3MN7A

Structures of actin-bound wh2 domains of spire and the implication for filament nucleation
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin-5C
publication title Structures of actin-bound Wiskott-Aldrich syndrome protein homology 2 (WH2) domains of Spire and the implication for filament nucleation.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Contractile protein/protein binding
total genus 108
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3mn7A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3mn7A03
1KXPA 1YUWA 3MN7A 3MN9A 3J8AA 3LDNA 2EWSA 4BR4A 4HWIA 4CD1A 2A3ZA 5AQFA 5FPNA 4B1ZA 3H1QA 2H3GX 3HI0A 1CZAN 1QQNA 3QDKA 4RTFD 1P8ZA 2WUSA 3KHYA 4I6MB 1NGAA 1QZ6A 3ENOA 1K8KB 3O6WA 5E84A 1BU6O 4FWKA 4H0XB 3L4IA 4IXCA 2GWKA 3H45C 4CZMA 4M7YA 5E26A 4FWQA 3TU5A 5ADXH 4DB3A 4CBWA 2IVOA 3DAWA 2GWJA 3DXMB 3EL2A 3VEZA 4M7XA 1SZ2A 3R8EA 3VF2A 5AFUA 3ATUA 3QBWA 3U9DA 5FPMA 4MO5A 1ATRA 2IVPA 1HJOA 3CJAA 3UB5A 3VENA 2P9KB 2E2NA 3MN5A 2P9SB 3QMLA 5KPTA 1EQYA 2HF4A 4EHTA 3DJCA 5KPZA 2A42A 5LJWA 4CZEA 4QS7A 5F0XA 1KAYA 2Q0UA 1GLLO 2QWLA 1NGBA 2V7YA 1H1VA 3DXKA 3FE1A 2NLXA 4IO8A 3ATVA 4FSVA 1U2VB 4AM6A 4CZJA 5AQGA 4BG8A 2HF3A 2YJEA 3SMSA 1NM1A 4JAXA 2UYTA 4RCHA 1QQMA 2Q2RA 4BRKA 4GNIA 3JS6A 3C7NB 3ZETA 1NGJA 1T6CA 3JXUA 3VEVA 2QWPA 2A41A 3U9ZA 1S3XA 5AQWA 1NGIA 5AQJA 3CJ7A 2ZWHA 1TYQA 1NGHA 4BRNA 3WEEB 5AQOA 2PAVA 4BC3A 3DWLA 2P9UB 2BUPA 3WXLA 4DCHA 4L3QA 5JMVA 5KPRA 1Y64A 4JN4A 4WYBA 1HX1A 1IG8A 4BGBA 4XH1A 1GLCG 1D4XA 3D7EO 4A2BA 1LOTB 3VEWA 4JNEA 4FWSA 3O08A 3RSEA 4A62A 5AQQA 1KAZA 1Q18A 4BRLA 1JCGA 4PL8A 2I7NA 3SJHA 3HM8A 3VGLA 4CZFA 3D2FB 3FZKA 4BREA 4FWNA 4CD3A 3UE5A 5FPEA 1RFQA 1GLJO 3IDHA 1ZC6A 5LJVA 4H5NA 5F2RA 3UKRB 5FPDA 4H03B 5AR0A 4CZIA 1BUPA 2FSJA 3QFUA 3R6MA 4FOEA 4EFHA 1E4GT 2P9LA 5AQZA 3VOVA 2F9TA 4C23A 4ISGA 3S41A 1MWKA 3LM9A 5AQSA 3WUHA 2A6AA 4H5VA 4EHUA 3O4WA 4DQ8A 5AZJA 2P9PA 4FWMA 2ZGZA 4H0YB 5AQPA 3CHWA 5AQRA 3ENHA 3QBXA 4H0TB 4M63C 5BREA 3WT0A 2J4RA 3VERA 5EVZA 3HBTA 4BR0A 4A2AA 1NBWA 4H0OA 4JHDA 1ESVA 4FPAA 5ADXA 3ZX3A 4BR5A 1ZXOA 2YJFA 3M6GA 3LDQA 4B1WB 5CE3A 4BG9A 4BRQA 4BC2A 2QXLA 4PKIA 3A0IX 3WQTA 3IFRA 3CQXA 1E4FT 4BR9A 1RDWX 5AQHA 5BRHA 1GLDG 5KQDA 1SAZA 4KBOA 1U6ZA 5AQVA 4PL7A 3DXMA 4LC9B 4K25A 1KAXA 1V4SA 4HTLA 5BPMA 3LM2A 4B1UB 1X3MA 4BROA 4AM7A 3LDLA 4Y0WA 2D1KA 2V7ZA 3A5NC 2BTFA 2Q97A 4BGAA 1TUYA 3CIPA 3EKUA 4CZLA 1OKJA 3BF3A 5BRDA 1MA9B 2A5XA 2YHYA 3MK6A 1QHAA 4NO7A 2AP1A 5EXWA 1XC3A 1T44A 3FZFA 1C0GA 3DXKB 1ZBSA 2E88A 3OHRA 2VWBA 1C0FA 3I8BA 1U2VA 2E2PA 5AQYA 3FFKB 4BRHA 2ZGYA 4BRMA 3VF4A 1NGGA 2IIRA 3O80A 3VGMA 1NGCA 3BUZB 2FSKA 5AQKA 1HKGA 4CZKA 1MDUB 2E2OA 1Z05A 4YDUA 5AQLA 4JD2A 5AQNA 3BEXA 5BN8A 3GDQA 1TYQB 4B1XB 5AQUA 5BN9A 1DEJA 4XH5A 2F9WA 3MMVA 3O1WA 1V4TA 1DGKN 4GY2B 3UKUA 4BRIA 2QWQA 2Q1NA 3FLCO 3ULEB 1IJJA 4WQ5A 3VETA 3WEEA 2D4WA 1DKGD 2P9UA 4BQZA 2ZF5O 3GOIA 4XEIA 5BPLA 1GLFO 2CGLA 2QM1A 4IJNA 2HMPA 2P9IA 4K41A 4NB4A 2GTDA 3VGKA 4BVOA 2QWMA 5ELZA 3RSEB 5AQXA 1WOQA 4EAHD 3KZBA 5AQMA 4CBUA 2E1YA 3H46O 1GLEG 4PKHA 1MWMA 1NLVA 4F9OA 3LDOA 2E8AA 3EN9A 2CGKA 2YHWA 3I33A 3ZX0A 5JICA 3QB0A 4BRAA 3ZEUA 3HSCA 2PBDA 4MLHA 4FL9A 2D0OA 1G99A 5EY4A 3UKRA 3B8AX 2P9LB 4FPBA 3O5BA 2I7PA 2W40A 4BR2A 4H5WA 3GE1A 2Q31A 1NGDA 2A40A 4CZGA 4FO0A 3FZMA 4H5RA 5KQ8A 1X3NA 2VCPA 3VF6A 1TUUA 2GELA 2P9PB 2AA4A 2NZTA 1SQKA 3HZ6A 1R59O 3F9MA 3GL1A 5AZIA 3D2EA 3L0QA 2P9NA 1NWKA 3CJBA 3QFPA 4FWPA 4JHDB 4CZHA 1BG3A 3P4IA 4BRFA 4WQ4A 4I6MA 1WUAA 3VESA 4A61A 2E1ZA 3U8XA 4XH4A 1K8KA 4H0VB 3MCPA 3EKSA 1BA1A 3EO3A 4FWRA 3TPQA 2YI1A 3FGUA 3WXJA 1HPMA 5JLHA 3BF1A 3WXKA 3H6EA 4ISFA 3GBTA 3KVGA 2VYPA 5EX5A 2QWRA 4YDUC 3R9PA 3U4LA 2ITMA 2FLOA 4IJAA 2P9KA 2P9SA 4BRGA 2V52B 3CERA 3FR0A 4MO4A 4WQ5C 4PKGA 3CQYA 4BC4A 3H1VX 1ATNA 3WQUA 4FOIA 5BPNA 1BA0A 3AAQA 4FWOA 1GLAG 2KHOA 5AFUH 2GEMA 1XUPO 3SLCA 5JLFA 2NRHA 1JCEA 3BP8A 3VEXA 4K43A 4BRPA 4H5TA 2ASMA 3AARA 1J6ZA 1HKBA 4FWLA 3L6QA 5F1XA 5BR9A 3M3ZA 2ASPA 5I9EB 1HKCA 3LL3A 4IWVA 3HTVA 1BOTO 2CH5A 3GG4A 3IUCA 4EIAA 3ZETB 3ZX2A 3H3OB 3SK3A 3C7NA 1NGFA 2FSNA 1T6DA 4ISEA 3VEYA 4QS9A 2HOEA 1NGEA 5LY3A 2QWOA 3AAPA 4BRCA 4BR7A 4O8KA 3CJ9A 4IZ9A 4QS8A 5TKYA 5AQTA 4JD2B 4B9QA 1RGIA 5BRFA 3WXIA 3M1FA 3SMPA 1QQOA 3FZHA 3UKUB 1HUXA 1BDGA 5EOYA 4K42A 3CJCA 3ULEA 4BC5A 3EZWA 4RWTA 4BQLA 5AQIA 3W3DA 2E20A 1YAGA 2E2QA 4WQ4C 3A8YA 3QICA 2V51B 2IVNA 2P9IB 2FF6A 2YHXA 3C0BA 3O8MA 3VPZA 4CJ7A 4J8FA 4DHYA 3A5LC 2DPNA 1QZ5A 3FZLA 4MLEA 3G25A 3MN6A 1X9JA 2FF3B 4E1JA 3A5MC 3D2FA 2ASOA 4BVPA 4CBXA 2QW9A 1GLBG 1BO5O 2YCHA 1YXQA 4B1VA 1JCFA 2QWNA 2Q0RA 3CJ1A 4O5FA 4CI6A 4B1YB 2W41A 3ZEUB 2Q36A 4H0PA 3O1BA 1BWFO 3IMXA 5B8HA 5AZJB 3W0LA 3CETA 3ID8A 3MDQA 3LDPA 4BRDA 1Z6RA 2D0PA 2OANA 1YVNA 3VEOA 1ATSA 2FXUA 1NMDA 1HLUA 3H3NO 3AY9A 1LCUA 3CI5A 3A5OC 5AZIB 3D2EB 4Z94A 2P9NB 2CGJA 1XQSC 2GUPA 1S22A 2CH6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EU7A 4B9TA 1YUWA 2DY4A 4NYNA 3J8AA 4BACA 5AQFA 3H1QA 2H3GX 3HVRA 4JKGB 3K5LA 3SQ4A 4RTFD 1P8ZA 4DV7K 3KHYA 4I6MB 4PA1A 1TAUA 4CJFA 5FRMA 4CFCA 3QEXA 4Z4IA 3J7ZO 4IXCA 2GWKA 3WNHA 4JEPA 3MWPA 5E26A 1VRUA 1VSMA 1HQEA 2HW3A 3RMAA 2GWJA 4Z4CA 1YT3A 1LWCA 1SZ2A 2G8HA 4KTZA 3R8EA 4IO9L 1VSLA 4O44A 3SNNA 3CM5A 5HLFA 1I39A 3U9DA 2YHAA 2VWKA 1ATRA 3HVTA 4GKKK 3SAHA 3MN5A 1VQPN 4DSKA 5KPTA 5GAHP 1RT4A 1IBLK 3J7YP 4OKEA 1T03A 4EHTA 1HNWK 3I8DA 5KPZA 3I56N 1Z25A 4IOAL 2Q0UA 2QWLA 4FXDA 3V1OA 4WE1A 2NLXA 4IO8A 2E5LK 1SL2A 1U2VB 2HHIA 4BG8A 3AO1A 3SMSA 4F2RA 3ID6A 1TK8A 2UYTA 1VQMN 1EETA 2HNYA 3WNEA 4B3MK 1T6CA 2UU9K 1U45A 3I0SA 1OH6A 1O13A 2DFEA 1S3XA 3SUQA 4JKDA 3CJ7A 2ZWHA 1TYQA 1FK9A 1D8YA 4I9LA 4M3WA 3AVCA 1L3TA 4M45A 3WEEB 3F9KA 3QNOA 3CD6N 2HHUA 3WXLA 4U7BA 5JMVA 4PUOA 2XY8A 4DSIA 5C10A 1W7AA 2OTLN 2OA8A 4K8XA 4XH1A 3V81A 1D4XA 4XJXA 4A2BA 4AHVA 4JI3K 4CEFA 3KLFA 3NH0A 2ETJA 2JLEA 3IS9A 4KB0A 4A62A 3K9KA 4PL8A 2I7NA 1CLQA 3D2FB 2JWKA 3K0SA 3M8SA 4CD3A 1RFQA 1GLJO 5LJVA 2G8KA 4E1NA 4I2PA 2VGMA 4DV5K 5J2NA 4W5OA 1R0AA 4WFBL 4KRFA 2FSJA 4FOEA 3DLLL 1RT7A 3VOVA 4OO1J 1KSPA 4IDHA 3VMFB 4CEDA 2A6AA 1RBSA 1YJ9N 4IBNA 4Z4FA 3LANA 2P9PA 4H0YB 5M1QA 3VA3A 1VQ8N 3CCSN 1K9MO 3P1GA 5AQRA 3QBXA 4H0TB 2OPQA 3WT0A 2J4RA 2GV9A 4MDAA 3HBTA 5LMNK 1FXXA 1NBWA 4H0OA 1ESVA 5C25A 1WSFA 3ZSVA 4OGCA 4Q0BA 4BR5A 1T7PA 1ZXOA 2R7YA 3LDQA 2Z1GA 3G6EN 4K8ZA 2FBYA 1L3UA 4BC2A 3NDKA 4JI2K 1RDWX 1GLDG 2QI2A 5KQDA 4KBOA 3MXIA 4B8CA 5AQVA 4FM0A 4DF4A 2OYQA 4FK0A 1RT5A 4LC9B 4NCGA 3PSFA 4PY5A 4HTLA 1NKBA 4OKKA 3LDLA 4Y0WA 3MEDA 1K8AO 3THWB 5KTQA 3TABA 1TUYA 3BF3A 2QXFA 2Z1HA 1QHAA 3AVJA 2NNWA 1T8EA 2XY5A 3TR8A 3DXKB 1ZBSA 3DRRA 4CJQA 4UQGA 4CF8A 3TTFA 1C0FA 2E2PA 3FFKB 3PO5A 4BRHA 4N5SA 1SKSA 4FJ8A 1NGCA 2FSKA 5AQKA 2OPSA 4CZKA 2HVHA 1MDUB 4F4KA 4NCBA 5AQLA 4DUYK 3V9XA 1VSEA 4B1XB 5AQUA 3OA9A 1YVUA 2F9WA 1BL3A 4CFBA 3CXCM 1L5UA 4O5BA 3VETA 4WQ5A 1S1UA 1DKGD 4DF8A 2ZF5O 4DSFA 3EYZA 2AJQA 2I5JA 2YNGA 4FJ7A 1GLFO 2P9IA 4KPYA 3K5NA 4NB4A 4DFMA 2GTDA 3VGKA 3DLBA 4O8UA 2XY7A 3RSEB 2OPRA 3VQPA 2E1YA 3H46O 4CEQA 4ID1A 1NLVA 3PIPL 1U4BA 2A1SA 3EN9A 3OYNA 3I33A 1EO1A 3OYHA 2HHSA 3ZX0A 2IGIA 3LPTA 3QB0A 3ZEUA 2ZQBA 2PBDA 2BANA 4FL9A 2Z1JA 2P9LB 4FPBA 4PQUA 1NGDA 3VQ9A 2A40A 4AHUA 4CZGA 4FO0A 3FZMA 3ULDA 2UUCK 1X3NA 2VCPA 2W42A 4DSJA 3ZLJA 3GL1A 1IKXA 3L0QA 4I9QA 3IRXA 1JJ2M 2X6SA 1WSIA 1S5JA 4JHDB 4JKGA 3P4IA 4B9MA 4I6MA 1WUAA 3L2QA 3VESA 2E1ZA 4H0VB 2ZD1A 3MCPA 1XI1A 3EKSA 3OTOK 3EO3A 1WAJA 2NRTA 2F8SA 1HPMA 5JLHA 1YHQN 3ALYA 4DQPA 3GBTA 2FBVA 2WONA 5EX5A 3I55N 2QWRA 1SS6A 3M8RA 1DLOA 4EP4A 4CJVA 4ILGB 3FR0A 1ASWA 1KVBA 1NKCA 3H1VX 2KKZA 4JKBA 1ZBHA 5AFUH 3D0PA 1SUQA 1XUPO 3AGRA 3CCRN 4JI8K 1QS4A 1REVA 1JCEA 1TGOA 3RRHA 1W9HA 4BRPA 1J53A 2WTUA 4NYFA 2HB5A 3L6QA 2OZSA 3M3ZA 2ASPA 4IWVA 1JKHA 4C8KA 3HTVA 2CH5A 3OYBA 4C8NA 4EIAA 3DLHA 4JLHA 4W5TA 3SK3A 1BHLA 5LY3A 1WSJA 2VQEK 4CJSA 4MQ3A 3KIOA 3K9JA 2NRXA 4BR7A 2P5GA 4BY9C 3UIQA 3S9HA 1RGIA 4OPJA 4DR3K 1JLQA 3LWMA 1BDGA 2IAJA 3CJCA 4BC5A 3LP2A 5AQIA 2E20A 3T69A 2IVNA 3ZYYX 2FF6A 4YOWA 1M1KO 3SYZA 4Z0UA 4CJ7A 3VTIA 3FZLA 1QZ5A 2NRVA 4IFYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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