1YAGA

Structure of the yeast actin-human gelsolin segment 1 complex
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title The structure of nonvertebrate actin: Implications for the ATP hydrolytic mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 116
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yagA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yagA04
4RWTA 1RFQA 4BQZA 3DXMB 3A5LC 5FPMA 5LJVA 5BREA 3A5OC 4BRKA 1TYQB 5AQVA 2IIRA 1NGCA 1Z05A 2PAVA 1U6ZA 2A41A 1BG3A 3LDLA 3U9DA 1X3NA 4PKIA 2V7ZA 3H1QA 4BR9A 3VETA 3UKUA 3ENHA 2UYTA 4JD2A 1YXQA 3CIPA 3UKRB 4EFHA 3O8MA 3LDOA 2ZF5O 3CJ9A 1XUPO 4H0PA 4MO5A 2FF6A 4B1VA 3SJHA 4DB3A 3D7EO 3WUHA 4CBUA 2F9WA 5BRHA 5AQMA 3BF1A 4BRCA 2ZWHA 3JS6A 4FWLA 4FOEA 2QWOA 4WQ5C 4FO0A 3I33A 2P9SA 1KAZA 4M7XA 4FWQA 3FZLA 5FPDA 3O4WA 3WXJA 4IZ9A 4B1UB 5JLHA 3W3DA 3FE1A 3DXKA 4A62A 5KPTA 3EN9A 4CBWA 2QWNA 3VEOA 4PL7A 4XEIA 4M63C 3AY9A 3SMPA 3HZ6A 4NB4A 2E2PA 5BN8A 3OHRA 4AM6A 3RSEA 4BRGA 1NMDA 1G99A 3O80A 5FPNA 3CJ1A 4Y0WA 5AQSA 4FWMA 4BG8A 2KHOA 4BR2A 1H1VA 4FWPA 4BRNA 4CZGA 4HTLA 1J6ZA 2E88A 3ZX0A 1TYQA 3O1BA 4CD1A 1X9JA 1S3XA 5AQZA 3GBTA 5AR0A 3QFPA 3J8AA 1XQSC 4BRMA 4EHTA 3QBWA 2D0OA 3ZETB 3VF2A 1WOQA 5AQNA 1QZ6A 4CZLA 3H46O 4YDUC 4H0YB 3GOIA 3HSCA 3EKUA 4WYBA 3UB5A 4DCHA 4K25A 2A5XA 2NZTA 4WQ5A 2J4RA 2AP1A 2V7YA 2ASOA 2A42A 3MCPA 4RCHA 3A5NC 1Q18A 3SK3A 4BVOA 3EZWA 1HJOA 4PL8A 3VGMA 3P4IA 1NGJA 4JN4A 3FR0A 2GEMA 3H6EA 2HF3A 1GLAG 3U9ZA 3SMSA 2FSKA 2FF3B 3U4LA 4C23A 4GY2B 3LM2A 4KBOA 5TKYA 3GE1A 5AZIA 4J8FA 1R59O 2QM1A 5AQGA 2P9NB 4AM7A 1NGIA 2QWRA 3EKSA 2ASPA 2QXLA 3WXLA 4JHDB 4H0VB 2P9LA 3DJCA 1EQYA 2P9IB 5F2RA 5AQOA 2WUSA 1ATRA 4BR7A 2NRHA 1NGDA 5AFUH 2FSJA 1MDUB 4CD3A 2CGLA 1HUXA 3CJCA 2GWJA 3MN9A 4BC3A 3ZEUB 2NLXA 4ISGA 3VEXA 4BR5A 4DQ8A 3DWLA 1YAGA 4YDUA 5AQQA 1QQOA 2FXUA 3L6QA 1NLVA 3D2FB 5AQWA 2QWLA 1DKGD 3HTVA 4IXCA 2EWSA 3GG4A 2Q2RA 2GTDA 3VOVA 5EY4A 3QICA 5AQYA 3WXKA 3ATVA 2YHXA 3ZX3A 5AQLA 1DGKN 4XH5A 1T44A 3VPZA 5I9EB 3TU5A 4EHUA 5AQFA 3A8YA 4BQLA 4HWIA 1K8KB 4CZIA 2CH6A 3WQUA 3C7NB 4PKHA 4O8KA 4BROA 2IVNA 2YI1A 2P9NA 5JMVA 2DPNA 1NWKA 4FWNA 2P9UB 2P9PB 4JHDA 5BRFA 1HKBA 1U2VB 3ULEA 1NGBA 2P9IA 3MMVA 3CJ7A 1BDGA 3WQTA 4BC2A 5EOYA 3CERA 1YVNA 2Q0RA 3W0LA 4BGBA 3L0QA 4QS7A 1ATNA 3AAQA 4CZFA 4DHYA 4H5TA 3LDQA 4FOIA 4LC9B 4CJ7A 1RDWX 3ZX2A 3DXMA 5FPEA 3L4IA 2IVPA 2D4WA 4IO8A 2GUPA 5ADXA 1TUYA 1V4TA 1HX1A 1ZXOA 3CETA 2OANA 4H0TB 3D2EB 1S22A 3QMLA 4ISFA 2ASMA 1ZC6A 5AZJB 2HF4A 1LOTB 2D0PA 3D2FA 3O6WA 3UKRA 1CZAN 1NGGA 2E1YA 2ZGYA 3QBXA 3B8AX 1QHAA 5AQIA 3IUCA 4I6MB 3BP8A 4B9QA 4IJAA 4MO4A 2Q31A 5KQDA 3CQYA 3GL1A 4O5FA 1NGHA 3R9PA 1OKJA 3IMXA 4K43A 1QZ5A 1V4SA 5AQUA 3CJBA 4ISEA 3QDKA 3C7NA 3ID8A 5BPMA 2E2QA 1KAXA 3CQXA 2YHYA 3IFRA 4IJNA 3MN5A 4BGAA 2PBDA 3HM8A 5BPLA 2P9UA 1NGEA 1U2VA 3R8EA 5KPRA 4H03B 3SLCA 1BWFO 3UKUB 4QS8A 5B8HA 3FZMA 5CE3A 2P9KB 4CZJA 3QFUA 2HOEA 3VF4A 2A3ZA 4CI6A 2I7PA 5AQPA 3R6MA 2QWMA 4H5RA 3VF6A 1GLBG 4A61A 1BOTO 1C0FA 3CHWA 3MDQA 3EO3A 4B1YB 3D2EA 3O08A 1ESVA 3M1FA 5AZJA 4PKGA 2P9SB 2Q97A 3WEEB 3VGKA 4XH1A 3IDHA 1XC3A 3AAPA 1IJJA 2FLOA 4H5NA 1DEJA 3ZETA 4A2AA 1E4FT 1HPMA 2QWPA 2BTFA 2YCHA 3FZHA 5BN9A 4B1XB 1NBWA 3M3ZA 5BPNA 3RSEB 2FSNA 4FSVA 3DAWA 3VEYA 2YJEA 4FWKA 4CZKA 3WXIA 1BUPA 3UE5A 2VCPA 1SQKA 2E20A 1QQMA 5F0XA 4BC4A 2A40A 3O5BA 4L3QA 4BRFA 4BRQA 4BRAA 5LJWA 1TUUA 4NO7A 1NM1A 3H3NO 4F9OA 1HLUA 3S41A 5KPZA 1LCUA 1E4GT 4H0OA 3CI5A 4XH4A 1T6DA 1Y64A 2W40A 2P9KA 1QQNA 4K41A 3BEXA 4WQ4C 2YJFA 3EL2A 3LL3A 5KQ8A 4E1JA 3BUZB 2E8AA 5E84A 1X3MA 4B1WB 5F1XA 1HKCA 3M6GA 3H1VX 1WUAA 1GLCG 1GLJO 4BR4A 2Q0UA 2YHWA 4RTFD 4BR0A 4FWRA 5AQTA 3WT0A 4BG9A 5ELZA 1JCEA 4BRDA 3O1WA 4CZEA 3VEZA 3MN7A 3GDQA 3WEEA 3KZBA 2IVOA 3H45C 3JXUA 2F9TA 1GLFO 3QB0A 4JAXA 4A2BA 1KAYA 4BVPA 3MK6A 1MWKA 1NGAA 5AQHA 3ZEUA 4EIAA 2VWBA 1RGIA 4MLHA 5ADXH 3FZKA 2V51B 3KVGA 4H5VA 1BA0A 4FL9A 1MWMA 3MN6A 3A5MC 3LDPA 5LY3A 4FPBA 3TPQA 2E1ZA 4CBXA 5AZIB 4FWSA 3VERA 2Q36A 1ZBSA 4EAHD 2P9LB 3FLCO 5EX5A 2D1KA 4K42A 2CGKA 3HI0A 1SZ2A 1BU6O 5BR9A 1T6CA 5AQKA 4B1ZA 2QWQA 2V52B 3LM9A 3A0IX 1K8KA 3FFKB 1GLEG 2QW9A 2A6AA 3LDNA 3VESA 4WQ4A 5AQXA 2BUPA 1SAZA 1C0GA 5BRDA 1Z6RA 2E2OA 2P9PA 4JNEA 2H3GX 2CH5A 4FPAA 4MLEA 2GWKA 1BO5O 4QS9A 1P8ZA 3ENOA 1D4XA 5E26A 5EXWA 4JD2B 1KXPA 2E2NA 3C0BA 4CZMA 4BREA 1JCFA 1MA9B 1GLDG 2HMPA 1YUWA 2I7NA 3KHYA 4BRHA 1GLLO 1HKGA 2ITMA 3BF3A 3CJAA 1NGFA 3G25A 3U8XA 3F9MA 3VENA 2Q1NA 3FZFA 3AARA 4BRPA 5JLFA 3ATUA 5JICA 1BA1A 5EVZA 3VEWA 5AQJA 3HBTA 3VEVA 3DXKB 2AA4A 2VYPA 4CZHA 2CGJA 3H3OB 4FWOA 4I6MA 1ATSA 4H5WA 4M7YA 5AQRA 3ULEB 2GELA 4IWVA 4H0XB 4BRLA 3VGLA 4BRIA 5AFUA 2ZGZA 2W41A 3FGUA 4GNIA 4BC5A 4Z94A 1IG8A 1JCGA 3I8BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXMB 5FPMA 1S1TA 1KRPA 2NRTA 1NGCA 4B3SK 3ZSVA 5FRNA 2A41A 1VSDA 1BG3A 3ALYA 4AF1A 4PKIA 2V7ZA 3H1QA 4LF5K 3VETA 5HP1A 1XC9A 1I3AA 3SNNA 3SQ1A 3O8MA 3M5RA 4Z4GA 3ID6A 3OYDA 4CIGA 5AQMA 2ZWHA 2KKZA 3E1YA 4FWLA 3TTCA 4AILC 1T8EA 3CCUN 3I33A 4JKFA 1NOYA 1C1CA 3FFIA 4BWJA 5HRNA 4AHSA 3FZLA 3LP2A 1RTHA 1NKBA 3NF6A 1SKRA 4IZ9A 4IFVA 3W3DA 4OLBA 3MEEA 3RR7A 3PIPL 4B9NA 2QWNA 4XEIA 5TKWA 4DV6K 1VSEA 5BN8A 1RT5A 4JI7K 3THYA 1K73O 4BE2A 3VN5A 4JI0K 4GMJB 5AQSA 4FWMA 3MX2A 5M1KA 4KV8A 3LZJA 4BR2A 3SPZA 4JK8A 4FJ9A 4FM2A 1HYZA 2E88A 5EU7A 4CD1A 3DM2A 1YITN 1Z25A 3GBTA 3HJFA 1NMNA 3QFPA 3J8AA 3TTFA 4JK7A 5GAHP 4EHTA 3O9QA 3HPOA 3VF2A 3K9JA 1QZ6A 4CZLA 1N36K 3G10A 2XY5A 2GV9A 4DQIA 1S1WA 2HBLA 2BE2A 3UB5A 4DCHA 2A5XA 4WQ5A 4IO9L 1P90A 4AHRA 4RW7A 2ZJRL 4O44A 1HYSA 4RCHA 1XNQK 1IO2A 1HJOA 1VSMA 3WNGA 4HUGA 4PL8A 2XHBA 1RTDA 3HL8A 2KFZA 3AO3A 2HF3A 4M3RA 4M3TA 3VQBA 4Z4EA 2O8FB 3U4LA 3LM2A 3CCSN 2HHVA 3B6PA 2ASPA 4H0VB 3E9OA 4IOCL 2O4IA 3HXMA 3N4PA 1TKDA 4EP5A 4DLEA 3JSMA 4E7LA 2FSJA 3CCRN 4CD3A 4F3OA 4JS4A 1NJIO 1JLCA 4XIUA 3QIOA 4LFAK 3VEXA 1EETA 5AQQA 2FXUA 2VG7A 2GX9A 3JYTA 1C0UA 3I0RA 4YOXA 3HTVA 4O8UA 3J81O 2UU9K 1Q8IA 4YY3K 4FJJA 4CEFA 3ATVA 2YHXA 1ITGA 4JKEA 5J1EA 4OPKA 4FK4A 1TK8A 3T1HK 4FM1A 3VPZA 3G6EN 4ZTFA 3HP9A 4CCHA 4DR2K 1TK5A 5BR8K 4DQPA 1IKWA 1K8KB 4CZIA 1B9DA 1RT3A 4H4OA 2F7TA 2P9NA 5JMVA 2DPNA 4C8NA 1IBLK 3VQ7A 1OVQA 1VQON 2P9UB 4JHDA 4R5PA 3ULEA 1NGBA 2F8SA 4M3XA 5EOYA 3L0QA 4QS7A 4H5TA 2ITGA 4CFDA 3NCIA 3ZX2A 2HHSA 4I7FA 2IVPA 2GUPA 5ADXA 4DR5K 4FLTA 1HX1A 1Q81O 3SUNA 3ZT3A 3KJVA 4ISFA 5AZJB 2HF4A 4DU1A 3TAPA 2HVHA 3CQ8A 5GAEP 1K8AO 1CZAN 3ZSRA 2ZGYA 1L3UA 4GV6A 1RT1A 4IBNA 3B8AX 3CFOA 1TK0A 5AQIA 1HNXK 3KWIA 1CXUA 4MO4A 2Q31A 2DTUA 1SL1A 4E7JA 3AA5X 2KQ2A 3OS1A 1NGHA 1VRTA 5FLXO 1QZ5A 5AQUA 3NDKA 2FBYA 3C7NA 3CFPA 4PHTX 5BPMA 3RTVA 3CQXA 4IJNA 4CHPA 1NGEA 4W5TA 3OJUA 3AGKA 5KTQA 3SLCA 5CYQA 3UKUB 3F2KA 1LWCA 3HRGA 5DK5A 2OPSA 1JXBA 3O3HA 3CCLN 2KW4A 4F4KA 1NK5A 3R6MA 4CJUA 1VRUA 1XI1A 1GLBG 2OPRA 3QEXA 1BOTO 1C0FA 3S9HA 4CHQA 1RT7A 5MLCQ 4CJKA 1NU0A 5I42A 3A2FA 2P9SB 3CPEA 1VQ5N 3BZCA 3VGKA 3AO4A 4XH1A 3F9KA 2PZSA 4KHQA 1XC3A 3AAPA 3THXA 3MEGA 3AVKA 3ZETA 4A2AA 1RBTA 3PUFA 1T7PA 4M42A 3ZYYX 2YCHA 3AO1A 3FZHA 5BN9A 1IG9A 3D6RA 5HRRA 4E7KA 4JI6K 3RSEB 4FSVA 1QVFM 4DMNA 4CZKA 3NF9A 5CZ2A 1BUPA 3WNFA 3O3FA 3OY9A 3QINA 2HSTA 4DTRA 2E20A 3RMCA 1WNSA 1NKCA 1ZBHA 1TUUA 3OYFA 1KVBA 3KTQA 2RN2A 3VQ4A 3RWUA 4W5QA 1WBDA 1T6DA 3CCMN 3LAMA 1EWRA 1QQNA 1SS6A 4WQ4C 4Z0UA 1WAFA 3BUZB 5GIOA 4B1WB 4FZYA 3MWPA 1EWQA 3OYLA 3H1VX 1WUAA 4RTFD 3JXUA 2F9TA 4JAXA 4FJIA 2O8DA 5AQHA 3FZKA 2V51B 4FLXA 4BWMA 1XHXA 3V9ZA 1VSKA 1TKTA 3A5MC 3CCJN 2HHIA 4CBXA 4FWSA 3LPUA 5J2MA 2YNGA 1ZBSA 3MX5A 1L3VA 2P9LB 2HHXA 4C8MA 4DV1K 5KGXA 2OPQA 1QTMA 4J2DA 3T7ZA 2A1SA 2D5RA 5BR9A 1T6CA 3R1XA 4J2BA 3LDNA 4CFCA 3LP0A 5AQXA 3THVA 4UQGA 3OYBA 4CHYA 1YJNN 4JNEA 2H3GX 4CJ4A 1BO5O 3L2VA 2D0CA 2HNZA 4BREA 3DLGA 1HNVA 2HMPA 2QI2A 2I7NA 3AVNA 3MXJA 2RF2A 4BRHA 1F21A 2ITMA 3O3GA 3BF3A 1KD1O 4JRPA 3CJAA 2XY6A 2XY7A 2O4GA 2JGUA 3G25A 5JVHL 4CHZA 3NVMA 5CHIA 3VENA 3THWA 4FLUA 3OW2M 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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