3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/transport protein
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
4EHTA 3ZETA 1BU6O 1K8KB 3WUHA 2E2QA 3AY9A 3FZKA 4JD2A 1E4FT 2QWRA 2A5XA 2E2PA 2F9TA 5KQ8A 4H5RA 4CZIA 5KQDA 3VETA 1NGFA 3JS6A 1BO5O 5AFUH 1WUAA 3CJCA 4IXCA 1NGDA 2Q2RA 2YHXA 3MN7A 2CGKA 4EHUA 1ESVA 4Z94A 3LDNA 5LY3A 1ZC6A 2P9IA 3CQYA 5AQJA 4A2BA 2E8AA 3ATVA 1NGAA 5AQRA 5AQPA 4I6MB 3WQUA 2ASPA 4BC4A 2PAVA 1TUUA 2YJEA 1DGKN 3DXMA 1TYQB 4FO0A 1ZXOA 3VERA 3UKUA 1GLEG 3O80A 4K43A 2P9PA 4FWMA 5F1XA 4DQ8A 2YHYA 1QHAA 5EOYA 5EVZA 3MCPA 4JD2B 3HSCA 1IJJA 1Z6RA 4FWKA 3H3OB 5AQUA 3VEOA 2IVPA 4BR0A 5AQTA 4M63C 4BRQA 4H5VA 5KPZA 2FF3B 3UE5A 2AP1A 3P4IA 3A5NC 3U9DA 5JLHA 2P9SA 4CZFA 2QWNA 1MDUB 5ADXA 5JMVA 1GLLO 3D2FA 2P9IB 4FWOA 3AARA 3FGUA 5AZIA 4A62A 3MN6A 2ZF5O 5BPMA 5CE3A 3VGLA 2V52B 3UB5A 4FWRA 2GEMA 3J8AA 2D4WA 5TKYA 3WXKA 4PKHA 3A5LC 4H03B 1NWKA 3BEXA 2E2OA 3CERA 3JXUA 4FWQA 3EZWA 4M7YA 2P9KB 1NGBA 3VPZA 1NGJA 2QXLA 3DXKA 2FSJA 2GUPA 4JHDA 4BC2A 1QQMA 3BUZB 3LM2A 3ULEA 3UKRB 1YUWA 2CH6A 3A5MC 3WEEB 4WQ5A 5KPTA 5AQOA 3QDKA 4BR9A 5AZJA 3AAPA 3O5BA 4WQ4A 4DB3A 3B8AX 3F9MA 1BA0A 4H0OA 4JNEA 4CD1A 3G25A 5BPLA 4O5FA 1BUPA 5BPNA 1DKGD 4MLHA 4WQ5C 3CIPA 3SK3A 1MA9B 3GE1A 3H46O 4BRDA 3QMLA 4LC9B 5F2RA 5BN8A 4WQ4C 1ZBSA 2FLOA 3LM9A 1QQNA 3KVGA 4H0XB 2QW9A 4MLEA 4NB4A 1MWMA 4AM6A 1XC3A 4AM7A 3LDQA 2E2NA 1KXPA 4ISFA 4JHDB 1BG3A 4BRNA 1MWKA 4K41A 4BRLA 1V4TA 3ENOA 4H0YB 4BRCA 3QFPA 2NRHA 1HPMA 3VENA 5AQGA 4BQLA 2FSNA 3EN9A 4PKGA 2NLXA 4H0VB 5AZJB 4E1JA 4CI6A 1Z05A 3H45C 1JCGA 1QZ5A 4WYBA 4IO8A 2I7PA 3CJ9A 2FSKA 3CI5A 2YCHA 2ZGYA 3HTVA 1BDGA 1U2VA 2Q31A 4FWLA 3ZX3A 1GLDG 1T6CA 2IIRA 3FZFA 3H1VX 5LJWA 1HKCA 2HF4A 1P8ZA 5KPRA 4EAHD 1S3XA 2A41A 3AAQA 4ISEA 5JLFA 4BG8A 3FZLA 1R59O 5BRFA 2P9NB 3WQTA 5AR0A 1NGEA 5BREA 1ATNA 4HWIA 4B1VA 3EKUA 3QBXA 4HTLA 1RGIA 3VEWA 3W3DA 3ZETB 2I7NA 4BRGA 3CJAA 3I8BA 4QS7A 5AQVA 3EO3A 3ZX2A 2BTFA 5FPNA 2QWQA 4CZGA 2QWMA 1TUYA 4CZMA 2P9LA 2V51B 4IZ9A 3LL3A 2QWPA 3MN9A 3RSEA 2CH5A 4BC3A 5I9EB 1X3MA 1C0FA 3CETA 2Q97A 4K42A 4RWTA 1V4SA 4BR4A 3WXLA 4QS8A 2V7ZA 4XH4A 1YXQA 3D2EA 4C23A 1NGGA 3DXMB 3D7EO 3UKUB 2D1KA 1Q18A 2P9PB 2A40A 3CHWA 5BN9A 3CJBA 2E20A 4B9QA 3DAWA 3MDQA 1RDWX 4BVOA 3S41A 1GLAG 4BG9A 2GWJA 1BWFO 1KAXA 2HMPA 4MO5A 3GBTA 4RTFD 4BR5A 4EFHA 1T6DA 4B1WB 4BROA 3L0QA 4BRIA 2E88A 3MN5A 2GWKA 4B1YB 2ZGZA 2P9SB 4H5TA 3ID8A 4BRMA 3RSEB 4KBOA 4BR7A 3M6GA 3D2FB 2E1YA 5AQSA 3ENHA 5AZIB 5AQIA 4B1XB 5BRHA 1XUPO 4CBWA 4IWVA 5B8HA 4IJNA 5AQQA 3FFKB 3ZEUA 4RCHA 4CJ7A 3C7NA 3D2EB 2UYTA 3HI0A 3C0BA 3SMPA 3I33A 1IG8A 3HZ6A 1YVNA 4BRPA 1XQSC 4CZEA 4PL8A 3EL2A 1K8KA 2Q0UA 4JN4A 3VEVA 1GLCG 3VF4A 1NMDA 2W40A 5AQMA 1H1VA 2QWLA 3LDLA 1QZ6A 2CGLA 3O1WA 1NGIA 3VGMA 3DXKB 3WT0A 5JICA 4BRAA 5E84A 1KAYA 4BGAA 4XEIA 3ULEB 3BF1A 3FZHA 3CJ1A 3M1FA 1WOQA 4BR2A 1NGCA 2P9UA 2V7YA 4BRKA 2A42A 3L6QA 4ISGA 3GG4A 3ZEUB 4H0TB 1QQOA 4CZLA 4CZHA 3C7NB 3EKSA 5FPEA 2ZWHA 4FSVA 4Y0WA 3FLCO 3VESA 4FOIA 3WXIA 4NO7A 5AQKA 4L3QA 2YHWA 4K25A 3SJHA 1NGHA 2HOEA 2A6AA 2D0OA 3ATUA 2VYPA 1G99A 1LCUA 4H0PA 4A61A 3R9PA 2GTDA 2CGJA 3HM8A 2W41A 3SLCA 5AQLA 4B1UB 3IUCA 3MMVA 1YAGA 3VF2A 5FPDA 1ATSA 3VF6A 3FE1A 2P9UB 1J6ZA 2NZTA 3W0LA 2FF6A 4XH1A 1LOTB 3FR0A 1NM1A 5AQZA 2D0PA 2ASMA 4PL7A 3LDPA 3GDQA 4FWNA 4FWSA 5ELZA 1SAZA 3IDHA 3U4LA 4GY2B 4BRFA 3VEYA 3TPQA 5BRDA 5AQXA 3ZX0A 1HKGA 3R8EA 3O4WA 1SZ2A 1U2VB 1BA1A 5E26A 2YJFA 2J4RA 5BR9A 1DEJA 4DCHA 1KAZA 2HF3A 1HKBA 2VCPA 1S22A 4FOEA 1GLJO 3H1QA 2H3GX 3BP8A 4F9OA 4YDUA 4CBUA 2BUPA 1GLBG 1C0GA 2P9KA 1BOTO 4FL9A 4J8FA 4EIAA 5AQYA 2E1ZA 1RFQA 4B1ZA 1Y64A 3OHRA 3CQXA 2YI1A 3L4IA 3CJ7A 3O1BA 1JCFA 3QICA 4YDUC 1U6ZA 3SMSA 1HX1A 4QS9A 3UKRA 2EWSA 3WEEA 1HUXA 1D4XA 3HBTA 3DWLA 4PKIA 2WUSA 4IJAA 2P9LB 2PBDA 2FXUA 5AQHA 3QB0A 1T44A 3TU5A 1EQYA 3KHYA 3FZMA 3LDOA 4A2AA 3O6WA 5AQNA 2Q1NA 3IFRA 5LJVA 4CZKA 4FPBA 1ATRA 4XH5A 5EY4A 3O08A 1NLVA 4MO4A 4BC5A 1GLFO 2A3ZA 4H5NA 3O8MA 5EX5A 4BGBA 4O8KA 2DPNA 1OKJA 2OANA 3VEZA 3QBWA 2QM1A 2GELA 4FWPA 3U9ZA 4BQZA 4CZJA 3A5OC 5EXWA 3KZBA 1JCEA 3H3NO 3DJCA 3WXJA 1NBWA 1X3NA 3A0IX 5AFUA 4BRHA 3MK6A 2F9WA 3IMXA 5ADXH 3QFUA 2QWOA 5FPMA 3GL1A 3M3ZA 1CZAN 2IVOA 4BVPA 1X9JA 4GNIA 4CD3A 3BF3A 5F0XA 3H6EA 4FPAA 3VGKA 3A8YA 5AQWA 2AA4A 3U8XA 4DHYA 2KHOA 2Q36A 1HJOA 4BREA 2ASOA 3GOIA 4H5WA 1E4GT 3R6MA 3VOVA 4JAXA 5AQFA 2P9NA 4I6MA 2ITMA 1HLUA 2IVNA 4CBXA 2Q0RA 4M7XA 2VWBA 3VEXA 1SQKA 1TYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1J54A 4EHTA 3ZETA 1BU6O 4AF1A 4Y1CA 4N41A 3TANA 1KTQA 1T8EA 1TK0A 2QWRA 4FLYA 4IBNA 4C8MA 3NGZA 4M45A 1L3UA 1UA1A 3VETA 1WUAA 4DR5K 4CGDA 4M3UA 2Q2RA 2YHXA 2IOCA 3SAHA 4EHUA 1NKBA 1ESVA 4X62K 3F9KA 3LDNA 3HOTA 2JGUA 1NGAA 3LAKA 4IDKA 3WQUA 3AO1A 1YIJN 2JWLA 3KK1A 2YJEA 4DV1K 1RBUA 1TYQB 1J53A 2Y1IA 1Z26A 3O80A 5F1XA 4DU1A 1J5EK 2O4IA 3WNGA 2YHYA 5EOYA 3OYBA 3MCPA 3MXJA 3L4QA 5AQUA 1JLGA 3QLHA 3VEOA 2IVPA 3SUQA 4BR0A 4CF8A 1HNZK 4KH6A 1OH5A 4JK7A 3C65A 4CGJA 4NCBA 3UE5A 1IO2A 2AP1A 3P4IA 4M3WA 2E6MA 3ZT4A 3MX2A 2QK9A 5AZIA 1XHXA 2V52B 1SS6A 5M1PA 4A5BA 3NH1A 3TWHA 2HHQA 4FWRA 4B08A 4DTXA 1IKVA 3OS1A 4FJ7A 3AGRA 4CF9A 3CQ8A 3HVTA 2P5GA 3OBWA 4CEFA 3JXUA 1OH6A 4FWQA 3EZWA 3TAGA 4DV3K 1YJNN 4NLCA 3G6EN 2WC9A 1NGBA 3LP1A 1TK8A 1L5UA 4CGHA 3O9QA 2QXLA 3DXKA 3RMCA 4CFAA 4O44A 4OKKA 2BDPA 3C6AA 1RT4A 2CH6A 4XJXA 3WEEB 4WQ5A 4YHHK 3QDKA 2KFZA 3VQBA 3WNFA 1WAFA 4WQ4A 3ZSYA 2EHGA 4LFAK 2ZD1A 3NF6A 4CD1A 2OTJN 4O5FA 3BZCA 1RT3A 1DKGD 4YOWA 4YOYA 4OGCA 4BRDA 4LC9B 5KGWA 3LDSA 5BN8A 2D5RA 1ZBSA 3T19A 4NB4A 1F21A 3HT3A 4AM6A 4KB0A 4AM7A 3QNNA 3SCXA 3DLHA 3MCAB 2GBZA 4ISFA 3O3HA 2XY5A 4JHDB 4BRNA 5CYQA 1S5JA 3SYZA 2E6LA 4YOTA 3ENOA 4N56A 3QFPA 3KKSA 5C15A 4FJMA 2HHIA 4Z4HA 1HPMA 1YT3A 3VENA 5AQGA 4BQLA 3K5OA 2FSNA 4PKGA 1SL1A 1Z05A 1YF5L 1Q86O 3ZT1A 1BCOA 4IO8A 2FSKA 5GIPA 2P5OA 1HNXK 4FWLA 4E89A 1RDDA 4JI1K 3H1VX 2VG6A 4FXDA 2HSTA 1A5XA 5KPRA 1S3XA 3AAQA 4ISEA 1NK6A 1NJWA 2HBJA 1R59O 5BRFA 4E7KA 5AR0A 2E5LK 2F8SA 5BREA 4HWIA 1TAUA 4NYFA 1RT6A 1RGIA 4I2PA 3AA3A 1JLEA 4OVLA 1U45A 1NJZA 5MLCQ 3EO3A 3DI6A 4LF8K 4LH5A 3CPWM 1KFDA 1TUYA 3ZSWA 3SQ1A 4DR7K 1SUQA 3J81O 2P9LA 3KK3A 2PYLA 5I9EB 1C0FA 3CETA 3LP3A 3SAFA 2O8CA 2FC0A 3OYNA 3DRPA 4QS8A 4XH4A 4K0KK 1TVRA 4B9SA 1QSSA 1YXQA 3D7EO 5KRTA 1Q18A 2A40A 1UOCA 3CJBA 4I9LA 4IG0A 4HCCA 1A5WA 4KI6A 4JK8A 3K59A 1XMOK 4FLTA 4O8UA 4RTFD 2HVHA 4EFHA 4B1WB 3DLBA 2E88A 3O9TA 4BE1A 4B1YB 2ZGZA 3AO5A 2P9SB 2YNFA 4C1NK 2F96A 3ID8A 3K58A 3ALYA 3V6DA 3M6GA 2E1YA 4E7JA 4O0JA 1C1CA 3HJFA 4IWVA 1RILA 3E1YA 3FFKB 4KI4A 2HHTA 4M3ZA 3D2EB 2IGIA 3C94A 2A1SA 3C0BA 2G8IA 1HMVA 3SMPA 5SWMA 4YY3K 5HROA 4UY8O 3WNEA 3RRHA 2YNIA 4B3RK 4PL8A 3QEPA 4A59A 1VQ5N 1K8KA 2HNZA 3SUPA 3ID6A 3S3NA 3BF1A 3CJ1A 3VQ7A 1WOQA 4CIGA 1JLAA 3CM5A 4AHUA 2A42A 4NYNA 3L6QA 1WSIA 4ISGA 3ZEUB 4NLBA 4E1MA 4CZHA 5FPEA 3EKSA 2OPQA 3O9RA 4CEAA 4FSVA 4Y0WA 1RDUA 1RBSA 2FBTA 1T03A 4L8RB 5DM6L 4K25A 2HOEA 4CHOA 2D0OA 2D0BA 2IS3A 4BWMA 4OJRA 4H0PA 1WSFA 3R9PA 3DLGA 3HM8A 4R79A 2W41A 3SLCA 5AQLA 3NE6A 4KRFA 2NRWA 3VQ8A 2G8HA 3VF2A 2NZTA 1CXUA 2FF6A 3QO9A 3AVHA 5C12A 1BI4A 1TKDA 2D0PA 2ASMA 4FWNA 5ELZA 4FWSA 2OA8A 3SPYA 1U4BA 3TPQA 5BRDA 1RTDA 3O4NA 1R0AA 3R8EA 4U7BA 2YJFA 4AH9A 4BECA 2QA4N 4JK9A 2IAJA 3DYAA 4KPYA 4CJ4A 3THVA 4BE2A 1HKBA 4FW1A 2KZMA 3H1QA 3K5NA 1HRHA 4YOXA 1IKWA 3M5RA 2BUPA 4E72A 4B3SK 4FL9A 3V1QA 1JXEA 5JVGL 1Y64A 1C0MA 2UXCK 2YHAA 2VGNA 1JCFA 3QICA 5GAHP 4B9UA 1SV5A 1IBMK 2ETJA 4LFCK 4Z4IA 4CJVA 4DV2K 4W5OA 4J2EA 1P90A 4B8CA 4PKIA 2YKNA 4CHZA 1S1WA 5AQHA 1VQ7N 3QB0A 3TU5A 3FZMA 4FK4A 1KVCA 3ZT3A 1XHZA 3MEEA 4FJ8A 1SKWA 4XH5A 5EY4A 4KO0A 1NLVA 4BC5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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