2PBDA

Ternary complex of profilin-actin with the poly-pro-gab domain of vasp*
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2pbdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pbdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pbdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pbdA04
2KHOA 3AAQA 1OKJA 2YI1A 1XQSC 3BP8A 5F2RA 4H5NA 1SQKA 4KBOA 2E1YA 2HF3A 4LC9B 3O1WA 1GLLO 4CD3A 2HF4A 1H1VA 3FZHA 3ZETB 4BC2A 4BRFA 1V4SA 3RSEA 3KVGA 3RSEB 4FWRA 2V7YA 5KPRA 3W0LA 4BRAA 4FPAA 4BG9A 5F0XA 3VETA 1NGDA 4H0TB 3UKUA 2GTDA 4CZLA 3UKUB 3LDPA 1YVNA 1S3XA 2HMPA 3ZX3A 5AZIA 5B8HA 4YDUA 4CD1A 3J8AA 1BWFO 4FWKA 4EHTA 4FOIA 4BQZA 2A41A 5AQUA 5AQJA 4FPBA 3ZEUA 3C7NA 3C7NB 4FSVA 2A40A 4B1UB 1WUAA 5AFUH 5TKYA 4ISEA 2VWBA 1IG8A 1HUXA 1X3NA 2NZTA 2AP1A 1DGKN 3CI5A 1QHAA 1JCFA 2IVOA 3H46O 4B1XB 4BRPA 3CQXA 2V52B 3R6MA 3DAWA 3M1FA 4K25A 2Q36A 3MDQA 4A2BA 2FSKA 3WXIA 3EKUA 3U9ZA 4BVPA 4A62A 3TPQA 5ADXA 3FZLA 1HKGA 2E88A 3BUZB 4NO7A 2FSJA 5LJVA 1NGHA 4JN4A 5AQOA 1D4XA 4GY2B 3VENA 2D4WA 4F9OA 4BRIA 3LM9A 3DWLA 4PL7A 4JD2B 1EQYA 5AQMA 5AQSA 3O6WA 2UYTA 4PL8A 4K42A 4BC4A 1ZBSA 2QWRA 2CH6A 1SZ2A 1BA0A 3VF4A 3CJ1A 3LDOA 2QWLA 2QM1A 1Y64A 4BRMA 4BRKA 2P9UA 3P4IA 5AZJA 4H5VA 2P9KB 1X9JA 3HI0A 3BF1A 5ELZA 2QWPA 5FPNA 5AQIA 1C0GA 3U4LA 5AQNA 5FPMA 3H3OB 3CJ9A 4IO8A 2QW9A 3DXKA 3DXKB 3MMVA 5AQQA 3QFUA 2Q0UA 2P9NB 3I33A 3QBWA 4K43A 4CZHA 3ATUA 1ATNA 1NMDA 3LDLA 2GUPA 5JICA 3UKRB 3O1BA 3WEEB 2VCPA 4WYBA 2YHWA 4CZKA 2P9PA 3DJCA 4B1YB 3VGMA 3M6GA 4H0YB 1NBWA 1Z05A 4WQ5C 3WT0A 4WQ4C 1GLJO 4FWNA 1NGBA 3QICA 1Z6RA 2E1ZA 1S22A 2P9LA 3O80A 3MCPA 4O8KA 2FF3B 4CJ7A 3LM2A 3KHYA 4CZEA 2P9IA 2YHYA 3D2EA 2P9IB 5BREA 1LCUA 4H0VB 3FZMA 3S41A 3VEXA 3VF2A 4BQLA 4BC3A 4DB3A 3ENHA 3ZETA 3GBTA 1YAGA 3L6QA 4FWQA 3DXMB 3HSCA 3MN6A 4QS7A 2PBDA 4I6MB 2DPNA 1XUPO 2QXLA 2GWJA 3FLCO 4FWPA 3B8AX 4L3QA 4CBUA 1KAXA 1E4FT 1ATRA 2YCHA 1ATSA 2D0OA 5E26A 1P8ZA 4BRGA 4BR7A 1HJOA 3CHWA 4H0XB 4H0PA 4FOEA 1GLBG 3VEYA 4XH1A 3ZX0A 1NGCA 4JHDA 5LY3A 1DEJA 4JHDB 2ASOA 3VERA 2E2NA 1U2VA 1U2VB 1JCGA 3WXJA 4PKIA 4BR5A 1GLAG 5ADXH 3MN7A 5JMVA 1MA9B 1CZAN 3CIPA 3H45C 1R59O 3CETA 1E4GT 2IVNA 4IWVA 4Z94A 1QZ6A 4PKGA 3CJ7A 1RDWX 2A6AA 1DKGD 1TUYA 2J4RA 5BRFA 4E1JA 1T6CA 4QS8A 1KXPA 4HTLA 5BPNA 3ENOA 3IMXA 2H3GX 3A5MC 3JS6A 5FPEA 1GLEG 3D7EO 1BO5O 4JD2A 1NGIA 1KAYA 4AM6A 2Q1NA 4NB4A 2A42A 3LL3A 4CBXA 3FZKA 4H0OA 4AM7A 3VPZA 2A3ZA 3FFKB 1BA1A 5KQDA 1ZC6A 2QWQA 4Y0WA 4BR4A 2P9KA 3A5OC 4BRDA 1BUPA 3FE1A 1RGIA 2W40A 4BVOA 2EWSA 4MO5A 3G25A 4BGAA 2IVPA 5AQTA 3CERA 2FXUA 4B1WB 3F9MA 3EZWA 4BROA 4DQ8A 1BG3A 4EFHA 4B1ZA 3VOVA 3MK6A 2GWKA 2IIRA 3SLCA 2P9NA 1QQNA 4CZMA 3VGKA 1WOQA 4IJAA 1T44A 4BR9A 1TUUA 2W41A 4FWOA 2E20A 3UKRA 2CH5A 2P9SB 3L0QA 2QWNA 2YHXA 3WEEA 4GNIA 5BRDA 1QQOA 1GLCG 3A5LC 5JLFA 3A0IX 1BDGA 3IDHA 4O5FA 1RFQA 5E84A 1TYQA 3I8BA 3AAPA 1TYQB 4EIAA 4JNEA 3JXUA 4H5WA 4FL9A 1V4TA 4DHYA 1NGGA 4IZ9A 1BU6O 3FZFA 3GOIA 3QBXA 3ZX2A 5EOYA 4BG8A 3L4IA 4BC5A 3CJCA 2Q2RA 4EHUA 3O5BA 2AA4A 1ESVA 3R9PA 3O8MA 4FWSA 3AY9A 3WXLA 3BF3A 3HTVA 4C23A 2ZGYA 5AQLA 2HOEA 3IFRA 3ULEB 3GG4A 4CZIA 2E2PA 4BR2A 4H5RA 2FF6A 3DXMA 1NGFA 4CZGA 5AQKA 4FWMA 4BRLA 2CGJA 3QDKA 3EKSA 2OANA 4I6MA 5AQFA 5BPMA 1MWKA 4M63C 3SJHA 5FPDA 2QWMA 3A5NC 3GE1A 2CGKA 3EO3A 2ZGZA 3QB0A 2Q31A 3AARA 1MDUB 2ZF5O 3GL1A 5AQVA 3SMPA 3U9DA 2NLXA 1KAZA 1QQMA 3SK3A 3VESA 5CE3A 3O08A 3WXKA 4HWIA 4BRCA 2CGLA 3H6EA 4CI6A 5AQYA 2D1KA 5I9EB 4CZFA 1HKBA 3VEOA 1HPMA 4DCHA 3C0BA 3M3ZA 1MWMA 2ASMA 4J8FA 4ISFA 4BGBA 5LJWA 1T6DA 4IXCA 5AZIB 4M7YA 4XH5A 5BR9A 1JCEA 3EN9A 1GLFO 4YDUC 2QWOA 3ZEUB 2Q97A 3HBTA 4QS9A 3QMLA 3CJBA 2ZWHA 3LDQA 4RTFD 3LDNA 3TU5A 4JAXA 3VGLA 2D0PA 1J6ZA 4B9QA 3U8XA 4XH4A 5KPTA 1HKCA 1NLVA 2ASPA 4BRQA 3IUCA 1NM1A 2FSNA 5AQHA 5KPZA 4A61A 4BRNA 2BUPA 5AFUA 3QFPA 1XC3A 5BN9A 2E8AA 5EVZA 4RWTA 1HLUA 3H1VX 5AQRA 2A5XA 3MN9A 2ITMA 1IJJA 3O4WA 3D2FA 3OHRA 3D2FB 3R8EA 1LOTB 3ID8A 4MLHA 5EY4A 2E2OA 1GLDG 3H1QA 1ZXOA 4BREA 2GEMA 5AQPA 2VYPA 2V7ZA 3A8YA 3VEVA 2V51B 2PAVA 5BN8A 3UE5A 1NGJA 4EAHD 4K41A 3VF6A 3HM8A 3VEZA 2YJFA 2NRHA 3HZ6A 5AQZA 4H5TA 2E2QA 4FO0A 4CBWA 5AZJB 2P9UB 2P9SA 1K8KA 3WQTA 1K8KB 1YXQA 5BRHA 4WQ5A 3CJAA 4IJNA 4WQ4A 4B1VA 3H3NO 3W3DA 4H03B 3KZBA 4ISGA 1NGAA 5AQXA 2GELA 3WQUA 3GDQA 1C0FA 1G99A 2Q0RA 1SAZA 2WUSA 1BOTO 4MLEA 3CQYA 5AR0A 1YUWA 1QZ5A 1NGEA 4BRHA 4RCHA 4XEIA 5AQWA 1U6ZA 4PKHA 2FLOA 1X3MA 4MO4A 4FWLA 3ATVA 3MN5A 3FR0A 3WUHA 2P9PB 5BPLA 5AQGA 5EXWA 1HX1A 2I7NA 3FGUA 3SMSA 4BR0A 3ULEA 1Q18A 4A2AA 2P9LB 5EX5A 2F9WA 2F9TA 2YJEA 4M7XA 3UB5A 2BTFA 3VEWA 4CZJA 5F1XA 5KQ8A 3D2EB 5JLHA 2I7PA 3BEXA 3EL2A 1NWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4W5OA 4B9LA 4CF2A 1HQEA 5DM7L 3F73A 4H5NA 2YHAA 4LC9B 3O1WA 5GIOA 3HVTA 3G0ZA 4BC2A 4DV7K 4FWRA 3OA9A 4UY8O 4M3UA 4V19S 1U47A 4JKGB 3SYZA 3UKUA 2BGGA 4CZLA 3BY5A 4CHZA 4F4KA 4W5RA 3QNNA 1YVNA 3EYZA 1EWQA 4DTUA 3ZX3A 4JI5K 4PWDA 3J8AA 1EX4A 1Z26A 1EXQA 4MDAA 4EHTA 3ZEUA 2HSTA 4NYFA 4KH4A 1WUAA 2KKZA 1CXQA 1QSSA 4CJSA 3NH1A 1QE1A 1VK0A 2VWBA 4RW4A 3VTHA 4Y1DA 2G8IA 4AH9A 4RG8A 2AP1A 1DGKN 3UIQA 2DFFA 3DOKA 3DRPA 1JCFA 1T05A 2HVIA 3H46O 4DV4K 3ZSOA 3K9JA 3R6MA 1NU0A 3OYAA 4X66K 4JI8K 2Q36A 4A2BA 4DR3K 4G1QA 3EKUA 5C12A 4BVPA 4A62A 1F21A 1FKPA 3BUZB 2F96A 3OS1A 1CZ9A 4DSEA 1NGHA 4GV9A 1LV5A 3SPZA 1YJWN 4JD2B 5AQMA 3O6WA 1NKBA 3L3VA 5M1QA 2QWRA 4E7LA 3VQDA 1VHXA 4OKJA 3HRGA 2YKNA 3OW2M 2O8EA 2KZZA 4QCLA 4BRMA 4BRKA 4LFBK 3P4IA 3K5MA 3VQ7A 2P9KB 3HI0A 3G10A 3OYJA 2O8DB 3BF1A 5ELZA 5AQIA 1EKEA 4JI0K 3IKMA 2HHSA 1W9HA 3H3OB 4IO8A 1SL0A 3SBTA 1HMVA 3DXKB 4BWJA 4ILHA 2GUIA 2P9NB 1ATNA 3LDLA 1RBRA 2VCPA 4IG0A 3SPYA 4CZKA 4M3YA 1C1CA 1NMNA 2I5JA 1GLJO 3THXB 3O80A 3S3OA 2FF3B 3DRSA 3OBWA 5C25A 2F8SA 3KHYA 3D2EA 1JJ2M 2P1JA 4LF5K 1UOCA 1RT6A 3FZMA 3KLGA 4J2BA 3VEXA 3O3FA 5CR4A 2QEXN 3ZETA 5J2NA 1IKYA 1JLAA 3M8PA 4YOVA 3MAQA 4M42A 1J9AA 2NRXA 2HMIA 5M1NA 5J1EA 3KIOA 1W97L 1NOZA 4CFDA 4CBUA 1IBMK 2D0OA 5E26A 2LSNA 1P8ZA 4JK9A 3ZSXA 4Z4HA 3C6HA 3NFAA 4HUGA 1N6QA 3CFOA 4XH1A 3VEYA 3HP9A 3ZX0A 1NGCA 1Q7YO 4B8CA 3VA3A 4O44A 1I39A 1E3MA 3V9ZA 3OYFA 2E2NA 1U2VA 1C0UA 1JCGA 4PKIA 2X6SA 4CGGA 4BR5A 1K9MO 1GLAG 5ADXH 2W6KA 1JLFA 1CZAN 2VWJA 3NDKA 3CMAN 4FJ5A 3CETA 5SWMA 1NK8A 1QZ6A 4KREA 3AA5X 1TUYA 4YHHK 4E1JA 2X74A 1A5XA 1C0TA 2ITGA 1NK5A 3ENOA 4JI6K 1BO5O 3EE9A 4AM6A 3IAYA 4FJIA 2Y1JA 4CESA 4AHSA 1T03A 3Q7CA 2Q1NA 3LL3A 4CBXA 4FLYA 4H0OA 3QO9A 1OH8A 1BA1A 4Y0WA 2DTUA 4LD0A 4BRDA 1BUPA 1VSLA 2WFBA 1W0HA 4BVOA 1Q82O 2EWSA 4MO5A 2ZJPL 3CERA 1D9DA 1IH7A 3PIPL 4B1ZA 4PUOA 3MK6A 2FBXA 3C65A 4AHUA 1L3SA 4CZMA 1QQNA 3VGKA 4IJAA 3CFRA 4FM1A 2QKKA 4CK1A 1QSYA 3VQPA 1SL1A 3L0QA 3WEEA 4GNIA 5BRDA 3OTOK 1I3AA 5JLFA 3RR8A 4FM2A 1XHXA 3L3UA 4ZHRA 4O5FA 3AAPA 4JI1K 4FLTA 4DG1A 1V4TA 2UUAK 4EP5A 3ASMA 3GOIA 2ZJQL 3CJCA 1KD1O 3O5BA 4E7KA 4YOTA 4CGDA 3R9PA 3ENBA 3O8MA 1YTUA 4JYAK 3ULEB 3GG4A 3T19A 3CPEA 4JKFA 5AQKA 4BRLA 2CGJA 2VWKA 3QETA 5AQFA 4I2PA 4A5AA 5M1FA 3H08A 5M1PA 3QEWA 4HUEA 2E4LA 5CZ2A 3U3YA 2CGKA 4E3SA 1VQLN 2YNGA 2W00A 1T8EA 1MDUB 3CMEN 3RTVA 1VSEA 1WSJA 3DLKA 3CPWM 2NLXA 4Z4IA 4N56A 1KAZA 4BRCA 2KFZA 1OH6A 5LMUK 3H6EA 4E7IA 4BY9C 4BE2A 1TL3A 3MWPA 3OYDA 2ASMA 2P5OA 3ZYYX 3K9KA 4DQSA 5LJWA 1T6DA 1VQ6N 1ASWA 3LZIA 3OVNA 4E89A 3I8DA 5KRTA 3EN9A 3K5OA 3ZSQA 1TAUA 2QWOA 3ZEUB 2Q97A 1CZBA 3QMLA 3CJBA 1ZBLA 3F9KA 5FDLA 1TL1A 4CECA 5EU7A 2OPQA 4JS5A 4YFUA 1JXBA 3AVKA 4BRQA 3IUCA 2W6LA 3I56N 5AFUA 3TTDA 2IDOA 3TSQA 4FVMA 3ZT2A 3SQ2A 3P39A 4A57A 3WXMB 1TVRA 2A5XA 2ITMA 4N5SA 1SKWA 2NNWA 3OHRA 3D2FB 2OCEA 2ZD1A 5GAGP 1HNXK 3KD5E 4B08A 3H1QA 4YY3K 3NAEA 3V1RA 1XNQK 4Q0BA 4JK7A 2V7ZA 3VEVA 2V51B 5BN8A 1YJ9N 3PO5A 1HNIA 5HRNA 4LSNA 4J2EA 3HM8A 4CJWA 4Z0UA 2O8EB 1TAQA 3HZ6A 4H5TA 2KW4A 4N41A 5MLCQ 4BEBA 1FK9A 3P31A 1K8KB 4NXMK 3BDPA 3SAGA 3HP6A 2HHVA 4JKCA 4BE0A 3GDQA 2Q0RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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