5JLFA

Structure of the f-actin-tropomyosin complex (reprocessed)
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
367
structure length
366
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Contractile protein
total genus 94
structure length 366
sequence length 367
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 5jlfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5jlfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5jlfA04
2IVPA 1GLLO 2WUSA 2V52B 4FWMA 5LY3A 3FZLA 3FGUA 1H1VA 2ZGYA 4XH1A 3L6QA 5AQHA 3QFPA 2QWRA 2Q1NA 3GG4A 4BREA 1LCUA 1QQOA 3IMXA 1EQYA 4B1XB 3FZFA 3MMVA 3HM8A 1SQKA 3KVGA 4BC2A 4XH5A 5AQQA 2QWNA 3ZEUB 5LJVA 2QM1A 1K8KB 3CQYA 4FPAA 2FSNA 5BR9A 4BRMA 4DHYA 3CJ9A 1G99A 4WQ4C 5AQGA 2F9TA 1NBWA 2A6AA 1GLDG 2Q2RA 2H3GX 5E26A 4FWLA 3C7NA 1D4XA 2Q31A 1P8ZA 3VETA 5BPMA 4I6MA 2A40A 3O80A 1NLVA 1NMDA 5E84A 2EWSA 3IFRA 5AZJB 4AM7A 1TYQB 2D0PA 3UB5A 3SMPA 1MDUB 3MN6A 4BC3A 5KQDA 3R8EA 4H5NA 1BOTO 4MLEA 4AM6A 2E2NA 4BVPA 1BWFO 4BRFA 1TUYA 3D2EA 4H5VA 1T44A 4HWIA 2E20A 3ENHA 4A2BA 3SMSA 3HTVA 1GLFO 4O5FA 2NRHA 2CGLA 2E1ZA 3ULEA 3CJ7A 3GDQA 1J6ZA 2D0OA 4BRGA 4CZLA 1NWKA 3UKRA 4PKHA 2GEMA 1C0GA 3UKUA 1S3XA 4K43A 3CHWA 3FZHA 1IJJA 1YAGA 2E2OA 4BRKA 3O8MA 2Q0RA 5EOYA 4CBUA 2ITMA 3H6EA 4BVOA 5KPRA 3WXKA 3C7NB 3HI0A 4LC9B 1NGBA 4I6MB 3J8AA 1HJOA 4CZJA 4M7YA 2D4WA 2ZWHA 5ELZA 4FWOA 5KPTA 5F2RA 2DPNA 4J8FA 2PAVA 4K41A 2P9UA 4EFHA 2V7ZA 1GLJO 4M63C 3H1VX 1HKCA 3I33A 3O1BA 3WXIA 4EHUA 3GL1A 3UE5A 2Q97A 5AQFA 1KAXA 5BREA 3D2EB 1KAYA 3W0LA 2A5XA 3BUZB 4F9OA 3CJ1A 1NGEA 4GY2B 5AQJA 2I7PA 2GTDA 2P9SA 1HKGA 3GOIA 1ZXOA 2HOEA 1HUXA 1YVNA 5FPMA 3LM9A 3ULEB 4BGBA 4JN4A 3EKUA 3VEOA 4A62A 3U9ZA 3UKRB 3D7EO 1NGJA 2FF6A 3EO3A 4QS8A 1DKGD 3UKUB 2QWMA 5AQMA 3W3DA 3FR0A 3FE1A 2ASMA 2CGJA 1Z6RA 4E1JA 2BUPA 1DEJA 1HKBA 1YXQA 3GE1A 5AQNA 2VCPA 4BR9A 1ATNA 2P9IA 4B1UB 3ID8A 4H0XB 2AA4A 2QWPA 4JD2B 2P9PA 3A8YA 4H5RA 3RSEA 3SJHA 3DXKA 3VERA 4FWKA 4PKGA 2ZF5O 4CBWA 3CJAA 4DQ8A 4B1WB 5KQ8A 1NGCA 1CZAN 4A61A 3KHYA 4JAXA 1BU6O 3D2FA 4QS9A 4CZMA 1S22A 2E1YA 3VF6A 4B1VA 2YCHA 4H5WA 5FPEA 2P9SB 4CZFA 2IIRA 3AY9A 3U8XA 4BQZA 1T6CA 1ZC6A 5F0XA 3MK6A 5AQZA 3VEXA 2HMPA 2GWJA 5FPDA 2YJFA 3DAWA 4FL9A 5AQPA 4BR0A 4ISFA 5AQTA 1NGIA 3H1QA 2Q0UA 5EX5A 3LDOA 4BROA 4FOEA 4CD3A 2AP1A 3WEEB 4CJ7A 4K42A 3A5NC 3WXLA 5EVZA 3LDQA 4CI6A 1MWKA 1IG8A 2V7YA 1BA0A 3VESA 2GUPA 3DJCA 3QBWA 3VF4A 3A5LC 5AFUA 5JLHA 3VENA 2W40A 2VWBA 4BG8A 3LL3A 3M3ZA 2D1KA 4CZGA 1JCGA 5BRDA 2I7NA 4Z94A 1ATRA 3AAQA 1NM1A 3EN9A 3AAPA 3EZWA 1QZ5A 5BRHA 1JCEA 3O08A 3ENOA 5FPNA 3WQTA 3KZBA 1YUWA 3CJBA 2GELA 3QBXA 4JHDA 4ISEA 4M7XA 3VEWA 4C23A 4H0PA 4BR4A 3HSCA 1T6DA 1NGFA 2BTFA 3HBTA 1ATSA 4CBXA 5TKYA 4H0YB 3LDLA 5ADXA 4FWPA 4DCHA 3F9MA 4EAHD 3FZKA 1BO5O 4BQLA 3IUCA 4L3QA 1BUPA 3DXMA 1U2VA 3GBTA 4BRLA 2YI1A 3B8AX 1HPMA 3DWLA 1KAZA 1E4GT 2ASPA 2FF3B 2YHYA 1XUPO 2V51B 1R59O 4NO7A 1U6ZA 3WXJA 1GLEG 4IXCA 2A41A 1QQNA 4BR7A 3LDNA 3CETA 5AQOA 3ZX3A 3WQUA 2KHOA 2CGKA 2QWLA 4H5TA 3VGMA 3ZETA 2F9WA 5I9EB 4FSVA 3MN5A 5AQUA 5BPLA 4ISGA 4RWTA 3I8BA 4FPBA 1NGDA 3BP8A 2UYTA 3M6GA 3S41A 3JS6A 4JHDB 5KPZA 2IVOA 2FSKA 2P9KA 5AZJA 3QDKA 4XH4A 4Y0WA 1Y64A 2J4RA 1NGHA 4FOIA 3A5OC 5JICA 4H0TB 1X9JA 2E2QA 1XQSC 2P9UB 1U2VB 1ZBSA 1XC3A 3OHRA 4B1ZA 5BRFA 4MO4A 1BA1A 3ZX2A 3CQXA 2FSJA 4HTLA 3VOVA 3P4IA 4PL7A 4CZEA 5LJWA 2YHXA 2CH6A 4GNIA 2QW9A 4IJNA 3VEVA 3O1WA 3A0IX 4O8KA 4YDUA 1GLAG 3H3NO 4K25A 5AQVA 4FWNA 4MO5A 4KBOA 2ASOA 1MWMA 3R6MA 3CERA 5AQRA 3ZETB 2P9LA 3VF2A 4WQ5A 3U4LA 4A2AA 5AQIA 4FWRA 4FWSA 4NB4A 3O6WA 3VGLA 4BRPA 3CI5A 1Z05A 3QICA 2W41A 2ZGZA 5AQLA 4WYBA 3VEYA 1OKJA 4QS7A 2YHWA 4BRCA 3JXUA 4EIAA 3G25A 3EL2A 3L4IA 2VYPA 2A42A 4BRIA 2P9IB 2P9KB 2OANA 3EKSA 4RTFD 3SLCA 3FFKB 2P9PB 2HF4A 1WOQA 3RSEB 3C0BA 1JCFA 1KXPA 3H46O 3DXKB 3U9DA 3ATVA 3WT0A 5EY4A 2NLXA 2Q36A 4BGAA 4DB3A 4BRQA 3ATUA 3FZMA 5AZIA 2PBDA 1V4TA 4FWQA 3R9PA 4CZKA 5AFUH 1E4FT 3IDHA 4CZHA 1QHAA 3MCPA 1RGIA 3D2FB 4IWVA 4EHTA 3MN7A 4H03B 3MDQA 2IVNA 5JLFA 3VGKA 5B8HA 2HF3A 4BRHA 2CH5A 3H45C 4H0VB 4BC4A 4YDUC 5AQSA 1X3MA 2P9NA 4CD1A 4RCHA 4B1YB 3O4WA 3BEXA 4MLHA 2P9LB 4IZ9A 1DGKN 1ESVA 3AARA 4BRDA 3CJCA 5ADXH 3FLCO 3TU5A 1Q18A 1NGAA 3BF3A 3LM2A 4WQ5C 3TPQA 4BC5A 1HLUA 5AQKA 3QMLA 2FXUA 3QB0A 4BRNA 1MA9B 2QWOA 1TUUA 4JD2A 3VEZA 1SZ2A 3O5BA 2NZTA 2A3ZA 4XEIA 3SK3A 1V4SA 5BN8A 1BDGA 2QXLA 2GWKA 3H3OB 1QQMA 4IJAA 2YJEA 4BR5A 4JNEA 4WQ4A 3ZEUA 3MN9A 4PL8A 3QFUA 1K8KA 1RDWX 1X3NA 5BN9A 1LOTB 4CZIA 3A5MC 5AZIB 3WUHA 1GLCG 5AQWA 1HX1A 3ZX0A 2FLOA 4H0OA 4IO8A 5BPNA 3HZ6A 5AQXA 3L0QA 1NGGA 4BG9A 1SAZA 5JMVA 1BG3A 5EXWA 4BR2A 2P9NB 2QWQA 1TYQA 4FO0A 1C0FA 1GLBG 2E88A 4PKIA 3CIPA 1RFQA 2E2PA 2E8AA 5AQYA 3VPZA 1WUAA 3DXMB 5CE3A 5AR0A 4BRAA 3LDPA 1QZ6A 3BF1A 3M1FA 3WEEA 5F1XA 4B9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U67L 2WUSA 4FWMA 3FGUA 4BREA 1J9AA 3OS0A 1EQYA 1VRUA 3OW2M 4CEQA 4XH5A 1K9MO 1S9GA 1WLJA 1YT3A 2YNGA 1OH8A 2BGGA 4Z4EA 2QM1A 4LF8K 2O8FA 1JXEA 2W6LA 3CJ9A 1G99A 4WQ4C 2F9TA 1NBWA 2A6AA 5E26A 2RF2A 4FWLA 4KTWA 3NH2A 4QAGA 3VETA 4I6MA 2A40A 3O80A 3QETA 1FKPA 5HOOA 1W2BM 3C94A 2D0PA 3AV9A 3U6FA 4BC3A 2NUBA 4FW1A 4I9QA 1RILA 1NK4A 4BVPA 4JKGA 2IDOA 3NCIA 1BWFO 4KHQA 4RW6A 2HNYA 1N5YA 1S9EA 4KHNA 4YNQA 1NOZA 4HWIA 3MAQA 4FJKA 3LZIA 4K8ZA 3HTVA 1U45A 1GLFO 2NRHA 4JKEA 4CJVA 4CJPA 4FJXA 3CJ7A 4XIUA 1X9SA 4BRGA 1NWKA 3OYEA 3E9LA 3CHWA 1TKDA 3QEXA 1IJJA 1YAGA 4DUZK 1ZYQA 2E2OA 2ZE2A 3AVJA 4N47A 3O8MA 5EOYA 4CBUA 3H6EA 3WNEA 4BVOA 3AVHA 3QINA 1FJGK 1HNZK 3NF9A 2HVHA 2KKZA 1ZBFA 2FBXA 1J5EK 4M7YA 2F7TA 3SJJA 5KPTA 3H08A 2P9UA 1KSPA 4CFBA 5FLXO 2UXBK 4Z4HA 1TVRA 1YIJN 1NU0A 4IFEA 3HO1A 3GL1A 3RVCA 3UE5A 2Q97A 5IT9O 3D2EB 4IKFA 2A5XA 3CJ1A 1NGEA 3OYJA 3KK3A 4FLUA 4M3YA 4ELVA 1HUXA 4CHYA 2A1SA 3LM9A 4JN4A 2F8SA 3VEOA 1SV5A 3ZSXA 3U9ZA 2VGMA 3D7EO 4CF0A 3UKUB 5AQMA 2DFFA 1VQLN 4O5BA 2ASMA 2CGJA 4X65K 3CC7N 4DSLA 3RRHA 2BUPA 3LPTA 4J2BA 1YXQA 1HKBA 5C12A 5JVHL 4W5RA 2VCPA 4B1UB 4GVEA 1WB9A 4MQ3A 2QWPA 4FJGA 1M1KO 2XRIA 3ULDA 4B9MA 2QA4N 3WNFA 4IDHA 4LFBK 1RBRA 2HMIA 1VSFA 5GADP 4DR1K 3THYB 4JAXA 4NCGA 3CF5L 3NFAA 4BACA 3UIQA 1IBKK 4C8OA 2YCHA 4A59A 4JI7K 3NBPA 5CHIA 1S1XA 2X78A 3OBWA 3U8XA 4AILC 4OX9K 1WN7A 2ATQA 5FPDA 3DAWA 4ID5A 4KH5A 4BR0A 4WCEL 3HP9A 1VHXA 3RR7A 4OKKA 1B9FA 1OVYA 3U3YA 2O8EB 3WEEB 5GIPA 5M1KA 4O4GA 3EYZA 1CZBA 3TTCA 1IG8A 3QEWA 2V7YA 3NVMA 3KWIA 3NHGA 3HYFA 3S3MA 4OGEA 4DKWA 2QXFA 3I0RA 3NGZA 2PYLA 3CC2N 3VTIA 3K2PA 2HHTA 3VENA 3CM5A 3LL3A 4BG8A 3EE9A 2O8BB 1RDDA 2G8FA 4A57A 1NKEA 3HOSA 3EN9A 5JVGL 1QZ5A 1RBVA 1JCEA 2Z1HA 3O08A 3ENOA 3KZBA 4HUGA 3SQ0A 5LMNK 3OYGA 4BR4A 1T6DA 2KTQA 3O3FA 3LDLA 5ADXA 3K5MA 4FWPA 3VQAA 3NF7A 4EAHD 3VQPA 3FZKA 1BO5O 5J1EA 3IUCA 3V6DA 1HNVA 3VA3A 2BDPA 4CVNE 4OKJA 1KTQA 2YX6A 1TGOA 1YI2N 1R59O 4EZ9A 4X66K 1U6ZA 3NF8A 4Z4CA 3V1RA 4ILGB 4BR7A 5AQOA 2HW3A 3SV4A 3ZX3A 3V9UA 4CK2A 4E7LA 3DOLA 4FSVA 4M3ZA 3NDKA 4KH4A 1RNHA 1TKTA 3K5LA 4DSKA 3KWGA 3K59A 4FJIA 3CYMA 3L4QA 2B4JA 4FLXA 2ETJA 1T03A 4FM1A 4CK3A 2RPIA 4PUOA 4RG8A 3QDKA 4Y0WA 4MFBA 3OA9A 1NGHA 4CJSA 4CHNA 5JICA 4WFNL 4H0TB 3JSMA 3TANA 1L3SA 2ZJPL 1RT4A 4DTMA 4HTLA 3QIOA 4GV9A 4QOZB 3P4IA 5KRSA 5LJWA 3DLBA 4J2AA 2CH6A 5KGWA 3A0IX 3TSPA 1JLFA 4O0JA 1GOAA 4YDUA 4CJEA 4DMNA 4OJRA 3HJFA 4FWNA 4MO5A 4OPHA 1EX4A 3CERA 4C8MA 2P9LA 3VF2A 4IG0A 2XY5A 2X6NA 4A2AA 1X9WA 3O6WA 3QICA 2W41A 3ZT2A 1QSYA 1OKJA 1RBSA 1BI4B 1R0AA 3G10A 3O9SA 4FLYA 1ILYA 3AVIA 3VQQA 4I2QA 1RT7A 5HRSA 1NKCA 3NH0A 3VQ5A 3SNNA 3SLCA 2HF4A 3E66A 3RSEB 5M1NA 1TAQA 2GX9A 5E41A 3PLAA 4FYDA 5MLCQ 1W7AA 4KHYA 2GBZA 1L3TA 4BGAA 4OKEA 5KI6A 1BIUA 1CZ9A 1TK0A 5AFUH 4HVJA 1QHAA 1U48A 3AA4A 3KD1E 4EHTA 1UA1A 4BRHA 3KLFA 4H0VB 3HRGA 4BC4A 4N76A 4YDUC 5AQSA 3OYCA 4JS5A 2O8CB 3ZSQA 3O9RA 1JLBA 3BEXA 5HROA 1DGKN 2HSTA 2VQEK 5FRNA 4AH9A 3LDSA 3TU5A 4RW4A 3VQCA 1NGAA 3LM2A 3ZT1A 4CIGA 3QB0A 4EP5A 4FZXC 1D5AA 3SAHA 3VEZA 3O5BA 2UUCK 1EWQA 4E72A 4XEIA 1NG9A 1V4SA 4M41A 5BN8A 1BDGA 3MX2A 1RBTA 3ZEUA 3MN9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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