2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
1DEJA 1JCEA 3UKUB 4EIAA 3OHRA 5KPRA 4JN4A 3LDQA 4JHDB 2Q0RA 1HKGA 3MN5A 1HPMA 1RDWX 4WYBA 3ZEUB 2ASOA 4WQ4A 3FE1A 3VEWA 1YUWA 3D2FB 4B1WB 5KQ8A 4K41A 4RWTA 2BUPA 1U2VB 2A42A 3LDPA 4FPBA 4H0VB 1NGCA 3GG4A 3UB5A 3VGKA 4CI6A 5F1XA 3ATVA 5AZIB 3O1WA 2A6AA 4FWRA 4H0OA 3O80A 4ISFA 3ID8A 5FPMA 1BOTO 1HLUA 5KQDA 1IG8A 4H5NA 1G99A 1ZC6A 3VOVA 2D1KA 1SZ2A 4JNEA 4CBXA 2Q1NA 5AZJB 5BREA 1CZAN 2DPNA 2GTDA 5AQZA 4FWPA 4QS8A 3H46O 4DB3A 3O08A 3HTVA 3KHYA 4BG8A 5LJWA 3F9MA 2GEMA 5CE3A 3FZMA 4LC9B 1K8KB 3VPZA 1LCUA 1Y64A 1GLAG 3RSEB 2GWJA 2YJFA 2P9NB 3FFKB 3FZFA 3JXUA 4H03B 5JLFA 2QWLA 4O8KA 2P9IB 4FO0A 5EX5A 3GL1A 1SAZA 4XH1A 3LDNA 3VESA 1KAZA 4CZIA 3B8AX 2CGLA 2ZWHA 3SMSA 1NGBA 3FZHA 4HWIA 5AQQA 1BDGA 4MLEA 1KAYA 3R6MA 1NMDA 3ATUA 4BQZA 1MA9B 3P4IA 3FZKA 5JICA 4H0YB 4RCHA 3DXKA 3WXKA 4PL7A 5TKYA 2Q31A 1XC3A 3VF6A 1BU6O 4KBOA 3VEYA 2P9IA 3FZLA 2A41A 3CJBA 4XEIA 3FLCO 2P9KA 4H5TA 4BRGA 4CZEA 5BRDA 5AQSA 4BC2A 4WQ5C 3L6QA 3CQYA 1Z6RA 5F2RA 2P9PB 1NGAA 3EN9A 1GLLO 2EWSA 3H45C 1H1VA 2QWMA 3VEXA 1NGDA 3AAQA 3LM9A 3VERA 2E1YA 3LDLA 5AR0A 1JCFA 3L0QA 5BPNA 3UKRB 5BRFA 3ZX2A 3BUZB 1X9JA 1HUXA 3TPQA 2P9LB 3L4IA 1C0GA 3C0BA 4BR0A 3VEZA 3W3DA 4BRFA 3WXLA 5E26A 1X3MA 4FOIA 2QWOA 1TYQA 3IMXA 4ISEA 4ISGA 3VF4A 3J8AA 2V51B 2Q36A 2P9SA 3DJCA 5AQYA 4DCHA 5BN8A 3H1VX 4FPAA 1NGGA 4A62A 1TUUA 5KPZA 3H3NO 4FWMA 4AM6A 2GELA 1IJJA 2WUSA 2YHXA 3CI5A 4M7YA 4M7XA 2A40A 2CGJA 2NLXA 3LDOA 4IZ9A 2BTFA 5FPNA 5LJVA 2E20A 3R9PA 3CJ9A 4MO5A 4PKHA 4YDUC 3QBWA 3SMPA 4F9OA 3SJHA 4BROA 4MO4A 5EXWA 4EHUA 2V7ZA 1NGFA 2E2OA 2YHWA 3BF3A 3ZETB 4FSVA 2IVPA 2VWBA 3CJ7A 1WUAA 3FGUA 5AFUH 3MK6A 4YDUA 3WEEA 3IDHA 3VEOA 4BRIA 3GOIA 4CZMA 3IUCA 3MN7A 2IVOA 1GLBG 2Q2RA 1ZBSA 3EKUA 1NGHA 3WUHA 5JMVA 3JS6A 1T6DA 3BP8A 5AQLA 2ASPA 5BPMA 3HM8A 3ZETA 4CD3A 3U4LA 4BR9A 4K43A 4BVPA 2I7NA 3D2EA 2QW9A 4B1XB 4BC3A 4DQ8A 4CZFA 3CERA 4K42A 4E1JA 2Q0UA 4BR2A 4IWVA 3R8EA 4CZKA 4FWNA 2HOEA 3HSCA 4O5FA 4A61A 5KPTA 2E8AA 2Q97A 4H5RA 4Y0WA 3S41A 1X3NA 3DXKB 3A5MC 1DKGD 3QFUA 2V52B 5AFUA 2A3ZA 4FWQA 3CQXA 2P9KB 1DGKN 2HF4A 4H5VA 3WXIA 3ENHA 3WXJA 1EQYA 1V4TA 3AARA 2ASMA 4PL8A 3I8BA 4H0PA 3MMVA 5AQHA 2CGKA 1JCGA 4EFHA 3IFRA 3KZBA 4NO7A 4PKGA 1NGEA 1ATSA 3CETA 3GE1A 3MN9A 2HMPA 1TUYA 1ATNA 4CD1A 5AQKA 4BREA 3CJAA 2FSNA 3O1BA 4BRPA 3QBXA 5FPEA 3QMLA 4XH4A 4A2BA 3WQUA 4BRKA 4I6MA 4NB4A 3AAPA 4BRDA 1TYQB 3MDQA 1ZXOA 1BG3A 2E2NA 2P9SB 5AQUA 5AQGA 4XH5A 4WQ5A 4FOEA 1YAGA 5AQIA 4DHYA 3BF1A 3U8XA 3EO3A 4CZJA 3O8MA 1BWFO 4BRCA 3MCPA 3VGMA 2F9WA 2NZTA 1YXQA 1QZ5A 3A0IX 3D7EO 2UYTA 2W40A 2FSKA 4BR4A 2AA4A 4B1VA 5ELZA 1E4GT 1ESVA 3VENA 1GLJO 1T6CA 3I33A 4L3QA 2FF3B 5E84A 2ZF5O 3C7NA 3EZWA 1NGJA 1QQOA 1BA1A 1QHAA 1J6ZA 4CBWA 2QWNA 1Z05A 1BO5O 1KXPA 2E88A 2KHOA 4BQLA 5F0XA 3BEXA 3WEEB 4FWKA 1E4FT 4BRQA 4QS7A 3U9DA 4BRNA 3DXMA 2GWKA 3G25A 1HJOA 3ULEA 3O4WA 4IXCA 1HKBA 2P9UA 1KAXA 1GLDG 2E2PA 3FR0A 3H3OB 3A5NC 4B9QA 4K25A 2NRHA 1QQMA 4BRMA 2D4WA 3WQTA 4H5WA 3M1FA 2FF6A 4M63C 3GBTA 4BGBA 2ITMA 3D2EB 3DAWA 2AP1A 5AQXA 2YI1A 2VYPA 4WQ4C 3HI0A 3VGLA 4H0TB 4JD2B 4CZGA 1SQKA 3UE5A 4BGAA 1GLEG 1NGIA 5LY3A 4A2AA 3DWLA 1MWKA 1XQSC 2FLOA 3A5LC 1MDUB 3EL2A 2A5XA 3GDQA 1MWMA 3M3ZA 3CIPA 1U6ZA 4Z94A 4JD2A 1S22A 2HF3A 5BRHA 3UKUA 4GNIA 4BRHA 4H0XB 1NLVA 5FPDA 4BVOA 3HBTA 4HTLA 4JHDA 3O6WA 5I9EB 3H1QA 5AQJA 3ZEUA 4FWOA 2FSJA 3D2FA 3M6GA 3SK3A 4FL9A 3WT0A 3TU5A 4BG9A 5AQFA 4CZLA 1U2VA 1RGIA 5BPLA 3U9ZA 1XUPO 2W41A 4B1YB 1GLFO 1QZ6A 5AZIA 5EVZA 3EKSA 2IVNA 3W0LA 4I6MB 1YVNA 2CH6A 2ZGZA 3ENOA 4BC5A 2J4RA 1HX1A 2I7PA 3VETA 4IJAA 4BR5A 2QWQA 1V4SA 1GLCG 3A5OC 4AM7A 5AZJA 3QDKA 1RFQA 3H6EA 5AQWA 2H3GX 3HZ6A 3A8YA 1K8KA 3KVGA 2PBDA 4B1ZA 4IJNA 5AQMA 4CBUA 5B8HA 3RSEA 1NM1A 1D4XA 2P9NA 3LL3A 2PAVA 3SLCA 3C7NB 1S3XA 2QXLA 2YCHA 4BRLA 3VF2A 3ZX3A 1HKCA 2CH5A 3VEVA 2GUPA 2E1ZA 1OKJA 1WOQA 1NBWA 3QFPA 5AQRA 4QS9A 1C0FA 5ADXH 3DXMB 3ULEB 5AQOA 1NWKA 2QWRA 5AQNA 4CJ7A 5AQVA 4PKIA 2P9UB 4EAHD 2QWPA 4GY2B 5JLHA 2VCPA 3ZX0A 2OANA 2D0PA 2YHYA 3LM2A 4BRAA 3CHWA 4IO8A 2IIRA 2P9PA 4BC4A 2FXUA 3QICA 5BN9A 4FWLA 2E2QA 2D0OA 2ZGYA 4J8FA 5EOYA 3MN6A 4B1UB 1T44A 3AY9A 1BUPA 1BA0A 4RTFD 5EY4A 2F9TA 1R59O 3CJ1A 3O5BA 4BR7A 1LOTB 4FWSA 3UKRA 1Q18A 2QM1A 1ATRA 2V7YA 4EHTA 5BR9A 1P8ZA 4MLHA 4CZHA 3QB0A 5ADXA 5AQTA 4JAXA 1QQNA 2P9LA 2YJEA 3CJCA 4C23A 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DEJA 1KVAA 1JCEA 3UKUB 3VQDA 3NCIA 1XHZA 3CYGA 2W00A 4CFAA 1Z25A 4FYDA 1HYSA 1K8AO 4YOUA 3ZSZA 3THXB 4WYBA 3ZEUB 4A5AA 1ASUA 4O4GA 1RT6A 4OKKA 2D0AA 4IFYA 5AZIB 3QEXA 2W6LA 1VQ9N 5GADP 1NK4A 3ID8A 3VQQA 3QEPA 5CYMA 1IG8A 2QA4N 3PY8A 4FLYA 1A5WA 4Z4EA 4CK1A 1LWCA 3V1QA 1NJXA 5AQZA 1RTJA 2D0BA 4F3TA 5T7BA 4BY9C 3K9KA 3HTVA 2IC3A 3KHYA 3LP0A 2GEMA 3NMUA 1BGXT 1VK0A 3FZMA 3O4NA 1W97L 4DSKA 3M8SA 3VPZA 1LCUA 1GLAG 4FLWA 3JXUA 5FDLA 3AGRA 4E7HA 4DQSA 2HHVA 4O8KA 4DV0K 5JS2A 4AF1A 3R1XA 3GL1A 2P1JA 4FJGA 1RTDA 4CZIA 3SQ1A 2UUAK 2CGLA 2ZWHA 3FZHA 5AQQA 4DR7K 1BDGA 4DTSA 2HHTA 1XC9A 1TL3A 4KH4A 3R6MA 4BQZA 5JICA 1MA9B 3P4IA 3FZKA 3MEGA 4RCHA 2I5JA 5TKYA 3ASMA 4F4KA 3K5NA 4KBOA 4YOTA 4I2PA 4FCYA 3CJBA 4DV2K 4R79A 1VQPN 2HBKA 4BC2A 3E9LA 3C95A 3L2QA 1T3VA 2HBLA 4DR6K 3EN9A 4JEPA 4I9QA 1NKCA 3VEXA 3KTQA 1NGDA 4FW2A 1HQUA 3LM9A 5D3GA 3VERA 3ZT4A 3LDLA 5AR0A 4W5QA 3T7ZA 3L0QA 1VSJA 5BRFA 4FM1A 3ZX2A 1ASWA 1LWEA 3BUZB 2PFUA 1RT5A 1HUXA 3P83D 1N34K 2XY8A 2P9LB 3L4IA 1C0GA 3C0BA 4B9TA 3HO1A 3W3DA 4DUZK 4FLZA 3H08A 5E26A 1X3MA 3NGZA 4JS5A 1TYQA 4ISGA 1OH5A 3PO5A 5AQYA 1VSMA 2JWLA 4DCHA 1NU0A 1XI1A 4FPAA 1TUUA 3KJVA 1RTHA 4XJXA 4AM6A 3L3UA 1KRPA 1L3SA 1VHXA 4FJ8A 3LP3A 2HHUA 4KTWA 2NLXA 4J2AA 2BTFA 4WFNL 3CCEN 5FPNA 3DMJA 5LJVA 4CEBA 4B3OA 4MO5A 4J2EA 4YDUC 1U49A 3QBWA 3V6DA 3RTVA 5I3UA 2JLEA 4AHCA 5M1KA 1YHQN 4B3SK 2V7ZA 3BF3A 3D45A 3MK6A 3CC7N 3HL8A 5HP1A 3THYA 1S9EA 1O13A 3NH1A 3IUCA 4FJHA 3T19A 3NAEA 4HTUA 1SL1A 1IKYA 3MXJA 3JS6A 4GVEA 1YITN 4CGIA 3VA0A 4MDBA 1B9DA 4DQ8A 1Z26A 2Q0UA 1SKSA 4BE0A 4FWNA 4O5FA 1X3NA 2HHQA 4WE1A 4FJXA 2A3ZA 3DLLL 5CZ1A 1JLCA 3E9PA 4DFPA 4A59A 1M1KO 4ELVA 1V4TA 3HXMA 5K14A 4H0PA 4C8MA 5AQHA 4B9SA 4PKGA 1NGEA 4CE9A 3CETA 3GE1A 2B6AA 4NLCA 4CF2A 5AJ3K 4N76A 4IOCL 1EX4A 5DM6L 4CJTA 3V9WA 1TUYA 1Q86O 4CD1A 3SNNA 4DF8A 2F4VK 3O1BA 4LFCK 1ZBFA 4O5BA 3KD1E 5FPEA 3ISNC 3WQUA 2G8HA 4NB4A 1UAXA 1MU2A 4IG0A 4HUEA 4M3UA 1VQ6N 5AQGA 4WQ5A 3PSFA 4ILGB 3K9JA 5A2QO 1L3VA 3RR7A 3KLGA 4IOXA 1NK0A 1BWFO 4JKAA 4O0JA 4PWDA 2Y1IA 3MCPA 1NK6A 3C6TA 4J2DA 4FLUA 3TANA 2VGNA 3BDPA 1FKOA 3R3LA 1RBSA 3D7EO 5C0YA 2W40A 4BR4A 4KV8A 5ELZA 1OVYA 3SUPA 1GLJO 3G71N 4YHHK 3U3YA 4LFBK 4DV7K 3J7AP 1NNEA 3C7NA 3OS2A 1QQOA 2WBNA 4DKWA 1QHAA 3AO2A 4G9ZA 3CM6A 4IG3A 3VQ8A 1BO5O 2KHOA 5F0XA 3WEEB 4O8UA 4M42A 3CFRA 3TTCA 2ZJQL 4BRNA 3OVNA 3G25A 1I3AA 3SV3A 4C8KA 2E2PA 1GLDG 2D4WA 3WQTA 4CEZA 2IOCA 1YIJN 4DSJA 4K8ZA 4CF9A 3A2FA 3O9SA 2ITMA 3DAWA 2NNWA 3CCQN 2VYPA 3G10A 3HI0A 1VSHA 3V9XA 3RRGA 3P31A 1TKZA 4B9VA 5KRSA 4DTXA 1Q9YA 1VQ4N 1KVCA 3A5LC 4W5RA 4DV5K 2A5XA 4O44A 3CYMA 4FJ9A 4DFMA 2G8WA 4KPYA 1RDAA 3OYBA 2HF3A 3UKUA 2HHWA 1T05A 1NLVA 3AO4A 1LV5A 5FPDA 3HP6A 3O6WA 3DYAA 3THXA 5I9EB 3SPYA 4O0IA 3ZEUA 2C1IA 1U48A 1JLBA 1WSGA 3TU5A 3KLIA 2WOMA 1RGIA 1M90O 3U9ZA 4K0KK 3PX0A 4OPHA 1GLFO 1CZ9A 2JGUA 2PYLA 4DLGA 5AZIA 3S3MA 4OO1J 2IVNA 3W0LA 4I6MB 4BE7B 3ENOA 1XNQK 1W0HA 4JRPA 2QWQA 1NK9A 4MQ3A 3J7YP 2OPSA 4AM7A 4ELTA 1QS4A 4CJKA 3SAGA 3QDKA 3H6EA 4E19A 2B5JA 1LAWA 3AVKA 1TKTA 3A8YA 3DLKA 3KVGA 2PBDA 5GAEP 3JAMO 4YOYA 3NH2A 1ZBHA 4CBUA 1QVGM 4CECA 1Y97A 5M1PA 3WNGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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