2A40A

Ternary complex of the wh2 domain of wave with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 120
structure length 361
sequence length 362
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a40A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a40A04
3D2EB 3FZLA 2YCHA 4CZHA 4DQ8A 2NZTA 4CBUA 3VESA 1HKBA 4BROA 4BC2A 1NMDA 5KQDA 2V7YA 3MN9A 4NB4A 1LOTB 3R8EA 4BC4A 3O08A 5EOYA 3UKRA 2P9NA 1X3NA 4MLEA 3TPQA 2H3GX 2FSNA 5AQHA 1HKCA 5EX5A 3CQXA 2ASOA 1NGEA 4FPBA 3HM8A 1NGCA 3KVGA 4BR2A 3QB0A 1T44A 3QFUA 3CERA 3CI5A 4M7XA 2DPNA 3H1VX 1GLEG 5AQKA 4CZMA 2YI1A 5EXWA 3LDQA 3SMSA 1YUWA 1NM1A 2V51B 3ZX2A 2E1ZA 3M1FA 4K42A 4BR0A 3QBWA 3D2FA 3GL1A 1IG8A 3F9MA 3M3ZA 4WQ5C 5AZIB 1E4GT 4QS8A 4L3QA 2NLXA 1ATNA 5BN8A 1ATRA 4AM7A 4JD2B 5AR0A 2P9IB 2P9LB 3O80A 3CJAA 3FZFA 4FWNA 2E2OA 3GE1A 3JS6A 4H0XB 4Y0WA 4H0TB 3C7NA 1NGIA 3EL2A 3MK6A 3UB5A 1QQOA 2QWNA 3FFKB 4ISFA 3LM2A 1V4SA 4BVPA 1HJOA 3WUHA 4IZ9A 3AARA 5F1XA 4BR7A 2A6AA 5AQUA 4FWLA 3DXMA 4HTLA 4M7YA 4PL8A 3FLCO 3LDOA 5AQMA 4A2BA 4CZJA 2IVOA 4H0OA 1S3XA 4CZKA 4LC9B 4BGAA 1SZ2A 5AZJA 3FR0A 4CZIA 4DCHA 3GBTA 3U4LA 2QWLA 3ID8A 1R59O 3R9PA 1GLCG 2PBDA 1SQKA 5AQYA 3DWLA 3DAWA 4MO5A 3KZBA 4O5FA 3LDNA 5AZIA 1JCGA 4BC3A 1TYQA 3SJHA 4C23A 1D4XA 2P9LA 2Q1NA 3ULEB 2A40A 4CI6A 2ITMA 4PKIA 2BTFA 5JLFA 4BRKA 3CJBA 1MWMA 3VETA 2VYPA 1QQMA 3FZMA 1EQYA 4QS9A 3VENA 5JLHA 3FGUA 1XC3A 1ATSA 2D0OA 3BUZB 4B1XB 1DEJA 2E20A 2AP1A 3I8BA 3QFPA 3O5BA 4A61A 2I7NA 1GLBG 2ZWHA 4JHDA 3B8AX 1QQNA 2EWSA 5AQVA 3VGKA 5AQGA 3U8XA 3LDLA 5E84A 3ENHA 4IO8A 4B9QA 3L4IA 1YVNA 5LJWA 2P9PB 2QXLA 3AY9A 3VF6A 4BQZA 3RSEA 1T6DA 1BUPA 1GLLO 1MWKA 3TU5A 3W0LA 1KAZA 2E2NA 3WEEA 5BRHA 1NGJA 5KPZA 2QWRA 1BOTO 3A5OC 4ISGA 2QWMA 4ISEA 4B1ZA 1U2VB 4IJNA 1JCEA 1KAXA 2Q0UA 2YHYA 3L6QA 1DKGD 2A41A 4H5VA 4PKGA 1BU6O 3ATUA 4H0YB 5FPMA 4EAHD 5FPDA 2GTDA 2CGLA 3UE5A 1MDUB 5TKYA 3FZHA 4IXCA 5AQNA 2QW9A 2GELA 1XUPO 2A3ZA 1GLDG 3O6WA 2E2QA 3A5NC 1JCFA 1X9JA 2E1YA 3DXKB 3WXKA 4FWQA 2Q31A 4CZFA 2D4WA 1MA9B 4O8KA 2V52B 2FLOA 1HKGA 5AQIA 5BRDA 1GLFO 4K41A 3CHWA 3MDQA 3VEZA 3IUCA 1QZ5A 3R6MA 2P9PA 2FF3B 2FF6A 5CE3A 2VWBA 1XQSC 2P9SB 5I9EB 4A2AA 3IMXA 3P4IA 2Q97A 3WQTA 2ZF5O 4XH5A 2GEMA 4FWOA 4F9OA 4NO7A 2VCPA 3VOVA 1T6CA 3VERA 5AFUA 3D2EA 1WOQA 3MN6A 1U2VA 5ADXA 1NGDA 4B1WB 4FWPA 5AFUH 1BWFO 2ASPA 3VEOA 4CZGA 4CBXA 5F0XA 2E2PA 3CETA 3GOIA 3HTVA 3SK3A 1U6ZA 4H5TA 2P9KB 3O8MA 4XH1A 2OANA 3HI0A 4BRCA 3HBTA 5FPNA 4BRGA 2J4RA 5EY4A 3IDHA 4EIAA 1Z05A 5AQOA 1NGBA 4EHTA 1NBWA 1HX1A 4FOEA 3SMPA 3HZ6A 1V4TA 5AQJA 3U9DA 3G25A 4BRFA 1TUUA 4CBWA 3WXJA 3ZETB 4JD2A 3WXIA 1LCUA 2GWJA 2P9IA 5BR9A 1BG3A 3LL3A 2D0PA 5LJVA 2ASMA 3BF1A 4CZEA 5BPLA 2KHOA 3ZX3A 4BRIA 3MN7A 4QS7A 1CZAN 4BRNA 3H3OB 1K8KB 4WYBA 4DHYA 4RWTA 3UKRB 3WXLA 3EKUA 1TUYA 2PAVA 4CD3A 2YJFA 3CJ7A 1SAZA 3AAPA 2CGJA 3D7EO 4WQ4A 4KBOA 3A0IX 4BR9A 4BRLA 4MO4A 3WQUA 4FPAA 3LDPA 3FZKA 1WUAA 3VEWA 3EN9A 5KPTA 2HMPA 3H46O 4YDUA 4BRAA 2WUSA 1NGGA 4FL9A 3ZEUB 3CQYA 1DGKN 2I7PA 3W3DA 3I33A 4GY2B 2W41A 3D2FB 2QWQA 2ZGZA 3IFRA 2D1KA 1ZBSA 5JMVA 1BA0A 4BREA 4AM6A 4A62A 5AQPA 2Q2RA 1RGIA 3A5LC 3ULEA 4EFHA 5KPRA 5AQXA 5F2RA 3BP8A 5ELZA 4FOIA 3C7NB 4FWSA 3O1WA 4FO0A 1BA1A 1HPMA 1Z6RA 4B1UB 5AQQA 3BEXA 4M63C 4H5RA 2YHXA 5FPEA 3DXMB 5AQTA 1K8KA 4BG8A 4MLHA 4BR5A 2GWKA 1S22A 3MCPA 4BGBA 2W40A 2CGKA 5E26A 2HOEA 3H45C 1Y64A 5AQWA 3HSCA 3J8AA 2CH6A 3H1QA 2A42A 4HWIA 1GLJO 5AZJB 1P8ZA 4IJAA 4PKHA 3UKUB 4CZLA 2AA4A 4DB3A 3ENOA 2IIRA 2NRHA 3H3NO 4Z94A 1BDGA 4FWRA 3ZX0A 4XH4A 2F9TA 2FSKA 5BRFA 4IWVA 5AQFA 5AQRA 3SLCA 3ZEUA 4BRQA 3CJCA 1NGHA 2UYTA 2FXUA 1QZ6A 4K43A 3O1BA 1TYQB 1KXPA 5ADXH 4JN4A 4FWKA 1KAYA 3U9ZA 2Q36A 5BREA 3A8YA 5EVZA 4B1YB 4RCHA 1H1VA 1HLUA 4E1JA 2CH5A 2GUPA 3CIPA 3CJ1A 3MMVA 2YHWA 4WQ5A 4PL7A 1X3MA 4BQLA 1RFQA 4JHDB 1NWKA 1GLAG 2F9WA 2Q0RA 5AQLA 3DXKA 1YXQA 2P9UB 3GG4A 4CJ7A 2BUPA 3DJCA 1QHAA 2E88A 4EHUA 3A5MC 4I6MB 1NGFA 4J8FA 5JICA 3RSEB 4JNEA 2HF4A 3L0QA 4FSVA 2P9SA 4H5WA 2QWOA 3UKUA 3WEEB 3EO3A 4XEIA 3GDQA 4JAXA 2QWPA 3M6GA 3QDKA 4WQ4C 5LY3A 3VEYA 1OKJA 4B1VA 3QMLA 5BPNA 4BRPA 1J6ZA 4K25A 5BN9A 5B8HA 1YAGA 2P9NB 3C0BA 3FE1A 3MN5A 4YDUC 3VF4A 1E4FT 3VEXA 3JXUA 4H0PA 4BC5A 5AQSA 5KQ8A 1C0FA 2IVPA 3EZWA 3KHYA 5BPMA 3LM9A 3CJ9A 2P9KA 1C0GA 3AAQA 3H6EA 3VGLA 3VEVA 1NLVA 3VGMA 1NGAA 2IVNA 3S41A 4H03B 2ZGYA 3QBXA 2YJEA 4RTFD 4BG9A 1ZXOA 3QICA 1G99A 2P9UA 2HF3A 5AQZA 1ZC6A 4GNIA 3VF2A 2QM1A 1BO5O 1HUXA 1IJJA 3OHRA 2E8AA 3VPZA 4BR4A 2FSJA 4I6MA 2A5XA 4H5NA 1ESVA 4BRHA 1Q18A 3WT0A 4CD1A 3ATVA 4H0VB 3ZETA 4BRMA 3BF3A 3EKSA 2V7ZA 3O4WA 4BVOA 4BRDA 1RDWX 4FWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IGIA 3FZLA 2YCHA 3ASMA 3PSIA 4YY3K 1VHXA 3OYCA 3OBWA 4A5BA 3HO1A 3LALA 3VESA 1HKBA 1Z26A 4BC2A 4BDPA 1VSMA 1S1VA 4NB4A 1RDBA 5DMRA 3UKRA 2P9NA 4OKJA 2PFUA 4QAGA 3G0ZA 2FSNA 4CJTA 1HKCA 4OLBA 4DR5K 4FJ7A 4JKEA 5GAHP 1W9HA 4LF8K 3WNFA 4E3SA 2DPNA 4GV6A 3DM2A 4IKFA 2HMIA 4QCLA 5EXWA 3LDQA 3SMSA 1YUWA 3O9TA 3ZX2A 4DQIA 4BWJA 4K42A 3D2FA 1WBBA 1IG8A 3F9MA 3M3ZA 4KAZA 3L2RA 5AZIB 1E4GT 4QS8A 1EWRA 1ATNA 4ID1A 3OS2A 4ID5A 1K9MO 3E01A 3FZFA 4DTOA 1QSSA 1WSJA 3PIPL 4DTXA 3VQAA 3UB5A 3HK2A 2UXCK 3M8SA 1XMOK 2QWNA 3FFKB 1N8RO 1OH6A 4ISFA 3LM2A 4RW6A 4CEEA 1C0MA 3K2PA 1HNZK 2D0BA 4Q0BA 3AARA 5F1XA 5C10A 3VQEA 4HTLA 4FLWA 4CHQA 4ZHRA 4CIFA 3TI0A 2OCEA 3NGIA 4PWDA 1S6PA 1S3XA 3JYTA 4CZKA 4LC9B 3EZ5A 4BGAA 1SL1A 4DCHA 1VQ6N 3R9PA 3ID8A 1U49A 1GLCG 3AVMA 2PBDA 5CR4A 3S5TA 3CM5A 5HROA 3DAWA 2NRZA 4YNQA 2HNZA 1EO1A 3K5MA 3QESA 3KD5E 4CHOA 1HNVA 4K0KK 4FJXA 4FJJA 2BGGA 5AZIA 4BC3A 3SJHA 3NHGA 1OVQA 4C23A 4LF9K 3C6HA 2Q1NA 5CYQA 3P1GA 2DFFA 3NBPA 4BRKA 2F7TA 1MWMA 2EX3A 2IC3A 3SAHA 2QEXN 5SWMA 1EQYA 5JLHA 3FGUA 1ATSA 3BUZB 4B1XB 3I8BA 3OYDA 1VQNN 2UUCK 3OVNA 1RTHA 1RBUA 2O4GA 5LJWA 2P9PB 2OPSA 2JWKA 4AHVA 4BQZA 3TAMA 3LWMA 5HRRA 4W5RA 3AVKA 4JKGB 3K57A 1RTDA 2KFNA 1X9MA 3W0LA 2RF2A 5BRHA 1NGJA 2QWRA 1D9DA 2NUBA 3MEDA 3NE6A 4BE2A 1BOTO 3NH2A 3V9UA 3V9ZA 4KKOA 4AH9A 2O8BA 2OZMA 2QWMA 4JK7A 4B1ZA 2OTLN 4WE1A 4CF9A 2A41A 1Q9YA 3K0SA 2FBVA 4LFAK 2G8KA 4PKGA 3ATUA 4EAHD 3UE5A 3TSQA 1OH8A 4WF9L 3K59A 1GLDG 4IOCL 3O6WA 3V1RA 1HJRA 2ETJA 2E2QA 2HHSA 3NF6A 3ZSRA 1X9JA 3WXKA 1L3VA 1SKSA 3HVRA 3V6DA 4YHHK 5BRDA 1GLFO 5J1EA 2XY6A 3VQ7A 2HHVA 1YITN 3IUCA 2O8DA 1HNXK 1QZ5A 3R6MA 2P9PA 4M45A 2FF3B 4CGDA 4Y1DA 1BCMA 2BANA 3G4SN 3IMXA 4JKGA 3NF9A 5HRSA 2YNGA 2ZF5O 4XH5A 4FWOA 4F9OA 1C0UA 2NRWA 3SNNA 3VQ5A 3QERA 3R3LA 4IEIA 2F8TA 3K5LA 1NGDA 2OZSA 3LAKA 3NVKA 4KTWA 4FWPA 4FYDA 3VEOA 2O4IA 1LAWA 3P5JA 3TAQA 4CF8A 3AA2A 4JI4K 1FKOA 2B5JA 1IKVA 1VK0A 2QKKA 1Z05A 2NNWA 2OA8A 4KHQA 2YNHA 4EHTA 4CJFA 1NJYA 3K58A 1Z25A 4FW2A 1V4TA 5AQJA 1YJ9N 3HL8A 1TAQA 1M1KO 3LZIA 3SQ4A 3S3OA 4JD2A 1LCUA 4M41A 4O5BA 1QE1A 1CZBA 3O3GA 5LJVA 1DTTA 3HVTA 2BDPA 4CZEA 1IKYA 5BPLA 3ZX3A 3NFAA 4IFYA 4E0DA 4BRNA 2XY5A 1K8KB 4WYBA 3WNHA 2G8VA 4BACA 2VGMA 1QQCA 1C0TA 1DTQA 3CJ7A 3AAPA 4DSJA 3M8QA 4DU4A 4WQ4A 4KBOA 5M1PA 1Y97A 4FPAA 1K6YA 3LDPA 3FZKA 1WUAA 2C1IA 5D3GA 4YDUA 4KHNA 4FL9A 4FLUA 3LAMA 3ZT0A 1RDDA 2QWQA 2QXFA 3PIOL 4FZXC 1RGIA 1NK5A 2I5JA 5FROA 5KPRA 4FK0A 5AQXA 5ELZA 1I94K 1I3AA 4FOIA 4PQUA 3C7NB 3O1WA 4FO0A 4B1UB 2VQFK 1X9SA 4EZ6A 3IG1A 2KTQA 3CFOA 4X62K 5FPEA 5AQTA 1K8KA 4BR5A 1VSJA 3MCPA 2HBLA 2OPQA 3I8DA 3DRSA 4CEOA 3CC7N 3HSCA 3OY9A 1JLFA 1WB9A 4LSNA 1JLAA 4CZLA 2AA4A 4DB3A 3ENOA 1NJXA 3SUPA 4IDKA 3QETA 2FSKA 4DFPA 1NKCA 2YHAA 4HUGA 4K43A 5M1FA 1NOYA 2LSNA 1TYQB 3KLGA 4QOZB 3MCAB 5J2NA 2B6AA 4DQRA 2ZJQL 4JKCA 3U9ZA 4LFBK 5EVZA 1HLUA 1WSHA 3L3UA 3QINA 3MMVA 5J2MA 4DV1K 1VSIA 3MAQA 4WQ5A 1X3MA 1N6QA 4N47A 3IRXA 2F9WA 3MWTA 1YHQN 5AQLA 1YXQA 4GVMA 1WN7A 1YVUA 2GUIA 4CJ7A 1J5EK 4E89A 3CPEA 5I42A 4ELUA 5M1QA 4EHUA 3A5MC 4KTZA 3LDSA 1UWBA 5JICA 1YT3A 3RSEB 2HF4A 3L0QA 1FK9A 2RKIA 3L4QA 3KK3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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