3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/transport protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
4MLEA 3VENA 4QS9A 3SLCA 4H5VA 3SJHA 1QZ6A 3LL3A 3HBTA 4BC4A 4A62A 1YAGA 4WQ4C 4A61A 2HF4A 2Q36A 5AFUH 2F9WA 3A8YA 5AZJA 5CE3A 3L4IA 1KAXA 2FSKA 5EOYA 3WEEB 4WQ4A 3LM9A 4BRDA 4C23A 4GNIA 3O1WA 3C7NA 4IWVA 3H6EA 3ZETA 4MLHA 2I7PA 1DKGD 1BUPA 5BRFA 3QB0A 3MCPA 1ZC6A 2F9TA 2P9NB 3RSEA 3QBXA 4CBWA 3A5MC 3EN9A 3FZLA 3H1VX 2Q0RA 5AQGA 1RGIA 4FWLA 3ATUA 4BRHA 3TPQA 4BR9A 3S41A 4AM7A 5F2RA 1NGDA 2YCHA 5AQUA 1XC3A 5TKYA 1S22A 2FF3B 2YJEA 3WQTA 4A2AA 1TYQA 1MWKA 2VYPA 1E4GT 3VERA 4IZ9A 3WXJA 2QWMA 4BROA 4BRGA 1X3MA 1T6CA 4M7XA 4FPAA 3D2EB 3QMLA 4B1VA 2ZWHA 3WUHA 4XH5A 2A6AA 3CJ1A 3MN6A 2E8AA 5AQMA 3GDQA 4CZGA 5E84A 3DXKA 2FSJA 3AARA 3CETA 3FE1A 4BVPA 2Q1NA 4EHUA 2V7YA 4DCHA 2UYTA 2QWLA 4BRCA 2E2PA 3ZX3A 2W41A 4CZKA 5BPNA 1SZ2A 2CGLA 1NM1A 4H0OA 2P9LA 3GBTA 4B1ZA 5AQRA 3DXMA 1K8KB 3H45C 2J4RA 2W40A 4B1YB 1NGHA 4BQLA 2NRHA 2GEMA 3MDQA 2GWJA 1C0FA 1BDGA 3FZHA 5FPEA 1T44A 2FLOA 1X9JA 3VGKA 1QHAA 3UKUB 2CGKA 1QQMA 1V4SA 3HZ6A 4PL8A 4M63C 3O8MA 4CZLA 2FSNA 3GOIA 4RCHA 1QZ5A 5JLFA 2QWQA 4XEIA 3H1QA 3JXUA 2ASPA 5AQFA 4CBXA 5AQIA 4BRKA 1NGEA 4MO4A 4DQ8A 5AZIA 4BGAA 4YDUA 1YUWA 2Q31A 2YHWA 1NGJA 3FFKB 4BR4A 2AP1A 3UKRB 3D2FA 1GLDG 3B8AX 3HTVA 4BR5A 5LJVA 1QQNA 1MWMA 4JHDB 3MN5A 3D7EO 3WXKA 2OANA 2Q2RA 4BRIA 4BVOA 1C0GA 4BRLA 2WUSA 4H03B 3VEYA 3A5NC 4JAXA 1E4FT 4ISGA 1YXQA 1SAZA 3R6MA 4XH4A 4CZIA 1GLJO 2E20A 4FWKA 4HTLA 3CJBA 1Z6RA 4B9QA 2YHXA 2D0PA 3QDKA 1U2VB 1HUXA 3A5OC 4CI6A 1DEJA 5AQVA 4FWNA 3VPZA 2YI1A 1LOTB 4FWQA 4BRNA 3CQXA 1XUPO 2QWPA 1NGFA 3VF6A 5LY3A 2ZF5O 2E2QA 4B1WB 4KBOA 1CZAN 5JLHA 3WXLA 1GLAG 3ENHA 1NGBA 3WEEA 4FO0A 5BRHA 2GELA 2ZGZA 1OKJA 2IIRA 5BRDA 2QW9A 3R9PA 2ASMA 3MMVA 1TUUA 5AQSA 5AQXA 3IMXA 3U8XA 1MA9B 3CQYA 3OHRA 2NZTA 3MN7A 2P9NA 3LDQA 1NWKA 3HI0A 1DGKN 2P9PB 4EAHD 1SQKA 3VF4A 3O80A 4FSVA 5AQJA 1RDWX 3WT0A 4FWMA 5AZJB 5EXWA 2P9SB 1ATRA 4BRQA 1R59O 1HKBA 4K43A 2HF3A 4FWOA 3R8EA 4GY2B 3EKUA 1ZBSA 5AQPA 1ZXOA 3ZEUB 4WQ5C 3GE1A 1NGIA 3IDHA 4K25A 1BOTO 3GL1A 2P9UB 4I6MA 4ISFA 3VEXA 4BC3A 4CJ7A 5ADXH 3I33A 1YVNA 2D4WA 4WQ5A 4K41A 3VEWA 3M6GA 4H5TA 4EIAA 3M1FA 4B1UB 2E2OA 4BG8A 3CHWA 2A40A 4JD2B 3EKSA 3D2EA 1HLUA 2D1KA 4H0YB 1LCUA 3LM2A 3AAPA 2P9KB 4PKGA 3EZWA 2FXUA 5AQTA 5KQDA 3G25A 5AQZA 5F0XA 4H5NA 2E2NA 5BPMA 5BPLA 4PL7A 2ASOA 2A3ZA 1RFQA 3SMPA 2Q97A 4IO8A 3QICA 1MDUB 4H0VB 5EVZA 3TU5A 3P4IA 4RWTA 4A2BA 1D4XA 5I9EB 1HKGA 3EL2A 1K8KA 5E26A 3ID8A 3WXIA 3SMSA 2KHOA 5AQYA 3FZFA 1GLFO 4BREA 1S3XA 3UKUA 2E88A 3LDNA 3O5BA 1NGAA 4BRAA 1BG3A 4YDUC 1HKCA 1KXPA 3GG4A 4IXCA 1TUYA 4AM6A 2ZGYA 4M7YA 1GLEG 4DB3A 2CH5A 3L0QA 4NO7A 1JCFA 3VOVA 2A41A 1KAZA 3BF1A 1KAYA 1IJJA 1ESVA 1GLBG 4JHDA 4H0XB 3FR0A 4BRPA 4NB4A 2V51B 5JMVA 4BG9A 2Q0UA 2QM1A 3QFUA 5ADXA 1H1VA 2IVOA 5AQLA 1U6ZA 1J6ZA 2QXLA 4FWSA 5AZIB 1NBWA 1GLLO 5B8HA 3SK3A 2P9IB 1U2VA 3FGUA 3U9ZA 1QQOA 5AQKA 5BN8A 2VCPA 3H46O 3D2FB 4CD3A 3FZMA 3ATVA 3QBWA 5KPZA 2CH6A 5EX5A 5AQWA 5AQHA 2A5XA 3UB5A 4FPBA 4O8KA 3BF3A 3ULEB 1EQYA 3ZX2A 1NMDA 4CBUA 5FPDA 1GLCG 2AA4A 4H5WA 4K42A 4H0TB 3UE5A 5KQ8A 4L3QA 3VGMA 3CJ9A 3O1BA 4HWIA 2QWRA 5KPRA 3HSCA 1BU6O 3VEOA 4RTFD 3BUZB 2P9PA 3VESA 4WYBA 5FPNA 4ISEA 2DPNA 2IVNA 5AQOA 2YHYA 2P9SA 5FPMA 3VGLA 5AQNA 1WUAA 2ITMA 1ATNA 1Q18A 3AAQA 3CI5A 4BC5A 3IFRA 2I7NA 3U9DA 4F9OA 3FLCO 3C7NB 2GTDA 3ZEUA 3KZBA 2NLXA 3ZETB 4JNEA 2QWNA 2P9UA 4XH1A 3CIPA 2V7ZA 3CJ7A 3RSEB 3A5LC 3WQUA 4PKIA 3VEVA 4BR2A 1JCGA 1XQSC 5BR9A 4FOIA 5AR0A 2V52B 3W3DA 2CGJA 1JCEA 2YJFA 4JD2A 5EY4A 4QS7A 3W0LA 4PKHA 3H3OB 3DJCA 2P9KA 4FWPA 3KHYA 2A42A 5AQQA 4JN4A 3AY9A 4I6MB 2GWKA 1TYQB 4EFHA 3EO3A 2H3GX 3C0BA 3MN9A 4FWRA 4J8FA 4IJNA 3O6WA 3HM8A 3LDPA 2E1ZA 1HPMA 4H5RA 3VF2A 4CZMA 4CZJA 4BC2A 2E1YA 3CJAA 4EHTA 4CD1A 4CZFA 4B1XB 3J8AA 5F1XA 3MK6A 4BQZA 3IUCA 4FOEA 3F9MA 3BEXA 4IJAA 5ELZA 1NLVA 2IVPA 2PAVA 4BR7A 3BP8A 3DXKB 4BRFA 3JS6A 1X3NA 3CJCA 5KPTA 3KVGA 1ATSA 1IG8A 3H3NO 3I8BA 4H0PA 4FL9A 2BUPA 2HMPA 1Y64A 3LDLA 4MO5A 1HJOA 5AFUA 1NGGA 2P9LB 4BGBA 2QWOA 3DXMB 2EWSA 4Y0WA 3O08A 3DAWA 3ZX0A 3UKRA 2GUPA 3A0IX 3QFPA 3L6QA 3VETA 3DWLA 1BA0A 3LDOA 2BTFA 2D0OA 1HX1A 5JICA 1BWFO 4CZEA 5LJWA 4LC9B 2FF6A 2P9IA 1BA1A 4DHYA 5BREA 4O5FA 4E1JA 1NGCA 3CERA 3O4WA 3U4LA 2PBDA 4Z94A 2HOEA 1T6DA 3FZKA 1Z05A 2VWBA 3M3ZA 3VEZA 4BRMA 4CZHA 3ULEA 4QS8A 1V4TA 1G99A 3ENOA 1P8ZA 4BR0A 1WOQA 5BN9A 1BO5O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MLEA 3HSTB 1QZ6A 1RT1A 1S9EA 4CK1A 2HBLA 1RNHA 4A61A 3ZSOA 4N47A 3A8YA 5CE3A 3P5JA 1LWEA 2FSKA 3NCIA 3J7AP 3QEXA 1W9HA 1YF5L 3OYFA 4M41A 1WLJA 2YNGA 2HNYA 4ID5A 3C7NA 1ZBLA 3RMAA 1I94K 4MLHA 4F4KA 4KPYA 4M3UA 2F9TA 3RSEA 4JI0K 3EN9A 3E1YA 2HVHA 1N6QA 3AO5A 1QE1A 3ISNC 1OVYA 4JEPA 4BRHA 4BR9A 1CZBA 1X9MA 3S41A 3KK1A 4FJKA 1RDBA 2FF3B 3BZCA 3WQTA 1TYQA 3PLAA 4M3TA 3V9XA 1RDDA 3AO4A 4NCGA 1E4GT 2HHQA 4IZ9A 4IEEA 2F96A 1A5WA 4LH4A 4HCBA 1HJRA 4ILHA 4FPAA 3ZSYA 3V9WA 3LANA 3IRXA 4B1VA 2F7TA 1KVBA 1P90A 3WUHA 4KH5A 2Z1IA 4XH5A 4CK2A 4KI4A 3CYGA 2FSJA 4FLZA 1IKVA 3CETA 4EHUA 1C1AA 4BRCA 1HYVA 2X6NA 4B08A 3ZX3A 5BPNA 1SZ2A 1JLBA 2P9LA 1BI4B 1LW2A 3HPOA 3H45C 1YTUA 2W40A 1K9MO 4B1YB 2JWLA 3QEVA 4ILJA 1C0FA 3FZHA 1T44A 3C6TA 3SZ2A 3VGKA 4ZTJA 4Z4CA 1TGOA 2CGKA 4O4GA 3HZ6A 4DUYK 3SPZA 5JLFA 4RW6A 2PFUA 1LAWA 3H1QA 4IKFA 5GINA 4BRKA 4BGAA 3HP9A 4C8KA 3HVTA 2Q31A 1VQ4N 2OPQA 1T7PA 2AP1A 3NH1A 1HPZA 3D2FA 4FJ7A 4W5TA 3OBWA 1GLDG 3CM6A 1TK8A 3HTVA 4BR5A 1QQNA 3D7EO 3WXKA 4JKDA 1T03A 2X78A 1C0GA 4B3RK 4BWJA 3VEYA 1E4FT 5JVHL 4ISGA 1YXQA 1SAZA 1C0TA 2HHHK 3OYLA 4CZIA 4M3RA 2QK9A 4FWKA 2NRRA 3MX5A 3CJBA 3DI6A 4B9QA 3NH0A 1HUXA 3A5OC 5DK5A 4LF7K 3AVGA 3OBYA 3OYCA 1D5AA 2X74A 4W5OA 2FBVA 4BRNA 1XI1A 2QWPA 2YNHA 2E2QA 1CZAN 3ZSRA 5JLHA 3EZ5A 4DR2K 1GLAG 4FJXA 4JRPA 3SQ4A 4DV7K 4H4MA 2P5GA 2XRIA 3DLGA 3O9TA 1VSFA 2ASMA 3OS0A 5AQSA 5AQXA 3VQCA 3OHRA 4IEIA 4Z4HA 3MN7A 4ILGB 2P9NA 3LDQA 2P9PB 2KQ2A 1N34K 3O4QA 3QEIA 5KTQA 5AQJA 1KLNA 4CERA 4BDYA 3T1AA 1YJWN 2X6SA 5SZTA 4BWMA 3NVKA 2HBKA 5AQPA 2F8TA 4FM0A 4C1NI 1D9FA 3TSUA 4FJIA 1N36K 4CJ7A 3VEXA 3AVLA 1RBRA 5HOOA 2BE2A 4E3SA 3I33A 4GV3A 3ZSQA 2D4WA 3L3UA 4IFVA 3VEWA 4FJGA 1N32K 1LV5A 1RT2A 2OPRA 3ITHA 4W5QA 3CHWA 4WE1A 3DRRA 3ZYYX 4IFEA 4JLHA 2P5OA 2D1KA 4Y1CA 4YY3K 3OJSA 3LM2A 4GKJK 3AAPA 3EZWA 5KQDA 2Z1HA 3O9SA 4H5NA 4QOZB 2E2NA 3ASMA 4AHSA 1TL1A 4H4OA 3HYFA 3OJUA 5M1FA 2YNFA 3M8PA 4UY8O 3B6PA 3SUOA 4RWTA 4CFCA 4E89A 1VQNN 1Q81O 3EL2A 4Q5VA 5MLCQ 5E26A 4XJXA 2IC3A 4I2PA 2O4GA 2HNDA 1KTQA 1GLFO 3TAFA 1S3XA 3UKUA 2E88A 4N41A 4E7HA 1HNZK 4BRAA 4FYDA 4DTUA 3CQ8A 4YDUC 1HKCA 2IAJA 1TUYA 4C8LA 4M7YA 4LF5K 4DV1K 3VQEA 1EWRA 4IO9L 4NO7A 3K2PA 4WFAL 3D45A 3BF1A 4X65K 1SL1A 4F3TA 1EETA 4BECA 3QINA 3BZKA 4EP5A 4IOAL 3SQ2A 1H1VA 5AQLA 3F9KA 4KAZA 1U6ZA 4Q0BA 4OKEA 3SAFA 4FWSA 3QESA 4IFYA 2KLAA 1QQOA 4DU4A 5M1PA 4FJHA 3PO4A 4CD3A 3FZMA 3KK3A 3ATVA 3QBWA 2HHXA 3ZSZA 5AQWA 2A5XA 3UB5A 3ULEB 3I8DA 2RKIA 3VQQA 3F5TA 4CBUA 5FPDA 1GLCG 4CIGA 4K42A 1IKXA 3UE5A 3C6HA 3T69A 3VGMA 3THWA 3KLGA 5HRPA 3O1BA 2HBJA 3CXCM 4KRFA 3VEOA 1SKSA 2ETJA 3NF6A 3ENBA 3MXIA 4CJTA 3CC7N 4Z0UA 1HNWK 2XY6A 5C2DA 4JI8K 4B9SA 2QA4N 1WUAA 1Q18A 4BC5A 1HNVA 3CI5A 3IFRA 3AVKA 3U9DA 1BIZA 4E1NA 4IDHA 3C7NB 1LAVA 1HNXK 2GTDA 3ZEUA 2WBNA 1UOCA 3OYAA 3CIPA 3RSEB 1B9FA 1XHXA 1KFSA 5E41A 3F2KA 2BDPA 3L2QA 5BR9A 1RBUA 2DFEA 4FVUA 5GIPA 2CGJA 2XY5A 5EY4A 1QSYA 4AF1A 3J7YP 2GV9A 4PKHA 4CJWA 5J1EA 4DQSA 4AHTA 2P9KA 2KW4A 4OLAA 2Z1GA 4CJKA 4JN4A 3AY9A 4I6MB 2P51A 3IS9A 1TYQB 2WFBA 2H3GX 3C0BA 3MN9A 4FWRA 1L5UA 4IJNA 4Z4GA 4FZZA 5KI6A 1BGXT 3AO1A 4B9LA 2UXCK 3L2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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