3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
4FOIA 3EN9A 3GE1A 3VERA 2P9PB 4FWKA 5BN9A 3FLCO 4BGBA 3MMVA 4FO0A 4ISEA 5AQXA 4H0TB 3JXUA 1HJOA 4H5WA 4PKGA 4A2BA 5FPNA 3O08A 3MK6A 1U2VB 3FZKA 3ZX2A 2VCPA 4H5NA 4FWLA 4BRGA 3A5LC 3M3ZA 4FWRA 4AM6A 4H0PA 4E1JA 1KAXA 5AQPA 1EQYA 5AQMA 5AQNA 3UB5A 3H1VX 3ULEB 1BWFO 3D2EA 4M7XA 3KVGA 1HX1A 1SQKA 2A5XA 4CZJA 2CH6A 1IG8A 4CZGA 3AY9A 4KBOA 2ASPA 4BREA 1NGIA 3QMLA 4B1ZA 4PKIA 3U9DA 2HOEA 1NGCA 3FR0A 2GWKA 4HTLA 4JHDB 4BRAA 5AQKA 5AQUA 5KPTA 2CGLA 2ZF5O 2FSNA 3DXMB 4Y0WA 3D2FA 3AAPA 4WQ5A 5ELZA 2P9UA 3O1WA 1NGGA 2WUSA 3M6GA 4NO7A 3DAWA 4BRDA 3WQTA 2D4WA 2P9LA 3U9ZA 1R59O 4QS9A 5JLFA 2P9IB 1BG3A 3AAQA 4H0VB 5EX5A 3DXMA 3H3OB 4K25A 1NGFA 1GLEG 3WQUA 1MA9B 3SJHA 4K42A 4H0XB 5BRFA 4FWPA 5AQGA 2Q0UA 5AQZA 4JD2B 5E84A 4BRMA 3IFRA 3GBTA 3EKSA 2I7NA 1QQOA 2V7YA 3WXJA 2A3ZA 1KAYA 3VEYA 2QWNA 1HKBA 3C0BA 1OKJA 3D2EB 3I33A 5KQ8A 4B1VA 2F9WA 3SMSA 3CJCA 4CZIA 2Q0RA 3D7EO 1NBWA 2FSKA 1SZ2A 1QHAA 2KHOA 1JCEA 3VENA 4F9OA 4BVOA 1U6ZA 2E2NA 2UYTA 3FZFA 3LDQA 2FLOA 3U8XA 3GG4A 2YJFA 5JMVA 2A42A 3VF2A 3DJCA 2ZGZA 1NGAA 2Q97A 2PAVA 1GLCG 3UKUB 4H5TA 4H03B 3LL3A 2YHYA 5JLHA 1GLJO 4BR7A 4CD3A 1ATSA 1C0GA 5BPMA 2AA4A 5AQLA 4QS8A 3R8EA 2BTFA 4FOEA 3OHRA 4L3QA 2QM1A 3VEZA 4WQ4C 2QWLA 3O1BA 4CZKA 3JS6A 4CD1A 2FF6A 4B1WB 5BRHA 2W41A 3P4IA 4IWVA 4QS7A 3VETA 2D0PA 5AZIB 4IZ9A 1NLVA 3FE1A 4ISGA 1G99A 3CQXA 4DQ8A 4BC5A 3L4IA 1NGJA 1Y64A 1GLLO 2P9LB 2QXLA 5F0XA 4BRHA 1BOTO 5AQJA 1X9JA 3L0QA 3IUCA 3ZETA 1DEJA 2GEMA 5AQWA 4BR5A 3QFPA 4YDUC 3CIPA 3WXLA 3LDOA 3QFUA 3BF1A 4ISFA 1YAGA 4BR4A 2FF3B 3VEVA 5FPDA 2CGKA 3IMXA 3ZX3A 2HMPA 1H1VA 4Z94A 5BR9A 1TUYA 1J6ZA 3A0IX 3B8AX 4CI6A 4BRKA 1WUAA 4JHDA 2GTDA 5BREA 4B9QA 2A6AA 1K8KB 3R6MA 5BN8A 3O6WA 5BRDA 1XQSC 1V4TA 5KQDA 4XH4A 1TYQB 3CJBA 3FZHA 3BEXA 1C0FA 4BG9A 1S22A 2H3GX 3WT0A 1RGIA 3LDNA 3O5BA 1YVNA 1ZXOA 4BR2A 2NLXA 3L6QA 2PBDA 4HWIA 5EOYA 4BRFA 3VESA 4JN4A 1BU6O 4BRLA 1TUUA 1KAZA 4DHYA 4DB3A 3WXKA 3H6EA 3WXIA 2QW9A 5AQFA 2NRHA 2HF3A 3BP8A 3AARA 1YXQA 2YCHA 3VEXA 5KPZA 2QWMA 2E1ZA 4BVPA 4MLEA 4DCHA 3QBXA 3SLCA 3CJAA 4RCHA 3MN7A 1CZAN 4IJNA 1KXPA 1DKGD 4BQZA 3CJ9A 4BQLA 2Q36A 3D2FB 2D1KA 1GLFO 5LY3A 4EHTA 3O8MA 4BRIA 5AZIA 3CJ1A 1TYQA 3W3DA 1NM1A 1T44A 3UKRA 4A62A 2I7PA 1IJJA 1HUXA 1JCFA 1ESVA 3MN9A 1NGBA 4BC4A 3HBTA 4RTFD 3WUHA 3QB0A 4MO4A 4CZHA 4J8FA 4H5VA 4GNIA 4IXCA 4BR0A 4XH1A 3A5MC 3CQYA 1GLBG 3WEEB 2BUPA 5ADXA 2QWOA 2E8AA 4FWOA 2E1YA 1NGHA 2E2QA 1X3NA 3GOIA 1HKGA 3H46O 3FZMA 2HF4A 1NGDA 3EL2A 3S41A 1MWKA 2A40A 4PL8A 1QZ5A 2E2PA 1ZBSA 3FGUA 4PKHA 4CJ7A 2IVPA 2CH5A 3ID8A 3ATUA 5BPNA 3VPZA 1BA1A 1RDWX 5CE3A 3I8BA 2FSJA 1K8KA 1XC3A 2P9SB 3DXKB 1QQMA 4BRQA 2VWBA 3LDLA 4BR9A 4FPBA 4I6MA 4FWNA 3MN6A 4FWSA 5AR0A 2IVOA 2P9KA 3CERA 5LJVA 4EAHD 3HM8A 3EKUA 1ZC6A 3M1FA 4FWQA 4NB4A 3ZETB 3CI5A 3DXKA 2VYPA 4MLHA 3SK3A 3EO3A 3MN5A 3KHYA 1BDGA 4FL9A 4H0YB 4K43A 3RSEB 1LOTB 5AQOA 4CBWA 3LM9A 2E20A 3FFKB 3ATVA 3O80A 2CGJA 3IDHA 2ASMA 3QDKA 4PL7A 4H5RA 3VOVA 4RWTA 4MO5A 3H45C 2Q1NA 3WEEA 2E2OA 1T6CA 1HKCA 4CZMA 1DGKN 1RFQA 2P9NA 3UE5A 5AQSA 3VF4A 4B1XB 3W0LA 2OANA 4A61A 4XH5A 3UKRB 1E4FT 4K41A 2J4RA 2GUPA 5AQVA 3CETA 3F9MA 3VEOA 3U4LA 2P9PA 2EWSA 3VGLA 4YDUA 1SAZA 2NZTA 2V7ZA 3O4WA 4BC2A 4BRPA 2ZGYA 5I9EB 3QBWA 1NMDA 4C23A 3RSEA 2AP1A 5B8HA 3C7NA 3KZBA 2IVNA 2ASOA 2P9SA 5AZJA 2GELA 4B1YB 1Q18A 4AM7A 4WYBA 5FPEA 4XEIA 2ITMA 3DWLA 1BO5O 1HLUA 3HZ6A 4IJAA 5ADXH 3TPQA 2FXUA 4BGAA 4A2AA 2ZWHA 3VGMA 2P9KB 4M63C 3ZX0A 2V52B 5LJWA 3R9PA 4JD2A 4CZEA 3ZEUA 3VGKA 2V51B 1GLDG 4FSVA 4WQ5C 4LC9B 4I6MB 2QWPA 4FWMA 1QZ6A 2YHXA 4CZFA 4O8KA 1XUPO 5AQRA 1NWKA 1BA0A 3ENOA 5BPLA 5AQIA 4CBUA 2F9TA 4B1UB 2DPNA 5EXWA 5AQTA 1T6DA 2YJEA 3EZWA 2YHWA 3GL1A 4H0OA 2P9IA 3H3NO 5AQYA 3ENHA 5AFUH 3CJ7A 1Z05A 5JICA 1V4SA 1ATRA 3H1QA 1HPMA 3C7NB 3BUZB 5TKYA 2D0OA 3BF3A 1S3XA 4BC3A 1D4XA 1YUWA 2P9NB 1MDUB 5F1XA 4M7YA 5EY4A 5F2RA 4JAXA 3MCPA 1U2VA 4O5FA 2E88A 3TU5A 2YI1A 1ATNA 3HI0A 2GWJA 5AZJB 4WQ4A 3VF6A 3ULEA 4CZLA 2Q2RA 2Q31A 4IO8A 2W40A 3HSCA 3G25A 4JNEA 3HTVA 1Z6RA 1P8ZA 3SMPA 4BROA 2P9UB 2QWQA 1QQNA 1BUPA 3FZLA 3LDPA 3ZEUB 2IIRA 1E4GT 3CHWA 4EFHA 1MWMA 1GLAG 1X3MA 5EVZA 4EHUA 3MDQA 4GY2B 2A41A 5AFUA 4FPAA 3UKUA 3A8YA 1NGEA 5FPMA 3QICA 1WOQA 5AQHA 3J8AA 3A5NC 5AQQA 3A5OC 4BRNA 1LCUA 5E26A 5KPRA 3VEWA 3GDQA 4EIAA 4BRCA 2QWRA 4CBXA 3LM2A 1JCGA 4BG8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EN9A 3CYMA 4LY7A 3OYNA 4FK0A 3HP9A 5BN9A 3FLCO 4FO0A 4ISEA 3JXUA 4DR5K 1DT9A 1SL2A 4I9QA 4CHNA 1N8RO 4KREA 3OYHA 4FWLA 1S9EA 1S1WA 1XHXA 3TAEA 5C10A 4FJJA 2BE2A 4FWRA 4AM6A 3ALYA 1KAXA 4CJVA 1EQYA 3QEPA 4DR2K 2NNWA 1BWFO 2PFUA 3ZT2A 4M7XA 3T3FA 2F7TA 4CEDA 2A5XA 3K9JA 4WCEL 3RRHA 3RRGA 2G8UA 4BREA 4B1ZA 2GUIA 2HOEA 3U9DA 1NGCA 1RDAA 5GADP 4BRAA 4Y0WA 2FSNA 1VSLA 1JL2A 5AJ3K 4E19A 1NGGA 1TKXA 5HBMA 3WXMB 4BRDA 4ELUA 1L5UA 4NYNA 4BWJA 2EX3A 3SUNA 1R59O 3VQCA 1RBSA 5JLFA 1BG3A 4DS5A 3VQDA 1WBDA 3H3OB 4K25A 4X64K 4CEAA 1GLEG 1MA9B 1HPZA 3NF7A 3ZSRA 3NH2A 1NU0A 4JRQA 3OYKA 5GAGP 3GBTA 3EKSA 3AVMA 2P51A 1WSFA 2HVIA 1IKXA 3HPGA 4ICLA 1EO1A 2Z1HA 4UQGA 3CJCA 4CW7B 4CZIA 3O9UA 4CK3A 3AO2A 4MQ3A 1YTAA 4BVOA 1Q9YA 4C8OA 1QE1A 4KKOA 3VF2A 2ZGZA 2Q97A 4KTZA 4CF2A 4CERA 3SQ1A 4B3RK 4H5TA 4CJ3A 2X6SA 2VG7A 3K5MA 4CD3A 4LSNA 1NK8A 3PX6A 5AQLA 5LMUK 2NRTA 3LPTA 4HCCA 3R8EA 4M45A 2BTFA 4L3QA 3EEQA 3I56N 5C25A 3JS6A 4WFNL 1XHZA 2W41A 5GAHP 3SAHA 1EKEA 4CF8A 3C6UA 3F2KA 2G8KA 3CQXA 4BC5A 1NGJA 2OPRA 2FBXA 4DQRA 1GLLO 3QETA 1TK0A 3LAKA 5HLFA 1BL3A 4FVMA 3VTHA 3HT3A 5C0YA 3AVFA 1X9JA 1BISA 1RBTA 3L0QA 3O4NA 3ZETA 4KFBA 2GEMA 3J7YP 3RTVA 1W7AA 4FLYA 4M3XA 2YHAA 4BR5A 4DV3K 3CIPA 1XWLA 4IG0A 3LDOA 3HOSA 3QFUA 4ISFA 2G8WA 3PIOL 4BR4A 3V9XA 5HOOA 2DFFA 4CIFA 4I2QA 4DTRA 3NCIA 3ZX3A 4Z94A 3QEWA 1D9FA 4CI6A 5CR4A 3L3VA 4B9QA 2BDPA 2A6AA 3O6WA 4FK2A 4FJNA 3B6OA 4N41A 1TYQB 3C6AA 3J7ZO 1E3MA 1C1AA 3LDNA 2D0AA 1YVNA 2JGUA 4JI3K 4CJFA 1BQMA 1JLFA 3L6QA 1LV5A 2PBDA 4HWIA 5EOYA 4BRFA 3VESA 4BRLA 4DB3A 4JLHA 3ENBA 4FXDA 4JI0K 5MLCQ 1YXQA 2YCHA 3VEXA 4DUZK 1M90O 4MLEA 3AVIA 4CIGA 3SLCA 1WAFA 3KLGA 4G1QA 1Q8IA 2Q36A 4BQLA 3V9WA 1WSHA 1TGOA 1ZBLA 4CJRA 3AVGA 3DM2A 5J2PA 4DR3K 4JI7K 3W3DA 1T44A 4BACA 4A62A 1IJJA 4DR6K 4DLEA 3AVLA 4IO9L 3HP6A 1RDBA 1X1PA 4K0KK 2XY8A 4OJRA 1T03A 1O13A 1I94K 3CQYA 4CEZA 1GLBG 3K5OA 1S1XA 5ADXA 2QWOA 2E1YA 1X3NA 3GOIA 3K2PA 2UXCK 4NCAA 3S41A 2E2PA 4PKHA 5HROA 2O8FA 1BA1A 5CE3A 5A2QO 1XC3A 4DV7K 4H4OA 5FRNA 1A5WA 3ZSXA 4H8KA 2P5OA 1C6VA 5AR0A 2P9KA 3QESA 4KH6A 1KVBA 4EAHD 3ZSOA 4CGGA 4F2RA 4RW4A 3M1FA 1RT5A 1NNEA 3KK1A 1KLNA 4AF1A 3S3NA 4DTSA 3TAMA 1BDGA 3JYTA 4K43A 3RSEB 4FZYA 5AQOA 1NMNA 2UUAK 1GOCA 3ATVA 1YJ9N 2CGJA 2XY7A 1NKCA 3IDHA 1QSLA 4ZTJA 4H5RA 4JEPA 1VRUA 2G8IA 4FJLA 4OPHA 3H45C 3BDPA 1FJGK 3WEEA 2E2OA 1ASVA 1SKSA 4CZMA 1DGKN 4YOTA 4FJ8A 2P9NA 5CY4A 5AQSA 2RN2A 2ATQA 3D45A 4B1XB 4JS5A 5M1OA 3QNNA 2KQ2A 2GUPA 3NVKA 3CETA 3VEOA 1RT4A 3I55N 3U4LA 3VGLA 3MCAB 4ILHA 3WNHA 2RE2A 3O4WA 4BC2A 1RTDA 1NMDA 4PA1A 4LFAK 4DV5K 1Y97A 3MAQA 4KHQA 3C7NA 4RW6A 3LANA 2GELA 4B1YB 3ISNC 3K9KA 3DWLA 2QKBA 3HZ6A 1HLUA 4CJLA 1K6YA 2Y1JA 1RTJA 3CCJN 3CCMN 4GVMA 4CEQA 4E7IA 3MEGA 3KD5E 4YFUA 1S72N 1KD1O 1U49A 2V51B 1GLDG 4FSVA 4NLCA 4FVUA 4LC9B 1JL1A 3R1XA 3TSPA 1N32K 4FWMA 4FM0A 4CK2A 5DM6L 4O8KA 1RDCA 3PIPL 1BA0A 5BPLA 3AVBA 4QCLA 4B1UB 4PHTX 2DPNA 4KI4A 2O4GA 3H08A 5AQTA 1L3SA 3PO4A 3L8BA 1VHXA 1T6DA 4CFCA 1NJXA 4ID1A 2Z1JA 3LDSA 3LAMA 3HPOA 4CVNE 1KVCA 2YHWA 3GL1A 2P9IA 3AO1A 5AQYA 3ENHA 2XHBA 1Z05A 1VQ7N 4A5AA 1V4SA 3C7NB 4K8ZA 1SUQA 3BF3A 4JV5K 3IRXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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