3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
3MN7A 4IZ9A 5AQWA 3WEEB 2W40A 3FZLA 5AZJA 3LL3A 5KQDA 4BR2A 3JS6A 4FOIA 2VCPA 4CI6A 1BUPA 3H6EA 5FPEA 2A40A 2IIRA 3GE1A 3U9ZA 3U9DA 3A8YA 3FZMA 4HWIA 4K25A 3HI0A 5EOYA 2P9LB 4FWQA 2I7NA 3UB5A 3CIPA 2V7YA 3IFRA 5FPNA 2FF3B 3ZX0A 3FE1A 4BR7A 3DXMA 2ASPA 4I6MB 2FSNA 3VESA 3LDQA 4M63C 4FWLA 3WUHA 4K43A 2PBDA 2P9SB 3I8BA 4H0YB 5ADXH 3H45C 2W41A 5AQRA 3O4WA 1BA1A 2OANA 4CZKA 4FO0A 4Y0WA 4FPAA 2IVOA 2QWRA 2E20A 1TYQB 3SK3A 5AQSA 4FWNA 3HBTA 2YI1A 1IJJA 4FOEA 1D4XA 2A5XA 4BC2A 5AQQA 1K8KB 3BF3A 3WEEA 1KXPA 3SLCA 1RFQA 1T6CA 1QQNA 3QFUA 4LC9B 2QM1A 3AAQA 3H46O 2E1YA 2QWMA 4PKGA 4FWRA 1MWKA 2PAVA 3LM9A 1GLLO 3U8XA 4BRAA 2P9UB 1YXQA 2FSKA 1NM1A 3VEOA 3QBXA 4BC4A 3DXKB 1YAGA 2Q2RA 3CHWA 4AM6A 3D2EB 3VGLA 2P9LA 3C0BA 4XH5A 3ATVA 4B1XB 4B9QA 2GTDA 1ZC6A 5EX5A 2YCHA 1TUUA 2VYPA 3ZX3A 3KZBA 3MCPA 2KHOA 3CJAA 4BQLA 4JHDA 3RSEB 5AQMA 1TUYA 5AFUA 1HKBA 3CQYA 4I6MA 5AQVA 1KAYA 3EN9A 5AZIB 4YDUA 3A5LC 5JMVA 4NO7A 4M7YA 2P9SA 1OKJA 3L4IA 3A5MC 3F9MA 4BRKA 4FSVA 1LOTB 3IUCA 5FPDA 4Z94A 5AQIA 2YHWA 2Q0UA 2V7ZA 3MDQA 1T6DA 1JCEA 1TYQA 1BU6O 1Q18A 4JD2B 4FWMA 4H5VA 4NB4A 4CZFA 1K8KA 1E4FT 2QWLA 3VOVA 3QDKA 4CBWA 1NGEA 3LDOA 4H0TB 4MO4A 2E8AA 3W0LA 5F1XA 3WXJA 4DHYA 1SZ2A 4EIAA 3VEVA 3AY9A 3DAWA 2P9UA 5AQHA 1C0FA 4K41A 4F9OA 3O1BA 3DXKA 4H5TA 4EAHD 4BRPA 4CZLA 5ADXA 3UE5A 2YHXA 2QW9A 2IVNA 4EHUA 1NLVA 3FLCO 4ISFA 1NBWA 3QICA 3D2EA 4ISEA 4WQ5A 4GY2B 2ASOA 2GWKA 3AARA 2YHYA 3SJHA 3VETA 3LM2A 1RGIA 4E1JA 3SMSA 4BREA 3L6QA 3RSEA 5E26A 3O80A 3WXIA 3W3DA 3GG4A 3WXLA 1X3NA 3QMLA 5AZIA 1NGDA 2NLXA 4RCHA 2YJEA 4MLEA 1DEJA 3UKRB 3HM8A 4M7XA 2QWPA 3R8EA 4WYBA 5FPMA 3I33A 4JHDB 2E88A 2GUPA 1XC3A 1HJOA 4JD2A 4BRFA 5F2RA 5AQJA 2HF3A 5AQFA 5AQTA 4GNIA 1XQSC 3ID8A 5AQXA 3DJCA 1BDGA 5AQGA 3ZEUB 3EZWA 2I7PA 2A41A 2A3ZA 3VEWA 3VEYA 3O1WA 1U6ZA 1V4SA 3FFKB 3CJ7A 5KPZA 5BPNA 4EFHA 1DKGD 1GLBG 3VF6A 5F0XA 5BN9A 3ENHA 4BRNA 1C0GA 4CBUA 3HSCA 4BR0A 1HUXA 4BR4A 1Z05A 4BRDA 3CJBA 3BP8A 5ELZA 4CD3A 1P8ZA 1HKCA 1U2VB 2FSJA 3MN9A 4MLHA 3VENA 3QB0A 3GL1A 4B1WB 2NZTA 3EO3A 5KPTA 4J8FA 2P9PB 5EVZA 3L0QA 3UKRA 5BR9A 4BRMA 3FZKA 1NMDA 3H1VX 3TPQA 4BGBA 2BUPA 2P9NB 1S3XA 5BPLA 4BVPA 1S22A 3QBWA 2BTFA 2E2PA 3M1FA 1ATNA 2Q97A 1GLJO 2CGKA 4H03B 3B8AX 5BN8A 3ZEUA 1ESVA 5BPMA 2QWNA 3FZFA 4JNEA 4MO5A 4WQ5C 1IG8A 4B1YB 2D0PA 4H0VB 5AQNA 1HPMA 4JN4A 3H3OB 2YJFA 4CZMA 1SAZA 3GOIA 1H1VA 4FWKA 3HZ6A 1JCGA 4FWOA 3D2FB 3R6MA 2FXUA 3IDHA 3IMXA 3O5BA 4WQ4A 3R9PA 4CZGA 2Q36A 2WUSA 3O8MA 1HLUA 4B1VA 1SQKA 4BR9A 4L3QA 1GLAG 4BRQA 5EY4A 1ATSA 1V4TA 1HX1A 3D7EO 4PKHA 2HF4A 4DCHA 1NGFA 1U2VA 3KHYA 2F9TA 1MA9B 1X3MA 2QXLA 3FGUA 3LDPA 3MN5A 2P9PA 3LDNA 2AA4A 4CZEA 3LDLA 1T44A 4BRGA 3VPZA 3CETA 3EKUA 3VGKA 2Q1NA 1EQYA 4A62A 3MK6A 1CZAN 3BUZB 2HOEA 4FWPA 3VEZA 2FLOA 2P9NA 4CBXA 2QWOA 3C7NB 1Y64A 3WT0A 2CGJA 5AQZA 4CJ7A 5BREA 3GDQA 3A5OC 5BRDA 4A61A 4FWSA 5KPRA 1ZBSA 3M6GA 4QS7A 4RWTA 1NGIA 1R59O 2F9WA 2V52B 1BWFO 4A2BA 4B1UB 3CQXA 2E2QA 3VGMA 3VF2A 3HTVA 4H0PA 2AP1A 2GELA 3S41A 2J4RA 4CZIA 2NRHA 1QQMA 2ZGYA 1KAZA 1YVNA 1BG3A 4QS9A 3ULEB 5LJVA 1KAXA 3D2FA 4O5FA 2D0OA 1X9JA 4BVOA 2GEMA 3CJCA 2CH5A 2D1KA 1BA0A 1J6ZA 1NGAA 1XUPO 3EL2A 4H0OA 2P9IB 2CGLA 1DGKN 2QWQA 4JAXA 3UKUB 5KQ8A 3AAPA 5AQUA 3H3NO 5JLHA 4XH4A 3A5NC 3ZETB 1NGBA 3CI5A 2UYTA 4PKIA 1NWKA 4CD1A 4XEIA 4YDUC 4DB3A 5CE3A 5JICA 1QZ5A 3VERA 2VWBA 1BOTO 4BG8A 2H3GX 1MDUB 4KBOA 4QS8A 4CZJA 3C7NA 2ZGZA 2GWJA 5AQLA 1GLEG 2A6AA 4IO8A 1WUAA 3A0IX 3GBTA 4WQ4C 3CJ1A 3CJ9A 2EWSA 3M3ZA 3MN6A 3VEXA 3ENOA 2HMPA 3MMVA 1BO5O 4O8KA 1WOQA 2IVPA 5JLFA 1GLCG 3DWLA 4BRCA 2ZF5O 4BG9A 1GLFO 5I9EB 1QZ6A 5AR0A 2E1ZA 4C23A 4H5NA 1ZXOA 2ITMA 1QHAA 3EKSA 4IXCA 3ULEA 1Z6RA 3H1QA 2DPNA 4ISGA 4B1ZA 2P9KB 4BC3A 5BRFA 2V51B 1GLDG 3WQUA 3VF4A 4K42A 5AZJB 4PL8A 4A2AA 4PL7A 5EXWA 1G99A 2P9IA 1LCUA 4FL9A 3BEXA 1NGJA 3ATUA 4RTFD 3UKUA 3O6WA 2ASMA 2E2OA 3WQTA 4BRHA 1YUWA 3KVGA 3FR0A 2E2NA 4BGAA 4BQZA 3ZETA 4BRLA 4BROA 1ATRA 1QQOA 2A42A 4BR5A 4H0XB 3CERA 3FZHA 2CH6A 4IWVA 3G25A 3QFPA 4FPBA 5AQPA 3OHRA 3BF1A 3JXUA 3WXKA 2Q0RA 1JCFA 3DXMB 5B8HA 3SMPA 5AQKA 4BRIA 2Q31A 3J8AA 4BC5A 3TU5A 3U4LA 1HKGA 4DQ8A 5BRHA 2D4WA 4CZHA 1NGHA 5E84A 5LJWA 4IJAA 1NGGA 5LY3A 4H5RA 5AQYA 1E4GT 3O08A 4IJNA 3ZX2A 4XH1A 4HTLA 5TKYA 2FF6A 4H5WA 1RDWX 1MWMA 4EHTA 5AQOA 2P9KA 2ZWHA 3P4IA 4AM7A 1NGCA 5AFUH
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYDA 4ILHA 2VQFK 1BCOA 3MWTA 1NK4A 3K5OA 3M8PA 2I5JA 5FLXO 3R3LA 1X1PA 3GE1A 3U9ZA 3U9DA 4NLBA 3FZMA 4K25A 2P9LB 2IGIA 5MLCQ 4M3YA 1NMNA 3K9KA 4JI7K 3IFRA 4IKFA 1JKHA 1WSJA 2GV9A 4NYFA 1WBDA 3DXMA 2ASPA 3ISNC 3KIOA 2NRVA 4I6MB 1DT9A 4FLVA 4OPJA 3WUHA 3SUNA 3I8BA 4H0YB 5ADXH 5AQRA 4FZYA 3O4WA 2O8CA 1BA1A 3OYBA 3SQ0A 1RDCA 2IVOA 1RBUA 1TYQB 3SK3A 5AQSA 3VQ5A 4B08A 2BH1A 1BGXT 2A5XA 4BE0A 1K8KB 3BF3A 3SI6A 3SZ2A 4IFVA 4CK2A 3CXCM 1QQNA 1EO1A 2QM1A 3AAQA 3LP1A 1XNRK 4BRAA 1GLLO 3LWLA 1IG9A 1T7PA 1KVBA 2FSKA 4B3MK 1MU2A 3SQ4A 4M42A 3KWIA 5E41A 1N8RO 4DU3A 1YAGA 2Q2RA 4FLYA 4DU4A 4FJKA 4AM6A 2KKZA 3C0BA 4CHOA 4B1XB 2GTDA 5CZ2A 5FRNA 2OTLN 1TUUA 3NH2A 3ZX3A 3HVRA 4LFCK 4FK4A 1ASVA 3DLKA 5AQMA 4IOAL 4GVEA 2HW3A 1HKBA 2G8VA 3CQYA 1RT2A 1KAYA 4CESA 2YNIA 1YITN 3TAFA 5CY4A 4NO7A 2Z1HA 1KSPA 1C0TA 4BRKA 5C25A 3ZYYX 3MX5A 3V9ZA 2G8FA 3IUCA 3AVCA 5FPDA 5J2QA 4RW9A 4LY7A 1QSYA 4Z4FA 1Q7YO 2RE2A 3CD6N 2JWLA 3PV8A 3K59A 3CC4N 4KAZA 3SAHA 3D45A 4IO9L 4CZFA 1NOZA 4RG8A 3E9LA 4CJ3A 2QWLA 3VOVA 5BR8K 4CBWA 4FXDA 1NGEA 4CGHA 3WXJA 4DV6K 1SZ2A 4EIAA 3AY9A 3AA5X 5AQHA 1C0FA 3P83D 4H5TA 2QW9A 3J7ZO 3L2VA 1U49A 3D2EA 4GY2B 3WNGA 3V6DA 3T1YK 4E1JA 3SMSA 4FLXA 3I56N 3SAFA 3E9PA 1RBSA 3DRPA 3CC7N 4JS4A 5AZIA 4RCHA 2YJEA 1DEJA 3V81A 3TTFA 2Z1GA 3DLGA 4CERA 1ZBIA 2VWJA 5IT9O 1NJZA 4FJHA 3TAMA 3IKMA 2VGNA 5M1OA 2HHHK 1YIJN 4AHSA 5F2RA 4M41A 2D5RA 5AQTA 4UY8O 4IFEA 3VA3A 3I0SA 1BDGA 1KLNA 1LWFA 4Z4IA 1RT5A 2A41A 3KK7A 3CCQN 3JYTA 1FXXA 4Z4EA 1ITGA 3HT3A 4CF1A 3CM5A 2DFHA 4BR0A 1TK0A 4BR4A 1NK0A 3V1QA 4BRDA 4CJRA 1EWRA 5GIOA 4C1NI 1P8ZA 4JI1K 1U2VB 1LV5A 5KGXA 4JI4K 1ZBHA 4W5NA 4MLHA 1REVA 2KFNA 1BI4A 4LFAK 1UA0A 1ASUA 2NZTA 5KPTA 2P9PB 4DTUA 3O9TA 4DR1K 1NJWA 1J5OA 2F8TA 3FZKA 4DV5K 3NMUA 2JWKA 2ZD1A 4DR4K 3J7AP 1X9WA 1I39A 3QBWA 4J2EA 1OH7A 3M1FA 4J2AA 5C0YA 2Q97A 4GV3A 1GLJO 2UXBK 3AVLA 3AVKA 4CF9A 1ESVA 3THYB 2D0PA 1TKDA 4TSXA 5AQNA 1YTAA 4J2BA 4CZMA 4FWKA 3HOSA 4NCAA 2WFBA 1JCGA 1TK8A 1SKWA 4FJ9A 3JSMA 3O5BA 4CZGA 3OYGA 1QSLA 4B1VA 4FJ7A 1SQKA 3VQQA 2Y1IA 4H8KA 4HUGA 3NH1A 5EY4A 2NRRA 3ZT3A 3D7EO 3U3GA 2HF4A 3TSUA 4DCHA 3KHYA 1S9EA 4LSNA 1X3MA 1XMQK 1VQON 3MN5A 3P31A 3VPZA 4PWDA 5C10A 4FVMA 2P5GA 2Q1NA 1W97L 1EQYA 1ZBFA 3BUZB 2DFEA 1VQ8N 4JKFA 4LH5A 4O8UA 4OKEA 2FLOA 2P9NA 3RR7A 2QWOA 5AQZA 5BREA 3GDQA 4A61A 3MECA 2HNZA 4I9LA 1EWQA 2QEXN 1T3VA 3ZSRA 4YOYA 1NGIA 1R59O 2E4LA 3HYFA 4WF9L 4OKKA 1A5WA 3CFPA 2E2QA 3VGMA 2KQ2A 3VF2A 3HTVA 4H0PA 4DSKA 2QA4N 1VSKA 1HR0K 2J4RA 2NRHA 1QQMA 3CM6A 1YVNA 3L3VA 5CR4A 3HL8A 5CZ1A 4CJQA 2BE2A 1HQUA 4DU1A 2HVHA 2CH5A 3NAEA 3EL2A 4H0OA 5CYQA 1QE1A 4KI4A 2OZMA 2CGLA 2ZJQL 5KQ8A 4XH4A 3ZETB 3CI5A 1NKCA 4GMJB 4PKIA 4CD1A 5CE3A 4FJXA 4DB3A 3KK2A 1QZ5A 1SL1A 3PY8A 2VWBA 1VQKN 1OH5A 4B8AB 5KRTA 3S3MA 4EP4A 4YY3K 3T69A 1JLFA 1RBRA 3CPEA 3QIPA 4XIUA 3CJ9A 2VG5A 5HRSA 3B6OA 3NF6A 1JLBA 1BCMA 4YFUA 3N4QA 5J2PA 4ILJA 2IVPA 4BRCA 4BG9A 1GLFO 1JXEA 1QZ6A 3LDSA 2Y1JA 4IXCA 3ULEA 3RVCA 1FJGK 4LF6K 1HNIA 1EETA 1NK5A 4B1ZA 2PZSA 4BC3A 5BRFA 3OYIA 3WQUA 2XRIA 5HRNA 4ICLA 4PL8A 5EXWA 2P9IA 4N76A 3QERA 4RTFD 3NHGA 2ASMA 4BRHA 2E2NA 4BGAA 1IBLK 4IG3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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