1NWKA

Crystal structure of monomeric actin in the atp state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Crystal structure of monomeric actin in the ATP state. Structural basis of nucleotide-dependent actin dynamics.
pubmed doi rcsb
total genus 118
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1nwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nwkA04
1JCFA 3CJCA 3D7EO 2A41A 3UE5A 3D2FA 4A61A 4EHUA 4ISGA 1TUYA 3ZX2A 1J6ZA 1GLBG 4H5WA 5FPNA 4PKHA 2QWOA 2QXLA 5AQUA 3LM2A 4JNEA 2PAVA 3QFUA 5F1XA 4AM7A 5AR0A 4BRKA 4DB3A 1IG8A 2IVNA 1NGIA 4B1VA 1Y64A 5BN9A 4QS9A 1BU6O 3ULEB 4BVOA 4BQZA 1MA9B 3W0LA 1BDGA 3M3ZA 4BRHA 5BRHA 2HMPA 3D2EA 3IMXA 3GDQA 4BR0A 1S22A 1HUXA 2A3ZA 4CBUA 2GWKA 4BR2A 1H1VA 1KXPA 3O80A 4B1YB 4PL7A 2Q2RA 2Q1NA 4JAXA 4FPAA 2CGLA 5BN8A 4DCHA 3VGKA 3EN9A 3CJAA 4XH4A 2P9SB 1YXQA 2HF3A 4CZJA 2I7NA 4B1WB 1GLDG 3EO3A 2YHWA 2CGJA 2YHXA 1GLEG 1Q18A 3M6GA 3IDHA 4BRIA 2E1YA 3SK3A 2W40A 3S41A 4FWLA 2FXUA 5BPNA 1EQYA 2D0PA 3D2FB 1YVNA 2WUSA 5ADXH 1RGIA 1D4XA 5F0XA 3MK6A 5KPRA 1NGGA 3EKSA 3IFRA 3SMPA 4CBWA 3F9MA 3O6WA 2GEMA 1ZC6A 2ZGYA 1BOTO 3O1WA 4K42A 4BC3A 3GE1A 3D2EB 1DGKN 2GTDA 3O8MA 4RCHA 2ZF5O 3ZEUA 4BRMA 1BA1A 3QBWA 2Q0UA 1NM1A 2Q97A 3LL3A 4GY2B 1E4GT 3ZETA 2QWLA 1X3NA 3MDQA 1SQKA 3VEOA 3WUHA 5AQNA 3KVGA 4QS8A 4EFHA 4BRPA 3LDLA 4BQLA 3R8EA 3LDOA 1XC3A 3B8AX 3U4LA 3RSEA 3ZX3A 5I9EB 2YCHA 5AQQA 5AQSA 4RTFD 1GLJO 4IWVA 4IXCA 4XH5A 1BG3A 2V7YA 1BUPA 2Q0RA 4O8KA 1WOQA 1MDUB 2I7PA 2ZWHA 1KAZA 3A0IX 4CZLA 4YDUC 4WQ4C 5JLFA 2HF4A 1QQMA 5AQYA 1U2VA 4BR7A 4FWKA 4BRAA 5AQRA 3I8BA 5AZJA 3R6MA 4H03B 4WYBA 4BC4A 3H45C 3U9ZA 1K8KA 2DPNA 3BP8A 3ID8A 2ASPA 3DWLA 3DXKA 3L0QA 4H0PA 3O5BA 3ZEUB 1QQOA 5AQFA 2CGKA 3EZWA 4BRFA 3R9PA 1DEJA 3QB0A 5AZIB 2P9LA 3ZETB 4BGAA 4MLEA 5AQVA 4BG8A 3VEYA 3VF2A 3FZLA 4FWOA 4CZIA 1ATRA 2ASOA 1CZAN 1HLUA 4CZFA 5B8HA 2E20A 4IJNA 3MN9A 4A2AA 1NGFA 1ESVA 1DKGD 4AM6A 5AQKA 5CE3A 4H5NA 1T6DA 3UB5A 2D0OA 5BR9A 4A62A 3HM8A 3RSEB 3ZX0A 4Z94A 3QBXA 4JN4A 4XEIA 5AQGA 1NGDA 4JD2A 3A8YA 3CHWA 4FOEA 4B1XB 3BF1A 3GOIA 2YJEA 1HKBA 4BC5A 1NLVA 1RFQA 3ATUA 4MLHA 1SZ2A 4BRGA 4BR9A 3GG4A 3MN5A 4IO8A 4CZHA 2V51B 3CETA 5FPMA 3JXUA 3VF4A 4BRCA 1U2VB 5AFUA 2E8AA 5AZJB 2H3GX 1NBWA 1S3XA 1K8KB 1NGBA 2QWQA 3CERA 3DXKB 1JCGA 4A2BA 5F2RA 2QM1A 2QWPA 4MO5A 5KPTA 5AQOA 1T6CA 3VEVA 5AQXA 3CJ1A 4CD1A 2P9LB 2NZTA 3FE1A 1P8ZA 1YUWA 4IZ9A 4M7XA 3OHRA 4NO7A 4PL8A 1QZ5A 4K25A 2Q31A 1TUUA 3EL2A 5AQLA 5LJVA 4BR5A 3WXIA 3SMSA 1U6ZA 4BC2A 3VGLA 1LCUA 2D1KA 2CH5A 3C7NA 1V4TA 2GUPA 4K43A 2FF6A 4JD2B 5TKYA 4HWIA 2P9UB 4EAHD 3J8AA 4EHTA 2BUPA 5AZIA 3A5LC 4H0XB 4PKGA 3EKUA 3MN6A 5AQPA 5KPZA 2QWMA 3W3DA 3O1BA 4ISFA 5BREA 3U9DA 2E88A 1GLFO 4H0YB 1KAXA 3KZBA 1ZBSA 3LDPA 3FZMA 3G25A 3WXKA 4CJ7A 4BG9A 4M63C 4BR4A 1GLCG 3UKRA 1IJJA 4BRDA 3WQUA 4WQ5C 3FGUA 3A5OC 2A6AA 1C0FA 2PBDA 3FZFA 4FWSA 4DHYA 2EWSA 2QWRA 4J8FA 4H5VA 3SLCA 4E1JA 4MO4A 1WUAA 1Z6RA 3H1QA 5JICA 2E2NA 3VOVA 4FWPA 3VERA 1GLAG 1NGJA 4JHDA 1LOTB 3WEEA 1NGEA 4H5RA 4FSVA 4CD3A 1QQNA 3AAQA 1JCEA 2E2PA 3GL1A 5FPDA 5E26A 2NRHA 1G99A 3C7NB 4L3QA 1X3MA 4FL9A 2KHOA 3CJ7A 5BRDA 5ELZA 2BTFA 3FZKA 3VEXA 4BROA 3A5MC 1HX1A 4FWQA 4B1UB 1MWMA 4PKIA 5AQHA 3VGMA 4ISEA 2UYTA 4O5FA 5AQIA 1OKJA 4YDUA 1YAGA 1ATSA 4WQ4A 5KQDA 4BRLA 3ENOA 3GBTA 3H46O 3H3NO 2YJFA 2FLOA 3I33A 5EX5A 4I6MA 4CZEA 4CZGA 4GNIA 3UKRB 2IIRA 3ENHA 5KQ8A 3O08A 4IJAA 1SAZA 4KBOA 4FWRA 3FLCO 2P9UA 5BPMA 1RDWX 3TU5A 2FF3B 3CI5A 3QICA 2ITMA 4H0TB 4CI6A 5AQMA 2E1ZA 3JS6A 3AARA 4EIAA 1XQSC 4LC9B 4BGBA 2P9NA 1NGHA 5JLHA 1KAYA 4JHDB 1Z05A 2YI1A 3DAWA 2P9IB 5EOYA 3WEEB 3H6EA 1X9JA 2F9WA 3IUCA 2ZGZA 5LY3A 2GELA 5FPEA 2GWJA 4QS7A 3WT0A 3L4IA 2VWBA 2V52B 1QHAA 3CJBA 4DQ8A 1GLLO 1NMDA 3LM9A 1QZ6A 3HSCA 1TYQA 2Q36A 1NGAA 4HTLA 1BA0A 4RWTA 1R59O 1ATNA 3U8XA 4FOIA 4BRNA 4FWNA 3CIPA 4F9OA 3O4WA 4FWMA 4NB4A 2CH6A 2VCPA 3UKUB 2ASMA 3DXMA 3A5NC 4I6MB 1T44A 3MN7A 3MMVA 2P9KA 4CZKA 2HOEA 3C0BA 2E2OA 2FSKA 5AQWA 4BVPA 4C23A 3VF6A 3HBTA 5BPLA 3HZ6A 2P9NB 3MCPA 1E4FT 2AP1A 2V7ZA 2AA4A 3VEWA 4B1ZA 1ZXOA 2QW9A 2FSNA 2P9PA 3VEZA 4B9QA 2F9TA 4BRQA 3VETA 1HKGA 3AY9A 3H3OB 1XUPO 1NWKA 1V4SA 3FFKB 5AQZA 1TYQB 5EY4A 3HTVA 3SJHA 5ADXA 4XH1A 3WQTA 2IVPA 4H0OA 2IVOA 4H5TA 2J4RA 2A42A 3H1VX 3M1FA 1HJOA 3WXJA 2D4WA 4K41A 3VPZA 4Y0WA 4H0VB 3CQXA 2W41A 3FZHA 4FPBA 4CZMA 3ULEA 3QFPA 3WXLA 1NGCA 3CJ9A 2P9IA 3LDQA 3DXMB 2QWNA 2A40A 3DJCA 3VESA 3P4IA 1HPMA 2FSJA 3LDNA 2E2QA 3ATVA 3QDKA 1BO5O 1MWKA 5BRFA 4WQ5A 2P9KB 5JMVA 1BWFO 3TPQA 3FR0A 1HKCA 3KHYA 4FO0A 2YHYA 5AFUH 3BF3A 3CQYA 3QMLA 5E84A 2P9SA 4BREA 2VYPA 5LJWA 5AQJA 2OANA 3HI0A 5AQTA 4M7YA 2P9PB 2NLXA 1C0GA 3BEXA 4CBXA 3UKUA 3VENA 5EVZA 2A5XA 3BUZB 3L6QA 3AAPA 5EXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G4SN 2BGGA 3CJCA 4H4OA 2G8KA 4OPKA 1K73O 2OTLN 1C1BA 4KTZA 4X66K 4ISGA 4FJIA 1TUYA 1J6ZA 1GLBG 4CERA 5FPNA 3ZT2A 2OPPA 5AQUA 4JNEA 2PAVA 4I9LA 3QFUA 5F1XA 4AM7A 5AR0A 4I9QA 4KO0A 5FRMA 2O8FB 1X9MA 4MDAA 3ULEB 3NF9A 3W0LA 3RR7A 3QO9A 1BDGA 4CJRA 4GVEA 3P1GA 1S22A 4KH4A 4BR2A 1KXPA 2PZSA 2VWJA 1TV6A 4LSNA 1TK5A 1TKXA 3HYFA 5BN8A 3D6RA 1RCHA 2P9SB 2GV9A 3Q7CA 4AHTA 1VSEA 4CZJA 1VQ8N 2I7NA 1L3TA 4OPHA 3EO3A 2ATQA 1Q18A 3M6GA 4BRIA 3OYMA 4FJGA 3SQ0A 2W40A 4DSLA 2VG5A 3NF8A 5BPNA 1EQYA 2D0PA 4M41A 1YVNA 2WUSA 3LWMA 1SV5A 4DFKA 3FFIA 5KPRA 4JI7K 1UWBA 3VN5A 3ID6A 1RNHA 4BC3A 4K42A 1P90A 3O9QA 3ZEUA 1QTMA 4OX9K 5SZTA 3V81A 3S5TA 4F3OA 3LL3A 3O9TA 3AO5A 4W5NA 2QWLA 2Q3SA 5IT9O 3VTIA 3MDQA 1SQKA 1IH7A 4DKWA 1L3SA 1TK8A 2HVIA 5GAGP 4QS8A 4EFHA 4BRPA 3LDLA 4BQLA 3EYZA 1JLAA 3TTDA 3U4LA 1HYVA 1VRUA 1L5UA 1HJRA 5AQQA 3QNNA 1S6QA 4DQPA 2XY7A 1BG3A 1BUPA 2F96A 2QEXN 3A0IX 5FRNA 3T1YK 3OYJA 1S1UA 5JLFA 2NRVA 4LF4K 1CXUA 1U2VA 5AZJA 4H03B 4WYBA 4BC4A 3ID8A 3CPEA 3TSUA 4L8RB 3KLIA 3ZEUB 5AQFA 1HQUA 2CGKA 3O4NA 4FLZA 4BRFA 3C94A 1SL2A 3QB0A 1LAWA 1NKEA 4GVMA 5AQVA 1B92A 3VEYA 3OTOK 3KLGA 4CJVA 4JKDA 5B8HA 4A2AA 3MN9A 4BEBA 1ESVA 5AQKA 2QA4N 3UB5A 4ELUA 4OLAA 3CCVN 3QBXA 3TR8A 1O1WA 3BZKA 3M8SA 1UA0A 1KVCA 2KTQA 1EP4A 3CHWA 3HK2A 3SPZA 1HKBA 4BC5A 1RT1A 3HP9A 2UU9K 1VSFA 2D0AA 4IEEA 4BR9A 4O55A 4BE0A 3V9UA 4B8AB 1K9MO 1XMQK 3CETA 3VF4A 1U2VB 4LFCK 5AZJB 1NMNA 4CFBA 4E7KA 3NCIA 1W7AA 1TVRA 4FYDA 5H1SQ 1NGBA 2F7TA 1JCGA 5F2RA 2QWPA 4JKBA 1Q81O 5AQXA 4FJXA 1RT6A 4JYAK 2Z1GA 4YOXA 4PA1A 3FE1A 5FROA 3AA3A 4NXNK 4Q5VA 1EWRA 5C2DA 4M7XA 1QZ5A 4CFDA 4DTJA 4BR5A 3HSTB 3WXIA 1B9DA 3SUNA 1B9FA 1NJWA 1LCUA 2HHQA 2W6LA 3MX5A 4MDBA 2BUPA 4H0XB 3D0PA 1LW0A 2VG6A 1RTIA 3EKUA 1OH8A 4CGIA 3O3HA 4E3SA 4M3WA 3NMUA 1VSIA 3ZYYX 3E9PA 4ISFA 4FLVA 3DLHA 2D0BA 2E88A 1DLOA 1ZBSA 4ILHA 1VSHA 3FZMA 3G25A 4BG9A 1S1TA 3QEXA 4N5SA 1GLCG 3K5MA 1IJJA 3C65A 3FGUA 3HP6A 2A6AA 3NDKA 1C0FA 2PBDA 4DR5K 3KK1A 3VQ7A 4FWSA 4DHYA 2EWSA 5JVHL 3AVMA 4J8FA 4H5VA 1S72N 4LH4A 1A5XA 3SLCA 4E1JA 4MO4A 2E2NA 1NGJA 1TKDA 2UUBK 4KTQA 3WEEA 4CESA 4H5RA 1KD1O 3AAQA 1SUQA 5C25A 5FPDA 4JLHA 3JYTA 4DTXA 2OA8A 3MXMA 4L3QA 3BY5A 4CEAA 3Q7BA 4HCBA 4FL9A 2KHOA 1UAXA 4Q0BA 4CGGA 2G8WA 4FWQA 5AQHA 1YI2N 3CCMN 1WLJA 3NHGA 4YDUA 1YAGA 3MWPA 3I8DA 4LFBK 4FZZA 2VGMA 1J9AA 3DLLL 3ENOA 1JXEA 4FLTA 2HHIA 2YJFA 1RBVA 1HNXK 2FLOA 3LP3A 3N4QA 3RTVA 3LPTA 4BACA 1XWLA 3O08A 5KRTA 3FLCO 3THVA 1BCMA 3CQ8A 4DS5A 1VSKA 2IS3A 4YOUA 1EO1A 3G0ZA 4EIAA 1NK6A 1XQSC 2O8CA 2P9NA 3IS9A 5M1FA 2NRWA 3KWGA 4UQGA 4QOZB 3OYAA 1NGHA 2YI1A 3DAWA 3WEEB 4JV5K 5J2MA 4B9MA 2UXDK 2GELA 3P31A 1QHAA 2ZJPL 3K5OA 4IOAL 4N47A 4DQ8A 3K57A 2FBTA 4UY8O 1TYQA 1CZBA 2HHHK 3P5JA 1L3UA 3TANA 4B9UA 2UXBK 4FM0A 1D5AA 4CGDA 4RWTA 1R59O 1NJIO 1IBMK 1HRHA 2G8IA 4JRPA 3CFOA 4DU3A 4E1MA 5M1KA 1VQ5N 4A59A 3V9WA 3NVMA 3SUPA 2G8FA 1LW2A 4DTRA 1N33K 3MN7A 4FJLA 1RTHA 3QETA 4DSKA 1A5WA 2FSKA 4LF7K 3AO3A 4C23A 5GIPA 3QEVA 5BPLA 1BCOA 4PHTX 2O8CB 2P9NB 2V7ZA 3VEWA 1IG9A 2QW9A 2FSNA 2OTJN 3V9ZA 3VEZA 1SL1A 3NVKA 3RMDA 1HKGA 1WN7A 4DV7K 2PYJA 3ASMA 3VQAA 4JK7A 5J2PA 3CXCM 3H3OB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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