1RBSA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEACEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 48
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbsA00
2BANA 4CJKA 2HHUA 3SI6A 1HJRA 3AVNA 3PV8A 2WOMA 2XY6A 4E3SA 3RRHA 1SV5A 5C42A 4FJGA 1NK7A 3DMJA 1EP4A 3QETA 3NFAA 3D45A 3MXJA 1NKBA 2E6MA 2B4JA 1JL1A 2HB5A 1UA0A 3ZSQA 4N47A 1QS4A 2HNZA 4O0JA 3ZT1A 4CJ4A 2VWJA 3QEWA 1SL1A 4LD0A 4Z4FA 3F9KA 3FFIA 4H8KA 1T8EA 2HVHA 1NK4A 2WONA 3OVNA 4CJLA 2RN2A 3OYFA 4I2PA 4I2QA 3LDSA 1BISA 4JS5A 4FW1A 4J2DA 2HNDA 3I0RA 3LPTA 3K59A 4AHCA 3NF6A 4DS5A 4KHWA 2BGGA 3VQEA 4J2BA 1RBVA 4CF1A 5KRSA 4HTUA 2G8KA 3OYEA 3SCXA 1J54A 1CZBA 1S1XA 3IAYA 3ZSRA 1BCOA 2NUBA 4IG3A 4CEAA 2HHXA 2YNFA 3M8SA 1REVA 1RTDA 2P5OA 5HROA 2KFZA 4CEBA 4KTZA 4FXDA 1BGXT 4DG1A 3QEPA 3ALYA 4R5PA 4DSLA 1HYVA 1XHZA 2RKIA 3M8PA 5HBMA 3NCIA 1LV5A 1YTUA 3V81A 2O4GA 2G8HA 2X74A 4N56A 4DSEA 1TK8A 3NH0A 1TKTA 3OYCA 3KD1E 4CHPA 2JGUA 3ZT0A 4FCYA 2A1SA 4DU3A 3KLHA 4IBNA 4G1QA 3NHGA 1GOCA 4W5OA 3K57A 3SZ2A 3TANA 1O1WA 4FJIA 4FJ9A 4EP5A 3V6DA 4LSLA 1QTMA 3VQ8A 4OLAA 3F73A 1VSDA 3AV9A 4E1MA 1LW2A 2G8VA 4I9LA 1TKZA 3U3YA 1L3SA 4F4KA 1NK5A 1TK5A 1SUQA 4ZTFA 3ZT4A 4DTJA 3CYMA 2XY7A 2HMIA 2FC0A 2HHVA 3RMAA 2KQ2A 3HPGA 2IOCA 3QNOA 4GVMA 3KLEA 4DSFA 2QK9A 1KTQA 3L8BA 1Z25A 1S1TA 1QE1A 3PY8A 2IAJA 5JS2A 3ITHA 4CEZA 1QSSA 1J53A 1I3AA 1RILA 4IKFA 3HSTB 5I3UA 3VQ7A 1A5VA 3AVJA 4KHUA 5EU7A 1WAFA 5HRRA 2QKBA 1RDDA 2XY5A 3OYLA 4C8LA 4JS4A 4KHYA 3RRGA 3I0SA 4CIGA 4BDZA 4KTWA 4DTSA 3IRXA 4OGCA 1U48A 4KI6A 3AO5A 3MXIA 4GW6A 3KLFA 1RNHA 4M3XA 3AVAA 1BIZA 1VSFA 3QLHA 1SKRA 3K5OA 4DSKA 2KZZA 5I42A 4AHVA 4OVLA 1LW0A 3DLKA 1BQNA 4O4GA 4CJ5A 4E7JA 4KB0A 3AA3A 1VSKA 3HP9A 4O0IA 4O55A 2Z1IA 1VSEA 2OPRA 4RW6A 4BACA 3SQ4A 1U49A 3OS1A 4PQUA 1RTIA 3AVGA 2OPSA 1S1WA 4FW2A 4CJVA 3VA0A 3QESA 3OJSA 1NJXA 3L2WA 3KJVA 5KRTA 3LZJA 1DLOA 1WSJA 1BHLA 1LAVA 4C8KA 4YFUA 3AO2A 2XY8A 3ZSWA 2W42A 3BGRA 4Y1DA 3DOKA 1RT1A 3NF8A 1TKXA 1BIUA 2KZMA 3OY9A 3QEVA 2Z1GA 4B08A 5HRSA 2D0CA 4W5RA 4BE0A 3MEEA 3ZSXA 3NE6A 4IDKA 2QKKA 5KGXA 2VG6A 4QAGA 3LWMA 4DTXA 4DTNA 3EYZA 1D9DA 4DFKA 3M8RA 4FJ5A 4DF8A 1C0UA 2YHBA 3VN5A 3OYMA 3OYGA 2PY5A 2O4IA 2OPPA 4F3TA 2DTUA 1RBSA 4OJRA 1VSIA 2GUIA 4ICLA 4CHYA 3HJFA 4FLZA 4FK0A 3L2UA 3VQ5A 1C6VA 4CFCA 1Y97A 3HVTA 3OYHA 2E6LA 3HP6A 4DQRA 3SJJA 2G8UA 4KHSA 5FRNA 1KVAA 4E7IA 2F8SA 3DYAA 4CF8A 5HP1A 4BWJA 1NOZA 4E7KA 4C8MA 1UOCA 4DTRA 4L8RB 4F2SA 3SQ0A 4BWMA 3MXMA 4W5NA 1G15A 3TR8A 1U04A 4CHNA 1FXXA 3C94A 3HVRA 2OYQA 3TAEA 4E0DA 3DLRA 1F21A 2RPIA 4C8OA 3HPOA 3TWHA 3KD5E 2HNYA 3K5LA 5JS1A 1TL1A 1JLAA 3HM9A 1ITGA 4DTOA 1X1PA 1HMVA 4LH4A 4KKOA 4XIUA 4FJKA 3OS0A 1RBUA 3CFOA 4DLEA 3RMCA 4J2AA 4DMNA 1NKEA 3WNHA 2HHQA 2Z1JA 3QINA 1WSEA 1ZBFA 1Q9XA 1EXQA 3DLBA 4F8RA 1QSYA 4M42A 3G0ZA 3U6FA 4B8AB 4FLVA 3SUQA 1LWEA 3DLEA 3QO9A 4M41A 4IFVA 4E89A 3OYNA 4BDPA 2GBZA 3LAMA 4KHQA 4ID1A 5SZTA 1WSGA 2IDOA 3TAPA 1ASWA 1VSHA 4FYDA 4DTUA 1CLQA 2XHBA 4CGHA 5J1EA 5J2PA 1NKCA 4B8CA 3SUPA 3L2RA 2ITGA 4OKEA 1S6QA 1YT3A 2EX3A 3VQPA 3RR7A 1DTQA 4DQPA 3DLGA 1EETA 3O3GA 4C8NA 3HPHA 1BI4B 1KLNA 2G8FA 1VRTA 4CECA 4KAZA 4OLBA 3AO1A 3AVKA 5CZ2A 1HYZA 2PYLA 4FM2A 2OZSA 1HQEA 4AHTA 1YVUA 3SNNA 1J5OA 4Z4EA 3V9WA 3HT3A 4GMJB 4QOZB 5SWMA 1ZYQA 2ZQBA 4DU1A 2OPQA 4JLHA 1JLBA 1D5AA 1VSJA 4AHRA 3S3MA 4E1NA 1GOAA 1XI1A 3K5NA 3DRPA 1VRUA 5FDLA 1GOBA 3AVMA 4MFBA 1LWFA 3EY1A 3THVA 4PY5A 4NYFA 3AO3A 3O3FA 4F2RA 1TGOA 1JL2A 3DRRA 3DRSA 3S3OA 3T1AA 4ZTJA 4E7HA 3CM5A 3U3GA 4B9MA 4FZYA 2XRIA 1HNVA 1QSLA 4CIFA 3B6PA 2XO7A 4EZ9A 4Z0UA 4O5BA 2HVIA 3ZT2A 4FZXC 3M8QA 3HO1A 4Q0BA 1QQCA 3S3NA 1KRPA 4ELUA 4QCLA 3CQ8A 3OJUA 1IKVA 3KIOA 2RF2A 3V1RA 2HHSA 1S1VA 1L3UA 1B92A 1C1CA 1KCFA 1Q8IA 5CZ1A 4ELTA 1Q9YA 3LP3A 4H4MA 3D0PA 4DTPA 1L3VA 3LP2A 5FRMA 3LP0A 3K2PA 2A1RA 3ULDA 4DFPA 3SV4A 2IC3A 2YKMA 4CHQA 1S1UA 1L5UA 4FJXA 3ZCMA 2YV0X 3KTQA 3C95A 1K6YA 3L2VA 1VSMA 4FLTA 1LAWA 3AA2A 3QNNA 1CXUA 1ASUA 1B9DA 1RT4A 3LPUA 2OA8A 2DFHA 4CJFA 3LP1A 3OYIA 4FJ7A 3E01A 4DSIA 1T7PA 1RDCA 2YNHA 4RW9A 4AILC 3EZ5A 1NJZA 4LSNA 5E41A 3L3VA 4CF2A 4CJTA 4LH5A 4CJQA 4DFJA 4EZ6A 1YTAA 5DMRA 4NYNA 3VQQA 1ASVA 3AVBA 4KB1A 3HYFA 1KVCA 4BE1A 4CEOA 4M3TA 5DK5A 4FM1A 2X78A 3WNEA 3QIOA 2YNGA 1T05A 2FBTA 4DFMA 3NH2A 1JKHA 4FJ8A 4Z4GA 4BDYA 4DQSA 4DSJA 3LALA 3RTVA 3K5MA 5KI6A 3H08A 1IO2A 1R0AA 1HNIA 3UIQA 3V1QA 3ZSYA 2IGIA 5HRNA 2Z1HA 4OPJA 3JSMA 3DM2A 1IH7A 4CJPA 2EHGA 2Y1JA 3PO4A 4B9UA 1RBRA 2VWKA 4OGEA 4RW8A 4W5TA 1SL0A 4O44A 4NCBA 2F8TA 4FJNA 2VG5A 4RW4A 3QERA 3S9HA 1B9FA 2VG7A 1JXBA 5J2MA 4PWDA 1W9HA 4H4OA 4HUFA 3AVFA 3QEXA 4KHNA 1NJYA 4M3WA 4PA1A 1N6QA 4KV8A 3TABA 4ID5A 1D9FA 4FJLA 4OKJA 4J2EA 1X9WA 1ZBHA 1IKXA 3IG1A 3O4NA 3SQ2A 4KFBA 4N41A 2GV9A 4CEQA 2FBVA 4OPKA 3MAQA 1C0TA 1HRHA 2B6AA 4CJSA 4RG8A 3OYKA 4CK3A 3PO5A 4CE9A 1S9GA 3NF7A 4JRPA 4B9TA 1U45A 3VQ9A 1S5JA 3TAGA 4OKKA 5HLFA 4WE1A 4CJWA 5KTQA 2F96A 3KK1A 1RCHA 5CYQA 1IKYA 1RDBA 1JLQA 1RT2A 1TL3A 1KFDA 4B9NA 4Q5VA 2PYJA 1RT7A 3KKRA 3TAFA 1Z26A 1KVBA 3L3UA 1ZBIA 2KW4A 3VQDA 4I9QA 4AHSA 2ATQA 5FROA 4FZZA 3TAQA 1SKWA 4FVMA 1U47A 4CEDA 3C6TA 4CERA 3HL8A 3SV3A 3V9UA 3V9SA 2D5RA 5T7BA 1W0HA 1IG9A 1KSPA 1XWLA 3A2FA 1A5XA 3PX4A 1TKDA 2HHTA 3RMDA 1NK9A 1KLMA 1RDAA 3DI6A 5CYMA 4DWIA 5HRPA 4CJRA 4W5QA 3HXMA 1JLFA 4Z4CA 3V9ZA 4CEEA 4CK2A 4TSXA 3RMBA 3AVIA 1XC9A 1DTTA 4KPYA 1C1BA 4HHTA 3NH1A 1CZ9A 1JLGA 1WN7A 4ELVA 1S9EA 4FLXA 3QIPA 1C0MA 4RW7A 2D0BA 2YNIA 3AVHA 3ZSZA 3VQAA 1TK0A 2D0AA 2FBXA 3P83D 4CESA 1L3TA 3BDPA 1HYSA 4M45A 4CF9A 1XHXA 3WNGA 4B9VA 4Z4IA 1WLJA 3LZIA 1FKOA 2I5JA 3PUFA 4ZHRA 3OYJA 3CFPA 1U4BA 2G8WA 3LWLA 1WSIA 4HCCA 1C1AA 3V4IA 1TAUA 3V9XA 4CJ3A 4FJMA 4FM0A 4NCAA 4B9SA 4Z4HA 4EP4A 1VK0A 1NK0A 3NGYA 1ZBLA 3VQ4A 4FLYA 1KFSA 1WNSA 1EX4A 3MEDA 3SYZA 4FJHA 4JRQA 2YHAA 1FKPA 1BCMA 3CG7A 2P5GA 1EKEA 4IG0A 2P1JA 1ZBUA 3KK2A 1UA1A 1S6PA 1QHTA 3B6OA 4CFAA 1NK6A 2OZMA 4KTQA 4FLWA 1UWBA 1I39A 4CHOA 4HUGA 3PX6A 3KLIA 3VQCA 1A5WA 3AA4A 3P1GA 4B3OA 4HVJA 3L2QA 2DFEA 1RT3A 3SQ1A 4B9LA 5J2NA 3SUOA 3NGIA 3LAKA 3OS2A 2DY4A 1JXEA 4CGFA 4DU4A 2ZE2A 3RWUA 5C24A 4AH9A 3VQBA 4CK1A 2Q3SA 3O3HA 1CXQA 1NK8A 1TVRA 3CM6A 4CGIA 1MU2A 3ISNC 3NGZA 4M3UA 1RT5A 4M3ZA 3OYAA 4DTMA 2LSNA 4KRFA 1UAXA 3OYDA 1X9SA 4YNQA 3T3FA 3DLHA 4I7FA 4KO0A 1J9AA 1FK9A 3OYBA 4UQGA 4HCBA 1NOYA 3G10A 3NAEA 2X6SA 4HUEA 4CGGA 3PX0A 3SPZA 3ZSOA 1BL3A 1RBTA 1WAJA 1JLEA 4CIEA 4DF4A 2FBYA 2BE2A 1BI4A 2QXFA 2X6NA 4M3YA 4FLUA 3ZT3A 3KK3A 3MECA 4KREA 4Y1CA 3WNFA 3NDKA 3AO4A 3C6UA 2YKNA 5KGWA 5K14A 4E19A 3K58A 1SKSA 3RR8A 5CY4A 5C25A 2ETJA 1TV6A 3AVCA 1TAQA 1RT6A 2ZD1A 3SUNA 4KI4A 3NBPA 3LANA 3NF9A 4CF0A 1RTJA 3CFRA 3P5JA 4CFDA 3TAMA 4CHZA 1NJWA 1D8YA 1VSLA 1N5YA 3V1OA 4CJUA 2G8IA 3TI0A 1HPZA 4FJJA 1WSHA 2B5JA 1BQMA 4DS4A 3KLGA 2HW3A 2HHWA 4NCGA 3AA5X 4IFYA 1T03A 3ASMA 4M3RA 4AHUA 2Y1IA 3VA3A 2PZSA 2AJQA 2R7YA 2E4LA 2JLEA 3IS9A 4MQ3A 4N5SA 3JYTA 1X9MA 1IKWA 4CFBA 4K8ZA 2P51A 4F3OA 4DQIA 3KKSA 3I8DA 3MEGA 4N76A 1LWCA 1HQUA 4FK2A 4BE2A 4FK4A 4LY7A 3HK2A 4CEFA 4CCHA 2KTQA 2DFFA 4CGDA 3TARA 4PUOA 3DOLA 3O4QA 4K8XA 2KFNA 3VQ6A 5J2QA 1RTHA 4CJEA 4E7LA 3SPYA 5D3GA 4DLGA 2IS3A 3ZSVA 4DQQA 1SL2A 1JLCA 4CGJA 3T19A 3QEIA 3AVLA 2BDPA 1WSFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHUA 3G4SN 2FF6A 2WOMA 1C0FA 3FZLA 4BGBA 1BA1A 3QETA 2E6MA 3VGKA 4Z4FA 1FW6A 1CZAN 3FFIA 3DXMA 4H8KA 3OVNA 3OYFA 1N8RO 2RN2A 4JKDA 1RGIA 4FL9A 4JS5A 4FW1A 4J2DA 3I0RA 5TKWA 4DS5A 4FWOA 4AHCA 4GNIA 4KHWA 4J2BA 3PSFA 3CMEN 3OYEA 1CZBA 2HHXA 3ZSRA 1BCOA 4IG3A 4CEAA 2P5OA 5HROA 5AQQA 4FXDA 1BGXT 3QEPA 5HBMA 3SLCA 1VQ8N 2X74A 5MLCQ 1TK8A 2A40A 3K9KA 3OYCA 4CHPA 2JGUA 2F4VK 3TTFA 4G1QA 3VEYA 3K57A 3TANA 3WEEA 1KD1O 1KC8O 1VSDA 4I9LA 4FWLA 3VENA 3WXJA 1NK5A 3ZT4A 4DTJA 3D2FA 3MX5A 3CCQN 2HHVA 4BRFA 2IOCA 3KLEA 1KTQA 3L8BA 2NZTA 1QE1A 4JKHA 1NGBA 5JS2A 3CF5L 3OA9A 5EVZA 5LY3A 3HSTB 5I3UA 3AVJA 4KHUA 5EU7A 1GLAG 1RDDA 3QFPA 2WBNA 3ENHA 3ULEB 1OH8A 4JS4A 3MN9A 2QWNA 4DTSA 3AO5A 3VEXA 3E9LA 4DSKA 3G25A 2KZZA 1LW0A 4CJ5A 1NGAA 3HP9A 3MWTA 4O55A 4WF9L 4CZIA 3SQ4A 4PQUA 3VTIA 1S1WA 4FW2A 4CJVA 2QWOA 3QESA 3OJSA 3LZJA 1DLOA 1EO1A 1LAVA 4C8KA 3B8AX 3BGRA 2O8FA 3BUZB 3DOKA 3OY9A 5HRSA 4WFAL 2UUCK 4QAGA 4DTXA 1D9DA 5AQWA 1X3MA 3AAPA 4JI3K 4FJ5A 1C0UA 3VN5A 4FVUA 2A5XA 2DTUA 4OJRA 4ISFA 4CHYA 3HJFA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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