3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Hexokinase-1
publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
4RCHA 1RDWX 1U2VB 3M1FA 3MN9A 4FOEA 5AQTA 4FO0A 5BPMA 4CD3A 3QBXA 3CQYA 5AQSA 5LY3A 4H5NA 3D2FA 3UKRB 3DXMA 1ZXOA 4BR0A 2OANA 2J4RA 2VCPA 2CH5A 2GTDA 1ESVA 2ZF5O 3CJAA 2E88A 2P9KA 4PKIA 3VEYA 4Y0WA 4BREA 4H5TA 4JNEA 1NGBA 4BRDA 1NM1A 3D2EB 2CGKA 1SQKA 1HUXA 1SAZA 2Q1NA 4IJNA 4WQ5C 5AZJB 4M63C 3WXKA 3I8BA 4CBXA 3CIPA 3ZX0A 5E26A 3ATVA 3GOIA 4FWMA 5BRDA 3U9ZA 1IJJA 5BN8A 3DXMB 4KBOA 3R8EA 4QS7A 5AQLA 5KQ8A 3VEWA 5KQDA 3U9DA 4EAHD 1OKJA 2P9KB 4IO8A 4H0TB 2ZGYA 1HKCA 5CE3A 4BRPA 1LCUA 4E1JA 3H45C 1GLLO 4H0PA 1S22A 3AAQA 4BRNA 3O1BA 2VWBA 3OHRA 4CZEA 1T6CA 3P4IA 1NGFA 4B1YB 2E1ZA 2V51B 5AFUH 1JCEA 4L3QA 3UKUA 4MLEA 3MMVA 2P9LA 3LDNA 4FWKA 3H6EA 3O6WA 3VGMA 3M3ZA 3AY9A 4H0XB 1TUUA 4DCHA 2NRHA 1YXQA 2ZGZA 3MN5A 4IJAA 3DXKA 4BC2A 2I7NA 3AAPA 1U6ZA 3B8AX 2E1YA 1BU6O 2FSNA 3QDKA 4JHDA 3QFUA 2H3GX 4EHTA 3MCPA 1E4GT 1NWKA 3VEZA 4FPBA 2HF3A 3GL1A 3DWLA 3F9MA 2NZTA 1NGEA 1T44A 5TKYA 2P9LB 2PAVA 2QXLA 3L6QA 1GLBG 2Q31A 4A2BA 1V4SA 3FE1A 3VETA 4CZHA 3KZBA 3CJCA 2WUSA 5EOYA 5AZIB 2D0OA 4EHUA 2E8AA 1YVNA 1YUWA 3DXKB 1ZC6A 3H3NO 1MWMA 2P9IA 3FZLA 2YI1A 4CZMA 3WEEA 2HOEA 5LJVA 3BUZB 2CH6A 4MLHA 3WQTA 1KAXA 1ATNA 3VF6A 2QWLA 1HX1A 3SMSA 1X3NA 3FZFA 2BTFA 2HF4A 3KHYA 3VESA 3SLCA 3ZETA 3ZEUA 3GDQA 4BC4A 3QFPA 4ISFA 2ITMA 4FWRA 4F9OA 5AQJA 4BRKA 5AQNA 3WEEB 2YHXA 3RSEA 4BR2A 4H0OA 4H5VA 1SZ2A 3ID8A 3W0LA 3FZMA 4K43A 3HM8A 5BRFA 2GWJA 2P9UA 2E2OA 3I33A 3UB5A 4C23A 5EVZA 3A5MC 1NGCA 3BP8A 4FSVA 1Z6RA 1BOTO 3DAWA 4XH1A 2FSKA 4CBUA 5ELZA 2FSJA 5E84A 4CZLA 4A61A 3LL3A 4H0YB 4QS9A 1P8ZA 3W3DA 4M7XA 5AQQA 5AQWA 3UE5A 2YJFA 3KVGA 1QQMA 3RSEB 4CZKA 5AFUA 5F0XA 5FPMA 5KPZA 4H0VB 3EN9A 3FR0A 4WQ4C 3CQXA 3HI0A 2QWPA 2D1KA 4K25A 1MDUB 4BRIA 4IZ9A 1BG3A 2P9UB 4J8FA 3VGLA 3QMLA 5LJWA 4LC9B 3D2FB 4BR7A 1DKGD 4BRGA 1NGIA 3VEVA 2FF6A 5BN9A 3JS6A 3WQUA 3ZX2A 3IFRA 1YAGA 5JLFA 4BRCA 2HMPA 3ENHA 3EO3A 4WQ4A 2ASMA 4GY2B 1HLUA 5FPNA 1X9JA 2A40A 3M6GA 5AQRA 1GLEG 2UYTA 3EKSA 3MN7A 4BQZA 3DJCA 2QWQA 3BF3A 1DEJA 1JCGA 1KXPA 3IDHA 2W40A 1J6ZA 4BR4A 3MK6A 3J8AA 3U4LA 4CZJA 3C7NA 3VENA 4PL7A 5AQMA 3FLCO 4NB4A 2QM1A 2E20A 4Z94A 4FWOA 2PBDA 2CGLA 3L0QA 4BC5A 3WT0A 3VF4A 4BR5A 1Z05A 5AQPA 5AQXA 3CJ9A 3QB0A 4MO4A 2NLXA 3VOVA 4CBWA 4CJ7A 2A42A 1EQYA 2P9NA 5AZJA 4A2AA 2QWOA 5AQKA 2F9WA 3WUHA 4I6MA 3S41A 2P9PA 2ZWHA 3WXIA 1V4TA 1BO5O 3ATUA 2ASOA 4BRFA 2A41A 5BR9A 2ASPA 4BGBA 3UKUB 5AQIA 2YHYA 4H5RA 1S3XA 4BQLA 3VEOA 4EFHA 3WXJA 4K42A 3ZX3A 2P9NB 3SK3A 3HBTA 5AR0A 5F2RA 3EL2A 1LOTB 3FZHA 5BPNA 1KAZA 4JHDB 5KPTA 2E2PA 4DB3A 3BF1A 4BRAA 1KAYA 3O1WA 2Q36A 1GLCG 1NGHA 4A62A 5ADXH 3TPQA 2W41A 2E2NA 4BC3A 4DQ8A 5B8HA 5AQFA 4MO5A 5AQZA 4JD2A 2IIRA 3LDLA 1NBWA 3MDQA 2P9IB 3A8YA 1BDGA 2QWRA 5BRHA 1IG8A 1MA9B 4DHYA 5EY4A 1U2VA 3G25A 1G99A 2A3ZA 1BUPA 3H3OB 3AARA 1WUAA 1QQOA 3VF2A 2D4WA 1GLFO 4AM7A 3LDQA 1QQNA 1GLAG 3VERA 4CZIA 4FL9A 3UKRA 3A0IX 3H46O 4B1UB 4AM6A 4M7YA 3CHWA 3CJ7A 2EWSA 2V7YA 4JD2B 1MWKA 3ZETB 3D7EO 3ZEUB 1RFQA 4BG8A 3QICA 1C0FA 3D2EA 1ATRA 5KPRA 1XQSC 5AQGA 2YCHA 4B1XB 2I7PA 2CGJA 3FZKA 3R6MA 3EZWA 4O8KA 3VPZA 5AQVA 3LDPA 2FXUA 2GEMA 4CD1A 1TYQA 1RGIA 4JAXA 2Q0RA 3SMPA 4IXCA 2AP1A 2P9SA 2FLOA 2GWKA 4BRLA 3R9PA 3O5BA 2V52B 3SJHA 5BPLA 2VYPA 1GLJO 3HZ6A 5BREA 4QS8A 3GBTA 4RTFD 1HKGA 3FFKB 3LM9A 5JICA 1K8KA 4O5FA 4BG9A 5JMVA 4BRMA 4IWVA 3ULEA 3VGKA 3O8MA 5AQHA 4NO7A 5F1XA 2QWMA 1C0GA 4CZFA 1TYQB 4BR9A 3A5NC 1CZAN 1BA0A 4HWIA 2V7ZA 1HPMA 3CJBA 2P9SB 1NMDA 4XH5A 3WXLA 4BRQA 2QW9A 3HTVA 4WQ5A 1E4FT 1ATSA 3IMXA 4B1WB 1HKBA 1R59O 4FWNA 1T6DA 3CETA 1K8KB 4PKGA 2GELA 4GNIA 3ULEB 1NGDA 1Q18A 3CI5A 3H1QA 4YDUC 5ADXA 4H03B 5AQYA 4RWTA 4CZGA 1HJOA 2GUPA 1NLVA 4BRHA 1QHAA 4EIAA 3VEXA 3CERA 3O08A 3C7NB 3LDOA 1TUYA 4FWPA 2A6AA 3CJ1A 4ISEA 2BUPA 2IVOA 1QZ6A 3U8XA 4FWSA 1NGJA 4FOIA 4K41A 5AZIA 4ISGA 1H1VA 5AQOA 1XUPO 4B1VA 1Y64A 4B9QA 4YDUA 3IUCA 1NGGA 2Q0UA 3C0BA 3A5OC 4PL8A 5EXWA 4FWQA 2E2QA 1GLDG 4I6MB 4BVPA 2DPNA 2YJEA 2P9PB 3ENOA 3GG4A 5AQUA 1XC3A 2AA4A 4JN4A 3TU5A 4FWLA 1BWFO 4HTLA 4BVOA 1BA1A 5JLHA 3MN6A 4XEIA 2Q97A 2QWNA 3BEXA 4BGAA 1WOQA 3FGUA 1D4XA 1ZBSA 1NGAA 4PKHA 4CI6A 2F9TA 4FPAA 3O80A 2D0PA 3H1VX 1DGKN 3O4WA 4H5WA 3A5LC 2KHOA 1QZ5A 3HSCA 4WYBA 5EX5A 2Q2RA 5I9EB 3EKUA 2FF3B 3LM2A 2IVPA 3L4IA 4XH4A 1JCFA 3QBWA 2YHWA 2IVNA 4BROA 5FPDA 3JXUA 2A5XA 1X3MA 5FPEA 3GE1A 4B1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AO1A 1C1AA 4B3OA 4DQRA 5AQTA 1VQ5N 2P5GA 3ZSQA 5BPMA 4KTQA 4NCGA 3DXMA 1ZXOA 2J4RA 2XRIA 2GTDA 2NRXA 3CJAA 2E88A 4PKIA 4CF2A 5C2FA 2CGKA 1SQKA 1HUXA 3NF6A 4M63C 4CBXA 1OVQA 3NHGA 4FWMA 5BRDA 3OYCA 4FJNA 3ZSVA 3OS1A 3MXMA 2XY7A 4DKWA 3D0PA 1BISA 4KBOA 3CMEN 4UY8O 5AQLA 3VEWA 3LDSA 4LF5K 1OKJA 4DR6K 4IO8A 4H0TB 1XWLA 2ZGYA 1VQ4N 4E1JA 3OYJA 3P39A 3M8QA 4JLHA 4BRNA 4LFAK 5H1SQ 3L2RA 2YNGA 1VSJA 2E1ZA 5J2QA 4JKEA 1NOZA 5M1KA 3HM9A 2KLAA 3QNNA 1D8YA 1VSHA 5M1FA 2UXDK 3MMVA 2P9LA 2IGIA 3LDNA 4FWKA 3O6WA 3ZT1A 4F2RA 2HHSA 2NRHA 1NJYA 2QEXN 2VG6A 4IJAA 3DXKA 4DUYK 3L3UA 3NVMA 3NGZA 4RW9A 1LW2A 1N33K 4I2QA 4CJ5A 4PQUA 3MAQA 3KK2A 3VEZA 2E5LK 1E3MA 3DWLA 3F9MA 4BE2A 3F5TA 2PAVA 3ISNC 4DFJA 3L6QA 1W9HA 4FZZA 1B9FA 2WUSA 5AZIB 4KHWA 4EHUA 1YVNA 3QETA 4E7IA 3RR8A 3PSIA 2YHAA 4U67L 3HL8A 4BE0A 2GBZA 1RT5A 1YVUA 3WNEA 5GIOA 1HYVA 4CJLA 1ATNA 4LF9K 3VF6A 4X64K 1B92A 1VAZA 1X3NA 5HRPA 4BE1A 1KTQA 4ICLA 2O8EB 2BTFA 3V9XA 5HP1A 4JI5K 3SLCA 3ZEUA 3GDQA 4BC4A 1X9WA 3KLEA 1MU2A 1S1XA 3TANA 4BRKA 2YHXA 4FVUA 1RBTA 4YOXA 3E9LA 4H5VA 4CF1A 3ID8A 3HVTA 4CGFA 1QVFM 1JXEA 1SKWA 3WNHA 3VQCA 4FW2A 2UU9K 3T3FA 4CW7B 2BANA 4FSVA 1BOTO 3C6TA 1DTQA 4FZXC 5E84A 3V1OA 4CZLA 3SQ4A 2W42A 3W3DA 4F2SA 4TSXA 3CC7N 5AQQA 3KVGA 3A2FA 4CZKA 5F0XA 4KB0A 4CJPA 1T03A 5KPZA 1HNVA 4WF9L 4H0VB 3FR0A 1RDBA 4WQ4C 1U4BA 1TL1A 2IC3A 3V9WA 1KLNA 3NGYA 4CFAA 3QMLA 4CHQA 2HBJA 3MX2A 4LC9B 3D2FB 4Z0UA 1DKGD 4BRGA 1NGIA 3S9HA 1KVAA 3CCQN 1LWFA 1K9MO 4DSFA 1YAGA 3V6DA 3DLBA 4FJ9A 2O8FB 2O8DB 2HMPA 5C12A 1Q81O 3MEEA 1YIJN 1QE1A 2UXBK 4GY2B 5FPNA 4CJ3A 1BQNA 5AQRA 5KGWA 3CFRA 1GLEG 4LSLA 3SI6A 4BQZA 3DJCA 3I0SA 3K9KA 2XY6A 1J6ZA 3KD5E 3G71N 3R1XA 4E19A 2B5JA 4PL7A 3FLCO 1LAWA 2OTLN 1A5XA 4Z94A 4FWOA 3EZ5A 3BY5A 3WT0A 1GOBA 4BR5A 2YKMA 4IDHA 2NLXA 4CBWA 4FJXA 2P9NA 5AQKA 4NLBA 4K0KK 4RW7A 1YJNN 4DS4A 1U48A 2UUCK 4LH4A 5AQIA 1WSIA 4M3RA 4DV6K 3VMFB 3MECA 4EFHA 1IKVA 2Z1JA 1HNXK 4OGCA 4J2EA 3HBTA 5F2RA 3EL2A 1LOTB 3FZHA 4YOYA 1KAZA 3OYDA 1CZ9A 2Q36A 4Y1DA 1NK0A 4YFUA 2WONA 3VQ7A 4DR2K 4DQ8A 1Z26A 5AQFA 4M42A 3O4QA 3SV4A 1QQCA 1L3VA 5AQZA 3HOSA 1KQSM 1SL1A 3KJVA 2FBXA 1SS6A 3A8YA 3CCMN 2WC9A 1IG8A 3O4NA 1U2VA 3G25A 3H3OB 3WNFA 1WUAA 4CF8A 1HR0K 1GLFO 4AM7A 3LDQA 1GLAG 3A0IX 3H46O 4CGHA 4M7YA 3SAGA 4CK3A 5EU7A 3P1GA 5C42A 3J7YP 3IAYA 1HJRA 5HRRA 1UA1A 3MEDA 1RFQA 4KHSA 3IS9A 2I7PA 3FZKA 5I3UA 3DM2A 5DK5A 1JL1A 5AQVA 1FW6A 2RKIA 3F2KA 4CD1A 1KRPA 3HO1A 1RGIA 2X74A 2ETJA 1T8EA 4KH4A 4AHRA 4E1MA 5J2PA 2AP1A 4MFBA 2X78A 2GWKA 4BRLA 3R9PA 3THXA 4Z4EA 2V52B 3TWHA 1YTUA 4OGEA 5AJ3K 3GBTA 5DM7L 1SV5A 1TK5A 5CYQA 4DUZK 1JJ2M 3VA0A 3NH2A 5JICA 1VQ7N 2F8SA 4RW4A 4CIFA 4N56A 2BDPA 3VQEA 4OKJA 1Q7YO 2FBYA 1C0GA 3A5NC 3OYEA 3RMDA 3K5MA 2V7ZA 1HPMA 3SAFA 4XH5A 3AA5X 4WE1A 2QW9A 4WQ5A 2ZJRL 1T6DA 1VK0A 4PKGA 1C1BA 2GELA 3P5JA 4GNIA 3ULDA 1HRHA 3THWA 1WAFA 4YDUC 5ADXA 4ELUA 3CM5A 1XMQK 3L2UA 5AQYA 1UOCA 1HJOA 2GUPA 1XNRK 4BRHA 3CCUN 4DTNA 4EIAA 3EYZA 4KH5A 1LV5A 1HQUA 3IRXA 3LDOA 1VQON 2A6AA 3BZKA 3CJ1A 3LAMA 1ASVA 4FLTA 4B9MA 1NGJA 5AQOA 1XUPO 1Y64A 4CVNE 1UA0A 4JK7A 1NGGA 2Q0UA 3AGRA 3C0BA 3NGIA 2ZD1A 4PL8A 3CF5L 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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