1NWKA

Crystal structure of monomeric actin in the atp state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Crystal structure of monomeric actin in the ATP state. Structural basis of nucleotide-dependent actin dynamics.
pubmed doi rcsb
total genus 118
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1nwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nwkA04
3O4WA 5EX5A 4IJNA 3UE5A 5AFUH 3VEOA 1IG8A 5AQZA 1YXQA 4BG8A 3CI5A 3FZMA 3WT0A 2P9UA 4AM7A 3OHRA 3SMPA 4O8KA 1GLCG 3AARA 1BWFO 3EO3A 1XQSC 1E4GT 3LDPA 3R6MA 3RSEB 4BRLA 1MDUB 3C7NA 1DGKN 3UKRB 1U2VB 1TUUA 4CZGA 5FPDA 5KQ8A 4L3QA 3M1FA 4CZJA 4Y0WA 4JHDA 3FE1A 2W41A 3QBXA 4QS8A 4K43A 1RFQA 4H5VA 3ZETA 3H3NO 2VYPA 5KPTA 4BRAA 3HBTA 3IFRA 3SJHA 4BRCA 2P9NA 1NGFA 3FGUA 2F9WA 1BO5O 2Q31A 4BC3A 4KBOA 5BR9A 3A5LC 1LCUA 4CZLA 2E1ZA 3CJ1A 5AQHA 3FZLA 2QWMA 1JCFA 4EIAA 2QWPA 1G99A 3QB0A 3EZWA 2E88A 5AQVA 1ZC6A 5EVZA 2FXUA 2NLXA 4PKHA 4RCHA 2QM1A 3VF2A 3DWLA 3UB5A 3ID8A 1KAXA 1BU6O 3CIPA 2ASOA 2A40A 3DXKB 3WEEB 4B1ZA 2PAVA 4B1UB 5KPZA 1QHAA 3A0IX 3KZBA 4DB3A 3ZX3A 4F9OA 2YJFA 4PKIA 4I6MA 4PL7A 5KPRA 4HWIA 2CH5A 3VETA 3CERA 3U8XA 4YDUA 2ZF5O 2ASPA 5KQDA 3FZKA 5ELZA 4A2BA 4BGAA 1HLUA 2QXLA 3L0QA 3CQYA 4K25A 3R8EA 1SZ2A 3MK6A 4BRIA 4NB4A 4BR7A 4RTFD 3A8YA 5JLHA 4IZ9A 4CBWA 4M7YA 2V52B 3UKUA 2DPNA 5AR0A 4CZEA 3ZX2A 4BC5A 2BUPA 3CJAA 2HMPA 2P9SB 2QWRA 5FPEA 1BDGA 2P9PB 3CJ7A 1NGAA 1NGJA 2Q1NA 1IJJA 3GDQA 5I9EB 2IVPA 3GL1A 4BREA 1NBWA 4DQ8A 4FWOA 3H1QA 4FWSA 4BR2A 2A3ZA 2D1KA 2GWJA 4XEIA 3VGKA 3VEWA 5TKYA 1E4FT 4FWNA 2OANA 4J8FA 4CBUA 5AQUA 3VEYA 2A6AA 1MA9B 1ESVA 1ZBSA 4O5FA 2P9KB 2A42A 1NGGA 3MN9A 1H1VA 1TYQB 2Q0RA 4IXCA 2GTDA 5JLFA 4B1XB 3HZ6A 4B1VA 1Z05A 2WUSA 4EAHD 3F9MA 4A62A 1RDWX 1NWKA 3O1WA 4JD2A 3VEZA 3BF1A 1HUXA 4WQ4C 4CD1A 4PKGA 5BRHA 3H1VX 1GLLO 4CZFA 3ZEUB 2Q0UA 3CJBA 4WQ5C 1NGIA 4BRMA 3WQTA 2YHYA 3D2FA 4BRNA 1TUYA 4M63C 3H3OB 1NLVA 4MLEA 2A5XA 2QWQA 2V7YA 3FZHA 3QICA 2P9IB 1V4SA 2J4RA 4FWMA 5ADXH 1QZ6A 2YHWA 1NGHA 4BGBA 2Q97A 4CZIA 1C0GA 3O80A 1U6ZA 4FOIA 4GNIA 2FSKA 5AQLA 1MWKA 5FPMA 5JMVA 5AQFA 1OKJA 1S22A 1KAZA 3WQUA 3L6QA 4FWRA 5FPNA 3VGLA 3D2EA 4XH5A 1GLEG 1X3NA 3QDKA 3WXKA 5AQJA 2YJEA 4M7XA 1P8ZA 4AM6A 1HKGA 3UKRA 4RWTA 4BRFA 1U2VA 4MO4A 5AQMA 3HSCA 3U4LA 2GELA 3B8AX 2KHOA 3HM8A 3EL2A 4K42A 5AFUA 1R59O 3DAWA 5EXWA 3VGMA 2GUPA 1RGIA 5AZIB 3I33A 3U9DA 4IO8A 4I6MB 3BUZB 5AQRA 3SMSA 3MN7A 4XH1A 4BC4A 4EHUA 1GLDG 3DXMB 3W0LA 1KAYA 5AQNA 1QZ5A 1X3MA 3MCPA 3VF6A 1GLFO 3GE1A 3WXLA 3MDQA 4BQLA 3ENOA 1ZXOA 3KVGA 3MMVA 4FL9A 2H3GX 4QS7A 2ZWHA 4H0PA 3WEEA 3DXKA 4ISGA 3LDQA 1J6ZA 2IIRA 3H46O 4WYBA 3AAQA 3SK3A 1XC3A 4H0YB 3BEXA 1MWMA 1NGDA 4H5WA 4H5NA 1NMDA 2QWOA 3ULEB 3H6EA 1BOTO 1T6CA 1QQNA 4BR5A 5F0XA 3VPZA 1K8KB 2D4WA 4H03B 4H0TB 4JNEA 3VOVA 5AQSA 3WXIA 3O1BA 4A2AA 5BPMA 2E8AA 3S41A 5LJVA 5E26A 5EY4A 2ZGZA 2AP1A 1HX1A 4BVOA 3LDOA 2W40A 3CJ9A 3C0BA 2V7ZA 4A61A 2P9SA 1LOTB 3LDLA 2FSNA 2P9PA 2HF3A 2P9LB 4H5RA 3AY9A 3TU5A 1NGEA 2FF3B 5AZJB 5F2RA 2A41A 2NRHA 1Y64A 5BRFA 1HKBA 3G25A 4WQ4A 4JN4A 3SLCA 3ATVA 5AQTA 2E1YA 5B8HA 2YCHA 1NGBA 4LC9B 2E2NA 4BR0A 2D0PA 3TPQA 1ATNA 1KXPA 1X9JA 3MN6A 1SQKA 4WQ5A 2P9UB 5AQGA 4BR9A 3M3ZA 1TYQA 3ENHA 5BN9A 3L4IA 4B1YB 2F9TA 5AQOA 3GBTA 2AA4A 3LM9A 4BRQA 3QMLA 3C7NB 4FPBA 4K41A 4EFHA 4Z94A 1D4XA 2VWBA 3VERA 3JXUA 4JHDB 4BVPA 1BA1A 2GWKA 3O8MA 4IJAA 5AQQA 3FR0A 1Q18A 4CZHA 3ZETB 5BPNA 4BQZA 5E84A 3FFKB 3ZEUA 2EWSA 1WUAA 4BC2A 3VEXA 1NM1A 4CD3A 2I7PA 2P9NB 2QW9A 3D2EB 3WXJA 2QWLA 2FF6A 3DJCA 2GEMA 3EN9A 2D0OA 4FSVA 4H0OA 4IWVA 3GOIA 4CZKA 3W3DA 5BPLA 2ZGYA 3RSEA 3A5MC 3QFUA 2P9IA 3EKSA 1DKGD 4MLHA 4PL8A 5AQXA 5BREA 2CGKA 3VESA 1T6DA 3HTVA 3LDNA 3QBWA 5F1XA 3I8BA 5EOYA 4FWKA 4DCHA 5LY3A 2UYTA 1EQYA 1QQMA 3FLCO 2BTFA 5BRDA 1YVNA 4FWQA 4H0VB 4MO5A 1CZAN 3IDHA 1JCGA 3M6GA 3MN5A 3R9PA 4BRDA 4FOEA 4HTLA 2PBDA 4ISFA 4FWPA 4EHTA 3JS6A 1GLBG 2I7NA 5AQIA 2E2PA 3VF4A 2QWNA 5ADXA 3VENA 2E20A 2IVNA 3FZFA 4FO0A 4BRKA 1V4TA 3UKUB 3CJCA 1S3XA 3ATUA 5AZIA 3CHWA 2YHXA 1HKCA 2Q2RA 3BF3A 1ATSA 1NGCA 4BR4A 1C0FA 3HI0A 4FWLA 4YDUC 4BROA 3DXMA 1XUPO 1YAGA 4H5TA 1T44A 1ATRA 3KHYA 1BA0A 1JCEA 3U9ZA 3LL3A 2CGLA 2NZTA 5CE3A 3O6WA 4ISEA 3GG4A 4JAXA 4BRGA 1GLAG 3LM2A 3BP8A 4CJ7A 1YUWA 5AQWA 4FPAA 4H0XB 4BG9A 5AQKA 3H45C 2HOEA 3ZX0A 2IVOA 4XH4A 1BUPA 5LJWA 2ITMA 3O08A 3AAPA 4JD2B 3ULEA 5AQYA 4E1JA 3WUHA 4BRPA 1DEJA 4BRHA 1K8KA 1SAZA 4NO7A 4DHYA 2FLOA 5BN8A 5JICA 2CH6A 2ASMA 4CBXA 3IUCA 3VEVA 2CGJA 2FSJA 1WOQA 4GY2B 1HJOA 3D7EO 3CQXA 3J8AA 4B1WB 2P9KA 3D2FB 1BG3A 1QQOA 2Q36A 3A5NC 3QFPA 4CI6A 1HPMA 2P9LA 2E2QA 5AQPA 4C23A 3P4IA 2VCPA 2E2OA 4B9QA 4QS9A 3CETA 1Z6RA 5AZJA 3A5OC 4CZMA 1GLJO 3O5BA 3IMXA 3EKUA 2YI1A 2HF4A 2V51B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D5RA 5EX5A 4NLCA 3EEQA 3VQCA 1RDUA 5K14A 3WXMB 1HPZA 3VEOA 1IG8A 1XI1A 1B9DA 4W5RA 4JRPA 3THXB 4EZ6A 1BWFO 4YOXA 1I3AA 3EO3A 1XQSC 3K5MA 3OYFA 3LDPA 4FM1A 2VQFK 2OYQA 3C7NA 4KHUA 4OKEA 1TUUA 3RRHA 3TSQA 1EP4A 5CZ1A 3K5NA 4EP5A 1OH6A 3QBXA 4B9NA 4KHPK 4DSEA 4JI4K 4KI6A 3S3OA 4DMNA 3H3NO 3AVNA 5KPTA 2QI2A 3SJHA 1BO5O 2Q31A 4BC3A 1YHQN 3NGIA 3HVTA 3WNEA 4NYFA 3OS0A 3NF8A 1RT1A 3QB0A 5EVZA 2FXUA 4RCHA 5BR8K 4O0JA 3FFIA 3ZSOA 1JL2A 3P39A 2IAJA 4O8UA 3CIPA 3HPHA 2ASOA 3BDPA 5FLXO 4DF8A 2OPPA 3K5OA 1VSIA 3L8BA 2F8TA 4KFBA 3OYNA 4F9OA 4NCBA 2YJFA 1VHXA 4PKIA 4I6MA 1M1KO 4DFMA 2FBVA 5KPRA 3MXIA 3CERA 3U8XA 3S3MA 5CY4A 1BIZA 2ZF5O 2FC0A 2ASPA 1IKVA 5ELZA 4FJ9A 4A2BA 4BACA 3SAFA 4FM0A 4J2EA 4K25A 3CQYA 3LP2A 4NB4A 4RTFD 3PX6A 5GAHP 3OYJA 3OJUA 4BC5A 1YJNN 3G4SN 5I42A 4Q0BA 1BDGA 3CJ7A 1NGAA 4KO0A 2ATQA 4FJKA 1NGJA 2IVPA 4DQ8A 3V9UA 5DM6L 4BR2A 2GX9A 2VG6A 4EZ9A 4KHYA 4M3WA 5TKYA 3S3NA 1A5VA 2O8EA 2UUCK 4J2DA 2A6AA 3CYMA 2A42A 1NGGA 1TVRA 1RT7A 1XNQK 2Q0RA 2Y1JA 1D9DA 1XHXA 2VQEK 4FM2A 1JLGA 1YT3A 4F3OA 4DS5A 4JI8K 2HHSA 3SYZA 1ASWA 3F9MA 5C10A 2E5LK 1YIJN 3F5TA 2HHIA 2OPSA 3BF1A 1Q9XA 1L3UA 4CHQA 2VG5A 1RDDA 2WC9A 3H1VX 3LP3A 4FXDA 4B3SK 4M41A 3ZEUB 4N5SA 3PLAA 2KZMA 5HOOA 4WQ5C 1NGIA 1WNSA 3EE9A 3WQTA 1HNIA 4MQ3A 1DTQA 4HTUA 1D5AA 4BRNA 1K73O 2F8SA 5M1KA 2A5XA 4BE1A 2UXCK 4JKDA 3FZHA 3QICA 1UA0A 1V4SA 3AVIA 4FWMA 4DQQA 2YHWA 4FLZA 1U6ZA 4FOIA 2O8DA 3P1GA 1MWKA 1OKJA 1S22A 1NJXA 2ZD1A 3QO9A 3WQUA 1JXBA 4FWRA 4M42A 3QEIA 4DR3K 1TAUA 2NRTA 4GVMA 4DV0K 1LW0A 1X3NA 1JJ2M 3H08A 3J7YP 2QKBA 4BRFA 1U2VA 3DI6A 3RMAA 2HHQA 1W7AA 1XHZA 1D8YA 3B8AX 3HM8A 4M3UA 4K42A 4C1NI 4HCBA 4FJ5A 2FBYA 2O4GA 4CHZA 4PQUA 3I33A 2HHHK 3L2RA 4JI3K 3NDKA 4XH1A 4EHUA 1KAYA 1JLAA 1QZ5A 2ZJPL 1X3MA 4W5OA 3VF6A 1GLFO 1QTMA 3MDQA 3NVKA 4B9TA 1NJYA 4FJNA 4PUOA 2HHUA 2X6SA 4H8KA 2NUBA 1TL3A 2ZWHA 2Q3SA 1HNWK 2Z1GA 3DXKA 5LMUK 5JVHL 5HL7L 3I0SA 1ZBIA 3JYTA 2BDPA 2HHTA 4BWJA 1VSLA 5IT9O 3ZT4A 3VPZA 1K8KB 3PIPL 3KKRA 4JI5K 5AQSA 4DTSA 4A2AA 3SV4A 3S41A 1BI4A 3I55N 3C6HA 2AP1A 3Q7BA 4W5TA 3C0BA 5HRNA 5D3GA 3NF6A 4H5RA 3PSFA 2OA8A 3AO4A 1LW2A 3LWLA 4FVUA 4DTMA 1HKBA 3AVKA 1Q82O 3ATVA 2E1YA 1NGBA 4CERA 4BR0A 3M5RA 4CEOA 1X9JA 4YOTA 3ZT2A 4F4KA 3HXMA 3TWHA 1F21A 1RTDA 3K57A 4CK2A 1X9MA 1S1WA 1Q8IA 3GBTA 2AA4A 4CJTA 3QESA 3LM9A 3VTIA 2JWLA 3JAMO 1YTUA 2HBMA 1RBRA 3MECA 5M1NA 3DLRA 4ELVA 4IJAA 4CECA 1Q18A 1IBKK 1LWCA 2EWSA 4BDZA 2VGMA 1CXQA 2YKMA 4JK7A 4FJLA 3DJCA 5C15A 3EN9A 2D0OA 4NLBA 4CJKA 5KRSA 1NK4A 3W3DA 3TSPA 4WFNL 5HRPA 4KH6A 3R1XA 3EKSA 4PWDA 5BREA 2CGKA 4Z4CA 4CK3A 3NHGA 3S9HA 1WN7A 5H1SQ 1EWRA 4FWKA 1FKPA 1N32K 4IOCL 1T03A 3VA3A 1CXUA 1EQYA 4JKGA 4FWQA 4CJEA 3M6GA 2LSNA 3MN5A 4OPJA 3WNGA 2PBDA 1W9HA 4RW7A 5AJ3K 4EHTA 1VSJA 3JS6A 1X1PA 5M1QA 2E2PA 1J5EK 3VF4A 3NFAA 4FK2A 3VENA 3FZFA 1CLQA 3VQEA 1U49A 3BY5A 1EETA 2NNWA 1VRTA 1U04A 1HJRA 3UKUB 1L5UA 2W6KA 3CJCA 4YORA 3ATUA 4DSLA 5AZIA 1HNZK 3AO1A 1KTQA 4ILGB 5HRRA 1K6YA 4FCYA 3BF3A 4OKKA 4LH5A 3HI0A 4I7FA 4YDUC 3TAMA 1WLJA 3DXMA 1YAGA 2UXBK 1U45A 1VSFA 1SL0A 5CYQA 2KQ2A 2P5GA 3LL3A 5CE3A 2UU9K 1WBDA 4MFBA 3LM2A 1UAXA 4BRGA 4CJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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