2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
b'VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Structural protein
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
1E4FT 1GLBG 3CERA 2F9TA 3O80A 1NGAA 4JHDA 3BF3A 1X3MA 1GLLO 3GDQA 3BEXA 3D7EO 2E2NA 2ZGZA 2QM1A 4CBUA 3GL1A 5AQGA 1ZBSA 1GLAG 4XH1A 5EOYA 1BA1A 3B8AX 2NRHA 3HZ6A 4A2AA 1XQSC 2E2PA 5AQTA 3HBTA 3J8AA 3UKUB 1NWKA 4MO5A 1Z05A 2FF6A 2QWPA 1HUXA 4WQ4C 5BN8A 3S41A 4FWQA 1GLEG 4FWSA 4O5FA 2Q0RA 3MDQA 2P9KB 2CH6A 1BWFO 1NGFA 4M63C 3VESA 1NGDA 2QWNA 4BRMA 4H03B 2QXLA 3CJAA 4BRIA 3C7NA 2A41A 3LL3A 2FSJA 1CZAN 5AQQA 1V4TA 1XUPO 2P9LA 3VENA 3WQUA 3O1WA 1ATRA 2YJEA 2ASPA 2KHOA 5AQLA 1GLJO 1T6DA 5BR9A 2IVOA 2YI1A 1U2VB 5BRHA 5KQ8A 3WEEB 3VF4A 3SMPA 4DHYA 3FZLA 4FWOA 3SMSA 1BOTO 2E88A 4K43A 2QWLA 2ZWHA 3CQXA 3VEVA 4WQ5A 3UE5A 4IJAA 3VGLA 2CH5A 3UKRA 2E20A 4BRDA 3CJ9A 2J4RA 1T44A 4BR2A 4PL8A 4FPAA 3MN5A 3FLCO 5AQMA 4BRFA 5AQPA 3L0QA 3ULEA 5AQUA 5BN9A 4BROA 3VERA 1X9JA 4RTFD 4BR4A 3CJ1A 4H0OA 4B1XB 4DB3A 3I33A 3AARA 4FOEA 4YDUA 3G25A 3HI0A 5AQIA 3R8EA 5BPLA 4FL9A 2Q31A 1BA0A 3ZEUA 5LY3A 3A8YA 4L3QA 2E1ZA 3FZKA 2GELA 1BG3A 1BDGA 2GTDA 3HSCA 4A2BA 4H0TB 3MCPA 1DEJA 1G99A 3BP8A 2A3ZA 2DPNA 4FSVA 3IFRA 3MMVA 5KPRA 4QS7A 5ELZA 2QW9A 3VEZA 4C23A 4LC9B 2GWJA 2YHWA 4XEIA 2P9SA 3DXKB 2PBDA 3VEWA 2D1KA 5JMVA 3FZFA 1S22A 4CZKA 3GOIA 3ZX2A 3FR0A 3A5LC 1NM1A 5AZIB 1X3NA 3D2FA 4K41A 4QS9A 3ZETB 4BRLA 3RSEB 2P9NB 2ITMA 2CGLA 1C0GA 4DCHA 1GLCG 5AZJA 4CD1A 1U6ZA 5AQSA 1WOQA 4A61A 3HM8A 2ZF5O 5LJVA 3HTVA 2P9PA 1V4SA 3DXMA 4BGAA 1NGIA 1EQYA 4HWIA 5AQJA 4E1JA 3M3ZA 2GEMA 4BC4A 4ISFA 2D0OA 5BRDA 2VCPA 4BRPA 3A5OC 3H3NO 1NGBA 4H5WA 5BPNA 1D4XA 3BF1A 3WQTA 1T6CA 3D2EA 4F9OA 3WXKA 2VYPA 2FLOA 4JHDB 3UKUA 1ATSA 1C0FA 2I7PA 4I6MA 5AQKA 3AY9A 3U9DA 1MWMA 4JNEA 3DWLA 1KXPA 5I9EB 3LDQA 5AQVA 3W0LA 2A42A 3C0BA 3KHYA 2IVNA 2V7ZA 3VEXA 5BREA 3QDKA 4QS8A 1P8ZA 1K8KA 3AAQA 3EN9A 1E4GT 4BR7A 4CZGA 1TUYA 2V7YA 3R9PA 4AM7A 3O6WA 4BC2A 2V52B 2W41A 4H0VB 3SK3A 2HF3A 1YXQA 1ATNA 2BUPA 4H5RA 2ASOA 4IXCA 2NZTA 3QB0A 3I8BA 4BC3A 1NGEA 1HLUA 3FFKB 4FWKA 5EX5A 5F0XA 4PL7A 3VPZA 2QWQA 1QHAA 3WXLA 5AQWA 3TPQA 4B1WB 4B1ZA 3AAPA 3FZMA 4Y0WA 3QFUA 2P9IA 1JCEA 3C7NB 1ZC6A 2A5XA 3H3OB 1JCGA 1KAXA 3GG4A 3EO3A 3QICA 2P9UA 1QQOA 4XH5A 2P9LB 1QZ6A 3FE1A 4IZ9A 4CBWA 5BPMA 2W40A 2AA4A 3M6GA 4CZFA 1GLFO 3CI5A 4WQ5C 4IJNA 3MN9A 4FWPA 1NLVA 1HKGA 1XC3A 3IDHA 3ZX3A 2E2OA 1R59O 4GNIA 3DJCA 1NGCA 5EY4A 3BUZB 2QWOA 5EXWA 3UB5A 1LOTB 1SZ2A 3VF2A 3QBWA 4FWLA 5AQNA 5FPDA 3GE1A 1RFQA 4H0YB 1J6ZA 4RWTA 4YDUC 2AP1A 2Q1NA 2QWRA 4WYBA 3ULEB 2FF3B 4AM6A 1H1VA 2YHXA 4EHTA 5AQYA 3H46O 4GY2B 4JD2A 5AQZA 1MWKA 4FO0A 4JAXA 4EHUA 1GLDG 3CJBA 4B9QA 1Y64A 3ZEUB 1MA9B 3CQYA 2YJFA 3U9ZA 3L4IA 5KQDA 3R6MA 1MDUB 3A5NC 2CGJA 1OKJA 3FZHA 1TYQB 5AZIA 4BRKA 1Z6RA 3VGMA 3CJ7A 4EFHA 1YVNA 3ENOA 4BVOA 3LM9A 4CZHA 2D0PA 2GWKA 3LM2A 4KBOA 5AFUA 1QQNA 1IJJA 5JLFA 4CZJA 2P9SB 5ADXA 5AQRA 1BO5O 1QZ5A 3EZWA 2E2QA 3H45C 5EVZA 3O1BA 3SLCA 1HKCA 3D2FB 4K42A 1HPMA 3CIPA 4IWVA 2H3GX 3W3DA 3LDOA 2IIRA 2CGKA 5AZJB 4H5NA 4JN4A 2EWSA 3M1FA 3MN7A 3ATUA 3CJCA 3ID8A 4FPBA 3WXJA 3ZX0A 2FXUA 4O8KA 4NB4A 3VGKA 2E1YA 4B1VA 2P9PB 3TU5A 2A40A 1RGIA 2FSKA 3A5MC 3DXMB 4CZIA 4MLEA 4A62A 3EL2A 5AFUH 2QWMA 3F9MA 5ADXH 3QMLA 4CZMA 3VETA 5LJWA 3VEOA 3U8XA 2P9KA 4PKIA 3VEYA 4NO7A 3VF6A 2HOEA 2Q36A 4CZLA 4WQ4A 4FOIA 4K25A 1IG8A 3D2EB 2IVPA 1QQMA 4FWMA 1TUUA 5FPMA 3WUHA 4BQLA 5F1XA 3DAWA 1NGGA 2WUSA 2Q2RA 4I6MB 4PKHA 4PKGA 2V51B 5E84A 2FSNA 3O4WA 1KAZA 3ATVA 5AQHA 5AQXA 1SQKA 1U2VA 3QBXA 4BRCA 5KPZA 4B1YB 3WEEA 4CJ7A 1K8KB 2I7NA 3O8MA 1HX1A 1LCUA 1HJOA 1YAGA 4BVPA 5JICA 4EIAA 4BG9A 4M7XA 2YCHA 3JS6A 1YUWA 3CHWA 4EAHD 4BGBA 4BRHA 1WUAA 4J8FA 4BQZA 2HF4A 3H1VX 5AQFA 5F2RA 3MN6A 2Q97A 1SAZA 3OHRA 4Z94A 5AR0A 4BR5A 1DGKN 3IMXA 4B1UB 2ZGYA 3LDLA 3QFPA 4BR9A 1NMDA 5TKYA 5CE3A 4CD3A 2D4WA 3IUCA 2P9IB 3LDPA 2VWBA 4CBXA 3CETA 3ENHA 3H6EA 3JXUA 4BRAA 4BRQA 2P9UB 2F9WA 3O5BA 4IO8A 3UKRB 3O08A 2OANA 3VOVA 1NBWA 3FGUA 4BG8A 4FWRA 3U4LA 1S3XA 4H0PA 1NGJA 3SJHA 2Q0UA 4MO4A 4XH4A 4BREA 4RCHA 4MLHA 1HKBA 1DKGD 2YHYA 4BC5A 3EKUA 5FPNA 3WXIA 2ASMA 3MK6A 3L6QA 3P4IA 4ISGA 5FPEA 4H5VA 5AQOA 1ESVA 2A6AA 3DXKA 1NGHA 4BRGA 5E26A 4H5TA 4ISEA 1ZXOA 1TYQA 1Q18A 2NLXA 1RDWX 3ZETA 3H1QA 3RSEA 2P9NA 3EKSA 1BU6O 4JD2B 5KPTA 3LDNA 4H0XB 4FWNA 4CZEA 2E8AA 2HMPA 3WT0A 1JCFA 1BUPA 5BRFA 4HTLA 2BTFA 1KAYA 3KVGA 3KZBA 4CI6A 2PAVA 5JLHA 4BR0A 4BRNA 4M7YA 4DQ8A 3A0IX 2GUPA 2UYTA 3GBTA 5B8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E4FT 4X66K 3O80A 3VQ8A 4JHDA 3BF3A 4DFKA 1JLAA 3AVBA 1X3MA 1GLLO 1I39A 4CGFA 3NFAA 4JYAK 1VSMA 1S6PA 4Z4FA 1KRPA 4DSEA 1BA1A 3S5TA 2NRHA 1J54A 1C6VA 3DRRA 4ILJA 3NVMA 2O4IA 2D0AA 3L2WA 4YOWA 3DLRA 3M8SA 3THYA 3UKUB 4X62K 5IT9O 1EETA 4B3RK 5LMNK 3HYFA 3TAQA 1L3SA 1J5EK 2X78A 2P9KB 1C1AA 3OYAA 2QWNA 4DV2K 4H03B 4BRIA 2HHTA 4KO0A 2A41A 3LL3A 4AHVA 1ASWA 1U04A 3KK7A 4JV5K 4HCCA 1M1KO 3ZSQA 2P9LA 4RW9A 1HQUA 4Q0BA 4PQUA 1NK9A 3ALYA 1WNSA 3V4IA 3CYMA 3HP6A 4DHYA 3SMSA 3ZLJA 1BOTO 2E88A 3OBWA 3NCIA 2UUBK 5JS2A 3VEVA 4WQ5A 2HHWA 1OH6A 2G8UA 2GUIA 2DFHA 1XI1A 5JVHL 4RW8A 3CFPA 2Y1IA 1ZYQA 1P90A 2FBYA 5AQMA 5HP1A 1S1TA 3MWTA 3L0QA 3ULEA 1RCHA 4DMNA 4DV4K 3OYMA 3HPHA 4CHQA 1CXQA 4Y1CA 4FOEA 3NAEA 3MXMA 1BA0A 4L3QA 1Q9XA 2DY4A 4AHRA 3B6OA 3PV8A 4DSLA 1BDGA 4Z0UA 1YI2N 3ULDA 3P1GA 4H0TB 1DEJA 4M41A 1XNQK 4CJRA 2UXCK 3KKRA 2DPNA 3IFRA 3CCEN 4WFBL 4DUZK 4JKGB 3VQAA 1Q81O 1S6QA 4QS7A 5ELZA 1UA1A 2QW9A 4C23A 4LC9B 3CCJN 4CHZA 4L8RB 4DWIA 2P9SA 2HHSA 3PO4A 3VEWA 3KLHA 3M8QA 3VQ4A 3FR0A 3OS0A 3VQ9A 5M1QA 2FC0A 4FVMA 5AZIB 4K41A 4BRLA 2ITMA 2O8CB 1XMOK 5AZJA 2RN2A 5FRNA 1U6ZA 5AQSA 4E7KA 1WOQA 1BQMA 5CZ1A 3HM8A 4CCHA 1NNEA 1IBKK 3AVMA 5HROA 4BGAA 2G8WA 2E6LA 1EQYA 2XO7A 1HNWK 1KVBA 3M3ZA 2GEMA 4BC4A 4U67L 5M1KA 1YJNN 1BHLA 3C65A 4FZYA 3VMFB 1BGXT 4FLXA 2XY6A 1VSLA 2Y1JA 4JHDB 2PY5A 1YTAA 4JKBA 5AQKA 3AY9A 1MWMA 4FJ7A 3ENBA 3K5OA 4OPHA 4ILHA 3SJJA 3W0LA 2A42A 5BREA 2V7ZA 3QDKA 3AAQA 3ZSYA 4CZGA 4B8AB 1RT4A 1NJIO 2V52B 3CCLN 5MLCQ 3THYB 3RRHA 5CR4A 1WLJA 1YXQA 1SL0A 4H5RA 3RMCA 4CJUA 2ZJQL 4CF1A 1U4BA 1HLUA 1W97L 5F0XA 2G8VA 3S3MA 1IV0A 1EO1A 4F2RA 3OYHA 5AQWA 4B1WB 4CJ5A 3LAMA 1I94K 3FZMA 4Y0WA 3DRSA 3EY1A 1JCEA 2C1IA 1ZC6A 4H4OA 4JI1K 4XH5A 2WONA 3AGKA 3MEEA 2P9LB 4DTOA 3FE1A 1N6QA 5BPMA 4CZFA 5SZTA 1GLFO 4J2EA 4WQ5C 1QVFM 4DU1A 4Z4GA 3LWMA 1HKGA 1XC3A 1VAZA 3DOKA 3QINA 3DJCA 3WNGA 1HNXK 1IO2A 3VQ6A 1Q86O 4GV3A 4RW7A 4FWLA 1RFQA 4IBNA 1J6ZA 2YX6A 3LP3A 2HHHK 5T7BA 4WYBA 3ULEB 3QETA 4A5AA 5HRPA 2ZJPL 1TGOA 1RBUA 2KQ2A 5AQYA 4DQPA 1JLBA 3ITHA 4YHHK 4FO0A 1O1WA 4B9QA 3CQYA 4B3TK 4DR7K 3AA4A 5HL7L 3D0PA 2YKNA 3FZHA 1TYQB 3NF6A 2F96A 3VGMA 3CJ7A 4JI7K 3AGRA 3ENOA 3MCAB 3SUOA 1VQ6N 3PSFA 4NLCA 4FXDA 3O9UA 4C8MA 5AFUA 5JLFA 2P9SB 1DTQA 5AQRA 3OYGA 4RW4A 1EKEA 4B8CA 1YITN 1Y97A 5EVZA 3THVA 3B6PA 3ZSVA 1HKCA 3VN5A 1W9HA 4ID5A 4BDPA 5C2DA 4JI0K 3AVIA 3LDOA 4EP5A 2O8DA 5AZJB 4CE9A 5C10A 2VWKA 3E9OA 2EWSA 2KFZA 2FXUA 4NB4A 3VGKA 4FJGA 4FZZA 3ISNC 3A5MC 3L2VA 5TKWA 1WSIA 2HB5A 2R7YA 4ICLA 3EL2A 3IKMA 5ADXH 3L3UA 4F3TA 3VEYA 3V1RA 2D0CA 3OS1A 2HOEA 4FM2A 2Q36A 4B9VA 1N34K 3AVJA 4FOIA 2DFEA 2NRVA 3F2KA 2IVPA 1QQMA 4JRPA 4FWMA 3WUHA 4EP4A 3DAWA 1D5AA 4YFUA 3CFRA 3ATVA 3ZYYX 4QCLA 5AQXA 3U3GA 3QEVA 4BEBA 4B1YB 3WEEA 4A5BA 1TK8A 1HX1A 2KFNA 4E7JA 1SKSA 3M8PA 3S3NA 4OKEA 4OLAA 1YUWA 1WUAA 4J8FA 4FVUA 4BQZA 3TWHA 3VA0A 2HF4A 1RILA 3H1VX 3MN6A 2ZE2A 3C95A 4Z94A 1BI4B 4E72A 1S1XA 1L3UA 3IMXA 2G8FA 3O3FA 4CECA 4XJXA 1A5WA 4O4GA 1U47A 1N32K 3IUCA 1IKVA 4JKCA 3OJSA 4DV7K 3SBGA 3ENHA 3T1YK 2F9WA 3CF5L 3DLBA 2HW3A 4OX9K 3AVKA 3QIOA 1NBWA 4C1NI 1QE1A 3LPUA 4MO4A 3WXIA 2ASMA 3L6QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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