4L3QA

Crystal structure of glucokinase-activator complex
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
447
structure length
447
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glucokinase
publication title Pyrimidone-based series of glucokinase activators with alternative donor-acceptor motif.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 156
structure length 447
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4l3qA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4l3qA01
3GG4A 1YAGA 2W40A 3C0BA 4BROA 3CJ7A 2FF6A 4PKHA 3HM8A 4H0YB 2UYTA 3ZX0A 2ZGYA 1NGIA 2KHOA 3U8XA 1ZXOA 3WQTA 4CD3A 4B1VA 2Q2RA 3ULEA 3MK6A 1NM1A 2A3ZA 3FLCO 4BRMA 1GLLO 5KQ8A 3QFPA 3I8BA 2P9UB 3MN7A 5FPDA 1NLVA 2YJEA 3CI5A 2AP1A 5BRFA 1CZAN 5FPMA 2GELA 3JS6A 3A5NC 3VF2A 3FZLA 5BPMA 4A61A 2Q0RA 1GLAG 2W41A 5AQUA 4DCHA 1Q18A 2YI1A 5BR9A 2E1ZA 3VERA 3H3OB 3ZEUB 4BC4A 3U9ZA 5AQYA 5E26A 1GLEG 5ADXH 3BEXA 1ATSA 2QM1A 1NGCA 1TYQA 1HPMA 4IJAA 2E2PA 3FZKA 2HOEA 3KHYA 3EN9A 4BRKA 1NWKA 5ELZA 3BUZB 3H46O 3ZX3A 4FWKA 4BC3A 3IDHA 4MO5A 3MN6A 4CBWA 3RSEB 4BVPA 1NGJA 1NGEA 4H5RA 4WQ4A 5TKYA 3VEXA 3G25A 2E88A 4BC2A 2YHWA 3H45C 2P9NA 3L0QA 2E2OA 3WXIA 2YHXA 1BO5O 5CE3A 3DXKA 1HKCA 3KVGA 4FWMA 1MDUB 1G99A 4BRLA 1IJJA 3SMSA 4HTLA 3LDNA 3TU5A 5AQRA 1X3MA 4NB4A 5AZJA 5KQDA 1SAZA 5KPRA 4BC5A 1Y64A 4B1YB 2FXUA 3W0LA 4CBXA 4FOEA 2IVOA 4QS8A 4PL8A 4BR0A 3VETA 5AQFA 3C7NB 3ENOA 3MDQA 2EWSA 3O6WA 3OHRA 4BRPA 2HF4A 3WXLA 3CJCA 5AQSA 3M1FA 5AQHA 1YUWA 5AQPA 3FZMA 4ISEA 3IUCA 3CERA 1U6ZA 4WQ5A 2VWBA 1T6CA 2P9SA 1WOQA 1MWKA 2CGKA 4CZKA 2FSJA 3WT0A 1EQYA 2AA4A 2I7PA 4PL7A 4KBOA 1J6ZA 3LDQA 3P4IA 3S41A 3A5LC 1R59O 3UKRA 1BOTO 3UB5A 4JHDB 4WQ4C 2A42A 2ASPA 3HTVA 3ID8A 2F9WA 1E4FT 4B9QA 2BTFA 4F9OA 4H0PA 4BVOA 3R9PA 4FWPA 4BGBA 2P9KB 1GLFO 2P9LB 2YCHA 2A5XA 4MO4A 4AM6A 1RFQA 2A6AA 5LY3A 2QW9A 2IIRA 2IVPA 1ESVA 4H0XB 3SLCA 1QQMA 3VOVA 4DB3A 3FZHA 5FPEA 1WUAA 1HX1A 1LOTB 5JLFA 4PKGA 2YJFA 3O4WA 3CQXA 2ZWHA 2HMPA 4A62A 2GWKA 3DXMB 2GTDA 1RDWX 3WXKA 3SMPA 3M6GA 3WXJA 3VEYA 4JD2B 5EOYA 3A0IX 1U2VB 4CBUA 3D2EB 2HF3A 2QWRA 3ZEUA 3MCPA 3VESA 1E4GT 4FWRA 5EY4A 4IO8A 2VYPA 3BF3A 1DEJA 3VPZA 4FWQA 4ISGA 4BRFA 4BREA 4BRDA 1ZC6A 3H3NO 4O5FA 1HJOA 3EL2A 4CZLA 5AFUH 3RSEA 1GLCG 3EO3A 5AQVA 1TUUA 3A8YA 2A41A 4PKIA 5EXWA 1T44A 3AAPA 3LDOA 4H5NA 3WEEA 3L4IA 4B1WB 3UKUA 4BRCA 4BQLA 2BUPA 4BGAA 4EAHD 1XQSC 5AZIA 4M7XA 2PAVA 3VEZA 3IFRA 1ATRA 3MN9A 3VF4A 5BRHA 4BRQA 3A5MC 2NZTA 2CGJA 4CZFA 3W3DA 4EFHA 3DWLA 4H0VB 1NGBA 2F9TA 1GLDG 3CJAA 3DAWA 4FWSA 4EHUA 2QWNA 3ULEB 4H5WA 1BA1A 3O1WA 4EIAA 4O8KA 3AARA 5F2RA 4H5VA 4H0TB 5BPNA 3QMLA 1JCFA 5AR0A 2FSKA 4CZIA 4B1ZA 2Q97A 2VCPA 1KAZA 4IWVA 5AQMA 2PBDA 1RGIA 3H6EA 4AM7A 4BR5A 5F0XA 5BN8A 1NBWA 2GWJA 5E84A 3WUHA 2NLXA 1XUPO 2D1KA 3GL1A 2V52B 4IXCA 4FPBA 4DQ8A 4Z94A 4CZEA 1NMDA 5EX5A 2D4WA 5F1XA 2V7YA 2D0PA 3QFUA 2CH5A 2Q31A 1HKGA 3CJBA 1SQKA 4BRGA 2ITMA 4C23A 3ENHA 4EHTA 1NGGA 1KXPA 4Y0WA 5ADXA 3M3ZA 4CZJA 2P9KA 3BF1A 4YDUA 2P9LA 2Q0UA 3R8EA 1K8KB 1YXQA 4RTFD 4JAXA 2P9IB 3MN5A 2QWOA 1DGKN 2P9NB 2E2NA 4FWNA 5AQKA 3HSCA 4L3QA 2QWLA 3DXKB 1ATNA 2GEMA 4FPAA 2FLOA 4XEIA 2D0OA 1IG8A 3DXMA 5BRDA 4K43A 5KPTA 3QBWA 3ATUA 4BR9A 5EVZA 5AQIA 5JICA 1QQNA 3LDLA 4HWIA 5FPNA 4K41A 3QDKA 2A40A 3GOIA 1X3NA 5AQQA 1XC3A 2ASMA 2E1YA 2P9UA 1JCEA 1OKJA 3IMXA 3B8AX 3FE1A 2V7ZA 1D4XA 4QS7A 3FFKB 1Z6RA 2Q36A 1NGAA 2QWQA 1BWFO 1Z05A 2ZGZA 1HKBA 3LM9A 1QZ6A 3DJCA 4FL9A 1X9JA 4FSVA 1SZ2A 5AQXA 1BUPA 3O08A 4I6MB 5AQWA 4BR7A 3D7EO 2J4RA 3WQUA 4FWLA 3HZ6A 3UKRB 2FF3B 4FWOA 5AQNA 3BP8A 3EKSA 4LC9B 3CJ1A 4YDUC 4WQ5C 3LM2A 1HUXA 1T6DA 3HBTA 4B1UB 1S22A 1NGHA 2I7NA 1MWMA 4H0OA 2WUSA 4GNIA 5JLHA 1H1VA 1BA0A 2FSNA 3I33A 2CGLA 4M63C 3SK3A 3AY9A 4IZ9A 2P9PB 4RCHA 2E20A 3D2FB 5AQOA 2CH6A 3ZETB 4XH1A 5AQLA 4QS9A 4BG9A 3VEVA 4BR2A 5AQJA 3O5BA 5BPLA 1DKGD 2H3GX 1S3XA 3VGMA 4FO0A 3VGKA 3EZWA 1QZ5A 3FR0A 2E8AA 3GBTA 4RWTA 3U9DA 3GDQA 3TPQA 3VGLA 3R6MA 3AAQA 1C0GA 3C7NA 5LJWA 3CIPA 1BU6O 3ATVA 2QXLA 4BG8A 2QWMA 1BDGA 4BRIA 4A2AA 2Q1NA 3VEOA 1P8ZA 3CHWA 1HLUA 4BR4A 2OANA 2QWPA 4XH5A 3VEWA 1KAXA 1C0FA 1K8KA 5KPZA 1MA9B 2V51B 3ZX2A 5B8HA 5AFUA 1V4SA 2P9IA 1NGFA 1QQOA 4NO7A 3WEEB 1KAYA 4GY2B 3U4LA 4MLEA 3QB0A 3UKUB 4IJNA 1TYQB 3H1VX 4CJ7A 4JHDA 2NRHA 2ZF5O 5BREA 4K42A 2ASOA 5AZIB 2GUPA 4M7YA 1TUYA 4BRHA 1GLJO 4K25A 5BN9A 4J8FA 3LDPA 4DHYA 3CQYA 4MLHA 1YVNA 3CETA 3FGUA 3J8AA 3GE1A 3HI0A 3UE5A 1V4TA 4H5TA 4CZHA 5LJVA 3FZFA 3O1BA 2DPNA 3VF6A 4CZGA 1JCGA 1NGDA 3EKUA 4BQZA 1QHAA 3LL3A 2IVNA 4CZMA 4FOIA 4JD2A 3QICA 1U2VA 3CJ9A 3L6QA 5AQTA 4B1XB 3D2EA 3SJHA 4XH4A 4BRAA 5AZJB 5I9EB 3JXUA 2YHYA 4I6MA 3A5OC 2E2QA 3F9MA 5AQZA 4H03B 4E1JA 4JNEA 4JN4A 1LCUA 4CI6A 1GLBG 4WYBA 5JMVA 3VENA 3H1QA 3MMVA 5AQGA 4CD1A 1ZBSA 1BG3A 4A2BA 2P9PA 3KZBA 3QBXA 3O80A 3D2FA 3ZETA 4ISFA 3O8MA 2P9SB 4BRNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B3RK 4OGEA 1VQ4N 3VQEA 3CJ7A 2FF6A 2NNWA 3K5MA 4H0YB 4DSLA 1SL0A 2Z1GA 3WQTA 1TGOA 3TAPA 5GIOA 5A2QO 4B1VA 4G9ZA 4JI8K 1N32K 1NM1A 2ZD1A 1U49A 4BRMA 3QFPA 4CHZA 4FVMA 2YJEA 2VG6A 4CHPA 3G6EN 1VSIA 3PSIA 5FPMA 2NRZA 3JS6A 3A5NC 3FZLA 3PV8A 2Q3SA 4I7FA 4F3TA 2UXDK 5LMNK 4X62K 3H3OB 3NF9A 1OVYA 3ZEUB 5AQYA 1D9FA 3OVNA 3WNFA 1BISA 4KB0A 3QNOA 3EN9A 5CYQA 4OLAA 5ELZA 4CJLA 4PY5A 1LW2A 4FWKA 4CEZA 3IDHA 3NF7A 4O8UA 5FDLA 1HNZK 4LFAK 1CXUA 1NGJA 1JL1A 3VEXA 3G25A 3THWB 2E88A 4H4MA 1ASWA 2YHWA 3TAEA 3VQDA 4DR2K 3WXIA 4KI4A 2YHXA 3ZCMA 4KHNA 1X9SA 3RVCA 4FJGA 5HROA 4FWMA 3V1RA 1MDUB 1G99A 4JV5K 4HTLA 1SAZA 4KB1A 3RMAA 4CBXA 4BR0A 2O8DA 4E1NA 5AQFA 3C7NB 3J7ZO 3ENOA 1D8YA 2PYLA 4BRPA 2HF4A 2KQ2A 3CJCA 3M1FA 4DR3K 1OH6A 1WAJA 1K9MO 2FBXA 5AQPA 3FZMA 3NGZA 4B9SA 4Z4IA 4NXNK 3DRRA 1UWBA 3IUCA 5I3UA 3IKMA 4KHSA 1EO1A 3CFRA 1SKWA 4B9UA 5D3GA 2P9SA 1WOQA 4DR4K 2O4IA 1EQYA 1T3VA 4N47A 4MDAA 2HHUA 3L4QA 3A5LC 3HSTB 1JKHA 1I39A 2ZQBA 4FK2A 2O8FB 4CJRA 4WQ4C 3AO3A 3OYEA 2ASPA 1JL2A 3LP1A 3CMEN 1W2BM 4F9OA 4CEDA 2P9KB 2HHQA 3OYGA 4RW7A 3LPUA 2P9LB 4LY7A 3KK1A 5M1QA 1RFQA 2A6AA 5LY3A 2IIRA 2IVPA 1ESVA 3SLCA 1QQMA 4DTXA 1C1BA 3TAMA 3SUOA 3OYAA 5HL7L 1NMNA 4GKKK 2YJFA 3CCQN 4Q5VA 4I9QA 3L2QA 1YT3A 3DXMB 4GMJB 2QTDA 4E1MA 2F96A 4JKEA 3HXMA 1VRUA 3WXJA 5HRNA 3TWHA 2DTUA 3VEYA 4CBUA 3J81O 2XY7A 2ATQA 3ZYYX 2QEXN 3TSPA 2NRXA 2O8EB 5EY4A 4DU1A 2HW3A 4BE1A 3OW2M 3NGIA 4DV3K 1HJOA 3EL2A 4CZLA 5GAHP 1S72N 4FZYA 1RT2A 3KWGA 1GLCG 1QQCA 2RE2A 1TUUA 5SWMA 1WLJA 4AHCA 5EXWA 2PY5A 4CHQA 3OTOK 3WEEA 2O4GA 1RTJA 3NVKA 1C0MA 4BQLA 4FK4A 2WFBA 4E7HA 4JS4A 1ASVA 5AZIA 2YKNA 3EY1A 1ATRA 5C2DA 3QEIA 3RR7A 5BRHA 4BRQA 1T8EA 2NZTA 3OA9A 3M8RA 3AO4A 4OKJA 3DWLA 4EFHA 2F9TA 4DFMA 2QKBA 5SZTA 3TTFA 3OYKA 4E0DA 4H5WA 1YTUA 1BCMA 2Z1JA 3AARA 5F2RA 4J2EA 4CJFA 1YJ9N 4KI6A 3IRXA 3CCJN 4CZIA 4B1ZA 2Q97A 3DOKA 3T1YK 1I3AA 4OPJA 4JKHA 3AVAA 3WUHA 2NLXA 1XUPO 2D1KA 3O4QA 3CQ8A 2WONA 3DYAA 4FPBA 4DLEA 5CHIA 4WFBL 4OX9K 3A2FA 3CC7N 3QFUA 4O55A 4WFAL 4FYDA 2CH5A 4OKKA 4FZXC 4C23A 4BRGA 2IOCA 3BGRA 1EKEA 1KVCA 2NRVA 3OYNA 4NCAA 2Q0UA 1HR0K 1LWCA 3DLRA 3R8EA 4NLBA 3AA3A 3ZSVA 3EE9A 2GBZA 2P9IB 1DGKN 4JKBA 5DMRA 5AQKA 2DFEA 1VSMA 3T3FA 2QWLA 3MEGA 1ATNA 4FPAA 3OYDA 4K43A 2D0CA 2X6NA 2A1SA 2XRIA 4CIGA 3TAFA 2AJQA 3LAKA 1K6YA 1FW6A 5JICA 1QQNA 3LDLA 1BCOA 4CGDA 1IKXA 4DTUA 4IEIA 4Z4FA 1S5JA 4K41A 2HHWA 1A5XA 4YOYA 1X3NA 1VSLA 3NGYA 2P9UA 5C25A 2O8DB 1JCEA 4W5RA 4JKFA 1OH8A 1CZ9A 5TKWA 2V7ZA 1RT7A 1WSHA 4IOXA 4CJUA 3U3YA 3R1XA 5DM6L 2UXCK 3KKSA 4FK0A 1U4BA 4PHTX 1S6QA 1XHZA 2WC9A 3E66A 3WQUA 4FWLA 3D45A 3BP8A 4CE9A 3SQ0A 3CJ1A 3V9ZA 1A5VA 4WQ5C 3VA3A 4ELVA 1HUXA 2OCEA 3M5RA 4EZ6A 4CJWA 4DQQA 1N36K 1MWMA 5C42A 4KRFA 4GNIA 3MAQA 4LF9K 4CJQA 4M3WA 3PX0A 1VQKN 2P9PB 4RCHA 2E20A 3J7YP 4L8RB 3D2FB 2CH6A 4R5PA 4I9LA 4XH1A 4QS9A 1HQEA 3HT3A 1D9DA 3VEVA 1SV5A 1BIZA 4EP4A 4GKJK 4CGIA 3DMJA 4DTNA 2F8SA 1S3XA 1ZBHA 3FR0A 1NK4A 3GBTA 1HNIA 5GINA 4OPKA 1YHQN 4DR1K 3LZIA 3LWMA 3ATVA 3ZT4A 2QXLA 4A2AA 3F73A 3QIOA 1RILA 3OJSA 4DFKA 1HLUA 4BR4A 3QNNA 2QWPA 4K0KK 3HO1A 1KAXA 2G8VA 4ILGB 3ZT0A 3P83D 5B8HA 1NGFA 3WEEB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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