3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
3CQYA 3HBTA 2ASMA 1NGFA 1BWFO 3L4IA 4BVPA 5AZJA 3O1BA 4K25A 4EIAA 2FSJA 3KZBA 5JLFA 2PBDA 3FR0A 4H03B 5AQOA 1YAGA 4JHDB 5FPMA 2Q97A 2YHWA 3FZMA 3O8MA 2NZTA 2YJEA 2QWMA 3QB0A 4NB4A 3BP8A 5AQIA 3WEEB 4DHYA 4GY2B 1QQOA 2QWRA 3FE1A 4RWTA 5AQMA 4CZJA 2A41A 1DGKN 1NWKA 5EXWA 4H0PA 3ENHA 3VPZA 1XUPO 4CZKA 3LDQA 5BRHA 4FWSA 1Q18A 2V52B 3O80A 4DCHA 1KXPA 2P9UA 4FOIA 2QW9A 2W41A 4IJAA 4BQLA 1GLDG 1NGCA 1CZAN 2ZWHA 3AAPA 4MO4A 2GUPA 4H5WA 3QFPA 4NO7A 2QXLA 4BROA 2QWQA 3L0QA 1V4SA 2EWSA 4IXCA 4FWOA 1NGEA 5AFUA 4PKHA 3H46O 4E1JA 2QWOA 3DWLA 4EAHD 3VF4A 4FO0A 1K8KB 3H1VX 4A61A 4BRKA 2NLXA 4DQ8A 2UYTA 3SMSA 4I6MA 3R8EA 2GWJA 5BPMA 4A62A 3UKRB 1J6ZA 3HTVA 2Q0RA 2OANA 3U4LA 4BVOA 4EHTA 3ZETB 3UE5A 4BRLA 1TYQB 3MN5A 5AZJB 5E26A 1MA9B 2HOEA 3BUZB 1SZ2A 4LC9B 3SJHA 3UKUA 4BRHA 5AFUH 1HJOA 4K42A 3U8XA 4H5VA 3A5LC 4BR4A 3I8BA 2D1KA 4CBUA 1HKBA 3QFUA 4C23A 3S41A 3ULEA 3LM2A 4AM7A 2Q36A 2P9SA 3C7NB 1KAYA 3TPQA 1KAXA 5E84A 1MWMA 3VF6A 1YVNA 2Q1NA 2AP1A 3WXIA 1T6DA 2GEMA 4FSVA 4B1XB 3CJ7A 3LL3A 2FF6A 2P9UB 1RGIA 3A0IX 5KPTA 2V7ZA 5AQYA 3U9ZA 5TKYA 3KHYA 5BPNA 3BF1A 3VENA 5FPNA 4MLEA 5AQQA 2QWPA 2P9PB 5AQXA 3L6QA 3D2FA 2P9KA 4FWNA 5AQPA 4FWPA 3H1QA 3MK6A 4FWLA 2J4RA 1K8KA 3VEYA 2CH5A 3MDQA 5BN8A 5ELZA 5JICA 1HKCA 3AAQA 1BA1A 4CBWA 4AM6A 1S3XA 1OKJA 4BC4A 4BGBA 3TU5A 2A6AA 4PL7A 5AQSA 1Z6RA 1E4GT 4CZEA 2QWLA 5LY3A 3B8AX 3SLCA 4A2AA 5LJWA 3ZETA 3VF2A 4I6MB 3CERA 4F9OA 3CQXA 1TYQA 4JD2B 1HPMA 1S22A 2FXUA 1XC3A 4FPAA 4Z94A 2A3ZA 1GLAG 3QMLA 4XH1A 3MMVA 3GOIA 2E88A 2IIRA 2E20A 4FWRA 2IVOA 3UKUB 1GLEG 3FLCO 4BR0A 1IJJA 2GELA 3P4IA 4H0YB 4M63C 3C7NA 3MN6A 3ATUA 3ULEB 1BUPA 3UB5A 3HM8A 2GTDA 4XH4A 1NMDA 3FZKA 2P9SB 3GDQA 4M7YA 5I9EB 3CJCA 2I7PA 3O1WA 2FSKA 3CJ9A 4H5RA 3DXMB 3AARA 4IZ9A 3HI0A 3VOVA 1HLUA 4WQ5C 3U9DA 2P9PA 3O5BA 1BDGA 2QWNA 3EZWA 3WXJA 4CZGA 4PKGA 4JN4A 2HMPA 4PKIA 4XH5A 4MLHA 5FPDA 1P8ZA 1NGAA 3D2EB 4BRPA 2I7NA 1X3MA 2YJFA 1NGDA 5EVZA 3A5NC 1HX1A 1NGBA 2FLOA 3DAWA 3R9PA 4BRIA 3FZFA 2F9TA 3D2FB 2P9KB 2ZF5O 1V4TA 4FL9A 4H5NA 4ISFA 1Z05A 5AQKA 3FZLA 4BRNA 4HTLA 3EKSA 4L3QA 1BO5O 4XEIA 3VEZA 5BREA 2CGLA 1NGIA 2ZGYA 2ASOA 4JD2A 5F0XA 5AQVA 2AA4A 3QBXA 2HF4A 5B8HA 1BA0A 1H1VA 2D0PA 2YHXA 3O6WA 5AQRA 2P9IB 2E2PA 5BPLA 1SQKA 4BRDA 1ZBSA 2D4WA 1GLBG 2E2NA 4CZHA 3ZX0A 4BRGA 3R6MA 2IVNA 4MO5A 5AQFA 4B1ZA 1LOTB 5EY4A 1ATSA 2E8AA 3IDHA 3CI5A 1HKGA 2ASPA 3EN9A 4FWKA 1BU6O 4CZFA 3DXKA 4WQ4C 5FPEA 3LM9A 4IO8A 1WOQA 3FZHA 2YI1A 3EKUA 5BN9A 5KQ8A 4B9QA 3BF3A 4PL8A 1QZ5A 1U2VA 4CBXA 1JCEA 5ADXA 3DXMA 4BC5A 5EOYA 1EQYA 4QS9A 4O5FA 2ZGZA 3VESA 3VGMA 3H3NO 3CJ1A 5AZIA 3OHRA 1ZC6A 3ATVA 4BR9A 3D2EA 5CE3A 2VYPA 3A8YA 3FGUA 4K43A 1JCGA 2CGKA 1NBWA 4KBOA 4K41A 4FPBA 4WYBA 4B1WB 3WXKA 1QQNA 3VEVA 4YDUC 5KPZA 4FOEA 3ID8A 3VEOA 3WQUA 4BGAA 3SK3A 1T44A 3ZX2A 1GLCG 5BR9A 3WT0A 2YCHA 3BEXA 2P9IA 5AQUA 4RTFD 4CJ7A 2W40A 1G99A 2E2OA 4BG8A 5AR0A 3ZEUA 4CD1A 4B1UB 1TUYA 3DJCA 2V7YA 4CD3A 4H0OA 5KPRA 3GG4A 1GLFO 1ZXOA 4RCHA 5AQJA 4ISEA 3GL1A 1C0FA 2BUPA 3DXKB 1YXQA 1YUWA 2F9WA 1LCUA 4H0TB 3CHWA 3LDPA 1GLLO 5AQWA 3QBWA 3EO3A 3WQTA 1DKGD 2VCPA 1NGJA 1SAZA 1D4XA 3AY9A 1U2VB 3CETA 1C0GA 4FWQA 4QS8A 5LJVA 3IMXA 1ESVA 5JLHA 4BRMA 2PAVA 4H5TA 3H3OB 2WUSA 5AZIB 1X9JA 5AQHA 3CJBA 3VGLA 5AQNA 1BG3A 2H3GX 3VGKA 4CZIA 3F9MA 2P9NB 2P9LA 1XQSC 2Q2RA 1NGGA 2Q0UA 3KVGA 4BRQA 3I33A 3GE1A 1RFQA 4HWIA 3IUCA 4ISGA 3JS6A 3J8AA 2D0OA 4Y0WA 3RSEB 1R59O 2IVPA 4WQ4A 5AQZA 4B1VA 3CIPA 3H6EA 2NRHA 4BC2A 4BC3A 3LDOA 1U6ZA 5BRFA 5AQGA 4QS7A 3A5MC 3M6GA 3M3ZA 3ZEUB 4H0XB 4J8FA 2VWBA 1ATNA 2FF3B 2Q31A 4EFHA 3VERA 2YHYA 3FFKB 4IWVA 1HUXA 2HF3A 3MN7A 2FSNA 3EL2A 3IFRA 3GBTA 1MWKA 2A42A 4BR7A 5EX5A 1QZ6A 1JCFA 2E1ZA 4JHDA 4O8KA 2ITMA 4BRAA 4BRFA 4GNIA 1ATRA 1GLJO 4H0VB 1RDWX 5F2RA 3MN9A 3WEEA 4BR2A 3WXLA 3HSCA 4YDUA 5JMVA 3CJAA 1T6CA 4A2BA 5KQDA 3G25A 4B1YB 1NM1A 1Y64A 5F1XA 4FWMA 2P9NA 1TUUA 3O08A 1BOTO 2A5XA 3M1FA 4BREA 4BR5A 4CZLA 3LDNA 3VETA 2A40A 4JNEA 2P9LB 2DPNA 1QQMA 3RSEA 2BTFA 2CH6A 3ENOA 3W3DA 2E2QA 1E4FT 4EHUA 4M7XA 2CGJA 5ADXH 4IJNA 2GWKA 2E1YA 1NLVA 3WUHA 1KAZA 3HZ6A 3O4WA 1IG8A 1QHAA 3VEXA 4BG9A 1MDUB 5AQLA 3QDKA 3W0LA 3C0BA 2V51B 4BQZA 4CZMA 4JAXA 2QM1A 2KHOA 5BRDA 5AQTA 3SMPA 3MCPA 3H45C 3JXUA 4BRCA 3VEWA 1NGHA 3A5OC 3QICA 3UKRA 1WUAA 3D7EO 4DB3A 3LDLA 4WQ5A 1DEJA 3ZX3A 1X3NA 4CI6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW6A 1S1UA 2ASMA 1NGFA 1BWFO 1SV5A 2XY5A 4DQIA 3U6FA 4QCLA 5JLFA 2HSTA 5AQOA 2D0BA 3BZKA 1NK9A 5FPMA 2Q97A 1RBTA 3FZMA 1TK0A 3KLHA 1LWFA 3IG1A 3VQ9A 3CCUN 1ASVA 4JEPA 5DMRA 4GY2B 1IKXA 1NK7A 3EY1A 3CM5A 3VQ5A 4WFBL 4MDAA 3JSMA 1DGKN 2VG6A 4CIGA 4H0PA 3ENHA 1S9GA 3SJJA 3SV4A 3LDQA 4JI0K 3HSTB 3M8SA 1Q18A 3OW2M 1KXPA 3F2KA 4DTPA 4BQLA 2O4IA 1GOBA 1NGCA 3Q7CA 1CZAN 2GUPA 2OZSA 5AJ3K 3QFPA 2VGNA 4O55A 3OYIA 2KLAA 4NO7A 4B9VA 1HQUA 4BROA 3CPEA 1NOZA 3SV3A 4FJ8A 5AFUA 1NGEA 1FKOA 5DM6L 1JLGA 4DR3K 4EAHD 1K8KB 1KTQA 3H1VX 4A61A 1SKSA 4MQ3A 1Q7YO 2KTQA 2UYTA 3SMSA 3R3LA 3NF8A 4I6MA 5BPMA 4C8KA 1IBMK 1J6ZA 3AO2A 3HTVA 3ZETB 3UE5A 1L5UA 2VWKA 4DR4K 2E4LA 4FLYA 3V1OA 2HHTA 4KHQA 1MA9B 2HOEA 2Z1HA 5JS1A 3OJSA 4C1NK 3WNHA 2HHXA 3SJHA 1UA1A 5AFUH 2YKNA 3A5LC 4BR4A 2D1KA 4CBUA 4C23A 4XIUA 1RILA 4F8RA 5FLXO 1KAYA 3LAMA 4H8KA 4GKKK 1T3VA 3L3UA 1G15A 2ZE2A 3B6OA 2Q1NA 2WC9A 1NJZA 2GEMA 4OLBA 4OKJA 3CJ7A 1EXQA 2FF6A 3A0IX 1GOCA 4FZYA 3E01A 3KHYA 3VENA 3OYEA 1CZBA 4KHWA 2XY6A 3J7AP 3K2PA 3D2FA 4IBNA 4FWPA 4K0KK 3MDQA 3QERA 3SAHA 4AM6A 4BC4A 3O3GA 2A6AA 3R1XA 4U67L 1Z6RA 4CJ5A 5LJWA 2YNFA 4WF9L 4I6MB 3D45A 3M8QA 2X6NA 3CQXA 3I0RA 1HPMA 2OCEA 2DTUA 1XC3A 2OA8A 1HJRA 1GLAG 3RMDA 3QMLA 3E9OA 2UXBK 4CGGA 4CFDA 3QEPA 1RT4A 2RHKA 3M5RA 4EP5A 3NAEA 3OS2A 1HNVA 4FJ5A 1GLEG 1IJJA 4M63C 1VSLA 3C7NA 4FLUA 2G8UA 1S1VA 4CJLA 1BUPA 3HM8A 3FZKA 4Q5VA 4DV4K 4M7YA 1BL3A 2GUIA 4FJGA 2I7PA 3L2VA 3DYAA 2FSKA 4CK1A 4JKAA 3IAYA 3E9PA 1HLUA 2HHHK 4MFBA 3EZWA 3WXJA 4CZGA 4JN4A 1JLAA 4PKIA 5M1KA 3PIPL 2OTLN 4BRPA 4BE2A 2P1JA 2YJFA 4CW7B 3J81O 3A5NC 3DAWA 2KFZA 4R5PA 2KQ2A 3D2FB 4DQQA 4LF4K 3DRRA 3LALA 4X65K 4BRNA 4FJJA 2VG5A 2OPRA 3ISNC 1IV0A 1ZBIA 3MECA 4DR6K 4L3QA 1BO5O 3VEZA 1YT3A 2ASOA 5F0XA 3CMEN 5FRMA 4YOUA 3EEQA 3V9SA 3DLKA 2OPQA 2O4GA 2D0PA 1NJWA 2P9IB 4FJLA 1SQKA 4DR5K 2BE2A 4DTUA 4CJTA 1J54A 3ZX0A 1EETA 4FLVA 4B1ZA 1LOTB 5EY4A 1W0HA 1ATSA 1HKGA 4FWKA 1J5EK 2IGIA 3J7ZO 4CZFA 1OH6A 4M3TA 3AVNA 4EZ9A 3RMBA 4C1NI 1HNZK 1B9FA 3U3YA 1CXQA 4BACA 1X9MA 1L3SA 5FROA 3K9JA 3DXMA 5EOYA 4QS9A 2IAJA 2DFFA 3CJ1A 3OHRA 4DG1A 5DK5A 4RW9A 2ETJA 2O8CA 3FGUA 2CGKA 4JS5A 1NBWA 4B9SA 4LH4A 4KBOA 4BDPA 1IKVA 4B9LA 3OYDA 4OO1J 4B1WB 3THXA 3F9KA 4CGJA 1EP4A 3LP0A 1RT6A 3HJFA 4LF9K 4B9UA 1JJ2M 3ZX2A 5HRNA 1NK8A 1XWLA 5LMUK 4HTUA 4O0JA 4KTQA 4CD1A 4NCGA 2V7YA 1C0TA 4OVLA 3ZSVA 1S1TA 3V1QA 2FBYA 1VK0A 5GADP 3L8BA 1U04A 2WOMA 3SCXA 4B9TA 1YUWA 2F9WA 4E7JA 4V19S 4BE1A 3SBTA 4J2BA 1GLLO 4CEFA 3KLGA 1FW6A 3EO3A 1SAZA 4X64K 1X9SA 1NJXA 3M8PA 4DQSA 4KTZA 2E5LK 3SQ2A 4IKFA 2NRVA 5JLHA 4KV8A 3H3OB 1X9JA 3G71N 5BR8K 3TAMA 5AQNA 3VGKA 5CYMA 3ULDA 1TKTA 3L3VA 3O9SA 1RBRA 3K59A 4FJXA 3GE1A 4HWIA 3I56N 3J8AA 5HBMA 3THXB 2VQFK 1NK6A 1R59O 3TANA 3MEGA 4CJQA 3AVHA 4ZTFA 4KTWA 2YNGA 3RTVA 2NRHA 1T8EA 3LDOA 4DR7K 1U6ZA 5J2PA 3V4IA 3AVJA 5AQGA 1TL3A 3ZSZA 2KZZA 1FK9A 4KKOA 4JI4K 1QSLA 2Q31A 3DLLL 3ZSXA 4Q0BA 2XRIA 2HF3A 4IFYA 3IFRA 3QNNA 4PQUA 3GBTA 3DOLA 3AVBA 2A42A 3OYKA 1QZ6A 3BDPA 3QEVA 1KC8O 2ZQBA 3DLGA 1RDBA 4H0VB 3MN9A 3WEEA 5JS2A 4BR2A 3WXLA 3SBGA 5HP1A 4CJWA 3LAKA 3AVGA 2UXDK 4CESA 4B1YB 3T19A 3NE6A 3O08A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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