3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/protein binding
molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
2A40A 4H5TA 3LM9A 3CETA 3VEYA 3EZWA 5AQGA 3DXMB 1ATRA 4FL9A 4BRLA 3CJAA 2P9UB 4H5NA 3WUHA 4CZLA 3ULEA 5AQFA 4H0XB 1KXPA 1T6CA 3AY9A 4EFHA 1LCUA 4BR0A 5KPRA 1V4TA 4FWOA 1DKGD 3VF2A 4BRNA 1QQMA 3ZETB 2P9PA 1BU6O 1T6DA 2DPNA 2NRHA 4CZKA 3CJBA 1HJOA 4BROA 1TUUA 3HZ6A 3QFUA 4K41A 4MO5A 5AZJA 3VERA 4K43A 2P9NA 4XH4A 4H5VA 5JMVA 2IVNA 4BRCA 2V7ZA 1BA1A 1GLDG 2Q36A 3D2EB 4BR7A 2Q0RA 2Q0UA 3BF3A 3ZX3A 3FZKA 4PKIA 4AM7A 4A61A 2GEMA 3B8AX 3EKSA 4CZJA 3AAPA 3A5NC 5KQ8A 3MCPA 3J8AA 3DXMA 5AQTA 5AQIA 3R8EA 5AQRA 1BO5O 2QWRA 3BUZB 1V4SA 1EQYA 2E2NA 2FF3B 2P9UA 3H3NO 1U6ZA 3ZX2A 3BEXA 2A5XA 1BUPA 1RDWX 1D4XA 2Q97A 4YDUC 4CZMA 1KAZA 3MDQA 3SMPA 2CH5A 1HX1A 2ITMA 3FZLA 4BGAA 1CZAN 3ZETA 5LJWA 2Q31A 4WQ4A 3RSEA 1NBWA 2HF3A 2QWOA 2P9SB 4QS9A 4BR2A 3WEEB 1ZXOA 1C0GA 4H5RA 4Z94A 3H6EA 1XC3A 3FGUA 5FPDA 2WUSA 3D7EO 5AQSA 4DCHA 2A3ZA 4A62A 3VPZA 2ASMA 4MLHA 2D1KA 3D2FB 3D2EA 3VEXA 4FO0A 3C7NB 1U2VB 2E88A 1NGJA 4FWRA 5TKYA 2V7YA 1NLVA 1NGDA 2P9LB 3VESA 2FSKA 3QMLA 4FOIA 3CIPA 5AR0A 3BP8A 1J6ZA 1QQOA 4FWMA 3WXJA 3QDKA 4EAHD 5KPTA 3IUCA 1IG8A 3CQXA 2P9PB 1JCEA 2QXLA 4IO8A 3SK3A 4B1WB 4ISGA 2QWNA 5I9EB 4CZFA 3W0LA 5BRDA 4BQZA 3G25A 3F9MA 2YHYA 2ZGZA 5AZJB 3U9ZA 5AQXA 4K42A 3O8MA 1JCGA 4CZGA 3U4LA 1ZBSA 2FSJA 1OKJA 3QBXA 2P9SA 3WEEA 5ADXA 4XH1A 1ESVA 1Y64A 4RCHA 1GLFO 3AAQA 2IIRA 4WQ4C 4FWNA 4YDUA 3VF6A 5JLFA 4IXCA 1MWKA 3D2FA 4B1UB 1XQSC 3C7NA 1U2VA 2E2OA 1NGAA 4WQ5C 1TYQB 3DXKA 4BVOA 1K8KB 2P9LA 2UYTA 1HUXA 2NLXA 1R59O 3CJCA 4RTFD 3VEWA 4BC4A 1SAZA 2E1ZA 4ISFA 3LDNA 2J4RA 3R9PA 3FE1A 4Y0WA 4H0TB 1MA9B 5AFUA 2GWJA 4PL7A 3RSEB 1DGKN 4FWLA 4A2AA 3O1BA 4IJAA 4FPBA 3M6GA 2PBDA 4M63C 1ATSA 4DQ8A 3TPQA 2H3GX 1KAXA 5AQKA 3ZEUB 3O08A 4CBWA 1BDGA 5LJVA 5KPZA 1YAGA 3H1VX 2HMPA 1DEJA 2YJEA 3C0BA 3ATUA 5BN8A 5LY3A 3H46O 2VYPA 2VWBA 1NM1A 3UKRB 3CHWA 3MN5A 3ATVA 5AZIB 3HTVA 1TYQA 4BRIA 3MMVA 2A41A 3O1WA 2Q1NA 1K8KA 4PL8A 4HTLA 5ELZA 3FZFA 2P9KB 2CH6A 4DB3A 4JN4A 4RWTA 3FFKB 5AQOA 1NGGA 3GE1A 4IZ9A 5JLHA 4BREA 1BG3A 2GTDA 4BRFA 5BPMA 2QM1A 3HSCA 3OHRA 3VETA 2IVPA 4KBOA 1XUPO 1NGHA 4PKHA 1ZC6A 3QBWA 4WQ5A 2ASOA 3LDLA 4BRHA 4B9QA 1YVNA 4JAXA 4B1VA 1HKGA 2YHXA 3ZEUA 1G99A 3VF4A 1X3NA 3O4WA 3JXUA 4BRPA 4CI6A 2CGKA 2ZGYA 3DXKB 3H1QA 5AQPA 4BGBA 4CJ7A 2E20A 1S22A 4EHUA 2KHOA 5F1XA 1P8ZA 3TU5A 4CZHA 3UKRA 3M1FA 5AZIA 3CQYA 3VGMA 3WQTA 5BN9A 4O8KA 2P9KA 3WXIA 4EIAA 5BRFA 1BA0A 1GLLO 5E84A 3FZHA 5FPEA 4O5FA 4BR5A 3ENHA 2GWKA 4JD2B 2FLOA 4M7YA 3QB0A 1GLEG 1WUAA 1RFQA 5AQLA 1GLCG 2F9TA 3L0QA 1SQKA 1GLAG 4FWSA 3EN9A 5AQVA 1NGBA 3VGLA 4BR4A 4L3QA 4FWKA 4IWVA 2EWSA 4H03B 5AQNA 1JCFA 2AP1A 1HKBA 4H0OA 5AQQA 3CJ9A 5KQDA 2W41A 5F2RA 3KZBA 3L4IA 4IJNA 2YHWA 2P9IA 3VEVA 5EXWA 4BQLA 3IMXA 3CJ1A 3IFRA 1MDUB 1E4GT 1BWFO 4QS7A 1S3XA 3LDPA 2V52B 3UE5A 3CI5A 4H5WA 3LL3A 3EO3A 5EY4A 3VENA 5CE3A 2FXUA 4FSVA 1IJJA 4E1JA 3GOIA 3UB5A 3H45C 2D4WA 5AQJA 5EX5A 4JD2A 4J8FA 3MN9A 3GL1A 4FOEA 4PKGA 1NGEA 3FZMA 4CBXA 4BG9A 1NGFA 1YUWA 3QFPA 3ZX0A 2F9WA 3O80A 1QQNA 1GLJO 2A6AA 4BRQA 3IDHA 3LDQA 3JS6A 4GNIA 1WOQA 4HWIA 3A5OC 3SJHA 4BRDA 2ASPA 3EL2A 1SZ2A 4K25A 1E4FT 4BC3A 2CGJA 1T44A 4JHDB 1RGIA 1HLUA 5B8HA 1YXQA 1Q18A 1KAYA 3KHYA 2QW9A 3I33A 3CERA 3L6QA 3WT0A 4B1YB 5F0XA 3R6MA 2E2QA 3WQUA 4B1ZA 3S41A 4BRKA 3GG4A 4H0VB 4NO7A 2A42A 5FPNA 4H0PA 1X9JA 1ATNA 5BPLA 4BVPA 4CD1A 4AM6A 5ADXH 1BOTO 1TUYA 4MLEA 4BRAA 4CZEA 3HM8A 3UKUB 4QS8A 2Q2RA 3BF1A 3WXKA 4EHTA 2OANA 3AARA 3A8YA 3WXLA 1NMDA 4I6MB 1Z05A 2BUPA 2YCHA 3U9DA 4NB4A 1C0FA 2FF6A 2QWLA 2PAVA 3VEZA 3EKUA 5JICA 4BRGA 3MK6A 5AQUA 3W3DA 3VEOA 1LOTB 4A2BA 2QWPA 5AQWA 4DHYA 2HOEA 2P9IB 2QWQA 2I7NA 3FR0A 4BC5A 3KVGA 4BG8A 2E1YA 4XH5A 2E2PA 4FWQA 2AA4A 4CZIA 5AFUH 1Z6RA 1QZ6A 2V51B 5AQHA 3U8XA 4JHDA 1HKCA 4GY2B 1QZ5A 4ISEA 4WYBA 1NGCA 2GELA 3CJ7A 2NZTA 2I7PA 2E8AA 4H0YB 4LC9B 2W40A 4BRMA 3SMSA 2IVOA 3I8BA 3MN6A 3MN7A 2QWMA 3ULEB 1MWMA 5AQMA 3M3ZA 3FLCO 3ENOA 3O5BA 3GDQA 2D0PA 2YJFA 4CD3A 3O6WA 2BTFA 3LM2A 4FWPA 2GUPA 3H3OB 1NWKA 2ZWHA 2D0OA 4XEIA 5FPMA 4JNEA 3UKUA 3QICA 3A0IX 2ZF5O 2HF4A 2YI1A 3P4IA 4FPAA 4I6MA 4F9OA 4MO4A 3GBTA 5BPNA 5EVZA 4BC2A 3HI0A 2FSNA 5EOYA 3DJCA 2P9NB 5BRHA 1GLBG 1X3MA 5E26A 3SLCA 3LDOA 5AQYA 2VCPA 1NGIA 5BR9A 5AQZA 3DAWA 3A5MC 4B1XB 4BR9A 4C23A 2CGLA 1QHAA 3DWLA 5BREA 1HPMA 3A5LC 3VGKA 3VOVA 4M7XA 3HBTA 1H1VA 3ID8A 4CBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5TA 3LM9A 3CETA 3THVA 1WSIA 1YTUA 2HHWA 1VSKA 3DXMB 1ATRA 3WUHA 2P9UB 3SQ0A 1Q9XA 5AQFA 4C1NK 4H0XB 3E9LA 3K58A 4FJIA 4FWOA 3VF2A 4AHSA 3P5JA 3NH0A 3QNNA 2BDPA 4R79A 2OA8A 2C1GA 3CJBA 4K0KK 2VGMA 3HZ6A 4K41A 4MO5A 4CK3A 2P9NA 3ENBA 4W5RA 2Q36A 4PWDA 4BR7A 2Q0UA 4A59A 3FZKA 4AM7A 1QSLA 5CZ1A 4JI1K 3EKSA 4CZJA 3KLEA 4NYFA 4NCBA 4W5NA 3THWB 1SS6A 5CR4A 3ZCMA 4CJLA 1KSPA 3K9JA 1BO5O 2QWRA 2E2NA 3ZX2A 3H3NO 1T3VA 4IDKA 4LF5K 1BUPA 2W6LA 3CFRA 2Q97A 4FK0A 3T69A 4YDUC 4CZMA 4LFBK 4FJ9A 2WBNA 3CG7A 1RT7A 1RBSA 3C95A 1Q7YO 1FJGK 2ITMA 5LJWA 1CZAN 4OKEA 1VQ7N 1NBWA 2HF3A 3DRSA 3HRGA 3SJJA 4DSIA 4Z94A 1NK7A 1S1XA 5FPDA 3PUFA 3TABA 3SAGA 2ASMA 1UWBA 4DLEA 2D1KA 1G15A 3D2EA 4IG3A 2E88A 1NGJA 2O8BB 1NGDA 3J80O 5GAGP 1NK9A 1VQ9N 3BP8A 3BY5A 3WXJA 1U47A 3QDKA 4GV9A 4LFAK 4FVMA 4YOVA 3TWHA 4NLBA 1SV5A 2KTQA 5KPTA 2QXLA 3KK1A 1C0UA 2G8VA 4CJ3A 1C0MA 2QWNA 4CEBA 3EE8A 3G25A 3ZSZA 2G8IA 3O8MA 3MXJA 3LAKA 1JCGA 4KAZA 1IO2A 3U4LA 1ZBSA 2NRZA 2YNHA 2HHTA 3J7ZO 2O8FB 3CYMA 3T1YK 1RT1A 4RCHA 1N8RO 5EU7A 4I9QA 3AAQA 2FBXA 2IIRA 1RBTA 4FWNA 4YDUA 5HRRA 1HNVA 4KTWA 1MWKA 1Q8IA 3D2FA 5T7BA 4B1UB 1VSIA 4CJWA 1HR0K 4FJHA 3LALA 1ITGA 2D0CA 3O4NA 3DXKA 2P9LA 4IOAL 2HVIA 2YX6A 4RTFD 2BH1A 4ISFA 3LDNA 5HOOA 1ZBFA 2J4RA 1K8AO 3MWPA 4E3SA 3FE1A 3M8RA 3NVKA 1O13A 3PX4A 4DG1A 1ATSA 4ZTJA 4DQ8A 4GMJB 4Q5VA 4JK7A 3OYMA 5AQKA 4GVEA 1RT3A 1DEJA 2YJEA 4HTUA 3SQ1A 1EXQA 3NF9A 1B9DA 3TTFA 2VWBA 1NM1A 4B9NA 3SQ2A 4DUZK 4UQGA 3MCAB 4BRIA 3MMVA 3K9KA 3MEDA 3HO1A 1RT5A 2NRVA 4X65K 4CIEA 4JRQA 4IO9L 4FZZA 1BIZA 1L3TA 2G8KA 5AQOA 4C8MA 1NGGA 4IZ9A 1BG3A 4WCEL 3CQ8A 3HSCA 3HP6A 4DTJA 4ELUA 2O8DB 2IVPA 4NCAA 4KBOA 1EETA 4PKHA 1ZC6A 3BZKA 3OJSA 1E3MA 4CERA 3AVJA 1HKGA 1EO1A 1TKDA 3ZEUA 4X64K 2RPIA 3NAEA 2HHUA 1X3NA 1W0HA 3O4WA 4CI6A 2CGKA 2A1RA 1WSEA 1XNRK 3AA4A 3KIOA 3AO5A 3TU5A 3CXCM 4CZHA 1NOYA 4DV0K 3CD6N 3CC4N 3B6OA 1J5EK 4JKAA 4DR1K 3TAPA 2G8FA 3ZSXA 4BWMA 3A2FA 1BA0A 4HUEA 3NFAA 4RG8A 5HRSA 1GLLO 3FZHA 4BR5A 2GWKA 4F4KA 3KK3A 2GUIA 5DM7L 3VQ7A 3O3HA 2RHKA 3QO9A 3QB0A 1WUAA 4Y1DA 4CJUA 2PY5A 1GLAG 2OZMA 4JRPA 1M90O 4U67L 1SKRA 4L3QA 4FWKA 4H03B 1BQNA 1JL1A 4GKKK 3QNOA 2AP1A 1TAQA 1HKBA 3CJ9A 2NRXA 2W41A 5F2RA 1N34K 3QEVA 2YHWA 4XIUA 3V9ZA 1TL3A 4LSLA 3TTCA 4M3UA 4B9MA 2UUAK 1N6QA 1E4GT 4V19S 4QS7A 2YHAA 4H5WA 4AILC 2FXUA 3GOIA 2NRRA 5AQJA 1S72N 2ZJQL 3VN5A 4G1QA 1LWEA 4OPHA 1OVYA 3O9SA 1WBDA 2IOCA 4JI2K 3VQ5A 2O8EB 1YUWA 4H4OA 1QTMA 3HVRA 4UY8O 4BRQA 4DR2K 1N33K 3SBGA 3L2WA 5MLCQ 4GNIA 1WOQA 3K5MA 2OPSA 3SQ4A 1ZBIA 3MX2A 1SZ2A 4BC3A 1ASWA 4IOXA 1T44A 4JHDB 2IC3A 1RGIA 1HLUA 1Q18A 1VQ5N 4F2RA 4DR6K 5F0XA 4PUOA 4J2EA 3RMBA 1N36K 2HHVA 4BRKA 1A5VA 4B8AB 5FPNA 3AA2A 5E41A 5FDLA 1X9JA 3OYLA 4BVPA 4CEZA 4KH4A 4B8CA 3G0ZA 4CZEA 4M3ZA 1C6VA 1IBMK 3K5LA 1BI4A 4EHTA 4YOTA 2HBMA 2YCHA 1SKSA 3U9DA 1C0FA 2PAVA 4G9ZA 1RDCA 3NF7A 3DYAA 5AQUA 3W3DA 1P90A 4CF0A 5C12A 1LOTB 5AQWA 2JGUA 2I7NA 4BC5A 3KVGA 4E72A 3ASMA 3ZSYA 2AA4A 4CZIA 4A5BA 2VQEK 3C6UA 5AQHA 4ELTA 4M3WA 1YVUA 1QZ5A 4ISEA 3IRXA 2GELA 4TSXA 2I7PA 4LC9B 4EZ6A 4HUFA 3WNHA 1NKEA 3M3ZA 4DSFA 4Z4GA 2KFZA 3ENOA 5CY4A 3GDQA 3OYJA 3CC2N 1RNHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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