1RNHA

Structure of ribonuclease h phased at 2 angstroms resolution by mad analysis of the selenomethionyl protein
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
151
structure length
151
Chain Sequence
LKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords RIBONUCLEASE HI
publication title Structure of ribonuclease H phased at 2 A resolution by MAD analysis of the selenomethionyl protein.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
total genus 43
structure length 151
sequence length 151
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1990-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rnhA00
3NH2A 1TL1A 1D8YA 1RT2A 1BCMA 3WNEA 4B08A 4CHQA 1CZ9A 4FCYA 4FLVA 4DSIA 3VQ5A 3SQ0A 3LANA 3G10A 3AA4A 3V1RA 5HLFA 4GW6A 3HVRA 1CZBA 1XHXA 3NE6A 4MFBA 4Y1CA 1IG9A 4RW8A 1GOAA 2WONA 3L3UA 1LWEA 4FVMA 3VQ6A 3PX0A 1X9SA 2O4IA 5J2PA 1RILA 3OYHA 4KV8A 2X74A 1TKXA 3S9HA 3G0ZA 4E7IA 3ZT2A 3L2WA 3NF9A 1KSPA 4F3OA 3DLRA 3AO5A 4W5QA 4CJWA 2E6LA 3NH1A 2OYQA 4DSJA 3AVJA 1I3AA 4NCGA 3QEWA 4E1MA 4CF2A 1NK5A 4Z4GA 1Z26A 1T03A 5CYMA 4B9SA 4KB1A 4FYDA 3ZSZA 3AO1A 4CFBA 4ZHRA 1RBVA 1IKWA 1VSLA 3CYMA 3D0PA 1CXUA 5CZ1A 3KD5E 3ZT4A 1VSJA 2VG7A 4ICLA 3SPZA 3EY1A 5CYQA 4OKJA 4YFUA 3OYMA 4DSFA 2QXFA 2Z1HA 3ZT1A 4Z4IA 1S9GA 4HHTA 4FK4A 3DLBA 5D3GA 3HPOA 4OVLA 1L3TA 1BI4A 4O0JA 1S9EA 4N56A 4F2SA 1RTDA 1NK7A 2Z1GA 4FZYA 2XY5A 4KPYA 1BQNA 4DF4A 3SUQA 4CHYA 2KTQA 2EHGA 3WNHA 4E0DA 5FRNA 4FXDA 2D5RA 1NJZA 4DQIA 1XHZA 4E7HA 1HPZA 4CGFA 2YHBA 3AA5X 1ASVA 1DLOA 1RCHA 4BACA 2PY5A 3VA0A 4FJNA 1SUQA 1S6PA 4F8RA 2Y1JA 1LAVA 4M3WA 4LH4A 4KHYA 2HVIA 5CY4A 3ZSWA 2VG5A 4CIFA 4E7JA 3NHGA 3OYKA 1KVBA 1LW2A 3SQ1A 4KRFA 3KLGA 3HPHA 3O4NA 2OPPA 1ASWA 4DLGA 3DYAA 4AHTA 2O4GA 1ASUA 3DLKA 3ZSXA 3M8RA 4E7LA 4KTWA 1B92A 1F21A 4FLTA 4F3TA 4FZZA 4CF0A 2RN2A 4CFDA 3QEPA 4EZ9A 4KAZA 4Z4EA 3IG1A 4CEAA 2YKNA 2VWKA 2XY6A 1TK5A 1Z25A 4CGJA 4B3OA 4DSEA 1TVRA 3UIQA 1IH7A 1S1WA 4CESA 4KI6A 4N76A 3VQEA 4CGGA 4CJ3A 1KRPA 4DS5A 4PUOA 1SL2A 4JS4A 1SL1A 3CFPA 2Q3SA 3JYTA 1A5VA 4B9VA 1NK6A 4M3XA 1O1WA 3QLHA 1NJYA 1QSYA 4ELUA 4OKEA 5KRSA 1G15A 4DQRA 1QE1A 1B9DA 2Y1IA 5HP1A 1ZBIA 3D45A 3V9UA 3TANA 4M42A 1ZBUA 3M8QA 5CZ2A 4IG0A 3AVKA 2JGUA 4CEQA 1UAXA 3DM2A 3QEVA 4DQPA 4KHUA 4PQUA 4LY7A 4DTRA 2PYJA 2RKIA 4BDYA 3IS9A 1VK0A 4DG1A 3OYLA 2YNIA 3QEXA 3VQ4A 5J1EA 1X1PA 4FM2A 3RMBA 3SJJA 3TI0A 4FJ7A 3AO4A 4KHNA 5HRNA 3SQ2A 3ISNC 4FK0A 4HVJA 3QEIA 3P5JA 2BGGA 2GUIA 2YHAA 1FKOA 2YV0X 3C6UA 4CK3A 2ITGA 4OLBA 2ZE2A 3AVBA 3LPTA 4Z4FA 1IKXA 2KZMA 1ZBHA 1KLNA 3HK2A 3TAPA 2B6AA 1K6YA 4JS5A 1U4BA 3VN5A 4M3TA 2YNFA 3VQQA 3SZ2A 3TAEA 4FJGA 2RF2A 4CJQA 4HUGA 5FRMA 4FW2A 4JLHA 1RDAA 1QQCA 1L3VA 3S3OA 1W9HA 4DFKA 1T05A 3LAKA 3ZSQA 4DQQA 4Q5VA 1C0TA 1C6VA 4CEBA 4CF1A 1NKCA 4NCAA 5C42A 4J2DA 3LDSA 4CJRA 1NK9A 4Q0BA 2OPRA 3I0SA 2HHTA 2OZMA 3QERA 4Y1DA 4CFCA 1NOZA 3DLHA 3P83D 1QS4A 4M41A 1BHLA 3VQBA 1UA1A 3QNOA 1NK8A 2XY8A 3NGIA 3AVAA 3OYNA 3OVNA 4CJVA 1U04A 1JL1A 3HP9A 1D9FA 2HHUA 4KTQA 3AO3A 1KFDA 3DOLA 4FLUA 2G8VA 1HQUA 1HRHA 2BE2A 1HNIA 2HB5A 4WE1A 3K58A 4DLEA 1SKWA 3ULDA 3AVHA 2GV9A 3KKRA 1WAFA 4CK1A 4ZTJA 1QSSA 4CEZA 5FDLA 1L5UA 4GVMA 1JLAA 3V9WA 4DFJA 1FKPA 3E01A 3C94A 2A1RA 5J2QA 3NGYA 1NOYA 3HT3A 5E41A 1BCOA 1RT6A 3DRPA 4AHRA 1WN7A 4ID1A 3AVFA 1RDBA 3CFRA 3KK1A 4ELTA 2HW3A 1FXXA 3ITHA 2G8HA 5JS2A 4HTUA 1KTQA 2VG6A 4KKOA 1C1BA 2E4LA 1S1UA 1BGXT 1VSIA 2P1JA 3VQAA 5HRSA 3K5OA 4FJHA 1WSFA 3K2PA 4FLWA 2XY7A 4B9LA 4RG8A 2D0CA 4AHUA 4FM1A 4EZ6A 3PX6A 1WSIA 3SPYA 3RR8A 4OPJA 4KI4A 2KQ2A 5FROA 2P51A 4FJMA 4L8RB 3HO1A 4FJKA 2G8KA 1S5JA 4KHSA 3M8SA 3SNNA 3TAFA 4FJJA 3KK2A 4DTUA 1BISA 3HJFA 1RT7A 3PO4A 3OYGA 3P1GA 5C24A 4CGHA 3L8BA 4FJ5A 3MEGA 1C1AA 4I2PA 4KB0A 4CF9A 1RT4A 4E89A 3V1OA 3U6FA 1RT1A 1VSEA 4E1NA 3RTVA 1R0AA 2HNYA 3NF8A 1CLQA 3SUPA 5SZTA 2PYLA 4J2BA 4AHCA 4OLAA 1FK9A 2HHQA 4NCBA 4E3SA 1WAJA 4H4MA 4CGIA 4CJPA 3KD1E 4J2EA 1EKEA 4CERA 1VSFA 3WNFA 3NBPA 1XC9A 1EP4A 1J5OA 1TGOA 4O44A 4CGDA 4CJKA 3L2VA 1RTJA 4C8NA 3T1AA 1EXQA 4CJ4A 3PX4A 3OY9A 4BE0A 4DU3A 5HRPA 3OS1A 1JLEA 1GOBA 1LW0A 3AVNA 3ZSRA 3O3HA 3ZCMA 4CJ5A 3HPGA 1YT3A 4CEOA 4Z4CA 4HCCA 4B9NA 4KHQA 3I0RA 4BE2A 3NGZA 4M3ZA 3AV9A 4R5PA 3VQ8A 4DTNA 3OYDA 4RW4A 3SYZA 1ZBLA 3HL8A 2JLEA 5KGWA 3RMDA 4M45A 4QCLA 4DTMA 2EX3A 5HRRA 4Z0UA 4DU1A 3K5NA 4CF8A 2G8UA 4DFMA 1XWLA 4FW1A 1BQMA 1C0UA 3MXJA 2HVHA 1BL3A 2ETJA 2YNGA 3AVMA 1HYSA 4ZTFA 1HNVA 3NH0A 3L2QA 3PO5A 4CHZA 1HQEA 5I3UA 1UA0A 1NK4A 3RWUA 1RDCA 2X78A 3T19A 4DMNA 3MECA 3SV4A 1TK8A 1S1XA 4CK2A 1Q9XA 2IC3A 3LP2A 4B9MA 1D5AA 1A5XA 4BDPA 4DSLA 3ALYA 3K5LA 2IOCA 3KTQA 3HP6A 4O4GA 1WLJA 4H4OA 4NYFA 3NFAA 3V81A 3OYBA 3T3FA 3QIPA 3SQ4A 3LAMA 4KREA 2IDOA 5SWMA 1WSGA 2ATQA 3VQCA 3OYJA 4CEDA 1ITGA 1TKTA 1VSMA 1RBSA 1TL3A 3DI6A 4B8AB 3L3VA 2DY4A 2FBVA 3CM6A 4AILC 2G8WA 2IGIA 3I8DA 1HJRA 1QSLA 3ZT0A 2R7YA 3ASMA 1KCFA 4DTOA 2PZSA 1S6QA 1JLCA 5KGXA 2D0AA 4W5NA 3TAMA 3C95A 4KFBA 4N47A 4CJTA 2G8FA 4RW9A 4KHWA 3KLHA 1HYVA 2OPSA 1JXBA 2KZZA 4M3RA 2X6SA 1NKEA 2OPQA 1ZBFA 4BE1A 3K59A 2B5JA 1QHTA 3PV8A 3BGRA 1U45A 3OS2A 2KFNA 3V4IA 1I39A 1YVUA 3DLEA 4I2QA 3NDKA 3TABA 2OA8A 1S1VA 1NJWA 1NJXA 4ELVA 4QOZB 4DSKA 4C8MA 4AHVA 4GMJB 4FJXA 3AA2A 1X9WA 3DMJA 5KTQA 3F73A 3OYAA 2OZSA 3LALA 4LH5A 4CJFA 3MXIA 1RBUA 3DRRA 4OGCA 4RW6A 4DFPA 3RMAA 1T8EA 5HBMA 4M3YA 3ZT3A 4I7FA 3VQPA 4CEEA 3OYIA 3OJUA 4DTSA 3SCXA 1RNHA 4W5TA 4CHOA 4CJLA 4FLZA 3AVCA 1WSEA 4FK2A 4PWDA 1WSJA 3DLGA 3WNGA 4JRPA 4CJUA 4MQ3A 1KVAA 3TR8A 2VWJA 1TV6A 1TKZA 1VSDA 1SKSA 3BDPA 4CCHA 4AHSA 4KO0A 2RPIA 3AO2A 4B8CA 2X6NA 4IKFA 3V6DA 1KLMA 3LP0A 1LAWA 4BDZA 1N6QA 3KJVA 3VA3A 3PY8A 1DTTA 4F4KA 5J2MA 4M3UA 3V9SA 1KFSA 3NAEA 2GBZA 3LP1A 2KFZA 3KKSA 2XRIA 4BWJA 3OYCA 4FJ9A 1IKYA 3MAQA 2AJQA 1Q8IA 2DFFA 4DS4A 4YNQA 4CE9A 4E7KA 2A1SA 5K14A 3O3GA 4H8KA 1REVA 4W5OA 4XIUA 4AH9A 1JL2A 3H08A 3LP3A 4EP4A 5HROA 3IAYA 4QAGA 3L2RA 2ZD1A 3FFIA 3RR7A 2QKBA 1EETA 3THVA 1RTHA 2FBYA 4OJRA 3NF6A 3LWMA 4N5SA 3LZIA 3V9XA 1VRTA 1GOCA 3VQ9A 3ZSVA 2QKKA 4Z4HA 3QETA 1RDDA 1BIUA 4B9TA 5DMRA 4ID5A 2Z1IA 3MEEA 1RBRA 2BDPA 5KRTA 1U48A 2NUBA 4LSLA 1S1TA 2WOMA 4CJEA 2P5OA 3ZSYA 4C8LA 1Y97A 3VQDA 3QNNA 2DFHA 3HM9A 2XO7A 2LSNA 1JXEA 2HHXA 3TWHA 2ZQBA 2F8SA 3DOKA 1MU2A 1SL0A 1N5YA 4IFYA 3AVLA 3OYFA 1XI1A 4F2RA 3S3NA 2W42A 1A5WA 4I9LA 3TAGA 4DTJA 2B4JA 4LSNA 1U47A 3SUOA 2KW4A 4C8KA 3OS0A 1YTUA 1X9MA 3EZ5A 4B9UA 3LPUA 2HHSA 1JLQA 4HUEA 3CG7A 3TARA 2HHWA 4DWIA 4I9QA 1BIZA 1RBTA 2YNHA 3AVIA 1TAQA 4IDKA 2E6MA 5T7BA 1TK0A 3C6TA 3NF7A 5DK5A 1LWFA 2HNZA 1C1CA 1RTIA 1WSHA 3DRSA 1JKHA 4JRQA 1DTQA 3HVTA 3KLEA 2HNDA 1UWBA 4PY5A 4CEFA 1J53A 4NYNA 4IFVA 3EYZA 1SKRA 3QO9A 4CHNA 2IAJA 1B9FA 2F96A 3AA3A 3HXMA 3RRGA 4RW7A 1J9AA 1RT5A 4BWMA 3K57A 4OGEA 3CM5A 3TAQA 3AVGA 3QINA 4FJ8A 2DTUA 1EX4A 1CXQA 1VRUA 3CQ8A 3RMCA 4DQSA 4G1QA 1J54A 3SUNA 4W5RA 3MXMA 4HUFA 3KLIA 4UQGA 1HYZA 4CECA 3LWLA 1L3UA 4K8XA 3HYFA 3VQ7A 1T7PA 4OKKA 2FC0A 3JSMA 1UOCA 4K8ZA 1JLFA 3MEDA 5KI6A 5J2NA 4O55A 1ZYQA 1W0HA 1KVCA 3A2FA 1NK0A 4J2AA 4C8OA 4FJIA 4N41A 5JS1A 3SV3A 3S3MA 4IBNA 1TAUA 1C0MA 3V1QA 1VSHA 3KLFA 3U3YA 3QIOA 1HMVA 5EU7A 1TKDA 1Q9YA 3IRXA 3B6PA 2XHBA 3KIOA 3V9ZA 1LV5A 3L2UA 1VSKA 3F9KA 1JLBA 3CFOA 5I42A 1L3SA 4FLYA 2BANA 3O3FA 3K5MA 4PA1A 1SV5A 4HCBA 1YTAA 4TSXA 4O0IA 3M8PA 4CHPA 2F8TA 2IS3A 2G8IA 3PUFA 4CIGA 2DFEA 2FBTA 3ZSOA 4FLXA 2HMIA 1BI4B 1RT3A 1IKVA 2Z1JA 3SI6A 1JLGA 4DU4A 4CJSA 3OYEA 4EP5A 3KK3A 3B6OA 1IO2A 1QTMA 4DTXA 4FJLA 4FZXC 3U3GA 2I5JA 4O5BA 4IG3A 4OPKA 4LD0A 3NCIA 3LZJA 3HSTB 2YKMA 3QESA 1D9DA 4DF8A 2HHVA 4KTZA 4CIEA 4E19A 2QK9A 3OJSA 1WNSA 3O4QA 2FBXA 4FM0A 1U49A 4DTPA 1NKBA 3RRHA 4CFAA 5C25A 2P5GA 2D0BA 1LWCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH2A 3HRGA 4DSIA 1BOTO 2GX9A 3IMXA 3K9KA 4MFBA 4Y1CA 1NM1A 4RW8A 5JVGL 3M6GA 2X74A 1IG8A 3G0ZA 2V52B 3TSUA 3L2WA 2P9KB 1KSPA 3S41A 5FLXO 4W5QA 4CJWA 2E20A 2HBMA 4UY8O 3SK3A 4CF2A 3AARA 3CXCM 4ZHRA 1RBVA 3D0PA 1VSLA 2QTDA 1CXUA 4AQYK 2VG7A 4ISGA 4ICLA 3SPZA 4OKJA 3O6WA 2GELA 4Z4IA 3AGRA 3DLBA 4NXNK 1L3TA 1U2VB 3H1QA 4N56A 1NK7A 4FL9A 2HBLA 4KPYA 4KHPK 1NGEA 4A61A 4FXDA 5F0XA 3CCMN 2YHBA 3AA5X 5AQIA 1ASVA 4BRGA 2E2NA 3QBXA 3SMPA 3VF6A 3ZX0A 4M3WA 4KH4A 4LH4A 3I8BA 4E7JA 2QWQA 1KVBA 4ISEA 3SQ1A 1VQ6N 3O4NA 2P9LA 4AHTA 3DXMB 3ZSXA 1F21A 4F3TA 2CGLA 2RN2A 5AQNA 4KAZA 4CBUA 4Z4EA 2VWKA 3HZ6A 4JN4A 2P9KA 3UIQA 4A2AA 3DLLL 4BREA 1KRPA 4PUOA 3O9TA 1SL1A 3LDOA 2O8FB 3EKUA 3QLHA 4ELUA 4BY9C 1B9DA 2Y1IA 5HP1A 5AQMA 4M42A 3TANA 4IG0A 2JGUA 4MLHA 4DQPA 4JKCA 4PQUA 4DTRA 4CBWA 2PYJA 2RKIA 4LF7K 4A62A 3OYLA 3QEXA 3VQ4A 4BR2A 1X1PA 1K9MO 3VENA 3RSEB 4BC2A 4HVJA 3P5JA 2YHAA 2ITGA 4B1WB 1VQNN 5IT9O 2VQFK 2KZMA 1ZBHA 1KLNA 5BRHA 3HK2A 5FPNA 2B6AA 4LF8K 3SZ2A 4IWVA 2UUBK 1LOTB 4ISFA 3S3OA 2NRWA 4DFKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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