4IO8A

Crystal structure of human hsp70 complexed with 4-{(2r,3s,4r)-5-[(r)-6-amino-8-(3,4-dichloro-benzylamino)-purin-9-yl]-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethoxymethyl}-benzonitrile
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGDTKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional analysis of hsp70 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A variant
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4io8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4io8A04
2IVOA 1SQKA 1R59O 1YXQA 2V51B 3HTVA 4B1VA 4H0VB 3CJCA 4BROA 1QHAA 3CQXA 1BO5O 2I7NA 4HWIA 4H5RA 2Q36A 3BF3A 3HZ6A 3ENHA 4BRHA 4QS9A 3LDNA 2P9IB 4CBUA 2FSKA 4I6MA 4BRLA 2E2NA 3ATUA 4H5TA 3KZBA 3IMXA 1GLCG 3OHRA 5AQVA 4BQLA 1NGFA 5BPMA 1U2VA 1ZXOA 5AQHA 4PL8A 3FLCO 3ZX0A 3A5LC 4BR5A 3DJCA 5BPLA 4H0YB 3C7NA 2P9SB 2E8AA 1OKJA 3VEZA 3VEVA 2CGJA 5BN8A 3HBTA 2QWRA 4BRPA 3U9ZA 3D7EO 3CJAA 4FWKA 5FPDA 5EOYA 1HLUA 4EIAA 1J6ZA 3BF1A 4DCHA 3ATVA 4YDUC 4MLEA 3UKRA 1D4XA 2NLXA 5BRFA 4BC5A 3TPQA 4O5FA 4DB3A 5AZJB 3IDHA 2PAVA 4K43A 2P9NA 2NZTA 1X3MA 1U2VB 2FSNA 2J4RA 2CH5A 3QFUA 3U8XA 4CBWA 2YCHA 4XH5A 3WEEA 4FSVA 3C7NB 3LDOA 3CJBA 1U6ZA 5AQTA 1GLLO 3BP8A 3H6EA 3O08A 3WQTA 4A2BA 3H46O 1X3NA 1YVNA 5AQLA 3WQUA 1NGEA 4CZKA 2YHWA 3CQYA 5F0XA 3ZEUA 5AQUA 1GLFO 1GLJO 4CZLA 2QWMA 1IG8A 3UKRB 4CJ7A 1TUUA 2D0OA 5AZIA 2FLOA 1GLBG 3VF4A 2ASMA 1E4FT 1MDUB 3EO3A 2D4WA 3H1VX 2PBDA 3M3ZA 4CD1A 1NM1A 2HOEA 3DWLA 2IVNA 1HX1A 4WQ5A 3GL1A 1E4GT 4BRMA 3VESA 5EX5A 1T44A 1WUAA 1NGJA 3WEEB 2AA4A 3L6QA 3ID8A 3J8AA 3SMPA 4CZIA 1Z05A 4CBXA 4FWSA 3LDPA 3LDLA 4NO7A 5AQMA 5AQYA 1H1VA 4Y0WA 3FR0A 3ZX2A 1T6DA 2UYTA 4B1ZA 3ZEUB 4FPAA 3FZFA 4BC2A 5AQRA 1NMDA 5AZIB 1EQYA 3RSEA 4EHUA 4BC3A 1BU6O 3KVGA 4L3QA 2QWLA 3VGKA 4FWQA 1S22A 1XQSC 4K42A 3EZWA 2EWSA 2D0PA 5FPNA 3SJHA 3FZHA 3QICA 1V4SA 1ATRA 3FE1A 1MWMA 4WQ4A 5AQIA 4AM7A 1MA9B 1GLEG 1NGIA 1QQMA 5AFUH 4BRDA 3FZMA 3VGMA 3EN9A 3B8AX 3VOVA 3A5NC 2KHOA 1NGGA 5AFUA 4XH1A 5AZJA 4B1WB 2V52B 2D1KA 1BUPA 1RDWX 3O5BA 4IZ9A 3EKUA 3RSEB 3H3OB 5JLHA 3CJ1A 3I33A 2QWQA 2Q0RA 4K41A 3WXIA 2BUPA 2AP1A 3HI0A 3L4IA 3IFRA 2V7YA 2Q97A 4H5WA 3P4IA 5BR9A 3ZETB 1HJOA 4BRIA 2A6AA 3VF2A 2CGLA 1HKBA 4LC9B 3UB5A 5BN9A 3CIPA 1JCFA 2E2QA 4QS8A 5AQGA 3TU5A 1YAGA 2A40A 1ATSA 3BEXA 3C0BA 4FOIA 1NGAA 4M63C 1QQOA 3R6MA 2GWJA 1SZ2A 1K8KB 3GBTA 3LL3A 4H5VA 4B1XB 1Y64A 2Q1NA 3AARA 4BRQA 5AR0A 3W3DA 4WQ5C 2QWNA 3CETA 3ZX3A 4BR7A 5AQKA 5JLFA 1IJJA 3O4WA 1JCEA 1CZAN 4A62A 5AQNA 2YJFA 3VEOA 1Z6RA 5EXWA 2E2OA 3UKUA 3MCPA 3A0IX 5BPNA 2YJEA 4JHDB 2GWKA 4BREA 2DPNA 3M1FA 4BRGA 3FFKB 5TKYA 3VPZA 2W40A 4MO4A 3A5OC 2Q2RA 3DXKB 2A5XA 3VETA 1BA0A 4JD2A 4H0PA 4WYBA 2F9TA 5F1XA 2QXLA 2FF3B 3JXUA 4PKGA 2ZGYA 4EFHA 4E1JA 1T6CA 4BC4A 2F9WA 5BRHA 4RCHA 1Q18A 4FWLA 2A41A 4BG9A 2E88A 3MN6A 2ITMA 1QZ5A 1BA1A 5AQFA 2A3ZA 3VERA 2IVPA 1HKGA 4B1YB 3UKUB 3U9DA 5KPTA 2P9LA 4JAXA 2GUPA 5JICA 3CHWA 3CERA 4F9OA 3ULEA 3AAPA 4AM6A 4C23A 4O8KA 4H0TB 1TYQA 5JMVA 3D2FA 2CH6A 4CZMA 3GG4A 5ADXH 1NGBA 4KBOA 3VEXA 4QS7A 5FPEA 1NBWA 4J8FA 2ZF5O 4EHTA 2E20A 3MMVA 4H03B 2P9KB 5ADXA 4JD2B 1C0FA 3GOIA 4JN4A 3QBWA 2GELA 4BR9A 4CI6A 4EAHD 4BRAA 2FXUA 4ISEA 3H3NO 5KPZA 5B8HA 5AQSA 3EKSA 1NGHA 2I7PA 3VGLA 1XC3A 5AQJA 3ZETA 3VEWA 4CZFA 1XUPO 5KQDA 3H1QA 4H0OA 4NB4A 2BTFA 3UE5A 4IJAA 2P9LB 2P9UA 1ZC6A 4M7YA 4CZGA 1DEJA 3ULEB 3GE1A 4FWRA 4BVPA 1GLDG 4IWVA 1K8KA 5AQXA 1TYQB 5AQWA 3D2FB 1BOTO 1MWKA 3IUCA 3SK3A 5FPMA 3MDQA 3FGUA 4FWMA 4XEIA 4BR0A 4FWOA 4IXCA 4BGBA 2WUSA 4PL7A 1RGIA 4DQ8A 4Z94A 3O8MA 4XH4A 3S41A 3WXJA 4BR2A 1NWKA 1KAYA 2ASOA 3I8BA 3BUZB 1X9JA 4FO0A 4MO5A 3A8YA 3SMSA 2NRHA 4PKHA 3SLCA 3CI5A 3L0QA 4JHDA 1ATNA 1NGCA 3CJ9A 1HUXA 4BRNA 5CE3A 2W41A 3FZKA 3U4LA 3DXKA 2P9UB 2GTDA 3O6WA 3H45C 5LY3A 4A61A 1QZ6A 1LOTB 3A5MC 1NGDA 2QWOA 2YI1A 1S3XA 1C0GA 1ZBSA 4IO8A 2YHYA 2HF4A 4CZHA 4MLHA 3HSCA 3O80A 4K25A 4DHYA 2E1ZA 4JNEA 4FOEA 4FWNA 2ASPA 2FF6A 2IIRA 2P9PA 2VYPA 2QWPA 3HM8A 3LM9A 4BR4A 2A42A 1QQNA 2QW9A 3MN7A 1BWFO 3WXKA 3D2EA 2VCPA 3VEYA 1JCGA 1GLAG 1KXPA 3LM2A 3JS6A 4I6MB 4FWPA 3VF6A 2FSJA 4CD3A 3DXMA 5AQOA 2P9KA 3KHYA 3MK6A 5BRDA 4RTFD 3W0LA 4BRCA 3GDQA 4GY2B 4BRKA 4FPBA 3F9MA 5F2RA 1DKGD 3QB0A 2ZWHA 3M6GA 4BRFA 5I9EB 4H5NA 1V4TA 3O1WA 4GNIA 3G25A 3R9PA 2CGKA 3QBXA 3WUHA 3EL2A 3LDQA 5EY4A 5E26A 5LJVA 1WOQA 3O1BA 5LJWA 2P9PB 4ISGA 4PKIA 4WQ4C 4BVOA 1DGKN 1P8ZA 4YDUA 1SAZA 2HF3A 5AQZA 3D2EB 4HTLA 1KAZA 4M7XA 2VWBA 4ISFA 1BG3A 4IJNA 3QDKA 3DXMB 3QFPA 2P9NB 4CZEA 1TUYA 2V7ZA 1BDGA 5E84A 1LCUA 4BGAA 3VENA 4H0XB 2ZGZA 2Q31A 2E2PA 2YHXA 4RWTA 3MN9A 3WT0A 2P9IA 1HPMA 4A2AA 1YUWA 2Q0UA 3R8EA 5AQQA 4BG8A 5KPRA 5AQPA 1NLVA 2OANA 5ELZA 3DAWA 1G99A 3WXLA 3CJ7A 1RFQA 3ENOA 4BQZA 5KQ8A 2H3GX 2E1YA 3MN5A 4B1UB 5EVZA 2HMPA 3AY9A 4B9QA 5BREA 2GEMA 1ESVA 3FZLA 2P9SA 2QM1A 1KAXA 3AAQA 3QMLA 4CZJA 1HKCA 4FL9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RE2A 3BY5A 1NMNA 3HTVA 4B1VA 1U4BA 3PX4A 2OTJN 5E41A 4FZYA 3CQXA 1B92A 1RTIA 5HRPA 4HWIA 4CK1A 1EO1A 3HZ6A 2KGQA 4FK4A 4QS9A 4OKJA 1CXUA 3V1OA 4I6MA 3JSMA 2VG6A 4NXNK 2E2NA 1SKRA 5M1OA 4Y1DA 5C10A 1JL1A 5AQVA 4FJHA 1S6QA 4RW4A 3H08A 3K5NA 5AQHA 4PL8A 3VQDA 3DJCA 4CIFA 4ID5A 3C7NA 2LT8A 2CGJA 3HBTA 4Y1CA 4CJVA 3GKUA 4CJ4A 4FWKA 3AVAA 2VQEK 1T7EA 4CIEA 2E5LK 4CGGA 3WXMB 3SQ0A 3E9OA 3OS2A 1OH5A 2KTQA 4KH6A 4CVNE 3B6PA 2NY8X 3IRXA 4O4GA 3TPQA 5TKWA 4CE9A 4DU4A 4DB3A 4F2RA 3CCSN 3N4PA 3SV4A 2YC1C 5C24A 2P9NA 1U48A 1DTQA 2GMOA 1U2VB 4CFDA 4FJ7A 2CH5A 2OPSA 3QFUA 4KPYA 4DQSA 4N56A 4FSVA 1OH7A 3NF9A 1K73O 2UXCK 3CPWM 1BRZA 4YFUA 3BP8A 3H46O 4DQQA 1DJTA 4E72A 3QESA 2HHXA 2DFEA 2ZJPL 4GV3A 2YHWA 1YJWN 4DV7K 5AQUA 3KLFA 4OGCA 3T1AA 2G8FA 3UKRB 3O9SA 4JK8A 4RW8A 1T1TA 3TI0A 3VF4A 1SN4A 3RMCA 5JS1A 3R1XA 3H1VX 1C0UA 2PBDA 2F8TA 3F5TA 3MX2A 4J2AA 3DWLA 1TL1A 1EX4A 1RT6A 3NH0A 3WEEB 4W5RA 2LSNA 1VQKN 1W9HA 1WMTA 1VSHA 1B9FA 4CBXA 4YOXA 3HOTA 3TTDA 3LDLA 1A5VA 4ZTJA 4ELUA 4NO7A 3ZSRA 5HL7L 4FJLA 3HM9A 3TABA 1H1VA 1VSMA 3K58A 3I56N 3V9SA 3SUOA 3ALYA 3QINA 4YOWA 4BY9C 3LPUA 1ZBUA 1QS4A 5AZIB 5D3GA 4EHUA 4JKHA 1NJIO 3MXMA 3DM2A 2B5JA 3HSTB 3VGKA 4B3SK 1CXQA 4KTZA 4E89A 1XQSC 1AYJA 3ISNC 4E0DA 2EWSA 1O1WA 4CK2A 3NVMA 1ZVGA 3PV8A 2G8KA 4CF0A 1EWRA 2YKNA 1N8RO 2BANA 2NUBA 4AM7A 1MA9B 3DI6A 1HYSA 1NGIA 4E7IA 4DV5K 1ZBIA 3EN9A 3B8AX 3VOVA 1KD1O 1NGGA 3QNNA 2KBHA 5AZJA 1BUPA 1RDWX 3O5BA 3HK2A 4IFVA 3EKUA 3EE8A 4DR7K 3RSEB 3H3OB 1LQHA 2QWQA 3I33A 5BR8K 2HBLA 2AP1A 4CEEA 4CJKA 4DV4K 4KFBA 2Q97A 4DV1K 2HMIA 4BRIA 1KSPA 2LJMA 2CGLA 4LC9B 4A5AA 4E7HA 3SV3A 1NJWA 1FXXA 4LSNA 1LWCA 1YAGA 4C8MA 2D5RA 1VSKA 5HRRA 3HJFA 1TKTA 4JI5K 2VWKA 2N2RA 1SZ2A 1ASUA 3CFRA 4X65K 4DV2K 2HW3A 3AVNA 5LMNK 3AARA 4KTWA 3OJUA 1L3VA 4R79A 4I9QA 3AGRA 2E0HA 3ZX3A 2QWNA 4BR7A 1ZBLA 3SQ1A 1HNWK 3OA9A 4LF5K 3SBTA 4O0JA 4A62A 4KB1A 2YJFA 1Z6RA 4L8RB 5BPNA 2YJEA 4KKOA 3ZSYA 4BREA 1T03A 3ASMA 4MQ3A 3FFKB 5TKYA 1IKYA 1C0MA 3VPZA 3ZSQA 1LWFA 2Q2RA 3P83D 2A5XA 3AVFA 2G8VA 4FJJA 4OJRA 2F9TA 1ZYWA 4UADE 3NFAA 4B9UA 4CQKA 1T6CA 3SF4D 4FLUA 2A41A 2HBJA 4DTPA 2NRRA 4N41A 4JS5A 2LN8A 3SBGA 4NCAA 2YKMA 1Y97A 2A3ZA 3AO1A 3O9UA 4B3TK 3U9DA 2GUPA 5JICA 2YX6A 2OPRA 4CESA 3MEEA 3CW4A 1GOCA 3AAPA 4AM6A 4O8KA 3RMAA 4PHTX 3M5RA 3D2FA 2CH6A 5FRMA 4KBOA 2BH1A 3VQ6A 3VEXA 4WFAL 4J2BA 3AVJA 3VQBA 4EHTA 3DLKA 3TARA 1C0FA 3GOIA 4Z4HA 2O8FA 4JN4A 4RW9A 3V1RA 1VQ4N 5CR4A 5KPZA 3VEWA 2QK9A 1XUPO 5HRNA 3MCAB 1HNVA 4H0OA 4R5PA 4NB4A 3T19A 1UA1A 4O55A 4XJXA 4BEBA 3NGIA 4IJAA 1NOYA 3WNHA 3O3GA 2O8EB 4M7YA 4B3MK 2G8HA 3CCEN 2KBJA 1K8KA 1RDUA 4I9LA 1VK0A 5AQWA 4Z0UA 1BOTO 1I2UA 2QKBA 1XNRK 1VSJA 4F3TA 4JS4A 4IXCA 4RW6A 3TAQA 4LY7A 4PL7A 1NJZA 1IV0A 2LJ7A 1LV5A 3O8MA 4BR2A 4DSEA 4DV6K 1GOAA 1KAYA 2ASOA 4CGFA 4NYNA 4H4OA 3A8YA 4JV5K 2NRHA 4PKHA 3JYTA 4B9LA 1DTTA 2O4GA 1ATNA 4BRNA 5CE3A 4KREA 4NLCA 3DXKA 2P9UB 2GL1A 5LY3A 3WNGA 4A61A 3A5MC 4DUZK 2R7YA 2QWOA 2YI1A 1WBDA 4B9VA 1C0GA 1ZBSA 2YHYA 3KOXA 2HF4A 2VGNA 1GPTA 4V1DC 4K25A 3KK3A 2ASPA 4G1QA 3HM8A 3QI7A 2A42A 1QQNA 3WXKA 4OGEA 4FLYA 3VQAA 3VEYA 3ID6A 1GLAG 2HBKA 4I6MB 5JS2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2RE2 A;  3BY5 A;  1NMN A;  3HTV A;  4B1V A;  1U4B A;  3PX4 A;  2OTJ N;  5E41 A;  4FZY A;  3CQX A;  1B92 A;  1RTI A;  5HRP A;  4HWI A;  4CK1 A;  1EO1 A;  3HZ6 A;  2KGQ A;  4FK4 A;  4QS9 A;  4OKJ A;  1CXU A;  3V1O A;  4I6M A;  3JSM A;  2VG6 A;  4NXN K;  2E2N A;  1SKR A;  5M1O A;  4Y1D A;  5C10 A;  1JL1 A;  5AQV A;  4FJH A;  1S6Q A;  4RW4 A;  3H08 A;  3K5N A;  5AQH A;  4PL8 A;  3VQD A;  3DJC A;  4CIF A;  4ID5 A;  3C7N A;  2LT8 A;  2CGJ A;  3HBT A;  4Y1C A;  4CJV A;  3GKU A;  4CJ4 A;  4FWK A;  3AVA A;  2VQE K;  1T7E A;  4CIE A;  2E5L K;  4CGG A;  3WXM B;  3SQ0 A;  3E9O A;  3OS2 A;  1OH5 A;  2KTQ A;  4KH6 A;  4CVN E;  3B6P A;  2NY8 X;  3IRX A;  4O4G A;  3TPQ A;  5TKW A;  4CE9 A;  4DU4 A;  4DB3 A;  4F2R A;  3CCS N;  3N4P A;  3SV4 A;  2YC1 C;  5C24 A;  2P9N A;  1U48 A;  1DTQ A;  2GMO A;  1U2V B;  4CFD A;  4FJ7 A;  2CH5 A;  2OPS A;  3QFU A;  4KPY A;  4DQS A;  4N56 A;  4FSV A;  1OH7 A;  3NF9 A;  1K73 O;  2UXC K;  3CPW M;  1BRZ A;  4YFU A;  3BP8 A;  3H46 O;  4DQQ A;  1DJT A;  4E72 A;  3QES A;  2HHX A; 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