4BGAA

Nucleotide-bound open form of a putative sugar kinase mk0840 from methanopyrus kandleri
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
LTRVLGIQLGNTGTDYCVMNEDGDWEIVAREEGVFGKISCVFTLEESRRALREEIAPRVIERVRRVNPDLAVVGTIVDELGLILGPMIHEKTGVPTLAVYGDPWGAPDGDAVGAPYCVAEEYPNCVHVDVGAMAVVTPIRDGRPDFGDAVVSVGTFPLDLAARELLGKEYDEGGKKAAEGEVDENFRRELRSVDVDGKPVFGRVRGSLAPVPPEQERVLRDHIRDAGAPAEDVLRTLVELVAETIVINAAQYDMDLLVLSGGGVKNELLKRRVSELWEGDVSIFAGEELEARGLCLLGLRYLEGEPVPALPCEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords PREDICTED MOLECULAR CHAPERONE DISTANTLY RELATED TO HSP70-F O
publication title Structural Characterization of the Ribonuclease H-Like Type Askha Superfamily Kinase Mk0840 from Methanopyrus Kandleri
pubmed doi rcsb
source organism Methanopyrus kandleri
total genus 95
structure length 314
sequence length 314
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bgaA02
3.30.420.430 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4bgaA01
4CI6A 1HUXA 2CH6A 3IMXA 5AQTA 2YHWA 2J4RA 1BO5O 4YDUA 4IJAA 4BVPA 1RDWX 1ATNA 3A5LC 5BPLA 3CIPA 1SQKA 1K8KB 3JXUA 2FSKA 4A2BA 4A62A 3LM9A 1TYQA 4H5NA 3VPZA 1IJJA 1ATRA 4B9QA 5AQJA 3FGUA 5AZIB 2D1KA 2Q0UA 4FWKA 3SJHA 3EKUA 2GWKA 5AQWA 2P9UB 4BG9A 4FWSA 2ZF5O 3I8BA 1RGIA 1T6DA 2BTFA 3DAWA 1Y64A 3I33A 4BRDA 2P9LA 3ENOA 2A6AA 1IG8A 3DWLA 3A5NC 4EHTA 1T6CA 4BGBA 3U8XA 4YDUC 3MCPA 3VEYA 3CJCA 4H5RA 5TKYA 3IUCA 5EXWA 3MN6A 5EY4A 3CJBA 2P9UA 5AQYA 1GLAG 4H0YB 4CBXA 1RFQA 3C7NB 5AQLA 2CGKA 3CJ7A 1U2VB 4JD2B 2AA4A 4MLEA 2ASPA 5AQUA 1HKGA 3ZETB 1NLVA 3VOVA 5AQIA 1H1VA 5JMVA 1HJOA 3VGKA 1OKJA 1XC3A 2P9SA 5AQFA 5AQZA 1J6ZA 4Y0WA 3F9MA 3A5MC 4K43A 2GWJA 4ISGA 3H46O 3W0LA 3MN5A 3GE1A 2E88A 4BG8A 1QQOA 1EQYA 3IFRA 3D2FB 2ZGYA 4JD2A 4IXCA 3UKUA 3ZETA 2NZTA 4JHDA 4QS9A 4IZ9A 4CZFA 3BEXA 5CE3A 1U6ZA 1BA1A 1JCEA 4JAXA 2E2QA 4H0OA 3DXMA 3O8MA 2QWLA 3WUHA 1QZ5A 2YI1A 3AY9A 5LY3A 2I7NA 1NGGA 2Q97A 3WXKA 3WQTA 2V52B 4NB4A 3M6GA 1X3MA 1YUWA 1TUYA 2D0OA 1KXPA 1MA9B 2E1ZA 5FPNA 2ASMA 3QDKA 5BPMA 3P4IA 3GG4A 4F9OA 1NM1A 5BN9A 3H3OB 3D2FA 3ATVA 3BF3A 3J8AA 2IIRA 2Q2RA 1DGKN 4CZHA 2DPNA 4FL9A 2P9PB 3B8AX 1WOQA 3QBWA 4PL7A 3KZBA 1TYQB 2VWBA 4BRMA 4PL8A 3L4IA 4FWPA 1X9JA 5LJVA 1S3XA 2NLXA 1TUUA 3M1FA 1G99A 2YHXA 4FPBA 3LDPA 3H3NO 2E20A 2HF3A 4M63C 4BROA 5AZJA 4A61A 3C0BA 1QHAA 5KPZA 2P9LB 1XQSC 1NGCA 4M7XA 5BRHA 3D2EB 2CH5A 1KAYA 1NBWA 1Q18A 2P9PA 3H6EA 3EO3A 3O1WA 4M7YA 1BU6O 2GEMA 4DHYA 5JLFA 3VGMA 2E2PA 4FWLA 3FZFA 4H0VB 3SLCA 1HLUA 4CZIA 4QS8A 4FOEA 3O80A 1GLFO 1NGHA 3AARA 2E1YA 3HI0A 4FWMA 4BRKA 5JLHA 1Z6RA 1QZ6A 4MO4A 2YCHA 3ENHA 3LDOA 4FWOA 3WEEA 3VF6A 1GLJO 2QW9A 3DXKB 1V4TA 4BC5A 2P9SB 3D2EA 4L3QA 1JCFA 3EL2A 3RSEB 3SMSA 4BRFA 3A5OC 5AQMA 4WQ5A 3ZEUA 2VYPA 4HTLA 3HZ6A 5AQRA 3VESA 4RCHA 3SMPA 1NGAA 3FZLA 1YXQA 2QM1A 3R8EA 1GLDG 4BC2A 1GLCG 1NGIA 1ZBSA 3UKUB 4DB3A 4H5VA 4JHDB 4B1UB 3SK3A 1YVNA 2D4WA 2E2NA 3IDHA 3VEVA 4Z94A 3DXKA 5F2RA 3DXMB 3FZKA 1HX1A 3RSEA 3G25A 3ULEA 1QQMA 4BRGA 4PKHA 5AQGA 3VEZA 5AQVA 4B1YB 2PBDA 2AP1A 4O8KA 1NGEA 4H5TA 4WYBA 2FLOA 3DJCA 3GBTA 2IVNA 3AAQA 4MLHA 3MN7A 4CZMA 5BPNA 4RTFD 3WXIA 3L0QA 3BF1A 4WQ5C 3WXJA 2YHYA 2F9TA 3U4LA 3R6MA 3ZX3A 3FE1A 2GUPA 3CQYA 3AAPA 2P9NA 4LC9B 1HKCA 5FPDA 4BRLA 4BREA 3H1VX 5AQPA 3ZX2A 4B1VA 2QWPA 4K42A 4K25A 3LDLA 5FPMA 1NMDA 3JS6A 4I6MA 4BRNA 3QICA 2IVOA 4CJ7A 2Q1NA 2P9IA 3GDQA 1BWFO 3FZMA 5FPEA 5AZJB 3UB5A 1NGBA 4MO5A 1C0GA 3U9DA 2E8AA 4WQ4A 3CJAA 4KBOA 3EZWA 3KVGA 4BR7A 4CD1A 4BRPA 4BQLA 4EAHD 3BUZB 2NRHA 4CBWA 1WUAA 3HSCA 4EHUA 4GY2B 3U9ZA 5E84A 5E26A 4H0XB 4PKIA 2IVPA 1S22A 3QMLA 5I9EB 4K41A 2V7YA 4AM7A 3BP8A 2UYTA 2A40A 3MMVA 4CZKA 1X3NA 2V51B 1Z05A 2F9WA 3TPQA 3QBXA 2WUSA 3HTVA 3M3ZA 3WEEB 1E4GT 2QWOA 3GL1A 3MK6A 4FO0A 2A41A 4H03B 3R9PA 4H0PA 4BR4A 1NGDA 3EKSA 4FPAA 5BREA 2QXLA 3LDNA 4BR2A 2E2OA 3VEXA 2GELA 3EN9A 4CZEA 3ZEUB 4WQ4C 1QQNA 3HM8A 2ASOA 3A8YA 1NGJA 5B8HA 3VEOA 1CZAN 2H3GX 2BUPA 2W40A 3H45C 4BC3A 1BG3A 4BC4A 1P8ZA 2FSJA 2CGJA 2V7ZA 4EIAA 1BUPA 4CZGA 3O08A 3VF2A 1NGFA 4B1WB 3O1BA 5KPTA 3HBTA 4A2AA 4BR5A 4XH5A 2P9KB 3W3DA 4FOIA 1HPMA 5AR0A 1E4FT 2FXUA 1D4XA 4IO8A 3ULEB 3O6WA 4BQZA 3VETA 2Q36A 4CZLA 4O5FA 5KQDA 2ITMA 3H1QA 3TU5A 4IWVA 1LOTB 5AQSA 3MDQA 1NWKA 5BRDA 3ATUA 3L6QA 3CI5A 3VERA 3LL3A 4BRQA 3S41A 3VF4A 5AQOA 4CD3A 1K8KA 2Q31A 4JNEA 2GTDA 2P9NB 2QWRA 1SZ2A 2HF4A 3WT0A 4CBUA 3FZHA 3UKRB 2A42A 1ESVA 2P9KA 5AZIA 3CETA 4BR0A 1GLBG 4GNIA 4I6MB 1ZXOA 3CJ9A 3QB0A 3QFUA 3O4WA 1C0FA 1GLLO 4HWIA 1T44A 2FF3B 4BRCA 2P9IB 2FF6A 4BGAA 4EFHA 3WQUA 4B1ZA 1V4SA 5F1XA 2HMPA 1ATSA 4DCHA 4IJNA 1GLEG 4BVOA 4FSVA 5BRFA 5AQNA 3CQXA 5AFUH 2FSNA 1YAGA 3UKRA 1KAXA 5AQQA 3ZX0A 3A0IX 3VENA 4DQ8A 1DEJA 3CJ1A 3CHWA 4ISFA 3UE5A 4JN4A 1ZC6A 4NO7A 2QWNA 2QWMA 2EWSA 2PAVA 4PKGA 4XH1A 3C7NA 4H0TB 1U2VA 1MWKA 4XEIA 2KHOA 3ID8A 3FR0A 4H5WA 2ZWHA 4CZJA 5ADXH 5BN8A 3OHRA 4C23A 3WXLA 4AM6A 4J8FA 4BRAA 5AFUA 5BR9A 3LM2A 3O5BA 5F0XA 4FWQA 2W41A 5KQ8A 1R59O 2ZGZA 1MDUB 3CERA 1JCGA 5JICA 1XUPO 5LJWA 5ELZA 1KAZA 2Q0RA 4FWNA 3VEWA 3LDQA 1DKGD 4XH4A 1BA0A 4BRIA 4B1XB 5EOYA 1SAZA 2VCPA 4QS7A 2QWQA 3MN9A 4FWRA 2A5XA 3D7EO 5EX5A 2YJFA 3GOIA 2D0PA 5KPRA 2A3ZA 1LCUA 4BRHA 4E1JA 5ADXA 4ISEA 5AQHA 3VGLA 2CGLA 1MWMA 3QFPA 5EVZA 2I7PA 2YJEA 5AQKA 2OANA 2HOEA 4BR9A 3FLCO 1BDGA 4RWTA 3FFKB 5AQXA 3KHYA 1HKBA 1BOTO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F8SA 3TANA 2CH6A 5AQTA 1BL3A 2YHWA 4OO1J 2J4RA 1VQ9N 5DM7L 2QXFA 4BVPA 1TK8A 1K8KB 3NVMA 4U7BA 4DG1A 4DV2K 1NMNA 3KK1A 4DR4K 3MWTA 4W5NA 5AZIB 3SJHA 4RW4A 1JL2A 2P9UB 3IG1A 5KI6A 4BG9A 4FWSA 1NK9A 1RGIA 2IGIA 3QNNA 4JV5K 1TGOA 5GAEP 2BTFA 1NKBA 4GV6A 3MX5A 1VQ6N 1Y64A 1QSLA 5HRNA 4E7IA 3ENOA 4LSLA 5HL7L 4G1QA 4DTPA 4M3RA 3ZYYX 1HQEA 1HNZK 5HRPA 4BGBA 1RT6A 4CJ3A 1KVCA 4YDUC 3MCPA 5LL6Z 2KLAA 3K9JA 4O44A 4E1NA 3CJBA 3L2WA 5AQYA 1N34K 4DV7K 3AA2A 1DT9A 4E7KA 1Q9YA 3CJ7A 1U2VB 3LAKA 4JD2B 2AA4A 3KJVA 4MLEA 2ASPA 3BZCA 1LAVA 3O9UA 3ZETB 1BIZA 4CEAA 3RVCA 2HHTA 1HJOA 3CPWM 4FZXC 3CYMA 3E9OA 3VGKA 2P9SA 1XC3A 2X6SA 4F8RA 2HNDA 2FBVA 1NJYA 4Y0WA 4IG3A 4ISGA 3MECA 3HP6A 2ZD1A 3C6UA 3MN5A 4BG8A 3F9KA 2WC9A 3HT3A 4DSEA 1VQMN 1TKXA 3V81A 3UKUA 3OJSA 3G10A 4IZ9A 3BEXA 5CE3A 3SPZA 4KB0A 3K5NA 4FLWA 4MFBA 5LY3A 1VQ5N 4ID5A 4CJWA 2NRVA 2OTLN 3WQTA 1VHXA 2V52B 3K57A 2DFFA 5GINA 4FK2A 2D0OA 1KXPA 3BGRA 2E1ZA 3QDKA 3VQEA 3P4IA 3PLAA 5CYMA 1YJWN 3D2FA 2O4IA 2GBZA 1SL2A 1S1WA 2RF2A 1S9EA 4CZHA 3IKMA 1UAXA 2P9PB 3I55N 4C1NI 2DFHA 3U6FA 3VA3A 1X9JA 2KZZA 4ZHRA 4I7FA 3M1FA 1G99A 2VWJA 4OKJA 1BHLA 1VQKN 2HF3A 4OKEA 4BROA 5AZJA 3D6RA 1YHQN 4OX9K 1RT3A 1Q81O 4CJVA 3OYKA 3DLBA 3VQAA 4AF1A 4M7XA 5BRHA 3D2EB 3AV9A 3LANA 3QEXA 3O1WA 4FM2A 3FZFA 4Y1DA 3O3FA 3SI6A 2HHWA 1HLUA 1NK8A 4YNQA 5CR4A 1GLFO 3ZT4A 3JYTA 4Y1CA 5H1SQ 4FWMA 5JLHA 4MO4A 1N33K 3QEVA 1RT7A 2WOMA 2YCHA 3KLGA 3WEEA 3VF6A 5MLCQ 1GLJO 1SL1A 3SBGA 3THWB 1JCFA 4OGCA 3EL2A 4CHOA 3SUOA 3QINA 3ZEUA 4B9VA 1S72N 4JLHA 3HZ6A 2O8FA 1QVFM 3ULDA 3LAMA 1DTQA 3FZLA 3BDPA 1WSGA 4JHDB 3TAEA 4B9LA 4B1UB 1VSFA 4A57A 3DXKA 5F2RA 4Z94A 1WNSA 3DXMB 3NBPA 4C8KA 3RSEA 4DV3K 1N6QA 1QQMA 4FLTA 3KKSA 3JAMO 2HBLA 2ZJPL 2KW4A 4KHYA 4GW6A 3MEGA 2AP1A 4O8KA 1RTIA 3I0RA 4WYBA 3DJCA 3AAQA 3CC2N 5BPNA 1IKYA 2XRIA 1J54A 2YKNA 2P51A 4CGFA 3BF1A 3O9TA 3KWIA 4KH4A 3MAQA 1SKWA 1OH8A 4Z4EA 1ASVA 3AAPA 1KRPA 1M1KO 4IEIA 1HKCA 3OYLA 3H1VX 3ZX2A 2QWPA 4K25A 4DU3A 5J2QA 5M1NA 1NMDA 3AVHA 3IRXA 4GVEA 3QICA 4IBNA 1W0HA 1KD1O 3J7YP 2Q1NA 3GDQA 3FZMA 1I3AA 5HROA 1B9DA 1Q82O 4LF7K 3NFAA 2XY5A 2E8AA 3AO2A 1N36K 2ITGA 5CY4A 3OVNA 4WQ4A 3CJAA 3KVGA 4WCEL 4BRPA 5J1EA 3MXJA 4BQLA 3OS2A 3T1HK 1WUAA 4OJRA 3ISNC 3OYAA 1X9MA 5E26A 3HXMA 4FW1A 5C10A 1ZBFA 3PIPL 2V51B 3AVCA 3QBXA 2WUSA 3HTVA 1E4GT 2HBKA 2ZJQL 3OA9A 4LF9K 4H03B 2A41A 3PX6A 1VSHA 4B9TA 3OYBA 3MWPA 5HRRA 1EKEA 2E2OA 3KD5E 3VEXA 4CZEA 2RKIA 2YHAA 1L5UA 4JI5K 4N47A 4BE1A 2Y1JA 4BC3A 1DLOA 4BC4A 2CGJA 3DMJA 4J2AA 1BUPA 2BDPA 5C2FA 4YOUA 3NH1A 4CGGA 3IS9A 2HHUA 1RDDA 4CFCA 3C6TA 3VQDA 1HPMA 4B9SA 1E4FT 3ULEB 5C24A 4JI8K 3O6WA 4W5QA 3HK2A 4JKHA 3NAEA 4DSLA 2KQ2A 2Q36A 4B3TK 4CGIA 1RTHA 3ZLJA 5J2PA 3OJUA 4AQYK 3DRPA 3TAMA 1TL3A 2YNIA 3NHGA 3ATUA 3CI5A 3VF4A 3O4QA 4FJKA 2QWRA 1SZ2A 2HF4A 4CBUA 3FZHA 2A42A 1ESVA 2P9KA 3AO3A 3F73A 5LMUK 3I8DA 2HBMA 3CETA 1GLBG 2IS3A 3MX2A 4I6MB 3CJ9A 2I5JA 1WBBA 3D0PA 2O8DA 1TAQA 4HWIA 1ITGA 4FJNA 4B1ZA 5A2QO 1VQLN 3OYEA 5F1XA 3FFIA 3OYNA 1XHZA 2RE2A 4CJ4A 4IJNA 1GLEG 3KK3A 3B6PA 5AQNA 5HOOA 1KVBA 3NH2A 1WBDA 5AFUH 3U3GA 2F4VK 2O8BA 2OPRA 4W5TA 4CF1A 4DQ8A 1DEJA 1OVYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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