1YAGA

Structure of the yeast actin-human gelsolin segment 1 complex
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
b'EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title The structure of nonvertebrate actin: Implications for the ATP hydrolytic mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Contractile protein
total genus 116
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yagA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yagA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yagA04
1K8KB 4XH4A 2GTDA 1X3MA 4CZLA 3VESA 1NGHA 3ULEB 1XC3A 3VOVA 4LC9B 5AQRA 4CD1A 1ATSA 4YDUA 1DKGD 4BR9A 3EKUA 1H1VA 3L0QA 3QBWA 5E84A 4BRDA 1OKJA 3HZ6A 4JHDA 3LM2A 1YUWA 4Y0WA 4BRHA 5JLFA 5F1XA 4H0PA 3A5OC 3GL1A 4H0XB 1HUXA 5AZIA 4BR4A 3ZETA 5EXWA 3GOIA 3AAPA 1JCFA 4FWRA 4FWSA 3O80A 1BG3A 1WUAA 5AQHA 3CQXA 4B1YB 2CGKA 1GLLO 2CGLA 3LL3A 3QFPA 2ASMA 4MLEA 2HF4A 3M6GA 3VPZA 5AQFA 3TPQA 3M3ZA 4DHYA 4FOIA 3D7EO 3L6QA 1GLBG 3FZLA 4FWLA 4CZIA 2YHWA 3D2FB 2P9KA 3GBTA 4BRPA 2P9UA 1BU6O 2WUSA 2FXUA 1G99A 5AFUA 1V4TA 4BR5A 4EAHD 4CBUA 3UKRB 3SLCA 4FWNA 4O5FA 4BC3A 3A5LC 4E1JA 5BN9A 3MN9A 1TUUA 3VEOA 4B1XB 5F0XA 4J8FA 4H5NA 2YHXA 2E2QA 3DXMB 5EY4A 1BOTO 5FPEA 3JS6A 3MN5A 1R59O 2HMPA 1Y64A 2I7NA 3FE1A 1MDUB 4ISEA 4CBWA 5BPMA 4BC5A 1SQKA 3IFRA 1GLEG 3JXUA 2BTFA 4RCHA 1S3XA 5JLHA 2PBDA 3H1QA 3DXMA 4K25A 3F9MA 2FLOA 3A5MC 3J8AA 1ZC6A 2AP1A 5FPMA 3U4LA 2VCPA 1HJOA 3HI0A 1T44A 4FPAA 1WOQA 3G25A 5EOYA 3U9ZA 3LDLA 2NZTA 4JN4A 4EHTA 2NLXA 4A62A 4NB4A 2OANA 2Q31A 1P8ZA 1C0FA 2Q36A 1U2VB 2QWOA 3HM8A 1IG8A 2D0PA 3I33A 2P9LB 5KQDA 3WUHA 1JCEA 3ZX0A 4IJNA 4WQ5C 2HF3A 4O8KA 1NMDA 5AZJB 1MA9B 2A5XA 1U2VA 2VYPA 2YI1A 4A61A 4H0YB 2KHOA 2Q1NA 4A2BA 3FZMA 4JAXA 3S41A 5AQXA 4AM7A 5CE3A 1NM1A 2GWJA 4BR7A 5AZJA 4HWIA 2QWQA 4H5VA 4A2AA 3VEXA 1U6ZA 2VWBA 1TYQB 1YVNA 4M63C 3QB0A 2P9PB 2A42A 3WQTA 3CERA 2GEMA 1KAXA 3O6WA 2GELA 2IVPA 4FWPA 5AQIA 3SMSA 1HKGA 1E4FT 3AAQA 3WXKA 3GG4A 1GLJO 3CIPA 2ZWHA 3LDQA 4BG9A 3VGKA 2ASPA 3WEEA 4BQLA 4K43A 3CI5A 4XEIA 1NGFA 4BR0A 3A0IX 5AQOA 2D0OA 4ISGA 4JHDB 3IDHA 1ATNA 4JD2A 1IJJA 3VF2A 4Z94A 5AQNA 1QZ5A 1TUYA 5AZIB 3ZETB 5BRFA 4EFHA 1SAZA 2E1ZA 2ZGYA 4HTLA 3CJ7A 2NRHA 3VF6A 5AQTA 1XQSC 4CI6A 3L4IA 1LCUA 3LDNA 3CJAA 2D4WA 2QWNA 5I9EB 2BUPA 4PL8A 1ATRA 3VETA 1LOTB 4BC4A 5AQMA 1QQNA 4PKHA 1ZBSA 4DB3A 3UKUA 1C0GA 1RFQA 1BO5O 2P9KB 3BF3A 3A5NC 4XH5A 2P9UB 2V52B 3EO3A 2E88A 3I8BA 1BA0A 3WT0A 1KAZA 3KZBA 4BC2A 4B1UB 2A3ZA 1RGIA 3HSCA 2P9SB 4ISFA 4QS8A 1T6DA 3LM9A 2P9IA 3QDKA 3DAWA 2CGJA 2PAVA 2YJFA 2P9NA 4RTFD 3RSEB 1SZ2A 2P9SA 4FSVA 4M7YA 1NGBA 3GDQA 1BWFO 2D1KA 3MN7A 3CJ1A 2GWKA 4EIAA 4CZFA 1DGKN 4NO7A 3RSEA 3O4WA 2CH6A 3BUZB 1NGAA 5LJWA 3FLCO 4FWMA 4I6MB 1NGIA 2A6AA 4H0OA 1NGCA 3VEWA 5BPLA 5ADXH 5AQPA 2FF6A 1HX1A 5AQYA 4BRMA 5AQUA 1NLVA 4I6MA 4PL7A 3H3OB 2E8AA 5AQJA 2GUPA 3UE5A 4IJAA 4BRFA 1KXPA 3O1BA 3LDOA 1Q18A 2J4RA 4CZGA 3GE1A 4JNEA 4MLHA 1T6CA 3DXKA 3H3NO 4B1ZA 2F9TA 4AM6A 3EL2A 5BRHA 4BVOA 4RWTA 3BF1A 3VERA 3C7NA 2CH5A 5BRDA 1E4GT 5KQ8A 3MN6A 1DEJA 4XH1A 3FZFA 5AQGA 1QQOA 1HKCA 5AQWA 3VGMA 2A41A 1RDWX 3IMXA 1Z6RA 4H03B 3WEEB 1NGDA 3D2EB 4PKGA 3WXJA 3FGUA 4H5RA 3SK3A 3M1FA 3H1VX 2A40A 3FFKB 4BRGA 3ID8A 3WQUA 4PKIA 3D2EA 4JD2B 4EHUA 5KPZA 3BP8A 3QFUA 1QZ6A 3VF4A 4CD3A 1X9JA 3WXIA 3WXLA 4CZHA 2YJEA 5JICA 3R6MA 2ITMA 3EZWA 4H5WA 4C23A 4DQ8A 4CBXA 4BREA 4M7XA 3QMLA 2F9WA 3FZKA 4BVPA 3ENOA 1D4XA 2FF3B 4BRKA 3MDQA 4FOEA 1BUPA 1BDGA 1ZXOA 3B8AX 4IXCA 3R9PA 3O08A 5KPTA 2QXLA 4CZKA 4BRAA 3FR0A 4GNIA 3UKUB 1YXQA 1GLCG 1YAGA 3KHYA 1KAYA 5BN8A 4BGAA 3W0LA 4B1WB 1V4SA 1K8KA 2QWPA 3AARA 1NGGA 3O1WA 3ULEA 3OHRA 1S22A 3FZHA 4WQ4C 5B8HA 1GLDG 1NBWA 4H5TA 4BROA 5ELZA 2P9IB 4CZJA 2FSNA 3KVGA 3LDPA 2IVOA 4MO5A 2E1YA 5AQZA 3VEZA 4B9QA 4BRCA 4F9OA 2ZGZA 5AFUH 2FSJA 3BEXA 2HOEA 2P9NB 4FWKA 1XUPO 1HKBA 1QQMA 3CJCA 4WQ5A 5TKYA 4FO0A 4DCHA 2DPNA 5BR9A 3CJBA 1CZAN 3UB5A 3SMPA 1MWMA 2YHYA 3VEYA 3QBXA 5AQSA 1BA1A 3ZX3A 3IUCA 5FPDA 2V7ZA 1HPMA 4QS7A 3CQYA 3HTVA 2Q0RA 2IVNA 2V7YA 5E26A 5KPRA 3TU5A 2QWRA 4H0TB 2E2NA 3MK6A 2H3GX 4BRNA 2E2OA 3MCPA 4IWVA 4K42A 3H45C 1NGJA 3D2FA 5FPNA 3SJHA 3EKSA 5EVZA 4YDUC 4KBOA 4FPBA 4BRLA 2QW9A 3C0BA 5AQLA 4BR2A 3DXKB 3O5BA 3UKRA 4BQZA 4CZMA 2ZF5O 3O8MA 5JMVA 1Z05A 1JCGA 3QICA 4BGBA 2AA4A 2V51B 4BRQA 3DJCA 2I7PA 3C7NB 5AR0A 1EQYA 1ESVA 3ATUA 1GLFO 3ZX2A 2IIRA 4FWQA 3R8EA 3P4IA 4B1VA 5ADXA 4FL9A 2W41A 2UYTA 2E2PA 2YCHA 5F2RA 4WYBA 3ZEUB 4CJ7A 4L3QA 3A8YA 5BPNA 2Q97A 5LY3A 5EX5A 3W3DA 2FSKA 3DWLA 3H46O 4GY2B 3ZEUA 1HLUA 3VEVA 5AQVA 4CZEA 2ASOA 1GLAG 1J6ZA 3HBTA 5LJVA 4K41A 4WQ4A 3ENHA 4MO4A 2P9LA 2QWMA 3EN9A 4BG8A 5AQQA 1NGEA 1X3NA 1QHAA 2E20A 5BREA 4IZ9A 3CJ9A 3MMVA 2EWSA 2Q0UA 2QM1A 2QWLA 3U8XA 3CHWA 4IO8A 3AY9A 2Q2RA 3VENA 2W40A 3ATVA 3CETA 4H0VB 4QS9A 3VGLA 4FWOA 5AQKA 1MWKA 1TYQA 3H6EA 3U9DA 2P9PA 4BRIA 1NWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K8KB 5DMRA 3OYGA 2YKNA 1RCHA 4QCLA 1NU0A 3L4QA 1VSKA 4A57A 5HRNA 3ULEB 4DV4K 3ZSQA 1BQNA 4LC9B 4FJJA 5AQRA 5KGWA 1NNEA 4CD1A 1ATSA 4YDUA 3E9LA 4FLZA 3J80O 4CHOA 1OKJA 3HZ6A 4JHDA 3RRGA 3NGIA 2GBZA 2O4IA 4H0PA 5AZIA 2HSTA 4FZXC 3NHGA 2NRRA 4NXMK 1JCFA 4CF1A 5JVHL 1BISA 3QNOA 3O80A 4E7JA 3B6OA 2F96A 5AQHA 3CQXA 2UUAK 4DQIA 1GLLO 1VQMN 2OZSA 4MLEA 1N36K 3VPZA 4OJRA 1X9WA 3I0RA 3VQAA 3D7EO 3FZLA 4PA1A 2JGUA 2P9UA 3IRXA 4CF9A 2UU9K 2FXUA 1N33K 1NKEA 5AFUA 2NRZA 1V4TA 4AF1A 4EAHD 1KD1O 3DMJA 2EX3A 3MN9A 1TUUA 3AA2A 2VWKA 1HR0K 4B9UA 3K2PA 1SL1A 2FBXA 1D9FA 3QINA 4CJ4A 1RT1A 2YHXA 2E2QA 2Z1JA 3DXMB 3K57A 1BOTO 5FPEA 1LAVA 3FE1A 1FK9A 1Y64A 5LMUK 4O0JA 2G8FA 1KVAA 4FK4A 2HBKA 3SCXA 3NAEA 1KCFA 3U4LA 3MX2A 4LH4A 4O5BA 5FPMA 3I56N 1EO1A 1HJOA 4Z0UA 3RMBA 4B3RK 3G25A 1FJGK 2F4VK 4EHTA 5CHIA 2XO7A 2NLXA 4DF4A 3TSPA 2D0CA 4HVJA 1WLJA 4KHYA 1P8ZA 4C8OA 3M8RA 4KHSA 2D0PA 2P9LB 4GVMA 1QQCA 1XNQK 3WUHA 3CCJN 1S1XA 2HF3A 3PUFA 4WQ5C 5GADP 1IV0A 3AVIA 1U2VA 4A61A 3QNNA 2KHOA 3FZMA 4LY7A 4OPHA 4W5RA 4GV9A 2GWJA 3VA3A 1EXQA 1CLQA 4HWIA 3VEXA 1Q82O 2VWBA 4KI4A 1YITN 3LPTA 1XWLA 3SMSA 1HKGA 3PY8A 1E4FT 3GG4A 1WAFA 2W42A 4DTJA 2ZWHA 1G15A 2ASPA 5J2PA 4A5BA 1J5EK 1NGFA 4H8KA 4BR0A 4GMJB 5AQOA 4KTWA 4MDBA 2WONA 1J53A 4DSKA 4JHDB 3ITHA 1RDCA 5AQNA 5AZIB 4DTSA 5HL7L 1KC8O 1HYSA 2E1ZA 3THVA 3CJ7A 4J2AA 3LZJA 3CCMN 5HLFA 4UQGA 3HOTA 4FJLA 2B5JA 5FRMA 4EZ9A 1QVFM 1VSFA 3EY1A 2ZJPL 2QWNA 5I9EB 1A5WA 3VETA 4M3RA 1S1UA 3M8QA 4PKHA 1VQ5N 4DB3A 1C0GA 4U67L 4BEBA 2D0AA 3AVFA 2P9UB 4CJEA 1S6QA 3KLIA 4N41A 4DLEA 5DM6L 4JKGB 4CJ5A 3EYZA 2P9SB 3LP0A 1U45A 1U47A 1T6DA 2VGMA 3RWUA 1REVA 3L3VA 1Q7YO 2CGJA 4NCAA 1QS4A 3TAEA 2HHHK 4FSVA 1Y97A 3GDQA 1BWFO 5JVGL 4F4KA 4ELUA 4EIAA 4FW2A 3L2QA 4WFAL 1KFDA 1NJZA 1GOBA 1NGAA 3BUZB 3VQCA 4CJFA 2A1RA 1JLBA 2A6AA 4H0OA 5BPLA 4NYFA 1S5JA 5AQPA 2FF6A 5AQYA 3QESA 2G8UA 1RILA 2HBJA 5AQUA 2XY8A 1L3UA 2QA4N 5JENA 5AQJA 1RT7A 4IJAA 4KTQA 1KXPA 3O1BA 1JLQA 4KRFA 2GUIA 1LWFA 3CPWM 2O4GA 3OYLA 3EL2A 4CGIA 4N56A 2XHBA 3BF1A 4KV8A 4OPJA 3DRRA 3OS2A 3MN6A 3O3GA 3SZ2A 4JI5K 4XH1A 5AQGA 1QQOA 1VK0A 1HKCA 5AQWA 2VWJA 3CFOA 3Q7BA 5KI6A 5M1FA 2E4LA 4H5RA 3M1FA 2A40A 3ZLJA 4I9LA 2DY4A 1VQPN 4PKIA 1BCOA 2Z1GA 4CECA 4B3MK 4B9MA 3BP8A 3LANA 3NGZA 4CEQA 1YI2N 1HQUA 3WXIA 3SAHA 2IAJA 2YJEA 5JICA 4DR4K 4C23A 4DQ8A 1L3VA 1QE1A 4DSEA 4BREA 2OTLN 3CCUN 3KD1E 3FZKA 4E7IA 1FW6A 4BRKA 3ALYA 3MDQA 4FOEA 4IEEA 5M1KA 3B8AX 4BRAA 4E7KA 2XY6A 3WNHA 5K14A 1YXQA 5C12A 2P1JA 2BDPA 1TL3A 5BN8A 1JLEA 3OYDA 2QWPA 3AARA 3VMFB 1VQLN 3O1WA 1VRUA 4DR2K 4WQ4C 5B8HA 1N8RO 3LWMA 2JWKA 4CZJA 4DQRA 4MO5A 1I3AA 2E1YA 3VEZA 3I8DA 3HVTA 4JI2K 1X1PA 3BEXA 4A59A 3SQ0A 4FWKA 1XUPO 4R5PA 4H4MA 4CE9A 2RPIA 1RDBA 5BR9A 3UB5A 3BDPA 3K9JA 3KK1A 5M1NA 3VEYA 1CXUA 2YNIA 4CW7B 3ZX3A 4ELVA 2V7ZA 4DU1A 1HPMA 1JLCA 1I39A 3CQYA 2YNFA 3TU5A 1N6QA 5JS2A 4O8UA 3T7ZA 1XC9A 2QKBA 1BI4A 4F8RA 4RG8A 3SJHA 1KLMA 4KBOA 3SYZA 4KH4A 1RT6A 2W6KA 4BR2A 3OYAA 3UKRA 4BQZA 2ZF5O 1UOCA 3O9TA 3QICA 4DFKA 3F5TA 4BRQA 1Q81O 4KHUA 3VQQA 1ESVA 3AVAA 1R0AA 2PY5A 4NLBA 1K6YA 3KKSA 3G10A 4OPAA 4BE7B 4FWQA 5ADXA 4WE1A 1YIJN 1RTHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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