 4C23A 3SMPA 3C7NB 3UE5A 3UKRB 4B1ZA 1R59O 3CI5A 4BR7A 2E20A 4EFHA 3CJAA 4BRMA 1SZ2A 2A3ZA 3VPZA 4H5WA 3QBWA 3O8MA 3O4WA 1K8KA 4BR5A 4K42A 5JMVA 1KXPA 4WQ4C 3MN9A 4HTLA 1XUPO 2QWOA 1G99A 2AP1A 3BEXA 2HF4A 3QFUA 3EZWA 2J4RA 4CBUA 4O5FA 2E2QA 3DXMB 4H03B 1GLJO 4WQ5C 2F9WA 3BUZB 5JICA 1WUAA 2YHYA 3ATVA 3FLCO 4FWKA 2Q97A 4O8KA 4ISGA 2PBDA 4CZLA 1MWKA 4B9QA 3MN5A 1HKGA 3P4IA 5AQZA 4ISFA 3WQTA 4BVPA 1QZ6A 5AQWA 5KPTA 2P9UB 4FL9A 2BTFA 2IIRA 4MO5A 2PAVA 3WT0A 4A61A 4LC9B 3SLCA 5AQGA 4BRQA 1YXQA 4XH1A 1NGFA 3KHYA 1E4GT 3BF3A 1NLVA 4EAHD 2A40A 3CJBA 3JXUA 4H5VA 3ZEUA 5ADXH 4H0TB 3QFPA 3O5BA 1ZC6A 3A8YA 2E2NA 3CIPA 5JLFA 4EHTA 1QQOA 1K8KB 5ELZA 4K43A 5CE3A 4FWLA 4GNIA 3CJ9A 1EQYA 2Q0RA 3O1WA 1T44A 5EX5A 1RFQA 4K25A 4CZEA 3KVGA 2GWKA 3ID8A 3LM9A 3O08A 3SJHA 1ESVA 5E26A 3OHRA 1YAGA 1LOTB 4QS8A 2FLOA 4M7YA 2ZGYA 3I33A 2QWQA 3LDOA 3WEEA 5FPDA 2HOEA 4J8FA 3UKRA 1U2VA 3VF4A 3IFRA 3VEZA 3FFKB 2QWPA 4BC4A 4FWQA 1NGJA 5F0XA 3H46O 2DPNA 2Q1NA 1T6CA 4BR9A 3CERA 2QWLA 3CHWA 3VEXA 4BRLA 4BRNA 4CZJA 1P8ZA 3FZKA 1SAZA 2FSKA 3VGLA 4GY2B 3DXKA 3GE1A 3MK6A 4IJAA 1HKBA 3ZEUB 1C0FA 4BC2A 1KAZA 1V4SA 4KBOA 1OKJA 2YJFA 4BQLA 5AFUH 4BQZA 1QQNA 4B1WB 5AQRA 4JHDB 4QS7A 3ENOA 1KAYA 4BR2A 5KQDA 4EIAA 3HZ6A 5AQNA 4RCHA 2ZWHA 3KZBA 4FWNA 4K41A 2QWNA 5AQTA 3D2EA 2Q36A 4JD2A 3VOVA 2E2PA 3ATUA 2I7NA 5JLHA 4MO4A 1H1VA 4BC5A 3U9ZA 4H0PA 4YDUC 4XEIA 4FWPA 3U9DA 1Z6RA 4DCHA 3WEEB 3CJ1A 3ZX2A 3FGUA 3IMXA 3AAQA 1NGGA 1U2VB 2UYTA 4BG8A 4H5TA 1QHAA 3AAPA 5FPNA 2YI1A 4BG9A 1NGEA 1Y64A 3MN7A 5AQQA 2CH5A 5FPMA 3WQUA 1LCUA 1CZAN 1IJJA 5AQHA 3ZX3A 3A5MC 2CH6A 2CGLA 3QDKA 4BRGA 3DXKB 3W0LA 2OANA 5AQFA 4CD3A 2YJEA 3LDQA 4JN4A 4B1YB 1NGHA 5E84A 3ULEA 2ZGZA 4JAXA 2QXLA 4Z94A 3H1VX 1NM1A 3QBXA 3F9MA 2GEMA 2D0PA 1MDUB 3FZHA 5AQJA 5KPRA 1JCGA 3L0QA 1GLEG 2V52B 2P9LA 3AY9A 3D2EB 3DJCA 3EKUA 4JD2B 3UB5A 4A62A 4CBXA 4DB3A 3FZLA 4FWOA 4H0YB 1IG8A 3A5LC 3RSEA 2E88A 3L6QA 3FZMA 3LL3A 4CZGA 2W41A 3VERA 4H0XB 3G25A 3VEVA 2P9KA 5BRDA 2GUPA 2A5XA 2P9PA 3WXIA 5AQMA 4BGAA 1Q18A 4JHDA 4BC3A 5AZJA 3B8AX 5BREA 1GLDG 2IVNA 2YHXA 4CD1A 5I9EB 3HBTA 4BGBA 2ITMA 4BRHA 1DGKN 1ATRA 2CGJA 3VF2A 3ULEB 1MA9B 3HTVA 3GBTA 2HF3A 4HWIA 3C0BA 4IXCA 3R9PA 3VESA 1X9JA 3ZX0A 3CQXA 4IO8A 5BN8A 4B1VA 2V51B 1BU6O 2NRHA 2P9LB 3TU5A 1GLLO 2VWBA 3WXLA 4BRAA 1GLAG 5B8HA 5LJWA 4H0OA 3RSEB 1S3XA 4CZMA 3IUCA 2V7ZA 4AM6A 4CZFA 2E2OA 1C0GA 1SQKA 5EY4A 5AR0A 2P9KB 4BREA 3VENA 5AQIA 1X3MA 4CZIA 3FE1A 2QW9A 3W3DA 4BRPA 1GLBG 2P9PB 3ZETB 1J6ZA 4PL8A 2CGKA 4H5RA 2QWRA 4XH5A 3A0IX 4CI6A 2P9NA 5AZJB 1NGBA 2Q0UA 4FPAA 1DEJA 3DAWA 4IJNA 1BA1A 4FWSA 3VETA 3VEYA 4ISEA 1WOQA 5EOYA 4IWVA 5BR9A 5ADXA 2VCPA 4M7XA 5LY3A 4CBWA 2ASOA 4WQ4A 5BRFA 2D4WA 3SMSA 3MN6A 1HKCA 3IDHA 2V7YA 5F1XA 2I7PA 3GL1A 4BRFA 2W40A 5AQKA 3CETA 3U8XA 2YCHA 4BRCA 2QWMA 1BUPA 3S41A 3EKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGGA 1MU2A 1IO2A 3WXJA 4AHTA 1TUYA 4BE2A 4DSIA 4Z4IA 2OCEA 4E0DA 4IFYA 1RDBA 4JEPA 2FF3B 3PO4A 3P31A 3B6OA 4YOTA 3MAQA 2NRTA 4R79A 5LMNK 1S1XA 3J7AP 3WXKA 1IBLK 1WLJA 3TTDA 2F8TA 2HVHA 2A1SA 1U4BA 4EHUA 3CYMA 4F2SA 4IG0A 4H8KA 3KLFA 3TSQA 3SCXA 4JI4K 1N6QA 1C1AA 4AF1A 2YHWA 1QS4A 1HNZK 4JK9A 2IGIA 2OPPA 4ZTFA 2VYPA 1BOTO 3ZLJA 1GLFO 5FRNA 3HYFA 2VG6A 4JNEA 1OH7A 4CJSA 4BY9C 1J9AA 4MDBA 2XY5A 5TKWA 4F9OA 4B3OA 3OBYA 2UUBK 5SWMA 1NJXA 2O8EB 2E1ZA 5FROA 3CCSN 5HBMA 1XWLA 1JCEA 1KSPA 5FDLA 3VEOA 4X62K 1NK4A 1Y97A 3SV3A 3AARA 3QICA 4KRFA 2GELA 3VEWA 4DR2K 1TK0A 5AQLA 3O80A 3LDPA 2ZJPL 2P5OA 1NGCA 2P9SA 3VQ4A 1TL1A 4BE1A 1NGAA 3E9PA 3ALYA 5HROA 4NLCA 4CZKA 1Q81O 1D8YA 4B3SK 3NF6A 3SUQA 3PLAA 4OJRA 2FSJA 3T19A 1A5WA 3I56N 3LDSA 1L3UA 1E4FT 5AQXA 4A2BA 4DQRA 4CFBA 3K9KA 1Q82O 4FSVA 1JXBA 2FF6A 3DXMA 1WBDA 1XC3A 4DHYA 4M3TA 1HYVA 2NRRA 4DR4K 1Z05A 3D2FB 3H1QA 3LDLA 4DTUA 2HW3A 1RBVA 3O1BA 3DWLA 3AVHA 3KLHA 4PUOA 3LP0A 4CF1A 1YTUA 4CJ5A 4NCGA 3QMLA 1CXUA 4FJ5A 4FZXC 1S22A 2G8HA 3QEVA 2Q2RA 4CCHA 4DF4A 4E7HA 3MCPA 1R59O 4DV3K 4B8CA 1K8AO 1VK0A 4ID1A 4BRMA 1X1PA 2QKKA 4H5WA 5GIOA 2JWLA 5C10A 4BR5A 4UY8O 3K0SA 3CFRA 1IKWA 4DSKA 1G99A 3QESA 2AP1A 1KFSA 3EZWA 2J4RA 4YFUA 2XY7A 4NCBA 2PYLA 2E2QA 2I5JA 4H03B 1KCFA 4WQ5C 5EU7A 4O5BA 4DFPA 4YOXA 3G10A 2A1RA 3ATVA 4FWKA 1RTHA 3E1YA 4CZLA 3AA4A 3VQEA 3WQTA 3R3LA 5AQWA 2P9UB 4FL9A 2BTFA 2IIRA 2F7TA 3SAGA 4CK1A 1NLVA 3F73A 3CC4N 4H5VA 4M3RA 3T69A 3V9UA 5ADXH 2IDOA 2W42A 2HHTA 3MXMA 3QFPA 4K8ZA 2E2NA 3VQBA 4EHTA 3DLBA 3BGRA 2BANA 1UOCA 1WSJA 4FWLA 3QLHA 2Q0RA 3O1WA 3ZSZA 4X65K 1RFQA 5K14A 4DTNA 1D9FA 4CZEA 2HNDA 3HXMA 1TKTA 3KVGA 3E9LA 1QSSA 2GWKA 4J2DA 3LM9A 3O08A 2UXDK 3OJUA 2KQ2A 4M7YA 5LL6Z 4E1MA 3M8QA 3CCRN 3V1QA 3HP9A 3VF4A 4JKFA 1BQMA 3O4QA 3ZSRA 4FWQA 2ZD1A 4CF0A 5F0XA 4FVUA 1NK0A 1JLEA 3CERA 3ZSXA 2O4IA 1ASUA 2QWLA 5FRMA 3VN5A 4CJVA 4JKHA 4BRLA 1P8ZA 3FZKA 4DTXA 1HNXK 1S9GA 3VGLA 3K59A 4Y1DA 3SBGA 2D0CA 4IJAA 1HKBA 3G4SN 1KAZA 1NK7A 1OKJA 3OYAA 1WN7A 4EP5A 2YKNA 4QS7A 3ENOA 3S3MA 2RKIA 4WFNL 4K41A 3AGRA 3KWGA 3LP1A 3MX2A 3D2EA 3PV8A 1EWRA 4EZ9A 1IKYA 3T1YK 3E66A 2B4JA 3M8SA 3JYTA 1VQ4N 1T7PA 4CJTA 4XEIA 1IH7A 4LF7K 4JS4A 1U2VB 3LPUA 4BG8A 4H5TA 5HP1A 3AAPA 4W5RA 4DSFA 1N36K 3EE8A 1Y64A 3MN7A 5AQQA 1IKXA 2GUIA 4KH4A 3SQ2A 2Z1HA 1LCUA 3CXCM 4LF4K 3A5MC 1XHZA 4Y1CA 4CEFA 4E7IA 1U45A 2Q3SA 1HYZA 1W97L 3VQ6A 2B5JA 3TTFA 3MXJA 4CD3A 3THYB 4B1YB 3V1RA 4DV5K 3LANA 3AVIA 4Z94A 3ISNC 3H1VX 4FK2A 1NJWA 3HP6A 5CY4A 2KFNA 3F9MA 1GOCA 5FLXO 3L0QA 4HUFA 3K5LA 4DU4A 2V52B 1HNIA 3AY9A 4OKEA 3UB5A 3DJCA 3LAKA 4JD2B 1I94K 1IG8A 3A5LC 1IBKK 3LL3A 5H1SQ 3ZSOA 1NOZA 3VERA 1LWCA 1WSFA 4AH9A 3V9SA 2P9KA 4IOAL 3DI6A 3ZT1A 2P9PA 1SL1A 3QO9A 1Q18A 4FJJA 3EEQA 4JHDA 4DR6K 5AZJA 4CHYA 2O8DB 1VQ5N 3CCJN 5BREA 1GLDG 3ENBA 1Z25A 5KRTA 5IWAK 4IOXA 4BGBA 3KIOA 2ITMA 4YOWA 3OYJA 3SUPA 2CGJA 2QTDA 3KKSA 3K9JA 3ULEB 1RT7A 2WOMA 3HTVA 3ID6A 3GBTA 1RCHA 1X9JA 3ZX0A 3CQXA 1T8EA 2V51B 1REVA 5DK5A 3TU5A 1FKPA 3RSEB 3DMJA 4LF8K 3IUCA 2X74A 2E2OA 4MFBA 4WE1A 2HHVA 1ZBLA 1SQKA 2D0AA 5EY4A 4RG8A 1FKOA 3VENA 3BZKA 2HBJA 3VQPA 1X3MA 2WONA 1J6ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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