1ZC6A

Crystal structure of putative n-acetylglucosamine kinase from chromobacterium violaceum. northeast structural genomics target cvr23.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
PSIRYLIGVDGGGTGTRIRLHASDGTPLAMAEGGASALSQGIAKSWQAVLSTLEAAFQQAGLPAAPASACAIGLGLSGVHNRQWAGEFESQAPGFARLSLATDGYTTLLGAHGGQPGIIVALGTGSIGEALYPDGSHREAGGWGYPSGDEASGAWLGQRAAQLTQMALDGRHSHSPLTRAVLDFVGGDWQAMMAWNGRATPAQFARLAPLVLSAARVDPEADALLRQAGEDAWAIARALDPQDELPVALCGGLGQALRDWLPPGFRQRLVAPQGDSAQGALLLLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords probable N-acetylglucosamine kinase
publication title Crystal Structure of Putative N-acetylglucosamine Kinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
source organism Chromobacterium violaceum
total genus 86
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A01
4IJNA 1KXPA 3UKRA 3O6WA 3ID8A 5AZJB 2QWMA 4EFHA 4K43A 1E4FT 3WXLA 5AR0A 5AQJA 4CBWA 4H03B 1BUPA 3CJAA 3FZKA 3EO3A 1KAXA 2I7PA 3AAQA 2NZTA 4BRIA 5ADXH 4BRKA 4WQ5C 4BR4A 4LC9B 2GUPA 2P9PB 3BF3A 5BREA 4EIAA 5AQZA 1SAZA 4CZLA 2E2OA 5BPLA 1NGBA 2FSNA 1S22A 2E2PA 2AP1A 5AZJA 5B8HA 3C7NB 3UB5A 2D0OA 4BRPA 3LDQA 2F9TA 4H5RA 3VEOA 4H0TB 2P9LB 4BQZA 4EHTA 3KZBA 1YUWA 2E8AA 3H46O 5F0XA 1X3MA 2QM1A 2HMPA 1J6ZA 5EXWA 5BPMA 2VWBA 3U4LA 2E1YA 2P9PA 2Q36A 3IMXA 4BREA 4FPAA 4B9QA 5BRDA 3VGKA 4BR5A 1BDGA 5AQSA 1NWKA 2QW9A 4M63C 4BG9A 3WQUA 4MLEA 4BRHA 4H0PA 4MLHA 2BTFA 1HJOA 3C7NA 3IUCA 4B1YB 1BA0A 4BC3A 5BRFA 3DXMB 3MN6A 4GNIA 3RSEB 3CERA 3UKUA 3FZFA 4CD1A 4PL8A 1NBWA 3R6MA 1BU6O 2YHYA 5FPNA 2NRHA 1NGIA 4PKIA 3SMPA 4QS9A 3GBTA 3MN7A 5AZIB 2A3ZA 5F1XA 3ATVA 2QWRA 4K25A 2YHWA 3ZX2A 3VEXA 1LOTB 4BC4A 3WXIA 1K8KB 2F9WA 3EKUA 3B8AX 3H3OB 3ENOA 3SK3A 3EKSA 1YAGA 4K41A 3BF1A 1X3NA 1E4GT 3DXMA 4BR0A 2Q0UA 2Q0RA 3RSEA 2YJFA 5AQGA 5AQQA 3CJBA 3VERA 4A61A 3WUHA 5JMVA 1NGDA 5AZIA 3M1FA 3HTVA 1S3XA 4XH4A 2GTDA 3H1QA 3FE1A 2E1ZA 5AQRA 1MA9B 2FSJA 1BOTO 4MO5A 5KPRA 1K8KA 1YVNA 3CI5A 2HF3A 1XQSC 2DPNA 1EQYA 5FPEA 1ZBSA 2CGLA 2CH5A 2ASMA 1QQMA 2IVOA 1WOQA 4FO0A 1TUUA 2YJEA 5EVZA 2W40A 1C0GA 3A5NC 3WQTA 4NO7A 2HF4A 1GLLO 3EL2A 2P9IB 4FWLA 1GLAG 4K42A 1DGKN 1D4XA 1GLBG 4CZKA 1HKGA 2D1KA 4A2AA 3QDKA 4FL9A 3GOIA 3VF6A 3M3ZA 5KQ8A 1V4SA 3L4IA 5BN9A 4PL7A 3CJ7A 1IJJA 4WQ4C 3L0QA 3MN9A 4BC5A 3A8YA 4JN4A 2P9IA 5I9EB 5LJWA 3QICA 3U9DA 1QQNA 3GG4A 4CI6A 4FPBA 3H1VX 4FOIA 3HBTA 2GELA 1HX1A 4L3QA 1QQOA 2P9SB 2E2QA 2GEMA 3U9ZA 2GWKA 4ISGA 5AFUA 3U8XA 2W41A 3H45C 3CJ1A 3FLCO 2P9NB 1NGGA 2V7YA 3VOVA 3C0BA 3FZLA 1CZAN 2QWOA 3I8BA 1R59O 3UKUB 4CZEA 4XEIA 3LM9A 5AQUA 1Q18A 3D2FB 3ENHA 3VGLA 3O4WA 1G99A 2V52B 4BRGA 4B1VA 2FLOA 4YDUA 3M6GA 3I33A 5AQHA 4H0XB 4M7XA 1T44A 4CZJA 4FWSA 4BRQA 4JNEA 5AQLA 1XC3A 3SLCA 3QBWA 2P9SA 3KHYA 3VEZA 3HZ6A 5ELZA 3VENA 2A42A 3L6QA 5JLFA 5EY4A 2P9NA 1HKCA 1NGCA 3EN9A 4B1ZA 5BR9A 1Z05A 3F9MA 3VEYA 3J8AA 2BUPA 3HI0A 2Q2RA 1T6CA 4FSVA 3D2FA 5F2RA 4BRMA 4B1UB 3O08A 1NGEA 2IIRA 5AFUH 5BPNA 1NGAA 3DXKB 2HOEA 2Q1NA 3P4IA 1BO5O 1QHAA 2V51B 5AQPA 3WEEB 4WQ5A 1T6DA 3ZETB 3JS6A 3LL3A 1RDWX 5AQKA 1MDUB 4H0YB 4RCHA 3LDPA 2VCPA 3O1WA 3BUZB 3DAWA 3FFKB 2Q97A 4FWQA 1GLDG 2YHXA 3CJ9A 5AQYA 2P9KB 1HKBA 3HSCA 3VEWA 3DXKA 4O5FA 3VGMA 1GLEG 2ASOA 3GL1A 4NB4A 3FZMA 4A62A 4MO4A 3WEEA 5KPZA 3LDOA 3ZETA 2A5XA 1GLCG 4FWMA 1GLJO 2YI1A 3AY9A 1TYQB 4RTFD 5EX5A 5AQNA 5FPDA 3ULEB 5LJVA 4PKGA 1KAZA 5ADXA 1NLVA 5BRHA 1H1VA 3FR0A 3O80A 3H3NO 4CZHA 4ISEA 5KQDA 3ZX0A 3O1BA 1NGFA 4GY2B 3WXKA 2P9KA 4B1WB 3R8EA 4BROA 4BVOA 2V7ZA 2P9UA 4YDUC 4BRDA 3CQYA 3OHRA 4HWIA 4CBXA 3QFPA 3UE5A 3LDLA 4BC2A 3IFRA 5E84A 4CZGA 3A0IX 4H5WA 4CJ7A 5EOYA 3O5BA 2A41A 4BG8A 4M7YA 4B1XB 4WYBA 4IJAA 2E20A 4BGAA 4DQ8A 1TYQA 4RWTA 3A5LC 4BR7A 3ULEA 1HPMA 4JHDA 4QS7A 1C0FA 1BA1A 2CGKA 1U2VA 2A6AA 2ZWHA 1KAYA 1YXQA 2QWQA 3GE1A 3MK6A 4BGBA 4DB3A 1JCGA 1RFQA 3QMLA 2KHOA 4DCHA 1HUXA 1SQKA 1NGHA 2I7NA 2ZGYA 4KBOA 3MMVA 3IDHA 1LCUA 1XUPO 2PBDA 2QWPA 3TPQA 4BR9A 4CZFA 2VYPA 4J8FA 4H5NA 3QBXA 4EAHD 4BRFA 4QS8A 4FWKA 3CQXA 2D4WA 1ATRA 5AQVA 4CZMA 1V4TA 2D0PA 2E88A 3FGUA 3JXUA 3SMSA 5AQIA 2IVPA 3MCPA 5FPMA 3ZEUB 1X9JA 3O8MA 3QB0A 2IVNA 3TU5A 3W3DA 2ASPA 4BQLA 1U6ZA 2PAVA 2OANA 1MWMA 4IZ9A 5LY3A 5AQXA 2FF3B 2CGJA 4IO8A 3H6EA 3D2EB 2E2NA 1BWFO 3G25A 1TUYA 4FWPA 4WQ4A 4H0OA 4HTLA 3QFUA 4CZIA 3CJCA 4PKHA 5E26A 4JAXA 4BR2A 1SZ2A 4FWRA 5JICA 2J4RA 2P9LA 4AM6A 3ZEUA 4BVPA 2YCHA 2GWJA 1P8ZA 3FZHA 2H3GX 2WUSA 3VF2A 3WXJA 2NLXA 3MDQA 3A5MC 4H0VB 4JD2B 1JCFA 2UYTA 5TKYA 1QZ5A 4I6MB 3A5OC 3ATUA 3KVGA 5AQFA 4C23A 2CH6A 4O8KA 2QWNA 2AA4A 3BP8A 3CHWA 2P9UB 3D2EA 4EHUA 4FWOA 1MWKA 3CETA 1ESVA 3VPZA 3WT0A 2FSKA 4FWNA 1NGJA 3VEVA 3AAPA 1GLFO 1QZ6A 2FXUA 1ATSA 3MN5A 3D7EO 4E1JA 4BRCA 5AQTA 3EZWA 2ZGZA 1HLUA 1ZXOA 3DJCA 2Q31A 3W0LA 5BN8A 1IG8A 5AQMA 5KPTA 1DEJA 2FF6A 3CIPA 1NMDA 5AQWA 3VESA 4XH5A 4JHDB 1ATNA 4IXCA 4JD2A 2QXLA 1NM1A 4F9OA 5CE3A 1U2VB 4I6MA 3UKRB 1ZC6A 4A2BA 4AM7A 4BRAA 3AARA 3VETA 1RGIA 3HM8A 4H5TA 1JCEA 2ZF5O 3S41A 3R9PA 4Y0WA 1DKGD 2A40A 3DWLA 2ITMA 1OKJA 5JLHA 3VF4A 1BG3A 4IWVA 3LDNA 2EWSA 3SJHA 5AQOA 3ZX3A 3GDQA 3BEXA 4Z94A 4XH1A 4FOEA 4DHYA 1Z6RA 3LM2A 1Y64A 4BRNA 4H5VA 4CD3A 1WUAA 4BRLA 2QWLA 4ISFA 4CBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CYMA 4JKCA 4DSEA 3E01A 2G8HA 4M45A 3OS2A 1WAFA 3MEEA 1CZ9A 4EFHA 1NJXA 5AR0A 4KV8A 2I5JA 2OPSA 4H03B 3FZKA 2KKZA 2HVIA 1A5WA 4O0JA 2F8TA 5ADXH 1QHTA 2FBXA 3LPUA 1TK0A 3KTQA 2YHBA 3L2QA 5AQZA 2W6LA 3HK2A 2BE2A 4RG8A 4NLCA 4KH5A 4FLXA 4DQRA 4CIFA 5JS1A 3UB5A 2D0OA 4BRPA 3LDQA 4H5RA 3KLGA 1SL1A 1TKTA 3D45A 1U47A 4FM1A 1N5YA 3KZBA 1Q9YA 3JYTA 3ZSWA 1A5VA 4I9LA 3E1YA 5F0XA 3OYHA 4KHQA 2Q36A 4BREA 5HOOA 3THWB 4B9QA 5BRDA 3VGKA 1BDGA 4JRQA 1RT6A 3WQUA 5T7BA 3H08A 1OVYA 2P1JA 3IUCA 4DFPA 4B1YB 3AA3A 4WCEL 2VGNA 3DXMB 1WSJA 3CERA 1SKWA 1C0TA 1A5XA 1YTAA 4B9SA 4PKIA 1XI1A 3TABA 5AZIB 3VQAA 4CEAA 3THVA 4KHYA 3V9SA 3BZCA 4R5PA 4K25A 3OYMA 1TKDA 3THWA 3ZX2A 2Z1JA 1RDUA 3EKUA 2WBNA 1OH5A 4NYFA 2E4LA 3B8AX 3AVCA 3ENOA 2R7YA 1YAGA 1Q7YO 4LD0A 1YF5L 5FLXO 1E4GT 2KW4A 4DUYK 3DXMA 4FLZA 2Q0UA 2G8FA 2FC0A 2X78A 3NH1A 5AQGA 5AQQA 3CJBA 2XY7A 1VQNN 4LSNA 2OA8A 4GKKK 4JS4A 1NGDA 5AZIA 3HTVA 2GTDA 5AQRA 3HXMA 1TAQA 1TKXA 2NRRA 2FSJA 4Z4GA 2EX3A 3ZT4A 4CK3A 1NJIO 5MLCQ 2YX6A 1DTQA 2ASMA 1VSFA 1QQMA 1HYVA 3AVBA 1X9MA 3NH0A 3SUPA 4FO0A 4RW6A 2YJEA 3A5NC 4NO7A 4WF9L 3ZSZA 5M1FA 3J7AP 4W5OA 3A2FA 3MEGA 1S1WA 4RW9A 2FBVA 4C1NI 1D4XA 3G10A 1GLBG 4CZKA 3HJFA 5CYQA 1B92A 3CCQN 3O9UA 1I39A 1C0MA 3AVFA 3VF6A 4UQGA 3RR8A 4GV9A 5HRSA 4FK0A 3SJJA 1IJJA 4WQ4C 3L0QA 3T7ZA 4JN4A 4QAGA 5LJWA 1TGOA 3QICA 3U9DA 3KLHA 4EZ6A 2Z1GA 1W2BM 1QQNA 4FPBA 2O4GA 4LFAK 3VA3A 4FOIA 3TAEA 2GELA 1CZBA 1QQOA 2GEMA 4ISGA 1C6VA 3TWHA 1Q81O 1NOZA 3C0BA 4JKDA 2RE2A 3B6OA 3I8BA 3M8PA 4AHUA 1ASUA 1VSMA 3O4WA 3SV3A 5GIPA 4DLGA 4NXNK 4J2AA 4FJNA 3I33A 2RN2A 4FWSA 1QS4A 1VQ4N 4LF9K 3QO9A 3QBWA 3VEZA 3O3FA 3L6QA 1NU0A 2XO7A 3HI0A 2G8VA 4FJHA 5F2RA 5E41A 4BRMA 5CZ2A 3O08A 4DTJA 3O4NA 4OJRA 1K9MO 4OPJA 1RT5A 4OPAA 2NRVA 2NRZA 1QHAA 1HQUA 3DLGA 5LMNK 4JI0K 2YV0X 3LL3A 2G8KA 2YNGA 1RDWX 3P1GA 4H0YB 4RCHA 2VCPA 1IG9A 3O9SA 1XNRK 4CEBA 3CJ9A 1M1KO 5AQYA 4Q5VA 3BY5A 5KTQA 1OH6A 1IBMK 1GLEG 3GL1A 2BH1A 2WOMA 3TR8A 1LAVA 3ASMA 3OJSA 3QEVA 1G15A 3AY9A 1VRTA 4RTFD 4Z4EA 4YFUA 1DT9A 3QEWA 3SI6A 3O80A 4CZHA 2G8IA 4JYAK 1U48A 1BIUA 4GY2B 3WXKA 4CF1A 1HNXK 4CFAA 5K14A 3I8DA 4HWIA 4DR3K 2BGGA 3VQ8A 3OYIA 4I2PA 3AA4A 3L2UA 3SYZA 1ITGA 4B1XB 2E20A 4BGAA 1IBLK 2HHVA 4BR7A 1QSYA 4MDBA 4YOWA 4QS7A 1C0FA 4PA1A 1U2VA 4KHNA 4CJ5A 3WXMB 4KREA 4CHZA 1EWRA 4IKFA 1YXQA 4CESA 4BGBA 4E7JA 4DCHA 4ZTFA 1M90O 2ZGYA 1JLCA 3K9JA 3MMVA 3EE9A 1S9GA 5J2MA 3G6EN 4BDZA 3QLHA 3OS0A 2VYPA 4J8FA 3QBXA 2DFHA 3DYAA 3Q7BA 2VG7A 2PZSA 2D0CA 4CJ3A 1WBDA 3MX2A 4Y1CA 1RTIA 5EU7A 1EWQA 5AQIA 2KQ2A 2IVPA 5FPMA 1X9JA 1SL0A 3QB0A 2KZMA 2IVNA 3TU5A 4A59A 4B08A 2ASPA 5J1EA 2QKKA 2PAVA 2PYJA 4IZ9A 4PQUA 4KTZA 4CHQA 4X66K 4X62K 2CGJA 1O13A 2E2NA 4O44A 4CJEA 1IKVA 2ZJRL 1EKEA 2A1SA 4PKHA 4IOCL 1NJZA 4JAXA 3OTOK 4FWRA 2P9LA 4BE0A 4E89A 4DR1K 4FJLA 4FJ7A 4GW6A 4CCHA 4JKBA 4B8AB 3WXJA 3NBPA 2UUCK 1JCFA 5TKYA 3PSIA 1QZ5A 4I6MB 3A5OC 3VQQA 1T03A 5AQFA 4DV4K 4C23A 2CH6A 4O8KA 4R79A 4AILC 4FWOA 3KIOA 3P5JA 3OA9A 1S5JA 3O3HA 1KRPA 2O8DB 1QZ6A 1T3VA 3HOSA 3MN5A 3D7EO 4E1JA 1REVA 5AQTA 5C2FA 3W0LA 3SNNA 3VQDA 4WFAL 1KCFA 1I94K 1ZBIA 1TK8A 1ATNA 5CE3A 2VWKA 4I6MA 1ZC6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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