3L4QA

Structural insights into phosphoinositide 3-kinase activation by the influenza a virus ns1 protein
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
SVPASRYLTDMTLEEMSRDWSMLIPKQKVAGPLCIRMDQAIMDKNIILKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSLPGHTAEDVKNAVGVLIGGLEWNDNTVRVSETLQRFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Non-structural protein 1
publication title Structural insights into phosphoinositide 3-kinase activation by the influenza A virus NS1 protein
pubmed doi rcsb
source organism Influenza a virus
molecule tags Viral protein/protein binding
total genus 31
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l4qA00
2KKZA 3D6RA 4OPHA 3KWIA 2RHKA 3O9SA 4OPAA 3O9UA 3EE8A 3KWGA 3L4QA 2GX9A 3M5RA 3O9RA 3F5TA 3RVCA 3P31A 3O9QA 3OA9A 3EE9A 3O9TA 3P38A 3P39A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K0SA 2Y1IA 4FOEA 3PX0A 3D6RA 4E1NA 3C6AA 4CGJA 4DQQA 4C1NI 3BF1A 4LC9B 4CEDA 1C0MA 4HTUA 5DM6L 3H08A 4FCYA 3MWTA 1VRTA 4BC4A 1KFDA 1HKCA 1NJIO 4B9LA 3C65A 1XC9A 4RW8A 3PX6A 2E1ZA 1GLJO 2E2QA 2RE2A 4NB4A 3V6DA 2QWPA 5FLXO 1HNXK 2OZSA 1C0FA 3F9KA 4IWVA 4BQZA 4CHPA 3P4IA 3C7NA 5FRMA 2O4GA 4ZHRA 3DXKB 3H3OB 3T19A 4E0DA 3HPGA 3E01A 1DKGD 3TU5A 1BO5O 3D2EA 1SUQA 3MEGA 3PIOL 1J5OA 5BPNA 4DUYK 4JYAK 1T7PA 4Y0WA 4CGDA 2O8CA 1B92A 4WYBA 4L3QA 4CD1A 3R8EA 2KW4A 1TK8A 1JL1A 4RW7A 1BA1A 2ZWHA 1N34K 4FJHA 3HJFA 3VN5A 2YJEA 2I5JA 4BGAA 3AO5A 2UXBK 4YOWA 4F4KA 3O9RA 3SPZA 3OVNA 4CGIA 4BR0A 1K8KA 3KZBA 1BCMA 1ZXOA 3P39A 4KHUA 4I2QA 3QBWA 3ENOA 3LAKA 1B9DA 2X74A 3THVA 4DR2K 4H5TA 3VGLA 1TGOA 2IVNA 3CPWM 3H1VX 3MCAB 3RR7A 2OYQA 1WBDA 3L6QA 4JK7A 4JKAA 1ILYA 4BWMA 4A59A 4CGGA 2IS3A 2KZMA 4JEPA 4BDPA 2HBLA 1NBWA 2ZM6K 4DR3K 4AF1A 2HBKA 4JK9A 3OYFA 1YJNN 1GOBA 4CJLA 3LZJA 3VQ7A 3VQBA 3DLBA 2W40A 1YIJN 4X62K 1EETA 4FJNA 3DYAA 2V7ZA 2NZTA 3UKUA 4CEAA 4FK4A 3DXMA 4JK8A 2E2OA 3LP0A 4A5AA 2YHYA 3CFPA 3DOLA 1YTUA 2CH6A 4KKOA 3DRPA 1YVUA 4CJTA 4JI1K 4CIFA 1VSLA 4M7YA 2O8DA 4DSFA 1NKCA 2ZD1A 3KLFA 3U9DA 2D0CA 4M3RA 1IV0A 4FJXA 3O8MA 5BRDA 1VQPN 4BDYA 3DMJA 1XC3A 4CERA 2VYPA 3THYA 3A5OC 5JICA 3FR0A 5C2DA 1IBLK 4LF5K 4AH9A 2WC9A 2KFNA 3J7AP 4FVUA 5LL6Z 2GELA 4TSXA 1UA1A 2NNWA 1GOAA 1HPZA 1HPMA 4CZHA 2ASPA 1VSMA 1EO1A 4CD3A 3EYZA 3Q7BA 3CCUN 3H6EA 1HLUA 2E2PA 3OW2M 4KO0A 1Z05A 3ZEUB 3P31A 3NVMA 4AM6A 4EHUA 2BUPA 3QO9A 3O5BA 2FSJA 4QS7A 1U04A 5AQFA 1RBTA 4DQPA 1FJGK 1X9MA 3CCMN 1HR0K 1MDUB 3O9SA 3CG7A 3ZSQA 5AQQA 4RG8A 3M3ZA 1TUUA 4B9SA 3TTFA 1WSFA 2OCEA 4IFYA 4N47A 1RDUA 4CJKA 1FKOA 2VWBA 4MDAA 3BZKA 4DQ8A 3QERA 3G6EN 1NGDA 4JLHA 1VSIA 2PY5A 3H45C 4CGHA 3J7ZO 3CJCA 3VEWA 1V4TA 4CK2A 2YNIA 3HPOA 2YHWA 3R6MA 2JLEA 4CVNE 4H0OA 1L3SA 5LMUK 2P9SA 4PKHA 5AQIA 4B3MK 4CI6A 1T44A 2WUSA 2F8TA 1RT2A 3ZSXA 2ZGYA 3CHWA 4EZ9A 2FBYA 4B1XB 4FJ9A 4H03B 3PIPL 4N5SA 3NGIA 4DU3A 1VQ4N 3VF6A 2V52B 3I8BA 1WSIA 4DF8A 1WOQA 1ESVA 4O55A 3CCJN 4M3UA 4H0VB 1O1WA 4ZTJA 1BOTO 3VGMA 5HRSA 5MLCQ 4IO8A 1XNRK 2Q36A 3L4QA 3NF6A 3QINA 2QA4N 3E66A 2FC0A 2P9UA 3KHYA 3WQUA 2KFZA 4BRKA 4W5RA 2NRHA 4ISFA 5F0XA 2P9LB 3RMCA 2D4WA 2JWLA 1SV5A 4RCHA 4J8FA 3EL2A 1W7AA 2A6AA 1HYSA 1HMVA 3LANA 2OTJN 1QSYA 3SCXA 1VSDA 3PUFA 4JI2K 3GG4A 5GADP 4CZIA 4FWLA 1YF5L 4B1WB 4CHYA 2P9PA 5EXWA 3WQTA 2W6KA 4IOCL 2HF3A 2DTUA 1JL2A 4OGEA 4PA1A 3DLRA 3OYMA 4JI0K 3FZKA 3HM8A 4FWSA 1QQOA 4DTOA 4WCEL 2HOEA 4KB0A 2WBNA 4MO5A 4PL8A 1J9AA 3BEXA 3HSTB 3ZETB 1YUWA 3AVLA 5SZTA 2Q97A 1K8AO 1QQNA 1G15A 5M1QA 4A62A 5HRPA 3E9OA 4M42A 4FK2A 3KK1A 4K8XA 3D2FA 4DSJA 2O8EB 4CBXA 2OPQA 4FLTA 1DGKN 1QE1A 2BGGA 4CFDA 1X3MA 3AVBA 3VOVA 2F9TA 1EWRA 3DM2A 3G71N 3P83D 4JKGB 1VSKA 1TYQB 3OBWA 5C42A 1YVNA 3HT3A 3BP8A 5E84A 4DSEA 3HTVA 5KGWA 4BY9C 2ZJPL 2ZJRL 3I8DA 3MN5A 3CPEA 5BREA 2D0AA 2W42A 3N4PA 2Q1NA 2WFBA 3K57A 4FLWA 4DU1A 3D0PA 3VQPA 4JN4A 1J54A 3KLIA 2B5JA 2UYTA 1RBRA 2JGUA 4O5BA 4F3TA 3ULEA 4H5RA 4DWIA 5KGXA 4CHQA 3UB5A 3O1WA 3BY5A 3TSUA 4X66K 3QDKA 3ZT2A 3AO2A 1S9GA 2V51B 3ZT0A 1WSJA 1JXBA 4I9QA 3ISNC 3FFKB 2Z1GA 4OX9K 2P51A 3O3GA 4YORA 3SMSA 1HYZA 4CEBA 1OKJA 5KRTA 3P1GA 4DKWA 1Y97A 4M3WA 3N4QA 4CJEA 2P1JA 1N33K 1KAXA 5ADXH 3HZ6A 4BRIA 1Q7YO 5EU7A 4FL9A 3A5MC 3SJHA 1SL2A 1TKXA 3NBPA 3VF4A 5C25A 1QQMA 3L0QA 2QM1A 3NH0A 1HRHA 1SL1A 3S3MA 4PUOA 4DR7K 3A8YA 3BGRA 1SAZA 4FYDA 3KJVA 3LM9A 1Z25A 5AFUA 4FXDA 2NRWA 1E4GT 4DFJA 4BG9A 1BA0A 4DSLA 1HKBA 2P9NB 1SZ2A 4CK1A 3Q7CA 3TAMA 3KK7A 3HVTA 1QQCA 3SV3A 3RR8A 3I0SA 4C8MA 3AVFA 4DTMA 2IC3A 2HW3A 3VENA 2XY7A 3OYBA 4CJUA 1BIZA 3RSEA 2FSKA 4BRDA 4RTFD 1IKYA 4FJ8A 2IIRA 2F8SA 3AO1A 3MECA 4Z94A 2LSNA 2ITMA 3FZLA 4NO7A 1RT6A 2QWQA 1FXXA 3V1OA 2VWJA 4C8LA 1RTIA 2F96A 2QTDA 2B4JA 1LW0A 3VEVA 2HHHK 2E8AA 5I42A 1TK5A 1RBSA 2UUBK 4XH5A 3CC4N 1KSPA 4KAZA 2NRXA 3OTOK 2FBVA 1Q18A 3C7NB 3WXKA 3PO4A 3V4IA 4LF4K 4JI8K 4FLZA 2NUBA 3U3YA 1EKEA 4N76A 4E1JA 2BH1A 1R59O 4Z4EA 4BRQA 4IBNA 1VQKN 2FSNA 4DFKA 1S6QA 3L2WA 1LCUA 5AQHA 1D9DA 2D0PA 4ZTFA 3VQ9A 3OYEA 5HLFA 2HHTA 4O5FA 3H1QA 1RDDA 2UXDK 2NRZA 3J8AA 3TI0A 2XY8A 3TR8A 3UE5A 4CJQA 2G8KA 4UQGA 1JKHA 1BQNA 3T3FA 3ZX0A 3DLEA 4CW7B 3RVCA 1BU6O 4CZMA 4JV5K 3KLEA 4I9LA 4PKIA 3M6GA 4MDBA 4BRGA 4B9TA 3L2RA 2HSTA 4CEEA 1Y64A 4CEZA 3OYGA 1I94K 2DFHA 3UKRB 3H46O 3EN9A 4FW2A 2GV9A 1S1VA 4DTNA 1NKBA 4FLUA 3SMPA 5AQTA 3L2UA 1QZ5A 1RTHA 2A41A 2A40A 3NGZA 1TK0A 3I0RA 5H1SQ 3LPTA 2UU9K 4OKJA 4CBWA 1NGJA 1LV5A 5M1NA 4QS9A 5AQRA 3HO1A 4J2EA 3O3FA 4B3OA 4C8NA 1ZYQA 1N8RO 4JKBA 3FZHA 5J2MA 3LDPA 1XQSC 1HNWK 1D5AA 5E26A 3DXMB 1YJ9N 1QSLA 4JHDB 2DFFA 3LDSA 4PQUA 3V1RA 1JCEA 4FW1A 4HHTA 1E3MA 3M8SA 1S72N 4DR6K 3KTQA 2HHUA 4QAGA 1NJWA 1J6ZA 1C0GA 4E7LA 3U4LA 3ZSRA 1YTAA 1IBKK 1KLMA 4CBUA 1GLAG 4M3YA 4FPBA 4H0PA 3ZYYX 4CEFA 3T69A 5FPMA 5C10A 4WFNL 3EY1A 2I7PA 4AHRA 3OYIA 3HP9A 5C15A 2OZMA 3TAPA 4BACA 3VTHA 3OA9A 3K5OA 1WB9A 1NGIA 3OYJA 2GUPA 4MFBA 4GKJK 3ATVA 4WF9L 1T05A 3HSCA 3RMDA 3O3HA 2VG6A 3PSFA 1NK8A 1NK0A 4IEIA 2DFEA 4N41A 2HNZA 4LF7K 2DY4A 2IVOA 1C1AA 1RILA 4H4MA 3LPUA 3M8QA 3NCIA 4DQIA 3CETA 2QWOA 1U47A 1HKGA 2GWKA 5GIPA 1RT7A 5BRFA 4FWNA 4YY3K 1ASUA 3CCEN 1A5WA 5BN8A 1VHXA 2A1SA 2YKNA 2P9IB 4FOIA 1Q81O 4B08A 4DR1K 1Z6RA 3U9ZA 2ZGZA 3VQ6A 3VQQA 2D5RA 4DV3K 1IKXA 3U3GA 4WQ4C 3CQ8A 1RTDA 4YOYA 1HUXA 1U45A 4E1MA 4WQ5C 2G8UA 4JI3K 1KVCA 3AO3A 1KCFA 4OGCA 4NCGA 1DEJA 3OBYA 3THXA 3IRXA 4DS4A 4BVPA 4CECA 2E1YA 3J80O 3CCQN 1TUYA 3DLLL 3QBXA 3QNNA 2G8HA 1XMOK 1WNSA 5AQYA 2P9SB 3AAQA 3KKSA 3DRSA 3V9SA 5GAEP 1QSSA 2OANA 3MEEA 1REVA 3NAEA 2O8BA 3VQCA 2YHBA 4BVOA 1M1KO 1QVGM 1NK7A 1RTJA 3QEIA 4LFCK 4FWQA 4JI6K 5I3UA 1IBMK 3ZLJA 2A3ZA 4LH5A 4OPHA 5CY4A 4DTUA 4PY5A 4FM2A 4LF9K 1RBUA 4E7HA 3OYNA 4DR4K 5AQJA 5KRSA 3MMVA 3L8BA 4E89A 3AA4A 3WEEB 3ZSYA 3WUHA 1BGXT 3QNOA 3TSPA 3JSMA 4DB3A 2IAJA 4HUFA 3MXIA 1VQ9N 1NJZA 4JRPA 4DF4A 2Q0RA 5CR4A 3AVMA 3OS0A 1GLFO 3JAMO 3CI5A 3L3UA 3A0IX 4OJRA 1KLNA 2O8FB 3ID6A 1W2BM 4C23A 1NGAA 1LWCA 1X9SA 4DS5A 1KVAA 4Z4HA 1S1TA 4HWIA 4KH6A 3G25A 4CF0A 2QKBA 1TKTA 3NVKA 3VETA 3NF8A 3T1AA 3MN9A 3AVNA 1HQEA 4IJAA 4ID5A 2E2NA 5AR0A 5BR9A 1JLAA 2PYLA 2RPIA 4I6MB 5AZIA 3VMFB 1C0UA 3ASMA 2ASOA 4EIAA 3W0LA 3HI0A 3NH1A 3OYLA 2E4LA 4V19S 2HF4A 2J4RA 4B1VA 4FWOA 3O9TA 4DV7K 1C6VA 1L3TA 4KI6A 1BQMA 1T03A 4HVJA 4ID1A 1K73O 3ITHA 2Q31A 4BR9A 4K0KK 2EX3A 2YNHA 5M1OA 3E1YA 1S6PA 5GAHP 4KHPK 3KWGA 2G8FA 2KZZA 4CESA 1JLEA 1D8YA 4DTPA 2X6NA 3KKRA 4JD2A 5BN9A 1RDCA 5FDLA 4JKDA 2Q3SA 4O4GA 1TAQA 3SBGA 3ZX2A 3IDHA 1LWFA 2HVIA 1NGEA 1S5JA 3KD1E 4BRLA 3K9JA 3SQ4A 1ZBUA 3TAQA 5F1XA 4MQ3A 1NU0A 3VEYA 4YHHK 1XWLA 4ILHA 3QEWA 4FPAA 4DG1A 3CCRN 1S3XA 4O8UA 2HNYA 5JLFA 5FPDA 1KFSA 3LDQA 3ULEB 4CJWA 1C1CA 3ENHA 4CIGA 4JI7K 5JS1A 4FM0A 4JKCA 3MXJA 4ILGB 3AA3A 3CM6A 1BI4B 1Q86O 1ASVA 4R5PA 5M1KA 4X64K 1IG9A 3C6TA 3MEDA 3MAQA 3SUOA 2QKKA 1DTTA 1UOCA 4B1ZA 4X65K 3L3VA 3HBTA 4BRNA 3SI6A 4CZKA 3QB0A 4BR2A 3RTVA 3O9QA 4KHYA 2WTUA 2ATQA 4LFBK 3THWB 4FJ5A 5EY4A 4CJ7A 4BQLA 1NNEA 4CJPA 5HROA 2HNDA 3RWUA 2WOMA 3ZSZA 4CFAA 1GLEG 4B1UB 2AJQA 1E4FT 1ITGA 3AVCA 3QIPA 4YDUA 5CYQA 2FXUA 3C95A 3T7ZA 3MXMA 4EP5A 4KH4A 4DHYA 3DWLA 1S22A 5DM7L 2P5OA 5HL7L 5AQOA 3QFUA 2XY5A 2BANA 1I3AA 3F5TA 2YHXA 4WFAL 3VQDA 2ZJQL 2RHKA 4AHCA 3FFIA 2QW9A 2E6LA 3SUNA 4BDZA 4M7XA 3CMAN 4ILJA 4OLBA 4CF9A 4KTQA 5AZJB 5AQMA 1NWKA 4LSLA 4LH4A 4BC5A 3LP1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2KKZ A;  3D6R A;  4OPH A;  3KWI A;  2RHK A;  3O9S A;  4OPA A;  3O9U A;  3EE8 A;  3KWG A;  3L4Q A;  2GX9 A;  3M5R A;  3O9R A;  3F5T A;  3RVC A;  3P31 A;  3O9Q A;  3OA9 A;  3EE9 A;  3O9T A;  3P38 A;  3P39 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K0S A;  2Y1I A;  4FOE A;  3PX0 A;  3D6R A;  4E1N A;  3C6A A;  4CGJ A;  4DQQ A;  4C1N I;  3BF1 A;  4LC9 B;  4CED A;  1C0M A;  4HTU A;  5DM6 L;  3H08 A;  4FCY A;  3MWT A;  1VRT A;  4BC4 A;  1KFD A;  1HKC A;  1NJI O;  4B9L A;  3C65 A;  1XC9 A;  4RW8 A;  3PX6 A;  2E1Z A;  1GLJ O;  2E2Q A;  2RE2 A;  4NB4 A;  3V6D A;  2QWP A;  5FLX O;  1HNX K;  2OZS A;  1C0F A;  3F9K A;  4IWV A;  4BQZ A;  4CHP A;  3P4I A;  3C7N A;  5FRM A;  2O4G A;  4ZHR A;  3DXK B;  3H3O B;  3T19 A;  4E0D A;  3HPG A;  3E01 A;  1DKG D;  3TU5 A;  1BO5 O;  3D2E A;  1SUQ A;  3MEG A;  3PIO L;  1J5O A;  5BPN A;  4DUY K;  4JYA K;  1T7P A;  4Y0W A;  4CGD A;  2O8C A;  1B92 A;  4WYB A;  4L3Q A;  4CD1 A;  3R8E A;  2KW4 A;  1TK8 A;  1JL1 A;  4RW7 A;  1BA1 A;  2ZWH A;  1N34 K;  4FJH A;  3HJF A;  3VN5 A;  2YJE A;  2I5J A;  4BGA A;  3AO5 A;  2UXB K;  4YOW A;  4F4K A;  3O9R A;  3SPZ A;  3OVN A;  4CGI A;  4BR0 A;  1K8K A;  3KZB A;  1BCM A;  1ZXO A;  3P39 A;  4KHU A;  4I2Q A;  3QBW A;  3ENO A;  3LAK A;  1B9D A;  2X74 A;  3THV A;  4DR2 K;  4H5T A; 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 3THX B;  4B3S K;  1T8E A;  4ISE A;  2G8V A;  5AQL A;  3MWP A;  2UUA K;  3VA3 A;  3H3N O;  4NYN A;  1VSJ A;  3M8P A;  1U2V B;  2P9K B;  2YCH A;  3AGR A;  2O8B B;  5KQD A;  3OYD A;  5EOY A;  4MO4 A;  1N6Q A;  2HHW A;  1OH7 A;  4CJ4 A;  4FZZ A;  2I7N A;  1Q9X A;  4DMN A;  1W0H A;  3EEQ A;  3OJU A;  3AA5 X;  2NLX A;  4IEE A;  1FK9 A;  4PL7 A;  1YHQ N;  3JXU A;  3NF9 A;  5KTQ A;  3F73 A;  3QFP A;  4RW4 A;  2KHO A;  3ZT3 A;  1NG9 A;  4W5T A;  1NGB A;  3TAE A;  4NLC A;  4JKF A;  5A2Q O;  2O4I A;  4CJS A;  4DV4 K;  4DFP A;  4CZL A;  3NFA A;  3QML A;  4W5Q A;  4H5W A;  5FPN A;  3SAG A;  3NH2 A;  1U6Z A;  1WAF A;  1OH6 A;  1L3V A;  3D45 A;  1Q9Y A;  3AVG A;  4IOA L;  4FWP A;  2VGN A;  4ISG A;  1YAG A;  5J1E A;  1KRP A;  4K8Z A;  3G0Z A;  1RFQ A;  3O4Q A;  4RWT A;  4O0I A;  1OH8 A;  1XNQ K;  3R9P A;  2QEX N;  1ZBF A;  4H0X B;  1EWQ A;  4KHQ A;  1WBB A;  1SQK A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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