3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
2FF3B 3HI0A 1MDUB 3CJBA 3H3OB 3VF4A 1XC3A 2E2NA 3D2EA 5BRFA 3H45C 3VF2A 5BPLA 3HSCA 1GLDG 1CZAN 1MA9B 3SMPA 3JS6A 4AM6A 4B1ZA 4FPBA 2P9PB 3U9ZA 1K8KB 3GDQA 4BC2A 1WOQA 4BG8A 5EVZA 3FGUA 4A61A 3CJ7A 5AQUA 5BRDA 2P9PA 4IJAA 5EY4A 1K8KA 2E88A 2QWQA 1BA0A 3BF1A 3AAPA 1NGEA 3O8MA 1V4TA 1QHAA 3WEEB 2KHOA 3OHRA 3ZETB 3VENA 3FZLA 1T6CA 5AQYA 2EWSA 3VEWA 2WUSA 1BG3A 1GLLO 3WEEA 4BRLA 4EHUA 4BR0A 3VEZA 3LDNA 3ZETA 5JLFA 3ZX0A 3B8AX 3CHWA 5AQFA 3QDKA 1Z05A 1ZXOA 2GEMA 5F0XA 4I6MB 2UYTA 3SK3A 4BR9A 3WXLA 4B1XB 1BUPA 2NZTA 2VWBA 4K43A 3O1WA 3LDOA 3H1QA 4Y0WA 5AQVA 4I6MA 5AQIA 1RGIA 3UE5A 4CZEA 2Q1NA 4BC4A 2A40A 3QFUA 2D0PA 1EQYA 1YVNA 4BRMA 4H5NA 3A5OC 1T6DA 4K25A 4FPAA 1HUXA 3QBWA 3EZWA 4XH1A 4EIAA 1QQMA 1NGDA 3LM9A 4NO7A 5KPZA 4FSVA 3RSEB 4GNIA 2QWPA 3GE1A 5E84A 2QWOA 2F9TA 4A62A 2F9WA 4B1YB 5AQHA 3G25A 4FWOA 1GLCG 5FPMA 3BEXA 3EO3A 3RSEA 3VPZA 3VGLA 2FSJA 4H0TB 4BRFA 3IUCA 3EKUA 4CBUA 3ENOA 5AR0A 3F9MA 2ZGYA 5AZJB 4EAHD 1S22A 3AY9A 5BN9A 3U8XA 5KQDA 1R59O 2Q97A 1SAZA 3WXIA 3GL1A 4BROA 3HTVA 2HF4A 5AFUH 4DB3A 5AZJA 5BRHA 4M7YA 3TU5A 3FFKB 4IWVA 5EX5A 3GOIA 2OANA 3MDQA 3H3NO 2I7PA 2Q36A 3L4IA 1DKGD 2HOEA 1ESVA 4H5WA 4BRDA 5AQGA 1NGGA 1J6ZA 1Z6RA 3A8YA 2P9NA 3DWLA 4IO8A 3L6QA 4JHDB 2A3ZA 4Z94A 2Q31A 5AFUA 4BRPA 3CJCA 2A5XA 1LCUA 4QS7A 2ASOA 4JHDA 3ZEUA 1BA1A 1E4GT 4BR5A 2CGLA 3R6MA 1S3XA 3VF6A 3FZKA 4FWKA 2D4WA 4H0XB 1ZC6A 4CZIA 3VEOA 3U4LA 3C7NB 5LJVA 3VETA 3O4WA 4O5FA 3QB0A 1HLUA 2V7ZA 5BPMA 3UKRB 2Q0UA 4BGAA 4J8FA 3FZHA 4B1VA 4C23A 4CBWA 3GBTA 1IG8A 3C7NA 3I8BA 4BR7A 1NWKA 3O6WA 2D1KA 4PKIA 3D7EO 1XQSC 5KPTA 3UKRA 1GLBG 2HF3A 1RFQA 4HTLA 4IXCA 3HZ6A 4RTFD 3W3DA 3H6EA 3HM8A 2IVOA 4EFHA 5JICA 4EHTA 2PBDA 3DXMB 4FOEA 3KHYA 1DGKN 1QZ6A 1OKJA 4JAXA 2A41A 4YDUC 3VEYA 5FPNA 2QM1A 3QMLA 3QBXA 4CZHA 3DXMA 3O5BA 3WUHA 3FLCO 3WQUA 3VEVA 3FZMA 2IVPA 4CD3A 4GY2B 3A5NC 4BC3A 3M3ZA 1DEJA 2E2OA 3DXKB 4IZ9A 1KXPA 3VERA 1ZBSA 3MCPA 1YAGA 4DHYA 2ITMA 5CE3A 1C0FA 3ATVA 4B1UB 5AQJA 3WXKA 3ZX3A 1NM1A 3DXKA 2E20A 3LM2A 4E1JA 4BRKA 3UB5A 4FO0A 1U6ZA 4B1WB 5AQTA 2FSKA 1NGIA 5AQXA 1NGFA 4WQ4C 4XEIA 1YUWA 3A5LC 1BWFO 2GUPA 5BN8A 4FWMA 4PL7A 3MN7A 4H5VA 4MO5A 3SJHA 4CJ7A 2I7NA 4K42A 2W40A 1YXQA 2GTDA 3EN9A 3I33A 2V7YA 1QQNA 4K41A 5FPEA 3CJ9A 3CJAA 2P9LB 4BQZA 5JMVA 4BRNA 5LY3A 1ATRA 1WUAA 2CGJA 4QS8A 3CI5A 4BREA 4CZGA 5LJWA 2P9LA 5BPNA 1GLFO 3LDPA 4B9QA 4H0YB 3CJ1A 1HKBA 2ASPA 2HMPA 2ZWHA 1JCGA 1ATNA 4XH4A 1BO5O 4FWSA 4HWIA 2V52B 4L3QA 3M1FA 3ZX2A 2YHXA 1ATSA 3O80A 3LDQA 3IMXA 5EXWA 2AP1A 3A0IX 3KZBA 4H0OA 2CH5A 2E8AA 5BR9A 4H0VB 3ID8A 1D4XA 2E1ZA 3JXUA 1KAYA 2ZGZA 3MN6A 2YJFA 2ASMA 4BG9A 4JN4A 4FOIA 3GG4A 4QS9A 1NGBA 2BUPA 1G99A 3W0LA 2YCHA 4AM7A 1GLJO 2CGKA 3CQXA 3O1BA 1Y64A 1TUYA 3J8AA 4PL8A 1NLVA 2QXLA 4PKGA 5KPRA 2ZF5O 2NRHA 1NGCA 2E2QA 2AA4A 2YJEA 4LC9B 1MWMA 3MN9A 3ATUA 4KBOA 2FXUA 4FWPA 2A42A 4H5TA 1IJJA 3WT0A 3DJCA 3MMVA 1SQKA 5AQPA 4BVOA 4M7XA 4H03B 3FR0A 4BR2A 1HJOA 4CZMA 4DQ8A 3IFRA 3ULEB 3HBTA 3MK6A 2YHYA 5F1XA 4BVPA 3TPQA 2YI1A 2E2PA 3U9DA 3ENHA 3D2EB 5ELZA 3WQTA 4BRQA 5ADXH 3S41A 3ULEA 3C0BA 4CI6A 2J4RA 5EOYA 3CETA 3A5MC 2DPNA 1BDGA 4FWQA 5AQSA 2FSNA 5AZIB 2W41A 3VEXA 1HX1A 1X3NA 1TUUA 4ISGA 3P4IA 2IVNA 3QFPA 5ADXA 4BQLA 4FWLA 5AZIA 2IIRA 2PAVA 2GELA 3IDHA 1E4FT 5AQOA 2P9IB 2VCPA 4JD2B 4WQ5A 3CIPA 4H5RA 5AQQA 2QWMA 2FLOA 3MN5A 5AQNA 5JLHA 1BU6O 3VOVA 4ISEA 5KQ8A 4FWRA 2P9IA 2NLXA 4JD2A 4O8KA 4RWTA 1MWKA 2V51B 5AQMA 1C0GA 1HPMA 4H0PA 3AAQA 4XH5A 3DAWA 3R9PA 5AQWA 1V4SA 1JCEA 4RCHA 1XUPO 4A2BA 4F9OA 2BTFA 4BRGA 4FL9A 3SMSA 3R8EA 1T44A 3KVGA 4DCHA 1GLAG 5B8HA 1X3MA 2QWLA 4NB4A 3BP8A 3WXJA 3UKUB 2Q0RA 3L0QA 2A6AA 1KAXA 1NGAA 1NBWA 2D0OA 1NGHA 1JCFA 3SLCA 4PKHA 2E1YA 3UKUA 4BGBA 4BC5A 1BOTO 1X9JA 4MLHA 2FF6A 1H1VA 1U2VB 1RDWX 5I9EB 2QW9A 2Q2RA 1QQOA 1NMDA 4BR4A 3AARA 1NGJA 3H46O 1U2VA 2YHWA 1Q18A 3O08A 4BRIA 1HKGA 3EKSA 2P9UB 3BF3A 4BRCA 4CD1A 2H3GX 2P9SB 4WQ5C 4MO4A 3VGMA 1HKCA 3BUZB 2QWNA 4YDUA 2QWRA 2P9UA 1LOTB 2GWKA 5AQRA 4BRAA 4CZLA 1SZ2A 2P9SA 1KAZA 5FPDA 5TKYA 3QICA 4CBXA 3D2FB 3VESA 1TYQB 4FWNA 4ISFA 2P9NB 4A2AA 3FZFA 2VYPA 4WYBA 2P9KB 5AQZA 4BRHA 4JNEA 1GLEG 3CERA 3D2FA 5E26A 1TYQA 3H1VX 4CZFA 1QZ5A 2GWJA 3FE1A 3ZEUB 2P9KA 5BREA 4MLEA 3CQYA 3EL2A 3LDLA 1P8ZA 4IJNA 4M63C 5AQKA 5F2RA 5AQLA 4CZKA 4WQ4A 4CZJA 3VGKA 3LL3A 2CH6A 3M6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FF3B 5GAHP 3SQ4A 5LMNK 1NK4A 3LZJA 1C0MA 5BPLA 4DFPA 2RN2A 1SL1A 3VTHA 1CZAN 4OPJA 3SMPA 4DLEA 4KHUA 3QEXA 3U9ZA 3GDQA 1VQ4N 3OYKA 2FBVA 3FGUA 3NHGA 4GV9A 3TAQA 1ITGA 4A61A 3CJ7A 3CFPA 2WOMA 1W9HA 1K8KA 2E88A 3BGRA 2OPSA 3HP6A 3KLHA 4Z4IA 1V4TA 1LW0A 5HROA 2KHOA 1RT2A 5CZ2A 3E9PA 1M90O 2EWSA 1JJ2M 2O8BA 3DOLA 3VEZA 1Z25A 2O8EA 3IS9A 3B8AX 3CHWA 3B6OA 4FJJA 3QDKA 1NJZA 4I6MB 2UYTA 4BR9A 5CYQA 1X9WA 3WXLA 3HXMA 1U04A 4O8UA 3LDOA 3H1QA 4Y0WA 1KQSM 1RGIA 2Q1NA 3AGKA 2XO7A 1O13A 3G10A 5I42A 3T1YK 3HVTA 4BRMA 3EYZA 3A5OC 1T6DA 4ZTFA 1HUXA 3U6FA 3K57A 3V1OA 3EZWA 4XH1A 3Q7BA 1VSIA 4CHOA 1EETA 3LM9A 4EIAA 1WSHA 3HP9A 2X78A 3OW2M 3P5JA 1ZBIA 4DF8A 3S3MA 3OS0A 5HP1A 3OYFA 1LV5A 1ZBHA 4K8ZA 1NKEA 4FZYA 2F9WA 4B1YB 2O8DA 3LPTA 1GLCG 5FPMA 3VGLA 1BL3A 4BDZA 4JV5K 2VQEK 1KD1O 2G8VA 3SAFA 1WNSA 2ZJPL 4IBNA 5KQDA 3LAMA 1IBKK 3HTVA 4HVJA 3VA0A 3DRPA 1R0AA 4W5OA 3TU5A 3KTQA 5EX5A 3GOIA 3JYTA 2OANA 3AVAA 3H3NO 3MDQA 3WNGA 2LSNA 4FLUA 2HVIA 3L6QA 1C1BA 4WFAL 3SUNA 2O4GA 1KLNA 2AJQA 4BWJA 4BE2A 4JI2K 2A5XA 4JK7A 5HRRA 1NK5A 4JKGB 5KGXA 3E9OA 4CW7B 1BA1A 4BR5A 3SQ1A 1VHXA 3OYNA 2HBKA 4CZIA 2GV9A 3LP3A 4DTOA 4HUGA 1Q9YA 5BPMA 2Q0UA 3LALA 4BGAA 3V6DA 4F8RA 3C7NA 4C1NI 3C6AA 1VK0A 3T19A 2QTDA 4H4MA 3THYB 4NYFA 4C8NA 1ASUA 3W3DA 3PSIA 3HM8A 4E7HA 1RT1A 2HHWA 2HNYA 1OKJA 4JAXA 2A41A 4YDUC 3J80O 4FK2A 2QM1A 2JGUA 3QBXA 1HYZA 4N76A 1JLGA 3FLCO 3VQDA 2IVPA 1OH7A 3CCEN 4GY2B 4KAZA 4CHYA 4CF0A 3AGRA 1XC9A 3M3ZA 5SWMA 1DEJA 4KH4A 2HHVA 3HYFA 2ITMA 2RPIA 3OBYA 3ATVA 3L2WA 1VQNN 4KH5A 4DU4A 3WXKA 4LH4A 4J2EA 1D9FA 3LM2A 4GV6A 2YV0X 3UB5A 1VRUA 2FSKA 4X65K 3AVCA 1NGFA 2YNFA 1BWFO 3NF8A 4Z4GA 4NCAA 4CK3A 3MN7A 4MO5A 3SJHA 1X1PA 5J2PA 3PX6A 4FLWA 2W40A 1BCMA 5FPEA 2V7YA 3CJAA 4BQZA 5JMVA 3SJJA 4AHUA 4BDPA 5LY3A 1W7AA 5HOOA 3G4SN 4IFYA 3CI5A 1UAXA 1L3VA 4O55A 5BPNA 2VWJA 4H0YB 2HMPA 2ASPA 4XH4A 2F8SA 1BO5O 1VQ5N 4L3QA 1Q9XA 2OPPA 2YHXA 3O80A 4LD0A 4FXDA 3LDQA 3IMXA 2AP1A 3KZBA 2UUAK 2VG7A 3V9ZA 3U3YA 3ID8A 4B3RK 4DR7K 2Y1JA 3ZSVA 1JLCA 4HUFA 3ENBA 4CGDA 3OYEA 3RR8A 3M8RA 4DLGA 3O9RA 4NXNK 3O1BA 4U7BA 5A2QO 4PKGA 2UU9K 1TGOA 1RDAA 1A5XA 2AA4A 3HO1A 1MWMA 3MN9A 3ATUA 3C65A 4H5TA 3WT0A 1YT3A 3V9UA 4FW1A 3AVLA 3KLEA 4M7XA 4CFDA 4H03B 5KGWA 1VQKN 4X62K 4PA1A 4Z4EA 2E2PA 2WFBA 4CJTA 4B3OA 3D2EB 4C1NK 4CFCA 1EX4A 3H08A 3S41A 4IO9L 3J7ZO 3ULEA 2RE2A 4KFBA 1A5WA 4PQUA 4FWQA 1N34K 5AZIB 1HX1A 3L4QA 3PY8A 3SYZA 3P38A 2D0AA 4CGIA 4FWLA 1I94K 3HPGA 2E6LA 4AHRA 1HNWK 2IIRA 5FLXO 4CHNA 1OVQA 4OGCA 1KVAA 4WQ5A 1BIUA 3DLGA 3C6UA 5AQQA 4BE1A 4AQYK 5JLHA 5KQ8A 4ISEA 5FDLA 4JD2A 1VQ6N 4OKJA 3DYAA 2V51B 3MEGA 3AO4A 2PZSA 3CM5A 3M8PA 1HJRA 3R9PA 4F9OA 1T3VA 3SMSA 3R8EA 4HCCA 1LAWA 4JKBA 1N36K 1RBTA 1RCHA 2QWLA 5B8HA 5GIPA 4NB4A 4DTPA 1L3TA 3BP8A 1T03A 3UKUB 2Q0RA 4KH6A 4O5BA 5J1EA 4KHPK 3C6TA 3NGYA 2E1YA 4FJHA 5C2DA 4KTQA 2O8FB 4DTRA 5KI6A 1X9JA 4DU1A 2DFFA 1RDWX 5I9EB 2W6LA 3AVFA 3WNEA 4CEFA 3LP1A 1NMDA 5DK5A 4BR4A 3HL8A 3T1AA 3PX0A 3NVKA 1QTMA 3ZT1A 1U2VA 4I9QA 5DM7L 3P83D 2H3GX 2P9SB 3ZYYX 4MO4A 3K0SA 3KKRA 4DR5K 4IFVA 1TK8A 2P9UA 2XRIA 4G1QA 1TYQB 4JKCA 1ZBLA 1RTDA 1QSLA 4WFNL 2VWKA 2P9NB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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