3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
1X3NA 5AQGA 2F9WA 4JHDA 1ATRA 4BG9A 3BUZB 1XC3A 2P9UB 2FLOA 3LM9A 4BC4A 5KQ8A 3HI0A 3VENA 2F9TA 4BQLA 1BA1A 1V4TA 1YVNA 3A8YA 1YAGA 1NGCA 4IZ9A 4FWRA 3FZHA 1NLVA 3LDNA 2P9KA 1X9JA 1Y64A 4H5RA 4C23A 1JCEA 2ZF5O 4IJAA 1X3MA 2DPNA 2ZGZA 2QXLA 2FSJA 2V7YA 3U9DA 3VEYA 4BREA 5KQDA 4ISEA 1WOQA 4BR0A 3J8AA 1RFQA 3G25A 5AQQA 2A6AA 3UKUB 2WUSA 3D7EO 4CZFA 4H0XB 4CBWA 4FWSA 2BUPA 4XH4A 3A5MC 4WYBA 4NB4A 2W40A 3LDLA 4QS8A 3QBXA 3BEXA 5AQVA 1DEJA 4JAXA 1GLAG 5AQSA 2PAVA 5EX5A 2AA4A 3FE1A 1LOTB 5BN8A 3MDQA 4H0TB 2E2QA 1BG3A 4FWLA 3QFPA 1HKCA 3BF1A 3IMXA 3MMVA 5AQXA 5LJVA 4FOEA 4BR9A 3CJCA 5FPEA 4CZGA 1BOTO 2Q97A 3KVGA 4H0OA 3WEEA 3VF4A 3ZX0A 2ASMA 4RTFD 4B1WB 4WQ4C 1BWFO 3VEOA 2Q2RA 3BF3A 4XH1A 3DXKB 2CGJA 4NO7A 1QQOA 4EHTA 1MWMA 4J8FA 2FF3B 4WQ4A 3CJ9A 5LJWA 1JCFA 4BRPA 1U2VA 4LC9B 1KAZA 3H45C 4BR5A 5AZJA 5AQHA 2IVPA 4BRKA 2FXUA 4L3QA 5AQPA 3LL3A 3EKSA 5BPNA 4A2BA 5AQOA 1GLJO 3TPQA 2HF3A 4FWNA 3AY9A 4O5FA 2A42A 3GDQA 3MN6A 4BVOA 5F0XA 5BR9A 5KPRA 3WXJA 3ENHA 4Y0WA 1NGFA 3CJBA 3UKRB 4A61A 1BU6O 3VF2A 1RDWX 3EKUA 3D2EB 5AQJA 3EZWA 1GLCG 4QS9A 5AQIA 1JCGA 1YXQA 2AP1A 3FZMA 3WXLA 1CZAN 1LCUA 1QQNA 2YJEA 3EN9A 3ZEUB 1NGHA 2D0OA 3A5OC 3M3ZA 5AQMA 1U2VB 1E4FT 2Q0UA 4B1ZA 4DCHA 2Q36A 3UKUA 4FWQA 4CZIA 5AQFA 1ZBSA 4ISFA 3FLCO 5FPMA 4BR4A 4M63C 3CHWA 1E4GT 4JD2A 2NZTA 5EOYA 1NGDA 2YHWA 1TUUA 4B1XB 4GY2B 4CZLA 5AQWA 3VGLA 3M1FA 3W0LA 4AM6A 3VGKA 2A40A 3I8BA 2HF4A 4XEIA 4BRMA 3ULEA 4PKGA 1ATNA 4B9QA 2E2OA 3KZBA 5AQRA 1HLUA 2E8AA 3O80A 4H5TA 2GWKA 4JN4A 3BP8A 3L6QA 3MN9A 3QBWA 3A5NC 2YHYA 2GEMA 3MCPA 5BRHA 1HUXA 3AAQA 3CERA 3R8EA 4BRCA 3FZFA 1OKJA 1GLEG 3FR0A 4XH5A 4CD1A 3GG4A 3LDPA 1TYQB 4FWPA 3U9ZA 4CZMA 4BQZA 3DXKA 1V4SA 4CZJA 4M7YA 4K25A 3C0BA 1QQMA 2ZWHA 1GLDG 4CD3A 5AQYA 3UE5A 2CH6A 3JS6A 2CGKA 1NMDA 1S22A 3CETA 1SZ2A 4JD2B 4MLHA 3U4LA 2UYTA 3IFRA 4BVPA 1Z05A 1NGBA 3D2FB 4DB3A 1QHAA 3EO3A 4B1YB 5JLHA 4YDUA 1RGIA 2D0PA 3LDOA 3ULEB 4FO0A 3C7NB 5AQNA 2QWMA 2D1KA 1ESVA 3O6WA 3GBTA 3RSEA 1BO5O 3VETA 3WT0A 4GNIA 3A0IX 5BRDA 4CZKA 3CIPA 2E20A 1BDGA 2Q1NA 3I33A 5BPMA 2QM1A 3UKRA 1KXPA 3JXUA 5AFUA 2H3GX 3S41A 3AAPA 1KAXA 2GUPA 3D2EA 1XUPO 2HOEA 5EY4A 4BRQA 4RWTA 3AARA 2P9NA 5BRFA 1GLLO 1HX1A 1G99A 1C0FA 3ZEUA 5AQKA 3P4IA 1ZXOA 2J4RA 3IDHA 5FPDA 1EQYA 2YI1A 2Q0RA 4PL8A 4BRIA 3GOIA 3RSEB 3F9MA 4BRDA 4H03B 4BROA 1T6DA 3R9PA 1NGEA 1K8KA 2A5XA 4FWMA 1YUWA 3KHYA 1NGAA 2QWRA 5AQLA 1S3XA 1C0GA 3H46O 4I6MB 4BRLA 2ASOA 1R59O 3CI5A 1DGKN 5AFUH 2A41A 3O5BA 1MA9B 5JMVA 2P9LA 1P8ZA 3HSCA 3VEXA 2P9NB 4PKHA 1MWKA 4IXCA 1HKBA 5B8HA 2I7PA 2P9PA 3WUHA 4EFHA 1TYQA 4MO4A 2VWBA 3LDQA 4F9OA 5LY3A 3ZX3A 2GTDA 1QZ5A 3SJHA 3M6GA 4MLEA 5KPTA 3MN7A 4FL9A 4HWIA 4ISGA 2E1ZA 3GE1A 3IUCA 2ITMA 5ADXA 4EAHD 1Z6RA 3O4WA 3H3OB 5ELZA 2IVNA 1Q18A 3D2FA 3L4IA 1IJJA 3O8MA 3CQYA 4CJ7A 1BUPA 1K8KB 2GELA 3QDKA 1J6ZA 3C7NA 3SLCA 2W41A 1HPMA 3GL1A 1H1VA 4K41A 3VERA 2E1YA 2VCPA 5BN9A 2QWQA 2GWJA 4H5NA 4DQ8A 2P9LB 5AQUA 3FZLA 3WQTA 1D4XA 3OHRA 2E88A 3ATUA 3WXKA 2P9PB 5KPZA 2QWLA 2VYPA 1ATSA 2P9IB 3VPZA 4BGAA 3R6MA 3ATVA 2V7ZA 1T6CA 3HBTA 3CJ1A 4YDUC 3SMSA 1NWKA 4FOIA 4RCHA 3WXIA 4CZHA 3H1QA 3VEZA 4H5VA 4BC2A 3L0QA 2P9SA 2YJFA 1WUAA 4JNEA 2I7NA 5ADXH 3DWLA 1DKGD 1NGJA 3CQXA 3HZ6A 3U8XA 4A2AA 5AZIB 5CE3A 2ZGYA 4IJNA 2PBDA 1SAZA 4FWOA 1SQKA 4HTLA 3VF6A 5BPLA 2IIRA 3SK3A 4KBOA 3HTVA 1ZC6A 1U6ZA 3MK6A 1MDUB 3MN5A 3FZKA 2HMPA 3LM2A 2FSKA 2QWPA 3DXMB 3CJAA 2FSNA 4BRGA 1NGIA 4I6MA 1BA0A 4FSVA 4A62A 3WQUA 3O1BA 4K42A 4JHDB 5EXWA 2YHXA 2NRHA 3ENOA 4BRAA 1NGGA 2KHOA 1HKGA 2CH5A 2QWOA 4IWVA 3QFUA 3QB0A 3ZX2A 3FFKB 3QMLA 2P9SB 5BREA 4AM7A 3VEWA 4WQ5C 1TUYA 2P9KB 5F1XA 1GLFO 2QWNA 3A5LC 4BC3A 1IG8A 2CGLA 2IVOA 4H0VB 2QW9A 4WQ5A 4EHUA 5JLFA 3VGMA 4CZEA 4B1VA 1NM1A 1KAYA 4H0PA 5F2RA 3VOVA 4CI6A 4PKIA 4Z94A 4PL7A 5JICA 4BG8A 3FGUA 4BR7A 4BRHA 2V52B 1NBWA 2ASPA 3H3NO 3O1WA 3CJ7A 5EVZA 4M7XA 4DHYA 3ZETA 4FWKA 4BRNA 4MO5A 5E26A 4CBUA 4CBXA 3W3DA 3ID8A 5I9EB 2P9IA 2EWSA 2V51B 4FPBA 4H5WA 5TKYA 1XQSC 3H1VX 3WEEB 4BGBA 2P9UA 4QS7A 2D4WA 1GLBG 3EL2A 5AZIA 1T44A 2A3ZA 3UB5A 5FPNA 3B8AX 2NLXA 4E1JA 3TU5A 4K43A 5AR0A 1QZ6A 3VEVA 3DAWA 4EIAA 4H0YB 4BC5A 4FPAA 4O8KA 5AQTA 5AQZA 5AZJB 2E2NA 2OANA 4IO8A 1HJOA 2Q31A 2FF6A 5E84A 4BR2A 3DJCA 2E2PA 3H6EA 3HM8A 3ZETB 4B1UB 3DXMA 3O08A 4BRFA 3VESA 2YCHA 3SMPA 2BTFA 3QICA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ILGB 3OYMA 1NOYA 4XIUA 3DI6A 4JHDA 2KLAA 1S1XA 2P9UB 1CXUA 2AJQA 4BC4A 4WFNL 1X9WA 1YVNA 4DQIA 3G4SN 2WTUA 3FZHA 3LDNA 4FW2A 2ZF5O 1X3MA 2ZGZA 3U9DA 2FSJA 1YITN 5KQDA 1WOQA 4DU1A 2UXBK 3J8AA 3DM2A 3S9HA 2Z1IA 5DK5A 3G25A 1TAUA 1TK5A 4CZFA 3F73A 4CBWA 3OS2A 2BUPA 3MX2A 3K5NA 1K6YA 1WN7A 1RCHA 4RW9A 4NB4A 4FLVA 5AQVA 4F2SA 4JAXA 1J54A 1D5AA 4CJQA 4B9SA 4H0TB 3K0SA 3C95A 3TANA 3E01A 3O9SA 4CJ3A 5AQXA 5LJVA 5FPEA 1BOTO 2Q97A 4H0OA 3RMDA 3OYBA 2HBMA 4RTFD 4DTUA 3VEOA 3IRXA 4B9VA 1WSJA 1N8RO 3MWPA 1OVQA 1QQOA 2FBYA 3HJFA 4Q5VA 4EHTA 2ZJRL 3K9KA 3LWMA 1M1KO 4AHVA 3KK2A 1JCFA 3AVLA 3H45C 5AQHA 1W2BM 2FXUA 2E6LA 3TWHA 4RW8A 4A2BA 5JVGL 1GLJO 5JS1A 2HF3A 1J9AA 3VQ8A 2VG7A 4CFAA 1GOAA 3G71N 3MEDA 5C42A 2IOCA 3C6UA 3G10A 3MWTA 3HP6A 1KTQA 2AP1A 2HW3A 1JLEA 2ZJQL 2OPRA 3ZT3A 3M5RA 1QQNA 1XNRK 2YJEA 3I0RA 3EN9A 4B3RK 4F4KA 4OKKA 1ZBLA 1DTQA 4CJPA 4M63C 1S9EA 4GY2B 4CZLA 4CVNE 3M1FA 4KREA 1QSYA 3I8BA 4CHQA 4OKEA 2GBZA 1SKSA 1NK8A 4FLWA 4A5AA 3IAYA 4B9QA 1HLUA 2E8AA 3O80A 4W5RA 1HPZA 4B9NA 1RT7A 4KKOA 3OYIA 1VSJA 1C1BA 3CCVN 1NJIO 5BRHA 3ZSWA 3THXA 4RW4A 3C6AA 5CZ1A 3GG4A 3KD5E 4QAGA 3K5LA 4I9LA 5LL6Z 1V4SA 4CIFA 1I3AA 4M7YA 2XY8A 2HBJA 1KFSA 3CC4N 4JEPA 4ZHRA 5SZTA 2UYTA 4BVPA 1YIJN 3V9UA 1BIUA 5DMRA 1QHAA 3JYTA 2WOMA 1RGIA 4KHPK 4FJNA 3C65A 4ZTJA 4FO0A 3C7NB 5AQNA 3R3LA 4IG0A 2D1KA 3O6WA 3VMFB 1BO5O 4DTOA 1IO2A 5BRDA 1NK5A 1TKDA 1S5JA 2YX6A 2Q1NA 1C1CA 3UKRA 1YTUA 5AFUA 3OYCA 2IAJA 3ZSYA 3CCJN 1HR0K 1XUPO 4B3MK 2HOEA 4IG3A 2G8VA 1EWRA 4IDHA 3TSQA 1NJYA 4U67L 5A2QO 3AARA 2P9NA 1S72N 4HVJA 3RRGA 3PIOL 3TAEA 2GV9A 3ZEUA 1RILA 3THWA 3U3GA 4FVUA 1Q9XA 2EHGA 1CLQA 2F8SA 3EZ5A 4OGEA 2HHVA 3AO2A 4NXNK 3Q7CA 4BRDA 1NGEA 1K8KA 2FBVA 4JKGA 1K73O 2JWKA 3E9LA 1YUWA 1HYVA 3KHYA 3HP9A 3H46O 2ASOA 3K2PA 1Q81O 4ELUA 1BI4B 3VTIA 3ZSXA 1IKWA 3HSCA 1HMVA 3PSIA 3NF7A 3VEXA 2P9NB 2ZM6K 4PKHA 1MWKA 1IKYA 4F2RA 3DRRA 4FM1A 3NMUA 3V9XA 1EP4A 4A59A 4MO4A 4NCBA 1JXEA 4I2PA 3THWB 1KC8O 4DKWA 3M6GA 4DV0K 1VSMA 3SQ0A 5ADXA 4JS5A 3IUCA 1WSHA 1YT3A 5ELZA 3L4IA 3O8MA 3HSTB 2PZSA 4KPYA 1S6PA 3C6HA 1K8KB 3KWGA 2G8IA 1KCFA 3LPTA 5KTQA 3SLCA 4C8KA 4K41A 3NE6A 1WLJA 3CCLN 4FYDA 1A5VA 1EO1A 3KWIA 3PLAA 4HCCA 2QWQA 4DV4K 4H5NA 3WQTA 4DQPA 3OHRA 3LZJA 3B6PA 1L3SA 4FXDA 1HNVA 3AA5X 3N4QA 3VQPA 4PY5A 3HOSA 4W5QA 2QWLA 4DTXA 4X62K 2RN2A 3CXCM 1T6CA 3HBTA 4FOIA 3H1QA 3F2KA 4H5VA 5TKWA 4AHTA 3U8XA 3K9JA 1D9FA 3DLEA 2PYJA 2XY7A 4E19A 4FWOA 4YOUA 4HTLA 2IIRA 3MEGA 2OTJN 4E7KA 4CEEA 1U6ZA 4OPHA 1MDUB 3MN5A 3FZKA 3JSMA 3LM2A 5FROA 1U4BA 4FSVA 4H8KA 3AVBA 1N5YA 2GUIA 4K42A 2JWLA 3G0ZA 2YHXA 2NRHA 3DOLA 5GIPA 5LMNK 2KHOA 1HKGA 1VQLN 4CJ5A 1TKZA 2QWOA 1G15A 4BE1A 4J2BA 1T03A 4FK2A 3DLLL 3SV3A 1NKCA 1LAVA 3BGRA 4DUYK 2QWNA 4CGFA 5M1QA 4BY9C 2O8CA 2IVOA 1VRTA 2QW9A 2ITGA 1HYSA 1B9DA 5JLFA 2ZE2A 4CZEA 4IKFA 3NGIA 4AHSA 1SKWA 4CI6A 4CW7B 4BACA 3THYA 3ZSVA 1TVRA 2E4LA 2V52B 3H3NO 2QTDA 3AA4A 5EVZA 4IEIA 1OH5A 1BCOA 3ZETA 1SS6A 1K8AO 4K8XA 3VA0A 4GVEA 3P83D 2W42A 3W3DA 4HUFA 2V51B 3V9ZA 3H1VX 4K8ZA 4CE9A 3EL2A 2NUBA 3PO4A 5AZIA 1T44A 2A3ZA 5BR8K 3ZSQA 4B08A 4F8RA 5E41A 5FPNA 4M3UA 4E1JA 2Q3SA 3DAWA 1RBVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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