5JLFA

Structure of the f-actin-tropomyosin complex (reprocessed)
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
367
structure length
366
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Mus musculus
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 94
structure length 366
sequence length 367
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 5jlfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5jlfA04
1QQMA 5AQKA 3WEEA 2HMPA 4BQZA 1BO5O 4H0YB 4HWIA 4AM6A 5BPMA 1SZ2A 4BRMA 3I33A 1BOTO 3LM2A 4I6MB 2NLXA 2P9UA 5AQJA 2HF3A 2PAVA 3FZFA 4BR0A 5FPNA 3VEXA 4FWKA 1TUUA 3UKUB 3U9ZA 1JCEA 5F0XA 4BC3A 3CJCA 4BRFA 3CI5A 2Q97A 1QHAA 3MMVA 4B1ZA 1BA1A 4BRGA 2E1ZA 5AQIA 2P9NA 1GLJO 2HOEA 3VGKA 1QZ5A 2EWSA 2V7ZA 4HTLA 2ASOA 5LJWA 4K43A 3CJ7A 3IMXA 4IWVA 2P9PA 4BC4A 1NGGA 3VF6A 1WOQA 1GLLO 1MWMA 2A41A 4NO7A 2QW9A 3IDHA 1LOTB 1X9JA 3BF1A 3QFUA 1RGIA 1K8KA 3WUHA 4JAXA 4JHDA 4CBWA 1X3MA 3EZWA 4CI6A 4BVPA 4EHTA 3ZX0A 3CJAA 2UYTA 4BR5A 3LDOA 2YHYA 1U2VB 3CQYA 1YXQA 2FSNA 4BR4A 3I8BA 5TKYA 1NWKA 5AQPA 1QZ6A 4GNIA 5FPMA 4WQ4C 3SMPA 1NGFA 4BRNA 3AAPA 3LDLA 2YHWA 2FXUA 1NGIA 3UKRA 1BG3A 3VEWA 3BF3A 4O5FA 1Q18A 1NLVA 2D4WA 1MWKA 1C0GA 4A2AA 4BRPA 3VERA 3JXUA 4PKHA 5BRDA 4WQ4A 3O4WA 1JCGA 3F9MA 2VWBA 5AQLA 3L0QA 3WXLA 5AQUA 2QWMA 4BG8A 3BP8A 2QM1A 3VETA 2P9KB 5KPRA 1NGAA 4H5WA 1Z05A 3B8AX 3R6MA 5CE3A 1IG8A 3VEYA 2V7YA 4IJNA 1HPMA 2FLOA 3DXKB 4EIAA 5AQXA 3RSEA 5AFUH 4FWSA 1GLEG 5AQYA 1D4XA 3VOVA 3L6QA 5LY3A 3D2EA 3H1VX 3AAQA 3CETA 1P8ZA 3ULEB 4BR7A 4FSVA 4IZ9A 2IVPA 4DCHA 4Y0WA 2QWPA 5AZJA 3A0IX 5AQOA 3H3NO 3HBTA 2PBDA 2Q0RA 2Q1NA 3FZLA 1ATSA 1Y64A 3O6WA 1YUWA 1YVNA 4EAHD 3MN9A 3WQTA 3FZHA 2YJEA 3ZETB 2FSJA 3FLCO 4FPAA 5ELZA 4BR2A 3QBXA 3GDQA 4XH5A 3U8XA 4CZMA 4BRIA 4H5VA 2E20A 2A6AA 4FL9A 3EO3A 3O8MA 4BQLA 1MDUB 4MO4A 3VF2A 2GTDA 3UE5A 2CGJA 4F9OA 4A61A 5BREA 4JD2A 4C23A 3A5LC 5FPDA 2CH6A 3LDNA 3ZEUA 1NBWA 3H45C 4MO5A 4CZKA 4M7XA 4EFHA 3SK3A 2W40A 5BN8A 2BTFA 4BRCA 3M3ZA 5AQGA 5KQDA 3VGMA 4BRDA 3O5BA 3WEEB 4CZEA 4DHYA 3C0BA 3H1QA 2D0OA 4IXCA 3C7NA 4H0PA 1DEJA 2YJFA 3ENOA 3QDKA 2FF6A 4I6MA 1U6ZA 2I7NA 5EX5A 5AQSA 2WUSA 4CD3A 1BU6O 5AQHA 3R8EA 2QXLA 1CZAN 3ZX3A 3MN6A 2P9SA 5BRHA 5BN9A 3GL1A 3VEOA 4QS7A 3W0LA 1MA9B 1XC3A 2P9NB 5EY4A 1NGJA 4FWPA 2E8AA 4M63C 3VESA 5AZIA 3GOIA 2P9PB 3ID8A 4PL8A 4CZHA 2A5XA 4NB4A 1GLDG 4B1XB 1J6ZA 4FWNA 4BRKA 5AQZA 1K8KB 5EOYA 1HX1A 3D2FA 1TUYA 4JHDB 1NGBA 2YHXA 3DXMA 3CIPA 3O1WA 4ISGA 3MN5A 5AQVA 3GBTA 3JS6A 1HUXA 4K42A 2ITMA 3CHWA 5ADXH 2ZWHA 3HTVA 1HLUA 3CJBA 3LDPA 4FPBA 4QS9A 4H5NA 4O8KA 3ENHA 1T6DA 3U4LA 4BR9A 3KVGA 4RTFD 3UKRB 4MLHA 2ASMA 4B9QA 4IJAA 3O08A 4FWQA 1TYQA 1ESVA 5BPLA 3FZKA 3D7EO 4PL7A 3VENA 2GEMA 1ZC6A 3H46O 3FFKB 3CJ1A 2BUPA 1BA0A 2Q0UA 2AP1A 4B1UB 1GLCG 1KAXA 4H0OA 3J8AA 1WUAA 2VCPA 2P9KA 2A3ZA 4FO0A 3SLCA 5BPNA 1G99A 3A8YA 2P9LA 4MLEA 4BRQA 1NGHA 2E2QA 4RCHA 1XUPO 4CZJA 2F9TA 3RSEB 2D1KA 4B1VA 2ZGYA 4BVOA 4H03B 1H1VA 5JMVA 2Q36A 2V51B 3AY9A 4FWOA 5F1XA 2YI1A 3GG4A 4FWRA 5AQRA 5AQWA 4FOEA 2IIRA 3EKSA 4FWLA 5BR9A 2W41A 1X3NA 1ZXOA 3QFPA 5AZJB 2GELA 3WT0A 3EKUA 3CJ9A 3ULEA 1S22A 4B1WB 4BGBA 2ZF5O 4BG9A 3IFRA 1JCFA 2OANA 1HJOA 3OHRA 4M7YA 3DWLA 2E1YA 3FGUA 5BRFA 4PKGA 1KAYA 3KHYA 2QWLA 1GLBG 4CZFA 3R9PA 3SMSA 4BC5A 3ATVA 4H0VB 4BRLA 2DPNA 2Q31A 5KPTA 3VPZA 5F2RA 3A5OC 2E2NA 3A5NC 1OKJA 3MCPA 1E4FT 4EHUA 4IO8A 4JD2B 3TU5A 4XH4A 3O1BA 3S41A 1RFQA 4RWTA 3A5MC 4YDUC 4AM7A 4CBUA 2YCHA 4WQ5C 5E84A 4CBXA 2P9IA 2QWQA 1DGKN 4FOIA 4BGAA 1NM1A 3VEVA 1NMDA 2P9UB 2KHOA 4CD1A 1HKGA 1HKBA 4DQ8A 3FZMA 2CGLA 2CH5A 1KXPA 3C7NB 4A2BA 4BROA 4YDUA 4BREA 2GWJA 1HKCA 4WQ5A 3M1FA 3LDQA 1NGDA 3UKUA 4Z94A 5LJVA 4XH1A 1YAGA 4K25A 2V52B 2NRHA 5JICA 5JLFA 1V4SA 4L3QA 1QQNA 2IVNA 4WYBA 2I7PA 3QB0A 1Z6RA 2P9SB 4CZGA 3DJCA 1GLFO 4BRAA 3WXKA 3ZX2A 3QICA 4DB3A 1SQKA 4QS8A 1SAZA 2D0PA 1KAZA 2IVOA 4LC9B 4CJ7A 3CERA 5AZIB 5B8HA 4H5TA 1ATNA 4ISFA 2FSKA 4GY2B 4H0TB 3EL2A 3VF4A 3DAWA 3WXJA 2A40A 4E1JA 2E88A 4BRHA 3GE1A 5EXWA 3D2FB 4ISEA 3VGLA 1U2VA 3DXMB 5ADXA 5KQ8A 4XEIA 1ZBSA 5AQMA 2CGKA 1BUPA 1NGCA 3HI0A 3MDQA 1XQSC 4K41A 5I9EB 2ZGZA 3ATUA 1ATRA 2GUPA 2HF4A 1EQYA 2QWOA 5FPEA 4H5RA 2QWNA 2A42A 1T6CA 4H0XB 1TYQB 4CZIA 3HM8A 3KZBA 1R59O 3WQUA 3MN7A 5AQNA 5E26A 3H6EA 1RDWX 1LCUA 2QWRA 5KPZA 3FR0A 3H3OB 4J8FA 1E4GT 1S3XA 2NZTA 5EVZA 5AFUA 3MK6A 4BC2A 3W3DA 2Q2RA 3AARA 3SJHA 3HSCA 3U9DA 2FF3B 2H3GX 4KBOA 3DXKA 2GWKA 2P9LB 4FWMA 4JNEA 5AQQA 5AQFA 5JLHA 2AA4A 3D2EB 3QBWA 4JN4A 3IUCA 1DKGD 1QQOA 3G25A 1NGEA 3EN9A 3M6GA 3VEZA 3ZETA 4CZLA 5AR0A 3P4IA 3QMLA 4B1YB 4PKIA 1T44A 3BEXA 3CQXA 3HZ6A 3LL3A 1GLAG 1BDGA 1C0FA 2F9WA 1BWFO 3UB5A 3WXIA 3ZEUB 3L4IA 5AQTA 2J4RA 3O80A 2E2PA 3FE1A 3TPQA 3BUZB 1V4TA 3LM9A 1IJJA 2ASPA 2E2OA 4A62A 2P9IB 2VYPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ELVA 3ZSYA 4BRMA 3KJVA 3RMBA 3DRSA 3K5NA 3K57A 2DTUA 2PAVA 2VWKA 2HB5A 3VEXA 3J81O 1U45A 3CJCA 2JWLA 1NK7A 4DMNA 2OZSA 2E1ZA 2A1SA 3U3GA 4NLCA 1J53A 3KWIA 2P9NA 4PUOA 3VGKA 4J2EA 3LDSA 2EWSA 2O8CB 2P9PA 4CEDA 4CEZA 1WOQA 1GLLO 4NO7A 4FVMA 4WCEL 3IDHA 3V1OA 3QFUA 3MXMA 2D5RA 3WUHA 3WXMB 2BGGA 4RW6A 4FM1A 4CI6A 4EHTA 4BECA 3CJAA 3LZIA 1ZBHA 2UYTA 2YHYA 1U2VB 2JGUA 4BR4A 4KHWA 4FVUA 5TKYA 4BY9C 4HUEA 4WFBL 1SL2A 1WBBA 1QZ6A 3G0ZA 4FZZA 1QQCA 3LDLA 2YHWA 1NGIA 3UKRA 4DQPA 3PV8A 3VEWA 1Q18A 4I2QA 1MWKA 1S72N 4E89A 4CK1A 1XNQK 2DY4A 3MWPA 3O4WA 3SBTA 1JCGA 4RW4A 2EX3A 5AQUA 4BDPA 4BG8A 1IKYA 3BP8A 2QM1A 5C25A 5KPRA 3KK1A 3NE6A 3R6MA 3F5TA 5CE3A 1WSJA 4CHPA 4IBNA 3SZ2A 2VG7A 3L6QA 1NJWA 1EWQA 1JJ2M 3D2EA 3CETA 1WSFA 3AO1A 3DLEA 4IZ9A 2IVPA 3T1HK 4Y0WA 5AZJA 5C10A 1U48A 2FBTA 4JI3K 2PBDA 2Q0RA 3O6WA 1YUWA 1BIUA 3TTDA 5KRSA 4DSIA 3LPUA 4EAHD 3ZSVA 4LFBK 2O8EB 4QCLA 1KVBA 3L2QA 1IH7A 2P51A 3GDQA 3TTCA 4CZMA 4G1QA 3T69A 3J7ZO 1S6PA 4H5VA 2ZM6K 4L8RB 2HHSA 4CF2A 3EO3A 2E6MA 3C6UA 3VF2A 2CGJA 5HROA 4CEOA 4CK2A 2O4IA 4OGCA 3ZEUA 4CEQA 4NCGA 4OVLA 3SK3A 3K0SA 2P5GA 4FLTA 5DM7L 3CCRN 5KQDA 3DOKA 3O5BA 3WEEB 4DHYA 4JKEA 3C0BA 4DR1K 3O9UA 4JI0K 3C7NA 3E01A 5EU7A 2O8BA 4HHTA 1NK4A 4FJGA 2YJFA 3AVLA 3QDKA 4MDAA 3BGRA 4ID5A 4I6MA 1U6ZA 2XO7A 1HNXK 4DTUA 3LALA 5HRRA 3KWGA 4BDZA 3ZX3A 4B3RK 4WF9L 3V9XA 1VQ8N 5CYQA 1HMVA 4LF7K 3VESA 4CHNA 4CZHA 2A5XA 4NB4A 3T7ZA 3AA5X 1N36K 1NJIO 1RBTA 1HYVA 3D2FA 1KD1O 2X74A 3ZCMA 2YHXA 1BL3A 4B9VA 3S3NA 4ISGA 5J2QA 4E19A 4YY3K 3JS6A 1HUXA 1J54A 3DLGA 5IT9O 2C1IA 4OLBA 1HLUA 4CF0A 4O8KA 4HCBA 1CZ9A 4O8UA 2B4JA 1BCMA 4B9QA 4IJAA 2NRVA 1UAXA 4FJJA 3O08A 3ZT1A 4FWQA 3HK2A 5BPLA 1WB9A 4EP5A 4KFBA 2GEMA 3DM2A 1ZC6A 4CECA 1X9SA 3CJ1A 2BUPA 4AHUA 1FW6A 4B1UB 1HJRA 1KLMA 4DWIA 1GLCG 2QI2A 1L3SA 1WUAA 1M90O 2VCPA 1TKTA 2W00A 4ICLA 3SQ0A 4CJ5A 3CF5L 4DV6K 3ZSRA 4DQSA 1JL1A 4BVOA 3CM6A 4H03B 4X65K 4B08A 3AY9A 1NJZA 4FWOA 3DLRA 5AQRA 4CJKA 3EKSA 4FWLA 4FLZA 3THXA 3O4QA 3SUNA 1ZXOA 1NKBA 2ZF5O 3IFRA 1JCFA 3MEEA 3QINA 4FZYA 1HJOA 2Z1IA 4M7YA 3OYCA 3IG1A 3FGUA 2HBJA 4CJTA 2UXCK 3SMSA 4PA1A 3Q7BA 3ATVA 4OO1J 3CYMA 4H0VB 3SQ4A 2O8DA 2OZMA 1RNHA 1RT3A 1C0TA 2UUAK 2QKKA 4BE0A 3MCPA 3D0PA 4EHUA 4CJEA 4RWTA 2OTJN 4JKGB 3M8PA 2RN2A 4LH5A 5E84A 2YNGA 3WNFA 2A1RA 1T7PA 1NMDA 1VAZA 1TGOA 4K8XA 1S9EA 2ITGA 4OPKA 4ZHRA 1KXPA 3T3FA 3AA3A 1YHQN 3THVA 3OS2A 3RR7A 3AVAA 1VQ6N 5LJVA 4AILC 5J1EA 4K25A 3S9HA 4JKDA 1YVUA 4NXNK 1V4SA 4RW8A 4UQGA 4JLHA 3QB0A 1Z6RA 4U67L 2P9SB 3THYA 4DFMA 2FC0A 4M41A 4LF8K 3NCIA 3V9SA 2IVOA 3AVFA 5B8HA 1O13A 1ATNA 4F8RA 2WBNA 4JI5K 3DAWA 3TAFA 1S1UA 2OCEA 3VTIA 1IKWA 2HNDA 4K0KK 5FRMA 1I3AA 4ISEA 4FJ7A 4DF8A 1WAFA 3MEDA 4CE9A 4C8NA 4NYFA 4B9UA 1X9MA 3HI0A 5HP1A 1L3UA 3O9QA 3CFRA 1KC8O 1TKXA 2F7TA 1XQSC 3H08A 1QSYA 3C94A 2ZGZA 4CFAA 3ATUA 3KLIA 4DR2K 2O8FA 1NU0A 4B9TA 2QWNA 3V4IA 4H0XB 1TYQB 3HM8A 1WAJA 4IO9L 4E7JA 3WQUA 1VSHA 2YV0X 3MN7A 1RDWX 3N4PA 4RW9A 2O4GA 3H3OB 1JLBA 5EVZA 3MK6A 4BC2A 3F73A 1K8AO 5J2PA 2BDPA 2Q2RA 4AHVA 3HSCA 3HP6A 1KVCA 2FF3B 4O0IA 4KBOA 1QVGM 4C8LA 3VQ6A 4JNEA 3ULDA 4M3WA 3QBWA 3WNEA 3IUCA 2G8VA 4B3TK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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