3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-5C
molecule tags Contractile protein/protein binding
source organism Drosophila melanogaster
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
4H5RA 4HTLA 2P9UA 4DHYA 2F9WA 4BG9A 3LM9A 1XC3A 4GNIA 1EQYA 4IJAA 3HM8A 3FLCO 3WXKA 1GLDG 4FSVA 3ZETA 1T6DA 5AFUH 4BVOA 1U2VB 2ASOA 2GWJA 5AZJB 5KPZA 3GBTA 1S3XA 4BC5A 2QWPA 4YDUC 3QBXA 1GLJO 4XH1A 4CZGA 3SMPA 4AM6A 3EKUA 3BF3A 3ATUA 3VF6A 1KXPA 1BA0A 2YJEA 4CZFA 4H5TA 3DXMB 4RCHA 5AQRA 4JAXA 1KAXA 4BRQA 2HF3A 3QFUA 3SK3A 3FZMA 1C0GA 3FGUA 3VGMA 2VWBA 5FPMA 5CE3A 4BGBA 1X3NA 3F9MA 3I8BA 1NGIA 1Y64A 2GEMA 1QHAA 1XQSC 4CBUA 4FO0A 4C23A 3J8AA 4NO7A 5BR9A 2QWOA 4BC3A 2FF6A 5TKYA 3VEOA 2E88A 4JD2B 5BPNA 1GLEG 5BN8A 5BREA 2P9KA 5BRFA 4EIAA 4B1VA 2P9SA 4B1YB 3ENOA 2GELA 2D4WA 4BG8A 5AQXA 1H1VA 4XH4A 4F9OA 3MN5A 2A5XA 3A5MC 4BRHA 3ATVA 5AQGA 4YDUA 4K42A 1NGAA 4H0PA 1ESVA 1G99A 1Q18A 1V4TA 1Z05A 2FSKA 2I7NA 2FSJA 3JXUA 4H0XB 4PKGA 5AQVA 3R8EA 4H0YB 2ZF5O 3EZWA 4IXCA 4CZIA 4FWLA 3H6EA 3VEXA 2KHOA 1ATNA 3WEEB 4A61A 3WT0A 4JHDA 3WQUA 3QDKA 3W0LA 1HKBA 3RSEA 4FPBA 4XH5A 2YI1A 3D2FA 3SLCA 3GL1A 4BRMA 1HUXA 2H3GX 2E2OA 4FWSA 5KPRA 4BR2A 2GWKA 1QQOA 1TYQA 1BA1A 1E4GT 3WUHA 5KQ8A 1IJJA 5AQPA 2V7YA 1IG8A 4FWRA 1NBWA 5JMVA 1R59O 1MWKA 3VEZA 2EWSA 4B1WB 3UB5A 2P9PB 1KAYA 2YHWA 4CD1A 4CJ7A 3EN9A 3H1VX 3UKUA 1YUWA 3ZEUB 1MWMA 5AZIB 1NGFA 4BRNA 1U2VA 4RTFD 3FR0A 3SJHA 3TPQA 4XEIA 1K8KA 4EAHD 2ZGZA 4BR0A 3EL2A 5AQJA 3UE5A 1QQMA 2ZGYA 3M3ZA 4M63C 4DB3A 3VGLA 4FWKA 3WXIA 4CBWA 3QBWA 2QM1A 4JN4A 4L3QA 2ITMA 5AQQA 2Q36A 3MK6A 2WUSA 4KBOA 3U9ZA 4Z94A 3OHRA 3DXMA 4WQ4C 4H5NA 2A3ZA 2NZTA 5I9EB 4K43A 5ADXA 1SAZA 1DEJA 2P9LB 3P4IA 3VGKA 3O1BA 5AQSA 1ATSA 3CETA 3DXKB 1XUPO 3B8AX 4IWVA 3CJBA 1TUUA 3ZX3A 3BP8A 3MCPA 5LJWA 1NLVA 3BUZB 4CZEA 4MLHA 3D2EA 4A2BA 3A8YA 5AQTA 4BRDA 1LOTB 3C7NB 2FSNA 3CI5A 3FZHA 3IFRA 3MN6A 1QQNA 1GLCG 1NWKA 5AFUA 5BRHA 1T44A 2BUPA 3H45C 3JS6A 3L6QA 3WQTA 2ASMA 3SMSA 2VCPA 2IIRA 4CZMA 5KQDA 1C0FA 4BQZA 4BRGA 2E20A 4WQ5A 3CHWA 2PAVA 2QWQA 3H3OB 1BOTO 4PKIA 4BR5A 4H0VB 1D4XA 3WXJA 4ISGA 1BO5O 5AQWA 2IVPA 2Q97A 1U6ZA 3MMVA 1BG3A 3LDQA 4I6MA 2P9IA 1X3MA 1NGBA 5BPLA 4EHUA 1DKGD 1BDGA 5F0XA 3U4LA 2FLOA 3VEWA 3A0IX 3VF2A 4H0OA 5E26A 4BRFA 3TU5A 2HF4A 3BEXA 5ELZA 5FPEA 5JICA 2Q31A 2QWMA 3H46O 2W40A 5EOYA 3M6GA 4BGAA 3VF4A 3L0QA 1YXQA 5AQHA 4CZJA 4B1ZA 3VPZA 5AQKA 4J8FA 1NGHA 3O08A 4QS7A 2PBDA 3GDQA 2V52B 5AR0A 3M1FA 2P9NB 5AQUA 3DJCA 3UKRA 4E1JA 2E1ZA 2VYPA 3CQXA 2BTFA 1CZAN 4DQ8A 2QWNA 4PKHA 1JCEA 4FWMA 4BROA 2CGLA 1QZ6A 4H0TB 3HZ6A 1HPMA 3O4WA 4RWTA 1GLFO 1HJOA 3VERA 2OANA 4BC2A 2P9SB 5BRDA 3A5NC 2IVOA 3IDHA 2P9LA 4B9QA 4FOIA 4BRAA 1NGDA 4BC4A 3LDLA 4IO8A 5BPMA 3AAQA 4FWNA 3LDPA 5AZJA 1X9JA 2NRHA 1P8ZA 3ID8A 5AQYA 3ULEB 4IZ9A 5EX5A 3DWLA 4MO4A 5JLHA 5LJVA 4B1UB 3AY9A 3DAWA 4AM7A 2YHYA 3C7NA 4A2AA 4JHDB 4PL8A 4FPAA 2DPNA 3HSCA 1ATRA 3CERA 4GY2B 1JCGA 3D2FB 3S41A 4CBXA 4ISFA 5ADXH 1GLAG 4BRKA 3CJ1A 2GTDA 2V7ZA 3O5BA 5FPNA 1TYQB 4CZKA 5AQFA 4CZLA 2GUPA 4A62A 3G25A 4O5FA 2ASPA 3CJAA 2A40A 1J6ZA 1BWFO 4JD2A 5AQZA 3L4IA 4H03B 3U9DA 3UKUB 1HLUA 3BF1A 3HTVA 2HMPA 3AARA 2HOEA 5AQOA 2FF3B 4B1XB 1WUAA 1SZ2A 3D7EO 3LM2A 1NGEA 1NGCA 1MA9B 1K8KB 3QICA 5AQMA 5AQNA 3MN9A 3EO3A 3FZKA 3LDNA 4CZHA 5KPTA 2E2QA 3IMXA 2AP1A 1HKCA 3KHYA 3FFKB 4FWOA 5EY4A 4BVPA 3CIPA 4K41A 3O8MA 5JLFA 1RGIA 3HBTA 4BRIA 2P9UB 1OKJA 4WQ4A 3WEEA 2W41A 3AAPA 4O8KA 4WYBA 3ZETB 3I33A 4FWPA 4FOEA 3U8XA 1NMDA 5E84A 3H3NO 4BRPA 3VEYA 1Z6RA 2P9NA 1T6CA 5F2RA 1NGJA 4BREA 4FWQA 3O1WA 2E2NA 3CJCA 1JCFA 2A6AA 4FL9A 3CJ7A 3H1QA 3D2EB 2ZWHA 1ZBSA 4JNEA 4K25A 2Q1NA 2Q2RA 4H5VA 2E8AA 3VEVA 2P9PA 3HI0A 4BR9A 5B8HA 4DCHA 1YAGA 4IJNA 1BU6O 2E2PA 3CJ9A 2QWLA 4LC9B 3ZEUA 3CQYA 5EVZA 5AZIA 5BN9A 2D0PA 4EHTA 4M7YA 5AQIA 2QXLA 5FPDA 3GE1A 3VESA 1RDWX 2YCHA 4BQLA 3IUCA 2QW9A 4CI6A 1E4FT 1DGKN 2V51B 3A5OC 1GLLO 3ZX2A 1LCUA 3ENHA 3ULEA 4BRCA 2FXUA 3R9PA 3LL3A 4NB4A 3O80A 4Y0WA 1GLBG 4PL7A 3GOIA 4CD3A 3EKSA 1BUPA 3R6MA 3VENA 1MDUB 2P9KB 2E1YA 4I6MB 4BRLA 3FE1A 2P9IB 1ZXOA 1NM1A 2YJFA 3LDOA 3KZBA 2CGKA 1TUYA 2A41A 2YHXA 4BR4A 5F1XA 3DXKA 1WOQA 2UYTA 3ZX0A 1KAZA 2Q0RA 2CH6A 1QZ5A 3GG4A 4M7XA 2I7PA 1S22A 3MDQA 1NGGA 4QS8A 2QWRA 5LY3A 2D1KA 3O6WA 4H5WA 3FZFA 1V4SA 3FZLA 1ZC6A 5EXWA 2A42A 3QFPA 1HKGA 5AQLA 2F9TA 3RSEB 1SQKA 2CGJA 3MN7A 2CH5A 4ISEA 2AA4A 4MO5A 3A5LC 3W3DA 4QS9A 3VOVA 3QMLA 2NLXA 3KVGA 4BR7A 2J4RA 3UKRB 3VETA 4EFHA 1RFQA 3QB0A 4HWIA 2D0OA 1HX1A 3C0BA 4MLEA 4WQ5C 2Q0UA 3WXLA 1YVNA 2IVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KFSA 3L2RA 4HTLA 2P9UA 4CF0A 4B9MA 4DWIA 4BG9A 4X66K 3WXKA 1YITN 1T6DA 1VQPN 5C2DA 4FJ5A 5KPZA 3PLAA 1S3XA 5GAGP 3SV3A 4UQGA 1JLAA 4YDUC 4I2QA 4AM6A 4KI6A 2UXCK 4ILJA 3ATUA 2VG5A 1BA0A 2HNDA 3C94A 4DQRA 2QI2A 5AQRA 3RRGA 4FJNA 1KAXA 4BRQA 3OYEA 2DFHA 2HF3A 3QFUA 3SK3A 3SUOA 3MEEA 4E7IA 3VGMA 3TI0A 3SQ2A 1NKEA 4LF6K 2X6NA 3HM9A 4CCHA 3AO5A 2GEMA 2X78A 1XQSC 1RBUA 2IAJA 1TKDA 4CBUA 2FC0A 1ITGA 4FO0A 3T69A 2ATQA 2A1RA 2FF6A 4JD2B 1SV5A 4A57A 4NCAA 4JKAA 2HHTA 5BREA 4LD0A 4B1YB 3SQ4A 1VQ5N 4ELTA 2D4WA 3LPTA 5HP1A 1YHQN 4KFBA 2A5XA 5AQGA 1YJNN 4YDUA 1HPZA 4K42A 4Z4IA 3CD6N 1NGAA 4XIUA 4E89A 1V4TA 2I7NA 2FSKA 4H0XB 3PIOL 2FSJA 5AQVA 4NXMK 1K9MO 2KFZA 2ZF5O 4G9ZA 3KKSA 4DFKA 2O4GA 3KLIA 4IXCA 3PX4A 4CGHA 1IBMK 4DV4K 3OYNA 2X74A 4FWLA 2IDOA 2D0AA 3DLRA 3E66A 4M3WA 3S3MA 1E3MA 2ETJA 4JHDA 1QSLA 5D3GA 3DLBA 3VQAA 4HUFA 1XMOK 2RE2A 3ZSXA 4OPJA 3SCXA 4A5BA 3D2FA 3SLCA 4YORA 3GL1A 5HRSA 1HMVA 3I8DA 2E2OA 1IKXA 1BI4A 1TYQA 3WUHA 1B92A 2VQEK 1NBWA 1R59O 3MXMA 2XHBA 3UB5A 3RR7A 5FRMA 1RCHA 1KVBA 1SKWA 3FR0A 3P39A 3TPQA 4EAHD 5AQJA 1QQMA 3F73A 3CM6A 5CZ2A 4CIEA 4DTNA 3SNNA 4K8ZA 3M3ZA 3VGLA 3V9ZA 4L8RB 5AQQA 4E7KA 3DXMA 4KAZA 4WQ4C 1GOCA 2O8FB 1DEJA 2P9LB 3O1BA 4C8KA 3OBWA 4PY5A 5AQSA 3MAQA 1U4BA 1JXEA 3HJFA 4NLCA 4IWVA 3CMEN 1TUUA 1NOYA 3T1HK 3MCPA 4CZEA 4MLHA 1JLEA 4DSIA 3C7NB 2KFNA 3MN6A 3IFRA 4RW6A 3CFRA 4XJXA 3QNNA 3JS6A 1T05A 1X9MA 4DV5K 3IS9A 1LWFA 1JLGA 2O8EA 4CZMA 4A59A 1C0FA 3SAHA 4W5RA 4JRQA 3R1XA 4FVUA 4KHPK 1BOTO 4C8MA 5GIPA 4H0VB 5GIOA 1Q81O 4HVJA 3THYA 5AQWA 2G8IA 1VSDA 3MMVA 1U6ZA 1WAJA 3TAFA 1X3MA 3RMAA 5F0XA 1ILYA 4BRFA 5E26A 2HF4A 3BEXA 5JICA 5CHIA 4M3RA 5JENA 4B3RK 2P5GA 2QWMA 3H46O 2HHVA 2G8FA 1VQ9N 3NFAA 3L0QA 2KW4A 1B9DA 3O9QA 2NRXA 3HRGA 1Q86O 3P5JA 3NH1A 3K5MA 3O08A 3EE9A 3WNFA 2HBLA 2V52B 3VQEA 1VQ8N 3M1FA 1N5YA 5C12A 2I5JA 3O4NA 3UKRA 4E1JA 4YOUA 4CEOA 4DQ8A 1RTJA 4PKHA 1IH7A 4DU3A 1QHTA 4KH6A 4BROA 3ASMA 5JS2A 3HZ6A 4CK3A 2P9SB 3VQPA 3A5NC 4E7JA 4BRAA 1VQON 4H8KA 3AAQA 4FWNA 5AZJA 2F4VK 3HO1A 4JI2K 4DV1K 1X9JA 1NJXA 1LAWA 4CW7B 1IV0A 3OYHA 1CXUA 5GADP 3CPEA 1HNIA 3NF9A 2YHYA 4AQYK 1WBDA 3AVLA 3RTVA 3ZLJA 4JYAK 4A2AA 3HPHA 4DFJA 4CFDA 3CCQN 1XHXA 1VSLA 3ENBA 2GBZA 3QEIA 3HSCA 1DTTA 1ATRA 2GUIA 1U04A 4GY2B 1JCGA 4CBXA 5ADXH 1VQLN 1GLAG 3DOKA 4BRKA 4DU1A 4WFBL 2E5LK 1SL1A 1SL0A 4DR2K 1NJIO 2V7ZA 4KKOA 3DLHA 2OTLN 5AQFA 1RTIA 4KH5A 4O5FA 3IAYA 3CJAA 2A40A 3KK3A 4DR1K 3MXIA 3ZYYX 3PX6A 3BF1A 4H4OA 3O9RA 5CR4A 2OPPA 5AQOA 4DTUA 2BANA 3D7EO 3LM2A 4GKJK 3RMDA 1HYZA 3EO3A 4CZHA 1QS4A 2E2QA 2HHQA 1T8EA 1QTMA 3CCRN 3D6RA 4YOYA 4BVPA 3ZT4A 1FKOA 5H1SQ 2Z1IA 3THVA 2VWJA 1WSEA 3TTDA 2Z1JA 3WEEA 2W41A 4IEEA 3CG7A 4DS5A 4ILHA 4WYBA 3S3NA 1JLQA 3CM5A 4GVEA 4O44A 2HNYA 3U8XA 1NMDA 1BIZA 2B5JA 1LAVA 1X1PA 4B3SK 3L3UA 1T6CA 3Q7CA 3ZSRA 1NGJA 3U6FA 4IOXA 3O1WA 5MLCQ 2RKIA 1K8AO 2A6AA 3QEVA 3H1QA 2HVHA 4JNEA 3KKRA 3TABA 4K25A 4QCLA 3LP3A 4H5VA 4KTQA 2P9PA 4IJNA 4LC9B 1YTAA 4MDAA 4JI1K 5AZIA 3SPYA 3RR8A 3K5NA 3OYLA 4FJKA 4EHTA 2NRVA 3HOSA 2QXLA 5HRRA 2YCHA 4NCGA 4BDPA 3WNEA 4C1NK 3QLHA 4CFBA 1GLLO 4DTMA 2HHXA 2YNFA 4ID5A 4FLWA 4FLYA 1YF5L 3GOIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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