3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
2FSJA 1HKBA 5AZJA 5BRDA 4FWOA 5JICA 3LDNA 4C23A 3VF2A 4IWVA 1NWKA 3O1BA 5F0XA 3HI0A 4BRNA 2V7YA 1ZBSA 4YDUA 3LL3A 3WEEA 1GLCG 1V4SA 1C0FA 1CZAN 2GWJA 1BO5O 3DXMA 2D0OA 3ZETB 4K41A 4YDUC 3FFKB 2QWQA 2QW9A 2A5XA 2D4WA 2QWRA 4KBOA 3CERA 2Q0RA 2W41A 3MDQA 2E2PA 3QMLA 3EKSA 5BPMA 1NGHA 4BREA 3FGUA 1NGFA 3SMPA 4QS7A 4BRCA 3CQYA 2A40A 3R6MA 2OANA 2GEMA 5EXWA 4BR4A 4IXCA 4PKGA 4IJNA 4BROA 2IIRA 1J6ZA 1NGAA 4MO4A 3D7EO 3L0QA 2VCPA 1NGEA 1T6CA 3VESA 2PBDA 4FWLA 3VGLA 3SMSA 4H0VB 1ESVA 2P9NA 5AQRA 3VEVA 3ENOA 4K42A 5AQHA 2Q36A 4O8KA 2NRHA 2WUSA 1HLUA 4EHUA 3VETA 4J8FA 1QZ5A 4M7YA 4CZMA 3ZEUB 3UKRA 3HSCA 3VEWA 3BUZB 4H0PA 1GLAG 4QS8A 3R9PA 1P8ZA 2YCHA 1R59O 1WOQA 4BR2A 4BR7A 2Q97A 1RGIA 1G99A 3ID8A 2QWOA 2NLXA 3FZHA 3QFPA 4JN4A 3ZX2A 1T44A 3C7NB 4BRGA 3EN9A 1NGDA 4I6MB 3HTVA 3OHRA 2V51B 3O8MA 1NBWA 2ASPA 2GTDA 3O80A 1HJOA 5AQTA 3LDOA 3DJCA 5AQOA 5AZIA 1DGKN 4JAXA 3MMVA 4FWNA 1SZ2A 2P9UA 2P9IB 2YJEA 3A8YA 5BRFA 4CJ7A 1XC3A 4EFHA 5BPLA 3CJ9A 2I7PA 1EQYA 2YHXA 1NGCA 4WQ5C 3A0IX 4CZJA 2A42A 5BN9A 2ASMA 3VEZA 3O08A 2YHWA 1Z05A 3CJ1A 3VEXA 4XH1A 2A3ZA 1U2VB 1X3MA 3ULEB 3U9ZA 1Z6RA 2V7ZA 2E2OA 3HBTA 1TYQB 2NZTA 4K25A 2FF3B 1ZC6A 4FWPA 2P9LA 5KPTA 4CZIA 3WXIA 3GOIA 5AQZA 4FL9A 4ISGA 4WQ4A 3FE1A 2E8AA 5AQXA 5AZJB 2ZWHA 3EO3A 3D2EA 4JNEA 4QS9A 4L3QA 3A5NC 2FLOA 4FSVA 4WQ4C 4BVOA 3DAWA 5I9EB 1BOTO 1NGJA 4PKIA 1BA0A 4A2BA 1K8KA 3WEEB 3VPZA 3U4LA 3DXMB 1NGBA 4FWQA 2FSKA 5AQKA 1KAZA 5EVZA 4FWSA 5FPEA 5AQSA 4BRLA 1GLDG 2ITMA 3A5MC 3H1VX 1TUYA 2EWSA 2V52B 3HZ6A 4IJAA 3VENA 5JLHA 1YVNA 3ZX3A 3L4IA 4A61A 2BUPA 2UYTA 3H3NO 3SK3A 2CH6A 4DHYA 1YAGA 3FR0A 1S22A 1SAZA 4H0XB 2P9NB 5FPDA 4M63C 2CGKA 4FO0A 1GLEG 2HF4A 2Q2RA 3RSEA 1QQMA 2BTFA 2E2NA 4O5FA 4IO8A 3O6WA 4BC3A 4BR9A 3GE1A 4H5VA 1WUAA 4EHTA 4CZGA 4XEIA 2QWNA 3GBTA 3UKRB 4BC5A 1HUXA 1NGIA 1C0GA 1QHAA 4BRDA 1DEJA 4Y0WA 3R8EA 5JMVA 1HX1A 1XUPO 2VWBA 2IVOA 3J8AA 2AP1A 2J4RA 2P9SA 2A41A 3EL2A 3IDHA 3VF4A 2IVNA 4BC4A 2Q31A 2A6AA 3ENHA 5AQUA 3P4IA 4CZHA 3I8BA 2QM1A 1Q18A 3EKUA 2CGJA 5AR0A 4PL8A 3I33A 3WT0A 4BR0A 5FPNA 3H1QA 5AZIB 2DPNA 3KVGA 4CZLA 4CD1A 2P9UB 3C0BA 1MWMA 3QB0A 1BWFO 5E84A 3LM2A 3UKUA 1QQOA 4H0YB 4EIAA 3LDQA 1LOTB 1GLFO 3BF1A 5AQQA 1XQSC 2P9KA 4ISFA 2HMPA 4GY2B 3CQXA 1ATRA 3H46O 3QDKA 3VGMA 3VF6A 4CD3A 4MLHA 2PAVA 4WQ5A 2P9PA 5ADXA 3BF3A 1JCEA 1RDWX 3ATUA 4HWIA 1ATNA 3CJBA 2E88A 2I7NA 3F9MA 2P9LB 1ATSA 3U9DA 3D2FA 3WXKA 3LDLA 1D4XA 3KHYA 4Z94A 4B1YB 3DXKA 4JD2B 1JCGA 3WXLA 3CHWA 2CH5A 4JHDA 4B9QA 3D2EB 3S41A 4H0TB 5LJVA 4MO5A 1E4GT 3QICA 3MN6A 4FWMA 3QFUA 1K8KB 5ADXH 5BN8A 2Q0UA 4BR5A 4DB3A 5AQLA 5AQWA 5BR9A 4JD2A 1S3XA 2HOEA 1SQKA 2ZGZA 3GG4A 2Q1NA 3B8AX 2GWKA 4ISEA 3VGKA 5LJWA 1IJJA 1TUUA 4BQLA 4FPBA 3IUCA 5AQMA 4H5NA 2FSNA 2CGLA 1X3NA 4BGBA 3U8XA 3WXJA 4FWRA 2FF6A 3MN9A 1OKJA 3EZWA 3H6EA 5AQIA 3MN7A 3WQUA 5LY3A 3CJ7A 3CJCA 3G25A 4FOIA 3VEOA 3MCPA 1MDUB 1GLBG 5KPRA 3SLCA 4H5RA 3AY9A 1NLVA 3FZMA 4BRPA 3W3DA 3IFRA 3O4WA 1NGGA 4CZEA 4PL7A 3AAPA 2E2QA 3BP8A 4FWKA 5AQJA 3RSEB 4B1XB 4DQ8A 3QBXA 1BG3A 2VYPA 3ATVA 3O5BA 4BVPA 4H5WA 4M7XA 1NMDA 2YHYA 5KQDA 4BG9A 1BA1A 5AQFA 4H5TA 3O1WA 1BU6O 2F9TA 5AQPA 5AFUH 3CI5A 3LM9A 3IMXA 4B1UB 4BC2A 4BRIA 4BRFA 1V4TA 2P9SB 4CI6A 4B1WB 4CBUA 2YI1A 3SJHA 3MN5A 3JS6A 1E4FT 2AA4A 4E1JA 4CBXA 1KAYA 1NM1A 2FXUA 3KZBA 4PKHA 3ZETA 3DWLA 4CZKA 4XH5A 5EX5A 3VOVA 4B1ZA 1MWKA 5ELZA 4BG8A 5AQNA 3FZLA 3H45C 1MA9B 4FOEA 3AAQA 4GNIA 2GELA 5AQYA 3BEXA 3UKUB 2QWPA 3FLCO 4CBWA 1IG8A 3JXUA 5E26A 2YJFA 1DKGD 4LC9B 4NO7A 4A62A 3GL1A 4CZFA 2P9KB 2ZF5O 1QQNA 4RCHA 5KQ8A 4F9OA 1BUPA 3CETA 5BREA 3M1FA 2QXLA 5AQGA 4BRKA 1JCFA 4AM7A 3WQTA 2P9PB 4BRMA 5BRHA 3VEYA 5BPNA 4BRAA 5EY4A 3M6GA 2QWLA 3TPQA 4BRQA 3M3ZA 5B8HA 3H3OB 2GUPA 2F9WA 2KHOA 3D2FB 1HKCA 1Y64A 3TU5A 3UE5A 5AQVA 3FZKA 3HM8A 4HTLA 2E20A 3DXKB 3ZEUA 4JHDB 4A2AA 4XH4A 2D1KA 5EOYA 1BDGA 4MLEA 1H1VA 3GDQA 5CE3A 1GLLO 3CIPA 1HKGA 2ASOA 3UB5A 4H0OA 3L6QA 4RWTA 3A5LC 1LCUA 4B1VA 2IVPA 1T6DA 3LDPA 3C7NA 2QWMA 5F1XA 2ZGYA 4I6MA 2E1ZA 4EAHD 4K43A 4NB4A 1HPMA 1GLJO 1X9JA 5TKYA 1QZ6A 4BGAA 3WUHA 2P9IA 4DCHA 5FPMA 4AM6A 3CJAA 5JLFA 1KXPA 4RTFD 1KAXA 2E1YA 3VERA 1YUWA 1RFQA 3A5OC 3AARA 1U6ZA 5KPZA 4H03B 3QBWA 1U2VA 1YXQA 5F2RA 3ULEA 1ZXOA 4BQZA 2HF3A 4WYBA 2D0PA 5AFUA 3W0LA 1TYQA 4BRHA 3ZX0A 2H3GX 3MK6A 4FPAA 4IZ9A 3FZFA 2W40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HKBA 5AZJA 1U45A 1HQUA 4K0KK 3VF2A 1EO1A 4YHHK 4G1QA 5HL7L 3LL3A 5DM7L 2Z1GA 1CZAN 4N76A 4DFMA 2EHGA 3DXMA 3FFKB 2QW9A 5CZ1A 3CERA 2Q0RA 2QXFA 3EKSA 3R3LA 4QS7A 4BRCA 2OANA 4FM1A 1JLEA 1S1XA 3NFAA 4IXCA 3HPHA 1T8EA 4BROA 3SUNA 3VMFB 4C1NI 4MO4A 3D7EO 4YOWA 2KFZA 2ZM6K 2PFUA 3L0QA 1NGEA 3M8RA 2C1GA 4FWLA 2KKZA 3VN5A 2G8VA 1BQMA 4Q0BA 3N4QA 4FJKA 2NRHA 3VETA 1GOCA 2HHIA 2BANA 1RTJA 1C0TA 4QS8A 1P8ZA 1VRTA 4W5NA 3G71N 3MEEA 1G99A 2OZSA 1N34K 2HSTA 1IG9A 1KFSA 4FJ7A 4HUFA 3QERA 1C0MA 3C7NB 3NBPA 4I6MB 4E1NA 4BE0A 4IG0A 2VG6A 4ZTJA 4I9QA 2HVHA 5AQTA 3TSPA 4JAXA 5GAHP 1RDAA 4FWNA 4CVNE 3MX5A 2YJEA 2KQ2A 4B9UA 3TSUA 4ELVA 4IDHA 3CJ9A 1WB9A 4B3MK 2I7PA 4BDYA 4KHYA 3LWLA 4B3OA 2KFNA 3CM5A 1NOZA 3SUPA 1TK8A 2YHWA 3VQDA 3PO4A 4AILC 1JKHA 1RT3A 3THWB 4JI7K 2E2OA 4FWPA 3M8SA 5KPTA 4NXMK 4JI1K 3WXIA 4JKBA 1NKBA 1L3SA 3GOIA 2BH1A 4O4GA 4Y1DA 2I5JA 3D2EA 3LDSA 1SS6A 3L8BA 5BR8K 2FLOA 4BVOA 4JV5K 3OYLA 2HNYA 1BOTO 1NMNA 4JKCA 1BA0A 3VPZA 1S6QA 3TAMA 3QEIA 1TL3A 2D0CA 1F21A 1NGBA 4NYNA 5AQKA 3J81O 3OJSA 4R79A 3AVFA 3PX4A 3ZSWA 4W5RA 4BRLA 1WSEA 2FBYA 4BACA 5JENA 4H8KA 3T7ZA 2VWJA 1YJNN 1WSHA 5CZ2A 3A5MC 2OTJN 3UIQA 3H1VX 3AV9A 3LPUA 5HRRA 4PQUA 3C95A 2P1JA 4DU4A 3BZCA 4CF1A 4DTOA 3CCMN 2UYTA 3H3NO 1CZ9A 2CH6A 3ZT3A 4DHYA 1SAZA 3TANA 3KLEA 1DT9A 4H0XB 4E89A 3HM9A 5FPDA 1TKXA 3OYMA 4DQRA 2Q2RA 2BTFA 2O8DB 1T3VA 4O5FA 4J2EA 4BR9A 4JI2K 4DMNA 3SQ2A 4KO0A 5H1SQ 4XEIA 3GBTA 3UKRB 2OCEA 1DEJA 2XHBA 4M3XA 2AP1A 4M3WA 3CM6A 3LPTA 2P9SA 3JAMO 1JXEA 2IVNA 4F2RA 3ENHA 1I39A 4C1NK 1VSIA 3F5TA 1ZBLA 5C42A 3DM2A 3I8BA 4Z4FA 2KW4A 2QM1A 4PL8A 3I33A 3DLBA 2JWLA 2RKIA 1W0HA 2F96A 5FPNA 5E84A 1MWMA 3LM2A 3UKUA 3E1YA 3TAFA 4OO1J 4DU1A 2G8UA 1LOTB 4CJKA 3BF1A 5HP1A 4YY3K 4DTJA 3SCXA 2P9KA 4FK2A 4CJWA 5CR4A 3THVA 3CQXA 3VF6A 3ZT4A 2PAVA 3I8DA 1HJRA 2Y1IA 3ATUA 4HWIA 1ATNA 3ZSXA 3QNOA 2P9LB 3ISNC 4M3RA 2KTQA 1IBLK 3D2FA 1VSJA 3EZ5A 4JD2B 4JKAA 2CH5A 3S41A 4BWMA 4IEEA 4K8XA 1I94K 4LF8K 1RTIA 3MN6A 1KVAA 4CJ5A 1K8KB 2O8BA 3AVKA 4DB3A 1VQMN 5AQLA 2YKNA 3QEWA 3GG4A 4ELUA 5LJWA 1VSDA 1IJJA 4CFBA 3QEPA 2NRRA 5AQMA 5C15A 3S3MA 4H5NA 3TAQA 2CGLA 3MX2A 3VTHA 2Y1JA 4WF9L 1KD1O 3HXMA 2PY5A 2ETJA 3WQUA 5AQIA 5LY3A 3J7YP 4EZ9A 1O13A 3AVCA 3CJ7A 1KVBA 3G25A 3VA0A 1K9MO 4FVUA 4LF4K 1MDUB 3SLCA 3KJVA 2QTDA 3AY9A 1ITGA 3BDPA 2XY8A 3RR8A 3WXMB 4A5AA 3IFRA 4G9ZA 3AAPA 3MEGA 3QINA 3ZT2A 1U4BA 1D9DA 1ZYQA 2E2QA 5AQJA 1RT4A 2FC0A 1KQSM 3E01A 2VG5A 1LAVA 1HR0K 1EX4A 1NMDA 5KQDA 3SZ2A 2HBLA 2BE2A 1BU6O 3ASMA 4BRFA 3IMXA 2Z1HA 4CI6A 3HP6A 3NGIA 1JJ2M 2ZJPL 3P39A 1A5XA 1Q81O 1E4FT 4E1JA 1VQNN 1LWEA 3PLAA 3OW2M 5IWAK 3OJUA 4LF6K 4FM0A 4PKHA 4KV8A 4M42A 5KI6A 5EX5A 4B1ZA 5ELZA 1VSEA 4CJSA 4IDKA 1MA9B 3QLHA 4JRPA 3FLCO 4ID5A 2QKKA 2O8CB 4DS5A 2HHVA 4OGCA 1VSMA 4F9OA 3CETA 1TKDA 2YHBA 3P1GA 5CY4A 4GVEA 3VEYA 4NCGA 2JWKA 5BPNA 4BRAA 4DR1K 4WFAL 5B8HA 4LF7K 2F9WA 2QI2A 5HBMA 4CEDA 4CE9A 3UE5A 1HKCA 3TU5A 4B9TA 1RT2A 3HM8A 2RF2A 3DXKB 3KKRA 4F8RA 1J5EK 5EOYA 1ILYA 4B8AB 4CJ3A 1H1VA 3ZSZA 3S9HA 1GLLO 1I3AA 4LSLA 3UB5A 4B9LA 1ZBUA 3IRXA 2O8EB 4IEIA 4PY5A 3C7NA 3SQ1A 4I6MA 1VQ7N 4JI6K 4DQIA 4ILHA 1GLJO 1QZ6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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