The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
|
sequence length |
116
|
structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| total genus |
23
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4LFA K; 1IBM K; 4DV6 K; 2UU9 K; 5IWA K; 1XNR K; 4OX9 K; 4LFB K; 4JI3 K; 4LF7 K; 4DUY K; 4JI5 K; 2VQF K; 2UXD K; 5BR8 K; 1IBK K; 4B3S K; 4X64 K; 4DR3 K; 5LL6 Z; 4KHP K; 4JV5 K; 3OTO K; 5IT9 O; 4B3T K; 4K0K K; 4LF8 K; 4CVN E; 4DUZ K; 3JAM O; 4DR2 K; 5A2Q O; 2HHH K; 4JI2 K; 4LF5 K; 2UXC K; 3J7Y P; 1N33 K; 4GKJ K; 4DR6 K; 4LF6 K; 4X65 K; 4NXM K; 2UUB K; 4NXN K; 4DV3 K; 2UUA K; 4DV1 K; 4LFC K; 2UUC K; 4YHH K; 5FLX O; 4DV2 K; 4JYA K; 4B3M K; 1XMO K; 1XNQ K; 3J7A P; 4DR5 K; 4B3R K; 1HNW K; 4JI8 K; 3T1Y K; 2ZM6 K; 4X62 K; 5AJ3 K; 1HR0 K; 4JI0 K; 2VQE K; 5LMU K; 4JI1 K; 4DV0 K; 3J80 O; 4DR1 K; 2UXB K; 4AQY K; 1FJG K; 4DR4 K; 4JI7 K; 4DV5 K; 1IBL K; 1HNX K; 4DV7 K; 4V19 S; 1XMQ K; 4DV4 K; 4JI4 K; 2E5L K; 4LF4 K; 1I94 K; 4DR7 K; 2F4V K; 4X66 K; 4CW7 B; 4YY3 K; 3J81 O; 1N34 K; 1HNZ K; 3T1H K; 4LF9 K; 1N32 K; 1J5E K; 4GKK K; 1N36 K; 5LMN K; 4JI6 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HQU A; 4NCG A; 3V4I A; 1UWB A; 3QES A; 4PKI A; 4KH6 A; 3RR8 A; 4BRG A; 1T05 A; 1O13 A; 1NGB A; 3ZX2 A; 4CF8 A; 4BE1 A; 2YHW A; 4BDZ A; 1K8A O; 1YI2 N; 1QZ5 A; 4DTS A; 3PX4 A; 4E1M A; 1YUW A; 1KAY A; 1MA9 B; 3CET A; 4CBX A; 3WQU A; 1L3U A; 3WNG A; 1K8K B; 4B1X B; 1WBD A; 1NKC A; 1HYZ A; 1TAQ A; 2HHH K; 1KLN A; 3J7Y P; 2A1S A; 5GIN A; 3U9Z A; 3KLG A; 4F3O A; 4O8U A; 3DLE A; 1SKS A; 4FXD A; 3V9S A; 2F96 A; 1BI4 A; 4I2Q A; 4DV1 K; 4PWD A; 4LSL A; 1VSI A; 4CES A; 4LFC K; 3AO4 A; 2HOE A; 2E2P A; 4FJH A; 2VYP A; 3R1X A; 5AQU A; 2E1Y A; 3DI6 A; 1TGO A; 3VGM A; 3SMS A; 2XY7 A; 1XMO K; 2NRT A; 2R7Y A; 2D4W A; 3K9J A; 2I7P A; 4DTJ A; 2ZJQ L; 2JGU A; 5CYM A; 4BVP A; 3U3Y A; 4DQ8 A; 4KFB A; 4EZ9 A; 4WCE L; 1TKZ A; 3BZC A; 4HVJ A; 1ATN A; 3HVR A; 1T6C A; 2Z1I A; 1EET A; 2PYJ A; 4C8N A; 4JI1 K; 1OH8 A; 1HNI A; 5C0Y A; 4BRP A; 3AAQ A; 4DHY A; 5DMR A; 4FLT A; 2OYQ A; 2VCP A; 4M3U A; 1X3M A; 4IG0 A; 4DV5 K; 1LWC A; 5AQP A; 3OYN A; 1GLC G; 2HNZ A; 4M63 C; 1Z25 A; 1NMD A; 1W97 L; 4FWL A; 1NGE A; 4ZTF A; 2E6L A; 4FWO A; 1VRT A; 2QK9 A; 4IO8 A; 1HKB A; 4DKW A; 3I8D A; 1CZB A; 4WE1 A; 4OLA A; 1S3X A; 4DTM A; 4WFN L; 5AZI A; 3O4N A; 4CF9 A; 4ICL A; 4HUF A; 3NF7 A; 4EP4 A; 1ZC6 A; 3HTV A; 2GWK A; 5KQD A; 3HOS A; 1XNR K; 4FJM A; 4PL8 A; 5KTQ A; 4BGB A; 3CCS N; 4JI3 K; 4CJV A; 1C1A A; 4JRP A; 3D45 A; 4BR2 A; 3L2R A; 2FBT A; 4W5N A; 5BR8 K; 4KKO A; 5FPN A; 1NK6 A; 4CE9 A; 3ZET A; 3U6F A; 4PKG A; 4Z4I A; 4B3T K; 1SKW A; 2IAJ A; 3AVM A; 4DUZ K; 3LZI A; 3O80 A; 1Q8I A; 4JI2 K; 1XQS C; 1YVU A; 4BRQ A; 3HVT A; 3EKU A; 3ZYY X; 4KV8 A; 3L4Q A; 3QEW A; 2NUB A; 3H46 O; 3CJC A; 5M1O A; 3FFK B; 4TSX A; 1HX1 A; 3KK2 A; 1NK9 A; 4A62 A; 1YT3 A; 2CGK A; 3L6Q A; 3V1R A; 3QIC A; 1RTH A; 3BDP A; 2XHB A; 3QIP A; 4M45 A; 4N47 A; 4N76 A; 1NLV A; 4Z4F A; 4CED A; 4FLX A; 2YNI A; 4B3M K; 4K25 A; 4Z4G A; 1GLB G; 3ID6 A; 4BE2 A; 3DXM B; 3OHR A; 5BPN A; 3QIO A; 5EXW A; 3HO1 A; 4Z0U A; 3V6D A; 4I9Q A; 1NGI A; 1YTU A; 4B1Z A; 1WOQ A; 2F9T A; 2Q97 A; 4PL7 A; 1H1V A; 1FJG K; 4DR4 K; 3IDH A; 4NO7 A; 1RIL A; 3SAF A; 2G8F A; 4CZJ A; 5KPR A; 3WXL A; 3QML A; 3RRG A; 3BP8 A; 3LL3 A; 1WSF A; 2O8F A; 5KPZ A; 5CE3 A; 4YY3 K; 4YFU A; 3HP6 A; 1T3V A; 4FJ7 A; 2O8D B; 1WUA A; 1HPZ A; 3T1H K; 3Q7B A; 4JRQ A; 1M90 O; 4CEO A; 4FOI A; 4CER A; 4WQ4 A; 1JL2 A; 2P9I A; 1IBM K; 2PY5 A; 4M3W A; 3MDQ A; 4G1Q A; 4J8F A; 1LWE A; 4BDY A; 1ZBI A; 3TAR A; 1VSF A; 2HHX A; 2CGL A; 2QM1 A; 1UAX A; 2P9K B; 4Z4H A; 4CJK A; 3VEO A; 3DJC A; 4JD2 A; 2QWL A; 4AHS A; 3UKR A; 2DY4 A; 3NVK A; 4BAC A; 2PBD A; 3AO1 A; 3NFA A; 4FPA A; 1U2V A; 4BRD A; 4H0Y B; 4MO4 A; 1X9J A; 5AQQ A; 1VQ9 N; 4O55 A; 2G8U A; 2Z1J A; 4M3Z A; 3VTI A; 4DFK A; 2UUA K; 5AQI A; 2WOM A; 4JKH A; 4KHS A; 5BR9 A; 3KKS A; 1KLM A; 3MN7 A; 1J53 A; 4PKH A; 1SL0 A; 3NE6 A; 3VEV A; 4KB1 A; 3GOI A; 5FLX O; 3MK6 A; 3ISN C; 4M41 A; 3O08 A; 3RVC A; 3L0Q A; 3FGU A; 3CFP A; 1Q9Y A; 4CEF A; 4FJJ A; 4M7Y A; 3T1Y K; 4CEE A; 1GOC A; 2O4I A; 4M3X A; 1KVC A; 2VQE K; 2BGG A; 3ZSW A; 3MEC A; 4U7B A; 1QE1 A; 3DMJ A; 2P9P B; 4DF8 A; 2QKB A; 4J2B A; 3BUZ B; 4FJK A; 1RDD A; 4CZF A; 3O3G A; 4JKA A; 5BRE A; 1N5Y A; 3B8A X; 4DV7 K; 1XMQ K; 3QFP A; 1RFQ A; 3U3G A; 2KHO A; 2E5L K; 4KHQ A; 1E4G T; 4DR7 K; 1S9E A; 3EYZ A; 4HWI A; 1FXX A; 2HNY A; 2WBN A; 3GDQ A; 4M42 A; 5C15 A; 2Y1J A; 4DFJ A; 1RNH A; 2ASM A; 3BY5 A; 5JS1 A; 4KH4 A; 1VK0 A; 3O9R A; 1W7A A; 3OBY A; 1VQK N; 1LCU A; 3H6E A; 3SQ1 A; 4ISF A; 4IFY A; 4JNE A; 4DV6 K; 3DYA A; 4AHU A; 4CBU A; 1ASU A; 5JLH A; 3OS0 A; 4BY9 C; 3QFU A; 4H0T B; 4KO0 A; 3OYE A; 4DUY K; 1Q81 O; 1P8Z A; 4FOE A; 3LP3 A; 4CF1 A; 4CHY A; 4KHP K; 2G8H A; 2F9W A; 1KXP A; 3OBW A; 3DXK A; 2OPR A; 3OTO K; 4HCB A; 4FZY A; 3NF9 A; 4CK2 A; 3SNN A; 1VQ4 N; 3WXK A; 1N8R O; 2HBK A; 1KTQ A; 1TVR A; 5A2Q O; 2O8E A; 2HB5 A; 4LF5 K; 3ZT2 A; 3RSE A; 1U4B A; 1C1C A; 2HVI A; 3HPH A; 4GKJ K; 5KGX A; 4Y1C A; 2FF6 A; 4CJQ A; 4H5W A; 1JKH A; 4DV3 K; 1BI4 B; 3L2Q A; 3CCV N; 1MWM A; 4DSF A; 3L3V A; 2KQ2 A; 1JLA A; 4A59 A; 1VQL N; 1KVB A; 3LDS A; 1MDU B; 2W40 A; 3AGR A; 3FLC O; 1XC9 A; 1TYQ A; 3VEW A; 2CGJ A; 1IKX A; 2Q36 A; 3JS6 A; 2HMI A; 4FM0 A; 5AJ3 K; 4ZTJ A; 4BGA A; 1NOZ A; 5AQS A; 2W41 A; 4JKF A; 3QNO A; 4DB3 A; 2O8B B; 3IS9 A; 4CJF A; 4KI4 A; 1ZBS A; 4N56 A; 1BCM A; 4YOX A; 4BG9 A; 2HHW A; 4H5N A; 3VQQ A; 1D4X A; 4EFH A; 1EWQ A; 2YHX A; 4DTO A; 2ASO A; 4DSK A; 3AO5 A; 4JKE A; 4CK1 A; 1NK4 A; 3EZW A; 1I94 K; 5M1F A; 4IXC A; 3AAR A; 4CIE A; 4RW8 A; 4KHW A; 1WLJ A; 4DLG A; 3AAP A; 1SS6 A; 3ENB A; 3L4I A; 1QTM A; 4AM6 A; 2BE2 A; 3OJU A; 4XH1 A; 3AA4 A; 4O44 A; 4E7J A; 3R8E A; 4DMN A; 1NOY A; 4B9V A; 5CHI A; 4YNQ A; 4WF9 L; 1TKT A; 2FSJ A; 1CZ9 A; 2A40 A; 1JCG A; 2IS3 A; 5BRH A; 4FJX A; 5C25 A; 3F2K A; 5C12 A; 1UA1 A; 3CHW A; 3TTD A; 3HPO A; 3MEG A; 4LF7 K; 1V4T A; 4BQL A; 3SUP A; 4A2A A; 1VSJ A; 2GX9 A; 1RT4 A; 3RR7 A; 1YF5 L; 2VG7 A; 3ZSO A; 1N6Q A; 4KTW A; 3CCR N; 4CD3 A; 5GIO A; 1D9D A; 3CFO A; 1VSM A; 4W5O A; 1QSL A; 3OS2 A; 4DTR A; 4DU4 A; 1JL1 A; 5AQK A; 4ID5 A; 1TK8 A; 3WNH A; 2A42 A; 4H0V B; 4G9Z A; 3NGZ A; 4BRH A; 3MED A; 2GUP A; 3I8B A; 2CH6 A; 3TAB A; 2I5J A; 1SZ2 A; 3AA5 X; 3G4S N; 1MU2 A; 4E1J A; 1IJJ A; 4JKD A; 5KRS A; 2YCH A; 4B9L A; 2EWS A; 3E9L A; 5K14 A; 1SUQ A; 3PX6 A; 2O8C A; 4PA1 A; 1BGX T; 4NB4 A; 3KLF A; 3QEX A; 1TUU A; 3G71 N; 4KTZ A; 4FW2 A; 1YJN N; 5AZJ A; 2HF4 A; 1KFD A; 3J80 O; 1IKY A; 3LPT A; 3KHY A; 4JK8 A; 1U47 A; 1M1K O; 1HRH A; 3O9T A; 3R3L A; 4H8K A; 3CG7 A; 3VF4 A; 3K2P A; 3LDN A; 1X9S A; 1HNX K; 2B5J A; 4CF2 A; 4DV4 K; 4JI4 K; 3THX A; 1OH5 A; 4DQI A; 3QBW A; 2O8F B; 2F4V K; 4ILG B; 1E4F T; 2UYT A; 4X66 K; 3E9O A; 4FM2 A; 2NRW A; 5J2N A; 3MCA B; 1X1P A; 4DSL A; 4RTF D; 1NK5 A; 2XY8 A; 3LM2 A; 1ZBF A; 2IGI A; 3SMP A; 2VG5 A; 3FR0 A; 3DAW A; 4YOR A; 1VRU A; 2P9I B; 2PZS A; 3AVL A; 4E7H A; 2X78 A; 3ENO A; 3AA3 A; 1VSD A; 2F7T A; 3LM9 A; 4FCY A; 4BQZ A; 4EAH D; 1K6Y A; 3CM5 A; 3R9P A; 3AY9 A; 3IG1 A; 4JD2 B; 1Z05 A; 3UKR B; 2E1Z A; 4CVN E; 1D8Y A; 2X6S A; 1SL1 A; 4Z4E A; 2OTJ N; 1U2V B; 3CD6 N; 3O4W A; 3TSU A; 5BN8 A; 3HM9 A; 1N33 K; 3DRS A; 1HKC A; 2Y1I A; 1JLE A; 4C8O A; 4FJ5 A; 5TKY A; 3A0I X; 3HSC A; 2D0A A; 2YJE A; 1BUP A; 4KTQ A; 4U67 L; 3CFR A; 3B6P A; 3LDP A; 3LPU A; 4RCH A; 3IKM A; 2YKN A; 4ILH A; 3CCE N; 5AFU H; 2P51 A; 4ID1 A; 4DV2 K; 4FWK A; 4GW6 A; 1RDB A; 2OZS A; 5JIC A; 3VGK A; 4BC3 A; 5CR4 A; 3AVN A; 3P83 D; 1YIJ N; 3EZ5 A; 1VAZ A; 3WQT A; 3E01 A; 1ILY A; 2NLX A; 3CMA N; 2ZGZ A; 3FZK A; 1RCH A; 2FBV A; 2JLE A; 5JVH L; 1FW6 A; 2ETJ A; 4CZM A; 5GIP A; 5FRN A; 4FSV A; 3K59 A; 2JWL A; 4JK9 A; 1VSK A; 3EL2 A; 1XUP O; 3NF8 A; 4IBN A; 5FRO A; 5JS2 A; 3VF6 A; 2BDP A; 3OYI A; 1BL3 A; 3VQC A; 4CEC A; 1VQP N; 1N32 K; 5EX5 A; 2NNW A; 1U04 A; 4AH9 A; 3WNE A; 3QIN A; 2KZZ A; 4FK2 A; 1HJR A; 4Z4C A; 1RBR A; 2D5R A; 2OPQ A; 3NBP A; 5DK5 A; 1U45 A; 3KLE A; 4DTU A; 4FWS A; 3DLH A; 1RT3 A; 3CCU N; 5C24 A; 3LAM A; 4CFD A; 4AF1 A; 3LWL A; 1MWK A; 2ZF5 O; 1TKD A; 1E3M A; 3IFR A; 3VA3 A; 1C1B A; 1KRP A; 3CQY A; 4DSJ A; 3DXK B; 1QVF M; 1QQM A; 3JAM O; 2Q31 A; 4DLE A; 4FJG A; 4FLY A; 3SPZ A; 2RKI A; 4QS8 A; 1T7P A; 4DR2 K; 3LWM A; 1OVY A; 3P5J A; 3HT3 A; 2O8E B; 1SAZ A; 4E19 A; 4DFP A; 2WUS A; 1DLO A; 4BWM A; 2V7Z A; 3VQE A; 3KKR A; 1NGD A; 1QVG M; 4NCB A; 4Y1D A; 1NBW A; 1RBT A; 3K0S A; 2KW4 A; 4UQG A; 3SV3 A; 2AP1 A; 3H1V X; 3WUH A; 4I2P A; 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1W0H A; 4A61 A; 1KQS M; 2YNH A; 4BWJ A; 4B9S A; 1RDA A; 2OPP A; 3LDQ A; 3H1Q A; 4HHT A; 3VQ7 A; 4FK0 A; 1BA1 A; 4YOU A; 3W0L A; 2QA4 N; 2A1R A; 3CCM N; 3V81 A; 1NGJ A; 1KCF A; 1S22 A; 3CI5 A; 1S1X A; 2O8C B; 4LSN A; 4F2S A; 2HW3 A; 3O3H A; 1FKP A; 1Q86 O; 1HMV A; 1W2B M; 1C0F A; 4BRO A; 1HR0 K; 4JI0 K; 4FJI A; 3FZF A; 2E4L A; 1VQN N; 1D5A A; 3FZH A; 5EY4 A; 4IJA A; 5AZJ B; 4B3O A; 5CY4 A; 4W5R A; 5AQL A; 4DR1 K; 3I55 N; 4JKG A; 3VEY A; 2QXF A; 4N5S A; 3VN5 A; 1O1W A; 1QQN A; 1YHQ N; 2BUP A; 3MAQ A; 1EO1 A; 1WAJ A; 3THX B; 5SWM A; 4DWI A; 2RPI A; 3THV A; 4AHC A; 3J81 O; 4CZK A; 3ENH A; 5AQG A; 2HST A; 5AFU A; 1RT1 A; 3VEZ A; 4EP5 A; 4LF9 K; 1BIS A; 4FZZ A; 2RN2 A; 3TPQ A; 2VWK A; 1CXU A; 4O0J A; 1K8K A; 3NMU A; 1NJX A; 4CGD A; 1WBB A; 4LFA K; 4KRE A; 3S3N A; 1NJY A; 3MN9 A; 4CJU A; 3OYJ A; 2HHQ A; 5FPE A; 2E6M A; 4B9Q A; 4IKF A; 3C94 A; 3ZT4 A; 3BF1 A; 5I42 A; 1RDU A; 4LH5 A; 2QXL A; 3C95 A; 4X64 K; 5LL6 Z; 5AQZ A; 3BEX A; 3NAE A; 2VWJ A; 1G15 A; 4CZH A; 1BU6 O; 3PX0 A; 4BDP A; 1NG9 A; 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