2A40A

Ternary complex of the wh2 domain of wave with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
361
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 120
structure length 361
sequence length 362
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a40A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a40A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a40A04
1KAYA 4BRCA 3R6MA 3DXMB 3GDQA 5JMVA 3QBXA 3VF6A 1YUWA 4CZLA 2P9PA 5BRHA 3H46O 4WQ5A 4I6MB 1GLDG 1T6DA 3MN5A 3WQTA 2FF6A 4B1UB 3M6GA 4A2BA 1KAZA 4H0YB 2Q1NA 5AQXA 3GOIA 2NRHA 5KPZA 4H0VB 2J4RA 3LDLA 3QDKA 3O08A 1R59O 4H5NA 3A5MC 3WT0A 3VGKA 3U9DA 3SK3A 3VEOA 5AQMA 4DCHA 3IDHA 4WQ4C 5AQWA 3ULEA 4FO0A 2ASPA 3O1WA 4BGBA 3CHWA 3AAQA 3WXIA 1EQYA 3I33A 1DKGD 3WXJA 3EO3A 3W3DA 4DQ8A 4E1JA 3I8BA 4F9OA 3IFRA 3EKSA 3MN9A 5FPEA 1XC3A 4FWRA 1BDGA 1GLJO 2BTFA 3LDNA 3SMPA 2YHXA 3P4IA 3BF3A 1KAXA 2FXUA 3D2EA 2A3ZA 4IZ9A 3H6EA 5TKYA 4C23A 1TUYA 5AQRA 4GY2B 3A0IX 2W40A 2Q0RA 3VESA 3QFUA 2E2OA 4YDUA 4PL8A 3BP8A 4FWMA 3VEZA 4B1VA 1P8ZA 5E26A 1C0FA 1HUXA 4AM7A 1X3MA 4BRHA 1K8KB 1E4FT 1MWMA 4IJNA 1DGKN 4IXCA 2YHYA 3DXKA 2AA4A 4MLEA 4BRQA 4H5WA 4JD2B 1ESVA 4RTFD 1S22A 5JLFA 4EAHD 4O5FA 3A5OC 3RSEB 2VWBA 4M63C 5AZIB 1E4GT 2P9SA 5AQZA 2CGKA 4FWNA 3M1FA 3VGMA 4ISFA 5ELZA 2H3GX 3IUCA 3FE1A 1BA1A 4ISEA 4BRIA 2BUPA 3M3ZA 4BVPA 2QWNA 3CETA 4XH1A 3H3NO 2CH5A 2QWOA 4DHYA 3OHRA 2DPNA 3FZFA 3KHYA 3ZETA 3VOVA 4BRNA 3HI0A 3VEXA 3U4LA 4B1WB 1BWFO 3DWLA 5BR9A 5AQTA 2UYTA 4CZEA 5AQHA 5JLHA 4BRLA 1BU6O 2FSJA 3WXKA 2Q36A 5AQSA 4PL7A 2V52B 2GELA 2ITMA 2GEMA 1U6ZA 4M7YA 4B1ZA 2YI1A 2QWLA 4JHDB 3RSEA 5AFUH 1NGBA 4H5RA 5I9EB 2QWQA 2ASMA 3SLCA 1TYQB 5EOYA 3GE1A 4FPAA 1MA9B 1YAGA 2VYPA 2QM1A 3CJAA 3ZEUA 3GL1A 3EN9A 2E2PA 1BG3A 3BUZB 1H1VA 2NLXA 5AFUA 4XEIA 4XH4A 1MWKA 5AQVA 1HX1A 2PAVA 1ZBSA 1YXQA 3QMLA 2Q97A 4FWOA 4GNIA 3UKRB 2OANA 1WOQA 4EIAA 5JICA 5BPLA 4BG9A 3QB0A 3IMXA 3L0QA 2P9UA 2GWKA 3FZKA 3LM2A 3C7NB 1GLBG 2P9NB 3UKUB 2P9LB 4BC5A 4CBWA 3DJCA 3TPQA 3U8XA 2AP1A 3CJCA 4ISGA 2ZWHA 1NGGA 4DB3A 2QWPA 3VETA 2P9IB 3TU5A 4BRGA 3FFKB 3D2FB 5E84A 4FWKA 2HF3A 1D4XA 1RDWX 3D7EO 3DXMA 4H0PA 5AQNA 2W41A 1SAZA 2HOEA 3LDOA 1SQKA 5AQLA 3VPZA 4FWSA 1NMDA 2FSNA 4BG8A 4L3QA 5BPMA 5AQYA 4FL9A 2A42A 3CI5A 4I6MA 3ATVA 4FOIA 4PKIA 3WUHA 4BRAA 1NGCA 4JAXA 4BRDA 5BRDA 2GWJA 1QZ6A 1J6ZA 5LY3A 5KPRA 2ASOA 3VF4A 3B8AX 2IIRA 3VEWA 1T6CA 3VEYA 4RWTA 1U2VB 4HTLA 5AZJB 4BRKA 1NGFA 5BRFA 4K41A 3WQUA 5AQKA 5BREA 1IG8A 4EHUA 1V4SA 4CZIA 4FPBA 2ZF5O 5AQIA 4B9QA 4WQ4A 5KQ8A 2P9KB 5AQGA 4BQZA 3MN6A 4O8KA 3J8AA 4J8FA 5B8HA 4BQLA 3HM8A 1GLEG 4BC4A 1QQOA 4PKHA 3AY9A 3R8EA 1HKGA 1GLCG 5EXWA 1TUUA 1X9JA 4LC9B 4B1XB 3UB5A 2A41A 2YHWA 1YVNA 3LM9A 4JNEA 3O4WA 1ATSA 3GG4A 3FGUA 4WQ5C 4Y0WA 1G99A 2PBDA 1JCFA 3WEEB 1MDUB 1NLVA 2E1ZA 3MDQA 4MO5A 4H0XB 3FLCO 4QS8A 5ADXH 4IWVA 3H3OB 5F0XA 1QQMA 3JXUA 1LOTB 1K8KA 1QHAA 3VF2A 4BVOA 4HWIA 1Z05A 1HKBA 4JD2A 4BROA 1JCGA 4FWQA 2FLOA 3ZX3A 1XQSC 5ADXA 4CZFA 5AZIA 4BR4A 4WYBA 2IVOA 3SMSA 3HZ6A 4Z94A 2E2QA 3O5BA 1WUAA 2Q31A 3QBWA 4EHTA 1QZ5A 2D1KA 4A61A 4RCHA 2YJFA 2V7ZA 1Y64A 3ULEB 4CZHA 2IVNA 5CE3A 1BOTO 4NO7A 3CQXA 5AQOA 5AQUA 3VENA 3W0LA 1GLLO 2GUPA 2KHOA 4PKGA 3L6QA 4H0OA 3VGLA 2E2NA 2QWRA 5KPTA 2CGLA 5FPMA 1HJOA 3ENOA 3ENHA 4NB4A 3VERA 3EZWA 4CZGA 3FZHA 3CERA 3KVGA 5AQQA 2QW9A 3BEXA 5LJVA 3CJ7A 1XUPO 4YDUC 4H0TB 4CZJA 3HTVA 3D2EB 3LDPA 2HF4A 3LL3A 4BC3A 3LDQA 4BR5A 2I7NA 5EX5A 1IJJA 2QXLA 4JHDA 2CGJA 4FWPA 3O6WA 1NM1A 1NWKA 1TYQA 1ZC6A 1DEJA 1Q18A 3G25A 2A40A 2V7YA 5EVZA 3H1QA 2FSKA 3DXKB 2FF3B 1RGIA 1ZXOA 3SJHA 1CZAN 2A5XA 3DAWA 1NGHA 1NBWA 4MLHA 2ZGYA 4H03B 4BR2A 1HKCA 2F9TA 2WUSA 1QQNA 2P9SB 3AARA 4EFHA 1C0GA 2E8AA 1T44A 1BA0A 4IJAA 4M7XA 3FR0A 1GLFO 4A2AA 3UKRA 3EKUA 2NZTA 5F1XA 3A5LC 4BGAA 3O80A 3ATUA 1X3NA 2VCPA 4FSVA 3ZX2A 3CQYA 2V51B 4BR7A 2Q0UA 4CZMA 4AM6A 3BF1A 2YCHA 2Q2RA 3C7NA 3ZETB 3WXLA 1S3XA 2P9NA 5AR0A 2P9LA 3UKUA 1GLAG 1HLUA 4CI6A 5LJWA 1OKJA 4QS7A 3CJBA 3C0BA 2EWSA 2P9IA 3H45C 4QS9A 4CJ7A 3D2FA 4CD1A 4K42A 3UE5A 3HSCA 4K25A 3GBTA 4FOEA 4BR9A 1NGAA 2D0OA 4KBOA 4BR0A 2ZGZA 3R9PA 4A62A 3FZMA 5FPNA 5BPNA 2YJEA 1JCEA 4JN4A 3H1VX 5BN9A 5EY4A 4H5VA 4B1YB 4CZKA 4MO4A 2I7PA 5KQDA 3CJ1A 1V4TA 3MN7A 2IVPA 3MCPA 4XH5A 2GTDA 1SZ2A 5F2RA 1KXPA 2P9PB 3ZEUB 2E1YA 3S41A 1U2VA 5AQPA 1BUPA 1NGDA 3EL2A 1Z6RA 2CH6A 3JS6A 3VEVA 2E88A 5AZJA 3A5NC 2HMPA 3MK6A 5AQFA 4BRPA 2D4WA 3U9ZA 1NGEA 4BREA 4BRFA 5AQJA 3QICA 1HPMA 2A6AA 4K43A 2D0PA 4CBXA 1LCUA 2P9KA 1NGIA 3O1BA 3ID8A 3CJ9A 4IO8A 3AAPA 2F9WA 3FZLA 1ATNA 2P9UB 3O8MA 5BN8A 2QWMA 1RFQA 4CBUA 3F9MA 4CD3A 4BRMA 3QFPA 1ATRA 4FWLA 2E20A 4BC2A 3L4IA 3HBTA 3ZX0A 1NGJA 3CIPA 5FPDA 3MMVA 3KZBA 1BO5O 3A8YA 4H5TA 3WEEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K9KA 4NXNK 1YUWA 5HRPA 4WQ5A 4I6MB 1GLDG 3MN5A 4JI2K 4CJEA 4B1UB 3S3MA 3P31A 5FRNA 3GOIA 2NRHA 3ZSYA 5KPZA 3THWA 1SL2A 1N36K 3ZSRA 2J4RA 4CF2A 3M8QA 3MX2A 3DLRA 4PA1A 1WSJA 3SK3A 3VEOA 2A1RA 1S1UA 5JS1A 2UU9K 3EE8A 4IKFA 4IG3A 5AQWA 3P1GA 3HRGA 1EO1A 1BCOA 4FJ5A 1EQYA 1DKGD 3W3DA 1NKEA 2Z1JA 3IFRA 3EKSA 2IS3A 4JV5K 5FPEA 4E3SA 1VQ8N 4DLEA 1BDGA 1YTAA 3CPEA 2X6NA 5J1EA 3LDNA 4QCLA 4OKKA 3BF3A 1KAXA 4IOAL 3LP1A 3K2PA 3H6EA 1XNRK 4ZHRA 1KD1O 1IH7A 3A0IX 4IFVA 4N5SA 4U7BA 1TKDA 2E2OA 3OBYA 4YDUA 1ASWA 4PL8A 4EZ6A 4FWMA 1CXUA 4B1VA 4LF4K 4Y1CA 3T7ZA 1C0FA 4B9MA 4AM7A 1X3MA 1K8KB 3Q7CA 1MWMA 4IJNA 2W42A 3SV4A 4J2DA 4KHYA 2YHYA 3SAHA 3TAGA 1ESVA 1VQ4N 3AVNA 1NK0A 5JLFA 1RBRA 4O5FA 5C12A 3RSEB 4DR6K 5AQZA 4FWNA 4GKJK 3VGMA 4ISFA 5ELZA 4ICLA 4CJ4A 4JKGB 3LWMA 4A5BA 3CETA 4XH1A 4JI3K 2IOCA 4W5RA 4Z4FA 3J81O 3HI0A 2GX9A 4B1WB 1BWFO 4WFBL 4JKDA 1NJYA 3CYMA 2HBLA 3KIOA 5AQHA 3THYB 1KSPA 3CFPA 2C1GA 2FSJA 3WXKA 4O4GA 3FFIA 1U6ZA 4AHCA 1Q82O 4B1ZA 1BIZA 2FBYA 5KGXA 4JHDB 5AFUH 3OTOK 4H5RA 5I9EB 3WNGA 1CXQA 2ASMA 3SLCA 1TYQB 5EOYA 4FPAA 3K59A 5HRNA 4OGEA 3NVMA 1RDCA 3TTFA 3VQCA 4XEIA 4XH4A 4CJQA 1HX1A 1YXQA 5HBMA 1NMNA 3QMLA 4DTMA 2Q97A 1S6PA 2OANA 3ZSOA 5JICA 4CHOA 5BPLA 2GWKA 1D5AA 3CCVN 4FLTA 3D0PA 3C7NB 1KVAA 2IDOA 4Q0BA 3UKUB 4NCGA 2VG5A 2AP1A 3CJCA 1TK5A 2JLEA 1K73O 4X65K 3VETA 3OYKA 3FFKB 2OPPA 3RRHA 1RDWX 4ILJA 3DXMA 1SAZA 2HOEA 3IRXA 4JI7K 4U67L 3O9RA 2YV0X 4PKIA 2FC0A 1RTIA 2GWJA 2PY5A 2OCEA 1XWLA 2YKNA 1WSFA 3DLEA 2OPQA 4FJIA 3IS9A 3VEWA 1T6CA 3VEYA 3NF8A 3SPYA 1RT2A 4CHPA 1WSEA 1JL1A 4CHYA 1IG8A 4KV8A 1V4SA 2DFHA 4KHUA 1RBUA 4CZIA 2RHKA 3LP0A 2ZF5O 5AQIA 4WQ4A 5FLXO 5KQ8A 2P9KB 5GIOA 4DF8A 4Z4IA 3HPOA 1XMOK 3IKMA 4ELTA 1QVFM 3HM8A 1J54A 4BC4A 4J2EA 1ZBHA 1IBLK 1DLOA 4F4KA 3I55N 4B1XB 3LM9A 3NF6A 3KWIA 1VQ5N 2W6KA 3DRPA 3GG4A 4WQ5C 4E7LA 1JCFA 3WEEB 4MO5A 1NKCA 3FLCO 1VHXA 3H3OB 4PWDA 2F96A 5HRRA 4ID5A 4TSXA 1LOTB 4CIGA 4JD2A 3SPZA 3C6AA 3PSIA 4FWQA 3THWB 5ADXA 2NUBA 5AZIA 4CZFA 4C8OA 1M1KO 3HZ6A 3EY1A 2E2QA 3NFAA 2GV9A 2Q31A 3QBWA 4AHRA 3OJUA 1RBSA 3LZIA 1XNQK 1EP4A 3SQ1A 3P38A 3CQXA 5AQOA 4FJKA 4CFAA 1KC8O 1GLLO 1KFSA 4PKGA 4H0OA 2G8HA 3OS1A 2BH1A 1S1TA 4FM2A 4CW7B 5CYQA 3TTCA 4FLVA 4FJJA 3KVGA 5LJVA 3CJ7A 4YDUC 4CZJA 4H0TB 4IOCL 3NGYA 1NJXA 4JI8K 4BR5A 4DS4A 4B9LA 2I7NA 4CGJA 3VQ9A 3JAMO 3PLAA 2D0BA 3CMAN 4RW4A 4JI4K 2E4LA 1NM1A 1NWKA 1ZC6A 1Q18A 5M1OA 2FSKA 4DTUA 3O9SA 4DTRA 4KI4A 1ZXOA 3SJHA 4CGGA 3ZLJA 3DAWA 1NGHA 4KPYA 3OYAA 1HKCA 4B9UA 2PYLA 1QQNA 4HVJA 4M3ZA 4NYFA 4EFHA 3HVTA 2E8AA 1BA0A 4CGHA 3FR0A 3PX4A 3QIPA 3LANA 3R1XA 4DS5A 3ZSZA 4DSKA 3CQYA 2O4GA 3ZCMA 4B3SK 5AR0A 1GLAG 2PFUA 4MQ3A 3SJJA 1VAZA 2EWSA 3ULDA 1VSFA 1JXEA 3CF5L 4DR2K 1Q8IA 4M3XA 3H45C 4CD1A 4K42A 1S72N 3UE5A 3HSCA 4K25A 2D0CA 2XHBA 1NGAA 2D0OA 3NHGA 4LF9K 1VSIA 2ZGZA 3FZMA 1HNIA 5BPNA 4CJ5A 2YNGA 5BN9A 1L3TA 5EY4A 4JS4A 2YHBA 5DMRA 4FJ9A 4HCCA 4CZKA 4MO4A 3QEXA 1V4TA 3SQ2A 4J2AA 4B3TK 3J7AP 4JK8A 2GTDA 3DLHA 4DWIA 3MEGA 3NBPA 1BI4A 2EHGA 2P9PB 1Q9YA 3KKSA 2YNFA 4CIEA 2D0AA 3K5LA 1U2VA 3G71N 2HNYA 3ZYYX 5AZJA 1BQNA 1N34K 2ETJA 1JKHA 3U9ZA 3RWUA 4JKHA 4BE2A 4DR7K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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