3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
1SQKA 4XH4A 1V4SA 4K42A 4O8KA 1E4FT 3VF2A 3MCPA 2FSKA 4JNEA 2QWOA 4C23A 2DPNA 3AY9A 1JCFA 3CJCA 5JLHA 3GBTA 3G25A 2GWJA 2Q97A 3QMLA 4BR2A 1Z05A 3O08A 5AQSA 4E1JA 3WUHA 1D4XA 2V7YA 2QW9A 5JICA 2P9SB 2Q2RA 3IMXA 1IJJA 3I33A 3A5OC 2A3ZA 3VEOA 3QFUA 1IG8A 1Z6RA 2E2OA 3L6QA 4XH5A 3QBXA 4FPBA 4ISGA 2E2QA 1S22A 1BDGA 3D2EB 2P9KB 4B1VA 3U8XA 3EKUA 5AFUA 2CGKA 5BN9A 3CERA 1HX1A 2E2PA 4B1XB 3MK6A 2GTDA 4BC4A 1QQMA 2GWKA 1GLLO 3M1FA 2GELA 4LC9B 5AQZA 1HKCA 4CD1A 2H3GX 4NB4A 4PL8A 5EOYA 5AQRA 4IO8A 4GNIA 3FZLA 2BTFA 3U9ZA 1KXPA 1S3XA 2YHXA 4CI6A 2I7PA 2E88A 1X3NA 4PKIA 1X3MA 3BF3A 3LM2A 2WUSA 2VCPA 4HTLA 2YJFA 1BWFO 2FF3B 3SMPA 3CJ7A 4PL7A 2D0OA 1BUPA 4H0YB 4BR4A 3IUCA 2V51B 1HPMA 2NRHA 4ISFA 1KAXA 4BQZA 3B8AX 3M3ZA 3UB5A 4BRGA 4BRCA 3LM9A 4A2AA 1V4TA 5LJWA 1TYQB 3FZKA 3ZEUA 1GLEG 5AFUH 4AM6A 3U4LA 4CZIA 1TYQA 2E1YA 4JHDB 5AR0A 1KAYA 5BRDA 3CJ9A 3L4IA 2NZTA 4BRLA 2QWLA 3CIPA 4BRIA 4CZEA 3QB0A 3LL3A 2QWQA 1NGEA 5AQIA 5KPTA 1HUXA 3CQYA 1BO5O 3HTVA 3D2FA 4BRHA 2QWNA 2I7NA 3LDOA 3QFPA 3S41A 3CJBA 3JXUA 4H5NA 1J6ZA 1NGAA 3A5MC 1NMDA 3CQXA 3EKSA 2FF6A 4FO0A 4DB3A 3A0IX 3UKRA 4BG9A 3LDLA 2KHOA 3AAPA 3HZ6A 3EL2A 3WEEA 2Q0RA 5AZIB 1NGFA 3KZBA 4BRMA 2P9UA 1SAZA 2GEMA 3H3OB 4EAHD 3UE5A 2F9TA 1DEJA 4CZFA 1QHAA 4JAXA 4QS7A 1NGHA 2V52B 5AQOA 4JD2A 3ZEUB 2P9UB 3MN9A 3VENA 1ATRA 3BEXA 3DJCA 3R9PA 5EVZA 4BGAA 3LDPA 1RDWX 1JCEA 2V7ZA 3VGKA 3VETA 4FWMA 4CZHA 4I6MA 4ISEA 3GE1A 1TUUA 3O1BA 1YXQA 5BRHA 5EXWA 4QS8A 3M6GA 3CJ1A 2P9PB 1GLFO 4I6MB 4CZMA 2W40A 5KQDA 3HSCA 1BA0A 3MDQA 1LOTB 3BUZB 1DGKN 3VEVA 4YDUC 2QWPA 2PBDA 3FZFA 4FPAA 3QICA 2CGJA 4A61A 4BR7A 2HMPA 4B9QA 3D2FB 5JLFA 3J8AA 4CBXA 2ZF5O 3CI5A 4MLEA 5EX5A 2E1ZA 1NGIA 2A42A 4Y0WA 4GY2B 1BG3A 3HM8A 3ID8A 2HF3A 3MMVA 4BR9A 4CZJA 1XUPO 2J4RA 4B1UB 4FWKA 5AQNA 5AQPA 5JMVA 3D2EA 3SK3A 1X9JA 1QQOA 2E8AA 3IDHA 4FSVA 4WYBA 5AQJA 3R6MA 5LY3A 5AQHA 3H6EA 3OHRA 4BROA 1Y64A 3GOIA 1BOTO 5AZIA 2QXLA 3VERA 5AQWA 5AZJA 1Q18A 3ZX0A 4CBUA 3EZWA 5F0XA 2IVOA 3I8BA 4DCHA 4CZGA 4BVPA 1NGDA 3FZMA 3ZETB 1QZ6A 3ULEA 4H0XB 3WXKA 4H0PA 3CJAA 1XQSC 1C0GA 1R59O 2AP1A 5BR9A 2P9LA 4H03B 3RSEB 1ATSA 4FWPA 3C7NB 4H0OA 1P8ZA 4BC5A 3VEYA 4BR5A 4EFHA 4JD2B 1GLBG 4BRAA 5KPRA 2EWSA 2A41A 2Q1NA 1WUAA 5LJVA 3VGMA 3SJHA 2P9IA 4DQ8A 2BUPA 2YCHA 1NWKA 3H3NO 4IJNA 5CE3A 4JN4A 4H0VB 4CD3A 3ENOA 1ATNA 3D7EO 1MA9B 2P9IB 5E84A 1ZBSA 4K43A 3WXJA 3UKRB 3A5NC 2ASPA 2IIRA 3VGLA 1T6CA 4MLHA 5BPMA 3H1QA 3LDNA 1HJOA 1U2VB 1NGBA 3FE1A 1NLVA 4FOIA 3BP8A 3EO3A 3LDQA 2ZGZA 3FFKB 2CGLA 4M7XA 3O5BA 3DAWA 5KPZA 1CZAN 4WQ4C 4BG8A 3TU5A 1HKBA 2IVPA 3EN9A 2YHWA 4CZLA 4K25A 1WOQA 2P9SA 3WXLA 3SMSA 3W3DA 1BU6O 1T44A 2CH6A 3C7NA 2P9NA 3JS6A 1MDUB 5BPLA 1RFQA 4FWNA 2FLOA 4RTFD 3ZX3A 1NGJA 5AZJB 5ADXA 4EIAA 4RCHA 4IWVA 2VYPA 1GLDG 4JHDA 3RSEA 2YI1A 3VESA 4FWOA 2HF4A 2Q36A 3R8EA 2GUPA 5AQUA 1HKGA 4MO5A 3FZHA 3ULEB 3FGUA 3WT0A 1NGGA 4IZ9A 4WQ5A 1U2VA 3O8MA 2ZGYA 4BRPA 4L3QA 4F9OA 3H1VX 3U9DA 1MWMA 2QWMA 3WEEB 4BVOA 1E4GT 3VPZA 5KQ8A 3BF1A 3FR0A 3ATUA 1K8KA 3VF4A 3UKUA 3A8YA 4BC2A 2ITMA 3KHYA 3O80A 3ATVA 5FPNA 3VEWA 1K8KB 4H0TB 1HLUA 2VWBA 4FL9A 2QM1A 1BA1A 5AQTA 3C0BA 4A62A 4BREA 2NLXA 4BRFA 1ZXOA 1G99A 5AQXA 4BGBA 5AQFA 4M63C 4KBOA 5BRFA 3A5LC 3HI0A 4CJ7A 1LCUA 1NBWA 4YDUA 4BC3A 5ADXH 5I9EB 2YHYA 3QBWA 4IJAA 2ASOA 1YUWA 5BREA 4BQLA 1ZC6A 4FOEA 2OANA 4EHTA 2QWRA 3TPQA 2F9WA 1SZ2A 3F9MA 4O5FA 5AQVA 3DXMB 2FSJA 3HBTA 3IFRA 4EHUA 2YJEA 4H5WA 3GG4A 2FXUA 3GL1A 4PKGA 4PKHA 4QS9A 3SLCA 3ZX2A 2ASMA 1JCGA 2D1KA 4XEIA 1YAGA 3WXIA 3CHWA 1ESVA 4BR0A 4FWQA 3VEZA 3MN6A 4WQ5C 2A5XA 2IVNA 3L0QA 1TUYA 5FPEA 1C0FA 3O4WA 5BN8A 4AM7A 5BPNA 3AAQA 4K41A 5F1XA 3DXMA 3O1WA 4HWIA 4IXCA 4M7YA 5AQGA 4B1YB 5B8HA 4CBWA 1GLAG 3QDKA 1H1VA 4BRQA 5AQYA 3FLCO 1KAZA 4Z94A 4DHYA 3O6WA 4FWSA 3DXKB 1EQYA 1T6DA 4H5VA 3P4IA 2CH5A 2AA4A 4RWTA 4FWRA 2ZWHA 5ELZA 3ZETA 5AQKA 2P9PA 3GDQA 1XC3A 5E26A 2E20A 3H45C 2Q31A 4J8FA 1U6ZA 2P9LB 3UKUB 2UYTA 3W0LA 1YVNA 2FSNA 2W41A 3DWLA 1DKGD 4BRKA 2A6AA 1GLJO 2A40A 3MN7A 4MO4A 3KVGA 2P9KA 5F2RA 5TKYA 2PAVA 5EY4A 4A2BA 4B1WB 4CZKA 1NM1A 1GLCG 4BRDA 3CETA 5FPMA 2HOEA 4H5RA 3H46O 3VF6A 4XH1A 4WQ4A 5AQMA 2E2NA 4FWLA 3AARA 3VOVA 1QQNA 5AQQA 1QZ5A 2Q0UA 2D4WA 3WQTA 4NO7A 2D0PA 3MN5A 5AQLA 4H5TA 1NGCA 1MWKA 3VEXA 1OKJA 3ENHA 4B1ZA 1RGIA 3WQUA 4BRNA 5FPDA 3DXKA 2P9NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SBGA 3PSIA 3OYEA 1SQKA 4O8KA 4FLUA 4CGHA 4JI6K 3CJCA 5JLHA 3G25A 2GWJA 2Q97A 2X74A 3KK2A 3KKRA 1T7PA 1TL1A 4C8OA 4Q0BA 5AQSA 3NHGA 5C15A 5JICA 2P9SB 4KH6A 4MQ3A 1CLQA 2A3ZA 3SUOA 4M41A 4KH5A 1O1WA 5FLXO 2E2OA 3L6QA 4KHNA 4ISGA 2E2QA 2JWKA 3MX5A 4IEIA 3U8XA 2KKZA 4CHNA 4XIUA 3SJJA 1Q82O 3SI6A 3J7YP 2GTDA 4BC4A 3SUQA 3QIOA 1GLLO 1W0HA 4H4MA 3M1FA 3VQ6A 3M5RA 5AQZA 4JI8K 4DTUA 3UIQA 4FW2A 5EOYA 5AQRA 4CJ4A 5GIPA 4LF4K 2DFEA 3P31A 4KI6A 3T1YK 1RT2A 4PWDA 2I7PA 3KD1E 1BQMA 3VN5A 1X3MA 1S1VA 2F4VK 3I8DA 4HTLA 3CCQN 1L3UA 3KK3A 3IG1A 4FJ9A 5C10A 1VSHA 3TWHA 4FVMA 1QVFM 3ZT3A 3AVFA 1OH5A 1XNQK 1IKWA 4CHQA 3ZCMA 3WNFA 1HPMA 2NRHA 3OVNA 4ISFA 3OYLA 3B6PA 5KGXA 2YNIA 1KAXA 2NUBA 4BRGA 3RWUA 2HSTA 3LM9A 3PX6A 4JK9A 1KLNA 5LJWA 4B9LA 5GIOA 1L3TA 4BWMA 2W6LA 4AM6A 3U4LA 4YORA 4CK3A 3AO5A 5HLFA 2E1YA 4JHDB 1KAYA 3CIPA 3QO9A 1HNXK 3PO4A 4KAZA 3QB0A 5AQIA 3CYMA 4BRHA 4JI7K 1TKTA 4DFJA 4J2BA 4B8CA 3SNNA 4G9ZA 4CJFA 1WSIA 3EE9A 1WAFA 3AA5X 1OH8A 2O8FB 1J6ZA 4JI3K 4CK1A 2FF6A 4HHTA 1KC8O 2O8BA 2VWJA 2HHSA 4GV9A 1IKVA 2JWLA 4FO0A 4DB3A 1VQMN 4FJHA 4BG9A 2G8KA 2QK9A 3LDLA 3EL2A 1K9MO 2Q0RA 3CMAN 3RMBA 2P51A 3K2PA 5AZIB 1I94K 4BE0A 1NGFA 3KZBA 4NXNK 1SAZA 3H3OB 3VTHA 4JYAK 1QHAA 4JAXA 1U4BA 1NGHA 3VTIA 1VSMA 1BQNA 1VK0A 2P9UB 1EXQA 5EVZA 3I0RA 3LDPA 4JS5A 5FRNA 3ZT1A 1BI4A 5BR8K 3LAKA 4DV6K 1HYZA 1TUUA 3ASMA 5EXWA 4FJKA 1Q81O 1GOBA 4LH5A 4HCBA 2W40A 3MDQA 4KHPK 3RR8A 3NMUA 3MEEA 4WFNL 5A2QO 3VQ5A 2P5GA 4B9QA 5CR4A 2YV0X 4H8KA 1NGIA 4CJSA 2A42A 1BG3A 4KB0A 5M1NA 3DI6A 2FBXA 1KSPA 5AQNA 1C1AA 1KRPA 3D2EA 3SK3A 4YHHK 4WYBA 1QQOA 2WONA 3J80O 4OKEA 4BROA 4U67L 1Y64A 3CCUN 3T1HK 1BOTO 5M1KA 1J53A 5AZIA 3VERA 1UAXA 5AQWA 3SQ4A 3QLHA 4CBUA 4E89A 4Y1CA 5F0XA 3C6HA 4DCHA 3HPHA 4E7HA 1N8RO 4PHTX 2HNYA 1WN7A 3FZMA 4H0XB 4OLAA 4WF9L 5SZTA 4C1NI 4H03B 3RSEB 2ZJQL 2G8FA 1ATSA 1ILYA 4H0OA 1J5EK 4DSFA 3QINA 3L2RA 4E7LA 1QTMA 2KZMA 4EFHA 4JD2B 2E6MA 4CGIA 2YX6A 2BUPA 1M1KO 1JXBA 4KKOA 4CEDA 5CE3A 3ENOA 5CZ2A 4F8RA 1LWCA 4BE1A 1MA9B 3UKRB 3TAMA 1T6CA 4NCGA 3H1QA 1X9SA 4W5NA 1NGBA 4CHOA 4FZZA 3BP8A 4E19A 3L2QA 5J2QA 3DAWA 1CZAN 3TAEA 1BL3A 3TU5A 3QETA 1WOQA 4KV8A 4FJMA 1EWRA 3WXLA 3TABA 4FXDA 3W3DA 4N5SA 2OZSA 2CH6A 2HW3A 3JS6A 4RW7A 1JLFA 4CE9A 2DFFA 4FWNA 1ZBUA 3TARA 3NCIA 2YHAA 2XO7A 4EIAA 2IDOA 1JLQA 3K5MA 5AQUA 4HVJA 4MO5A 3BZCA 3WT0A 2HHWA 1U2VA 3O8MA 2ZGYA 4F9OA 4HCCA 4EP5A 2XHBA 4IBNA 1B9DA 1E4GT 4BVOA 1VSJA 3BF1A 3PX4A 3ATUA 3VQ9A 2EX3A 3UKUA 4R79A 3A8YA 2PZSA 1RDDA 4BC2A 2ITMA 1L3SA 3LWMA 4JI2K 3MEGA 1NG9A 4FL9A 3C6TA 1BA1A 4K0KK 3NH0A 4BRFA 1ZXOA 4DUZK 5AQFA 2FC0A 3V1QA 5BRFA 1JLGA 4CFBA 4AF1A 4DF8A 5I9EB 3L3VA 3LP2A 3C65A 4X64K 4MDBA 2ASOA 1YUWA 2O4GA 5BREA 2OANA 2UU9K 3SAHA 2QWRA 4O5FA 4Z4HA 3OJUA 3DXMB 1DTTA 1TKXA 4N41A 4H5WA 2W42A 4JKAA 4R5PA 5FDLA 3AVMA 2D1KA 3AO3A 2IGIA 3V9ZA 3MEDA 3VEZA 1F21A 4KTZA 4OPHA 4WQ5C 3L2VA 3AVIA 3ZSZA 3L0QA 3O4WA 3ZT0A 3AO2A 3AAQA 4JKCA 4C8MA 3EEQA 4B9MA 3OYKA 5AQGA 4B1YB 3OYMA 3LZJA 2E5LK 3LPUA 4BRQA 5AQYA 3FLCO 4KTQA 1DTQA 1KAZA 4FZXC 1T6DA 1K8AO 2CH5A 4FJ8A 3TAFA 2HBLA 2UXBK 2P9PA 1FXXA 5LL6Z 5E26A 3H45C 2HNZA 4A57A 3CM5A 1NK4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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