2P9IA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
410
structure length
393
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 131
structure length 393
sequence length 410
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iA03
3ULEA 4I6MA 3CERA 5EX5A 3O8MA 4BRCA 4F9OA 3VOVA 3VENA 5AQSA 3GE1A 1H1VA 2GWJA 4RWTA 1S22A 3MN5A 4BROA 4QS8A 5AQFA 3CQXA 4BRHA 1BO5O 5BPLA 3M1FA 4CJ7A 3A5LC 2P9IA 1C0GA 2A42A 4A62A 1SAZA 5BR9A 3VEOA 5JLFA 3C7NB 4HWIA 2CH6A 5FPEA 2YJEA 2YCHA 3WQTA 2OANA 3ZETB 2Q0RA 2VWBA 2YHXA 3A0IX 1T44A 3GL1A 1BU6O 3O5BA 5AQVA 2EWSA 4B1ZA 3B8AX 4Y0WA 1BA0A 3F9MA 3H3OB 5AQXA 1LOTB 1Y64A 1HJOA 2P9PA 1JCEA 4IJNA 1YUWA 1MWKA 2FLOA 3FE1A 4DHYA 4BRKA 3AAPA 3MN9A 4FO0A 4JAXA 1NGAA 1TUYA 3QB0A 3BUZB 3H45C 4XH4A 3ID8A 4FWMA 2YHWA 3CJ9A 4O5FA 4BVOA 2E2NA 5KQDA 1HX1A 3VERA 2E1ZA 2P9NB 2FXUA 3ZX0A 4BRNA 1ATRA 1QQNA 5AQOA 4C23A 2PAVA 3IUCA 5LJVA 4B1VA 2E2QA 3WQUA 1K8KA 2FSJA 5F0XA 2P9LA 3A5NC 2D0OA 3QFPA 3BF1A 4CBUA 3O80A 5AQKA 4DQ8A 2IVPA 3FR0A 3ZEUB 1ATNA 3CJ7A 3CQYA 3HI0A 1Z05A 4M7YA 4E1JA 5BREA 3P4IA 4ISEA 5CE3A 4WQ5C 4BRLA 4BRGA 1KAYA 5AQNA 4FWNA 4DB3A 4H5TA 1HKGA 1GLEG 3DJCA 2P9SA 2NZTA 4BR5A 5KPZA 4YDUC 1BG3A 3ENOA 3UKUB 3ZX2A 1HPMA 5E84A 5AZIA 4FWSA 3GG4A 4EHUA 1DEJA 3U8XA 1EQYA 4H0OA 4BRPA 1GLLO 2E88A 2FF3B 5FPDA 4FWKA 2PBDA 4BR7A 4IWVA 4IXCA 1E4GT 3LDQA 1JCGA 4CZMA 4PL8A 1HKBA 4B1UB 4CZIA 5AQGA 3H3NO 3RSEA 2D4WA 1D4XA 3S41A 3DXMA 5JICA 3HTVA 2NRHA 1KAXA 3VEVA 4QS9A 3WXJA 1MWMA 2QWQA 1BUPA 5AQJA 3L0QA 2F9WA 4CZHA 1HUXA 2QWOA 3IDHA 1ZC6A 4BRIA 1NGGA 3UE5A 3I8BA 1KXPA 4CZJA 4FWQA 3BEXA 1GLJO 2ZGYA 5AQZA 1TUUA 3JS6A 5F1XA 3VPZA 3D2EB 4H0TB 2Q1NA 1NGBA 1X3NA 2P9UA 4FWOA 2UYTA 3CHWA 4H5VA 4BGAA 1BWFO 4PKHA 1QZ5A 2HMPA 2F9TA 3UB5A 1ATSA 1XC3A 3KZBA 4AM7A 4NO7A 4BR4A 4CD1A 4IO8A 1XUPO 2BTFA 2E2PA 2QWPA 3FZHA 3QBWA 1YXQA 1Q18A 3VF6A 3UKRA 1U2VB 3IMXA 2ASPA 3LDNA 4K42A 3OHRA 3RSEB 1MDUB 3SMPA 2AP1A 4JHDA 4CZLA 4H0PA 4BC4A 3DXMB 1GLBG 2VCPA 3EZWA 3H1VX 5KQ8A 2FF6A 3DWLA 4K41A 2BUPA 4BR2A 4BQZA 2P9KA 4FSVA 1YVNA 2YI1A 5F2RA 5AR0A 3LDLA 3CI5A 5AQWA 3W0LA 2YJFA 4LC9B 3QICA 2QWNA 4JD2B 5JLHA 3O4WA 1HKCA 4MO4A 4EAHD 2E8AA 3SLCA 3SMSA 3TU5A 3DXKA 2J4RA 3ULEB 4I6MB 4A2AA 4CI6A 2P9UB 2IVOA 3HZ6A 4XH1A 3L4IA 1NLVA 2A41A 4BREA 5AQPA 4B9QA 1IJJA 1JCFA 1QHAA 2QWRA 4XEIA 2P9IB 3R8EA 3ATUA 1J6ZA 3LM9A 3VESA 4CBWA 2ZGZA 2I7NA 1G99A 3WUHA 5BN8A 4DCHA 3FGUA 5ELZA 3HSCA 5AZJA 1BDGA 4H0YB 4IZ9A 3FZFA 2FSNA 2FSKA 4WQ5A 1TYQA 3BF3A 3WEEA 2QXLA 3D2FA 4FWPA 3H6EA 4WQ4C 3TPQA 5LJWA 3O6WA 1V4SA 2CH5A 1NGHA 2E2OA 3L6QA 4BVPA 5AQIA 1QQOA 5FPMA 4CZFA 3CETA 3MN6A 2ZF5O 4YDUA 4CZKA 2P9KB 5JMVA 2ASOA 3O1BA 2A6AA 3WXLA 5E26A 2P9PB 3AY9A 4MLEA 1GLFO 5AQTA 3CJBA 4EHTA 5KPRA 1QQMA 4BRFA 1NGFA 1V4TA 2QWLA 4B1YB 3EL2A 3M6GA 3MMVA 4MO5A 1QZ6A 5EOYA 3A5OC 3AARA 3KVGA 2KHOA 2Q97A 4BR0A 2A3ZA 1YAGA 3JXUA 3R9PA 2Q0UA 4BRDA 4KBOA 5BPNA 3FLCO 3WXIA 4FL9A 2IIRA 3MCPA 1GLCG 1RDWX 3ENHA 3C7NA 1HLUA 2V52B 1K8KB 1RGIA 1WOQA 1ESVA 2P9LB 4L3QA 5BN9A 2ASMA 3M3ZA 4BRQA 3ZETA 1S3XA 5BRFA 4AM6A 1MA9B 4B1XB 5AQMA 3IFRA 4BG8A 5ADXH 4RCHA 2H3GX 3KHYA 1SZ2A 5EXWA 1NGJA 4FWRA 2P9SB 4H5WA 3GBTA 4BC5A 5AFUA 4H0XB 3EO3A 1DKGD 3VEXA 3GOIA 4FPAA 4CZEA 5AZIB 3U9DA 4BR9A 4ISGA 3VETA 1T6CA 3VF2A 3WXKA 5AFUH 2P9NA 2I7PA 3A8YA 3U4LA 4RTFD 2DPNA 3VEYA 3MN7A 3MK6A 3VF4A 2Q31A 3FZKA 3QDKA 2CGLA 1NGCA 5AQRA 5AQUA 2A40A 5I9EB 5BRDA 4PL7A 1T6DA 1IG8A 5AQLA 3W3DA 3ZEUA 3O08A 3BP8A 4NB4A 1SQKA 2V7ZA 4JNEA 3VGMA 4CZGA 4O8KA 2ITMA 3I33A 3FZLA 4H0VB 3VEZA 2E20A 3CJ1A 2A5XA 3H1QA 3VGKA 4H5NA 4A61A 4FWLA 1NMDA 2AA4A 1X9JA 4H03B 5BPMA 3EKSA 3FFKB 4J8FA 2V51B 4BC2A 4MLHA 4CBXA 2HF3A 3EN9A 5EY4A 3UKUA 3CJAA 3O1WA 1WUAA 5AQQA 1ZBSA 1GLDG 2Q36A 3HM8A 1C0FA 2QM1A 2GEMA 3LDPA 3HBTA 1NGDA 4BQLA 1CZAN 4PKGA 3LL3A 5BRHA 3DAWA 4Z94A 1BOTO 1X3MA 2D0PA 2HOEA 4K43A 3SJHA 3QFUA 4H5RA 2QWMA 3CIPA 2IVNA 3A5MC 3D7EO 3FZMA 3ATVA 2HF4A 3UKRB 5KPTA 5B8HA 4XH5A 1NBWA 3U9ZA 1U6ZA 2Q2RA 3LM2A 1R59O 4JHDB 4FOIA 3CJCA 1DGKN 3D2EA 2GUPA 3C0BA 4K25A 4A2BA 1BA1A 3VGLA 2CGKA 4PKIA 5FPNA 1OKJA 5EVZA 5TKYA 1Z6RA 4BRMA 4BC3A 2ZWHA 4WQ4A 1NGEA 2E1YA 2GTDA 1XQSC 4EFHA 2VYPA 3VEWA 2NLXA 3GDQA 1RFQA 2QW9A 3DXKB 3WT0A 2D1KA 4B1WB 3G25A 4GNIA 4QS7A 1ZXOA 4EIAA 1NWKA 5ADXA 1U2VA 2CGJA 1LCUA 4HTLA 4JN4A 3SK3A 5AQYA 2YHYA 3AAQA 3H46O 2W41A 1P8ZA 4FPBA 3ZX3A 3MDQA 2V7YA 1E4FT 4FOEA 1GLAG 4GY2B 3LDOA 3J8AA 4CD3A 2W40A 4M63C 3QMLA 1NM1A 4JD2A 5AZJB 4BRAA 2GELA 2GWKA 5AQHA 3EKUA 1TYQB 3WEEB 3QBXA 3R6MA 4IJAA 4M7XA 4WYBA 4BG9A 1NGIA 3D2FB 2WUSA 4ISFA 5LY3A 4BGBA 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DR5K 4Z4FA 4F9OA 3VOVA 3VENA 5AQSA 3PIOL 1IO2A 3KLGA 3V9SA 2R7YA 4YOXA 1TAUA 3DYAA 4DWIA 3I55N 5BR9A 1N6QA 1IBKK 1YJWN 3VEOA 2HHIA 4DU4A 3IKMA 4ILHA 2CH6A 3WNEA 3NH0A 2ETJA 3E1YA 4OPHA 1XHZA 2DY4A 1BQNA 3O5BA 1VSHA 3SPZA 4Y0WA 1BA0A 3H3OB 4CERA 2O8EA 3TR8A 1MWKA 3FE1A 1Q8IA 4R5PA 4BRKA 3AAPA 1T03A 4FO0A 4JAXA 1NGAA 1Y97A 4XH4A 1QE1A 1S1WA 4RW7A 3OYJA 1S6QA 4BVOA 5KQDA 3VERA 4CGGA 3VMFB 4DV5K 3PX6A 3K58A 5GAGP 5AQOA 2FSJA 5F0XA 3A5NC 2D0OA 1HNXK 1QSYA 4KAZA 1A5WA 1W0HA 4YOTA 2OPSA 3FR0A 3CQYA 3HI0A 1Z05A 4M7YA 3T19A 4E1JA 4ISEA 4BRLA 4FWNA 4DB3A 2NRRA 3E9OA 4OPAA 2NZTA 5C2FA 4DV1K 2E6MA 1C1BA 1QSLA 3CC2N 4CJLA 1A5XA 3E01A 3HPHA 3WNHA 2XO7A 3ZX2A 1HPMA 4BE1A 4CF1A 1BL3A 4AHRA 5C2DA 4C8NA 2ZE2A 1NK4A 5FPDA 1BGXT 3J7ZO 4DR7K 5KGWA 4B9LA 2PBDA 4BR7A 4IWVA 4DFJA 4B3OA 1WBBA 4NLBA 3THVA 3CCSN 4OJRA 4X65K 4CEZA 2FBVA 3TAMA 5AQGA 3RSEA 1U45A 1S9GA 3O9RA 3MX2A 2OPRA 1MWMA 4CFCA 4LSNA 3ALYA 3ENBA 2QWQA 2B4JA 4CZHA 1HUXA 2G8KA 3IDHA 1EKEA 3M8RA 3VQ9A 3Q7CA 3I8BA 1VSKA 3F73A 3RWUA 3O4NA 3OYKA 4C8LA 3BEXA 1GLJO 5AQZA 2O8FB 1B9DA 1TUUA 3JS6A 1RTDA 3VPZA 2HVHA 5C10A 4DLEA 3DOKA 1W7AA 3OYBA 4N56A 4DQQA 2IAJA 4BGAA 2DFFA 3OYDA 4E19A 1QZ5A 3JAMO 1NKBA 1XC3A 1ITGA 4AM7A 4BR4A 3RR7A 1XUPO 1IV0A 2BTFA 1YF5L 2QWPA 3FZHA 3QBWA 1OH6A 4DR6K 2BH1A 1U04A 4M3WA 3R1XA 3LDNA 1C1AA 2RN2A 4CZLA 1GLBG 2VCPA 4FXDA 1NKCA 3T3FA 3RMAA 2YNHA 5AQWA 1KVAA 2HW3A 1MU2A 3RMBA 4LC9B 2ZQBA 2XRIA 1GOCA 4MO4A 4EAHD 3TAPA 4CK3A 3K0SA 1TK0A 1QVFM 3KK1A 1JLBA 3ZCMA 2P5OA 4JV5K 1SL0A 1QVGM 2IVOA 4X62K 3U6FA 4XH1A 4CEOA 2XY6A 1HNIA 3CMEN 4IOXA 4IKFA 3D45A 3SBGA 4FM2A 4IDKA 4E7HA 2P51A 1IJJA 4B8CA 1P90A 3K59A 4Z4HA 3ATUA 2QXFA 3LM9A 3TAEA 1HNVA 1T3VA 3WUHA 3VA0A 4PY5A 3NCIA 4DCHA 3HSCA 3NH1A 1CXUA 5AZJA 1BDGA 3OYAA 4FJNA 3WEEA 3P38A 2QXLA 1SKWA 3D2FA 3AA3A 4FWPA 3H6EA 5LJWA 3O6WA 2E2OA 3OYMA 1NGHA 1VQON 3V9ZA 1QQOA 2D0AA 2O8EB 2P9KB 2ASOA 3O1BA 2A6AA 4C8MA 5E26A 4DTPA 3CJBA 3VQ8A 3NF6A 2E5LK 3MMVA 4MO5A 1QZ6A 1Q86O 2JLEA 4DR2K 4X64K 4KREA 4BRDA 3FLCO 3I0RA 2KQ2A 4FL9A 3KTQA 3ENHA 3C7NA 3OS2A 3VQQA 4E7LA 4RW9A 1NJWA 3M3ZA 1VAZA 4LFBK 5GIPA 4O44A 1EXQA 5BRFA 3CC7N 4N47A 1N33K 3WNFA 3M8PA 1B92A 4RCHA 3KHYA 5D3GA 1NGJA 1BIUA 1R0AA 3GBTA 1Z26A 1UAXA 3EO3A 3EYZA 4CZEA 3GOIA 3KKSA 5C25A 5C15A 2VG6A 4BR9A 1SUQA 3AGRA 2I7PA 3A8YA 3U4LA 4N76A 3ZT4A 3MK6A 4IFEA 4OKKA 4WFNL 4DSKA 5AQRA 3AVCA 5AQUA 3PY8A 4N5SA 4B9TA 2HVIA 1HMVA 2KTQA 4PL7A 3BDPA 4WFBL 2QKKA 4CECA 2F96A 4R79A 4XIUA 2ITMA 4JKBA 2ZJQL 4TSXA 1I94K 4DTOA 4DTRA 2PYLA 1TKTA 1NMDA 1X9JA 4CHYA 1QS4A 2QEXN 4RW4A 3FFKB 4DLGA 4F4KA 1NK9A 4DSLA 2HSTA 4DU1A 3EN9A 4HUGA 1JXBA 3LZJA 4JK8A 3VN5A 3PX4A 3O1WA 1FKOA 3TTDA 2NRZA 1HYZA 2Q36A 3KIOA 1T8EA 2IS3A 1NGDA 3K5OA 3H08A 4DU3A 2RPIA 1OH8A 3SQ4A 1SKSA 3CFOA 4FW2A 1NKEA 3AO4A 3LL3A 2X6NA 1TL3A 3L4QA 4Z94A 3ZSVA 1X3MA 1T05A 2BDPA 4ELTA 4K43A 3QFUA 4E0DA 1CXQA 4ELUA 3VQ7A 3FZMA 2OYQA 1K8AO 4H4MA 5CYMA 4JKDA 4KI4A 3T1YK 4E1NA 2HHSA 1U6ZA 3LM2A 4DKWA 4FOIA 3QEWA 3O9UA 1F21A 4K25A 1BA1A 3M8SA 4JKCA 3CYMA 5TKYA 4WCEL 2GTDA 4EFHA 2VYPA 3VEWA 2O8CA 1HPZA 2QW9A 3NE6A 5HROA 3SNNA 3S3NA 2WONA 2G8IA 4OGCA 4B1WB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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