1NWKA

Crystal structure of monomeric actin in the atp state
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
366
structure length
353
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of monomeric actin in the ATP state. Structural basis of nucleotide-dependent actin dynamics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein
total genus 118
structure length 353
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1nwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nwkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nwkA04
3M3ZA 5AQZA 3MCPA 4PKGA 5EXWA 3VF6A 3FGUA 1OKJA 1TYQB 3I8BA 5AQQA 3D7EO 2CH6A 2YCHA 4ISFA 2P9PA 4WQ4A 3DXKB 3A5LC 4BRIA 3KZBA 3VF2A 3CJBA 1K8KB 4ISEA 3RSEA 3QFUA 2NZTA 3U4LA 3EZWA 4FWMA 3BEXA 4H0VB 1NGEA 3BUZB 1TYQA 2F9WA 3DXMB 3ULEB 2Q31A 4BG9A 2Q2RA 4GNIA 2IVNA 1QQMA 1R59O 2EWSA 3VENA 3TU5A 1HX1A 4BR5A 3HM8A 4MLHA 4DQ8A 1NLVA 1IJJA 1NGGA 1CZAN 3EKUA 3O4WA 2GWJA 1YUWA 3C7NA 3U9ZA 4B1ZA 3ZX3A 4A2AA 2V52B 3WQUA 4WQ4C 4I6MA 1HPMA 3VEWA 2ASOA 3W3DA 2HF3A 3VEZA 4CD3A 4L3QA 3CJ9A 3CQYA 1E4GT 2HF4A 5E26A 1NMDA 5AQHA 3ZETB 2W41A 4NB4A 3GBTA 1NGBA 1TUUA 5LJWA 3KVGA 2YJFA 3LM9A 5EX5A 5F2RA 2D0PA 4XH1A 2ITMA 4H0YB 1ATSA 1KAYA 3HBTA 1BWFO 5AQJA 5ADXA 4B9QA 5AQLA 2YHYA 3LL3A 4IO8A 4BC2A 4PL7A 3R8EA 3SLCA 2P9NB 4BVPA 1C0GA 5I9EB 3GDQA 1YXQA 2A42A 1C0FA 3HSCA 1JCEA 2OANA 3VETA 4BGAA 3H46O 5JICA 3O5BA 2FSJA 2CGKA 2FSNA 3CQXA 5AFUH 1BU6O 1JCFA 3R6MA 3WQTA 2V7YA 2IVOA 2A5XA 2AA4A 4PKHA 4O5FA 1NWKA 5BPMA 4FL9A 1TUYA 3LDNA 3VEOA 2V51B 4O8KA 2HOEA 3ID8A 5JLFA 2A3ZA 1GLFO 3G25A 3CIPA 2QWQA 4C23A 3CJ7A 5AQWA 2P9NA 1NGAA 3WEEA 3D2FA 3FZHA 1HKGA 2IIRA 3MN7A 4FO0A 4ISGA 4K41A 5BPLA 2P9UB 2CGJA 2QWPA 4H0TB 5B8HA 2QWRA 4BC5A 4A2BA 3W0LA 4NO7A 3FFKB 4BRQA 5AQGA 4B1UB 3LDQA 1ZC6A 1KXPA 3EO3A 2P9PB 5AQTA 2BUPA 3SK3A 2E1YA 4XEIA 2YI1A 1T6DA 2KHOA 3LDOA 3RSEB 2Q97A 3SMSA 4DCHA 2ZGZA 4JNEA 4BRNA 4CBXA 4XH4A 3VEVA 4B1WB 2I7NA 4QS9A 2Q1NA 3LDPA 3CETA 2HMPA 3QDKA 1ATNA 4DHYA 1YVNA 1Y64A 1GLEG 3L4IA 4H5WA 2PBDA 2FF6A 4BRAA 5JLHA 3MK6A 1T6CA 2E2QA 3OHRA 3IMXA 5F0XA 4FWQA 1MWKA 1QQNA 1ESVA 2QW9A 4H5NA 3D2EA 4EHTA 3H45C 3C7NB 1DEJA 3TPQA 1GLJO 3GE1A 3KHYA 2P9LA 4M7XA 2E2NA 4IWVA 4I6MB 1NBWA 3DJCA 3HTVA 4CZKA 1NGHA 5AQKA 4QS7A 3AAQA 3WXJA 3ENHA 2QXLA 2AP1A 4CZMA 2Q36A 3A5OC 3O08A 5BRFA 2P9SA 4FWOA 1BUPA 2VWBA 5LJVA 5ADXH 4FPAA 1U2VB 2ASPA 5LY3A 1KAXA 2YHXA 1BA0A 4BC3A 3H1QA 1HUXA 4H0XB 3ATUA 4BRCA 2QWLA 3FZFA 1HKCA 4BR4A 3JS6A 3H6EA 3O80A 5CE3A 2GTDA 2P9KA 3FE1A 4FPBA 3EN9A 3QMLA 2V7ZA 4BRMA 4M7YA 3ZX2A 1NGCA 2E20A 5BN9A 5KPTA 3UKUA 1S22A 1U2VA 3A8YA 3GL1A 4JAXA 5FPDA 4M63C 2DPNA 5FPNA 2A41A 1RFQA 3WXIA 1GLDG 4BGBA 3HI0A 3UKRA 3D2FB 3WEEB 4FSVA 5FPEA 4FWKA 5AQPA 5KQ8A 2GELA 1BG3A 4PKIA 1JCGA 1Z05A 3H3NO 3FZKA 2PAVA 5AQUA 3FLCO 4CZLA 1MDUB 3H1VX 4CZGA 3ZEUA 3F9MA 5KPZA 3CJAA 2VYPA 1X9JA 5AZJA 3MN9A 3O8MA 4EAHD 3VGMA 4FOIA 3H3OB 3IDHA 4IJAA 2WUSA 4BR9A 3VPZA 2A40A 3UB5A 1QQOA 1J6ZA 5AQIA 5BPNA 4JHDA 2VCPA 4FWLA 4IZ9A 2GEMA 3IUCA 1QZ5A 3S41A 3A5NC 1KAZA 5EY4A 1U6ZA 4AM7A 4JD2B 3EKSA 4B1XB 1HLUA 2F9TA 3O1BA 3QBXA 4CI6A 3UE5A 1GLBG 4BVOA 5BRDA 3WXKA 2Q0UA 5AQNA 3CHWA 4FOEA 4BRFA 4BQLA 1EQYA 3P4IA 1NM1A 3ATVA 4BRHA 3D2EB 4K42A 4WYBA 3LDLA 1ZBSA 3WXLA 4FWSA 4CJ7A 1Q18A 2A6AA 1NGIA 3QB0A 4A61A 2P9LB 3I33A 3J8AA 4JD2A 5AZIA 4CBWA 3O1WA 2UYTA 1BOTO 4MO4A 3CJCA 3GG4A 4DB3A 4F9OA 5JMVA 4AM6A 5TKYA 2H3GX 2GUPA 3A5MC 1MWMA 3AAPA 3WUHA 1LCUA 4BC4A 3LM2A 5AQSA 4CBUA 2P9SB 4Z94A 2FLOA 3GOIA 1MA9B 3QBWA 4EHUA 4H0OA 4FWNA 4QS8A 4CZHA 3C0BA 4BREA 1HKBA 2D4WA 2FXUA 3HZ6A 3L0QA 5ELZA 5E84A 5AQMA 4A62A 3MN5A 4BRDA 1X3NA 1RDWX 1LOTB 3M6GA 4Y0WA 4BROA 5BREA 2ZGYA 4E1JA 2P9KB 4H03B 2D0OA 3BP8A 4BQZA 4RTFD 4BRLA 4H5TA 2QWMA 1SAZA 3QFPA 4K43A 3UKUB 1WUAA 3SJHA 4IXCA 3ZX0A 4EIAA 5AR0A 4YDUA 1V4TA 4H5RA 1RGIA 5AQYA 3BF3A 4MO5A 4BR2A 2E1ZA 3DXKA 3CI5A 4K25A 4KBOA 3R9PA 1V4SA 1XQSC 3VGKA 3FZLA 3SMPA 2E88A 1K8KA 1WOQA 3UKRB 2QWNA 3FR0A 1QZ6A 2YJEA 5BR9A 4XH5A 2FF3B 4HWIA 2ASMA 2YHWA 2ZWHA 1XC3A 3BF1A 3DXMA 3VEYA 3ULEA 4PL8A 3ZEUB 3QICA 5AQXA 2P9IB 5AZJB 4RWTA 4BG8A 5BN8A 4RCHA 5BRHA 1QHAA 1X3MA 2QM1A 2NLXA 1S3XA 4BRPA 4FWRA 4YDUC 2ZF5O 3MMVA 4JHDB 3U9DA 4B1VA 3ENOA 5KPRA 3L6QA 1GLAG 2CGLA 3A0IX 4CZFA 4H0PA 1GLCG 4H5VA 1ZXOA 5AQVA 3VEXA 5AQFA 1NGDA 3WT0A 1BA1A 4FWPA 2W40A 2Q0RA 2P9IA 4J8FA 2NRHA 1HJOA 3VESA 2CH5A 3ZETA 1T44A 1NGJA 4CZJA 5AQOA 4B1YB 4CD1A 1D4XA 3MDQA 5AQRA 4WQ5A 2BTFA 2QWOA 3DAWA 4CZEA 2FSKA 2E2OA 4IJNA 1E4FT 3AARA 3JXUA 3U8XA 5AZIB 3DWLA 1SZ2A 2D1KA 1ATRA 2IVPA 3FZMA 5EVZA 5FPMA 5KQDA 1DGKN 4JN4A 1NGFA 3VOVA 5F1XA 1G99A 3CJ1A 3EL2A 4LC9B 3VERA 3MN6A 3VF4A 4BR0A 2GWKA 4MLEA 4EFHA 3IFRA 2J4RA 4HTLA 4BRKA 5AFUA 4CZIA 3AY9A 1H1VA 3VGLA 1P8ZA 3CERA 4BR7A 4GY2B 5EOYA 1YAGA 2I7PA 1BO5O 3B8AX 3M1FA 3O6WA 1SQKA 1XUPO 4BRGA 1Z6RA 2E2PA 4WQ5C 1GLLO 2E8AA 1IG8A 1BDGA 1DKGD 2P9UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IKFA 3M3ZA 1S1TA 5EXWA 3VF6A 3FGUA 1ZBIA 1VSJA 5LMNK 2CH6A 1VSFA 4ISFA 5HOOA 4KHSA 4C8LA 3OYBA 4WQ4A 3KK1A 5FROA 4J2EA 3K5MA 3CJBA 1K8KB 4ISEA 5CYMA 3RSEA 4OGCA 2OCEA 2NZTA 3OTOK 4L8RB 3S3MA 1K6YA 3NVKA 1TYQA 4FJLA 2OPSA 3N4QA 2Q31A 3MWTA 4K0KK 3K59A 2NNWA 2ZM6K 3TU5A 1HX1A 3R3LA 3HVRA 4KHNA 3CYMA 2GV9A 4CE9A 3KLGA 1IJJA 4OX9K 1RNHA 1YUWA 4YOWA 1EKEA 4B1ZA 1FW6A 1VQMN 2NRVA 4Z0UA 1UOCA 2V52B 3LZIA 1WB9A 2OZMA 4I6MA 3UIQA 1YITN 3ISNC 3J7YP 1Q9YA 3LDSA 4OPAA 5CZ2A 3D6RA 3ZETB 1RBVA 2W41A 3SNNA 3DI6A 1RBTA 3GBTA 1NGBA 4DS4A 5C42A 3LM9A 5F2RA 4XH1A 4H0YB 1ATSA 1Q7YO 4LF6K 3SV3A 4I2PA 2YHYA 4PL7A 3S3NA 4BVPA 2UUBK 1YXQA 2A42A 1JCEA 4YY3K 3SPYA 3H46O 5AFUH 1YF5L 2O8CB 3AGRA 1JCFA 1YI2N 1XMOK 2QXFA 1RDDA 4DKWA 1QVFM 1VQ6N 4M3ZA 4PUOA 2AA4A 4O5FA 5BPMA 1FXXA 1LAWA 2PYLA 2A3ZA 1ZBFA 4B8CA 1GLFO 2QK9A 2HHXA 3G25A 2KTQA 3T1HK 3NGIA 1NGAA 4KHQA 3TI0A 5C2DA 4FLUA 4DR6K 4CGFA 2IIRA 5M1NA 1JL1A 4O0JA 1OVQA 3ZSVA 2E5LK 1OH6A 4FO0A 4ISGA 3OVNA 2B5JA 4JI6K 4KI4A 4KB0A 3AVMA 4IFEA 3BZCA 2XY8A 4CF9A 2O8DA 4DTUA 4CJSA 3M8SA 5AQTA 2BUPA 4XEIA 3TAFA 1T6DA 3THVA 3CCLN 4DQIA 4E7LA 4DR3K 4LFBK 4FJNA 3TTCA 1A5WA 2F7TA 3L2QA 4JNEA 2HBMA 3K9KA 3QEIA 1C0UA 3TARA 4XH4A 4BWJA 1RBSA 4B1WB 2I7NA 2KQ2A 2HHUA 1QSLA 3Q7CA 3CMEN 1Y64A 3LAMA 4EZ6A 2FF6A 3AGKA 3I0RA 4BRAA 1HNXK 1VQ8N 5DK5A 3KIOA 4DFJA 3U3YA 2G8UA 4FWQA 1NOZA 1ASVA 3ENBA 3D2EA 2NRXA 4H5NA 2YKNA 1TAQA 3KHYA 3F5TA 4KHWA 4DV1K 4IWVA 4DTXA 3D45A 2RN2A 4JRQA 4DU3A 3HTVA 1NGHA 3KKSA 3K5OA 3QIPA 5AQKA 1NKEA 4FVMA 3LANA 2Q36A 2XRIA 2P9SA 2ETJA 4RW6A 3FFIA 4FPAA 2W6KA 1RT2A 1S72N 4JYAK 4KH5A 4AHTA 1BA0A 3K5NA 3NHGA 3ID6A 1GOAA 4JI0K 3SBGA 1HUXA 3ATUA 4E0DA 2QWLA 2HNZA 3FZFA 1N8RO 4KHUA 2HHTA 4BR4A 3JS6A 3DLRA 1S5JA 1HYSA 3EN9A 4BRMA 4M7YA 1S1UA 4CHZA 5BN9A 3CCEN 1QQCA 3UKUA 4QOZB 3A8YA 1Q8IA 5KI6A 3GL1A 2QA4N 1KRPA 4DR4K 5FPDA 2YNIA 1TKTA 3PY8A 1RFQA 1YJNN 1W0HA 1HRHA 1JLFA 4CFAA 4FWKA 3AO2A 3D0PA 1BQNA 3LWLA 3KJVA 4O5BA 2HHVA 1JCGA 4FJ8A 2X74A 3H1VX 4DQSA 3CJAA 3CM5A 4IEEA 4LSNA 2WUSA 4BR9A 3C65A 3OY9A 1J6ZA 3LZJA 5AQIA 4DG1A 2VCPA 4AHUA 4FWLA 4V19S 4B3SK 3T7ZA 2GEMA 3F9KA 3A5NC 4F2RA 3L2RA 3T1YK 1KAZA 1U6ZA 2KZMA 5HLFA 1HLUA 3QO9A 3QBXA 3WXKA 4N5SA 2IAJA 5AQNA 4FOEA 4BRFA 3SAFA 4CIEA 1BCOA 3ATVA 4BRHA 4K42A 1TKXA 1NMNA 3IAYA 4FWSA 4MFBA 1U4BA 2HW3A 1VSDA 3O9QA 1IKYA 4QCLA 3EE9A 3DYAA 3OS2A 3KLEA 4JD2A 4CBWA 3O1WA 2UYTA 1BOTO 3L3VA 3GG4A 4KKOA 4F9OA 5JMVA 5TKYA 4M42A 3RVCA 4JI1K 2O8EB 4LF5K 3AAPA 1KD1O 4Z94A 3OYLA 3GOIA 3QINA 5J2QA 4O8UA 1BIZA 5HROA 1M90O 1VQ9N 1N33K 2HVHA 1EP4A 2BH1A 3C0BA 3NH0A 2D4WA 2FXUA 2R7YA 2OPPA 3QEPA 3TAPA 3KWGA 2P5OA 4BY9C 1RDWX 1RT7A 4JKAA 2Y1JA 4Z4CA 3SUPA 1YTAA 5GINA 3AVNA 4CEBA 3ZX0A 4EIAA 4H5RA 3OYGA 5JENA 3K2PA 3VQ6A 3OYAA 4K25A 1HNZK 3VGKA 4OPHA 3RR7A 3UKRB 2E88A 1K8KA 2QWNA 4RG8A 1HJRA 4LH5A 4XH5A 4DTSA 4LF8K 4EZ9A 4M3XA 2UUAK 4IFVA 1I94K 3VEYA 4F3TA 5AQXA 1W9HA 3LP1A 1D5AA 4BG8A 4YNQA 4OVLA 3AO3A 2QM1A 2OTJN 1NK6A 4BRPA 4FWRA 4YDUC 4E1MA 1A5XA 4FLZA 3MMVA 3U9DA 4QAGA 3A0IX 3JAMO 3CXCM 1JLEA 1REVA 4H5VA 1ZXOA 5AQVA 3VEXA 1EO1A 4CJLA 1XC9A 4DTNA 2JWKA 4NCAA 4DLEA 5D3GA 3MCAB 1HJOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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