3CJ7A

Structure of rattus norvegicus ntpdase2 in complex with amp
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
426
structure length
419
Chain Sequence
PALKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYANDPSKAGQSLVRCLEQALRDVPRDRHASTPLYLGATAGMRLLNLTSPEATARVLEAVTQTLTQYPFDFRGARILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGRWIRPRKGTLGAMDLGGASTQITFETTSPSEDPGNEVHLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQILLRLLASALQIHRFHPCWPKGYSTQVLLQEVYQSPCTMGQSAIVSLSGTSNATLCRDLVSRLFNISSCPFSQCSFNGVFQPPVAGNFIAFSAFYYTVDFLTTVMGLPVGTLKQLEEATEITCNQTWTELQARVPGQKTRLADYCAVAMFIHQLLSRGYHFDERSFREVVFQKKAADTAVGWALGYMLNLTNLIPADLPGLRKGTHF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2
publication title Structural insight into signal conversion and inactivation by NTPDase2 in purinergic signaling
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Hydrolase
total genus 138
structure length 419
sequence length 426
ec nomenclature ec 3.6.1.5: Apyrase.
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cj7A01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3cj7A02
1H1VA 5FPMA 3WT0A 2A6AA 1E4GT 3WQTA 4QS9A 3CJBA 1T44A 3CETA 3VF4A 3UE5A 1BDGA 1BOTO 2A41A 3QMLA 1SQKA 4H5NA 4MO4A 1QQMA 4BVOA 4CZHA 3O08A 4B1YB 3LDQA 3M6GA 5AQOA 3QBWA 4AM7A 1X3MA 3KZBA 1BG3A 3DWLA 2A42A 2Q31A 2YJEA 3H46O 5BREA 3BEXA 3M3ZA 5JICA 4MLHA 4H0YB 2ZWHA 5E26A 4PL8A 1NGEA 3VGLA 3VETA 1G99A 2E2NA 4FOIA 5KQDA 5BN8A 5AQSA 5E84A 2IVOA 4BG8A 3A5NC 2QWPA 4CD3A 1RFQA 3A5MC 4WQ4C 4DQ8A 1GLLO 4BRNA 2E1YA 2HMPA 4BR9A 3LM9A 1ZC6A 2F9TA 5BRDA 1Z6RA 3FLCO 2Q36A 1DGKN 5AR0A 4Z94A 3CJ1A 5AQTA 3J8AA 5BR9A 3EKUA 5EY4A 3TPQA 3AY9A 1ATNA 1DEJA 5JLHA 3I8BA 2E2OA 5AQVA 1U2VA 2J4RA 1U2VB 2VWBA 4EFHA 3FFKB 3WUHA 4YDUC 3F9MA 5AFUA 1BA0A 4B1ZA 2P9NA 3MN7A 4RWTA 2P9NB 2Q97A 2NLXA 1MDUB 4FSVA 1JCFA 3BUZB 3VENA 1JCEA 4XH1A 1T6CA 4CJ7A 3O80A 3DXKA 4B9QA 4FWLA 3DXKB 2BTFA 3LDLA 2QWMA 5AQGA 2IVPA 3HTVA 1Q18A 1OKJA 4BGBA 4BREA 1MA9B 4H5RA 3FZHA 3WEEA 3WEEB 3O6WA 2E1ZA 4K43A 5AQQA 4JAXA 2A3ZA 2D4WA 2YHYA 3ZX0A 4CZLA 3GL1A 3RSEA 3O4WA 3RSEB 1Y64A 3FGUA 2F9WA 3AAQA 3WXLA 3HI0A 3GOIA 4HWIA 3CQXA 5AQPA 2Q1NA 5JMVA 1NGHA 3ULEA 2W40A 4WQ5A 4XH4A 3ULEB 5AQYA 3SLCA 3BP8A 3WXJA 4BC3A 4BRCA 3A8YA 4CBWA 5FPDA 3VEYA 1E4FT 2Q2RA 3SMPA 4BRPA 3H3NO 3SK3A 2ASOA 2P9LA 3D7EO 2D0OA 1GLEG 2P9LB 4IJAA 2CGLA 3C0BA 4EIAA 2FSJA 3JS6A 5KQ8A 3W3DA 4BROA 1NGAA 5EOYA 4IZ9A 1X9JA 2KHOA 5AQRA 4B1VA 1V4TA 3TU5A 3JXUA 2P9IA 4C23A 2P9IB 2V7YA 3KVGA 4JD2A 4CI6A 1BO5O 5BRHA 3VEXA 4JD2B 3QDKA 1S22A 4CZIA 2P9KA 2YHWA 3CQYA 4H0VB 4A2AA 4CZMA 2P9KB 1LCUA 4BC4A 4BC2A 4CZGA 3MMVA 4EHTA 3O5BA 4K25A 4L3QA 2ZF5O 2DPNA 1XC3A 3L0QA 4H0XB 4RCHA 1YXQA 4H0TB 4E1JA 5ADXH 1ESVA 4NB4A 4FWNA 3LL3A 3U9DA 1IG8A 1RGIA 4CZFA 3MN6A 4ISFA 4I6MA 3CJAA 4IWVA 4I6MB 1NGCA 5JLFA 3MK6A 1HJOA 3FZLA 3DAWA 5LJWA 3LDOA 1DKGD 3D2FA 4QS7A 3D2FB 4EAHD 4CBXA 4GY2B 3D2EA 2EWSA 4J8FA 4O8KA 3SJHA 3D2EB 2CGKA 2FF3B 4BQLA 4F9OA 4A2BA 3AARA 3ATUA 2PAVA 2NRHA 4ISGA 2FSNA 4LC9B 3GG4A 1JCGA 3FR0A 1BU6O 4H5VA 4B1XB 2ASPA 3UKUA 2QM1A 5BN9A 3UKUB 3VGMA 2E20A 3P4IA 1NGGA 5KPZA 3CJ7A 1C0FA 2E88A 4BRMA 3ENHA 5BPLA 1HKBA 2HF4A 3WXIA 1CZAN 1QQOA 4FWKA 2UYTA 5AQIA 4BQZA 4WQ5C 4O5FA 4FO0A 3ATVA 3GDQA 3CERA 2W41A 5BRFA 4WYBA 4IO8A 1NMDA 4BRQA 4GNIA 2GWKA 4BRDA 4FPBA 3S41A 2P9SA 2I7NA 3LDNA 3MN9A 4K41A 2P9SB 4A61A 4Y0WA 4M7YA 5AQMA 4H03B 3ENOA 2AP1A 3AAPA 3QFUA 2QW9A 3U8XA 3CIPA 1R59O 1LOTB 1HKGA 1KAXA 3HSCA 3B8AX 4FWRA 3I33A 5AQZA 1HLUA 3IUCA 4H0OA 4BR4A 3HBTA 1QHAA 5AZIA 5AZIB 2OANA 1QZ6A 3CJCA 3FZMA 2Q0UA 4NO7A 5AQKA 5CE3A 2P9UA 2P9UB 1T6DA 5KPTA 4CZKA 2FLOA 3IDHA 4BC5A 3CHWA 5LY3A 4PKHA 3VPZA 3EO3A 5AQLA 3HM8A 4XH5A 3ID8A 5I9EB 1BA1A 2E8AA 4M63C 1NGBA 1MWMA 3MDQA 5AQJA 1Z05A 2BUPA 3U4LA 4DCHA 2QWOA 3R9PA 3QFPA 1NGJA 4H0PA 2ITMA 3WQUA 3G25A 5EVZA 4YDUA 3UKRA 4FL9A 2HOEA 3UKRB 4MO5A 4IXCA 4FWSA 3VEWA 1KAZA 4DHYA 1X3NA 3WXKA 4BRKA 2V7ZA 2FXUA 3O1WA 5EXWA 1GLDG 3EZWA 3O1BA 5KPRA 1WOQA 1GLJO 1NWKA 1TUYA 3MN5A 3A0IX 2GTDA 4BR2A 2ASMA 1BWFO 5AQFA 4FWMA 3ZX2A 4BR0A 4DB3A 5ADXA 1KXPA 2V52B 2PBDA 4A62A 3HZ6A 3DJCA 4ISEA 3VEVA 2AA4A 2YJFA 4KBOA 4JN4A 4BR5A 1TYQA 1TYQB 1HKCA 1QQNA 2I7PA 4HTLA 2H3GX 3MCPA 3IMXA 3EL2A 5BPNA 5LJVA 4BVPA 3ZX3A 3OHRA 1IJJA 1NGIA 2GWJA 4BRIA 4BRGA 1P8ZA 1YVNA 4H5TA 5AQUA 3VERA 3CJ9A 1GLBG 4PKGA 5F1XA 1GLFO 5F0XA 3QB0A 5TKYA 4AM6A 3EN9A 3ZEUA 1V4SA 3ZEUB 4RTFD 5FPNA 3H3OB 3H45C 1K8KA 4FWQA 1J6ZA 1K8KB 3C7NA 4M7XA 3C7NB 2VCPA 3U9ZA 5B8HA 4FPAA 4JHDA 2A5XA 1C0GA 4JHDB 1U6ZA 3VOVA 2D1KA 4JNEA 2VYPA 4EHUA 2CH6A 2GEMA 1NLVA 5AQWA 2GUPA 4BG9A 1HPMA 3UB5A 2YCHA 3IFRA 3R8EA 5AQXA 1XQSC 5FPEA 3L6QA 5AFUH 4K42A 3VGKA 2FF6A 3VF6A 4XEIA 3LM2A 2E2PA 5F2RA 4BRFA 1ZXOA 1SZ2A 4B1UB 1KAYA 1ZBSA 3DXMA 1NM1A 2A40A 3DXMB 2ZGYA 1QZ5A 1WUAA 4FOEA 4BRHA 1NGFA 1RDWX 2IVNA 2FSKA 4QS8A 4CD1A 1TUUA 3FZKA 5AZJA 4H5WA 5AZJB 4WQ4A 1XUPO 4CZJA 4BGAA 2WUSA 3EKSA 5BPMA 2IIRA 3ZETA 3GE1A 3VEZA 3VEOA 3ZETB 1HUXA 1ATRA 3M1FA 2YHXA 3L4IA 3CI5A 3SMSA 4FWOA 3QBXA 1BUPA 4BRLA 1YUWA 1NGDA 2QWRA 1D4XA 3VESA 1GLCG 2QWNA 1NBWA 2NZTA 3W0LA 3FE1A 3R6MA 3FZFA 1ATSA 2Q0RA 3KHYA 2P9PA 2E2QA 2QXLA 2P9PB 4BR7A 2CGJA 4IJNA 1YAGA 4MLEA 3QICA 4B1WB 3H1QA 2GELA 5ELZA 5AQNA 1EQYA 2HF3A 3BF3A 3BF1A 5EX5A 4PKIA 1MWKA 4PL7A 1GLAG 2YI1A 1SAZA 2QWLA 2ZGZA 3LDPA 4CZEA 4FWPA 2QWQA 1HX1A 3GBTA 3A5OC 4CBUA 3O8MA 3A5LC 2V51B 2CH5A 5AQHA 1S3XA 3H6EA 2D0PA 3VF2A 4BRAA 3H1VX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C0MA 5HP1A 2A6AA 3WQTA 4X66K 3CETA 3VF4A 3UE5A 4H5NA 4DS5A 4IOXA 4B1YB 4N76A 3LDQA 3NMUA 5AQOA 4DTUA 3DWLA 3L4QA 2Q31A 4IBNA 3HJFA 3H46O 4KREA 5BREA 4AHSA 3MXIA 3CMEN 3VGLA 5M1OA 1G99A 3KLEA 1UWBA 5C42A 4YNQA 2IVOA 5SWMA 4DQ8A 1GLLO 2E1YA 3LZJA 3RTVA 4M3TA 1U4BA 3E9PA 1N34K 1QSSA 4BR9A 3TI0A 1O13A 2F9TA 4LF4K 4KHPK 3FLCO 1NK6A 5AR0A 4Z94A 3L2RA 3KIOA 2UUAK 3HSTB 3J8AA 5AQTA 3LWMA 4GV3A 3QINA 4B9TA 3QIPA 1HJRA 4MDAA 1DEJA 1QS4A 1U2VA 4BDZA 1U2VB 2VWBA 4WF9L 4A5AA 3J7ZO 1YVUA 4YDUC 4NCAA 4EP5A 2E5LK 3F9MA 1VQ8N 3MN7A 3CG7A 4RWTA 1W7AA 2F4VK 1BISA 1G15A 5C2DA 2NLXA 4FSVA 1T8EA 4IG3A 1D8YA 3LAMA 1JCEA 4E1MA 3LDSA 2FBYA 1X9SA 4CJ7A 3O80A 4LF6K 4JI4K 3DXKA 4DKWA 4FWLA 4FJXA 3DXKB 2BTFA 4I7FA 2QWMA 5AQGA 5JVGL 4J2EA 4BREA 1MA9B 3AA2A 5AJ3K 4DTXA 1RBUA 1VHXA 1S72N 4DS4A 4HUFA 2YHBA 5K14A 3C95A 3FGUA 4CF0A 2KFNA 4KFBA 3AAQA 1J9AA 3BZKA 1N36K 1ZBFA 3AO5A 5KRSA 1F21A 1VSDA 1NGHA 3LPTA 3SCXA 3DMJA 2DFFA 4WQ5A 4IFEA 3CMAN 3V4IA 3BP8A 3F9KA 4FLUA 3VEYA 2BH1A 3SMPA 1VQ7N 3D7EO 2OCEA 2CGLA 4DU1A 3G6EN 1VQ4N 3JS6A 1WSEA 3WNFA 4FVUA 4DV6K 1X9JA 5AQRA 2HBMA 3TU5A 2P9IA 3UIQA 2P9IB 3KVGA 4CI6A 2Y1JA 3IAYA 1S22A 4X65K 1XWLA 5LMNK 2P9KA 2YHWA 3CQYA 4H0VB 4DF8A 2P9KB 4BC4A 2B5JA 1KLNA 4CJPA 4I9QA 2AJQA 4L3QA 2ZF5O 3AVBA 2ZM6K 3LP2A 4H0XB 1NK0A 5ADXH 4FYDA 3KK1A 3QLHA 1WB9A 4YOUA 1HNWK 1IG8A 4HHTA 1TK0A 1X1PA 3MN6A 4I6MA 4O44A 4I6MB 1NGCA 5JLFA 3MK6A 3NE6A 3DAWA 3LDOA 1DKGD 3HOSA 3M8SA 3SQ1A 4GY2B 3KTQA 4O8KA 4Z4IA 2CGKA 5KTQA 1TL1A 4FJIA 1WBDA 1S9GA 2PAVA 3ZSXA 4B9MA 2NRHA 3F5TA 5C25A 4GV9A 4LD0A 4CJSA 3UKUA 3ZT2A 2QM1A 3UKUB 3DYAA 3P4IA 1NGGA 2ITGA 4CECA 3OYJA 4BRMA 5FRMA 3O9UA 2RE2A 2X6SA 3CM6A 3HP6A 1QQOA 2P51A 4IKFA 1SL1A 2UYTA 4Q0BA 4M3XA 3AA4A 4O5FA 3L2QA 3CERA 3DOLA 5IT9O 5BRFA 4IO8A 4BRQA 1VK0A 3T7ZA 1NKEA 4JKCA 1S6QA 3MN9A 3CPEA 4Y0WA 5AQMA 1CLQA 1RT4A 3LPUA 3TANA 3ENOA 5I42A 1BCMA 3U8XA 2P5GA 3CIPA 4DF4A 1VAZA 3FFIA 1C1BA 3K0SA 4CE9A 1KAXA 3HSCA 4FWRA 1ASUA 2XHBA 3IUCA 4DSFA 1ITGA 1QHAA 2GBZA 3QESA 4B3RK 3SV4A 3OW2M 2P9UA 2P9UB 4CEAA 4CCHA 4C8OA 4LFBK 1HNIA 4OKEA 2FLOA 1C0UA 3M8QA 2IDOA 3OYFA 4DFMA 1LV5A 2G8WA 2WFBA 4DQIA 1BA1A 2E8AA 3TAEA 4JI6K 4KTWA 2XY6A 3Q7BA 5AQJA 4MFBA 4DFKA 1S9EA 3WQUA 4YDUA 3S3MA 3UKRA 4FL9A 4R79A 4RW4A 3UKRB 4DQPA 4IXCA 4JLHA 2HHSA 4CHYA 4DHYA 1TAUA 2ZJPL 4I9LA 2V7ZA 3O1WA 1GLDG 3EZWA 4J2DA 3SAHA 3SUOA 4JK7A 2XY7A 4EZ6A 3A0IX 2F8SA 1RDDA 1HYVA 1BWFO 4BR0A 3WXMB 3VQEA 3SQ0A 3KWGA 3L2UA 2EHGA 3DJCA 3JSMA 4KBOA 1RBRA 3BZCA 1HKCA 4DV3K 4EZ9A 1SS6A 3EL2A 5BPNA 4CJ3A 1Q82O 1K9MO 2F96A 4KHSA 4FJGA 4Z4HA 3K57A 4JRQA 4LF8K 4CHNA 2O8EA 1NGIA 2O8EB 4BRIA 1BQMA 1P8ZA 2PY5A 4E7KA 4B3SK 1SKWA 1YVNA 4TSXA 4KB0A 3MEDA 3VERA 3CJ9A 1GLBG 2YNIA 3AO3A 4PKGA 4H4MA 3V1OA 5F1XA 1I3AA 1VQ9N 5TKYA 2WOMA 4HVJA 4JK8A 4FWQA 4M3YA 3EE9A 4JRPA 3EY1A 1WLJA 3MWPA 2A5XA 3OJSA 2D1KA 2NRVA 4EHUA 2CH6A 4CJVA 5AQWA 3V9WA 1NKBA 2GUPA 1NJWA 1Q8IA 3CCLN 3KWIA 3N4PA 5AFUH 1RT7A 5GINA 1HR0K 3OTOK 5J2NA 2E2PA 1C6VA 2Z1JA 1KAYA 3T1YK 1YI2N 4DSEA 1ZBSA 4NXNK 4IOCL 1D9DA 4IDKA 2GV9A 4B8AB 3NAEA 4M3RA 2IVNA 2FSKA 4FVMA 2ZJRL 4V19S 4BGAA 3EKSA 2IIRA 1DT9A 3ZETA 3VEZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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