1YAGA

Structure of the yeast actin-human gelsolin segment 1 complex
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structure of nonvertebrate actin: Implications for the ATP hydrolytic mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
total genus 116
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yagA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yagA04
3QMLA 5BREA 3DXMA 3ZEUA 3CJ9A 1BDGA 3UKRA 1LOTB 2A3ZA 3FLCO 3H3NO 3H1VX 3ATVA 2VWBA 4LC9B 3H3OB 4CZMA 4WQ5C 4BC5A 5AQGA 2BUPA 5AQIA 3WXLA 2YHXA 2A40A 1BA0A 4FWQA 4FOIA 2QWPA 1T44A 3DXKA 3CQXA 4ISFA 3DJCA 4BGAA 4FPAA 5BRFA 5CE3A 5AR0A 4CZIA 2GEMA 5AQMA 1C0GA 4AM7A 4PKHA 2ASMA 1MWMA 3EL2A 1MA9B 1ZC6A 3U8XA 4EAHD 3QICA 2P9NA 4CZLA 1NGCA 5KPZA 5BPLA 1K8KB 3VESA 4FL9A 2A41A 2YI1A 5KQ8A 1ATNA 3U9DA 5ADXA 2P9PA 3GE1A 3GG4A 2UYTA 3ENHA 3FZFA 4PKIA 3DAWA 1S22A 2P9LB 4XH4A 5BR9A 1U6ZA 4JAXA 3L0QA 4B1ZA 1H1VA 2EWSA 2GUPA 1E4GT 4CI6A 4BRQA 2PBDA 3DXKB 3UE5A 3VEZA 2FF6A 4DB3A 3P4IA 1IJJA 3CI5A 3WQTA 3VENA 2E2QA 1WOQA 4RWTA 4AM6A 3D2EB 2CGKA 2NZTA 3IFRA 5AQOA 3VEYA 1NM1A 4BG9A 1K8KA 3O8MA 3VEVA 4BG8A 4A2AA 1IG8A 2FSKA 3WXIA 1V4TA 3R9PA 4BVOA 1GLDG 4WYBA 1OKJA 2Q0UA 2QXLA 2A42A 3W3DA 1QQNA 2BTFA 1BOTO 5LJWA 4BQZA 1NGDA 4M63C 4XH5A 1XUPO 2GELA 4H0YB 3FGUA 4H5NA 5E26A 2QWLA 3RSEA 4FOEA 1NGJA 3WXJA 4L3QA 3EN9A 1HJOA 3VERA 3BP8A 5EXWA 3D7EO 2Q1NA 3DWLA 4H0PA 4A2BA 4M7XA 3LM9A 3CJCA 3LDPA 2D0PA 2P9UB 2E1ZA 2GTDA 4KBOA 3L6QA 5KQDA 5AZJB 2FSJA 5F0XA 4BREA 3KVGA 3ZEUB 2D0OA 1J6ZA 3ENOA 4C23A 4BRMA 4B1XB 2WUSA 1NBWA 1Y64A 2CGLA 1YUWA 4A62A 3ZETB 1XC3A 5EVZA 1SAZA 3A5NC 1NWKA 3HTVA 2CH6A 3CERA 1P8ZA 4FSVA 1GLJO 1LCUA 2CGJA 3O08A 1HKBA 4BRKA 1XQSC 4IJNA 2E2OA 4BR4A 1ATSA 3SMPA 4I6MB 4MO5A 3VEXA 4WQ4C 1TYQA 2GWKA 1NGEA 3A0IX 4BGBA 4BR5A 3HSCA 3TPQA 1NGGA 3LDLA 5EY4A 1NGHA 3O80A 3ULEB 4CZEA 4J8FA 2IVOA 3C7NA 3EO3A 3L4IA 4Y0WA 2ZGZA 2QM1A 1GLCG 1BG3A 4IXCA 5JLFA 4CZGA 4QS8A 5FPDA 2E20A 4H0VB 4CBUA 3SMSA 3U9ZA 1DKGD 3H45C 2I7NA 3WQUA 4CBXA 1U2VB 4H5TA 3EZWA 4FWMA 1EQYA 3FZLA 3FZHA 3WXKA 5AQQA 2E88A 2D4WA 4FWKA 4ISGA 1X9JA 3HBTA 3WEEA 4H0TB 2KHOA 2QWQA 3TU5A 4BRPA 3CJBA 4JHDB 4MO4A 1C0FA 1QZ6A 2CH5A 3GL1A 3M6GA 3MDQA 5ELZA 4BR0A 3QB0A 2QWNA 3BF1A 3ZX0A 4MLHA 1Q18A 4BRFA 1SZ2A 2FXUA 3R6MA 4B1VA 1QHAA 3RSEB 3KZBA 3CHWA 4CD3A 2D1KA 3M1FA 2V52B 4BC3A 2Q0RA 3VEOA 2ZGYA 4XEIA 3AARA 4BROA 1DEJA 2ASOA 4Z94A 2YJEA 1GLLO 5I9EB 2P9IA 2I7PA 4DQ8A 4O8KA 1DGKN 1QQMA 1SQKA 1JCEA 4QS9A 3VF6A 4WQ4A 1S3XA 2HMPA 3D2FA 4JNEA 4QS7A 2ASPA 4BC2A 4DCHA 3LL3A 5AQRA 4ISEA 2E1YA 4FWNA 3LDNA 3SK3A 1HX1A 4BRGA 5AQNA 5LY3A 2E2PA 4RTFD 3FE1A 2P9SB 4F9OA 4K41A 2HOEA 3W0LA 4CD1A 2YCHA 5BRDA 3CJ7A 4FWLA 5LJVA 4BC4A 4CBWA 1QQOA 2OANA 2PAVA 3HI0A 1V4SA 4K43A 4BR7A 4CZKA 1RGIA 5BPNA 2VYPA 4BRNA 3CJAA 3I8BA 4YDUC 5AQUA 3QDKA 4EIAA 1CZAN 4A61A 4B1YB 3LDQA 2F9TA 4CJ7A 4PL8A 3VF2A 1X3MA 4H5RA 1KAXA 4HWIA 3O6WA 2J4RA 3OHRA 3BEXA 1NGIA 4JD2A 2P9KB 5AQPA 2DPNA 2Q31A 3HZ6A 3MN9A 3S41A 5BN8A 2NLXA 4WQ5A 4B1WB 1MDUB 1BUPA 5EOYA 2A6AA 2V7YA 3QBXA 3G25A 5BPMA 2AA4A 1X3NA 1ZBSA 3MN7A 2QWMA 4BRDA 4H0XB 3D2EA 4NB4A 4FPBA 2IVNA 3MCPA 3HM8A 4JN4A 1E4FT 5AZIB 5AFUH 4FWSA 2FSNA 5AQTA 3JXUA 5KPTA 5AQKA 5AQHA 3VETA 1GLEG 2P9KA 3UKRB 5BN9A 3A5LC 4H03B 2P9LA 3ZETA 3UB5A 3SJHA 3MK6A 4H5VA 3O1WA 1NLVA 3QBWA 1KAYA 1HKCA 3U4LA 1R59O 3CJ1A 4K42A 5AQLA 1YXQA 2YJFA 4K25A 2P9IB 4MLEA 3ZX2A 4I6MA 3IMXA 3VOVA 4YDUA 2P9NB 4BRAA 3AAQA 5KPRA 1NGBA 5AZIA 3D2FB 4PL7A 3WT0A 4BR2A 2FLOA 2A5XA 5AQJA 2IIRA 2ITMA 2P9PB 4EHTA 2V51B 1JCGA 5B8HA 4EFHA 5ADXH 4BVPA 4H0OA 3F9MA 1G99A 5BRHA 2P9SA 3KHYA 5AQWA 4IWVA 3ID8A 5TKYA 1Z05A 5AFUA 4CZHA 3IDHA 3MN6A 5FPMA 3VPZA 5AQVA 5F1XA 3EKSA 1KXPA 3CIPA 1RFQA 2QW9A 2AP1A 5AQZA 2VCPA 3FFKB 5JLHA 5AQYA 1WUAA 3DXMB 4JHDA 3H1QA 5AQFA 5FPNA 4CZJA 3VF4A 3ZX3A 3I33A 3UKUA 3C7NB 5AQXA 4XH1A 3GOIA 4O5FA 3BUZB 3H6EA 4E1JA 2V7ZA 3A5OC 3ATUA 4M7YA 1T6CA 3AAPA 5JMVA 4FWOA 4NO7A 4CZFA 1BU6O 3SLCA 4PKGA 2GWJA 3M3ZA 3QFUA 3BF3A 4DHYA 4EHUA 3CQYA 3VEWA 1ZXOA 2W40A 2ZF5O 3IUCA 5AQSA 4B1UB 3O5BA 5FPEA 1QZ5A 1GLFO 1NGAA 3EKUA 1HPMA 2YHWA 2F9WA 3FR0A 3O1BA 3GDQA 3ULEA 4FWPA 4RCHA 1BWFO 1GLAG 5F2RA 3UKUB 1TUYA 5E84A 1D4XA 4BRIA 3CETA 3O4WA 4IZ9A 3JS6A 1HLUA 3QFPA 4H5WA 3GBTA 4BRHA 4FWRA 1YAGA 3VGMA 2NRHA 1BO5O 1MWKA 1NMDA 3J8AA 4BQLA 3LDOA 1TYQB 2YHYA 1HUXA 3WEEB 2FF3B 4B9QA 2W41A 2QWOA 3A8YA 4GY2B 2E8AA 3FZMA 4JD2B 2HF3A 1YVNA 5EX5A 3B8AX 1Z6RA 4HTLA 1JCFA 3MMVA 2Q2RA 2IVPA 4GNIA 1GLBG 3VGLA 2ZWHA 3AY9A 3C0BA 1HKGA 2QWRA 3A5MC 2E2NA 3LM2A 2Q97A 1ESVA 4BR9A 1KAZA 3MN5A 4BRCA 1ATRA 2H3GX 5JICA 1RDWX 3H46O 3R8EA 3WUHA 1TUUA 1U2VA 2HF4A 3FZKA 4FO0A 3VGKA 1T6DA 2Q36A 1NGFA 4BRLA 4IO8A 2P9UA 4IJAA 5AZJA 1BA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QMLA 5BREA 2YX6A 3CJ9A 3V9WA 3B6OA 2YHBA 3H3NO 4KV8A 3K59A 3AVCA 1E3MA 4FM1A 3T1HK 4WQ5C 2RE2A 3RRHA 4FJKA 2YHXA 2D0BA 3PV8A 2A40A 4DQIA 3MX5A 4FWQA 1T44A 3P38A 4ISFA 1NKBA 4CZIA 4EZ9A 2GEMA 5AQMA 1C0GA 4Y1DA 4AM7A 3V9SA 4J2AA 4PKHA 2ASMA 1KSPA 1JL1A 1HNWK 3EL2A 3MX2A 3E1YA 1NKCA 4LSNA 2P9NA 4CZLA 1NGCA 3D6RA 3CCUN 1NJWA 2UXDK 4LF7K 1HNVA 4FL9A 1VSFA 1YF5L 4DTSA 1SL0A 3U9DA 3LAMA 5ADXA 2VQFK 4KB1A 3GG4A 3FZFA 2ZJRL 2QK9A 4PKIA 4DR2K 1Q82O 2ITGA 2D5RA 5HRRA 4A57A 4CGJA 4JAXA 1T05A 2A1SA 4B1ZA 4FM0A 2EWSA 4IFEA 1JLFA 4CGHA 2PBDA 1VAZA 3KD1E 3P39A 2OZMA 3OA9A 4FK4A 3CI5A 1C1AA 4B9VA 4RWTA 1WLJA 3R1XA 3JYTA 3RVCA 3HJFA 4G1QA 5CYQA 5AQOA 1ILYA 2IC3A 1RBUA 3O8MA 5HRNA 4JK9A 4E3SA 3R9PA 4DU3A 4DR1K 3OYJA 2G8FA 4JI3K 3P83D 5GIOA 3S3MA 3QINA 2YKMA 2A42A 4IFVA 1RNHA 3W3DA 1QQNA 1IH7A 1BOTO 3ZT3A 2P5OA 5LJWA 2RN2A 5CR4A 1HYZA 3ULDA 4F2RA 1DLOA 3C6HA 2NUBA 3FGUA 3AO3A 4IO9L 1BQMA 4W5NA 3K9JA 3MAQA 4DV2K 4FOEA 3WNFA 4KTQA 3KLHA 3O9TA 3O4NA 5KRSA 4Z4IA 2Q1NA 3DWLA 4H0PA 4CJPA 1JLBA 3LM9A 1S6PA 2O8EA 5F0XA 2FSJA 1KC8O 4M41A 2OYQA 3SZ2A 4V19S 2W42A 3WNHA 4JKGB 4B3SK 1HMVA 4B1XB 1S1WA 1Y64A 4A62A 1LWFA 1XC3A 3SUQA 1RDUA 5EVZA 1NWKA 4B3MK 2XY6A 1VSLA 1C1CA 1LCUA 2CGJA 4JKAA 4YY3K 2NNWA 3SMPA 4IBNA 3QETA 3THYA 3VEXA 1QQCA 2HNZA 3D45A 3M8PA 1NGEA 1DTQA 3HSCA 1NGGA 4DV4K 4YNQA 1NGHA 3ULEB 3KKRA 4BE1A 4J8FA 4FLXA 4DR4K 4DSKA 4Y0WA 4E7JA 1KQSM 2WFBA 1N5YA 1RTDA 3VMFB 5FPDA 2IGIA 3VQ8A 2KTQA 4AH9A 3ZCMA 4CBUA 3SMSA 4U7BA 5KGWA 1MU2A 3QEWA 2VG7A 3U9ZA 3WQUA 1YI2N 2I7NA 4DSEA 3VQQA 3EZWA 4JI4K 4I2QA 1ITGA 3NFAA 3QIPA 2D4WA 4M45A 2G8VA 1X9JA 3MXIA 1N32K 4FZZA 4JKDA 4H0TB 1JJ2M 2B4JA 4Z0UA 3DYAA 3MDQA 4BR0A 3TAQA 3BZCA 1JKHA 2QWNA 2Z1IA 4MLHA 4BRFA 1LAVA 3AVBA 4B1VA 1QHAA 2WONA 3RSEB 2OPPA 4Z4FA 4C8LA 2V52B 2Q0RA 4FK2A 2ZGYA 3I55N 4Z94A 1GLLO 2I7PA 3THWB 4M42A 3L2QA 4O8KA 3T19A 5KRTA 4JI7K 4WQ4A 2HMPA 3C6TA 4DTMA 3TABA 4OKKA 2VG6A 4JKGA 4ISEA 2E1YA 1L3SA 3SK3A 4YOTA 3VQCA 3KLEA 5LY3A 1C0TA 1SL2A 3AA5X 4F9OA 4FJHA 4C8MA 5BRDA 4TSXA 3ENBA 4JRPA 4MFBA 4FWLA 1VHXA 5LJVA 3T3FA 4C8NA 4CBWA 1QQOA 5BPNA 4BRNA 4NLBA 3K5MA 1CZAN 1WSEA 2KKZA 3TTDA 4DTRA 4JI5K 3KTQA 3KWIA 2F9TA 3BDPA 2QXFA 3HSTB 3VQBA 4DLGA 4JD2A 2P9KB 3NH1A 3RMDA 2Q31A 3HZ6A 3S41A 3PSFA 3OYMA 5C12A 4WQ5A 1MDUB 4OLBA 3OJSA 4E0DA 5BPMA 3T1AA 1WSHA 4DU1A 2HHWA 1X3NA 3AO2A 3DOKA 2QWMA 1KVCA 3ASMA 4NB4A 5J2PA 4FPBA 3MCPA 3J80O 3DRSA 4IFYA 1OH6A 1E4FT 4CK3A 2FBXA 5AFUH 3AO4A 4CEAA 4KPYA 1Z25A 4DS4A 5AQKA 3VETA 1XMOK 1GLEG 5BN9A 2G8HA 3A5LC 4BDYA 3ZETA 3UB5A 4ICLA 4WF9L 1XNRK 4AHSA 2XRIA 3SQ0A 5GAGP 5C2FA 1NU0A 1IBLK 2JLEA 3AVHA 3OYEA 3LP1A 2QA4N 4FLVA 1S9GA 4K42A 4HVJA 1YXQA 4ID1A 4CF1A 4DG1A 2PFUA 3ZSYA 4I6MA 3IMXA 3VOVA 4YDUA 4KHWA 3AAQA 4DMNA 4FM2A 3F5TA 2P9PB 5B8HA 4J2EA 3ZSZA 1HYSA 3F9MA 2RKIA 3VQAA 3T7ZA 5BRHA 3AV9A 1Q86O 1SV5A 2E6MA 3ID8A 3C94A 3IRXA 3MN6A 3MWPA 5J2MA 3TSUA 4XIUA 3NVKA 1RT2A 4DV5K 5E41A 3OBWA 1RFQA 1RDAA 3DI6A 2P1JA 5I42A 4ELUA 1HR0K 1WSFA 5FROA 3DLHA 3H1QA 4OO1J 5FPNA 4YOXA 3VF4A 1RBRA 3I33A 1NOZA 3C7NB 4XH1A 2Z1JA 3E9LA 2W6KA 3H6EA 4E1JA 2V7ZA 3ATUA 1HNZK 4KI6A 2ZQBA 1A5WA 5DK5A 1S1VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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