3MDQA

Crystal structure of an exopolyphosphatase (chu_0316) from cytophaga hutchinsonii atcc 33406 at 1.50 a resolution
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
QRIGVIDMGTNTFHLLITDIVNDRPHTLVNEKSAVGLGKGGITKGFITEEAMDRALDTLKKFRVILDEHAVVHVIATGTSAVRSGSNKQVLIDRIKKEVNIDVEVIDGAREAELIFRGVQQAVPMEDHISLAMDIGGGSVEFIIGNKNEILWKQSFEIGGQRLIDRFHVHDPMREDDRVMMHNYFDEVLVPLEKAINTWRPTQLIGCSGTFDTLAEMNIQHHREKIALEKQTSYLLSLPDFNRLRKQLVASTRRERLAIAGMIELRADMVVVAICLIEHVLKLVSTNAITVSTYSLKEGVLYTMLDGVKVGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exopolyphosphatase
publication title Crystal structure of an Exopolyphosphatase (CHU_0316) from Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 at 1.50 A resolution
rcsb
source organism Cytophaga hutchinsonii
total genus 102
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.6.1.11: Exopolyphosphatase.
pdb deposition date 2010-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02541 Ppx-GppA Ppx/GppA phosphatase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mdqA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3mdqA02
4BRGA 3A5MC 1HJOA 3QFPA 4CBUA 4XH1A 1S22A 3VPZA 5BRDA 3DJCA 1BWFO 1HPMA 4DQ8A 3IFRA 2QWLA 2A40A 2QM1A 3BUZB 5I9EB 3GE1A 2PBDA 4BVOA 1Z05A 2GELA 5KPTA 2E88A 2IVPA 4JHDB 1R59O 3CJCA 5FPNA 5E84A 5AZJA 2QXLA 2V52B 5BRHA 1U2VA 2BUPA 2Q36A 2V7ZA 4KBOA 3WXKA 4CZEA 2D0PA 3VEXA 3CHWA 3D2EB 4FWKA 3RSEB 3UKUA 4PKIA 3VESA 4CJ7A 2HMPA 4FWRA 5AQWA 1QZ6A 4ISGA 1HKGA 4QS8A 4JD2A 3U4LA 1X3MA 4BC4A 4MO5A 1Y64A 5BREA 1KAXA 5AQZA 1LCUA 1QQOA 5AQIA 2ASMA 1V4TA 1X3NA 3FR0A 4BRFA 4H5VA 3IMXA 4QS9A 2YHWA 5ADXH 2P9LB 5AQUA 2YI1A 2W41A 2FSJA 3JS6A 3FZLA 3MN9A 4B1VA 1NGEA 4K42A 2IVOA 3EO3A 3O08A 4BRDA 2H3GX 3KHYA 5JLHA 5KQDA 2D0OA 4FWNA 5AZIA 4GY2B 4K25A 2P9LA 3UB5A 1ATSA 3DXMB 1BA0A 2GWKA 3G25A 3WQTA 2FF3B 2J4RA 4CBXA 4FWLA 4A62A 3SLCA 1IG8A 4AM6A 4H5WA 4B9QA 3CJ9A 1NMDA 4XEIA 4H0PA 3VOVA 1MA9B 3FE1A 4CBWA 1GLAG 2E2QA 3DXMA 3U8XA 5AQKA 2ZWHA 3OHRA 1EQYA 4B1WB 4BR5A 3CERA 3UKRB 3LM2A 2QWOA 4BR0A 3LDLA 2E1ZA 3QICA 2GWJA 3ZETB 4DB3A 4E1JA 1E4FT 1WOQA 2CH6A 4HWIA 4IWVA 3UKRA 4ISEA 1HKCA 5BPNA 4MO4A 4A2AA 4H5RA 1X9JA 4J8FA 4B1XB 2QWQA 4H5NA 3FZKA 4WYBA 1T44A 2NZTA 3CJAA 4FWMA 5E26A 4LC9B 4EHTA 3I8BA 1NGDA 1WUAA 2D4WA 1ATNA 2CGKA 5EY4A 2W40A 3FGUA 3AARA 4PL8A 2P9NB 4BREA 1GLJO 3MN5A 4BVPA 5AQLA 3MMVA 5BRFA 2P9SB 3A0IX 4RTFD 1JCGA 1NGCA 2IVNA 4I6MB 1GLEG 3ULEA 3W0LA 2DPNA 4BRNA 4O5FA 5ELZA 5FPEA 3KVGA 4NO7A 4I6MA 2ASPA 2Q97A 1NLVA 2QWRA 4B1ZA 1BA1A 2CGLA 4CZJA 4H0OA 1GLCG 4EIAA 3MCPA 4EFHA 3MN7A 4QS7A 3EN9A 1BU6O 4BGAA 4BC2A 1TUYA 2FXUA 3O1WA 2VWBA 1MWMA 4JHDA 4O8KA 1LOTB 4WQ5C 3TPQA 1HKBA 4BC5A 1GLLO 2Q1NA 2A42A 3LDNA 4B1YB 5JMVA 3AY9A 3M6GA 3MK6A 2FF6A 1G99A 2Q31A 3ZEUB 3ZX3A 1XQSC 5BN9A 3O8MA 4IZ9A 1JCFA 3QBXA 1MWKA 3QDKA 3H1QA 1QQMA 1RGIA 4WQ4C 3D2EA 5AQRA 3RSEA 3FLCO 1NGBA 3EL2A 5EXWA 4CZFA 2A6AA 1GLBG 3WT0A 1YVNA 4BG8A 3WQUA 2ZGZA 4FOIA 3VENA 4B1UB 3EKSA 3HI0A 3DAWA 5BPMA 4A2BA 1DKGD 2E8AA 4C23A 3FZMA 3R9PA 4CZIA 3I33A 5AQVA 4CD1A 3VGMA 3ZX2A 4BQZA 1DEJA 4BRPA 1QZ5A 4AM7A 3VEOA 3C7NB 1NGGA 1ESVA 1U6ZA 2A5XA 3AAQA 3ENOA 4FWQA 4H0XB 2HF3A 1KAYA 1KXPA 1GLFO 4CI6A 5AQQA 3WUHA 3CQYA 2I7PA 3C7NA 1KAZA 1NGAA 1OKJA 5JLFA 3ENHA 4JAXA 3H3NO 5EOYA 3CIPA 5FPDA 1HLUA 2PAVA 3O6WA 3LDQA 4M7YA 4FPAA 4Y0WA 2VYPA 3VEYA 3FZFA 3A5NC 4RWTA 1ATRA 1QQNA 3S41A 4CZMA 5F1XA 5AQGA 2E2PA 4PKGA 3HZ6A 5B8HA 1ZC6A 2F9TA 2F9WA 3QFUA 4H0VB 1C0FA 4YDUC 3U9ZA 1C0GA 3SJHA 4BRAA 4BRMA 4MLEA 3H1VX 4BRQA 3ZETA 1BDGA 2P9PB 3CJ7A 3GDQA 3O80A 2HF4A 3O4WA 5AQHA 5AQPA 3H6EA 5LJVA 2NRHA 3W3DA 2WUSA 1E4GT 5AR0A 2YHXA 5EX5A 3VERA 2D1KA 2P9PA 3M1FA 3UE5A 4BRHA 2AP1A 4BG9A 4K43A 4IXCA 4PL7A 2VCPA 3O5BA 3LDOA 5AFUA 2V7YA 3L0QA 2OANA 1SZ2A 5ADXA 4FO0A 3ATVA 1SAZA 3VETA 4BR4A 2P9KB 1J6ZA 3CJ1A 2P9NA 5KPZA 3H45C 2Q0RA 3SK3A 1BUPA 2P9IB 2P9SA 2QWPA 4FSVA 2YJEA 4HTLA 3DXKB 2P9KA 3CI5A 1S3XA 2ASOA 1ZXOA 1NM1A 1YUWA 3D2FB 4M7XA 1MDUB 5KQ8A 3O1BA 4A61A 3R8EA 1IJJA 3DXKA 1YXQA 2Q2RA 3IUCA 3D2FA 4BRKA 3C0BA 3HSCA 2HOEA 2E2NA 3GL1A 4Z94A 3GOIA 3H46O 5LY3A 5FPMA 3VGKA 3R6MA 1SQKA 2YJFA 5BR9A 4FL9A 5AZJB 4IJNA 1U2VB 2GEMA 4CZHA 4F9OA 5F0XA 1T6CA 1XUPO 3F9MA 3A5LC 1BO5O 1P8ZA 4PKHA 5LJWA 3FZHA 2QWMA 5CE3A 2A3ZA 4BQLA 4CZGA 3WXJA 2Q0UA 5AQOA 3UKUB 3VF6A 5AQFA 3ZEUA 3HM8A 4WQ5A 1T6DA 4JN4A 1YAGA 2QW9A 3U9DA 3MN6A 1NGHA 1K8KB 1HUXA 4JD2B 3GG4A 4FPBA 5AQXA 3WXIA 3LL3A 1ZBSA 3IDHA 3JXUA 3ID8A 3VEVA 3EKUA 5AQYA 4DHYA 1K8KA 1QHAA 5TKYA 3KZBA 3B8AX 4WQ4A 3VF4A 1HX1A 4CZLA 2IIRA 2YHYA 3ATUA 2FSKA 3LDPA 4BR9A 1BOTO 3D7EO 4FOEA 1TYQB 2CGJA 5KPRA 3L4IA 5AQSA 3QB0A 5AFUH 3BEXA 5EVZA 4JNEA 5AZIB 4FWSA 3WXLA 1GLDG 2FLOA 2YCHA 5BN8A 2P9UB 3A5OC 1TYQA 4BRCA 1XC3A 5AQNA 1NGFA 4CZKA 3VEWA 4NB4A 3SMSA 2E2OA 2QWNA 2UYTA 4IO8A 3BF3A 1NGJA 2P9UA 2ZF5O 4FWPA 4L3QA 4BC3A 4BROA 3BP8A 3DWLA 4DCHA 4M63C 3MDQA 4H0YB 4EAHD 2AA4A 2BTFA 2EWSA 1DGKN 1H1VA 2GUPA 2A41A 1V4SA 4BR7A 4MLHA 5AQJA 2CH5A 2KHOA 3QBWA 1NGIA 4H0TB 4EHUA 2V51B 4BGBA 1NWKA 3VF2A 4BRLA 3A8YA 3L6QA 4ISFA 3HTVA 3J8AA 3ZX0A 3CJBA 1Q18A 4YDUA 3CETA 2I7NA 4XH5A 1TUUA 4RCHA 5JICA 3CQXA 1RFQA 4BRIA 4H03B 3EZWA 3BF1A 4XH4A 3P4IA 2ITMA 1NBWA 1D4XA 4FWOA 1Z6RA 2E1YA 2NLXA 4GNIA 3AAPA 3VGLA 3GBTA 4IJAA 3WEEB 1CZAN 5AQTA 4K41A 1JCEA 4H5TA 5F2RA 3TU5A 4BR2A 3ULEB 2ZGYA 3M3ZA 5AQMA 4CD3A 3H3OB 3VEZA 2E20A 3WEEA 3HBTA 3LM9A 2FSNA 2P9IA 5BPLA 2GTDA 1BG3A 3FFKB 1RDWX 3SMPA 3QMLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F96A 4MFBA 4FVUA 3T19A 1HJOA 3E1YA 4XH1A 2HW3A 4GKJK 3VPZA 3IAYA 3HYFA 3LP0A 2A40A 2QM1A 1S5JA 5I9EB 3NAEA 1NG9A 3AVLA 2GELA 5KPTA 1JL2A 4CW7B 2O4GA 3CJCA 5C12A 1JLQA 3U3GA 5E84A 3K58A 1XWLA 1HYSA 3V9SA 2P1JA 1NKEA 4OGEA 3VQCA 2BE2A 3O9QA 3DLRA 3KWIA 3VEXA 4KH6A 3CHWA 4YOYA 3B6OA 2HMPA 1QZ6A 1N32K 4Q5VA 1HKGA 4QS8A 4OLBA 4JD2A 4M3YA 4FK0A 4PQUA 3NGYA 1JLBA 3CG7A 1KAXA 4ILGB 3P38A 3AVBA 2ASMA 2F8TA 1NJYA 1HQEA 3FR0A 4LF9K 4F3TA 1VQMN 3A2FA 2NUBA 5ADXH 4M3TA 4KHPK 2P9LB 5AQUA 3AVAA 3JS6A 1C0UA 3O08A 3SQ1A 4FWNA 3I8DA 3CC7N 3LALA 1BA0A 3WQTA 4DFKA 1VQ6N 2KZMA 3RMDA 1IG8A 4H5WA 4CCHA 1VSEA 4H0PA 1YHQN 1WNSA 4IEEA 1TAQA 3OHRA 1EQYA 4W5OA 3IS9A 3AA2A 3CERA 4W5QA 4BR0A 3RWUA 1FKPA 3NGIA 1RTDA 4DB3A 3OS1A 4IOAL 4JI8K 4FJMA 3E66A 1K9MO 1S9EA 4IWVA 3UKRA 4ISEA 2O8EA 4B1XB 3D0PA 4I7FA 1Q82O 1T44A 2NZTA 2JWKA 5J2NA 1HYZA 5E26A 1TL1A 4LC9B 3I8BA 1NGDA 1WUAA 4H8KA 2D4WA 1K73O 2W40A 1J5EK 4PL8A 4BE2A 3HP6A 1EKEA 3H08A 2P9NB 3OYLA 4N5SA 4KRFA 1DTTA 1GLEG 3DOLA 4M3RA 4CGHA 3N4QA 2DPNA 4FJ7A 4YOXA 4O5FA 3E9OA 4I6MA 1NLVA 2ZJRL 3KD1E 2QWRA 1WBDA 4EIAA 3LAKA 5M1PA 3MN7A 2VWJA 2P51A 4DU1A 1RTJA 4DV1K 4W5NA 5GAGP 2HNYA 4FZXC 2QTDA 4M3WA 3KLHA 4FLVA 2XHBA 1MWMA 3AVCA 4C1NI 4O8KA 3T69A 4CEBA 3MXIA 4CEOA 2A42A 4B1YB 4GVEA 3ZX3A 4CESA 4CJUA 5BN9A 1MWKA 3QDKA 3H1QA 3K57A 1VK0A 3D2EA 5AQRA 3RSEA 3TSPA 3FLCO 1NGBA 1WSJA 3WT0A 1NNEA 3AVFA 1GOAA 4FOIA 5HRNA 5M1FA 2Z1JA 4RW9A 1WAFA 3HXMA 1DKGD 3R9PA 3I33A 5AQVA 4CD1A 3VGMA 1NK4A 4O5BA 3AV9A 2YHAA 5M1KA 4CJQA 3ZSQA 3VEOA 1UOCA 1HNWK 3V9ZA 2A5XA 4Z4IA 3CC4N 4KTQA 2NRTA 2A1RA 1KXPA 1HRHA 4KKOA 1VSJA 4CJVA 1GLFO 3WUHA 1N8RO 2I7PA 1VSLA 3C7NA 5FDLA 3LP3A 5JLFA 1KLMA 1CXUA 3HOTA 3NFAA 4WF9L 4CHQA 3O6WA 3LDQA 4Y0WA 1QQNA 2HSTA 3G10A 5AQGA 4AHCA 2RF2A 3HZ6A 1VQNN 5B8HA 5GINA 1O13A 3LZJA 3L3UA 2P9PB 2HF4A 4LF6K 2VG6A 4HCBA 4J2EA 2G8HA 5LJVA 2ZQBA 1YJ9N 4LFCK 2YHXA 3OVNA 5EX5A 3UE5A 3ZSVA 4BRHA 2UUBK 2RHKA 4K43A 4BG9A 3K5LA 3KLFA 1S1XA 1EO1A 1RDAA 3OA9A 4CJTA 3TARA 2VCPA 3O5BA 3RRHA 2BDPA 2OANA 1X9WA 5ADXA 3ZYYX 3ATVA 4JK7A 2QXFA 3MXJA 4BR4A 2LSNA 3O3GA 1U4BA 3THXB 3O9RA 3ZLJA 3RR7A 2RKIA 4HTLA 3SAFA 3DXKB 2P9KA 1VQ8N 3CI5A 1YI2N 1NOYA 1S3XA 1FK9A 5KQ8A 4M7XA 3NF8A 5GAHP 2XY7A 4FW1A 1QS4A 3I0SA 1TL3A 3P31A 5KI6A 1YXQA 3OJSA 3MECA 4U67L 3J7ZO 3T3FA 4JKFA 3IUCA 3CFRA 3HSCA 4DR6K 3GL1A 5FPMA 2BGGA 1CXQA 1XNQK 4JKAA 3F9KA 5BR9A 4FL9A 5AZJB 1N6QA 1YJNN 2GEMA 3PO4A 1BO5O 1P8ZA 3V9WA 4NCBA 3PUFA 1BQMA 4CZGA 2Q0UA 5AQOA 3UKUB 3VF6A 3VQ8A 4FW2A 1T6DA 3C95A 5J1EA 3MN6A 2FBTA 2KKZA 1NGHA 3SCXA 1HUXA 5TKWA 4TSXA 5AQXA 3WXIA 4Y1CA 1ZBSA 3WNEA 1Q9XA 2HB5A 1ASUA 3E9LA 3ALYA 4F8RA 2KQ2A 3KD5E 1K8KA 4B9SA 3VF4A 5TKYA 4YORA 4CZLA 3ATUA 3SQ4A 3LDPA 3KKRA 5J2PA 1LWFA 4BR9A 3ENBA 3WNFA 1RNHA 3DRPA 1JXBA 3SI6A 3AVHA 1ZBIA 5AFUH 4DUZK 5AZIB 3THYB 1QQCA 3PX0A 4BRCA 1NGFA 4JI4K 5LL6Z 4CZKA 1TKXA 2WTUA 4EP5A 2RE2A 3TAPA 3BF3A 4FWPA 2P9UA 4L3QA 3SAGA 3T1YK 3NGZA 3AVIA 1RCHA 3OYGA 3F5TA 3BP8A 4JI1K 3DWLA 3MDQA 4H0YB 3CFOA 5J2MA 2BTFA 4DTRA 2A41A 2KHOA 4N76A 1NGIA 3ZSRA 1IBKK 3VF2A 2WONA 4ISFA 1T8EA 1IBMK 3J80O 2DFHA 3HTVA 3AGKA 3HOSA 4RCHA 1HYVA 1RT1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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