1ZC6A

Crystal structure of putative n-acetylglucosamine kinase from chromobacterium violaceum. northeast structural genomics target cvr23.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
PSIRYLIGVDGGGTGTRIRLHASDGTPLAMAEGGASALSQGIAKSWQAVLSTLEAAFQQAGLPAAPASACAIGLGLSGVHNRQWAGEFESQAPGFARLSLATDGYTTLLGAHGGQPGIIVALGTGSIGEALYPDGSHREAGGWGYPSGDEASGAWLGQRAAQLTQMALDGRHSHSPLTRAVLDFVGGDWQAMMAWNGRATPAQFARLAPLVLSAARVDPEADALLRQAGEDAWAIARALDPQDELPVALCGGLGQALRDWLPPGFRQRLVAPQGDSAQGALLLLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Putative N-acetylglucosamine Kinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Chromobacterium violaceum
molecule keywords probable N-acetylglucosamine kinase
total genus 86
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A01
4DCHA 3LM9A 4K41A 5AQWA 2YCHA 4H0OA 3FZHA 3MK6A 1Q18A 1TUYA 1TYQA 4H0XB 2QM1A 4A61A 3ENHA 4PKHA 3ZEUB 4CBUA 1NGAA 2YHXA 2FF6A 3U8XA 4BR5A 1R59O 1LOTB 1NGFA 5FPMA 3ZETA 2V51B 3WXLA 2P9PA 3A8YA 3SMSA 3A5MC 2AP1A 5FPDA 4BRMA 5F0XA 1XUPO 4C23A 4CZFA 1RFQA 2FSKA 3VEXA 3H3NO 4PL7A 3VF2A 1K8KA 3A5NC 4I6MA 4WQ4C 3FZMA 3ULEA 3MN5A 4CZLA 2ZGYA 5KPRA 4PKGA 1S3XA 1NMDA 3KVGA 5AQRA 1QQOA 1GLEG 2NZTA 4IWVA 5CE3A 3RSEA 2FSJA 4ISEA 3VEZA 5AQQA 4B1UB 3VF6A 4F9OA 3QICA 1MWKA 4FWSA 4JD2B 2YHWA 3VEYA 1EQYA 4GNIA 3OHRA 3R8EA 3VGKA 1YUWA 3BF1A 1ATRA 4BROA 2Q1NA 4HTLA 3LDPA 3D7EO 2CH6A 3WXKA 3H1QA 1GLJO 3MN6A 4IZ9A 5AQOA 4A2BA 5BREA 1NGEA 1Z6RA 2OANA 2PAVA 2Q31A 4MLEA 4B1YB 4BG9A 5KPTA 3VEWA 2E1YA 2IVNA 3FZFA 5FPEA 4FOEA 2E2PA 2WUSA 1TYQB 4CD1A 3JXUA 4K25A 3ZEUA 3O1BA 2V52B 4CZGA 3FLCO 2DPNA 3L4IA 4FWKA 4HWIA 4WQ5A 1YVNA 4FWOA 1WUAA 3MDQA 1IJJA 4BRGA 4BC2A 3KZBA 2Q0UA 4FPBA 3ZETB 2P9PB 1ESVA 3VENA 2P9SA 1QZ5A 2GWKA 3G25A 3DXMA 3FFKB 2P9KB 2GELA 5LJVA 4H5TA 3VPZA 3GOIA 1SZ2A 2ASPA 1BU6O 5BPNA 1YXQA 3GDQA 3VEOA 1BA1A 1XQSC 3VGMA 1K8KB 1OKJA 1T6DA 1X9JA 4I6MB 2FF3B 4JHDA 4H0TB 4O5FA 4BQLA 2CH5A 5KQDA 3MN9A 4BRDA 2VYPA 3LM2A 4EAHD 5E26A 3CQXA 3RSEB 4BQZA 3KHYA 3H3OB 4DHYA 3CHWA 3H45C 3CETA 4H0PA 4JD2A 3CIPA 1NGBA 2CGLA 4J8FA 3DXKA 1JCGA 5JMVA 5AQTA 3R9PA 4PL8A 2D1KA 1QZ6A 2QWLA 4FO0A 4H0YB 2E1ZA 4DB3A 2QWOA 3LL3A 1NLVA 4XH5A 4FWLA 3QBWA 4XEIA 3ID8A 4FWNA 3CJAA 2P9IB 1MDUB 3FZKA 1ZC6A 1XC3A 5BRFA 4BR2A 2H3GX 5JLHA 4B1ZA 3FE1A 1NGHA 5BPLA 2ZGZA 2A41A 3FGUA 2D4WA 2P9SB 2P9KA 2Q0RA 3DXMB 2YJFA 4RTFD 2NLXA 1BG3A 5AQYA 4M7YA 4BRCA 2GTDA 4FSVA 5EX5A 5F2RA 3TPQA 3TU5A 4BGAA 4MO5A 3MN7A 3HI0A 1NGCA 2BUPA 1P8ZA 4JHDB 5I9EB 4EHTA 4RCHA 2F9WA 1JCEA 2I7NA 1D4XA 3GE1A 4CZHA 1T6CA 2P9NB 3CJ7A 3HTVA 2CGJA 2QWMA 4H5VA 1HKBA 4B1VA 3EKUA 3ZX2A 2A40A 4BRPA 2NRHA 3WQUA 1ZBSA 5AQIA 1GLCG 2W41A 3W3DA 3O1WA 4B1XB 5AR0A 1U6ZA 4EFHA 5EVZA 1SAZA 4CZIA 1MA9B 1Z05A 3DXKB 3BEXA 1ATSA 4K43A 3ZX3A 4RWTA 2D0OA 1E4FT 1X3MA 4CD3A 3HBTA 1BDGA 1GLFO 1HPMA 5AFUH 1LCUA 1NBWA 2P9IA 4FWRA 4YDUA 1BUPA 5KQ8A 1T44A 5AFUA 3A0IX 2BTFA 1GLDG 5BR9A 2HF3A 5AZIB 2I7PA 4NO7A 4WQ4A 2QW9A 4BRQA 2QWQA 2HOEA 1WOQA 4CZMA 3B8AX 1KAZA 1S22A 2HF4A 3L0QA 2QWPA 1HLUA 4K42A 2ITMA 4JNEA 3VETA 2A6AA 3D2EA 4BGBA 5ELZA 5BPMA 4H03B 5FPNA 3WXIA 3QFUA 4L3QA 4CBXA 1QQNA 3M6GA 3AAQA 2A3ZA 3JS6A 4FWPA 2P9NA 1DGKN 1QHAA 3CQYA 1MWMA 3CI5A 2FLOA 1HJOA 4BR4A 4B1WB 4Z94A 4NB4A 1NGGA 5F1XA 5JICA 5AZJA 4B9QA 3VERA 1HKGA 2AA4A 4BRHA 1GLBG 3EO3A 4H5RA 4BC3A 2YI1A 5ADXH 2V7YA 5AQPA 5ADXA 3UKUA 2E2OA 3DJCA 3SLCA 2ZF5O 5AQZA 2GEMA 4XH4A 5LY3A 4AM7A 5AQHA 3ATVA 1G99A 4Y0WA 1ATNA 2IVOA 4BVPA 3ATUA 5AZIA 2GWJA 3GBTA 3DWLA 5BRHA 4XH1A 3H46O 1BA0A 4BVOA 2UYTA 1NWKA 4JN4A 3O08A 3BF3A 3VF4A 2QWRA 4MLHA 5AQFA 1NGDA 3WEEA 3R6MA 2E8AA 2FXUA 3A5OC 3D2FA 3O5BA 4BR9A 3VEVA 4CI6A 3O4WA 5AQGA 3MCPA 3AAPA 4O8KA 3QBXA 4IO8A 3D2EB 2FSNA 3QDKA 2YJEA 1ZXOA 3QB0A 3IUCA 3O80A 1BO5O 4FOIA 3UKRB 2ZWHA 1H1VA 1Y64A 1U2VB 3BP8A 4CZJA 5KPZA 3FR0A 2GUPA 5AQMA 2E2NA 2W40A 4IJNA 1BOTO 4YDUC 4CZEA 4DQ8A 4CBWA 3IFRA 2VCPA 4FWQA 2E2QA 4FL9A 2E20A 5AQUA 3EZWA 3LDLA 5AZJB 1C0GA 4GY2B 3CJCA 4IXCA 4WQ5C 3HM8A 3UE5A 3MMVA 4KBOA 3QMLA 2KHOA 2F9TA 3IMXA 3W0LA 4BRFA 4M63C 3UKUB 2EWSA 1SQKA 3CJ9A 1IG8A 2ASOA 3C0BA 5AQLA 3M1FA 4A2AA 3QFPA 4H0VB 3U4LA 1KXPA 3AY9A 3H6EA 4EIAA 1KAXA 1V4TA 3DAWA 1KAYA 2A42A 3C7NB 1NGIA 4EHUA 5BN8A 2P9UA 4FWMA 5BRDA 1GLAG 5AQXA 1RDWX 5AQJA 5AQSA 3HSCA 3WXJA 1J6ZA 4H5WA 4FPAA 1GLLO 3SJHA 3SMPA 3H1VX 4E1JA 2V7ZA 5E84A 4BRNA 2P9LA 4BG8A 1V4SA 3VESA 3WEEB 3ZX0A 1CZAN 4AM6A 4BC5A 1E4GT 3D2FB 3O6WA 5JLFA 4ISGA 1X3NA 5BN9A 4PKIA 4ISFA 2J4RA 4BREA 4CJ7A 1DKGD 3UKRA 3P4IA 2E88A 4H5NA 3I33A 1C0FA 1U2VA 2VWBA 4A62A 1NGJA 3F9MA 3SK3A 3BUZB 3ENOA 2IIRA 5EOYA 2QWNA 4BR7A 4BRLA 2CGKA 3CJBA 4QS7A 3A5LC 4WYBA 1TUUA 5EXWA 5TKYA 2D0PA 3CJ1A 3EN9A 3VOVA 3FZLA 1HUXA 3M3ZA 1HKCA 2ASMA 1JCFA 3GL1A 5AQNA 1RGIA 1YAGA 3ULEB 3WUHA 1NM1A 3LDOA 4IJAA 1DEJA 1HX1A 3HZ6A 3EKSA 3S41A 3IDHA 3L6QA 4BC4A 4MO4A 3WQTA 1QQMA 5EY4A 3WT0A 2A5XA 2PBDA 4BR0A 3O8MA 4BRKA 4BRAA 3LDQA 4M7XA 4LC9B 3I8BA 2Q2RA 3LDNA 5B8HA 2Q36A 4CZKA 5AQKA 2HMPA 3C7NA 4QS8A 5LJWA 3J8AA 3AARA 2P9UB 3U9ZA 5AQVA 4QS9A 3VGLA 2IVPA 3UB5A 2QXLA 3EL2A 3GG4A 1BWFO 2Q97A 2YHYA 3U9DA 4JAXA 3CERA 2P9LB 4BRIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DCHA 3RR8A 4K41A 4ID5A 2YCHA 4CEOA 1B9FA 3K5OA 2A1RA 4GKJK 4K0KK 4M42A 2NRZA 4BDYA 3P39A 3ENHA 3OYIA 4CGGA 4IFVA 2PFUA 2X78A 4CIGA 3C94A 3A5MC 3NGIA 5FPDA 3I55N 1RDUA 4WFAL 1C1BA 4RW8A 4LH4A 1VQNN 1RFQA 3QIOA 1OVQA 3DLRA 3J7AP 1T03A 1W0HA 3AVGA 2DFHA 3VF2A 3THYB 3A5NC 3O9SA 3MN5A 4CZLA 3HPHA 3KIOA 5GIPA 1QE1A 1A5WA 4DSIA 3CCSN 4IDHA 3SI6A 4B1UB 1I3AA 2VQEK 3QICA 3MXMA 5C42A 2VWKA 4DMNA 3KLEA 4E7IA 3TAFA 3VA0A 2KTQA 4KTQA 1YUWA 3T1AA 3SJJA 4BROA 4KTWA 2UXBK 4GV3A 3JYTA 4JKGA 2XHBA 3WXKA 1S1WA 3H1QA 2X6SA 5BREA 1Z6RA 2OANA 4BG9A 3C6TA 3RTVA 2FBVA 3NH2A 3VEWA 2IVNA 2WUSA 3OA9A 4K25A 4CZGA 4OKJA 2DPNA 2KZMA 4CGFA 3C65A 4WQ5A 3HM9A 1N5YA 1SKWA 2D0CA 2YNIA 1YF5L 2Q0UA 4J2BA 2GUIA 2FBXA 3VENA 3R3LA 3SUPA 4HTUA 2O8FA 2G8IA 4C8NA 2GELA 5LJVA 1BU6O 3QNNA 5BPNA 1S1UA 1BA1A 4M3ZA 1O1WA 1S6PA 4FJ7A 1F21A 4DFPA 3DOLA 4O5FA 3I56N 5KQDA 2IAJA 2VYPA 3LM2A 2GBZA 3AGRA 3DLKA 4MFBA 4BQZA 3VQ7A 4DV1K 3E9PA 1D9FA 1QHTA 4DHYA 4R5PA 3T19A 2YNHA 2YX6A 3NVMA 4J8FA 3QINA 4BWMA 3K0SA 1N8RO 2E1ZA 3PX0A 4JKGB 3SUNA 2KQ2A 4FWLA 3QBWA 4FK2A 4XEIA 1TKZA 1TL3A 4JI7K 4OLAA 4DTRA 4B3OA 3TI0A 3CG7A 4B9UA 3FZKA 1M1KO 1JKHA 1XC3A 4B9VA 5BRFA 5E41A 1UAXA 2HNDA 5C25A 5CYQA 4R79A 2QKKA 4FYDA 3BGRA 2ZGZA 3FGUA 4DTJA 4DV7K 2D4WA 2O8FB 2Q0RA 1BG3A 2QTDA 3MN7A 2ZJPL 1NGCA 1RCHA 4RCHA 1JCEA 1BISA 2I7NA 2E5LK 4J2EA 3OYJA 4GW6A 4U67L 2I5JA 2P9NB 3HSTB 3HPOA 1HKBA 4B1VA 2W6KA 1HRHA 3EKUA 3ZX2A 4BRPA 1VQ9N 1BQMA 1TV6A 2Q3SA 4HHTA 2JWLA 1L5UA 2D0AA 5SWMA 3W3DA 2O8BA 5AR0A 3NDKA 5C12A 1Z05A 3G0ZA 4CJ4A 3OYKA 3QLHA 2NNWA 2HBMA 3OTOK 4JKDA 4CD3A 2NRTA 2GX9A 1D5AA 4YOYA 1XNRK 2OPSA 4FWRA 3RMAA 1GLDG 5KRSA 4FW1A 1VSIA 2VG5A 3RMDA 3K5NA 4WQ4A 4OKKA 2HOEA 4Y1DA 4MDAA 3U6FA 1EX4A 1S22A 3L0QA 2OCEA 2E6LA 4E7KA 4F4KA 2A6AA 3PO5A 3D2EA 5M1NA 4AHVA 4KH5A 1RT5A 3PV8A 5FPNA 5JS2A 4FJ9A 5LL6Z 1W97L 4DS5A 4HUEA 1QQNA 1VSLA 3AAQA 3JS6A 3CQ8A 3O4NA 3S9HA 1J5EK 3P83D 4KHWA 4CEQA 1MWMA 3CI5A 2FBTA 2FLOA 4CF9A 1LW0A 1XWLA 4B1WB 4NB4A 5F1XA 4M3TA 3QESA 3ITHA 2O8CA 2UUAK 3V9XA 4DQPA 2AA4A 4YOTA 1GLBG 3EO3A 2O8BB 3J7ZO 1VQ7N 4OPKA 4JKEA 4IG0A 4KHYA 1KSPA 3DJCA 5AQZA 3B6PA 4XH4A 4DR1K 5C0YA 1VSMA 2VG6A 5AQHA 3NGZA 1WLJA 4DSLA 1RDDA 3ATUA 1UOCA 2GWJA 3SNNA 3IRXA 4DU1A 4PHTX 4CJUA 1KFDA 4XH1A 1BA0A 3PUFA 3HVRA 1C1AA 1MU2A 3KJVA 1ZYQA 3EY1A 5M1OA 3WEEA 3R6MA 4DU4A 1RDBA 4Z4FA 3TWHA 4AF1A 3QBXA 4GVMA 3TSPA 3V9SA 3D2EB 3K9JA 4KHPK 4N41A 5DK5A 2YJEA 1VSEA 3K5MA 3QB0A 3O80A 1BO5O 3HL8A 1Y64A 3L3UA 1EWRA 4KV8A 4DTOA 4IJNA 3O9QA 4CJKA 4YDUC 3UIQA 4FJMA 3VQCA 3K5LA 4FZZA 1IV0A 3WNEA 1C0GA 4IOCL 1SS6A 2O8CB 1RILA 3UE5A 4HCBA 1CZ9A 3AVNA 3SPYA 2F9TA 4ZHRA 3P38A 2Z1GA 4ELTA 1VQ4N 3NF9A 1IG8A 3QFPA 1YJWN 4H0VB 1Z25A 3SBGA 1HNIA 3DAWA 1KAYA 4O5BA 1NGIA 2AJQA 1WSJA 4E1MA 4FCYA 3ZT1A 4CGHA 4CEZA 5FRNA 1NJZA 1ZBHA 5GADP 4L8RB 1KVCA 5J2QA 3G4SN 3OYEA 4PWDA 1V4SA 1VSDA 3WEEB 3ZX0A 4AM6A 1E4GT 3O6WA 2JLEA 1JLBA 3TTDA 4CECA 4ISGA 4YNQA 1K73O 3BDPA 1JLQA 4PKIA 1HYZA 4CJ7A 4M45A 4H5NA 4CEBA 3I33A 4DTNA 1C0FA 3AVCA 1YT3A 4A62A 1NGJA 5EOYA 3NBPA 4KI4A 3L3VA 4DSEA 4QS7A 3U3YA 3TAQA 1KTQA 3VOVA 2R7YA 4B3MK 3CCQN 1LWFA 4JK7A 4JI0K 5AQNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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