4L3QA

Crystal structure of glucokinase-activator complex
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
447
structure length
447
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Pyrimidone-based series of glucokinase activators with alternative donor-acceptor motif.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 156
structure length 447
sequence length 447
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4l3qA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4l3qA01
3AY9A 4PL7A 1QQOA 4NO7A 1NGIA 4PKIA 2P9KA 2YHWA 4MLEA 4FOEA 5AQUA 2QXLA 4WQ5C 3VERA 3A8YA 4MO5A 2E1YA 2FF6A 3CIPA 4BRIA 1BUPA 4FWKA 3MN7A 3B8AX 5JLHA 1OKJA 2FSJA 3JXUA 3VEVA 5EXWA 3A5OC 3EO3A 3L6QA 2E2NA 4IXCA 3VF4A 4EFHA 2ASPA 2V52B 3FR0A 3D2FA 3CQXA 4BR7A 4BR5A 3W3DA 4PKGA 2IVPA 1ZBSA 4QS8A 5LY3A 2QWLA 2QWQA 2ZGZA 4CZFA 2ZF5O 5BN8A 2ASOA 5AQFA 1HPMA 3C7NA 3H46O 5LJVA 2BUPA 3H1QA 3R6MA 1NGAA 4HTLA 1E4FT 3SK3A 3AAPA 4DB3A 3LDNA 3EKSA 2NLXA 5FPNA 3HTVA 1U6ZA 5AQGA 3DXKB 1HKCA 3IFRA 4K41A 3LM9A 4BC4A 3LDQA 3KHYA 5BRFA 2ASMA 2HOEA 4FWQA 4IO8A 3TU5A 1S3XA 5ADXH 3O08A 3WT0A 3ZX3A 1S22A 5BPLA 2H3GX 3QBWA 3U4LA 4WQ4A 2GUPA 3ATUA 4WQ5A 5AQQA 2A3ZA 4A2AA 2VYPA 1DKGD 3QMLA 3GBTA 1BA1A 2P9UA 4BR2A 2CGKA 2E8AA 4BRAA 1RGIA 5AZJA 1KXPA 4MO4A 4QS9A 1Z05A 4CJ7A 4CZHA 4FWRA 4BR0A 1X9JA 3DXMA 4BRNA 2EWSA 4FPAA 3WXIA 4FWLA 4GY2B 2D1KA 3QBXA 3ENOA 1NLVA 3EN9A 2NRHA 4XH5A 1SQKA 1ATNA 1NGCA 2WUSA 1GLBG 3FZMA 1RDWX 5AQYA 1JCFA 5EY4A 4FPBA 4BR9A 3VGKA 4RTFD 3UKUB 4M7XA 3VESA 1QHAA 2W41A 4BRDA 1C0FA 4K42A 4H0YB 4I6MB 2A5XA 3H45C 2Q0UA 3VF2A 2YJFA 4EIAA 2FXUA 3BP8A 4H0OA 1NGBA 5AQZA 3AARA 2E2PA 2FSNA 3L4IA 1KAXA 2QWNA 3WEEA 4BVPA 3U8XA 3GDQA 4BQLA 3GG4A 4QS7A 1HKBA 3LM2A 3O1WA 4AM6A 4B1YB 3VEZA 4A2BA 5JICA 3CJ1A 3VEWA 3DWLA 1HKGA 2QWRA 2Q97A 3MMVA 1WUAA 3H6EA 3BUZB 4BRPA 1X3NA 4DCHA 2F9TA 1GLFO 4MLHA 1ZC6A 4E1JA 1DGKN 1DEJA 5ADXA 4CBUA 3HM8A 1H1VA 1QQMA 1SAZA 3VEYA 2YHYA 5AQJA 3DAWA 3ZETB 4RWTA 2HF4A 5TKYA 3O1BA 3U9DA 3DXMB 4FWOA 2P9PB 2QM1A 1P8ZA 5BRHA 4FWSA 4H0VB 1IG8A 2A6AA 5AQHA 3HI0A 4FWPA 3UE5A 2IVOA 1XC3A 2J4RA 2NZTA 3VGMA 3KVGA 3WUHA 4H5RA 1J6ZA 2E20A 5FPEA 2Q31A 3GE1A 4BRCA 1BA0A 1Y64A 3M1FA 1BDGA 2A40A 1U2VB 4CZKA 3D2EA 1JCEA 3IDHA 4EHUA 2GWJA 5AZIA 3UKRB 3HSCA 2D0PA 2CH6A 2P9IB 4JHDB 3U9ZA 4FWMA 4CBWA 2A41A 3CJ7A 3VF6A 4BG9A 1NM1A 5F1XA 4BRHA 3D7EO 3MK6A 3I8BA 4CZLA 4A61A 5ELZA 3R9PA 4BGBA 2GEMA 5AQRA 4CD3A 1NWKA 1TYQA 5B8HA 3LDLA 1YVNA 1NGFA 2P9KB 3QFUA 1T6CA 3ENHA 5BREA 2ZWHA 2YI1A 4BRKA 2E1ZA 1NGDA 4KBOA 1GLEG 5BPNA 2YHXA 1K8KA 3H3OB 2F9WA 3ULEA 5AQKA 2Q1NA 1X3MA 4B1VA 1CZAN 2P9SA 4JNEA 4H0PA 1RFQA 4BR4A 5AFUH 3P4IA 1XQSC 2P9LA 5AQXA 1V4SA 4O8KA 2QW9A 5BR9A 3AAQA 3O5BA 3D2FB 2YJEA 1NGGA 3TPQA 3O6WA 3JS6A 4FL9A 4PL8A 4ISGA 4H03B 2FF3B 3ZEUA 4H0TB 1MDUB 3HZ6A 4BGAA 3A5LC 3C7NB 3CQYA 3KZBA 4NB4A 1ZXOA 4C23A 1T6DA 2FSKA 5AR0A 2AA4A 3LDPA 1GLCG 1MWKA 1G99A 5EVZA 1NMDA 3EKUA 4XH1A 3CJAA 5JMVA 3LL3A 3VPZA 4PKHA 5KQ8A 3CJ9A 5FPDA 1MWMA 3SJHA 3FZKA 4BREA 1D4XA 3EZWA 1HUXA 3HBTA 3RSEA 4BVOA 4AM7A 1V4TA 5AQLA 4WYBA 4H5WA 2GWKA 3M6GA 2ZGYA 2IVNA 1BO5O 4JAXA 2D4WA 4BC3A 4H5VA 3WXJA 1NGEA 4FWNA 1HX1A 3VEOA 3MN5A 2KHOA 3BF1A 3CJCA 3CETA 4CZEA 4GNIA 4O5FA 1HJOA 2CGJA 4B1ZA 4BQZA 4LC9B 5KPZA 4BC2A 3H1VX 1MA9B 2IIRA 2P9UB 1BWFO 1ATSA 2PAVA 3W0LA 4F9OA 3SLCA 3C0BA 4YDUC 2E88A 2FLOA 2Q2RA 4CI6A 5AZJB 5AQOA 1QZ5A 5AQNA 1LOTB 5FPMA 4K43A 3QB0A 1QZ6A 3CJBA 3A0IX 3VEXA 5F2RA 4M63C 3MDQA 3FGUA 1IJJA 5AFUA 2A42A 2QWMA 4K25A 2GELA 4DHYA 1EQYA 2PBDA 1NGHA 3IMXA 4A62A 5KPRA 2OANA 4WQ4C 5AQVA 4H5TA 4IJAA 3FZHA 2BTFA 1GLLO 4B1WB 4BG8A 1KAYA 1LCUA 3VOVA 5AQMA 4CZMA 4EHTA 3EL2A 3RSEB 5AQTA 2W40A 3VGLA 2V7ZA 2AP1A 1WOQA 5KPTA 3M3ZA 3WEEB 4CD1A 3CI5A 1ESVA 2E2QA 3WQTA 3FFKB 3H3NO 3G25A 1GLJO 5E26A 5JLFA 2V7YA 3VETA 1HLUA 1R59O 5I9EB 3A5NC 3GOIA 4IJNA 4RCHA 3GL1A 3QICA 1YXQA 2UYTA 3FLCO 3CERA 4XEIA 4CZGA 5EOYA 4H0XB 3VENA 5AQIA 3QDKA 1T44A 3S41A 4YDUA 1Q18A 3UKUA 2V51B 1BOTO 4FO0A 4HWIA 2QWOA 4JN4A 4FSVA 5AQSA 2HF3A 4I6MA 1Z6RA 4CZIA 1TUUA 3FZFA 3LDOA 2E2OA 3DJCA 2P9NA 4B9QA 3WQUA 5LJWA 4J8FA 1TUYA 3O8MA 4JD2A 2QWPA 4IWVA 2CGLA 2VWBA 4FOIA 1E4GT 3SMPA 4DQ8A 3ZX2A 1JCGA 3J8AA 3OHRA 5AQWA 1XUPO 4Z94A 1SZ2A 3D2EB 4BRGA 3CHWA 5EX5A 5AZIB 3BEXA 2ITMA 4ISFA 1GLDG 4ISEA 4BROA 3MN9A 3F9MA 3ZETA 1ATRA 3FE1A 2P9PA 4EAHD 3ID8A 3WXLA 4CZJA 2DPNA 4BC5A 1TYQB 3QFPA 5BN9A 3BF3A 2VCPA 2I7PA 3MCPA 5AQPA 2I7NA 3ATVA 1K8KB 3R8EA 3ULEB 3SMSA 4M7YA 2P9SB 2Q0RA 4IZ9A 3ZX0A 4BRQA 1BG3A 1YAGA 1NGJA 2P9LB 3A5MC 4B1XB 2YCHA 4BRMA 1NBWA 3FZLA 4H5NA 3IUCA 2D0OA 1C0GA 2GTDA 5BPMA 1U2VA 1YUWA 4Y0WA 3O80A 2P9NB 4BRFA 2HMPA 3I33A 3UKRA 4L3QA 3MN6A 5CE3A 1QQNA 3ZEUB 4JD2B 1KAZA 2P9IA 4JHDA 5E84A 5F0XA 3WXKA 2CH5A 3O4WA 5KQDA 4XH4A 3L0QA 5BRDA 4CBXA 3UB5A 1BU6O 2Q36A 3DXKA 4B1UB 1GLAG 4BRLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AY9A 5HRRA 4DU3A 5A2QO 3OYCA 4NCGA 3SCXA 4FJMA 5JVGL 2KKZA 3TAFA 4NO7A 1NGIA 2P9KA 4FOEA 5AQUA 3VERA 1HNZK 4DMNA 1WBDA 4MO5A 2E1YA 3CIPA 3N4PA 3KLFA 2P51A 1WNSA 1X1PA 3MAQA 1YI2N 1X9WA 3JXUA 1BQNA 3KLIA 3A5OC 4ILJA 1TL3A 1NJXA 3VF4A 3FR0A 1BQMA 4CVNE 3D2FA 3EE9A 1XMOK 1QVFM 2JWLA 4C8NA 4PHTX 2O8EA 2RF2A 5M1PA 2ZF5O 1L3TA 3QERA 4RW6A 4F8RA 1HPMA 3C7NA 4FVMA 3P1GA 2BUPA 4IDHA 3KKRA 2HHSA 3B6PA 3J81O 3QIPA 4E7IA 3R6MA 3NF6A 4DTUA 3VQAA 1Q7YO 4B9TA 3M8RA 2FBVA 5IWAK 1RT2A 3VQDA 2HBMA 3T1AA 3LZJA 5IT9O 5C12A 3HTVA 4Z4CA 4B9SA 1J5EK 3RMCA 4K41A 3LM9A 3ZCMA 3LDQA 2XO7A 1BGXT 4JI8K 2HOEA 4FWQA 4IO8A 1S3XA 2I5JA 1L3UA 3LP1A 3ZSVA 4WQ4A 2HBKA 3ISNC 4DKWA 3S3MA 4FJ7A 2QI2A 1SS6A 4A2AA 1RT6A 2IC3A 1DKGD 3QMLA 5C2FA 3MWPA 4BR2A 4LF6K 3ASMA 4NCAA 1OVYA 3AO5A 3J7YP 2P1JA 4BRAA 2A1SA 4MO4A 4BY9C 3KWIA 3O9SA 1ZBHA 4FWRA 3TTCA 2KFNA 4BR0A 1X9JA 4FWLA 3B6OA 3C6AA 3CFPA 1VSFA 1NLVA 1S1VA 3KTQA 1UOCA 3PX6A 1JCFA 4CW7B 1N6QA 3VGKA 1CLQA 3UKUB 4JKGA 1QHAA 2W41A 4L8RB 1I3AA 3CCMN 4H0YB 3JYTA 3VF2A 1REVA 4QOZB 2BH1A 2WOMA 4EIAA 1UWBA 3CPEA 2IGIA 3AARA 4M3RA 3GG4A 1HKBA 3OS0A 2HHWA 4B1YB 4A2BA 3CJ1A 3VEWA 3V9XA 3AA3A 1BIUA 1WUAA 4IG0A 3BUZB 4DSEA 2FC0A 1C1AA 1KD1O 4BRPA 2F9TA 1HNVA 3OYEA 4MLHA 4DR4K 3AA5X 2E4LA 3VEYA 1DT9A 3CYMA 5AQJA 3QNOA 5TKYA 4CHQA 3O1BA 3U9DA 3IKMA 2P9PB 5CZ2A 2D5RA 4DFPA 3OJUA 3NVMA 1IG8A 2A6AA 1YIJN 3OYNA 3LANA 3UE5A 2IVOA 4PY5A 3E9PA 4CEBA 4LFAK 1GOBA 2NZTA 3L8BA 3OTOK 4RW9A 4KPYA 5FPEA 2Q31A 1WLJA 1BA0A 5KRSA 1U2VB 3TAQA 3AVLA 2R7YA 1JCEA 3IDHA 3SQ0A 2GWJA 3O9UA 4JHDB 3K5NA 3U9ZA 4FWMA 4KH5A 4DU4A 2BANA 3NF7A 1RTDA 3SQ1A 2QK9A 4WFNL 4GV6A 1NM1A 4BRHA 4FZYA 3D7EO 2YNHA 5AQRA 4WFBL 3LDLA 1NGFA 3QFUA 5HP1A 5BREA 1VQLN 2ZWHA 4CECA 4CGHA 1GLEG 3K9JA 1WSHA 1EWRA 3ULEA 3MXMA 4LH4A 4B1VA 1JLGA 4G9ZA 4IFVA 1RFQA 1Q9XA 5AFUH 3P4IA 5BR9A 3AAQA 4AHUA 3O5BA 3P38A 3L2QA 2YJEA 5K14A 1NGGA 1U04A 2HVHA 1YJNN 3O6WA 1BHLA 1KVCA 3ZEUA 1EO1A 4DSFA 4JKDA 5LMNK 4B9MA 1W9HA 1MDUB 4DV6K 1OVQA 3O4NA 3J7ZO 4U7BA 4FVUA 3DOKA 3F73A 3V9SA 5AR0A 4H4MA 4ICLA 2G8IA 4JLHA 4DR1K 3SJHA 4ZTFA 3FZKA 4CJWA 3L2VA 4DV0K 4IEIA 4LD0A 1W97L 2ZQBA 2ZGYA 3LP3A 1RDUA 2HW3A 4NLCA 3BDPA 3VEOA 2YX6A 1N34K 3MN5A 3ENBA 5J2MA 2YNGA 1RILA 1HJOA 4O4GA 4BC2A 4W5TA 3WNEA 1XNRK 4DTPA 1EKEA 1WSEA 1P90A 1ATSA 3TAMA 3L2UA 5HROA 3C0BA 4YDUC 1JXEA 1VSKA 3DLLL 1NKEA 4CI6A 1S6QA 4F3TA 4K43A 2YHAA 5HLFA 5GAHP 1BCMA 3A0IX 2VG5A 3VQ4A 4H8KA 4FCYA 4M45A 3AVCA 3TR8A 4DHYA 3WXMB 3IMXA 2KQ2A 3NMUA 5AQVA 4H5TA 3PLAA 1GLLO 4B1WB 2HVIA 2GUIA 4GVEA 3VOVA 1KRPA 3EL2A 3AO2A 3RSEB 3R1XA 2W40A 3O9RA 1FW6A 1LAVA 2O8FB 1S6PA 3VQ7A 3AVMA 3VQEA 2OPSA 1VQ9N 3QLHA 4JK7A 1N8RO 5E26A 1NMNA 2WFBA 3NGYA 2E6LA 4X66K 1HLUA 3CD6N 1VRUA 1S9EA 4CFCA 3PIPL 4CEOA 4BDZA 1VSLA 5TKWA 3NGZA 2RPIA 4CF8A 5J2NA 4CJKA 3EEQA 4OKEA 4H0XB 3ZSOA 5KRTA 3S41A 3UKUA 2V51B 4FO0A 4HWIA 2QWOA 1TAQA 1RDAA 3OYLA 4CGFA 1C0MA 4B3RK 3E01A 2O4GA 2PZSA 3C65A 2OYQA 3SAGA 4B9NA 4J8FA 1TUYA 3M8QA 1S72N 1KFSA 3TSQA 4A5AA 1JCGA 3T69A 3K5LA 5EX5A 5AZIB 3OYKA 1VSHA 1Z25A 1Q82O 1JL2A 4KI6A 1O13A 1QTMA 4ISEA 4XIUA 1RT4A 1S9GA 4B8CA 3V1RA 3PUFA 2P9PA 3MCAB 1YJ9N 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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