5JLFA

Structure of the f-actin-tropomyosin complex (reprocessed)
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
367
structure length
366
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Contractile protein
total genus 94
structure length 366
sequence length 367
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 5jlfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5jlfA04
3D2FA 5ELZA 2I7PA 1KAYA 4FWNA 1JCEA 3FE1A 2VWBA 4B1ZA 3WXIA 3H6EA 3VF2A 5AQSA 1KAXA 2ZWHA 3VGKA 3DXKB 3WXJA 5AQRA 3BF1A 5BN8A 3F9MA 4XH4A 3VEWA 4EFHA 2FXUA 5AQOA 4FOIA 2A5XA 1CZAN 5AQWA 4FWOA 5AQQA 3TPQA 4B9QA 4I6MB 4BRAA 3CQYA 5BRHA 3VERA 4CZGA 2E8AA 2EWSA 1BDGA 4A62A 1RDWX 5LJVA 3VEOA 1YVNA 2FSJA 3DWLA 3ZEUA 1RFQA 1GLLO 3LDQA 3VESA 3SMSA 5BPMA 3HTVA 3RSEB 2E88A 3EN9A 4CBWA 1Y64A 3CQXA 4LC9B 3EKUA 1R59O 1NGHA 5AQJA 3ID8A 1MWKA 3GL1A 3S41A 4CZJA 4EIAA 4L3QA 2P9UB 4BRDA 2P9UA 4BC2A 3CETA 4FL9A 2P9KB 4PKGA 2UYTA 3WEEB 2DPNA 5AQFA 2VCPA 3MN6A 3SK3A 5AZJA 4AM7A 1QZ6A 1NWKA 1SAZA 3ULEA 2H3GX 4NB4A 4DQ8A 2P9NB 3H1VX 3DXMA 4BC4A 3VEYA 4H5NA 4BREA 5BREA 2YJEA 3U4LA 5KQ8A 3MDQA 3L0QA 1TYQA 2QWOA 5F2RA 4CD1A 1NGGA 3L4IA 2YHXA 3GBTA 5BRFA 2P9SA 2GWJA 1J6ZA 4FWPA 3ZX2A 4IO8A 2GTDA 2NZTA 4BQZA 2ITMA 2IVPA 4CJ7A 5F0XA 4K25A 1NMDA 2QWNA 3VEXA 4BRFA 1HX1A 2D0PA 4BR0A 1BWFO 4E1JA 1YXQA 3H46O 4H0OA 3MK6A 4WYBA 4NO7A 3CERA 3TU5A 1ESVA 4Z94A 4BVOA 3MN7A 1WUAA 5F1XA 2YHYA 3UKRA 3O4WA 4FSVA 5LJWA 3GG4A 3VEVA 2HOEA 4WQ5C 3ATVA 1MWMA 3UB5A 5I9EB 2F9WA 3UKUB 3IUCA 4CZMA 2D4WA 5BRDA 4K43A 2E2PA 2KHOA 1GLEG 3LDOA 4Y0WA 2GUPA 3C7NB 1YUWA 2D0OA 4CBUA 2IVNA 1T6CA 3UE5A 3CJ7A 4BR5A 4DB3A 2V52B 4PL8A 4M63C 3QMLA 1K8KB 2W40A 1LCUA 3A5LC 4JD2A 4B1XB 2YI1A 4A2AA 3A5MC 4FPBA 3DJCA 2P9PB 3SMPA 3H3OB 4YDUC 1WOQA 4KBOA 3WT0A 1MDUB 2HF4A 3D2FB 2YCHA 5TKYA 3O8MA 1GLCG 4BC3A 4CD3A 4JN4A 4PL7A 5AQNA 3ENHA 4ISEA 5AQHA 5AQMA 1E4GT 1E4FT 3QFUA 3R9PA 2Q0RA 4FWSA 4EHTA 3CJ9A 4RWTA 1XQSC 5E84A 3FZMA 1IG8A 2AP1A 2E2OA 2Q31A 1X3NA 1EQYA 3KHYA 1NM1A 5EY4A 1C0GA 4O8KA 3O08A 3CJCA 1U2VA 4AM6A 3VGLA 5AQKA 2ASMA 5AQLA 3HZ6A 1HKGA 3IMXA 2Q0UA 3O1WA 3EZWA 4B1YB 3ZEUB 2BTFA 1U6ZA 3GOIA 3MN9A 3CHWA 3FZLA 1QQMA 4A2BA 3QFPA 3CI5A 4BRCA 4H0XB 3R6MA 3O1BA 3L6QA 4H03B 2GWKA 1NGBA 4DHYA 5KPTA 3JXUA 4CBXA 4C23A 3ZX3A 2CGJA 4ISFA 5EVZA 1GLBG 5KQDA 4EHUA 1YAGA 1KAZA 4JHDA 5AQIA 4BR4A 4BRHA 1T44A 1NBWA 2ASPA 2IIRA 4H0YB 1ZC6A 4H5WA 5AZJB 4HWIA 3ULEB 2NLXA 2HMPA 3DXMB 4MO5A 3FGUA 1GLDG 2QXLA 3DAWA 1TYQB 3FLCO 1P8ZA 1Q18A 4BVPA 3FZKA 3AAQA 1GLFO 2E1ZA 3EL2A 2P9SB 5AQVA 2GEMA 2P9LA 4CZIA 1QQNA 3G25A 3VPZA 4JAXA 4QS9A 1S22A 1BA0A 2V7ZA 1DKGD 1SQKA 3HBTA 1Z6RA 3WQTA 3BEXA 3EKSA 1V4SA 3BUZB 2P9IA 3I8BA 5EXWA 4QS7A 2Q2RA 1HUXA 2V7YA 3D7EO 3LL3A 2GELA 4BRMA 4BROA 1S3XA 1SZ2A 4PKIA 2D1KA 5AZIA 1QHAA 2F9TA 4BR7A 3QDKA 4CZKA 4MLHA 4FWKA 3UKRB 4FWLA 2ZGZA 5JICA 5EOYA 3SJHA 3M1FA 5BPNA 3BP8A 2V51B 3AAPA 3P4IA 2QWQA 1XC3A 1RGIA 2W41A 3MCPA 4IXCA 4CZEA 4WQ4A 4IJNA 1BU6O 3O80A 3WXKA 4JNEA 4FO0A 1BUPA 1DEJA 2A6AA 3ENOA 5LY3A 1JCFA 2QWPA 4JD2B 4K42A 1ATRA 2YJFA 1D4XA 4CZHA 1NGCA 1QZ5A 3CJBA 5AFUH 3WQUA 3LDNA 4J8FA 3MN5A 2ZGYA 3LDLA 3QBXA 3J8AA 1HKBA 3A5NC 4M7YA 2E20A 2YHWA 4FPAA 1MA9B 3CIPA 4MLEA 2FF6A 2QWMA 5AQUA 1HKCA 3H3NO 4BR9A 4BRPA 3D2EA 5KPRA 1U2VB 4IJAA 4BRLA 2FLOA 1TUYA 2FSKA 3ZETA 1NGDA 3A8YA 1X3MA 4FOEA 3VF6A 4IZ9A 3R8EA 2WUSA 4RTFD 3VOVA 3AY9A 5BR9A 4K41A 3IFRA 1LOTB 1TUUA 5E26A 3M3ZA 3DXKA 1ZBSA 5FPNA 1DGKN 1NLVA 4EAHD 5AR0A 3I33A 4A61A 3VENA 1BG3A 3VEZA 4H5VA 3C0BA 1IJJA 4I6MA 2BUPA 4BQLA 1HPMA 2QWLA 5FPDA 2QW9A 4H0TB 5KPZA 5JLFA 2NRHA 4HTLA 5AQTA 4BGAA 5CE3A 4RCHA 2PBDA 4PKHA 3GE1A 4JHDB 3SLCA 3W0LA 2QWRA 5EX5A 4BGBA 2ASOA 4GY2B 3RSEA 4BRNA 4BRGA 3GDQA 5BN9A 4XEIA 2E2QA 3W3DA 2AA4A 4BC5A 3B8AX 1GLJO 4BRIA 4CZLA 3U8XA 1HJOA 5B8HA 4BRQA 2OANA 5FPMA 4B1UB 4MO4A 5ADXH 3FR0A 4CI6A 2ZF5O 4DCHA 2P9KA 5AQPA 3FZFA 1JCGA 2I7NA 5AQGA 3O5BA 3WEEA 5ADXA 4BG8A 2CH6A 1Z05A 2CGLA 2P9LB 2PAVA 4BRKA 1OKJA 3MMVA 4H0PA 3QB0A 5AQXA 3FZHA 2CGKA 1NGAA 2Q97A 4BG9A 4F9OA 2P9NA 3A0IX 1ZXOA 3AARA 3QICA 5BPLA 2CH5A 2FSNA 4WQ5A 3HM8A 2P9IB 1BA1A 1ATSA 1G99A 3KVGA 3LM2A 3O6WA 2Q1NA 3U9DA 2A3ZA 5AZIB 3A5OC 3VF4A 3KZBA 3H1QA 1KXPA 5JLHA 2E1YA 4FWRA 1T6DA 3U9ZA 1C0FA 5JMVA 2IVOA 3BF3A 2J4RA 3CJ1A 3CJAA 3JS6A 3FFKB 3M6GA 4QS8A 2QM1A 3LM9A 2A42A 5AQYA 5FPEA 4BR2A 1NGIA 3HI0A 1GLAG 4YDUA 1XUPO 3WUHA 3H45C 1NGFA 4M7XA 3IDHA 3ATUA 1ATNA 2FF3B 4IWVA 4B1VA 1NGJA 2E2NA 3QBWA 2A40A 2HF3A 1H1VA 3UKUA 2Q36A 4H5TA 1BOTO 1NGEA 4GNIA 3WXLA 1V4TA 4XH5A 5AFUA 1BO5O 3C7NA 3LDPA 3OHRA 4FWQA 3HSCA 4XH1A 1QQOA 1HLUA 3VGMA 4H5RA 4O5FA 4CZFA 4FWMA 2VYPA 5AQZA 4H0VB 3ZX0A 2A41A 1K8KA 3EO3A 3D2EB 4ISGA 4WQ4C 3VETA 4B1WB 2P9PA 3ZETB 1X9JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C0YA 4B1ZA 3PLAA 2G8IA 3WXIA 5DMRA 1TGOA 1OH5A 2ZWHA 3QIPA 3P31A 3F9MA 4O55A 1Q9YA 2FBVA 5AQOA 3RWUA 2VGMA 3KLIA 1CZAN 4PWDA 3O3GA 3HJFA 4B9QA 4I6MB 1T3VA 3JSMA 4FK0A 4JKCA 2E8AA 1BDGA 2OPQA 2Y1JA 1U47A 1HNVA 4YNQA 3NHGA 1GLLO 3V9SA 3LDQA 1I94K 1D8YA 3IAYA 3HTVA 3RSEB 4FLYA 4UQGA 4DU3A 2KZMA 4LC9B 3K59A 1R59O 1NGHA 5HOOA 2KFNA 3ID8A 1MWKA 3S41A 4EIAA 4FJHA 1L3VA 1QVGM 4JI4K 4L3QA 2P9UA 4WFNL 1NNEA 1U45A 3CCMN 1C1BA 1RBSA 3C6AA 1ASUA 3WEEB 3AVAA 3QESA 3K5LA 3QEPA 3MN6A 4KTQA 4IDKA 3ZSQA 4EP4A 1HQEA 5KRSA 1QZ6A 1NWKA 1SAZA 4Z4EA 4AHUA 3VEYA 2G8UA 4H5NA 5BREA 4A5BA 2O8CB 2OTJN 3ZSYA 3MDQA 4KH5A 4DR1K 2HVIA 4FZXC 2QWOA 3THYA 5JS1A 4B9UA 4CIEA 3C94A 4FJ9A 4FCYA 4IO8A 2FBYA 4Q5VA 4IOAL 4BACA 1KFSA 1VQLN 2QWNA 3VEXA 4BRFA 4JRQA 2BGGA 3MXMA 4DQSA 5LMNK 4E1JA 1EWRA 3H46O 4I9QA 3P5JA 4WYBA 4CF0A 2Y1IA 5CYQA 4Z94A 3NGZA 4E0DA 4J2BA 4DMNA 3O4WA 2HBJA 2HOEA 4BWJA 2KZZA 1VHXA 4V19S 3P39A 4JI7K 3C7NB 2D0OA 4IFVA 4EP5A 4CBUA 3AO1A 1RT1A 3JAMO 1WBBA 3PO5A 1T6CA 3Q7CA 1C0UA 3AA2A 2V52B 2YNFA 4M63C 4PL8A 3K57A 4N5SA 3V9WA 4B1XB 3TI0A 4JD2A 2O8EA 4CGIA 2P9PB 4CEBA 4CJKA 3VQBA 3H3OB 3CCSN 3V1QA 2YHAA 2KTQA 4IEEA 2HF4A 5TKYA 1GLCG 5C24A 4PL7A 4JN4A 3G10A 4CGJA 1D9FA 3TTCA 4OJRA 4NXMK 3QFUA 2PYJA 3R9PA 4FWSA 4RWTA 4DLGA 4JV5K 4O0IA 1IG8A 5DM7L 3OVNA 1EQYA 4DS5A 3I8DA 5EY4A 4CCHA 1YJWN 3VMFB 1E3MA 4FJIA 3CXCM 4Z0UA 4NCGA 4DTRA 4B9LA 2Q0UA 4AHRA 3ZEUB 4CEFA 3GOIA 4F4KA 1EX4A 1GOAA 1S9EA 3FZLA 1NK6A 4A2BA 1Z26A 2YKMA 3CI5A 4BRCA 4KHPK 1RDDA 4LY7A 1BI4B 2KW4A 1C1CA 3MEEA 3VQ9A 4CBXA 5M1QA 4CF2A 3NVKA 3CG7A 1GLBG 1YAGA 3TSUA 4M3TA 2HHUA 4GMJB 4NYFA 1NBWA 2OPRA 3NH0A 1X1PA 3SPZA 3ZT4A 4LH4A 4AF1A 4B8CA 2D0BA 2DFFA 3DXMB 1TK5A 1VQMN 1KLNA 4B9TA 1NK9A 1WN7A 3FGUA 4FJ5A 1T7PA 1W9HA 2QXLA 1WAFA 1P8ZA 3KIOA 4FJXA 2HBMA 1GLFO 4LFCK 1EWQA 2P9SB 2GEMA 3LWMA 3KK2A 4UY8O 3VPZA 4QS9A 2V7ZA 1BA0A 1RBTA 4X65K 2QA4N 4YOYA 3F9KA 3PSFA 2V7YA 2HHSA 3LL3A 1MU2A 4E1NA 1RTHA 2FBXA 1VQ7N 1C0MA 1VSEA 4CHYA 2ZGZA 3BZKA 4ZHRA 2Z1IA 5EOYA 4FM1A 4Q0BA 2ZJRL 3M1FA 5BPNA 3BP8A 2OZMA 3BZCA 4IBNA 1XC3A 3WNHA 3TAMA 3WXKA 3J80O 3T1YK 4DS4A 3ENOA 3QINA 3PIOL 5M1NA 1JCFA 4KAZA 2EX3A 4K42A 1RTIA 1A5VA 2YJFA 4I7FA 5CYMA 1D4XA 1NGCA 3CMEN 1ILYA 3LDNA 4J8FA 3SQ4A 4KREA 2ZE2A 4B8AB 3QBXA 3J8AA 1HKBA 1N33K 2E20A 4DUYK 1JXBA 2E5LK 3DLKA 1XMOK 4GKJK 3H3NO 1W0HA 4BRPA 1G15A 1U2VB 4IJAA 4BRLA 3LZIA 4X64K 4FOEA 4CFDA 5K14A 4CFAA 3LAMA 3VOVA 4K41A 3QO9A 3EZ5A 4JKFA 1BQNA 3M8SA 3CFPA 3DOLA 2C1IA 3CCQN 4A61A 2NRTA 4CK3A 2F96A 3AVMA 5M1KA 1HPMA 4WFAL 3CF5L 4IFYA 1CZBA 4HTLA 1YVUA 4YOTA 2PBDA 1Z25A 1UAXA 3GE1A 4JHDB 4F2RA 3W0LA 5EX5A 1QS4A 1NK4A 1JL2A 1NKCA 2X6NA 1WSHA 2AA4A 4BC5A 4DWIA 3DLGA 3RR7A 3OYLA 3QLHA 2YNIA 4BRQA 1TK8A 4B1UB 4MO4A 3C6HA 4ICLA 4CI6A 2ZF5O 4KI4A 4GVEA 1KD1O 1VAZA 3O5BA 1YTUA 1XNRK 5ADXA 4CEEA 3NF6A 2JLEA 4ILJA 4BRKA 3AA4A 3MMVA 3QB0A 1HQUA 3N4PA 4JS5A 3PO4A 2YX6A 1JXEA 3A0IX 1SV5A 4DF4A 3AARA 3IRXA 2FSNA 4DFPA 4WQ5A 1TKXA 3RVCA 1BA1A 1G99A 2Q3SA 3OBWA 3O6WA 1VSDA 4E7HA 2QEXN 4FJGA 3S5TA 3A5OC 3H1QA 3ZSZA 4FWRA 1T6DA 3U9ZA 1REVA 1C0FA 2HNDA 2X74A 3BF3A 3OW2M 4DV1K 4IG3A 1XI1A 1ZBIA 4OKEA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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