2A40A

Ternary complex of the wh2 domain of wave with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 361
sequence length 362
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a40A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a40A04
5AQRA 4IJAA 5AQJA 5F2RA 3CJ7A 3LM9A 4ISGA 2QWQA 3JS6A 1X9JA 3UE5A 1QZ6A 3VERA 1LOTB 2VWBA 1BWFO 4IZ9A 4FWNA 4O5FA 3FFKB 4CD1A 3BF1A 5AQSA 1RDWX 2Q31A 4CI6A 3QICA 1XUPO 3WT0A 4KBOA 4BREA 3DJCA 2FF3B 4BRDA 4CZIA 4C23A 4EHUA 4H0YB 3HBTA 1NGHA 2P9NB 2A6AA 3KHYA 5AQVA 3VEWA 1D4XA 4LC9B 4XH4A 1BA1A 3VEZA 4H03B 1QQOA 4PKHA 1RGIA 1IG8A 5LY3A 3EL2A 1NLVA 1ATSA 1XQSC 3FR0A 3LDQA 5CE3A 3SLCA 2E2QA 2H3GX 3D7EO 4FWMA 1KAXA 5AR0A 2VCPA 3M1FA 3DXMB 4B1UB 2A42A 3UKRA 2FXUA 3WEEB 4XH1A 4B1VA 4B9QA 3IUCA 3U9ZA 1T44A 3FZMA 5ADXA 3CERA 1RFQA 2Q1NA 4WQ4C 5LJVA 2BTFA 3AARA 4JN4A 3IFRA 3BUZB 4BC2A 1NBWA 1Z05A 3B8AX 3ZETA 4QS8A 1HPMA 5ADXH 3VF4A 1Y64A 1GLDG 3VF6A 4FWSA 2A40A 1MDUB 3CETA 4H5NA 3MN9A 3VPZA 1C0GA 1HX1A 2DPNA 2Q0UA 1QHAA 3CJAA 3H45C 3WUHA 4M7XA 4BGBA 1GLLO 1V4SA 2E8AA 3A8YA 4JD2B 1JCGA 1ZC6A 3GBTA 4H0VB 3W0LA 5EVZA 3CJ1A 5EOYA 4DCHA 3O6WA 4CJ7A 4JNEA 3VETA 3LDOA 2P9PB 4BR9A 5ELZA 4BRHA 2YHWA 4K43A 3A5OC 4DB3A 1GLFO 1TYQB 1NGCA 3GOIA 3F9MA 2PAVA 1CZAN 1DGKN 1HKBA 2IVNA 1IJJA 1BU6O 2NRHA 5JLFA 3FGUA 1ZBSA 3WEEA 5BRDA 2V52B 3D2EB 4FO0A 4JD2A 4CZFA 4MLEA 4BR7A 5BREA 5AZIA 3CQXA 3DXMA 3MK6A 2D1KA 1H1VA 2IIRA 4B1ZA 3O8MA 1U2VB 1GLBG 1GLJO 4B1XB 5BPLA 2W40A 2FLOA 4EAHD 3ZX3A 5KQ8A 4BR2A 5FPMA 3MN5A 3A5MC 3IMXA 4RTFD 3VOVA 1ATRA 4B1YB 1QZ5A 4FWQA 4CZMA 2E1YA 1K8KB 3O1WA 1BO5O 4JHDB 3R9PA 3UKUA 1HUXA 3WXKA 3QFUA 3A0IX 5AQWA 5FPEA 3ZX2A 1QQNA 1YAGA 2GEMA 4BRNA 3BP8A 1LCUA 1HKCA 2Q36A 2YCHA 3IDHA 4I6MA 1DKGD 2P9IB 5F0XA 3LL3A 4FOIA 3BEXA 1P8ZA 1WUAA 4QS9A 2ASOA 2GUPA 4DQ8A 4Z94A 1NGFA 2HF4A 2GWJA 1DEJA 1Z6RA 2BUPA 3H6EA 2QWPA 1E4GT 4IJNA 2P9UA 2YHYA 4QS7A 3EZWA 3C7NA 2ZGZA 3U8XA 1NGDA 3QDKA 3CJCA 1SAZA 4BRIA 4AM7A 4BR0A 2V7ZA 3VEXA 3O1BA 3ENOA 4WQ5A 4K42A 5AQZA 5JMVA 4XEIA 1NGEA 4WQ4A 2J4RA 3CQYA 4J8FA 1X3MA 4CZEA 2A5XA 3QB0A 5FPNA 4BRKA 3I8BA 4CBWA 3OHRA 2GTDA 4K25A 3A5NC 1NM1A 3C0BA 4EHTA 3I33A 3CJ9A 5AQFA 2F9WA 2FF6A 4H0XB 1BG3A 2WUSA 4IXCA 4XH5A 3ULEB 4H5TA 4A2AA 3L4IA 3MN7A 2E88A 1ZXOA 3RSEA 2Q97A 4PL7A 2E1ZA 4BVOA 1K8KA 4EFHA 3VEVA 4YDUC 3R6MA 2P9LA 5AQPA 3AAPA 3ID8A 4I6MB 3L6QA 5AQXA 3D2FB 2IVOA 1XC3A 1G99A 3HZ6A 3GG4A 1TUYA 4BQZA 3CJBA 1C0FA 1KXPA 2QWLA 1GLAG 4H5RA 3U9DA 3UKUB 5KPTA 3ATUA 5KPZA 3MDQA 2A3ZA 1MWKA 3A5LC 4A2BA 2YJEA 2I7PA 4H5VA 5FPDA 1KAYA 1GLEG 1NGBA 2QW9A 4ISFA 4BC4A 4WQ5C 2QWMA 1X3NA 2V7YA 4BRMA 2CGJA 4BVPA 4MO4A 4GNIA 2QXLA 3HM8A 2HOEA 4PKGA 1NGJA 4MO5A 3U4LA 3MCPA 4BGAA 2ZGYA 3HSCA 2IVPA 4IWVA 3H1VX 3MN6A 2VYPA 4PKIA 2PBDA 3D2EA 2W41A 4H0OA 1U6ZA 3WXLA 5BPMA 2HMPA 4FWKA 3VEYA 3M3ZA 2QM1A 3JXUA 3FE1A 3KZBA 1JCFA 4FOEA 5AFUA 1MA9B 4HTLA 2E2PA 5AFUH 4BRFA 5AQIA 2CH6A 2V51B 3WQTA 3H46O 4FWPA 3EKUA 3WQUA 4RWTA 4HWIA 5BN8A 3FZFA 3DAWA 2QWNA 5E84A 3O5BA 1SZ2A 5BN9A 3LDPA 3ZETB 3EKSA 2CH5A 5AZIB 3CHWA 4CZHA 3VF2A 5EY4A 4BRLA 1E4FT 2Q0RA 4CZJA 5AQHA 4M63C 3VGKA 5I9EB 4WYBA 3H3OB 2D0PA 4H0PA 2P9PA 1T6DA 4BG9A 4B1WB 2HF3A 3SJHA 4JHDA 5E26A 3J8AA 4JAXA 4FWRA 3ATVA 2ZWHA 3QFPA 2I7NA 1MWMA 4CD3A 5AQOA 3MMVA 3ZEUA 1WOQA 2QWOA 5KQDA 1TUUA 4BROA 2D0OA 4YDUA 5AQKA 3TPQA 5LJWA 1EQYA 4EIAA 4A61A 3EO3A 2P9KB 3ZEUB 2E2OA 3CI5A 2AA4A 2P9NA 4BC3A 3WXJA 4FWLA 4H0TB 4NO7A 5TKYA 3FLCO 4ISEA 4Y0WA 1BDGA 1TYQA 1GLCG 5AQTA 1YVNA 3GL1A 4CZKA 4BR4A 2ZF5O 1BUPA 2YJFA 5AQYA 4L3QA 3VGMA 2CGLA 3VEOA 3UKRB 4CBXA 4BQLA 5KPRA 2AP1A 1Q18A 3ENHA 2P9KA 2A41A 2GWKA 1NGAA 2UYTA 3DWLA 5AQUA 1T6CA 4BRCA 1JCEA 4BRAA 1U2VA 1QQMA 3P4IA 3EN9A 3BF3A 3H1QA 3VESA 5EX5A 2P9LB 4FPAA 1S22A 2OANA 2P9SB 2FSNA 3M6GA 3TU5A 2YI1A 1HJOA 3W3DA 4NB4A 1NGIA 4CZGA 1HLUA 4DHYA 1ATNA 3ULEA 1YXQA 2CGKA 2ASPA 3QMLA 3VGLA 3RSEB 4PL8A 5BR9A 1J6ZA 4RCHA 3FZLA 4BRQA 1HKGA 5BRHA 1NMDA 3FZHA 3DXKB 5B8HA 3LDLA 2P9SA 1BA0A 5AZJB 5JICA 4BG8A 3SMSA 3FZKA 5AQQA 4BR5A 3HI0A 1R59O 3GDQA 4E1JA 4FPBA 4M7YA 4CZLA 5AZJA 1BOTO 2NLXA 3CIPA 4A62A 2NZTA 5EXWA 4FL9A 5AQLA 2P9UB 2YHXA 5JLHA 4FSVA 2EWSA 2ITMA 2Q2RA 1KAZA 4BC5A 3R8EA 3O4WA 4IO8A 1V4TA 2FSJA 2E2NA 3AY9A 2P9IA 1NWKA 3VENA 3WXIA 4GY2B 3KVGA 3O08A 2D4WA 4F9OA 3QBWA 5AQMA 4BRGA 4MLHA 1SQKA 4K41A 4CBUA 3H3NO 3L0QA 3ZX0A 5F1XA 3SMPA 3GE1A 3G25A 4H5WA 5BPNA 3HTVA 2KHOA 3D2FA 5BRFA 3DXKA 3LM2A 2F9TA 1NGGA 3LDNA 4AM6A 1YUWA 3QBXA 3AAQA 4FWOA 2E20A 3S41A 1OKJA 3O80A 4O8KA 5AQGA 2FSKA 4BRPA 3UB5A 3C7NB 2QWRA 1ESVA 3SK3A 5AQNA 1S3XA 2ASMA 2GELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E7KA 1T3VA 4LF8K 3LM9A 3TAPA 1R0AA 4KI6A 3DLKA 4CEZA 3ZSRA 4E3SA 3P39A 4YNQA 2QI2A 4Z4HA 4BDZA 2VWBA 1X9MA 3DM2A 4FJLA 4NLCA 1VK0A 1BWFO 4IZ9A 4O5FA 2HHIA 3L3VA 3E1YA 4DKWA 5SZTA 3S3MA 1RDWX 1JXBA 2EX3A 1LV5A 4KBOA 4FJMA 4AHUA 1KVCA 3ZSZA 4N41A 3NGYA 3V1OA 3CCLN 4C23A 4EHUA 4E0DA 4KHSA 3V9ZA 4O0JA 2A6AA 3KHYA 4DG1A 4J2AA 1D4XA 1S1XA 3DLBA 1YITN 4H03B 1ZBFA 3AO3A 4B3SK 3B6OA 2H3GX 3TR8A 4FWMA 2PZSA 5DK5A 4FLZA 3T7ZA 1TK8A 3WEEB 4RW9A 4B1VA 3TABA 3U9ZA 3NDKA 1T44A 3DMJA 5ADXA 4NYFA 3ZT2A 2BTFA 4EZ6A 4CFDA 3I0RA 4KHWA 3NF9A 4B3OA 1Z05A 3ZETA 1D5AA 1RT4A 3VF4A 4KPYA 2GX9A 2ZJRL 4ELVA 5C2DA 2A40A 3CETA 4OPKA 1MU2A 3HYFA 2B4JA 2DPNA 3CJAA 3WUHA 3CCRN 1NJXA 1KFSA 4FLWA 2E8AA 4IDKA 4IDHA 4EZ9A 4KRFA 3DLRA 4M3WA 4DCHA 1BGXT 2P9PB 4IOAL 4IBNA 4BRHA 3DI6A 3A5OC 3QINA 3CM6A 1GLFO 3GOIA 4CW7B 1BU6O 3FGUA 4DFKA 3CPEA 2VWJA 3DLLL 1JLFA 3AVFA 5BREA 3LP1A 5I42A 2D1KA 1H1VA 4B1ZA 3O8MA 3ALYA 1NOYA 2HBLA 1OH8A 4O4GA 3MN5A 3VOVA 4RTFD 4M45A 4B1YB 2O8BB 3CC7N 1VSIA 4CZMA 3O1WA 1BO5O 4JHDB 2GBZA 1P90A 3VQ5A 2X78A 1S1UA 1UAXA 1TKXA 3OTOK 4KH5A 1C1CA 4KFBA 2AJQA 1YAGA 3CM5A 1S72N 1NG9A 2GEMA 5HRRA 3BP8A 2YCHA 3IDHA 4HCCA 3NH1A 1YIJN 4FOIA 2B6AA 1P8ZA 3AA3A 3OW2M 1Q7YO 3M8SA 5FRMA 4DQ8A 4YY3K 1RTJA 2QTDA 2HF4A 3KD5E 1DEJA 4CHOA 1EWRA 3AO4A 1VSDA 3K57A 4KO0A 1Q81O 2YHYA 3C7NA 3ZSWA 3QEIA 3OYLA 4KAZA 4DR4K 3CJCA 1W9HA 3ID6A 4BR0A 1JXEA 3CD6N 3VEXA 4NCAA 3O1BA 4A5AA 4WQ5A 4XEIA 1NGEA 2J4RA 2IS3A 3ITHA 3OBYA 3CQYA 4CHNA 4B3MK 1KSPA 1FK9A 4CJFA 3VN5A 3A5NC 3AVLA 3AVMA 1Q9YA 3CJ9A 4HUEA 4H0XB 4DQPA 4XH5A 4B9MA 2HNZA 2UUCK 3I0SA 4LF7K 3C94A 3RSEA 1DT9A 3PLAA 1K8KA 3BY5A 3R6MA 4JRQA 3J7ZO 1KRPA 3P1GA 3ID8A 1SUQA 3MX2A 4IFEA 4FM1A 4OVLA 5AQXA 1BI4B 3L2RA 3D2FB 3WNEA 4DSKA 4FVMA 1G99A 3GG4A 3CCEN 2P5GA 1NOZA 3KK2A 3U9DA 1IBMK 2F4VK 2O8FB 1EX4A 2W42A 2HMIA 2GV9A 3A5LC 2VG5A 3N4QA 1WSFA 4NLBA 3TWHA 3MEGA 1S9EA 1QSYA 3RMAA 4N47A 4O55A 1NGBA 4HVJA 5KTQA 2V7YA 3KLEA 4YOTA 1RDCA 2BANA 4DSIA 1SL1A 4OLBA 3MCPA 1KQSM 4IEEA 3AO2A 2IVPA 2FBVA 4H4MA 2KFNA 3DLGA 3LAMA 5CY4A 2PBDA 3SJJA 1IKVA 5GINA 2QKBA 1YHQN 2HMPA 4L8RB 4DSEA 3KZBA 4YOUA 4LH4A 4YORA 2E2PA 4BRFA 3OS1A 2XO7A 3KWGA 5C10A 4M3YA 4CERA 4HWIA 2OPPA 3CMAN 3THYB 2Q3SA 2Z1HA 1SZ2A 2QA4N 4QCLA 1QVGM 4DTRA 2HHWA 3CHWA 4BRLA 1SS6A 2YNIA 4AILC 4CJSA 2IAJA 2NRRA 3VGKA 1VHXA 3R1XA 4HTUA 2O8DA 4KV8A 3SJHA 1C0UA 4JHDA 2FC0A 5E26A 4UQGA 3O9QA 4FWRA 2LSNA 2O8BA 3O9SA 2I7NA 3NH0A 1MWMA 3L4QA 5AQOA 3MMVA 3V1QA 1WOQA 2W6KA 3AVBA 5JS2A 3U6FA 5EU7A 4BROA 2KLAA 3VMFB 4CK1A 4EIAA 5J2MA 4A57A 4PHTX 2G8UA 3CI5A 4FJXA 1NK0A 4H4OA 1KD1O 3NF6A 1YJ9N 4DV1K 5GIOA 1GLCG 5AQTA 4CZKA 4JI3K 1O1WA 4LSLA 4BR4A 1BUPA 3Q7BA 4L3QA 3CFPA 3PY8A 3UKRB 4AHVA 3K0SA 3OY9A 3ENHA 2RKIA 2A41A 1NGAA 4M3TA 5AQUA 1OVYA 1U2VA 4CK2A 3AA4A 4LY7A 4YOXA 3H1QA 5HRPA 4GKJK 3C6UA 4I2PA 1S22A 1JLCA 3DRSA 2IC3A 3TU5A 2YI1A 2YNFA 3AVJA 1NGIA 4J2EA 1ATNA 3DLEA 3ULEA 4C1NI 3VGLA 4DF8A 1J6ZA 1FKOA 4QAGA 2F7TA 4RW4A 4U7BA 3MECA 1W0HA 4BG8A 3QEWA 1RDUA 1KVAA 4M3UA 3LALA 2E5LK 5AQQA 3HI0A 1NKBA 2O8FA 2HNYA 4LF4K 1T05A 5AZJA 1IKWA 1BOTO 1HJRA 1WBBA 4XJXA 4FL9A 2DTUA 2E6MA 2Z1GA 3WNGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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