4L3QA

Crystal structure of glucokinase-activator complex
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
447
structure length
447
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Pyrimidone-based series of glucokinase activators with alternative donor-acceptor motif.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 156
structure length 447
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4l3qA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4l3qA01
1U2VA 3H3OB 4MLEA 1BDGA 2Q1NA 1XQSC 4BR9A 2E20A 5KPTA 2YI1A 2ZGYA 4BGAA 4CZEA 3EZWA 2EWSA 2W40A 3D2EB 3EO3A 1NBWA 4IXCA 5BRDA 1OKJA 1HJOA 4PKIA 1MDUB 1JCGA 3LDQA 4FWRA 5AQRA 3GBTA 3ATVA 1BA0A 4I6MB 3CJ7A 2A42A 3A5LC 3VEVA 2QWNA 4H5NA 3FR0A 2OANA 2E1YA 3O1BA 5AQPA 1GLCG 2FSKA 1DKGD 3SMPA 3R6MA 5AQFA 3ZX2A 2QWMA 1GLDG 4FOEA 3FFKB 2E8AA 2Q0UA 1U2VB 4DHYA 3EN9A 5F2RA 4HWIA 5F0XA 3O08A 1X9JA 3A0IX 4CI6A 2I7NA 2V51B 4ISGA 4CZMA 1DGKN 5KPRA 1NGDA 5AQJA 1NGEA 3I33A 4CZKA 3BF1A 3CJCA 4CZGA 4C23A 3VF2A 4JHDA 4FWQA 5KPZA 3IUCA 5E26A 1GLBG 3FLCO 2KHOA 2BUPA 1HLUA 3BF3A 4M63C 3L6QA 4QS7A 1WUAA 4BRLA 1SZ2A 2CGKA 4NO7A 3R9PA 3UB5A 1U6ZA 2Q31A 3C7NA 4BQZA 3EKSA 1X3MA 3LM9A 3SJHA 4RCHA 4H03B 4B1YB 3BP8A 4FWNA 4L3QA 4YDUC 3VEYA 4BC5A 3JXUA 1KAYA 2A40A 3MCPA 3MN6A 3U9ZA 1HPMA 5BPMA 2GWJA 3O5BA 4DCHA 4ISEA 3ATUA 5BR9A 3CJAA 5AQIA 3WQTA 1QQOA 2VWBA 2I7PA 2YJEA 2VCPA 4JHDB 3QBXA 2W41A 1YAGA 4RTFD 1NWKA 3AAPA 3MN9A 3CQYA 3H3NO 5AQTA 3H45C 4MO5A 5AQYA 2CGJA 3W3DA 4BRNA 2V7YA 4XH4A 3O6WA 1ZBSA 5LJWA 3C7NB 1CZAN 4GNIA 1E4GT 3VEXA 1V4SA 1JCFA 3VF4A 1S22A 3B8AX 2IVPA 5KQ8A 1BUPA 2D0PA 1BG3A 1RGIA 3F9MA 3HM8A 4FOIA 4H0VB 5BN9A 3MMVA 4H0YB 2Q0RA 3ZX0A 1TUUA 3M6GA 3WUHA 1XC3A 4M7XA 4CZLA 5I9EB 2P9LA 1KXPA 4BR2A 2PBDA 3HI0A 5LJVA 4CBUA 1QQMA 4MO4A 1LOTB 2AP1A 1EQYA 5LY3A 1Z6RA 2E2NA 2ZGZA 5AQWA 2QWRA 5JMVA 2ZF5O 2YHXA 3CIPA 4QS8A 1NGGA 3M3ZA 4BC4A 2P9IA 5AQVA 2FXUA 5BRFA 3LM2A 1ESVA 3U8XA 4IZ9A 2P9UA 4H0TB 3VEOA 2NLXA 3AAQA 3GDQA 3A5NC 2GUPA 3CJBA 1YUWA 2P9LB 3DXKA 3ENOA 4BRAA 3ZEUA 4B1VA 5AQUA 4M7YA 3VETA 4CZIA 4BC3A 4BRGA 5EVZA 4FPAA 4FWOA 4GY2B 4K42A 4BVPA 4NB4A 3QICA 1NGJA 1NM1A 3VERA 2P9SA 3A5OC 3VOVA 1ATNA 1HKCA 3HSCA 4FO0A 2P9IB 3CETA 3WXLA 4A61A 2YHWA 3R8EA 1QZ5A 3VF6A 4EHUA 2F9WA 4B1WB 2QWLA 4BG8A 3H1QA 5EY4A 5JLFA 3JS6A 3BEXA 4H5RA 1QQNA 3GG4A 4PL8A 3DXKB 1KAXA 3VESA 3ZEUB 2ASPA 3CJ1A 4H5TA 1NLVA 3TPQA 1SAZA 2A41A 4BR5A 2YCHA 4B1XB 2A6AA 3CI5A 1GLEG 4K25A 4CZFA 2P9SB 1GLAG 5AQNA 5FPMA 5E84A 2FF6A 2E1ZA 4FPBA 4EHTA 1J6ZA 4DB3A 3OHRA 1IJJA 2DPNA 1NGBA 4FWPA 4AM7A 5ELZA 2F9TA 3FZFA 4BRKA 1G99A 4JAXA 2GELA 2H3GX 3CQXA 2A5XA 4A62A 3L4IA 1C0GA 4HTLA 3U9DA 3ZX3A 1TUYA 3O8MA 4BRFA 2QWPA 2GWKA 1BU6O 3G25A 2P9NA 4J8FA 3ID8A 2V52B 4PL7A 3S41A 1D4XA 5CE3A 3IMXA 4K41A 1T44A 3A5MC 3IDHA 3QFPA 3MK6A 1P8ZA 5AQGA 1RDWX 5F1XA 5FPDA 3D2FA 5FPEA 3VEWA 4KBOA 2ITMA 3QFUA 3QBWA 1HUXA 4IO8A 3H6EA 1QHAA 5AZIA 4CD3A 1RFQA 3DWLA 3LDLA 1HKGA 4BGBA 4JNEA 1IG8A 1NGAA 3UKRA 4LC9B 3WXIA 1DEJA 3DXMA 1C0FA 5EXWA 2IIRA 3FZLA 4BRMA 3FE1A 2E2OA 2P9NB 2QWQA 4EIAA 1BOTO 2A3ZA 3D2EA 2ASOA 4WYBA 3ZETA 2D4WA 5BPLA 4BC2A 4BR4A 2HF4A 4BRCA 4XH1A 1S3XA 5AQLA 1R59O 4I6MA 2ZWHA 2YHYA 4QS9A 3VGKA 3D2FB 1GLFO 4IJAA 1H1VA 5JLHA 3KVGA 1LCUA 4FWMA 3KHYA 2FLOA 4K43A 4B1ZA 3LDPA 5AZIB 3SLCA 4FL9A 5AQXA 2QM1A 3QB0A 5AQSA 5BREA 3QMLA 4CD1A 1K8KA 5AQZA 1TYQA 4CZHA 4H0XB 4BR7A 3WEEA 2GTDA 3UKRB 2PAVA 3VGLA 3AARA 3FGUA 3DXMB 4H5VA 1Y64A 4BQLA 4FSVA 5KQDA 5AR0A 4PKHA 3ZETB 4IJNA 5AFUH 3O1WA 4BROA 5AZJA 5ADXH 3WQUA 3LL3A 3H1VX 3U4LA 4DQ8A 2UYTA 1GLJO 2QWOA 1E4FT 2D1KA 3CHWA 2D0OA 3DJCA 3GL1A 5AQHA 2YJFA 2P9UB 3FZHA 4ISFA 1ZC6A 4O5FA 5AQMA 2FSNA 3GE1A 3I8BA 3GOIA 1T6DA 1K8KB 1Q18A 3FZKA 1TYQB 3WEEB 3LDOA 2CGLA 4IWVA 1V4TA 3FZMA 4CBWA 5AQKA 4B9QA 2BTFA 4F9OA 4PKGA 2Q36A 2IVNA 4BRDA 4FWSA 3VENA 4MLHA 4H5WA 5EOYA 3O80A 5EX5A 2VYPA 2Q2RA 3AY9A 3KZBA 4CBXA 3IFRA 5AZJB 5BN8A 1ATRA 5AQOA 3ULEA 3L0QA 4JN4A 1YXQA 3D7EO 3O4WA 5B8HA 1X3NA 3DAWA 3QDKA 5FPNA 5JICA 1GLLO 3ENHA 3HTVA 3WXJA 1NGCA 1NGIA 3UE5A 3M1FA 4EAHD 1MA9B 1ZXOA 3MDQA 4BRHA 1KAZA 2P9KA 3J8AA 4CJ7A 1BA1A 1HKBA 4A2BA 5BPNA 3HZ6A 2HF3A 2P9PA 1YVNA 4B1UB 2QW9A 4RWTA 1XUPO 4JD2A 2E2PA 4FWKA 1WOQA 3VPZA 4CZJA 2ASMA 3H46O 3W0LA 2E2QA 2QXLA 5TKYA 3RSEA 1JCEA 3ULEB 4XEIA 4YDUA 4XH5A 2AA4A 4BVOA 1MWMA 3WT0A 4H0OA 3SMSA 2NZTA 2FSJA 4WQ5C 3UKUA 4EFHA 1SQKA 1HX1A 5AFUA 3C0BA 2P9KB 3P4IA 5ADXA 2IVOA 4WQ5A 3CJ9A 2Q97A 2P9PB 2GEMA 1T6CA 5BRHA 4JD2B 1BWFO 4O8KA 3EKUA 3HBTA 2E88A 4A2AA 1Z05A 4FWLA 4Z94A 2HMPA 4H0PA 2CH6A 3RSEB 4BREA 3CERA 3TU5A 3VEZA 2CH5A 3BUZB 2NRHA 1NMDA 4BRIA 3VGMA 4WQ4C 4Y0WA 1NGFA 5AQQA 2HOEA 1QZ6A 4BRQA 4AM6A 1BO5O 4WQ4A 1ATSA 3LDNA 1MWKA 3SK3A 2J4RA 3WXKA 4E1JA 3EL2A 4BR0A 3UKUB 3A8YA 2FF3B 2V7ZA 1NGHA 2WUSA 4BG9A 4BRPA 3MN7A 3MN5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U2VA 1RT2A 1TV6A 2Q1NA 1XQSC 2B5JA 2E20A 2YI1A 5JVHL 4LF8K 4BGAA 2EWSA 3LP3A 3T19A 3KLFA 2W40A 3EO3A 5BRDA 3WXMB 3A2FA 1HJOA 3OJSA 4PKIA 1MDUB 4I2QA 3GBTA 3ATVA 3TAMA 1RBRA 3F73A 1Q81O 2A42A 2BDPA 4FJ9A 3MAQA 5HLFA 4FJNA 3V1RA 3U3YA 3PIOL 2EHGA 4H5NA 3L8BA 3THXB 4MQ3A 1GLCG 3AVCA 2FSKA 1DKGD 3ZT3A 1BGXT 5AQFA 3N4QA 4FOEA 3DOLA 5T7BA 4J2DA 3ZLJA 1RTHA 3EN9A 5F2RA 4L8RB 1X9JA 4JI2K 4YOTA 3RR8A 4KAZA 4CEFA 2JWKA 1QSSA 3RVCA 3DLLL 2O8BB 3I33A 2G8HA 3CJCA 1WSFA 3F2KA 1NKEA 2XY7A 2HHSA 3K59A 5C42A 3DI6A 5E26A 4LSNA 4CJWA 2KHOA 4I7FA 3OJUA 3BF3A 3D6RA 4DTXA 2I5JA 4O8UA 4JK8A 3Q7BA 4IFYA 3I8DA 4HVJA 3AA2A 4N41A 2RE2A 3EKSA 1KLMA 1RDBA 3RWUA 3AV9A 4M42A 4L3QA 2PY5A 2NRXA 3D0PA 4DS5A 3C6AA 3NFAA 2G8VA 4ID5A 4B3RK 4AH9A 3DYAA 5E41A 1NJXA 3WQTA 2I7PA 4CERA 2VCPA 3V9SA 5LL6Z 1NWKA 3AAPA 3CQYA 5C15A 4FJIA 1C1BA 1VSHA 4DUYK 1RTIA 1RTJA 3OS2A 2W42A 4F4KA 3SQ0A 3LAMA 1XHXA 3WNHA 3NH1A 3C7NB 2O8DA 3CCJN 3O4QA 3VEXA 3MXMA 3VF4A 1S22A 3KLEA 1BUPA 1VQ5N 1N36K 3F9MA 2EX3A 2RPIA 3DLRA 4FOIA 3SQ2A 1VQON 4DFKA 3CCSN 5I9EB 4JKCA 4E1MA 1FKOA 1X9MA 1TVRA 2JLEA 2PBDA 4DQIA 4JKAA 4JI8K 5LY3A 2E2NA 5AQWA 4DR7K 1S6PA 2YHXA 1ILYA 3VA0A 4DTMA 4FLTA 3SPYA 3CG7A 4K8ZA 4JKFA 1JXBA 2NRRA 1WSIA 2FXUA 3LM2A 5C2FA 5FLXO 3DRPA 4FM0A 4JI6K 3A5NC 5LMNK 2F7TA 2GUPA 3CJBA 3THWA 1VAZA 1S1VA 2P9LB 3IKMA 3L4QA 5M1NA 3V1QA 5KRSA 4BRAA 4M7YA 3TTDA 3CYMA 4FWOA 4K42A 4B3SK 3DLKA 3KTQA 4BVPA 4E7JA 4FM1A 4K8XA 1NM1A 4LSLA 4DFPA 3ALYA 4FJ5A 3SQ1A 1VQPN 2OPQA 3HSCA 4YOVA 4JLHA 1KSPA 3CETA 2Y1IA 4M3ZA 3HT3A 2YNHA 3F9KA 2YV0X 1UA1A 3CPWM 2QWLA 3CM5A 3HO1A 4A5AA 4CGJA 3HOSA 3JS6A 4FJ8A 1NU0A 3BEXA 4H5RA 1JL1A 2HBLA 3DXKB 1KAXA 3ZEUB 1N33K 1OH7A 1NLVA 3SNNA 4BR5A 2GV9A 1K73O 3T1AA 2A6AA 4N56A 4Z0UA 4K25A 4DF4A 1TL3A 1RT7A 4LH4A 1WSHA 1VSDA 1L5UA 4W5QA 4DB3A 3OHRA 1B92A 2DPNA 4CFAA 4JK7A 4B3MK 2F9TA 3FZFA 3OYNA 1D8YA 1IO2A 3ZSQA 2GELA 2H3GX 4IBNA 1LWEA 1VQ6N 4A62A 2W6KA 1C0GA 3U9DA 3PIPL 3O3HA 3O8MA 2QWPA 4CEAA 2GWKA 1I3AA 5KI6A 2XHBA 1BU6O 2ZJRL 3ID8A 3HSTB 4PL7A 4FK4A 4W5RA 1OH5A 4OKKA 3S41A 1D4XA 3VQDA 4YOUA 3ASMA 3DM2A 2OPRA 3IMXA 1T44A 3A5MC 4NXMK 2XY8A 4E89A 1RDWX 5FPDA 4HCBA 1XC9A 3K2PA 3QBWA 4CGGA 3CFRA 1IBKK 4CESA 2ZQBA 3MCAB 4PQUA 3CM6A 4DSEA 5KGWA 4FLWA 1HKGA 3THYB 4JNEA 1Q82O 4WFBL 4W5OA 1DEJA 3TWHA 2IIRA 1L3TA 3FE1A 2P9NB 2HHVA 1CZ9A 4FJKA 1T3VA 2YHBA 1TL1A 4CEQA 3C6HA 3L3UA 2D4WA 3OYCA 4FK2A 5K14A 1NOYA 2PYLA 4I6MA 4KI6A 1DTTA 4E3SA 2YHYA 4E7LA 4KB0A 4E7IA 1H1VA 3DLGA 1NKCA 1LCUA 4FWMA 4ELVA 4B1ZA 5GIPA 3LDPA 3KK1A 1QQCA 4E7KA 4CD1A 1A5VA 5AQZA 3KKSA 3AVJA 1GOAA 4B3TK 3O4NA 3PO5A 2F8TA 3DXMB 3TSPA 3VQ5A 4B9NA 1UOCA 3HK2A 2UUBK 3K5NA 5ADXH 4GV3A 3U4LA 3NDKA 3HM9A 1VRTA 3LZJA 1U49A 2D1KA 2D0OA 4FLZA 3VN5A 4KTQA 4ISFA 1J5EK 3L2QA 3NE6A 2RHKA 1EO1A 1JXEA 2PZSA 2Z1HA 3I56N 4IOAL 1GOCA 3NH0A 3NAEA 1T6DA 2UXBK 1QVFM 3WEEB 3J81O 4IWVA 3K5LA 4B9QA 2BTFA 4OX9K 3NGIA 2Q36A 4FWSA 4H5WA 1WB9A 4YFUA 4CBXA 1YXQA 5KRTA 4ZHRA 3OS0A 4OJRA 5B8HA 1X3NA 5FPNA 4OPKA 3SPZA 2HBKA 4W5NA 4X65K 3UE5A 3SI6A 4FJJA 3KLHA 3I55N 3K5MA 2G8WA 4CJ7A 1HKBA 4CECA 4C1NI 1T8EA 1IG9A 3PO4A 4RWTA 2HHTA 1F21A 2OYQA 2UU9K 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1U2V A;  3H3O B;  4MLE A;  1BDG A;  2Q1N A;  1XQS C;  4BR9 A;  2E20 A;  5KPT A;  2YI1 A;  2ZGY A;  4BGA A;  4CZE A;  3EZW A;  2EWS A;  2W40 A;  3D2E B;  3EO3 A;  1NBW A;  4IXC A;  5BRD A;  1OKJ A;  1HJO A;  4PKI A;  1MDU B;  1JCG A;  3LDQ A;  4FWR A;  5AQR A;  3GBT A;  3ATV A;  1BA0 A;  4I6M B;  3CJ7 A;  2A42 A;  3A5L C;  3VEV A;  2QWN A;  4H5N A;  3FR0 A;  2OAN A;  2E1Y A;  3O1B A;  5AQP A;  1GLC G;  2FSK A;  1DKG D;  3SMP A;  3R6M A;  5AQF A;  3ZX2 A;  2QWM A;  1GLD G;  4FOE A;  3FFK B;  2E8A A;  2Q0U A;  1U2V B;  4DHY A;  3EN9 A;  5F2R A;  4HWI A;  5F0X A;  3O08 A;  1X9J A;  3A0I X;  4CI6 A;  2I7N A;  2V51 B;  4ISG A;  4CZM A;  1DGK N;  5KPR A;  1NGD A;  5AQJ A;  1NGE A;  3I33 A;  4CZK A;  3BF1 A;  3CJC A;  4CZG A;  4C23 A;  3VF2 A;  4JHD A;  4FWQ A;  5KPZ A;  3IUC A;  5E26 A;  1GLB G;  3FLC O;  2KHO A;  2BUP A;  1HLU A;  3BF3 A;  4M63 C;  3L6Q A;  4QS7 A;  1WUA A;  4BRL A;  1SZ2 A;  2CGK A;  4NO7 A;  3R9P A;  3UB5 A;  1U6Z A;  2Q31 A;  3C7N A;  4BQZ A;  3EKS A;  1X3M A;  3LM9 A;  3SJH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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