4IO8A

Crystal structure of human hsp70 complexed with 4-{(2r,3s,4r)-5-[(r)-6-amino-8-(3,4-dichloro-benzylamino)-purin-9-yl]-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethoxymethyl}-benzonitrile
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGDTKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A variant
publication title Functional analysis of hsp70 inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 117
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4io8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4io8A04
2QXLA 2QWNA 1TUUA 4H0TB 4MLEA 4BR5A 3QFUA 1K8KB 3O4WA 1NWKA 2FF3B 3EKUA 3IMXA 1NMDA 4ISEA 1BA0A 4H0PA 2CH5A 4MO5A 3VENA 4JHDA 2GEMA 4M63C 1MA9B 1ESVA 4Y0WA 4WQ4C 4FOIA 5ADXH 1BG3A 2P9KA 3H45C 3GG4A 2QM1A 1E4GT 1NM1A 4BRAA 4M7XA 5EVZA 5LJWA 4BC5A 2YHXA 5EXWA 4BROA 3ZX2A 5FPNA 4WQ4A 2FXUA 1XC3A 2I7NA 1BA1A 2I7PA 3CJBA 5FPMA 4BR4A 5BPNA 3QDKA 3B8AX 1V4TA 2A42A 1TYQB 1GLAG 1JCEA 5FPDA 3BUZB 4K25A 4BRGA 2P9UA 3BF1A 3SLCA 4RWTA 2QWRA 1HPMA 5JMVA 4IO8A 3MN6A 4KBOA 4H0XB 2ZGYA 3VEZA 1GLDG 1GLBG 4FWKA 1DEJA 4M7YA 5AR0A 2J4RA 3FZLA 4HWIA 1WUAA 4H0VB 2Q2RA 3DJCA 1NGAA 2E8AA 2P9NB 1NGJA 3LM2A 4FO0A 1NGHA 3UKUB 1C0GA 4H03B 2HF3A 3ID8A 4JD2B 2V52B 5AZJA 3F9MA 4BC4A 2E2PA 1HUXA 5ADXA 1JCFA 4O8KA 5F0XA 2H3GX 3O08A 2YJFA 5B8HA 2V7ZA 3MDQA 3OHRA 4BGBA 2P9LB 1T44A 3FFKB 1WOQA 2D0OA 3AAQA 1NGIA 4BRPA 2VCPA 3SMSA 1S3XA 3IDHA 3WXJA 4PKGA 3LDNA 4BRCA 1NGDA 5BRHA 1QQNA 1U6ZA 2IVNA 5AQOA 1IG8A 2E88A 1Y64A 5AQNA 4FWQA 4BVPA 4BR9A 4IXCA 4A61A 3ENHA 2GWKA 1BOTO 4NO7A 2HOEA 2QWLA 2D0PA 3I8BA 3DXKB 4B1WB 2ASPA 1CZAN 3EKSA 3ULEA 1ZXOA 3D2EA 3HM8A 2QWQA 1RFQA 3VGMA 4XH1A 4H5TA 2EWSA 2AA4A 5BPLA 4H5VA 3VOVA 4CZFA 1NLVA 1BU6O 2AP1A 4HTLA 1C0FA 4BG9A 4F9OA 2FF6A 4IWVA 2HMPA 3WXIA 4BR7A 2IVPA 2ASOA 4CZHA 4FWNA 2PBDA 3VEVA 1BUPA 5AQIA 5AQVA 5AFUH 3VGLA 5AQFA 2YJEA 3O6WA 3QBWA 4CZJA 3JS6A 4WQ5A 2IVOA 2V7YA 3EN9A 3R6MA 3TPQA 4CI6A 3KVGA 4CZMA 3WQTA 5ELZA 1IJJA 4MO4A 2BUPA 3VEWA 5F1XA 3C0BA 3WEEA 4FWPA 3A5NC 4CBUA 1DKGD 3L0QA 3IFRA 4B1UB 3VEYA 3UKRA 1MDUB 1Z05A 1GLCG 4NB4A 2P9UB 2A41A 1YXQA 1KAZA 1ZBSA 2PAVA 3ENOA 3CJ1A 3BF3A 4YDUC 3VERA 5KPZA 4ISFA 1U2VA 3SK3A 4BR2A 5BN8A 2NZTA 3CJ7A 3U8XA 3LDPA 2Q0UA 2GWJA 2P9SA 2E1ZA 2P9IA 3D2FA 4C23A 4DQ8A 1T6CA 4A2BA 5AQLA 3U9ZA 3FGUA 4YDUA 4B9QA 3O1WA 5AQWA 5I9EB 4BRQA 4DB3A 4B1XB 3IUCA 2CGKA 3FE1A 1SAZA 3I33A 1NBWA 5AZJB 3EO3A 2QWMA 2ZGZA 5EX5A 5AFUA 5EOYA 4BRFA 2NRHA 3VGKA 2FSKA 4B1YB 5AQUA 3ATVA 3MMVA 5AZIB 3FZMA 3EZWA 3WUHA 2V51B 5BREA 3DXMB 4QS7A 5AQSA 1EQYA 5KQ8A 1D4XA 3CIPA 3KHYA 4DHYA 4H0OA 3FLCO 3J8AA 4EFHA 2YI1A 2A6AA 4IJNA 3CETA 5TKYA 1HKBA 3QICA 2QWPA 4QS9A 4IZ9A 2CGJA 3MN7A 1LOTB 4I6MA 1GLLO 1GLFO 3HBTA 5AQKA 4E1JA 1YAGA 4GNIA 3ULEB 3D2EB 2A5XA 2GELA 3A5OC 4PL7A 3MN9A 5AQZA 5BRFA 4EHUA 2W41A 5AQGA 3VF6A 4BRKA 5E84A 3QBXA 5LJVA 3U4LA 4FL9A 2GUPA 1NGEA 3WXKA 1JCGA 3G25A 4CJ7A 1X9JA 3BP8A 3VESA 2Q36A 2KHOA 1XUPO 3WT0A 3DAWA 3LL3A 4BGAA 1NGGA 2NLXA 2E2OA 2E2NA 4CZIA 5BPMA 2P9PA 3CJ9A 5JLHA 3O80A 1SZ2A 1Q18A 3RSEA 3WEEB 3ZEUA 3H6EA 5F2RA 3AY9A 4XEIA 1QZ5A 3GL1A 4FSVA 2GTDA 3W3DA 2W40A 4JHDB 4BQLA 4ISGA 3UKRB 2ITMA 2E2QA 4BC3A 5EY4A 5BR9A 2ZF5O 3TU5A 4A2AA 4FWRA 2P9KB 5LY3A 5BRDA 4BRIA 1YVNA 5AQXA 1GLJO 1U2VB 3H3NO 4EAHD 1Z6RA 4Z94A 1RDWX 3A5LC 3LDQA 4J8FA 4K43A 5E26A 5AQRA 2YCHA 3GE1A 4B1ZA 2P9SB 2DPNA 3QB0A 3SMPA 3CJAA 3VF4A 2ZWHA 3M3ZA 2VYPA 2YHYA 2E20A 1ATNA 3VETA 2QWOA 4H5RA 3VPZA 3P4IA 1H1VA 3H1QA 3O8MA 3FR0A 1BO5O 4IJAA 4BREA 4CZGA 1QHAA 4FPAA 4XH5A 4H5NA 3M6GA 3ZETA 5KQDA 1BDGA 3W0LA 3QMLA 4BRNA 4BQZA 3LDOA 1HKGA 1QZ6A 2D1KA 1NGCA 1HLUA 1S22A 3CERA 4RCHA 4XH4A 1QQOA 5AQQA 3HTVA 4FWOA 3SJHA 3ZX0A 3UB5A 1ATSA 1KAYA 1YUWA 3C7NA 2Q1NA 5AQHA 4CD3A 4CZKA 2Q97A 1HKCA 5AQYA 3GDQA 5AQPA 2VWBA 4L3QA 1ZC6A 3VEOA 4B1VA 1ATRA 4MLHA 2BTFA 4H0YB 4DCHA 1GLEG 1K8KA 4I6MB 4FWLA 2ASMA 3UE5A 3CI5A 3AAPA 5KPRA 4O5FA 3R8EA 1DGKN 4BG8A 2FSJA 3QFPA 4CBWA 4PL8A 3R9PA 4BC2A 1NGBA 1V4SA 3S41A 4BRMA 1OKJA 2F9WA 5AQTA 3KZBA 5JLFA 2E1YA 3HZ6A 3A5MC 5AQJA 3FZKA 3CQYA 5FPEA 3LM9A 4EIAA 5CE3A 3ATUA 3H1VX 3EL2A 4A62A 3M1FA 3CJCA 1HJOA 2IIRA 3WXLA 3GOIA 4CD1A 4JAXA 2P9PB 3D7EO 5JICA 4BVOA 4FWSA 1E4FT 1LCUA 3HSCA 1P8ZA 2D4WA 3RSEB 3VEXA 1TYQA 2F9TA 4JNEA 3WQUA 3ZEUB 1NGFA 2HF4A 4AM7A 2UYTA 3FZFA 1KAXA 4BRHA 4CBXA 3CHWA 5AQMA 4K41A 3BEXA 1KXPA 4CZLA 3VF2A 4AM6A 4WYBA 1RGIA 1X3NA 3L4IA 3MCPA 2A40A 4GY2B 3A0IX 4K42A 3U9DA 4CZEA 5BN9A 1XQSC 1TUYA 3AARA 3HI0A 4FWMA 1MWKA 1SQKA 2QW9A 5AZIA 4EHTA 4PKIA 3DXMA 4FOEA 1HX1A 3H46O 2P9NA 2WUSA 3O1BA 3UKUA 3A8YA 4JN4A 3CQXA 4PKHA 1R59O 2FSNA 4JD2A 3H3OB 1MWMA 1QQMA 3DWLA 1J6ZA 4LC9B 1BWFO 4BR0A 3FZHA 2YHWA 3LDLA 2Q31A 4BRDA 2P9LA 4RTFD 3ZETB 3JXUA 2CGLA 4H5WA 4WQ5C 3GBTA 2Q0RA 3ZX3A 1X3MA 2P9IB 2OANA 1G99A 2FLOA 3MN5A 3D2FB 5KPTA 1T6DA 3MK6A 4QS8A 3O5BA 4BRLA 2CH6A 3L6QA 3C7NB 2A3ZA 3DXKA 4FPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DLGA 4PQUA 3AVKA 1L3UA 3AVHA 4JYAK 3LPTA 4H4OA 1RTHA 2E6LA 1K8KB 1OH5A 4DG1A 3IMXA 1WSGA 1YTUA 1N32K 1Q9XA 3KWIA 4M63C 2ZM6K 4WQ4C 4IDHA 3NCIA 3AVMA 3KLHA 1T8EA 3GG4A 3LPUA 1C1CA 4BRAA 2DFEA 5CZ2A 5HRPA 1YHQN 1WBBA 3C6AA 1EETA 4JS5A 1T7AA 4B3MK 1XC3A 3FFIA 3VQPA 3L2QA 4DR6K 2JLEA 5FPMA 3SBTA 1TYQB 1GLAG 1U45A 1JCEA 2KGQA 2KQ2A 1HPMA 1HYVA 5JMVA 3MN6A 4DU4A 4WE1A 4CFBA 1RILA 4IOCL 2F8SA 4F2SA 4I9LA 4B9TA 3C6UA 1WUAA 4FLXA 1NK5A 4UAFE 2Q2RA 5HLFA 1TL1A 3DJCA 4RW4A 3HL8A 1IKXA 4FJNA 1VNBA 3HPHA 5CY0A 4KFBA 4M45A 4JD2B 1LWEA 2I5JA 1BISA 5ADXA 3L2WA 1P0AA 1JXBA 3AVLA 2NY9X 2O8EB 1DJTA 3VA3A 3CCVN 4NYNA 3O08A 3LALA 2ETJA 1WOQA 4B8AB 4DSLA 4JI6K 3IDHA 4YORA 4PKGA 5HOOA 1NK7A 4DTPA 2OYQA 5BRHA 2IVNA 4BE2A 1U4BA 2E88A 1UOCA 5M1OA 4A61A 3L2RA 3ENHA 3QEPA 2GWKA 1BOTO 3LAKA 4UY8O 1BK8A 2R7YA 3V1RA 4B1WB 1ZXOA 3HM8A 2YIPA 4DQPA 1RFQA 3HVTA 1N6QA 3VQCA 4XH1A 4FXDA 4CGGA 1OZZA 4H5VA 2QI2A 5KGXA 4JKEA 2AP1A 4DSKA 1CHZA 4YOVA 4FWNA 4FLVA 1BUPA 2YEOA 1DLOA 3VQ9A 3CCEN 1TK8A 5AQFA 4F2RA 3M8PA 4WQ5A 4Z4IA 3PSIA 2UUBK 5KGWA 2V7YA 4X65K 3DLRA 3VEWA 1EP4A 4Q5VA 5E41A 1KFSA 3G0ZA 1RBSA 3MX2A 3A5NC 3L0QA 3LZJA 4ZTJA 3OYHA 2LSNA 3UKRA 1JLEA 4BACA 1Z05A 4KHWA 1FW6A 2LY5A 1VRUA 3THXA 4PY5A 1ZBSA 2NRZA 3BF3A 3VERA 4C8OA 4HUFA 4W5RA 4BR2A 3VQ5A 4HUGA 5HP1A 3MEDA 2GMOA 1IBMK 4C23A 4DSEA 4B9UA 1RCHA 5AQLA 5CYMA 3FGUA 4CESA 4GKJK 1Q81O 4BRQA 1SAZA 4M42A 1NBWA 2GV9A 1LW0A 2QWMA 3J81O 2VWKA 2NRHA 1JXEA 3K57A 5DM6L 3T1AA 3KOZA 3HXMA 1J9AA 1F21A 2WOMA 1X1PA 5AQUA 3MMVA 5AZIB 3FZMA 3MXIA 4OVLA 4QS7A 3KHYA 1W0HA 2HBJA 3B6PA 3CIPA 4DHYA 3J8AA 1RBTA 2UUAK 2A6AA 4FK2A 4IJNA 3CETA 3CXCM 4QS9A 2BGGA 4M3ZA 4KHNA 1GLFO 4CEZA 3SQ0A 1I94K 1C55A 5SZTA 1CZBA 2SN3A 2ATQA 5E84A 1UGLA 1NOYA 3K5MA 5KI6A 3TABA 3F5TA 1EWRA 3G25A 2MN5A 1O1WA 2GX9A 4A5AA 4BEBA 4BY9C 1SL0A 5J1EA 3BP8A 2KHOA 4BGAA 3LL3A 2E2OA 2O4GA 1HRHA 4CFCA 4IOAL 5JLHA 3VTHA 4U67L 1Q18A 3OJUA 1HYSA 5F2RA 2N2QA 1JLQA 1YF5L 3AY9A 2BE2A 3GL1A 1WAFA 2GTDA 3W3DA 4B9MA 2W40A 3C6HA 4A57A 3UKRB 2E2QA 4KB1A 2VGMA 1J53A 1YJNN 3ZT4A 2N69A 3THXB 3OYJA 2KBHA 4A2AA 3DLKA 4B9LA 4JRPA 2KFZA 2QEXN 2WFBA 4IFEA 2HBKA 1ASUA 4EAHD 1RDWX 4AF1A 4LF5K 4IG0A 4BWJA 3LDQA 2PYLA 2YCHA 2P1JA 3CJAA 4KHPK 3M3ZA 3DMJA 2F4VK 3AVIA 1E3MA 3BK3C 3PO5A 2QWOA 4H5RA 1YJWN 4W5QA 1NNEA 3M8QA 5J2QA 2P51A 2MBKA 3O8MA 3WNHA 4DQRA 3C6TA 3QEXA 3G10A 1TAUA 4IDKA 4LFBK 2FBXA 3VQEA 4JV5K 4H5NA 3M6GA 5D3GA 4BDZA 2AJQA 3QMLA 4BQZA 1EWQA 3QINA 4ELTA 3AO1A 1NGCA 2QTDA 1S22A 3O3GA 3JAMO 4CJWA 3CERA 3VQ6A 3CMAN 4RCHA 3HTVA 1KLMA 1EO1A 4GV3A 4L8RB 1KSPA 1KC8O 1ATSA 4KAZA 1LQIA 2IC3A 4CD3A 4CZKA 4M3YA 3VEOA 4B1VA 2NUBA 1PTXA 3QIOA 3KC6A 3KLFA 4DV3K 3V9WA 4KRFA 3QEIA 5KPRA 4O5FA 4JKCA 1DGKN 4OGEA 4BG8A 1KRPA 3DLLL 2FSJA 4JI0K 5M1NA 3LAMA 1S1TA 2LJ7A 2VGNA 5FDLA 3S41A 4BC2A 4RW8A 5JVHL 4DS5A 3D45A 4MDBA 4CGDA 2KKZA 3I8DA 3H1VX 4DMNA 4A62A 2HMIA 4IG3A 1SL2A 1IV0A 4CD1A 1VSKA 3R3LA 3HJFA 4OO1J 2KPYA 4DV5K 4KH6A 5MLCQ 3RR8A 1VSEA 2PFUA 3VEXA 3I0SA 2UYTA 4AM7A 3AVBA 4AHCA 1MR4A 2HHWA 2VQEK 4DTNA 2RKIA 3S5TA 3BEXA 3DLHA 2BH1A 3VF2A 3I55N 3MECA 3HK2A 3NAEA 1WN7A 3ALYA 2E6MA 3DRPA 1TAQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DLG A;  4PQU A;  3AVK A;  1L3U A;  3AVH A;  4JYA K;  3LPT A;  4H4O A;  1RTH A;  2E6L A;  1K8K B;  1OH5 A;  4DG1 A;  3IMX A;  1WSG A;  1YTU A;  1N32 K;  1Q9X A;  3KWI A;  4M63 C;  2ZM6 K;  4WQ4 C;  4IDH A;  3NCI A;  3AVM A;  3KLH A;  1T8E A;  3GG4 A;  3LPU A;  1C1C A;  4BRA A;  2DFE A;  5CZ2 A;  5HRP A;  1YHQ N;  1WBB A;  3C6A A;  1EET A;  4JS5 A;  1T7A A;  4B3M K;  1XC3 A;  3FFI A;  3VQP A;  3L2Q A;  4DR6 K;  2JLE A;  5FPM A;  3SBT A;  1TYQ B;  1GLA G;  1U45 A;  1JCE A;  2KGQ A;  2KQ2 A;  1HPM A;  1HYV A;  5JMV A;  3MN6 A;  4DU4 A;  4WE1 A;  4CFB A;  1RIL A;  4IOC L;  2F8S A;  4F2S A;  4I9L A;  4B9T A;  3C6U A;  1WUA A;  4FLX A;  1NK5 A;  4UAF E;  2Q2R A;  5HLF A;  1TL1 A;  3DJC A;  4RW4 A;  3HL8 A;  1IKX A;  4FJN A;  1VNB A;  3HPH A;  5CY0 A;  4KFB A;  4M45 A;  4JD2 B;  1LWE A;  2I5J A;  1BIS A;  5ADX A;  3L2W A;  1P0A A;  1JXB A;  3AVL A;  2NY9 X;  2O8E B;  1DJT A;  3VA3 A;  3CCV N;  4NYN A;  3O08 A;  3LAL A;  2ETJ A;  1WOQ A;  4B8A B;  4DSL A;  4JI6 K;  3IDH A;  4YOR A;  4PKG A;  5HOO A; 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