3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
1Q18A 1SQKA 3SK3A 4FWPA 3TU5A 2P9LA 3IMXA 3WEEA 4BR9A 5AQQA 5KPRA 1J6ZA 1NLVA 2QWLA 3LDQA 2Q36A 4NO7A 4WQ4C 4DCHA 2GUPA 4BRQA 4H0VB 5CE3A 3BUZB 5AQSA 3EL2A 5JMVA 3AAQA 3U8XA 1E4GT 3D2EA 1BO5O 3HBTA 1IG8A 4XH4A 3VESA 2NLXA 5AQOA 3DXKB 3QFPA 4RCHA 5AQYA 5AR0A 5BRDA 1EQYA 5KQ8A 3SMSA 1QZ6A 4AM6A 4B1UB 5F2RA 2VYPA 4BR7A 4BQLA 1U2VA 3U9DA 4K41A 1GLFO 1RDWX 3IFRA 5AQLA 5AQNA 2I7NA 5BRHA 4BR2A 4PKHA 5AQUA 4GNIA 4H5VA 1X9JA 2E88A 2E1ZA 3DXMB 4O8KA 3CQYA 3FFKB 3H6EA 3GBTA 4FWQA 3ZEUA 1D4XA 1U2VB 2Q1NA 4YDUA 4JAXA 4CZMA 1ATRA 3ULEB 2ZWHA 1X3MA 3VF6A 4CD1A 2A42A 1SZ2A 5ELZA 2NRHA 2YI1A 3L6QA 4H5NA 2ZGYA 3GL1A 1DKGD 3JS6A 3A5LC 2P9SB 3OHRA 5JLFA 1YXQA 3C7NA 5KQDA 4PL7A 2V51B 3B8AX 4BRNA 3AY9A 4FPBA 4FWSA 3H1VX 4BC3A 1C0FA 5EXWA 2YJEA 1R59O 2HMPA 3O80A 4JNEA 1CZAN 3ZX2A 5JLHA 3O8MA 3SLCA 2WUSA 3MN5A 5F1XA 4BRAA 3LDOA 3ENHA 2QWMA 4H5WA 3MN9A 2W41A 1RFQA 3FZFA 3GOIA 2QW9A 5AQXA 1NMDA 1T6DA 1QQNA 4JD2B 4MO4A 5EY4A 3VEXA 3VERA 4KBOA 1S22A 3M1FA 5AQTA 1NGIA 2KHOA 4Z94A 3R6MA 3GE1A 4H0PA 3WT0A 4BGAA 2CGLA 5BN8A 5BR9A 1Z05A 4ISGA 2EWSA 4H0XB 3VENA 1NGCA 3O4WA 1YVNA 3AARA 2E1YA 2V7ZA 3DWLA 5FPDA 3WXIA 2E2QA 4BG9A 3QICA 4CZKA 3QBWA 3DXMA 5B8HA 1SAZA 2QWRA 3U4LA 3KHYA 4H5RA 1ZC6A 3LM9A 5EOYA 2E8AA 2ITMA 1QZ5A 2A5XA 1HKBA 4B1ZA 4PKIA 2DPNA 3MMVA 3EN9A 5KPTA 1QQOA 3UKRB 4CZIA 5KPZA 1GLCG 4BREA 4FWKA 4FSVA 3A5MC 3TPQA 3RSEA 2QXLA 4MLEA 1NGHA 3VGKA 3UB5A 4DQ8A 4F9OA 4FWLA 3WXLA 5AZIA 5EVZA 3R8EA 1BA1A 3CJBA 2P9NA 3LDLA 3WQUA 4CBXA 5E26A 2HF4A 3D7EO 4J8FA 1TYQA 4BRPA 4XH1A 4HTLA 1V4TA 4MO5A 2IIRA 3LL3A 1ATNA 4I6MB 1MWKA 1T44A 2F9WA 3EO3A 1KAZA 1QHAA 2J4RA 5AQVA 4XH5A 3O6WA 1BOTO 4CZEA 4E1JA 4IJNA 4EAHD 4RWTA 5AQKA 3EKUA 5F0XA 1MWMA 4FWRA 2CH6A 1GLDG 1XQSC 4LC9B 3CIPA 2ZF5O 2QWQA 2UYTA 5AFUH 1KAYA 3CETA 5ADXA 4BVOA 1NGEA 2P9PB 4EIAA 4JD2A 4A62A 3MN6A 1BG3A 3EKSA 4FWNA 1XUPO 4BC4A 2YJFA 4WQ5C 4PKGA 1GLLO 1C0GA 4WYBA 4H0YB 5JICA 4QS7A 3P4IA 4FOIA 4CBWA 4CZJA 3VPZA 1KAXA 4BRDA 3HI0A 4BRMA 3WUHA 2HF3A 4B1XB 4ISEA 1HLUA 5AQIA 1RGIA 2FF3B 5EX5A 2A40A 5FPMA 4BRHA 5AQHA 5LJWA 3QDKA 3ULEA 3KZBA 5AZJA 1NWKA 3L4IA 2H3GX 4XEIA 3FZLA 3O5BA 4JN4A 1JCGA 2GTDA 2W40A 4WQ4A 4BQZA 3ID8A 2GELA 5FPNA 4CBUA 3ZEUB 2CH5A 3FR0A 3I8BA 4JHDA 4A2AA 3MK6A 5AQJA 5AQRA 2P9NB 2VCPA 5AZJB 4GY2B 2Q0RA 4PL8A 4BGBA 3JXUA 2ASOA 2GWKA 5E84A 1X3NA 4IJAA 5BREA 3VGMA 5ADXH 4IWVA 3H45C 2Q31A 2OANA 3O1WA 5AFUA 1T6CA 1WOQA 2IVNA 2P9IA 4BC2A 1K8KB 2E2OA 3HM8A 3HZ6A 1S3XA 3BF1A 3WQTA 3VEVA 1BWFO 4K43A 3C0BA 3KVGA 1XC3A 3R9PA 2F9TA 5I9EB 3QB0A 2ASMA 4WQ5A 4IXCA 4CZHA 3CQXA 5AQGA 4BRIA 1V4SA 1ESVA 3CJ9A 5TKYA 1JCEA 2A41A 2BTFA 3W3DA 4Y0WA 3GG4A 3UKRA 4FO0A 5BPNA 4BR5A 1BA0A 2FSJA 3WXJA 2P9SA 2NZTA 3CHWA 5AQZA 4H5TA 1E4FT 2VWBA 3M3ZA 5BN9A 1BU6O 1G99A 4BG8A 4H03B 3FZHA 3ATVA 1TUUA 3QBXA 3QFUA 4BR4A 3H46O 3IUCA 1BUPA 4AM7A 2AP1A 1NGFA 4O5FA 2FSKA 4B9QA 3GDQA 3QMLA 3AAPA 3CERA 4ISFA 3VF4A 1ZXOA 1WUAA 4BC5A 2FSNA 1OKJA 5LJVA 3H3OB 1YAGA 3FLCO 5AQFA 2P9KB 1NGBA 1NM1A 4CZFA 4NB4A 2FLOA 5LY3A 3ZETA 4BRFA 1NGDA 1K8KA 1Y64A 1ZBSA 2A3ZA 2GWJA 3ATUA 4CZLA 4CD3A 4FPAA 2V7YA 3DAWA 3UKUA 2FF6A 2FXUA 1HJOA 2E2NA 3VETA 3O08A 3VEYA 3LDNA 3J8AA 1NBWA 3FZKA 2P9PA 2Q0UA 3L0QA 2PBDA 3DXKA 1NGAA 2GEMA 4BVPA 3A5OC 3VEWA 4RTFD 3H1QA 2P9UA 1GLJO 3A5NC 3CJCA 4H0TB 5BRFA 2ASPA 5AZIB 2V52B 2YCHA 3F9MA 3WXKA 5AQWA 2E20A 3CI5A 2Q97A 2PAVA 3SJHA 4H0OA 2ZGZA 2P9UB 4JHDB 1HKGA 3VOVA 3FGUA 5BPLA 2A6AA 2D1KA 2D0PA 1YUWA 4EFHA 3SMPA 3BF3A 3ZETB 4FOEA 2QWNA 4B1YB 3LM2A 1HPMA 2YHXA 1QQMA 2D0OA 1MDUB 3G25A 4FL9A 2YHYA 3DJCA 3FE1A 1NGJA 2E2PA 4BRKA 2I7PA 2HOEA 3FZMA 4C23A 1MA9B 4BRLA 4QS9A 2AA4A 3A0IX 4EHTA 3D2EB 4IO8A 2CGKA 4A61A 4CZGA 4BRCA 1U6ZA 4B1WB 3HSCA 1ATSA 3BP8A 4M63C 1TUYA 4L3QA 4M7YA 2IVPA 3H3NO 3CJ7A 3MDQA 1JCFA 1HX1A 4HWIA 3UKUB 2QM1A 4I6MA 3UE5A 2D4WA 4CI6A 1GLEG 2IVOA 3ZX0A 4B1VA 5FPEA 3WEEB 1LCUA 2BUPA 2CGJA 1DEJA 5BPMA 1BDGA 1HKCA 4A2BA 3U9ZA 1NGGA 5AQMA 2Q2RA 1DGKN 3ENOA 5AQPA 3MN7A 4BRGA 3RSEB 2P9IB 3S41A 3M6GA 4K42A 4FWOA 4DHYA 3CJ1A 3W0LA 3D2FB 4BR0A 1TYQB 4DB3A 4IZ9A 1GLAG 2QWOA 1KXPA 4YDUC 3O1BA 3VEZA 3BEXA 4FWMA 3VF2A 3EZWA 1GLBG 3VEOA 3CJAA 1Z6RA 2P9LB 3D2FA 3ZX3A 4QS8A 2QWPA 1IJJA 4MLHA 4K25A 3A8YA 3HTVA 3MCPA 1LOTB 1H1VA 4CJ7A 4M7XA 3C7NB 3I33A 3VGLA 4BROA 2YHWA 3IDHA 2P9KA 4EHUA 3LDPA 1P8ZA 1HUXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OY9A 3TU5A 1RCHA 4FWPA 4JK9A 3OYCA 3IMXA 4BR9A 4DKWA 4KH4A 1J6ZA 2QWLA 2YKNA 4JS4A 1QVGM 4H0VB 5C2DA 1RTHA 5CE3A 3BUZB 4IKFA 3KK2A 1E4GT 3DRSA 4JRQA 4GVMA 4OGEA 2OZSA 4I2QA 4JEPA 3K5OA 3OYGA 2NLXA 3C6HA 3DXKB 3T3FA 3DLRA 3V1QA 1ZBHA 2HHSA 1D9FA 5BRDA 4CF2A 1EQYA 3IKMA 4DLGA 2HMIA 4AM6A 4X62K 4CCHA 5F2RA 3EE9A 4BR7A 3F5TA 3LANA 3VQBA 1KVAA 3IFRA 1RDAA 1K6YA 4FJHA 5AQUA 4E19A 4GNIA 3THWB 1X9JA 2G8FA 2E1ZA 3DXMB 1Q8IA 4YY3K 3MAQA 1QE1A 1L3UA 3L4QA 3H6EA 3GBTA 4FWQA 4FJIA 1A5XA 1FKPA 1VSIA 2G8WA 3HO1A 3DMJA 4G9ZA 4J2AA 2A42A 4H5NA 4F3TA 3JS6A 2QA4N 3A5LC 1TL1A 3OHRA 3VN5A 4PUOA 1YTUA 3B8AX 5M1OA 3LP1A 4FCYA 1FK9A 4IOXA 3BY5A 2VWJA 3CCVN 3TAGA 5M1FA 3AVAA 2UUCK 1CZAN 4KHYA 4CEAA 3CCMN 2OZMA 3VQEA 3SLCA 4BRAA 3VQ5A 4OKJA 3KLEA 4CF1A 3CCSN 1BI4A 3T1AA 4DTOA 5AQXA 1IKXA 1T6DA 4YHHK 4MDAA 5EY4A 4QOZB 2QK9A 4M3XA 1C0UA 4Z4FA 2KHOA 1JXBA 3WT0A 4BGAA 5AJ3K 5BR9A 4KHNA 1Q86O 2EWSA 4H0XB 4JI1K 3THYB 4NCAA 2QEXN 3AARA 2XY6A 4IG0A 4DV6K 3H08A 2E2QA 2YX6A 3DXMA 2QWRA 3U4LA 3TR8A 3P38A 2E6MA 4H5RA 3U6FA 3LM9A 2W42A 5EOYA 1RT4A 4ILJA 1QZ5A 4PKIA 3P83D 2JGUA 3QESA 2ZE2A 3ENBA 2D0CA 3EN9A 1S1XA 5KPTA 1QQOA 3CPEA 2NRVA 4CZIA 5C10A 5GADP 3L2VA 1T03A 1KRPA 3QEPA 4FSVA 4J2BA 1BCMA 1NMNA 2QXLA 2UUAK 4MLEA 1NGHA 3VGKA 3UB5A 4DQ8A 1X9MA 3QERA 4ILGB 5AZIA 1BA1A 3LDLA 4CBXA 4JLHA 5E26A 4K8XA 3PSFA 3KKSA 4E0DA 3ZT0A 4N76A 4AQYK 4HTLA 3MCAB 3BZKA 4M3TA 1ATNA 1KC8O 3DLGA 1EETA 1NU0A 3EO3A 5AQVA 3T7ZA 3DLLL 1YJNN 4XH5A 3PX6A 3BZCA 1OH7A 4IJNA 3SV3A 5IT9O 4OVLA 5AQKA 4BE1A 1N33K 3SQ1A 1MWMA 4NLBA 3LZIA 2CH6A 1GLDG 3OS0A 3CIPA 2ZF5O 4DV1K 3K9JA 2OYQA 2UYTA 3CETA 1NGEA 4JD2A 4FWNA 4EP5A 3V9UA 1XUPO 1KVCA 4Z4CA 1C0GA 4H0YB 4E3SA 3P4IA 1Q9XA 4N5SA 3DI6A 3PIPL 4CEDA 3O4QA 4K0KK 3HK2A 4LF7K 2G8VA 2HF3A 2EX3A 3V9ZA 2HW3A 2UXDK 2A40A 5FPMA 4HUGA 3KZBA 5AZJA 1NWKA 3SPYA 3ASMA 4XEIA 3O5BA 4JN4A 4LF8K 3VQPA 4JRPA 4WQ4A 4BQZA 3SAHA 4DS4A 4JHDA 5C2FA 3MK6A 4W5RA 5AZJB 4GY2B 3SUOA 4PL8A 3S3NA 3NCIA 3TARA 1A5VA 4Z4HA 2ASOA 2YNHA 4M45A 2NRXA 3CM5A 5HP1A 4IWVA 2D0AA 2YKMA 2Q31A 1RT3A 2OANA 3O1WA 4CJVA 2P9IA 3IAYA 3TTCA 3V9XA 3NVKA 1S3XA 2XHBA 1ILYA 4CJ5A 1VQPN 1YITN 3OS1A 3QB0A 1XWLA 4WQ5A 2HVIA 3HPHA 3VTHA 3LWMA 1VAZA 4BRIA 4CK2A 4CERA 2IC3A 4CEQA 4FJ7A 3KWGA 1ASUA 3LPUA 2A41A 3W3DA 4HUFA 1NK0A 4Y0WA 3UKRA 2KW4A 5BPNA 3CCUN 3TSUA 5AQZA 5CZ2A 3E9LA 3PLAA 3ZSWA 5SZTA 4W5OA 4JI2K 3JAMO 2VG6A 1XMOK 4PWDA 3IUCA 4CF9A 4FJMA 4H4OA 3V1OA 1J54A 3TSPA 4FW2A 4FLVA 4FJKA 4B9QA 3LP2A 4ISFA 2WTUA 2HHHK 1WUAA 4M3YA 2Q3SA 3H3OB 3AO5A 1IBMK 5AQFA 4FK4A 4KTWA 5HRPA 3AGKA 2O8DB 1RT1A 1E3MA 2A3ZA 2GWJA 4CJTA 4ZTJA 4O8UA 4BDYA 1MU2A 1T3VA 1NG9A 3QLHA 1Q7YO 5GAGP 4O4GA 1VQON 4FK2A 3J8AA 3EEQA 3FZKA 3RVCA 4HHTA 4RG8A 4A5AA 4EZ9A 1NGAA 3RWUA 3N4QA 1FW6A 3R3LA 5FRNA 3TTFA 4ILHA 1RTJA 3THXB 2P9UA 1GLJO 2IOCA 4F4KA 3ITHA 3CJCA 4YOVA 3QEWA 5CYQA 3U3YA 3O9QA 5AQWA 3J81O 1FJGK 2E20A 3NGIA 2PAVA 3SJHA 4H0OA 4CFBA 1DTTA 2HNDA 2OPQA 1HKGA 3VOVA 4CJKA 4OPHA 2D0PA 4OO1J 1U49A 4PQUA 3K59A 2D0BA 1MDUB 3G25A 4FL9A 5HBMA 1RBUA 2E5LK 3I55N 3FE1A 4A59A 3TAMA 3FZMA 1KFSA 4EZ6A 1MA9B 1RBRA 1XC9A 1W9HA 4HUEA 2XO7A 2CGKA 4FJGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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