1YAGA

Structure of the yeast actin-human gelsolin segment 1 complex
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
publication title The structure of nonvertebrate actin: Implications for the ATP hydrolytic mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
total genus 116
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yagA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yagA04
3DXKA 5AZJB 4CZKA 5AQGA 3RSEB 2QXLA 1DEJA 3R6MA 4FPBA 4GY2B 1JCGA 2HMPA 1GLAG 2Q1NA 2PAVA 3WQUA 2ASOA 1DKGD 4DB3A 2E20A 3P4IA 2DPNA 1BOTO 4YDUC 4BVOA 3J8AA 1QQNA 2FF6A 2ITMA 2HOEA 4CZIA 4BRIA 3H6EA 4ISGA 2J4RA 2Q31A 4O5FA 3R8EA 4BR4A 3L4IA 2Q36A 1V4SA 4BR7A 4H5TA 1LOTB 3FFKB 3B8AX 2V7YA 2Q2RA 3MK6A 2P9NA 3H1VX 2W40A 4XH4A 3GE1A 3QICA 4BRKA 3ZX3A 4A61A 1HKCA 3CI5A 2PBDA 3C0BA 3KZBA 2Q97A 3BEXA 1HX1A 4B1WB 5LJWA 3L0QA 4I6MB 3ATVA 3AY9A 4K42A 1BA0A 4BRCA 5FPEA 2QM1A 3L6QA 2YHWA 5ADXH 3FLCO 4PL8A 1ATNA 3CIPA 1NGFA 1NGBA 4QS8A 5EXWA 4BR5A 4CD1A 5AQIA 3GG4A 4O8KA 3SMPA 1V4TA 2V7ZA 4BR0A 3GDQA 2KHOA 4FWQA 1QHAA 5AQSA 1MDUB 4CZHA 1GLDG 3MDQA 3BUZB 1ESVA 5F2RA 4B1UB 4BG8A 2E8AA 4MO5A 3LDNA 3WXJA 5LJVA 1KXPA 5AR0A 2CH5A 2FSKA 4DHYA 1T44A 1GLJO 3BP8A 3LDPA 3VESA 2D0PA 2QWPA 4IXCA 4BC3A 3OHRA 1BO5O 3VEYA 3HZ6A 1NGEA 2W41A 3BF3A 3I8BA 3LM9A 1U6ZA 4BRQA 3QB0A 1T6CA 3QFPA 3VENA 3QBWA 4FWPA 4H5RA 5AFUA 1NGIA 4BREA 1C0GA 5KPZA 2E1ZA 1JCFA 5AQUA 5BPNA 2P9LB 3HBTA 2NRHA 3ENHA 4XEIA 5E84A 2P9KA 2E2NA 3G25A 5AQWA 4A62A 1X3NA 4HWIA 1ZC6A 3U9DA 4IWVA 1NGGA 3UKRB 3WXIA 1QQOA 2FXUA 4H03B 4BRNA 4FWOA 5AQVA 4CZFA 5AZIA 3UKUB 3O1BA 1H1VA 4BVPA 4BGBA 1OKJA 4PL7A 4DQ8A 1HJOA 4BG9A 1JCEA 2V51B 5I9EB 2ZF5O 1K8KB 4E1JA 2GWJA 1ZXOA 2A42A 3EKUA 1TYQA 4K43A 1S3XA 1QQMA 2AP1A 4BC5A 1Q18A 4JHDA 4IJAA 3FE1A 4WQ4C 4LC9B 2A6AA 2P9PB 3HM8A 4BGAA 2HF4A 3F9MA 3H3NO 3UB5A 5KQDA 4CZMA 3CJAA 1SAZA 3D2EB 3IFRA 3DAWA 2I7NA 2P9UB 1QZ6A 4HTLA 4B1XB 1Y64A 2ASMA 2CGJA 2QWRA 3CHWA 3ID8A 1HLUA 3VGKA 5BN9A 3EN9A 4NO7A 5E26A 1E4FT 4BRPA 3JS6A 4B9QA 3EZWA 5AQHA 3VERA 4AM6A 3U8XA 4ISEA 4BR2A 4BQZA 1MA9B 2YCHA 5AQOA 1YVNA 4KBOA 3ULEA 3MN5A 1BDGA 3A0IX 4CI6A 1KAXA 2Q0UA 5AQYA 1BG3A 3BF1A 1HKBA 3CJ1A 4FWSA 3MCPA 3KHYA 5AZJA 1E4GT 1GLCG 2FLOA 1G99A 3MN6A 3RSEA 2NZTA 2V52B 2YJEA 3TPQA 2HF3A 4B1YB 2P9IB 1SZ2A 4J8FA 2ZGZA 1LCUA 1TUUA 1YXQA 3H45C 3I33A 3LDOA 4NB4A 4BRLA 5KPRA 4BRFA 4RCHA 3UE5A 3CJ9A 5EVZA 3ZEUB 4M7YA 1HKGA 2GEMA 1BA1A 4MLEA 2NLXA 2A3ZA 4CBXA 2AA4A 3HI0A 3QDKA 4FWKA 4JNEA 2BUPA 4GNIA 5ELZA 5B8HA 3D2EA 3U9ZA 3O1WA 3A5NC 3IDHA 4FL9A 1EQYA 2BTFA 3GL1A 5LY3A 3LM2A 2ZWHA 3H1QA 2WUSA 4EAHD 2IVPA 1NM1A 5AQQA 3U4LA 4BC2A 2IIRA 1S22A 2F9WA 2A5XA 4BRGA 2YJFA 4BRMA 5FPNA 2E2PA 2QWNA 4BRHA 5AQMA 4CZGA 2FF3B 4I6MA 4EIAA 1X3MA 2P9IA 3CQYA 4PKGA 3WQTA 1XUPO 2E1YA 4FO0A 5AQNA 4FPAA 4H5VA 4CJ7A 1J6ZA 2YI1A 4A2BA 5F1XA 1NMDA 1BU6O 1YUWA 4K41A 3WEEB 1WUAA 3DXMB 1HUXA 3TU5A 3ZETB 4RTFD 3C7NB 4FWLA 3VEZA 3HSCA 4BRAA 3ZX2A 4BRDA 4DCHA 5BREA 5KPTA 5KQ8A 1U2VB 2Q0RA 2P9SB 1C0FA 1GLFO 1IG8A 1SQKA 3DXKB 3A5MC 1NBWA 3O8MA 2GELA 1GLBG 3VEXA 2GTDA 3AAPA 3ATUA 1IJJA 4FWNA 1MWKA 4CD3A 5BN8A 2VWBA 5JMVA 1HPMA 1XC3A 1ATRA 1NWKA 3VPZA 4H5WA 5AQKA 5AQRA 1NGHA 4CBWA 4XH1A 3H46O 5EX5A 4H0XB 3QBXA 5BRFA 3WUHA 3CQXA 2FSJA 3O4WA 1KAYA 3WEEA 3DXMA 3FZLA 4EHUA 4C23A 5AQXA 4BQLA 2P9LA 2VCPA 4K25A 3M6GA 4CZEA 3FZHA 1U2VA 3VF6A 1XQSC 3IMXA 4IJNA 2D0OA 3A5OC 5AQZA 5JICA 4Y0WA 2I7PA 3VGMA 1NGJA 3QMLA 3R9PA 4CZJA 5BRDA 3VOVA 3M1FA 3UKRA 4A2AA 2IVNA 5BPLA 1R59O 4XH5A 3MN9A 4H5NA 4JN4A 3UKUA 1MWMA 3GOIA 4FOEA 4BR9A 1X9JA 5EY4A 5FPDA 3H3OB 1K8KA 3FR0A 3A8YA 5BRHA 1RDWX 2OANA 4H0OA 4IZ9A 1ZBSA 3ENOA 3O80A 3SLCA 1Z6RA 3DJCA 4BROA 2P9PA 4H0YB 2GUPA 4F9OA 2E2OA 3CJBA 3FZMA 4ISFA 5JLFA 1Z05A 3EL2A 2P9UA 4CBUA 2E88A 5AQLA 3VGLA 1QZ5A 4Z94A 4L3QA 3SK3A 4WQ5A 3EKSA 1NLVA 2D1KA 1BUPA 1T6DA 4RWTA 3MMVA 1YAGA 4H0VB 3M3ZA 3FZFA 2E2QA 5CE3A 3WXKA 5TKYA 4B1VA 2GWKA 4H0PA 4M7XA 5ADXA 3VETA 5BR9A 3W0LA 4M63C 3CJCA 3QFUA 4PKIA 1D4XA 3GBTA 4CZLA 5AQTA 4EFHA 4QS7A 5AFUH 2IVOA 3SMSA 3LDLA 3CJ7A 2P9KB 2YHYA 2ZGYA 3LL3A 3VF2A 2VYPA 3WXLA 5BPMA 3ZEUA 2QWLA 3CERA 4EHTA 4QS9A 2CH6A 3D2FB 3O5BA 1CZAN 3HTVA 1NGAA 4WQ5C 3SJHA 4H0TB 5AZIB 4JD2B 2QWOA 5FPMA 4FOIA 3ZX0A 2F9TA 2UYTA 4JAXA 5JLHA 1TYQB 3VF4A 1TUYA 2A41A 4FWMA 1RGIA 3JXUA 4JHDB 3S41A 3VEVA 4FWRA 3O08A 3LDQA 2QW9A 1DGKN 2QWMA 3VEWA 1NGDA 5AQFA 1ATSA 3W3DA 3IUCA 1P8ZA 1NGCA 2A40A 2H3GX 3AARA 3MN7A 4WQ4A 2CGKA 4YDUA 3A5LC 1BWFO 4MLHA 3FGUA 4B1ZA 3EO3A 1GLEG 3VEOA 2EWSA 4BC4A 3DWLA 3O6WA 3D2FA 3AAQA 1KAZA 4PKHA 2FSNA 5AQJA 1WOQA 3FZKA 3ZETA 5F0XA 2P9NB 4WYBA 1GLLO 3C7NA 4AM7A 3ULEB 2QWQA 3KVGA 5EOYA 2CGLA 2YHXA 4JD2A 1RFQA 4MO4A 3WT0A 4FSVA 2P9SA 2D4WA 5AQPA 4IO8A 3CETA 2ASPA 3D7EO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXKA 1NJZA 4CF1A 1QSSA 3KKSA 3OYMA 4FPBA 4OKJA 1L3VA 3O4QA 3CFOA 1TK5A 2G8HA 3QEIA 5HRNA 1BI4A 4DR2K 2PYLA 3QEVA 4E7IA 4O0IA 3FFIA 1L5UA 3N4QA 1EP4A 3K59A 2J4RA 2Q31A 5GADP 1NKEA 4B8CA 3L4IA 4R5PA 1V4SA 4BR7A 3HPHA 4CK1A 1LOTB 3FFKB 4DQPA 1IKXA 1ZBHA 3B8AX 4KV8A 2G8IA 1VSLA 1EETA 3Q7CA 4DTUA 3GE1A 4BRKA 4BWMA 3KD1E 4C1NK 1RCHA 5CZ2A 2E5LK 3WXMB 1VQ9N 2Q97A 3NF7A 1HX1A 3MXJA 5LJWA 4BE0A 4FK4A 4NLBA 3ATVA 3AY9A 4K42A 2HW3A 4GVEA 2HHIA 2QM1A 3L6QA 5ADXH 2G8UA 3E66A 4PL8A 1ATNA 4FZXC 2O8FA 3S9HA 1NGBA 3NVKA 4CFDA 4BR5A 4N5SA 2HMIA 4IDHA 2OCEA 3BDPA 1GOAA 4DR3K 2DFHA 2YNIA 1VQLN 5EU7A 2ETJA 1U04A 2YV0X 3THWB 3LDNA 3LP2A 3AVKA 1L3UA 3KJVA 1WAFA 4LH5A 2ZJQL 2OPRA 1NKBA 1T44A 3B6PA 1GLJO 3VESA 2Z1GA 3M8PA 3OHRA 2OYQA 1BO5O 3HZ6A 4G1QA 3NE6A 2IGIA 2RF2A 3M8QA 1LWEA 1XNQK 3SCXA 4BRQA 2W6LA 1T6CA 2NRTA 1VSDA 3OVNA 1NGIA 3SZ2A 1CXQA 4V19S 3VTHA 1C0GA 4DS5A 2HHWA 4CHZA 5CYQA 2P9KA 1NJXA 3G25A 4CEQA 2R7YA 1JLGA 1GOBA 4Z4HA 1S5JA 4FLTA 1NGGA 4OJRA 4YORA 3MX5A 5A2QO 2FBXA 4CFAA 3V4IA 1KTQA 4YOUA 3VQ4A 1RTDA 1BIZA 4F3OA 4FLZA 3E01A 4UY8O 1YJNN 3EKUA 2PZSA 1S3XA 2AP1A 3NF9A 2KZZA 1Q18A 4DMNA 3FE1A 3VQDA 2P9PB 5M1KA 3F9MA 3UB5A 4CHOA 5J1EA 3CJAA 2BH1A 1SAZA 1NG9A 3KLGA 1VQ8N 1M1KO 1XWLA 4LFCK 3ID8A 2PYJA 3EN9A 4CHPA 4C8MA 4B08A 4WFBL 2OPPA 3EZWA 3OYLA 4BR2A 4DR5K 3U8XA 4Z0UA 3NGIA 2YCHA 4DUYK 5AQOA 3A0IX 2NRXA 4CI6A 4N76A 1IV0A 2JGUA 5LMUK 3CJ1A 3P5JA 4FWSA 5HBMA 1X9SA 3DOKA 3ZLJA 3RSEA 2YJEA 3TPQA 1TK0A 4B1YB 2P9IB 3V9SA 4RG8A 4J8FA 1QVGM 1LCUA 1TUUA 2Z1JA 1YXQA 3H45C 4BRLA 4JS4A 1NK6A 4DSLA 4RCHA 4M7YA 4DSEA 2UUCK 4DLEA 4CW7B 4CK3A 1VRUA 2WONA 1WSHA 3QDKA 4QAGA 3VQ7A 5FDLA 3TTCA 4GNIA 2A1RA 2X74A 5C2FA 3D2EA 3U9ZA 3HVRA 3OBYA 3A5NC 3JSMA 3JAMO 2BTFA 3HOTA 1WSIA 3TAQA 4IBNA 2JLEA 2B6AA 2HHXA 4GMJB 1P90A 2ZWHA 1I39A 2F96A 1IBMK 3TTFA 4KHNA 1NM1A 2Z1HA 3U4LA 1NOYA 3P31A 2O8CA 2IIRA 4JK8A 3HT3A 2UXDK 2E2PA 3L2QA 2O8BA 4BRHA 1C6VA 3PUFA 4CZGA 3DOLA 4DV6K 3SUPA 2KW4A 3CQYA 1BCOA 3CMEN 4DV5K 2VGMA 3OYCA 5M1PA 2E1YA 1EXQA 4FO0A 1FKOA 4FPAA 5DK5A 3PSFA 1WUAA 1ITGA 3ZT2A 3TU5A 3PY8A 4BRAA 3ZX2A 4I9LA 5KQ8A 5C25A 2P9SB 1C1CA 3THYA 3DXKB 4C1NI 3O3GA 3VTIA 2GTDA 3AAPA 1IJJA 1MWKA 5BN8A 1D5AA 2VGNA 1BI4B 1NWKA 4DR6K 4KB0A 2UXBK 3DM2A 3EZ5A 1L3TA 4YOXA 3CQXA 3AA5X 1NJYA 1SL1A 3ZSWA 1RBTA 1Z26A 1KSPA 3SQ4A 2LSNA 4BE2A 4FJXA 1L3SA 1DLOA 4B9SA 4JEPA 1LWFA 3NMUA 3AGKA 1EX4A 3KIOA 3ZSXA 2IOCA 1IO2A 4E72A 4DF8A 1U49A 4Y0WA 4F8RA 3VGMA 3R9PA 2HBKA 3QMLA 4KPYA 2HHTA 1K8AO 1DTQA 4LSLA 3SAFA 2JWKA 2O8FB 1IBKK 3DLLL 3H08A 3OS0A 3MEGA 4X66K 3DMJA 1MWMA 3UKUA 4BR9A 5HLFA 5FRNA 1VQON 4W5TA 5FPDA 4IKFA 4Z4FA 1K8KA 4Z4IA 3A8YA 4DFMA 3DLHA 3O80A 4UQGA 2YHBA 3DRPA 3IS9A 4WF9L 4CJTA 2GUPA 4CJ3A 3SBGA 1VQPN 4CFCA 1ZYQA 2BDPA 5JLFA 4OPHA 2P9UA 3AVGA 1X1PA 2E88A 3ITHA 3LAKA 4CGFA 1VSMA 3SAGA 2OTLN 4WE1A 1LV5A 1T6DA 1BUPA 4R79A 3MMVA 4FM0A 4DTPA 3SV3A 3TI0A 3M3ZA 3MXMA 5CE3A 5TKYA 3VA0A 2VQEK 2OZSA 3ZSOA 1S1VA 3KLHA 2GWKA 5I42A 1XC9A 4KB1A 4ID1A 4CE9A 5BR9A 3QIPA 3GBTA 3NF8A 2Q3SA 3J7AP 5AFUH 2IVOA 3LDLA 2P9KB 5LMNK 2ZGYA 4DV2K 5BPMA 2NRVA 3ZEUA 3CERA 1HNVA 1TKDA 4QS9A 2CH6A 3LZJA 1JL2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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