2P9IB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
354
structure length
272
Chain Sequence
VVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALDDMKHLWDYTFGPLLTEPPMVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
total genus 76
structure length 272
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB02
3.30.420.520 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iB03
3VGKA 5BPNA 3A5MC 4IZ9A 3U4LA 3LDNA 4B1UB 2H3GX 4PL8A 4MLHA 2D0OA 3LM9A 5ELZA 3L6QA 3A0IX 3IMXA 3CERA 4K43A 5FPMA 4A61A 2E20A 1ATSA 1HLUA 5E84A 3WXIA 4DHYA 2E1ZA 5AQVA 2YJEA 1JCEA 3H6EA 4BRHA 4FOEA 2FSJA 4BG8A 4FO0A 3M3ZA 2D4WA 4BGAA 1XQSC 4BRQA 3DXMB 5JMVA 3OHRA 4K42A 1NWKA 2A6AA 3TPQA 5EY4A 3EN9A 3H46O 5AQMA 3UKRB 3UKUA 4B1ZA 5AQSA 4EHTA 1NLVA 3ENHA 2YCHA 4JD2B 4BR7A 3EL2A 3BUZB 1ZC6A 4B1XB 1R59O 4RWTA 5ADXA 3A8YA 1HKBA 1QHAA 2F9TA 3EKSA 3O80A 3CJ1A 4BRMA 4O8KA 1T6CA 3VENA 1ATRA 3FLCO 3EKUA 1TUYA 4IXCA 3VEZA 4BRIA 3IUCA 3LDLA 3VEWA 4IJAA 3VF4A 4FL9A 1S3XA 4CBUA 3MMVA 3CI5A 5AQOA 3H3NO 4L3QA 1NGHA 3AY9A 3WXJA 3CQYA 1SZ2A 4ISGA 4YDUC 3KHYA 2AP1A 2CGKA 5AQUA 4K41A 2E2PA 2YJFA 3FR0A 3WUHA 5KPRA 4FWOA 3ZEUA 4XEIA 5F1XA 3VETA 5KPZA 1U6ZA 1OKJA 1MWKA 2YHXA 4M7YA 1X9JA 1H1VA 4IWVA 2E1YA 5EVZA 2QWQA 2GUPA 4FWSA 3DXKB 5BN9A 3WQTA 2EWSA 1NGCA 3BEXA 1G99A 5AQPA 3CJBA 1QZ6A 1WOQA 2DPNA 3SMSA 3W3DA 3EZWA 1KXPA 2W41A 2ZGZA 4JHDA 1J6ZA 3HI0A 1GLEG 4A62A 5AQIA 4I6MA 5KQ8A 4MLEA 3CIPA 4CZFA 4RTFD 3ENOA 2IVOA 3BP8A 2P9KB 4CZGA 3VEVA 4H5WA 3JXUA 3DWLA 3H45C 3O1BA 4BR9A 4CBWA 3S41A 3C7NB 3D2FB 3HSCA 2P9UA 4XH4A 4A2BA 1NBWA 2FF3B 5AQXA 2I7PA 5AQNA 3P4IA 2OANA 1Z05A 3KVGA 1KAXA 2HOEA 1QQNA 3ZX2A 5BRFA 4BVOA 2E88A 4CZHA 4BGBA 5AQFA 4H03B 2YHYA 3M1FA 4JN4A 1K8KA 2CGLA 1ESVA 2QWRA 2P9PA 3L0QA 5F2RA 5AZIB 1QZ5A 5JLHA 3FZFA 1NGJA 3GL1A 4H0PA 1BG3A 1E4FT 3VEXA 2E2QA 3ULEB 2GWKA 5LJWA 5E26A 1BU6O 2P9LB 3TU5A 5AR0A 3ID8A 4BVPA 2J4RA 3DAWA 5AQWA 1RFQA 4CJ7A 4BRLA 4DB3A 2PAVA 3WXLA 4WYBA 1NM1A 2GWJA 3O08A 3MK6A 5CE3A 4HTLA 1HJOA 4EAHD 2YHWA 4FWNA 5FPEA 1KAZA 3UKUB 1U2VA 3EO3A 3ATVA 1LCUA 3AARA 4NO7A 5AQKA 1BWFO 1SQKA 3U8XA 1LOTB 1HKCA 1RDWX 4FWQA 4IJNA 2A40A 3RSEA 4BG9A 4CZLA 2I7NA 2V7YA 4CZMA 4PL7A 3D2EA 5TKYA 4QS7A 4BC3A 1TYQA 4BRDA 3QB0A 3CJ9A 4C23A 4XH1A 4CBXA 3GOIA 2A41A 3MN7A 1Y64A 4BR0A 4JNEA 1ZBSA 4WQ4A 4BRAA 4M7XA 4CZIA 2QWMA 3FFKB 4FWLA 4J8FA 3VESA 3VPZA 2HF4A 1MDUB 4BQZA 5FPNA 1P8ZA 1NGAA 2A42A 2A3ZA 3MN6A 2AA4A 4CD3A 3QDKA 3R8EA 2P9SB 4BRKA 3QMLA 3C0BA 2ASMA 4WQ5A 2P9NB 3AAQA 3J8AA 3FZKA 2CH5A 2FSKA 2KHOA 3CETA 3UKRA 1X3MA 1YXQA 2ASPA 3MDQA 1IG8A 2IIRA 4FPBA 1BA1A 2D0PA 3LM2A 1T44A 5BR9A 4BRCA 4JD2A 4JAXA 1QQMA 3ZX0A 5AQLA 5BRHA 4H0TB 3AAPA 1ATNA 4B1YB 2VCPA 3M6GA 3SLCA 4CZEA 1Z6RA 3A5NC 5AQYA 3LDOA 4ISFA 2CH6A 3B8AX 4K25A 2QWPA 4BRGA 4AM7A 5AQZA 2W40A 2ZGYA 1XUPO 5AZJB 2IVPA 2GEMA 4MO5A 5EXWA 4CD1A 1DEJA 3KZBA 4A2AA 3QICA 2P9PB 4BR5A 3HBTA 5I9EB 1E4GT 3WEEA 4BC2A 3QBXA 2V7ZA 2V52B 2E8AA 3QFPA 2P9IB 3JS6A 2BTFA 4B1VA 4PKIA 3FZMA 4FSVA 4BR2A 3CJAA 2F9WA 3HM8A 5KQDA 3WQUA 4XH5A 5FPDA 1YUWA 5JLFA 3GDQA 3WT0A 1BDGA 4WQ5C 4Z94A 4HWIA 4H0OA 2QWOA 4FPAA 5F0XA 1HX1A 4FWKA 1CZAN 3VEOA 2D1KA 1GLFO 3WXKA 2Q0RA 2ZWHA 2ITMA 4FWMA 3ZETA 2FLOA 2P9KA 3L4IA 1C0GA 2HF3A 5AQQA 4BRNA 3VOVA 1NGIA 3O8MA 1GLDG 3D2FA 2CGJA 2V51B 3MCPA 3H3OB 5BRDA 3LDQA 4CI6A 3BF3A 1MWMA 3FE1A 5BPLA 1BA0A 3H1QA 4BRPA 4YDUA 2ASOA 2QWLA 1HKGA 5LY3A 4PKHA 3BF1A 3I8BA 3O4WA 3ATUA 1NGBA 1BUPA 2Q0UA 5B8HA 5AZIA 2YI1A 4H5RA 3VGMA 1WUAA 1EQYA 2E2OA 2ZF5O 3MN9A 4KBOA 4FOIA 3CHWA 3ULEA 2P9LA 1GLCG 1JCGA 3ZX3A 3DJCA 3O6WA 1C0FA 4CZJA 3FGUA 2Q31A 4BC5A 5AQTA 1QQOA 4Y0WA 3UE5A 4H0VB 2QW9A 2UYTA 2HMPA 1V4TA 2Q36A 2VYPA 3ZEUB 1DGKN 4H5VA 5BPMA 4GNIA 2NZTA 3R9PA 3SK3A 1KAYA 4F9OA 3R6MA 4EIAA 3SMPA 3CJCA 1YVNA 3H1VX 2E2NA 5AQHA 3VF2A 1S22A 3DXMA 2NLXA 3FZLA 4B1WB 3A5LC 5AFUH 2GTDA 4NB4A 3VF6A 4JHDB 2NRHA 4GY2B 3I33A 4I6MB 1BO5O 3G25A 3HZ6A 4BC4A 4QS8A 3UB5A 3VEYA 2Q97A 4RCHA 4DCHA 2Q1NA 1HPMA 4H5NA 2PBDA 1DKGD 3LL3A 4MO4A 3FZHA 3QFUA 1X3NA 4ISEA 3VGLA 1GLAG 3A5OC 3O1WA 5KPTA 2P9UB 3F9MA 1GLLO 1HUXA 4O5FA 5EOYA 3LDPA 3WEEB 1SAZA 2WUSA 4H5TA 2QXLA 1MA9B 2P9SA 4M63C 4PKGA 4QS9A 4FWPA 3W0LA 4WQ4C 1K8KB 2P9NA 3SJHA 2FXUA 2VWBA 4H0XB 4EHUA 2Q2RA 3QBWA 4BRFA 3O5BA 3VERA 1BOTO 1NGFA 5BREA 1JCFA 3MN5A 4H0YB 3DXKA 3GBTA 3ZETB 3CJ7A 4B9QA 5BN8A 3U9ZA 3GG4A 1ZXOA 1GLBG 1NGEA 4BROA 3U9DA 1Q18A 3D7EO 5AFUA 2QWNA 4IO8A 4E1JA 1TUUA 1YAGA 2GELA 2FSNA 1NGDA 1NMDA 4BREA 5LJVA 4DQ8A 3IFRA 1XC3A 1NGGA 1GLJO 4LC9B 2BUPA 2QM1A 1U2VB 5AQGA 1T6DA 5AZJA 5JICA 5AQRA 1D4XA 4BR4A 4BQLA 4FWRA 3IDHA 3C7NA 5ADXH 3RSEB 5EX5A 4EFHA 2FF6A 3D2EB 3HTVA 2A5XA 2IVNA 3GE1A 5AQJA 4CZKA 1V4SA 2P9IA 4AM6A 3CQXA 1TYQB 1IJJA 1RGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HW3A 2HSTA 3U4LA 4DSIA 2H3GX 1N5YA 3LZJA 4JI2K 4L8RB 3NCIA 3CERA 4O44A 1N33K 1YI2N 3E9LA 4JLHA 2G8FA 4M3RA 3E66A 1DTQA 3AVBA 3M8PA 4A61A 2UUAK 1HLUA 3ID6A 1FKPA 5FLXO 4WFAL 2E1ZA 5AQVA 1JCEA 5FROA 2VQEK 3IRXA 4BRHA 3HPHA 4HUEA 4FOEA 2FSJA 3VQ5A 4BGAA 4BRQA 5C25A 2VG5A 4K42A 1N6QA 5EY4A 3EN9A 3H46O 3UKRB 5BR8K 4B1ZA 1YF5L 4LF5K 3OYJA 3ENHA 2YCHA 4JD2B 4BR7A 3BUZB 2DY4A 4B1XB 1R59O 4Q5VA 3AVIA 1GOCA 3LP0A 3O80A 2F9TA 4BRMA 4CJQA 1T6CA 3VENA 3TAMA 4CHNA 3EKUA 1U04A 3EZ5A 1TUYA 4BRIA 3NVKA 4CERA 4IJAA 3J7AP 3AY9A 1Q8IA 3TR8A 1SZ2A 4ISGA 4YDUC 4HVJA 2OPRA 4OPKA 4CGJA 3HRGA 4AQYK 1HR0K 3O3HA 3WUHA 1Q7YO 3SBTA 4E89A 3KWGA 4PQUA 1RT3A 2QTDA 4XEIA 2X6NA 5F1XA 4FJ7A 4KHWA 4BECA 1MWKA 1H1VA 3MCAB 5EVZA 3DLEA 3DXKB 4CJLA 3V81A 1JLCA 1G99A 3RRGA 3S3NA 3F5TA 4XJXA 2DPNA 3TTCA 4FJGA 3U6FA 3TAEA 2ZGZA 3CD6N 4LF9K 3HVTA 5KQ8A 2A1SA 3CIPA 3AVJA 3DOLA 2QKKA 2P9KB 2OZSA 4NXNK 4BDYA 5JENA 2KTQA 5KI6A 4CIFA 4KI6A 5A2QO 5M1PA 3WNGA 4CBWA 1JLBA 1Z05A 3RMBA 1KAXA 4DR2K 3G6EN 1QQNA 1SL1A 4CZHA 1KFSA 3AGRA 5AQFA 1NOYA 2G8WA 3AVAA 3J7ZO 4H03B 4AHUA 2YHYA 3ITHA 1K8KA 2G8VA 5JLHA 4H0PA 4M42A 2OTJN 1BG3A 3T19A 4E1MA 4CFDA 3KTQA 1RT6A 3ULEB 2GWKA 5LJWA 1E3MA 4IG0A 3OJUA 3TU5A 3OS2A 3ID8A 4BVPA 2J4RA 3DAWA 5HOOA 1RFQA 1LWEA 1A5XA 4BRLA 2HVHA 1T7PA 2PAVA 4FJLA 4YOXA 3OYFA 1VRUA 1KAZA 5FPEA 2F8TA 2WFBA 4FLTA 1U2VA 5J2NA 2UU9K 3ATVA 4C8OA 5AQKA 4DSEA 1BWFO 2Y1IA 1VQMN 2P5GA 1HKCA 1RDWX 4FWQA 4IJNA 4KTWA 2UXBK 4CZMA 3D2EA 1YVUA 1Z26A 4BC3A 2NRRA 4DG1A 4IDHA 4DTPA 5SWMA 1TYQA 3QB0A 1W97L 3RMCA 5I42A 2EX3A 3IG1A 2RPIA 4BR0A 4FK4A 4DFKA 1R0AA 4B08A 1YITN 4WQ4A 2RE2A 4M7XA 4DUZK 3FFKB 4U7BA 5C10A 3CC4N 3VPZA 3DLGA 4JS5A 1NGAA 3O9TA 4NCBA 2A3ZA 3D0PA 2NRVA 2AA4A 3OTOK 2P9SB 3QMLA 1C1BA 3O3FA 2P9NB 3CPWM 3U3YA 4FLVA 2CH5A 3FZKA 4Z0UA 4AILC 2UUBK 4CHYA 1X3MA 2KQ2A 3MDQA 2ASPA 3LM2A 3VQPA 1T44A 2LSNA 2GBZA 1D9FA 4RW6A 2RN2A 4JAXA 2KZZA 3ZX0A 1FJGK 5AQLA 5HRRA 3OYIA 4OX9K 3SLCA 4B3TK 1Z6RA 4FM1A 3LDOA 4GMJB 4CHOA 3VN5A 4ISFA 3CCMN 2CH6A 4K25A 1HMVA 2QWPA 4OPAA 3EE9A 1Q82O 2YNHA 3MWTA 1HNXK 3DLKA 1HNVA 2IVPA 3CFPA 1NK6A 5EXWA 4CD1A 1DEJA 4B9TA 4FXDA 1E4GT 5HRSA 4JRPA 2V7ZA 3AVGA 4CIGA 2HHQA 2QI2A 5C2FA 4BR2A 3CJAA 1HNZK 3HM8A 1N34K 5JLFA 3R1XA 4CGFA 3HVRA 4BDZA 4H0OA 1JJ2M 2D1KA 3M8QA 5J2PA 3V9XA 3ZETA 4CF9A 3ZLJA 1VQ6N 3F9KA 3L4IA 3O8MA 3MEEA 4EP4A 3D2FA 4YOTA 2P1JA 2GX9A 1KD1O 3CC7N 4IG3A 3ZCMA 2KW4A 4I2PA 3L3UA 3BF3A 1MWMA 3SZ2A 2EHGA 1I94K 4BRPA 3CCEN 3C6UA 4PA1A 4PKHA 3BF1A 3O4WA 4R79A 3ATUA 2Q0UA 5B8HA 1QE1A 4WCEL 4ELTA 1J5EK 1EQYA 2VG7A 3AVLA 3NGIA 2ZF5O 1NK0A 3J80O 1J9AA 4FOIA 2HHTA 2BH1A 3CHWA 2ZM6K 3KLIA 1JCGA 1S6PA 4F8RA 3DJCA 3AO1A 2P51A 4LF7K 4JI1K 4JI7K 2C1GA 4I9QA 4KTQA 5C12A 1F21A 2VYPA 2W6LA 4MDAA 4DU3A 3SK3A 3ZT1A 2HHSA 4RW8A 3SQ1A 3H1VX 1NJIO 4DQSA 1IKVA 2HHUA 3VF2A 4N47A 1QSLA 3FZLA 4B1WB 4FJ5A 4NB4A 4W5RA 3DLBA 1VQ4N 4GY2B 1GOBA 1SKRA 4BC4A 3UB5A 3VEYA 1TK5A 1TL1A 4CJKA 2Q1NA 2Z1IA 4H5NA 5C15A 4B9UA 4ILGB 3LL3A 3ZSXA 1ASVA 3QFUA 1KFDA 5K14A 3F9MA 3G0ZA 5IWAK 3NF8A 3V1QA 3PIOL 4O5FA 3WEEB 2WUSA 4OKEA 3QEVA 4MFBA 5DM7L 2G8IA 2QXLA 1QVFM 1RBUA 4QS9A 4FW1A 3DRSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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