4L3QA

Crystal structure of glucokinase-activator complex
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
447
structure length
447
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
publication title Pyrimidone-based series of glucokinase activators with alternative donor-acceptor motif.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
total genus 156
structure length 447
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4l3qA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4l3qA01
1GLFO 3I8BA 3O1WA 2P9LA 4EHUA 2GELA 2YHYA 3WEEB 1QHAA 4JD2A 3FZKA 4NB4A 3WXKA 4CZFA 3OHRA 2ZF5O 1KXPA 4BG9A 4M7YA 4FWQA 3U9DA 2P9NA 4PL7A 1XUPO 2P9PA 5KPRA 5JMVA 1WUAA 3UKUA 5BRFA 2E1YA 3CJCA 1NMDA 2D0OA 5FPMA 5AQJA 1XC3A 1QQNA 2P9IB 3ATUA 4H5TA 3UE5A 4JN4A 1DKGD 4M63C 3CETA 4FWMA 1U6ZA 4CZJA 3VEVA 5JLHA 3CJAA 3A5OC 5AQKA 3H45C 2YJEA 4L3QA 5EXWA 3EZWA 1BO5O 2P9UB 1BA1A 1E4FT 3O1BA 4QS8A 4BC2A 1P8ZA 3D7EO 5AQHA 1ATSA 2FSNA 5EX5A 4BRLA 4CBWA 3VF4A 2ASMA 2QWPA 1Q18A 2D1KA 3G25A 4Z94A 3KVGA 3SMPA 3M3ZA 3O5BA 4BRKA 2QXLA 5AQOA 3ENHA 2IVOA 2V7YA 1NGCA 4K41A 4HTLA 2DPNA 2P9KA 1KAYA 1U2VA 1JCFA 3HSCA 1GLAG 1S3XA 2CGJA 2YCHA 2YI1A 4PKGA 1BWFO 3EN9A 3EKSA 2E88A 2IVPA 3D2EB 4C23A 3C7NB 3ZEUB 4BR9A 4CD1A 5AQRA 3WQUA 4CZEA 5B8HA 4CBXA 3H3NO 1DGKN 4BQLA 3FLCO 1GLJO 2Q0RA 3LM2A 4FPBA 1C0FA 1GLLO 3FR0A 5TKYA 3VENA 4H0YB 1NGBA 4BC5A 4H0OA 5AQYA 4BVOA 5AQUA 1ZBSA 2H3GX 3VGKA 4H5VA 3VEOA 3A8YA 2FSJA 4CZGA 4F9OA 4O5FA 4BROA 5AQPA 3MN6A 3KHYA 4PKIA 1NGJA 2GUPA 5BR9A 2A3ZA 5AZIB 3LDOA 4FWNA 3HBTA 2A41A 5AQVA 4BVPA 2F9WA 1ATNA 3WT0A 3DAWA 3ZETA 3DXMA 1YVNA 4JHDB 4WQ5C 4CZLA 2NLXA 3BUZB 4EHTA 3GBTA 2VWBA 3KZBA 4A62A 2AP1A 3L6QA 2P9LB 3U8XA 3FZHA 4BGAA 4KBOA 5FPNA 1NGEA 4JD2B 5ADXH 1MWMA 2D4WA 2KHOA 3HM8A 4BG8A 5LJWA 1X9JA 3TU5A 2ZGYA 2P9NB 4BRDA 2HOEA 4XH5A 2P9PB 1XQSC 4FO0A 5AR0A 4QS9A 3VEYA 4FWOA 1QZ5A 2OANA 3H6EA 1NGHA 3J8AA 3O80A 3JXUA 3CJ7A 5ADXA 3CIPA 2QM1A 3A0IX 3FZLA 3LDNA 5AQTA 4FPAA 3HTVA 2HF4A 3VPZA 2QWNA 4IJNA 3BF1A 5AQWA 4IWVA 4GY2B 4DCHA 1V4SA 3D2FB 4A61A 4ISEA 1HUXA 2E2QA 5BPNA 1TYQB 3DWLA 3IMXA 2FSKA 1EQYA 5BPMA 1JCEA 3QMLA 4B1XB 4EAHD 1RGIA 3R6MA 4JNEA 2GTDA 3BEXA 4LC9B 2GEMA 2YHXA 1MA9B 1IJJA 5AQZA 5LY3A 3CJ9A 5EOYA 4EFHA 2ITMA 5EY4A 3IFRA 4MO5A 2P9IA 4RTFD 3VOVA 1X3NA 4YDUC 5AZJA 1ZC6A 4BRFA 5AQXA 3GOIA 1H1VA 4YDUA 5F2RA 3QBXA 4IXCA 2Q97A 4BR4A 3VEZA 3VF2A 4H0PA 2E8AA 3QFUA 1HKBA 2GWJA 3L0QA 1NGFA 3QICA 3VGMA 2GWKA 1TUYA 5AQNA 2HMPA 2P9UA 1GLEG 2A5XA 5CE3A 2FXUA 2NZTA 4PKHA 3IUCA 4A2AA 3LL3A 1NGDA 3W0LA 4HWIA 1QZ6A 3R8EA 3UB5A 1ESVA 2P9SA 1HKCA 3CJ1A 3MN9A 2Q1NA 1T6DA 3EO3A 1NGIA 4FWLA 5BN9A 1K8KB 3VESA 1GLDG 3AAPA 2FF3B 3F9MA 3SMSA 4IJAA 4CZHA 1DEJA 3VERA 3VETA 3ULEA 5E26A 2HF3A 4JAXA 2IIRA 2E2PA 1X3MA 2AA4A 5AQQA 4CJ7A 3D2EA 4FWRA 1LOTB 1QQOA 3GDQA 3C7NA 4B1YB 3A5NC 4BC3A 3DXKB 2Q31A 3DXMB 3RSEB 2ASPA 3CQYA 3QBWA 4H5RA 5JLFA 5BN8A 5AQMA 4WQ4C 3A5MC 3I33A 5BRHA 3O08A 4M7XA 1QQMA 3GL1A 4WQ4A 5AQGA 3MDQA 3MN5A 4K43A 5BRDA 4FOIA 1ATRA 5ELZA 4WQ5A 4BC4A 4H0VB 2EWSA 1MDUB 1KAXA 2D0PA 3EKUA 1D4XA 4BREA 1SAZA 3H1VX 3QFPA 3IDHA 4Y0WA 5BPLA 1MWKA 3AY9A 4DHYA 1IG8A 2QWOA 3FZMA 2WUSA 1BUPA 5I9EB 4XEIA 1WOQA 2CGLA 4H5NA 1BDGA 4EIAA 3UKUB 5EVZA 2VYPA 1LCUA 1NGAA 2CH6A 3MCPA 3L4IA 4XH4A 1RDWX 2BUPA 3FGUA 1BG3A 3GG4A 2ZWHA 3LDQA 1NWKA 2Q36A 4BR7A 3R9PA 3LDPA 4I6MA 2FF6A 3H3OB 3UKRA 1KAZA 4CZIA 4K42A 2A42A 1S22A 3ZX2A 4A2BA 3S41A 2I7NA 1E4GT 2QWQA 1T44A 1YAGA 3A5LC 4FSVA 4BRAA 3BP8A 2F9TA 4IZ9A 3WEEA 1R59O 2UYTA 3W3DA 1NBWA 3FE1A 4BRMA 3WXLA 4MO4A 4BRHA 2A6AA 4BRGA 5LJVA 4QS7A 4H0TB 1CZAN 4FWPA 4FWSA 3MK6A 3O6WA 3SK3A 3MMVA 5FPDA 4E1JA 5F0XA 2QWLA 4PL8A 3MN7A 4K25A 3AAQA 5AZJB 1HJOA 4FL9A 5AFUH 3SLCA 3GE1A 2PBDA 1YXQA 3ID8A 2P9KB 2NRHA 1U2VB 1BU6O 1NGGA 5KQ8A 3ENOA 3D2FA 4AM6A 4CZMA 1C0GA 1TYQA 3CQXA 1HX1A 4NO7A 3VEXA 4FOEA 5FPEA 2IVNA 2ZGZA 5AQLA 5AFUA 3ZX3A 3VEWA 5AQSA 2P9SB 3O8MA 1BA0A 2CH5A 1GLBG 5E84A 1T6CA 1OKJA 4H5WA 2YHWA 3AARA 1Z6RA 2ASOA 3CERA 3WQTA 5BREA 4CBUA 2V52B 3CJBA 5KQDA 4B1WB 2Q2RA 3WXIA 4CI6A 1HKGA 4FWKA 4IO8A 4ISGA 4BRCA 1BOTO 4BRIA 4WYBA 3WXJA 5F1XA 3ATVA 1Y64A 3M1FA 1HPMA 2YJFA 3ULEB 4B1ZA 4BR2A 3TPQA 4BRQA 4DB3A 3WUHA 4MLEA 3H46O 3JS6A 1J6ZA 3LDLA 4RWTA 2I7PA 1NLVA 3HZ6A 3ZX0A 3U4LA 3ZEUA 4BR0A 4GNIA 2E2OA 3ZETB 1NM1A 2J4RA 1SZ2A 3B8AX 4ISFA 5KPTA 3QDKA 2E1ZA 5JICA 2W41A 1GLCG 4B9QA 1JCGA 4BRPA 3HI0A 1Z05A 5KPZA 1K8KA 4MLHA 3C0BA 3BF3A 3CHWA 2V51B 4H03B 1TUUA 2W40A 4CZKA 5AQIA 1RFQA 2A40A 3H1QA 3CI5A 4BR5A 1ZXOA 2QWMA 3DJCA 1G99A 2Q0UA 3M6GA 3FFKB 3SJHA 4BRNA 4J8FA 3EL2A 4RCHA 2QW9A 3QB0A 2FLOA 3VF6A 4CD3A 4BGBA 1HLUA 3VGLA 3DXKA 2BTFA 2V7ZA 4DQ8A 3RSEA 2QWRA 5AZIA 4B1VA 2CGKA 1V4TA 2PAVA 5AQFA 1SQKA 3P4IA 3FZFA 3O4WA 4O8KA 4B1UB 1YUWA 2E20A 4BQZA 3LM9A 3U9ZA 4I6MB 4XH1A 3UKRB 4JHDA 4AM7A 2E2NA 4H0XB 2VCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYJA 5HRNA 3DLRA 3I8BA 3ZYYX 3IKMA 2P9LA 4CHNA 4DU4A 4JI3K 1QHAA 5K14A 1N33K 4JI8K 2BANA 4CZFA 3OHRA 1Z25A 4CGFA 2HNZA 4LFCK 1QVGM 1JLAA 4DMNA 4X65K 2P9PA 4DTRA 2O8CB 1BISA 2E1YA 4RW9A 3OYCA 3HVRA 3DLHA 3O4NA 3ZSOA 3EY1A 1NMDA 1L5UA 2P9IB 3ATUA 4H5TA 4JN4A 1MU2A 4KTQA 2RKIA 1DKGD 4CHZA 5DM6L 1EP4A 2HHQA 5CYQA 3S9HA 1QSLA 1VQ7N 3VEVA 1SL1A 5AQKA 3H45C 4L3QA 1RNHA 1BL3A 4GVEA 3D6RA 5FDLA 3KJVA 3P31A 5EXWA 4GV9A 3EZWA 2HHSA 3D7EO 5EX5A 4BRLA 4Z4IA 4CBWA 4FLXA 4FK0A 3LWLA 3SMPA 3TANA 3M3ZA 4KHPK 2NRWA 5C24A 4OKJA 1BHLA 3S3MA 4HTLA 5HLFA 1KAYA 1VRTA 1JCFA 1GLAG 1S3XA 1GOBA 4O8UA 4CE9A 4FJJA 2YCHA 1BWFO 5GAEP 3CM6A 4DTPA 2E88A 1HNWK 4M3TA 3HM9A 4CJLA 3LZJA 4E7JA 4BR9A 5AQRA 3VMFB 4CBXA 3SUOA 4DV6K 4BQLA 1G15A 2Q0RA 1HJRA 3KK2A 3AO5A 3LM2A 1GLLO 1C1BA 5LMUK 1QVFM 5AQYA 3SAFA 4JS5A 1WSIA 1NKCA 2H3GX 4AHVA 3D45A 4CZGA 4JKGA 4BROA 4CJRA 3MN6A 3KHYA 2FC0A 3AO1A 3DRRA 1IBLK 3G6EN 3FFIA 2DTUA 1ZBHA 4DSFA 4LF9K 5AQVA 4DF8A 3DAWA 1KTQA 3ZETA 2A1RA 1VAZA 3ALYA 3BUZB 1QTMA 4B3MK 5FRNA 4JV5K 1EXQA 1S1VA 3M8SA 4A62A 1WSHA 5KRSA 3U8XA 4DSLA 4CERA 3NH2A 1XC9A 3SJJA 4JD2B 2YKNA 1EX4A 1MWMA 3HM8A 3TU5A 3CQ8A 1TVRA 4BRDA 4Z4EA 2IOCA 4XH5A 1L3TA 1DLOA 2HHWA 1OH6A 3KD1E 4CGGA 3QETA 3VEYA 2QK9A 1QZ5A 4TSXA 2OANA 3H6EA 4IDHA 3J8AA 3MXIA 4FLVA 3CJ7A 2IAJA 2OZSA 5KI6A 4OJRA 4FPAA 4BDPA 2HF4A 2QWNA 3BF1A 3MX2A 4IWVA 4IEIA 3BGRA 3JYTA 1IBMK 3C6TA 4BE0A 1TYQB 3IMXA 4IFVA 2B6AA 4KHWA 4B9MA 4IFYA 2OA8A 4N41A 5SWMA 2XRIA 4YOWA 1TK8A 4FJNA 3NMUA 1RDCA 1ITGA 5AQZA 5LY3A 3CJ9A 3L4QA 1KLNA 1ASVA 2WFBA 4C8LA 3IFRA 2WTUA 2D5RA 5AZJA 1X3NA 1ZC6A 2BDPA 4B8AB 4DV2K 3RWUA 3HVTA 4YDUA 3RRGA 4PHTX 4KHYA 3EZ5A 3VEZA 1N6QA 4LF4K 2E8AA 4CJ3A 3SPZA 1NGFA 3VGMA 3PV8A 5AQNA 2P9UA 1GLEG 1W7AA 2KFNA 2XY6A 1U47A 4Z0UA 3CJ1A 3MN9A 2Q1NA 1EKEA 3CCVN 4Z4GA 3EO3A 4DSIA 1SKRA 4FJ8A 1L3UA 5BN9A 2PY5A 3VQ5A 3VESA 2D0CA 3AAPA 4IKFA 1K6YA 1KVAA 4GW6A 4IJAA 2G8WA 3ULEA 2HF3A 3OJUA 4E1NA 4DTUA 4FWRA 5HOOA 4B1YB 3A5NC 3AVFA 3M5RA 1Z26A 5IT9O 3DXMB 2ASPA 3OY9A 4DV1K 5BN8A 5AQMA 3NF9A 2ETJA 3A5MC 3I33A 3LZIA 4M7XA 2E4LA 3MN5A 3ZT3A 3TAPA 4K43A 3TAQA 4FOIA 2AJQA 4FW1A 3VQPA 3RR7A 4H0VB 2EWSA 3CPWM 1NK8A 5GIOA 1ZBIA 3K59A 3PX6A 2KQ2A 5KTQA 1B92A 1MWKA 3ZSXA 3CCEN 1NJYA 1VSJA 4EZ9A 4DSJA 1IO2A 3THXA 1S9GA 3SAGA 4FK4A 1RTDA 5JS1A 5M1PA 4KB1A 1CZBA 2YKMA 4RW4A 2BUPA 3K5OA 4OGEA 2OZMA 1FKPA 3FGUA 5JVHL 1BIUA 3GG4A 1NWKA 2Q36A 3MWTA 1LV5A 3VN5A 1WB9A 4BWJA 1XNQK 3H3OB 4Y1CA 3SUPA 4CZIA 3ZX2A 3V1QA 1NJXA 2JWLA 3PO4A 1E4GT 1YAGA 4FSVA 1X1PA 3B6OA 4OPJA 3QNNA 1VSDA 3P5JA 4OLAA 2NUBA 4BRHA 5LJVA 4QS7A 3ZSZA 1HR0K 4FWPA 3SK3A 2O8CA 1W0HA 4MDAA 4PL8A 3DLGA 4FXDA 3NH0A 4BE1A 4G9ZA 2F4VK 1VK0A 3GE1A 3MX5A 1WSGA 5C0YA 2WOMA 2RPIA 3K5MA 2OTLN 3B6PA 5DK5A 1TL3A 1NJWA 4FJMA 1JLCA 3OYHA 4JRPA 4K8XA 3OYEA 4CGHA 5DMRA 4L8RB 3I0RA 3RMDA 4A5AA 2Z1IA 2P9SB 4DLGA 1YTAA 3SNNA 1GLBG 5M1NA 2VG7A 3AVCA 5LMNK 1Z6RA 3PY8A 3F2KA 5I3UA 3HP9A 1J53A 4JEPA 2Q2RA 3WXIA 2EX3A 1KLMA 4KREA 4CI6A 4A57A 2OPRA 3LAKA 4BRIA 4AHRA 1XWLA 4BRQA 4DB3A 3CXCM 3ZT4A 5CZ1A 4UQGA 2HHHK 4DS4A 1WAFA 1NLVA 3ITHA 1YT3A 4M45A 3U4LA 2E5LK 3ZETB 4CF2A 1SZ2A 2E1ZA 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1NK6A 3HSTB 3P39A 2FSJA 4F9OA 4DQPA 4O5FA 1NGJA 3KTQA 3VQAA 1ILYA 3KK3A 5AZIB 3LDOA 4FWNA 3HBTA 1C0TA 2A41A 2F9WA 2XY8A 4CEQA 4YOTA 3K58A 4OPHA 4DSEA 3DXMA 1NK7A 1YVNA 4CZLA 2NLXA 1A5VA 4EHTA 3GBTA 2VWBA 3VQQA 4E1MA 4F8RA 2AP1A 2YNHA 4CHQA 2G8KA 1REVA 1QE1A 3FZHA 4KBOA 4IFEA 5FPNA 4LFBK 1FW6A 3SQ1A 1X9JA 2ZGYA 5GINA 4OGCA 1XQSC 3VQEA 3C65A 4QS9A 2I5JA 1NK5A 3NHGA 3AGKA 4FWOA 4ILGB 5AJ3K 4B9VA 4DG1A 3VQ4A 2G8HA 2ATQA 5ADXA 3PX0A 2UU9K 3LDNA 4U67L 1FKOA 5AQTA 3K57A 4GV6A 3VPZA 5GAGP 4GY2B 2QA4N 1V4SA 4A61A 4F2SA 4X66K 3PLAA 2FSKA 4IOXA 5BPMA 4JKDA 3U6FA 4DR6K 3BEXA 4LC9B 2ZJQL 1MA9B 2OCEA 1IJJA 1KC8O 3QEPA 5EOYA 4CFBA 3VTIA 4EFHA 4F4KA 4DR4K 2ITMA 5M1FA 5EY4A 4RTFD 3DLBA 4FM2A 4YDUC 2WONA 2HHXA 2KTQA 2HHVA 1B9DA 5AQXA 1H1VA 1J54A 4DUZK 5F2RA 1U4BA 1CLQA 1TKDA 4CCHA 4H0PA 4QCLA 3QFUA 4DQIA 2GWKA 1TUYA 2HMPA 4C8MA 3OYAA 1QHTA 1HNXK 3W0LA 3CCRN 4ZHRA 3R8EA 2O8FA 3UB5A 1ESVA 1FK9A 2P9SA 3JAMO 1T6DA 4FWLA 1K8KB 3CFRA 4CJTA 2FF3B 3F9MA 3SV4A 1EWRA 1UAXA 3DOLA 3VETA 3ZSYA 1HQEA 5E26A 4JAXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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