3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
2YHWA 5F2RA 4H5WA 2NZTA 2QM1A 4PKGA 4XH5A 4JHDB 1ATNA 4JN4A 2VCPA 3C0BA 2ASMA 5I9EB 1MWMA 2FF6A 2V51B 3FFKB 3BF1A 4ISEA 3FZLA 2QWNA 5LJVA 3CHWA 1OKJA 4K25A 3DAWA 1KAYA 3IDHA 2YJEA 3DXKB 4MO5A 1NGJA 5JLFA 3C7NA 3LDLA 5BN9A 1NM1A 3VESA 1WOQA 4BRKA 1NGHA 5KPZA 3CJAA 5AZJA 1RGIA 2A41A 3A5NC 3OHRA 4QS7A 3VEXA 2QWQA 2VWBA 2A42A 3D2FB 3WT0A 1C0FA 4IXCA 3KHYA 4QS8A 4Z94A 3G25A 3EL2A 3D2EB 5AQTA 2A40A 3FZFA 3UKRA 5FPNA 3GOIA 1X9JA 1GLFO 3ZEUA 1P8ZA 4BRPA 4CBUA 2FSNA 3W3DA 3SK3A 5AQIA 5B8HA 3H1QA 5JICA 3ULEB 5AQRA 3TU5A 3GDQA 5AQPA 4FWQA 2D4WA 4BROA 2Q0UA 2P9PA 3FLCO 3QBWA 1U2VA 4RWTA 1EQYA 3DXMB 4BC5A 3VF6A 3ZETA 1D4XA 4K42A 4NB4A 5BREA 5EOYA 3GL1A 3H3NO 4BRLA 5LJWA 3EZWA 5BRHA 1GLDG 2IIRA 1BUPA 2Q36A 3IUCA 3M6GA 2F9WA 4BR7A 3CJCA 1HLUA 5AQSA 3KZBA 2V7ZA 4IWVA 2ITMA 3UE5A 1QZ6A 1E4GT 4CBWA 4BRDA 3VF4A 3WEEA 3SJHA 1IJJA 4CZHA 4H0PA 3FR0A 3AY9A 4KBOA 2P9KB 3GE1A 4CD1A 4BC4A 2NRHA 1MDUB 3BF3A 1NGCA 2E20A 2HOEA 5JLHA 4BVOA 1K8KA 4EAHD 1HJOA 3P4IA 2J4RA 4MLHA 4E1JA 1R59O 3MN7A 4A2BA 4A61A 4I6MA 2GELA 4HTLA 2AA4A 2Q2RA 3WQUA 1HKGA 3DJCA 3CERA 3J8AA 4CZFA 1S22A 4QS9A 3VEVA 3CJ1A 2P9NA 5BRFA 1NGDA 4B1YB 1BU6O 4BRCA 2E2QA 3RSEA 4H0XB 3D7EO 4H0YB 4BG9A 1XUPO 1KAZA 3L4IA 3UB5A 4A62A 5KPRA 3VF2A 2IVPA 2OANA 4IJAA 3C7NB 2Q97A 3CI5A 5EY4A 3VPZA 3KVGA 5CE3A 1Z05A 3AAQA 2P9SA 5AZJB 2IVOA 2AP1A 3LDPA 5AQJA 1Y64A 1DKGD 5KQ8A 4XEIA 1KXPA 2P9LA 2V7YA 5AQOA 1GLJO 3VGMA 2QWRA 3O8MA 4CD3A 4FWMA 1BA1A 3M3ZA 3TPQA 1S3XA 3UKRB 4CZEA 3O4WA 3ZEUB 3A8YA 1BDGA 1X3NA 1XQSC 4BQLA 4J8FA 4AM7A 3O08A 3CQXA 3ZX2A 3LL3A 1GLBG 3F9MA 4IO8A 4B1ZA 5AZIA 3A5OC 2FSJA 4Y0WA 4CZIA 4MO4A 2P9PB 4HWIA 5AQUA 1U2VB 4B1XB 4WQ5A 1HKBA 3HBTA 3ZETB 4BQZA 3SLCA 2GTDA 3O80A 5AQXA 3ZX0A 3WXKA 3UKUA 4BRIA 4EFHA 2HF3A 2QWMA 3FGUA 3LDOA 4CZKA 2E1ZA 2YI1A 1BWFO 5E84A 3R9PA 4BRQA 5AQZA 1ESVA 3VGKA 4WQ5C 4AM6A 3QMLA 1DEJA 4H0VB 5AFUH 3QDKA 1E4FT 3WEEB 4BGBA 1HX1A 5ADXA 4BR2A 4BG8A 4K43A 3EN9A 4LC9B 3AAPA 3QFUA 3AARA 3IFRA 4ISGA 4O5FA 5TKYA 2A6AA 3B8AX 5AQQA 2E2PA 2NLXA 4WYBA 3JXUA 4M63C 2D0OA 5FPDA 1IG8A 4JD2A 1K8KB 2V52B 3VEZA 3ATVA 4BR0A 4BRHA 4I6MB 2CGLA 5BPMA 3CJ9A 2IVNA 2E2OA 3LM9A 3ATUA 3FZHA 1HPMA 4M7XA 5AQYA 1HKCA 1DGKN 1YVNA 4EIAA 5BPNA 2QXLA 2P9NB 3EO3A 4K41A 3O1WA 1ZC6A 1GLLO 5AQGA 5JMVA 3RSEB 1NWKA 4IZ9A 4GNIA 4H5NA 3MN6A 4PKIA 1MWKA 1CZAN 1TUYA 2WUSA 4BRNA 3H3OB 4BRGA 3U9DA 3JS6A 2CH5A 2E88A 2F9TA 4H5VA 1NLVA 1G99A 5AQFA 1JCGA 5ELZA 2P9SB 3CIPA 3VGLA 4BR4A 4B1UB 4FSVA 4CZJA 1LCUA 3A5MC 5F0XA 1TYQA 5AR0A 3H45C 2P9LB 4H5RA 5KPTA 1NGEA 2FLOA 3W0LA 4C23A 4CJ7A 4FWPA 4B1WB 3CETA 3S41A 1T44A 1QHAA 1RFQA 3VENA 3WXJA 2Q0RA 4FWLA 1V4TA 3ENHA 4FWNA 1ATSA 5AZIB 4XH4A 5AQNA 2QW9A 3VEYA 2VYPA 4WQ4C 2E2NA 1BOTO 2Q1NA 4M7YA 1SZ2A 2Q31A 2A3ZA 3VEWA 3VOVA 3WQTA 3WXLA 1GLAG 4FWSA 4RCHA 3BUZB 4FPBA 5EVZA 5BRDA 1J6ZA 1JCEA 4PL8A 3H6EA 4PKHA 4FOEA 2I7PA 4FL9A 5AQKA 2CGJA 2P9UA 2YHYA 3L6QA 3UKUB 2P9IA 1XC3A 1ATRA 4H0TB 2QWPA 4BRFA 3ENOA 4JAXA 5BPLA 4DHYA 4YDUC 3CQYA 1C0GA 4PL7A 4FWKA 4CZGA 3FZKA 3CJBA 3LM2A 2BUPA 4FPAA 4CI6A 4XH1A 2PAVA 5AQLA 4DQ8A 2EWSA 3O5BA 4BVPA 3HM8A 3I33A 4FWRA 5KQDA 5EXWA 4BRAA 3VETA 1Z6RA 4H0OA 1Q18A 3MMVA 3SMPA 3HZ6A 3HI0A 3LDNA 5FPEA 3M1FA 2HF4A 3HSCA 3MK6A 4JD2B 4F9OA 2FF3B 2FSKA 3U4LA 5AQWA 1BA0A 3WXIA 4JNEA 5BN8A 2ZGYA 4JHDA 2E8AA 1GLEG 1YAGA 5AFUA 2BTFA 3FZMA 2YHXA 2YJFA 1NGBA 2GUPA 1BG3A 4RTFD 4DB3A 1NGFA 1ZXOA 3GG4A 3EKUA 1HUXA 4FOIA 4BC2A 5AQMA 3A5LC 3VEOA 1T6CA 2QWLA 1NGAA 2ASOA 3EKSA 2ZF5O 3GBTA 3CJ7A 3R8EA 2KHOA 3DXKA 2E1YA 2ZWHA 4BRMA 3MN5A 3BP8A 1YXQA 2ASPA 3I8BA 4FWOA 1RDWX 1T6DA 1SQKA 3H46O 1QQOA 3QB0A 3QBXA 3L0QA 5AQVA 4BR9A 1TYQB 2CH6A 3U8XA 1QQNA 5AQHA 2DPNA 2GWKA 5ADXH 3ZX3A 3D2FA 5FPMA 2ZGZA 3MN9A 1MA9B 4BGAA 1X3MA 4H5TA 3SMSA 1JCFA 3D2EA 1NMDA 2A5XA 2UYTA 3R6MA 3BEXA 3ID8A 4GY2B 3WUHA 3QFPA 1V4SA 2W41A 5EX5A 4NO7A 2GEMA 3FE1A 1SAZA 3O6WA 1ZBSA 3ULEA 1TUUA 1NGIA 2W40A 4DCHA 5F1XA 3U9ZA 1NGGA 1BO5O 5LY3A 3A0IX 4A2AA 3DXMA 2P9UB 4WQ4A 4CZMA 4O8KA 3IMXA 4BR5A 2FXUA 2PBDA 2D1KA 2P9IB 4MLEA 3HTVA 4L3QA 4EHTA 3LDQA 3H1VX 3MDQA 4H03B 3DWLA 2YCHA 2GWJA 1NBWA 4EHUA 4FO0A 4CBXA 1LOTB 4BC3A 5E26A 1KAXA 2D0PA 2H3GX 3MCPA 5BR9A 4YDUA 2I7NA 4CZLA 4B9QA 1WUAA 4B1VA 1QQMA 2P9KA 3QICA 2HMPA 1U6ZA 4ISFA 4BREA 3O1BA 3VERA 2QWOA 1QZ5A 2CGKA 1GLCG 1YUWA 4IJNA 1H1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PKGA 4R79A 5HRSA 1KVCA 4JN4A 3K58A 1HNXK 3MCAB 4GKJK 2ASMA 3NH0A 1A5VA 1MWMA 2XO7A 1XHXA 2V51B 3BF1A 4NCAA 2RKIA 4E0DA 4JI3K 3G4SN 3E9OA 1YJNN 4FLXA 5JLFA 1MU2A 3Q7CA 1LV5A 2OZMA 3C7NA 2W42A 2XY7A 1WOQA 5KPZA 3ZT0A 4HUEA 4Y1DA 4DFJA 3A5NC 3CCJN 1VQMN 3AVBA 3WT0A 1WB9A 4OLBA 3TAFA 2KZMA 1RBRA 3C94A 3D2EB 3SQ1A 4DSLA 3UKRA 1GLFO 4CGFA 1P8ZA 4BRPA 4BE2A 3TSQA 4DTUA 2FSNA 3W3DA 4CJ3A 3SK3A 5AQIA 4CIGA 5B8HA 3H1QA 1ILYA 3P5JA 3AVHA 3HVRA 4NLBA 3PUFA 4FWQA 2D4WA 1JJ2M 4Z4FA 1K8AO 4RWTA 3OYEA 4DQPA 1JLBA 4DV5K 3ZETA 4K42A 4NB4A 4C8NA 5EOYA 3P1GA 3Q7BA 5BRHA 1GLDG 4FJGA 4IKFA 1BGXT 3NGIA 3SJJA 1RCHA 4A59A 3F9KA 2OCEA 5AQSA 4RW8A 4JEPA 1QZ6A 1E4GT 2YHAA 4CBWA 4BRDA 1NG9A 4ZTFA 2RE2A 3WEEA 4W5RA 4QOZB 4KBOA 1GOAA 4J2EA 4CD1A 2NRHA 3B6PA 4CHYA 3BF3A 3O3FA 2HOEA 5JLHA 4BVOA 1K8KA 4FJHA 5FROA 4F4KA 2FBTA 5K14A 1R59O 4I6MA 4OKKA 3DRRA 1NK8A 3WQUA 3DJCA 4JKBA 2YNHA 1S22A 4QS9A 2WOMA 3THXA 1BISA 4DFKA 1TL3A 1JLFA 1Q86O 1NGDA 1HQUA 3PO5A 1IKYA 3KJVA 4E7HA 4PWDA 5J2NA 2HNDA 3D7EO 3LPUA 4B3SK 4JS4A 1RT5A 4QCLA 3DLBA 2XY5A 4JI2K 1RBSA 3TARA 1T05A 1JXEA 3MEGA 4WE1A 2OYQA 3TSUA 1S1VA 1DKGD 1RTJA 4XEIA 2A1RA 1NKBA 2V7YA 3V1QA 5DMRA 3T69A 4CEAA 2QWRA 3O8MA 3CCRN 4CJUA 3PIPL 1NJIO 4CJRA 1OVYA 3OYDA 4U67L 5SZTA 2GUIA 3UIQA 4FM1A 2QK9A 3S3OA 4B1ZA 4IO8A 4M3XA 5GIOA 4IO9L 5AZIA 2YX6A 4CZIA 3JAMO 2P9PB 1VSJA 3P38A 5C24A 1QE1A 1SKSA 3SLCA 3O80A 4CK2A 1WBDA 1RILA 1VRTA 3UKUA 4DS4A 2KW4A 2OTLN 1VQ8N 4BACA 1BQNA 3LAKA 3NHGA 5E84A 3AV9A 1ESVA 4LFCK 4WQ5C 4FYDA 4AM6A 4R5PA 1UA1A 1EETA 3SUQA 4PY5A 4GMJB 3TSPA 3HL8A 3BZKA 2UUBK 2D0BA 3EN9A 4CEZA 1T8EA 3IFRA 4ISGA 2A6AA 5AQQA 1RDUA 4WYBA 3P39A 4CEQA 4LFAK 5FPDA 1U45A 2VG6A 2F8TA 4DTPA 1C1AA 4CJ4A 4E89A 2O8DB 2CGLA 2IVNA 1TL1A 2E2OA 4DU1A 3OYMA 4X65K 3TAQA 4FJXA 1HPMA 1HKCA 1DGKN 1S1UA 4EIAA 2QXLA 1VSDA 2QKBA 2X6NA 4GV3A 5GINA 3EO3A 1XC9A 3RRHA 2IS3A 1ASVA 4M3RA 5C0YA 1GLLO 4I2PA 5JMVA 3DRSA 3RSEB 4E3SA 4IZ9A 4FZXC 2WUSA 2UXDK 1VQ5N 1HMVA 4AHCA 1D9FA 1X9WA 2CH5A 4H5VA 1O1WA 4DV7K 1RNHA 4X66K 3CIPA 3KKSA 4OGEA 1JL1A 3AVIA 3BDPA 2P9LB 4FJKA 4YHHK 2FLOA 3V9ZA 2P5OA 2UXBK 4B1WB 4FLVA 4CJFA 1XHZA 1QSSA 3NVKA 1QHAA 3WXJA 4KHYA 1ATSA 4CF1A 5LMNK 4CJQA 4XH4A 2VYPA 2Q1NA 3VEWA 4DSKA 2A3ZA 3AVJA 3F5TA 4RCHA 4CFDA 3E9PA 2YV0X 2PZSA 2I7PA 4FVUA 1HJRA 2WFBA 2YHYA 3K57A 1P90A 1L3UA 1NJWA 4DV0K 4IOXA 2P9IA 4KI4A 2QWPA 1TAUA 5BPLA 3KWGA 2Z1GA 4YDUC 3SUNA 1ASWA 4FWKA 3FZKA 3LM2A 4FPAA 1BIUA 4NXMK 4DQ8A 4CIEA 4JYAK 3KK1A 3CM6A 2HHSA 4FWRA 5KQDA 3VETA 1J53A 4IEEA 5GAEP 4H0OA 2PYLA 1Q18A 3MMVA 4ZTJA 4IEIA 3QEXA 4KI6A 3H08A 1NJXA 1BIZA 2FSKA 3VTIA 4LSLA 1S72N 2HMIA 4NCBA 3BZCA 2O4GA 4JHDA 4FJNA 5AFUA 4F2SA 2HBKA 3FZMA 4YFUA 2BDPA 2YHXA 4DV4K 2YJFA 4RW6A 3AVAA 4DB3A 3SI6A 1ZXOA 3EKUA 5AQMA 3OJUA 2UXCK 1T6CA 2QWLA 3GBTA 3DXKA 3OBYA 2E1YA 1X1PA 3MN5A 4KTWA 1F21A 1T6DA 2XY6A 2Q3SA 3OYGA 1ZBUA 2NRZA 3HP9A 1YF5L 4GVMA 4KHPK 4BR9A 4DSFA 2DY4A 4LSNA 1QQNA 4HUFA 1WSIA 1WNSA 4OPAA 2HNYA 3MN9A 1MA9B 4BGAA 3HSTB 4IFYA 4BDPA 4OPKA 4C8OA 1NMDA 2A5XA 3ID8A 3E01A 1RTHA 3M5RA 4YNQA 4B9LA 5CYMA 5EX5A 2GEMA 1CLQA 3ID6A 1SAZA 4JKFA 3CPWM 3SCXA 2DTUA 4HCBA 1EO1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4CZJ A;  1TYQ A;  5AR0 A;  4GW6 A;  3W0L A;  3PX6 A;  1NK4 A;  3D0P A;  4BE0 A;  4FWP A;  3QEP A;  1ZBL A;  4CCH A;  1FXX A;  1IKW A;  1RFQ A;  2VG5 A;  5GAD P;  1TK5 A;  1V4T A;  3ENH A;  4KKO A;  4PHT X;  3VEY A;  5AQN A;  1CXQ A;  3WQT A;  3DOL A;  3G0Z A;  4WFB L;  5FRN A;  5I3U A;  3VQE A;  1T7P A;  5SWM A;  5J1E A;  3L6Q A;  1XC3 A;  3ENO A;  1J54 A;  2OZS A;  2PAV A;  4ELV A;  3QIP A;  3O5B A;  4BVP A;  3HM8 A;  4CGJ A;  4JKE A;  3HVT A;  3HI0 A;  3NGY A;  3QIN A;  1OH7 A;  3CME N;  4JK8 A;  3IAY A;  2FF3 B;  3U4L A;  1HQE A;  1J5E K;  3RRG A;  4EP4 A;  1BA0 A;  4FK2 A;  2BH1 A;  1GLE G;  1YAG A;  3CFP A;  3CFR A;  3C6T A;  4WCE L;  4B3T K;  3QEI A;  4LFB K;  1NGB A;  4KHN A;  4CGG A;  3BGR A;  3N4Q A;  2GUP A;  2WON A;  1HUX A;  4FOI A;  1Q9X A;  4BC2 A;  2I5J A;  4H4O A;  3T1Y K;  2ASO A;  4O55 A;  3SAG A;  3CJ7 A;  3QNO A;  2ZWH A;  4DTM A;  3C95 A;  4B8A B;  1X9S A;  3PSI A;  3ZSW A;  3OYA A;  1N5Y A;  4DR4 K;  1HYZ A;  4KV8 A;  1C0M A;  2WBN A;  3OYI A;  1J5O A;  3H46 O;  1QQO A;  3QB0 A;  1NKC A;  3QBX A;  3L0Q A;  2O8B A;  4GKK K;  3I55 N;  2YNF A;  2CH6 A;  3CCL N;  5AQH A;  3K5N A;  4B9U A;  2XY8 A;  3D2F A;  2ZGZ A;  1RT1 A;  4H5T A;  1RT6 A;  4CF0 A;  3BEX A;  2Y1I A;  4I9Q A;  3V9X A;  1Z26 A;  4IDK A;  4NO7 A;  2HBJ A;  4N47 A;  3OYB A;  1IG9 A;  4XIU A;  3M8R A;  1ZBS A;  3ULE A;  1Q8I A;  4KTZ A;  1NGI A;  4DCH A;  1ZBI A;  1NGG A;  5HRO A;  3KWI A;  1WSG A;  3A0I X;  1VQN N;  1R0A A;  3DOK A;  2P9U B;  2G8V A;  4O8K A;  2KKZ A;  2FXU A;  2DFF A;  3TAM A;  3V9U A;  1RT2 A;  3CC7 N;  4CW7 B;  4V19 S;  4KH6 A;  1U49 A;  4FJL A;  3AGR A;  1QTM A;  3O4N A;  2ZD1 A;  4C1N K;  2GWJ A;  2O8E A;  4IDH A;  4AHU A;  4EHU A;  1TK0 A;  4FO0 A;  4CBX A;  1YI2 N;  2HHQ A;  4YDU A;  1QQM A;  2ZM6 K;  2P9K A;  2HVI A;  3VN5 A;  4M3Z A;  4ID5 A;  1U6Z A;  4ISF A;  4BRE A;  4JKD A;  2QWO A;  1X9M A;  1N36 K;  4JI6 K;  5A2Q O;  1L5U A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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