3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
b'SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Hexokinase-1
publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
3QB0A 3AARA 4QS7A 4RTFD 3TU5A 1QQMA 4DB3A 3JXUA 1ATRA 3FR0A 3BUZB 5E26A 4QS8A 2FSKA 3QFUA 2QWMA 2E88A 4IO8A 1GLEG 2QWPA 3I33A 3IMXA 3LM9A 5AQMA 3HBTA 4AM7A 3O6WA 4I6MB 4FWNA 3KZBA 5I9EB 4A2BA 3LL3A 3QBXA 1KAZA 1NGGA 2GTDA 1NGHA 5AQQA 4BC4A 1ATSA 1Q18A 3A5OC 3EO3A 3ZX0A 3UKUB 1ZXOA 4CZFA 1C0FA 1HKBA 4ISFA 1ATNA 1RFQA 3FZFA 4ISGA 3B8AX 3CQXA 2AA4A 4RWTA 3ZX2A 3UKUA 1NGEA 4BRAA 3VENA 3KVGA 3DXKB 4CZIA 1MWMA 3MCPA 3EKUA 4FWKA 3EN9A 3U9DA 4BRIA 4QS9A 3ZEUA 4FWSA 4A62A 4CZGA 3DXKA 1TUUA 5AQOA 3A0IX 3BEXA 1GLJO 3DAWA 4J8FA 1V4TA 5EXWA 3CJ1A 2Q31A 3SMSA 2D0OA 2ZWHA 1NGBA 4L3QA 1ZBSA 4EAHD 5BN9A 5KPRA 5ELZA 3WXIA 1QZ5A 4B1ZA 4A2AA 4HWIA 1BO5O 4HTLA 1P8ZA 4H0PA 1XUPO 3WEEB 2A5XA 3FE1A 1Y64A 1YUWA 3IDHA 1BUPA 2QWOA 2V52B 4IJAA 1BDGA 3CHWA 4IJNA 4MO4A 3A8YA 1YAGA 3BP8A 4CZMA 3ATVA 3VERA 3WEEA 3ENOA 1GLBG 5AQLA 2W41A 3U8XA 1Z6RA 2V7ZA 1QHAA 4FL9A 3O08A 4K25A 3D2FB 4BRNA 2P9PB 2A3ZA 1NLVA 4GNIA 4CZEA 1DKGD 1C0GA 5AQZA 4H5NA 4NB4A 1HPMA 3EL2A 3EKSA 1S22A 4WQ4A 4AM6A 3MN6A 3MN9A 3D2FA 3P4IA 4ISEA 4PKHA 2P9PA 2ZF5O 4FWQA 2I7PA 1JCFA 2J4RA 4XH4A 4BRMA 2P9KB 3W0LA 3QDKA 1R59O 4H0VB 3GBTA 3CJ9A 2PAVA 3FLCO 4YDUC 2NLXA 4BRDA 4H0XB 2E1YA 1BOTO 5LJWA 3U4LA 4F9OA 1S3XA 2UYTA 3VESA 5F2RA 2P9KA 4BG8A 3QBWA 4B9QA 5EY4A 5BPNA 2D0PA 5JMVA 1YVNA 3RSEB 1ZC6A 2FXUA 3VEZA 1JCEA 2P9SB 3O4WA 4H0OA 4BC5A 4EHTA 2QM1A 4BRPA 5LY3A 1MWKA 3VEOA 3RSEA 1GLCG 3AY9A 1HKGA 4WQ5A 3FZHA 5JICA 3VF2A 1NGIA 4CBXA 2P9SA 3GL1A 2A6AA 4JD2B 5AQXA 1T6DA 3HI0A 4PKGA 3HSCA 3H46O 2A41A 1NMDA 4FWLA 1E4GT 4K42A 5AZJB 5AFUH 4CZKA 3GG4A 5AQHA 3UKRB 4JD2A 1HKCA 2HMPA 1X3NA 2E2OA 3ATUA 1Z05A 4FPAA 3ZX3A 4WYBA 3D7EO 3QMLA 1HX1A 4H0YB 1U2VB 1NBWA 4BQZA 4I6MA 4O5FA 4H5VA 2ITMA 5AZJA 1SAZA 1EQYA 4BROA 3UKRA 2HF4A 4M7YA 1BA0A 4CD3A 3GOIA 5BRDA 2ASOA 3C0BA 2A42A 1U2VA 5BRFA 3C7NB 3WXJA 1QZ6A 3FZMA 2EWSA 2KHOA 2DPNA 3OHRA 5AQRA 3QFPA 4O8KA 3ULEB 3H1QA 2GUPA 1MA9B 5AQVA 3VEYA 4BRCA 4CZJA 3LDQA 3CJ7A 3A5LC 3C7NA 5AZIB 1WUAA 3SMPA 2Q0RA 3VPZA 2YCHA 2IVPA 1WOQA 3VGMA 3TPQA 3ULEA 4BRLA 3R6MA 3CJCA 5AZIA 3J8AA 1NGAA 3DXMB 3MDQA 4PL7A 4Z94A 2YI1A 1IG8A 5AQTA 1X3MA 2IVNA 3HTVA 3JS6A 2OANA 1OKJA 1BG3A 2VWBA 5B8HA 3LDPA 3CJAA 3DXMA 2QWLA 4B1XB 3MN5A 5KQ8A 3UB5A 3FGUA 4BQLA 2CGLA 4IXCA 4CJ7A 5AQFA 5JLHA 3VEVA 3UE5A 2P9UB 1NGJA 2YHXA 3O1BA 3G25A 1KXPA 3H45C 3I8BA 4B1VA 3SJHA 3WQTA 2NZTA 4MLEA 1GLFO 5FPMA 4PL8A 1XC3A 4IWVA 3BF1A 3U9ZA 5BPLA 2P9UA 2Q97A 3A5MC 4H5RA 3ZETB 1H1VA 1QQNA 4FWRA 4WQ4C 5AQJA 1GLDG 4BRKA 5BPMA 4BR9A 4JN4A 1T6CA 1HUXA 2YJFA 3FZKA 1DGKN 3ZETA 3HM8A 2FSJA 3L0QA 2CH6A 4H03B 1NGFA 4E1JA 3VF6A 2QW9A 1G99A 5ADXA 5AQNA 2E2NA 3R8EA 3H1VX 4EFHA 3O80A 4H0TB 4BGBA 1JCGA 1BU6O 3ENHA 2ZGZA 1NWKA 3WUHA 4CZLA 3L4IA 2CGKA 4DHYA 3MK6A 2D4WA 3CERA 1GLLO 4MO5A 3AAPA 4BG9A 3EZWA 1KAXA 4BREA 4BR7A 3LDNA 2YJEA 2FF3B 4BC2A 1NGDA 4A61A 2NRHA 4RCHA 4FOIA 5EX5A 3VGLA 5BRHA 4JAXA 2D1KA 4JHDB 4YDUA 1T44A 2GWJA 5ADXH 4DQ8A 5AQWA 2Q2RA 5KQDA 2HOEA 2P9NB 4JHDA 1YXQA 3SK3A 4NO7A 1X9JA 4FWMA 3AAQA 2IIRA 5LJVA 2VCPA 5BR9A 2FLOA 4CBUA 1SZ2A 4DCHA 5FPEA 3H3OB 3HZ6A 4BR4A 2E2PA 2E8AA 3D2EB 1NM1A 2P9NA 5EVZA 5AR0A 4CBWA 3WT0A 1D4XA 1HJOA 2FSNA 5JLFA 3H6EA 5FPDA 5AQPA 4K41A 3M6GA 2CGJA 1GLAG 5F1XA 3VOVA 3D2EA 3IUCA 5AQGA 4FOEA 2CH5A 5KPZA 2ASMA 1MDUB 2HF3A 4FWOA 4Y0WA 5TKYA 2P9IB 4BRGA 2I7NA 1KAYA 2QXLA 2YHWA 4MLHA 3VGKA 3ZEUB 3MN7A 2QWQA 4B1WB 2E20A 2ZGYA 2GELA 2P9IA 3VF4A 1NGCA 2QWRA 3WXLA 5BREA 1BA1A 3DJCA 3DWLA 4C23A 1U6ZA 1LCUA 4B1YB 1CZAN 3CIPA 4BVPA 4BVOA 2F9WA 3VETA 1XQSC 4FO0A 5KPTA 1BWFO 3BF3A 4XH5A 2YHYA 5CE3A 2Q36A 3O5BA 2F9TA 4FWPA 3O1WA 4FSVA 2W40A 5AQUA 3M3ZA 3SLCA 1E4FT 4IZ9A 3MMVA 4H5TA 2GWKA 2BUPA 1SQKA 3LM2A 4PKIA 3O8MA 1V4SA 2VYPA 3CQYA 4EIAA 4M7XA 4XEIA 3GE1A 1QQOA 2E2QA 4BR2A 4CD1A 2Q1NA 2BTFA 1IJJA 1LOTB 2IVOA 3S41A 3M1FA 2QWNA 2ASPA 3QICA 4K43A 3LDOA 1K8KB 3L6QA 3LDLA 4JNEA 5FPNA 4BRHA 1RDWX 4BRQA 2GEMA 4BGAA 4CI6A 5F0XA 4LC9B 2Q0UA 3H3NO 3CI5A 1HLUA 3W3DA 4FPBA 3IFRA 2FF6A 1K8KA 1ESVA 2H3GX 3F9MA 1RGIA 1TYQB 4B1UB 4GY2B 2E1ZA 3FFKB 4BR0A 1DEJA 3VEXA 2V51B 4XH1A 1TUYA 3ID8A 3VEWA 4WQ5C 5AQYA 3WQUA 5EOYA 4KBOA 5AQIA 1TYQA 5E84A 2WUSA 4BR5A 3FZLA 5AFUA 2P9LB 3GDQA 3WXKA 4CZHA 2A40A 3R9PA 4BC3A 5AQKA 5BN8A 3KHYA 4M63C 1J6ZA 2PBDA 2AP1A 2P9LA 4BRFA 4H5WA 2V7YA 5AQSA 4EHUA 3A5NC 3CETA 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F3OA 4AHUA 4QS7A 4WF9L 4DB3A 3K57A 4FJ8A 1X1PA 1ZBFA 2QWMA 4B9NA 4IO8A 1XMOK 1SS6A 3HBTA 2KZZA 4JI8K 3O6WA 4I6MB 5I9EB 4A2BA 3J81O 1VSDA 4F8RA 1HNWK 3VQ7A 4B3RK 4KB0A 2GTDA 4FM1A 3QEWA 3QIPA 2E4LA 4CZFA 4HCCA 3SQ4A 3FFIA 1VQON 5GAHP 1RFQA 3KLGA 3DLHA 2AA4A 2RKIA 1NJYA 4RWTA 1D9FA 3ZX2A 2WC9A 1U49A 3DXKB 2RHKA 2RPIA 1T8EA 5KGWA 4BRIA 4QS9A 3TANA 3ZEUA 4NLBA 4FWSA 4A62A 1QQCA 2NUBA 1GLJO 3DAWA 2ZJPL 2G8KA 2QXFA 1RBTA 4AILC 4IBNA 1K73O 4CVNE 2Q31A 3MWTA 5HRPA 5GIOA 3C95A 4E7JA 1KLNA 3LPUA 4YOVA 2HMIA 3K5NA 4C8NA 5HBMA 3HP6A 2HHVA 1OVQA 3IKMA 3IAYA 1P8ZA 2KQ2A 1XUPO 3TSPA 3PX6A 4E3SA 3FE1A 4OKEA 3OYAA 4FJMA 4O0IA 2HB5A 3AVGA 5M1OA 3VERA 3WEEA 1RBSA 1RBUA 2G8WA 3DMJA 2W41A 2V7ZA 1U45A 2HNYA 4CEZA 1JL1A 3D2FB 4CFAA 3L3VA 4H4MA 2A3ZA 4GNIA 4CZEA 1C0GA 4N76A 4NB4A 1LAVA 4W5QA 1VSJA 3EKSA 4DLGA 3OYHA 4DV0K 3HVRA 1LWEA 1VSFA 3MN9A 1TK0A 3HP9A 2NRZA 2ZF5O 4FWQA 2I7PA 1JCFA 2J4RA 4MDAA 3VQDA 3MEEA 1RDBA 3FLCO 1SL2A 4KH5A 4DTXA 3THVA 1R0AA 3O9SA 3VESA 3V9SA 1S72N 2P9KA 4BG8A 3QBWA 3K5MA 4B9QA 4WFBL 5EY4A 5BPNA 2HVIA 3VEZA 1ZC6A 1JCEA 3BY5A 4FZZA 1Q7YO 4W5OA 2P9SB 1HNVA 3O4WA 4H0OA 4Z4CA 4KI6A 1JLGA 1NKBA 3AVBA 4CFBA 1MWKA 4GMJB 4JI0K 3RSEA 4MFBA 5JICA 4CF1A 1NGIA 1VSKA 3OBYA 3GL1A 2IOCA 4JD2B 1N5YA 3HI0A 3HSCA 1QSYA 5CR4A 3T1YK 4DQRA 4ILHA 4GKJK 4CHPA 3I0RA 4CZKA 5AQHA 1MU2A 2HMPA 3ATUA 4FPAA 3ZX3A 3OYLA 1B9DA 4QOZB 1N33K 1S9EA 5KGXA 3V4IA 1T7PA 3SAHA 5DM6L 4KHQA 4I6MA 5AZJA 3AVFA 3UKRA 2JGUA 5J2PA 4DU3A 5BRDA 2JWKA 3C0BA 1TKZA 3V9UA 4OGEA 2DPNA 3RMDA 3OYKA 1N6QA 3ULEB 1B92A 3TSUA 4DF8A 3HOTA 3O9UA 2E6LA 3CJ7A 4AHTA 2Q0RA 4MDBA 3VPZA 4B08A 1VHXA 4BDYA 3G6EN 3TPQA 1RT4A 4DUZK 1I94K 4FLZA 4M45A 1IV0A 3D6RA 5AQTA 1HNIA 2OANA 5B8HA 2XY6A 3L2VA 4B1XB 1ITGA 5KQ8A 4IEIA 3VQ6A 3V9XA 4ILJA 4IXCA 5AQFA 4L8RB 3VEVA 1NGJA 3LP0A 1KXPA 3I8BA 5M1KA 1RT7A 2EX3A 1U04A 3WQTA 2NZTA 2FBYA 4PL8A 4Z4EA 4RW8A 2KLAA 2P9UA 4H5RA 3LANA 4KTQA 4WQ4C 5AQJA 2XRIA 3IG1A 3E01A 4FM2A 1L5UA 3J7AP 2QKBA 2YJFA 4B9SA 1QSLA 4KHYA 4W5TA 1XWLA 3RWUA 1ZYQA 3ZT3A 4Y1CA 5E41A 2HHXA 4E1JA 3VF6A 4RW9A 1N8RO 3TAPA 5ADXA 4DU4A 3OBWA 4IOCL 3O4QA 3MX5A 3H1VX 3O80A 4BGBA 3P83D 1N36K 1BU6O 2ZGZA 1NWKA 2YNFA 1QTMA 3VA3A 4DHYA 4M3TA 2D4WA 2KFZA 4I7FA 2F4VK 4FJ9A 4CF2A 4BC2A 2FF3B 4A61A 2AJQA 3DLEA 2A1RA 3OS2A 4CHOA 1F21A 5BRHA 4JAXA 4JKEA 4DTRA 1T44A 2UXDK 1P90A 2IS3A 4DQ8A 4B9TA 3F73A 3RVCA 3KLFA 2HOEA 2P9NB 3D0PA 4NO7A 4YOYA 4QCLA 4M3WA 1EXQA 3AAQA 5LJVA 2FLOA 4CBUA 1TAQA 2VGMA 2OYQA 4DCHA 5FPEA 3ID6A 4CBWA 3CCEN 1XHXA 1D4XA 3V6DA 1NJZA 2VG5A 1VSLA 3H6EA 5FPDA 3ZSVA 3PO5A 3S3OA 3U6FA 1NMNA 1IKYA 2RN2A 4F2SA 2CH5A 1J53A 1KFDA 3AA2A 2YNIA 2HF3A 5GADP 2P9IB 1NK8A 2OZMA 3E9PA 3NGZA 4MLHA 3VGKA 4B8AB 3DRSA 3U3YA 2E20A 4O4GA 2QTDA 4FLTA 1NGCA 3DJCA 4B1YB 4UY8O 4OKJA 4R79A 2IGIA 1SUQA 3HM9A 3DM2A 1VQ7N 2HW3A 4KI4A 3BF3A 4OJRA 1EWQA 1W0HA 3CPWM 2GBZA 1YF5L 1WSEA 3O1WA 3OYBA 2JWLA 5AQUA 3CQ8A 1VQKN 4H5TA 1ZBLA 1L3VA 4PKIA 1NOYA 3M8QA 3O8MA 5SWMA 2FBTA 2W6LA 3SV4A 4CD1A 1QE1A 2BTFA 5J2NA 3QICA 3O4NA 4K43A 1HPZA 4BRHA 5FLXO 1KC8O 4Z4GA 2UUBK 3AO1A 4G9ZA 4LC9B 2Q0UA 3V1OA 3CI5A 4ID5A 5C15A 3KK3A 4CW7B 3IFRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1QQO A;  2E2Q A;  1O1W A;  3SUQ A;  3KWG A;  1IJJ A;  1LOT B;  4WFN L;  3RRG A;  2KTQ A;  3M1F A;  2QWN A;  2ASP A;  3SAF A;  3CC4 N;  1J5E K;  3HYF A;  3AA5 X;  3HST B;  1W7A A;  3LDL A;  1YJW N;  3R3L A;  4FLU A;  2Q3S A;  4E89 A;  4BGA A;  1S6P A;  3E9L A;  4KHN A;  1BIU A;  3H3N O;  3L2U A;  4CEA A;  1HLU A;  3V81 A;  1W2B M;  4FPB A;  2FF6 A;  5C12 A;  4IDH A;  1LWF A;  2YHB A;  4DV3 K;  1EWR A;  4TSX A;  2E1Z A;  2Z1J A;  1SL1 A;  5H1S Q;  5J2M A;  5CHI A;  3E9O A;  5C2D A;  4E7K A;  4O5B A;  2UU9 K;  3CFP A;  3SUO A;  3ID8 A;  3D45 A;  1LV5 A;  3VEW A;  4WQ5 C;  5AQY A;  1JLB A;  3DLK A;  2NRT A;  3SV3 A;  3SNN A;  3AV9 A;  3FZL A;  4B8C A;  2OPR A;  1Q86 O;  3GDQ A;  2F8S A;  3WXK A;  3OYG A;  2A40 A;  3SPZ A;  1BI4 B;  1RNH A;  4BC3 A;  4GVM A;  4O8U A;  1T05 A;  2P9L A;  1JXB A;  1RTJ A;  3CME N;  1RT1 A;  4H5W A;  4JKC A;  4PUO A;  3A5N C; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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