2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
1NGFA 2CGKA 1GLBG 4H0YB 3VEWA 1BA1A 1MWMA 1QZ5A 2FLOA 4BROA 4BRPA 3R9PA 3ZETA 2P9UA 4BC3A 4FWKA 1K8KB 2FXUA 3VEZA 1TUYA 2J4RA 4JHDA 2A42A 1NM1A 4B1UB 3VGLA 2CGJA 2P9UB 4FPAA 4Z94A 3VESA 4EAHD 4M63C 1HX1A 3GE1A 5JMVA 3J8AA 2ZWHA 1WUAA 2P9NB 4BR7A 4ISGA 2YCHA 2YHWA 4PKHA 3H3OB 3WXLA 4BR9A 1HKGA 5LY3A 2P9NA 5FPMA 1BOTO 3GOIA 3ZX0A 4IXCA 5AQSA 3VPZA 4CZGA 4H0PA 1ZC6A 4BRFA 3MN6A 3TU5A 4RTFD 4B1XB 1QHAA 4GNIA 1T6DA 4L3QA 4FO0A 1H1VA 1S22A 4QS7A 1T44A 3W0LA 3SJHA 3D2FA 2AP1A 4FWRA 3HTVA 4JN4A 3A5LC 3CIPA 3O8MA 4H0TB 4ISEA 1HLUA 5AQFA 5BRHA 5AQUA 3UKRB 4WYBA 3WT0A 3W3DA 1HJOA 5F1XA 2E20A 4C23A 2F9WA 3RSEA 2NLXA 3GL1A 5AQJA 5EXWA 1XQSC 1JCEA 5ELZA 2Q97A 4IJNA 2A5XA 5AR0A 5AQRA 3BP8A 4BC4A 2Q31A 2V52B 2FF6A 3FLCO 3H1VX 1ZXOA 5ADXA 3DXMA 3QBWA 5AZJA 4MLHA 3O6WA 4RWTA 1LOTB 3GDQA 5AQZA 3VENA 4H03B 2ZGZA 1ESVA 1YVNA 1NBWA 4WQ4C 3HBTA 5AFUA 2E2QA 3VF6A 3I8BA 2H3GX 2EWSA 5F2RA 4RCHA 1R59O 3QBXA 2KHOA 1GLCG 4FOIA 4BQZA 2QXLA 3D7EO 4FWSA 4BG8A 3BF3A 2Q1NA 3HZ6A 4DCHA 1P8ZA 2HMPA 5BRFA 5AQQA 3BUZB 2W40A 3QICA 5KQDA 3QB0A 3VEVA 2FSJA 1NGBA 5AQKA 1K8KA 3CJBA 3H1QA 4CZLA 2QWLA 3L4IA 4BRAA 1MWKA 1V4SA 4MLEA 3LDOA 4K43A 1NGHA 1BU6O 3CJAA 1C0GA 5AQNA 5AZIA 5FPEA 4EHUA 4M7XA 3L0QA 4CI6A 4XH1A 3EKSA 4B1VA 3L6QA 3CHWA 4BR4A 4FWMA 1BG3A 5AQXA 3VERA 1HKBA 3O1BA 4E1JA 1ATRA 2A41A 2ZF5O 4MO5A 4BRGA 1DEJA 1KAZA 4PL7A 3H3NO 3QMLA 4B1YB 1NWKA 2QWMA 3ATUA 4EHTA 3LDPA 2QWRA 4NO7A 4FPBA 4AM7A 4YDUA 3D2EA 2BTFA 3AAPA 1KAXA 4YDUC 3MK6A 1NGDA 4BVPA 3G25A 2GEMA 1G99A 3CQXA 3RSEB 4BRIA 2P9KB 3O4WA 4AM6A 1XUPO 3LM2A 4I6MA 3A5OC 3LDLA 2QWQA 5E26A 3MMVA 1ATSA 2P9PA 3MN5A 3D2EB 3U4LA 3GG4A 1GLEG 4WQ5C 4DQ8A 2Q36A 1GLFO 3VF4A 1NGJA 3MN7A 4CZFA 5AQHA 2VCPA 4BRQA 2NZTA 4J8FA 1E4FT 1NGGA 3A5NC 4Y0WA 5I9EB 3LM9A 3FZHA 4GY2B 4HWIA 3U8XA 4BR5A 3KVGA 2BUPA 4XH4A 4K42A 2A6AA 5AZIB 1NGIA 3WUHA 4BRKA 3SK3A 4A62A 5AZJB 4K41A 5BN9A 3EL2A 1JCGA 2A40A 5AFUH 5AQVA 3MN9A 5EVZA 3M3ZA 2HF4A 2AA4A 2ITMA 3A0IX 3ZX3A 1NGEA 1BA0A 1BO5O 4BRMA 5AQPA 4DHYA 4JD2A 3ID8A 3JS6A 2GTDA 3LDQA 3WXIA 3FFKB 2ASOA 3ZX2A 3U9ZA 3KHYA 5AQGA 3U9DA 2E2NA 5F0XA 4BGAA 4BR2A 2I7NA 5FPDA 2NRHA 1ZBSA 2WUSA 3EKUA 4NB4A 2YJEA 2E8AA 3FR0A 5BPLA 3QFUA 3M6GA 2D0PA 2P9KA 4K25A 4CBUA 5BN8A 4JAXA 4BRCA 4IZ9A 5TKYA 3CETA 5AQOA 1TUUA 1U2VB 1HKCA 3C7NA 3M1FA 3ATVA 2Q2RA 3AAQA 3ENOA 5BREA 3CJ9A 1TYQB 2P9IA 2FF3B 3FZFA 4B9QA 2E88A 4FWPA 3TPQA 3AY9A 1MDUB 4O8KA 3CQYA 4WQ5A 2E1ZA 3HI0A 5ADXH 2QWOA 1Z6RA 3WEEB 5B8HA 1NMDA 1U2VA 1HPMA 2I7PA 4H5RA 1GLLO 3BF1A 4FOEA 2CGLA 2ASMA 2YJFA 4CJ7A 3IFRA 1U6ZA 4CD3A 2P9SB 3WXKA 4JHDB 1SZ2A 3UE5A 4JD2B 3FGUA 5AQLA 3A5MC 3VEXA 3FZKA 1KAYA 5EX5A 3EN9A 4H0VB 4IWVA 1NGAA 2D4WA 2P9SA 1X3NA 4BVOA 4M7YA 4H5VA 2OANA 3VGMA 3FZLA 4PL8A 3LDNA 3DXKA 2Q0RA 5LJWA 2QWNA 1SAZA 5E84A 4BC2A 1QQOA 4CBXA 4FWLA 1BWFO 1DGKN 2QW9A 5FPNA 1D4XA 3QDKA 3DXKB 4BG9A 3O80A 3LL3A 4PKIA 1BUPA 1ATNA 4DB3A 1SQKA 4CZKA 1DKGD 3EO3A 3SMPA 3VGKA 1GLJO 1Q18A 5KQ8A 3MDQA 1GLAG 4H5WA 2ZGYA 3FE1A 3OHRA 4H5TA 4I6MB 5KPRA 2P9LA 4CZHA 5AQTA 4BRDA 4CZJA 3VETA 2E1YA 1E4GT 3DJCA 5JLFA 5JLHA 1T6CA 2GELA 4MO4A 4CZIA 1YAGA 1LCUA 1IJJA 3VEOA 2HF3A 5BRDA 4HTLA 1RGIA 1NGCA 5BPMA 2QWPA 1CZAN 3C0BA 3P4IA 1NLVA 4BGBA 2D0OA 2V7ZA 5EOYA 4QS8A 2F9TA 3O08A 4FSVA 4CZMA 3IUCA 4XH5A 4H0OA 1C0FA 3D2FB 5KPTA 3ULEA 3R6MA 3B8AX 3O1WA 5JICA 2QM1A 2V51B 2V7YA 2A3ZA 4BRNA 2YI1A 4XEIA 2FSNA 5AQWA 3UKRA 3ZEUA 3WEEA 3JXUA 2UYTA 4IO8A 4FL9A 2E2OA 3CERA 1BDGA 4H5NA 4F9OA 5BPNA 5BR9A 4BREA 2HOEA 1S3XA 2E2PA 2IVPA 2Q0UA 3VOVA 4FWQA 5AQMA 3F9MA 3H45C 2YHYA 2CH6A 3HM8A 4CBWA 3C7NB 4CD1A 1X9JA 1RFQA 3GBTA 1Z05A 5KPZA 3I33A 4O5FA 5AQYA 2D1KA 2DPNA 5EY4A 3SMSA 1JCFA 2YHXA 4FWNA 3O5BA 1WOQA 1J6ZA 1QQMA 2PAVA 3S41A 3H6EA 3ZETB 1V4TA 3H46O 3CJ1A 3IDHA 2VYPA 5AQIA 1TYQA 2GWJA 1YUWA 2P9IB 2P9PB 2W41A 1YXQA 4KBOA 4H0XB 3VF2A 3ULEB 3CI5A 3IMXA 4WQ4A 2IVOA 2IVNA 3UB5A 1QQNA 4A2BA 4BR0A 3QFPA 2ASPA 1GLDG 3A8YA 1OKJA 4LC9B 3UKUB 2FSKA 4BRLA 1RDWX 4QS9A 1Y64A 3CJ7A 3FZMA 3DWLA 5LJVA 3AARA 2GWKA 3BEXA 2P9LB 2VWBA 3DXMB 2CH5A 1XC3A 4B1WB 3ENHA 2IIRA 4FWOA 3WXJA 4EIAA 3MCPA 3HSCA 5CE3A 4EFHA 3ZEUB 1KXPA 2GUPA 1QZ6A 4JNEA 4A2AA 3R8EA 3KZBA 1HUXA 3UKUA 3WQTA 4A61A 2PBDA 3SLCA 3EZWA 4BRHA 3VEYA 4BC5A 4B1ZA 4CZEA 4ISFA 4IJAA 3WQUA 3DAWA 1EQYA 3CJCA 4BQLA 1X3MA 1MA9B 1IG8A 4PKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WSIA 3V9WA 1WSFA 3OYNA 1MWMA 1VK0A 4B8AB 4FJJA 1RDBA 3KLGA 3ZETA 2P9UA 4BC3A 1K8KB 3AA5X 3JSMA 4AHTA 1W9HA 5KGXA 2O8CB 4JHDA 1OH7A 1NU0A 5BR8K 4WF9L 4Z94A 4AILC 4EAHD 5JMVA 4DKWA 1X9SA 4TSXA 2P9NB 4JKCA 3C6HA 3AO3A 3H3OB 2DFHA 4BR9A 3THWB 3I8DA 4CEBA 4CJRA 1L3TA 4FCYA 2P9NA 3SV4A 2ITGA 4RW9A 4KREA 1S9EA 3AVIA 3OYJA 4E3SA 4A59A 3F9KA 1CLQA 4DUZK 3GOIA 4FJIA 4CZGA 4CF1A 1HQEA 1T6DA 3AV9A 1DTTA 2W42A 3THYB 4F3TA 1W97L 2HHQA 2XY6A 3SV3A 1VSHA 2JLEA 3D2FA 4AHRA 5JENA 3CIPA 4ISEA 3OJSA 3B6PA 2HHHK 1HLUA 5AQFA 2P1JA 5AQUA 4DTMA 3UKRB 4FW1A 1S1XA 3AVLA 3AVKA 4B3OA 4A5BA 3SUQA 4KHQA 4C23A 3K9KA 3QEWA 2OA8A 4JKAA 3RSEA 4CFAA 3VQBA 1BISA 1XQSC 2DTUA 4IDKA 5AR0A 1NJWA 1VQ4N 3BDPA 1HYZA 3BP8A 2Q31A 4R5PA 3I0SA 4JK7A 4CEDA 1ZXOA 4YOTA 3DXMA 3QBWA 5AZJA 4RWTA 2BE2A 5AQZA 3T3FA 3IKMA 3THXB 2YKMA 1OH8A 5HRRA 1ESVA 1YVNA 3VQ5A 1QHTA 3HBTA 3SBGA 2HBMA 3OVNA 1K9MO 1VRUA 3QBXA 4I9QA 4CJEA 1GLCG 3AA2A 1IBLK 2NNWA 3D7EO 3K5NA 4FJLA 4PWDA 5CY4A 4BG8A 3KTQA 3TSQA 4CFBA 5KI6A 1KLNA 2FSJA 3DM2A 4CGDA 1XC9A 3OYIA 1C1AA 1O1WA 4I2QA 4AHVA 1MWKA 1V4SA 4MLEA 3LDOA 4IG3A 3VA3A 3DOLA 2RN2A 3NGIA 1E3MA 2UU9K 1SUQA 3AGKA 1XMOK 1Q81O 4CJKA 4K8ZA 1BG3A 5AQXA 3V9UA 1B9DA 3O1BA 3HL8A 4C8LA 3OBWA 3PX6A 2KZZA 4RW6A 3NF7A 3E9LA 4B1YB 3QMLA 4GW6A 5T7BA 3E1YA 5DK5A 3ZSXA 2PY5A 1NJIO 4FPBA 4AM7A 1KQSM 1DTQA 1KAXA 4CJ3A 1EX4A 4KO0A 1NGDA 2NRRA 4IFVA 2W6LA 2ZM6K 4IKFA 1U47A 4KI6A 4AM6A 4JK9A 4CJ4A 4UQGA 3MWPA 4CGJA 3AO2A 1QE1A 5EU7A 3L8BA 1ZYQA 1SL0A 1ATSA 3TABA 1S1UA 1N34K 1RT4A 4FK2A 4BACA 1WBDA 4DQ8A 2Q36A 1GLFO 2RF2A 4CFDA 4B3TK 2YHBA 1JLCA 4EP4A 1RBUA 5I9EB 3LM9A 3U8XA 4DU3A 3V1OA 2HHXA 2O4IA 1NGIA 2O4GA 3ITHA 3T69A 3F73A 1W2BM 2QK9A 2O8DA 5BN9A 3VMFB 5AFUH 3MN9A 2AA4A 2KKZA 2ITMA 4KHNA 4BRMA 3NE6A 1FW6A 5AQPA 3DI6A 3E01A 3JS6A 4CJUA 4K8XA 4ID5A 3CFPA 3FFKB 4M41A 5HL7L 3U9ZA 3KHYA 1LW2A 3D6RA 5AQGA 4CJLA 2E2NA 3O4QA 3C94A 3O3FA 3Q7BA 5D3GA 4GV3A 5I42A 4IOAL 1IG9A 4DV5K 4CJTA 2HMIA 4KFBA 4LFBK 4YOVA 4CBUA 3DLRA 4RW8A 4BRCA 4DSLA 3ZT0A 5TKYA 4CJ5A 3CETA 1TUUA 4QCLA 2HHTA 4DLGA 2HVHA 4F2RA 2QI2A 3ATVA 2Q2RA 1JL2A 3AAQA 1WAJA 3CJ9A 4B9QA 1ZBHA 5FRMA 2KFZA 3LWMA 2Z1JA 4FJNA 1XWLA 4CIEA 1BIZA 5B8HA 2HHSA 3S5TA 3NH2A 1DT9A 1GLLO 1QS4A 2QTDA 2RPIA 3BF1A 4Z0UA 4BY9C 3T19A 4DQQA 4LF5K 3WXKA 1SZ2A 3PIOL 3VEXA 5LMUK 1VSIA 3P5JA 1D8YA 4IWVA 1HR0K 1X3NA 5HLFA 1YITN 4CIFA 4KB0A 1SS6A 4FZYA 2O8FA 2ZJQL 4CJSA 3ZSRA 1LWFA 1BL3A 1C1CA 2FBTA 3DXKA 5LJWA 3VQEA 3V9XA 3G71N 4BE7B 4BC2A 1RDUA 3RRHA 1D4XA 4BE2A 1Q9YA 3DXKB 1OH6A 4KTZA 3O9UA 4CJFA 4DB3A 3NF9A 4Z4IA 1DKGD 1RT1A 3OS1A 2GV9A 3SMPA 1Q7YO 5CZ2A 5KRSA 3P1GA 3CMEN 3CCMN 5KQ8A 3MDQA 3J7YP 3FE1A 4CGHA 4BE1A 4H5TA 2KQ2A 2P9LA 3NGYA 3CFRA 3FFIA 5M1KA 2E1YA 2G8FA 4ZHRA 2KFNA 4CECA 3OBYA 4KHUA 1SKRA 2RHKA 1LCUA 1RBRA 3KKRA 3VQ4A 3KK7A 3KJVA 3AO1A 4HTLA 1QTMA 1RTHA 2OTJN 3CXCM 5BPMA 1NK6A 3ENBA 1HMVA 4DR6K 1S6QA 1KSPA 2XY8A 3RRGA 5HRNA 4WFBL 3VQ8A 1JLGA 5EOYA 4LH5A 1JL1A 2QXFA 3JAMO 5H1SQ 4XH5A 4H0OA 3D2FB 1TV6A 1NKBA 2V7YA 2A3ZA 1VQ5N 1RT2A 1ZBUA 1RT6A 3ZSOA 3KK3A 3ZEUA 4CHQA 3K2PA 3OYAA 2UYTA 4IO8A 2R7YA 1BDGA 1JKHA 2EHGA 4BREA 2IVPA 1S3XA 3VOVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1R0A A;  5HRS A;  4YOY A;  2YJF A;  2ASM A;  4CGI A;  4CJ7 A;  3IFR A;  1S1W A;  1CZB A;  4E1M A;  3A5M C;  3FZK A;  3IS9 A;  4KTW A;  2NRZ A;  3EN9 A;  4JK8 A;  2P9S A;  4CEE A;  4BVO A;  3LAL A;  4BWJ A;  4H5V A;  1KVC A;  4PL8 A;  3O9Q A;  4CF2 A;  3CC7 N;  3V1Q A;  4Q5V A;  1VQ6 N;  3AO5 A;  1U04 A;  1BWF O;  3V1R A;  3KIO A;  3O80 A;  3MED A;  2X6S A;  1ATN A;  4DFJ A;  1VSF A;  2Z1I A;  3LP2 A;  4CZK A;  1IV0 A;  5HBM A;  3VGK A;  5A2Q O;  1BCO A;  1GLA G;  4H5W A;  1YTA A;  5KRT A;  1JJ2 M;  4JKG A;  3ID6 A;  5KTQ A;  4CZH A;  4BRD A;  1E4G T;  3DJC A;  3ZSZ A;  1NJY A;  3QNO A;  1K6Y A;  4CZI A;  4KHP K;  2HF3 A;  5BRD A;  1XNR K;  1FK9 A;  1CZA N;  3AO4 A;  3C0B A;  3PIP L;  3OYK A;  2UXB K;  1ILY A;  2D0O A;  5GIO A;  2WOM A;  2V7Z A;  3CG7 A;  4E7J A;  1LW0 A;  3S9H A;  5J2Q A;  4DTJ A;  5GIN A;  1TKX A;  1VRT A;  4KPY A;  2UUC K;  3IUC A;  5AJ3 K;  1C0F A;  5KPT A;  3R6M A;  3O1W A;  2QM1 A;  4LSL A;  4BRN A;  3TWH A;  2YI1 A;  4XEI A;  4CEQ A;  2FSN A;  3ZT3 A;  4J2A A;  5AQW A;  3UKR A;  4FYD A;  3JXU A;  1DLO A;  4FL9 A;  4H5N A;  4F9O A;  4KRF A;  1YJN N;  1TKT A;  2WFB A;  1BGX T;  4FWQ A;  4CHN A;  3KD1 E;  4WE1 A;  4CBW A;  4LFC K;  1L3U A;  5GAD P;  1RFQ A;  5KPZ A;  1YJW N;  1EP4 A;  2OPP A;  4CHY A;  3SQ2 A;  4GMJ B;  3LAK A;  4DFP A;  2D1K A;  3G4S N;  3THX A;  4CEZ A;  1JCF A;  4FWN A;  3O5B A;  4YOX A;  4MQ3 A;  4N76 A;  2C1G A;  1J6Z A;  2PAV A;  3KWG A;  1ITG A;  2F4V K;  3HYF A;  1V4T A;  2P9I B;  4H8K A;  3VQA A;  4KBO A;  2IVN A;  1TL3 A;  1U4B A;  4A2B A;  4I7F A;  2ASP A;  4M3Y A;  1OKJ A;  1YTU A;  5LMN K;  1K8A O;  1LV5 A;  4QS9 A;  3ZSQ A;  1Y64 A;  3AAR A;  2GWK A;  1VSL A;  3G6E N;  4FLY A;  4BDP A;  3DXM B;  1XC3 A;  2UUB K;  2NUB A;  4FWO A;  4EIA A;  1HNV A;  2ZJP L;  2QA4 N;  1N36 K;  5DM7 L;  2IDO A;  5CE3 A;  1KXP A;  2GUP A;  3RR7 A;  1QZ6 A;  1Q8I A;  3KZB A;  1HUX A;  3UKU A;  1TK0 A;  1IKY A;  4KH6 A;  4DWI A;  2XY5 A;  2ZQB A;  4MDB A;  2GBZ A;  4CEA A;  3VEY A;  3NHG A;  4B1Z A;  3K0S A;  1X3M A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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