4FPAA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i mutant d413n glucose 6-phosphate
Total Genus 335
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
335
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVNGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title DETERMINATION OF SITE AFFINITY CONSTANTS FOR PRODUCT INHIBITION of WILD-TYPE AND MUTANT FORMS OF RECOMBINANT HUMAN HEXOKINASE TYPE I
rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 335
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fpaA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fpaA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4fpaA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4fpaA03
3FZMA 1NGCA 5AZJA 3RSEB 1DGKN 5FPEA 1QZ5A 2V52B 2GEMA 1V4TA 2QWQA 3S41A 1TYQA 5AQOA 3GG4A 3QB0A 3ZX3A 1NGHA 2A5XA 4DQ8A 5AQZA 1K8KA 2P9LA 4DHYA 4B1VA 4BRFA 2QWLA 4WQ5C 4BRQA 1GLAG 3VEXA 3DXMB 1GLBG 3FR0A 3O4WA 4H5VA 3UKRB 4H0OA 4BG9A 4CD3A 2QW9A 5EVZA 3I33A 3JXUA 5AQUA 1IJJA 4MLHA 3VESA 3HI0A 3SK3A 3CJBA 1R59O 4CZGA 4E1JA 5KPTA 5LJVA 2E2PA 5ADXA 5AQLA 5JMVA 5B8HA 3BEXA 3H1QA 1NLVA 3ENOA 4FWQA 4CJ7A 3O80A 1TUYA 4FO0A 2NRHA 1E4GT 1QHAA 2FSNA 2KHOA 5AQPA 4K41A 1GLLO 3H45C 5KQ8A 1MDUB 4RCHA 1XUPO 1NMDA 2E2QA 1XQSC 1BDGA 3ENHA 4BR9A 1C0FA 4NB4A 4YDUC 2E88A 4H0YB 1BU6O 2A42A 1BUPA 1BA0A 5AQJA 3ZEUA 1JCGA 5KQDA 3MN9A 1WOQA 5BPNA 2QM1A 5BR9A 2ZGYA 4Z94A 5AQRA 2UYTA 4DCHA 2GWJA 3WUHA 3VERA 5BRFA 1NGAA 5I9EB 3O5BA 3C7NA 3MMVA 1E4FT 2P9IA 4BRDA 1YUWA 2Q31A 3VENA 1U6ZA 2YHWA 3VOVA 5FPNA 1QQOA 2QWMA 2FF6A 1U2VB 2W41A 3HTVA 5LJWA 2VWBA 4DB3A 3FZLA 2P9IB 1OKJA 1S3XA 2CGKA 3CJ7A 4CZEA 4H0XB 4ISFA 2Q2RA 4CD1A 3MCPA 3R9PA 1NGBA 4J8FA 1GLFO 2YJEA 4CBUA 5BRDA 2E1YA 5CE3A 1HKCA 4BRIA 2J4RA 2PBDA 1P8ZA 2QWPA 5AZIA 4FPBA 2H3GX 3BUZB 3UB5A 3CERA 3VF6A 1HKGA 4B1ZA 1BA1A 3VETA 2P9PA 4BRNA 4EAHD 2FSJA 1LOTB 4FWKA 4BQZA 4FL9A 3CQYA 4JHDB 1T6DA 4H0VB 4EIAA 5BPLA 2P9UB 4B1WB 3AY9A 4FWNA 1NWKA 5F0XA 2D4WA 3FLCO 4WQ4C 2HOEA 2ITMA 4EHUA 3OHRA 1QZ6A 3KHYA 3W3DA 4ISEA 4BROA 4JD2B 4RWTA 2D1KA 4IXCA 1Y64A 4GY2B 3FZFA 3ZETA 1YAGA 4CZJA 1NGJA 4WYBA 5JLFA 4QS7A 4BC2A 3MDQA 4BR0A 3VEYA 4BR7A 3WXJA 2GWKA 3O1BA 4CZKA 4CZLA 2YHXA 3MN7A 2ASPA 1DKGD 4JAXA 2P9NA 1QQMA 3WEEB 4EFHA 4MO4A 5AZJB 1IG8A 2QWNA 1GLJO 2BTFA 2P9SA 1GLCG 1NGGA 1NGEA 3ZETB 1GLDG 1Q18A 1TYQB 3D7EO 5BN8A 3A5NC 1K8KB 2P9LB 4BC4A 4JNEA 2YI1A 2YCHA 1RFQA 4A2AA 3IUCA 4XH5A 3TU5A 5AQSA 3KVGA 3GBTA 4FPAA 5BPMA 3EKSA 1X3NA 4F9OA 4EHTA 2Q97A 3FFKB 4FWMA 3WQUA 4BRKA 3CQXA 4B1UB 2HMPA 1ATNA 3VEWA 2EWSA 5AFUA 3BF3A 2Q36A 4BG8A 1SAZA 2YHYA 3O1WA 3QICA 3LM9A 4CZIA 1X9JA 4MLEA 1GLEG 5EOYA 2ASOA 3UKUA 3UE5A 3DJCA 4BGAA 1HX1A 1DEJA 3D2EA 4FWPA 4NO7A 3R8EA 4BRGA 3U8XA 3VF4A 2IIRA 2HF4A 3ZEUB 1H1VA 4BR5A 3DXKA 3QBWA 3ULEA 4CI6A 2V51B 4BRPA 3MN5A 2D0PA 3SJHA 3M6GA 4LC9B 2A3ZA 4BC3A 1KAXA 3UKUB 3EKUA 3QMLA 3C7NB 2HF3A 4BRLA 5JICA 3GOIA 3I8BA 3ZX0A 4BC5A 3W0LA 3HM8A 5E84A 1G99A 2OANA 4K25A 4B1YB 3F9MA 1ZBSA 4CBWA 5AQHA 3A5MC 3ULEB 4L3QA 2A6AA 3DWLA 4WQ5A 3AAQA 4IJNA 3AAPA 5EY4A 3CJAA 4A2BA 1RGIA 4BR2A 3QBXA 3VGKA 4B9QA 2DPNA 3ATVA 5FPMA 2W40A 1RDWX 3P4IA 3O6WA 3R6MA 3B8AX 4PKHA 3CJCA 4XH4A 2CH5A 3O8MA 2AP1A 1J6ZA 2VCPA 1S22A 3BF1A 4A61A 1MWKA 1V4SA 4K43A 3SLCA 2IVNA 5KPZA 5AZIB 4FSVA 5AQKA 4JN4A 5ADXH 1ATSA 4Y0WA 3VGMA 1TUUA 3A0IX 3JS6A 2P9PB 4CZFA 3EO3A 5TKYA 5AQMA 4RTFD 1X3MA 1YVNA 3WXKA 2V7YA 2P9KA 1ZXOA 3H46O 3M3ZA 4XEIA 4IZ9A 4CZHA 3EZWA 3L4IA 3LDLA 4FOEA 5AQTA 2I7PA 3FZHA 5LY3A 3HZ6A 3GE1A 4AM7A 3KZBA 1SZ2A 3M1FA 2Q1NA 2FSKA 3H3OB 3VF2A 4O5FA 3AARA 3DXMA 4PKIA 4BRMA 1KAZA 3CI5A 3EL2A 3UKRA 4HWIA 5F1XA 3ID8A 3J8AA 5AQQA 1CZAN 1JCFA 4H5RA 2P9KB 3A5LC 3U9DA 1KAYA 4H0TB 5BN9A 1MWMA 2GELA 3FZKA 4IJAA 4GNIA 2AA4A 3CJ1A 4H5NA 3VEOA 5EX5A 1NBWA 3WT0A 2A41A 4BVPA 5FPDA 4BQLA 2P9NB 1ZC6A 3FGUA 3QFPA 2FLOA 3TPQA 1BG3A 3QDKA 2D0OA 5AR0A 4H5WA 4BR4A 1C0GA 3VEZA 1ATRA 2P9SB 3SMSA 1JCEA 3FE1A 2CGLA 2GTDA 1KXPA 5AQWA 3VEVA 3BP8A 3IFRA 2E2NA 4BVOA 2CGJA 3EN9A 3SMPA 2V7ZA 4M7YA 4K42A 5JLHA 2F9WA 2BUPA 3CHWA 4KBOA 1Z05A 5EXWA 4HTLA 4C23A 3A8YA 3MK6A 1ESVA 2E2OA 1WUAA 3L0QA 1NGDA 3H3NO 4QS8A 1BOTO 3HBTA 1LCUA 5AQYA 2E1ZA 2NLXA 2FXUA 4FOIA 3LDQA 4FWSA 1XC3A 4QS9A 5AQNA 2WUSA 4M63C 4O8KA 4WQ4A 3CETA 3O08A 2QXLA 3GDQA 4CBXA 3IDHA 4IWVA 1U2VA 2IVPA 1BO5O 1QQNA 4ISGA 4FWLA 1HUXA 4MO5A 3D2EB 3D2FA 4BREA 3CIPA 1D4XA 1EQYA 2A40A 3DXKB 3WEEA 2F9TA 4BRAA 4PL7A 3CJ9A 3DAWA 5AQFA 1HLUA 4BRCA 4H5TA 4AM6A 4BGBA 1BWFO 3A5OC 3HSCA 2QWRA 5E26A 2PAVA 3GL1A 4A62A 3D2FB 2NZTA 5BREA 2Q0RA 4FWOA 5BRHA 3IMXA 1Z6RA 1HKBA 1HPMA 5F2RA 4H03B 3C0BA 2E20A 3LDNA 2QWOA 1HJOA 3G25A 4BRHA 4JHDA 2ZWHA 1T44A 2I7NA 1NM1A 2FF3B 4PL8A 1YXQA 4IO8A 4PKGA 2P9UA 2GUPA 2IVOA 3QFUA 4YDUA 1NGFA 2E8AA 3H1VX 4I6MA 3VPZA 2YJFA 3MN6A 2ZF5O 3RSEA 4JD2A 3LL3A 3ATUA 3VGLA 4M7XA 3WXLA 1T6CA 3U4LA 3U9ZA 4FWRA 4H0PA 1SQKA 5AQGA 4B1XB 3LM2A 3WQTA 2ASMA 3H6EA 1NGIA 5AQVA 5KPRA 3LDPA 3WXIA 3ZX2A 3L6QA 2CH6A 2VYPA 5AQIA 1MA9B 2ZGZA 5AFUH 2Q0UA 4I6MB 5ELZA 4XH1A 3LDOA 5AQXA 4CZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2ZM6K 1J54A 3HRGA 3RSEB 1QZ5A 2HNZA 3IKMA 2QWQA 1Q7YO 3RR7A 3ZX3A 4E7IA 1NGHA 4FYDA 3J80O 4GW6A 1K8KA 4CFAA 4YOTA 1YVUA 1GLAG 4OPJA 1GLBG 3DLKA 3NF7A 3O4WA 5DMRA 1QVGM 4DWIA 2O8DB 4BG9A 4CCHA 2E5LK 3I33A 1IJJA 4E1JA 4YNQA 5HL7L 3QINA 4KHPK 3BEXA 4DV3K 1NLVA 2XHBA 1BCOA 4E7HA 3O3HA 2O8FA 1BI4B 1FXXA 3NGYA 1WB9A 1YTAA 1R0AA 1GLLO 3SZ2A 3VQCA 1XUPO 1VSJA 2E2QA 4ELTA 1BDGA 4BR9A 1C0FA 4NB4A 3PUFA 4E89A 2E88A 3TTFA 1SKSA 3NVKA 2A42A 5AQJA 1JCGA 1CXQA 2QM1A 1YF5L 3OBWA 4FJ8A 3K9JA 3WXMB 3VERA 3QIPA 3C7NA 3OA9A 4BE1A 4RW7A 1OH6A 3TAPA 4DLEA 4BRDA 1VQNN 2NRRA 1YUWA 4K0KK 4FLYA 4E7KA 1RT2A 1QSSA 1I3AA 3AO5A 3O3GA 4DR7K 2YHWA 1QQOA 2HVHA 4CK2A 3DLLL 2FF6A 2UXDK 2G8IA 3O3FA 5LJWA 3BZKA 1Q9XA 1IKWA 5GAEP 1RTJA 1BIUA 1N6QA 3RVCA 2Q2RA 1NK0A 1NJWA 3MCPA 3T3FA 4CBUA 3LWLA 4GV6A 4CJKA 1TV6A 3OYHA 1ZBIA 2KLAA 3SBTA 3T19A 1X9SA 3TAGA 4OO1J 4KTQA 4CK3A 3S3OA 1RT6A 4B1ZA 2QXFA 3L4QA 4YOUA 4DTNA 3SQ0A 3V6DA 2DY4A 4CEQA 1LOTB 4FWKA 4FL9A 3CQYA 3OYLA 4JHDB 1VSDA 1T6DA 4H0VB 4FLUA 5BPLA 4DQSA 2YKNA 2P9UB 4DR6K 4CESA 4BWJA 4WFNL 2YHAA 3C94A 2Y1IA 3RTVA 3Q7BA 1QZ6A 3CCQN 3THXA 4M3XA 1VAZA 3KHYA 3MAQA 4ISEA 4F3OA 2FBVA 2A1SA 4M3RA 3V1OA 4JI8K 4FVUA 3ZETA 1QE1A 3V9XA 1NGJA 5JLFA 3MDQA 4BR0A 3VTIA 3KJVA 3WXJA 4CZKA 3E9PA 3MN7A 4JAXA 4Q5VA 4RW4A 1QQMA 4W5OA 3OYAA 2QWNA 3OYFA 5C12A 4DR1K 1VSFA 3DLEA 3THVA 4IG0A 3WNFA 3CXCM 3AVJA 4A2AA 2HBKA 4B08A 3OTOK 4LSLA 4O55A 4FXDA 4DMNA 4OPAA 3T1YK 4OPKA 2ATQA 4E1NA 3AVAA 1BL3A 4EHTA 5GINA 4BRKA 1IKVA 4KO0A 3MWTA 3BF3A 1NK9A 2O8CA 2JWKA 3MEGA 4DSIA 3LM9A 3AA2A 5EOYA 4DR5K 1D8YA 4CE9A 1FJGK 3AA5X 2UXCK 1HX1A 5E41A 4B9VA 2KQ2A 1C1BA 4FVMA 3R1XA 4QOZB 2HF4A 4BR5A 3DXKA 3TABA 4BRPA 4FZXC 2D0PA 3M6GA 2A3ZA 1TVRA 1ASWA 4A57A 4BRLA 5E84A 4DV7K 3OYMA 4K25A 4B1YB 4M3YA 1ZBSA 2JWLA 4CBWA 2D0CA 3NE6A 4BWMA 2YX6A 2HHWA 4IJNA 3DRRA 3SJJA 4BR2A 3VGKA 3ATVA 2ITGA 4GV9A 4LD0A 3R6MA 4PKHA 1JLFA 3LP0A 1KVBA 1ZBLA 3TWHA 3VQ8A 1JL1A 2VCPA 2QA4N 4CJFA 5AZIB 4FM0A 1RTDA 3CPEA 1QHTA 3OYDA 3HXMA 5JVGL 3SI6A 1UA1A 1YI2N 3JS6A 1VRUA 4HUFA 4F2RA 4CZFA 1ILYA 1P90A 4E1MA 4RTFD 4CJVA 4DTMA 3WXKA 4R79A 2V7YA 3H46O 4XEIA 3U6FA 2O8EA 4IZ9A 4AILC 1IG9A 3LDLA 5LY3A 4B3MK 2HHXA 4JKGB 2ZJRL 5CZ1A 1WNSA 1HYSA 3VF2A 3H3OB 3D45A 4O5FA 3NBPA 4PKIA 3DXMA 4BRMA 3HP9A 3VQBA 2NRXA 4DQRA 1N34K 1S72N 1CZAN 2VGNA 4H5RA 2P9KB 1KAYA 5BN9A 1XI1A 4DSEA 1W97L 1CZ9A 4GNIA 2AA4A 1J9AA 1GOBA 1HJRA 4IOXA 3WT0A 3OYJA 3ZT3A 4CEAA 5FPDA 2RE2A 1KD1O 3FGUA 4CW7B 4KTZA 3THWB 1BG3A 2D0OA 4BR4A 1C0GA 3B6PA 4I2QA 1JCEA 4IDKA 3G0ZA 1D9DA 4IG3A 5LMNK 5GIOA 3BP8A 2E2NA 4DKWA 2CGJA 3AO3A 1L3TA 3L2QA 4Z4HA 1XNQK 2Q3SA 1NKCA 1BQMA 2HBLA 1WUAA 4BE0A 3TARA 4FJLA 3NH2A 3H3NO 1BOTO 3CCMN 3HBTA 4Z4CA 2E1ZA 2NLXA 2KZZA 4FOIA 3LDQA 3P5JA 1XC3A 4QS9A 4CFBA 3QO9A 1VQLN 2F7TA 3T69A 1G15A 1X9MA 3L3VA 1RT3A 3RMDA 2IVPA 1QQNA 4CF0A 3CF5L 1HUXA 4MO5A 3AGRA 2WTUA 3CIPA 1EQYA 5J2PA 4C8LA 3ZT0A 1WLJA 1RBRA 1HLUA 4BRCA 2HBJA 3QNOA 3A5OC 3HSCA 4FCYA 2QWRA 5E26A 4KHQA 4DV2K 3K0SA 1BISA 5BREA 2EX3A 1Z6RA 4BDZA 3KLFA 1S1VA 3C0BA 4O5BA 3KLGA 3LDNA 2Z1IA 1A5VA 1HJOA 2D0BA 4IOAL 5CYMA 3NAEA 2I7NA 4IO9L 4YHHK 4PL8A 3TANA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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