1RNHA

Structure of ribonuclease h phased at 2 angstroms resolution by mad analysis of the selenomethionyl protein
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
151
structure length
151
Chain Sequence
LKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
publication title Structure of ribonuclease H phased at 2 A resolution by MAD analysis of the selenomethionyl protein.
pubmed rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
total genus 43
structure length 151
sequence length 151
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1990-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rnhA00
1YTAA 3O4QA 1VSDA 1QSYA 4CJWA 1C0TA 4PQUA 2YV0X 4FJXA 1KVBA 3V1QA 1L3VA 2G8WA 1J9AA 4CFDA 1JKHA 4CECA 3AVMA 4CJ5A 4XIUA 3D0PA 1WLJA 3A2FA 4AHVA 4CGIA 3PX0A 3OYJA 4IKFA 2X78A 1RT5A 3HVRA 2PYJA 1D5AA 4OJRA 1A5WA 4Y1CA 4Z4CA 5J1EA 4B9UA 1I3AA 3RRGA 4RW6A 3KD1E 1IKWA 4DTSA 1NK7A 4W5NA 4CJVA 4DTXA 3V1RA 1U47A 3MECA 3NFAA 4DF4A 2GV9A 3OYFA 1LWFA 3VA0A 1RTDA 1C6VA 3RMBA 3LPUA 3DRRA 5KI6A 1RBVA 1YT3A 1LAWA 3KIOA 5HRSA 3KLIA 3K59A 4DTUA 1HYVA 4IBNA 3NGZA 1N6QA 3WNEA 2IAJA 4CHPA 3K5LA 1HRHA 3OYIA 4KHWA 1XHXA 3AO3A 3DRPA 1S6PA 4GMJB 3NGYA 4J2DA 1B9DA 2IS3A 3AVHA 1RT3A 4FLZA 4CJ3A 3QEXA 2PY5A 3AVNA 2YKNA 1HNVA 4HCBA 4NCBA 3SCXA 1NK9A 5JS1A 4BACA 3DLGA 3T1AA 4HHTA 2G8HA 1IG9A 2WONA 3ZT4A 4CEFA 1IKXA 2ZQBA 1B92A 3TANA 4FJGA 2P1JA 1HYZA 3BGRA 4AH9A 4O4GA 4R5PA 4M3UA 3MEEA 2O4GA 4C8MA 4E3SA 3V1OA 3QNOA 3KLEA 1RDBA 3SI6A 3KTQA 2XHBA 4CEAA 1RTIA 4FJKA 4CEOA 3C6TA 1QHTA 4CE9A 3F73A 3SYZA 4CGJA 4B3OA 2DFFA 3B6OA 3I0SA 3L2WA 2HW3A 4BE0A 1VSLA 5I42A 1KRPA 4YFUA 3H08A 4CGHA 3U3GA 4CJKA 1A5XA 3AVGA 1N5YA 4FM2A 2OYQA 4WE1A 3T19A 2ITGA 3KKRA 1KSPA 1S6QA 4B9VA 4CFAA 3V9UA 1W9HA 3NH2A 1VSFA 1X9SA 1SKRA 1T7PA 2P5OA 2BANA 4DTPA 4CJQA 3NF7A 3RRHA 4FJMA 4DSEA 4I9LA 4OLBA 3LZJA 3S3NA 1HYSA 1L3UA 3TAPA 1U48A 3M8PA 2P5GA 1VRUA 4HCCA 3TAEA 1TK5A 1S5JA 3QETA 1QSSA 1RDAA 4H4OA 2KTQA 5J2QA 4E1MA 1SL0A 2FC0A 2HNYA 1NK6A 5JS2A 3ZSRA 3PY8A 2IOCA 4ELUA 4JLHA 1KTQA 4KI4A 3VQ5A 4FYDA 3VQ8A 3AVJA 1BISA 4FZZA 3WNHA 2A1SA 2QK9A 2E6MA 4M3RA 1XC9A 1NOYA 1RT6A 2Z1GA 3LP3A 4IDKA 5I3UA 1RTJA 4B08A 4F3TA 3LANA 4BDZA 3SV4A 3LZIA 1WSGA 3SUOA 1IKVA 1CLQA 4N47A 5E41A 3SUQA 4OKJA 3KKSA 3LAMA 3P83D 2R7YA 4CJSA 3TI0A 1I39A 3SJJA 5HRPA 1XWLA 3ZSXA 1NK5A 4FLUA 1C1AA 3NAEA 2HHSA 4DSIA 3V9ZA 3AVCA 3G10A 4KAZA 3M8QA 1RBSA 2B5JA 3HT3A 4W5QA 4DFMA 4Z0UA 4FK2A 3OYGA 2DY4A 4JRPA 3RMDA 2FBXA 4HUGA 3PX6A 4B9TA 2W42A 4DTNA 5T7BA 3OYLA 4CJLA 2YNGA 1BI4A 4DS5A 4QOZB 4I2QA 4I7FA 1S1UA 1RBRA 2VWJA 1ITGA 1LWCA 3ZSOA 4KKOA 1XHZA 4DQQA 1JLEA 2G8KA 2G8UA 1T05A 2OPQA 4DWIA 4NCGA 4DG1A 2OZMA 4FJHA 4KREA 3DLRA 1BQMA 3L3VA 1WSHA 1RT2A 3C94A 4GVMA 4PA1A 2IGIA 3ZT2A 5HRNA 2G8FA 4RW4A 3C95A 3HP6A 4FLYA 3P1GA 2BGGA 1ZBUA 3TAGA 1W0HA 4CCHA 3PUFA 4J2AA 2YNFA 4CF0A 4CIFA 4CGDA 3OJUA 4G1QA 2ZE2A 4ID1A 4BDPA 3AVBA 4KTQA 4K8XA 3V9XA 1RT1A 1TGOA 2ETJA 2GBZA 4GW6A 1WSFA 3NGIA 3S3MA 2HVIA 1CXUA 3OS0A 3KLFA 2HHTA 3AVIA 3PX4A 4FLVA 2YHAA 1F21A 3B6PA 3QIPA 5CY4A 3ZT1A 1J5OA 4CEQA 3CFRA 4BE2A 3ALYA 3DLKA 4CHQA 4W5OA 4FJLA 4FK4A 4M3TA 3NBPA 2DTUA 4KI6A 3HPGA 3G0ZA 3I0RA 4JRQA 1WAJA 3AVAA 3TAQA 4FVMA 1HQEA 1Z26A 4Z4HA 3HO1A 1BCOA 2D0AA 4DTOA 3HL8A 5HP1A 4C8KA 2G8IA 4DFJA 3DMJA 1T8EA 3AO5A 1TK0A 4LY7A 3V9WA 3QERA 4E7LA 3C6UA 1JLBA 4OVLA 3SPYA 4KRFA 2OZSA 4MQ3A 3LALA 4ZTJA 2E4LA 3EZ5A 3AV9A 4I2PA 2PZSA 3BDPA 4EZ9A 2X6NA 3SQ0A 3RMCA 3CYMA 4DLEA 3SUPA 2FBTA 4FJ9A 2Q3SA 5FROA 3IG1A 1JLAA 1K6YA 2XY8A 1Q9XA 4MFBA 4B9MA 1JLGA 1HQUA 5HBMA 4CK3A 3LDSA 1LAVA 3MXIA 1DTTA 1KLMA 4M42A 4DFPA 2XY5A 2B6AA 1WN7A 3HXMA 3DRSA 2Z1HA 1U4BA 1D9FA 3HM9A 1C0UA 2DFHA 3OS1A 4F3OA 4O5BA 2HB5A 3NH0A 1JLCA 1SUQA 1C1CA 4F2SA 3QINA 5C24A 1JL2A 2X74A 3QEVA 3L3UA 4CJFA 2HHUA 3MEGA 1R0AA 5FRMA 4CK1A 2HVHA 4M41A 3WNGA 2D0CA 3QLHA 4DSFA 4KTWA 1S1TA 3S3OA 4DSJA 3CM6A 1VSMA 4AHTA 2Y1IA 2OPPA 3CG7A 1ZBHA 2F96A 4EP4A 3K5MA 2DFEA 3AA5X 4W5RA 3O3FA 4AILC 3OJSA 3IAYA 3PO4A 1TAQA 4B8CA 3LWLA 4CJ4A 1A5VA 5FRNA 1RILA 3CQ8A 1VSHA 3MAQA 3L2RA 1UWBA 3KK2A 2Z1JA 5KRSA 5C42A 4N41A 3VQCA 2B4JA 1ZBIA 1TKXA 1ASWA 1LWEA 4KB1A 4OGEA 1QE1A 3K2PA 4KTZA 4O44A 4E89A 4CHZA 4FLTA 1CXQA 4ELVA 1KFDA 2KW4A 4Y1DA 5EU7A 1KCFA 3MXMA 4ICLA 1HPZA 4RW9A 4F2RA 2Y1JA 1WSJA 1Q8IA 1GOCA 2ATQA 2XRIA 4DU4A 4DTRA 3NF8A 1EXQA 4CF9A 3I8DA 2XY7A 1O1WA 3VQ4A 3T3FA 2I5JA 5HROA 3V81A 1TV6A 4IG3A 1JL1A 5DMRA 4FCYA 3K5OA 4CGFA 2RF2A 1SV5A 4CEEA 3K5NA 4E7KA 4DTMA 4JS4A 1QQCA 3RTVA 3ASMA 5J2PA 3KK3A 1U04A 5DK5A 3K57A 3HVTA 4B9LA 5D3GA 3SQ1A 1FKOA 2VWKA 3FFIA 4O0JA 1VSIA 4E1NA 4O0IA 2QXFA 2G8VA 4L8RB 2F8TA 4FZYA 4FM0A 1LW0A 3LP0A 1C0MA 1RBUA 1JXBA 3O3GA 4N56A 3IS9A 4M45A 4DQSA 3SQ2A 4CJPA 4C8LA 1WNSA 4HVJA 3SUNA 4OLAA 3ZT3A 5HLFA 3O4NA 3VQDA 4M3WA 3DYAA 1TL1A 2NUBA 4F4KA 1NOZA 4HUFA 1J53A 1ZYQA 4LH4A 4E7IA 5J2MA 4RW8A 3OYHA 3UIQA 1TKZA 3VQQA 1L3TA 1QSLA 2RKIA 3IRXA 3QIOA 1D8YA 4M3ZA 1BGXT 1C1BA 2HNDA 3QEIA 1XI1A 2IDOA 1S1WA 2WOMA 4CEZA 4OPJA 3NHGA 4DS4A 3ITHA 5HRRA 3M8SA 3KLGA 4Z4FA 3AVKA 1NK8A 4CEBA 5CZ1A 4B9NA 3SQ4A 2X6SA 4DMNA 2EHGA 3VQPA 2HHQA 4CJTA 4JS5A 4DU1A 3OS2A 1L3SA 1WSIA 1RBTA 1FXXA 4CERA 1NJYA 4E19A 3DM2A 1X9MA 3TR8A 1TAUA 1LW2A 4YNQA 4N5SA 3AA3A 1JLFA 1BHLA 3QO9A 2A1RA 1EETA 2VG6A 1DLOA 5CZ2A 3U6FA 4KHSA 1YVUA 1JLQA 4M3YA 4IFYA 1B9FA 1RCHA 1HJRA 1UA1A 3TWHA 1U49A 4I9QA 3AO1A 4LSNA 4QCLA 1GOAA 4CIEA 5KTQA 4Q5VA 1SKSA 4FW1A 3LP2A 1VSJA 1VRTA 1EKEA 3HSTB 2AJQA 1FKPA 1RT4A 3OY9A 4F8RA 4CK2A 3V9SA 3OYCA 4QAGA 3S9HA 1VK0A 2BDPA 3QEPA 4KPYA 2D0BA 3VQ7A 1RDCA 3AO4A 2P51A 4KV8A 2LSNA 1TVRA 4CF1A 4DFKA 1ZBLA 1BIUA 1D9DA 3OYMA 3M8RA 3ISNC 4FXDA 3L2UA 5K14A 3QNNA 2YNHA 5FDLA 4H4MA 3KLHA 3L2QA 4FJJA 1RT7A 1HMVA 3ZT0A 3OYBA 1TKTA 1MU2A 4CESA 4DTJA 1T03A 3V4IA 3HPHA 4KHYA 4HUEA 4UQGA 3OVNA 4AHRA 2ZD1A 4M3XA 2HHVA 2HHXA 2D5RA 1IKYA 3AVFA 4DQPA 4FJNA 4CHYA 1U45A 3ULDA 3DLBA 4FK0A 2KFNA 1S1XA 2EX3A 4FZXC 1SL2A 2OPRA 1CZBA 1YTUA 1SKWA 1BIZA 1NKCA 3K58A 3EYZA 3P5JA 1ZBFA 3KD5E 1VSKA 1NKBA 4CFBA 3KK1A 4J2BA 2YNIA 2XO7A 4NYFA 4Z4GA 4B8AB 3OYDA 3DI6A 2VG7A 2XY6A 4IG0A 1X1PA 3L2VA 2QKBA 5SZTA 4PUOA 3E01A 3CFPA 1BL3A 3KJVA 4OKKA 1RNHA 2JGUA 3ZSWA 3TAMA 3TAFA 2HHWA 4CF2A 3AVLA 3HK2A 4ELTA 3AO2A 3HYFA 3ZSQA 5CYMA 3VQ6A 1FK9A 2JLEA 4AHSA 4CF8A 5C25A 4OKEA 4EP5A 4FJ5A 1CZ9A 1VSEA 3OYKA 3NDKA 3MEDA 1TK8A 4LH5A 4NCAA 4OPKA 4CEDA 4DSLA 4FJ8A 3F9KA 2IC3A 3SNNA 3LAKA 2FBVA 4CJRA 3VA3A 4OGCA 4E7HA 1S1VA 2RN2A 1X9WA 1UAXA 4RW7A 3SZ2A 4BE1A 1NJZA 3PO5A 3VQEA 1ASUA 4DU3A 4HTUA 3RMAA 4Z4EA 2OA8A 3OYAA 4CFCA 3VQBA 4RG8A 4CHNA 2KQ2A 3HJFA 1L5UA 3NCIA 2YKMA 4W5TA 3OYEA 4BWJA 4KFBA 3HP9A 3DLEA 4FJ7A 1J54A 4CGGA 3MXJA 1NK0A 4ZTFA 2RPIA 2KZZA 1NJWA 4KO0A 1WAFA 3QESA 4LD0A 3ZSVA 1Q9YA 1S9EA 1WSEA 3ZCMA 3LWMA 3CM5A 1HNIA 4K8ZA 2FBYA 3ZSYA 2GUIA 3VQ9A 1NJXA 3JYTA 1BCMA 3PV8A 4CJUA 3SPZA 3TARA 3DOLA 3CFOA 3RR7A 1GOBA 2HMIA 2KZMA 1LV5A 5KRTA 1SL1A 1Y97A 3QEWA 4DQRA 4NYNA 4AHCA 3RWUA 3VN5A 4O55A 5SWMA 3DLHA 1UOCA 5KGXA 3VQAA 2HNZA 1REVA 3D45A 3V6DA 1TKDA 4BDYA 4H8KA 5J2NA 3TABA 3O3HA 4KHNA 3EY1A 2YHBA 4ID5A 3WNFA 4C8NA 3OYNA 1NKEA 4KB0A 1RDDA 4BWMA 4AHUA 4DLGA 4DSKA 4CJEA 2E6LA 4KHQA 3SV3A 1JXEA 2Z1IA 3NF6A 2OPSA 2KFZA 4B9SA 1G15A 1IO2A 4ZHRA 4FM1A 4N76A 4EZ6A 1DTQA 3NF9A 4LSLA 5KGWA 1S9GA 3AA2A 4DF8A 4Z4IA 3U3YA 1KVAA 3L8BA 1KFSA 2QKKA 1BI4B 1KVCA 1RTHA 4C8OA 4PY5A 3AA4A 1UA0A 4PWDA 3RR8A 4FLXA 3THVA 2F8SA 4TSXA 1IH7A 3JSMA 2BE2A 4DQIA 1BQNA 1NK4A 4FW2A 1Z25A 1EP4A 2VG5A 3LP1A 1QS4A 4CIGA 1QTMA 2O4IA 1TL3A 2PYLA 4FJIA 4Q0BA 1EX4A 5CYQA 1KLNA 1ASVA 3NH1A 4KHUA 3ZSZA 4CHOA 3HPOA 4E7JA 3NE6A 4J2EA 4IFVA 4FLWA 3DOKA 4E0DA 3LPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CE3A 3OBYA 3F2KA 4PQUA 1KVBA 1L3VA 2G8WA 4JKAA 4H0TB 4AM7A 4J8FA 3AVMA 4XIUA 1WLJA 3A2FA 4CGIA 3OYJA 4YDUC 3HVRA 1A5WA 5J1EA 2E2PA 1I3AA 1IKWA 1OH6A 4BRPA 5AZIB 3VA0A 2VGNA 2O8EB 1HKGA 1LAWA 3EKSA 4DTUA 3QB0A 5AQHA 1HRHA 3B8AX 2UXCK 4X65K 1XHXA 1VQ7N 3THYB 3NGYA 1B9DA 2IS3A 4FLZA 4CJ3A 3QEXA 1OH5A 1HNVA 4A5BA 3ATVA 3DLGA 3T1AA 3OTOK 3BZCA 4CEFA 3MN9A 2P1JA 1KC8O 3KLEA 1RDBA 3SI6A 3SMSA 4FJKA 3F73A 3I0SA 3WXMB 4BE0A 1K8AO 5I42A 1VQKN 5FPDA 4WFAL 3A8YA 3D2EB 5FPMA 2WC9A 3H08A 4CJKA 2OYQA 1S6QA 4DR1K 1E4GT 4CJQA 1WBDA 4DSEA 4I9LA 1HYSA 3GG4A 4HCCA 3TAEA 3QETA 1RFQA 3ZETB 3CCQN 2O8BA 4H4OA 5JS2A 3CETA 5AQSA 2IOCA 3ZSRA 4ELUA 1KTQA 2NRWA 3WNHA 5ADXH 4R79A 4F3TA 3SV4A 1IKVA 4BR5A 3J8AA 5E41A 4JNEA 4OKJA 2GWJA 4E1JA 2R7YA 4CJSA 2FF6A 2PFUA 4JK8A 3C6AA 3NAEA 5AQJA 4NLCA 4JKEA 2DY4A 4JRPA 4RCHA 3RMDA 2FBXA 1EWRA 3PX6A 2BUPA 3H1QA 4EFHA 3WXIA 4OPHA 1RBRA 2ASMA 1LWCA 3ZSOA 4DQQA 4CBWA 2G8UA 2Q0RA 4B1ZA 2OPQA 4U7BA 1IBKK 5HRNA 2BGGA 3VEVA 1W0HA 5GAHP 4CCHA 4J2AA 4MLEA 4CIFA 3OJUA 4GW6A 1WSFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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