2PBDA

Ternary complex of profilin-actin with the poly-pro-gab domain of vasp*
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 120
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2pbdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pbdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pbdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pbdA04
3H46O 5E26A 1GLCG 5AQXA 2VWBA 3KHYA 3H45C 5ELZA 4IO8A 3LM9A 3BP8A 2EWSA 4MO4A 1MWKA 4F9OA 5BRHA 1T6DA 4JHDA 3BUZB 4FWMA 2A40A 5AQMA 4BRDA 4CBXA 4H5NA 4BQZA 4JHDB 3WEEA 2HF3A 1V4TA 4BR0A 4A62A 2CGKA 1TYQA 1NGEA 2IVPA 3SMPA 1TYQB 2Q2RA 4K43A 2GUPA 1GLLO 1BDGA 3VENA 2PAVA 1J6ZA 1CZAN 2P9SA 4PKHA 1MA9B 3D2EA 4BG9A 3WQUA 3R6MA 2YJEA 3HM8A 4CZMA 1ATNA 2P9SB 2E1ZA 3D2EB 3M6GA 3HSCA 1NWKA 3O80A 3A5MC 3UB5A 4BGBA 1ZC6A 3CI5A 2OANA 1KAYA 2V7ZA 3I33A 5AQQA 4EHUA 4ISEA 3AARA 2P9PA 3O08A 4XH4A 3TU5A 3CJCA 4K42A 1MDUB 1GLJO 2QWQA 1WOQA 3ENOA 3D2FA 5FPEA 5TKYA 2P9PB 4RTFD 1GLBG 2Q1NA 4B9QA 3UKRA 3D2FB 4H0XB 1JCGA 3EKUA 3LDPA 1HJOA 1ATSA 1QQOA 5BPLA 2HF4A 3MN5A 4BRKA 4LC9B 1NGGA 1IJJA 4O8KA 5AZJA 4YDUA 4BC4A 2ZGZA 4FPBA 3LDLA 1MWMA 1U6ZA 2IVOA 2CH6A 3VPZA 4PKGA 4DQ8A 2ZWHA 3ID8A 2QWMA 3ATVA 1E4GT 2I7NA 1RDWX 5E84A 5AQOA 4M7YA 4CZHA 2E2NA 1HUXA 3AAPA 4BRGA 1Y64A 1HKBA 1SZ2A 3BF1A 3R8EA 2FF3B 1NGDA 2NRHA 3EO3A 2I7PA 2J4RA 5AQJA 4B1VA 2WUSA 4BREA 2QWRA 4EAHD 4BR4A 3AY9A 3U9ZA 1NGCA 2FSNA 2GEMA 3HBTA 1C0FA 3GOIA 5EY4A 3W3DA 2ASPA 3VF2A 4YDUC 1QQNA 3M1FA 4FWNA 3H6EA 5AQGA 5AQWA 2IIRA 3ENHA 4MLEA 4BRIA 3ULEB 3QFUA 2VYPA 1YXQA 2F9TA 1KXPA 3HZ6A 1G99A 4H5TA 4RCHA 3S41A 4MO5A 2PBDA 2HMPA 4B1YB 1ZBSA 4FPAA 1QQMA 4CD1A 2CH5A 2A3ZA 3VEVA 1NGIA 1OKJA 1ESVA 1WUAA 4JN4A 1BU6O 4L3QA 4QS8A 4BRHA 2P9LA 2D1KA 3LDQA 4C23A 1BA1A 2QW9A 3ATUA 4IJNA 4H0OA 4K25A 2P9LB 2QWOA 5EXWA 4CBUA 3WQTA 3F9MA 3TPQA 1BUPA 2A5XA 1NGFA 2KHOA 5JMVA 2AP1A 3WXLA 3CJAA 3FGUA 1T6CA 5KPZA 3QFPA 3U8XA 5AQTA 3HTVA 3I8BA 5AQRA 4JNEA 1DEJA 3L4IA 2Q97A 5AQKA 3FFKB 1NGBA 1NBWA 4FSVA 3VEYA 2A42A 3WT0A 5KQ8A 4B1UB 4WQ5A 3QMLA 5BN9A 5B8HA 4BROA 2E2OA 2QWLA 4IXCA 3O1WA 3GE1A 2ITMA 2A6AA 1RGIA 1YVNA 2YHWA 3CJ1A 3FZLA 3O4WA 4NO7A 3DXMA 4BC3A 3ZX0A 1QZ6A 3LDNA 5JLHA 5LY3A 5AQIA 2QXLA 3DXMB 1BG3A 1XC3A 3A0IX 1Z05A 2NLXA 1U2VB 4FWQA 5BPMA 3VGMA 1GLEG 3ZETA 4CJ7A 4FOEA 3WXJA 1X3MA 4BGAA 4FO0A 3BF3A 3EZWA 1YAGA 4HTLA 4BVPA 3ZETB 3VOVA 1DKGD 4ISGA 3LDOA 3C7NA 4BRPA 4QS9A 4DCHA 1NMDA 3IFRA 5BRFA 3O1BA 3C7NB 2D4WA 3EN9A 3DJCA 2Q0UA 3A5OC 4BR9A 4BVOA 4JAXA 3UKUB 5AQVA 3U9DA 3MN9A 4M7XA 3BEXA 4IWVA 2V51B 2V52B 2P9NA 4Z94A 1X3NA 4EFHA 3QBXA 3VERA 1ATRA 1HKCA 2GTDA 4GNIA 4NB4A 2P9NB 2YJFA 4H0PA 4CZGA 2ZGYA 1RFQA 4PL8A 2FLOA 4XH1A 4BRLA 4H5WA 4DHYA 3U4LA 4I6MB 1C0GA 4MLHA 2E8AA 1GLFO 4Y0WA 2YI1A 3JXUA 1Z6RA 4GY2B 1XQSC 1K8KA 2E88A 2YHYA 3VGLA 3JS6A 3QB0A 4CZLA 4DB3A 1H1VA 1K8KB 2A41A 1DGKN 3ULEA 2YHXA 2P9UB 3O5BA 3FZHA 1HKGA 3J8AA 4BG8A 5FPMA 4XH5A 3GDQA 3VGKA 3CERA 1GLDG 3WXKA 4AM7A 1E4FT 5FPDA 4B1XB 3SLCA 1LCUA 3VEXA 5AFUA 5LJVA 4FWKA 4PL7A 2V7YA 1QZ5A 4FWSA 3A8YA 2QM1A 4CZIA 4ISFA 3MK6A 1IG8A 3CJBA 5F1XA 5ADXA 4HWIA 2P9KA 5KPRA 4CZJA 5CE3A 3D7EO 3O8MA 4H03B 2BTFA 4FWRA 1KAXA 2P9KB 2W40A 1BA0A 3HI0A 4JD2A 3SK3A 3L6QA 3ZX3A 2CGLA 1HX1A 3VF4A 3DAWA 4JD2B 3B8AX 2FXUA 5AQFA 4BC5A 2DPNA 5F2RA 4EIAA 3VEZA 3WUHA 1S22A 3ZEUB 4FL9A 2D0OA 3VF6A 4AM6A 3KVGA 5AQNA 1XUPO 4H5VA 3KZBA 1GLAG 3CQYA 3CETA 4K41A 2H3GX 4BRCA 3GG4A 4CZFA 5AQYA 5AR0A 3CIPA 1QHAA 5JLFA 2E1YA 1JCEA 4WQ4A 3WEEB 4BR5A 5AQLA 4CI6A 3H1VX 4BRFA 4XEIA 4QS7A 3FR0A 3IMXA 3QDKA 1U2VA 1Q18A 1R59O 5BREA 4CZKA 3MCPA 4RWTA 1LOTB 4E1JA 2GELA 2QWPA 3CJ7A 3R9PA 2ASOA 4B1ZA 3VETA 1T44A 1HPMA 5AQHA 3FZMA 1HLUA 2E2PA 3H1QA 2FSKA 1TUYA 3L0QA 3P4IA 4H0TB 4IZ9A 5AFUH 2UYTA 4BQLA 4CD3A 2Q0RA 3FZFA 3AAQA 5FPNA 3EL2A 3W0LA 2YCHA 4WQ5C 4B1WB 3FE1A 4O5FA 3UKUA 5ADXH 5F0XA 1X9JA 4EHTA 3UE5A 3A5NC 5BR9A 1EQYA 3ZX2A 5EX5A 2CGJA 3IUCA 3QBWA 4IJAA 3MN6A 1JCFA 1NM1A 1D4XA 3VEWA 5AQZA 5KQDA 4BR2A 5AQUA 2NZTA 3H3NO 4WQ4C 2BUPA 3LL3A 3IDHA 5BN8A 3UKRB 4BR7A 1ZXOA 4BRAA 4KBOA 4A2AA 2FSJA 3DWLA 4BC2A 4I6MA 4CBWA 3FLCO 4A61A 4BRMA 3QICA 3SJHA 5AZIA 2D0PA 3O6WA 4WYBA 2AA4A 5AZJB 2Q36A 5EVZA 3CQXA 2ASMA 1KAZA 5AQSA 5AZIB 3FZKA 2F9WA 1NLVA 2P9UA 2ZF5O 2P9IA 5LJWA 5EOYA 3RSEA 5BRDA 3GL1A 5JICA 4BRQA 2Q31A 3G25A 2P9IB 3H3OB 3RSEB 4CZEA 5BPNA 2IVNA 1S3XA 4M63C 3WXIA 1NGJA 3OHRA 3MMVA 4FWLA 5I9EB 4H0YB 1SQKA 3M3ZA 3DXKA 4J8FA 2W41A 3MN7A 5AQPA 4A2BA 2VCPA 2QWNA 3MDQA 4FWPA 3VEOA 4FOIA 4H5RA 4BRNA 1YUWA 3DXKB 1NGAA 1V4SA 3C0BA 2E20A 2GWKA 1NGHA 3CHWA 3EKSA 3SMSA 4H0VB 3CJ9A 4FWOA 1TUUA 1P8ZA 1SAZA 2GWJA 1BWFO 2FF6A 3GBTA 1BOTO 4PKIA 2HOEA 3A5LC 3LM2A 2E2QA 5KPTA 3ZEUA 1BO5O 3VESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVGA 5E26A 1GLCG 1W97L 4B3RK 4BE1A 4O4GA 5ELZA 2G8VA 4LFBK 3S5TA 3LM9A 4KRFA 2EWSA 4MO4A 3M8RA 3WXMB 5BRHA 1C6VA 1T6DA 2ZE2A 3OS2A 2A40A 3K5OA 4H5NA 4F3TA 4CGDA 1Z26A 2D0CA 5LMUK 1V4TA 1M90O 2P51A 4E19A 2CGKA 1RT2A 2W00A 1VQPN 5K14A 2I5JA 2IVPA 4OPJA 3HK2A 4K43A 1A5XA 2GV9A 4CHPA 1NK6A 2RF2A 2PAVA 4KH4A 5C15A 1CZAN 4PKHA 4JI5K 2DY4A 3HPHA 3R6MA 4CHYA 4DQRA 2KZZA 4CJSA 3DLEA 5KGWA 3M8SA 1DT9A 3H08A 1WAFA 3NF7A 2BANA 3I33A 5AQQA 4EHUA 4V19S 3CJCA 1QQCA 4K42A 4F8RA 1MDUB 2QWQA 1WOQA 1YTAA 3OYAA 3CPEA 3P83D 3KKSA 2Q1NA 4DR6K 3UKRA 4J2DA 4B3TK 4C8KA 3EKUA 3OY9A 3SNNA 3ZSVA 2DFEA 5CYQA 1IV0A 4IFEA 5BR8K 1NGGA 1IJJA 3OYCA 3SPYA 4JKGB 3AVJA 3L4QA 5AZJA 4YOYA 4LF7K 5HOOA 1VAZA 4DLEA 4AHSA 1QSSA 1WSJA 5D3GA 1JLCA 1D9FA 3ATVA 4JKAA 1NJYA 2ATQA 5E84A 4CZHA 1HUXA 3AAPA 4BRGA 5M1OA 4HTUA 4CJ5A 2G8UA 4DQSA 2NRHA 4B3OA 3HP9A 2J4RA 5AQJA 4C1NK 3J81O 4BREA 3QNNA 3HJFA 3VQDA 1LW0A 2O8FA 3KK3A 2XHBA 3V9ZA 4OPHA 3HBTA 3N4QA 3GOIA 2O8FB 1BISA 4DFKA 2X6SA 5EY4A 4JRPA 2O8DB 1NK5A 3L3UA 4NYFA 3F73A 1IO2A 1JLFA 2ASPA 3MXIA 4Z4EA 4CW7B 1RDUA 3M1FA 1VQ5N 5AQWA 2YHAA 3ZT2A 1NU0A 1ASUA 1DTQA 4BRIA 3K58A 3KK1A 1RTDA 2F9TA 1B9DA 4FLZA 1U04A 4YOVA 1D9DA 1S1WA 4GVEA 2PBDA 3QETA 1YITN 1VSEA 1M1KO 3PO5A 3K9JA 4DV6K 3PY8A 1NGIA 1GOCA 4BRHA 2P9LA 3J7ZO 3AVLA 3LDQA 2QW9A 1O1WA 4IJNA 4H0OA 2P9LB 4DU3A 4CBUA 3WQTA 3F9MA 4I2PA 4LF6K 3VQ9A 4E7KA 5FRNA 2KHOA 3V4IA 2AP1A 1QHTA 3CJAA 3QFPA 4NLCA 1KVAA 3NHGA 1VSIA 3I8BA 4ELVA 2RKIA 4Z4IA 1VSFA 3OYFA 4TSXA 1UWBA 2OPPA 5DMRA 3FFKB 1NGBA 4CEQA 4B1UB 4NXNK 1C1AA 4KHNA 4OLBA 2W42A 4E72A 2F7TA 5M1PA 4BROA 3B6OA 1ASWA 1XWLA 4CIGA 4KI6A 1OH6A 4KKOA 3O9TA 2ITMA 4DSEA 1EWRA 2X6NA 2YHWA 1KLMA 3KLIA 1KCFA 4NO7A 3DXMA 1RTIA 3ZX0A 5KRSA 4M3YA 3LDNA 4C8NA 5JLHA 1F21A 3KK7A 5AQIA 5HRSA 4H4MA 3DXMB 1ZBFA 1BG3A 2VQFK 1D5AA 1ZBUA 1U2VB 3SQ1A 1RNHA 3CD6N 3MECA 4FOEA 3WXJA 4E7IA 2HMIA 4W5QA 3EZWA 4HTLA 1YAGA 4BVPA 4E1MA 1LV5A 3LAMA 1NK0A 5GADP 4M3UA 4A5BA 3DM2A 1YJWN 4FJGA 3EN9A 4LH4A 4LD0A 4BVOA 1W7AA 3J7YP 3UKUB 3U9DA 4YOUA 2UUCK 3BEXA 4IWVA 3RR8A 4DV2K 4Z94A 4ID5A 3MXJA 1X3NA 4KTZA 3QBXA 2JWKA 4CJ3A 1BIUA 1ATRA 3O3HA 1W2BM 1IKWA 3A2FA 1RBSA 2JGUA 4KHSA 2FLOA 1LWCA 3CQ8A 4BRLA 4DV1K 3AO5A 2IC3A 4I6MB 1GOAA 3JXUA 4KHYA 4GY2B 3RWUA 5FROA 1K8KA 2YHYA 4X65K 3JS6A 1B92A 3QB0A 5KI6A 3RMDA 1K8KB 2A41A 1DGKN 3ULEA 3VQCA 3O3GA 2XY7A 5CY4A 3FZHA 1HKGA 4CEAA 3TAQA 3VGKA 2NRWA 4E0DA 4AM7A 5FPDA 2Y1IA 3NH2A 4FJNA 4PL7A 3ASMA 1QZ5A 3KK2A 2QM1A 1VQNN 4ISFA 4CJQA 3DOLA 1JLBA 3THWA 4DKWA 3PIPL 1S5JA 2G8KA 2P9KA 4O0JA 3M5RA 4H03B 3THWB 1KAXA 2P9KB 2HVIA 2W40A 1BA0A 3HI0A 4Z0UA 4JD2A 3ZX3A 3L6QA 3AO1A 2IOCA 3LWMA 4JD2B 1VRUA 4DTOA 5AQFA 3HSTB 4BC5A 4CFDA 2DPNA 3L2VA 3KLGA 3SV4A 1Q7YO 3VEZA 4KB1A 3WUHA 4CGFA 5MLCQ 3K5LA 2W6KA 3VF6A 3EZ5A 1LW2A 4H5VA 4CFBA 4DTPA 3QEWA 3CETA 5M1KA 4KO0A 2H3GX 1ZYQA 4CZFA 3GG4A 1WLJA 3HP6A 3P39A 2ZJRL 3PV8A 3AA2A 4WQ4A 3IG1A 3OVNA 2E6MA 3ZSRA 3QESA 3C6TA 3OA9A 4BE7B 2FBYA 4JLHA 1NK8A 3NMUA 4PA1A 2QWPA 3R9PA 3VETA 1HPMA 3FZMA 3WNGA 4DTMA 5AFUH 3THYA 3CXCM 3C6UA 5FPNA 4IKFA 1HNZK 1BI4A 3Q7CA 2HHQA 3THYB 2D5RA 3FE1A 4O5FA 5F0XA 1X9JA 4EHTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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