2PBDA

Ternary complex of profilin-actin with the poly-pro-gab domain of vasp*
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis for the recruitment of profilin-actin complexes during filament elongation by Ena/VASP
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural protein
total genus 120
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2pbdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pbdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2pbdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2pbdA04
4WQ4A 3LDPA 5BRHA 3U9DA 3LL3A 3SMPA 1NGAA 2CH5A 1D4XA 3BF1A 1BU6O 4I6MB 3VF6A 3WT0A 3MN7A 1ATSA 3A5MC 4HTLA 3UKRA 2QWRA 3MCPA 1HKGA 1E4FT 4CZKA 1X9JA 1YUWA 3H46O 3M3ZA 1XQSC 2ASPA 5JLHA 3O6WA 3ZEUA 4CZJA 1RFQA 4MLEA 4FWKA 1NGDA 1QQMA 3CJCA 4ISEA 4B1XB 2ZGZA 3QBWA 2P9PA 2V7YA 4H0VB 2E2OA 2QWPA 4K25A 4F9OA 2Q97A 1HKBA 2VWBA 3O5BA 5AQXA 1QQNA 5AQFA 3ZX0A 4H0TB 4WQ5A 3ENHA 1U6ZA 4FSVA 3SK3A 3DXKA 3HTVA 3M6GA 1J6ZA 4BRKA 5AZIB 5AQWA 1BO5O 2P9IB 4FWOA 3RSEA 3VGKA 2Q1NA 5AQMA 3UKRB 5EX5A 5AQTA 4KBOA 3P4IA 4K43A 1JCGA 2GEMA 5KQ8A 3JXUA 1HX1A 3U8XA 1YVNA 5BR9A 1YAGA 5ADXH 4H0XB 3QFUA 3ZEUB 1R59O 1BDGA 4XH5A 5F0XA 1JCEA 2CGLA 4WQ4C 4BRNA 4M7YA 4EHTA 5AQLA 3IMXA 5EOYA 4NB4A 4EFHA 3AAPA 5AFUH 1X3NA 3IDHA 3CQYA 1HJOA 4PKIA 4BR7A 5JMVA 2NRHA 4CD1A 1GLJO 2BTFA 2W41A 1GLEG 2YI1A 2P9NB 1EQYA 4CBWA 2P9LB 3H1VX 4RWTA 2I7NA 2E1YA 4IJNA 2P9SA 3LDOA 5AZJA 2FLOA 4IWVA 1TUYA 1BG3A 4PKHA 3GE1A 3FZHA 3RSEB 2A6AA 5B8HA 1SAZA 3DXMB 4I6MA 5AQYA 2QXLA 4FL9A 1KAXA 3GG4A 4BROA 3H45C 4DHYA 4IJAA 4A61A 5AQGA 5BPLA 3AY9A 1T44A 3MDQA 3JS6A 3ATVA 4M63C 2F9TA 3A5LC 3GOIA 4WQ5C 4A2BA 4CBUA 1RGIA 1GLBG 1V4SA 2QW9A 2UYTA 4H03B 5LY3A 5FPDA 3MN9A 2HMPA 4B1VA 1C0FA 5AQRA 1MA9B 3GDQA 4CZMA 5AQZA 3O80A 3WEEB 1QHAA 1NLVA 1NGJA 1HKCA 2HOEA 1ZC6A 3H1QA 5AQKA 5E26A 4DB3A 4PL8A 2YHXA 3VF4A 3VEWA 1GLDG 1TYQB 1BUPA 5AZIA 3UE5A 1OKJA 4BC4A 2YHWA 2F9WA 4BRQA 1KAYA 2P9IA 3BUZB 5AQUA 3VENA 4FPAA 4FPBA 2A41A 1NGBA 5FPNA 3LM2A 4LC9B 4BC3A 2VYPA 4H5VA 2Q36A 3DWLA 3U4LA 2D1KA 2EWSA 3EN9A 4BRIA 1ZBSA 2P9UB 2A5XA 4BRLA 3KHYA 5FPMA 2ITMA 5FPEA 4O8KA 3ULEB 3A5NC 3EKSA 2CH6A 4BRFA 3QMLA 4FWQA 4BRAA 2E2QA 5BPMA 2E8AA 2E1ZA 2YCHA 5AR0A 3FFKB 3J8AA 4CZEA 1GLFO 5BREA 3VPZA 3FLCO 5AQPA 3EO3A 3F9MA 3VETA 2A42A 5AQSA 4XEIA 2ZWHA 2P9NA 1E4GT 4RTFD 3WXKA 1DGKN 2P9LA 2V51B 3LDQA 3U9ZA 3UB5A 3SLCA 2KHOA 5I9EB 4BRMA 2BUPA 1NGHA 4IZ9A 2PBDA 2FF6A 2E88A 4QS7A 4B1WB 3CETA 4BQLA 3VF2A 2WUSA 4FWLA 2V7ZA 4CZFA 4H5WA 3DXMA 3GBTA 1K8KA 4FOIA 1HUXA 1HLUA 4FOEA 2QWOA 3S41A 4A62A 4CZIA 3H6EA 3R6MA 4HWIA 3CJ7A 3VEZA 3OHRA 4RCHA 3ENOA 3D2EA 3HSCA 1Q18A 2NZTA 1IJJA 2DPNA 5BPNA 2Q0UA 2D0OA 2FXUA 5BRFA 5E84A 4QS8A 1SQKA 4B1YB 4CJ7A 4BG8A 1BA0A 4AM7A 2NLXA 3WQTA 4EAHD 3MMVA 5JLFA 5BN8A 5AQQA 4PL7A 1U2VB 3WEEA 1ATNA 3BF3A 2P9KA 1IG8A 1NM1A 4MO5A 1YXQA 2D4WA 5LJVA 1GLAG 5CE3A 5EVZA 3H3OB 3QBXA 2J4RA 3ATUA 4BC5A 1SZ2A 4BC2A 2I7PA 3HI0A 4K41A 1TYQA 3VEXA 3EL2A 3EKUA 1NGCA 1KXPA 1K8KB 4J8FA 5KPRA 4QS9A 3LDLA 5KQDA 3BEXA 4O5FA 3VGMA 2HF3A 3BP8A 3A8YA 1ATRA 1WOQA 4IXCA 4GY2B 3D2EB 3MN5A 4BR0A 2P9UA 1RDWX 4FO0A 1TUUA 3ULEA 4M7XA 2Q0RA 3HZ6A 3O08A 4L3QA 5AQNA 1MWMA 2FSJA 4Y0WA 1NGIA 2P9KB 5AQJA 4C23A 4PKGA 3TPQA 4GNIA 4EHUA 5AQHA 4CZHA 4FWMA 4FWPA 3VOVA 3D7EO 4ISGA 2VCPA 3EZWA 5EY4A 4BVPA 2IVNA 4JD2B 2IVPA 3GL1A 3A5OC 1G99A 4BR2A 4H5TA 2Q31A 1X3MA 5F2RA 1H1VA 3W0LA 3D2FB 3WXIA 1NGFA 3CERA 5ADXA 4MO4A 3FZLA 3R8EA 3MN6A 3QICA 2QWLA 4BQZA 3FGUA 2GWJA 3FZFA 1NWKA 5AFUA 3L0QA 3SMSA 4BRGA 5EXWA 1KAZA 3UKUB 3TU5A 4XH1A 2FSNA 4JAXA 3L4IA 1BOTO 1V4TA 1Z6RA 3FZKA 4BRCA 3M1FA 1U2VA 4JHDA 3MK6A 1MDUB 3VGLA 4K42A 1T6CA 1Y64A 3WUHA 3DJCA 4BVOA 3ZX3A 3C0BA 1WUAA 5TKYA 2OANA 3ID8A 1NMDA 3H3NO 4Z94A 1QZ6A 5AQVA 4WYBA 4NO7A 3HBTA 2YJEA 3LDNA 3LM9A 4E1JA 3AARA 4JN4A 3QDKA 3R9PA 1LCUA 2QWNA 3CJBA 4H0OA 3CHWA 4BR5A 5F1XA 3C7NA 1MWKA 2E2NA 1XUPO 5KPTA 2PAVA 3VEYA 3I33A 4BREA 3G25A 4H5RA 4BR4A 1JCFA 1NGGA 2GWKA 5LJWA 3L6QA 4CD3A 3WXJA 1ESVA 2YHYA 4BRPA 3O8MA 3CQXA 5KPZA 4BR9A 4JHDB 2H3GX 1NBWA 1QQOA 5AQIA 3W3DA 2AA4A 3KZBA 3FE1A 3ZETA 1C0GA 2A40A 1DEJA 2GELA 3I8BA 4YDUA 5BRDA 4FWNA 4IO8A 1XC3A 2E20A 3CJ1A 3O1BA 2A3ZA 1T6DA 4BGBA 4ISFA 2Q2RA 2QWMA 3WXLA 3FR0A 4JD2A 3O4WA 3CJAA 4JNEA 3VEVA 4B1UB 3VESA 2FSKA 3DAWA 2P9PB 4FWSA 2GTDA 3C7NB 4CZGA 3D2FA 2D0PA 2CGJA 3CI5A 5BN9A 2GUPA 4AM6A 2E2PA 2IIRA 2AP1A 3DXKB 1S3XA 4BRDA 1HPMA 1NGEA 5JICA 2ASMA 3UKUA 4H5NA 4CZLA 3FZMA 3IFRA 3VERA 3HM8A 2YJFA 3IUCA 2QM1A 2ZGYA 3QFPA 3SJHA 3QB0A 3B8AX 2QWQA 3ZETB 4B9QA 1GLCG 1S22A 1BA1A 4H0YB 1GLLO 4BGAA 1DKGD 4FWRA 2ASOA 4CI6A 4XH4A 3CIPA 1P8ZA 3ZX2A 3CJ9A 2HF4A 4B1ZA 4H0PA 5AQOA 3AAQA 1CZAN 2ZF5O 4MLHA 4CBXA 1Z05A 1LOTB 2IVOA 4DQ8A 3A0IX 1BWFO 2V52B 3WQUA 2FF3B 4DCHA 4EIAA 5ELZA 2W40A 3VEOA 1QZ5A 4A2AA 3O1WA 1ZXOA 4YDUC 4BRHA 4BG9A 2CGKA 2P9SB 3KVGA 5AZJB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JI7K 3LL3A 3OBWA 2IGIA 4CFCA 4I6MB 4Q0BA 4ILJA 4HTLA 1KVBA 4LSLA 4AHTA 1E4FT 1XI1A 1YUWA 3H46O 4OKJA 1I39A 2XY5A 2ETJA 2ASPA 4U7BA 1HPZA 2RKIA 3EE9A 2F96A 4CZJA 1DT9A 4OPKA 4CIGA 4JEPA 1O13A 4FJ8A 4DTSA 1NGDA 3SPYA 3AO3A 2QKBA 3AVFA 4B1XB 2ZGZA 4BEBA 3IG1A 1IBLK 2YHAA 3NDKA 3V4IA 2V7YA 4H0VB 2NNWA 3OY9A 4K0KK 4FVUA 1WNSA 1QQNA 1QSYA 4BE2A 4H0TB 4WQ5A 1UAXA 3DXKA 4E7HA 3HJFA 2JWLA 3NAEA 5AZIB 1RTJA 4CE9A 3HVRA 4KI6A 4DR6K 1IBMK 5AQMA 5EX5A 1VRUA 2F4VK 5LMNK 1TKDA 2GEMA 3VA0A 3AVIA 3HP6A 1HX1A 4WCEL 3K2PA 4KHSA 1YVNA 1TK0A 3ZEUB 4CJFA 1R59O 4JLHA 2HHHK 4BRNA 4WQ4C 4EHTA 4GKJK 1RDUA 4OVLA 5EOYA 4C1NK 3EYZA 1M90O 4PWDA 5EU7A 3VQ9A 3IDHA 1FJGK 3OA9A 4BE7B 2NRHA 3ID6A 2VWKA 3C65A 1GLEG 2KZZA 3NMUA 2YI1A 1EQYA 5FDLA 3O3FA 1FK9A 3K5MA 2W6LA 4F3OA 4EP5A 4RWTA 1NJYA 1SKSA 2I7NA 2OTJN 3CFRA 2P9SA 2NRWA 4K8ZA 3NH0A 4JI0K 1TUYA 3MAQA 3RR8A 1BQMA 4DQRA 1IKYA 1WAJA 3RSEB 3CCVN 1SAZA 4FK0A 1VRTA 4FL9A 1JLQA 1ZBFA 4CJ4A 1RT1A 4BDPA 4IJAA 4HCCA 4R79A 5SWMA 3J7AP 1OH5A 3TTCA 5BPLA 1YVUA 3JS6A 4M63C 4GMJB 4CBUA 4RG8A 2KTQA 2UYTA 4Z4IA 3CCEN 5KGXA 2I5JA 1C0FA 3L2RA 1MA9B 2PY5A 2FBXA 3WEEB 4YY3K 3N4QA 1W2BM 4KI4A 1RDBA 2G8FA 3NVKA 3VQ8A 1HKCA 3AVBA 4GKKK 5M1NA 4JRQA 4PL8A 2RE2A 4FW1A 1XHZA 3VEWA 3UE5A 1OKJA 3AA3A 2F9WA 4BRQA 1KAYA 4FPBA 5FPNA 3LM2A 3K5LA 1WSEA 3KJVA 4C1NI 2D1KA 2EWSA 4R5PA 5E41A 4C8MA 4O0IA 1IH7A 2P1JA 4BRLA 3HPGA 2PYJA 3U6FA 1JL2A 1BGXT 5JVHL 4B3SK 4BRFA 4Y1CA 3TAGA 1RT5A 5BPMA 3KLHA 2BANA 2E8AA 1A5XA 1RNHA 4FZYA 3J8AA 4CZEA 5BREA 1YI2N 3DMJA 5AQPA 1VSIA 2ZWHA 5HBMA 2UU9K 3BDPA 3U9ZA 3LDQA 2V51B 4ILHA 5J1EA 4BRMA 4IZ9A 2IAJA 2V7ZA 3GBTA 3HO1A 1HLUA 2XRIA 3S41A 4DTUA 4OO1J 1VQ4N 1XNRK 4DTOA 4WFNL 3CJ7A 1YIJN 3VEZA 1KD1O 4RCHA 3ENOA 3HSCA 1Q18A 2NZTA 1IJJA 1DLOA 2IDOA 5BPNA 4DTRA 2XY6A 2Q0UA 1S72N 4QS8A 3SAFA 3AVKA 4CJ7A 4BG8A 3NGZA 1L3TA 1BA0A 4AM7A 3WQTA 4FLTA 3T7ZA 3EY1A 5AQQA 4PL7A 5BR8K 4CGJA 4CW7B 2KKZA 3K9KA 1EWQA 3NH2A 2D4WA 1K8AO 5LJVA 3QBXA 3NCIA 4DSEA 2HHIA 1B92A 3ENBA 3OYDA 2BDPA 2NUBA 1NGCA 1RDAA 1KXPA 5K14A 3AV9A 3RTVA 3BEXA 3KLGA 3A8YA 4B3MK 4JKDA 1FXXA 3DLHA 4YOUA 4KH6A 2OZMA 2P9UA 3QIOA 4A57A 2DFEA 2BGGA 2HBKA 2WTUA 4I2QA 4KV8A 4C8KA 1HNWK 5A2QO 1EWRA 3RRGA 1IKWA 1QQCA 1NKEA 3HPOA 3OS2A 1RT6A 4C23A 3TPQA 4EHUA 2YHBA 1HNZK 3B6PA 3I8DA 4GV9A 4DFMA 4BVPA 2IVPA 1S5JA 3LAKA 1JLBA 4JKGB 4BR2A 1IO2A 4Z4FA 4DQIA 3SYZA 4FLZA 3WXIA 1NGFA 3LZJA 5ADXA 1IKXA 4MO4A 1JLFA 3MN6A 2E5LK 2QWLA 1VSDA 3ZSOA 2EHGA 3D45A 3FZFA 4AHSA 1QVFM 3SMSA 1UWBA 4O44A 4B9NA 1B9DA 2HHSA 4CK2A 3P38A 3RRHA 3LAMA 3OYFA 1VQ6N 1J54A 3ULDA 4K8XA 4M3TA 4JV5K 3HVTA 4K42A 3ZSVA 3E1YA 2VG6A 4JKCA 3HM9A 3WUHA 3VQ6A 3C0BA 3ID8A 1NMDA 1NJZA 1QZ6A 1QE1A 4DS5A 2HHUA 3LPUA 5LMUK 4E1JA 3AARA 4JN4A 3OW2M 4B9TA 3DLGA 3KK3A 1TVRA 2QWNA 1RBUA 3CJBA 2JWKA 1TK8A 2E4LA 4F8RA 1S6QA 3C7NA 4KHNA 1HNIA 1L3SA 1XUPO 1CXQA 5KPTA 4JI4K 4AF1A 4FVMA 3AVMA 1NGGA 3DI6A 4ELVA 4CD3A 1ESVA 2YHYA 3OJSA 1NG9A 1KTQA 2YV0X 3O9RA 3VN5A 3CQXA 3PSFA 3J80O 1NBWA 4AHRA 4W5OA 1JLEA 4DTXA 1C0GA 4FLYA 3MEGA 3K5OA 5CHIA 2HB5A 2RF2A 3TANA 4DV0K 1VQON 4FWNA 1WBBA 4OLBA 4I9QA 4ISFA 2UUCK 3NGYA 4DR5K 4O5BA 3VESA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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