1RBSA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEACEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbsA00
5DMRA 5CZ2A 4K8ZA 1JLCA 1WSEA 4WE1A 4ZTJA 4FJJA 4LY7A 4J2AA 4FJGA 1HMVA 1S9EA 1RCHA 2P5OA 1ITGA 1C0TA 1TV6A 1RDBA 2GBZA 4KB0A 4ELUA 2VWKA 3AA2A 3CM6A 4OLAA 2X6NA 3K2PA 1ZYQA 4OKKA 3ZT4A 2G8HA 1RBTA 4RG8A 3VQDA 5I3UA 4BWJA 1BI4B 2OPRA 4ICLA 3V4IA 3DLBA 4DU4A 3OS0A 1SL2A 1L5UA 3KLHA 3L2WA 5SWMA 1CXUA 1TL3A 4AHRA 1T03A 4CJTA 2G8FA 4J2EA 1VSEA 1QSLA 3K5MA 1NJXA 2D0BA 4CJ5A 4N56A 1YT3A 2EX3A 3ITHA 4CGDA 3TI0A 4B9SA 1C1CA 1YTAA 1Q9YA 4O55A 4EZ9A 4M3WA 1JLBA 3ALYA 5J2NA 3LP3A 1XI1A 2HVIA 4RW6A 3TAEA 1QHTA 3SUQA 3TAPA 4CECA 4KPYA 1TAQA 4CEZA 4CJEA 4CESA 4DLGA 3SZ2A 4B8CA 4I2QA 4DTRA 4AHSA 1SKWA 1NK9A 4ID5A 1RTJA 3LP1A 3VQPA 4Z4IA 3QEXA 3RR8A 1VSKA 4Q0BA 1I39A 3D45A 2O4IA 1BGXT 4JLHA 4IG3A 5HRRA 1SV5A 4DSFA 3LPTA 4BE2A 3SQ1A 3M8SA 3C6TA 3ZCMA 1ASWA 4DTJA 1JL1A 4CF8A 1REVA 1XC9A 4DQPA 3SQ2A 1L3UA 3S3MA 3K5LA 4NYNA 4DSIA 4BWMA 4DSEA 2YV0X 1J5OA 3RMBA 4KHQA 4FLYA 4FK4A 1NK7A 4B08A 1W9HA 1U4BA 4HCBA 3V9SA 4CHOA 4JRPA 2G8KA 4HCCA 1ZBLA 4B3OA 2A1RA 2Q3SA 3IRXA 1SL1A 4I2PA 1ASVA 2E6MA 2IAJA 3ZT2A 1C0MA 4IDKA 2QKBA 4KB1A 4KKOA 2P1JA 1JKHA 4KV8A 4AHUA 4R5PA 3OYJA 4DTPA 3KD5E 1LAVA 4F2SA 4IBNA 1T05A 4CJWA 5J1EA 1L3SA 4CE9A 4FJNA 5D3GA 3DYAA 4IKFA 2G8IA 3AA3A 3NF7A 2HHTA 1HQUA 2HB5A 1QTMA 4O5BA 3AVFA 4JS5A 4FM1A 1S1UA 1QE1A 1Q9XA 3RMDA 4KAZA 1RT6A 3RMCA 4DFKA 4FCYA 3DI6A 1XWLA 2YHBA 3M8PA 5HRNA 3ASMA 4DTOA 4NYFA 3OYDA 4M3UA 5I42A 4PQUA 1S6QA 3KIOA 2IS3A 3PUFA 4CGJA 5JS2A 3KK3A 1D9DA 5HRPA 3M8QA 3HJFA 4CGGA 2A1SA 2JLEA 1LW2A 5HRSA 4C8KA 4EZ6A 2KTQA 3OJUA 2DFHA 3K57A 2XO7A 5HROA 3IAYA 1WAJA 3NAEA 3V6DA 1JXBA 2HW3A 3AO1A 1RT3A 2OZMA 4CHQA 1X9SA 5T7BA 4CEFA 3QERA 3G0ZA 4M3YA 2D5RA 2DFFA 1BQNA 3ZSOA 4CJVA 4FW2A 3SV3A 4KFBA 2KFZA 3NH1A 5HP1A 4B9NA 1QQCA 2FBXA 4FM0A 3NF8A 1JLEA 3L8BA 3DM2A 4OKJA 3ULDA 4NCAA 3AVLA 4CK1A 3EYZA 3WNGA 1D8YA 4B9LA 4ELTA 4KTWA 2E4LA 5KRSA 4DTNA 3AVBA 1TK5A 4M3ZA 1BL3A 1L3VA 4CJPA 4B9MA 3MEDA 1R0AA 1HJRA 4FLZA 1NK0A 3OYEA 3L2UA 4FJ7A 1KVAA 1GOBA 1RT5A 2B6AA 4CJQA 3SPYA 3AO5A 3DLHA 4FJIA 2ZQBA 4DFJA 1RBRA 3U3YA 2BGGA 3QEVA 3KJVA 4LH5A 3MXIA 4CK3A 4Z4GA 3AVNA 4BACA 1A5WA 2YKNA 4OPKA 1S5JA 4PA1A 4DQQA 1HNVA 4GVMA 3ZT3A 3KK2A 1HRHA 2ZE2A 5C25A 4AILC 4B9TA 3RRHA 3PO4A 5E41A 2D0AA 4HVJA 1HYVA 1KVCA 3OYLA 4CGHA 4H8KA 4B8AB 2OA8A 1B9DA 3OYMA 4OGEA 3L3VA 4O0JA 3NH0A 5SZTA 3VQCA 1UAXA 2E6LA 3I8DA 3LAKA 4FYDA 4FZXC 3O3GA 3TAQA 1RTDA 4FXDA 4DQSA 4DFPA 2F8TA 1BIUA 1JLAA 1GOAA 2GV9A 3VN5A 4CJRA 4FM2A 3QETA 5C24A 1IKWA 3DOLA 1XHXA 4F8RA 3HO1A 4DTXA 2YNFA 3THVA 4HTUA 1IG9A 2WONA 4CF2A 4DSLA 3LZIA 1RT7A 4AHVA 4JRQA 4BDZA 1KSPA 4E7KA 4I9QA 4F2RA 4J2DA 2HHXA 1S9GA 3L2VA 4DMNA 2G8UA 3V9XA 1FKPA 1J9AA 5JS1A 1RBVA 1L3TA 1VK0A 5FRNA 1HYZA 1TVRA 3OYAA 4Z4EA 2Z1GA 1QSYA 3D0PA 1WSIA 3S3OA 2VG5A 4O0IA 3IS9A 1RDCA 2IC3A 4E19A 1NKEA 3B6PA 2VWJA 5CYMA 4KTQA 4CF9A 3ZSYA 3HPOA 3EZ5A 3C6UA 3HSTB 1UOCA 1LWCA 3HPHA 4IFVA 3ZT0A 3VQ5A 4AHTA 2Y1JA 2HMIA 4QCLA 3P83D 2D0CA 1ASUA 3TWHA 5CYQA 3IG1A 2P5GA 2OYQA 3HVRA 1K6YA 3DMJA 4M3RA 1X9WA 4FLUA 4H4MA 4FJLA 2HNYA 2AJQA 3HVTA 4LH4A 4OPJA 4F3TA 3T1AA 2HVHA 3OVNA 3L3UA 4JS4A 1N6QA 1JXEA 1KTQA 1GOCA 4UQGA 4BDYA 2F8SA 3JYTA 5FROA 5FRMA 1ZBIA 2B5JA 3ISNC 4FW1A 4DS4A 3UIQA 4C8OA 3SQ4A 4EP4A 4CERA 1EP4A 3KKRA 1WSFA 4Z0UA 5EU7A 1BIZA 3O4QA 4Y1DA 1LWEA 1WSGA 4KREA 4CJUA 3HXMA 2OZSA 4KO0A 1WAFA 3A2FA 4QAGA 4Z4HA 3PX4A 1UA0A 1KRPA 5FDLA 1U47A 4W5TA 4DTSA 4QOZB 3LALA 1UWBA 3K5OA 3WNHA 4FLWA 3S3NA 1W0HA 2YKMA 4CK2A 4I9LA 3V1QA 4M42A 1U45A 1C1BA 3V9UA 1HYSA 1NOZA 2FC0A 3VQ8A 3G10A 1Y97A 1RNHA 4E1MA 1X9MA 4CGFA 2W42A 1TKZA 3KTQA 1SUQA 1Q8IA 3NF6A 2DFEA 2RPIA 3O3HA 4CJFA 3VQBA 3ZSZA 3SI6A 1DLOA 3OYIA 1NK6A 2HHWA 3NHGA 3BDPA 1U04A 2ATQA 2FBYA 3NDKA 2HHSA 3V1OA 1JL2A 3T3FA 4FJ9A 1NOYA 3C95A 3MEEA 3AVMA 3HPGA 3U6FA 3NBPA 4F4KA 3O4NA 4CEQA 4PUOA 1RBSA 1RT2A 5KTQA 1D9FA 4FZYA 3AA4A 3VQAA 2KZZA 3AO3A 4IG0A 4CFCA 4KHSA 1KCFA 4KI4A 1UA1A 4RW9A 3C94A 1EX4A 3AVCA 1RDDA 3SUNA 3O3FA 1DTQA 3MECA 4M3XA 1NJZA 3LP0A 3HYFA 1A5XA 2X74A 4HUGA 4CJSA 4E0DA 4DFMA 1LV5A 3OYHA 4B9UA 2XHBA 3OJSA 4BE1A 4OJRA 4E3SA 1HNIA 4FZZA 3NE6A 2XY5A 2HHVA 1J54A 1KFDA 2OPPA 3K5NA 4CF1A 4HHTA 1RDAA 1HQEA 3VQ4A 4OGCA 4YNQA 4C8LA 4OVLA 4W5OA 3VQ7A 2NUBA 3PX0A 3SNNA 1T7PA 1NKBA 3WNEA 2IGIA 2ZD1A 1IH7A 2QK9A 3DOKA 1VSMA 3KK1A 2R7YA 1CXQA 4DLEA 3DRRA 5KGWA 1U48A 2ETJA 1O1WA 3DRPA 1RILA 4NCGA 3NFAA 4C8NA 2RF2A 4M45A 1TL1A 4FLTA 4DS5A 3RR7A 1TGOA 4PWDA 1KFSA 1YVUA 3AVJA 1IKYA 4FJXA 1FKOA 4K8XA 1I3AA 4Q5VA 2RN2A 4LSNA 3ZSXA 3QEWA 2IDOA 3RTVA 3E01A 3KLIA 1Z26A 2PZSA 3NGYA 4CIFA 4OLBA 1RBUA 3AA5X 4LSLA 4AHCA 4CHZA 5KGXA 4CIEA 4CFDA 3CFPA 4FJHA 2VG6A 2YNGA 3M8RA 4CEAA 4Y1CA 2KW4A 2FBTA 1WSJA 3KLFA 1VSLA 1C6VA 2FBVA 3CFOA 3VA0A 3SYZA 4ELVA 4FJ5A 3TAGA 3NGZA 3CG7A 3V9ZA 4CEOA 3DLEA 3KD1E 3RWUA 3VQ6A 1JLQA 1IKXA 3PX6A 3ZT1A 3DLKA 3L2RA 1WLJA 4DU3A 3EY1A 3P5JA 1WN7A 1NJWA 4DF8A 4E1NA 1VSIA 1ZBHA 2YNHA 3CYMA 5DK5A 4CGIA 4DF4A 1LWFA 4CHPA 4FLVA 1F21A 1NKCA 4DSJA 1D5AA 1TK8A 1C1AA 3VQEA 2I5JA 4LD0A 3VA3A 3OYNA 4E7IA 1BCMA 3I0RA 1ZBUA 4BE0A 2X6SA 1CZ9A 1VRUA 3NCIA 1VSDA 3BGRA 4HUFA 3PV8A 3RRGA 3AVAA 3AO4A 3LWMA 4CJLA 2QKKA 3CQ8A 1TAUA 2OPSA 3LANA 1BQMA 3HT3A 4DQRA 3F73A 3FFIA 1RT4A 4OKEA 4KHNA 2YNIA 1VSFA 1ZBFA 4C8MA 3ZSVA 2QXFA 3AVKA 3KLEA 4FJMA 4I7FA 2XY8A 3DLGA 4M3TA 2HHQA 2PYLA 4FK0A 4FJ8A 3AO2A 3K59A 3TARA 2GUIA 3L2QA 5HLFA 1NK8A 4W5NA 1JLGA 3CM5A 2XY6A 4DWIA 3LP2A 1S1XA 1J53A 4ID1A 1KLNA 2DY4A 2DTUA 1X1PA 4EP5A 3LAMA 3OYFA 1DTTA 4N47A 3HP6A 4ZHRA 4CEBA 3K58A 4L8RB 3KLGA 1IO2A 4CJKA 2WOMA 3MXMA 4CFAA 4N41A 2Z1HA 3DLRA 1RT1A 4TSXA 1BHLA 3ZSWA 3I0SA 3DRSA 3VQQA 4CHYA 2XRIA 4RW7A 3TR8A 4DSKA 3H08A 5CZ1A 4HUEA 1NK4A 3HP9A 3SV4A 2G8VA 3MAQA 3TABA 3OY9A 1VSHA 1SKSA 4BDPA 1N5YA 1SKRA 2LSNA 4IFYA 4KI6A 3QIPA 4MFBA 1YTUA 1RTHA 4O4GA 1NJYA 3SPZA 2G8WA 3ZSRA 1TK0A 4E89A 4CCHA 1WSHA 4PY5A 1BCOA 3U3GA 3CFRA 3MXJA 2O4GA 2YHAA 4GW6A 1S1VA 2HHUA 1B92A 3JSMA 3PY8A 4Z4FA 4KTZA 3WNFA 3TAMA 1BISA 3OS2A 2F96A 3QLHA 3RMAA 3VQ9A 4KHUA 2BE2A 1C0UA 4CF0A 4CHNA 2HNZA 1IKVA 4Z4CA 3B6OA 1TKXA 1A5VA 1NK5A 1RTIA 4M41A 4NCBA 4F3OA 4MQ3A 3TAFA 1BI4A 1EKEA 3LZJA 5C42A 4CEDA 1TKTA 2B4JA 3V9WA 3SUPA 4N76A 1SL0A 1S6PA 3AVHA 3HL8A 2BDPA 3OS1A 3ZSQA 4W5QA 4FJKA 3AVGA 5KRTA 1S1TA 2P51A 3V81A 5J2QA 3QIOA 3V1RA 3F9KA 3T19A 5CY4A 1U49A 1EXQA 3LDSA 4J2BA 2RKIA 3OYKA 1QS4A 1QSSA 1JLFA 4E7JA 4N5SA 3LPUA 2X78A 3SUOA 3SQ0A 3SJJA 4FVMA 3OYGA 3HM9A 1KVBA 3QESA 5HBMA 1MU2A 2KZMA 2Z1IA 4DTUA 3LWLA 1KLMA 1XHZA 5K14A 1HPZA 1TKDA 3AVIA 1FXXA 4CFBA 3NGIA 3QNNA 4ZTFA 1LW0A 2IOCA 3OYCA 5J2MA 4DTMA 4DQIA 3AV9A 4YFUA 2PYJA 1G15A 3QO9A 1FK9A 3MEGA 1S1WA 4RW4A 1T8EA 2Y1IA 4CJ3A 1LAWA 4XIUA 3HK2A 3NH2A 2XY7A 2PY5A 4KRFA 4CEEA 5J2PA 3OYBA 1WNSA 3TANA 1B9FA 1CZBA 1CLQA 2EHGA 3P1GA 4E7LA 1VRTA 3KKSA 4FLXA 1EETA 3SCXA 4GMJB 5KI6A 4CIGA 3NF9A 4CJ4A 3PO5A 4W5RA 4FK2A 3S9HA 3QNOA 4B9VA 4E7HA 4DU1A 3QEIA 4O44A 4RW8A 4H4OA 2BANA 1Z25A 2VG7A 4DG1A 3QINA 2KQ2A 3QEPA 2JGUA 4KHWA 2Z1JA 4AH9A 2ITGA 4KHYA 2HNDA 2OPQA 2KFNA 4G1QA 1VSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ELZA 4I6MB 1WSEA 4LF9K 1BU6O 4J2AA 1RCHA 3S41A 4PL8A 3KVGA 3ID6A 3VEXA 4KB0A 4FWRA 4OLAA 4H0TB 2X6NA 1ZYQA 1JCFA 3VEVA 4RG8A 3CF5L 3W3DA 3KLHA 4X65K 3IKMA 5SWMA 5AQZA 1TL3A 4BC5A 3VTIA 1S3XA 1VSEA 4N56A 2EX3A 2ZJQL 3OBWA 4JD2B 4O55A 4EZ9A 4MLEA 5AQMA 1JLBA 4K25A 1XI1A 2HVIA 2PBDA 3VERA 4CECA 1TAQA 4ISFA 2A40A 4CEZA 3SZ2A 1SKWA 1W2BM 1N34K 3R6MA 4B1WB 3N4QA 5F1XA 3WEEA 3VQPA 2O4IA 3TU5A 3RR8A 1VSKA 3D45A 4WYBA 1VQLN 2ASPA 5HRRA 3LPTA 5BRFA 2CH5A 2E2NA 1VAZA 4QS9A 1P8ZA 1ASWA 4MO5A 5TKYA 3SLCA 4J8FA 1NM1A 3K5LA 4NYNA 4DV1K 4RTFD 4DSEA 4CZLA 2FF6A 3HM8A 3V9SA 4CHOA 2G8KA 4HCCA 4XH1A 1MA9B 2A1RA 3IRXA 3A0IX 3RSEB 2IAJA 2GWJA 3CJBA 4IDKA 4KKOA 2P9NB 3KD5E 4IBNA 4BGAA 4IKFA 5M1QA 3QICA 3AVFA 4JS5A 4FM1A 1S1UA 2O8CA 2QEXN 3RMDA 2NRHA 4KAZA 1RT6A 5M1PA 4NYFA 4M3UA 3HTVA 1S6QA 3WT0A 2KLAA 2IS3A 3EE9A 1T6DA 4CGJA 5JS2A 3O9QA 2JLEA 3QMLA 3TSUA 1LW2A 1EWRA 2KTQA 2DFHA 3P4IA 4DR2K 5T7BA 3VPZA 4CJVA 3EE8A 4CZJA 4KFBA 1QQCA 2ZM6K 4FM0A 3ZETA 4DV2K 3HOSA 3EYZA 4B9LA 1S22A 3WNGA 4DTNA 3VEZA 1TK5A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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