3H6EA

The crystal structure of a carbohydrate kinase from novosphingobium aromaticivorans
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
462
structure length
458
Chain Sequence
TIVIDLGKTLSKVSLWDLDGRMLDRQVRPSIPLEIDGIRRLDAPDTGRWLLDVLSRYADHPVTTIVPVGHGAGIAALTDGRLAFPPLDYEQSIPEAVMADYRSQRDPFARTGSPALPDGLNIGSQLWWLDQLHPDVMANATLLPWAQYWAWFLTGRAVSEVTSLGCHSDLWDPQDGDFSPMAKRLGWAARFAPIVRAGDTVGALLPAIAERTGLSPDVQVLAGLHDSNAALLAARGFAEIADNEATVLSTGTWFIAMRLPATPVDTATLPEARDCLVNVDVHGRPVPSARFMGGREIETLIEIDTRRVDIKPDQPALLAAVPEVLRHGRMILPTLMRGFGPYPHGRFAWINRPEDWFERRAAACLYAALVADTALDLIGSTGRILVEGRFAEADVFVRALASLRPDCAVYTANAHNDVSFGALRLIDPGLRPQGELVRIEPLDTDLDTYRNRWQAEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Carbohydrate kinase, FGGY
publication title The crystal structure of carbohydrate kinase from Novosphingobium aromaticivorans
rcsb
source organism Novosphingobium aromaticivorans
total genus 122
structure length 458
sequence length 462
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h6eA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h6eA03
2F9TA 4F9OA 1RFQA 4BRLA 5JICA 3GBTA 3CQXA 2ASOA 1YXQA 1NGHA 1V4TA 3BF1A 5JMVA 4IJAA 2P9IB 3DXMB 1NWKA 2HOEA 1YUWA 1TYQA 2Q0UA 1NGEA 2E2PA 4BREA 4CBXA 4ISGA 3O08A 4DB3A 2V52B 3MK6A 4A61A 4O5FA 5AQIA 2YI1A 4MLEA 3A5OC 4A2BA 4BRQA 1HJOA 2P9KB 1GLCG 2GELA 1MWKA 3L6QA 2HF3A 3RSEA 5B8HA 3VGMA 4M63C 4K41A 4BR2A 2PAVA 3CJ9A 3MDQA 1TYQB 1Q18A 2P9UA 4J8FA 2VWBA 3HM8A 4PKIA 2QXLA 4FPAA 1MA9B 3VEZA 3B8AX 4FOIA 4BRKA 1U6ZA 1ATRA 3FR0A 3CJCA 1HPMA 3ZETA 1BA1A 1LOTB 2V7YA 4IWVA 5AQHA 1Z6RA 2P9UB 3BUZB 2FSJA 1ESVA 5BPMA 1WOQA 1J6ZA 4CJ7A 5ADXA 4XH5A 1H1VA 2BUPA 1NGAA 4K42A 4B1WB 1IJJA 1BA0A 5FPEA 3U9DA 2ASMA 3M3ZA 5BN8A 3EZWA 4H5TA 3O1BA 4RWTA 1SQKA 3LDLA 3O5BA 3VF2A 5ELZA 5AQUA 4BVPA 3ATUA 4FWPA 2QWLA 4NB4A 5BREA 3ENOA 4QS9A 5AQSA 1X3NA 1KAZA 4NO7A 3VF4A 1QQMA 3FZLA 2P9LA 1GLLO 4BR4A 4CBUA 1ATNA 3GDQA 3M6GA 3SLCA 3HBTA 4B1YB 1YAGA 3SMPA 2I7NA 4CZKA 3LM2A 5BPLA 2GTDA 3F9MA 3O4WA 1HLUA 3QMLA 3EKSA 2FSKA 3IMXA 2D4WA 4A62A 3MN7A 2A3ZA 4FPBA 3VOVA 1NGBA 2HF4A 3HTVA 2QM1A 3L4IA 5AZIB 3KZBA 3HZ6A 5AQJA 1G99A 3D2EB 3WQTA 3WXIA 4H5VA 3DXKA 3M1FA 4AM7A 3G25A 1Y64A 1U2VA 2AA4A 3H45C 1BUPA 3ZX3A 5AZJA 2NRHA 3LDNA 4JHDB 4B1XB 5FPDA 3H3NO 3UKUA 2A5XA 4CZIA 2P9PA 3CETA 1QQOA 3CJ1A 4IXCA 4BRIA 3DXMA 2VYPA 1SZ2A 4BRCA 5AZJB 2YJFA 4KBOA 3I33A 3FZKA 3VF6A 3UKUB 2CH5A 3FZMA 2P9PB 2P9KA 3LDQA 5AR0A 4AM6A 3EN9A 3DAWA 5AQLA 2Q0RA 2ITMA 2DPNA 5TKYA 2OANA 4FWOA 4BROA 3VESA 3P4IA 1GLFO 1V4SA 1K8KA 5AQGA 3ULEB 2E2OA 4PL8A 4EFHA 1GLEG 5EOYA 4PKHA 3AAQA 5AQOA 1KXPA 3O6WA 3ZX0A 5AFUH 1X3MA 3BF3A 3ZX2A 3MN9A 4PKGA 4GY2B 4RCHA 3VEYA 4B9QA 4E1JA 3O1WA 4BQLA 4EIAA 4BRHA 3DWLA 5FPNA 4FWKA 3VENA 3I8BA 2YHXA 1K8KB 1GLJO 2ZWHA 2QWPA 1Z05A 4M7YA 5LY3A 3C0BA 2P9SB 3J8AA 1JCFA 2A41A 1X9JA 1NLVA 2CGKA 3FZHA 1ZC6A 4PL7A 2H3GX 2YHWA 3QBXA 5AQMA 5AQPA 1XC3A 1T6CA 2E1ZA 3A5MC 3GL1A 3VGLA 4K43A 2A42A 3EKUA 5AQRA 1NGIA 3JXUA 5KQ8A 3SMSA 5EY4A 3GG4A 3H6EA 2V51B 4ISFA 1BO5O 4DHYA 3D7EO 1XUPO 2P9NA 4BR9A 2GEMA 3AY9A 5F2RA 4FWRA 4QS7A 3LDPA 4FO0A 5AQZA 4MO4A 4IZ9A 3H3OB 3WT0A 5AFUA 3CIPA 4LC9B 1DKGD 3IFRA 4BRPA 4H5NA 4CBWA 4CZMA 2FSNA 3CHWA 2Q97A 5EVZA 3C7NA 2GWJA 2P9NB 3WQUA 2YCHA 2GWKA 3CJBA 4H0TB 2J4RA 2QWNA 2QWQA 5AZIA 4BRGA 1SAZA 3D2EA 4FWSA 3A8YA 5AQNA 3VEXA 1P8ZA 2E20A 3C7NB 1GLAG 4H0VB 3MCPA 4FWMA 2E88A 3MMVA 3A0IX 2IVNA 4FWLA 4JHDA 1HX1A 4HWIA 5EX5A 4XEIA 4MLHA 5AQTA 3AAPA 4H0PA 2QWRA 1S22A 4BC5A 2QWMA 4QS8A 5FPMA 3VEOA 5JLHA 1NGDA 4EHTA 3CI5A 5BN9A 3GE1A 1C0FA 3TPQA 3FFKB 3ID8A 4I6MB 3ZEUB 5AQVA 4CZLA 3BP8A 5JLFA 1NBWA 2YJEA 4JD2B 2I7PA 3WUHA 1NMDA 3SK3A 4BC3A 4FSVA 5E26A 1KAYA 3GOIA 2Q1NA 2WUSA 5AQWA 2IIRA 3QFPA 1IG8A 3ULEA 3VETA 3CQYA 1BDGA 1HKCA 1T6DA 5AQYA 3R9PA 3LDOA 1CZAN 3H1VX 4FOEA 4WQ5A 4WYBA 4CI6A 1TUUA 3WXKA 5LJVA 5E84A 4BQZA 4H5RA 3W0LA 1NGJA 4CD1A 2NZTA 3AARA 2CGLA 4EAHD 4K25A 3BEXA 2CGJA 3FE1A 3A5NC 4BGBA 4XH4A 3JS6A 2E2NA 2P9SA 2A6AA 3UE5A 2ZF5O 3HI0A 1KAXA 4JAXA 2QWOA 2KHOA 4FWQA 3IDHA 3VEWA 4BVOA 5ADXH 3ENHA 2FXUA 5KPZA 1NGGA 1RGIA 4BGAA 4MO5A 3EL2A 2D0PA 3UKRA 2E1YA 1LCUA 2BTFA 2D0OA 4XH1A 4CD3A 3DJCA 1NM1A 4CZEA 3QB0A 4BR5A 3QBWA 1ATSA 1WUAA 4O8KA 2EWSA 2FLOA 3UKRB 3IUCA 4BC4A 2W41A 2E8AA 5I9EB 2E2QA 2HMPA 3FLCO 2PBDA 2Q31A 3U4LA 1TUYA 1OKJA 1BG3A 2FF3B 3H1QA 3HSCA 3KHYA 2ZGYA 1ZXOA 2YHYA 3QICA 2Q36A 3RSEB 4RTFD 4C23A 4FWNA 3WEEA 4HTLA 3S41A 1QZ6A 4Z94A 3FZFA 3VERA 1HKBA 3WXJA 2UYTA 1XQSC 2CH6A 3H46O 1T44A 1R59O 4A2AA 3OHRA 4L3QA 1HUXA 4BRNA 1C0GA 3CJ7A 3QDKA 3ZETB 1QHAA 3WEEB 2F9WA 3U8XA 4B1VA 5BR9A 1DEJA 1BWFO 3VPZA 5KQDA 3SJHA 3R6MA 1GLBG 3FGUA 4BR7A 1EQYA 4YDUC 1JCEA 2A40A 4CZHA 4H0OA 4B1UB 5KPTA 5LJWA 3MN6A 3UB5A 4BRDA 4DCHA 1MWMA 1HKGA 4I6MA 2FF6A 2IVOA 3ZEUA 5AQQA 1BU6O 4JD2A 4H0XB 4M7XA 3CJAA 1D4XA 5F0XA 2Q2RA 1E4FT 1QZ5A 2VCPA 2W40A 4JN4A 4YDUA 2IVPA 4DQ8A 2NLXA 2AP1A 3A5LC 1S3XA 2P9LB 5AQFA 2QW9A 5BRHA 1YVNA 3VGKA 4WQ4C 1GLDG 3KVGA 4GNIA 4ISEA 1QQNA 4WQ5C 1DGKN 3D2FA 4BG8A 3WXLA 5BRFA 4H0YB 5CE3A 3L0QA 4BR0A 2ASPA 3EO3A 3W3DA 1JCGA 4B1ZA 4BRMA 4FL9A 3O80A 4JNEA 1RDWX 2ZGZA 5KPRA 4BRAA 4CZJA 4BRFA 3LL3A 4CZGA 5EXWA 1BOTO 5AQXA 4EHUA 5F1XA 1ZBSA 3ATVA 2GUPA 4WQ4A 3D2FB 1E4GT 4IO8A 3R8EA 3LM9A 4BC2A 2D1KA 3CERA 5AQKA 4H5WA 4Y0WA 3DXKB 1NGCA 4IJNA 3VEVA 2V7ZA 2P9IA 1MDUB 1NGFA 3TU5A 3O8MA 1U2VB 5BRDA 3U9ZA 4CZFA 3QFUA 4BG9A 5BPNA 4H03B 3MN5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F9OA 1RFQA 4BRLA 5JICA 3CQXA 1V4TA 3BF1A 4IJAA 2P9IB 2HOEA 5M1NA 4DU1A 4BREA 2KQ2A 3SNNA 2V52B 3VTHA 1L3TA 4CHPA 4PA1A 1RCHA 3HT3A 3NMUA 1IKXA 2GELA 2KFNA 4JRPA 2YNIA 1NK7A 4M63C 4K41A 3V81A 4FJGA 1TYQB 1Q18A 3U3GA 4CHQA 3HM8A 4F2SA 4G1QA 4KI6A 3K5MA 3B8AX 4FOIA 4BRKA 1TAQA 1JJ2M 1O1WA 1VQNN 3K2PA 3OBWA 3AVBA 1HPMA 1BA1A 1LOTB 3VQCA 1LAWA 3HO1A 3NDKA 1ESVA 5CYQA 1J6ZA 1WN7A 5JS2A 5ADXA 1B92A 3K5OA 4B3OA 3MAQA 2O4IA 4B1WB 4CGJA 1IJJA 5DK5A 5FPEA 5J2MA 3V9WA 3OJSA 2ASMA 3AVAA 3M3ZA 3EZWA 3P39A 1SQKA 1EWRA 1KC8O 4M41A 5ELZA 4WE1A 1T7PA 1IBMK 5J2NA 1LAVA 4JRQA 2QWLA 5BREA 4QS9A 1YITN 3E66A 1A5XA 5LL6Z 1HNIA 2ZE2A 1JL1A 1GLLO 2P9LA 2VWKA 3GDQA 5CR4A 1IBKK 2NNWA 1HRHA 1HMVA 4CZKA 3TABA 2HHHK 5BPLA 4NCBA 3O9SA 4NLBA 3KIOA 4Z4FA 1HPZA 4KTQA 5J1EA 3IMXA 4A62A 3K58A 1S1VA 3VOVA 1NGBA 3HTVA 1RTJA 2ETJA 1GOAA 2RHKA 1KLNA 4FK0A 2YX6A 5AQJA 2YV0X 3WQTA 5HLFA 3WXIA 2W6LA 1KVAA 3D6RA 1TK0A 2HHUA 3L2UA 4N47A 5KTQA 1U2VA 4LFBK 2P5OA 5AZJA 3MECA 4DFMA 3UKUA 2ZD1A 5CHIA 1EO1A 1IKWA 1Z26A 4CFCA 3WXMB 1SZ2A 3C95A 3I33A 3FZKA 2QA4N 3J7YP 4DTPA 5AR0A 3EN9A 4AILC 2D0AA 3SAGA 2G8FA 4OGCA 2OANA 2G8HA 3VESA 1Q8IA 2WC9A 4LF7K 5AQGA 3SQ1A 1GLEG 1B9FA 3AAQA 3ZX0A 1KXPA 3O6WA 3VTIA 1UAXA 3VEYA 4B9QA 4GY2B 4E1JA 3LZIA 3O1WA 4BRHA 3HXMA 1S6PA 4I9LA 3VENA 3BDPA 3I8BA 4KREA 2NRTA 4BWJA 4KFBA 1OH6A 4E1NA 3N4PA 1JCFA 1X9JA 4JI2K 3PSFA 4N5SA 2VQEK 1RTDA 3FZHA 4ELUA 1ZBLA 4LF5K 2UXDK 4OKKA 2JLEA 2IOCA 3LPTA 3SQ4A 2FC0A 5AQRA 3SPYA 3JXUA 3QINA 4M3TA 1FJGK 1N34K 1QS4A 2V51B 2O8DA 5GADP 4DSLA 2P9NA 2GEMA 3AY9A 3OYBA 1SKWA 4BDYA 4FO0A 3LALA 4MO4A 5MLCQ 4KV8A 4BRPA 1D8YA 2VQFK 3AA4A 2FBXA 3O9TA 3MWTA 1QSYA 2GWJA 3G10A 3WQUA 2XY5A 5C2FA 2J4RA 4KRFA 4YOXA 2Z1JA 3CM5A 4FWSA 2OCEA 2X74A 2OTLN 3VEXA 4E7LA 4YFUA 2DTUA 3S3NA 3DLLL 3QEWA 1GLAG 1WAFA 4ELVA 3OYLA 4H8KA 5C0YA 3M8QA 1NKBA 2VG5A 4MLHA 4JKHA 3AAPA 5GINA 3QLHA 4H0PA 4HCBA 4ELTA 1S1XA 4K8ZA 3M8RA 1S22A 1J5EK 5IWAK 4DFKA 4BY9C 5JLHA 4DQPA 2EHGA 2O4GA 3BP8A 2YKNA 1BCMA 2I7PA 3R1XA 3WUHA 4CEFA 3O3FA 3M5RA 4FSVA 2G8IA 3CG7A 3QNNA 2O8CB 4M3YA 2Q1NA 3LP0A 2ZM6K 5AQWA 3QFPA 1BQNA 3QEPA 3CQYA 1ITGA 4V19S 3KLIA 4CJVA 4CERA 4W5RA 3H1VX 4FOEA 4M3RA 1TUUA 2DY4A 3LANA 3HYFA 5M1FA 1UA0A 4KHNA 4PWDA 1GOBA 3ZSYA 3JS6A 3QNOA 3QEXA 1TK5A 3K59A 4CJUA 2DFHA 1KAXA 1IV0A 1KRPA 3IDHA 1T03A 5KPZA 2IDOA 2ZJQL 1LCUA 3HPOA 3HP6A 1YJWN 2HBJA 2NRRA 4CD3A 1SL0A 3DLGA 3TTDA 3VQPA 4CCHA 3QB0A 1RDCA 1W9HA 4MDBA 1WUAA 3I8DA 4O8KA 5LMUK 4DS5A 4O0JA 4BC4A 3IUCA 3J80O 4ID5A 3OYJA 3OS0A 2PBDA 1NK8A 4LFAK 1VQKN 3RSEB 1RT3A 1XMQK 3I55N 1HYZA 3TANA 3AO2A 4HTLA 1VQLN 3FZFA 4X66K 4CFDA 4CESA 3D0PA 3H46O 1R59O 3OHRA 4JS5A 3PO5A 3ZSOA 2RPIA 4HUEA 1QHAA 4CJPA 3F5TA 2F9WA 4Z0UA 4DQIA 5BR9A 1BWFO 3VPZA 4YOYA 3RRHA 3VQ4A 1EQYA 2AJQA 3VQQA 4CZHA 4B1UB 4CE9A 5HRSA 3TI0A 3UB5A 3PX4A 1VQPN 4E7KA 3PIOL 2IVOA 4EZ9A 5AQQA 1BU6O 2HHTA 3V1QA 1VK0A 3CC4N 4J2DA 5F0XA 1QZ5A 1NKEA 2W40A 3FFIA 3C94A 2NRXA 2O8CA 4JYAK 2IVPA 4DQ8A 2NLXA 3TTFA 4DS4A 1C1BA 5AQFA 4GKJK 3VA3A 1NNEA 1DGKN 4BG8A 4KB0A 3V9SA 1HYSA 4DLEA 2X6NA 4BR0A 1HR0K 3EO3A 3W3DA 5FDLA 4B1ZA 4CZJA 3WNFA 3OTOK 1XC9A 5EXWA 5F1XA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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