2P9IA

Crystal structure of bovine arp2/3 complex co-crystallized with adp and crosslinked with gluteraldehyde
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
410
structure length
393
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin-like protein 3
molecule tags Structural protein
source organism Bos taurus
total genus 131
structure length 393
sequence length 410
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9iA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9iA03
4HWIA 3VF2A 2A41A 4FWPA 4FWRA 4BRFA 1BDGA 4A2AA 3BF1A 2GEMA 2ZGZA 5BREA 2YHYA 3H3NO 3VF6A 2CGKA 3A5OC 3DXMA 1BOTO 3VERA 4A2BA 3ENOA 4IO8A 4J8FA 4CZFA 4CZHA 4WQ5C 5CE3A 2FF3B 4BVPA 2P9KB 4O8KA 3SMPA 1V4TA 3HSCA 2VWBA 1U6ZA 4BVOA 4FO0A 3BEXA 3D2FA 3FZLA 4AM6A 5KPTA 3A5MC 2F9TA 2KHOA 4Y0WA 3RSEB 2IIRA 1NWKA 2D4WA 4XH1A 4B1YB 4WQ4C 5BRFA 2P9PB 4YDUC 5F1XA 2ZGYA 4BR2A 1TYQA 2NLXA 1Q18A 4H0YB 4BRDA 2P9NB 4K41A 3WXKA 2IVNA 3O1WA 1C0GA 1XC3A 4CZMA 4H03B 3B8AX 2E2NA 3A0IX 3AAPA 4BG8A 3P4IA 5BPMA 3KHYA 2Q0RA 4CZLA 1K8KA 4CBXA 4WQ5A 2FSKA 1QQNA 3IFRA 4JD2A 3ATUA 3SLCA 2D0OA 1BA1A 2YJEA 2A5XA 5AQJA 2W41A 1KAYA 5AFUA 3WXLA 4GY2B 4FWQA 1X3MA 3R6MA 3VPZA 3AARA 3WEEA 3J8AA 4WQ4A 3UE5A 1T6CA 1RDWX 2EWSA 3M3ZA 4YDUA 3MN5A 2HF4A 2A40A 4CD1A 4IWVA 4BC3A 4BC4A 2I7NA 4EFHA 1ESVA 1WOQA 4BR4A 1NLVA 4QS9A 1HKGA 1E4GT 5KPZA 5JICA 5LY3A 4JNEA 3SMSA 1BO5O 4WYBA 5FPDA 3D2EA 4RCHA 5BRHA 3LM9A 4JN4A 3EKUA 5E84A 3ZETB 4BRAA 3O8MA 4XEIA 1E4FT 2QWQA 3GG4A 3H3OB 4IZ9A 3EKSA 4BRIA 4CZIA 2E2PA 1ZXOA 3L0QA 3LDQA 4XH5A 3UKUB 5BR9A 2VYPA 2E2QA 3MDQA 1HPMA 2FSJA 4K42A 2J4RA 3O80A 4CZKA 2IVPA 3A5LC 3WUHA 4DQ8A 1DGKN 5AQKA 3O4WA 3DXKA 5LJWA 1QQMA 2PBDA 3FZKA 4CBUA 1LCUA 2CGJA 3D7EO 3FZFA 3GDQA 3I8BA 3QB0A 1T6DA 3L4IA 4KBOA 2Q31A 1QHAA 3U8XA 4H0VB 4H5TA 1YUWA 3I33A 3MN7A 3QBWA 1X9JA 4CJ7A 4BRKA 3DJCA 3RSEA 2YHXA 2P9PA 4I6MB 3M6GA 2FSNA 3QFUA 1J6ZA 1ZBSA 1XQSC 3HM8A 5AQIA 3MN6A 2P9IB 2P9UB 1GLLO 4FWMA 3ULEB 3CJBA 3ZX3A 3U4LA 3O08A 3IUCA 3VF4A 4JHDA 5AQOA 3VEZA 4BRGA 2GWKA 2HMPA 4O5FA 4B1ZA 5AQWA 3EO3A 3VEWA 3A8YA 3C7NB 1NGDA 3VGKA 5BRDA 1Z05A 1TUYA 1R59O 2F9WA 5AQZA 4MLEA 2BTFA 1H1VA 4BRPA 4BR7A 3H46O 2ASOA 1HKBA 3CERA 1NGEA 3UKRB 4DCHA 2NZTA 4FWOA 3AAQA 5TKYA 1BUPA 3M1FA 4M7YA 3JXUA 3U9ZA 3R8EA 1HKCA 3CJ7A 3QBXA 4B1WB 3WXIA 1GLJO 1DKGD 3CJ1A 3CQYA 1S22A 4L3QA 2Q1NA 1NMDA 2Q36A 4A61A 5F0XA 3SK3A 2A3ZA 3HI0A 2NRHA 4NB4A 4BC5A 1NGCA 1LOTB 5AQPA 1NGFA 3FR0A 4MO4A 5AQYA 1ATRA 1NGHA 1NGGA 2VCPA 3KVGA 3ZETA 3CHWA 1NM1A 1YVNA 1Y64A 4BGBA 2ASMA 1U2VA 3ZX2A 3UKUA 3EL2A 4BC2A 4IXCA 1TYQB 2E8AA 4CD3A 4FWKA 5AQSA 1JCEA 5AQNA 4PL8A 2QWPA 1YAGA 3VGLA 2QWRA 4FL9A 1KAZA 3WQTA 2H3GX 2YI1A 4PKHA 4NO7A 4GNIA 4PKGA 2QW9A 4IJAA 4CI6A 4BRLA 4FWNA 3VEVA 5BN8A 5AZJB 4RWTA 4H5NA 3HBTA 1K8KB 2QM1A 2Q97A 4H0PA 4EHTA 4I6MA 2QXLA 2E1YA 1GLAG 4H0OA 2V7YA 3ZX0A 3TPQA 1GLDG 4PL7A 2P9IA 2P9UA 5AQQA 4BRHA 4H5VA 3ULEA 4ISFA 3QDKA 1HLUA 1P8ZA 2I7PA 3CJ9A 3CJCA 3F9MA 5FPNA 1T44A 3L6QA 3BUZB 2P9KA 3VETA 1NBWA 3R9PA 4K25A 4FWSA 4EIAA 4A62A 1X3NA 2V51B 4H5WA 1HUXA 4CBWA 4IJNA 1KXPA 5FPMA 5ADXH 2HF3A 1NGAA 3C7NA 4BRMA 2BUPA 2V52B 3VEOA 4M7XA 1MWKA 1GLBG 1MDUB 4PKIA 1MA9B 2GTDA 2OANA 5AQMA 3DAWA 2GUPA 2P9LB 2YHWA 4F9OA 5I9EB 1ZC6A 2P9NA 2IVOA 5AZIB 3LM2A 1YXQA 2GELA 4E1JA 1EQYA 5B8HA 4FWLA 5AQUA 3DWLA 4BQZA 5JLFA 3IDHA 4MLHA 4B1UB 4M63C 5AQRA 1DEJA 3LL3A 3U9DA 2P9SB 2V7ZA 3H6EA 3W3DA 1BA0A 4B1VA 3CJAA 4AM7A 3EN9A 3UB5A 4FPBA 5EVZA 4XH4A 2AP1A 3DXKB 5AQHA 4H5RA 1TUUA 5AQVA 3C0BA 3KZBA 4BGAA 4BR9A 3LDNA 2FF6A 2CH5A 5AFUH 2YCHA 1JCFA 1ATSA 5EOYA 3ATVA 4B1XB 3QICA 4RTFD 3VENA 4H0TB 3ZEUB 4EHUA 5AQGA 2A6AA 2UYTA 5ADXA 1C0FA 2FXUA 1IJJA 2ZWHA 2WUSA 3FE1A 5AQTA 4FPAA 5ELZA 4BREA 1RFQA 2Q2RA 3H1QA 3G25A 1XUPO 1BU6O 5AQXA 5FPEA 3DXMB 2ZF5O 3FFKB 4HTLA 5KQDA 1Z6RA 5KPRA 3FLCO 2E1ZA 1CZAN 1HX1A 3BF3A 4H0XB 3W0LA 4Z94A 2QWNA 4JHDB 2YJFA 3D2FB 2E20A 5AZJA 5KQ8A 1OKJA 4MO5A 3QMLA 5BPNA 2W40A 3CI5A 2CGLA 4BQLA 3MMVA 2Q0UA 3VESA 4BG9A 4QS7A 4K43A 5F2RA 4EAHD 1SAZA 5BN9A 4ISGA 4CZEA 4BRCA 4FSVA 4QS8A 4BROA 3O1BA 2HOEA 1QZ5A 1WUAA 3AY9A 2FLOA 1S3XA 3WXJA 4LC9B 5JLHA 5BPLA 4JAXA 2DPNA 3FZHA 2PAVA 1IG8A 2A42A 3LDOA 3GOIA 3CQXA 3JS6A 3VEYA 3H45C 3LDPA 3MCPA 3O5BA 2D1KA 4BR5A 3GBTA 4JD2B 3S41A 1SZ2A 1RGIA 4FOEA 3ID8A 5E26A 1QZ6A 1G99A 4BRQA 1KAXA 2P9LA 3CIPA 3ENHA 3HTVA 5AQLA 5EX5A 4BRNA 3GL1A 4DB3A 3FGUA 3WT0A 5LJVA 5AZIA 3WEEB 2E2OA 5JMVA 1GLCG 2ITMA 5AR0A 4ISEA 3VEXA 4FOIA 2QWLA 5EY4A 2QWOA 2E88A 3A5NC 3OHRA 1MWMA 1BWFO 2D0PA 2P9SA 1NGBA 2ASPA 3MN9A 4BR0A 3O6WA 4CZGA 1GLFO 1U2VB 1JCGA 1NGJA 3EZWA 5EXWA 4CZJA 2GWJA 5AQFA 3SJHA 3CETA 3FZMA 1GLEG 2AA4A 4C23A 4B9QA 2QWMA 3LDLA 1V4SA 3VOVA 1QQOA 2CH6A 3HZ6A 3IMXA 3WQUA 3UKRA 1ATNA 3H1VX 1D4XA 3D2EB 1HJOA 1SQKA 3TU5A 1NGIA 3VGMA 3ZEUA 3MK6A 3QFPA 3GE1A 1BG3A 3BP8A 4DHYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AH9A 3ZSVA 3MX2A 1UOCA 4IFYA 1ZBHA 4BDYA 2E6MA 3VF6A 3A5OC 4DQSA 3PIOL 4I9LA 1S9EA 4ZHRA 3ZCMA 2BGGA 3AVIA 3O9RA 2P9KB 2VGMA 2RHKA 4Q0BA 4CECA 3TAMA 3L2QA 4XJXA 4AM6A 5KPTA 3G4SN 3A5MC 1LWFA 4CEQA 4XH1A 4B1YB 3AO3A 3VA0A 4KI6A 3KIOA 3CCJN 2ZGYA 4BR2A 2NLXA 1Q18A 4H0YB 1XHZA 4BRDA 4DTMA 1RDBA 4LH5A 4DTRA 4CJFA 3SQ1A 4KPYA 2UUCK 5H1SQ 4CZMA 1A5VA 1L3SA 5JVGL 4H03B 3A0IX 4JYAK 1WLJA 3OY9A 4ELTA 4FLXA 1K8KA 1TGOA 3ATUA 3CPWM 1X9MA 3LP2A 4ILGB 2QA4N 2UUAK 4IEIA 2UU9K 1VSDA 3WXLA 5CHIA 3UE5A 3M3ZA 4RW6A 1B9FA 1NG9A 3VQQA 3ZSXA 4DTUA 2HF4A 4CD1A 1SL0A 4IWVA 4BC3A 1TK0A 2I7NA 4EFHA 4GW6A 1T7PA 3Q7BA 4CERA 3VMFB 2VGNA 4C8NA 1E4GT 5KPZA 2HNDA 5LY3A 3NH1A 4NLCA 1SKWA 4OPKA 2YX6A 2HHWA 2OPQA 4DQQA 2WC9A 3ZYYX 3CYMA 3ZETB 4F4KA 5GAHP 1C1CA 4BRAA 1EKEA 3PV8A 2QWQA 3GG4A 5BR9A 1ZXOA 5A2QO 3LDQA 2D0AA 2YNFA 3UKUB 4JV5K 1QSSA 4DV0K 5C15A 4DV7K 4ILHA 3PX6A 2HHTA 5AQKA 3BY5A 3O4WA 3DXKA 1L3TA 1QQMA 3FZKA 4CBUA 3D7EO 1OH8A 1S1WA 3KJVA 4EZ6A 3GDQA 2ITGA 4BDZA 3J7YP 4H0VB 4IEEA 2Y1JA 3I33A 3MN7A 4PY5A 1SUQA 4CJ7A 4BRKA 1JLAA 3U6FA 3DJCA 4Z4FA 3OS1A 4I6MB 3NGYA 3OBWA 4HUGA 1J6ZA 1XQSC 4NXNK 4CGDA 2GUIA 3EE9A 3ULEB 5HLFA 3ZX3A 1KLMA 1S72N 4CF0A 1QTMA 3CYGA 4KHYA 4KI4A 1NKCA 3VF4A 2Z1HA 3LAMA 4N41A 1C0TA 3LPUA 4B8CA 5SZTA 2HNYA 1S6QA 3ZT0A 1BQNA 3EO3A 3S5TA 2PYLA 3VQBA 1NGDA 3HYFA 3V1QA 1LW2A 1W9HA 3AVBA 4FLVA 1R59O 2HBLA 2F9WA 3VQ4A 1H1VA 4DSIA 5M1NA 2BANA 4KHSA 1HKBA 4DLEA 2IC3A 4OVLA 4DCHA 2NZTA 4FWOA 3AAQA 3EE8A 3HVRA 3M1FA 3OW2M 5C10A 3JXUA 3U9ZA 3R8EA 4O44A 4B1WB 4JKEA 2YKNA 3SV4A 4DR5K 3V4IA 4I9QA 4KTQA 1DKGD 1J5OA 2GV9A 2D0CA 2F96A 2OPRA 3MCAB 2Q36A 3HI0A 4NB4A 1NGCA 1LOTB 1VK0A 4HUEA 5M1QA 4MQ3A 2DY4A 4BECA 3CMEN 1NK8A 3SAFA 1KCFA 1WSJA 4L8RB 3ZETA 1XHXA 3TAEA 1WB9A 4DSJA 5D3GA 1YVNA 1WSEA 4BWJA 3OYGA 2WTUA 1DTTA 1EP4A 3KLGA 4IOAL 3TAQA 4HHTA 1T3VA 3UKUA 5HRPA 3HXMA 3RR7A 3AVLA 4CD3A 3CM6A 1JCEA 1HMVA 5AQNA 3U3YA 1OH7A 1C6VA 5DM6L 4K8ZA 1HRHA 3LP3A 3WQTA 4GVMA 4NO7A 4CF2A 3BDPA 4GNIA 4RG8A 2VG5A 2QW9A 4BRLA 3V9UA 5J2PA 2VWJA 1RDDA 3VEVA 5AZJB 3A2FA 1VSIA 4JK8A 3HBTA 4AHVA 1U49A 3SZ2A 4I6MA 3SUPA 2E1YA 1GLAG 4IO9L 4DS5A 3K0SA 1JLBA 4JKHA 2KZMA 4BRHA 3ULEA 4ZTJA 2I7PA 1VQON 2KW4A 4N5SA 1GOAA 1DLOA 3VETA 1BL3A 4CIEA 3AVKA 3QERA 4CF8A 3N4PA 2V51B 1HUXA 1NGAA 2BUPA 2V52B 4WE1A 3VEOA 2DTUA 3OBYA 1GLBG 2FBYA 3K2PA 2GTDA 5AQMA 3ASMA 5I9EB 3CQ8A 1ZC6A 1N36K 2IVOA 5AZIB 2GELA 5B8HA 3T3FA 1FKPA 3C95A 3K5OA 5JLFA 1E3MA 3O3HA 4CHQA 4YOVA 3RRGA 4NYFA 2V7ZA 4M3RA 4B1VA 4AM7A 1BIUA 3UB5A 3SQ0A 5KRTA 4FZXC 5EVZA 5GADP 4XH4A 1VQNN 2NUBA 2GX9A 1TUUA 1K73O 1JXBA 4BR9A 4CHNA 4DSLA 2JWLA 2YCHA 1CLQA 1ASWA 4B1XB 5EOYA 3ATVA 4PUOA 3ZEUB 4W5OA 2YHAA 5ADXA 4IOCL 3RMBA 3CCEN 3CD6N 5ELZA 1RFQA 3SV3A 1BU6O 2G8IA 4FLWA 2B5JA 3TTFA 2C1GA 1Q9XA 3T1YK 2R7YA 5I3UA 1FK9A 3TARA 3W0LA 4H0XB 1VSLA 1HNVA 2HW3A 4M41A 2VQFK 3D2FB 1K8AO 5AZJA 2UXBK 3LDSA 4RW4A 2X78A 2FBVA 4FW2A 2QKKA 4BQLA 3G71N 2KTQA 3MMVA 4JKCA 4E72A 4GKKK 3VESA 4BG9A 4K43A 1HR0K 4EAHD 5CZ2A 1SAZA 4M3ZA 5M1PA 3VQCA 4FCYA 3O1BA 2HOEA 4HCCA 1HPZA 1YIJN 2LSNA 3VQAA 2FLOA 3U3GA 3NH0A 4YOYA 4LFAK 2Z1JA 2OA8A 3RR8A 3FZHA 3L2UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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