2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
3WT0A 3O80A 3H6EA 4CZLA 3SMSA 1R59O 5AQRA 1NWKA 4QS7A 3U4LA 4B1XB 5AZJB 4ISEA 2P9SB 3A5OC 2ASMA 4BRLA 5AQWA 4BC5A 5JICA 4RWTA 3VEYA 4B1ZA 3VOVA 2FSKA 4H0TB 2ZWHA 3I8BA 3HSCA 1ESVA 3A5LC 1Z05A 2F9WA 4NO7A 3CJ1A 1HJOA 3CJ9A 4E1JA 2A40A 2P9IA 2AP1A 2BTFA 4I6MB 4BVPA 5EY4A 3VEOA 4BRIA 5JLFA 1NGGA 4MLHA 2Q36A 2P9SA 4EAHD 3U9DA 3GDQA 4A62A 2IVOA 5AQPA 1ZXOA 2YI1A 1LCUA 1IG8A 2P9UB 2QWQA 1TUUA 3P4IA 5AQFA 2CH5A 4H5TA 3O8MA 5AQTA 4IJAA 4M7XA 4Y0WA 5AQMA 4BRQA 4EHUA 4PL8A 4H03B 3VF4A 4O8KA 1TYQB 5ADXA 3RSEA 3ZX0A 2D0OA 1D4XA 3QDKA 4EIAA 1BDGA 2P9KA 2HMPA 4B1YB 2QWNA 3M1FA 3R9PA 5EOYA 4JNEA 4BGAA 4CZFA 4AM6A 4M63C 2P9PB 4H5NA 1NGDA 1NMDA 2D1KA 3S41A 1DEJA 3LDOA 4FPAA 5LJWA 1JCFA 4BRAA 4JD2A 1XC3A 2OANA 3UKRB 1J6ZA 1GLDG 1TYQA 4PKIA 3LDLA 1YXQA 3FFKB 3CETA 3R6MA 1BU6O 3M6GA 3SK3A 4BRHA 2ZGZA 3JXUA 5AQJA 2QWMA 4RTFD 4MO5A 3W3DA 2ZF5O 1T6DA 4XH1A 1QQNA 5AQSA 5LJVA 1NGHA 4QS9A 1XUPO 3MN6A 2D0PA 5BPNA 2YCHA 3AAQA 1NM1A 4BQZA 3LM2A 2E1ZA 4BR0A 3VGKA 3DXMB 2ASOA 4H0VB 5AQOA 4CD3A 5BPMA 2FXUA 1LOTB 1QZ6A 1JCGA 1GLAG 3WUHA 3QICA 4CD1A 4BRCA 3HBTA 1EQYA 2QWRA 4PKGA 4KBOA 4BRMA 1K8KB 3CQYA 5KPTA 4BRKA 4H0OA 3MCPA 2CGJA 3QFPA 3KVGA 1Y64A 3LDPA 2IIRA 5TKYA 1E4GT 2Q97A 1X9JA 4FWOA 1Z6RA 4BRFA 3TPQA 1BO5O 5F0XA 2HOEA 3A5MC 1QQMA 3FZFA 3ZETB 3J8AA 3BEXA 4JHDA 3ULEA 3WEEB 3CERA 3UB5A 3H1QA 1KXPA 4FWPA 1U2VA 3EKUA 4K25A 1GLJO 3MMVA 2E2OA 1YVNA 1GLCG 1ZC6A 3L0QA 1X3MA 4IXCA 1C0GA 2QM1A 4WYBA 1KAZA 2P9LB 1IJJA 2V52B 3CJBA 4K42A 1GLEG 2QXLA 3IUCA 3DWLA 3QFUA 5E84A 2H3GX 4FWLA 4FWMA 3UKUA 3H45C 3ZX2A 2YHWA 4CJ7A 3G25A 3GG4A 3BP8A 3CIPA 4H5VA 1GLLO 4Z94A 3ATUA 5AZJA 1RGIA 1HKCA 1V4SA 3A8YA 3KHYA 3LDQA 3VEZA 3D2EB 4EHTA 3I33A 1BWFO 3O5BA 4H0XB 2GWJA 4H5WA 2CGKA 5AQUA 4BR4A 4CZKA 1WOQA 3MK6A 3BF1A 5KQ8A 3DXKB 3ID8A 4DHYA 2QWLA 4JAXA 4FL9A 5BPLA 3GE1A 2GTDA 2W40A 4I6MA 3VEVA 1RDWX 5ELZA 5AQGA 2PBDA 3VETA 2F9TA 5AZIB 3D2EA 4CBWA 2BUPA 3EN9A 2P9UA 2GELA 4ISGA 4IJNA 2HF4A 2A41A 3ZX3A 2YHYA 1BOTO 4FOIA 4BROA 2QW9A 4BQLA 2FSNA 3FZHA 3MDQA 1MDUB 3VGMA 3CJ7A 4XEIA 4BVOA 3WQTA 1G99A 2WUSA 2V7ZA 3VF2A 3L6QA 1NGAA 1YUWA 4B9QA 4WQ4C 1JCEA 5AZIA 1QHAA 1XQSC 3A5NC 4HTLA 3O1WA 3FGUA 5AQZA 3U8XA 5FPDA 4YDUC 1NGBA 1HPMA 4MLEA 4XH5A 5AQNA 3VPZA 2DPNA 5AQVA 5ADXH 3BUZB 3HTVA 3SLCA 2P9PA 1KAYA 2GUPA 3CI5A 1S22A 3VENA 3U9ZA 1T6CA 3ZEUB 4CI6A 2AA4A 4WQ4A 3CQXA 3UKRA 1KAXA 1SQKA 3DAWA 4FOEA 1X3NA 4IZ9A 4B1WB 3CHWA 2ITMA 3HM8A 4DQ8A 3QMLA 4J8FA 4YDUA 4BRNA 5KPRA 3AARA 4QS8A 5I9EB 2Q0UA 3MN9A 3JS6A 1NBWA 3SJHA 2QWOA 5CE3A 1Q18A 1P8ZA 4BRDA 3IMXA 5EVZA 4CZHA 1E4FT 4ISFA 1DKGD 5AQHA 2PAVA 3D2FB 4BRGA 1SZ2A 1SAZA 4GY2B 1ATNA 1BA1A 4FWNA 5BRDA 3VEWA 5AQYA 3DXMA 1MWKA 5AFUH 4DCHA 4IO8A 2VYPA 2NRHA 3O6WA 3QBWA 3TU5A 4CZMA 3A0IX 3KZBA 4JN4A 4CZEA 1K8KA 4L3QA 4PL7A 3FZMA 2Q2RA 4BG9A 5AQIA 3O4WA 1H1VA 4H0PA 2CH6A 3FR0A 3EZWA 4BR2A 1DGKN 4HWIA 3R8EA 4CBUA 5FPEA 5KPZA 4FSVA 5JMVA 5E26A 2D4WA 2E2QA 1V4TA 4BR5A 1NGEA 3ZETA 1QZ5A 3WXJA 3WEEA 2P9IB 3O1BA 2FF6A 3OHRA 2HF3A 2I7NA 4FWRA 5BN9A 4CZGA 3AAPA 3B8AX 4BC2A 5BREA 3FZLA 3LL3A 2A6AA 3HI0A 2P9LA 3WXIA 4FWKA 1MA9B 2Q31A 3DJCA 3W0LA 4O5FA 1NGJA 2VCPA 3QBXA 3H3OB 1HUXA 2VWBA 2YJFA 1NGFA 4C23A 1RFQA 4NB4A 2A5XA 1YAGA 2NZTA 3LM9A 5AQLA 3VEXA 4A61A 4FO0A 3RSEB 5KQDA 2P9KB 2KHOA 2ASPA 4B1UB 4XH4A 5BN8A 3F9MA 2P9NB 1HKGA 2Q1NA 2ZGYA 3C0BA 4H5RA 2I7PA 3O08A 4GNIA 2E88A 3EO3A 4H0YB 3FE1A 1MWMA 1BG3A 2GEMA 5BRHA 3DXKA 3H46O 4M7YA 4IWVA 3C7NB 4FWSA 1HX1A 4JD2B 4BR7A 4RCHA 2J4RA 4BREA 3CJAA 4MO4A 3SMPA 3VF6A 4A2BA 1HKBA 1OKJA 2Q0RA 3EL2A 2P9NA 5AQXA 3GOIA 5AQQA 4CZIA 1C0FA 1ATRA 2EWSA 4WQ5C 1S3XA 3M3ZA 1NGCA 4DB3A 1U6ZA 1CZAN 3WXKA 1WUAA 4BRPA 4BC3A 1NGIA 1HLUA 2CGLA 4A2AA 3MN5A 4CZJA 3C7NA 3EKSA 5JLHA 2A42A 2V51B 4LC9B 2UYTA 3VESA 5EXWA 3VGLA 2E2PA 1BA0A 3IDHA 5BR9A 3WQUA 4AM7A 1NLVA 4PKHA 2E20A 4WQ5A 3WXLA 3AY9A 3LDNA 1ATSA 3HZ6A 4FPBA 4K41A 2YHXA 3VERA 2V7YA 5AFUA 5F2RA 3FZKA 2FF3B 3ZEUA 3GBTA 1ZBSA 3ENOA 5LY3A 2A3ZA 5FPNA 1GLFO 3QB0A 4BGBA 4JHDB 3ULEB 2QWPA 4CBXA 4K43A 1T44A 1TUYA 3ATVA 2GWKA 2IVNA 1U2VB 2E1YA 2IVPA 3D7EO 4BR9A 3MN7A 2E8AA 3CJCA 3IFRA 3UE5A 4B1VA 4BC4A 5BRFA 5AR0A 1QQOA 4EFHA 5F1XA 2E2NA 3BF3A 4F9OA 3ENHA 1GLBG 3FLCO 3H1VX 3D2FA 1BUPA 2FSJA 3GL1A 3L4IA 2W41A 5AQKA 3UKUB 4FWQA 5B8HA 2YJEA 3H3NO 5FPMA 2NLXA 2FLOA 4BG8A 5EX5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V9XA 2JWKA 1D9FA 4CFCA 5AZJB 3TWHA 1W0HA 5JICA 4KO0A 4RWTA 4FLYA 1VQ4N 4CJRA 3U3YA 3HYFA 4PA1A 3VOVA 3OS0A 3LWMA 3HP6A 2ZWHA 4E7JA 1ESVA 1Z05A 3C95A 2F9WA 3CJ1A 2A40A 3ALYA 3LZIA 4I6MB 4AH9A 5HROA 5LMUK 1EWQA 4ZHRA 3GDQA 1FKPA 3V6DA 2W6LA 1KQSM 2IVOA 1FXXA 3SUOA 1NOZA 1ZXOA 1LCUA 1TUUA 3P4IA 3OYBA 1KFDA 3PSIA 4LH4A 2EX3A 4M7XA 4BRQA 4Z4HA 3AVCA 4ILHA 1IBMK 4EHUA 4YFUA 4DFMA 1TK0A 1OH8A 1JL2A 4ILJA 1TYQB 4RG8A 3CCSN 2FC0A 3QDKA 2FBVA 4EIAA 1KLMA 3BZCA 3RMDA 2UU9K 2Z1JA 3V9ZA 5C2FA 3QEPA 1BCOA 3EYZA 4AM6A 2D1KA 4CEOA 4CJWA 2O8CA 5LJWA 3AVLA 3ZT2A 4BRAA 2PZSA 3UKRB 4N76A 3CFRA 3AA4A 2XO7A 1TYQA 4PKIA 1YXQA 1U49A 2YX6A 3FFKB 4CJTA 4CIFA 2HBJA 3BGRA 4NYNA 4H8KA 1B9FA 1SV5A 4C8OA 1TVRA 3T7ZA 1IV0A 3OYKA 5AQJA 5GAEP 1RTIA 4FJ5A 3OJUA 1M90O 5HOOA 3T1AA 4DTPA 1RTJA 2XY8A 4ILGB 4FM0A 4DQRA 1NM1A 4BQZA 3LM2A 3SZ2A 2QI2A 1CXQA 2E1ZA 4BR0A 3F73A 1S1VA 4CEDA 2ASOA 4C8MA 2FXUA 3P38A 2A1RA 1EP4A 1GLAG 4CD1A 2P5OA 4OLAA 3DLGA 3OVNA 1B92A 5H1SQ 3IG1A 3T3FA 2PFUA 1CZ9A 2UXBK 4FJLA 1VSEA 3KVGA 5MLCQ 1I39A 3AVHA 2IIRA 2Q97A 1U47A 1X9JA 1Z6RA 3DI6A 1BO5O 5HRRA 3A5MC 3ISNC 1QQMA 1NK9A 3WEEB 3SNNA 4XJXA 4FJHA 2WBNA 2YNHA 5D3GA 1WN7A 3MMVA 4CIEA 1XC9A 1YVNA 1GLCG 4IXCA 2X78A 1X3MA 4KTWA 1NK5A 3K9JA 1TKTA 2V52B 4CHYA 3DWLA 3V1RA 4M3XA 3QFUA 4YOVA 2O8FB 1W97L 3MWTA 2WOMA 5M1KA 4FLUA 1HQUA 1VSFA 3AA2A 3GG4A 3NH1A 2X74A 1CLQA 4H5VA 3M8SA 1T05A 4GV3A 1S1WA 1RGIA 3KHYA 2WC9A 1RBRA 3AVGA 3V81A 1WSJA 3TAEA 4OKEA 4BDZA 2O8FA 3P39A 3IKMA 4JKDA 5KQ8A 2VWJA 3ID8A 3O3GA 1TAUA 1NK0A 2VGMA 3NGZA 2GTDA 3LWLA 3V9WA 2B4JA 4CJ3A 1VQKN 3RR8A 4IFEA 2F9TA 5AZIB 2ZE2A 1WSHA 3KIOA 3OYEA 3QO9A 2W6KA 1JLGA 2BUPA 2DFFA 4B9MA 5CZ2A 4IFVA 4LF8K 3CC4N 4ELTA 4LF4K 3OYNA 1T7PA 4Z4FA 4NCGA 2A41A 4E1NA 4GV6A 4BQLA 1C1CA 3CFPA 2FSNA 2A1SA 3CJ7A 4CF1A 3WQTA 4CJ4A 5C10A 2V7ZA 3VF2A 2HHIA 4FLZA 4B9QA 4CF8A 4IEIA 1JCEA 1DLOA 5AZIA 1UOCA 3FGUA 5AQZA 1IBKK 4JI3K 5FPDA 4LF6K 1S9EA 1RT3A 5KGXA 2DPNA 3N4PA 5ADXH 3DYAA 2P9PA 2GUPA 1S22A 3SQ4A 2O8EB 1T6CA 3ZEUB 3NH0A 4CI6A 4WQ4A 3VQEA 3SPZA 2NRRA 3RRHA 1IH7A 1SQKA 1L3TA 1X3NA 4IZ9A 2RE2A 3VN5A 1RILA 3E9LA 3HM8A 5CY4A 3AARA 1LWEA 4QS8A 4DTJA 1VQLN 1HJRA 2BANA 4BACA 4DTUA 2P5GA 3D2FB 3V1OA 3S3MA 1SZ2A 4DU1A 4GY2B 1ATNA 3QNOA 2Y1JA 3SBTA 3DRPA 5AQYA 2VG6A 4JKCA 2OCEA 4RW6A 4CFAA 3KTQA 1W7AA 5I3UA 3ZT3A 4DCHA 4IO8A 2NRHA 4CHQA 1RDBA 3KZBA 4JN4A 3ENBA 4J2BA 4B9NA 1K8KA 2GX9A 5JVGL 3SJJA 1H1VA 2UXCK 4FJ8A 3HVRA 4W5OA 3EZWA 4BR2A 4CBUA 4CEFA 4Z4GA 1RBTA 4FSVA 4O8UA 3LZJA 4JK9A 4E7HA 4BR5A 4JKAA 4CK1A 1RCHA 1N5YA 1BISA 1QZ5A 2OPRA 3HPHA 4Z4IA 3OY9A 5FRNA 4B9VA 3BZKA 3TSUA 1LWCA 3L2QA 4YOWA 4HUFA 1S72N 1S5JA 3G71N 2QKBA 4BC2A 4FWKA 5BR8K 1VSIA 4DTXA 3N4QA 3H3OB 4OPAA 2VWBA 1UWBA 4DMNA 4EZ9A 2KLAA 2A5XA 3TAFA 3TSPA 4M3RA 4DTRA 4DF8A 4ZTFA 5KQDA 2P9KB 1YVUA 4KV8A 5M1OA 3TTFA 4J2DA 3C65A 2JGUA 4ELVA 3KLHA 3F9MA 3HP9A 2GBZA 3HXMA 4GNIA 2O8BA 3EO3A 3P5JA 3NH2A 2EHGA 1Q9YA 1VQMN 4ELUA 3QEVA 3C7NB 3DOLA 4R5PA 4JD2B 3CPWM 3K5MA 4CGGA 2VG7A 4MO4A 4CGDA 3VF6A 4OPKA 3CCLN 3G10A 4FLTA 1N8RO 3GOIA 3AVMA 5AQQA 4CZIA 1C0FA 4M3TA 1ATRA 4H4MA 2VQFK 1Q7YO 1NGCA 4JI0K 3WXKA 1NGIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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