1RBSA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEACEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE H
total genus 48
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbsA00
1S9EA 2HHWA 4DTMA 2X6NA 3DOKA 4EZ9A 4LSNA 2E4LA 1G15A 3VQ5A 4C8KA 3DRRA 3QIOA 2VG6A 3DLRA 1J5OA 4CJWA 1NK6A 3KJVA 1BIUA 4LY7A 3I0RA 1S6QA 2VWKA 1NKCA 3LAKA 3CM5A 4W5TA 4CJTA 4E19A 3RR7A 2QK9A 3LAMA 2Z1JA 5T7BA 2QKKA 1VSHA 3AVGA 4FK0A 2A1RA 3QINA 3NE6A 2X78A 1FXXA 3KK3A 3L2WA 4CJKA 3K5MA 4PQUA 3MEDA 2ZE2A 4E7IA 4WE1A 4DFPA 2AJQA 4FJ8A 2Y1IA 4E3SA 3DLEA 3O4QA 3SV3A 3K5LA 3NCIA 4HUEA 2YKNA 1RT7A 4CECA 2Y1JA 1KLNA 1JLBA 1SKWA 4CEDA 2HNYA 1T8EA 3ZT4A 4CFDA 4DLGA 2GV9A 3NFAA 1NK9A 2O4IA 3HVRA 3EZ5A 3TAFA 3ZT3A 1IH7A 1RTIA 1VSEA 4BDZA 4FJIA 4W5NA 4FJNA 3B6PA 4CEBA 3DLGA 4Z4EA 4F3OA 4EP5A 4DQPA 2KTQA 3CQ8A 4BE0A 3DLBA 5KRTA 4DF8A 4GMJB 4DSJA 4B3OA 4KTWA 3L3UA 1YT3A 1Z25A 2HNDA 1HJRA 3ZSQA 1KVAA 2G8WA 1VRUA 3ZSYA 4CIGA 4FZXC 2WONA 3OJSA 1RDBA 5HRPA 4ELTA 1IKYA 2XO7A 1NK4A 1NOZA 3OYKA 3QEWA 1R0AA 3SUNA 1Q9YA 3U3YA 3O3GA 3OYBA 2B4JA 3VQCA 4DQIA 3SUOA 4QAGA 1B92A 1WSFA 2LSNA 4FLXA 3UIQA 4OLAA 4DFMA 4JLHA 1U48A 3IG1A 3VA0A 4NCBA 3QETA 1C6VA 1GOBA 1BCOA 1LAVA 2OPQA 1L3SA 4M3UA 3V9SA 3SI6A 4FJ9A 3RTVA 1DLOA 3AVLA 1IKXA 1VSMA 3AA5X 3P5JA 4XIUA 3OYHA 2BGGA 4CEOA 4B08A 2G8UA 5DK5A 5D3GA 4KHYA 3V6DA 1A5XA 4L8RB 3G10A 3QIPA 3L8BA 3I8DA 4CFAA 4DQQA 5J2MA 4E0DA 3KIOA 4FLUA 1S9GA 4PA1A 1WLJA 1SL0A 5K14A 3AO3A 3RMBA 1UA1A 4CGHA 4IG0A 2QKBA 4KHNA 4F8RA 4IG3A 4CK3A 3BDPA 3HO1A 3RMDA 4QCLA 3HPOA 3K58A 3ZSZA 4RW7A 3SUQA 1KFDA 3KLGA 5C42A 3L2UA 2YNGA 3OYCA 4DF4A 1BGXT 1HYSA 3LWMA 4O0JA 2KFZA 1WNSA 3EY1A 1MU2A 3CFPA 3KD1E 1W9HA 1WN7A 1UOCA 4JS5A 1ZBUA 1XHXA 1RNHA 2FBTA 2Z1HA 1RT2A 2YNHA 5KI6A 4W5OA 3OYMA 2G8HA 5SZTA 3NF6A 2VG7A 4DG1A 3TAMA 4OKEA 3NGYA 3VN5A 1C0TA 3LALA 1SL2A 4ID1A 1KSPA 3KLIA 3C6UA 3CYMA 4KV8A 1IKWA 3OYFA 1QSLA 3VQDA 3AVJA 4CEZA 4M3ZA 4HUGA 1HNIA 1RDDA 4I2QA 4LD0A 3ZCMA 4KB1A 4J2AA 5J2PA 1BCMA 3WNHA 4K8XA 3LDSA 2E6MA 4GVMA 1ZBFA 5FDLA 3OJUA 3M8RA 1W0HA 5CZ2A 1LWCA 1ITGA 3KKRA 3NHGA 1UA0A 5FROA 4DTRA 4BACA 2PY5A 1XHZA 4NCAA 4BE1A 3DLKA 3DRPA 4MQ3A 4N76A 4Z0UA 5J2NA 4DSLA 1J54A 4QOZB 3HVTA 3T1AA 4FM2A 1HNVA 3TWHA 3AVKA 5J2QA 1Z26A 1ZYQA 4DLEA 4FJXA 2PYJA 1X9SA 3F9KA 1TGOA 4LH5A 5HBMA 1K6YA 3TAPA 1CXQA 4DSEA 4H4OA 2YHBA 3DOLA 1I3AA 4CJ3A 4RW6A 3AVNA 3ZT2A 1BQNA 1HQEA 1WAJA 2B5JA 2IC3A 2OPPA 2P1JA 4Y1DA 4BWMA 4M41A 4FLWA 1QTMA 3RRGA 2HVHA 4HVJA 3WNFA 4BDYA 4FW1A 2XY5A 4KHQA 1WSIA 2OPSA 3DMJA 1KLMA 3HXMA 1KRPA 2KQ2A 3LP0A 4FJ5A 3BGRA 3C95A 1A5WA 4FJJA 5CY4A 4JRPA 3QNNA 3ITHA 1VSDA 5KGWA 4R5PA 2NUBA 3QNOA 3IS9A 4CHPA 3TARA 3U6FA 1S1UA 3HSTB 1TK0A 1RTJA 4M3TA 2D0BA 1JKHA 1HYVA 1RDCA 4FW2A 4CGFA 3VA3A 4Z4FA 3QEXA 4HCBA 3NH2A 4B9MA 4B9LA 2YHAA 4IDKA 4C8OA 4DTUA 4YNQA 1RBUA 4CF9A 5KGXA 4Z4HA 3SV4A 4M42A 3D0PA 1EX4A 2VG5A 3DI6A 5KRSA 2F96A 4AHRA 2FC0A 3MAQA 2I5JA 3NBPA 2Z1GA 4OKJA 4OGEA 4CIEA 4KFBA 4DTSA 3VQBA 4KI6A 4Z4IA 4HUFA 2KW4A 3KLHA 4DQRA 3SQ0A 3VQ7A 4M3XA 1RBSA 3MXMA 1B9FA 3ZT0A 4EP4A 3C6TA 4CESA 3NF8A 4FJGA 1WSJA 3ZSWA 3LPTA 3OYLA 4KHSA 4YFUA 4KO0A 2B6AA 1RBTA 3AO5A 1JLGA 2Q3SA 2IGIA 4DS4A 2E6LA 2OA8A 3P83D 3H08A 1C0MA 2PZSA 1S1WA 1ZBLA 1QE1A 1BISA 3PX6A 2P5OA 2OYQA 2HHSA 2IS3A 4C8NA 2HHTA 3LPUA 1XWLA 4EZ6A 4F4KA 3RR8A 2D0CA 3AO1A 3OYNA 1T05A 1LV5A 3JSMA 4FLVA 1VK0A 5JS1A 1RBRA 3ISNC 1SKRA 4CJLA 1RTDA 3NF9A 2GBZA 3OVNA 4FM0A 1S1XA 4C8MA 4AHTA 2XY8A 4ID5A 3DLHA 1TKXA 4I2PA 4GW6A 4CJ5A 4DWIA 4FJKA 2HW3A 4Q5VA 1IG9A 3KKSA 1SL1A 3KK2A 2HMIA 1JLQA 4OLBA 4O5BA 3MEEA 1WSHA 2Z1IA 3MEGA 2W42A 1KVCA 1ZBIA 3VQQA 2RKIA 1UAXA 3KK1A 4CFCA 4DU3A 1U04A 4CJRA 4M45A 1XC9A 2YNIA 4CHOA 3KD5E 2ITGA 3QEPA 1EP4A 1Y97A 2DFHA 1HMVA 1QSSA 5HRNA 4FJLA 2IAJA 1D9FA 3ZSXA 1U45A 2A1SA 3AA2A 3KLEA 3D45A 1D8YA 1JL2A 3OYAA 3L2VA 2BDPA 4KB0A 2RPIA 3PX4A 4FJHA 1C0UA 4O44A 4J2BA 1LAWA 3ZSVA 2G8VA 4AILC 5I3UA 2ZQBA 1TK5A 1NKBA 2OPRA 1C1AA 3M8QA 1Q9XA 4CHYA 3O4NA 1XI1A 1VSLA 4W5QA 4FYDA 1C1CA 4O4GA 3VQ6A 4OKKA 4CHQA 1TK8A 4O55A 4CJFA 5HRSA 1BIZA 1GOAA 3KLFA 4E7LA 1JLAA 4OPKA 1ASVA 3DRSA 2QXFA 3OYDA 4DQSA 1IKVA 5JS2A 4CJEA 3SJJA 3S3MA 3K57A 1L3VA 2X74A 5C25A 4HCCA 5HRRA 1S1TA 4TSXA 3RMAA 1J53A 3AVCA 3F73A 4DU4A 4DS5A 3OS2A 3PV8A 1NK5A 4DFJA 2OZMA 1VSIA 3HT3A 2RF2A 4DU1A 1DTQA 3SQ1A 2IDOA 1TVRA 1RT5A 3G0ZA 3DM2A 3NGIA 1NK8A 1BI4A 3V1RA 3ZT1A 4KTQA 1I39A 1TKDA 4FK4A 1X9MA 3DYAA 3QESA 4I9LA 4CJ4A 1IO2A 3JYTA 5HROA 3OYEA 1X9WA 4I9QA 1DTTA 3QO9A 3NDKA 1YTUA 1S6PA 4DTOA 4KI4A 4E1MA 1RT4A 3SPYA 2R7YA 4AHUA 2F8TA 1NKEA 1BL3A 2YNFA 3AVHA 1J9AA 3K5OA 5CYMA 3V9UA 2WOMA 3K2PA 4CJQA 3FFIA 4UQGA 3PUFA 1U49A 4KREA 3TAEA 4FLYA 4AH9A 1U47A 4G1QA 4F2SA 2XY7A 3AO2A 1QHTA 3MXIA 4PY5A 3OS0A 3VQAA 4DMNA 4FK2A 1O1WA 3O3FA 1FK9A 3SQ4A 1ZBHA 3NAEA 1RT1A 1BQMA 1HRHA 2O4GA 3ASMA 4B8AB 1NK0A 1CZBA 3HYFA 1KCFA 4E7HA 1GOCA 3TABA 3V1QA 3LZJA 3S3OA 1YTAA 4BWJA 4F2RA 4CIFA 1NOYA 1WSEA 4ELUA 3HJFA 2HHQA 1X1PA 4DSFA 1KFSA 3CFOA 5CYQA 2KZZA 1EETA 4OVLA 3VQ8A 4CK1A 4FCYA 3QEVA 3ULDA 4FM1A 4I7FA 2PYLA 2FBXA 4E7KA 4DTXA 3RMCA 5FRMA 3LWLA 3HPGA 2EHGA 3K59A 4CEQA 1D5AA 1RBVA 4OGCA 4J2EA 3NH0A 1QSYA 2ATQA 4B9UA 4RG8A 4CEEA 4ZHRA 4CGDA 3SNNA 1KTQA 1NK7A 3IRXA 4CGJA 3CM6A 3NF7A 4C8LA 1LW0A 1C1BA 2KFNA 3QEIA 1N5YA 3V81A 4M3WA 2YKMA 3NH1A 1NJZA 2EX3A 1EXQA 1VSFA 1UWBA 4CF2A 5CZ1A 4B9SA 4B9VA 4N41A 3VQ9A 1HYZA 3L3VA 3SYZA 3ALYA 1SUQA 4LSLA 3S9HA 3WNEA 3QLHA 3OYIA 1ASUA 5J1EA 4PWDA 3P1GA 4IFVA 1S5JA 4KAZA 4CEFA 4ZTJA 4CERA 3MECA 5HLFA 4CF0A 4OPJA 2DFEA 3V1OA 3TAGA 4ZTFA 4OJRA 1Q8IA 3WNGA 4CJUA 4AHVA 3V9ZA 1SKSA 4BDPA 1B9DA 3AVMA 2YV0X 3A2FA 3S3NA 4DSKA 4CHNA 3O3HA 4ELVA 3I0SA 1TL1A 1NJXA 4MFBA 4RW4A 4B8CA 1F21A 3KTQA 3AO4A 3VQ4A 5E41A 3HP9A 3LP1A 3CFRA 3B6OA 3THVA 4FJ7A 1JLFA 3RWUA 3T3FA 4CJSA 2HHXA 3CG7A 3SUPA 3PO5A 4N5SA 2G8KA 2DTUA 5SWMA 4JRQA 1L3TA 1BHLA 2HB5A 3LP2A 4N47A 3AA3A 3AVFA 1LWEA 4CK2A 1QQCA 1LWFA 1WAFA 3V9WA 4AHCA 4M3RA 2G8IA 4BE2A 4DTJA 3TI0A 1A5VA 3V4IA 3RRHA 1BI4B 5EU7A 3NGZA 1TV6A 4LH4A 4DFKA 4CJPA 4KPYA 4Z4CA 4FZZA 1HQUA 2KZMA 4AHSA 1SV5A 2JLEA 2P51A 1CZ9A 1NJWA 1RT3A 3HP6A 5KTQA 2HNZA 2OZSA 4CF1A 1CLQA 4ICLA 3SZ2A 2HHUA 4FLTA 2F8SA 4KTZA 4DSIA 1TKTA 1VSKA 4KHUA 4CHZA 3MXJA 1TAUA 1HPZA 3LZIA 2XY6A 4CF8A 3SCXA 1N6QA 4NCGA 1RT6A 1RCHA 3ZSRA 2IOCA 3HK2A 3VQEA 4Q0BA 4Y1CA 2VWJA 3HM9A 1S1VA 3LP3A 1JLEA 3OS1A 4H8KA 3OY9A 4NYNA 3IAYA 3OYJA 4PUOA 1TKZA 2ETJA 1JXEA 1KVBA 1VRTA 4K8ZA 4RW8A 2DFFA 2XRIA 4DTPA 4M3YA 4IBNA 5DMRA 4N56A 3ZSOA 5FRNA 4KHWA 2X6SA 3AA4A 2JGUA 4JS4A 3EYZA 3QERA 3TAQA 1D9DA 4NYFA 3AV9A 4CFBA 1U4BA 4CGGA 4IFYA 3C94A 3E01A 1L5UA 1LW2A 1VSJA 3L2RA 3U3GA 4DTNA 1REVA 1CXUA 4Z4GA 2XHBA 3PX0A 3PY8A 3L2QA 4E1NA 3PO4A 1FKOA 1QS4A 1FKPA 4RW9A 4F3TA 1TL3A 4H4MA 1RTHA 1YVUA 2D0AA 4KKOA 1RDAA 5C24A 1NJYA 4FJMA 3SPZA 2P5GA 3TR8A 3M8SA 4FLZA 2BE2A 4B9TA 2FBYA 4J2DA 1EKEA 1WSGA 1T03A 4B9NA 2GUIA 3OYGA 4O0IA 4IKFA 3HPHA 4CGIA 3V9XA 5HP1A 4FXDA 1JLCA 4FVMA 4HHTA 3VQPA 1ASWA 4HTUA 2DY4A 3HL8A 4E89A 3LANA 1JXBA 4FZYA 1RILA 2D5RA 4CE9A 3K5NA 2ZD1A 4CEAA 4E7JA 5I42A 2RN2A 4CJVA 4W5RA 2G8FA 1T7PA 3AVBA 4CCHA 1JL1A 4KRFA 1TAQA 2HVIA 2HHVA 2FBVA 3T19A 1L3UA 3M8PA 2BANA 3TANA 3AVAA 3AVIA 3SQ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IDHA 3SAFA 2HHWA 1Z05A 3UKRB 1G15A 4DV5K 2FLOA 1VQ9N 3QIOA 1J5OA 5EOYA 5AZJB 2IVPA 3LAKA 4BROA 3NVMA 2OCEA 5MLCQ 5BR8K 1U2VA 5T7BA 4G9ZA 3QINA 1FXXA 4CJKA 4PQUA 4E7IA 2ZE2A 4DFPA 3O4QA 4YOTA 3SV3A 5CR4A 2E1YA 4CEDA 2HNYA 3A5OC 4CFDA 3NFAA 1NK9A 3K9KA 3JS6A 1VSEA 4IFEA 2W6LA 3H45C 4F3OA 3GBTA 4DQPA 1HX1A 3KZBA 4GMJB 5FPEA 4CI6A 1Z25A 2NRZA 4IXCA 3ZSQA 1VRUA 4CIGA 4K42A 3CI5A 3OJSA 1RDBA 1IKYA 1NK4A 4K25A 3OYKA 5KPRA 3SUOA 1B92A 1MWMA 3VA0A 1BCOA 4M3UA 4WYBA 3V9SA 3SI6A 4CJ7A 1VSMA 2PFUA 4CEOA 1C0FA 3O9SA 5BRFA 5JICA 5D3GA 3F9MA 3FFKB 1Q82O 1N33K 4IO9L 3CCEN 3MN9A 3PIOL 4DQQA 4JYAK 4BRQA 4IDHA 2NRVA 4KHNA 4EAHD 2YHYA 3BDPA 1M1KO 3IKMA 3HPOA 1XMQK 1HLUA 1BO5O 4NLBA 1KFDA 4BRLA 2YNGA 1HYSA 4IJAA 2KFZA 4BQZA 2GELA 3L0QA 4BVOA 5GAEP 3NF6A 2VG7A 4DG1A 3TAMA 3NGYA 3VN5A 1C0TA 2P9IA 3KLIA 3C6UA 3W3DA 3D2EA 3DAWA 3SMPA 2FSNA 4IEIA 1FW6A 1ATRA 1RDDA 3MMVA 4KB1A 5JMVA 4OX9K 3WNHA 2WTUA 4GVMA 3FGUA 1ZBFA 5FDLA 3VMFB 4BRFA 1ITGA 2QWMA 2H3GX 4N76A 1X3MA 3H6EA 4DV2K 1BA1A 4B1UB 3AVKA 4FJXA 2PYJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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