3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/transport protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
3FZHA 4QS7A 4H5NA 5I9EB 3ENOA 5AQFA 2KHOA 2PBDA 3UKUA 5BPLA 1T44A 2QWLA 3LL3A 2A41A 5AQUA 1NGJA 4NB4A 2NLXA 3VGMA 2V7ZA 4AM6A 5EOYA 3MN7A 3A5OC 4I6MB 1LOTB 4M7XA 4A62A 4H0PA 3HTVA 2QWMA 4B1YB 1H1VA 1BO5O 2UYTA 2D0PA 3EKUA 5ADXH 1SZ2A 4RWTA 4BRFA 3AY9A 4MLEA 1BA1A 1GLFO 1NGAA 3L4IA 1CZAN 2ASPA 5BR9A 5AQSA 4CZLA 1R59O 1BA0A 3QBXA 4IWVA 5E84A 1GLDG 1BOTO 1U2VB 4KBOA 4CZIA 2V7YA 3D7EO 4FPBA 2D0OA 5AQZA 2CGLA 3DXMB 4FWLA 2HMPA 4BRKA 3GBTA 4BR9A 4JD2B 4O5FA 1X9JA 2P9LB 1ZXOA 3O8MA 5TKYA 4J8FA 1P8ZA 1QQMA 4BREA 3AAQA 4WQ4A 4CZKA 1YUWA 3IDHA 2Q1NA 2BUPA 3ZETB 1NGHA 3HSCA 2ZGZA 4PL8A 1V4TA 4BRAA 4HTLA 4EHTA 3CJ7A 3CJ9A 2D4WA 2GWJA 1MA9B 4ISFA 3KVGA 4CD1A 1T6DA 3H1VX 2QWOA 1NGCA 4M7YA 3R9PA 5AR0A 3OHRA 3LM2A 4PKGA 4YDUA 5BRDA 2GELA 4IXCA 1X3MA 1J6ZA 5KQDA 4BRLA 4BRMA 4B1UB 4WQ4C 3TPQA 4PKHA 1BUPA 1GLEG 3WUHA 2CGJA 4BGAA 2HF4A 4WQ5C 2Q0UA 3CJAA 3QFPA 3BEXA 2GTDA 3L0QA 3R6MA 3GOIA 4CZJA 5AQOA 1V4SA 3ENHA 3ATUA 4JN4A 5AQNA 4H03B 3M1FA 5BREA 3HI0A 5ADXA 1NGBA 4L3QA 1HPMA 4YDUC 4DCHA 3VEVA 3CERA 3GDQA 2P9NB 1ZC6A 1DKGD 4H0VB 4FWMA 5JLFA 3DXKB 3RSEB 4BVPA 2CGKA 1YAGA 1ATRA 4EFHA 1GLLO 5AQXA 1XUPO 5AQHA 5AZJB 3C7NA 3I33A 4BG8A 1GLCG 2V51B 1SQKA 1HKBA 4DB3A 1K8KB 3M6GA 3LDNA 4A61A 3H3NO 4H5VA 3LDPA 4WQ5A 4JD2A 4BROA 2P9IB 3FZKA 3A5NC 1KAZA 5JLHA 3ATVA 2NZTA 3VGKA 4MO4A 3TU5A 1QHAA 1GLAG 2F9WA 3VEZA 2E88A 3G25A 3WQTA 1GLBG 3KHYA 4BR0A 2D1KA 1G99A 2NRHA 2I7PA 4FWOA 3UKRB 2W40A 3VEYA 3J8AA 2AP1A 2FF6A 2VCPA 5BPMA 2E2QA 1HX1A 3O4WA 1QQNA 4FO0A 3O08A 2A3ZA 4BG9A 4BR7A 4C23A 1GLJO 3EL2A 3FE1A 2HOEA 2YJEA 5AZIA 3FZFA 2GUPA 1BG3A 1NMDA 4WYBA 1RGIA 5AQTA 4BQZA 5AQMA 1NBWA 5EXWA 3SK3A 4F9OA 1IG8A 4GY2B 4K25A 2ZWHA 2DPNA 4LC9B 3DXKA 3ID8A 5KPZA 3RSEA 2QM1A 2FSNA 2A6AA 5F1XA 3EN9A 3VERA 4HWIA 4ISGA 4PL7A 5BRFA 3HM8A 2IVPA 3O6WA 3H3OB 2A42A 5FPMA 1Q18A 5EX5A 4H0OA 3A0IX 3QBWA 5FPDA 3CQYA 4BC3A 4H5WA 5JICA 4EHUA 2P9LA 5AQWA 5AFUA 1OKJA 1NGFA 2AA4A 2FSJA 3FGUA 5AQLA 5AQKA 5F0XA 4JAXA 4JNEA 5CE3A 3D2FA 3FR0A 3FZMA 4CBWA 3DWLA 4H5RA 4BRDA 1JCGA 1NWKA 4B1VA 3O80A 2FLOA 3FZLA 4O8KA 3VF2A 3CQXA 3FLCO 3QFUA 4Z94A 3VEWA 3BUZB 3HZ6A 3U9ZA 3WXKA 2E8AA 3BF3A 3JS6A 1YVNA 5EVZA 1T6CA 3IMXA 4BR2A 5AZIB 4EIAA 4XH1A 2IIRA 1QZ6A 5B8HA 3H1QA 4FPAA 4BRGA 2QWRA 1MDUB 2ASOA 3FFKB 1NM1A 3D2EB 2FF3B 2W41A 4IO8A 2Q31A 4BC2A 4FWPA 1JCEA 3WEEB 4BR5A 3H6EA 5JMVA 5KPTA 3CETA 2YCHA 4MLHA 2OANA 2Q2RA 5EY4A 3A5MC 3VESA 3P4IA 3AARA 1NGIA 1NGGA 4CI6A 1XC3A 3I8BA 3DXMA 4A2BA 4PKIA 2A5XA 2E2PA 5AQPA 1NGDA 3CI5A 3SJHA 3O1BA 3ULEB 3D2FB 5AQRA 2P9NA 4BRCA 3H46O 1QQOA 5AQGA 4IZ9A 1SAZA 2Q97A 3HBTA 2ITMA 3ZX0A 5KQ8A 1Z05A 2YHWA 3U4LA 3DAWA 4DQ8A 4Y0WA 3D2EA 3O1WA 3CJCA 2WUSA 4CZMA 3W0LA 3CJBA 3WT0A 1S22A 4BRIA 4BRPA 5BPNA 4I6MA 4K43A 2F9TA 4GNIA 2A40A 3UKUB 1KAXA 4QS9A 5E26A 2HF3A 2J4RA 4CZEA 1RDWX 3MCPA 3CHWA 4JHDA 3WEEA 2VWBA 3U9DA 3H45C 3W3DA 4B1WB 4BVOA 1XQSC 1U2VA 3BF1A 2P9KA 2Q0RA 3UB5A 2GWKA 3VEOA 1S3XA 3ZEUA 2V52B 3S41A 1RFQA 3LDLA 4XH5A 1MWKA 3UKRA 1X3NA 2QWPA 1D4XA 3VEXA 3C0BA 3VGLA 2YI1A 3MN6A 2QW9A 3VENA 5BN8A 2BTFA 3A5LC 4CBUA 1TUYA 1TUUA 4A2AA 4B9QA 3VOVA 3MDQA 1U6ZA 1YXQA 2IVNA 5AQQA 2YHYA 4FWKA 3QMLA 4QS8A 2P9KB 4H5TA 4CD3A 5AQVA 3LM9A 3ZETA 4JHDB 2ZGYA 3MK6A 3A8YA 4CZGA 3MN5A 1NGEA 3LDQA 1TYQA 4FSVA 3EKSA 3WQUA 4MO5A 3JXUA 4CZFA 2QWNA 3WXJA 5AQIA 4NO7A 5LJVA 4XH4A 1HKCA 1Z6RA 1C0GA 3EZWA 2VYPA 3DJCA 3GE1A 3VETA 3VPZA 3LDOA 1HLUA 1DGKN 2E2NA 2P9UB 4H0XB 1QZ5A 2IVOA 4ISEA 2FSKA 3KZBA 4K42A 3MMVA 4XEIA 2H3GX 3SLCA 2QXLA 2YHXA 4CZHA 3O5BA 3VF4A 1C0FA 3IFRA 4FWNA 4BC4A 4H0TB 2P9PA 3EO3A 5KPRA 3AAPA 2ZF5O 4E1JA 2P9IA 4RTFD 3ZEUB 1BU6O 3B8AX 5AFUH 2PAVA 2Q36A 3BP8A 4RCHA 1HJOA 1LCUA 3QDKA 5FPEA 1E4FT 4BGBA 4BC5A 4BRQA 4BQLA 3UE5A 4BR4A 3F9MA 4FOIA 1KAYA 5LY3A 2CH5A 1Y64A 2P9SA 1E4GT 3QICA 2FXUA 3CIPA 3R8EA 1KXPA 5AZJA 4DHYA 3GG4A 3ZX3A 5FPNA 3MN9A 2CH6A 3WXIA 1TYQB 2YJFA 1HUXA 4BRNA 2P9SB 5AQJA 3IUCA 5ELZA 1K8KA 4FWQA 2E1ZA 5BN9A 4H0YB 4B1XB 1WOQA 3VF6A 3WXLA 5F2RA 2E1YA 2ASMA 4EAHD 3C7NB 2I7NA 3ULEA 1JCFA 3CJ1A 4K41A 5BRHA 1DEJA 1EQYA 3SMPA 3M3ZA 1ATSA 1IJJA 4FWRA 1MWMA 1BWFO 2E20A 4M63C 4FOEA 4FWSA 3QB0A 4CBXA 1NLVA 1ESVA 5AQYA 3U8XA 1WUAA 1ZBSA 2P9UA 2EWSA 4BRHA 2GEMA 2QWQA 1ATNA 2P9PB 5LJWA 3ZX2A 3GL1A 4IJNA 3L6QA 4IJAA 4B1ZA 4FL9A 2E2OA 4AM7A 1HKGA 1BDGA 3SMSA 4CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PSFA 4CEEA 4WFNL 2ATQA 3AO5A 3I0SA 1N8RO 3AA4A 4TSXA 5J2QA 1S1XA 4JKHA 2QWLA 2A41A 4Z4FA 3VGMA 2V7ZA 5FLXO 4HUGA 3SJJA 2D0PA 3MWTA 3K9KA 2FBTA 3EKUA 5ADXH 3MCAB 1SZ2A 2G8KA 4RG8A 4CEDA 4IOAL 5GINA 3K58A 4NYNA 1CZAN 3FFIA 1U47A 3OY9A 4IWVA 3G71N 3R3LA 1BOTO 1NK7A 1U2VB 4KBOA 3THYB 3D7EO 4Y1DA 2D0OA 3SPZA 2HMPA 5M1OA 4Z4IA 1U48A 4PA1A 4J2AA 1IO2A 4C8NA 4J8FA 1QQMA 2UUBK 3CMEN 4OX9K 5GAEP 1Y97A 4HTUA 4DTMA 5J1EA 4DF8A 4KFBA 3HSCA 1S6QA 4KRFA 3C6UA 2X74A 3IRXA 5IT9O 3P38A 3CJ7A 4CEZA 4EP5A 4KH5A 2D4WA 1MA9B 3KVGA 4DR3K 1WBBA 5AR0A 4OVLA 1KSPA 5KQDA 4KTWA 4BRMA 4B1UB 2GV9A 4IOXA 3PO5A 4BGAA 1LAWA 4WQ5C 2Q0UA 3C6HA 1HR0K 3ATUA 4JN4A 2P51A 1Q7YO 4A5AA 3LP0A 3E66A 3M1FA 3OBYA 3LP1A 4L3QA 3HJFA 1RTHA 1JLGA 1ZC6A 4FWMA 5J2MA 5DMRA 3VQAA 4HUFA 3M8PA 4CJ5A 4IBNA 1D8YA 2ZE2A 4FZZA 2W42A 2JLEA 1JXBA 4JI6K 1VK0A 1TK0A 3KK3A 2D5RA 4DV4K 2UXDK 3OYMA 4DB3A 1K8KB 5KRTA 4PQUA 1ILYA 2P1JA 4LSLA 3T1YK 4JD2A 4JK7A 3DLRA 1BIZA 3P5JA 3ATVA 4RW8A 4PY5A 3VGKA 2RE2A 3SBGA 1UAXA 4GVMA 3VEZA 3G25A 4DMNA 1IBLK 3CC2N 2NRHA 4JI1K 4FLYA 3R1XA 2XY5A 3H08A 2FF6A 2VCPA 3CG7A 4ELUA 2HB5A 3QEWA 1QQNA 4FO0A 5FDLA 3NH0A 2A3ZA 3G4SN 1QS4A 4BR7A 3OYEA 5K14A 4U7BA 3EL2A 3T1AA 2HOEA 3AVHA 4FW2A 4DSIA 3MEEA 5AZIA 5GAHP 1BG3A 1NMDA 1VHXA 4CJVA 3DLEA 1W0HA 1HYVA 3I55N 4FJJA 2RPIA 1L3TA 1YTAA 4W5QA 4DQIA 2ZWHA 2DPNA 1VSDA 1VQ5N 3ID8A 4RW9A 1GOAA 3KKRA 1RNHA 3L2UA 4LSNA 1O13A 2YNIA 3RRHA 1VQLN 1C1AA 1L3UA 1VAZA 4FVMA 1UA0A 5EX5A 3PIOL 3A0IX 4BC3A 2ZJQL 1NJIO 4FM2A 2P9LA 5LMUK 5JS1A 5AQKA 3PX4A 2WFBA 4JAXA 3D2FA 3DWLA 3QETA 3AGRA 1T05A 4DQQA 2D0CA 3NF6A 1DT9A 3HZ6A 2E8AA 3HVTA 3JS6A 1YVNA 1T6CA 4XH1A 3T69A 2Q3SA 1VQ6N 2IIRA 4DG1A 1QZ6A 4WCEL 2KW4A 3EE8A 2PZSA 4N76A 2WBNA 4E72A 3OYJA 5GIPA 4IEEA 2E6LA 1Q9YA 3G10A 4FJ8A 3SYZA 1NJXA 3D45A 1J53A 2E4LA 2OANA 1IBKK 1HRHA 3P4IA 3AARA 3LAMA 5CZ1A 3K5LA 4LY7A 3TR8A 3I8BA 4N41A 4W5TA 3O1BA 4CHYA 4N5SA 4FJKA 5AQRA 4J2EA 2P9NA 4G1QA 3H46O 3RR7A 4BDZA 2Y1IA 2Q97A 3HBTA 4KREA 1D9DA 4Y0WA 3D2EA 3RVCA 2HNDA 3ZT0A 3I56N 4GKKK 5BPNA 1ZBFA 4K43A 1DLOA 2OCEA 3ZT3A 4GNIA 4KHSA 1B92A 1KAXA 4QS9A 4FK4A 2O8EB 3MCPA 3U9DA 1KQSM 2F96A 1ZBLA 3V9XA 4MDAA 3W3DA 3HVRA 3EYZA 1XQSC 5JVHL 1U2VA 2OPQA 5KGWA 2VWJA 3ZEUA 1NK8A 4AQYK 2WONA 1RFQA 1Q81O 4XH5A 1MWKA 1X3NA 4I9LA 3SNNA 1D4XA 1L3SA 4DUYK 1CZBA 1T03A 3M8RA 5LMNK 3A5LC 4B9TA 1TUYA 4CIGA 3CC4N 2WC9A 2W6KA 2ZD1A 3VOVA 1HNZK 4FWKA 5C12A 3NH1A 4JEPA 2P9KB 2OTLN 4CVNE 2ZJPL 1T7PA 1C6VA 4BY9C 3AVBA 4JHDB 3NGZA 2ZM6K 3MK6A 4I2PA 4KO0A 3A8YA 3THVA 3MN5A 3TAEA 4FSVA 4KAZA 4C1NK 4CEFA 3JXUA 4KI4A 1BI4B 1VQ9N 1XMQK 4JI8K 1O1WA 1Z6RA 1HYSA 4JK9A 3DJCA 2YNFA 2VG7A 2IDOA 3LDOA 1DGKN 2E2NA 2P9UB 3VQPA 4OPKA 4BWJA 2VQEK 3KZBA 2QXLA 2YHXA 1LV5A 3O5BA 1TL3A 3VF4A 1C0FA 1DTQA 3AVJA 3IFRA 2ZJRL 3QIOA 4LFBK 3AVNA 3KLFA 2P9IA 2OPPA 1BU6O 3B8AX 3K5MA 3ZT1A 4YORA 3OYDA 1NJWA 4RCHA 1K73O 3QNNA 2D0BA 5FPEA 5HL7L 1QSLA 4O4GA 4YOUA 4X65K 4NLCA 4FOIA 3KLHA 1KAYA 4IDHA 1JLQA 4M45A 4CCHA 3Q7CA 3MXMA 1E4GT 4DLEA 1RBTA 1VSFA 3CIPA 4OO1J 5AZJA 2NRWA 3ZX3A 1HPZA 4DR1K 3HPHA 3MN9A 4C8MA 3WXIA 2YJFA 4DSKA 1IKYA 5I3UA 4PHTX 3OS0A 3TAGA 3PX6A 3ULDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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